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质谱推测

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质谱推测相关的资讯

  • 质谱新技术丨原位探针离子化质谱仪DPiMS 第三期
    《质谱新技术丨原位探针离子化质谱仪DPiMS 第一期》为大家介绍了DPiMS的技术背景和工作流程;《质谱新技术丨原位探针离子化质谱仪DPiMS 第二期》介绍了DPiMS在食品安全、法医学、临床毒理学和生物学研究中的应用实例。 本期将隆重介绍DPiMS家族新成员——DPiMS QT,进一步拓展这一极具潜力的新型离子源的应用边界。 DPiMS QT 特点 1 前处理简单、操作简便、快速完成测定● 只需简单的前处理即可开始分析。● 与Q-TOF质谱仪联用,实现高分辨质谱分析。● 仅需微量样品即可完成分析,大大降低对于MS离子源的污染。 2 只需简单的前处理即可测定液体或固体样品● 使用传统方法分析血液、尿液和其他生物样品所需的时间减少约 50%。● 可以分析食物、组织切片和其他固体样品。● 样品前处理时间显着减少。3 快速定性分析●DPiMS QT定性筛查分析时,无需等待色谱分离的时间,效率更高。4 无残留的分析系统● 每次进样时,仅几十pL的样品粘附在探针上,无需担心质谱仪内部受到污染。也可以通过更换探针来防止样品残留,在测定浓缩样品和未知浓度的样品时无需担心交叉污染。5 在 DPiMS QT 和 Q-TOF LC/MS 之间轻松切换● 移除 DPiMS QT 装置约仅需15秒,即可重新配置为LC-QTOF系统。通过 DPiMS QT 实施初步筛查和定性分析,可以减少 LC-QTOF 分析所需的资源(溶剂和色谱柱),从而减少需要定量分析的样品数量,提高实验室工作效率。应用实例 对添加曲唑酮(500 ng/mL)的全血样品进行定性分析, MS和MS/MS分析在一个序列中同时进行。LabSolutions Insight Explore 支持组成推测、库搜索和结构解析。 1 MS分析检查色谱峰——通过在化合物表中输入分子式或对应的质量数来提取目标离子的质量色谱图。组成推测——从获得的质谱图中,选择任意 m/z 的质谱,并使用组成推测功能按匹配度分数顺序列出预测的分子式。 2 MS/MS分析碎片归属——使用 LabSolutions Insight Explore 中的结构分析归属功能,根据产物离子质谱图对碎片进行归属。通过谱库检索评分——通过使用 LC-QTOF 创建的质谱库,对使用 DPiMS QT 分析得到的质谱图进行评分。
  • 新成果:5小时可创建脂类串联质谱谱库
    通过部分脂类成员的化学结构建立谱库   来自美国和日本的科学家仅仅耗时五个小时就建立了一类新发现的脂质的串联质谱(MS/MS)谱库。一般而言,建立这样一个谱库需要更长的时间,科学家使用了一款新研发的软件缩短了研究时间。这是一款从化学结构推测质谱图的软件工具。   该软件被称为LipidBlast,是由Oliver Fiehn和他的同事们在加州大学研发的。Davis去年在《Nature Methods》杂志发表了一篇论文将此软件首次公开。LipidBlast创建一个特定类别脂质的质谱库的步骤是:首先,分析这类脂质中已知成员的化学结构。然后,使用这些信息来推测具有相似结构的此类物质的其它可能成员。接下来,此软件将部分已知成员的化学结构与之前研究得到的已知成员的串联质谱数据相关联。最后,它利用这些关系来确定含有已推测成员在内的所有其余成员的MS/MS谱图,包括母离子和子离子。一经验证,通过对比实验数据和检索MS/MS谱库,得到的谱库就可以用于鉴别LC-MS/MS分析的生物样品中的这些物质。 此软件灵活性很强   由于脂类在串联质谱中容易形成可预知的碎片,所以尤其适合此软件电脑谱库的创建。而且,LipidBlast非常灵活,足以应付推测正、负离子下或不同的外加电压下的MS/MS谱图。在建立谱库时,这种灵活性使得它能够利用40种高或低分辨率质谱仪的谱图,包括三重四极杆质谱仪和傅里叶变换质谱仪。   Fiehn和他的同事利用LipidBlast 建立了一个基本演示MS/MS谱库,包含212,516张谱图,覆盖26种脂类物质的119,200种化合物。这些化合物包括磷脂类、甘油脂类、细菌脂聚糖类和植物糖脂类。他们已经使用这个库来识别了藻类、有鞭毛的原生生物和哺乳动物干细胞中的脂质。 能应对低磷水平的脂类家族   最近,Fiehn已将注意力转移到了一类特殊的脂类&minus 葡萄糖醛酸糖脂(glucuronosyldiacylglycerol,GlcADG)。它是近期日本科学家从植物中发现的一种脂类。由于GlcADG可以代替植物细胞膜上的磷脂,所以可以帮助植物应对低磷水平。虽然这种脂类首先在植物中发现,但它也可能出现在细菌、真菌和藻类等其他生物中。   为了与最初发现这类脂质的日本科学家们一起在其它有机体中寻找这类脂质,Fiehn和他的一位同事使用LipidBlast创建了一个GlcADG类的MS/MS质谱库。照例,这需要利用日本科学家先前得到的MS/MS谱图和植物中GlcADG类物质的化学结构,以及相似脂类成员的化学结构。最终的谱库包含15,000 张MS/MS谱图,建成仅耗时5小时。   &ldquo 这项工作不仅有希望通过GlcADG来扩展已知有机体的范围,而且也从另一个方面体现了LipidBlast快速创建MS/MS谱库的能力&rdquo ,Fiehn说。他们还开发了应用于新型脂类的免费模板,用来鼓励其他研究人员使用这款软件。   编译:郭浩楠
  • 质谱大牛带你重新认识“有机质谱谱图解析”
    培训关键字:有机质谱谱图解析、面授、王光辉、苏焕华 授课专家 王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。著有《有机质谱解析》等专著。 苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。著有《色谱-质谱联用技术及应用》等专著。 范国樑 天津大学材料科学与工程学院、副教授;天津市色谱研究会秘书长;天津市分析测试协会副理事长;中国色谱学会理事。专著"有机结构波谱分析"-质谱部分20万字,天津大学出版社出版。在chromatography A、分析化学(中国)、色谱(中国)等期刊发表论文40多篇。做为项目负责人完成973项目、天津市自然基金、科技部攻关项目十余项。获天津市技术发明奖二、三等奖两项。发明专利10项。 课程内容 一、谱图解析基础知识 二、离子的丰度 三、离子碎裂的基本机理 四、常见有机化合物的质谱图特征 五、由质谱图推测分子结构 六、NIST谱图库检索实用技术 注:学员可自带原始数据采集文件,讲师可采用学员的文件作为案例进行分析 更多课程内容请直接电话咨询010-51654077-8123。 其他信息: 培训机构: 信立方培训中心 适用对象: 使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员。 费用:3800元/人 开班地点:北京市 开班时间:2015-05-26 培训天数: 共4天 地址:外国专家公寓(华严北里8号院外国专家大厦) 报名方式: 联系人: 安先生 Email: job@instrument.com.cn 联系电话: 010-51654077-8123 传真:010-82051730
  • 全球质谱市场将增长至59亿美元
    一项最新的报告推测全球质谱市场从2013年-2018年将以8.7%的复合年增长率增长到59亿美元。  此推测还显示,最大的增长是在亚洲市场。这其中,在中国和印度的质谱市场扩张将是最为显著的,一些南美和非洲国家市场也将有明显的增长。此报告从技术、应用和地域等方面评估质谱市场,也参考了公司简介,采用了73张表格和17张图来诠释。  目前,质谱应用市场最为火热的是制药行业。由于在临床诊断上的应用,MALDI TOF质谱是制药领域增长最快的质谱类型之一。而对MALDI TOF质谱市场最关键的限制因素是此仪器价格的高昂和系统专业操作人员的缺乏。编译:郭浩楠
  • 罗氏全自动质谱方案最新解读|2024准备好进入质谱分析新维度了吗?
    距离上一年度罗氏的半年报中公布了比较多的临床质谱方案细节后,又过去了半年时间,按其规划,2024年底将会在欧洲率先上市。  随着上市时间的临近,按着新品上市的一般推进流程,罗氏公司也不断对外公布了一些最新细节,使得其质谱方案的神秘面纱也一层一层的逐渐揭开。  在临床质谱火热之际,我们之所以如此关注罗氏公司的质谱项目,还是基于业界对罗氏公司全自动质谱方案的高度期望,尤其在科学仪器巨头赛默飞世尔(Thermo Fisher)公司全自动质谱一体机Cascadion项目以失败告终之后,我们更期待IVD巨头的解决方案。  看从IVD企业的方向是否可以走通,彻底解决临床质谱自动化,推进临床质谱进入临床检测科室,完成临床质谱普及的最后一公里路。  本文仅为分享临床质谱相关知识、探讨质谱自动化方案,以期质谱技术在临床端的进一步发展。质谱技术的普及,需要各级别企业的共同努力,有大象起舞,也有蚂蚁雄兵。文中内容仅为技术探讨,是对公开信息的进一步学习、推测和探讨,如有理解偏差、不准确的地方,请仅以罗氏公司未来官方资料及解释为准。我们敬重头部企业罗氏这么有创新的技术尝试且需保护相应的专属设计,也期待各家质谱相关公司凭借独立的创新精神取得各自的突破。  上市计划进展  简言之,如期推进!  落地时间与之前公布的信息没有变化,侧面证明在欧美地区的注册工作顺利、项目的研发按期望进展。  2024年1月9日,在第42届摩根大通医疗健康大会(JPM 2024)上,罗氏公司CFO Alan Hippe 以Entering the next growth cycle(进入下一个增长周期) 为题汇报了罗氏公司的一些主要进展,其中有两页提到了诊断部的质谱项目,确定其对未来增长的重要性,并再次提到其上市计划,2024年底CE欧盟区域落地,2025年预计美国FDA获批。  2024年2月初发布的2023年财报中,在诊断部CEO Matt Sause的报告部分,也看到他把i601全自动质谱系统在2024年CE落地作为他的首条关键任务。    我们还注意到,2023年5月,在意大利罗马举行的第25届国际临床化学与检验医学大会(IFCC WORLDLAB)暨第25届欧洲临床化学与检验医学大会(EUROMEDLAB)上,罗氏也将其质谱系统进行了揭幕,为欧洲市场的上市预热。  关于中国的上市时间,按业内推测及罗氏新产品在中国上市的规划传统,预计在2026年争取拿到国内上市资质。  值得提及的一件事情,在2023年12月国家卫健委临检中心第二届临床质谱的培训班上,很高兴的看到罗氏公司RA注册部相关人员也来学习质谱相关内容。  质谱技术对于罗氏公司也是一项新技术、新方法,为了做好相关注册工作、确保注册进度,相关人员主动学习相关知识,值得认可肯定!  设备整体结构  从左到右依次为进出样单元(含STAT急诊端口)、加样及磁珠前处理部分、色谱质谱部分。总体的尺寸并没有相关资料公布,但参照图片里其他模块的尺寸(e801及进样模块尺寸),按比例可大致估算,整体的设备长度约3.8米(含进样单元)。  其中色谱质谱部分从图中可以看出比e801(含MSB样本缓冲区)尺寸略短一些,我们姑且按1.4米算。  关于重量,我们也做个大概估算:考虑到色谱质谱部分有泵单元、分子涡轮泵、质量分析器等重量较大组件,整体重量应大于等于e801的730公斤,所以三者相加(190+730+730)整体重量应在1.7吨上下。  设备的整体结构,可以理解为进样单元,加上e801系统(含MSB样本缓冲区、无ECL电化学发光的检测系统),后面再加一个液相色谱及质谱分析仪部分。  此系统的e801部分,负责样品的进出样,传输,样品的加入,试剂的加入,基于磁珠的前处理等的流程,最后转移至液相色谱部分,进行液质分析相关步骤。  质谱试剂产线  在公布了质谱系统的型号i601之后,质谱的试剂盒也有了它的名称:Ionify(已注册商标),并形成Ionify® reagent line。很显然,这个词来自于离子的词根,这也正是质谱的工作原理,使物质离子化,测量待检物的质荷比M/Z。  至此,我们又可以大胆的猜测i601质谱系统这个cobas i系列的命名起源,那就是也是源于Ion离子这个词,与其免疫系统的e来自Electro ChemiLuminescence (ECL)elecsys电化学发光系统、临床生化的c来自Clinical Chemistry形成家族化命名逻辑,共同组成cobas中心实验室的主力机型系列。  试剂盒形式沿用cobas生化、免疫系统的cassettes式设计,即试剂多联包形式,从截图可看出也为3组分、尺寸与免疫e green package一致,这也使得其能兼容使用免疫系统e801的试剂处理单元,享用在线装卸载试剂功能。  若如猜测与e pack green试剂盒大小一致且试剂仓一致,则单模块也可以放置48个试剂。  我们可以对比下罗氏的质谱试剂与赛默飞世尔的Cascadion质谱系统的试剂,从临床使用角度,罗氏的即开即用、成分整合、可高度自动化的试剂更符合临床工作人员的喜好。  样本前处理工作流程  质谱检测与生化免疫等其他间接检测(检测器隔检测杯读值、非直接接触待检物)不同,其待检物质是被吞进检测单元的,是直接读取待检物M/Z质荷比的一种技术,无需标记物。  但血清中的成分非常复杂,有大量的磷脂、蛋白等基质杂质成分,待检成分只是非常少的一些物质,所以质谱检测是需要进行样本纯化后才能进样的,尽可能纯的待检物质可降低基质干扰,提升检测的灵敏度和准确性。样本前处理工作由于步骤复杂,目前是临床质谱分析的一个难点和重点,也是各家临床质谱自动化方案主要需解决的关键步骤。在众多的前处理方法中,磁珠法(或称萃取磁珠法)是最有希望实现高通量、自动化、标准化的,国内也有很多公司在这个方向下取得了卓有成效的进展。  这里我们看到罗氏采用的是磁珠法的方案,其过程简要整理如下:  此部分用到的各类试剂应主要来自Ionify的试剂包部分,从图中可大致判断罗氏的磁珠方案为正向抓取待检物的模式,磁珠依靠binder正向结合、抓取待检物质,最后洗脱下待检物质与内标物,进行后续检测。  这里稍微补充一句,磁珠法其实也能做除杂的方式,即沉降基质等成分,用上清部分作为为后续待检样品。  色谱质谱部分  前处理纯化后的样本转移到色谱部分,经过色谱柱,再到质谱检测器进行检测,得到信号。  为了提高检测通量,罗氏方案中设计了8个色谱柱单元,柱子放在cartridge中,这是一种特殊盛放色谱柱的弹夹式结构的装置,它还具有RFID标签。  此种设计与Cascadion的Quick Connect Cartridge有相似的设计理念,都是为了使其安装更换更加便捷,易于临床客户上手。  我们在上一次解读中提及到其设计检测通量可达到100个样品/小时,有过质谱使用经验的都知道,若按传统的单线程标准过色谱柱模式,要实现此速度非常困难。  罗氏采用了多线程模式,即有8根色谱柱可供样本通过,后面将顺序出锋而陆续进入质谱检测。  为便于理解整个实验流程,附简易功能模块示意图。  布局仅为推测,最终布局请以官方公布为准。  还有个非常重要的细节我们从图中可以看出,8个色谱柱单元长短并不一样,其中5个短柱子,3个长(常规)柱子区域。  从如此高的检测通量设计来推测,短柱子是做单项目(或小组合)测试的,这类柱子应与常规的色谱柱不同,是为这些快速检测项目而设计的,如激素类单项。  在结果界面的截图中,我们看到睾酮的色谱图里,单个测试是36秒的检测时间(注:色谱质谱系统里,30秒处为保留时间或出峰时间),按此检测模式恰好可以达到标称的100标本/小时(3600秒/36秒)的速度。  而对于长柱子(相对于短柱子的称呼),应该与传统色谱系统中的常规柱子更接近,预估是做一些联检类的项目,会有较长的检测时间来处理套餐类的项目组合。具体哪些是组合项目和色谱柱具体工作模式,还请大家静待罗氏公司的最终公布吧。  在设备的下方,则应是流动相溶剂等液体耗材部分及质谱仪部分(右侧)。  分析软件  检测流程的最后一部分,将会对数据进行自动处理,软件应用复杂的算法对结果进行验证,然后传输至LIS系统。这相比于传统的质谱分析软件有很大的改善,减少了很多人为参与、调整、确认结果的过程。  在软件界面我们可以看到峰型整合和结果验证的细节,如这个睾酮结果的界面中,分别显示了内标物与待检物质的响应值与峰型情况,依靠峰面积得出待检物的浓度。  在这个过程中,将自动完成待检物质与内标物的峰型质量检查、质谱仪与色谱仪的状态确认、整合与定标质量的确认、结果确认。  项目菜单  检测菜单也是质谱项目是否能成功的重要因素,罗氏公司一直以规划检测项目见长,这次在项目规划上也进行了大量的前期调研和顾问工作。  按规划i601将有一个超过60多个项目、全面的试剂套餐组合,分两批上市。  项目大类为以下5类:类固醇类激素类、维生素D类、TDM药物浓度检测、免疫抑制剂药物检测、滥用药物类检测。  未来质谱模块的灵活配置  模块化的设计一直是罗氏诊断产品的特点,从最早的Modular时代开始,到cobas 6000/8000。  作为cobas Pro的一个模块,罗氏的质谱方案同样拥有灵活的配置形式,在以下图片中我们可以看到i601可以进行双模块的拼接,以便进一步的扩展检测通量和项目数。  当然,还有几种与cobas Pro里其他模块的联机,与免疫模块e801的连接、与生化模块c503的连接,及与生化、免疫混合模块的连接 同样在今年落地的高速生化分析模块c703作为cobas Pro方案里的一员,未来也应可以参与到质谱模块的灵活配置中。  但请注意,在官网的标注中,明确的告知:在上市初期,将仅以单模块形式提供,所有其他的包括生化、免疫的配置将会在随后的日期提供。  一个有意思的探讨: 一套i601质谱系统算几个模块?  我的猜测是算2个,那么一个线体分支就最多可连接2个i601(4个模块),为什么?  视频里的2个i601联机展示图可作为依据吗? 不是仅仅从这里。  我的考量如下:通量的需求、设备长度、系统的复杂度、人员动线、通讯的限制、标本周转时间等等。  但需要进一步的官方消息确认,仅作猜测探讨。  补充知识:罗氏的多模块联机方案中,cobas 8000及Pro系列的模块连接数量,最多可扩展至4个。  我们再看一下罗氏公司的一个整体规划图,这是一套CCM2.0的流水线系统,颇为壮观,从图中可以看出P系列前处理+后处理、日立的轨道系统与生化、免疫、质谱、分子、尿机、血球、凝血组成的强大多学科布局,i601质谱系统作为一个新学科模块,占据着极为重要的战略意义位置。  写在最后  近些年,临床质谱一直是热门赛道,资本方、客户端、企业端,一直期待这一技术在精准医学中大展拳脚,但其发展速度一直不如预期,这里面有很多的因素限制。  我们非常期待有更多的企业在解决诸多困难中取得实质性突破,带我们进入临床质谱的新维度、新时代。  如罗氏官网中质谱项目的标题:Are you ready to enter a new dimension in mass spectrometry?  你准备好进入质谱分析的新维度了吗?  作为相关从业者中的一员,也意识到,临床质谱的普及除了产品维度外,还需要更多的质谱相关知识的推广,让大家理解这一检测利器,最终懂它、用它,真正发挥其作用。  希望今天的分享能起到一点点的作用。作者:IVD崔哥
  • 前沿应用∣岛津高分辨质谱助力合成多肽药物杂质结构鉴定
    截至2020年,全球共有76个多肽类药物被批准上市,7000多个活性多肽被发现,约150个多肽药物进入临床试验,在过去20多年中,平均每年被批准的多肽药物约3个。微球、脂质体、聚乙二醇(PEG)修饰等方法的深入应用解决了多肽药物稳定性差、体内易降解、半衰期短等成药性差的问题,促进了多肽药物的开发利用。多肽药物药效广泛,临床上以慢性病治疗为主,例如罕见病、肿瘤、糖尿病、胃肠道、骨科、免疫、心血管疾病等。国内外药典将合成多肽类药物列入化药的范畴进行杂质的控制。欧洲药典规定合成多肽含量在0.5%以上的相关杂质需进行定性分析,对含量在1%以上的相关杂质进行定量分析并考察其毒副作用。2007年国家食品药品监督管理局发布了《合成多肽药物药学研究技术指导原则》,指出合成多肽原料药中工艺杂质的来源和一般化学药物有所不同,其可能的工艺杂质如:缺失肽、断裂肽、去酰胺多肽、氨基酸侧链的不完全脱保护所形成的副产物、氧化肽、二硫键交换的产物、非对映异构的多肽、低聚物和/或聚合物及合成中所用的毒性试剂和溶剂等。 多肽含有二硫键、裸露的氨基和羧基,容易因分子间二硫键或氨基羧基间脱水形成共价聚合物。共价键形成的聚合物杂质可能存在较大免疫原性风险,在多肽类药物制剂质量研究和新药申报中应予以重点关注。质谱分析、氨基酸组成分析和氨基酸序列测定是合成多肽药物及杂质结构确证最常用的技术手段。 岛津解决方案 ● 分析仪器岛津液相系统Nexera LC-40 +高分辨质谱仪LCMS-9030 ● 分析条件流动相为水:乙腈:TFA=60:40:0.2流速:0.5 mL/min等度洗脱柱温:25℃质谱:离子源:ESI(+)扫描范围:m/z 100 ~5000 多肽药物应用案例一STN聚合物杂质结构鉴定图1. 注射用STN破坏样品HPLC色谱图(UV 210 nm)图2. STN聚合物杂质可能的聚合方式 通过STN聚合物杂质精确质量数预测其分子式,结合多肽的质谱峰归属对STN聚合物杂质进行结构推测(如图2)。STN结构中含有一对二硫键,综合判断其聚合位点为分子间二硫键。 多肽药物应用案例二TJN聚合物杂质结构鉴定图3. 注射用TJN破坏样品HPLC色谱图(UV 214 nm) 图4. TJN聚合物杂质MS2质谱图 使用岛津精确分子式预测工具Formula Predictor对TJN聚合物杂质进行分子式预测,其分子式预测结果恰好相当于两分子TJN脱水,因此推测其聚合位点为两分子TJN的氨基端和羧基端缩合生成肽键。TJN为20肽,其游离氨基端为苯丙氨酸,游离羧基端为亮氨酸。结合TJN二聚体的推定氨基酸序列进行二级质谱碎片归属,TJN聚合物MS2质谱图中识别出多种特征碎片。特别是y19和b21碎片的存在证明聚合位点为亮氨酸(L)和苯丙氨酸(F)缩合而成的肽键。 结论随着我国成为国际人用药品注册技术协调会(ICH)成员国,药品的技术标准逐步与国际接轨。同时随着我国药品一致性评价工作的全面开展,合成多肽药物杂质结构鉴定将面临巨大的技术挑战。岛津公司采用尺寸排阻色谱法建立合成多肽药物的聚合物分析方法,并通过高分辨质谱LCMS-9030测定聚合物的准确质量数推测其分子式,同时结合MS/MS特征碎片推测聚合物杂质的结构。本文展示LCMS-9030在多肽药物的两种主要聚合方式(二硫键和肽键)鉴定中的应用。岛津液相色谱四极杆飞行时间串联质谱LCMS-9030具有高质量准确度,高分辨率的性能优势,是合成多肽药物杂质一级结构鉴定的强有力工具。 本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。
  • 谱图大牛,教你重新认识有机质谱谱图解析!
    有机质谱分析基于不同质荷比(m/z)的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、同时进行多组份分析等优点。近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为日常工作中非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析基于对质谱谱图的解析而实现,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。 为适应广大分析技术工作者的需求,信立方培训中心将于2015年8月18日-21日在北京举办第十二期有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。 培训时间:2015年8月18-21日 培训地点:外国专家大厦(华严北里8号院外国专家大厦(北四环) 适用对象: 各企事业单位、科研院所从事食品卫生、检验检测、石油化工有环境监测及等行业负责分析测试的技术人员,以及各大专院校相关专业在校研究生及分析中心等技术人员。 学习目标: 系统掌握有机质谱谱图解析的基本方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,结合实例讲解谱图解析的基本思路和方法,为有机质谱的定性分析打下坚实基础。 课程特色: p 讲师均为长期从事质谱分析研究的高职人员,具有丰富的理论知识和实践经验; p 有机质谱谱图解析的基础知识、基本规律和精选实例相结合,深入浅出,通俗易懂; p 独有的有机质谱谱图解析水平测试题,可清楚的对比学习前后的技术水平; p 学员可带问题参加学习班,在学习班和专家即时讨论交流,解决实际问题; 授课专家:   1、王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》;   2、苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》; 3、授课专家不宜公开; 授课大纲:  一、谱图解析基础知识   1、原子中电子的排布   2、奇电子离子与偶电子离子   3、氮规则   4、环加双键值   5、同位素峰   6、单分子反应 二、离子的丰度   1、质荷比与离子丰度包含的结构信息 2、影响碎片离子丰度的基本因素 三、离子碎裂的基本机理  1、断裂  2、环的开裂  3、重排反应  4、置换反应   5、消除反应 四、常见有机化合物的裂解及质谱图特征   1、碳氢化合物   2、醇、酮、醛、酸、酯、醚   3、胺类、酰胺类   4、卤代物、硝基化合物 5、腈 五、由质谱图推测分子结构   1、基本方法及思路 2、实例练习 六、NIST谱图库检索实用技术   1、NIST谱图库简介   2、NIST谱图库主要功能 3、NIST谱图库检索实例 培训费用 每人3800元,2人以上组团报名可每人优惠100元(含报名费、培训费、资料费、培训期间每日午餐费用)。 颁发证书 参加相关培训并通过考试的学员,可以获得: 由信立方培训中心颁发并有授课老师签字的结业证书。该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。 报名咨询 联系人:李茹 电话:010-51654077-8119/15910410867 邮箱:liru@instrument.com.cn
  • 布鲁克超短TE磁共振成像技术可用于基于人体牙齿的法医学年龄推测(FAE)
    难民是指为逃离本国境内的战争、暴力或迫害,跨境到另一个国家寻求安全庇护的人。难民接纳国需要根据难民的年龄,遵循相应的程序。然而,难民离家时携带物品通常较少,极少会携带年龄证明(例如,出生证明)。因此,相关法院和政府当局通常需要进行法医学年龄推测(FAE),以确保依法行事。在法医学年龄推测(FAE)过程中,需要对个人牙齿的特定方面进行检测,并将测定结果与参考值进行比对。牙齿发育大多于13岁完成。第三磨牙(智齿)萌出发生在17-21岁之间,但并非每个人都会萌生智齿。因此,FAE所关注的通常是牙齿退化特征。次生牙本质的形成牙齿由牙釉质、牙骨质和牙本质这三个硬组织以及牙髓这个软组织组成。成牙本质细胞位于软牙髓和硬牙本质之间,负责生成牙本质。牙本质有三种类型:第一期原发性、第二期继发性和第三期。第一期原发性牙本质于牙齿萌出之前形成,第二期继发性牙本质于牙齿萌出之后形成,因为牙齿随着年龄增长而逐渐发育,第三期牙本质则于创伤后形成。第二期继发性牙本质会加入到面向牙髓的牙本质中,使牙髓腔的体积在人的一生中逐渐缩小。此外,与第三期牙本质不同,第二期继发性牙本质不受外部因素(例如,创伤)的影响。因此,检测牙髓体积是FAE中的一种常用方法。利用MRI技术检测牙髓萎缩情况使用锥束计算机断层扫描(CBCT)技术来检测牙髓体积的做法在相关报道中已屡见不鲜。通过该技术生成的三维数据集可用于重建牙齿结构。然而,在CBCT检测过程中,被检测者需要暴露于高辐射环境。近年来,无辐射的磁共振成像(MRI)技术的普及给FAE带来曙光,但挑战仍然存在,因为牙齿等坚硬结构含水量低,导致T2弛豫时间超短,故难以进行分析。超短回波时间(UTE)MRI这一相对较新的技术有望克服这一难题,因为该技术能够在很短的弛豫时间(低至40µ s)下,对物质进行表征。实践证明,该技术可实现以相对较高的空间分辨率和高信噪比,对皮质骨等硬组织进行分析。德国明斯特大学医院的一组研究人员使用布鲁克的超高场9.4 T Biospec 94/20 MRI波谱仪,对人体拔牙进行了分析,以确定FAE过程是否适用超短TE磁共振成像方法。超短TE磁共振成像 利用超短TE磁共振成像技术,生成高质量的牙齿硬组织及软组织数据在牙科成像中,图像质量是最重要的参数之一,因为研究人员通常需要对一些微小细节进行识别。本次研究实现了66μm3的平面内空间分辨率——与CBCT的分辨率相当。在这种高空间分辨率下,研究人员得以将软牙髓至根尖孔的部分与其他牙齿组织和样品包埋材料区分开来,从而获得切牙、尖牙、前磨牙和磨牙这四类人体牙齿的细节图像。通过半自动分割并基于不同强度的MRI数据集结构,研究人员可进行三维重建,从而计算出这四类人体牙齿的牙髓体积。此次分析还表明,牙髓(尤其是根髓)可能存在多种不同的形式,并可能在根管内发生分离和聚合。超短TE磁共振成像技术可用于FAE上述数据表明,超短TE磁共振成像技术有望以较高的空间分辨率实现牙齿的三维成像,以及对各种不同牙齿的牙髓体积进行量化。然而,此次研究的样本量很小,仅对四颗人体牙齿进行了分析。因此,我们计划在后续研究中扩大样本量,以测试此方法(结合参考库)能否测定牙齿年龄。此外,超短TE磁共振成像技术可能存在的局限在于,临床环境中的磁共振场强目前只能达到7 T,因此超短TE磁共振成像尚未全面普及。然而相比于CBCT,超短TE磁共振成像技术在无辐射分析方面具有显著优势,同时,鉴于此次研究提供了一系列非常具有前景的初步数据,因此,该技术有可能成为未来FAE的首选常规方法。全面的法医学解决方案组合布鲁克为法医学分析提供了最全面的解决方案组合——包括鉴定和量化麻醉品及兴奋剂、化学战剂、表征爆炸物、检测食品欺诈、识别艺术品及文件伪造、环境取证(包括废弃物分析),以及犯罪现场调查(例如,玻璃、纤维和枪弹残留物分析)。布鲁克的技术不仅应用于日常的例行分析,还被用于开发和改进本研究案例所述的其他新方法。布鲁克的使命是帮助执法部门针对法律程序生成连贯、可靠的数据,从而让社会更加安全。作为磁共振分析解决方案的领先研发企业,布鲁克服务于40多个国家的警署、海关,以及联邦级、州级实验室和边境管控实验室的数百个客户,为其提供丰富的高性能落地式磁共振系统,以及易操作的台式自动化磁共振系统。参考文献&bull Timme, M., et al. (2020). Evaluation of Secondary Dentin Formation for Forensic Age Assessment by Means of Semi-automatic Segmented Ultrahigh Field 9.4 T UTE MRI Datasets. International Journal of Legal Medicine. https://doi.org/10.1007/s00414-020-02425-7 .
  • 表面改性纳升电喷雾针提高质谱灵敏度
    大家好,本周为大家分享一篇发表在J. Am. Soc. Mass Spectrom上的文章,Surface Modified Nano-Electrospray Needles Improve Sensitivity for Native Mass Spectrometry [1] 。该文章的通讯作者是来自美国亚利桑那大学的Michael T. Marty教授。非变性质谱(NMS)和电荷检测质谱(CD-MS)已成为表征各种蛋白质和高分子复合物的多功能工具。两者通常使用硼硅酸盐针进行纳米电喷雾电离(nESI)。但由于蛋白质在中性pH值下通常带正电荷,可能会吸附在带负电荷的玻璃nESI针表面,从而降低灵敏度,影响数据分析。为了提高NMS和CD-MS的灵敏度,作者用惰性表面改性剂修饰了nsEI针的表面。通过将聚乙二醇(PEG)共价连接到硅烷醇表面,钝化了玻璃表面,以减少非特异性吸附。首先,为确定表面改性是否能提高质谱灵敏度,作者团队采用PEG涂层的玻璃nESI针检测了两种非特异性吸附玻璃的蛋白:牛血清白蛋白(BSA)和溶菌酶。结果发现,相比于对照组,BSA和溶菌酶的信号强度均提高了2倍左右(图1)。PEG 涂层显着提高了nESI针头对标准蛋白质的MS灵敏度。图1.(A) 未涂层对照针和 (B) PEG 涂层针的 BSA 原始质谱显示信号强度。(C) 溶菌酶和 (D) BSA的PEG涂层(浅蓝色)和对照(灰色)nESI针的信号强度。接下来,作者利用搭载PEG表面涂层nESI针的CD-MS检测完整腺病毒 (AAV) 衣壳。结果发现,与采用未改良针的对照组相比,在较低浓度下,PEG改良针所收集的离子总数高出8倍以上(图2)。相比于一般的CD-MS检测,采用改良针的CD-MS检测的样品浓度更低,采集时间缩短。图2. AAV2 衣壳的 CD-MS 分析。(A) 对照组; (B) PEG 涂层针。 (C) 从空AAV2衣壳的5分钟 CD-MS 采集中收集的单个离子总数。接下来,作者研究了nESI针尖端尺寸和几何形状变化对实验结果的影响。实验发现,虽然改良针在较低浓度下显著提高了信号强度,但其针间差异很大。作者团队假设信号强度的偏差是由人工修剪nESI针的尖端直径差异引起的。为了最大限度地减少nESI针尖端尺寸和几何形状的变化,作者开发了一个针头拉拔器程序,以重复生产具有2 μm吸头直径的nESI针头。结果发现,PEG修饰的2 μm针的可明显提高检测信号强度,并且每次运行差异较小。相比于人工修剪的针头,2 μm针信号提升幅度更大。0.1 μm nESI针与2μm针两者检测到的蛋白的信号强度相似(图3)。基于以上结果,作者推测2 μm针检测到的信号值更高的原因可能是2 μm针的锥度更短。较短的锥度可能会在针尖附近产生更高的涂层密度。而手动剪断的针头具有较长的锥度,在拉拔过程中在尖端附近损坏PEG涂层,因此检测到的信号值偏低。而0. 1μm和2μm针尖上的锥度都比较短,涂层在接近针尖表面时可能完好无损,因此两者检测到的信号强度相似。图3. 具有 2 μm(左)和 0.1 μm(右)尖端直径的PEG涂层(浅蓝色)和未涂层对照(灰色)nESI 针的 BSA 最丰富电荷状态的信号强度。通过以上实验,作者已证实了PEG 修饰nESI可提高NMS与CD-MS的灵敏度。接下来,作者对其作用机制进行深入研究。首先,作者测试了灵敏度的提高是否是由于减少了对玻璃的非特异性吸附引起的。作者采用两种化学性质不同的涂层:PEG与多氟分子PFDCS修饰针头,两者均可减少蛋白的非特异性吸附,理论上均可改善质谱灵敏度。但结果发现,仅有PEG涂层针头可改善信号强度。之后,作者采用两种针头检测了泛素信号值。泛素在中性条件下不与玻璃发生吸附作用,理论上两者信号值无统计学差异,但结果发现,相比于PFDCS 修饰针头,PEG修饰针头组检测到的信号值提高了3倍。由此得出结论,PEG涂层针头不是通过减少蛋白与玻璃之间的非特异性吸附来提高质谱信号值的机制。最后,作者研究了表面改性针的毛细管作用,发现无修饰的硼硅酸盐毛细管毛细管作用最强,PEG毛细管具有中等强度的毛细管作用,而PFDCS毛细管几乎没有毛细管作用(图4A)。然后,在没有流体泵送或施加压力的静态条件下研究了不同nESI针的流速(图4B)。结果发现,PEG修饰的nESI针流速最高,而PFDCS修饰和对照nESI针的流速没有统计学差异。作者假设灵敏度的提高可能是由nESI针的流速增加导致的。由于传统针头中较高的毛细力,液体会紧紧地附着在玻璃上,降低给定ESI电压下的液体流量。而PEG修饰降低了毛细阻力,可能会增加流向尖端的液体,从而增加信号。而PFDCS修饰针头虽然具有较低毛细作用,但其流速较小,原因可能是需要一定强度的毛细作用才能获得最佳的流动速度。作者未来的实验将进行深入探索这一假设。ESI针的毛细作用照片。 (B) PFDCS修饰 (深蓝色)、PEG修饰 (浅蓝色)和未修饰 (灰色) 针的流速。总而言之,作者证明了PEG修饰的nESI针增加了多种分析物的质谱信号强度和灵敏度,展示了一种可以在较低浓度下提高难分析物的灵敏度、相对快速且成本低廉的方法。作者推测表面改性通过提高nESI针尖端流速以发挥提高质谱检测灵敏度的作用,但该推测仍需进一步证明。[1]Kostelic MM, Hsieh CC, Sanders HM, Zak CK, Ryan JP, Baker ES, Aspinwall CA, Marty MT. Surface Modified Nano-Electrospray Needles Improve Sensitivity for Native Mass Spectrometry. J Am Soc Mass Spectrom. 2022 Jun 1 33(6):1031-1037. doi: 10.1021/jasms.2c00087. Epub 2022 May 19. PMID: 35588532.
  • 信立方培训中心“第11期有机质谱谱图解析”培训班在京成功举办
    2015年05月26-29日由信立方培训中心在北京举办&ldquo 第十一期有机质谱谱图解析&rdquo 培训班,历时四天,于2015年05月29日圆满落幕。 近有24家企业,共计30多位参加。  本次培训由中国科学院化学研究所质谱中心研究员王光辉、北京石油化工科学研究院苏焕华、天津大学材料科学与工程学院范国樑三位老师进行授课讲解。四天的课程从有机质谱与分子结构关联的角度,深入讲述与质谱谱图解析紧密相关的奇电子偶电子规则,氮规则,分子离子识别,离子丰度,离子碎裂规律等核心概念。介绍各类典型有机化合物---碳氢化合物、(脂肪烃,炔,芳烃等),醇,醚,酮,醛,羧酸,酯,胺,卤代物,硝基化合物等的裂解及质谱规律,并以丰富的实例讲述从质谱图推测分子结构的基本方法。 此次培训学员反映很有收获,通过参加此次培训班也与业内的其他同行进行了交流。 中国科学院化学研究所质谱中心研究员 王光辉 天津大学材料科学与工程学院 范国樑 北京石油化工科学研究院高级工程师苏焕华 学员认真听讲 王光辉老师给学员认真讲解实际遇到的问题 苏焕华老师现场讲解学员的疑问 学员与王光辉、范国梁老师的合影 学员与苏焕华老师的合影 联系人:李老师 电 话: 010-51654077-8119 手 机:15910410867 邮 件:liru@instrument.com.cn 更多培训班相关动态,请关注信立方培训中心微信公众号:training17
  • 2023年,这些色质谱国家标准开始实施!
    质谱(Mass Spectrometry, MS)是一种测量未知化合物质量的方法,是纯物质鉴定的有力工具。质谱与色谱联用,可以检测不同组分的物质;与光谱、NMR联用,可以推测出化合物的具体结构。色质谱方法因其极高的灵敏度和准确性,广泛应用于科学研究,化工产业,医学检验以及食品药物分析等领域。近年来,《质谱分析方法通则》(GB/T 6041—2020)和《化学试剂 气相色谱法通则》(GB/T 9722-2023)再次修订实施,进一步加强了色质谱方法进行物质定性定量分析时的要求规范。 据统计,2023年实施的色质谱相关的国家标准共有58项,其中54项为检测标准,4项为仪器性能和方法通则标准。58项国家标准中涉及食品、材料、环境、化妆品、医疗等多个领域。其中检测方法以ICP-MS、LC-MS和GC-MS为主,有四项涉及到离子色谱方法。据统计,2023年实施的色质谱相关的国家标准共有58项,其中54项为检测标准,4项为仪器性能和方法通则标准。在2023年实施的色质谱法国家标准中,有48项为首次制定,其中强制标准17项,17项均为食品兽残检测。值得关注的是,21项兽药残留检测方法食品安全国家标准,自2023年2月1日起实施,检测方法以LC-MS为主。特别值得关注的是,在2023版新标准增加的水质检测方法中,以质谱技术相关的方法居多,涉及质谱技术的检测方法由2006版标准的3个增加至本次的28个。其中气相色谱质谱法由原有的2个增至14个,新增1个气相色谱串联质谱法、1个液相色谱质谱法,同时增加了11个液相色谱串联质谱法。(点击查看:GB/T 5750-2023《生活饮用水标准检验方法》新增质谱方法盘点)
  • 岛津质谱谱图解析高级培训班在京举办
    质谱分析是当今最重要的分析方法之一,已日益倍受分析工作者的推崇。具备高超的质谱解谱能力,是分析工作者能够充分发挥质谱技术特长高水平地完成分析检测工作的关键。 为帮助岛津的有机质谱(含GCMS和LCMS)用户提高质谱解谱能力,岛津分析中心秉承&ldquo 专业分析者教育服务&rdquo 的核心服务理念,于2013年6月19日至6月21日在岛津北京分析中心成功举办了首届质谱谱图解析高级培训班。 培训班特邀请有机质谱界享有盛名的专家王光辉老师和盛龙生老师讲授有机质谱解析基础知识、离子丰度和离子碎裂机理、如何从质谱图推导化合物结构和大气压离子化质谱的解析等内容。13位来自全国各地的质谱用户抱着真诚的学习态度参加了本次培训班。 培训班课堂场景 6月19、20日两天,王光辉老师深入浅出地讲解了有机质谱图与分子结构的关联、由质谱图推测分子结构、偶电子离子裂解规律等内容。6月21日,盛龙生老师详尽讲解了大气压离子化质谱的解析等内容。 王光辉老师讲课 盛龙生老师讲课 两位专家渊博的学识和丰富的实践经验折服了本次培训班的学员。学员们从中学到了大量的质谱知识,理清了概念,受益非浅。学员们还就自身开展的项目向两位专家请教。王光辉老师特地介绍了岛津GCMSsolution软件和NIST软件在解谱上的实用功能;盛龙生老师为此次培训班特地编写了&ldquo 大气压离子化质谱的解析&rdquo 培训教材,这是业内所见到的第一个系统地讲解大气压下离子化质谱解析的教材。可见两位专家对此次培训班的用心。 鉴于此次培训班的成功举办,今后,该培训班有望在各地分析中心轮流举办,以满足不同地区用户的需要,作为岛津公司&ldquo 全面应对用户需求,提升服务品质&rdquo 实践中的重要一环。 附件 本次培训班特邀授课专家简介: 专家姓名 专家简介 王光辉 中国科学院化学所质谱中心研究员。国内最早从事质谱研究的专家之一,国内质谱解析领域的知名专家,有数十年从事质谱技术研究与教学工作经验。编著《有机质谱解析》一书,该书为国内质谱技术丛书的经典著作,是从事质谱解析工作的必备书籍。 盛龙生 中国药科大学教授,长期从事药物分析方法学研究。主要研究方向:质谱法及其联用技术的方法学和应用研究,包括色谱 /质谱联用技术在中药、生物药物、合成药物及药物代谢和代谢组学中的应用研究。著有《色谱质谱联用技术》,《药物分析》等多本专著。 关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所为扩大中国事业的规模,于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司。 目前,岛津企业管理(中国)有限公司在中国全境拥有13个分公司,事业规模正在不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心;覆盖全国30个省的销售代理商网络;60多个技术服务站,构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。 岛津作为全球化的生产基地,已构筑起了不仅面向中国客户,同时也面向全世界的产品生产、供应体系,并力图构建起一个符合中国市场要求的产品生产体制。 以&ldquo 为了人类和地球的健康&rdquo 为目标,岛津人将始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务。 更多信息请关注岛津公司网站www.shimadzu.com.cn/an/ 。
  • 有机质谱谱图解析培训班即将开班,从速报名
    信立方质谱培训中心致力于质谱应用技术培训工作。为满足当前从事质谱应用技术人员的迫切需求,培训中心与仪器行业最大的门户网站仪器信息网合作,在考察全国各类质谱应用技术培训现状的基础上,借鉴、发扬培训成效显著的质谱应用技术培训班的成功经验,旨在提高相关从业人员应用技术水平,使质谱技术更好地服务于科研、生产及质控,监测等领域。自2009年,迄今已开设二十余期不同类型和层次的质谱培训班,受到广大学员的欢迎和好评。2013年培训中心将继续举办此系列质谱培训班,并不断增加和更新培训内容,详情请查看信立方质谱培训中心。报名地址:http://www.instrument.com.cn/training/training_info.asp?TRI_No=101009 有机质谱分析基于不同质量数的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为的原理进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、可同时进行多组分分析等优点,近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为一种非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。为适应广大分析技术工作者的需求,我们将与仪器信息网合作于2013年12月3日-6日在北京举办有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。 专家团队   &diams 王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》   &diams 苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》 课程大纲 一、谱图解析基础知识 二、离子的丰度 1、原子中电子的排布 2、奇电子离子与偶电子离子 3、氮规则 4、环加双键值 5、同位素峰 6、单分子反应 1、质荷比与离子丰度包含的结构信息 2、影响碎片离子丰度的基本因素 三、离子碎裂的基本机理 四、常见有机化合物的质谱图特征 1、断裂 2、环的开裂 3、重排反应 4、置换反应 5、消除反应 1、碳氢化合物 2、醇、酮、醛、酸、酯、醚 3、胺类 4、酰胺类 5、腈 五、由质谱图推测分子结构 六、NIST谱图库检索实用技术 1、基本方法及思路 2、实例练习 1、NIST谱图库简介 2、NIST谱图库主要功能 3、NIST谱图库检索实例 咨询及报名联系方法   电话:010-51654077-8113 13810253507 传真:010-82051730   Email:training@instrument.com.cn
  • 有机质谱谱图解析专题培训班第一轮通知
    有机质谱分析基于不同质量数的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为的原理进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、可同时进行多组分分析等优点,近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为一种非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。 为适应广大分析技术工作者的需求,我们将与仪器信息网合作于2014年7月22日-25日在北京举办有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。 培训日期:2014年7月22日-25日 培训地点:北京 外国专家大厦 培训日程: 主要课程及讲师 授课时间及主要内容 有机质谱解析基础&mdash &mdash 王光辉 7月22日-23日全天 ①基础知识(原子中电子的排布;奇电子离子与偶电子离子;氮规则;环加双键值;分子离子的识别;同位素峰;单分子反应) ②离子丰度(质荷比与离子丰度;影响碎片离子丰度的基本因素) ③离子碎裂的基本机理(电荷及游离基定域的概念;离子碎裂的类型) ④由质谱图推测分子结构 常见有机物质谱解析 7月24日全天 常见有机物质谱解析(碳氢化合物、醇、醚、醛、酸、酯、胺、卤代物、硝基化合物) 质谱解析小结&mdash &mdash 苏焕华 7月25日全天 ①质谱解析方法小结(各类化合物的质谱特征,质谱推导结构的基本方法) ②质谱解析练习题 & 答疑 专家介绍: 王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,曾参与国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作: 《有机质谱解析》; 苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,曾参与国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。著作:《色谱-质谱联用技术及应用》; 其他课程: 2014年7月29-31日 液质联用(LC-MS)应用技术培训班(医药) 2014年10月21-23日 液质联用(LC-MS)应用技术培训班(食品/环境) 报名方式: 电话:010-51654077-8123 15801554077 安老师 Email:job@instrument.com.cn 报名地址:http://www.instrument.com.cn/training/train_sign.asp?TRI_No=101113
  • 日本岛津开展基于血液推测脑淀粉样蛋白蓄积的第三方检测业务
    为阿尔茨海默病的治疗药物和预防方法的基础研究开发做贡献承担岛津制作所和岛津集团内的委托分析业务的岛津TECHNO-RESEARCH,以阿尔茨海默型痴呆症(以下称“阿尔茨海默病”)相关的研究开发领域为对象,从8月7日开始,开展了根据血液推测脑淀粉样蛋白蓄积程度的委托分析。本技术应用了2018年2月1日(日本时间)在Nature Online版中发表的方法,提供委托分析服务。(Nature论文: A. Nakamura, N. Kaneko et. al., “High performance plasma amyloid-β biomarkers for Alzheimer’s disease” doi:10.1038/nature25456) 目前,阿尔茨海默病尚无可以根治的治疗药物和预防方法。岛津制作所及岛津TECHNO-RESEARCH旨在通过本服务,为治疗药物及早期预防方法的基础研究与开发做出贡献。【本服务的特点】1.通过少量血浆推测脑淀粉样蛋白蓄积程度推断脑淀粉样蛋白蓄积程度的方法有正电子发射断层扫描(PET)和脑脊液(CSF)检查法,但这两种方法对身体的负担很大,且可以实施检查的设施也有限。而本方法仅用0.6ml的血浆即可进行检查。 2.有助于治疗药和预防方法的基础研究与开发据说阿尔茨海默病和轻度认知障碍(MCI)从发病20~30年前,开始在脑内蓄积淀粉样蛋白。本方法可以从血液简便地推测脑淀粉样蛋白蓄积程度。 注:本分析服务供研究使用。不能用于医疗实践或诊断目的。 【术语说明】正电子发射断层扫描(PET)一种向体内微量注射容易积聚在患处等的特殊药物,并对药物释放的阳电子位置进行成像的方法。在阿尔茨海默病中,已知PiB(匹兹堡化合物B)等是可以观察淀粉样蛋白蓄积量和位置的药物。 血浆血液离心分离后,上层淡黄色液体是血浆,占重量约一半。剩余约一半是红细胞。含有蛋白质、肽、维生素和金属离子等多种化合物。淀粉样蛋白不到其重量的亿分之一。 淀粉样蛋白表示淀粉样蛋白的片段β-淀粉样蛋白开始凝集,在脑内蓄积的物质。一般认为β-淀粉样蛋白是阿尔茨海默病的主要致病物质。 关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理商网络以及60多个技术服务站,已构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。本公司以“为了人类和地球的健康”为经营理念,始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务,为中国社会的进步贡献力量。
  • 信立方有机质谱谱图解析培训班圆满结束
    有机质谱分析近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,已成为一种非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。 为适应广大分析技术工作者的培训需求,信立方质谱培训中心与仪器信息网合作开展的第一期有机质谱谱图解析技术专题培训班,于2009年7月20日在北京如期举办. 培训班为期5天,邀请中国科学院化学研究所质谱中心王光辉研究员、北京石油化工科学研究院苏焕华高工和北京防化研究院杨小兵博士共同主讲。培训内容涉及谱图解析的基础知识、离子的丰度、离子碎裂的基本原理、常见有机化合物的质谱图特征和NIST谱图库检索实用技术等,培训过程中主讲专家还带领学员进行了由质谱图推测出分子结构的基本方法和思路的实例练习。通过此次学习,加深了学员对有机质谱解析的理解和认识,并且更系统和条理的掌握了质谱解析的思路和方法. 谱图解析培训班授课现场 按照此次培训班日程安排。7月24日上午培训中心安排全体学员进行了有机质谱谱图解析培训班结业考试,考试结束后,便由王光辉和苏焕华老师针对培训班学员提出的问题进行集中答疑,杨小兵老师对学员的结业试卷进行批阅。答疑过程中,两位专家不仅仅只是解答单一的疑问,而是将所有的疑问归纳汇总,综合答疑。对全体学员解惑的过程也是将此次培训班所讲授的知识与实际操作融汇贯通的过程. 专家答疑现场 老师认真批阅结业试卷 此次培训班结业考试中,宁波市海洋与渔业研究院、上海计量测试技术研究所和石家庄疾病预防控制中心的三名学员分获前三名。培训中心向他们颁发了优秀学员证书并进行了500元至200元不等的优秀学员奖金奖励. 优秀学员与授课专家合影留念 有机质谱谱图解析技术不仅需要分析工作者深厚的经验积累,而且需要其对繁杂的裂解规律具有清晰的解析思路和系统条理的解析方法,为使广大分析工作者更系统掌握有机质谱谱图解析的基本方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,为有机质谱的定性分析打下良好基础。同时,也为未能参加此次培训班的学员再提供一次良好的学习机会,信立方质谱培训中心拟于2009年10月下旬在北京举办第二期有机质谱谱图解析技术专题培训班,结合实例讲解谱图解析的基本思路和方法,望感兴趣的广大分析工作者切莫错失良机。详细课程设置请密切关注本网培训中心专栏。 注:第三期气质联用(GC-MS)应用技术培训班9月21日-25日在杭州举办。目前已开始报名,详情请查阅: http://www.instrument.com.cn/training/training_info.asp?TRI_No=100244。
  • 信立方2009有机质谱培训工作圆满结束
    近年来,有机质谱分析已经成为一种非常重要的定性定量分析方法,而质谱的定性分析主要是基于对质谱谱图的解析来实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。为此,为满足广大分析工作者的要求,继第一期有机质谱谱图解析培训班后,培训中心又于12月在北京举办了第二期有机质谱谱图解析技术专题培训班。   在本期培训班中,继续邀请中科院化学所质谱中心王光辉、北京石油化工研究院苏焕华、防化院杨小兵担任主讲,主要从谱图解析的基础知识、离子的碎裂类型、由质谱图推测分子结构、常见有机化合物的质谱解析以及谱图解析基本方法入手,辅以课堂实例练习,逐级分步教大家质谱谱图解析的思路与方法。学员普遍感觉此次学习收获颇丰,为今后的工作提供了指导和帮助。    授课现场 课后答疑   沿袭信立方培训的一贯传统,培训班最后一天主要进行了结业考试和集中答疑,本次结业考试中天津春发食品配料有限公司、贵州茅台酒股份有限公司、中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所学员分获前三名,获得优秀学员奖金及证书。      考试现场 优秀学员与专家合影   伴随有机质谱谱图解析(第二期)培训班的圆满结束,信立方有机质谱培训中心2009年有机质谱培训工作也圆满结束。在2009年信立方质谱培训中心共举办有机质谱培训班6期,其中气质联用(GC-MS)应用技术培训班3期,液质联用(LC-MS)应用技术培训班2期,有机质谱谱图解析技术专题班2期。为保证听课效果,所有培训班均采用小班授课模式,限额招生40人,基本上09年所有的培训班都是提前于开班时间二周便截止报名。   为了继续致力于服务广大质谱分析工作者,满足更多工作者的学习需求,培训中心将于2010年继续举办有机质谱系列培训班,除了更多开展广受好评的气质联用、液质联用及谱图解析培训外,还将增加有机质谱在相关行业方面的应用培训以及软件应用培训,希望大家一如既往的支持并请密切关注本网培训信息发布。   信立方2010年有机质谱培训计划
  • 寻找“使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员”
    有机质谱谱图解析培训班 课程基本信息 培训机构: 信立方质谱培训中心 适用对象: 使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员。 课程详细信息 费用:3800 开班地点:北京市 开班时间:2015-05-26 培训天数: 共4天 详细地址 外国专家公寓(华严北里8号院外国专家大厦) 授课专家 王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。著有《有机质谱解析》等专著。 苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。著有《色谱-质谱联用技术及应用》等专著。 课程内容 一、谱图解析基础知识 1、原子中电子的排布 2、奇电子离子与偶电子离子 3、氮规则 4、环加双键值 5、同位素峰 6、单分子反应 二、离子的丰度 1、质荷比与离子丰度包含的结构信息 2、影响碎片离子丰度的基本因素 三、离子碎裂的基本机理 1、断裂 2、环的开裂 3、重排反应 4、置换反应 5、消除反应 四、常见有机化合物的质谱图特征 1、碳氢化合物 2、醇、酮、醛、酸、酯、醚 3、胺类 4、酰胺类 5、腈 五、由质谱图推测分子结构 1、基本方法及思路 2、实例练习 六、NIST谱图库检索实用技术 1、NIST谱图库简介 2、NIST谱图库主要功能 3、NIST谱图库检索实例 注:学员可自带原始数据采集文件,讲师可采用学员的文件作为案例进行分析) 课程特色 讲师均为长期从事质谱分析研究的高职人员,具有丰富的理论知识和实践经验; 有机质谱谱图解析的基础知识、基本规律和精选实例相结合,深入浅出,通俗易懂; 独有的有机质谱谱图解析水平测试题,可清楚的对比学习前后的技术水平; 学员可带问题参加学习班,在学习班和专家即时讨论交流,解决实际问题; 会务信息 汇款方式: 银行转帐: 户 名:北京信立方科技发展股份有限公司 开户行:兴业银行积水潭支行 帐 号:321 2601 001 0000 1500 优惠措施: 1、组团报名2-5人,报名费用每人减少100元; 2、5人以上组团报名优惠请联系客服, 电话:010-51654077-8123;15801550477。 联系方式 联系人: 安先生 Email: job@instrument.com.cn 联系电话: 010-51654077-8123 传真:010-82051730
  • 昆明理工大学“飞行时间二次离子质谱仪”通过验收
    3月15日,昆明理工大学资产管理处组织专家组,对飞行时间二次离子质谱仪(TOF.SIMS-5)进行验收。在逐一核实设备部件,配件型号、数量,质量分析器的动态离子能量扩展技术(EDR)后,专家组认为,该设备安装齐全,设备性能和EDR指标均已达到合同指标,通过终极验收。同时,专家组在设备的维护和管理、设备性能的开发利用等方面提出了一些意见和建议。截止目前,学校单价500万元以上的仪器设备已达到5台套。  飞行时间二次离子质谱仪(TOF.SIMS-5)主要用于矿物表面深度剖析、表面化学药剂吸附层厚度、表面微量组分、表面有机物吸附推测、表面3D表征及成像等表面微观研究。在进一步熟练设备操作和性能后,TOF.SIMS-5将正式投入使用,在矿物加工工程、矿物学、材料学、生命科学等专业的实验教学与科研工作中发挥积极作用。
  • 2015年第12期有机质谱谱图解析应用技术培训班邀请函
    信立方培训中心(北京信立方科技发展股份有限公司运营的科学仪器专业门户网站—仪器信息网(www.instrument.com.cn)旗下专业培训机构)致力于分析科学仪器的应用技术培训工作。为提高相关从业人员的技术水平,使分析科学仪器更好地服务于科研、生产及研发工作,适应当前从事质谱应用技术人员的迫切需求,培训中心自2009年起,至今已开设近三十期不同类型和层次的质谱培训班,涵盖气质、液质、谱图解析等领域,受到广大学员欢迎和好评。  有机质谱分析基于不同质荷比(m/z)的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、同时进行多组份分析等优点。近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为日常工作中非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析基于对质谱谱图的解析而实现,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。为适应广大分析技术工作者的需求,信立方培训中心将于2015年8月18日-21日在北京举办第十二期有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。  培训时间:2015年8月18-21日  培训地点:外国专家大厦(华严北里8号院外国专家大厦(北四环))  适用对象:  各企事业单位、科研院所从事食品卫生、检验检测、石油化工有环境监测及等行业负责分析测试的技术人员,以及各大专院校相关专业在校研究生及分析中心等技术人员。  学习目标:  系统掌握有机质谱谱图解析的基本方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,结合实例讲解谱图解析的基本思路和方法,为有机质谱的定性分析打下坚实基础。  课程特色:  讲师均为长期从事质谱分析研究的高职人员,具有丰富的理论知识和实践经验   有机质谱谱图解析的基础知识、基本规律和精选实例相结合,深入浅出,通俗易懂   独有的有机质谱谱图解析水平测试题,可清楚的对比学习前后的技术水平   学员可带问题参加学习班,在学习班和专家即时讨论交流,解决实际问题   授课专家:  1、王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》   2、苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》   3、授课专家不宜公开   授课大纲:  一、谱图解析基础知识  1、原子中电子的排布  2、奇电子离子与偶电子离子  3、氮规则  4、环加双键值  5、同位素峰  6、单分子反应  二、离子的丰度  1、质荷比与离子丰度包含的结构信息  2、影响碎片离子丰度的基本因素  三、离子碎裂的基本机理  1、断裂  2、环的开裂  3、重排反应  4、置换反应  5、消除反应  四、常见有机化合物的裂解及质谱图特征  1、碳氢化合物  2、醇、酮、醛、酸、酯、醚  3、胺类、酰胺类  4、卤代物、硝基化合物  5、腈  五、由质谱图推测分子结构  1、基本方法及思路  2、实例练习  六、NIST谱图库检索实用技术  1、NIST谱图库简介  2、NIST谱图库主要功能  3、NIST谱图库检索实例  授课方式:  (一)课程讲座  (二)案例讲解  注:学员可自带原始数据采集文件,讲师可采用学员的文件作为案例进行分析  培训费用:  每人3800元,2人以上组团报名可每人优惠100元(含报名费、培训费、资料费、培训期间每日午餐费用)。  颁发证书:  参加相关培训并通过考试的学员,可以获得:  由信立方培训中心颁发并有授课老师签字的结业证书。该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。  报名咨询:  联系人:李老师  电话:010-51654077-8119/15910410867  邮箱:liru@instrument.com.cn
  • 第15期全国有机质谱谱图解析培训班11月29日即将召开
    p br/ & nbsp   他们在质谱分析领域兢兢业业,掌握最前沿的应用技术,具有丰富理论知识和实践经验,我们都应向他们学习讨教。他们的在学术上的深度、钻研的态度值得我们追仿。 br/ br/ br/ 王光辉 br/   中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作: 《有机质谱解析》 br/ br/ br/ br/ 苏焕华 br/   北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》 br/ br/ br/ br/ 李重九 br/   中国农业大学理学院应用化学系教授,农残分析领域著名质谱专家,在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作:《有机质谱应用:在环境、农业和法庭科学中的应用》 br/ br/ br/   本月,大家有机会跟这三位资深的专家学者面对面,探寻质谱在分析领域有何最新进展,快速提升自己现有谱图解析水平,从掌握到精通... br/ br/ br/ br/ 第15期有机质谱谱图解析应用技术培训班即将开始~ br/ br/ & nbsp br/ 会议安排 br/ br/   会议时间:2016-11-29至2016-12-2(4天)会议地点:北京外国专家大厦(华严北里8号院外国专家大厦(北四环))适用对象: & nbsp 使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员。 br/ br/ & nbsp br/ 您能学到什么 br/ br/   1、本课程将有机质谱繁杂的裂解规律归纳提炼为简要、易学、易记的六大裂解类型 br/ br/   2、课程将讲解如何使用专属应用软件或手工计算的方式,计算未知物的元素组成 br/ br/   3、本课程将介绍若干免费网站,进一步查找特定元素组成可能的对应结构 br/ br/   4、本课程将以实例讲解偶电子离子的裂解规律,应用于ESI源(CID谱) br/ br/   5、本课程将讲解合理的中性碎片及氮规则等谱图解析中的核心原理,以识别分子离子峰 br/ br/   除此之外,你不懂的或者工作当中遇到的问题都可以带到课堂上来,授课专家会为您一一解答指导! br/ br/ br/ 课程内容 br/ br/   一、谱图解析基础知识1、原子中电子的排布2、奇电子离子与偶电子离子3、氮规则4、环加双键值5、同位素峰6、单分子反应 br/ br/   二、离子的丰度1、质荷比与离子丰度包含的结构信息2、影响碎片离子丰度的基本因素 br/ br/   三、离子碎裂的基本机理1、断裂2、环的开裂3、重排反应4、置换反应5、消除反应 br/ br/   四、常见有机化合物的质谱图特征1、碳氢化合物2、醇、酮、醛、酸、酯、醚3、胺类、酰胺类, 氨基酸,硝基化合物,腈基化合物4、卤代物5、多官能团化合物 br/ br/   五、由质谱图推测分子结构1、基本方法及思路2、实例练习 br/ br/   六、NIST谱图库检索实用技术1、NIST谱图库简介2、NIST谱图库主要功能3、NIST谱图库检索实例注:学员可自带原始数据采集文件,讲师可采用学员的文件作为案例进行分析) br/ br/ br/ 报名咨询 br/ br/   联系人:李老师& nbsp & nbsp & nbsp 座机:010-51654077-8119& nbsp 电话:15910410867邮箱: a href=" mailto:liru@instrument.com.cn" liru@instrument.com.cn /a /p
  • 岛津推出玉米赤霉醇及其杂质的离子阱-飞行时间串联质谱定性方法
    玉米赤霉醇是略带雌激素活性的合成激素,有催生长、提高瘦肉率的药物特性,作为家畜增重的外源激素,效果良好,但对人体生殖系统的形成和血浆中的甲状腺素水平有影响。家畜组织中玉米赤霉醇残留量一般为&mu g/kg水平,尽管极微量,但它仍对人体有潜在的危害。目前,许多国家对玉米赤霉醇用作动物促蛋白合成激素有严格控制,甚至禁止使用。我国农业部第235号公告明确规定玉米赤霉醇禁止用于所有食用动物,所有可食动物尿液。 &alpha -玉米赤霉醇结构式如图1所示。 图1:&alpha -玉米赤霉醇结构图 本文在研究&alpha ‐玉米赤霉醇(&alpha ‐zearalanol)标准物质时,采用高效液相色谱/离子阱-飞行时间/串联质谱仪(HPLC‐IT‐TOF MS)对其中杂质进行定性鉴定。高效液相色谱/离子阱-飞行时间/串联质谱仪是将高效液相色谱和离子阱质谱仪(IONS TRAP)以及飞行时间质谱仪(TOF MS)串联起来,使其在准确质量数和灵敏度方面较之其它多级质谱有较大提高,仪器具备高分辨率性能,能够准确提供分子和碎片离子的结构信息。由HPLC‐IT‐TOF MS 得到杂质的多级谱,对碎片裂解规律进行了探索,利用TOF较高的质量准确度,推测了杂质的可能结构,并用标准品对方法进行验证,结果表明,高效液相色谱/离子阱-飞行时间/串联质谱方法对杂质定性分析是很有效的。 有关玉米赤霉醇及其杂质的离子阱-飞行时间串联质谱定性方法的详细内容请参见http://www.instrument.com.cn/netshow/SH100277/down_171768.htm。 岛津高效液相色谱‐离子阱‐飞行时间质谱LCMS‐IT‐TOF LCMS-IT-TOF是岛津公司的高端质谱仪,该仪器曾于2005年3月获得了全球著名分析仪器匹兹堡展会的银奖,这是该年度质谱仪整机产品得到的最高奖。而后,又获得了国际权威的分析仪器杂志R&D的2006年新产品大奖。 关于岛津 岛津国际贸易(上海)有限公司是(株)岛津制作所为扩大中国事业的规模,于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司。 目前,岛津国际贸易(上海)有限公司在中国全境拥有12个分公司,事业规模正在不断扩大。其下设有北京、上海、广州分析中心;覆盖全国30个省的销售代理商网络;60多个技术服务站,构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。 岛津作为全球化的生产基地,已构筑起了不仅面向中国客户,同时也面向全世界的产品生产、供应体系,并力图构建起一个符合中国市场要求的产品生产体制。 以&ldquo 为了人类和地球的健康&rdquo 为目标,岛津人将始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务。 更多信息请关注岛津公司网站www.shimadzu.com.cn。
  • 《质谱分析方法通则》国家标准正式发布
    p   近日,国家标准化管理委员会在2020年第4号中国国家标准公告中发布了《质谱分析方法通则》(GB/T 6041—2020)。该标准将代替GBT 6041—1985、GBT6041—2002。新标准将在2021年2月1日实施。 /p p   该标准由中国石油和化学工业联合会提出。归口全国化学标准化技术委员会。起草单位有:中国石油化工股份有限公司北京化工研究院、上海市计量测试技术研究院、广州中科检测技术服务有限公司、复旦大学以及衢州氟硅技术研究院。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 360px height: 252px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/8607a3c4-a493-48c5-8440-c90cf4e8fa17.jpg" title=" GBT 6041-2020.jpg" alt=" GBT 6041-2020.jpg" width=" 360" vspace=" 0" height=" 252" border=" 0" / /p p    strong 新版本中的变化主要有: /strong /p p    span style=" text-decoration: none " (1) span style=" text-decoration: none color: rgb(255, 0, 0) " 关于定性分析 /span :增加相关描述和术语解释,如“质荷比”“质量准确性” 增加了定性分析的“样品分析”“数据分析”和“结果报告”等项目。 /span /p p span style=" text-decoration: none "   (2) span style=" text-decoration: none color: rgb(255, 0, 0) " 关于定量分析 /span :增加了术语解释,如“质量范围”“提取离子色谱图” 增加了定量分析的“结果报告”项目。 /span /p p span style=" text-decoration: none "   (3) span style=" text-decoration: none color: rgb(255, 0, 0) " 增加了新设备的标准 /span :扩散进样系统等进样器,ESI、APCI、MALDI、ICP、STI等离子源,离子透镜以及TOF、3D/linear ion trap、Orbitrap等质量分析器。 /span /p p   质谱(Mass Spectrometry, MS)是一种测量未知化合物质量的方法,是纯物质鉴定的有力工具。与色谱联用,可以检测不同组分的物质 与光谱、NMR联用,可以推测出化合物的具体结构。广泛应用于科学研究,化工产业,医学检验以及药物分析等领域。 /p p   详细文件请点击 a href=" https://www.instrument.com.cn/download/shtml/948710.shtml" target=" _self" 【此处链接】 /a /p p br/ /p
  • 使用共价标记质谱区分组氨酸互变异构体
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Anal Chem.上的文章,Distinguishing Histidine Tautomers in Proteins Using Covalent Labeling-Mass Spectrometry [1]。该文章的通讯作者是来自马萨诸塞大学阿默斯特分校的Richard W. Vachet教授。组氨酸是人体蛋白质结构中的重要组成氨基酸,研究发现,组氨酸具有Nδ-H和Nε-H两种互变异构体,通过两种互变异构体的转换,可以在蛋白质中介导质子转移。目前常使用2D NMR技术进行区分,但操作相对繁复。共价标记质谱是一种研究蛋白质结构的有力方法,具有操作简单,灵敏度高,结构分辨率高等优点。在本文中,作者尝试以焦碳酸二乙酯(DEPC)为标记试剂,采用共价标记质谱区分组氨酸互变异构体。组氨酸侧链的咪唑上具有两个氮原子,其中一个氮上的孤电子对参与芳香环π键的组成,而另一个氮原子仍保留孤对电子,更容易与DEPC等亲电子试剂反应。而组氨酸的两个互变异构体中都只有一个保留孤对电子的氮原子,且该氮原子位置不同,Nδ-H互变异构体中的Nε2与DEPC反应,而Nε-H互变异构体中的为Nδ1。因此以DEPC标记组氨酸以区分两个互变异构体的方法是可行的(图1)。图1. DEPC 结构及其与两种不同组氨酸互变异构体的反应 为了测试DEPC 标记区分两种互变异构体的能力,作者以几种含组氨酸的肽,在确保DEPC仅标记组氨酸条件下进行实验。以Fmoc-DGHGG-NH2为例子,该肽在N端包括一个Fmoc基团以确保仅标记组氨酸。采用等度洗脱来最大限度地利用LC分离两种异构体,并确保流动相组成不影响肽段电离效率,从而可以更好地量化每个互变异构体的比率。结果发现,在11.4和13.6分钟洗脱的峰具有相同的m/z值(图2)。根据串联MS数据,发现这两个峰代表着组氨酸上成功标记DEPC的单一物质(图3)。并且,这些同量异位离子的串联质谱不同,表明这两种物质为带有不同组氨酸互变异构体的物质。作者将先洗脱出的物质命名为修饰物质1,后洗脱出的为修饰物质2。根据MS/MS数据,两者的主要区别为修饰物质2具有更加丰富的羧基化a3离子(a3*)。图2. 未标记(蓝色迹线)和 DEPC 标记(红色迹线)肽 Fmoc-DGHGG-NH 2的提取离子色谱图。DEPC浓度比肽浓度高10倍,反应1分钟图3. 两种修饰的His异构体的串联质谱。(a)来自图2中的色谱图的修饰物质 1 的串联质谱。(b)来自图2中的色谱图的修饰物质2的串联质谱。标有星号 (*) 的产物离子包含羧基化产物此外,在重复实验中,作者发现物质2与物质1的丰度比为3.9± 0.2。而研究发现,在中性pH条件下,游离氨基酸Nε-H 互变异构体与 Nδ-H 互变异构体的比接近于4:1。因此,两物质的峰面积比表明物质1可能为 Nδ-H 互变异构体,而物质2可能为 Nε-H 互变异构体。结合以上发现,并考虑肽解离途径等因素,作者对两物质质谱图谱差异做出推测。当物质2为Nε-H互变异构体侧链时,DEPC 标记在Nδ1上,有利于肽通过bx-yz途径解离,随后通过bx-ax途径损失CO,因此物质2富含a3*离子。当物质1为Nδ-H 互变异构体时,DEPC 标记在Nε2上,肽通过组氨酸途径解离,并形成了稳定五元环,因此优先形成更稳定的b3*离子(图4)。以上发现进一步证明了Fmoc-DGHGG-NH2中物质1为 Nδ-H 互变异构体,物质2为 Nε-H 互变异构体。根据丰度比以及肽解离途径不同,作者在其他模型肽标记实验中也成功区分两互变异构体。由于组氨酸的pKa在一定程度上会影响互变异构体的比例,因此两互变异构体的丰度比可能会略有变化。总之,以上结果表明,DEPC共价标记质谱可以识别两个组氨酸互变异构体。图4. DEPC 标记的含组氨酸肽 CID 过程中两种异构体的肽片段化途径。左侧通路为物质1(Nδ-H互变异构体),右侧通路为物质2(Nε-H互变异构体)之后,作者还进一步研究了不同DEPC浓度对实验的影响。结果发现,在 DEPC 浓度范围超过一个数量级时,Fmoc-DGHGG-NH2的两种修饰形式的比率基本在4左右保持恒定,其他模型肽的比率略有不同(图5),但随着 DEPC 浓度的增加,给定肽的标记比率保持不变。在质谱可以确认互变异构体结构的肽中,Nε-H互变异构体总是丰度相对更高,洗脱相对较晚。此外,作者发现当组氨酸不是位于N末端残基时,Nε-H 互变异构体的an */bn *比率总是比Nδ -H 互变异构体的更高。但是,若组氨酸残基位于肽的N末端时,在质谱中观察不到b1和a1离子,将对结果造成影响。图 5. 在 DEPC 浓度增加时选择肽的两种修饰形式的标记比率。(a) Fmoc-DGHGG-NH2;(b) Ac-IQVYSRHPAENGK(Ac);(c) Ac-VEADIAGHGQEVLIR;(d) Ac-LFTGHPETLEK(Ac)。MS/MS 用于通过测量an /bn离子的比率来确认每个互变异构体总而言之,作者成功使用DEPC共价标记质谱区分肽与蛋白质中的组氨酸互变异构体,利用丰度比与洗脱时间,以及CID期间的肽解离模式,区分两种互变异构体。利用该方法,作者团队已经确定了几种蛋白质组氨酸互变异构体比率,并且相对于2D NMR方法,该方法更简单、更快、更精确,有利于探索蛋白质中组氨酸残基周围的局部结构,提供高分辨率的结构信息。[1]Pan X, Kirsch ZJ, Vachet RW. Distinguishing Histidine Tautomers in Proteins Using Covalent Labeling-Mass Spectrometry. Anal Chem. 2022 Jan 18 94(2):1003-1010.
  • 第16期(2017年)有机质谱谱图解析应用技术培训班邀请函
    p & nbsp & nbsp   信立方培训中心(仪器信息网旗下培训中心)致力于质谱应用技术培训工作。为提高相关从业人员的技术水平,使质谱更好地为科研、生产工作服务,适应当前从事质谱应用技术科技人员的迫切需求,自2009 年起,先后开设了近四十期不同类型和层次的质谱技术培训班,受到广大学员欢迎和好评。 br/   近年来,质谱技术在我国快速发展,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各领域,成为日常工作中非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析基于对质谱谱图的解析。但因有机化合物种类繁多,裂解规律繁杂不易掌握,在缺乏谱图解析思路和方法的情况下,许多分析人员在拿到谱图后常感到无从下手。应广大分析工作者需求,信立方培训中心将于2017年5月16日-19日在北京举办第十六期有机质谱谱图解析应用技术培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员报名。 br/ br/ strong   招生对象: /strong br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 各企事业单位、科研院所从事食品卫生、检验检测、石油化工、环境监测、制药等行业负责分析测试的技术人员,以及各大专院校相关专业在校研究生、分析中心专业技术人员。 br/ br/ strong   学习目标: /strong br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 系统掌握有机质谱谱图解析方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,结合实例讲解谱图解析的思路和方法,为有机质谱定性分析打下坚实基础。 br/ strong br/   课程内容: br/ /strong strong   一、谱图解析基础知识 br/ /strong   1、原子中电子的排布 br/   2、奇电子离子与偶电子离子 br/   3、氮规则 br/   4、环加双键值 br/   5、同位素峰 br/   6、单分子反应 br/ strong   二、离子的丰度 /strong br/   1、质荷比与离子丰度包含的结构信息 br/   2、影响碎片离子丰度的基本因素 br/   strong  三、离子碎裂的基本机理 /strong br/   1、断裂 br/   2、环的开裂 br/   3、重排反应 br/   4、置换反应 br/   5、消除反应 br/   strong  四、常见有机化合物的裂解及质谱图特征 /strong br/   1、碳氢化合物 br/   2、醇、酮、醛、酸、酯、醚 br/   3、胺类、酰胺类、氨基酸、硝基化合物、腈基化合物 br/   4、卤代物 br/   5、多官能团化合物 br/ strong   五、由质谱图推测分子结构 /strong br/   1、基本方法及思路 br/   2、实例练习 br/   六、NIST谱图库检索实用技术 br/   1、NIST谱图库简介 br/   2、NIST谱图库主要功能 br/   3、NIST谱图库检索实例 br/ strong br/   授课专家: /strong br/ strong   1、王光辉 /strong 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》; br/ strong   2、苏焕华 /strong 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》; br/ strong   3、李重九 /strong 中国农业大学理学院应用化学系教授,农残分析领域著名质谱专家,在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作《有机质谱应用:在环境、农业和法庭科学中的应用》 br/ br/    strong 举办时间/地点: /strong br/   2017年05月16日-19日 北京-外国专家大厦 br/ strong br/   培训费用: /strong br/   每人3800元,2人以上组团报名可每人优惠100元(含报名费、培训费、资料费、培训期间每日午餐费用) br/ br/ strong   报名咨询: /strong br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 联系人:李老师 br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 电话:010-51654077-8119& nbsp & nbsp & nbsp br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 手机:15910410867& nbsp br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 邮箱:liru@instrument.com.cn /p
  • 双特异性抗体解析新方法:离子迁移质谱结合碰撞诱导去折叠
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章,Ion Mobility-Mass Spectrometry and Collision-Induced Unfolding of Designed Bispecific Antibody Therapeutics1,文章的通讯作者是密歇根大学的Brandon副教授。  双特异性抗体(bispecific antibodies, bsAbs)是一类重要的新兴疗法,能够同时靶向两种不同的抗原,已被开发作为对某些单克隆抗体疗效有限疾病的治疗手段。尽管bsAbs具有独特的优势,但它的结构较为复杂,需要特殊的制备工艺,“knobs-into-holes”(KiH)是其中一种可以用于制备bsAbs的技术,这种技术通过将knob链CH3结构域表面的特定氨基酸突变为较大氨基酸,将hole链上的突变为较小氨基酸,从而实现“knobs-into-holes”的配对形式,提高不同轻重链在配对时的正确配对率,产生正确的bsAbs。然而,由于抗体治疗药物分子量较大,通常比传统的小分子药物表现出更大的结构复杂性和异质性,对KiH bsAb 高级结构的完整表征对定义bsAb的结构功能关系,以及确保最终治疗的稳定性、有效性和安全性都至关重要。目前已开发的分析方法有很多,但是普遍存在样品消耗量大、数据采集和解析时间较长等缺点。近年来,非变性离子迁移质谱(ion mobility-mass spectrometry, IM-MS)和碰撞诱导去折叠(collision-induced unfolding,CIU)逐渐被证实是用于分析单克隆抗体高级结构的有效方法,能够从存在结构异质性和杂质的几微克样品中表征单抗治疗药物的高级结构。IM可以根据气相蛋白离子的电荷和旋转平均碰撞截面(collision cross sections,CCSs)在毫秒时间尺度上对蛋白进行分离。当与质谱耦合时,可以很容易地将质荷比相同但CCS不同的离子区分开来,而CIU可以使IM-MS同步提供蛋白质结构和构象稳定性信息。CIU根据二硫键、糖基化水平、结构域交换特性等信息来区分差异。  在这篇文章中,作者描述了定量CIU在bsAbs中的首次应用,扩展了非变性IM-MS和CIU的能力,用于稳定表征KiH bsAb及其亲本knob和hole同型二聚体单抗的高级结构。  图1 Native、未修饰的knob(蓝色)和hole(橙色)同型二聚体,以及KiH bsAb异型二聚体(绿色)的CIU实验。(A)24+电荷态(左)及其相应重复RMSD基线(右)的平均CIU指纹图谱(n=3)。所有的指纹图谱都显示了白色虚线框所示的三个主要特征。在(B) 5 V、(C) 65 V、(D) 110 V时的标准化TWCCSN2分布。在较低的激活电位下,所有抗体均具有相似的CCS,在较高的加速电位下则存在显著差异。(E)两两的RMSD分析显示,与重复的RMSD基线(虚线)相比,抗体之间的整体高级结构差异。(F)CIU50分析说明了KiH bsAb模型的稳定性如何保持在knob和hole的同型二聚体之间。  如图1所示,bsAb的稳定性似乎与本文研究的KiH模型的两个亲本同型二聚体单克隆抗体相关。在电压为65V时,KiH bsAb的TWCCSN2分布与亲本knob同型二聚体单抗的分布相似 而在110V时,则与亲本hole同型二聚体单抗的分布相似。并且KiH bsAb的稳定性介于两种亲本同型二聚体单抗的稳定性之间。与指纹图谱中记录的第一次CIU转换相对应的是CIU50-1值,第二次的则是CIU50-2值,从3组样本的数据分析推测,CIU50-1和CIU50-2很可能代表了KiH bsAb和mAb结构中不同结构域的局部稳定性。  图2 knob和hole的半体CIU数据。(A)16+电荷态的平均CIU指纹图谱(n=3).(B)两两RMSD分析显示,半体之间的高级结构存在显著差异。(C)CIU50分析显示,蛋白质稳定性存在显著差异。  为了更好地展示KiH bsAb不同结构域的CIU特征,作者记录了同型二聚体单抗IM-MS光谱中16+电荷态的knob和hole半体的CIU数据。从图2A的指纹图谱可以看出,每种结构都包含4种主要的CIU特征,但是图2B的RMSD分析显示两种半体的高级结构之间存在显著差异。CIU50分析进一步表明,在观察到的两次展开过渡中,knob半体明显比hole半体更稳定。作者推测造成这种CIU主要差距的原因可能是Fab结构域的差异。  图3 Fab和Fc片段的CIU数据。(A)13+电荷态的平均CIU指纹图谱(n=3).(B)两两RMSD分析显示,knob和hole的Fab片段之间存在显著差异。(C)CIU50分析显示,不同片段之间稳定性存在显著差异。  为了进一步将CIU特征联系到KiH bsAb的结构域当中,作者对木瓜蛋白酶消化后产生的Fab和Fc片段进行了CIU分析。从图3A可以看出,knob和hole的Fab片段都具有3种CIU特征,但是嵌合的Fc片段则具有4种CIU特征。尽管knob和hole的Fab片段具有相似的CIU指纹图谱,但是RMSD分析显示它们之间的高级结构仍然存在较大差异,并且knob的Fab片段稳定性明显高于hole的。至于Fc片段的稳定性则远高于两种Fab片段,可能的原因是重链CH3结构域的强非共价作用以及knobs-into-holes配对的影响。  图4 去糖基化后的knob、hole同型二聚体和KiH bsAb异型二聚体24+离子(n=3)。(A)比较对照组和去糖基化抗体的RMSD分析显示,高级结构有显著差异。CIU50-1(B)和CIU50-2(C)分析显示抗体去糖基化后表现出显著的不稳定性。(D)对照组和去糖基化抗体之间的CIU50值差异图。  先前的研究已经证明,CIU对不同水平的单抗糖基化很敏感,其中去糖基化会导致单抗高级结构的不稳定。作者利用高分辨率非变性轨道阱质谱分辨添加PNGaseF前后同型二聚体mAb和KiH bsAb糖型的变化。实验结果显示,KiH bsAb表现出高度糖异质性,包含至少12种不同的糖型。这很可能归因于组装的KiH bsAb中每个独立的knob和hole重链上存在独特的糖基化,进一步增加了其复杂性。  总而言之,这篇文章展示了IM-MS结合CIU用于建立KiH bsAb及其亲本同型二聚体之间高级结构联系的能力。单独的CCS不足以解决此研究中抗体之间细微的高级结构差异。相比之下,CIU指纹图谱则可以分辨和区分每一个等截面的抗体。这一解释bsAb CIU细节的能力,加上对KiH bsAb稳定性的更深入理解,有可能提供支持KiH bsAb发现和发展的关键信息。  撰稿:梁梓欣  编辑:李惠琳  文章引用:Ion Mobility-Mass Spectrometry and Collision-Induced Unfolding of Designed Bispecific Antibody Therapeutics  李惠琳课题组网址www.x-mol.com/groups/li_huilin  参考文献  Villafuerte-Vega, R. C., Li, H. W., Slaney, T. R., Chennamsetty, N., Chen, G., Tao, L., & Ruotolo, B. T. (2023). Ion Mobility-Mass Spectrometry and Collision-Induced Unfolding of Designed Bispecific Antibody Therapeutics. Analytical Chemistry.
  • ​整合结构质谱法和计算模拟法探究糖原磷酸化酶中磷酸化介导的蛋白变构调控和构象动态性
    大家好,本周为大家介绍一篇本课题组发表在ACS Chem. Biol.上的文章,Insights into Phosphorylation-Induced Protein Allostery and Conformational Dynamics of Glycogen Phosphorylase via Integrative Structural Mass Spectrometry and In Silico Modeling1。变构调节在自然界中广泛存在,可以用于调控细胞过程。糖原磷酸化酶(GP)是第一个被鉴定出的与变构调节相关的磷酸化蛋白。GP是一个分子量约196kD的同源二聚体蛋白,是糖代谢中重要的组分,也是2型糖尿病及癌症的靶点。AMP结合以及Ser14的磷酸化介导了GP的变构调节,使其构象从非活化的T-state GPb(未磷酸化状态)转变为活化的R-state GPa(磷酸化状态)。即使目前X-射线晶体学法解析出了GP的原子级蛋白结构,但受限于较大分子量,其结构动态性的检测较为困难,因此与GP变构调节相关的结构动态变化过程仍较为模糊。核磁共振(NMR)谱及分子动力学(MD)模拟等是探究蛋白质结构动态性的常用方法,但NMR分析存在分子量上限,且样品消耗量大,MD模拟的时间尺度和力场准确度有限。质谱(MS)法具有快速、灵敏的特点,是蛋白质结构、动态性以及构象变化分析中强有力的一款技术。氢氘交换质谱(HDX-MS)通过监测蛋白骨架酰胺氢原子与溶液中氘的交换来反映蛋白质构象动态性,因此适用于探究由配体、蛋白结合或共价修饰引起的蛋白质构象变化。同时,多个软件实现了由HDX-MS数据计算保护因子(PFs)和吉布斯自由能,从而提取残基水平的蛋白动态性信息。此外,在先前的工作中2, 3,我们整合了native MS和top-down方法(native top-down,nTD-MS技术),成功实现了多个蛋白复合物的一级序列到高阶结构等多方面信息的检测(包括测序、翻译后修饰、配体结合、结构稳定性、朝向等)。整合多种结构质谱法(整合结构质谱法)可以有效填补传统生物物理法中结构到动态性联系中的空缺,更好地表征变构调控现象。本文整合了HDX-MS、nTD-MS、PF分析、MD模拟以及变构信号分析检测了磷酸化介导的GP变构调控的结构和动态性基础,为GP的变构调控过程提供了见解。根据X-射线晶体学结构报道(图1a),T-state GPb转变为R-state GPa时,二聚体界面中N-末端尾部、α2、cap’(图1b)以及tower-tower helices区(图1c)发生了明显的结构重排,导致催化位点开放,从而底物磷酸吡哆醛(PLP)可以结合。尽管有晶体学报道,但与变构调控关联的构象动态性仍有待探寻。图1.(a)磷酸化介导T-state GPb(PDB:8GPB)向R-state GPa(PDB:1GPA)的构象转变;亚基相互作用界面:(b)C端区域和(c)tower-tower helices,GPb为蓝色,GPa为绿色。首先我们通过nTD-MS进行了检测。如图2a、b,谱图中观察到了GPb的单体和二聚体信号,其中二聚体为主要形式;GPa除了单体和二聚体外,谱图中还存在少量四聚体,但仍以二聚体为主要形式。当增加sampling cone(SC)电压时,GPb、GPa保留了其二聚体形式(图2c、d)。随后我们选择离子(29+)并在trap池中进行了碎裂(图2e、f、g、h),谱图低质荷比区GPa的碎片相对峰强度较GPb高,说明GP的二聚体互作界面较为稳定,且GPb亚基结构较GPa稳定。nTD-MS不仅能够探究GPb、GPa的结构差异,也能够为接下来的HDX-MS实验做好前期样品质量检查工作。图2.不同活化条件下GPb、GPa的nTD-MS谱图。(a、b)SC=40V;(c、d)SC=150V;(e、f)SC=150V、trap=100eV;(g,h)SC=150V、trap=200eV。左侧为GPb,右侧为GPa。随后我们进行了HDX-MS实验。图3a中展示了五个时间点的HDX heat map。图3b为通过PyHDX软件计算产生的PF值。其中N-端(1-22)以及tower helix前的loop区域(256-261)的氘代值较高、PF值较低,说明这些区域较为柔性或是结构较为无序。此外我们发现,tower-tower helices(262-276)区域的氘代值较低、PF值较高,表明helices的旋转可能是由前端可塑性铰链区触发的,而非helices本身的变形和重塑引起的,这些发现在晶体结构数据中均有吻合之处。除这两个区域外,GPa和GPb基本保持了稳定的整体结构。而从1μs原子级MD模拟计算得到的均方根波动(RMSF)和溶剂可及表面(SASA)中我们也发现(图3c),这两个区域数据与HDX-MS信息有所吻合,但MD模拟中部分区域未和HDX-MS相吻合的区域可能跟序列覆盖不足相关。图3. (a、d)GPb和GPa在不同标记时间下的氘代热图并映射到结构中(PDB: 1GPA)。(b、e)基于HDX-MS数据计算得到的PF值并映射到晶体结构中。(c、f)MD模拟中RMSF和SASA值并映射到结构中。从氘代差异图(图4a)中可以看出,4个区域呈氘代降低趋势(红色方框),多个区域呈氘代上升趋势(蓝色方框)(GPa-GPb)。而PF差的变化趋势与氘代变化趋势基本一致(图4b)。由数据可知,N-端和tower-tower helices的变化说明磷酸化介导的变构稳定了这两个区域,α1-cap-α2区域的动态性轻微下降。除此之外多个区域(尤其是tower-tower helices序列后的区域)均表现为PF值下降,说明相比于GPb,GPa催化位点附近的区域动态性增强了。接下来我们根据HDX kinetic plot特征将其进行了分类,并详细讨论了所属区域的变化。图4.(a)GPa-GPb HDX-MS的氘代差异图。(b)GPb到GPa PF的变化。 首先是N-端和C-端的变化(图5)。N-端残基1-22表现氘代下降,这说明N-端具有一定可塑性。受N-端区域磷酸化和结构变化影响,C-端区域也产生了一定的变化。此外,残基30-50(cap区)和残基111-117(α4back-loop)区表现氘代下降,而103-109(α4front)表现氘代上升。根据晶体结构推测,cap区和α4back-loop的氘代变化受N-末端变化影响,原有的残基相互作用被打破,形成新的残基间相互作用,同时这两个区域也经历了结构重排,因此表现出较明显的氘代变化。残基88-99(β2-α3)和残基125-141(β3-L-α6)氘代上升。总的来说,磷酸化使得cap′/α2界面互作增强了,同时磷酸化基团和精氨酸残基的静电相互作用是cap区产生变化的主要原因,而α1和α2起到锚定作用,其相对位置基本保持不变。图5.GPb(a)和GPa(b)的N-端和C-端区域的局部结构和HDX动力学曲线(c)。 此外,tower-tower helices(α7,残基262-278)区的变化同样值得关注(图6)。250s loop是表面暴露区域,未与其他区域发生接触,其氘代下降可能是因为自身结构的收缩。而肽段262-267和268-274氘代下降提示该区域可能发生了低周转率或强互作的结合反应。280s loop区氘代值上升。这些变化均说明,tower-tower helix的角度的改变不仅影响了二聚体界面结构,而且还影响了其靠近催化位点的周围区域。因此我们结合晶体结构推测,磷酸化和N-端相对位置的改变,使250s loop自身结构收缩,从而打破了Tyr262' -Pro281和Tyr262-Tyr280′之间的相互作用,导致两个亚基的tower helices发生相对滑动,倾斜角度增加。图6.GPb(a)和GPa(b)tower helix区域的局部结构和HDX动力学曲线(c)。 最后是催化位点、PLP结合位点和糖原存储位点的变化情况(图7)。催化位点周围多数区域均表现氘代上升趋势。我们推测,随着Pro281、Ile165和Asn133间的相互作用被打破,Arg569与Ile165、Pro281、Asn133间的互作也随之打破,因此催化位点和PLP结合位点周围的残基溶剂可及性上升,局部区域结构变得更为灵活,催化位点开放并转变为活化构象。糖原储存位点位于GP表面,距离催化位点30Å,除了α23(残基699−708)外,HDX-MS在糖原存储区没有观察到明显的变化。图7.GPb(a)和GPa(b)的催化位点和PLP(橙色)结合位点的局部结构和HDX动力学曲线(c)。结合以上所有数据,我们对磷酸化调节的动态机制进行了推测(流程图1)。磷酸化后,N-端尾部残基与acidic patch的互作被打破,也导致N-端尾部的有序化以及C-端尾部的无序化以及伴随的其他结构变化。通过在pSer14和Arg69和Arg43′之间形成新的盐桥,N-端残基被重定位,随之带来的是Asp838和His36′间的盐桥断裂。随着三级和四级结构的转变,250s loop收缩并发挥类似“门环”的作用,当其收缩时,Tyr262′-Pro281与Tyr262-Tyr280′之间的相互作用、276-279区与162-164区之间的氢键也被打破,导致tower helix发生相对滑动,tower-tower helices之间的作用被打破,同时将结构变化传递到催化位点。最后,280s loop和催化位点以及PLP结合位点附近的残基松动,通往催化位点和底物磷酸盐识别位点的通道打开,酶得以活化。流程图1.GP变构调节过程中,被打破(蓝色)或新形成的(红色)关键残基相互作用。 本文整合nTD-MS、HDX-MS、PF分析和MD模拟检测了GP磷酸化变构调节过程的结构和动态基础,通过该整合结构手段揭示了GP构象柔性、局部动态性以及长程变构调控构象变化中值得关注的信息。各个方法具有各自的优势,但也在一定层面存在局限,我们期待将HDX-MS信息与计算模拟信息进行更深度的整合以实现二者对蛋白质结构更精确的分析。撰稿:罗宇翔编辑:李惠琳原文:Insights into Phosphorylation-Induced Protein Allostery and Conformational Dynamics of Glycogen Phosphorylase via Integrative Structural Mass Spectrometry and In Silico Modeling李惠琳课题组网址:https://www.x-mol.com/groups/li_huilin参考文献1. Huang, J. Chu, X. Luo, Y. Wang, Y. Zhang, Y. Zhang, Y. Li, H., Insights into Phosphorylation-Induced Protein Allostery and Conformational Dynamics ofGlycogen Phosphorylase via Integrative Structural Mass Spectrometry and In Silico Modeling. ACS Chem. Biol. 2022.2. Li, H. Nguyen, H. H. Ogorzalek Loo, R. R. Campuzano, I. D. G. Loo, J. A., An integrated native mass spectrometry and top-down proteomics method that connects sequence to structure and function of macromolecular complexes. Nat. Chem. 2018, 10 (2), 139-148.3. Li, H. Wongkongkathep, P. Van Orden, S. L. Ogorzalek Loo, R. R. Loo, J. A., Revealing ligand binding sites and quantifying subunit variants of noncovalent protein complexes in a single native top-down FTICR MS experiment. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2014, 25 (12), 2060-8.
  • 中科院深圳先进院司同课题组开发无标记质谱筛选,赋能新酶活定向进化
    近日,中国科学院深圳先进技术研究院司同课题组联合中国医学科学院杨兆勇课题组,在国际学术期刊 Chemical Science 在线发表了题为:Directed evolution of a cyclodipeptide synthase with new activities via label-free mass spectrometric screening 的研究论文。该研究依托深圳合成生物研究重大科技基础设施(简称为“合成生物大设施”),开发了无标记质谱筛选技术,应用于环二肽合酶的定向进化改造,快速得到了 F186L 突变体催化合成野生型天然酶无法产生的新二酮哌嗪分子。定向进化是酶工程的重要方法,需要开展反复多轮的突变文库构建和筛选。现有面向酶定向进化的高通量筛选方法,通常利用偶联反应、生物传感器等手段,将底物或产物浓度信息转化成光学、电化学等信号。开发筛选方法的过程不但费事费力,且通常需要使用衍生化、特殊标记底物等方法,不利于发现新的催化活性。另一方面,质谱分析基于离子的质荷比(m/z)对反应物进行定性与定量测定,具有更好的普适性。更为重要的是,基于无标记(label-free)原理,可以通过非靶向质谱方法识别新的酶促产物,从而发现对应的新催化活性。但质谱筛选的这一能力在酶定向进化中的应用还非常有限,主要限制因素是检测样品进入质谱仪之前通常需要经过耗时的样品制备和色谱分离步骤,限制了质谱筛选的通量该研究依托深圳合成生物大设施的机器人平台,针对酶突变文库构建和筛选过程中的不同环节,如分子克隆、微生物培养、产物乙酸乙酯萃取、MALDI-TOF 质谱分析、数据处理等,开发了对应的自动化流程和方法,实现了微生物发酵产物的无标记质谱筛选,通量为每样品5秒钟(图1)。图1:高通量、无标记质谱筛选用于酶新催化活性的定向进化研究文章以环二肽合酶(cyclodipeptide synthases, CDPSs)为研究对象,验证无标记质谱筛选在酶定向进化中的应用。环二肽合酶利用氨酰-tRNA底物可以合成二酮哌嗪(diketopiperazines, DKPs)骨架;含有这类骨架的天然产物可以通过肠屏障、血脑屏障,是重要的药物先导化合物。然而,基于蛋白质工程改造环二肽合酶的成功案例非常有限,部分原因在于缺乏高通量的产物分析方法,相关研究仅限于少数理性设计突变。研究团队以链霉菌(Streptomyces noursei)来源的 AlbC 作为研究模型,使用大肠杆菌底盘进行文库构建与筛选。重组表达野生型 AlbC 的大肠杆菌的主要环二肽产物为 cFL。作者首先利用半理性设计,选取底物结合口袋附近的10个位点及口袋外与 tRNA 密切作用的4个位点,构建和筛选了定点饱和突变(site-saturation mutagenesis,SSM),快速发现了多个产物谱发生明显变化的突变体。其中,有文献报道的8个突变体数据与本文实验结果相符,验证了方法的可行性与准确性;在此基础上,结合新的质谱筛选方法,本文首次对选取的14个位点的266个可能突变体中的238个进行了系统性表征,大大拓展了环二肽酶关键位点的突变效应数据。遗憾的是,从半理性设计文库中并未发现可以合成新产物的 AlbC 突变体。研究团队进一步利用易错 PCR 技术构建了 AlbC 随机突变文库,对4500个随机挑选的克隆开展无标记质谱分析,最终筛选得到3个突变体。与野生型相比,这3个突变体质谱谱图中出现了新的质荷比为247的离子峰,经高分辨质谱和二级质谱分析,新的产物鉴定为cFV,在表达野生型AlbC的菌株中未被检测到。并且,这3个突变体经 DNA 测序分析发现均只含有F186L单一突变(图2)。文章最后,作者利用分子动力模拟技术,对 F186L 突变效应的分子机制进行了推测。图2:无标记质谱方法筛选得到AlbC突变体生产新的环二肽产物cFV总的来说,该研究依托深圳合成生物大设施的机器人平台,开发了面向酶定向进化的无标记质谱筛选技术,在新催化活性发现这一工程目标方面进行了概念性验证。未来发展方向包括进一步提高筛选通量、扩大适用分子范围、对接不同类型质谱仪等。论文链接:https://doi.org/10.1039/D2SC01637K
  • 中科院深圳先进院司同团队等开发无标记质谱筛选,赋能新酶活定向进化
    近日,中国科学院深圳先进技术研究院司同课题组联合中国医学科学院杨兆勇课题组,在国际学术期刊 Chemical Science 在线发表了题为:Directed evolution of a cyclodipeptide synthase with new activities via label-free mass spectrometric screening 的研究论文。该研究依托深圳合成生物研究重大科技基础设施(简称为“合成生物大设施”),开发了无标记质谱筛选技术,应用于环二肽合酶的定向进化改造,快速得到了 F186L 突变体催化合成野生型天然酶无法产生的新二酮哌嗪分子。定向进化是酶工程的重要方法,需要开展反复多轮的突变文库构建和筛选。现有面向酶定向进化的高通量筛选方法,通常利用偶联反应、生物传感器等手段,将底物或产物浓度信息转化成光学、电化学等信号。开发筛选方法的过程不但费事费力,且通常需要使用衍生化、特殊标记底物等方法,不利于发现新的催化活性。另一方面,质谱分析基于离子的质荷比(m/z)对反应物进行定性与定量测定,具有更好的普适性。更为重要的是,基于无标记(label-free)原理,可以通过非靶向质谱方法识别新的酶促产物,从而发现对应的新催化活性。但质谱筛选的这一能力在酶定向进化中的应用还非常有限,主要限制因素是检测样品进入质谱仪之前通常需要经过耗时的样品制备和色谱分离步骤,限制了质谱筛选的通量。该研究依托深圳合成生物大设施的机器人平台,针对酶突变文库构建和筛选过程中的不同环节,如分子克隆、微生物培养、产物乙酸乙酯萃取、MALDI-TOF 质谱分析、数据处理等,开发了对应的自动化流程和方法,实现了微生物发酵产物的无标记质谱筛选,通量为每样品5秒钟(图1)。图1:高通量、无标记质谱筛选用于酶新催化活性的定向进化研究文章以环二肽合酶(cyclodipeptide synthases, CDPSs)为研究对象,验证无标记质谱筛选在酶定向进化中的应用。环二肽合酶利用氨酰-tRNA底物可以合成二酮哌嗪(diketopiperazines, DKPs)骨架;含有这类骨架的天然产物可以通过肠屏障、血脑屏障,是重要的药物先导化合物。然而,基于蛋白质工程改造环二肽合酶的成功案例非常有限,部分原因在于缺乏高通量的产物分析方法,相关研究仅限于少数理性设计突变。研究团队以链霉菌(Streptomyces noursei)来源的 AlbC 作为研究模型,使用大肠杆菌底盘进行文库构建与筛选。重组表达野生型 AlbC 的大肠杆菌的主要环二肽产物为 cFL。作者首先利用半理性设计,选取底物结合口袋附近的10个位点及口袋外与 tRNA 密切作用的4个位点,构建和筛选了定点饱和突变(site-saturation mutagenesis,SSM),快速发现了多个产物谱发生明显变化的突变体。其中,有文献报道的8个突变体数据与本文实验结果相符,验证了方法的可行性与准确性;在此基础上,结合新的质谱筛选方法,本文首次对选取的14个位点的266个可能突变体中的238个进行了系统性表征,大大拓展了环二肽酶关键位点的突变效应数据。遗憾的是,从半理性设计文库中并未发现可以合成新产物的 AlbC 突变体。研究团队进一步利用易错 PCR 技术构建了 AlbC 随机突变文库,对4500个随机挑选的克隆开展无标记质谱分析,最终筛选得到3个突变体。与野生型相比,这3个突变体质谱谱图中出现了新的质荷比为247的离子峰,经高分辨质谱和二级质谱分析,新的产物鉴定为cFV,在表达野生型AlbC的菌株中未被检测到。并且,这3个突变体经 DNA 测序分析发现均只含有F186L单一突变(图2)。文章最后,作者利用分子动力模拟技术,对 F186L 突变效应的分子机制进行了推测。图2:无标记质谱方法筛选得到AlbC突变体生产新的环二肽产物cFV总的来说,该研究依托深圳合成生物大设施的机器人平台,开发了面向酶定向进化的无标记质谱筛选技术,在新催化活性发现这一工程目标方面进行了概念性验证。未来发展方向包括进一步提高筛选通量、扩大适用分子范围、对接不同类型质谱仪等。
  • ESI Q-TOF质谱分析PEG化蛋白药物方法简介
    贾伟 沃特世科技(上海)有限公司实验中心 PEG修饰蛋白及多肽类药物后,可在不产生毒性、不损害药效的情况下,通过增加蛋白类药物的溶解性、减少免疫原性、增加稳定性、延长体内药物半衰期等功效增强大分子药物的疗效。PEG的这种功效在1970年代后期被发现,到了1990年PEG化修饰的Adagen被美国FDA批准,至今已有若干个PEG修饰的大分子药物上市销售,这些药物在癌症、肝炎、痛风、糖尿病等疾病治疗中为患者带来了福音。 明确PEG修饰位点、确定修饰位点的数量、以及表征PEG的聚合度分布性是PEG化大分子药物运用于临床前以及药品质量监控必须且非常重要的工作。由于PEG的高分子聚合物性质,由PEG修饰后的蛋白及多肽的结构变得极为复杂。在早期对其进行质谱分析,特别是对PEG的聚合度分布性分析方面,多使用MALDI离子源类型的质谱。这是因为MALDI源离子化的样品,所带电荷数较少(单电荷离子居多),因此其质谱图相对简单;而通过ESI源离子化的样品将携带多个电荷,这使离子信号复杂,致使其质谱图谱较难解析。随着LC-ESI技术的发展, 美国Indiana大学的Lihua Huang等学者通过在色谱分析柱后加胺的技术,使样品的ESI离子化时的荷电数适当减少,从而使PEG化样品的ESI图谱得到高效的解析[1]。而MALDI TOF类质谱由于质谱分辨率的限制(目前MALDI TOF分辨率在8万内),面对分子量动辄十几万甚至更高的PEG化蛋白,其可获得的数据质量较差,因而MALDI方法可得到的PEG化蛋白的有效结构信息非常有限。 Lihua Huang等学者进一步开发了ESI Q-TOF分析PEG化蛋白的修饰位点的质谱方法[2]。这种方法包括源内裂解(ISF,In Source Fragmentation)与二级质谱(MS/MS)两个步骤。在第一步ISF过程中,PEG化多肽的PEG部分被裂解而变短;在第二步MS/MS过程中,多肽被打碎产生b、y离子碎片。通过分析携带缩短的PEG链的b、y离子信息,最终得出确切的PEG化修饰位点。ISF与MS/MS为什么可以分别 &ldquo 选择&rdquo 碎裂PEG化多肽的PEG与多肽两个部分呢?推测与PEG化多肽的电荷分布有关。在PEG化多肽的离子化过程中,PEG的醚键附着了大量的H+,并在ISF下完全断裂,而使冗长的P EG链缩短到一两个单位大小。之后的MS/MS过程中,由于缩短的PEG链已无H+附着不再断裂。而多肽在MS/MS中获得了碎裂的机会,并产生携带&ldquo PEG短标签&rdquo 的b、y离子碎片。论文中,研究人员运用此方法成功地分析了IgG4与胰高血糖素的PEG修饰位点。 参考文献 (1) Huang L, Gough PC, Defelippis MR. Characterization of Poly(ethylene glycol) and PEGylated Products by LC/MS with Postcolumn Addition of Amines. Anal Chem. 2009, 81, 567-577. (2) Lu X, Gough PC, DeFelippis MR, Huang L. Elucidation of PEGylation site with a combined approach of in-source fragmentation and CID MS/MS. J Am Soc Mass Spectrom. 2010, 21, 810-818
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