能量代谢分析

[size=15px][color=#595959]近年来，[b]淋巴脉管系统[/b]和淋巴运输在胃肠道疾病中的作用受到越来越多的研究关注，淋巴[/color][/size][b][size=15px][color=#595959]畸形[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]和淋巴结重塑已被认为是许多胃肠道疾病的标志。此外，胃肠道淋巴引流受损和[b]淋巴淤滞[/b]会阻碍大分子、死细胞和病原体离开肠道的清除，从而加剧感染并延迟[/color][/size][b][size=15px][color=#595959]免疫[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]反应。[/color][/size] [size=15px][color=#595959]近年来，肠道和肠系膜淋巴管在肠道疾病，特别是炎症性肠病(IBD)中的作用已被广泛研究。然而，对[b]胃淋巴管(GLVs)[/b]的研究一直落后于胃肠学本身的发展。虽然最早对[b]胃淋巴泵(GLP)[/b]的可视化研究可以追溯到Nagata和Guth在1984年的报告，但在随后的40年里，关于GLP在胃疾病中的作用以及针对GLP的药物的报道很少。[/color][/size] [b][size=15px][color=#595959]半夏泻心汤(BXD)[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959]出自《伤寒论》，在现代医学实践中被广泛应用于治疗各种肠胃疾病，对[b]应激性胃溃疡(SIGU)[/b]等多种胃肠道疾病有明确的治疗效果，但对胃淋巴泵(GLP)的影响尚不清楚。[/color][/size] [size=15px][color=#595959]阐明GLP在SIGU和BXD治疗中的作用，探讨GLP调控的分子机制。 [/color][/size] [size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959]对SIGU大鼠模型进行体内GLP显像，评价淋巴动力学参数。采集胃窦组织及血清进行宏观、组织病理学及溃疡参数分析。收集胃淋巴管(GLV)组织进行RNA-Seq检测。从RNA-Seq结果中筛选差异表达基因(DEGs)并用于转录组学分析。采用qRT-[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]和WB检测关键DEGs及其衍生蛋白。 [/color][/size] [size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959]SIGU大鼠GLP明显受到抑制。[b]BXD能恢复GLP，改善胃淋巴淤积，减轻溃疡损害[/b]。GLV转录组分析显示，上调的DEGs集中在[b]平滑肌收缩信号通路[/b]，下调的DEGs集中在能量代谢通路，尤其是脂肪酸降解通路，说明BXD可以促进淋巴平滑肌收缩，调节能量代谢，减少脂肪酸降解。这些机制最有可能的目标是驱动GLP的[b]淋巴平滑肌细胞(LSMCs)[/b]。qRT-[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]和WB对关键基因和蛋白水平的评估进一步验证了这一推测。[/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size] [color=#3573b9]结论[/color][b][size=15px][color=#595959][/color][/size][/b][font=mp-quote, -apple-system-font, BlinkMacSystemFont, &][size=15px][color=#595959][/color][/size][/font] [b][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][/b][font=&][size=16px][color=#232323][/color][/size][/font][b][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][/b][font=&][size=16px][color=#232323][/color][/size][/font][size=15px][color=#595959][font=&][/font][font=&][/font][/color][/size][b][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][/b][font=&][size=16px][color=#232323][/color][/size][/font][b][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959]BXD通过激[/color][/size][/b][size=15px][color=#595959][b]活平滑肌收缩信号通路，恢复能量供应，调节能量代谢程序，减少脂肪酸降解，有效回收GLP，减轻胃内炎症细胞因子和代谢废物的积累[/b]，是其治疗SIGU的重要作用机制。[/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size][font=&][size=16px][color=#232323][/color][/size][/font][size=15px][color=#595959][/color][/size][size=15px][color=#595959][/color][/size]

日前，在国际生命科学学会中国办事处主办的学术论坛上，美国加州巴旦木商会首席科学家Karen Lapsley（凯伦·来普斯利）博士发布了美国农业部农业研究服务局的一研究中心对能量代谢研究的新成果。日前，在国际生命科学学会中国办事处主办的学术论坛上，美国加州巴旦木商会首席科学家Karen Lapsley（凯伦·来普斯利）博士发布了美国农业部农业研究服务局的一研究中心对能量代谢研究的新成果。该研究通过人体代谢实测的方法替代传统计算的方法发现，以美国巴旦木为代表的质地较硬、富含膳食纤维和脂肪的坚果食物，其实际可吸收的能量值低于通过计算标注在营养标签上的理论值。美国巴旦木的可吸收能量比理论能量值低约20%,开心果的可吸收能量比理论能量值低约5%.这为同等能量下食用坚果有利于控制体重提供了技术依据。 Karen Lapsley博士介绍说，目前食物的能量值依然沿用100年前Wilbur Atwater（韦伯·阿特沃德）提出的经典的热能系数来计算获得，即先检测食物中供能营养素的含量，再根据每克碳水化合物产能4千卡、每克蛋白质产能4千卡、每克脂肪产能9千卡来计算总能量。2003年FAO/WHO（世界粮农组织/世界卫生组织）更新了膳食纤维的产能吸收，不同于普通的碳水化合物，其每克产能系数为2千卡。例如：每盎司（28克）巴旦木含14克脂肪，6克总碳水化合物（其中3克为膳食纤维）含6克蛋白质，计算能量值为168千卡。但Atwater能量值是按照食物热能完全燃烧利用来计算的，但食物营养的消化吸收过程并不是百分百有效的，未被吸收的能量会随粪便流失，这对质地坚硬、富含膳食纤维的食物来说，表现得更为明显。 为确切了解没被吸收的能量有多少，美国农业部农业研究服务局贝尔茨维尔人类营养研究中心于2012年8月研究了人体摄入美国巴旦木后实际获得的能量。据该实验主持研究人员大卫·拜尔博士介绍，实验是用进食总能量减去受试者粪便、尿液中的能量获得的有效代谢能量。实验结果表明，每盎司美国巴旦木（约28克）被人体吸收的能量为129千卡，比传统认为的168千卡的数值低20%.这一结果解释了为什么研究发现吃巴旦木不会导致肥胖而是会有利于控制体重。研究人员说，不同的坚果具有不同的供能营养素构成，能量可代谢的系数也不同。同时研究的开心果的可代谢能量比理论值低5%-10%. Karen Lapsley博士告诉记者，高膳食纤维食品的人体吸收比例是一个非常活跃的研究领域，全球有很多研究机构在进行这一领域的研究，主要的研究团体在新西兰，今年10月份将在澳大利亚召开一个专门讨论这一课题的学术会议。除了巴旦木，有些高膳食纤维且能量密集的植物性食品如芝麻，据分析其可代谢能量比例也会较低。目前，美国加州巴旦木商会已经向美国FDA提出了申请，希望修改相关营养标签上的标注，至今已完成第一轮磋商，进入由美国FDA主导的政府实验室试验验证阶段。 美国塔斯夫大学奥利弗·陈博士表示，该能量代谢研究结果也提示消费者，吃坚果最好带皮吃，因为坚果种皮正是膳食纤维和具有抗氧化功能的多酚物质富集的部位。

化学反应过程中的能量以光的形式释放出来，成为化学发光，有些生物体在能量代谢的过程中通过消耗ATP也可发光，为生物发光。化学发光 常用物质包括二氧乙烷衍生物、鲁米诺及衍生物、和丫啶酯。这些试剂可用于各种标本分析、HPLC检测和流动注射分析系统。二氧乙烷衍生物在碱性磷酸酶的作用下水解，形成一种高能量的中间体，这种中间体进一步分解后释放出光子，此类有代表性的物质是AMPPD和CSPD。此方法最为广泛的应用是基于碱性磷酸酶和β半乳糖苷酶的分析系统。碱性磷酸酶（AP）的测定 检测AP，β-葡糖苷酸酶活性的方法是使用一种有商品供应的稳定的1，2-二氧乙烷衍生物，这种发光底物的发光时间为数分钟至数小时。发光强度直接与酶的浓度相关。这种底物可用于1) 微孔板的免疫分析，DNA 探针捕获法和报告基因分析法, 2) 用于蛋白质和核酸分析的96-孔斑点膜。鲁米诺 是一种最古老的和最常用的试剂，在碱性条件下可被过氧化物氧化，同时发光，鲁米诺和过氧化物之间的氧化还原反应需要催化剂，这种催化剂一般为多价金属离子、过氧化物酶如铁、辣根过氧化物酶等，此种方法常用于检测过氧化物、重金属、过氧化物酶的含量，以及由此衍生的检测自由基、进行毒物分析和基于过氧化物酶和葡萄糖氧化酶的分析方法。丫啶酯及衍生物 在碱性条件下可产生瞬时发光，将其作为标记物，已广泛用于免疫分析和分子杂交。

病毒与宿主免疫系统的关系就像罪犯与警察。病毒必须寄生在宿主细胞中，宿主细胞为了应对病毒的感染，会激活免疫系统来杀伤病毒。病毒为了自己的存活，进化了多种逃逸免疫系统的机制。近年来，免疫细胞代谢的调控成为研究热点，安捷伦Seahorse技术能够实时检测代谢状态，在免疫学研究的各个方面都有着广泛的应用。本次讲座将为大家介绍Seahorse在抗病毒免疫研究中的应用。[size=18px][b]讲师介绍：[/b][/size][b]范家栋[/b]:武汉大学生命科学学院博士，纽约大学、美国国立健康研究所博士后。博士阶段师从吴旻教授，研究方向为表观遗传学与细胞信号转导通路。博士后阶段研究膀胱癌、乳腺癌的分子机制。现任职于安捷伦科技（中国）有限公司，担任Seahorse细胞能量代谢分析系统的技术支持。[size=18px][b]会议时间：[/b][/size]2月26日 10:00[b][size=18px]报名地址[/size][/b]：[url]https://www.instrument.com.cn/webinar/meeting_10399.html[/url]

北京华威中仪科技代理的由美国Seahorse Bioscience 公司最新研发的XF生物能量测定仪(细胞代谢呼吸动态分析仪)XF extracellular analyzer是世界首创使用24孔及96孔微孔盘为平台，采用无损伤专利固态探针侦测技术即时同步侦测有氧呼吸O2(OCR)以及糖酵解作H+(OCAR)、 CO2产率(CDPR)的动态分析仪，透过此系统的协助，研究者得以更快的速度、更简易的设计了解细胞以及线粒体如何运用不同的受质作为能量的来源、评估疾病与氧代谢及线粒体运作状态之交互作用、分析代谢调节药物对于生理的效应、建立细胞品管系统、快速筛选出具开发潜力之药物及药物毒性评估等多种不同应用。此系统现已被广泛应用于免疫学、药物筛选、肝脏及外源性毒理、糖尿病及肥胖症、老化、干细胞、细胞生理、药物转化等各个领域，哈佛大学等名校已借助该系统在nature、cell上发表文章几十篇，其他SCI高影响因子文章200多篇，现在就拥有Seahorse Bioscience 公司的细胞代谢呼吸动态分析仪，领先下一个细胞与线粒体研究的黄金十年。

[b]职位名称：[/b]分析类产品销售经理[b]职位描述/要求：[/b]华威中仪是一家专业的实验室设备集成商，多家国际一线品牌科研仪器设备销售商、业务范围包含科研设备的销售及货物的进出口。用户涵盖科研单位、国家、检测机构、教学、医学、生物企业等。产品：奥地利OROBOROS O2K细胞能量代谢分析系统 探索生命的力量岗位职责：1.负责区域内用户开发和维护；2.市场推广、组织科室会/产品讨论会等；3.项目跟踪、把控等销售相关业务；任职资格：1.生物化学、医学实验技术、运动医学、市场营销等相关专业，本科以上学历；2.较强的沟通能力，责任感，团队精神，主观能动性强；4.有仪器销售相关经验优先录用；[b]公司介绍：[/b] 奥地利 TG 公司-提供全球顶级的免疫组化、免疫荧光单细胞定量分析平台，该设备是一款融合流式细胞术及免疫组织学技术为一体的高科技产品，实现了科学界有史以来第一 次对组织细胞中单个细胞（细胞质、细胞核、细胞膜等）进行鉴定和 RNA、 DNA、蛋白的定量分析。该技术已成功的应用到癌症、发育生物学、代谢生理学、免疫学、皮肤学、泌尿学、药物研发及临床诊断等研究领域，并在哈佛大学、海 德堡大学等诸多...[url=https://www.instrument.com.cn/job/user/job/position/59942]查看全部[/url]

~@IxHc% 本书原著由代谢工程领域从事多年研究工作的国外专家撰写，是剑桥大学的权威参考书之一，现在由国内从事相关工作的学者翻译成中文。系统介绍代谢工程的建模方法与优化技术，检验了代谢途径操作的研发策略，验证了系统模型有效的必要性，讨论了模型的设计和分析，重点则是在优化上。作者还阐述了生化系统理论中的幂定律模型和方法，由基本原理导出概念，汇集了大量的图片与研究实例。 B*2peE 本书的读者首推生物工程、生化工程、发酵工程、生物科学和生物技术等专业的高年级本科学生和研究生，可以成为他们了解代谢工程和从事相关研究时的参考书或教材，也可供从事代谢工程研究的相关领域专家、学者阅读和参考。MS 质谱.用于同位素示踪分析.我们试验室将使用代谢工程结合同位素,对红霉素进行途径分析. FKz+xmJq MFA最关键的是建模型(代谢途径),而用matlab进行矩阵计算很方便正如细履平沙所言，代谢流分析的关键在于建立基于物料衡算和反应方程的化学计量学的代谢通量平衡模型，结合同位素示踪分析（与HPLC/MS/MS联合使用）的实验结果，得到中间代谢产物的通量，进而通过matlab[font=

请教一下，动物代谢组学分析，[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]液质联用[/color][/url]。用的是小鼠的血清，进色谱分析，再打质谱，为什么有些要研究的物质在谱图上找不到呢？是不是在代谢中，含量太少了？还是血清中的物质太多了，目标物质信号被覆盖？要如何解决呢？用的是full ms/dd ms2[img=,690,885]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2021/05/202105041308215017_7339_5232559_3.png[/img][img]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2021/05/202105041308217876_3479_5232559_3.png[/img][img=,690,429]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2021/05/202105041309199549_3655_5232559_3.png[/img]

清华大学药学院代谢分析与疾病代谢实验室主要从事基于质谱平台的新型代谢分析技术（代谢组学和代谢流分析）的发展，及其在转化医学和药物研发领域的应用；以及疾病（主要是肿瘤、神经退行性疾病、感染性疾病）及其相应治疗的代谢分子机制研究。　　现招聘质谱分析、代谢组学和代谢流分析博士后和实验员多名。　　博士后：质谱分析、代谢组学和代谢流分析　　岗位职责：负责代谢相关课题的实验设计和具体操作实施、数据收集与整理、论文撰写等一系列研究工作。　　职位要求：　　1. 具有分析化学、化学工程、生物工程等相关专业的或博士（博士后）或硕士学位（研究助理），熟练掌握小分子化合物的质谱分析（包括高分辨质谱和三重四级杆质谱）技术；　　2. 具有代谢组学和代谢流分析的相关实验和数据分析经验；　　3. 具有强烈进取心，对疾病（主要是肿瘤、感染性疾病、心血管疾病、脑科学及神经退行性疾病）及其相应治疗的代谢分子机制研究有兴趣，具有独立开展科研课题的能力；　　4. 具有生物信息学或分子生物学研究经验的优先考虑；　　5. 具有较强的学习能力、工作责任心和积极性、沟通能力和团队合作精神；　　6. 有一定的英语读写能力。　　实验员2-3名　　岗位职责：负责代谢组学分析方法的建立，并负责/协助代谢相关课题的实验设计和具体操作实施、数据收集与整理、论文撰写等一系列研究工作。　　职位要求：　　1. 具有生物学、医学或化学等相关专业本科学历或硕士学位；　　2. 掌握基本的分子生物学知识和技术；　　3. 具有质谱分析化学背景，尤其是小分子代谢物分析和代谢组学研究经验者优先考虑；　　4. 工作细心，积极主动，具有较强的工作责任心、学习能力、沟通能力和团队合作精神；　　5. 能够尽快到岗工作；　　工资待遇：　　该岗位享受清华大学非事业编制人员待遇，按照清华大学合同制人员的相关规定办理，具体待遇面议。　　简历投递地址：http://www.instrument.com.cn/job/IU_job_index.asp?ID=RC109193

清华大学药学院代谢分析与疾病代谢实验室主要从事基于质谱平台的新型代谢分析技术（代谢组学和代谢流分析）的发展，及其在转化医学和药物研发领域的应用；以及疾病（主要是肿瘤、神经退行性疾病、感染性疾病）及其相应治疗的代谢分子机制研究。 　　现招聘质谱分析、代谢组学和代谢流分析博士后和实验员多名。 　　博士后：质谱分析、代谢组学和代谢流分析 　　岗位职责：负责代谢相关课题的实验设计和具体操作实施、数据收集与整理、论文撰写等一系列研究工作。 　　职位要求： 　　1. 具有分析化学、化学工程、生物工程等相关专业的或博士（博士后）或硕士学位（研究助理），熟练掌握小分子化合物的质谱分析（包括高分辨质谱和三重四级杆质谱）技术； 　　2. 具有代谢组学和代谢流分析的相关实验和数据分析经验； 　　3. 具有强烈进取心，对疾病（主要是肿瘤、感染性疾病、心血管疾病、脑科学及神经退行性疾病）及其相应治疗的代谢分子机制研究有兴趣，具有独立开展科研课题的能力； 　　4. 具有生物信息学或分子生物学研究经验的优先考虑； 　　5. 具有较强的学习能力、工作责任心和积极性、沟通能力和团队合作精神； 　　6. 有一定的英语读写能力。 　　实验员2-3名 　　岗位职责：负责代谢组学分析方法的建立，并负责/协助代谢相关课题的实验设计和具体操作实施、数据收集与整理、论文撰写等一系列研究工作。 　　职位要求： 　　1. 具有生物学、医学或化学等相关专业本科学历或硕士学位； 　　2. 掌握基本的分子生物学知识和技术； 　　3. 具有质谱分析化学背景，尤其是小分子代谢物分析和代谢组学研究经验者优先考虑； 　　4. 工作细心，积极主动，具有较强的工作责任心、学习能力、沟通能力和团队合作精神； 　　5. 能够尽快到岗工作； 　　工资待遇： 　　该岗位享受清华大学非事业编制人员待遇，按照清华大学合同制人员的相关规定办理，具体待遇面议。 　　简历投递地址：http://www.instrument.com.cn/job/IU_job_index.asp?ID=RC109193

[font=宋体][size=15px]发热是多种疾病急性期的主要病理生理反应之一，体温过高可导致脑组织损伤、免疫反应异常等多种不良后果。连翘为连翘科植物连翘的干燥果实，临床上长期用于治疗感冒或流感引起的发热。连翘是双黄连口服液、清热解毒口服液、连翘口服液、银翘解毒颗粒等中药制剂的主要原料。连翘苷（Phllyrin，Phr）是连翘中的主要有效成分,在体内可代谢为连翘皂苷（Phg）、Phg-磺酸盐（Phg-S）和Phg-葡萄糖醛酸（Phg-G）等,具有解热作用，但Phr及其代谢物的解热作用机制尚不明确。[/size][/font] [size=15px][font=宋体]2024年8月22日，南开大学药学院白钢/姜民团队在Phytomedicine上发表了题为“Phillyrin and its metabolites exert antipyretic effects bytargeting the NAD+ binding domain of GAPDH, MDH2 and IDH2”的文章，[/font][/size][font=宋体][size=15px]发现连翘主要药效学成分Phr有显著的解热作用，且Phr的解热作用与其代谢物Phg靶向甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）、苹果酸脱氢酶2（MDH2）和异柠檬酸脱氢酶2（IDH2）的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD+）结合域，抑制其酶活性。 [size=15px][b]1、Phr对肺炎发热小鼠模型具有抗炎、解热作用[/b][/size][size=15px][b][/b][/size] [font=宋体]作者首先通过鼻内滴注LPS诱导的小鼠肺炎发热模型中验证了Phr的解热作用。结果显示，LPS诱导的小鼠体温明显升高，而阿司匹林和Phr有效地抑制LPS诱导的体温升高。此外，阿司匹林和Phr显著增强了发热小鼠肝脏温敏探针的荧光强度（荧光强度与温度成反比），表明阿司匹林和Phr减少了发热状态下的肝脏产热。作者还发现Phr和阿司匹林在LPS诱导的肺炎发热模型中显示出较强的抗炎作用，表现为炎症细胞浸润减少，肺损伤评分降低，肺系数和肺W/D重量比增加。这些结果表明Phr在体内具有显著的解热和抗炎作用。[/font] [/size][/font][align=center] [/align] [size=15px][b][font=宋体]2[/font][font=宋体]、Phr的解热作用可能与其主要代谢产物Phg作用于GAPDH、IDH2和MDH2有关[/font][/b][/size][size=15px][b][font=宋体][color=#0070c0][/color][/font][/b][/size] [font=宋体][size=15px]作者发现Phr在体内主要代谢为Phg、Phg-s和Phg-g。通过使用线粒体温敏探针分析了Phr及其代谢物对细胞线粒体温度的影响，证实Phr及其代谢产物在一定浓度下有效地抑制了线粒体温度，但是0.1μM Phg仍对线粒体温度有显著的抑制作用，而相同浓度的Phg-s和Phg-g均无抑制作用，提示Phg可能是Phr发挥解热作用的主要活性形式。[/size][/font] [font=宋体][size=15px]为了鉴定Phr体内解热作用的靶蛋白，作者合成了Phr的主要活性解热代谢产物Phg的炔基探针，通过Pulldown+MS初步鉴定出47个蛋白质为Phg的潜在靶点，鉴于能量代谢是体内产热的主要途径之一，进一步对捕获的蛋白质和能量代谢相关基因进行交集，发现其中GAPDH、MDH2、IDH2蛋白与能量代谢相关。通过WB、细胞共定位分析、竞争分析验证了Phg与三个靶蛋白的结合。综上所述，Phg是Phr发挥解热作用的主要活性形式，其解热作用可能与Phg靶向GAPDH、MDH2和IDH2蛋白，进一步调节能量代谢，影响产热有关。[/size][/font] [align=center] [/align] [size=15px][b][font=宋体]3[/font][font=宋体]、Rossmann折叠被确定为Phg靶向GAPDH, IDH2和MDH2的结合口袋[/font][/b][/size][size=15px][b][font=宋体][color=#0070c0][/color][/font][/b][/size] [font=宋体][size=15px]为了确定Phg与GAPDH, IDH2和MDH2的结合机制，作者从蛋白质的结构-功能分析开始，并使用目标蛋白的天然底物和配体干扰目标蛋白被Phg捕获。结果显示，NAD+依赖的GAPDH、MDH2、IDH2酶活性测定表明，Phg竞争性抑制了参与NAD+的GAPDH、MDH2、IDH2酶活性，并通过分子对接分析了结合模式。GAPDH, MDH2和IDH2是核苷酸结合酶，它们的蛋白质结构包含辅酶NAD+结合口袋，称为Rossmann折叠。因此，作者推测Phg可能与NAD+竞争，与这些靶蛋白的Rossmann折叠结合，从而抑制其活性。 [/size][/font] [size=15px][b][font=宋体]4[/font][font=宋体]、Phg非共价结合于GAPDH的Asp35和Asn316残基，并竞争性占据NAD+的Rosmann折叠结构域[/font][/b][/size][size=15px][b][font=宋体][color=#0070c0][/color][/font][/b][/size] [font=宋体][size=15px]Rossmann折叠由两个重复的β-α-β-α-β拓扑结构组成，NAD+和Rossmann折叠中的氨基酸残基之间的氢键相互作用诱导GAPDH的构象变化。为了进一步验证Phg与NAD+竞争结合靶蛋白的Rossmann折叠的假设，作者以GAPDH蛋白为例，对比分析了NAD+和Phg与GAPDH蛋白的相互作用。通过圆二色谱实验、FQ实验、SPR分析、分子对接分析、fit实验、蛋白点突变实验证实Phg通过结合GAPDH的rosman折叠中的Asp35和Asn316残基，竞争性地抑制了NAD+与GAPDH的结合，从而抑制了目标蛋白的酶活性。 [/size][/font] [size=15px][b][font=宋体]5[/font][font=宋体]、Phg通过靶向GAPDH、MDH2和IDH2影响细胞能量代谢[/font][/b][/size][size=15px][b][font=宋体][color=#0070c0][/color][/font][/b][/size] [font=宋体][size=15px]作者进一步研究了Phg对GAPDH, MDH2和IDH2酶活性的影响，发现Phg抑制了细胞中三种酶的活性。GAPDH、MDH2和IDH2参与了能量代谢途径中TCA过程。因此，作者通过代谢组学检测了phg对TCA代谢的影响，发现相关代谢物显著变化，进一步结合线粒体应激实验证实Phg靶向GAPDH、MDH2和IDH2来抑制TCA和OXPHOS过程，从而减少线粒体的能量和产热。 [/size][/font] [size=15px][b][font=宋体]6[/font][font=宋体]、Phr通过作用于GAPDH、MDH2和IDH2发挥体内解热和抗炎作用[/font][/b][/size][size=15px][b][font=宋体][color=#0070c0][/color][/font][/b][/size] [font=宋体][size=15px]作者进一步验证Phr的体内解热抗炎作用是否与GAPDH、MDH2、IDH2的靶向作用有关。酶活性检测显示，肺炎发热模型小鼠血清中GAPDH、MDH2和IDH2的酶活性显著升高，而Phr显著抑制了这三种蛋白酶活性的升高。此外，模型小鼠血清中由这三种蛋白调节的NAD+/NADH比值显著降低，ATP含量显著升高，而Phr有效地逆转了这两项指标的变化。这些结果表明，Phr对肺炎发热模型小鼠的体内解热作用与其主要代谢产物Phg密切相关，Phg靶向作用于GAPDH、MDH2和IDH2，影响能量代谢通路。[/size][/font] [font=宋体][size=15px]作者进一步阐明了Phr在肺炎发热小鼠模型中的抗炎机制。免疫荧光定位分析显示，Phg特异性靶向肺炎热小鼠肺组织中的肺巨噬细胞，提示巨噬细胞可能是其在体内发挥抗炎作用的靶细胞。。除参与能量代谢途径外，作者发现GAPDH还可通过多种途径直接或间接影响TNF-α、il-1β、IL-6等炎症因子的产生，并与其酶活性呈正相关。提示Phr在肺炎小鼠体内的抗炎作用可能与其代谢产物Phg特异性靶向肺巨噬细胞中GAPDH，抑制其酶活性，从而抑制相关炎症因子的产生有关。 [/size][/font] [size=15px][b][font=宋体]7[/font][font=宋体]、Phg和Phg-s是Phr在体内作用于GAPDH、MDH2和IDH2的主要活性形式[/font][/b][/size][size=15px][b][font=宋体][color=#0070c0][/color][/font][/b][/size] [font=宋体][size=15px]由于Phg-S和Phg-G也是Phr在体内的主要代谢产物，作者进一步通过体外蛋白-分子相互作用实验验证它们是否也能靶向GAPDH、MDH2和IDH2。通过SPR证实Phr及其代谢产物与3种蛋白的结合顺序为PhgPhg-sPhr,Phg-g未与3种蛋白中的任何一种结合。FTS检测结果显示Phr及其代谢产物提高了GAPDH、MDH2和IDH2的热稳定性，Phg和Phg-s的作用比Phr和Phg更强。体外酶活性检测显示，Phg和Phg-s对GAPDH、MDH2和IDH2的酶活性有明显的抑制作用，而Phr和Phg-g对这3种蛋白的酶活性没有抑制作用。结果表明Phg和Phg-s可能是Phr在体内靶向GAPDH, MDH2和IDH2的主要活性形式。[/size][/font] [align=center] [/align] [size=15px][b][font=宋体]总结[/font][/b][/size][size=15px][b][font=宋体][color=#0070c0][/color][/font][/b][/size] [font=宋体][size=15px]研究阐明了调节能量代谢可通过减少能量供应和调节发热相关炎症因子发挥解热作用，发现连翘主要药效学成分Phr的解热作用与其代谢产物Phg和Phg-s有关，Phg和Phg-s作用于GAPDH、IDH2和MDH2的NAD+结合域，从而抑制酶活性和能量代谢。本研究为改善发热的治疗提供了新的视角。主要内容如下：[/size][/font] [font=宋体][size=15px]Phr在脂多糖诱发的发热小鼠模型中表现出明显的解热和抗炎作用。Phg可逆性靶向甘油醛-3-磷酸脱氢酶 (GAPDH)、苹果酸脱氢酶 2 (MDH2) 和异柠檬酸脱氢酶 2 (IDH2) 的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NAD+)结合域，抑制其酶活性。对细胞代谢组学和线粒体应激测试的深入分析表明，Phg抑制 GAPDH、MDH2 和 IDH2 酶活性导致糖酵解、三羧酸循环和氧化磷酸化信号通路调节的细胞能量供应和产热减少。此外，Phg特异性靶向巨噬细胞，通过下调GAPDH酶活性抑制 LPS 诱导的巨噬细胞活化，从而发挥抗炎作用。体内实验也证实，Phr在LPS诱导的发热模型小鼠中的解热作用与其主要代谢产物Phg和Phg-磺酸盐（Phg-S）有关，它们直接靶向作用于GAPDH、IDH2、MDH2的NAD +结合域，抑制这些酶的活性，从而减少能量供应，调节发热相关的炎症因子。[/size][/font][font=宋体][size=15px]连翘苷(Phr)的解热机制与其主要代谢产物连翘苷(Phlygenin)靶向作用于GAPDH、MDH2和IDH2的NAD+结合域，减少能量供应，调节发热相关炎症因子有关。[/size][/font]

[color=#444444]最近用maldi-TOF MS做的数据，是分析铜绿微囊藻在不同处理条件下的代谢物质变化，了解到产脂肪酸、烃类、脂质类等类的物质，得到的质谱峰比较多，怎样确定这种藻产的代谢物质是什么呢[/color]

光源能量的变化对NIR分析有哪些影响， 哪位朋友用NIR分析有机物分子量的有吗？

[color=#444444]目前在做[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质联用[/color][/url]分析真菌代谢组差异的实验。大体步骤如下：[/color][color=#444444]培养真菌细胞，菌体离心，液氮研磨破碎细胞得到菌粉，用纯甲醇萃取细胞代谢物3次合并萃取物，空离心浓缩仪中烘干，甲氧胺盐酸盐和N-甲基-N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺(MSTFA)衍生化，然后进行[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质联用[/color][/url]分析[/color][color=#444444]目前问题：[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url]图谱峰较少（大概25个峰左右），适当修改分液比提高浓度还是不行，有的峰面积很大，衍生化产物（硅化物）出现，说明衍生化彻底，但就是不知道为啥代谢物种类这么少。我看别人文献[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质联用[/color][/url]分析代谢组能出峰200多个，最后最少可以挑选差异大的70-80个峰没问题，请各位做过相关研究的帮分析下出出主意，谢谢啦！！！！[/color][img=,absmiddle]http://muchongimg.xmcimg.com/data/emuch_bbs_images/smilies/rolleyes.gif[/img][img=,absmiddle]http://muchongimg.xmcimg.com/data/emuch_bbs_images/smilies/cry.gif[/img]

我想做半定量分析，现在急需一款半定量分析软件，大家能不能介绍一下对于能量色散半定量分析的软件呢？

UV能量计的测量原理及分析UV能量计测量方案主要有两种不同的方案：1) 单芯片集成测量方案2）智能单片机采集方案对于单芯片集成测量方案，不需要程序设计，直接用传感器加可调电阻，组成了模拟信号的输入。只能显示通过调节可调电阻，单液晶显示最终的能量值。一般采用段码式液晶。这种方案的优点是设计简单，缺点是准确度不够，只能显示能量值，不能显示功率值。智能UV能量计方案的测量原理，首先通过ADC模数转换芯片，将紫外探测器的弱电流信号转换为数字信号，然后单片机采集到数字信号，通过软件调校，首先测量到UV功率，通过对UV功率的对时间的积分，得到UV能量。这个过程，一需要模数转换，得到UV功率大小，二需要积分，得到能量值。如果需要准确度高，采集时间必需足够的快，一般一秒钟至少1000次以上，这样积分的能量值，才比较准确。对于智能单片机采集方案，首先测到功率值，然后计算能量值。这样采用这种方案的UV能量计，都是同时显示实时功率值，最大功率值和能量值。有些智能UV能量计，还会集成温度测量。智能UV能量计采用的高速多点采集，所以能够记录采集过程的各个数据，得出过程中的曲线数据。总结：智能UV能量计，能够测量到UV功率值，可以带温度测量，并可有测量过程的曲线显示。这样就更能分析固化炉中的各个点的UV强度分布和温度分布，便于生产过程中工艺分析和工艺参数制定。

了解不同时间药物在血浆或血清中的浓度，对于计算一种药物的代谢动力学很有必要；反之，药物动力学也是药物吸收、分布、代谢和排泄过程的一部分。准确了解药物在体内吸收、分布、代谢和排泄的规律，便于精确地计算所需药物剂量，既能保持有效的药物浓度，同时避免用药过量致毒。预先对多屏深孔Solvinert（MultiScreen Deep Well Solvinert ）和多屏Solvinert滤板进行了验证，进行血浆或血清中蛋白质的板内沉淀，以便展开总药物分析。在滤板上可以快速、细致并完整地转移滤液，这样就可以在进行总药物分析之前为样品制备提供一个自动化兼容的平台。Solvinert滤板过滤的滤液中不含蛋白质，这与质谱分析法和紫外线分析法的结果一致。使用多屏深孔和多屏Solvinert滤板可产生有复验性的结果，它是一个稳定且可靠的平台。血清中的蛋白质被这些滤板过滤并沉淀之后，得到的样本中基本上不含蛋白质，回收率很高，便于萃取。药物动力学特性可以让新药开发商更了解药物的有效性和安全性，而这在新药的注册审批中是必要的。为了更好地了解候选药物的代谢动力，金斯瑞（ GenScript）建议用动物来做药物分布及其代谢的研究，分析在不同时间段、不同组织或血清中，药物及其代谢物的情况。金斯瑞进行精确的药物和药物代谢动力学研究，涉及两个主要方面：药物分布及其代谢动力研究和抗体药物的代谢动力研究。群体药代动力学研究的是个体之间药物浓度变异来源及其相关性，这些个体是指按临床上相关剂量接受候选药物的目标患者人群。患者的某些人口统计学特征、病理生理特征以及治疗方面的特征，比如体重、排泄和代谢功能、以及接受其他治疗，都能够有规律地改变药物剂量-浓度关系。例如，主要由肾脏排除的药物，在接受同样剂量的情况下，在肾功能衰竭患者体内的稳态浓度，通常高于肾功能正常的患者体内的稳态浓度。群体药代动力学的研究目的就是找出那些使剂量-浓度关系发生变化的、可测定的病理生理因素，确定剂量-浓度关系变化的程度，当这些变化与临床上有意义的治疗指数改变相关的情况下，能够恰当地调整剂量。在药品开发中使用群体PK方法，使获得完整的药代动力学资料有了可能，不但能从来自研究受试者的相对稀疏的数据中获取资料，而且还能从相对密集的数据或从稀疏数据和密集数据的组合中获取资料。群体PK方法能够分析来自各种不均衡设计的数据，也能分析因为不能按常用的药代动力学分析方式分析而通常被排除的研究数据，比如从儿科患者和老年患者获取的浓度数据，或在评价剂量或浓度与疗效或安全性之间的关系时所获取的数据。传统药代动力学研究的受试者通常是健康的志愿者或特别挑选的患者，一组成员的平均情况（即平均血浆浓度-时间曲线）一直是关注的主要焦点。许多研究将个体之间药代动力学的变异作为一个需要降到最低的因素进行观察，通常是通过复杂的研究设计和对照方案，或通过有严格限制的入选标准/排除标准，将其降到最低。事实上，这些资料对在临床应用期间可能会出现的变异至关重要，但是却被这些限制所掩盖。而且，传统药代动力学研究只关注单个变量（例如肾功能）的作法，还使其难以研究变量之间的交互作用。

有做过代谢数据分析的大佬吗？对拿到[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url] 和[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]GC-MS[/color][/url] 的原始数据之后的分析有些犯怵，看了好多学习视频还是觉得这个流程不清晰，有没有系统一些的学习资料，求助！

随着代谢组学在医药生物各领域中的发展，[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]-质谱联用技术（GC/MS）成为组学分析平台中最为常见的技术手段之一。对于生物样本（如尿、血、组织、唾液以及细胞等）中氨基酸、有机酸、多糖、胆固醇、维生素、酰胺、多胺、多醇、脂肪酸、激素、核苷酸、磷酸酯、多肽等小分子代谢物而言，GC/MS具有灵敏度高、分辨率强、重现性好以及高通量的优点。在代谢组学的分析策略中，不同类型的样品通过不同的提取方法和衍生反应方法获得相应的GC/MS总离子流色谱图，然后经过数学转化得到不同生理或病理状态下的机体的代谢谱，并建立数学模型，获得体内内源性代谢物的变量，再利用MS中强大的谱库检索系统或谱图解析功能进行分析，最后解释这些代谢物变化的生物学意义。早在1971年GC/MS就被临床用于检测一些特征性标志的代谢物以诊断疾病，例如尿中胆固醇和有机酸代谢物的变化。1978年，Gates和Sweeley等曾采用代谢谱分析技术对临床患者血和尿等样品中化合物进行定性和定量分析。2000年，Fiehn研究小组采用GC/MS方法对模型植物拟南芥的叶子提取物进行了植物代谢网络的研究。此后，代谢物靶标分析、代谢轮廓（谱）分析代谢指纹分析、代谢组学研究已经逐渐地被广泛应用于生物样本的药物安全性评估、疾病机制分析和生物标志物探索，并且对于机体受到外界环境刺激或扰动后其代谢产物产生的动态响应提供了一种全面的理解。比如以血清为研究对象，基于GC/MS分析技术的代谢轮廓谱观察到尿毒症患者与正常人代谢物中氨基酸（缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸）和脂肪酸（肉豆蔻酸、亚油酸）的异常变化，且被测物质灵敏度、稳定性非常好。同时与临床生化指标一致。同样，在中药雷公藤的毒性学研究时，根据GC/MS分析给药前后不同时间点的老鼠尿样结果，对中药安全性及多靶点作用的机制研究提供了新的思路。今年，GC/TOF-MS和GC×GC/TOF-MS技术中TOF-MS的快速扫描和强大的反卷积功能为生物样本的分析提供了高分辨率和高灵敏度的保证，也逐渐被用于代谢组学中尿、血、组织的研究，如Underwood等采用GC/TOF-MS研究Huntington疾病患者与转基因老鼠模型的血清代谢轮廓谱，并讨论其发病机制。与单维色谱相比，两维的色谱信息更全面更广泛，族分离效应、分辨率和灵敏度明显提高，且相应时间缩短，得到的光谱纯度大大改善。Welthagen等应用GC×GC/TOF-MS技术探究NZO肥胖鼠与C57BL/6鼠组织提取物中的代谢物变化，研究结果表明配置四级杆质量分析器的MS对样品的分析一次仅获得五六百个色谱峰，而TOF-MS却能检测到一千多个色谱峰，从而反映GC×GC/TOF-MS的快速扫描和信息采集对于复杂体系的全组分分析具有重要的意义，对于未来生物样品的代谢组学研究提供了技术上的保证。随着生命科学的发展，分析样品越来越复杂，分子量范围也越来越大，[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]-串联质谱技术如离子阱质谱联用仪具有MSn多级质谱功能，作为分析混合物和分子结构鉴定的重要手段，也逐渐成为当今医学和生物分析等领域研究的热点之一。目前，代谢组学技术正日益受到科研工作者的关注，特别是GC/MS技术的不断革新，有助于人们更好地理解机体内复杂的代谢网络以及生命活动规律

如题，想找几篇文献，找找方法，如果您分析TCA循环中的代谢物，请帮个忙，谢谢

质谱分析代谢小分子文献资料 查找途径

代谢组学与中药分析有何关系？大家讨论下？

早餐中加入燕麦、红薯等粗粮，在持续提供血糖的同时，还可提供B族维生素，有利于大脑能量代谢。

微生物学试题库试题(3)一、填空(每小题1分,共10分)1.微生物表面积与体积之比称比表面积 。2.鞭毛的化学成分为 蛋白质。3.细菌的主要繁殖方式裂殖 。4.在常见霉菌中,毛霉分解淀粉 能力较强。5.病毒由于无核糖体和能量代谢酶 ,故不能独立生活。 6.以有机物作为碳源和能源的微生物营养类型为化能有机异养。7.生物能量代谢的实质是ATP 的生成和利用。8.干热灭菌的温度160 ℃、时间 2小时 。9.土壤中不溶性磷酸盐在微生物作用下转变为可溶性磷酸盐的过程叫磷化物溶解作用 。[size=

各位大侠，在此求助各位能给整个数据分析软件吗，用trap做了点代谢组学的数据，没法分析，问安捷伦，说是没有针对离子阱的，问布鲁克，则可能要收费，在此求助，郁闷中，好心人帮帮忙啊[em09509]

昨天在分析样品时，发现分析的结果偏低，因为我们是很稳定的产品，后来换了台仪器做，同样的样品，在故障机上含量是93，在正常机上含量是95，今天早上查看，样品池能量只有130mv，灯点了1020个小时，这个灯刚换上的时候样品池的能量是595，现在不知道是不是样品池能量不足导致的分析结果误差大的原因

长期以来，我们计算食物能量时都是按1克蛋白质等于4千卡，1克碳水化合物等于4千卡，1克脂肪等于9千卡的计算方法计算的。不过，最近，Science有文章指出，这种方法可能不够准确。　　当我们谈及减肥时，1卡路里就是能量的1卡路里。一个多世纪以来，这已经成为了营养学家、营养师以及美国和欧洲的食品监管者们的口头禅。但是，我们当比较了生食和熟食，或者豆类和早餐谷物后，会发现这种想法也许是不准确的。在美国科学促进会（American Association for the Advancement of Science，AAAS）的年度会议上，一组研究人员通过多种计算得出共识：在食品标签的应用上，能量值并不全是简单的数字相加。“我们目前评估能量值的方法肯定是错误的。”研究小组的组织者、哈佛大学的进化生物学家理查德·兰厄姆（Richard Wrangham）说。　　研究小组就消化问题进行了宽泛的讨论，对象从人到大鼠直至蟒蛇，通过研究大量最新研究成果发现，食物在不同的物种的消化道中消化吸收的过程和方法是不同的。他们认为对许多食物来说，计算净卡路里是不够正确的，因为没有计算消化食物时消耗的能量、口腔和肠道菌群消耗的食物、不同的食物通过消化道的速度、熟食和抗消化的的食品通过消化道的速度是不一样的。　　评估食物的卡路里的方法是由威尔伯·阿特沃特（Wilbur Atwater）始建于19世纪至20世纪。这是一种简易的评价方法，它将1克蛋白质的能量视为4卡路里，1克脂肪视为9卡路里，而1克碳水化合物视为4卡路里（后人做了修改，补充了1克膳食纤维等于2卡路里）。“虽然这种方法计算许多食物的能量很有用，但是，近几十年来，人们也发现了它的不足之处，一些国家，如澳大利亚，已经因为该方法的不准确和不切合实际取消了这种能量估算方法。”研究小组的成员之一营养化学家、英国怀门德姆的独立营养有限公司的执行董事杰弗里·利弗西（Geoffrey Livesey）说。　　理查德·兰厄姆指出：这种计算能量的方法错误的关键之处在于评估熟食的能量。“一般来说，熟食的的能量会比生食低一点，然而肉类在烹调过程中会有一些胶原蛋白凝胶化，这会使得肉类变得更易咀嚼和消化，因此，熟肉的卡路里一般比生肉高。加热同样会使蔬菜中的蛋白质发生变性，如红薯。”会议的组织者、研究能量代谢的博士后、哈佛大学进化生物学家雷切尔·卡莫迪说。　　“加工方式也会让食物更加容易消化。以富含抗性淀粉的谷物颗粒为例，如大麦或大豆，这类食物需要很长的时间消化。但是，如果将同样颗粒的谷物碾碎成粉末或者加工成早餐谷物或即食麦片，就会变得更容易消化。这就是为什么面包易消化，豆子不易消化。”来自英国南安普敦的英格斯特有限公司的生物化学家营养专家克劳斯·英格斯特（Klaus Englyst）说。　　新的研究也发现，在消化加工食品和烹调食品时，肠道菌群的反应也是不一样的。卡莫迪教授报告称，当用食物和熟肉喂养大鼠时，她和哈佛大学的彼得·特恩博（Peter Turnbaugh）发现了其肠道菌群的不同是关键。“你所吃的食物会对肠道菌群产生巨大的影响，反过来也会对食物的消化产生影响。” 卡莫迪说。　　为什么这些发现十分重要？“因为我们现在正处在肥胖流行以及计算食物能量错误的尴尬境地之间。”来自波士顿儿童医院和哈佛医学院的儿科内分泌专家大卫·路德维希（David Ludwig）说。了解身体如何以不同的方式消化不同的食物对我们很重要。“能量的质量和能量的数量同样重要。” 小组之外的其他科研人员虽然也欢迎将“最科学”应用到减肥这个问题上，但是他们对这种过分担心能量计算不准确的想法提出疑问：“你可以花很大的努力去找到更加准确的计算食物能量的方法，但是你的目的究竟是什么呢？这与以前的方法有多大实际上的不同呢？如果你要减肥，你就是要减少能量的摄入。食物中能量的一点出入对于绝大多数人的影响并不大。” 斯坦福大学的营养学家克里斯托弗·加德纳（Christopher Gardner）说道。而该研究小组则认为积少成多。