方案摘要
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宏基因组学(Metagenomics),也称元基因组学,即“绕过对微生物个体进行分离培养,应用基因组学研究策略对自然环境/临床样本中的微生物遗传组成和群落功能进行研究”的学科。
宏基因组学(Metagenomics),也称元基因组学,即“绕过对微生物个体进行分离培养,应用基因组学研究策略对自然环境/临床样本中的微生物遗传组成和群落功能进行研究”的学科。
宏基因组二代测序技术(metagenomics next-generation sequencing, mNGS)是借助二代测序平台快速测序获得样品中的核酸序列,并进一步与各个物种的基因组序列对比,从而得知样品中微生物的种类和比例的技术,因此近年来在临床微生物检测中得到了广泛应用。
除了宏基因组检测外,液滴数字PCR (Droplet digital PCR, ddPCR) 也被用于测定病原微生物的相对丰度和/或绝对丰度,基于微流体技术,将扩增反应分离为>20 000个个体的液滴,允许同时对多达4个目标生物或基因的DNA进行绝对定量,检测限为10^(-5)相对丰度。
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