DNA ladder法检测细胞凋亡

DNA ladder法检测细胞凋亡

发生细胞凋亡时,内源性核酸酶被激活,染色体DNA链在核小体之间被切割,形成180~200个碱基或其整数倍的DNA片段,将这些DNA片段抽提出来进行电泳,可得到DNA梯状条带(DNA ladder)。


一、材料与试剂


凋亡细胞;


蛋白酶K(500μg/ml)


8mol/L 醋酸钾


白细胞裂解液:pH8.0,10mmol/L Tris-HCl,10mmol/L NaCl,10mmol/L EDTA,1% SDS。


氯仿


无水乙醇,70%乙醇;


2%琼脂糖凝胶。


二、操作步骤


1. 收集凋亡细胞:取1~2×106 个细胞,离心后,立即用70%酒精(-20℃)固定2h;


2. 洗涤:取出酒精固定的细胞,1000r/min离心5min ,去掉上清液,PBS洗二次;


3. 裂解细胞:加400μl细胞裂解液,充分混匀再加蛋白酶K100μl,置65℃水浴消化2小时或过夜;


4. 蛋白处理:加75μl 8mol/L的醋酸钾,4℃15min,再加750μl氯仿,充分混匀后,10000r/min离心10分钟后,将上清移至一新的Eppendorf管中;


5. 沉淀DNA:加入750μl无水乙醇,上下轻柔颠倒混合,即可见乳白色沉淀,若不明显时可置-20℃过夜,12000r/min离心10分钟,去上清;


6. 洗涤DNA:加1ml70%乙醇,混匀,10000r/min 离心5min,去上清;


7. 溶解DNA:根据 DAN 沉淀的大小,加一定量的蒸馏水或TE,37℃溶解;


8. 测定DNA浓度;


9. 2%琼脂糖凝胶电泳80V 2小时;


三、结果判断


出现梯状电泳条带,最小的条带为180~200 bp,其他的条带为其整倍数大小。坏死细胞则出现弥散的电泳条带,无清晰可见的条带。正常细胞DNA基因条带因分子量大,迁移距离短,故停留在加样孔附近。


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