简介
细胞间的差异在多细胞生物中普遍存在。对单个细胞进行测序可以评估基因表达的异质性及相似类型或来源的细胞之间的异质性,并为鉴定细胞群、分类和亚型提供基础。
传统的文库转化率只有所有转录本的10-20%。因此,目前的单细胞方法依赖于对数千个细胞进行测序通过增加数据测序深度来弥补低转换效率。然后只使用高丰度的marker转录本对细胞进行聚类。Lexogen的LUTHOR 3’mRNA-Seq Library Prep Kit使用专有的THOR扩增技术(T7高分辨率原始RNA扩增技术),使RNA-Seq从单个细胞或超低RNA input量具有前所未有的灵敏度。
THOR扩增技术和LUTHOR 3’mRNA-Seq
THOR稳定的扩增技术可对内源性mRNA模板直接进行线性复制生成更多RNA拷贝(图1)。原始mRNA与扩增所需的T7启动子融合。然后,RNA模板在体外转录产生反义RNA拷贝,但缺乏启动子序列。只有原始的mRNA分子作为模板,并被反复放大。从而提高RNA浓度,制备文库。文库是在一个高度特异性的链转换步骤中生成的(图1)。完整的LUTHOR工作流没有连接、模板转换和打断 ,因此可用于具有挑战性的样本。通过PCR扩增得到单链的cDNA,并引入与Illumina平台兼容的用于簇生成和i5、i7位置的UDIs的全长接头。Lexogen提供预混合的12nt UDIs index(Cat. No. 101 - 105, 156)。
订购信息
143.24 | LUTHOR 3’ mRNA-Seq Library Prep Kit for Illumina, 24 preps | 24 |
143.96 | LUTHOR 3’ mRNA-Seq Library Prep Kit for Illumina, 96 preps | 96 |