机器学习多组学数据发现基因5hmC丢失促进肾癌的发生发展--仪器信息网3i讲堂

机器学习多组学数据发现基因5hmC丢失促进肾癌的发生发展

5-甲基胞嘧啶（5mC）及其氧化形式的 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）均被认为参与肿瘤的发生发展。通过BS-seq和TAB-seq技术，在单核苷酸分辨率下，研究肾透明细胞癌中5mC和5hmC的变化规律，将有助于揭示肾透明细胞癌发生发展的机制以及可能的药物靶点。与匹配的正常组织相比，5hmC在全球范围内几乎在所有肾肿瘤组织中都丢失了，特别是在基因体区域。肿瘤组织中 5hmC 水平是肾癌的独立预后标志物，而且5hmC 水平较低的患者总生存期较短。