基因甲基化检测

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基因甲基化检测相关的厂商

  • 上海鲸舟基因科技有限公司是中科普瑞旗下子公司。本公司立足新一代测序及其衍生技术,以生物信息学为核心,提供覆盖肿瘤精准用药指导和预后评估,肿瘤早期筛查、甲基化研究和应用、单细胞研究应用、多组学科技服务等符合临床需求和转化研究的解决方案。公司在上海建立了符合美国CLIA和CAP认证标准的医学检验实验室,是基因科技领域极富竞争力的后起之秀。拥有国际一流的运营和科学家的顾问团队。是“中国十万人甲基化组计划(表观星图计划)”的项目实施方,首批合作单位包括中科院、中国医学科学院等十数家大专院所,并正在向制药等工业化企业渗透、覆盖。具有国际水平的专利和技术。建立了BD(中国)-中科普瑞单细胞研究联合实验室,完善的多组学科研服务平台。
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  • 达尔文实验机器人简介达尔文Darwin是实验机器人及智能实验室解决方案提供商。我们将生物医药领域由人操作的实验过程,进行定制化智能改造,用机器人代替人完成实验操作,实现实验过程全程自动化。达尔文帮客户完成实验室机器人换人的采购、设计、安装、调试、维修一站式集成,交钥匙服务。解放人重复性实验劳动,提高科学发现效率! 达尔文实验机器人能代替人完成细胞培养、流式细胞检测、核酸提取、高通量实时荧光定量核酸扩增(qPCR)检测、高通量测序(NGS)、酶联免疫吸附实验(ELISA)、T细胞受体测序(TCR?seq)、基因突变检测、单核苷酸多态性(SNP)、高分辨率熔解曲线(HRM)、甲基化特异性PCR等数百个生物医药实验,实现实验过程全程自动化及定制化智能实验室整体改造。达尔文实验机器人广泛应用于生物学、医学、药物研发、临床检测、基因工程、生命科学、化学及物理学等领域。 达尔文实验机器人成都有限公司 Darwin LabRobot co., ltd.电话/微信/Q Q: 李日186 0288 2272 李得顺183 2138 1160
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  • 华准计量是一家专业从事检测、校准的第三方综合实验室,是全国为数不多的集设备研发、销售、检定、校准、维修、教学于一体的综合能力完善,服务领域广泛的仪器设备综合服务商。成立于2019年5月,总部设在成都市成华区龙潭总部经济城,公司注册资金1亿元。 公司秉持求实创新、协同高效、卓越进取、服务科学的质量方针,为航空航关、石油石化、生物医疗、检验检测、机械生产、精密制造等行业提供全链条整体化的服务。并逐渐成为中国西部仪器行业服务能力最完善的企业。主要涉及几何量具、热学仪器、电学仪器、电磁学、时间频率、力学(压力、流量等)、化学类分析仪器等,均建立并完善了检、校、修全面保障的实验室。 公司总面积约 3000 平方米,设有技术部,质量部,几何量、电磁学、热学、力学、化学5大专业校准实验室,收发室,资料室,学习室,客服部,运维保障部等 公司服务团队中,国家级专家4人,国家一级考评员3人。校准实验室现有10年以上从业人员8人,注册计量师7人,工程师3人,内审员6人,经过培训考核合格的检测校准员 18人 标准考评员、机构考评员等专家4人,高级顾问2人其中几何量室3人,电学室3人,力学室4人,热学室3人,化学室4人 检测实验室 10人。 华准计量是通过四川省局建标的第三方综合实验室,现有建标50余项,CNAS 认可近 200 项。 业务范围:计量检定、校准、检验检测、仪器维修、仪器销售。市场范围:全国市场。服务效率:提供上门检校、验证、维修、上门取送等服务。证书时效:最快3个工作日内。 专家风采 景志红华准计量检测股份有限公司 技术总工高级工程师国家一级计量标准考评员实验室认可CNAS 评审员国家计量基准评价专家小组成员国家法定技术机构考评员国家资质认定评审员国家计量产品许可证评审员四川省司法厅/司法鉴定人 1985年毕业于华中科技大学电力系电磁测量及仪器专业。1985年至2020年中国测试技术研究院工作,先后担任电学室主任、计量检测校准中心法制部部长。1987年全国计量检定人员考核 电磁学 第1名。负责国家欧姆基准的保存和国际比对 建立国家高阻计量基准并荣获国家计量局科技二等奖。高阻过渡量研制具获国家质量监督检验检疫总局标准计量技术成果奖三等奖。参与《检测校准实验室能力建设与管理》编著。 陈永康华准计量检测股份有限公司 技术副总工高级工程师国家一级计量标准考评员角度专业技术委员会委员 1975年毕业于天津大学精密仪器工程系计量仪器专业。1975年至2019年中国测试技术研究院工作,担任长度室主任,先后从事过光学仪器检定及维修,几何量各类仪器及量具的检定工作。作为第一起草人,起草过数十份国家检定规程或校准规范(JJG201、JJG34、JJG35、JJG39、 JJG109、JJG661、JJG830、JJF1100、JJF1102 等)。 何丘华准计量检测股份有限公司 技术副总工高级工程师国家一级计量标准考评员国家物理化学计量技术委员会委员国家计量许可考评员国家计量认证评审员国家实验室资质认定考评员中国计量测试学会委员 1978年毕业于四川大学化学系分析化学专业。1978 年至 2019 年在中国测试技术研究院化学研究所工作,先后担任室主任、副所长。工作期间发表过多篇理化检测论文,作为第一起草人起草离子计检定规程(JJG757)。编著有《检定与校准管理》、《检测校准实验室能力建设与管理》等相关书籍。研制国家标准物质12 种,编写标准物质研制报告 12 篇。 硬件设施Hardware facilities 标准器、辅助设施设备、标准物质均采用国内外一流产品,共计 400 余台套。主标准器及配套设备均依法溯源,其中 99% 溯源到中国测试技术研究院。建立了完善的设施设备管理制度。 实验室介绍Laboratory introduction 几何量室 几何量实验室主要负责线纹、长度和端度、角度、工程参量方面的仪器校准工作,实验室现建立的计量标准有:《钢卷尺标准装置》、《指示表检定仪标准装置》、《框式水平仪和条式水平仪校准装置》、《试验筛标准装置》等装置。现可开展校准项目 60 余项,分别有:测微量具、光栅式测微仪、指示量具、显微镜类、线纹类、端度类、超声波测厚仪、焊接检验尺、游标量具、引伸计、引伸计标定器、试验筛等。 力学室 力学室主要负责力学相关测量仪器的校准,涉及的领域有质量、容量、流量、压力、硬度、力值、转速。开展项目主要有:砝码、电子天平、机械天平、数字指示秤、非自行指示秤、玻璃量器、移液器、精密压力表、数字压力计、普通压力表、硬度计(洛氏/维氏/里氏/布氏)、拉力、压力和万能试验机、电子式万能试验机、电液伺服万能试验机、抗折试验机、流量计、离心机等。 电学室 电学实验室主要负责电磁方面仪器的校准工作。开展项目:数字多用表、多功能标准源、直流电阻箱、兆欧表、绝缘电阻测试仪、高阻计、电压表、电流表、电阻表、钳形电流表、钳形接地电阻测试仪、直流电桥、静电腕带/脚盘测试仪、直阻仪、表面电阻测试仪、在线绕组温升测试仪、直流电子负载、平板电泳仪、电池内阻测试仪、过程校验仪、交直流电表校验仪、继电保护测试仪、电火花检漏仪、秒表等。 热学室热学实验室主要负责热学类仪器的校准工作。开展项目:生物安全柜、洁净工作台、溶出度测定仪、聚合酶连反应分析仪(PCR)、真空干燥箱、各类环境检测与可靠性试验设备、熔点测定仪、箱式电阻炉、恒温槽、医用热力灭菌设备温度计、电热恒温水浴锅、廉金属热电偶、工业铂电阻、玻璃温度计、医用电子体温计、双金属温度计、各类温湿度表、温湿度控制器、变送器、记录仪、湿度传感器等。 化学室化学实验室主要负责化学检测方面仪器的校准工作。开展项目:紫外、可见、近红外分光光度计、实验室pH(酸度)计、浊度计、可燃气体检测报警器、气相色谱仪、气相色谱-质谱联用仪、傅立叶变换红外光谱仪、原子吸收分光光度计、原子荧光光度计、荧光分光光度计、火焰光度计、旋光仪及旋光糖量计、手持糖量(含量)计及手持折射仪、测汞仪、液相色谱仪、离子色谱仪、薄层色谱扫描仪、四极杆电感耦合等离子体质谱仪、液相色谱-质谱联用仪校准、水中油分浓度分析仪、溶解氧测定仪、水质综合分析仪、化学需氧量(COD)测定仪、总有机碳分析仪、余氯测定仪、卡尔费休库仑法微量水分测定仪、卡尔费休容量法水分测定仪、实验室离子计、自动电位滴定仪、电导率仪、分光光度法流动分析仪、酶标分析仪、粉尘采样器、大气采样器、总悬浮颗粒物采样器、硫化氢气体检测仪、一氧化碳检测报警器、烟气分析仪、澄明度检测仪、全(半)自动定氮仪、农药残留快速检测仪、水质色度仪、阿贝折射仪等。 维修维护Maintenance 基于光、机、电、磁的仪器装备,工程师均能提供上门检修服务。在分析、检测、无损探伤、医疗卫生等诸多领域,自检自修能力达 80%以上,有效提高了团队服务效率,降低了客户维护成本。 时效保障Limitation of time 公司具有检校修售一体化服务的优势,深度开展以客户需求为核心的市场开发,维护工作。以成都为中心下设五个运营保障和客服组,物流时效5小时以内。 服务行业service trade电力、石化、医疗、疾控、环境、质检、特检、生物制药、食品药品、检验检测、精密制造、建筑工程等。
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基因甲基化检测相关的仪器

  • DNBSEQ-G99:全力释放你的测序速度DNBSEQ-G99是目前全球中小通量测序仪中速度最快的机型之一。基于华大智造核心的DNBSEQTM测序技术,G99对生化、流体、光学、温控等多个核心系统进行了优化和提升,同时内置计算模块,使得测序生信一体化,12小时可完成 PE150测序,适用于小样本量的肿瘤靶向测序、小型全基因组测序、低深度WGS测序、个体识别、16s宏基因组测序等多种应用,数据产出高效且优质。产品特点8 Gb~96 Gb per run满负荷PE150仅需12小时支持多种读长,包括PE50、SE100、PE150、PE300、SE400,测序精准度高,可连续读取12个以上单个重复碱基序列信息适用于小样本量的肿瘤靶向测序、小型全基因组测序、低深度WGS测序、个体识别、16s宏基因组测序等多种应用 性能参数单次运行最大载片数流道最大reads数 /载片*支持读长***数据量Q30**测序时间 (DNB-FQ)2 180 MSE100/PE508 Gb~16 Gb>90% 5 hPE15024 Gb~48 Gb>85%12 hPE30048 Gb~96 Gb>85%30 hSE40032 Gb~64 Gb 75%20 h* 有效 reads 数值根据特定标准文库运行所得,实际应用文库受样本类型、建库方式会有所波动。** 高于 Q30 的碱基百分比及运行时间是特定标准文库通过整个运行平均所得,实际应用表现受样本类型、文库质量、插入片段长度等影响。*** 现有试剂盒支持SE50、PE100读长,同时仪器设有 SE50、PE100 测序模式。方法学 应用推荐读长数据量样本数量/RUN1张载片 2张载片靶向捕获/多重检测伴随诊断Onco panelPE100/ PE150 小panel: ~1 Gb /样本2448遗传病诊断小panel(地贫、耳聋等)PE150地贫: ~0.2 M reads /样本耳聋: ~5 Gb /样本40048008ATOPlex panel(呼吸道、新冠等)PE100/ PE150呼吸道panel: 5 M reads /样本 新冠panel: 5 M reads /样本1632WESPE15015 Gb /样本1~22~4 甲基化Onco 靶向甲基化PE150~5 Gb /样本48小型基因组测序 未知病原宏基因组SE50/ SE100Meta: 20 M reads /样本48细菌、病毒 WGS测序PE100/ PE150单菌: ~1 Gb /样本16~2432~4816S 测序PE300≥0.1 M reads /样本5761152低深度 WGS测序NIPTSE50~10 M reads /样本8 16PGSSE50转录组测序RNA-SeqSE50/ PE150定量: ~25 M reads /样本转录组: ~6 Gb /样本3468司法DNA特征识别SE400~0.8 M reads /样本96192* 数据量推荐及样本数量仅做预估参考,具体数据量及样本数量需根据实际情况调整。相关产品货号货号 产品型号900-000561-00DNBSEQ-G99RS900-000560-00DNBSEQ-G99ARS940-000409-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM FCL SE100/PE50)940-000410-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM FCL PE150)940-000520-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM App-C FCL SE100)940-000413-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM App-C FCL PE150)940-000415-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM FCL PE300)940-000417-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM FCL SE400)940-000624-00DNBSEQ-G99RS 清洗试剂盒(G99 SM FCL)按需自选UPS
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  • 产品简介聚光科技Gene TOF 3100核酸质谱分析系统是快速、准确、经济、高效的多重基因检测平台,独立自主研发,拥有多项关键专利技术。GeneTOF 3100结合了PCR技术的高灵敏度、芯片技术的高通量、及质谱技术的高精度等优势,搭配完善的自动化体系,为客户提供包含仪器、耗材、试剂、软件在内的综合解决方案,可广泛应用于出生缺陷防控、药物基因组、肿瘤、传染性疾病等相关基因位点的分析。性能优势1) 多重可单孔实现几十个靶标的多重检测分析。2) 准确高分辨质谱检测,可区分仅一个碱基分子量差异,准确性99.5%,是 SNP 突变检测的金标准。3) 经济无需化学发光、荧光或其他任何二级标记,单个靶点检测成本最低的方法。4) 高效单批进样 384 个样本,日最高检测通量超过 3000, 能够满足不同检测量的需求。5) 便捷高度集成自动点样仪进行样品纯化及点样,自动分析结果,实现样本进结果出,无需任何手工操作,无须生物信息学分析。产品特点1)多基因多位点的精准基因检测平台;2)自主知识产权,多项关键专利技术;3)开放式平台体系,支持自建项目;4)提供完整的仪器、软件、基础试剂、耗材和自动化解决方案;5)可广泛应用于SNP分型、基因突变、DNA甲基化、拷贝数变异等的检测。应用领域出生缺陷防控(遗传病筛查):遗传性耳聋、地中海贫血症、脊髓性肌萎缩症(SMA)、G6PD缺乏症等;药物基因组学:心血管、精神类疾病个体化用药,儿童安全用药等;肿瘤精准防治:肿瘤早筛、肿瘤靶向用药指导、靶向治疗耐药监测等;传染性疾病:感染性腹泻、呼吸道多重感染病原体及其耐药性检测等。
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  • GenePix 4100A微阵列基因芯片扫描仪无需在烦躁情绪中继续等待中心实验室或相邻实验室正在工作中的基因芯片扫描仪。现在可以以更优惠价格马上获得一款高性能的微阵列基因芯片扫描仪。Molecular Devices公司推出的GenePix 4100A微阵列基因芯片扫描仪具有高端基因芯片扫描仪所有的特质:如超高灵敏性,可靠性和易操作性。实惠的价格和紧凑设计使得它更佳适合小实验室中使用。GenePix4100A基因芯片扫描仪支持用户在5-100μm范围内随意调节其分辨率来获取数据。可针对具体实验的需求优化图像分辨率和文件的大小。GenePix4100A基因芯片扫描仪具有自动调节PMT增益的功能,可简便、快速对信号强度和通道的平衡进行优化。 主要特点:1,一款简洁、易用、高性价比扫描仪2,出众的成像精度3,出色的重复性4,可灵活的支持各种荧光染料检测5,可整合GenePix Pro图像分析软件仪器优势:1,可自主研究不同染料:GenePix 4100A 微阵列扫描仪可支持多种不同的荧光染料分子, 其光学设计集成了用户可选的 6 种不同的发射滤光片。2,结果可靠:定期使用随机附带的校准玻片组来对微阵列扫描仪进行校正, 以确保长期使用时光电倍增管 (PMT) 的重复性能。此外, 在扫描过程中会动态监测激光功率变化, 以确保获得稳定的信号输出, 同时硬件诊断报告将持续的对扫描仪性能状况进行记录。利用这些功能, 可以立刻识别并纠正错误信息。3,优化动态设置:GenePixPro 自动绘制像素强度分布的柱状图。根据扫描进度动态更新图像和柱状图;并可在扫描时优化扫描仪设置。4,调整应用分辨率:使用 40 微米预览扫描可定位微阵列并优化硬件设置, 而数据扫描可以用于准确定量。GenePix 4100A 微阵列基因芯片扫描仪支持 5 至 100 微米分辨率的样品, 满足您的任何要求。5,较高的信噪比:本检测系统采用低噪声、高灵敏的 PMT 将光子转变成电信号, 然后使用优质的超低噪声数模转换器技术将其数字化。调节PMT增益和平均多线扫描, 以在低信号样品检测上获得更高的信噪比 (SNR)。6,样本追踪:GenePix Pro 采集和分析软件自动读取预览扫描、数据扫描和保存图像的条形码, 并将导出获得的数据。动态监测激光光源GenePix4100A基因芯片扫描仪光源强度可针对每个像素点进行相应变化,实时的动态监测,确保每个像素点均可获得稳定的、持续的信号。采用先进的激光器,配合了独特的强度校正系统,保证在图像中的所有像素点具有相等的曝光效率。内置所有激光器均具有自动校正功能,可以动态的监测激光器微小的波动,大大提高了信号噪声比。所有这些功能特征保证获取的数据具有高度重复性,避免了再一次费时、费力的重复相应实验。 8位滤光轮可大大提高荧光染料检测的灵活性GenePix4100A基因芯片扫描仪光路中设计有一个8位的发射滤光片转轮(如图一),标配有红色和绿色滤光片。根据需要还可以再装6个滤光片,提高了灵活性,以便于满足其它多种荧光染料的检测。作为质控程序的一部分,我们通过使用滤光片转轮中的空位置或中性密度滤光片, 也可以用扫描仪的635nm进行反射成像,允许用户检查未标记的DNA阵列点形态上变化。 采用非共聚焦光路采用非共聚焦光路的GenePix 4100A基因芯片扫描仪可用于微阵列芯片成像分析。其它类型基因芯片扫描仪大多利用共聚焦技术对厚样品的进行薄切片分层式成像,如组织样本,证实其并不适合进行微阵列扫描成像。微阵列芯片上大多数背景信号来源于非特异性的杂交反应,它们与样品位于同样的焦平面上(如图二)。此外,绝大多数微阵列基因芯片表面为非均一平面,由于共聚焦成像系统具有非常窄的景深,会受到各种不同基质载体的焦平面的变化而产生波动。GenePix基因芯片扫描仪具有大景深检测能力,可以在各种微阵列芯片表面收集更多的光学信号,同时也能够避免附近杂散光的干扰。 软件和硬件的高度结合所有GenePix4100A基因芯片扫描仪家族成员在设计之初就被要求能与GenePix Pro微阵列分析软件完美整合在一起。(如图三)扫描仪和软件之间这种无缝式的通信方式确保了其科高效的获取和分析相应实验数据,也能够实时检测扫描仪工作状态。可选的Acuity微阵列信息分析软件,具有数据库储存能力、群集算法、高级统计学能力和可视化界面。 仪器应用: 1,基因组学:针对基因组序列本身, 微阵列可用于识别全新基因、转录因子的结合位点、DNA 拷贝数变化、基础基因序列变异(如新发现病原体菌株或人类致病基因的复杂突变)。2,转录组学: 使用高密度微阵列芯片, 给复杂疾病转录水平的研究检测带来影响。通过目前最新微阵列检测技术的发展, 现在可以总体上定量分析转录水平, 并将这些数据与疾病相关信息进行整合。基于微阵列的转录组学可利用受影响和未受影响的个体绘制出某一疾病的关键基因区域, 然后通过识别关键区域中的差异表达基因来确定致病基因。3,蛋白质组:尽管尚未实现全蛋白质组分析, 微阵列芯片仍然促进了蛋白质组学领域取得长足进展。蛋白质组学展现出广泛动态复杂性;哺乳动物中不同蛋白质的数量一定超过基因数量, 因而需要合适的技术以进行相应分析。GenePix 微阵列基因芯片扫描仪具有很高的灵活性, 尤其是整合GenePix SL50 自动芯片装入系统后, 可大大提高检测通量, 可为研究人员提供优质的工具。4,表观遗传学:基因是承载着遗传信息的基本单位, 但这些信息仅在由表观基因组适当编码时才产生影响。DNA 甲基化模式是细胞类型特异性的, 与染色质结构相关。DNA 微阵列基因芯片可用于识别甲基化模式, 而且 GenePix 微阵列基因芯片扫描仪自动化解决方案使研究人员能够更快认识这些模式。5,新应用:微阵列研究的创造性和广泛适用性是没有限制的。各种应用微阵列进行大批量的定量分析强调了这一点。GenePix 微阵列基因芯片扫描仪可提供较灵活的研究解决方案和更大的自由度。
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基因甲基化检测相关的资讯

  • 中国生物子公司基因甲基化检测产品获批
    8月8日,国家药监局官网发布医疗器械批准证明文件(准产)待领取信息,文件显示,上海捷诺生物科技有限公司的人ASTN1、DLX1、ITGA4、RXFP3、S0X17、ZNF671基因甲基化检测试剂盒(荧光PCR法)于8月4日获得批准,注册证编号为20223401036。上海捷诺生物科技有限公司(以下简称“捷诺生物”)隶属于中国医药集团有限公司(以下简称“国药集团”)中国生物技术股份有限公司(以下简称“中国生物”),是中国生物旗下专业研发、生产、销售国内外医疗器械和体外诊断试剂的企业。捷诺生物的医学诊断是中国生物规划发展的重点板块之一,也是领衔中国生物混合所有制改革的第一家,旨在以体制机制创新来促进诊断业务的迅速发展。2019年,捷诺生物完成了国药集团内第一个对国外公司股权收并购项目,启动了海外研发中心建设,进一步加快引进国际先进技术,拓宽国际化布局的进程。捷诺生物定位于IVD领域全球领先技术产业化转化平台,产品集中于传染病病原体的多重检测和肿瘤的分子诊断,主要有宫颈癌甲基化检测试剂盒,呼吸道、脑炎/脑膜炎、肠道、中枢神经系统、优生优育生殖道感染单管多重病原体核酸检测试剂盒等,服务于各大临床医院、疾病预防控制中心、检验检疫局等。2020年捷诺生物针对新冠疫情快速响应,迅速投入研究开发,经过设计、优化和试验,成功研制出新型冠状病毒核酸检测试剂盒,第一批取得了国家药品监督管理局颁发的医疗器械注册证,并通过了欧盟CE认证,被列入世界卫生组织(WHO)应急使用采购清单。同时,捷诺与英国牛津大学合作,共同开发的新冠快速核酸检测试剂盒,已获批进入商务部防疫物资出口白名单。
  • 华大基因多家医学实验室满分通过全国SDC2基因甲基化检测室间质评
    近日,国家卫生健康委临床检验中心 (NCCL) 公布了《2023年全国SDC2基因甲基化检测室间质量评价预研活动结果报告》,华大基因旗下深圳、武汉、天津3地医学检验所均以满分成绩通过。这是5月华大基因深圳、天津医学检验所满分通过全国肿瘤游离DNAEGFR基因突变检测室间质评以来的再次满分认证通过,多次获得国家权威机构组织的充分肯定,证明了华大基因在肿瘤防控领域的专业检测能力。华大基因多家医学检验所满分通过室间质评华大基因十分注重医学检验所的质量管理。从2020年参与室间质评以来,多次以满分高分通过国家级室间质评。此次室间质评是国家卫健委临床检验中心首次针对SDC2基因甲基化检测面向全国医疗机构/临床实验室开展的室间质量评价,通过SDC2基因甲基化检测的定性检测,对临床实验室进行质量评价。华大基因三家医学实验室采用华大基因自主研发的粪便DNA甲基化检测试剂参加本次室间质评,阳性符合率和阴性符合率均为100%,满分通过该项能力验证,这也充分证明了华大基因粪便DNA甲基化检测技术的稳定性与高质量水平。在加速技术创新及完善实验室质量管理体系的同时,华大基因基于粪便DNA甲基化检测技术推出多款基因检测方案,其中,采用荧光定量PCR技术的华常康[gf]ae[/gf]粪便DNA甲基化检测,能够通过检测粪便携带的肠道脱落细胞中的3个肠癌相关基因 (SDC2、ADHFE1、PPP2R5C) 的甲基化水平,从而评估受检者罹患肠癌的风险。此外,华大基因为检测试剂提供配套处理系统,实现低中高通量的结直肠癌防控一站式自动化整体解决方案,为合作伙伴打造疾病检测和肿瘤防控“平急两用”通用型平台。近年来,华大基因始终坚持“防大于治、人人可及”的公共卫生普惠精准防控理念,不断创新技术,推动普惠民生项目。未来,华大基因仍将积极探索新模式、新思路、新技术与新场景,将基因科技赋能精准医学, 为加快实现‘健康中国2030’贡献科技力量。
  • 王家海团队最新成果:开发纳米孔计数器检测甲基化基因方法 检测限达到1aM以下
    近日,化学化工学院王家海教授团队开发了基于纳米孔计数器检测甲基化基因的方法,成果以“Nanopore counter for highly sensitive evaluation of DNA methylation and application for in vitro diagnostics”为题发表在国际知名学术期刊Analyst上。1、研究背景 DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,在维持正常细胞功能、染色体结构、胚胎发育和衰老方面发挥着重要作用。因此,DNA异常的甲基化水平被认为是重要的恶性肿瘤生物标记物之一,开发一种简单而灵敏的DNA甲基化水平检测方法是必要的。固态纳米孔是纳米孔技术中重要的组成部分,其对双链DNA(dsDNA)的检测具有无标记和超高灵敏度的特性。将DNA甲基化程度通过合适的转换机制,变换成特定长度双链DNA的浓度,有助于开发信号读出良好,灵敏度高的甲基化传感器。2、研究内容受此思路启发,王家海教授团队提出了一种过程简单,条件温和的甲基化监测方案——即通过纳米孔计数器对双链的读出能力,结合双限制性内切酶(BstUI/HhaI)消化策略和聚合酶链式反应(PCR)扩增将DNA甲基化转换为PCR扩增物的数量来评估DNA甲基化的程度。相比于传统亚硫酸氢盐转化方法,基于双甲基化敏感内切酶的消化策略结合纳米孔是更好的选择。首先,基于甲基化敏感的核酸内切酶的消化策略可以在更加温和的条件下特异性地消化未甲基化的DNA,这对于开发简单、通用的甲基化检测方法至关重要;此外,基于甲基化敏感的核酸内切酶消化策略的可以将非甲基化的DNA切碎,这可以大大减少背景信号,从而显著简化纳米孔传感器的数据分析,使得信号更加规整、好读。而加入PCR策略,是将信号灵敏度和选择性进一步提升,使其达到临床所需。图1 技术原理图:(a) 双内切酶系统可以消化未甲基化的DNA,但保留甲基化的完整DNA,完整的甲基化DNA可以通过PCR反应扩增并产生大量固定长度的双链DNA扩增子。(b) 通过玻璃纳米孔计数器直接检测PCR扩增子。由于PCR扩增子的规律性,信号是非常均匀、好读出的。3、工作亮点在本工作中,我们根据PCR扩增的效率以及产生信号的信号比优化了PCR产物的长度,使得传感器兼顾灵敏度以及读出信号的方便性。结合PCR技术产生固定长度扩增子后,该传感技术对DNA甲基化的检测达到了1aM以下的检测限,并且具有1aM~100pM之间(109倍)的超宽传感器线性区间:图2 PCR扩增子长度的优化。(a)扩增子的引物的位置。(b)凝胶电泳图,说明经过反应后,只有甲基化SEPT7基因可以保持完整,并成功产生不同长度的产物条带。(c)三种长度的PCR扩增子的易位信号,可以看出随着扩增子长度的增加,信噪比提升。(d) 317、406和806bp扩增子的信号幅度分布直方图,可以看到扩增子越长,信号率下降,传感器灵敏度下降。图3 纳米孔传感器对甲基化DNA的定量测试。(a)甲基化PUC57-SEPT9浓度范围为1 aM至100 pM时的校准曲线。(b)传感器的对数校准曲线。对数校准曲线的分段线性范围为1 aM至100 aM(c)和100 aM至100pM(d)。(e) 传感器在5秒内对不同浓度的甲基化PUC57-SEPT9的易位信号。此外,传感器具备优秀的选择性,能在大量非甲基化的基因中检测出仅有0.01%的甲基化基因。与其他现存技术相比,我们的技术在检测限及监测范围中有足够的优势。图4 传感器对DNA甲基化水平的测试。(a)用不同甲基化水平的DNA测试时的事件率。(b)测量的甲基化水平与实际输入甲基化水平之间的关系。结果显示即使在低至0.01%的浓度水平下也具有良好的一致性。表1 本文结果与其他甲基化检测方法的性能比较方法扩增手段检测范围检测下限fluorescenceOxidation damage base-based amplification100 fM-100 nM34.58fMelectrochemistryElectrochemical strategies for tetrahedral RCA amplification1 fM-1 nM100 aMchemiluminescenceSynergistic in situ assemblies of G-quadruplex DNAzyme nanowires1 aM-100 pM0.565 aMfluorescenceDual endonucleases digestion coupled with RPA-based CRISPR/Cas13a200 aM-20 pM86.4 aMfluorescenceFluorescence nanosensor based on Fe3O4/Au core/shell nanoparticles3.2 fM-800 fM310 aMNanopore(this work)Dual endonucleases digestion combined with PCR-based nanopore1 aM-100 pM0.61 aM4、研究相关 王家海教授为论文第一作者,团队成员陈达奇(广州大学讲师)为论文通讯作者,广州大学为第一通讯单位。文章链接: https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2023/an/d3an00035d

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  • 高效液相色谱质谱联用测全基因组甲基化水平

    [color=#444444]我自己接手一个新的实验项目,是用高效液相色谱质谱联用技术测人群的全基因组甲基化水平,想问问有没有哪个大神有做过这个类似的实验么,好多问题都不懂。DNA是之前用试剂盒提取了的,用了蛋白酶K把蛋白质消解了,这种情况下进一步水解DNA还需不需要进一步超滤去蛋白呢(哪个超滤好像好贵,成本好高);测的时候是不是也需要同时30 毫摩尔每升、pH为6.8的乙酸钠,30毫摩尔每升、pH 为7.8的乙酸钠溶液,具体怎么配啊,能用乙酸调么?谢谢[/color]

  • 【求助】如何用质谱检测RNA甲基化

    我准备分离小RNA,然后用核酸酶将其切成单个核苷酸,ESI质谱,首先先来检测是否有甲基化修饰的核酸,不知道这样行不行。如果行的话,对样品的纯度浓度有什么要求,希望各位有经验的大侠多多指点。先谢过了

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  • 甲基化试剂
    产品信息:甲基化试剂 (DMFDMA)能够轻松有效地将脂肪酸和氨基酸制备为甲酯用于气相色谱分析制备甲酯的优点是:*高速:反应随着化合物的溶解而完成(长链固体酸除外)*衍生物无需洗涤、萃取或浓缩*不会生成水*定量:当试剂和样品在未经混合的情况下注入分析柱内,即可获得定量结果*方便:即用型试剂,含 2mEq/mL 吡啶 订货信息:甲基化试剂描述规格部件号数量甲基化试剂(N, N-二甲基甲酰25mLTS-493501 Each胺二甲基缩醛)
  • 转基因大米快速检测卡
    转基因大米检测试纸卡 使用说明方法编号:CDC-70481 适用范围:本检测试纸卡适用于PAT蛋白转基因大米的现场快速检测,以及其它PAT蛋白转基因作物的参考检测。 2 检测意义:水稻植入PAT蛋白基因的目的是增强水稻对除草剂草丁膦(草铵膦)的耐受性。目前,中国允许商业化种植的转基因作物有潘木瓜和棉花。允许进口的转基因作物有大豆、油菜、棉花和玉米。大米是中国居民的主要食粮,我国至今还没有批准转基因大米的进口以及允许其作为商品在市场上进行销售。3 检出限:本检测试纸卡对LLRICE62基因蛋白的检出限是1/2000(2000粒粉碎后的大米中有1粒转基因大米即可检出),同时检测LLRICE62和LLRICE601基因蛋白时的检出限是1/50。 4 样品处理4.1简易处理法:取0.5克(通常约20粒左右)的大米,放在硫酸纸上,将纸折叠包裹大米,用自备的平口钳子将大米钳碎成粉末状,将米粉移入提供的试管中,向试管中加入1ml的纯净水,盖盖后振摇50次以上,放置1分钟后再振摇50次以上,5分钟后静置到分层;4.2常规处理法: 数出100粒大米,用感量0.01克的天平准确称量后除以100得出每粒的质量。将大米粉碎,取0.5克米粉移入提供的试管中,向试管中加入1ml的纯净水,盖盖后振摇50次以上,放置1分钟后再振摇50次以上,5分钟后静置到分层;5样品检测:取0.5ml的上层液于提供的试管中,将试纸标有箭头的一侧插入试管中,反应5分钟。 6 结果判断: 5分钟后,如果试纸条上只有一条质控线出现,说明结果为阴性;如果有两条线出现,说明结果为阳性;无条线出现为试纸条失效; 30分钟后读取的结果无效。 7注意事项:7.1请按照操作步骤进行测试,操作时请勿触摸试纸条显色区。7.2本试纸条为一次性产品,请勿重复使用。7.3本产品检测结果仅供参考,如需确证,请参照相关检测方法。8产品包装:检测试纸卡5片,吸管5只,硫酸纸5片,试管10个。9试纸效期:2~8℃冷藏保存,切勿冷冻,有效期为12个月,有效期见包装
  • CYDEX-B – 甲基化β 环糊精(手性柱)
    forte CYDEX-B – 甲基化β环糊精(手性柱)? 适于手性分离;? 操作温度:30°C - 220/240°C;? 等同产品:Cyclosil-B、Cyclodex-B、HP-CHIRAL B、β-DEX 和RT-β DEXm。CYDEX-B – 甲基化β环糊精(手性柱)订货信息:内径(mm)膜厚(μm)25m50m0.220.250549000549010.320.25054902—
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