Top-down Proteomics: Proteoform Identification and Quantification (整体蛋白质组学:蛋白质变体的鉴定与定量)

基于串联质谱数据的蛋白质鉴定技术是目前蛋白质组学的应用基础,然而,目前广泛采用的Shotgun(或称为Bottom-up)策略本质上是直接鉴定肽段而不是蛋白质,从肽段到蛋白质的推断带有复杂的不确定性问题,导致蛋白质的鉴定经常出现不可靠的问题。对应地,基于整体蛋白质(Top-down)的鉴定策略则不经过酶切,直接质谱分析完整的蛋白质,或更准确地说是“蛋白质变体(Proteoform)”。本报告将系统介绍整体蛋白质鉴定的基本特点,质谱分析方法与难点,常用软件工具,我们自己开发的软件性能评估,以及定量和应用等具体内容,为蛋白质分析提供新的思路和技术方法支持。

277 2022-03-11
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