简介
广谱病原微生物及耐药分析系统,是由杭州柏熠科技有限公司开发的一款面向于微生物病原检测一线工作人员的一键式易操作图形界面分析系统。本分析系统同时支持Nanopore、Illumina、MGI、Ion torrent以及Pacbio等主流三代、二代高通量测序数据输入,可实现快速简单分析,系统提供微生物物种组成及丰度信息鉴定、病原知识库信息注释及中文说明、目标物种测序数据提取、组装与溯源、耐药与毒力等分析功能,同时内置超过40000种基因组数据及对应病原注释信息,帮助用户进行本地化病原微生物分析。
功能介绍
本系统同时支持Nanopore、Pacbio等三代测序数据和Illumina、MGI、Ion torrent等二代测序数据进行生物信息学分析,具体功能如下:
1.支持用户样本临床信息批量上传和管理。
2.支持 fast5、fastq 及fastq.gz等多种格式的测序数据。
3.支持混样Nanopore测序数据拆分分析。
4.支持同一任务多个样本同时分析。
5.支持从下机数据上传到输出结果报告一键式操作。
6.支持一键式生成 PDF 格式分析报告。
7.分析系统分析结果包含:物种分类、序列数统计、病原微生物注释、目标物种测序数据提取、耐药元件分析(新建任务时可选,包含基因组覆盖度、支持序列数、序列一致性、耐药机理、对应药物、物种信息等)、毒力因子分析(新建任务时可选,包含基因组覆盖度、支持序列数、序列一致性、毒力元件分析、致病机理、对应物种信息等)。
8.支持分析数据及结果下载、图表输出等。
9.系统内置微生物数据库支持超过 40000 条物种信息条目。
10.分析系统能够提供国家认可的计算机软件著作权登记证书或其他知识产权证明。
2年
是
无
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