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新一代AI主导的(单细胞)深度视觉蛋白质组学
癌症是一种与蛋白质丰度或蛋白质功能障碍相关的疾病。因此,蛋白质组是区分健康和疾病状态的一个关键因素。有意思的是,癌症微环境中细胞的蛋白质含量变化很大。了解细胞的异质性是破译健康和疾病差异的关键。Matthias Mann实验室开发了一种被称为“深度视觉蛋白质组学”(DVP)的开创性方法,将激光显微切割(LMD)与超高灵敏度的质谱分析相结合,在细胞水平上提供具有空间背景的信息。可以探索单个细胞的蛋白质组,无需将其分子信息与邻近细胞相混合。从而可对同一微环境中的癌细胞和健康细胞的个体蛋白质组进行分离和分析。在这种新方法中,人工智能(AI)与LMD相结合,提高发现的通量。可自动识别已定义表型的细胞,标记的细胞坐标导入LMD,并进行精确切割。LMD的切割过程也可采用自动化,节省更多时间。
激光显微切割:活细胞切割和操作工作流
激光显微切割工作流:提取单一的癌症组织进行突变分析
利用数码显微镜快速可靠地检查印刷电路板技术报告
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