概述
SmartChip高密度实时PCR系统是第一套把芯片的高通量和实时定量PCR高灵敏度,精确度和动态范围结合起来的基因表达平台。具有一次运行超过5000个检测的能力,使得一次实验验证几千个基因成为可能。在一个新型高密度形式中表达多重通路概况,疾病相关基因,或者非编码RNA,可以在少于一天的时间一次运行中进行分析,使用已证明的实时定量PCR技术。
组件
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多样品纳升分液器
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8头多样品分液
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以100nL样品量进行高精度非接触分液
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环境控制分液平台
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用户可调整清洗方案
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用户友好软件界面
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小占地面积70cm X 70cm X 40cm
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微孔芯片
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高灵活性的格式:个基因4次重复的不同格式例子
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WaferGen Biosystems可以制造各种格式SmartChip
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循环器
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分析软件
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自动寻找点/孔
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通过曲线匹配测定Ct
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自动标记异常Ct
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溶解曲线分析
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通过标记分类/过滤结果表
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多 ‘heat map’ 显示
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放大曲线显示
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直方图/重复样品的Ct标准偏差
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控制产生校正曲线
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以XML或CSV格式输出结果
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汇总报告
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能够处理大于30000个试验
优点
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最小化移液步数
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得到数据所需时间= 2.25 小时
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中型和大型样品之间的研究结果间只相差数小时。
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智能使用试剂
样品需求
1、0.5微克总RNA用于每张芯片上的5184个反应 (1.0 微克用于microRNA)
2、100 纳升反应容量
3、cDNA每张芯片500微升mastermix
性能参数
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灵敏度: 20-30 copies RNA
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特异性: 区分小于90%的同源性的基因
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精确性: 重复品之间标准偏差<0.25 Ct
4、再现性:芯片间R平方值>0.95或<12%CV