精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的 DIA 解析

2015/12/29   下载量： 16 次

方案摘要

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应用领域 医疗/卫生
检测样本
检测项目
参考标准 GB/T 5009.17--2003 食品中总汞和有机汞的测定

PTM位点鉴定错误的概率较高，将位点错误的鉴定结果作为谱图库，会导致DIA解析结果的不可靠。实验使用Thermo ScientificTM Orbitrap Fusion三合一质谱仪，基于ptmRS/phosphoRS建立可靠的翻译后修饰DIA流程，突破了PTM DIA解析的瓶颈。使用phosphoRS/ptmRS筛选PTM定位准确的谱图，作为谱图库用于DIA，结果显示，具有精确PTM定位的谱图库中98.4%的磷酸化肽都获得了可靠的DIA解析(Q<0.01)，峰面积CV值<20%的肽段占86.9%，实现了准确可靠的大规模PTM DIA定量。

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配置单
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PTM位点鉴定错误的概率较高，将位点错误的鉴定结果作为谱图库，会导致DIA解析结果的不可靠。实验使用Thermo ScientificTM Orbitrap Fusion三合一质谱仪，基于ptmRS/phosphoRS建立可靠的翻译后修饰DIA流程，突破了PTM DIA解析的瓶颈。使用phosphoRS/ptmRS筛选PTM定位准确的谱图，作为谱图库用于DIA，结果显示，具有精确PTM定位的谱图库中98.4%的磷酸化肽都获得了可靠的DIA解析(Q<0.01)，峰面积CV值<20%的肽段占86.9%，实现了准确可靠的大规模PTM DIA定量。

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文献贡献者

赛默飞色谱与质谱
钻石会员 丨 第23年
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