台式测序仪

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综合评分暂无

仪器对比

品牌

因美纳

型号

NextSeq 1000/1000-CN

产地

中国大陆上海

应用领域

暂无

北京德泉兴业商贸有限公司

营业执照已认证

银牌会员
第13年
一般经销商

提高当前的测序效率，备以今后的规模需求

查看NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN测序系统的规格，从零开始重新设计，满足不断发展的需求

所有系统 /测序平台 /NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN:

每个流动槽的测序产出*

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

流动槽类型	P1	P2	P3 †
1 × 50 bp			60 Gb
2 × 50 bp	10 Gb	40 Gb	120 Gb
2 × 100 bp		80 Gb	240 Gb
2 × 150 bp	30 Gb	120 Gb	360 Gb
2 × 300 bp	60 Gb	180 Gb (300 M)

* 输出规格基于单个流动槽，使用Illumina PhiX对照文库，在支持的簇密度下产出进行计算。
† P3试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。

保质期

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

条目	储存温度	保质期
卡盒	-25°C至-15°C	6个月
流动槽	2°C至8°C	6个月
RSB（含Tween 20）*	2°C至8°C	6个月

* 室温下运输

每个流动槽通过过滤的read

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

流动槽类型	P1	P2	P3 *
单端reads	100M	400M †	1.2B
双端reads	200M	800M ‡	2.4B

* P3试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。
† 对于2 × 300 bp的测序深度，为300M单端reads。
‡ 对于2 × 300 bp的测序深度，600M双端reads。

质量分值*与运行时间†

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

质量分值
流动槽类型	P1	P2	P3 ‡
1 × 50 bp	在1 × 50 bp时，≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 50 bp	在2 × 50 bp时，≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 100 bp	在2 × 100 bp时，≥ 85%的碱基分值高于Q30
2 × 150 bp	在2 × 150 bp时，≥ 85%的碱基分值高于Q30
2 × 300 bp	在2 × 300 bp时，≥ 80%的碱基分值高于Q30
运行时间
1 × 50 bp			约11小时
2 × 50 bp	约10小时	约13小时	约19小时
2 × 100 bp		约21小时	约33小时
2 × 150 bp	约19小时	约29小时	约48小时
2 × 300 bp	约34小时	约44小时

* 质量分值（Q值）是对碱基检出中错误发生几率的预测。＞Q30的碱基百分比根据整个运行中的数据取平均值。质量分值是基于NextSeq试剂盒在NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN系统上的运行所计算的，利用了Illumina PhiX对照文库。根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同，性能表现可能有所差异。
† 运行时间包括NextSeq 1000/1000-CN或NextSeq 2000/2000-CN系统上的簇生成、测序和碱基检出。
‡ P3试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。

对关键应用估计的样本通量*

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

流动槽类型	P1	P2	P3 †
小型全基因组测序（300个循环） 130 Mb基因组；覆盖度大于30倍	~7	~30	~90
小型全基因组测序（600个循环） 130 Mb基因组；覆盖度大于30倍	~12	~36	~
全外显子组测序（200个循环）平均目标区域覆盖度为50倍；90%的目标区域覆盖度为20倍	~4‡	~16	~48
总RNA-Seq（200个循环） § 每个样本50M read对	~2‡	~16	~24
mRNA-Seq（200个循环）§ 每个样本25M read对	~4‡	~32	~48
单细胞RNA-Seq（100个循环）** 5K细胞，20K reads/细胞	1††	~4	~11
miRNA-Seq或小RNA分析（50个循环） 11M reads/样本	~9‡‡	36§§	~108
16S RNA测序（600个循环）	~384***	~384***	~

* 表格数据代表每次运行预计样本数。
† P3试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。
‡ 使用P1 300个循环试剂盒。
§ 对于Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep，建议读长是2 × 75 bp，对于Illumina RNA Prep with Enrichment建议读长是2 × 100 bp。
** 建议的测序深度在很大程度上取决于样本类型和实验目标，需要针对每项研究进行优化。
†† P1试剂是单细胞质量控制实验的好选择。
‡‡ 使用P1 100个循环试剂盒。
§§ 使用P2 100个循环试剂盒。
*** 因美纳提供最多384个唯一双标签序列。

Sequencing output per flow cella

NextSeq 1000 and NextSeq 2000

Flow cell type	P1b	P2b	P3b,c	P4c
1 × 50 bp				90 Gb
2 × 50 bp	10 Gb	40 Gb	120 Gb	180 Gb
2 × 100 bp		80 Gb	240 Gb	360 Gb
2 × 150 bp	30 Gb	120 Gb	360 Gb	540 Gb
2 × 300 bp	60 Gb	240 Gb

a. Output specifications are based on an Illumina PhiX control library at supported cluster densities.
b. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
c. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.

Shelf life

NextSeq 1000 and NextSeq 2000

Item	Storage Temperature	P1, P2, P3 Shelf Lifea	P4 Shelf Lifeb
Cartridge	-25°C to -15°C	6 months	3 months
Flow Cell	2°C to 8°C	6 months	3 months
RSB with Tween 20c	2°C to 8°C	6 months	6 months

a. P1, P2, and P3 with XLEAP-SBS chemistry will launch in Q2 of 2024 with a shelf life of 6 months.
b. In 1H of 2024, P4 shelf life will be 3 months. This will be extended to 6 months in 2H of 2024.
c. Shipped at room temperature.

Reads passing filter per flow cell

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry

Flow Cell Type	P1a	P2a	P3a,b	P4b
Single-end Reads	100M	400M c	1.2B	1.8B
Paired-end Reads	200M	800M d	2.4B	3.6B

a. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
b. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
c. 300M single-end reads for 2 × 300 bp with standard SBS chemistry. 400M single-ends reads for 2 x 300 bp with XLEAP-SBS chemistry.
d. 600M paired-end reads for 2 × 300 bp with standard SBS chemistry. 800M single-ends reads for 2 x 300 bp with XLEAP-SBS chemistry.

Quality scores and run time

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry

Flow cell type	P1a	P2a	P3a,b	P4b
Quality scoresc
1 × 50 bp	≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 50 bp	≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 100 bp	≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 150 bp	≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 300 bp	≥ 85% of bases higher than Q30
Run timed
1 × 50 bp				12 hr
2 × 50 bp	8 hr	12 hr	18 hr	20 hr
2 × 100 bp		19 hr	31 hr	34 hr
2 × 150 bp	17 hr	22 hr	40 hr	44 hr
2 × 300 bp	34 hr	42 hr

a. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
b. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
c. Quality scores are based on an Illumina PhiX control library; performance may vary based on library type and quality, insert size, loading concentration, and other experimental factors.
d. Run time includes cluster generation, sequencing, and base calling on a NextSeq 1000 or NextSeq 2000 System.

Estimated sample throughput for key applicationsa

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry

Flow Cell Type	P1b	P2b	P3b,c	P4c
Small Whole-Genome Sequencing (300 cycles) 130 Mb genome; > 30× coverage	7	30	92	138
Whole-Exome Sequencing (200 cycles) ~8 Gb per exome, 90× mean coverage	~2d	10	30	45
Total RNA-Seq (200 cycles) 50M read pairs per sample	2d	8	24	36
mRNA-Seq (200 cycles) 25M read pairs per sample	4d	16	48	72
Single-Cell RNA-Seq (100 cycles) 5K cells, 20K reads/sample	1e	4	12	48
miRNA-Seq or Small RNA Analysis (50 cycles) 11M reads/sample	9f	36f	108f	163
16S RNA sequencing (600 cycles)	384g	384g

a. Table values represent estimated number of samples per run. Recommended sequencing depth will largely depend on sample type and experimental objective and will need to be optimized for each study.
b. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
c. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
d. Use P1 300-cycle kit.
e. P1 reagents are a good option for single-cell quality control experiments.
f. Use 100-cycle kits.
g. A maximum of 384 unique dual indexes is available from Illumina.