文献速递|Origins高分辨率潜水电泳仪助力病原微生物流行病学研究

【Microorganisms】Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia

在斯洛伐克城市、农业和洞穴栖息地中，蓖麻硬蜱对伯氏疏螺旋体复合体感染率的时空特异性

莱姆病(Lyme borreliosis ，LB)是欧洲最常见的蜱传人类感染性疾病，近几十年来发病率不断上升。该病以蜱为媒介，由伯氏疏螺旋体(Bbsl)所致的自然疫源性疾病。在欧洲全域，特别是斯洛伐克，已观察到大量的蓖麻硬蜱种群，成为病原体伯氏疏螺旋体(Bbsl)复合体的主要媒介。了解感染性疾病的传播途径对实施有效的控制措施至关重要。

本研究聚焦于斯洛伐克，从代表城市/郊区、自然和农业栖息地的三个地点寻找感染伯氏疏螺旋体(Bbsl)的蓖麻硬蜱种群，调查Bbsl的感染率及其物种多样性的时空特异性。在布拉迪斯拉发镇(城市/郊区栖息地)、小喀尔巴阡山脉(自然栖息地)和斯洛伐克东部农业栖息地，通过拖拽植被采集蓖麻硬蜱若虫和成虫。用聚合酶链式反应检测蜱体内是否存在疏螺旋体，并用限制性片段长度多态性（RFLP）鉴定Bbsl种群。用反向线性印迹法（Reverse Line Blotting ，RLB）鉴定共感染蜱中的伯氏疏螺旋体类型，从而获得不同环境中蓖麻硬蜱携带伯氏疏螺旋体的真实情况。

• 期刊：Microorganisms

• 发表年份：2023年

• 样本：蓖麻硬蜱（Ixodes ricinus Ticks）

• 应用：限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism ，RFLP）

文中使用限制性片段长度多态性（RFLP）分析鉴定Bbsl种群类型，具体通过Origins高分辨率潜水电泳仪结合Spreadex gel EL300 mini预制胶，以核酸片段分布图谱确定Bbsl种群及亚种。

不同环境类型中，蓖麻硬蜱若虫和成虫对伯氏疏螺旋体的感染率

在探索的栖息地中，蜱虫感染伯氏疏螺旋体在空间和时间上存在显著差异。总感染率最低的是城市/郊区栖息地，而自然和农业栖息地的感染率较高。RFLP在每个环境类型中检测到6种Bbsl，包括B. burgdorferi sensu stricto (s.s.)， B. afzelii， B. garinii， B. valaisiana，B. lusitaniae 和 B. spielmanii。其中，共感染占总感染数量的3%。通过RLB和测序鉴定出B. kurtenbachii与B. burgdorferi s.s，B. garinii 和B. valaisiana存在共感染的情况。这是首次在斯洛伐克和欧洲的蓖麻硬蜱调研中发现B.kurtenbachii。同时在若虫和成虫之间、不同年份之间以及不同生物环境类型之间，发现了Bbsl物种比例的变化。在城市栖息地相对距离较短的地点之间，Bbsl物种的流行模式和比例也存在空间差异。伯氏疏螺旋体感染率和分布的时空特异性可能与当地环境条件和脊椎动物宿主谱有关。由于存在对人类致病的伯氏疏螺旋体类型，所有探索的地点都可以被列为具有高流行病学风险的地区。

原文：

Kazimírová, Mária, et al. "Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia." Microorganisms 11.7 (2023): 1666.

Origins高分辨率潜水电泳来自奥地利AL-Labortechnik公司，集成了整体的温度控制系统，即通过半导体元件和自动温度控制系统，精准控制电泳过程中的温度。同时整合循环泵系统，确保整个电泳区域温度和pH值恒定，形成均匀的、线性电场，这使得该设备具有高分辨率和高重复性，可广泛用于植物、微生物物种的分群和鉴定，以及疾病相关基因的研究等。

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