JM109感受态细胞的知识与应用及使用方法!
一、背景
JM109感受态细胞来源于E.coli K strain,是提取高质量DNA的理想菌株,recA1和endA1的突变有利于克隆DNA的稳定和高纯度质粒DNA的提取。携带hsdR17基因型背景,使得异源DNA不被内源核酸酶系统降解。laqI qZΔM15的存在使JM109可用于构建克隆,蓝白斑筛选实验;High5TM系列JM109感受态细胞经特殊工艺制作,经pUC19质粒检测转化效率可达1×109cfu/μg。
JM109感受态细胞源自于JM109,它含有T7RNA聚合酶基因的染色体拷贝。如果克隆至载体上的基因包含了核糖体结合位点,JM109(DE3)就可以对位于T7启动子下游的基因序列进行高水平的表达。但是要注意的是JM109(DE3)不能用于蓝白斑实验,JM109(DE3)采用经常使用的LB培养基,在37℃有氧的条件下培养,然后使用20%甘油,在-80℃的条件下进行菌种保藏。JM109(DE3)转化质粒采用的是42℃热激处理的方法。
二、使用方法
1、取感受态细胞置于冰浴中。一次转化感受态细胞的建议用量为50-100μl,可以根据实际情况分装使用。以下实验以50μl感受态细胞为例。
2、待感受态细胞融化后,向感受态细胞悬液中加入目的DNA(根据实际情况加入适量的DNA,通常100μl感受态细胞能够被1 ng超螺旋质粒DNA所饱和),用移液器轻轻吹打混匀,冰浴30分钟。
3、42℃热击90秒,迅速将离心管转移到冰浴中,冰上静置2-3分钟。
4、每个离心管中加入450μl无菌的SOC或LB培养基(不含抗生素),混匀后置于37℃摇床,150 rpm振荡培养45分钟使菌体复苏。
5、根据实验需求,取适量已转化的感受态细胞,加到含相应抗生素的SOC或LB固体琼脂培养基上,用无菌的涂布棒将细胞均匀涂开,将平板置于37℃直至液体被吸收,倒置培养,37℃培养12-16小时。
三、应用
用于OATP-B和OATP-D的mRNA及其蛋白在肺癌中表达的定量研究及意义研究:
建立用荧光定量RT—PCR法检测肺癌组织中人类有机阴离子转运多肽(organic anion transporting polypeptide,OATP)B和D mRNA的表达,并用免疫组化及图像分析技术定量分析肺癌组织中蛋白表达水平,分析其mRNA及蛋白表达与病理分型等临床资料的关系。
方法:
1、荧光定量PCR标准曲线的建立及优化:(1)组织总RNA提取:用Tiozol试剂分别提取不同病理分型肺癌组织和正常肺组织中的总RNA。(2)cDNA的合成:以所提取的组织的总RNA为原料进行逆转录反应,获得cDNA。(3)PCR反应及重组质粒的构建:以逆转录的cDNA为模板,进行普通PCR扩增。扩增后的PCR产物用琼脂糖凝胶回收法进行纯化。用PGEM-T Easy质粒载体连接PCR纯化产物,构建重组质粒。将重组质粒转化大肠杆菌JM109感受态细胞,蓝白斑筛选重组质粒。(4)标准曲线的建立及优化:优化荧光定量PCR体系和条件,以重组质粒为标准品建立检测OATP mRNA的标准曲线,并以此对40例肺癌标本中OATP-B和OATP-D mRNA的含量进行测定。
2、免疫组化:采用链霉亲和素—过氧化酶法(S—P法),DAB显色液显色,以抗OATP-B和抗OATP-D为一抗,PBS作为阴性对照,鉴定肺癌中OATP-B和OATP-D蛋白的表达。用IPP4.0图像分析软件对免疫组化结果进行分析。
3、临床资料分析:结合临床资料,分析OATP-B和OATP-D的mRNA及蛋白表达与病理分型、性别、年龄、肿瘤大小以及有无淋巴结转移等的关系。
4、统计学分析:采用SPSS11.5统计学软件包对所得实验数据进行统计学分析,实验数据均用(?)±S表示,多组均数间的比较采用方差分析,多组均数间的两两比较采用q检验。P<0.05,差异有统计学意义。
结果:构建了OATP基因的重组质粒,并且成功转化大肠杆菌JM109感受态细胞,经蓝白斑筛选提取重组质粒,对质粒进行梯度稀释,以稀释的质粒为模板优化荧光定量PCR体系和条件,建立定量检测OATP-B和OATP-D mRNA的荧光定量PCR体系。荧光定量PCR结果显示,OATP-B和OATP-D的mRNA在不同病理分型肺癌中表达上调,P<0.05,差异有统计学意义;OATP-B和OATP-D的mRNA在有无淋巴结转移肺癌中的表达差异有统计学意义,P<0.05。免疫组化法显示,与正常肺组织相比,OATP-B和OATP-D蛋白在不同病理分型肺癌中高表达,P<0.05,差异有统计学意义;OATP-B和OATP-D蛋白在有淋巴结转移肺癌中的表达明显无高于淋巴结转移肺癌,P<0.05,差异有统计学意义。OATP-B和OATP-D的mRNA及其蛋白在不同病理分型、性别、年龄及不同大小肺癌标本间的表达无统计学差异,P>0.05。
结论:
1、建立并优化检测OATP-B和OATP-DmRNA表达的荧光定量PCR体系。
2、OATP-B和OATP-D的mRNA及其蛋白在不同病理分型肺癌及淋巴结转移肺癌中均高表达;OATP-B和OATP-D的mRNA及其蛋白的表达与肺癌标本的不同病理分型、性别、年龄及大小无关。提示OATP-B和OATP-D在肺癌的发生、发展中发挥了重要作用,一方面可能为肿瘤发生及药物治疗的分子机制提出新的理论,另一方面为其他肿瘤多种基因的大规模临床检测提供了迅速可靠的mRNA荧光定量方法。
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