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代谢组学分析

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代谢组学分析相关的方案

  • 三重四极杆质谱仪LCMS™ -8060NX分析唾液中亲水性代谢产物的代谢组学研究
    通过使用LC/MS/MS进行唾液的代谢组学分析,可以全面分析口腔细菌产生的亲水性代谢产物。该分析方法在口腔细菌群研究的代谢组学分析中是非常有效的。
  • 基于高分辨质谱的代谢组学分析方法在白酒香型鉴别中的应用
    采用Thermo ScientificTM Ultimate 3000 RSLC超高效液相色谱(UHPLC)和基于Orbitrap高分辨质谱技术的Thermo ScientificTM Q ExactiveTM高分辨质谱,结合组学分析软件SIEVE和统计学软件SIMCA对不同香型的白酒进行了组学研究,利用多元统计分析建立了一种快速、准确、客观地鉴别白酒香型的新方法,并对找到的标志物进行了鉴定。相较于目前常用的感官分析法,质谱方法更加地客观,也更容易量化形成统一的标准。
  • 应用代谢组学批量数据分析工作流程表征细菌中的差异代谢物
    本文应用发现代谢组学的精确质量Q-TOF LC/MS 工作流程,研究了处于早稳定期和晚稳定期的细菌。所采用的软件可批量处理数据,使得数据分析更高效且实现了自动化。应用Agilent MassHunter Profinder(批量特征提取软件)总共从正离子数据中获得了488 个特征,从负离子数据中获得了623 个特征。采用Mass Profiler Professional (MPP) 进行的统计学分析揭示了细菌在早稳定期和晚稳定期丰度具有显著差异的特征。在正离子数据中,有57 个特征在早稳定期中的丰度要高于晚稳定期。而在负离子数据中,有52 个特征在早稳定期中的丰度要明显高于晚稳定期。为了理解这些代谢组学数据的生物学和生物化学背景,我们通过数据库搜索、精确质量MS/MS 谱库匹配,以及MS/MS 分子结构关联对超过100 个差异特征进行了标注和鉴定。
  • 使用岛津仪器研究代谢组学和脂质组学的复合组学方法
    本实验将以能高效生产含硫代谢产物—麦角硫因的大肠杆菌作为样品,对在合成基质的半胱氨酸时使用的硫源中添加了硫代硫酸盐或硫酸盐,通过代谢组学和脂质组学的方法来评价有关含硫代谢产物依赖于培养过程的变化实例进行介绍。本次分析中,确认到了49种一次代谢产物成分,56种磷脂质成分。本研究以与半胱氨酸产生相关的含硫代谢产物为中心,对大肠杆菌的培养过程相对应的代谢变化进行了回顾,通过采用三重四极杆质量分析装置进行的代谢组学分析和脂质组学分析相结合,使更为详细的代谢变化评价成为了可能。
  • 代谢组学全流程解决方案
    赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱(Orbitrap)质谱平台结合其功能强大的软件平台,提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求,而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标记物验证的代谢组学不同层次的分析需求。
  • 易科泰植物表型分析技术快讯——西红柿表型与代谢组学研究案例
    植物源蛋白水解物(PHs)是一类重要的生长刺激素,影响植物表型组及代谢组特征,进而促进植物生长和作物产量,尤其在缺水、盐胁迫、重金属等逆境条件下,这种促进作用更加突出。PSI植物表型组学研究中心首席科学家Klara Panzarova等,利用PlantScreen高通量表型分析平台,就一种PH对西红柿表型与代谢组学的影响进行了研究,并最新发布研究论文“A Combined Phenotypic and Metabolomic Approach for Elucidating the Biostimulant Action of a Plant-derived Protein Hydrolysate on Tomato Grown under Limited Water Availability”研究过程中,采用PlantScreen高通量表型分析系统来对实验条件下的西红柿反应进行无损监控,结合代谢组学分析,综合研究一种PH的作用效果。PlantScreen高通量表型分析系统整合LED植物智能培养、自动化控制系统、RGB多维成像、叶绿素荧光成像分析、热成像分析、自动称量与浇灌等多项技术。
  • Orbitrap GC-MS HRAM代谢组学数据库在代谢组领域更深入地探索
    生物学是复杂的。为了解释这些复杂性,代谢组学分析需要复杂的分析技术和先进的软件解决方案。Thermo Scientific™ Orbitrap™ GC-MS HRAM 代谢组学库是第一个商用高分辨率精确质量(HRAM)电子电离(EI)代谢组学数据库。包含超过 800 种代谢物的 900 条专门的保留指数索引,范围涵盖植物、动物和微生物中初级和次级代谢产物(包括挥发物)。将功能强大的 Orbitrap 质谱技术和独特的 Thermo Scientific 软件数据处理工具相结合,能够比以往更容易地应对代谢组学实验中非靶向检测带来的困难和挑战。
  • 基于 Orbitrap GC-MS 的非靶向代谢组学
    在此介绍的 Q Exactive GC 系统的工作流程顺序为样品制备、自动衍生化、GC 分离和质谱检测、数据分析和结果报告。这一工作流程使 Q Exactive GC 系统成为挥发性化合物和需衍生化非挥发性化合物进行代谢组学分析的独特分析工具。卓越的色谱分离能力、可重现的色谱分离结合快速数据采集使 Q Exactive GC 系统成为复杂代谢组学分析的理想平台。超高分辨率、始终如一的亚 ppm 的精确质量数测量为复杂生物分解基质中存在的多种代谢物提供了可靠和高选择性的分析。较宽的动态范围为分析样品中的代谢物提供高灵敏度和持续检测,且质量数精度丝毫不受影响,同时为已检测到的代谢物提供精确的相对定量。可依据已有商用库使用获得的 EI 数据对化合物进行初步识别,使研究人员对结果进行评价。同时,得到的精确质量数允许对数据进一步分析,如使用裂解分析(例如,Mass Frontier)或使在此介绍的 Q Exactive GC 系统的工作流程顺序为样品制备、自动衍生化、GC 分离和质谱检测、数据分析和结果报告。这一工作流程使 Q Exactive GC 系统成为挥发性化合物和需衍生化非挥发性化合物进行代谢组学分析的独特分析工具。卓越的色谱分离能力、可重现的色谱分离结合快速数据采集使 Q Exactive GC 系统成为复杂代谢组学分析的理想平台。超高分辨率、始终如一的亚 ppm 的精确质量数测量为复杂生物分解基质中存在的多种代谢物提供了可靠和高选择性的分析。较宽的动态范围为分析样品中的代谢物提供高灵敏度和持续检测,且质量数精度丝毫不受影响,同时为已检测到的代谢物提供精确的相对定量。可依据已有商用库使用获得的 EI 数据对化合物进行初步识别,使研究人员对结果进行评价。同时,得到的精确质量数允许对数据进一步分析,如使用裂解分析(例如,Mass Frontier)或使在此介绍的 Q Exactive GC 系统的工作流程顺序为样品制备、自动衍生化、GC 分离和质谱检测、数据分析和结果报告。这一工作流程使 Q Exactive GC 系统成为挥发性化合物和需衍生化非挥发性化合物进行代谢组学分析的独特分析工具。卓越的色谱分离能力、可重现的色谱分离结合快速数据采集使 Q Exactive GC 系统成为复杂代谢组学分析的理想平台。超高分辨率、始终如一的亚 ppm 的精确质量数测量为复杂生物分解基质中存在的多种代谢物提供了可靠和高选择性的分析。较宽的动态范围为分析样品中的代谢物提供高灵敏度和持续检测,且质量数精度丝毫不受影响,同时为已检测到的代谢物提供精确的相对定量。可依据已有商用库使用获得的 EI 数据对化合物进行初步识别,使研究人员对结果进行评价。同时,得到的精确质量数允许对数据进一步分析,如使用裂解分析(例如,Mass Frontier)或使用标准品进一步确认目标化合物。本例中,氨基酸信号的时间依赖性演变为检测死亡时间提供了一种简便的生化法医分析检测法。
  • 应用代谢组学技术研究不同品质白茶的代谢物与风味特征
    本应用通过基于 UHPLC-Q-TOF/MS 的非靶向代谢组学分析方法探讨了白茶中非挥发性化合物对茶叶风味特征的影响。使用 UHPLC-Q-TOF/MS 分析茶叶的提取物,然后进行特征化合物的提取和比对,得到 1915 种化合物。基于这些化合物的主成分分析 (PCA) 和有监督的偏最小二乘差异分析 (PLSDA) 表明,三种不同品质白茶样品可以很好地分离。通过与标准品和数据库进行匹配,鉴定出多达 99 种代谢物。经由显著性检验和相关性分析发现,有显著差异的代谢物中有 41 种与风味高度相关;其中,茶氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺和 AMP 与鲜味呈正相关,而黄烷-3-醇、聚酯型儿茶素、原花青素 B3 和可可碱与苦味和涩味呈正相关。结果表明,代谢组学技术是一种有效的发现茶叶中特征代谢物的手段,这些特征代谢物有望作为潜在标记物用来区分不同品质的白茶,以应对人为掺假和标签错贴的现象。
  • 代谢组学在疾病、中药及植物表型的研究以及复杂样品分离分析新方法、新技术及代谢组学技术的其他应用
    近年来,代谢组学受到研究者越来越多的关注,是当今分析化学和生命科学的一个前沿的交叉学科,有广阔的发展前景。代谢物种类众多,在体内的分布广泛,且不同代谢物的浓度范围相差极大,这对分析仪器及数据分析手段均提出了巨大的考验。许国旺研究员课题组(大连化物所高分辨分离分析及代谢组学组)是我国最早进行代谢组学研究、同时也是目前国内外实力最强的专注于代谢组学研究的课题组之一:该课题组多年来根据分析化学的特点和国际前沿研究领域的发展趋势,立足于中国现状,结合国家重大应用领域的需求与自身技术优势,以分离分析研究为立足点,生命科学、重大疾病、中医药现代化、公共安全等领域的复杂样品分析为切入点,开展极端复杂体系分析的方法学研究及其应用、代谢组学方法及其应用研究和转化医学等工作。目前,课题组拥有以许国旺研究员为核心的固定职工17人,现有硕、博士研究生20多名,学科背景涵盖分析化学、生物化学、临床医学、药学和微生物学等领域。
  • 全谱二维液相-QTOF系统用于大鼠抑郁症的非靶向代谢组学研究
    本文利用全谱二维液相系统结合四极杆-飞行时间质谱对抑郁症大鼠血浆进行了非靶向代谢组学分析。基于全谱二维液相系统,共找到8083个特征峰,其中第一维2713个,第二维5370个。正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)表明正常组与模型组有显著差异,共找到247种变量投影重要性(VIP)大于1的候选差异性代谢物,经数据库比对鉴定出44种,主要包括39种脂质、2种氨基酸、3种生物碱,主要影响的通路包括甘油磷脂代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、精氨酸生物合成、谷氨酸代谢等。
  • 葡萄酒真伪测定:采用 UHPLC ESI/Q-TOF MS 进行代谢组学分析
    本文展示了联用Agilent 1290 Infinity LC 系统和Agilent 6530 Q-TOF LC/MS,以及多元统计分析进行葡萄酒代谢谱分析的优势。该方法可以对法国和中国等不同地区的葡萄酒进行区分,并有望实现葡萄酒生物标记物的鉴定。
  • 赤霞珠葡萄酒的原产地区分——使用 UHPLC-Q-TOF/MS 的非靶向代谢组学研究
    食品掺假和标签虚假行为可能会给消费者带来潜在健康风险并造成信任危机,对于高档葡萄酒产品而言尤其如此。目前的分析方法和防伪标签技术不足以确定这类产品的身份信息和原产地。本应用简报介绍了一种基于 Liang 等人的研究开发的追踪葡萄酒产品原产地的代谢组学分析方法。参比赤霞珠葡萄酒来自五家酒庄(两家为美国酒庄,三家为中国酒庄),并使用安捷伦 UHPLC-Q-TOF/MS 平台在准确的 TOF/MS 扫描模式下进行了初步分析。所得原始数据通过分子特征查找提取方法进行了数据挖掘。将结果导入 Agilent Mass Profiler Professional (MPP) 化学计量学软件,以在各组之间查找特征化合物。所得差异化合物的主成分分析和聚类分析显示了该系统区分两组美国葡萄酒与中国产葡萄酒的能力。基于这些数据的偏最小二乘差异分析 (PLSDA) 模型能够高度准确地预测葡萄酒组别。通过使用针对葡萄酒的自定义多酚类化合物数据库和谱库以及其他可用的安捷伦 PCDL,我们对 23 种化合物进行了初步鉴定,其中大多数为葡萄中的内源性代谢物,表明在不同原产地的葡萄酒中,葡萄代谢物是区别葡萄酒主要特征的决定因素。本研究证明采用 UHPLC-Q-TOF/MS 结合化学计量学分析的代谢物组学分析方法是追踪葡萄酒原产地的有用方法。
  • 利用1H-NMR在代谢组学研究中进行生物流体样本的质量评价
    代谢组学研究中标准化的样本处理与加工是获得准确结果的关键。本文阐述了如何利用标准化核磁共振(NMR)技术(例如,基于布鲁克-AvanceIVDr平台)对不同的样本处理方法进行评估,从而对上述观点加以证实。因此,标准化1H-NMR是一种快速、可靠的生物流体样本细微变化监测方法。代谢组学分析可测量样本中的所有小分子,包括基质、中间代谢物和代谢的最终产物。因此,它可以提供样本采集时身体功能和状态的完整画面。它还能提供有关疾病诊断、预后、治疗监测以及身体对饮食或环境变化的反应的重要信息。在代谢组学研究中,可以使用任何生物流体,但血液和尿液最为常用,这是因为它们最容易获得。血液和尿液代谢组能反映出被研究的整个生物体的代谢状态,因此会受到健康、疾病和饮食状况的影响。代谢谱分析通常使用核磁共振(NMR)或色谱质谱(LC-MS或GC-MS)来实现。尽管质谱法具有更高的灵敏度,但得益于样本制备、测量和处理的标准化,NMR法更易于操作,且样本制备量最少,重现性高1。由于样本中代谢物的性质和浓度将构成研究结论的基础,因此所分析的化学成分必须准确反映出样本采集时的状态。工作流程的差异可能会影响所获得的结果,从而增加出现实验室间差异的可能性。因此,准确了解样本处理与加工中的偏差会对代谢曲线产生怎样的影响,以确保高准确度和可重复性分析是非常重要的。
  • 营养代谢组学 利用LC/MS/MS进行酒类变质分析
    本研究将介绍一种采用营养代谢组学进行食品变质解析的分析方法。实验中,将市售日本清酒与白葡萄酒在不利条件下保存后,采用高效液相色谱质谱联用技术(LC/MS/MS)对其进行整体分析,全面考察氨基酸、有机酸、核苷、核苷酸等亲水性代谢产物的变化。
  • 实时飞行时间质谱直接分析快速测定血清代谢组指纹图谱的方法优化
    体液的代谢组指纹图谱能够揭示许多代谢异常相关性疾病的发病原因,从而成为疾病诊断和治疗预后诊断的潜在工具。本文报导了一种将实时直接分析(DART)与飞行时间质谱(TOF MS)联用的快速方法,用该方法对人血清代谢组指纹图谱进行了分析。在本研究中,首先对血清样品进行蛋白沉淀处理,并通过衍生化提高代谢物的挥发性,然后进行DART MS分析。用同体积健康人血清样品优化了电离气体温度和流速等仪器参数,获得了DART MS的最佳性能。实验表明这些参数对所检测代谢物全质量范围及DART质谱图信噪比有显著影响。每次DART分析只需要1.2分钟,在此过程中可以按时间顺序观察到1500多张不同的特征图谱。用手动取样臂得到的总离子信号重现性为4.1% 到4.5%。DART MS最令人感兴趣的特点是高通量、无记忆效应和简单性,因此有望成为代谢组指纹图谱研究极宝贵的工具。 代谢组指纹图谱,一种基于代谢模式或“指纹图谱”对样品分类的无偏差全面筛查方法,已经在尿、血浆、血清和体液等各种生物样品类型上进行了实验。核磁共振(NMR)和质谱是代谢组指纹图谱研究广泛使用的两种分析平台。NMR的优势是几乎不用进行样品处理,更容易获得大量数据,但成本高、灵敏度低是它的两个主要缺陷。气相色谱-质谱(GC-MS)和液相色谱-质谱(LC-MS)是代谢组学工作流程中常用的两项补充技术。除非常复杂以外, GC-MS和LC-MS还有分析通量低和有色谱记忆效应等缺点,尤其是在研究生物基质(如血清)中的代谢物时。为了克服上述局限,人们还在不断研究能有效分析代谢组学的技术。 实时直接分析(DART)是一种在室温和大气压条件下操作的基于等离子体的电离技术。属于大气压等离子体电离技术,该技术包括直接大气压光电离(DAPPI)、实时直接分析(DART)流动大气压辉光放电?(FAPA)、等离子体辅助解吸附电离(PADI)、低温等离子体(LTP)电离和介质阻挡放电电离(DBDI)等。DART以记忆效应最小的非接触方式电离。样品可以手动处理,也可以通过自动进样器辅助,主要的消耗品是高纯压缩气体(氦气或氮气),每个样品的分析成本较低。DART的工作原理是,首先在气流(氮气或氦气)中发生辉光放电,形成的亚稳原子与大气压中的水发生相互作用,生成质子化的水簇。这些clusters通过质子转移与热气流解吸附的分析物发生作用。在大多数情况下,不经过样品制备即可发生直接电离。DART已成功用于制药产品、仿冒药物、细菌脂肪酸、调料和香料等分析领域。 本文报导了一种用DART-TOF和DART-Q-TOF MS快速分析人血清代谢组指纹图谱的方法。讨论了各种实验参数的优化,通过精确质量测定和添加实验,对血清代谢物进行了鉴定。用DART离子源与Q-TOF质谱联接,用DART进行血清代谢组学研究的工作,迄今尚未见文献报导。
  • 基于 Orbitrap GC-MS 的非靶向代谢组学
    本项研究展示了新型 Thermo Scientific? Orbitrap? GC-MS 完整非靶向代谢组学工作流程,检测了大鼠模型中的生物标记物,以判定其死亡时间。死亡时间(PMI)推断是法医调查中一项最关键也是最困难的任务,尤其当尸体温度与周围环境温度达到平衡后。由于当前用于确定 PMI 的方法不精确性且以目视检查尸体为主。因此,建立一种实验方法,使用耐用生物标志物推断死亡时间可辅助法医调查。该 GC-MS 装置使用基于 Orbitrap 的检测器,得到超高质量数分辨率、亚 ppm 质量数精度、宽动态范围以及一定的扫描速度,用于有效定量极复杂代谢组学样品。高分辨率、稳定的质量数精度和快速的扫描速度是进行稳定的数据解卷积的关键因素,以检测重叠 TIC 峰中的化合物,进行非靶向代谢组学分析。电子轰击电离(EI)裂解模式也适合基于应用广泛的 NIST 库和 Wiley 库进行匹配,以识别化合物,同时为更深入的表征提供精确质量数。
  • 全谱二维液相-QTOF分析人参二醇皂苷组分治疗阿尔茨海默症小鼠初步代谢机理
    本文利用全谱二维液相系统结合四极杆-飞行时间质谱对人参二醇皂苷组分不同剂量给药后的阿尔茨海默症小鼠血浆样本进行了非靶向代谢组学分析。基于全谱二维液相系统,正模式下共得到4679个特征峰。偏最小二乘判断分析(PLS-DA)表明模型组与给药组有显著差异,共找到457种变量投影重要性(VIP)大于1的候选差异性代谢物,经数据库比对鉴定出5种差异性代谢物,主要影响的通路包括精氨酸生物合成、花生四烯酸代谢、不饱和脂肪酸生物合成等。
  • 代谢组学技术的其他应用
    近年来,代谢组学受到研究者越来越多的关注,是当今分析化学和生命科学的一个前沿的交叉学科,有广阔的发展前景。代谢物种类众多,在体内的分布广泛,且不同代谢物的浓度范围相差极大,这对分析仪器及数据分析手段均提出了巨大的考验。许国旺研究员课题组(大连化物所高分辨分离分析及代谢组学组)是我国最早进行代谢组学研究、同时也是目前国内外实力最强的专注于代谢组学研究的课题组之一:该课题组多年来根据分析化学的特点和国际前沿研究领域的发展趋势,立足于中国现状,结合国家重大应用领域的需求与自身技术优势,以分离分析研究为立足点,生命科学、重大疾病、中医药现代化、公共安全等领域的复杂样品分析为切入点,开展极端复杂体系分析的方法学研究及其应用、代谢组学方法及其应用研究和转化医学等工作。目前,课题组拥有以许国旺研究员为核心的固定职工17人,现有硕、博士研究生20多名,学科背景涵盖分析化学、生物化学、临床医学、药学和微生物学等领域。
  • 代谢组学在疾病研究中的应用
    近年来,代谢组学受到研究者越来越多的关注,是当今分析化学和生命科学的一个前沿的交叉学科,有广阔的发展前景。代谢物种类众多,在体内的分布广泛,且不同代谢物的浓度范围相差极大,这对分析仪器及数据分析手段均提出了巨大的考验。许国旺研究员课题组(大连化物所高分辨分离分析及代谢组学组)是我国最早进行代谢组学研究、同时也是目前国内外实力最强的专注于代谢组学研究的课题组之一:该课题组多年来根据分析化学的特点和国际前沿研究领域的发展趋势,立足于中国现状,结合国家重大应用领域的需求与自身技术优势,以分离分析研究为立足点,生命科学、重大疾病、中医药现代化、公共安全等领域的复杂样品分析为切入点,开展极端复杂体系分析的方法学研究及其应用、代谢组学方法及其应用研究和转化医学等工作。目前,课题组拥有以许国旺研究员为核心的固定职工17人,现有硕、博士研究生20多名,学科背景涵盖分析化学、生物化学、临床医学、药学和微生物学等领域。
  • 代谢组学在中药研究中的应用
    近年来,代谢组学受到研究者越来越多的关注,是当今分析化学和生命科学的一个前沿的交叉学科,有广阔的发展前景。代谢物种类众多,在体内的分布广泛,且不同代谢物的浓度范围相差极大,这对分析仪器及数据分析手段均提出了巨大的考验。许国旺研究员课题组(大连化物所高分辨分离分析及代谢组学组)是我国最早进行代谢组学研究、同时也是目前国内外实力最强的专注于代谢组学研究的课题组之一:该课题组多年来根据分析化学的特点和国际前沿研究领域的发展趋势,立足于中国现状,结合国家重大应用领域的需求与自身技术优势,以分离分析研究为立足点,生命科学、重大疾病、中医药现代化、公共安全等领域的复杂样品分析为切入点,开展极端复杂体系分析的方法学研究及其应用、代谢组学方法及其应用研究和转化医学等工作。目前,课题组拥有以许国旺研究员为核心的固定职工17人,现有硕、博士研究生20多名,学科背景涵盖分析化学、生物化学、临床医学、药学和微生物学等领域。
  • 代谢组学在植物表型研究中的应用
    近年来,代谢组学受到研究者越来越多的关注,是当今分析化学和生命科学的一个前沿的交叉学科,有广阔的发展前景。代谢物种类众多,在体内的分布广泛,且不同代谢物的浓度范围相差极大,这对分析仪器及数据分析手段均提出了巨大的考验。许国旺研究员课题组(大连化物所高分辨分离分析及代谢组学组)是我国最早进行代谢组学研究、同时也是目前国内外实力最强的专注于代谢组学研究的课题组之一:该课题组多年来根据分析化学的特点和国际前沿研究领域的发展趋势,立足于中国现状,结合国家重大应用领域的需求与自身技术优势,以分离分析研究为立足点,生命科学、重大疾病、中医药现代化、公共安全等领域的复杂样品分析为切入点,开展极端复杂体系分析的方法学研究及其应用、代谢组学方法及其应用研究和转化医学等工作。目前,课题组拥有以许国旺研究员为核心的固定职工17人,现有硕、博士研究生20多名,学科背景涵盖分析化学、生物化学、临床医学、药学和微生物学等领域。
  • 代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化分析产品配置单(液质联用仪)
    采用基于静电场轨道阱高分辨质谱 Q Exactive 平台的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫 Bm5 细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究发现,CrPV 感染导致 Bm5 细胞的代谢具有显着和特定阶段的变化。比如,CrPV 持续感染过程中葡萄糖和谷氨酰胺水平均显着升高,随后在致病期急剧下降。不同代谢产物的丰度和途径分析进一步确定了病毒生命周期不同阶段的特定代谢特征,为病毒感染宿主后的致病过程、疾病分期、以及药物治疗效果提供理论依据。
  • 使用 Agilent VistaFlux 对软骨肉瘤细胞系进行 13C-谷氨酰胺定性代谢流分析
    在缺少动态信息的情况下,代谢组学数据的解读通常十分复杂,这是因为在相应代谢物丰度未发生改变时,某个通路的代谢流可能已经发生显著变化。稳定同位素示踪(定性代谢流分析)的巨大潜力有助于解决这些状况,以便更深入地了解生物系统。在定性代谢流分析中,将稳定同位素示踪剂(通常含有 13C、15N 或 2H)引入生物系统, 导致下游代谢物的同位素模式(同位素异数体分布)发生改变。该方法尤其适用于易于 引入稳定同位素示踪剂的细胞模型,对产生的标记模式及示踪剂掺入动力学的分析将提供对酶功能、途径依赖、基因表达和蛋白功能变化效应的洞察。 Agilent MassHunter VistaFlux 软件旨在设计一套完整的工作流程,帮助科学家进行定性代谢流分析,助于高分辨率准确质量数 TOF 和 Q-TOF LC/MS 数据的处理和可视化。软件提供的工具可进行特征提取、同位素掺入分析、同位素异数体丰度分析、天然丰度校正、统计学分析以及数据在通路中的可视化。
  • 基于质谱成像技术进行不同营养状态下小鼠肾脏脂质组学分析
    本文展示了应用成像质谱显微镜iMScope QT对不同营养状态下小鼠肾脏中脂质化合物的代谢变化进行研究的应用案例。使用iMScope QT结合数据分析软件IMAGEREVEAL MS对正常饮食小鼠和高糖高脂饮食小鼠肾脏组织切片中的脂质化合物进行检测和数据分析,计算每组的平均值、比值、P值等信息,最终筛选出17个上调脂质化合物、10个下调脂质化合物,为研究膳食模式、脂质代谢变化与肥胖三者之间的关系提供理论依据。
  • 安捷伦代谢组学动态 MRM 数据库和方法
    由于内源性细胞代谢物的理化性质差异巨大,因此代谢组学研究的一项主要挑战就是如何通过单一 LC/MS 分析方法对内源性细胞代谢物进行稳定、可重现的色谱分离。一种更易于控制的色谱解决方案是针对一小组代谢物开发 通路靶标的分析方法。建立优化的靶向 LC/MS/MS 方法是一项艰巨的任务,需要花费大量的时间和资金来表征大量化学标准品。 安捷伦开发出了一套适用于 215 种以上中心碳代谢物的 LC/MS/MS 解决方 案,可以稳定、可重现地分离酸性代谢物。该解决方案包括收录了保留时间和最佳 MS/MS 采集参数的优化数据库,还包括数据采集和分析方法。代谢组学 dMRM 数据库和方法利用了 Agilent 6470 三重四极杆 LC/MS 系统的高灵敏度和宽动态范围,以及安捷伦喷射流离子源久经考验的电离增强功能。本应用简报介绍安捷伦代谢组学 dMRM 数据库和方法的优势,其针对中心碳代谢物提供一套已经过优化且简单直接的靶向分析方法,让研究人员能够轻松执行分析。
  • 基于1H-NMR的血浆代谢组学研究表明,微生物群的变化与妊娠糖尿病患者的高血糖有关
    妊娠期糖尿病通常是一种发生在孕妇身上的暂时性糖尿病。在这种情况下,怀孕期间产生的激素会导致身体失去使用胰岛素的能力,而胰岛素是一种肽类激素,它驱动碳水化合物衍生的葡萄糖进入细胞,然后作为能量使用。怀孕期间与此有关的常见激素包括雌激素、皮质醇和催乳素。近年来,妊娠糖尿病的患病率急剧上升,但这种上升的原因仍未完全确定。 此外,妊娠糖尿病的发病机制尚不清楚。 肠道微生物群与妊娠糖尿病之间的联系 基于之前的研究,一项新的代谢组学研究的研究人员表示,孕妇的肠道微生物群可能是妊娠糖尿病生物标志物的来源。在这项研究中,来自中国的研究人员研究了肠道微生物群的变化对妊娠糖尿病患者和非妊娠糖尿病患者的循环代谢物的调节效应。 该研究纳入了进入中国医院的40名孕妇,其中一半患有妊娠糖尿病。研究人员收集了过夜的空腹粪便样本,以研究和比较妊娠期糖尿病患者和非妊娠期糖尿病患者的肠道微生物群的变化。 研究人员使用布鲁克600 MHz AVANCE III核磁共振(NMR)波谱仪,对血浆样品进行了基于1H-NMR的非靶向代谢组学分析。
  • 便携式电化学分析仪测生物传感器交流阻抗
    PlamSens3掌上型电化学分析仪,携带方便,直接USB供电,操作方便,易于上手。仪器灵敏度高,应用于生物传感器,可以得到更好的实验数据。详细请下载附件文件。
  • 利用NMR识别临床样品中的代谢变化(仅供研究之用)
    “我们的研究结果表明,血清与尿液中代谢物之间的日常可靠性差异很大,而脂蛋白亚组分则具有很高的可靠性。” 仅供研究之用。 代谢组学是通过对存在于组织或细胞中的小分子中间产物和最终产物的分析来研究活性细胞过程。 代谢组学分析通常使用核磁共振(NMR)谱进行,可应用于一系列生物流体,包括血液和尿液。由于这些样本可以通过微创手段获取,因此研究人员正在探索将代谢组学分析作为诊断与监测各种疾病过程的潜在工具。 它在肿瘤的定性与监测方面尤其有用,这是确保癌症患者获得最佳治疗所必需的。众所周知,前列腺具有独特的代谢物分布,但直到最近,还无法将其应用于诊断。 由于基于肿瘤病理学和血清前列腺特异性抗原(PSA)水平的预测算法和列线图的发展,前列腺癌的发病率和死亡率在过去几十年中已显著降低。然而,这些男性前列腺癌诊断的预测工具涉及显著的变异性。因此,生物标记物在准确诊断前列腺癌以及可靠区分侵袭性肿瘤和惰性肿瘤方面的需求仍未得到满足。 靶向代谢组学分析是评估前列腺癌演变风险以及相关死亡率风险的一种有前途的替代策略。由于尿液代谢组与前列腺的关系密切,因此在前列腺癌生物标志物的鉴定中具有特殊的意义。 前列腺产生的前列腺液被释放到尿道,通过直肠按摩前列腺可以刺激这一过程。因此,前列腺按摩后排出的首段尿将与前列腺液混合。然而,发生或未发生前列腺按摩的尿液之间的代谢谱的差异尚未得到描述。 这是最近一项研究中要解决的问题之一,该项研究检测了样本采集和样本处理程序对采集自被诊断为前列腺癌或良性前列腺增生的男性患者的血清脂蛋白以及血清和尿液中的小分子代谢物的影响。研究人员利用配备5毫米QCI低温探针的布鲁克 Avance III 600 MHz质谱仪对样品进行NMR分析。
  • 北京豫维:母乳中溴代阻燃剂及其代谢产物的分析检测方法
    建立了低分辨气相色谱-负化学源质谱法(GC/NCI-LRMS)定性与定量检测母乳中的溴代/氯代阻燃剂及其代谢产物的方法。所检测的溴代/氯代阻燃剂及其代谢产物分为中性化合物和羟基化合物两部分。采用RTX-1614(30 m)作为色谱分离柱,在优化的色谱条件下对8种多溴联苯醚PBDEs(包括BDE209)及其甲氧基代谢产物MeO-PBDEs,多种其它阻燃剂及代谢物等中性化合物同时进行了分离检测 采用DB-5(30 m)作为色谱分离柱,在优化的色谱条件下分离检测了9种羟基多溴联苯醚OH-PBDEs。在母乳样本中加入代用标准或内标,经过超声提取、液液萃取、硅胶净化和浓缩定容等预处理后,分别对中性和羟基化合物进行测定。十溴联苯醚、其它多溴联苯醚、甲氧基多溴联苯醚、得克隆及脱氯产物、其它阻燃剂等中性化合物,及羟基多溴联苯醚在两个添加浓度水平的回收率分别为66.5%~75.4%,84.2%~126.4%,60.9%~115.1%,86.7%~104.9%,42.9%~113.8%和64.7%~129.5% 中性化合物的相对标准偏差均小于22%,羟基化合物的相对标准偏差均小于30%。利用本方法对我国电子垃圾拆解区人体母乳中的目标物进行了分析检测,结果可靠。

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