方案摘要
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美国Prospect Biosystems, Inc.公司专利发明的Edge™200气动密度超速分离系统, 是一种易于操作、压缩空气驱动的台式超离系统,可实现强化密度离心分离。突破性的Edge技术采用的是分步密度梯度分离的方式,其分离溶液的浓度逐步增加, 提供了一个快速的,以生物学的变化为基本的,简化组织和细胞复杂成分的分离分组新方法。从而为生物标志物研发,临床诊断,及外科病理学提供了一个有力的工具和技术平台。 Edge技术在不同生物学分析流程中的应用 与其它蛋白分析技术相配合 应用领域 1.低丰度蛋白的分离和富集 ◆Edge 技术能够保持被分离组织或细胞亚结构分区的完整性 ◆降低原样品中成分的复杂性获得样品的浓缩和富集,大幅度增加在下游2-D胶上被检测到的机率 ◆加快靶蛋白浓度的鉴定速度,推进靶蛋白与亚细胞分区相互关系的研究 应用范例:分离分组大鼠肝脏的去细胞核匀浆上清液 2.寻找和发现生物标记物 ◆Edge 技术和 Edge200 分离系统与其它传统蛋白分析技术,如蛋白转印, 2D胶电泳和质谱相结合, 提供了一个快速有效的鉴定通路生物标志物及相关变化的生物网路系统。 ◆Edge 技术融合了该公司的评估潜在生物标记物的统计算法,该技术 (受专利保护)基于生物标记物的相对百分比分布,为进一步的临床验证提供更多的数据和机会。 应用范例:内质网应激反应和糖尿病关系的研究中,在分组样品中用已知生物途径标志物如IRE1为探针,有可能同时发现新的与该途径相关的其他生物标志物。 3.不同的亚细胞结构分区内生物信息和其变化的研究 应用范例:Edge 200可以用来研究在诱导I型糖尿病时T 细胞改变过程中,内质网分子伴侣蛋白和其他热休克蛋白家族成员的作用。 4.生物标志物的评价和验证 ◆Edge 技术融合了Prospect公司的评估潜在生物标记物的统计算法,该技术(受专利保护)基于生物标记物的相对百分比分布,为进一步的临床验证提供更多的数据和机会。 应用范例:突触功能障碍标记物p-synapsinI和氧化应激标记物GRP75作标记物在大鼠大脑和心脏中的表达对比研究 5.营养蛋白组学 应用范例:叶酸缺乏和氧化应激 ◆Edge 技术与2D LC-MS/MS技术相结合可以用于叶酸缺乏和正常组大鼠肝脏之间低丰度生物标志蛋白的定量分析比较。这项综合技术既快速又可承担大样品量的分析任务。 ◆Edge 密度萃取法与其它传统的蛋白谱分析技术,蛋白转印,2D电泳和质谱相结合提供了一个高效快速的蛋白组学究方法,从而可以充分理解叶酸缺乏同时对大鼠大脑和肝脏的影响以及相应亚细胞水平上蛋白变化之间的生物学联系。
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