方案摘要
方案下载应用领域 | 生物产业 |
检测样本 | 其他 |
检测项目 | 遗传 |
参考标准 | 单细胞蛋白组 |
常规蛋白组学一般为基于细胞群体内的研究,因此不可避免地 会将大量细胞内的信息平均化,已经越来越难以满足对生命功 能更加深入探究的需要。从单细胞层面去了解细胞特征以及彼 此之间的相互影响,可以为生物系统中细胞间的异质性提供更 宝贵的信息,因此有着越来越大的迫切需求。
FAIMS Pro 通过实现在线气相分离,可有效去除蛋白组学分析
中常见的污染和干扰物,为基于高分辨质谱的蛋白组学分析增
加多一维度的分离。本文将其应用在单细胞蛋白组水平的分
析,经过方法优化后,FAIMS Pro联合Orbitrap Fusion Lumos
可显著提升单细胞蛋白组水平的鉴定深度与定量性能。其
中,60min梯度,200pg Hela肽段(相当于单个细胞),搭载
FAIMS可鉴定1259个蛋白,4056条肽段,比不加FAIMS分别
提高216%和298%;2ng上样量时(相当于10个细胞),搭载
FAIMS时,可将肽段强度的动态范围从4个数量级提高至超过5
个数量级。该方法可用于单细胞水平以及其它少量样品的蛋白
组学分析。
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