当前位置: 仪器信息网 > 行业主题 > >

原油组学分析

仪器信息网原油组学分析专题为您提供2024年最新原油组学分析价格报价、厂家品牌的相关信息, 包括原油组学分析参数、型号等,不管是国产,还是进口品牌的原油组学分析您都可以在这里找到。 除此之外,仪器信息网还免费为您整合原油组学分析相关的耗材配件、试剂标物,还有原油组学分析相关的最新资讯、资料,以及原油组学分析相关的解决方案。

原油组学分析相关的资讯

  • 沃特世成功举办“代谢组学分析研讨会”
    沃特世公司于2012年10月18-19日在上海成功举办了“代谢组学分析研讨会”, 来自该领域的众多专家、同行出席了此次会议。代谢组学分析是一个非常重要的科研领域,在药物研发,生理病理、医疗应用和疾病诊断各方面都有着广阔的发展前景。代谢组学技术已经在各行各业得到广泛应用和发展,但是科学家在把自己的想法付诸实践的研究过程中,会面临这样那样的问题和挑战。您是否在自己的工作中涉及到代谢组学的研究内容,但是期待有更加系统和完整的组学技术交流呢?如何进行试验的设计,如何面对试验实施过程中可能遇到的问题和挑战,数据的处理和信息的挖掘,怎样高效地获得最低假阳性和假阴性率的结果, 多元统计学分析能为我们带来什么…… 总的来讲,就是怎样快速准确的得到有用的信息,实现从idea到data到result再到knowledge的过程呢? 此次会议期间,资深应用工程师,系统硬件工程师, 特别是该领域具有多年实践经验的John Shockcor博士(沃特世公司美国总部药物和生命科学部主管)系统地介绍和讨论了组学研究的流程和技术,并展示了实际的数据采集和数据处理过程案例分析过程。此次研讨会,系统全面地讨论代谢组学的发展与前景,实验设计,数据处理,技术更新,实际应用等切实具体问题。 主讲人Dr. John Shockcor 个人简介: 本次会议主讲人Dr. John Shockcor,沃特世公司药物和生命科学部主管,(英国)剑桥大学生物化学院客座教授,(英国)帝国理工大学Surgery and Cancer系客座教授,皇家化学学会会员,在分析化学领域(包括核磁共振和质谱技术)有着丰富的背景,在代谢组学和脂质组学研究领域具有25年的工作经验。 点击此处下载会议演讲资料 代谢组学现状和发展前景 代谢组学技术概论 代谢组学的应用和实例分析 Principle Component Analysis(PCA) 液相方法开发和样品前处理技术 代谢组学的工作流程和关键技术介绍 质谱分析的新视野 详情咨询:沃特世中国制药领域市场发展部经理:谭晓杰 (xiaojie_tan@waters.com) 欢迎您加入代谢组学讨论组,QQ群:276914065 ### 沃特世联系方式 媒体联系 叶晓晨电话:021-61562643xiao_chen_ye@waters.com周瑞琳(GraceChow)泰信策略(PMC)020-83569288 13602845427grace.chow@pmc.com.cn
  • 全国生命分析化学研讨会:组学分析
    仪器信息网讯 2010年8月20-22日,由国家自然科学基金委员会化学科学部主办,北京大学、清华大学和中国科学院化学研究所共同承办的“第三届全国生命分析化学学术报告与研讨会”在北京大学召开。   大会同期举办了“组学分析”系列报告会,300余人参加了此会。会议由中国科学院武汉物理与数学研究所唐惠儒研究员、中国科学院大连化学物理研究所许国旺研究员共同主持,8位来自科研院所和高校的专家学者做了精彩的报告。报告内容摘录如下:   中国科学院武汉物理与数学研究所 王玉兰研究员   报告题目:代谢组学研究寄生虫疾病   在寄生虫研究方面,代谢组学方法主要研究了宿主感染寄生虫后的代谢应答,如宿主对血吸虫、钩虫、锥虫和虐原虫等感染的代谢应答。其目的首先是进一步了解在寄生虫病的发生发展过程中其宿主的代谢通路的改变,其次是希望通过代谢通路的改变找到适合早期诊断寄生虫病代谢性标记物。王玉兰研究员总结了近年来代谢组学在寄生虫病研究领域所取得的进展,并且展望了代谢组学在寄生虫病早期诊断的潜在应用前景。   厦门大学 张博副教授   报告题目:基于液滴接口的二维分离平台   张博副教授在报告中指出:蛋白质组体系的高度复杂性迫切需要高分辨率的多维分离技术。他的研究采用微液滴技术,基于其微体积、低扩散、无返混等优点作为二维分离接口的解决方法,耦合毛细管液相色谱与毛细管电泳技术,构建二维微分离平台。分别通过“T”形芯片与“工”形芯片实现了样品由连续流至液滴以及液滴至连续流的转移,并实现了纳升尺度的全进样。通过简单的多肽混合物,初步验证了全二维分离与目标二维分离在该平台上的可行性。   中国医学科学院 李智立教授   报告题目:糖肽富集分离方法及糖链结构研究   李智立教授在报告中分别介绍糖肽富集分离的几种方法的优缺点以及使用范围。他着重介绍了通过优化免疫球蛋白G(IgG)分离条件和MALDI-FTICR MS检测条件,对IgG不同糖型的糖链进行了精细结构分析。在m/z2400-3000范围内,发现了GOF、G1F和G2F结构的IgG糖肽,此外还有类似“角平分线”的糖型结构。该研究为IgG糖型结构的高通量研究打下基础。   中国科学院长春应用化学研究所 姜秀娥研究员   报告题目:表面增强红外光谱研究膜蛋白的结构和功能   姜秀娥研究员介绍了他们课题组如何采用表面增强红外光谱研究膜蛋白的结构与功能。利用光感视紫红C端组氨酸与螯合的赖氨酸的强亲和性将膜蛋白定向组装到电极表面。利用表面增强红外光谱从分子水平上首次研究了跨膜电位是如何调制光感视紫红结构和功能。研究发现:当电位逐渐降低时,光激发诱导的红外差谱与溶液PH值逐渐上升时,光激发诱导的红外光谱显示了惊人的相似性。这一现象表明:电位降低驱动的电荷补偿行为改变了双层膜附近局部PH值,从而改变了膜附近质子释放基因的质子化状态,进而影响了光感视紫红蛋白的光循环动力学。   安捷伦科技(中国)有限公司 冉小蓉博士   报告题目:安捷伦最新生物信息学软件及在代谢组学标志物发现中的应用   冉小蓉博士在报告中介绍了安捷伦科技推出的全新的生物信息学软件Mass Profiler Professional(MPP)。该软件是专为质谱工作者设计的,能够通过对质谱数据的分析快速寻找代谢组学生物标志物并进行生理学意义的解释。MPP结合安捷伦优异性能的仪器硬件平台可以为靶标和非靶标代谢组学研究提供最全线的解决方案。   中国科学院大连化学物理研究所 梁玉同学   报告题目:基于新型整体材料的微流控芯片系统及其在蛋白质组学中的应用   梁玉同学报告中介绍到:在微流控芯片上原位光聚合制备酶反应器、强阳离子交换(SCX)整体材料、反相整体材料,搭建了芯片上酶反应器酶解-C18tip分离-质谱鉴定平台、芯片上SCX-C18tip二维分离-质谱鉴定平台、芯片上反相色谱分离-质谱鉴定平台,并用于蛋白质的分析。通过相关实验,证明了这些平台的潜力与适用性。   赛默飞世尔科技(中国)有限公司 戴捷先生   报告题目:赛默飞世尔科技iSRM试验方法和Pinpoint软件运用于大规模的目标蛋白质定量分析研究   戴捷先生在报告中对赛默飞世尔iSRM技术工作原理及Pinpoint软件功能在目标蛋白质定量分析研究中的应用进行了详细的介绍。通过将iSRM技术及Pinpoint软件二者结合,组成了目标蛋白质定量分析的整体工作流程,该工作流程可以在一次LC-MS/MS分析中对大规模的肽段实现同时的验证与定量分析,显示了iSRM技术及Pinpoint软件在目标蛋白质定量分析中的强大的功能。   南开大学 张锴副教授   报告题目:系统分析激酶家族蛋白多种翻译后修饰的研究   张锴副教授在报告中介绍了他们课题组以激酶中磷酸化和多种低丰度非磷酸化修饰为目标,将蛋白标签融合技术与Shotgun技术相结合,探索系统研究激酶中各种翻译后修饰的新方法。实验结果表明:通过联合标签蛋白融合技术与Shotgun策略,他们成功的在激酶上鉴定了未见报道的甲基化和乙酰化修饰形式,同时发现了一些潜在的修饰形式。研究结果预示激酶这类重要的蛋白生物酶可能存在更为复杂的修饰形式和生物功能。
  • 基于液相色谱-质谱技术的代谢组学分析方法新进展
    第二十届全国色谱学术会议于4月19日在西安曲江国际学术会议中心顺利召开,来自于国内外上千名的专家学者汇聚于此分享着在色谱领域中最新的研究成果和进展。在此次会议上,来自于中国科学院大连化学物理研究所的许国旺研究员向到场的嘉宾和观众介绍了液相色谱-质谱联用技术在代谢组学中的最新研究进展,并与现场嘉宾和观众进行了交流。   许国旺谈到,代谢组学是通过考察生物体系受刺激或扰动前后代谢物谱及其动态变化来研究生物体系代谢网络的一种技术。根据研究目的不同,可以将代谢组学研究策略分为非靶向代谢组学和靶向代谢组学。通常非靶向方法主要用于代谢表型区分或差异代谢物发现的研究。从分析技术的角度来看,非靶向代谢组学是尽可能多地定性和相对定量生物体系中的代谢物, 最大程度反映总的代谢物信息。靶向代谢组学通常针对某个代谢通路或某些感兴趣的已知代谢物进行高灵敏度检测和准确定量分析,主要用于某些差异代谢物的验证等经典的靶向代谢组学LC-MS分析先由目标代谢物标样产生选择反应监测(SRM)/多反应监测( MRM) 离子对, 然后对样品中的目标代谢物进行靶向分析。 中国科学院大连化学物理研究所 许国旺研究员   近年来随着分析化学的发展,代谢组学技术也获得了蓬勃发展。核磁共振和质谱是代谢组学研究领域的最主流分析平台,与其他色谱-质谱联用技术相比,液相色谱-质谱联用技术更适合分析难挥发或热稳定性差的代谢物,同时LC既可以选择与飞行时间、四级杆-飞行时间、离子阱-飞行时间、静电轨道阱等高分辨质谱串联,以进行非靶向代谢组学分析,又可以与四级杆、三重四级杆或四级杆离子阱等质谱串联,利用选择反应监测或多反应监测检测模式进行靶向代谢组学分析。LC-MS技术的这种灵活性与普适性,使得它成为了代谢组学研究中功能最为常用的技术平台。   基于LC-MS的代谢组学技术研究近年来取得了突飞猛进的成果,但技术的发展永无止境,就基于LC-MS的代谢组学分析技术而言仍存在很多问题亟待解决,例如,生物样品中代谢物组成十分复杂,许多痕量代谢物有重要的生理功能和意义,但目前的方法难以检测或因其含量较小导致分析误差很大 代谢组学面对的是大样本分析预处理技术及分析方法的重现性和可靠性显得尤为重要 生物样本间的个体差异导致了不同的基质效应,如何在复杂生物基质条件下对代谢物进行准确的定量分析也是代谢组学面临的挑战之一。   随着各种质谱仪器灵敏度和分辨率性能的大幅度提升基于LC- MS技术的代谢组学能够获得的代谢特征也在快速增加,但是如何将这些代谢特征转变为有用的代谢信息依然是代谢组学研究工作者面临的挑战之一,可以预见未来将会有更多的新技术、新方法出现,以满足日益增长的代谢组学研究需求。
  • 基于纳升电喷雾质谱直接进样的代谢组学分析新方法
    色谱-质谱联用是目前代谢组学分析的主流方法,但是色谱分离速度限制了其在大规模样本分析中的应用。直接进样质谱(DI-MS)虽然通量高,但面临着离子抑制效应导致代谢物检测灵敏度降低、缺少色谱分离使得定性定量困难等挑战。因此,亟需发展与DI-MS相配的高灵敏度质谱数据采集技术和数据分析技术。   为此,科研人员提出一种基于纳升电喷雾直接进样高分辨质谱的非靶向代谢组学分析策略:将一级精确质量、同位素分布模式、二级质谱相似度、母离子和子离子强度相关性等结合,使代谢物的定性准确率高于94%;定量方面采用一级母离子结合二级特征碎片离子的方式来实现。此方法稳定可靠,2-3分钟可分析一个样品,适合于大规模样本的高通量代谢组学研究。   此外,传统的细胞代谢组学分析方法通常需要数百万个细胞,但许多稀有细胞如循环肿瘤细胞、原代肿瘤细胞、干细胞等,面临着细胞数不足的问题。科研人员在上述工作基础上,建立了基于毛细管微探针的细胞取样、96孔板脂质在线提取、nanoESI DI-HRMS拼接式质谱数据采集的新方法,实现了3分钟内从20个哺乳动物细胞中检测19类脂质、500多种脂质代谢物。该平台在生命科学和临床医学研究中具有应用潜力。   相关研究成果分别以Strategy for Nontargeted Metabolomics Annotation and Quantitation Using a High-resolution Spectral-Stitching Nanoelectrospray Direct-Infusion Mass Spectrometry with Data-Independent Acquisition和Lipid Profiling of 20 Mammalian Cells by Capillary Microsampling Combined with High-Resolution Spectral Stitching Nanoelectrospray Ionization Direct-Infusion Mass Spectrometry为题,发表在《分析化学》(Analytical Chemistry)上。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金等的资助。图1.基于纳升电喷雾直接进样高分辨质谱的非靶向代谢组学分析策略图2.基于毛细管微探针的细胞取样、96孔板脂质在线提取、nanoESI DI-HRMS拼接式质谱数据采集的新方法
  • 全球基因组学和蛋白组学分析仪器市场预测
    全球权威调研机构Technavio最新报告显示,预计在2013到2018年全球基因组学和蛋白组学分析仪器市场将保持7.83%的复合年增长率。   基因组学研究的是基因及其功能,蛋白质组学研究的是蛋白质组或组蛋白的结构和功能,两者均使用分子生物学和生物信息学的工具和技术。基因组学通过绘制基因和DNA序列来了解基因组的结构和功能。一个蛋白质组是一个基因组在特定时间内表达的一整套蛋白质。蛋白质组学主要涉及的是使用分子生物学、生物化学和遗传学来分析蛋白质,这些蛋白质是通过基因编码而来。蛋白质是所有细胞的主要组分,而且控制细胞的不同功能特性。基因组和蛋白质组结构或功能的缺陷可能导致疾病,因此基因组学和蛋白组学技术在科研、新药研发、疾病诊断中发挥着重要作用。这些应用都需要基因和蛋白缺陷的识别和研究,而基因组和蛋白质组的蛋白质分离、净化、识别、量化和分析都需要仪器、试剂和软件。基因组学和蛋白质组学用到多种分析仪器,但应用最广泛的是色谱系统、质谱系统、PCR系统和下一代测序系统。   目前,基因组学和蛋白组学领域的主要供应商有安捷伦、Bio-Rad、罗氏集团、Illumina、PE和赛默飞,其他比较优秀的供应商还有BD、布鲁克、GE医疗、JASCO、日本电子、Luminex、Qiagen NV、Rigaku Corp.、岛津、西格玛、Spectrolab Systems、Waters等。   这个市场发展的主要推动力为基因组学和蛋白组学技术的完善,主要挑战在于基因组学和蛋白组学知识的缺乏,主要趋势为聚焦于药物研发和疾病诊断。
  • 药典蛋白质组学分析标准二次公示!增加QC评价标准
    随着质谱技术以及色谱与质谱联用技术的快速发展,蛋白质组学分析技术在未知蛋白质的鉴定、蛋白质结构的解析、靶向蛋白质定量、以及生物技术药物研发、质量控制和体内药代动力学研究方面应用越来越广泛。药典委拟制定《中国药典》蛋白质组学分析方法及应用指导原则,并于2024年2月20日发布第一版公示稿并征求意见。为确保标准的科学性、合理性和适用性,现将拟增订的蛋白质组学分析方法及应用指导原则(第二次)公示征求社会各界意见(详见附件)。公示期自发布之日起一个月。蛋白质组学分析方法及应用指导原则公示稿(第二次).pdf蛋白质组学分析基本流程主要包括:1. 蛋白样品的提取,变性还原,酶解与多肽分离富集;2. 多肽的分析与鉴定;3. 数据分析。在分离和富集中采用凝胶电泳和色谱技术,分析与鉴定中采用质谱、二维凝胶电泳、X射线分析、核磁共振波谱和透射电子显微镜技术。蛋白质组学分析方法及应用指导原则第二次公示稿修改说明 根据 2024 年 2 月蛋白质组学分析方法及应用指导原则第一次公示稿的反馈 意见和建议,国家药典委员会相关专业委员会进行了研讨,在第一次公示稿的基 础上修订了部分内容,主要为:一、适用范围1. 将文中“蛋白”修改为“蛋白质”。二、蛋白质组学的分析策略 1. 将“通过质谱分析技术检测到肽指纹图谱进行多肽的鉴定和定量分析” 修改为“通过质谱分析技术检测肽段一级与二级谱图进行多肽的鉴定和定量分 析”。2. 将文中“图谱”修改为“谱图”。三、蛋白质组学分析方法 1.“2.1 质谱技术”增加其他质谱碎裂技术,修订为:“蛋白质组样品经过提 取、分离富集或者进一步变性还原、酶切、多肽分离富集处理后,选择适宜的分 离系统导入离子源离子化,电离生成带电荷离子,离子通过碰撞诱导解离 (Collision induced dissociation, CID)、高能碰撞诱导解离 High energy collision dissociation, HCD)、电子活化解离(Electron activated dissociation,EAD)或其 它适宜的解离技术进行碎片化,后在加速电场的作用下形成离子束进入质量分析 器,通过质量分析器分离和过滤不同质核比的离子,过滤后的离子最终经检测系 统转换为可测量的信号,从而得到质谱图,以获得蛋白质的相关信息”。 2. 将文中“质核比”修改为“质荷比”。 3. 将“数据库检索对肽段碎裂质谱谱图和数据库中的理论序列谱图进行匹 配,实现肽段鉴定”修改为“质谱数据文件的数据库检索对肽段碎裂质谱谱图和 数据库中的蛋白质计算机模拟消化肽段碎裂模式进行匹配,以进行肽段鉴定”。4. 将“肽谱图匹配(peptide spectrum matching,PSM)”,“肽谱图匹配 (peptide-spectrum matches,PSM)”,统一为“肽段谱图匹配 (peptide-spectrum matches, PSMs)”。 5. 将“统计学分析(如 p 值)”修改为“统计学指标(如 p 值)”。 2024 年 6 月 与第一次公示稿比较,修改处加橙色标记 四、蛋白质组学分析的质量控制 1. 在表 1 中增加样品处理中酶解漏切率、酶解位点特异性等 QC 评价指标 及描述;增加色谱分析中峰宽和半峰宽等 QC 评价指标及描述;增加质谱分析中TIC 图等 QC 指标及描述。2. 调整仪器性能参数的描述顺序。将“建议结合仪器的性能进行设置,例 如可将两个参数均设置为 20ppm,也可以将母离子质量误差设置为 10ppm,子离 子质量误差设置为 0.02Da”修改为“建议结合仪器的性能设置质量误差,如将母 离子质量误差设置为 10 ppm,子离子质量误差设置为 0.02 Da,也可将两个参数 均设置为 20 ppm”。3. 将“鉴定的蛋白质应具有至少 70%的覆盖率,即被鉴定的多肽的氨基酸 序列覆盖蛋白质氨基酸序列的百分比,70%的蛋白覆盖率可提高鉴定结果的可信 度和全面性”修改为“蛋白质覆盖率是指被鉴定的多肽的氨基酸序列覆盖蛋白质 氨基酸序列的百分比,70%及以上的蛋白质覆盖率可提高鉴定结果的可信度和全 面性”。
  • 科学家发展蛋白质组学分析新方法
    近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮、研究员秦洪强团队开发了表征蛋白质中组氨酸残基反应活性的蛋白质组学分析新方法。该工作筛选并获得了具有组氨酸优异反应效率的α, β-不饱和醛探针,发展了基于烯醛探针的组氨酸标记技术和可逆酰肼化学富集方法,通过蛋白质组定量技术实现了人类蛋白质组中的组氨酸反应活性的高效表征。相关成果发表在《美国化学会志》上。  氨基酸亲核反应活性的表征推动了共价药物靶点和候选药物分子的发现。组氨酸占据超过1/5人源酶活性中心,在生理环境中既是质子的供体又是质子的受体,受到蛋白质空间微环境的精细调控。然而,由于缺乏可以在生理条件下标记组氨酸的化学探针,在此之前难以实现组氨酸活性的全局性表征。  本工作发现α, β-不饱和醛在生理状态下可与组氨酸残基发生迈克尔加成反应,且引入的醛基可作为富集标签用于后续的可逆酰肼富集。与基于点击化学的经典活性蛋白质组分析方法(ABPP)相比,该策略引入活性最高的烯醛探针——丙烯醛作为反应基团和富集标签,是目前报道的最小尺寸的ABPP多功能探针。  同时,该方法样品处理流程简便,引入标签质量小,并通过可逆富集过程引入稳定同位素标记试剂,有效避免了传统工作中制备同位素连接臂的繁琐流程和高成本。该方法共定量了超过8200个组氨酸残基的标记效率,筛选到317个高亲核反应性组氨酸残基,并且发现组氨酸的反应活性和其磷酸化呈负相关。  该方法为后续基于组氨酸的共价靶向偶联药物的开发提供了数据支持,且丙烯醛衍生物也可作为新型反应基团用于共价抑制剂的研制。
  • 许国旺团队连续发文:高覆盖脂质组学分析新进展
    p   脂质组学在生命科学研究中占据非常重要的地位。但是,全面的脂质分析受到脂质结构多样性、性质复杂性的挑战。常用的基于质谱技术的脂质组学分析方法包括直接进样(“鸟枪法”)、色谱-质谱联用、基质辅助激光解离质谱成像等,而超高效液相色谱-高分辨质谱(UHPLC-HRMS)非靶向分析和UHPLC -三重四极杆质谱靶向分析是最常用的分析平台之一,存在着各自鲜明的优缺点。 /p p   近日,中科院大连化物所的许国旺研究员团队在基于UHPLC-HRMS联用技术分析脂质代谢物方面取得了新进展,研究结果发表在 Analytical Chemistry 杂志 (2018 Jun 8. doi: 10.1021/acs.analchem.8b01331.)。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201806/insimg/ca1bfa21-0764-4816-8a08-24698b925868.jpg" title=" 微信图片_20180621103413.jpg" / /p p   该课题组结合非靶向和靶向方法的优势,建立了一种具有高检测覆盖度的拟靶向脂质组学分析方法,涵盖19个脂类,3377个脂质离子对,覆盖7000多种脂质分子结构。 /p p   该课题组首先使用UHPLC-HRMS联用技术在全扫(Full Scan)和数据依赖采集(DDA)模式下对不同来源的生物样品(细胞、组织、血浆)进行分析,根据获得的保留时间、精确分子量以及二级碎片信息对脂质分子进行归属。没有二级碎片的脂质分子通过与已知脂质或自建数据库中的保留时间和精确分子量进行比对,靶向提取脂质信息,以获得尽可能大的脂质覆盖度。 /p p   对于理论存在但是未被检测到的脂质分子(文中称扩展脂质),通过保留时间与已知脂质的酰基链的碳数或酰基链的双键数之间的关系对保留时间进行预测。根据脂质分子的结构特征以及质谱行为,建立包含已知脂质和扩展脂质的离子对数据库。 /p p   最后,将所有的脂质离子对应用到动态多反应监测中,建立基于液相色谱-质谱的高覆盖拟靶向脂质组学分析方法。该方法具有良好的线性、重复性,更低的检测线,更高的覆盖度,更好的数据质量,尤其适合大规模脂质组学分析。 /p p   该研究得到了国家自然科学基金项目、国家重点研究发展计划以及大连化物所创新基金的资助。 /p p   该论文作者: /p p   Qiuhui Xuan, Chunxiu Hu, Di Yu, Lichao Wang, Yang Zhou, Xinjie Zhao, Qi Li, Xiaoli Hou, and Guowang Xu. /p p   链接: /p p   http://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b01331 /p p   标题: /p p   Development of a High Coverage Pseudotargeted Lipidomics /p p   Method Based on Ultra-High Performance Liquid Chromatography? /p p   Mass Spectrometry /p p   出处: /p p   Anal. Chem., May 29, 2018, DOI: 10.1021/acs.analchem.8b01331 /p
  • 复旦大学杨芃原团队等创建精准N糖蛋白质组学分析方法
    p   复旦大学化学系教授杨芃原团队、中科院计算技术研究所研究员贺思敏团队、国家蛋白质科学中心(上海)研究员黄超兰团队合作研究,创建了基于质谱的高通量糖基化肽段分析方法pGlyco2.0,为精准N糖蛋白质组学提供了新技术。今天,相关研究成果以《pGlyco2.0:基于综合质控和一步质谱法的精准N糖蛋白质组学糖肽分析方法》为题发表于《自然· 通讯》。 /p p   据悉,杨芃原、贺思敏和黄超兰为共同通讯作者。杨芃原为该文的Lead Contact。 /p p   糖基化是最复杂的蛋白后修饰之一。与其他蛋白后修饰相比,糖基化不但会产生宏观不均一性(每个蛋白上可能有多个后修饰位点),更会产生海量的微观不均一性(每个位点上可能有几十甚至上百种不同的后修饰基团)。此外,糖链本身的离子化效率很低。这些因素的结合使得糖基化分析的通量和质量远低于蛋白质组学的常规分析水平。 /p p   这项研究通过深入研究和测试质谱条件,开发基于阶梯能量的一步质谱采集法,提高了糖肽鉴定的通量和开发具有自主产权的pGlyco2.0糖肽检索引擎,从糖链、肽段、糖肽三个层面对糖肽数据库检索进行精确质控,从而大幅提升了N糖蛋白质组学分析的通量和质量。 /p p   同时,研究人员首次将重标元素应用于糖肽鉴定准确度分析,为该领域的质控分析提供了新的方法及标准。 /p p   专家表示,这项研究报道了目前最大的糖基化数据集:在1%的假阳性率下,在小鼠的五个脏器种鉴定到了超过一万条N糖肽。 /p p /p
  • 不同加工方式对榛子油脂质组成的影响:一项脂质组学分析
    榛子是世界四大干果之一。榛子油是一种营养丰富、保健作用广泛、具有独特坚果风味的高级食用油。榛子油中的脂肪酸主要为油酸、亚油酸、棕榈酸和硬脂酸,不饱和脂肪酸的含量高达90%。其他生物活性成分和抗氧化活性物质也赋予了它抗氧化,抗衰老,提高免疫力,预防动脉粥样硬化,及促进胆固醇降解和代谢的作用。 脂质在生命活动中承担着关键的作用,具有多种重要的生理功能。脂质可分为八大类:脂肪酰(FAs)、甘油脂(GLs)、甘油磷脂(GPs)、鞘脂(SPs)、固醇脂(STs)、孕烯醇酮脂(PRs)、糖脂(SLs)和聚酮(PKs)。脂质组学(lipidomics)作为代谢组学的一个分支,利用现代质谱技术分析脂质的内在化学性质。高分辨率脂质组学平台的出现,包括鸟枪法脂质组学、液相色谱质谱联用(LC-MS)、基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱仪(MALDI-TOF-MS)和成像脂质组学等都成为了分析脂质的工具。脂质组学的研究涉及脂质的定性定量分析、结构和功能特性分析以及在生理和病理阶段的动态变化分析等等。其在食品科学领域的研究主要围绕在食品营养和食品安全控制方面。高分辨率质谱已广泛用于研究食品成分、产地溯源、质量鉴定和真伪鉴别。 为探究加工方式对榛子油脂质组成的影响,鉴定不同榛子油样品的特征脂质。在本实验中,沈阳农业大学的孙嘉阳、吕春茂教授等将脂质组学应用于榛子油的研究。使用冷压法、超声波辅助有机溶剂浸提法和水酶法提取分别得到不同的榛子油样品(CPO、UHO和EAO)。利用超高效液相色谱串联四级杆飞行时间质谱(UPLC-QTOF-MS)和多元统计分析方法对榛子油中的脂质进行全面表征与分析。探讨了不同加工方法对榛子油脂质组成和油脂品质的影响。这些数据为榛子油的加工利用提供了新的见解,并将有助于榛子产品的开发与应用。榛子油脂质的定性利用UPLC-QTOF-MS在正负离子模式下对3种不同的榛子油样品进行扫描,利用二级质谱数据库进行光谱匹配,实现脂质的定性。在榛子油中共鉴定出98种脂质,包括负离子模式下的63种脂质和正离子模式下的35种脂质(图1A)。这些脂质分为3个大类(GL、GP和SP)和10个亚类。GLs包含2个亚类(二酰甘油(DG)和三酰甘油(TG)),GPs包含7个亚类(甘油磷脂酸(PA)、甘油磷脂酰胆碱(PC)、甘油磷脂酰乙醇胺(PE)、甘油磷脂酰甘油(PG)、甘油磷脂酰肌醇(PI),和其他GPs(PEtOH、PMeOH)),SP包含的1个亚类(神经酰胺(Cer))(图1B)。(A)正负离子模式下鉴定的脂质数量;(B)脂质亚类数量的百分比。图1 榛子油中脂质的定性分析榛子油脂质的定量CPO、UHO和EAO中的总脂质含量分别为1248646.6325、1056993.7416和1027794.9027 nmol/g。图2A~C显示了各亚类脂质含量所占百分比情况。CPO、UHO和EAO中TGs所占比例最大,分别为98.49848%、98.32412%和98.42983%,其次是DGs、PAs和PEs。图2D进一步比较了3种不同榛子油中同一亚类脂质含量的差异。CPO组中GLs(TGs和DGs)含量最高,这可能是由于机械挤压导致的较高脂质浓度所致。UHO组中GPs含量最高,PCs、PIs和PEs含量显著高于其他两组,UHO组中PAs的含量是EAO的117倍。GPs是生物膜的主要成分,在加工时榛子被浸泡在有机溶剂中,溶剂会破坏细胞膜,从而增加GPs的释放,产生这一结果。而EAO组中Cer含量更高,主要是Cer-NS。图2 (A)CPO中脂质亚类的百分比;(B)UHO中脂质亚类的百分比;(C)EAO中脂质亚类的百分比;(D)CPO、UHO和EAO中同一亚类脂质含量的比较在榛子油样品中共鉴定了15种脂肪酸(表1)。除C12:0月桂酸、C14:0肉豆蔻酸、C17:0十七烷酸和C18:3亚麻酸外,CPO组的其他脂肪酸含量均显著高于其他两组。在计算每种脂肪酸的百分比后,发现CPO、UHO和EAO中不饱和脂肪酸的百分比分别为93.39%、93.30%和93.55%。表1 CPO、UHO和EAO中的脂肪酸组成(%)多元统计分析首先对不同加工方式的榛子油样品进行主成分(PCA)分析,可以初步了解不同处理组之间的自然聚类趋势。在图3A的PCA得分图中可以观察到3种榛子油样品分离明显。图3B的PCA的载荷图显示出TG类脂质是区分榛子油的最重要变量。利用偏最小二乘判别分析(PLS-DA)筛选显著差异脂质。图3C得分图显示,PLS-DA模型可以有效区分三种不同的榛子油样品。为了进一步验证模型,我们进行了200次交叉验证,以评估其稳定性和预测能力。R2和Q2值分别为0.8687和0.7769(图3D)。这表明建立的PLS-DA模型具有较高的可靠性和预测能力,且不存在过拟合现象。(A)PCA得分图;(B)PCA载荷图;(C)PLS-DA得分图;(D)PLS-DA交叉验证图。图3 无监督和有监督模式的多元统计分析EAO、CPO和UHO间的显著差异脂质基于构建的PLS-DA模型,将VIP 1且P 0.05作为筛选条件。图4A显示了鉴定出的12种显著差异脂质情况,包括6个TAGs,3个DAGs、1个PC、1个PA和1个PE。这12种脂质在不同加工方式榛子油中具有显著差异。与UHO组相比,CPO组中9种脂质显示上调,3种下调,其中PC(PC 36:2|PC 18:1_18:1)变化最大(图4B)。与EAO组相比,CPO组有11种脂质显示上调,1种下调,PE(PE 36:3|PE 18:1_18:2)变化最大(图4C)。与EAO组相比,UHO组中有10种显著差异脂质显示上调,2种下调,其中PC(PC 36:2|PC 18:1_18:1)变化最大(图4D)。我们发现在不同加工方式榛子油中GP类脂质差异最大。这些脂质含量的变化可能直接影响油脂的质量和功能。因此,未来对特定亚类脂质进行靶向研究十分重要。这12种显著差异脂质也可以作为潜在的生物标志物对这三个不同加工方式的油脂进行质量控制。图4 (A)PLS-DA VIP得分图,右侧热图表示相应脂质的含量;(B)CPO和UHO之间的差异倍数图;(C)CPO和EAO之间的差异倍数图;(D)UHO和EAO之间的差异倍数图在本研究中,使用UPLC-QTOF-MS对榛子油进行了非靶向脂质组学分析。对CPO、UHO和EAO的脂质组成进行了定性和定量分析,鉴定出10个亚类的98种脂质。通过有监督和无监督的多元统计分析,确定了12种显著差异脂质。这些脂质可以作为潜在的生物标志物来区分三种加工方式的榛子油以及其他掺假检测和质量鉴别。本研究明确了榛子油的脂质成分,并证实了不同加工方式对植物油脂质的影响。这项研究的结果有助于我们理解油脂加工的机理,为今后特定脂质的研究提供有用的信息,并促进榛子油的开发和应用。作者孙嘉阳,女,中共党员,沈阳农业大学硕士研究生(在读),2019年辽宁省优秀毕业生,2020年沈阳农业大学优秀团干部。主要研究方向为榛子油加工及贮藏氧化机制。参与国家自然基金及辽宁省重点研发项目的相关研究工作 。以第一作者在Food Science and Human Wellness发表一篇SCI论文1篇,申请国家发明专利2项。吕春茂,男,博士,沈阳农业大学食品学院三级副教授,硕士生导师,沈阳市高层次“拔尖人才”,沈阳农业大学服务乡村振兴团队首席专家。主要从事果蔬精深加工、食品生物技术和食品质量与安全方面的教学与科研工作。近年来一直针对北方特色果蔬农产品的高值化利用和加工关键技术开展科学研究,包括东北特色经济林作物榛子的食品加工、加工过程中主要营养成分的变化与关联机制、深加工产品及其功能性评价、加工副产品的综合利用;寒富苹果精深加工产品研制及功能性评价、果渣等加工废弃物的综合利用;越橘精深加工产品研制与功能性评价等。共发表论文50多篇,SCI收录5篇,完成专著2部,参与编著教材2部。申请发明专利5项。目前主持辽宁省重点研发计划项目“东北榛子深加工综合利用关键技术研究与示范”等科研课题5项,参加国家重点研发计划“特色经济林采后果实与副产物增值加工关键技术”和国家自然科学基金项目“富含油脂的食品热加工过程中晚期糖基化终产物(AGEs)形成机理研究”的部分研究工作。获得省部级二等奖3项,三等奖2项。学术兼职:中国经济林协会榛子专业委员会理事;中国食品科学技术学会休闲食品加工技术分会理事;中国经济林协会加工利用分会理事;中国经济林协会板栗分会常务理事;辽宁省食品质量与安全学会理事;辽宁省农科院专业学位评审专家等。
  • 安捷伦化学分析业务收入较去年同期增62%
    安捷伦科技在慕尼黑上海分析生化展(analytica China 2010)上举办媒体见面会   仪器信息网讯 2010年9月15日,安捷伦科技值第五届慕尼黑上海分析生化展(analytica China 2010)召开之际,举办了媒体见面会。安捷伦科技高级副总裁兼化学分析集团总裁Mike McMullen先生、安捷伦科技副总裁兼化学分析集团气相色谱和质谱产品经理Chris Toney先生、安捷伦科技全球副总裁兼生命科学集团与化学分析集团大中华区总经理牟一萍女士出席本次见面会,20余家行业专业媒体应邀参加会议。 发布会现场   发布会主要向与会媒体主要介绍了安捷伦新近推出的1200 Infinity系列液相色谱系统、基于iFunnel技术的6490三重串联四级杆液/质连用系统及其他产品,并简要介绍了安捷伦收购瓦里安后,对瓦里安的整合情况。 安捷伦科技高级副总裁兼化学分析集团总裁Mike McMullen先生致辞   在本次慕尼黑上海分析生化展上,安捷伦展出了在过去两年间推出的化学分析与生命科学领域的最新测试测量产品和技术,包括:2010年7月推出的全新一代液相色谱系统——1200 Infinity系列,包括Agilent 1220 Infinity LC 和 Agilent 1260 Infinity LC、以及增强型 Agilent 1290 Infinity LC,这一系列为分析型HPLC和UHPLC的性能建立了新标准;2010年ASMS上推出的6490三重串联四级杆液/质连用系统,该系统基于iFunnel技术,彻底变革了大气压离子采样过程,其实验室占用面积与之前型号相比减少25%,但灵敏度性能却提高了10 倍;以及为2010年南非世界杯提供兴奋剂检测的GC/MSD 系统和Agilent 7000 系列三重串联四极杆气/质联用系统。同时展出的还包括Agilent MX3005P 型五通道荧光定量PCR仪(QPCR);基于微流控技术的多功能微型工作平台的2100 Bioanalyzer;以及革命性的实验室自动化解决方案——Bravo自动化液体处理平台,以及安捷伦PlateLoc 微孔板热封膜机等。   Mike McMullen先生说道:“从全球市场来看,安捷伦化学分析业务收入较去年同期增长了62%,环境保护、石化和法医毒物鉴证市场均实现两位数的增长;生命科学业务收入较去年同期增长28%,伴随新兴市场拉动的需求,药物研发领域保持持续增长。为满足石油化工、食品安全、环境保护和法医鉴定等行业日益增长的分析需求,安捷伦在过去两年中不断推出了一系列重树行业标准的新产品和解决方案。而对瓦里安成功收购,使安捷伦科技扩充了光谱、核磁、真空、法医毒物检测等领域的产品线和解决方案,更强大的综合实力将确保提升人们的生活品质。” 安捷伦科技副总裁兼化学分析集团气相色谱和质谱产品经理Chris Toney先生   Chris Toney先生回答记者提问时表示,这是安捷伦第二次参加慕尼黑上海分析生化展。安捷伦以“测试测量让生活更美好(Better Measurement, Better Life)”及“强强联手共筑美好未来(Clearly Better Together)”为主题充分展示近两年来推出的世界领先的测量产品和技术,并全面展示在其成功收购瓦里安后,为用户提供的更广泛的专业技术及解决方案和更加完善的服务。   在5月份完成对瓦里安的收购后,安捷伦科技的产品线更加广泛,除了原有享誉业界的色谱和质谱产品外,此次安捷伦同时展出了原瓦里安知名的光谱产品,包括原子吸收光谱仪、原子发射光谱仪等。解决方案的全面扩充充分诠释了“强强联手共筑美好未来(Clearly Better Together)”的发展愿景。 安捷伦科技全球副总裁兼生命科学集团与化学分析集团大中华区总经理牟一萍女士   近年来,安捷伦在中国所取得的成功,首先要归功于中国经济的高速发展,同时,也归功于安捷伦在中国的综合实力包括最优异的产品平台、最完整的解决方案以及最完善的售后服务体系。安捷伦科技全球副总裁兼生命科学集团和化学分析集团大中华区总经理牟一萍女士表示:“作为中国分析仪器行业的领跑者,安捷伦生命科学与化学分析相关产品,数年来都位居市场占有率第一,安捷伦持续被评为‘用户满意度第一’和‘全国售后服务十佳’单位。今年5月,瓦里安的收购成功将进一步加强我们在中国市场上的领导者地位, 瓦里安的产品和技术将是对安捷伦产品线的有力补充,将有助于中国业务保持强劲增长。 8月, 瓦里安中国的全体员工正式加入安捷伦, 中国在全球率先完成两个团队的整合。今后,安捷伦将更加关注中国市场用户的需求,一如既往地在第一时间将最新技术和最先进的分析手段带给中国用户,同时深入与科研机构和政府机构的合作,共同快速响应业界突发事件,最大范围地保障人们的生命安全并提升生活品质。”   在过去的两年间,安捷伦不仅对业界标准做出不可磨灭的贡献,同时还凭借其先进的技术和仪器,力求为人们创造更安全更美好的生活。2009年12月,欧盟因在山东出口的熟鸭制品中发现了莫西霉素,对山东企业禽肉类的产品实行封锁。安捷伦的工程师与潍坊商品检验检疫局为此一起日夜奋战,凭借最先进的液质联用平台和工程师扎实的技术功底,安捷伦帮助证明了在每一批出口的熟鸭制品中都不存在莫西霉素。这是中国检验检疫系统第一次打赢国外的技术性贸易壁垒,并首次实现了中国食品对欧盟预警的成功反诉。此外,安捷伦一直以来将尖端技术推向石化、环境和食品安全测试领域,针对今年在美国墨西哥湾发生的油井原油的大量泄漏事件,安捷伦为此会同食品、环境和石化领域的专家,共同合作,为美国食品及药物管理局提供了一套全新的完整的检测解决方案,包括样品的提取、制备;多环芳烃的分析;空气中挥发物及半挥发物的检测;原油指纹溯源分析以及未知物的筛查等,把原先一天半的检测时间缩短到仅需4个小时。   最后,Mike McMullen先生总结道:展望未来,安捷伦将一如既往、持续创新,为业界提供更全面的测试测量产品线、更加完善的解决方案、并始终贯彻用户满意度第一的经营理念,通过遍及全国的维修站和快速响应的用户服务中心,真正为用户提供全程无忧的技术支持。安捷伦对瓦里安的成功收购,标志着全球科技界的两大集团完美合璧,将进一步推动安捷伦成为生物分析测量领域全球领导者的革命性进程。与此同时,安捷伦还将继续履行对中国社会的承诺,为提升人民生活品质提供强而有力的科技保障。   关于安捷伦科技   安捷伦科技(NYSE: A)是全球领先的测试测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司18,500名员工为世界上100多个国家的客户提供服务。安捷伦2009财政年度的业务净收入为45亿美元。了解有关安捷伦科技的详细信息,请访问:www.agilent.com.cn。
  • 药典委首次制定蛋白质组学分析标准,涉及色质谱、凝胶电泳等多种技术
    蛋白质组学是指在大规模水平上以蛋白质的生物多样性为基础,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律、蛋白质翻译后修饰以及蛋白与蛋白之间相互作用等,从而揭示疾病发生、发展和药物治疗相关的规律与机制。随着质谱技术以及色谱与质谱联用技术的快速发展,蛋白质组学分析技术在未知蛋白质的鉴定、蛋白质结构的解析、靶向蛋白质定量、以及生物技术药物研发、质量控制和体内药代动力学研究方面应用越来越广泛。药典委拟制定《中国药典》蛋白质组学分析方法及应用指导原则,并于2024年2月20日发布公示稿(详见附件)并征求意见。该指导原则适用于蛋白质组学在蛋白质组成及其变化规律、蛋白质翻译后修饰以及蛋白与蛋白之间相互作用方面的分析研究,规范蛋白质组学分析方法建立,分析过程质量控制和数据分析,确保蛋白质组学分析结果的重复性与可靠性。蛋白质组学分析方法需要具备实用性强、多肽和蛋白的检测特性好以及合适的质控过程,保证分析结果的可靠性。同时蛋白质组学在操作过程中能够处理大量样品。蛋白质组学分析基本流程主要包括:1. 蛋白样品的提取,变性还原,酶解与多肽分离富集;2. 多肽的分析与鉴定;3. 数据分析。分离和富集技术:凝胶电泳和色谱技术分析与鉴定技术:质谱、二维凝胶电泳、X射线分析、核磁共振波谱和透射电子显微镜技术附件: 蛋白质组学分析方法及应用指导原则草案公示稿(第一次).pdf
  • 全自动间断化学分析技术在石化行业应用实现重大突破
    在石化行业中,对炼油污水及工业用水的水质分析,主要是对硫化物、挥发酚、磷酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐、硅酸盐等理化指标的检测分析,这些理化指标也是检验油品质量的重要参考指标之一。目前,实际工作中主要运用传统的手工分析检测手段对炼油污水及工业用水进行分析检测,用手工方法进行检测分析,分析速度慢,准确度低,重复性差,费时费力;且炼油污水的水质比较复杂并含有原油等特殊介质,一般自动化分析仪器无法准确检测这些理化指标。 针对上述情况,朗诚分析技术研发中心与广东石油化工学院、茂名石化质量检验中心通力合作,经过近半年的技术攻关,克服了重重困难,采用德国DeChem-Tech公司的CleverChem型全自动间断化学分析平台,并进行二次开发,自主创新了炼油污水及工业用水专用前处理装置及软件控制系统,成功开发出了适用于炼油污水及工业用水的全自动化学分析系统,在中国石化集团茂名石油化工公司投入实际应用,实现了炼油污水及工业用水中硫化物、挥发酚、磷酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐、硅酸盐等理化指标的全自动化检测,不仅速度快、自动化程度及智能化高、样品量与试剂用量少,而且结果的精确度及灵敏度也远远优于传统手工分析,大大提高了该单位的检测效率,同时也节省了大量的分析测试成本。
  • 全自动间断化学分析技术在石化行业应用实现重大突破
    在石化行业中,对炼油污水及工业用水的水质分析,主要是对硫化物、挥发酚、磷酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐、硅酸盐等理化指标的检测分析,这些理化指标也是检验油品质量的重要参考指标之一。目前,实际工作中主要运用传统的手工分析检测手段对炼油污水及工业用水进行分析检测,用手工方法进行检测分析,分析速度慢,准确度低,重复性差,费时费力;且炼油污水的水质比较复杂并含有原油等特殊介质,一般自动化分析仪器无法准确检测这些理化指标。 针对上述情况,朗诚分析技术研发中心与广东石油化工学院、茂名石化质量检验中心通力合作,经过近半年的技术攻关,克服了重重困难,采用德国DeChem-Tech公司的 CleverChem型全自动间断化学分析平台 ,并进行二次开发,自主创新了炼油污水及工业用水专用前处理装置及软件控制系统,成功开发出了适用于炼油污水及工业用水的全自动化学分析系统,在中国石化集团茂名石油化工公司投入实际应用,实现了炼油污水及工业用水中硫化物、挥发酚、磷酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐、硅酸盐等理化指标的全自动化检测,不仅速度快、自动化程度及智能化高、样品量与试剂用量少,而且结果的精确度及灵敏度也远远优于传统手工分析,大大提高了该单位的检测效率,同时也节省了大量的分析测试成本。
  • 访北京科技大学分析检验中心
    为了解中国科学仪器的市场情况和应用情况,同时将好的检测机构及其优势检测项目推荐给广大用户,“仪器信息网”与“我要测”自2008年6月1日开始,对不同领域具有代表性的实验室进行了走访参观。近日,“我要测”工作人员参观访问了北京科技大学分析检验中心。   北京科技大学分析检验中心实验测试中心   北京科技大学分析检验中心(以下简称“中心”) 是北京科技大学唯一面向社会全面开展分析检验服务的窗口,由“北京科大分析检验中心有限公司”负责中心的建设和运营。中心于2008年完成了实验室认可(CNAS)和计量认证(CMA),成为独立的第三方商业化实验室。   北京科技大学分析检验中心   中心资质   中心办公室位于北京科技大学的材料测试楼。此次我们参观中心时,中心正在紧张进行着“首届全国大学生金相技能大赛”的筹备工作和组织兄弟院校师生的参观,我要测到访人员仍然得到了中心常务副主任兼北京科大分析检验中心有限公司常务副总经理刘亚东先生、中心张老师的热情接待。   中心建设发展历程   在共享科技资源,为社会提供服务这方面,各高校都拥有各自的优势和特色,但在实际开发运营中,常常面临着同样的问题,如资源分散在各院系和多个实验室,内部的科研教学任务和对外部的服务不易协调等。而北京科大分析检验中心有限公司则是高校科技资源市场化运营的先行者,也是高校实验室资源建设、开发和整合的领先者,比较好的解决了这些问题。很多成功的经验,也许可供其他院校实验室和机构借鉴。   据刘亚东先生介绍,2004年首都科技条件平台建设启动,提出要建立科技资源开放服务体系,高校及科研院所采取科技资源整体开放模式时,北京科技大学就是最早的三个创新试点单位之一(高校、企业、转制科研院所各一),在促进高校和科研机构的资源开放,探索高校科技资源、检测资源、设备和技术资源开发利用道路的过程中,北京科技大学逐渐确定了“市场化运作,公司化运营”的方向,并于2005年12月8日,成立了北京科大分析检验中心有限公司。2007年8月,北京市科学技术委员会前来调研平台建设情况,给予了高度评价。随着北科大模式得到广泛认可,2009年首都科技条件平台研发基地建设启动时,参考采用了北科大探索出的不少成功经验和模式。   经过7年的开发和建设,中心逐渐完成了各种资源的集中和整合:集中了学校的仪器设备资源,尤其是通用检测设备,由中心实行专人、专业化的管理维护。实验室和测试设备也集中到了主楼、材料测试楼为主的实验场所,方便工作的开展。人员方面,除了协调安排科研教学岗位的师资力量,中心还逐渐建立了一支以管理仪器设备和分析测试工作为主要任务的实验教师团队,均为专精分析检测工作的工程师和高级工程师,包括一些经验和技术丰富的教授级高级工程师,除此之外,还有不少退休的专家学者作为后备力量,技术实力相当可观。   在开发整合的同时,中心也认识到在高校原有体制下效率较之独立第三方检测机构是比较低的,因此不断扫清沟通障碍和优化管理,提高反应速度和服务效率。   目前,中心已拥有各类仪器设备1500多台套,能够提供以“材料制备、化学性能测试、物理性能测试、力学性能测试、组织结构分析、金相及热处理”六大体系为主的分析测试服务。中心在不断提高分析检测技术水平的同时,也依托高校首个科学中心:北京科技大学国家材料服役安全科学中心进行测试装置与设备的开发,其中包括国家重大仪器专项项目“极端特殊环境下材料及构件试验评价科学装置研制与应用”中的部分项目,如衍生测试装置与数据库等的研发任务。   中心仪器设备   在先前的金相技能大赛报道(详细报道)中,我们提及过一点北科大在显微镜科研应用方面的历史,而目前,中心有十余台电子显微镜用于科研教学和分析测试工作,并保持着良好和稳定的状态,主要用于材料的成分、组织、结构的分析等。   蔡司EVO 18 扫描电子显微镜   FEI Tecnai G2 F30透射电子显微镜   LEO 1450 电子显微镜及HKL Channel4背散射电子衍射分析系统   蔡司Ultra 55扫描电子显微镜   PPMS材料综合物性测量系统   国内比较少见的量子设计(Quantum Design)公司PPMS材料综合物性测量系统,能够在1.9k~400k温度范围和0~±9Tesla的磁场下进行多种材料物性测试,能够在变温度、变磁场、连续低温下测试材料的直流电阻、交流电阻、Hall效应、I-V特性、临界电流、DC磁化强度、AC磁化率、比热、热导率、热电势等各种磁学、电学、热学参数。   ULVAC CCT-AV-II模拟连续退火装置   日本ULVAC理工株式会社的CCT-AV-II模拟连续退火装置,主要用于金属板材的退火等工艺过程的模拟仿真试验。   Zwick/roell BUP600板材成形试验机   Zwick/roell BUP600板材成形试验机,用于检测金属薄板的成形性能,能够进行杯突、拉深、扩孔、锥杯、凸耳、拉弯回弹、液压胀形试验、以及成形极限曲线的测定。   中心还配备了多种规格的电子万能试验机,用于材料的力学性能测试与分析。   数种济南试金电子万能试验机   数种美特斯(MTS)电子万能试验机   济南东测试验机   中心定制的济南东测试验机,用于精确的测试及比较细小的样品如金属薄片、薄带样品等的测试。   DSI Gleeble 3500   正在进行测试的DSI热/力模拟试验机Gleeble 3500。Gleeble 3500能在室温~1450℃范围内,对各种金属材料进行多种热力学分析及测试。   轧制成型实验室   中心的材料轧制成型实验室和机加工实验室,比一般实验室要大许多,看起来比较像车间,配备了冷轧、热轧成型和加工设备。完备的设备使中心能够进行从材料冶炼、到轧制成形和材料加工制备的一系列材料研发分析工作。   实验室内配备了真空感应熔炼炉、真空淬火炉等冶炼设备。   真空淬火炉   实验室内使用的热轧机、冷轧机,均为实验轧机,比一般工厂用于生产的轧机要小得多,是兼顾粗轧和精轧的可逆式轧机,主要用于对试样进行实验,通过分析得到合理和优化的轧制工艺参数,为工业生产提供实验数据。   热轧实验轧机   冷轧实验轧机   瓦里安715-ES电感耦合等离子体发射光谱仪   中心的化学分析中心内配备的瓦里安715-ES电感耦合等离子体发射光谱仪,主要用做对无机元素的定量定性分析,我们参观时正在对大量钢铁样品做检测。   纳克CS-2008碳硫分析仪,主要用于测定矿物、钢铁及合金中的碳硫含量   纳克ON-3000氧氮分析仪,主要用于测定钢铁及合金中的氧氮含量   赛默飞世尔M6原子吸收光谱仪,搭配FS95自动进样器   莱伯泰科UV8100紫外可见分光光度计   由于时间关系,此次我们仅参观了北京科技大学分析检验中心的部分实验室,但所见到的设备及中心良好的师资力量,给我们留下了深刻印象。   附:   北京科技大学分析检验中心展位   http://www.woyaoce.cn/member/T100466/   北京科大分析检验中心   http://www.ustbtest.com/
  • 巴西新原油实验室选用赛默飞世尔质谱仪
    巴西新原油实验室选用 Thermo Scientific 组合质谱仪快速分析石油样品 -组合质谱仪将用于快速的同时分析石油样品中的多种成分。全球服务科学行业的领导者赛默飞世尔科技,今天公布汤姆森质谱实验室的新原油实验室购买了一台 Thermo Scientific LTQ FT Ultra 组合质谱仪 。该实验室隶属于巴西坎皮纳斯州立大学( State University of Campinas )化学研究所。这台 LTQ FT Ultra™ 将用于快速的同时分析石油样品中的多种成分,以加速生产并提高该实验室的工作效率。 石油是世界上最复杂的天然混合物和最具有化学分析挑战性的样品之一。新原油实验室是巴西石油巨头巴西国家石油公司( Petrobras )和巴西国家石油管理局( ANP )的合作伙伴。为了通过学术研究促进新分析技术的研发,巴西国家石油公司投资 250 万美元在汤姆森质谱实验室中建成了一个原油实验室。该原油实验室将会评估傅里叶变换质谱仪( FTMS )在原油生产加工中的应用。该实验室进行的实验已经突显了此技术在直接分析原油样品方面的优势,不需要额外的样品前处理和在线分离技术。 该实验室之所以选 择Thermo Scientific LTQ FT Ultra ,是因为它独一无二的快速鉴别多种化合物的能力,它仅用 10-15 分钟就能鉴别单个石油样品中的多达 10 , 000 种天然化合物的分子式。另外,它还能将最先进的离子阱和傅里叶变换离子回旋共振技术独一无二的结合在一台仪器上,为原油实验室提供优异的分析技术和多功能性。正因如此, LTQ FT Ultra 显著提高了所采集数据的质量和数量。 新实验室的协调员 Dr. Marcos Nogueira Eberlin 教授这样评价:“直到最近,巴西新原油实验室的研发主要还是通过公共资源来完成的。然而,巴西的石油公司现在越来越多地与科研实验室合作开发最新的先进分析技术。我们原油实验室应用了LTQ FT Ultra 组合质谱这样的先进技术,确保我们达到巴西国家石油公司对最快分析速度和最佳数据品质的要求。 LTQ FT Ultra 是我们实验室基础设施中一个非常重要的工具,它帮助我们显著提高了巴西国家石油公司的石油开采和生产加工的能力。” 关于赛默飞世尔科技( Thermo Fisher Scientific ) 赛默飞世尔科技有限公司( Thermo Fisher Scientific Inc. )(纽约证交所代码: TMO )是全球科学服务领域的领导者,致力于帮助客户使世界变得更健康、更清洁、更安全。公司年度营收达到 105 亿美元,拥有员工 34,000 多人,为 350,000 多家客户提供服务。这些客户包括:医药和生物技术公司、医院和临床诊断实验室、大学、研究院和政府机构以及环境与工业过程控制装备制造商等。该公司借助于 Thermo Scientific 和 Fisher Scientific 这两个主要品牌,帮助客户解决从常规测试到复杂的研发项目中所面临的各种分析方面的挑战。 Thermo Scientific 能够为客户提供一整套包括高端分析仪器、实验室装备、软件、服务、耗材和试剂在内的实验室工作流程综合解决方案。 Fisher Scientific 则提供了一系列用于卫生保健,科学研究,以及安全和教育领域的实验室装备、化学药品以及其他用品和服务。赛默飞世尔科技将努力为客户提供最为便捷的采购方案,为科研的飞速发展不断地改进工艺技术,并提升客户价值,帮助股东提高收益,为员工创造良好的发展空间。欲获取更多信息,请登陆: www.thermofisher.com (英文), www.thermo.com.cn (中文)。
  • 布鲁克为timsTOF平台推出新型测序算法,提高免疫肽组学分析准确性和速度
    2023年3月,布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)在美国HUPO会议上宣布为基于timsTOF平台的4D-蛋白质组学推出十分重要的生物信息学工具:  1. 与Rapid Novor公司合作开发了一种新型从头测序算法,使用超过170万个PASEF数据点来提高实时免疫肽组学分析的准确性和速度。timsTOF SCP系统无与伦比的灵敏度与新的PaSER Novor算法相结合带来免疫肽组学分析性能的全面提升,尤其是针对微量肿瘤活检样本   2. 用谱图库非依赖(Library-free)的TIMS DIA-NN软件进行dia-PASEF数据分析进一步提高了定量的准确性   3. Mass Dynamics图形可视化和统计云软件与4D-Proteomics的dia-PASEF数据可实现无缝集成。  A. 应用于免疫肽测序的PaSER Novor  凭借PaSER Novor,布鲁克推出在免疫肽组学分析的高级功能,它是由布鲁克与Rapid Novor(快序生物,一家加拿大软件和提供抗体测序服务的CRO公司)合作开发完成的。  免疫肽组学在timsTOF SCP超高灵敏度平台上对微量肿瘤活检样品中非蛋白水解肽进行测序。基于蛋白质组学数据库算法可能由于搜索空间太大导致无法进行精确搜索,造成重复性低和搜索时间长等问题。PaSER Novor使用基于GPU的布鲁克PaSER蛋白质组学软件平台,在训练了超过170万个timsTOF数据点后,可以直接从碎片离子谱图中从头测序获得多肽序列,从而得到实时结果。  莫纳什大学(Monash University)免疫蛋白质组学实验室主任Tony Purcell教授说:"从头测序分析是我实验室多年来研究的一个重要方面。这种新的算法在实时采集数据条件下,以更快的速度提供准确的结果,实现了大规模和实时的免疫肽组学分析。这对我的团队如何快速地将科学研究向临床转化具有重要意义,这一工作流程提供的检测结果也会对临床患者产生深远影响。”      图1:A 9-mer peptide sequenced by PaSER Novor  图2:timsTOF SCP ultra-high sensitivity MS  B. TIMS-DIA-NN 2.0 实现谱图库非依赖的dia-PASEF分析  TIMS DIA-NN是以CCS为中心的DIA–NN [1] 新版本,与之前版本相比具有显著的改进。TIMS DIA-NN 2.0通过新的机器学习,可以实现library-free dia-PASEF数据分析流程,并进一步提高定量准确性。加州大学戴维斯分校蛋白质组学核心实验室主任Brett Phinney博士评论道:“蛋白质组学已经取得了长足的进步,但色谱和数据分析具有与质谱仪相同的重要性。大队列样本分析时稳定的色谱系统,与DDA和DIA的实时搜索相结合,使我的实验室效率达到了更高的水平,而这只有通过TIMS DIA-NN的library-free搜索功能才能达到更好的结果。”  C. Mass Dynamics对4D-Proteomics的大规模图形知识可视化  通过与澳大利亚Mass Dynamics软件公司的联合创始人、WEHI公司的Andrew Webb教授合作,布鲁克timsTOF 4D-Proteomics通过Mass Dynamics的统计分析、交互式和可视化技术,可以直观地提取蛋白质组学信息。除了蛋白质列表、火山图、蛋白质相互作用图、PCA图,其它一系列可视化视图都有助于研究者们了解生物学过程和疾病机理。  Mass Dynamics联合创始人兼首席执行官Paula Burton表示:“PaSER的实时搜索功能和Mass Dynamics的发现服务相辅相成,形成强大的联盟。科学家们现在可以专注于生物学问题,借助蛋白质组学来寻求答案。”  布鲁克生命科学质谱生物信息学总监Dennis Trede博士评论道:"我们很高兴与Rapid Novor和Mass Dynamics的合作。本次合作将为蛋白质组学的发展带来意义非凡的影响。Rapid Novor与超高灵敏度timsTOF SCP相结合,现在可在活检小肿瘤样本中获得大规模的免疫肽组学数据。在美国HUPO发布的所有布鲁克软件解决方案适用于所有型号timsTOF平台:timsTOF Pro 2、timsTOF HT、timsTOF SCP和timsTOF fleX。在国际HUPO坎昆会议上发布的Biognosys Spectronaut® 17软件拥有全新的Direct DIA+功能,且完全支持timsTOF平台上的dia-PASEF数据。”    图:Mass Dynamics visualization for TIMS DIA-NN data
  • “雕刻”细胞!浙大、北大联手在单细胞蛋白质组学分析研究领域取得新突破!
    p    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 近日,浙江大学方群团队联合北京大学黄超兰团队在单细胞蛋白质组学分析研究领域取得了突破性进展。 /span 此项成果近日以全文形式在线发表于美国化学会的Analytical Chemistry杂志上(影响因子 6.32),论文题目为“Nanoliter-Scale Oil-Air-Droplet Chip-Based Single Cell Proteomic Analysis”。 /p p style=" text-align: center " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/noimg/0d88aade-7372-4d68-b5da-4d57efa64b73.jpg" title=" 001.jpg" width=" 650" height=" 478" border=" 0" hspace=" 0" vspace=" 0" style=" width: 650px height: 478px " / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 图:纳升级油-气-液滴(OAD)芯片和自动定位(SAM)装置的结构示意图(a)和用于单细胞蛋白质组分析的样品前处理和上样的全流程图(b)。 /strong /span /p p   蛋白质组学是后基因组计划之一,也是近年来的热点研究领域。作为生命体内功能直接执行者的蛋白质,和基因相比在揭示生命发育和疾病的发生发展的机制方面有更重大的意义。近年来,基于细胞群体内的蛋白质组学研究,因为不可避免地会将大量细胞内的信息平均化,已经越来越难以满足对生命功能更加深入探究的需要。从单细胞层面去了解细胞特征以及彼此之间的相互影响,可以为生物系统中细胞间的异质性提供更宝贵的信息,因此有着越来越大的迫切需求。 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 鉴于蛋白质不具有直接扩增的特性,以及蛋白质组学分析灵敏度的限制,目前对于少量乃至单细胞内蛋白质的检测在技术上还是极具挑战的。 /span /p p    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 单细胞内蛋白质含量极少,就典型体细胞而言仅为0.1- 0.2 ng,远远小于常规蛋白质组学样品前处理所需要的微克级蛋白量。 /span 并且细胞内的蛋白质通常需要在离心管内完成复杂多步的前处理操作,包括细胞裂解和蛋白质释放、蛋白质沉淀纯化、蛋白质还原和烷基化、酶切等,一个全细胞裂解蛋白质组的最后反应体积均是几十甚至过百微升,在这个蛋白质组学常规前处理的过程中,由于样品与离心管的接触、多步的样品转移和不完全上样等原因,在进入质谱之前不可避免地带来了蛋白质的损失。用此流程来处理单细胞,即使之后结合液相色谱仪器的自动进样阀可以以小于十微升的体积完成上样也无济于事,因为尚未等到分离蛋白质样品就有可能已经损失大半了。 /p p style=" text-align: center " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/noimg/ce546442-97dc-4a87-a243-558d62afe43e.jpg" title=" 003.png" / /p p    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 如果说单细胞蛋白质组学是在米粒上雕刻,那么两个团队就是造出了适合在米粒上雕刻的工具刀。 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 该项研究起自2014年,两个团队的研究人员协同合作将微流控液滴技术与蛋白质组分析技术相结合,发展了一种微型化的油-气-液“三明治”芯片及相应的纳升级液体操控和进样方法,能够在原位静态的纳升级液滴中完成少量细胞蛋白质组学分析所必需的多步样品前处理操作,并且实现了将液滴样品直接高效地注入到色谱分析柱内完成后续的液相色谱分离与质谱检测。 /span 通过采用优化后的芯片材料、裂解试剂、酶切比例和色谱质谱参数等实验条件,该芯片系统可以分别成功地从100、50、10和1个HeLa细胞内鉴定到1360、612、192和51个蛋白质。更重要的是,研究人员首次实现了以单个鼠卵母细胞为初始样本的蛋白质组学分析,一共鉴定到355种蛋白质,其中存在一系列与生殖发育(Ovgp1和Pabpc1)、疾病相关(AnxA6,Kpna2,Cct6a和Pcbp2)的基因。在该工作中,还采用两种常规的基于离心管的前处理方法进行了对照实验,实验结果明确证实了微流控液滴体系具有更低的样品吸附损失、更高的酶切效率和更高效的疏水性蛋白质鉴定能力等明显优势,更适用于微量蛋白质样品的蛋白质组学分析。 /p p    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 此项研究带来三个突破 /span :首先是成功发展了适合进行单细胞及类似微量样品的蛋白质组学分析样品前处理芯片和方法。芯片内550 纳升的液滴与芯片的接触面积仅为常规离心管模式下的十五分之一,显著减少了样品与反应器接触所带来的损失;二是发展了一种实现纳升级液滴的直接进样方法,利用3D打印加工的自动定位装置和高压气泵高效地(& gt 99%)将液滴样品注入到分析色谱柱内,完全避免了样品转移和经过液相仪器内复杂管路带来的损失;第三是为避免在常规微流控液滴系统中由于油相直接接触液滴而造成的缺陷,提出了一种采用气相来间隔液滴相和油相的新型液滴芯片结构,在成功防止液滴明显蒸发的同时,还避免了油相和液滴相直接接触带来的脂溶性样品的损失,也使系统能更方便地进行后续的分离柱进样、色谱分离和质谱检测。 /p p    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 该项研究在基于质谱的单细胞及微量样品的蛋白质组学分析方面开启了全新的技术,其所具有的系统结构简单、容易搭建、操作方便、可靠性高等特点,使其有望被广泛应用到细胞间异质性的研究以及与临床相关的研究,包括稀有的循环肿瘤细胞分析、生殖细胞相关研究和疾病诊疗等方面,因此在未来具有巨大的持续开发和应用转化前景。 /span /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/noimg/91e71d83-0fde-4b69-8b5f-10de6af33876.jpg" title=" 未命名_meitu_0.jpg" width=" 400" height=" 400" border=" 0" hspace=" 0" vspace=" 0" style=" width: 400px height: 400px " / /span /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " (左上:浙江大学 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 教授 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 方群、 /span /strong strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 右上: /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 北京大学 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 教授 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 黄超兰、 /span /strong strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 左下: /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 浙江大学博士生李紫艺、 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 右下:前国家蛋白质科学中心· 上海高级工程师 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 黄敏 /span span style=" color: rgb(0, 112, 192) " ) /span /strong /p p   该论文的第一作者为浙江大学博士生李紫艺,通讯作者为浙江大学化学系微分析系统研究所方群教授和北京大学医学部精准医疗多组学研究中心主任黄超兰教授。工作得到了国家自然科学基金和中国科学院杰出技术人才项目的支持。黄超兰教授的部分工作在前单位中科院国家蛋白质科学中心· 上海完成,特此鸣谢! /p p style=" line-height: 16px " img src=" /admincms/ueditor1/dialogs/attachment/fileTypeImages/icon_pdf.gif" / a href=" http://img1.17img.cn/17img/files/201805/ueattachment/b0d2802c-066e-4fdf-86c9-b683f1c317de.pdf" style=" color: rgb(0, 112, 192) text-decoration: underline " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " Nanoliter-Scale Oil-Air-Droplet Chip-Based Single Cell Proteomic Analysis.pdf /span /a /p p span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 文章链接: /span a href=" https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b00661" _src=" https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b00661" style=" color: rgb(0, 112, 192) text-decoration: underline " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.8b00661 /span /a /p
  • 1086万!长春中医药大学中医药蛋白组学分析检测平台建设采购项目
    一、项目基本情况项目编号:采购计划-[2024]-01439号项目名称:长春中医药大学中医药蛋白组学分析检测平台建设预算金额:1086.000000 万元(人民币)最高限价(如有):1086.000000 万元(人民币)采购需求:本项目主要采购四极杆超高静电场轨道阱超高分辨质谱仪及蛋白纯化系统等仪器设备,用于新药研发,代谢物鉴定、研究与疾病有关的标记物和蛋白组学、脂质组学、小分子和生物大分子的相互作用、快速纯化多种生物分子等,进行中医药生物组学分析检测平台建设。合同履行期限:自签订合同之日起,国产设备30天完成供货安装;进口设备90天内完成供货安装,任何迟交货将不予接受。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2024年05月10日 至 2024年05月16日,每天上午9:00至12:00,下午12:00至15:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:长春市绿园区皓月大路1888号(吾悦国际中心15栋1908室)方式:有兴趣的合格投标人,请携带营业执照副本、单位负责人授权书(含单位负责人及被授权人身份证明)的原件及加盖红章的复印件,于2024年5月10日起至2024年5月16日(法定节假日除外)北京时间每日9:00至15:00,在吉林省公诚采购建设招投标有限公司领购招标文件。售价:¥1000.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:长春中医药大学     地址:吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号        联系方式:曲婧 0431-86172126      2.采购代理机构信息名 称:吉林省公诚采购建设招投标有限公司            地 址:长春市绿园区皓月大路1888号(吾悦国际中心15栋1908室)            联系方式:李佳 18946768247            3.项目联系方式项目联系人:李佳电 话:  18004312825
  • 沃特世11月3日"食品过敏原分析:非靶向组学研究和靶向蛋白组学分析"网络讲座即将启动
    日期: 2017年11月3日时间: 14:00 – 16:00地点: 网络讲座语言: English 食物过敏原是食物中可能导致体内异常免疫反应的成分,通常是相对分子量为10000?70000的蛋白质或糖蛋白。食物过敏研究是蛋白质组学在食品科学领域的重要应用。食物过敏会导致皮肤发红和肿胀,甚至休克死亡,这是一个需要高度关注的问题。 曼彻斯特大学的Clare Mills教授是这个领域非常活跃的学者。她与当地医院建立了良好的合作关系,通过大量的临床样本分析,从食物过敏原标志物的发现、鉴定到其对人体的影响开展了广泛的研究。 在研究中,她使用高水平的离子淌度质谱系统发现食物过敏原标志物,进一步开发了可应用于食品过敏原监测和常规检测的高灵敏度LC / MS(串联四极杆质谱)检测方法。 在本讲座中,Mills教授将以花生为代表与您分享研究思路和成果。 主讲人:Clare Mills博士 曼彻斯特大学,炎症与修复研究所,曼彻斯特生物技术研究所,曼彻斯特健康科学学术研究所分子变态学教授 Mills教授目前在曼彻斯特大学从事分子过敏原研究,并领导欧盟综合项目iFAAM和EuroPrevall。 Mills教授运用分子科学研究过敏原,更好地诊断和治疗食物过敏症。 登录沃特世官网并搜索“食品过敏原分析:非靶向组学研究和靶向蛋白组学分析”即可进行注册报名。 此网络讲座免费报名参加。您只需要使用一台链接网络的电脑即可参加,如果您需要在讲座中加入讨论或语音提问,请您提前准备好麦克风。收到您的注册信息后我们会筛选并在讲座前一天通过电子邮件给您发送讲座登录链接。如有任何问题请拨打电话:021-61562642或发送邮件至minxing_guo@waters.com,谢谢。
  • 布鲁克推出 timsTOF Pro质谱仪 可实现更高灵敏度蛋白质组学分析
    p style=" text-align: center " img title=" IMG_1279.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/053b4ae8-ce11-4330-abec-7a4ed6c2a53a.jpg" / /p p   2017年9月18日,在第十六届人类蛋白质组学年度世界大会(HUPO)上,Bruker推出了用于PASEF质谱的timsTOF Pro系统。该质谱采用了专有捕获离子迁移谱(TIMS)技术,能实现更高速度、更高灵敏、更强大的鸟枪法蛋白质组学分析,具有出色的单次肽和蛋白质鉴定性能。 /p p   基于TIMS创新技术的四极杆飞行时间质谱仪(QTOF-MS)由MaxQuant / Perseus和PEAKS Studio蛋白质组学分析软件支持,这种timsTOF Pro方法对于定量蛋白质组学工作流程尤其有利。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp 从较小样品量的识别性能方面,这种独特的前端TIMS分析仪对更高速度的鸟枪法蛋白质组学进行了优化。其独特的双TIMS几何形状允许离子在第一个TIMS部分中并行累积,并且在实时执行额外的TIMS分离步骤之后,离子从第二个TIMS部分释放出来,用于MS / MS碎裂。这可以产生近100%的占空比,使得这种平行堆积和连续碎裂(PASEF)技术在酶促消化产生的蛋白质混合物中,应用可重复纳流LC-MS分析可以具有前所未有的性能。 /p p style=" text-align: center " img title=" timsTOF_Pro nanoELUTE_3D - 副本.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/b2589663-240a-424c-8bb3-77fa0c6b1803.jpg" /    /p p & nbsp & nbsp & nbsp PASEF能力代表了性能的改进,因为它提供更高灵敏度和更高速度的鸟枪法蛋白质组学分析,而不损失质量分辨率。而之前,更高的扫描速度通常导致用于鸟枪法蛋白质组学的基于FT的质谱技术具有较低质量分辨率。这些临界限制可以由PASEF消除,允许以高灵敏度以及接近100%的占空比,同时还可以保持前体和产物离子的超高质量分辨率。双TIMS技术这一重要PASEF功能,有助于科学家们深入研究细胞复杂生物学以及发现重要低水平生物学蛋白。同时,这一功能也有助于蛋白质翻译和临床蛋白质组学研究中的验证和纵向研究。 /p p   定量蛋白质组学是蛋白质组学研究的关键领域,双重TIMS供电的PASEF提供了超越传统门控时间串联FT的质谱分析局限性的优势。新的timsTOF Pro提供超过四个数量级的动态范围,低肽负载(100-200ng),这使得它非常适合于研究细胞生物学和临床中经常遇到的小细胞群体和低样品量的蛋白质组学。 /p p   德国马丁斯堡的马克斯· 普朗克生物化学研究所蛋白质组学和信号转导系主任马蒂亚斯· 曼(Matthias Mann)表示:“我的实验室与布鲁克合作开发PASEF技术,我们很高兴看到timsTOF Pro实现我们最初设想的鸟枪法蛋白质组学的潜力。这种新技术有可能革新蛋白质组学的几个领域:临床研究,其中速度和定量能力是运行大样本队列的关键 需要增加灵敏度的应用 富含磷酸肽或其中有限数量的细胞可用于分析的样品;并且对于使用等压标记的定量实验,其中使用捕获的离子迁移率的额外分离可以至少部分地消除引起所谓的比例压缩效应导致不可接受的误差的共分裂物质的干扰。我们对技术进一步发展的潜力感到非常兴奋。“ /p p   Bruker Daltonics的Omics解决方案副总裁Gary Kruppa表示:“蛋白质组学研究人员总是希望提高速度,灵敏度和定量能力,同时保持高分辨率,准确的质量和高保真度同位素图案,以便更深入地了解蛋白质组。使用PASEF,科学家们现在不需要将扫描速度和敏感度的解决方案进行权衡,它们通过TIMS前体离子选择获得高灵敏度,高扫描速度和无与伦比的特异性这三重效果。这提供了发现低水平生物相关蛋白质的可能性,目前它们是超出了非TIMS质谱仪的性能范围的。“ /p p   马丁· 马克斯普朗克生物化学研究所计算系统生物化学小组组长Juergen Cox评论说:“Bruker决定采用开放文件格式,以便我们可以直接使用原始数据,将有利于蛋白质组学研究人员的使用MaxQuant和Perseus软件平台。我们对数据质量特别重视,并期待与Bruker合作,通过最先进的客户支持软件和分析统计查询,我们可以使用PASEF在timsTOF Pro上获取数据。“ /p p   关于带有PASEF的timsTOF PRO /p p   专有的timsTOF Pro系统使用通过捕获离子迁移光谱(TIMS)实现的PASEF,为鸟枪法蛋白质组学提供了行业领先的数据采集速度。 timsTOF Pro的独特双TIMS几何结合了TIMS设备中离子包的时间聚焦,意味着PASEF提供的速度优势同时提高了灵敏度和定量。所有这些在速度,灵敏度和定量方面的增益保持了Bruker的高性能QTOF质谱仪的优势,包括高质量分辨率(即使在最高数据采集速率下,分辨率为50,000 FWHM),ppm精确质量和高同位素保真度(True同位素模式或TIPTM)。具有PASEF的强大的timsTOF Pro为科学家提供了深入细胞机器复杂生物学研究、发现低水平生物学重要蛋白质、在蛋白质翻译以及临床蛋白质组学研究中进行验证提供了有力工具。 /p p   关于MaxQuant和Perseus软件平台 /p p   MaxQuant是猎枪蛋白质组学数据分析的行业标准。 Juergen Cox在过去十年发展起来,已经成为肽,蛋白质和翻译后修饰的鉴定和定量最常用的包装。近期,MaxQuant已经适应于timsTOF数据的分析,管理由保留时间、离子迁移率、质量和信号强度所占据的空间中的4D特征。用于多元数据分析的Perseus软件支持生物和生物医学研究人员解释分子定量,相互作用和蛋白质翻译后修饰数据。 Perseus包含用于高维数据分析的统计工具的综合组合,涵盖归一化,模式识别,时间序列分析,跨学科比较和多重假设检验。 /p p   关于PEAKS Studio /p p   生物信息解决方案公司的旗舰软件PEAKS Studio为蛋白质组学研究界提供了创新的质谱数据分析工作流程。自从在二十世纪初期首次亮相以来,PEAKS Studio已被高度认可,其基准测试从头测序算法被集成到所有其他鸟枪法蛋白质组学软件模块中。从头测序与传统数据库检索的结合确保了对原始光谱数据的完整解释,以满足质谱的复杂性和灵敏度,并为蛋白质组学和治疗性蛋白质发现提供了先进的解决方案,如通过肽/蛋白质鉴定和定量,肽图,翻译后修饰和序列变体。 /p p   PEAKS Studio提供的独特工作流程以及由timsTOF Pro的第四维离子迁移率引起的令人信服的数据质量促成了生物信息解决方案公司和Bruker的合作。 /p p   关于布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR) /p p   55多年来,布鲁克已经使科学家们能够突破发现,开发新的应用,提高人类生活质量。 Bruker的高性能科学仪器和高价值分析和诊断解决方案使科学家能够在分子,细胞和微观层面探索生命和材料。 /p p   通过与客户的密切合作,Bruker在生命科学分子研究,应用和制药应用以及显微镜,纳米分析和工业应用方面实现了创新,生产力和客户成功。近年来,Bruker也成为细胞生物学,临床前成像,临床表现学和蛋白质组学研究,临床微生物学和分子病理学研究的高性能系统的提供者。 /p p & nbsp /p
  • 葛瑛团队成果|通过平行代谢物提取和高分辨率质谱对人体心脏组织进行全面的代谢组学分析
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Anal. Chem.上的文章:Comprehensive Metabolomic Analysis of Human Heart Tissue Enabled by Parallel Metabolite Extraction and High-Resolution Mass Spectrometry[1],文章的通讯作者是威斯康星大学麦迪逊分校的葛瑛教授。  心脏收缩需要持续的能量供应。作为一种“代谢杂食动物”,心脏利用多种代谢底物,如脂肪酸、碳水化合物、脂质和氨基酸等,来满足其高能量需求。然而,由于代谢物在极性尺度上具有广泛的覆盖范围,这使得它的提取和检测变得困难。因此,迫切需要对心脏的代谢产物进行全面的组学分析。本研究结合了平行代谢物提取和互补高分辨质谱检测的方法,对人类心脏进行了系统性代谢学分析。作者首先用六种提取方法获得了健康供体心脏组织的代谢物,包括三种单相提取,两次双相提取和一次三相提取,可以充分覆盖不同极性范围的代谢物。其中,单相的提取溶剂分别是100% 甲醇、80% MeOH 和乙腈/异丙醇/水(3:3:2),双相使用了Matyash和Bligh & Dyer法去萃取极性和非极性相,而三相则是进一步将非极性相分离成极性和中性脂质相,极性物质依然保留在水相中。紧接着,作者使用了两种互补的质谱平台进行代谢物检测:超高分辨傅里叶变换离子回旋共振质谱的直接进样(DI-FTICR)和高分辨率液相色谱四极杆飞行时间串联质谱(LC-Q-TOF-MS/MS)。总的实验流程如图1所示。这里总共鉴定到了1340种心脏代谢物,它们具有广泛的极性范围。本工作强调了平行提取和互补质谱检测技术在人类心脏代谢组研究中的重要性,其可作为帮助选择适当的提取和MS方法以研究特定类别代谢物的指南。    图1. 平行代谢物提取和高分辨率质谱检测的实验流程图。  为了捕获不同极性的代谢物,作者使用了六种提取方法获得了心脏组织的代谢物。单相法具有操作简便和通量较高的特点,但提取效率仍待提高。相对于单相法,多相提取可以覆盖更广泛极性范围的代谢物,但也需要注意一些代谢物可能在多相中分布,这会给检测和定量带来困难。比如,脂肪酰基链较短的酰基肉碱主要在极性相中存在,而较长链(C10)的酰基肉碱主要在非极性相中存在。DI-FTICR评估了六种提取方法的重现性,结果发现乙腈/异丙醇/水(3:3:2)在单相法中的重现性最好,两种双相法的重现性类似,但低相的Pearson相关性较低,说明了代谢物在跨相运动中有一定潜在困难。研究也发现不同提取方法均具有各自的提取特征,尤其在三相法中可以观察到更多的特征,它在极性相、极性脂质相和非极性脂质相中分别观察到了2275、541 和 443 个独特的SmartFormula注释。图2展示了六种方法通过DI-FTICR得到的代谢物SmartFormula注释,其中最大的三个交叉区域分别是六种方法共享、三相法特有和乙腈/异丙醇/水(3:3:2)特有的,分别有1287个、1010和703个,且发现多相提取的重叠度会更高。虽然在三相提取中可以获得更多的代谢特征,但该方法的重现性也最低。故对于发现代谢组学实验,Matyash提取法会更具优势,因为它可以鉴定到较多的已知代谢物,且重现性会更好。图2. 六种提取方法间代谢物SmartFormula注释的重叠情况(DI-FTICR)。  借助DI-FTICR平台,总共鉴定到9644个代谢特征,其中可以7156和1107个可以分配到SmartFormula注释和准确质量数。DI-FTICR在代谢物检测和鉴定方面具有强大优势,它可以给出准确的同位素分布,如图3B~3D所示。但需要注意的是,由于缺乏前端色谱分离,DI-FTICR对于异构体的分离检测能力有限,以及缺乏高通量的MS/MS分析。因此,作者利用LC-Q-TOF-MS/MS补齐了DI-FTICR检测平台的缺点。在LC-Q-TOF-MS/MS分析中,总共鉴定到21428个代谢特征,其中285个可通过比对二级谱图数据库来匹配确定。图4是鉴定到的代谢物和脂质。尽管与图3B~3C的酰基链组成相同,但在图4B~4C中可以通过观察酰基链的碎裂谱图得到脂质的酰基链信息。这说明LC-Q-TOF-MS/MS平台在获取更详细的酰基链信息方面的优势,但对于双键定位以及 sn1 和 sn2 定位等信息,还需要额外的实验去确定(如:衍生化和离子淌度)。此外,仪器参数设置也会影响到二级匹配评分。总的来说,相对单一的质谱检测平台,使用DI-FTICR MS和LC-Q-TOF-MS/MS平台可以增加心脏代谢组的覆盖范围。图3.使用LC-Q-TOF-MS/MS鉴定代谢物。(A)代表性的MS 谱图(100% MeOH),标注了SmartFormula注释和准确质量数,叠加实验质谱图(黑色)与理论质谱图(红色)以比较同位素分布 (C~D)FAHFA(40:5)、DG(32:0)和N-palmitoyl glutamic acid。图4.使用LC-Q-TOF-MS/MS鉴定代谢物,比较实验串联质谱图(黑色)与数据库质谱图(红色)。(A~D)N-acetyl-β-glucosaminylamine、DG(16:0_16:0)、FAHFA(18:1_22:4)和TG(18:1_18:1_18:2)。  使用多种提取和检测方法,本研究总共鉴定到了1340种心脏代谢物。每种提取方法都贡献了唯一检测到的代谢物。相较于提取效果最好的单一方法,平行提取可以检测到额外的350种代谢物。单相法可以鉴定到更多与二级谱图相匹配的代谢物,而多相法可以得到更多具有准确质量数的代谢物(图5A)。如图5B所示,三相法富集到的代谢物种类最多,包含甘油磷酸乙醇胺(PE)、脂肪酸和偶联物、三酰基甘油、脂肪酸酯和其他代谢物。此外,Matyash法可以鉴定到更多的氨基酸、甘油磷酸甘油和甘油磷酸丝氨酸,B&D法可以鉴定到更多的甘油磷酸胆碱(PC)、和磷磷脂,而100% MeOH鉴定最多的则是甘油磷酸盐。图5.已鉴定的人类心脏代谢物汇总。(A)各种提取方法中的准确质量注释、MS/MS注释和唯一检测到的代谢物 (B)各种提取方法中前10的代谢物种类。  最后,作者进一步表征了所有代谢物的化合物分类和通路富集,如图6所示。实验观察到很多代谢物归属于脂质和类脂分子,其中主要是PC、PE和脂肪酸,而非脂质化合物主要是有机酸及其衍生物(图6A)。通路分析也检测到了与心脏代谢过程相关的重要通路,包括嘌呤代谢和甘油磷脂代谢,如图6B所示。这里以嘌呤代谢(与多种心脏病变相关)为例,展示了平行提取在提高代谢物覆盖率方面的优势。在嘌呤代谢过程中,只有IDP仅在单一提取方法中观察到,而许多代谢物均在所有六种提取方法中都被检测到(图6C)。值得注意的是,B&D提取法在该过程中观察到了最多的代谢物,而100% MeOH富集的最少。上述结果为选择适当的用于分析人类心脏代谢物的提取方法提供了重要见解。图6.已鉴定的人类心脏代谢物的化合物分类和通路富集。(A)化合物分类 (B)所有已鉴定代谢物的通路分析汇总,每个圆圈的颜色和大小分别基于p值和通路影响值(红色表示影响大,黄色则相反) (C)嘌呤代谢过程,颜色表示鉴定代谢物的提取方法。  总的来说,本研究利用六种平行代谢物提取的方法和两种基于质谱检测平台,对人类心脏进行了全面的代谢组学分析,总共鉴定到1340种心脏代谢物,这代表了迄今为止对人类心脏代谢组学的最深度覆盖。研究发现三相法最适合脂质的提取,它获得的极性代谢物的数量与Matyash法相似,但其实验重现性也最低。因此,提取方法的选择应当取决于感兴趣的待分析物。但对于非靶向研究,作者建议使用Matyash提取法,以实现代谢组覆盖率和重现性的最佳平衡。尽管本研究目前还存在一定的局限性,比如,平行提取样品量较大和分析时间较长,但其为选择适当的提取和质谱检测平台去分析不同类型的心脏代谢物提供了宝贵经验,有助于人类心脏代谢组学的全面分析。  撰稿:陈昌明编辑:李惠琳文章引用:Comprehensive Metabolomic Analysis of Human Heart Tissue Enabled by Parallel Metabolite Extraction and High-Resolution Mass Spectrometry
  • 830万!福建医科大学孟超肝胆医院金山院区蛋白质组学分析相关设备采购项目
    一、项目基本情况项目编号:[350101]JKG[GK]2023003项目名称:福建医科大学孟超肝胆医院金山院区蛋白质组学分析相关设备采购项目采购方式:公开招标预算金额:8,300,000.00元采购包1(蛋白质组学分析相关设备):采购包预算金额:8,300,000.00元采购包最高限价: 8,300,000.00元投标保证金: 83,000.00元采购需求:(包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等)品目号品目编码及品目名称采购标的数量(单位)允许进口简要需求或要求品目预算(元)中小企业划分标准所属行业1-1A02100407-质谱仪质谱仪1(项)是详见《采购标的一览表》及招标文件第五章。8,000,000.00工业1-2A02100604-生物、医学样品制备设备生物医学样品制备设备1(项)是详见《采购标的一览表》及招标文件第五章。300,000.00工业本采购包不接受联合体投标合同履行期限:自合同签订之日起90日二、获取招标文件时间: 2023-08-18 至 2023-08-25 ,(提供期限自本公告发布之日起不得少于5个工作日),每天上午00:00:00至12:00:00,下午12:00:00至23:59:59(北京时间,法定节假日除外)地点:招标文件随同本项目招标公告一并发布;投标人应先在福建省政府采购网(zfcg.czt.fujian.gov.cn)免费申请账号在福建省政府采购网上公开信息系统按项目下载招标文件(请根据项目所在地,登录对应的(省本级/市级/区县))福建省政府采购网上公开信息系统操作),否则投标将被拒绝。方式:在线获取售价:免费三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名称:福建医科大学孟超肝胆医院(福州市传染病医院)地址:福州市仓山区金塘路66号联系方式:0591-881126622.采购代理机构信息(如有)名称:福建金开源工程咨询有限公司地址:福建省福州市晋安区鼓山镇后屿路23号福兴楼303单元联系方式:158801338493.项目联系方式项目联系人:庄旭鹏电话:15880133849网址: zfcg.czt.fujian.gov.cn开户名:福建金开源工程咨询有限公司
  • “雷磁”携手中仪学分析仪器分会化学传感器专家组设立“中国化学传感器成就奖奖励基金”
    p   strong  仪器信息网讯 /strong 以奖励在我国化学生物传感器科研领域取得优秀成果,并对我国化学生物传感器事业发展做出突出贡献的中国科研工作者,中国仪器仪表学会分析仪器分会化学传感器专家组(原专业委员会)将在第十四届全国化学传感器学术会议(14th SCCS)上颁发首届“中国化学传感器成就奖”学术奖项。 /p p   为了保证该学术奖项的持续性,大会组委会特设立“中国化学传感器成就奖奖励基金”。上海仪电科学仪器股份有限公司作为该基金的赞助方,携手中国仪器仪表学会分析仪器分会化学传感器专家组(原专业委员会),于2019年8月8日假上海市松江区绿地铂骊酒店举办合作签约仪式,设立“中国化学传感器成就奖奖励基金”。仪电科仪秉承“雷磁”品牌的“务实、创新、求精、致远”的发展宗旨,为中国化学传感器事业的发展贡献力量。 /p p   合作协议的签订,由化学传感器专业委员会主任委员、14th SCCS组织委员会主席、湖南大学吴海龙教授和仪电科仪董事长兼总经理汤志东签署。由化学传感器专业委员会原主任委员、湖南大学原化学计量学与化学传感技术教育部重点实验室主任、二级教授沈国励老先生、中国仪器仪表学会分析仪器分会关亚风理事长、刘长宽常务副理事长、中国仪器仪表行业协会分析仪器分会曾伟秘书长、上海市科委张露路处长、上海科学仪器产业技术创新联盟、上海市分析测试协会马兰凤秘书长等专家,以及上海仪电科学仪器股份有限公司副总经理殷传新、金建余,雷磁传感器公司总经理何海东等人共同见证。 /p p style=" text-align: center" img style=" " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/d1ed5a03-4998-4985-9797-e94353fc23da.jpg" title=" 微信图片_20190809004300_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center" img style=" " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/0578fbe2-94b5-4f6b-8906-0108585449dd.jpg" title=" 微信图片_20190809004215_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong 吴海龙教授与汤志东董事长签署合作协议 /strong /p p   中国仪器仪表学会分析仪器分会化学传感器专家组(原专业委员会)成立于1985年,目前为第六届,由吴海龙教授为组长、俞汝勤院士为主编,分别组成新一届“化学传感器专家组”和《化学传感器》编委会。组织机构有汪尔康、俞汝勤、姚守拙、陈洪渊、张玉奎、董绍俊、马立人、程京、谭蔚弘等9位顾问,其中5位为中科院院士。由其主办的全国化学传感器学术会议(SCCS),从最初的全国离子选择性电极学术交流会到如今的全国化学传感器学术会议,SCCS学术会平均每三年一届,迄今已成功举办十三届,反映见证了我国化学传感器研究领域的发展历程。 /p p   “雷磁”是上海仪电科学仪器股份有限公司的自主品牌,创建于1940年,是中国pH计和玻璃电极的诞生地,也是国内分析仪器的发源地。长期以来专注于电化学分析仪器事业,历经七十多余年发展,雷磁逐步发展成为集研发、生产、销售、应用、集成、服务为一体的高新技术企业。以“为提高人们的生活质量,提供高科技产品和优质服务”为企业目标,创新驱动、转型发展,成为不断进步的科学仪器制造商和检测溯源系统解决方案与运行服务的提供商。 /p
  • 安捷伦与密西西比州立大学合作检测墨西哥湾海产品中的原油污染
    安捷伦科技与密西西比州立大学合作检测墨西哥湾海产品中的原油污染 2010 年 7 月 22 日,北京 &mdash 安捷伦科技公司(NYSE:A)与密西西比州立大学(MSU)宣布,MSU 国家化学实验室的科学家已开发出一种检测墨西哥湾的海产品是否受原油污染的新分析方法。目前该方法已提交给美国食品和药品管理局(FDA)进行审查。 近日,安捷伦为密西西比州立大学安装了测定多环芳香烃(PAH,一种影响海产品的主要原油污染物)含量的 7000 系列 GC/MS/MS PAH 分析仪,由此,新方法的开发取得了突飞猛进的进展。安捷伦的工程师在七月的第一周完成了新仪器的安装工作。 &ldquo 在检测过程中,重现性和精密度是极为重要的,&rdquo 密西西比州立大学副教授兼 MSU 国家化学试验室研究部以及工业与农业服务部主任 Kang Xia 说道,&ldquo 但目前实验室所用的仪器已经不能再提供可靠的数据了。这台分析仪已经用了十多年,由于长年累月的过度使用,已经多次出现机械故障和软件失效。而有了 Agilent 7000 系列 GC/MS/MS PAH 分析仪,这些不利状况将不复存在。&rdquo 此外,使用 Agilent GC/MS/MS PAH 分析仪还大大缩短了从检测样品到向监管机构提供结果的周期时间。即便是分析 20 个样品,从运行测试到获得结果,仅仅只要两天半的时间。而目前美国国家海洋和大气管理局(NOAA)所使用的方法却要花上五六天的时间,可见使用本方法可在时间成本大幅节省。 &ldquo 对于担当着监测墨西哥湾海产品安全性重任的密西西比州以及相关研究机构来说,拥有目前最先进的技术至关重要,&rdquo 安捷伦化学分析部的总经理 Mike McMullen 说道,&ldquo 一直以来,安捷伦不断将尖端技术推向石化、环境和食品安全测试领域,而这恰恰是应对墨西哥湾原油污染的所有重要领域。漏油事故发生后的短短几周,我们的科学家已经开发出全套解决方案,能够立刻提高生产效率和分析性能。&rdquo 国家化学实验室预计在七月底将最新的检测方法提交到 FDA 进行审查。相关研究结果也将发表到同行评审的出版物。 &ldquo 现在,密西西比州的研究、服务和扩展正在发挥重要作用,而在该地区从原油泄漏导致的环境和经济影响中逐渐恢复过来的这段漫长时期,我们会继续提供领先的服务,&rdquo 政府赠地大学研究与经济开发部的副教授 David Shaw 说道。 密西西比州立大学简介 密西西比州立大学是一所政府赠地大学,也是该州科研大学中的佼佼者。在最新发布的报告中,该大学获得超过 2.1 亿美元的研究经费,在所有公立大学中排名第 58 位,并且在工程学方面排名第 34 位,在农业科学方面位列第 5 名。更多信息,请访问www.msstate.edu。 安捷伦科技公司简介 安捷伦科技(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通讯领域的技术领导者,公司的 19,000 名员工在 110 多个国家为客户服务。在 2009 财政年度,安捷伦的业务净收入为45 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com。
  • PHASE发布PHASE原油、渣油、船用燃料油析蜡点/浊点和熔蜡点分析仪新品
    析蜡点(WAT)和熔蜡点(WDT)原油、渣油、重质船用燃料油测试的突破作为开发低温流动性能检测方法的世界知名品牌,Phase有着悠久而引人注目的历史,现在已经扩展了它的能力,包括原油的关键测量:析蜡点(WAT)。析蜡点也被称为浊点,是原油样品在规定的试验条件下冷却时,首次析出固体蜡质的温度。同样,熔蜡点(WDT)是在升温循环中末期的蜡固体熔化成液体的温度。结束了主观的、乏味的测试目前为止,尝试测定原油的析蜡点或浊点是一个不精确、单调和主观的过程。已经尝试了各种手动方法,但都很困难,而且耗时很长,产生的结果误差大得令人无法接受。Phase新推出的WAT-70Xi分析仪创新性的改变了上游和中游石油行业,它是世界上首台一个完全自动测量原油、渣油、船用燃料油WAT和WDT的分析仪。基于ASTM D5773,我们独有的光学闪射技术以极高的灵敏度和准确度检测相位变化。检测速度快,无需设置或清洗这一重要的科学突破意味着,即使是最黑暗、最不透明的样品,现在也可以很容易地进行测试,精度为1.0℃。只需加载样品,其余均由分析仪完成,测试只需15-30分钟即可完成。不需要费时的手动设置,每次测试后自动清洗。值得信赖的70Xi平台设计新的WAT分析仪建立在70Xi系列平台上,具有省时、高效的特点。速度和精度有利于上游和中油石油行业检测WAT和WDT两个关键测试参数有助于理解原油、渣油、重质船用燃料油性质,也决定了蜡沉积和熔化的速度。比所有其他测试方法更快只需15-30分钟即可得到结果,而其他方法的平均测试时间为几个小时。测试不透明样品增强的光学结构可以“看到”黑暗的样品自清洗每次测试后自动使用溶剂冲洗无需手动设置简单地将样品直接注入分析仪后即可开始测试运行优越的精度重复性1.0℃更加敏感可控的自动测试方法确保报告结果没有主观性信息丰富、实时的测试结果完整的相图(回路)清楚地说明了WAT、蜡的相对形成量和WDT。直观的,易于使用的界面全彩色15英寸高分辨率触摸屏,一键式预设“收藏夹”。应用析蜡点(WAT)和熔蜡点(WDT)有助于预测原油中蜡质沉积的发生,对上游和中游石油企业具有重要意义。在油田应用中,WAT和WDT可以帮助确定蜡结晶改进剂和/或蜡沉积抑制剂的优良水平。WAT也是潜在原油不相容的一个指标,也是原油质量变化的一个监测指标。来自同一地区的原油可能具有截然不同的特性,其蜡沉积和溶解速率也不尽相同。位置的变化,提取深度的变化,时间的演变,甚至生产和混合的方法都可以通过WAT来验证。通过管道、铁路或游轮运输原油、渣油 、船用燃料油以及储油,蜡结晶可能会限制流量或造成完全堵塞。WAT和WDT可以帮助定义可接受的可操作性限制,并计算与清洗相关的停机时间和费用。WAT是一种准确预测管道和储罐中蜡沉积的有效工具,具有巨大的潜在节约价值。海底和陆地管道系统的设计和开发以及蜡质修复方案的实施得益于WAT数据的分析。创新点:在原油、蜡油、重质船用燃料油低温测试领域,弥补了空白。对于炼油厂、储运公司及船舶公司检测意义深远。 PHASE原油、渣油、船用燃料油析蜡点/浊点和熔蜡点分析仪
  • 应用行家共议冶金化学分析技术——CCATM’2016化学分析报告会
    仪器信息网讯 2016年9月20日-22日,由中国钢研科技集团有限公司和中国金属学会联合举办的第18届国际冶金及材料分析测试学术报告会暨展览会(CCATM’2016)在北京国际会议中心召开。其中的CCATM’2016化学分析报告会在9月21日-22日进行,包含国际大会报告和国内大会报告,并针对不同应用方法设立了固体化学分会场和湿法化学分会场。  在22日举行的CCATM’2016化学分析报告会国内大会报告上,11位技术研发和企业应用专家分享了最新技术成果。CCATM’2016化学分析报告会现场北京有色金属研究总院 李继东 报告题目《辉光质谱在金属材料中分析应用进展与展望》  李继东在报告中介绍说,辉光放电质谱(GDMS)是痕量和超痕量元素分享的极佳工具。根据供电方式不同,GDMS分为三类,其中直流辉光放电质谱的市场占有率最高,能达到90%以上。除了介绍GDMS的计算原理和仪器机构,李继东解释了目前GDMS的分析优势。分析速度快:通常一个固体进样样品全流程分析时间约1h;测定下限低:多数元素测定下限达到1ppb;基体效应小:可采用相对灵敏度因子进行多样品半定量成分分析。该团队在实验室曾采用GDMS分析过30余种金属合金。李继东还通过实例和数据详细介绍了GDMS在有色金属材料分析中的应用。李继东带领团队起草发布了近十项用辉光放电质谱测定有色金属材料的行业标准。李继东最后总结到,辉光放电质谱与光谱一样有很大的应用发展空间,射频和脉冲辉光放电离子源将进一步拓展其应用;目前,标样(特别是低含量标样)缺乏限制了GDMS的应用,发展标样非常重要。宝山钢铁集团中央研究院 何晓蕾 报告题目《全二维气相色谱/飞行时间质谱法分析焦化废水中的多环芳烃及其它有机物》  何晓蕾介绍了团队以焦化厂经过SBR生化处理前后的废水作为研究对象,采用液-液萃取分离方法,结合全二维气相色谱飞行时间色谱分析技术,建立了多环芳烃和其他有机物的检测方法。团队系统的研究了焦化废水SBR生化处理前后,多环芳烃的含量和毒性变化。通过两组大数据的比对,了解了SBR生化处理前后其他有机物的组成变化和分子构成变化,多环芳烃SBR去除率约为40%,高分子量多环芳烃去除率达100%,该研究获悉了废水处理系统的降解规律,为选择最佳的可行性后续废水处理方案提供了依据。中国船舶重工集团公司第七二五研究所(洛阳船舶材料研究所)刘攀 报告题目《Top-down技术和灰色理论评估化学分析测量不确定度》  刘攀介绍了以合理表征质控数据分散性的标准参数表示不确定度的Bottom-up (GUM)方法。该团队的研究通过45套质控数据验证了平均移动极差、稳健标准查、灰色标准差三种方法的一致性。刘攀还提到,检验检测应用也需要大数据深入探索,继续完Top-down技术。醴陵市金利坩埚瓷厂 荣金相 报告题目《多元复合助熔剂在红外碳硫分析仪上的应用技术》  荣金相介绍了复合助剂的种类和选择方法,以及在红外碳硫分析中的最佳分析条件。不同基体材料要正确选择相匹配的复合助剂,该团队研发并商品化了针对不同材料的复合助剂供以提高红外碳硫分析仪的应用效果。宝山钢铁股份有限公司 朱子平 报告题目《电解法测定化学钝化镀锡板表面铬量》  朱子平介绍了团队目前正在研究的电解法测定化学钝化镀锡板表面铬量的课题情况。镀锡板表面铬测定有比色法、电解法、X荧光法、原吸法和ICP法等。该研究团队设计了电化学测量装置。通过该装置,该研究对化学钝化表面铬电解曲线进行了微分曲线,可以准确判断起始点,进而确定化学钝化电解时间。根据化学钝化电解时间和电解法标定系数,可以得到化学钝化表面铬量。该电解法测量速度快、测量精度好。首钢京唐钢铁联合有限责任公司 张红领 报告题目《BH钢熔炼成分碳含量检测过程样品代表性的研究》  张红领介绍了团队在BH钢熔炼成分碳含量检测中的一些经验与数据结果。为保证球拍样检测过程的精确性,在生产检测过程中BH钢的铣床的铣削程序设置为1.2mm。同样的检验条件下,提桶样检测记过精确性略高于球拍样。球拍样与提桶样两种取样方式检测BH钢连铸碳含量无显著差异。国家钢铁材料测试中心 罗岁斌 报告题目《冶金原材料分析中溶液介质及盐分对电感耦合等离子体原子发射光谱(ICP-AES)分析结果的影响探讨》  罗岁斌介绍了影响ICP-AES信号强度的诸多因素。将无机酸引入检测体系会使进入等离子体内的分析物减少,分析信号降低。在基体匹配的基础上采用内标校正,可以校正硫酸加入量微小差异引起的对金属离子的分析误差。钠盐存在时,硫酸介质和盐酸介质下镁的测试结果均降低,基体匹配可以降低其影响,钠盐对分析信号也有明显影响。严格基体匹配较为困难,采取典型试样组成基体匹配可以完成绝大多数分析,具体个别情况可以采用参考物质监控和标准加入法验证。钢研纳克检测技术有限公司 王学华 报告题目《惰性熔融-红外吸收法测定硅钙合金中氧》  王学华在报告中介绍说,硅钙合金中有效相态组分为硅化钙,而不法行为加入CaO等非有效钙充当有效相态组分,损害产品质量。该研究组采用脉冲加热惰性气体熔融-红外吸收法建立了硅钙合金中总氧含量的测定方法。分析结果精度和准确度较好,RSD在1%左右,可满足实际生产要求。目前尚没有硅钙合金中氧含量的测定方法标准,课题组认为十分有必要建立硅钙合金中总氧含量测定方法。钢研纳克检测技术有限公司 李冬玲 报告题目《管线钢堆焊热区域成分统计分布表征及其组织和性能的相关性研究》  李冬玲在报告中介绍了用于堆焊区域成分标志的分析方法,详细解释了LIBSOPA分析方法及其特点。研究组对堆焊区域的成分、组织与显微硬度分布相关性进行了研究。其研究表明:在硬度较高的环状区域,Ti元素出现富集带,这个区域也是板条马氏体聚集的地方,可见该硬化区与Ti元素的偏析分布以及板条状马氏体分布密切相关。基体的组织晶粒细小、维氏硬度较低,焊材区域的晶粒组织粗大,其Si、Ti元素的含量也明显高于基体,导致其硬度高于基体。河钢集团钢研总院 刘洁 报告题目《光谱分析用镍基合金内部控制样品的研制》  刘洁镍分析了目前行业内基合金新材料种类开发越来越多,镍基合金类标准样品在国内非常少,而进口采购价格昂贵 直读光谱、X荧光光谱等仪器对镍基合金标准样的需求很大。在这种情况下,该研究组利用现有仪器设备资源,研制了3种镍基合金内部控制样品。这些控制样均按照相关标准的要求进行冶炼、锻造、加工、均匀性实验、稳定性检验和定值分析,该控制样品在产品质量、仪器校准、测试方法评价等发面发挥了很好的作用,并能够应用与直读光谱、辉光光谱谱仪和荧光光谱仪成分检测校准。钢研纳克检测技术有限公司 宋宏峰 报告题目《镁合金中11种稀土及非稀土元素的全谱测定及干扰校正》  宋宏峰在报告中介绍了该研究组采用电感耦合器件(CCD)的小型化光谱仪器对一定范围内的谱线进行全谱扫描,具有诸多技术优势。采用该方法,研究者系统研究了稀土镁合金中的十余种金属元素的准确度、短期精密度和干扰校正。研究表明:CCD型全谱光谱仪可以简便、快速的解决镁基样品中稀土元素及其它杂质元素的分析检测。该技术具有检出限低、覆盖面广、不受通道及基体限制等优势,还可以根据用户需求进一步拓展待测元素的种类和测定的含量范围。同时,对较低含量的元素也可以实现高精度、高准确度的检测。
  • “100家实验室”专题:访国家生物医学分析中心
    为广泛征求用户的意见和需求,了解中国科学仪器市场的实际情况和仪器应用情况,仪器信息网自2008年6月1日开始,对不同行业有代表性的“100家实验室”进行走访参观。日前,仪器信息网工作人员参观访问了本次活动的第三十站:国家生物医学分析中心。   国家生物医学分析中心,是国家科技部(原国家科委)1994年正式批准成立的全国唯一的国家级生物医学分析中心,在药物毒物分析、新药研发、蛋白质组分析、代谢组学分析、细胞分析、环境和食品分析等领域拥有雄厚实力,是我国在上述领域科学研究、新药研发和社会经济活动的重要依托基地。与此同时,中心也是军事医学科学院生物医学分析中心、军事医学科学院仪器测试分析中心、全军环境保护研究监测中心和北京市生物医药分析测试中心。   中心已通过国家计量认证和“中国实验室国家认可”,可提供权威的分析数据和检测报告。中心主要任务是:研究和发展生物医学分析领域的新技术、新方法及其在生物医学中的应用,可承担生物医学领域中的核酸、蛋白质分析,有机药物,有机毒物分析,基因工程重组药物分析,微生物分析,致癌致畸致突变物分析,免疫分析,生物自由基分析,细胞分析,微区元素分析,放射计量分析等科研任务。2004年,国家科技部和北京科委决定在中心共建具有当前国际先进水平的“北京质谱开放技术平台”,为我国在上述领域的科学研究、新药产品开发和社会经济活动提供重要的技术支撑和服务。2009年,中心加入“首都科技条件平台”,面向全社会开放提供技术服务。技术服务项目包括:新药报批服务、科研技术平台、测试服务以及专项服务。     资质证书     国家生物医学分析中心主要由以下技术服务平台组成:代谢组学技术平台、蛋白质组技术平台、中药现代化技术平台、细胞生物学技术平台、结构生物学技术平台、环境和食品安全技术平台、微量元素分析技术平台、药物与毒物分析技术平台以及公共突发事件应急分析技术平台。   中心分为7大专业实验室:质谱实验室、核磁共振实验室、电镜实验室、色谱实验室、环境监测实验室、光谱和元素分析实验室,这些专业实验室拥有大量高尖端分析仪器支撑科研工作的进行:   质谱实验室主要核心仪器为9.4T超高性能混合型四极杆串联傅里叶变换离子回旋共振质谱(Q-FT-ICR-MS) ,配套仪器有:高性能多肽测序质谱、高通量飞行时间质谱、磁质谱、飞行时间质谱、电喷雾串联质谱、离子阱质谱、高分辨气质联用以及无机质谱等,已建立完善的一、二、三代生物质谱系统。     Bruker高性能混合型串联傅立叶质谱(Q-FT-MS):9.4T Apex Qe 仪器说明:全球最新版双离子源(DualSource),分辨率超过140万,准确度优于1.0ppm,主要进行小分子物质结构快速解析、蛋白质与核酸序列测定及翻译后修饰分析以及疾病多肽组学研究。   Waters Micromass 高解析离子淌度质谱Synapt HDMS 仪器说明:该仪器为亚洲第一台引进的,主要进行无标记定量蛋白质组学、蛋白质复合物研究以及复杂体系离子淌度分离分析。     Bruker 高速高灵敏多功能串联飞行时间质谱 Ultraflex III TOF/TOF 仪器说明:该仪器为全球第一台,主要进行蛋白质组学、多肽组学、质谱成像、物药报批、修饰分析以及寡核苷酸分析。   电镜实验室配备有透射电子显微镜、激光扫描共聚焦显微镜、原子力显微镜及活体动物体内成像系统等,为研究组织学、病理学、细胞生物学、遗传学及分子生物学提供了重要的测试手段和技术方法。 Bio-Rad Radiance2100 激光扫描共聚焦显微镜  仪器说明:可对细胞内各种荧光标记物及其组分进行定位、定性和定量分析;对细胞、细胞器进行三维图像重建与定量分析。  Hitachi H7650投射电子显微镜 仪器说明:主要对组织、细胞等进行高分辨率、高灵敏度、高对比度的形态结构观察和组分的定性及定量分析。 Varian 600MHz NMR核磁共振 仪器说明:主要进行核磁共振方法学、天然及合成小分子结构、毒物分析、活体核磁共振、代谢组学以及生物大分子空间构象等领域的研究。 国家医学生物分析中心充分发挥人才、设备和技术优势,在保证向社会提供公正、科学、可靠、准确的检测数据的同时,积极参与国家重大项目的研究攻关和国际合作,在国家科技创新体系中成为集研究、培训、咨询、仲裁、成果鉴定、技术服务为一体的生物医学分析中心。中心作为国家生物安全应急分析基地,多次出色完成事关国家安全的重大事件样品分析。 国家生物医学分析中心承担的课题: 课题来源 项目名称 “863”项目 蛋白质组学新技术在肿瘤泛素通路研究中应用 “973”项目 人类肝脏蛋白质组定位图新技术新方法研究 “973”项目 定位整合、原位修复技术及机理的研究 创新研究群体科学基金 人胎肝蛋白质组学及重要细胞调控因子的发掘 国家科技攻关计划项目 蛋白质定位技术平台建立及应用 北京市肝脏及重大肝病的蛋白质组学研究科技计划项目 肝再生中系列蛋白质复合体的研究 国家自然科学基金 阻断泛素通路中Bcl-2蛋白形成复合体的生物质谱分析 “863”项目 蛋白质组技术平台的建立及其在肿瘤细胞泛素通路与凋亡调控研究中应用 国家自然科学基金 阻断泛素通路对正常和肿瘤细胞影响的巨大差异机制研究 “863”项目 应用蛋白质组技术对白血病细胞凋亡相关蛋白的高通量鉴定 国家科技部 生物质谱技术对蛋白复合体的鉴定 “863”计划青年基金 基于Bcl-2蛋白结构的创新药物发现 北京市自然科学基金 微丝相关新蛋白Lca295的空间结构及其与蛋白质间的相互作用 国家自然科学基金重大研究计划 代谢组学方法在中药毒性研究中的应用 国家自然科学青年基金 寡糖溶液构象的核磁共振研究 国家自然科学基金 新型分子成像技术——质谱扫描成像及其应用 国家科技部 一维固相pH梯度等电聚焦结合生物质谱直接鉴定混合蛋白质的方法初探 国家科技部 质谱(MALDI-TOF-MS)扫描成像技术初探 国家科技部 蛋白质组学技术用于分析肿瘤组织特异性自身免疫性抗原   附录:国家生物医学分析中心   http://www.ncba.cn/   国家生物医学分析中心蛋白质组学网   http://www.proteomics.com.cn/
  • 访四川大学分析测试中心
    为了解中国科学仪器的市场情况和应用情况,同时将好的检测机构及其优势检测项目推荐给广大用户,“仪器信息网”与“我要测”自2011年9月1日开始,对不同领域具有代表性的“100家实验室”进行联合走访参观。近日,“仪器信息网”与“我要测”工作人员参观访问了本次活动的第八十二站:四川大学分析测试中心。四川大学分析测试中心相关负责人热情接待了“仪器信息网”与“我要测”到访人员。   四川大学分析测试中心(以下简称“分析测试中心”)始建于1978年,是国家教育部直属高校中首批建成的近代分析测试中心之一,也是教育部直属高校中第一个获得国家计量认证合格证书的检测机构。现在的四川大学分析测试中心由原四川大学分析测试中心、原成都科技大学分析测试中心和原华西医科大学分析测试中心先后合并组成。   据介绍,“目前,分析测试中心拥有核磁共振仪、扫描探针显微镜、电子能谱仪、扫描电子显微镜、透射电子显微镜、四圆单晶衍射仪、X射线粉末衍射仪、电感耦合等离子体-质谱仪、电感耦合等离子体发射光谱仪、拉曼光谱仪、红外光谱仪、原子吸收光谱仪、离子色谱仪、气相色谱仪、液相色谱仪、数字图像分析系统、热分析系统、电子万能材料试验机等大型精密分析测试仪器及相应辅助、配套设备,总价值5000万人民币以上。而且985工程第三期还预算有2900万的资金来购置仪器。”   “分析测试中心于1991年通过了国家技术监督局对本中心的检定测试能力及其可靠性的评审、认证,取得了中华人民共和国计量认证合格证书,并于1996、2001、2006、2010年四次顺利通过复查评审。主要的业务范围包括无机分析、有机分析、微区形貌和成份分析、晶体结构分析、材料力学性能分析等。”   “目前分析测试中心主要服务于学校教学、科研及学科建设,在学校内我们是最好的共享平台,而且我们每台仪器都有专门的老师负责,测试人员的经验很丰富 同时我们也在认监委认定的能力范围内积极为社会提供检测服务。”   “除承担分析检测任务外,分析测试中心教师还直接招收培养生物医学工程、材料学、分析化学、无机化学、高分子化学与物理、环境科学专业的博士、硕士研究生,从事科学研究和科技开发,对外开展检测人员培训等。近年来,分析测试中心教师承担了国家"十五"科技攻关纳米科技重大专项项目和国家‘863’、‘973’、国家自然科学基金项目、国家重大仪器设备专项,以及其它省部级和横向课题等。近年来,每年科研总经费都超过1000万元左右(2011年超过2000万元),在生物医学材料、高分子材料和分析化学研究方面取得显著成绩。”   在采访中,分析测试中心的负责人除了介绍实验室的基本情况外,还特别就目前实验室共享平台建设中存在的一些难题、以及实验室从事分析测试工作的人员待遇等问题谈了自己的观点。   在仪器共享平台建设方面,分析测试中心正在做一些相关的课题研究,据介绍:“目前分析测试中心的仪器是完全共享的,但是若要将学校内各个课题组的仪器纳入共享平台,还有许多问题未能解决,如:第一,没有专门的人来操作仪器为课题组以外的测试服务 第二,课题组的有些仪器是专门针对某项研究课题购置的,所以其性能参数及测试范围有一定的针对性和局限性,适用的样品范围比较窄 第三,如何收费 第四,如何实现各个课题组间共享仪器的信息化联系等。”   关于实验室分析测试人员的待遇问题,也是实验室管理中面临的一个急需解决的问题。据介绍:“测试中心现在有89人,包括测试岗、科研岗和管理岗三类岗位的老师,其中测试岗有50多人。现在如何解决科研岗老师和测试岗老师的考核平衡问题,也是我们正在研究的一个问题。在我们的测试岗位上有不少老师工作十分认真负责,业务能力也很强,但是测试工作量上不去,升职晋级相对较难。   “四川大学现在设置了高级实验师这一职称系列,专门为做测试和实验技术服务的老师提供的,也是解决问题的一个办法。”   最后,谈到目前仪器用户都特别关心的售后服务问题,分析测试中心的负责人介绍说:“一些小的维修问题,测试岗的老师就可以解决,但是大的问题还是要请专门的工程师过来。现在进口仪器基本都是模块式的,自己很难拆开去维修。”   “但是请厂家的工程师来维修,人工费、差旅费,还有更换损坏的零部件的费用,这些消费都特别高。而且约工程师过来以及耗材配件从国外运过来都需要一定的时间,而老师学生们的实验时间又比较紧,所以碰到仪器维修的问题我们很着急。”   以下是分析测试中心的部分实验仪器: 北京科创海光仪器有限公司AFS-9600氢化物发生原子荧光光谱仪 赛默飞世尔科技Finnigan TSQ Quantum Ultra三重四级杆串联液相色谱质谱仪 布鲁克 AVANCE III 500MHz 固体核磁共振波谱仪 FEI Tecnai G2 F20S-TWIN场发射透射电子显微镜 法国HORIBA LabRAM HR激光拉曼光谱仪 斯派克SPECTRO ARCOS电感耦合等离子体发射光谱仪   附录:四川大学分析测试中心   http://atc.scu.edu.cn/
  • 智能数据采集FLASHIda应用于自上而下蛋白质组学分析
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Nature communications上的文章,FLASHIda enables intelligent data acquisition for top–down proteomics to boost proteoform identification counts [1],文章的通讯作者是德国图宾根大学的Oliver Kohlbacher教授。自上而下蛋白质组学(TDP)能够对完整的proteoform进行全面和深入的分析,目前已广泛应用于生物医学研究领域。proteoform在不同的生物系统中具有高度异质性,proteoform水平的信息可以为了解生物生化功能或疾病表型提供重要的信息。近年来,随着TDP样品处理方法、分离技术、碎裂技术和生物信息学方法的进步,proteoform变得更容易被检测和表征。在复杂样本的大规模研究,如微生物或人类细胞裂解液中,proteoform的鉴定数量已达到4000-6000(对应500-1000个蛋白质)。在单次TDP实验中,在大肠杆菌裂解液中可以鉴定出约800种proteoform,在人脑样本中可以鉴定出约1800种proteoform。由于proteoform的多样性和复杂性,完整蛋白质的DDA采集是非常重要的。然而目前的仪器软件在DDA采集中实施的碎裂技术优化主要针对自下而上蛋白质组学(BUP),而不是TDP。尽管这些方案在BUP研究中有效地捕获了各种高质量的肽段离子,但这些选择标准对于TDP中的proteoform离子选择并不是最优的。与BUP中的肽段离子相比,单个proteoform由于其高质量和高电荷会产生许多峰,Top-N采集往往会导致从一个丰度较高的proteoform中选择多个峰,而不是从多个不同的proteoform中进行选择,这会导致proteoform的覆盖率较低。此外,基于强度进行选择可能不会选到能产生多种独特片段的高质量前体。目前,大多数大规模TDP研究使用具有特定调优参数的DDA采集,例如,Top-N采用相对较低的N值(3-5)和相对较高的隔离窗口(1.2-15 Th,超宽隔离)。然而对所选前体离子的分析表明,对proteoform的选择依然不理想。因此,采用更智能的数据采集方式(Intelligent data acquisition,IDAs)是非常有必要的。本文中作者提出了一种用于TDP的基于机器学习的智能在线数据采集算法FLASHIda,该算法可以确保实时选择不同proteoform的高质量前体,最大化TDP中的proteoform覆盖。FLASHIda通过iAPI与tribrid Thermo Scientific质谱仪连接,允许对MS数据进行实时访问。在LC-MS运行期间,将实时去卷积算法和评估前体同位素质量的机器学习技术结合,非冗余选择高质量前体离子,从而提高蛋白质的覆盖率。FLASHIda流程如图1所示,该算法能在20毫秒内处理每个MS全扫描,并优化下一个采集周期,以最大限度地提高采集中的异型多样性。FLASHIda包括以下3个关键步骤,第一步是将输入的m/z-强度谱转换为mass-quality谱图,第二步是在转换谱图中选择前体离子,最大化唯一识别的proteoform离子数量,最后,动态确定每个选定质量的电荷态和隔离窗口大小,以尽量减少噪声或共洗脱的干扰。确定的隔离窗口m/z范围通过Thermo iAPI连接提供给仪器。  图1.FLASHIda总览  在对大肠杆菌裂解液的分析中,与标准DDA模式相比,FLASHIda在三分之一的仪器时间内将proteoform鉴定数量从800增加到1500,或产生几乎相同的鉴定数量。此外,FLASHIda能够灵敏地绘制翻译后修饰和检测化学加合物。作为仪器的软件扩展模块,FLASHIda可以方便地用于复杂样品的TDP研究,以提高proteoform的鉴定率。  图2. Proteoform分析  这项研究展示了IDA在TDP研究中的应用,目前作者依然在开发该算法的不同变体,用于靶向proteoform分析,深度表征,甚至从头测序。此外,由于FLASHIda能够选择无干扰的前体离子,因此它可以用于提高proteoform定量准确性。作者预计,未来在FLASHIda内开发的高级数据采集方法将有助于通过TDP探索proteoform的异质性。  撰稿:张颖编辑:李惠琳  原文:FLASHIda enables intelligent data acquisition for top–down proteomics to boost proteoform identification counts  李惠琳课题组网址www.x-mol.com/groups/li_huilin   参考文献  Jeong K, Babović M, Gorshkov V, Kim J, Jensen ON, Kohlbacher O. FLASHIda enables intelligent data acquisition for top-down proteomics to boost proteoform identification counts. Nat Commun. 2022 Jul 29 13(1):4407.
Instrument.com.cn Copyright©1999- 2023 ,All Rights Reserved版权所有,未经书面授权,页面内容不得以任何形式进行复制