质粒DNA的提取是从事基因工程工作中的一项基本实验技术,但提取方法有很多种,以下介绍一种最常用的方法:
碱裂解法:此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。方法如下:
1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养基。
2、37℃振荡培养过夜。
3、取1.5ml菌体于Ep管,以4000rpm离心3min,弃上清液。
4、加0.lml溶液I(1%葡萄糖,50mM/L EDTA pH8.0,25mM/L Tris-HCl pH8.0)充分混合。
5、加入0.2ml溶液 II(0.2 mM/L NaOH,1% SDS),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。
6、加入0.15m1预冷溶液III(5 mol/L KAc,pH4.8),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。
7、以10,000rpm离心20min,取上清液于另一新Ep管
8、加入等体积的异戊醇,混匀后于0℃静置10min。
9、再以10,000rpm离心20min,弃上清。
10、用70%乙醇0.5ml洗涤一次,抽干所有液体。
11、待沉淀干燥后,溶于0.05mlTE缓冲液中。
煮沸法
1、将1.5ml培养液倒入eppendorf管中,4℃下12000g离心30秒。
2、弃上清,将管倒置于卫生纸上几分钟,使液体流尽。
3、将菌体沉淀悬浮于120ml STET溶液中,涡旋混匀。
4、加入10ml新配制的溶菌酶溶液(10mg/ml),涡旋振荡3秒钟。
5、将eppendorf管放入沸水浴中,50秒后立即取出。
6、用微量离心机4℃下12000g离心10分钟。
7、用无菌牙签从eppendorf管中去除细菌碎片。
8、取20ml进行电泳检查。
注意:
1. 对大肠杆菌可从固体培养基上挑取单个菌落直接进行煮沸法提取质粒DNA。
2. 煮沸法中添加溶菌酶有一定限度,浓度高时,细菌裂解效果反而不好。有时不同溶菌酶也能溶菌。
3. 提取的质粒DNA中会含有RNA,但RNA并不干扰进一步实验,如限制性内切酶消化,亚克隆及连接反应等。
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靛蓝/还原靛蓝/印地科/靛青粉/靛兰(1)/还原蓝1#/靛/纯靛/铣傻謇叮合成靛青/2,2′-双氮茚型靛/Indigo
氯化硝基四氮唑蓝/氮蓝四唑/硝基蓝四氮唑/硝基BT/氯化硝基四氮唑兰/硝基氯化四氮唑蓝/氮四唑蓝/氯化四唑氮蓝/NBT
碘硝基氯化四氮唑蓝/碘硝基四唑紫/2-(对碘苯基)-3-(对硝基苯基)-5-苯基四唑氯水合物/2-(4-碘苯基)-3-(4-硝基苯基)-5-苯基氯化四唑氯水合物/碘硝基四氮唑紫/碘硝基四唑/碘硝基紫四唑/碘硝基氯化四氮唑/氯化-2-(4-磺苯)-3-(4-硝基苯)-5-苯基-2H-四氮唑/2-(对碘代苯)-3-(对硝基苯)-5-苯基氯化四氮唑/INT
伊文斯蓝/伊文斯兰/伊文思兰/偶氮蓝/依文氏兰/依文思蓝/依文斯兰/埃文斯蓝/6,6'-[[3,3'-二甲基(1,1'-二苯基)-4,4'-二基]双(偶氮基)]双(4-氨基-5-羟基-1,3-萘二磺酸)四钠盐/4,4’双[7-(1-氨基-8-羟基-2,4-二磺基)萘-偶氮]-3,3’-联甲苯上钠盐/伊文思蓝/埃文蓝/偶氮兰/Evans blue
亚甲基蓝/次甲基兰/美蓝/美兰/亚甲蓝/品蓝/亚甲基兰/碱性蓝9/四甲基蓝/次甲基蓝/亚甲兰/碱性湖蓝BB/碱性亚甲天蓝/盐基湖蓝/盐基湖蓝BB/亚甲基天蓝/3,7-双(二甲氨基)吩噻嗪-5-翁氯化物/次甲基蓝三水/次甲蓝/甲稀蓝/氯化-3,7-双(二甲胺基)吩噻咛-5-
异硫氰酸玫瑰红B/异硫氰酸罗丹明B/罗丹明B异硫氰酸酯/若丹明B异硫氰酸酯/异硫氰酸若丹明B/RBITC
丽春红2R/罂粟红R/罂粟红2R/丽春红G/酸性猩红/酸性大红/二甲苯胺丽春红/丽春红C/4-[(2,4-二甲苯基)偶氮]-3-羟基-2,7-萘二磺酸二钠盐/酸性红26/苯偶氮-8-乙酰苯胺基-1-萘酚-3,6-二磺酸钠盐/酸性偶氮红/Ponceau 2R
丽春红S/猩红S/酸性红112/3-羟基-4-[2-磺酸基-4-(4-磺酸苯基偶氮)苯基偶氮]-2,7-萘二磺酸四钠盐/Ponceau S
油红O/1-[2,5-二甲基-4-(2,5-二甲基苯偶氮)苯偶氮]-2萘酚/苏丹红5B/溶剂红27/红油O/1-[[4-[(二甲基苯基)偶氮]二甲基苯基]偶氮]-2-萘酚/Oil red O
曙红Y(醇溶)/伊红Y(醇溶) /四溴荧光素/醇溶伊红/酸性红87/溶剂红43/曙红Y(自由酸)/伊红Y(自由酸)/ 2',4',5',7'-四溴-3',6'-二羟基螺[异苯丙呋喃-1(3H),9'(9H)-占吨]-3-酮/Eosin Y free acid alcohol soluble
曙红Y(水溶)/伊红Y(水溶) /水溶伊红/朝红/四溴荧光素二钠/曙红钠盐/四溴荧光黄/曙红变性次甲蓝/黄光曙红/曙红微黄/酸性红87/2',4',5',7'-四溴-3',6'-二羟基螺[异苯丙呋喃-1(3H),9'(9H)-占吨]-3-酮二钠盐/Eosin Y sodium salt water soluble
曙红B/伊红B/蓝光曙红/二溴二硝基荧光素二钠/4',5'-二溴-3',6'-二羟 基-2',7'-二硝基螺(异苯并呋喃-1(3H),9'-(9H)占吨)-3-酮二钠盐/酸性红91/Eosin B
虎红/玫瑰红/四氯四碘荧光素/孟加拉红/孟加拉玫瑰红B/酸性红94/Rose Bengal
刚果红/直接刚果红/煮大红/棉红/直接朱红/直接大红/二苯基-4,4′-二[(偶氮2)-1-氨基萘-4-磺酸钠]/直接红28/3,3'-[[1,1'-联苯]-4,4'-基双(偶氮)]双(4-氨基萘-1-磺酸)二钠/风果红/直接大红4B /Congo red
甲基红/甲红/烷红/甲烷红/对二甲氨基偶氮苯邻羧酸/酸性红2/2-[[4-(二甲基氨基)苯基]偶氮基]苯甲酸/MR
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