FAIMS Pro联合Orbitrap Fusion Lumos 提升单细胞蛋白组水平的鉴定与定量性能

2021/11/22   下载量: 1

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应用领域 生物产业
检测样本 其他
检测项目 遗传
参考标准 单细胞蛋白组

常规蛋白组学一般为基于细胞群体内的研究,因此不可避免地 会将大量细胞内的信息平均化,已经越来越难以满足对生命功 能更加深入探究的需要。从单细胞层面去了解细胞特征以及彼 此之间的相互影响,可以为生物系统中细胞间的异质性提供更 宝贵的信息,因此有着越来越大的迫切需求。

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FAIMS Pro 通过实现在线气相分离,可有效去除蛋白组学分析

中常见的污染和干扰物,为基于高分辨质谱的蛋白组学分析增

加多一维度的分离。本文将其应用在单细胞蛋白组水平的分

析,经过方法优化后,FAIMS Pro联合Orbitrap Fusion Lumos

可显著提升单细胞蛋白组水平的鉴定深度与定量性能。其

中,60min梯度,200pg Hela肽段(相当于单个细胞),搭载

FAIMS可鉴定1259个蛋白,4056条肽段,比不加FAIMS分别

提高216%和298%;2ng上样量时(相当于10个细胞),搭载

FAIMS时,可将肽段强度的动态范围从4个数量级提高至超过5

个数量级。该方法可用于单细胞水平以及其它少量样品的蛋白

组学分析。


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