一.原理
DNA--pian断的分离与回收是基因工程操作中的一项重要技术,例如可收集特定酶切片断用于克隆或制备探针,回收PCR产物用于再次鉴定等。回收实验中两个最重要的技术指标是纯度和回收率:前者未达标时会严重影响以后的酶切、连接、标记等酶参与的反应;后者不理想时往往会大大增加前期的工作量。
本实验采用的是V-GENE公司的DNA凝胶回收试剂盒,其原理是:在凝胶融化液(Buffer DE-A)中凝胶块被迅速融化并释放出DNA。加入高离液序列溶液(Buffer DE-B)后DNA--pian断被选择性吸附到silica膜上。经Buffer W1、Buffer W2洗涤去除残留在silica膜上的杂质和高浓度盐离子后,吸附到 silica膜上的DNA--pian断经微量水或Eluent洗脱下来,即可用于各种分子生物学实验。
二.材料与方法
1 材料
PCR产物(未经纯化)
2 仪器、用具
电泳仪、电泳槽、凝胶样品梳、微波炉、台式离心机、移液器、恒温孵育器(55-65℃)、1.5ml 离心管
3 试剂
1×TAE电泳缓冲液;溴化乙锭溶液(EB)[有毒,小心操作] ;琼脂糖;6×加样缓冲液;NJ 缓冲液;DNA洗脱缓冲液;SPW洗涤缓冲液
2.4 方法
(1) 按常规方法于2%琼脂糖凝胶进行电泳。
(2) 在紫外灯下切下含有目的DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面液体。
(3) 称量凝胶重量,以1mg=1μl换算凝胶体积。
(4) 加入3个凝胶体积的NJ缓冲液
(5) 悬浮均匀后于55℃-65℃加热7min,期间每2—3min摇晃一次,直至凝胶块完全融化。
(6) 把DNA—琼脂糖溶液加到一个Mu-Pu DNA回收纯化柱上,并把柱子装在一干净的2ml收集试管内,14000rpm离心1ml,弃去流出液。对于体积大于700μl 的样品,则分别加到不同的柱子上,每次700μl。
(7) 用700μl无水乙醇稀释的SPW洗涤缓冲液洗涤柱子,加入柱子中后静置2-3min。室温下14000rpm离心1min。
(8) 弃滤液,以同样的方法再洗涤一次。
(9) 把柱子装在一个灭菌干净的1.5ml 离心管上,加入30-50μl的DNA洗脱缓冲液或无菌去离子水到柱基质上,14000rpm离心1min以洗脱出DNA。
(10) 取3μl样品,1%琼脂糖凝胶电泳检测回收结果。
注:PCR产物的纯化选用直接纯化法还是胶回收法主要取决于PCR产物。若PCR产物电泳时为单一条带,可采用直接纯化法,即将酶、dNTP等多余物质去掉便可;若PCR产物电泳时为多条带,则要根据需要回收特定条带,此时须选用胶回收法。
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