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臭氧严禁直接吸入肺内，因其可以损伤肺泡上皮细胞；臭氧有激活体内新陈代谢的作用，为此用于甲状腺机能亢进患者；禁用于葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症即蚕豆病，因为该病患者的红细胞缺乏抗氧化保护系统，与臭氧接触会导致红细胞大量破坏。臭氧具有神经毒性，不能注入蛛网膜下腔。
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