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蛋白质凝胶电泳仪

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蛋白质凝胶电泳仪相关的资讯

  • 药典委首次制定蛋白质组学分析标准,涉及色质谱、凝胶电泳等多种技术
    蛋白质组学是指在大规模水平上以蛋白质的生物多样性为基础,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律、蛋白质翻译后修饰以及蛋白与蛋白之间相互作用等,从而揭示疾病发生、发展和药物治疗相关的规律与机制。随着质谱技术以及色谱与质谱联用技术的快速发展,蛋白质组学分析技术在未知蛋白质的鉴定、蛋白质结构的解析、靶向蛋白质定量、以及生物技术药物研发、质量控制和体内药代动力学研究方面应用越来越广泛。药典委拟制定《中国药典》蛋白质组学分析方法及应用指导原则,并于2024年2月20日发布公示稿(详见附件)并征求意见。该指导原则适用于蛋白质组学在蛋白质组成及其变化规律、蛋白质翻译后修饰以及蛋白与蛋白之间相互作用方面的分析研究,规范蛋白质组学分析方法建立,分析过程质量控制和数据分析,确保蛋白质组学分析结果的重复性与可靠性。蛋白质组学分析方法需要具备实用性强、多肽和蛋白的检测特性好以及合适的质控过程,保证分析结果的可靠性。同时蛋白质组学在操作过程中能够处理大量样品。蛋白质组学分析基本流程主要包括:1. 蛋白样品的提取,变性还原,酶解与多肽分离富集;2. 多肽的分析与鉴定;3. 数据分析。分离和富集技术:凝胶电泳和色谱技术分析与鉴定技术:质谱、二维凝胶电泳、X射线分析、核磁共振波谱和透射电子显微镜技术附件: 蛋白质组学分析方法及应用指导原则草案公示稿(第一次).pdf
  • 凝胶电泳实验操作中的小技巧
    1、让凝胶电泳变得更快,更漂亮方法改进:将电泳电压进行定时变化,例如可以在开始时将电泳电压调节至 100V,大约 15min。使条带的确可以因为自身片段大小不同而产生较大差别的泳动速度,从而将片段分离,然而现在的分离或许会间距较小,从而图片很不漂亮,或者不易观察.可以紧接着进行 120V-130V 的电压进行较小差 异电泳,但是由于电泳电压较大,可以避免过大的片段残存在胶孔不易泳动的情况.结果:这样两个电压进行配合电泳,便可以得到非常漂亮的电泳条带,并且可以节省 1/5-2/5 左右 的时间.2、RNA 电泳如何得出漂亮的条带方法改进:1.电泳槽,制胶器,梳子等的清洗:去污剂浸泡过夜——自来水冲洗干净——ddH20 冲洗——3%H2O2 灌满浸泡过夜——灭活的 0.1%DEPC水冲洗干净——超净台内紫外线照射过夜. 2.烧瓶,烧杯,药匙,量筒等制胶器械的清洗:0.1%DEPC 水浸泡过夜后高压消毒灭活,烘箱烘干.或 者 ddH20 清洗干净, 超净台内紫外线照射过夜. 3.电泳缓冲液必须是 RNase free . 4.预电泳 5-10min 减少了非特异 RNA 条带的出现,有利于分离和纯化,同时可根据电泳仪是否冒泡判断电 泳仪装置是否有误. 5.样品是在电泳缓冲液液略低于胶表面而不是在高过胶面时加进齿槽,避免了加样 时 RNA 的扩散,加样后 RNA 从齿槽逸出造成 RNA 的弥散及定位不良等现象. 6.电泳 3-5min 让 RNA 进入凝胶后再加电泳缓冲液液高过表面,确保了加到每个槽中的 RNA 量及定位的准确性,从而有利于 DNA 的鉴定和纯化.3、如何提高 SDS-PAGE 的分辨率方法改进:借鉴 Tricine-SDS-PAGE 中添加甘油或者尿素来提高分辨率的成功经验,在普通的 SDS-PAGE 中加入约 13%的甘油,同样可以提高分辨率,有效防止小分子量蛋白的弥散.只要把原来 配方中的水换成 60%的甘油,就可以了.结果:加入甘油之后,条带较细,分得更开.4、改进一点点,我们能得到更加美观的 SDS-PAGE 胶方法改进:所做的改进很简单却很有效,加完分离胶后,用移液枪吸取酒精(浓度没有特别要求, 干净无污染就好)加到分离胶上至覆盖界面,静置片刻后放到 37℃恒温箱中可加速胶的凝固.待到分 离胶完全凝固之后倒去上层的酒精,就可以看到齐平漂亮的界面啦!改进二:脱色 背景:给染色结束的 SDS-PAGE 胶脱色往往需要比较长的时间,否则会由于脱色不完全而导致条 带不清晰,影响到拍照的效果.方法改进:改进的方法很简单易行——取一张我们常常随身携带的面巾纸,打个结放入盛有脱色液 的大培养皿里放到脱色摇床上,这样一来,原来过夜脱色达到的效果现在只需要短短的 3,4 个小时就 可以轻松实现了. PS:希望大家这个时候用的面巾纸是质量比较好不容易掉屑的...
  • 辐照食品-单细胞凝胶电泳法 国标审定
    受中国标准化研究院委托,河北省质量技术监督局于2009年1月8日在石家庄组织召开了《辐照食品的鉴定——单细胞凝胶电泳法(筛选法)》国家标准审定会。审定会专家组由中国检验检疫科学研究院、河北省分子细胞生物学重点实验室、中国疾病预防控制中心、北京市食品安全监控中心、中国标准化研究院、中国药品生物制品检定所、河北出入境检验检疫局检验检疫技术中心、国家农副产品及果品质量监督检验中心、农业部畜禽产品质量安全监督检验测试中心的各位专家组成。   该标准由国家环保产品质量监督检验中心研究起草。专家组认真听取了标准起草小组关于标准起草过程的介绍,对标准的具体技术内容、文本格式逐条进行了审查,经充分的讨论和质询,提出了修改意见,并形成了如下结论:   1、该标准提交的材料齐全、数据详实可靠,编写格式符合GB/T1.1-2000《标准化工作导则 第1部分:标准的结构和编写规则》的要求。   2、该标准是根据国内外辐照食品检测需要,参照欧盟 BS EN 13784:2002标准,在实验条件摸索和方法验证等研究结果的基础上而制定。   3、该标准技术内容先进,能满足国内对含DNA辐照食品的快速筛选要求,填补了国内空白,达到国际先进水平。
  • 安捷伦收购电泳仪制造商Lab901
    美国时间2011年2月28日,安捷伦科技宣布收购领先的电泳设备及耗材供应商Lab901公司。财务及收购其他条款尚未披露。   Lab901公司总部位于英国爱丁堡,开发和生产用于DNA、RNA和蛋白质研究的电泳产品,其主要产品是TapeStation台式电泳仪和ScreenTape及以塑料为基础的消耗品和相关试剂。   Lab901公司成立于2001年,员工约45人。Lab901的前首席执行官Joel Fearnley和公司所有的员工都将加入安捷伦公司,但是安捷伦并没有详细说明Joel Fearnley的具体职位。   安捷伦液相分离业务副总裁Patrick Kaltenbach在一份声明中说,此项交易使安捷伦能够满足用户在生命科学领域有关电泳应用的全部需求,从半自动化到兼容96孔板的工作流程。   “除了安捷伦现有的生物分析平台和Agilent G7100电泳系统,Lab901 公司的ScreenTape平台提供了一个具有广泛应用的,非常灵活、自动化和高通量的凝胶电泳解决方案,”他说。 ScreenTape平台   ScreenTape平台是一种快速、方便的自动化台式凝胶电泳解决方案,包括TapeStation台式电泳仪及ScreenTape及以塑料为基础的消耗品、相关试剂。用户只需加载样品和ScreenTape消耗品到紧凑TapeStation仪器上,一分钟就可以得到蛋白质、RNA和DNA样品的分析结果。   2009年底,Lab901公司从一家英国投资集团获得了400万美元的资金用于产品开发和提高ScreenTape平台的国际销售。
  • 蛋白质组学研究进展与趋势
    1.蛋白质组学研究的研究意义和背景 随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。尽管现在已有多个物种的基因组被测序,但在这些基因组中通常有一半以上基因的功能是未知的。目前功能基因组中所采用的策略,如基因芯片、基因表达序列分析(Serial analysis of gene expression, SAGE)等,都是从细胞中mRNA的角度来考虑的,其前提是细胞中mRNA的水平反映了蛋白质表达的水平。但事实并不完全如此,从DNA mRNA 蛋白质,存在三个层次的调控,即转录水平调控(Transcriptional control ),翻译水平调控(Translational control),翻译后水平调控(Post-translational control )。从mRNA角度考虑,实际上仅包括了转录水平调控,并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也证明,组织中mRNA丰度与蛋白质丰度的相关性并不好,尤其对于低丰度蛋白质来说,相关性更差。更重要的是,蛋白质复杂的翻译后修饰、蛋白质的亚细胞定位或迁移、蛋白质-蛋白质相互作用等则几乎无法从mRNA水平来判断。毋庸置疑,蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制。蛋白质本身的存在形式和活动规律,如翻译后修饰、蛋白质间相互作用以及蛋白质构象等问题,仍依赖于直接对蛋白质的研究来解决。虽然蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。 传统的对单个蛋白质进行研究的方式已无法满足后基因组时代的要求。这是因为:(1) 生命现象的发生往往是多因素影响的,必然涉及到多个蛋白质。(2) 多个蛋白质的参与是交织成网络的,或平行发生,或呈级联因果。(3) 在执行生理功能时蛋白质的表现是多样的、动态的,并不象基因组那样基本固定不变。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究。因此在上世纪90年代中期,国际上产生了一门新兴学科-蛋白质组学(Proteomics),它是以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象。可以说蛋白质组研究的开展不仅是生命科学研究进入后基因组时代的里程碑,也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之一。 虽然第一次提出蛋白质组概念是在1994年,但相关研究可以追溯到上世纪90年代中期甚至更早,尤其是80年代初,在基因组计划提出之前,就有人提出过类似的蛋白质组计划,当时称为Human Protein Index计划,旨在分析细胞内的所有蛋白质。但由于种种原因,这一计划被搁浅。90年代初期,各种技术已比较成熟,在这样的背景下,经过各国科学家的讨论,才提出蛋白质组这一概念。 国际上蛋白质组研究进展十分迅速,不论基础理论还是技术方法,都在不断进步和完善。相当多种细胞的蛋白质组数据库已经建立,相应的国际互联网站也层出不穷。1996年,澳大利亚建立了世界上第一个蛋白质组研究中心:Australia Proteome Analysis Facility ( APAF )。丹麦、加拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。在美国,各大药厂和公司在巨大财力的支持下,也纷纷加入蛋白质组的研究阵容。去年在瑞士成立的GeneProt公司,是由以蛋白质组数据库“SWISSPROT” 著称的蛋白质组研究人员成立的,以应用蛋白质组技术开发新药物靶标为目的,建立了配备有上百台质谱仪的高通量技术平台。而当年提出Human Protein Index 的美国科学家Normsn G. Anderson也成立了类似的蛋白质组学公司,继续其多年未实现的梦想。2001年4月,在美国成立了国际人类蛋白质组研究组织(Human Proteome Organization, HUPO),随后欧洲、亚太地区都成立了区域性蛋白质组研究组织,试图通过合作的方式,融合各方面的力量,完成人类蛋白质组计划(Human Proteome Project)。2.蛋白质组学研究的策略和范围 蛋白质组学一经出现,就有两种研究策略。一种可称为“竭泽法”,即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质,这种观点从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学,也更符合蛋白质组学的本质。但是,由于蛋白质表达随空间和时间不断变化,要分析生物体内所有的蛋白质是一个难以实现的目标。另一种策略可称为“功能法”,即研究不同时期细胞蛋白质组成的变化,如蛋白质在不同环境下的差异表达,以发现有差异的蛋白质种类为主要目标。这种观点更倾向于把蛋白质组学作为研究生命现象的手段和方法。 早期蛋白质组学的研究范围主要是指蛋白质的表达模式(Expression profile), 随着学科的发展,蛋白质组学的研究范围也在不断完善和扩充。蛋白质翻译后修饰研究已成为蛋白质组研究中的重要部分和巨大挑战。蛋白质-蛋白质相互作用的研究也已被纳入蛋白质组学的研究范畴。而蛋白质高级结构的解析即传统的结构生物学,虽也有人试图将其纳入蛋白质组学研究范围,但目前仍独树一帜。3.蛋白质组学研究技术 可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,通过表达载体进行蛋白质的体外扩增和纯化也并非易事,从而难以制备大量的蛋白质。蛋白质组学的兴起对技术有了新的需求和挑战。蛋白质组的研究实质上是在细胞水平上对蛋白质进行大规模的平行分离和分析,往往要同时处理成千上万种蛋白质。因此,发展高通量、高灵敏度、高准确性的研究技术平台是现在乃至相当一段时间内蛋白质组学研究中的主要任务。当前在国际蛋白质组研究技术平台的技术基础和发展趋势有以下几个方面:3.1 蛋白质组研究中的样品制备 通常可采用细胞或组织中的全蛋白质组分进行蛋白质组分析。也可以进行样品预分级,即采用各种方法将细胞或组织中的全体蛋白质分成几部分,分别进行蛋白质组研究。样品预分级的主要方法包括根据蛋白质溶解性和蛋白质在细胞中不同的细胞器定位进行分级,如专门分离出细胞核、线粒体或高尔基体等细胞器的蛋白质成分。样品预分级不仅可以提高低丰度蛋白质的上样量和检测,还可以针对某一细胞器的蛋白质组进行研究。 对临床组织样本进行研究,寻找疾病标记,是蛋白质组研究的重要方向之一。但临床样本都是各种细胞或组织混杂,而且状态不一。如肿瘤组织中,发生癌变的往往是上皮类细胞,而这类细胞在肿瘤中总是与血管、基质细胞等混杂。所以,常规采用的癌和癌旁组织或肿瘤与正常组织进行差异比较,实际上是多种细胞甚至组织蛋白质组混合物的比较。而蛋白质组研究需要的通常是单一的细胞类型。最近在组织水平上的蛋白质组样品制备方面也有新的进展,如采用激光捕获微解剖(Laser Capture Microdissection, LCM) 方法分离癌变上皮类细胞。3.2 蛋白质组研究中的样品分离和分析 利用蛋白质的等电点和分子量通过双向凝胶电泳的方法将各种蛋白质区分开来是一种很有效的手段。它在蛋白质组分离技术中起到了关键作用。如何提高双向凝胶电泳的分离容量、灵敏度和分辨率以及对蛋白质差异表达的准确检测是目前双向凝胶电泳技术发展的关键问题。国外的主要趋势有第一维电泳采用窄pH梯度胶分离以及开发与双向凝胶电泳相结合的高灵敏度蛋白质染色技术,如新型的荧光染色技术。 质谱技术是目前蛋白质组研究中发展最快,也最具活力和潜力的技术。它通过测定蛋白质的质量来判别蛋白质的种类。当前蛋白质组研究的核心技术就是双向凝胶电泳-质谱技术,即通过双向凝胶电泳将蛋白质分离,然后利用质谱对蛋白质逐一进行鉴定。对于蛋白质鉴定而言,高通量、高灵敏度和高精度是三个关键指标。一般的质谱技术难以将三者合一,而最近发展的质谱技术可以同时达到以上三个要求,从而实现对蛋白质准确和大规模的鉴定。3.3 蛋白质组研究的新技术 做过双向凝胶电泳的人一定会抱怨它的繁琐、不稳定和低灵敏度等缺点。发展可替代或补充双向凝胶电泳的新方法已成为蛋白质组研究技术最主要的目标。目前,二维色谱 (2D-LC)、二维毛细管电泳 (2D-CE)、液相色谱-毛细管电泳 (LC-CE) 等新型分离技术都有补充和取代双向凝胶电泳之势。另一种策略则是以质谱技术为核心,开发质谱鸟枪法(Shot-gun)、毛细管电泳-质谱联用 (CE-MS)等新策略直接鉴定全蛋白质组混合酶解产物。随着对大规模蛋白质相互作用研究的重视,发展高通量和高精度的蛋白质相互作用检测技术也被科学家所关注。此外,蛋白质芯片的发展也十分迅速,并已经在临床诊断中得到应用。3.4 蛋白质组生物信息学 蛋白质组数据库是蛋白质组研究水平的标志和基础。瑞士的SWISS-PROT拥有目前世界上最大,种类最多的蛋白质组数据库。丹麦、英国、美国等也都建立了各具特色的蛋白质组数据库。生物信息学的发展已给蛋白质组研究提供了更方便有效的计算机分析软件;特别值得注意的是蛋白质质谱鉴定软件和算法发展迅速,如SWISS-PROT、Rockefeller大学、UCSF等都有自主的搜索软件和数据管理系统。最近发展的质谱数据直接搜寻基因组数据库使得质谱数据可直接进行基因注释、判断复杂的拼接方式。随着基因组学的迅速推进,会给蛋白质组研究提供更多更全的数据库。另外,对肽序列标记的从头测序软件也十分引人注目。4. 蛋白质组学发展趋势 在基础研究方面,近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域,如细胞生物学、神经生物学等。在研究对象上,覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围,涉及到各种重要的生物学现象,如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。在未来的发展中,蛋白质组学的研究领域将更加广泛。 在应用研究方面,蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一。在对癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景,目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。 在技术发展方面,蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存,各有优势和局限的特点,而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外,更强调各种方法间的整合和互补,以适应不同蛋白质的不同特征。另外,蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益显著和重要,这种交叉是新技术新方法的活水之源,特别是,蛋白质组学与其它大规模科学如基因组学,生物信息学等领域的交叉,所呈现出的系统生物学(System Biology)研究模式,将成为未来生命科学最令人激动的新前沿。
  • 蛋白质印迹实验具体操作步骤
    蛋白质印迹实验具体操作步骤 蛋白质印迹免疫分析的过程包括蛋白质经凝胶电泳分离后,在电场作用下将凝胶上的蛋白质条带转移到硝酸纤维素膜上,经封闭后再用抗待检蛋白质的抗体 作为探针与之结合,经洗涤后,再将滤膜与二级试剂-放射性标记的或辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶 偶联抗免疫球蛋白抗体 结合,进一步洗涤后,通过放射自显影或原位酶反应来确定抗原-抗体-抗抗体复合物在滤膜上的位置和丰度。 【蛋白质印迹实验所需试剂】 1.IgG 标准品 2.羊抗人辣根过氧化物酶(HRP)标记的IgG 抗体 3.转移buffer:Tris 3.03g,Gly14.4g,甲醇200ml,加三蒸水至 1000ml充分溶解,4℃冰箱贮存。 4.Tris buffer(TBS):Tris 2.42g,NaCl 29.2g,溶于600ml三蒸水,再用1N HCl调至pH7.5,然后补加三蒸水至1000ml. 5.漂洗液(TTBS):TBS液500ml,加 Tween20 250ul. 6.封闭液:5%脱脂奶粉。 7.抗体buffer:1.5g BSA溶于50ml TTBS. 8.显色液DAB(3.3-diaminobenzidine,3.3-二氨基联苯胺)配制:5mg DAB溶于10ml 柠檬酸buffer(0.01mol/L 柠檬酸2.6ml,0.02 mol/L Na2HPO4 17.39ml),加30% H2O2 10 &mu l(临用时现配)。 9.脱色液:甲醇250ml,冰醋酸100ml,加蒸馏 水至1000ml. 10.氨基黑染色液(0.1%氨基黑 -10B):0.2g 氨基黑-10B 溶于200ml 脱色液中,充分搅拌溶解,滤纸 过滤。 【蛋白质印迹实验操作步骤】 一、样品的SDS -聚丙烯酰胺凝胶电泳 按实验四操作步骤进行。加样时,注意在同一块胶上按顺序做一份重复点样,以备电泳结束时,一份用于免疫鉴定,一份用于蛋白染色显带,以利相互对比,分析实验结果。 二、转移印迹 1.转移前准备:将滤纸,硝酸纤维素膜(NC)剪成与胶同样大小,NC膜浸入蒸馏 水中 10-20min 后浸入转移buffer中平衡30min . 2.凝胶平衡:将电泳后的SDS -PAGE胶板置于转移buffer 中平衡 30-60min. 3.按图操作:逐层铺平,各层之间勿留有气泡和皱折。 4.开始转移,连接正负极,盖好盖子,接上电源,恒流 0.8mA/cm,室温下转移1h,转移后的凝胶再用氨基黑10B染色液染色20min ,然后脱色检测转移效果。 三、免疫染色 1.转移后的NC膜于5%脱脂奶粉中封闭,4℃过夜。 2.TBS洗膜1-2次,10min/次。 3.加HRP标记的抗体,室温1h . 4.TBS 洗3次,10min/次。 5.NC膜再转入DAB显色液中,置暗处反应,待显色反应达到最佳程度时,立即用三蒸水洗涤终止反应。
  • 药典蛋白质组学分析标准二次公示!增加QC评价标准
    随着质谱技术以及色谱与质谱联用技术的快速发展,蛋白质组学分析技术在未知蛋白质的鉴定、蛋白质结构的解析、靶向蛋白质定量、以及生物技术药物研发、质量控制和体内药代动力学研究方面应用越来越广泛。药典委拟制定《中国药典》蛋白质组学分析方法及应用指导原则,并于2024年2月20日发布第一版公示稿并征求意见。为确保标准的科学性、合理性和适用性,现将拟增订的蛋白质组学分析方法及应用指导原则(第二次)公示征求社会各界意见(详见附件)。公示期自发布之日起一个月。蛋白质组学分析方法及应用指导原则公示稿(第二次).pdf蛋白质组学分析基本流程主要包括:1. 蛋白样品的提取,变性还原,酶解与多肽分离富集;2. 多肽的分析与鉴定;3. 数据分析。在分离和富集中采用凝胶电泳和色谱技术,分析与鉴定中采用质谱、二维凝胶电泳、X射线分析、核磁共振波谱和透射电子显微镜技术。蛋白质组学分析方法及应用指导原则第二次公示稿修改说明 根据 2024 年 2 月蛋白质组学分析方法及应用指导原则第一次公示稿的反馈 意见和建议,国家药典委员会相关专业委员会进行了研讨,在第一次公示稿的基 础上修订了部分内容,主要为:一、适用范围1. 将文中“蛋白”修改为“蛋白质”。二、蛋白质组学的分析策略 1. 将“通过质谱分析技术检测到肽指纹图谱进行多肽的鉴定和定量分析” 修改为“通过质谱分析技术检测肽段一级与二级谱图进行多肽的鉴定和定量分 析”。2. 将文中“图谱”修改为“谱图”。三、蛋白质组学分析方法 1.“2.1 质谱技术”增加其他质谱碎裂技术,修订为:“蛋白质组样品经过提 取、分离富集或者进一步变性还原、酶切、多肽分离富集处理后,选择适宜的分 离系统导入离子源离子化,电离生成带电荷离子,离子通过碰撞诱导解离 (Collision induced dissociation, CID)、高能碰撞诱导解离 High energy collision dissociation, HCD)、电子活化解离(Electron activated dissociation,EAD)或其 它适宜的解离技术进行碎片化,后在加速电场的作用下形成离子束进入质量分析 器,通过质量分析器分离和过滤不同质核比的离子,过滤后的离子最终经检测系 统转换为可测量的信号,从而得到质谱图,以获得蛋白质的相关信息”。 2. 将文中“质核比”修改为“质荷比”。 3. 将“数据库检索对肽段碎裂质谱谱图和数据库中的理论序列谱图进行匹 配,实现肽段鉴定”修改为“质谱数据文件的数据库检索对肽段碎裂质谱谱图和 数据库中的蛋白质计算机模拟消化肽段碎裂模式进行匹配,以进行肽段鉴定”。4. 将“肽谱图匹配(peptide spectrum matching,PSM)”,“肽谱图匹配 (peptide-spectrum matches,PSM)”,统一为“肽段谱图匹配 (peptide-spectrum matches, PSMs)”。 5. 将“统计学分析(如 p 值)”修改为“统计学指标(如 p 值)”。 2024 年 6 月 与第一次公示稿比较,修改处加橙色标记 四、蛋白质组学分析的质量控制 1. 在表 1 中增加样品处理中酶解漏切率、酶解位点特异性等 QC 评价指标 及描述;增加色谱分析中峰宽和半峰宽等 QC 评价指标及描述;增加质谱分析中TIC 图等 QC 指标及描述。2. 调整仪器性能参数的描述顺序。将“建议结合仪器的性能进行设置,例 如可将两个参数均设置为 20ppm,也可以将母离子质量误差设置为 10ppm,子离 子质量误差设置为 0.02Da”修改为“建议结合仪器的性能设置质量误差,如将母 离子质量误差设置为 10 ppm,子离子质量误差设置为 0.02 Da,也可将两个参数 均设置为 20 ppm”。3. 将“鉴定的蛋白质应具有至少 70%的覆盖率,即被鉴定的多肽的氨基酸 序列覆盖蛋白质氨基酸序列的百分比,70%的蛋白覆盖率可提高鉴定结果的可信 度和全面性”修改为“蛋白质覆盖率是指被鉴定的多肽的氨基酸序列覆盖蛋白质 氨基酸序列的百分比,70%及以上的蛋白质覆盖率可提高鉴定结果的可信度和全 面性”。
  • 安捷伦科技收购Lab901——扩展分子生物学应用的电泳产品线
    安捷伦科技收购Lab901&mdash &mdash 扩展分子生物学应用的电泳产品线 2011 年2 月28 日,北京 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布已收购位于英国爱丁堡的Lab901 公司,该公司是一家领先的电泳仪器和消耗品公司,其自动化电泳产品可用于DNA、RNA 和蛋白质分析。收购的财务细节尚未披露。 Lab901 公司主要开发和销售TapeStation 台式电泳仪、ScreenTape 塑料消耗品和相关的试剂。他们的客户包括传统制药、生物制药研发和质量控制领域的科学家,以及学术和政府科研机构。Lab901 成立于2001年,拥有大约45 名员工。 &ldquo 随着Lab901 卓越的技术和人才队伍的加入,安捷伦现在可以满足客户所有的电泳生命科学应用需求,涵盖半自动化到96 孔板兼容型工作流程&rdquo 安捷伦液相分离业务部副总裁Patrick Kaltenbach 说道,&ldquo Lab901 ScreenTape 系统将与安捷伦现有的2100生物分析仪平台以及G7100 毛细管电泳系统相结合,为广泛应用提供多功能、自动化并且可扩展的全套凝胶电泳解决方案。&rdquo Lab901 的ScreenTape 系统是一种快速、便捷的台式自动化凝胶电泳系统。客户只需将样品和ScreenTape 消耗品载入紧凑型TapeStation 仪器中,每个样品仅需不到1 分钟,即可轻松获得蛋白质、RNA 和DNA 样品的完整分析结果。 凭借其自动化、易用性和可扩展的独特性能,该系统将成为新一代测序和基因表达工作流程中样品质量控制,以及核心实验室中蛋白质电泳和DNA 片段分析的理想之选。在这些应用中,获取结果所需的时间以及数据的重现性至关重要。 &ldquo 我们早就意识到两家公司之间强烈的协同优势,&rdquo 将与其他员工一起加入安捷伦科技的Lab901 前CEO Joel Fearnley 说道,&ldquo Lab901 的创新技术、杰出产品和经验丰富的团队与安捷伦的文化和开拓性历史完美契合。我们期待着为全球客户提供一流产品的尖端组合,满足他们所有的电泳需求。&rdquo TapeStation 和ScreenTapes 系统将进一步完善安捷伦强大的电泳产品线。安捷伦2100 生物分析仪发布于1999 年,是首台利用微流控技术分析生物样品的商业化仪器。如今,它已成为市场领先的用于微阵列芯片、qPCR 和新一代测序工作流程中RNA 和DNA 质量控制(QC)的必有设备。安捷伦刚刚延长了该平台的芯片供货协议,并将继续为其开发新的应用。 2009 年发布的安捷伦 G7100 毛细管电泳系统是市场上功能最全面的台式电泳平台之一。它能够与UV(紫外吸收)、LIF(激光诱导荧光)、MS(质谱)、CCD(非接触电导检测器)等各种检测器相兼容。特别是G7100 能够与安捷伦广泛的质谱产品无缝整合,使其成为小分子、蛋白质和代谢组学研究和验证的不二之选。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的 18500名员工为 100多个国家的客户提供服务。在2010 财政年度,安捷伦的业务净收入为54 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。
  • “五洲同庆”凝胶成像图片大赛
    北京五洲东方科技发展有限公司的前身是成立于1988的北京东方科技公司,是中国科学院控股公司。依托中国科学院强大的技术背景,秉承" 五洲东方" 品牌,公司宗旨是引进全球最先进的产品,提供最优良的服务,促进中国科学技术进步。   公司主要经营进口实验室仪器和设备,为客户提供全面优质的实验室全套解决方案,同时还提供包括安装调试、使用指导、应用指导、维护保养和快速维修在内的整套售后服务。   2012年是北京五洲东方成立的第24个年度,今年的7月4日是我公司的司庆,为了答谢新老客户,让您与五洲东方公司24周年同庆,特此举办&ldquo 五洲同庆&rdquo 凝胶成像图片大赛活动,期待您的参加!   凝胶成像即对DNA/RNA/蛋白质等凝胶电泳不同染色(如EB、考马氏亮蓝、银染、SYBR Green)及微孔板、平皿等非化学发光成像检测分析。凝胶成像系统可以应用于分子量计算, PCR定量等生物工程常规研究。 凝胶成像种类:   1. 普通凝胶成像分析系统:可以对蛋白电泳凝胶,DNA凝胶样品进行图象采集并进行定性和定量分析,样品包括:EB、SYBR Green、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、 Radiant Red等染色的核酸监测;以及Coomassie Blue、SYPRO Orange、各种染色的蛋白质凝胶等。   2. 化学发光成像分析系统:成像范围涵盖UV,EB,化学发光、紫外-荧光、多色及可见样品成像;   3. 多色荧光成像分析系统:成像范围涵盖UV,EB,化学发光、多色荧光荧光、多色及可见样品成像;   4. 多功能活体成像分析系统:UV,EB,化学发光、多色荧光荧光、有色及可见样品成像和小型动物。 参赛说明: 一、活动名称:&ldquo 五洲同庆&rdquo 凝胶成像图片大赛 二、活动时间:2012年5月20日到8月20日 三、图片要求: (1)以凝胶成像系统拍摄的实验照片为主题,要求图片美观,清晰,平整 (2)作品题材为:核酸凝胶电泳图片,蛋白电泳图片以及化学发光图片。 (3)作品需附加100汉字以上文字说明,说明拍摄所用凝胶成像仪器品牌、型号(特别欢迎使用我公司独家代理的法国Vilber公司凝胶成像系统的师生参赛),您的研究方向,所发表的文章,您的姓名、电话、工作单位、邮箱。 (4)图片的大小为1M以下。 (5)照片必须是本人2012年拍摄的。 照片命名要求:工作单位-姓名-拍摄时间。 图片格式要求: JPEG格式。 (6)每人仅限参赛一次,每次最多可以发3张不同图片。 (7)照片附加信息需填写完整并且真实,以便我们联系客户并寄礼品,同时也是评奖的一个标准之一。 四、参赛方式:将您的照片和文字说明以邮件形式投送到g.y_liu@ostc.com.cn 五、评奖方式: 月度奖:每个月评一次月度奖,每次三个名额,奖品为精美4GU盘。满一个月后一周内网上公布获奖名单和参赛作品。 季度大奖:最终评出三个季度奖获奖作品,奖品均为Apple Ipod Nano,活动结束后一周内网上公示获奖名单和参赛作品。 六、五洲东方公司保留对此次活动的最终解释权。
  • 【综述】蛋白质组学研究进展
    p style=" text-align: center " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201601/insimg/4a14f65e-cb82-47d8-87d5-ea4b0d204756.jpg" title=" sss_56a5b6877c56c.jpg" / /p p   1、蛋白质组和基因组 br/ /p p   蛋白质组是指一种基因组所表达的全套蛋白质1,其英文为“proteome”。 有关蛋白质组的系统研究是蛋白质组学,英文为“proteomics”。基因组是生命体中全部基因的集合体,其英文为“genome”。有关基因组的系统研究是基因组学,其英文为“genomics”。 “proteome”和“proteomics”是由Marc Wilkins 及其同事于20世纪90年代初参照基因组和基因组学两个英文单词而创造出来的2。蛋白质组学是研发、利用、改进各种技术手段研究蛋白质组或在细胞某一生理通路中相关蛋白质集合的组成、结构、功能、代谢的一门新兴科学。 /p p   基因决定蛋白质的水平,然而,蛋白质的水平分为转录水平和表达水平,mRNA只包含前者,后者则是由mRNA被翻译所实现,而在翻译过程中通常伴随对蛋白质功能和活性起至关重要的修饰过程,如糖基化、泛素化等3。通过研究蛋白质组学,可以获取蛋白定位与修饰的定性信息和相关定量数据,丰富认知蛋白质表达水平和相关蛋白作用,对了解生命复杂活动有更深更全的认识。 /p p   2、蛋白质组的发展背景 /p p   自二十世纪九十年代以来,传统生物学得以突飞猛进地发展,并取得瞩目成就,其中三个重要点彪炳史册,也促使传统生物学获得质的转变。 /p p   第一 基因、表达序列标记(EST, expressed sequence tag)、蛋白质序列数据库的成长。细菌、酵母、线虫、果蝇的全部基因序列逐渐明了,甚至后来人类基因组计划也顺利告捷 其它的植物、动物、微生物也不断在探索。人们把已经掌握的基因分门别类地建立了序列数据库。 /p p   第二 生物信息学的发展。易获取的浏览型生物信息工具层出不穷,这种免费的网页式数据库可以让我们从其中获得所需的特殊的物质结构,如蛋白质结构中的结构域和模体等。 /p p   第三 寡核苷酸微阵列技术的发展。通过不同荧光标记的DNA样本同时与微阵列反应,形成不同荧光的现象,大幅提高Northern blot 的效率4。 /p p   3、蛋白质组学分类 /p p   蛋白质组学分类可有不同原则。 /p p   根据蛋白质来源可分为植物蛋白质组学、动物蛋白质组学、微生物蛋白质组学。植物蛋白质组学是以来源于植物或与植物相关蛋白质为研究对象,分析其在植物发生、生长、调节、凋谢等生命过程中的作用、功能、代谢、结构等的体系。同理,动物蛋白质组学是以来源于动物或与动物相关蛋白质为研究对象,最重要的一大内容就是研究人类相关蛋白质。微生物蛋白质组学是以来源于微生物或与微生物相关蛋白质为研究对象。 /p p   根据研究目的和阶段不同可分为结构蛋白质组学、表达蛋白质组学、功能蛋白质组学。结构蛋白质组学主要分析蛋白质大分子的多级结构形态,包括氨基酸顺序、二级结构、三级结构和四级结构 并着重于研究其共性结构特征和特殊功能基团 也是用于建立细胞内信号转导的网络图谱并解释某些特定蛋白表达对细胞产生特定的作用5。表达蛋白质组学是以经典蛋白质组技术如双向凝胶电泳和图像分析为方法着重于研究细胞内蛋白质表达过程及结果的体系3。功能蛋白质组学是以细胞内单一同种蛋白质功能体现、蛋白质之间、蛋白质与其他大分子之间相互作用关系为研究目的,研究和表述选定蛋白质,探明有关蛋白的修饰和信号转导通路,疾病机制或蛋白-药物作用关系3。 /p p   根据研究内容,还可分为组成性蛋白质组学、差异显示蛋白质组学、相互作用蛋白质组学。组成性蛋白质组学是鉴定某个体系的蛋白质并阐述其翻译后修饰的特性。差异显示蛋白质组学又名比较蛋白质组学,是对重要生命过程或人类重大疾病进行生理、病理体系或过程的蛋白质表达比较。相互作用蛋白质组学则是研究蛋白质间相互作用,绘制某体系蛋白质作用网络图谱8。 /p p   4、白质组学研究工具 /p p   蛋白质组学研究的重要工具主要有四个。 /p p   第一,蛋白质、表达序列标记(EST, expressed sequence tag)、基因序列数据库的建立与成熟 也可以说是生物信息学。因为蛋白质组学中所用的大多数技术所获得的数据通常都是高通量、高复杂度的,只有通过生物信息学分析才能对蛋白质的种类、结构和功能进行分析确定。 /p p   第二,质谱(MS)技术。其将样品分子离子化,根据离子间质荷比的差异分离并确定质量,实现高灵敏度、高特异性。首先,质谱技术能准确测量高达100kDa的完整大分子蛋白质,其准确度和特异度比SDS-PAGE还要高。其次,质谱技术也能准确测量从蛋白质分解下来的多肽。最后,它还可以测定多肽的氨基酸顺序,即多肽测序4。现有三条途径,一是肽链质量图谱,二是串联质谱途径,三是联合途径7。其中一种较理想的技术平台是表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SEL-DI)技术,可分析疏水性蛋白质、pI过高或过低蛋白质、低分子量蛋白质(& lt 25 000)和未经处理的样品中许多被掩盖的低浓度蛋白质,短时间内即可获得蛋白质的分子量、PI、特殊修饰位点等参数8。 /p p   第三,能将MS数据与数据库中特异的蛋白质顺序匹配的软件。它是快速、特异地将第一和第二工具联系在一起的分析方式。 /p p   第四,蛋白分析分离方法。通过蛋白分析分离方法可以简化蛋白复合物,同时产生不同蛋白质差异比较方法。普通的蛋白质分析分离方法包括1D-SDS-PAGE、高效液相色谱法(HPLC)、毛细管电泳(CE)、等点聚焦电泳(IEF)等。其中二维凝胶电泳如2D-SDS-PAGE是目前蛋白质组学中分离单一蛋白质的广泛应用方法。当然,多维分析分离方法是最理想的分离蛋白质和多肽的方法,譬如,离子交换液相色谱与反相高效液相色谱串联形成的分离系统是分离多肽混合物的有力方法4。 /p p   5、白质组学的应用 /p p   蛋白质组学原则性应用包括四个方面4:组成性应用、蛋白质表达模型、蛋白质网络图谱、蛋白质修饰图谱。组成性应用是指运用质谱及其相关技术将目的蛋白质按相关标准定性或定量地纳入蛋白质数据库,在此过程中研发相应技术的应用。蛋白质表达模型是指研究在生理或病理状态目的蛋白质在细胞内定位并表达情况,同时研究细胞在暴露物理、化学、药物等因素下蛋白质表达状况。蛋白质网络图谱是研究两种或两种以上蛋白质在生物体内组成结构、表达功能、调节控制间作用情况。蛋白质修饰图谱是探明蛋白质的修饰定位及修饰后功能表现。 /p p   当然,蛋白质组学在生活中无处不在,疾病、食品、植物、药品等等。 /p p   蛋白质组学在疾病中应用方向主要是发现新的疾病标志物,以探明疾病发生机制、发展变化,为治疗途径提供思路。Brea等利用双向电泳串联质谱技术,差异比较心源性脑栓塞患者和粥样硬化血栓性梗死患者各12例的血清蛋白,发现触珠蛋白相关蛋白和淀粉样蛋白A等蛋白质在粥样硬化血栓性梗死患者血清中显著升高9。 /p p   蛋白质组学在食品中应用方向主要是检测食品中过敏源检测、鉴定食品成分等,也给食品科学研究提供了新的研究思路和技术3。李明云等优化了相应的试验条件,并将蛋白质组双向电泳相关技术引入大黄鱼肝脏蛋白质分析中,得到了较清晰的大黄鱼肝脏蛋白双向电泳图谱。 /p p   蛋白质组学在植物中应用方向主要是植物群体遗传、环境信号应答与适应机制、植物组织器官、植物亚细胞等7。其中,如果研究的植物是农作物如棉花、马铃薯、水稻等,就可以简单地视作蛋白质组学在农业中的运用了。Chang等对玉米强制缺氧和低氧研究,发现低氧处理的效应不仅是氧气含量过低诱导增加糖酵解酶,通过质谱鉴定了46个相关蛋白质10。 /p p   蛋白质组学在药品中应用方向主要是药物研发、药物作用机制、耐药机制、药物毒理学等。在对紫杉醇类药物抗癌作用研究中,Bauer等对乳腺癌复发患者进行紫杉醇类药物治疗后进行蛋白质组学分析,发现a-防卫素可作为预测该类药物治疗乳腺癌治疗作用的生物标记物11。 /p p   6、展望 /p p   蛋白质组学在短短30年间发展迅猛,渗入到生活的许多方面,也对保证人类生存质量和良性繁衍有重大作用。但其思路不开阔,技术高效性、灵敏性、特异性仍有待提高,应用普及度低,蛋白质分离、纯化技术研发,基因组学丰富度低是制约蛋白质组学及其相关技术发展的瓶颈。不过,相信随着物理技术和化学方法的不断发展,研究水平的深入,蛋白质组学会随着基因组学的发展得到更进一步地丰富。 /p p   参考文献: /p p   1.诗,吕建新主编《分子生物学检验技术》第2版 /p p   2.Pandey A, Mann M. Proteomics to study genes and genomics [J] Nature,2000,405(6788):837-846. /p p   3.尹稳、伏旭、李平《蛋白质组学的应用研究进展》 [J]. 生物技术通报 2014年第1期 /p p   4.aniel C. Liebler《Introduction to Proteomics》:1-13 /p p   5.英超,党源,李晓艳,等. 蛋白质组学及其技术发展 [J]. 生物技术通讯,2010,21(1):139-144. /p p   6.鑫《比较蛋白质组学研究与应用进展》[J]. 国际免疫学杂志 2006年5月第29卷第3期:156-159 /p p   7.宇,荆玉祥,沈世华《植物蛋白质组学研究进展》 [J] 植物生态学报,2004,28(1):114-125 /p p   8.ore LE,Pfeiffer R,Warner M,et al. Identification of biomarkers of arsenic exposure and metabolism in urine using SELDI technology . Biochem Mol Toxicol , 2005,19(3):176. /p p   9.rea D,Sobrino T,Blanco M, et al. Usefulness of haptog lob in and serum amyloid A proteins as biomarkers for atherothrombotic ischemic stroke diagnosis confirmation [J]. Atherosclerosis,2009,205:561-567. /p p   10.ng,W.W.,L.Huang,M.Shen,C.Webster,A.L.Burlingame& amp J.K.Roberts.2000.Patterns of protein synthesis and tolerance of anoxia in root tips of maize seedlings acclimated to a low oxygen environment,and identification of proteins by mass spectrometry.Plant Physiology,122:295~318. /p p   11.er JA,Chakravanhy AB,Rosenbluth JM,et al.Identification of markers of taxane sensitivity using proteomic and genomic analyses of breast tumors from patients receiving neo-adjuvant paclitaxel and radiation[J].Clin Cancer Res,2010,16(2):681-690. /p p br/ /p
  • 岛津应用:蛋白质测序仪PPSQ-53A分析贝伐单抗N-末端氨基酸序列
    贝伐单抗是重组的人源化单克隆抗体。2004年2月26日获得FDA的批准,是美国第一个获得批准上市的抑制肿瘤血管生成的药。本文应用 SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳)将贝伐单抗的重链和轻链进行分离,使用电转印方法将 SDS-PAGE膜上的样品转移到PPSQ使用的PVDF膜上,使用蛋白质测序仪PPSQ-53A对贝伐单抗进行N-末端氨基酸序列分析。实验结果显示测定的重链和轻链的N-末端氨骏序列与理论相符,验证了方法的准确性,表明此方法适合抗体药N-末端的氨基酸序列分析。本文可作为分析抗体药N-末端氨基酸序列分析时的参考。 了解详情,敬请点击《蛋白质测序仪PPSQ-53A分析贝伐单抗N-末端氨基酸序列》关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理商网络以及60多个技术服务站,已构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。本公司以“为了人类和地球的健康”为经营理念,始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务,为中国社会的进步贡献力量。
  • “翻译后修饰蛋白质组技术及应用”专题学术研讨会召开
    仪器信息网讯,2009年11月24日由中国生物化学与生物学会蛋白质组学专业委员会、北京蛋白质组研究中心、岛津国际贸易(上海)有限公司共同主办的题为“翻译后修饰蛋白质组技术及应用”研讨会在北京蛋白质组研究中心成功举办,约200多位多从事相关研究的学者出席了此次研讨会 会议由钱小红教授、杨芃原教授共同主持。   在大会上做报告的专家有:Koichi Tanaka(田中耕一,岛津公司研究实验室,2002年诺贝尔化学奖获得者),Catherine Fenselau (University of Maryland),Robert J. Cotter (Johns Hopkins University), Emmanuel Raptakis (Kratos Analytical., Shimadzu Biotech), Pengyuan Yang(复旦大学),Siqi Liu (Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences), Xiaohong Qian (Bdijing Proteome Research Center) Fuquan Yang, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences) Koichi Tanaka(田中耕一,岛津公司研究实验室,2002年诺贝尔化学奖获得者)   Title:MALDI Matrix Development History   蛋白质是生命的物质基础,每一种生命运动形式,都是特定蛋白质群体发挥功能的结果;因而蛋白质组研究是人类研究细胞功能和疾病发生发展过程的中心环节。目前蛋白质组研究采用的主要技术是双向凝胶电泳和质谱法。具备测定大分子、快速、大规模分析的MALDI-TOF技术是用于蛋白质组分析的主要手段之一,并被认为是蛋白质分析领域的一项重大突破。在蛋白质组研究中,除了研究蛋白质一级结构外,还要对翻译后修饰的进一步分析,如蛋白质的糖基化、蛋白质的磷酸化等,MALDI-TOF在其中发挥了极其重要的作用。   田中耕一先生发明的“激光解吸附软电离技术”使分析生物大分子成为可能。MALDI是这一技术直接的商品化,广泛用于测定多肽和蛋白质的分子量、肽指纹图谱、以及氨基酸序列等。   Catherine Fenselau (University of Maryland)   Title: Proteomic Strategies for Longer Peptides: How and Way   Robert J. Cotter (Johns Hopkins University)   Titel: Characterization of Protein Post-Translational Modifications Using MALDI Mass   Emmanuel Raptakis (Kratos Analytical., Shimadzu Biotech)   Title: Using the Power of a MALDI-quadrupole Ion Trap-TOF to Elucidate Structures of Complex Biomolecules   Pengyuan Yang(复旦大学)   Titel:Mass Spectrometry Based Protein Glycosylation Analysis   Siqi Liu (Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences)   Title: Proteomic and Functional Analysis Towards the Nitrated Proteins in the Heart Mitochondria of db/db Diabetic Muse Model   Xiaohong Qian (Beijing Proteome Research Center)   Titel:Globel Analysis of Core-fucosylated Glycoprotein   Fuquan Yang, (Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences)   Title: Phosphoproteome Analysis of Rat L6 Myotubes Using Reverse Phase C18 Prefractionation and Titanium Oxide Enrichment 大会现场
  • 岛津推出《蛋白质测序仪PPSQ在生物药N-末端氨基酸序列分析的应用》方案
    —抗体药、蛋白质药、N-末端甲硫氨酸缺失或焦谷氨酸环化封闭等—? 目前,在制药领域,生物药得到越来越多的关注。生物药是利用DNA重组、细胞融合、细胞培养等生物技术开发出的蛋白质药物、抗体药物等。几乎所有蛋白质合成都起始于N-末端,其序列组成对于蛋白质整体的生物学功能有着重要的影响力,因此蛋白质的序列分析对于生物药效果非常关键。 2015版《中国药典》三部人用重组DNA技术产品总论对生物药的生产及质量控制方面,,针对其蛋白质结构提出技术要求,应测定目标产品的氨基酸序列,并与其基因序列推断的理论氨基酸序列进行比较。因此,N-末端氨基酸序列分析是很多已上市生物药的年检项目,如重组人促红素注射液(CHO细胞) 、重组人粒细胞刺激因子注射液等。此外,国际法规中也有对于生物药N-末端氨基酸序列测定的要求。药品注册的国际协调组织颁布的指导法规ICH-Q6B规定,生物药进行申报时,必须提供N-末端氨基酸序列信息。《欧洲药典》中规定,生物仿制药申报也必须提供N-末端序列。 Edman降解法是蛋白质N-末端测序的常用方法,岛津公司的蛋白质测序仪(Protein Sequencer)PPSQ以Edman降解法为基础,将蛋白质从N-末端顺次切断进行序列分析。此方法具有直接测定、可靠性高的优势。近期,岛津推出新型的蛋白质测序仪PPSQ 51A/53,配备SPD-M30A高灵敏度检测器、软件满足FDA 21 CFR Part 11数据完整性的要求。PPSQ 51A/53梯度系统更是在等度系统基础上,提高检测灵敏度,适合微量样品的氨基酸序列分析。我们应用岛津PPSQ 51A/53A开发了单克隆抗体药、重组蛋白药的N-末端氨基酸序列分析方法,另外,也开发了具有特殊结构的生物药N-末端氨基酸序列分析方法,如甲硫氨酸缺失、焦谷氨酸环化封闭等样品,编写了《蛋白质测序仪PPSQ在生物药N-末端氨基酸序列分析的应用》文集:包括经十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳分离轻链和重链,从而测定N-末端氨基酸序列的单克隆抗体药贝伐单抗和曲妥珠单抗等;含有特殊结构的如N-末端部分甲硫氨酸缺失的重组人粒细胞巨噬细胞刺激因子注射液原液、N-末端焦谷氨酸环化封闭类单克隆抗体帕尼单抗、含有二硫键的溶菌酶和催产素;用自制的脱盐装置分析具有高浓度盐的蛋白质药物重组人促红素原液(CHO细胞)和重组人粒细胞刺激因子注射液。关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理商网络以及60多个技术服务站,已构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。本公司以“为了人类和地球的健康”为经营理念,始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务,为中国社会的进步贡献力量。
  • 第四期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)
    北京蛋白质组研究中心 第四期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)   蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2011年11月15-18日在北京中关村生命科学园联合举办“第四期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。   北京蛋白质组研究中心(BPRC)于2004年成立,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金项目等100余项重要科研项目,拥有行业内高端实验设备及研究人才。   本期培训班由北京蛋白质组研究中心、军事医学科学院等国内从事蛋白质组学研究的一线专家授课,11月15-16日进行“蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点”等主题讲座,17-18日实验演示观摩。培训班结束后颁发蛋白质组学培训证书。   一、培训内容   (一)讲座   蛋白质组学理论、策略与应用 钱小红   蛋白质组学研究中的样本制备技术 姜 颖   蛋白质组学研究中的分离技术 张养军   生物质谱及其在蛋白质组研究中的应用 蔡 耘   蛋白质组信息学 朱云平   定量蛋白质组学研究方法与应用 应万涛   定量蛋白质组学研究中的实验设计 徐 平   蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建   蛋白质相互作用数据分析 李 栋   多肽组学技术与应用 魏开华   蛋白质组学前沿与热点 秦 钧   参观北京蛋白质组研究中心   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置,以及搜库技巧等。   二、注意事项   1. 培训结束后颁发北京蛋白质组研究中心和蛋白质组学国家重点实验室培训证书,如果需要中国生物化学与分子生物学会证书的学员需要另交1张2寸免冠照片,及20元工本费。   2. 中心通过了ISO/IEC 17025(CNAS-CL01)实验室认可,为社会各界提供科研技术服务。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。技术服务项目请看网站 http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27   3. 参会学员可以凭代表证以优惠价格购买正旦国际蛋白质组学任意一款产品。产品列表请看网站:http://www.bprc.ac.cn/guidance/show.php?itemid=21   三、时间和地点   报到:2011年11月14日1全天,北京扬子江药业海诺康会馆(北京市昌平区中关村生命科学园生命园路16号 15日8:30-10:00,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区中关村生命科学园科学园路33号)。   培训:2011年11月15-18日,北京蛋白质组研究中心。   四、参加办法及培训费用   网上注册地址: http://61.50.138.116/training/cn/   优惠截止日期:2011年10月14日,以银行汇款凭证为准。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。   (一)讲座   2011年10月14日前注册:每人1300元,学生1100元。   2011年10月15日至11月15日之间注册:每人1400元,学生1200元。   (二)实验演示观摩   2011年10月14日前注册:每人¥650元/项/半天,学生450元/项/半天。   2011年10月15日至11月15日之间注册:每人¥700元/项/半天,学生500元/项/半天。   学生报到时须持学生证。   五、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   六、联系方式   联系人及电话:注册:周建平(010)80705277   咨询:史冬梅(010)80705888   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)   北京蛋白质组研究中心   蛋白质组学国家重点实验室   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会   2011年8月15日
  • 第六期蛋白质组学技术与应用高级培训班第一轮通知
    北京蛋白质组研究中心 第六期蛋白质组学技术与应用高级培训班 (第一轮通知)   蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心于2012年11月13-16日在北京举办“第六期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。培训班由蛋白质组学国家重点实验室、军事医学科学院等从事蛋白质组学研究的一线专家亲自授课,通过技术讲座结合实验操作,展示应用实例,现场解答科研疑问,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。   一、主办单位   北京蛋白质组研究中心(BPRC)   蛋白质组学国家重点实验室(SKLP)   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)   北京蛋白质组研究中心成立于2004年,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金等100余项重要科研项目,拥有行业内高端实验设备及研究人才。   二、培训内容   (一)技术讲座   蛋白质组学理论、策略与应用 钱小红   蛋白质组学前沿与热点 秦 钧   蛋白质组学研究中的样本制备技术 姜 颖   蛋白质组学研究中的分离技术 张养军   生物质谱及其在蛋白质组研究中的应用 蔡 耘   蛋白质组信息学 朱云平   定量蛋白质组学研究方法与应用 应万涛   定量蛋白质组学研究中的实验设计 徐 平   蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建   蛋白质相互作用网络的知识发现 李 栋   多肽组学技术与应用 魏开华   参观北京蛋白质组研究中心   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置以及搜库技巧等。   三、时间和地点   培训:11月13-16日,北京蛋白质组研究中心。   报到:11月12日全天,北京扬子江药业海诺康会馆(北京市昌平区生命园路16号中,关村生命科学园内) 13日8:30-10:00,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路33号,中关村生命科学园内)。   住宿:北京扬子江药业海诺康会馆,标准间298元/天(含早餐)   四、培训费用   (一)讲座   10月12日前注册:每人1300元,学生1100元。   10月13日至11月13日之间注册:每人1400元,学生1200元。   (二)实验演示观摩   10月12日前注册:每人650元/项/半天,学生450元/项/半天。   10月13日至11月13日之间注册:每人700元/项/半天,学生500元/项/半天。   其他优惠:同一单位2人参加相同课程,每人可以享受10%的优惠 3人以上参加相同课程,每人可以享受20%的优惠。   提前注册截止日期:2012年10月12日,以银行汇款凭证为准。   网上注册地址: http://61.50.138.116/training/cn/   学生报到时须持学生证。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。   五、注意事项   1. 培训结束后颁发北京蛋白质组研究中心和蛋白质组学国家重点实验室培训证书,如果需要中国生物化学与分子生物学会继续教育证书的学员需要另交1张2寸免冠照片及20元工本费。   2. 中心通过了ISO/IEC 17025实验室认可,为社会各界提供科研技术服务。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。技术服务项目请看网站: http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27   六、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   七、联系方式   联系电话:注册:周建平,董微(010)80705277   咨询:史冬梅(010)80705888   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)
  • 第五期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)
    蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展, 北京蛋白质组研究中心(BPRC)于2012年7月17-20日在北京举办“第五期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。 授课团队由蛋白质组学国家重点实验室、军事医学科学院等国内从事蛋白质组学研究的一线专家组成。   一、 组织机构   主办单位: 北京蛋白质组研究中心   蛋白质组学国家重点实验室   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会   BPRC成立于2004年,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金项目等100余项重要科研项目,拥有行业内高端实验设备及研究人才。   二、培训内容   (一)技术讲座   蛋白质组学理论、策略与应用 钱小红   蛋白质组学前沿与热点 秦 钧   蛋白质组学研究中的样本制备技术 姜 颖   蛋白质组学研究中的分离技术 张养军   生物质谱及其在蛋白质组研究中的应用 蔡 耘   蛋白质组信息学 朱云平   定量蛋白质组学研究方法与应用 应万涛   定量蛋白质组学研究中的实验设计 徐 平   蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建   蛋白质相互作用数据分析 李 栋   多肽组学技术与应用 魏开华   参观北京蛋白质组研究中心   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置,以及搜库技巧等。   三、时间和地点   培训:7月17-20日,北京蛋白质组研究中心。   报到:7月16日全天,北京扬子江药业海诺康会馆(北京市昌平区中关村生命科学园生命园路16号 17日8:30-10:00,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区中关村生命科学园科学园路33号)。   住宿:北京扬子江药业海诺康会馆,标准间298元/天/两人(含早餐)   四、培训费用   (一)讲座   6月15日前注册:每人1300元,学生1100元。   6月16日至7月17日之间注册:每人1400元,学生1200元。   (二)实验演示观摩   6月15日前注册:每人¥650元/项/半天,学生450元/项/半天。   6月16日至7月17日之间注册:每人¥700元/项/半天,学生500元/项/半天。   其他优惠:同一单位2人参加培训班,每人可以享受10%的优惠 3人以上参加,每人可以享受20%的优惠。  提前注册截止日期:2012年6月15日,以银行汇款凭证为准。   网上注册地址: http://61.50.138.116/training/cn/   学生报到时须持学生证。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。   五、注意事项   1. 培训结束后颁发北京蛋白质组研究中心和蛋白质组学国家重点实验室培训证书,如果需要中国生物化学与分子生物学会证书的学员需要另交1张2寸免冠照片,及20元工本费。   2. 中心通过了ISO/IEC 17025实验室认可,为社会各界提供科研技术服务。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。技术服务项目请看网站 http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27   六、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   七、联系方式   联系电话:注册:董 微(010)80705277   咨询:史冬梅(010)80705888   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)
  • 第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班第一轮通知
    蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2011年7月19-22日在北京中关村生命科学园联合举办“第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。   北京蛋白质组研究中心(BPRC)于2004年成立,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金项目等100余项重要科研项目。   本期培训班由北京蛋白质组研究中心、军事医学科学院等国内从事蛋白质组学研究的一线专家授课,7月19-20日进行“蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点”等主题讲座,21-22日实验演示观摩。培训班结束后颁发蛋白质组学培训证书。   一、培训内容   (一)讲座   蛋白质组学理论、策略与应用 钱小红   蛋白质组学研究中的样本制备技术 姜 颖   蛋白质组学研究中的分离技术 张养军   生物质谱及其在蛋白质组研究中的应用 蔡 耘   蛋白质组信息学 朱云平   定量蛋白质组学研究方法与应用 应万涛   定量蛋白质组学研究中的实验设计 徐 平   蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建   蛋白质相互作用数据分析 李 栋   多肽组学技术与应用 魏开华   蛋白质组学前沿与热点 秦 钧   参观北京蛋白质组研究中心   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置,以及搜库技巧等。   二、注意事项   1. 为了尽可能多的解答学员疑问,请在报名回执表中填写您的问题,我们汇总后将其交到相关专家手中以便在课中回答。   2. 培训结束后颁发北京蛋白质组研究中心和蛋白质组学国家重点实验室培训证书,如果需要中国生物化学与分子生物学会证书的学员需要另交2张2寸免冠照片,及20元工本费。   3. 中心通过了ISO/IEC 17025(CNAS- CL01)实验室认可,为社会各界提供科研技术服务。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。技术服务项目请看网站 http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27   4. 参会学员可以凭代表证以优惠价格购买正旦国际蛋白质组学任意一款产品。产品列表请看网站:http://www.bprc.ac.cn/guidance/show.php?itemid=21   三、时间和地点   报到:2011年7月18日13:30-21:00,北京扬子江药业海诺康会馆(北京市昌平区中关村生命科学园生命园路16号 19日9:00-10:00,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区中关村生命科学园科学园路33号)。   培训:2011年7月19-22日,北京蛋白质组研究中心。   四、参加办法及培训费用   网上注册地址: http://61.50.138.116/training/cn/   优惠截止日期:2011年6月17日,以银行汇款凭证为准。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。   (一)讲座   2011年6月17日前注册:每人1300元,学生1100元。   2011年6月18日至7月19日之间注册:每人1400元,学生1200元。   (二)实验演示观摩   2011年6月17日前注册:每人¥650元/项/半天,学生450元/项/半天。   2011年6月18日至7月19日之间注册:每人¥700元/项/半天,学生500元/项/半天。   学生报到时须持学生证。   五、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   六、联系方式   联系人及电话:注册:周建平(010)80705888   咨询:史冬梅(010)80727777-1520   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)   北京蛋白质组研究中心   蛋白质组学国家重点实验室   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会   2011年3月8日
  • 高性价比!7款中小型实验室用凝胶成像仪介绍
    p    strong 琼脂糖凝胶电泳分离技术 /strong 是分子生物学实验室进行分离、鉴定和提纯DNA片段最常用的方法。通过在制胶时掺入或制胶后染色的方式,使荧光染料结合在DNA分子上,在特定光源的照射下便可确定DNA分子的位置。 /p p   早期,用于DNA琼脂糖凝胶染色的染料多为EB(溴化乙锭),EB可以嵌入到DNA分子碱基对之间,在紫外光的激发下发出强的荧光。EB由于其灵敏度高、稳定,而广受欢迎,但由于EB为强诱变剂,具有高致癌性,后期,EB逐渐被一些EB替代物如GoldView、GelRed、Gelsafe等所替代。 /p p   随着生物技术的发展,各大公司也在不断的改进技术,对产品和技术创新升级,使产品在使用和用户体验上朝着更快、更好、更安全的方向发展。凝胶成像仪种类很多,本篇文章盘点了7款近几年上市的性能优越的凝胶成像仪,罗列其特点和优势以供读者参考。 /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 1. 赛默飞 E-Gel Power Snap 凝胶电泳系统 /strong /span /p p    /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/da25050c-1734-4306-a844-96104f559fce.jpg" title=" 赛默飞 E-Gel Power Snap 凝胶电泳系统.jpg" alt=" 赛默飞 E-Gel Power Snap 凝胶电泳系统.jpg" / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(127, 127, 127) " 赛默飞 E-Gel Power Snap 凝胶电泳系统 /span br/ /p p   前面说到虽然国内很多分子实验室都将EB替换为低毒的GoldView、GelRed、Gelsafe等分子染料,但大部分仍还是采用紫外光激发,实验操作者在观察凝胶尤其是切胶时还是会暴露在紫外下。 /p p   赛默飞E-Gel sup TM /sup Power Snap电泳系统整合了快速实时的核酸电泳和高分辨率成像功能,为实验者提供无与伦比的便利性。一个小型的台式设备,配备有蓝光透射仪,可以在电泳过程中实时观察条带迁移,相比紫外透射更加安全,可以避免紫外光对DNA的伤害,大大提高下游克隆效率和片段回收率。并且这种整合式设计减少了大量的流程时间,加速科研发现。此外,它还自带琥珀色滤光片,可用于对预染了Invitrogen sup TM /sup SYBRTM Safe 或 SYBR sup TM /sup Gold染料的Invitrogen sup TM /sup E-Gel sup TM /sup 琼脂糖凝胶中的样品进行实时样品追踪。此设备预设多种程序方案,适用于不同类型的E-Gel琼脂糖凝胶。 /p p style=" text-indent: 2em " 产品特点 /p p    strong 1 快速分析 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 从上样到成像,最快仅需15分钟; /p p    strong 2 操作简单 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 大尺寸触摸屏,直观的用户界面和操作系统; /p p    strong 3 安全方便 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 配合使用Invitrogen sup TM /sup E-Gel sup TM /sup 预制胶,将化学品危害降至最低。小巧台式设计,快速电泳、彩色触摸屏,整合了凝胶成像功能等。 /p p    a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C277328.htm" target=" _self" strong 更多详情请点击专场 /strong /a & nbsp /p p style=" text-align: center "    strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 2 伯乐 GelDoc EZ凝胶成像系统 /span /strong /p p style=" text-align: center "    img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/22c28d0c-b8c3-4f76-896a-ff7c61fddd2e.jpg" title=" Bio-Rad GelDoc EZ凝胶成像系统.jpg" alt=" Bio-Rad GelDoc EZ凝胶成像系统.jpg" style=" text-align: center " / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(127, 127, 127) " Bio-Rad GelDoc EZ凝胶成像系统 /span br/ /p p style=" text-indent: 2em " Bio-Rad GelDoc EZ凝胶成像系统是很结构很紧凑的全自动成像系统,操作灵活性很强。 /p p style=" text-indent: 2em " 产品特点 /p p   strong  1 整合了免染技术 /strong /p p   样品无需通过染色和脱色步骤,电泳结束后2.5分钟即可进行自动成像和结果分析输出。加速您的科研流程 /p p    strong 2 省时高效 /strong 2小时的考马斯亮蓝染色的步骤省略,直接清洗后5分钟内即可得到高质量的图像结果。 /p p    strong 3 兼容后续实验步骤 /strong /p p   使用了Stain-Free技术的凝胶可以满足Western Blot、条带切取、质谱鉴定等后续实验要求。并可在电泳结束后快速鉴定实验结果。 /p p    strong 4 高灵敏度 /strong 考马斯亮蓝相比,灵敏度更高,且由于避免了染色和脱色步骤,定量重复性更高。 /p p    strong 5 绿色环保 /strong /p p   整个过程无污染物产生,所有试剂可直接排放。 /p p    strong 6 方便使用 /strong /p p   不用再考虑如何手工设置滤光片、光圈、聚焦、光源等参数,实验室的任何人员都能得到重复性极高的实验结果,期间避免了人工因素引入的误差。 /p p style=" text-indent: 2em " a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C294278.htm" target=" _self" strong 更多详情请点击专场 /strong /a & nbsp /p p style=" text-align: center "    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 3 Azure Biosystems C150凝胶成像系统 /strong /span /p p style=" text-align: center "    img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/62763b0f-c577-4e1e-a053-85b4a9422a7b.jpg" title=" Azure Biosystems C150凝胶成像系统.jpg" alt=" Azure Biosystems C150凝胶成像系统.jpg" style=" text-align: center " / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(127, 127, 127) " Azure Biosystems C150凝胶成像系统 /span br/ /p p   此款c150凝胶成像仪使用染料/荧光染料时,系统将自动选择光源和滤光片。UV用于EB染色DNA凝胶成像,蓝光用于SYBR& reg Safe 或者类似染料成像,白光光源用于银染或考马斯亮蓝染色蛋白凝胶成像。为基础型凝胶成像系统,推荐为预算有限的实验室准备。 /p p   产品特点 /p p    strong 1 聚焦技术 /strong /p p style=" text-indent: 2em " strong & nbsp /strong 图像采集时,自动选择最佳的焦距和镜头设置,无需手动调节; /p p    strong 2 紫外波长& nbsp /strong /p p style=" text-indent: 2em " 302nm和365nm,兼容多种染料EB、SYBR系列染料、荧光素、RadianRed& reg ,TexasRed& reg ,SYPRO RED和免染胶成像; /p p    strong 3 70nm EPI蓝光& nbsp /strong /p p style=" text-indent: 2em " 所有系统标配蓝光光源,可激发安全染料例如SYBR& reg Safe等染料,让用户使用对样品DNA以及环境伤害更小的安全染料; /p p    strong 4 合一体设计& nbsp /strong /p p style=" text-indent: 2em " 内置平板电脑:10.1英寸触摸屏,可连接网络,具有WiFi和蓝牙功能。 /p p    a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C277806.htm" target=" _self" strong 更多详情请点击专场& nbsp /strong /a /p p style=" text-align: center "    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 4 博鹭腾BLT GV 1500 Pro全自动凝胶成像系统 /strong /span /p p style=" text-align: center "    img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/3d98d8e3-1590-4b64-b436-0822ee91f6cd.jpg" title=" BLT GV 1500 Pro全自动凝胶成像系统.jpg" alt=" BLT GV 1500 Pro全自动凝胶成像系统.jpg" style=" text-align: center " / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(127, 127, 127) " 博鹭腾BLT GV 1500 Pro全自动凝胶成像系统 /span br/ /p p    span style=" text-indent: 2em " 博鹭腾BLT GV 1500 Pro全自动凝胶成像系统具有全新设计暗箱,且具备专利的广角发射滤光片技术,使二相色镜和宽带通滤光片的完美结合,有效去除杂散光,提高荧光检测的灵敏度。 /span /p p style=" text-indent: 2em " 产品特点 br/ /p p    strong 1 超灵敏CCD& nbsp /strong /p p style=" text-indent: 2em " 140万有效像素CCD,具有极高的灵敏度 /p p    strong 2 紫外和蓝光成像 /strong /p p    strong 3 F1.2/8-48mm变焦镜头 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 自动聚焦,无需人工调整 /p p    strong 4 可自定义紫外灯延时闭合功能 /strong /p p    strong 5 多功能 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 可对各种凝胶电泳、克隆计数、微孔板、抑菌圈、抗生素效价、物体切片等图片进行分析和计算。 /p p    a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C290957.htm" target=" _self" strong 更多详情请点击专场 /strong /a /p p style=" text-align: center "    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 5 AXYGEN凝胶成像系统GDBL-1000 /strong /span /p p style=" text-align: center "    img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/a049e4f7-36d0-464b-8b4f-ceabbda70a28.jpg" title=" AXYGEN凝胶成像系统GDBL-1000.jpg" alt=" AXYGEN凝胶成像系统GDBL-1000.jpg" style=" text-align: center " / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(127, 127, 127) " AXYGEN凝胶成像系统GDBL-1000 /span br/ /p p   Axygen BL凝胶成像系统除具有标准型所有组成外,另外配置了蓝光源,以及Microsoft& reg Windows& reg 平板电脑。蓝光主要用于EtBr替代核酸染料检测,使用此种检测方法,有效防止DNA损伤,回收得到的DNA片段可用于后续分析。 /p p   产品特点 /p p    strong 1 四种光源可选 /strong /p p style=" text-indent: 2em " UV 302、 UV 365、 Epi 白光或者Epi蓝光(仅限于BL系统),另可选配白光转换屏; /p p    strong 2 自动曝光工具 /strong 快速计算最佳曝光时间 /p p    strong 3 ROI工具 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 可以针对感兴趣的区域合理计算曝光时间,有效捕获亮度强或者亮度弱的目的条带; /p p   strong  4 Imaging工具 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 可以裁剪、旋转、缩放、调整图片大小,设置图片明暗对比,色彩饱和度等。Annotation工具用于文本注释和绘图操作。编辑完成的图像可以保存、打印、电邮、导出,进行下一步分析。 /p p    a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C258377.htm" target=" _self" strong 更多详情请点击专场 /strong /a /p p style=" text-align: center "    span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 6. Omega Fluor Plus 蓝光凝胶成像系统 /strong /span /p p style=" text-align: center "    img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/2f84a59e-8af2-486a-8d3d-9cac655ee345.jpg" title=" Omega Fluor Plus 蓝光凝胶成像系统.jpg" alt=" Omega Fluor Plus 蓝光凝胶成像系统.jpg" style=" text-align: center " / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(127, 127, 127) " Omega Fluor Plus 蓝光凝胶成像系统 /span br/ /p p   美国Omega Fluor Plus 蓝光凝胶成像系统,也叫做无损伤蓝光凝胶成像一体机,听名字就知道此款设备采用无损伤蓝光技术,能够大大降低凝胶成像过程的毒害作用。 /p p style=" text-indent: 2em " 产品特点 /p p    strong 1 高分辨率的图像& nbsp /strong & nbsp 500万像素的CCD相机 /p p    strong 2 操作简便 /strong /p p   智能化的镜头成像技术,无需手动或者电动调节镜头,放入样品,即可拍照,内置平板电脑,通过触摸屏控制拍照; /p p    strong 3 使用安全 /strong /p p   470nm的蓝光可以替代紫外光激发无毒性的荧光染料,如SybrGreen,MaestroSafe,GelGreen紫外光开门断电保护; /p p    strong 4 应用广泛 /strong /p p   可用于蓝光凝胶成像,紫外光凝胶成像,考马斯亮蓝和银染蛋白质凝胶成像,菌落计数等等。 /p p    a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C196399.htm" target=" _self" strong 更多详情请点击专场 /strong /a & nbsp /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 8 AlphaImager HP 凝胶成像系统 /span /strong /p p style=" text-align: center "    img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/03449928-4ef1-4116-903d-b38abbd4a266.jpg" title=" Alpha凝胶成像系统 AlphaImager HP.jpg" alt=" Alpha凝胶成像系统 AlphaImager HP.jpg" style=" text-align: center " / /p p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(127, 127, 127) " AlphaImager HP 凝胶成像系统 /span br/ /p p   该系统是全球最畅销的凝胶成像系统之一,用于荧光、可见光成像,具体支持各种荧光凝胶、蛋白PAGE胶、培养皿、多孔板等样品类型,采用145万(1360*1024)像素科研级CCD;可以通过硬件升级以支持化学发光成像。 /p p style=" text-indent: 2em " 产品特点 br/ /p p    strong 1 荧光、可见光成像 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 具体支持各种荧光凝胶、蛋白PAGE胶、培养皿、多孔板等样品类型,可以通过硬件升级以支持化学发光成像 /p p    strong 2 自动变焦镜头,分辨率高 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 采用科研级别CCD,140万像素 /p p    strong 3 检测动态范围为0 - 3.6 OD /strong /p p    strong 4 光敏度高 /strong & nbsp /p p style=" text-indent: 2em " 采用A/R Coating技术增加透光率,光敏度比同类产品高约30% /p p    strong 5 双波长双强度 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 302、365 nm,以适合不同应用标配推拉式紫外透射光源 /p p    strong 6 具有打开暗箱门时的UV自动关闭功能 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 也可切换为在开门时进入切胶模式切胶 /p p style=" text-indent: 2em " & nbsp strong 7 强大的软件分析功能 /strong & nbsp /p p style=" text-indent: 2em " 可同时打开多张图片,对比分析;可以方便添加注释,调节图像对比度;DNA/RNA、蛋白胶自动分析、分子量大小分析、1D泳道分析、光密度值定量分析、微孔板整列分析、克隆及菌落计数、进化树等等。 /p p    a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C141820.htm" target=" _self" strong 更多详情请点击专场 /strong /a & nbsp /p p style=" text-align: left "   好啦,看了这么多凝胶成像仪是不是眼花缭乱啦,小编想说的是,当科研工作者努力的做科研时,各大公司也在努力适应实验人员科研技术需要开发性能优越的仪器产品,在关注科研前沿发展动态时,也别忘了关注相关领域科研器材的进展,毕竟,他们是我们实验成功的好帮手呀。 /p
  • 第一期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)
    为进一步促进我国蛋白质组学技术发展及应用,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2010年7月20-23日在北京中关村生命科学园联合举办“第一期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。   北京蛋白质组研究中心(BPRC)于2004年成立,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金项目等100余重要科研项目。中心于2006年通过了ISO/IEC 17025(CNAS- CL01)实验室认可,以标准化的管理面向社会各界开放提供科研技术服务。   本期培训班由北京蛋白质组研究中心、军事医学科学院等国内从事蛋白质组学研究的一线专家授课,7月20-21日将就“蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点”等主题进行讲座,22-23日实验演示观摩。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。   一、培训内容   (一)讲座   蛋白质组技术策略与应用概述 钱小红   蛋白质组研究中的样本制备技术 姜 颖   蛋白质组研究中的分离技术 张养军   蛋白质组研究中的鉴定技术 蔡 耘   蛋白质组研究中的数据分析技术 朱云平   SNP相关技术及应用 周钢桥   蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建   疾病蛋白质组研究技术与应用 孙 薇   多肽组学研究进展 魏开华   蛋白质定量研究 徐 平   实验室参观:生物样本制备实验室、质谱鉴定实验室、蛋白质相互作用实验室。   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置,以及搜库技巧等。   二、培训特点   本次培训注重前沿技术分析,在系统梳理原理的基础上让学员掌握前沿技术 培训班在北京中关村生命科学园内举行,培训结合蛋白质组学理论讲解和实验现场演示,形成有效的技术支持 培训班针对具体技术问题可提供个性化实验设计。研讨班结束后颁发蛋白质组学培训证书。   三、时间和地点   报到:2010年7月19日9:00-18:00,20日9:00-10:00,北京海燕药业海诺康会馆(北京市昌平区生命园路16号,与北京蛋白质组研究中心隔湖相望)   讲座:2010年7月20-21日,北京海燕药业海诺康会馆   实验观摩:2010年7月22-23日,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路33号)   四、参加办法及培训费用   填写回执后Email/邮寄/传真至北京蛋白质组研究中心,提前注册截止日期:2010年6月18日,以银行汇款凭证为准。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的请在回执中填写住宿信息。   (一)讲座   2010年6月18日前注册:每人1100元,学生900元   2010年6月18日后注册:每人1200元,学生1000元。   (二)实验演示观摩   2010年6月18日前注册:每人¥650元/项/半天,学生450元/项/半天   2010年6月18日后注册:每人¥700元/项/半天,学生500元/项/半天。   学生报到时须持学生证。   五、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   六、联系方式   联系人及电话:注册:周建平(010)80705888 张雪莉(010)80705188   咨询:史冬梅(010)80727777-1520   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)   北京蛋白质组研究中心   蛋白质组学国家重点实验室   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会
  • 第二期蛋白质组学技术与应用高级培训班第一轮通知
    为进一步促进我国蛋白质组学技术发展及应用,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2010年11月16-19日在北京中关村生命科学园联合举办“第二期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。   北京蛋白质组研究中心(BPRC)于2004年成立,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金项目等100余项重要科研项目。   本期培训班由北京蛋白质组研究中心、军事医学科学院等国内从事蛋白质组学研究的一线专家授课,11月16-17日进行“蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点”等主题讲座,18-19日实验演示观摩。培训班结束后颁发蛋白质组学培训证书。   一、培训内容   (一)讲座   蛋白质组学理论策略与应用 钱小红   蛋白质组研究中的样本制备技术 姜 颖   蛋白质组研究中的分离技术 张养军   生物质谱及其在蛋白质组研究中的应用 蔡 耘   定量蛋白质组学研究中的实验设计 徐 平   疾病蛋白质组研究技术与应用 孙 薇   蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建   蛋白质相互作用数据分析 李 栋   多肽组学技术与应用 魏开华   质谱数据解读 朱云平   参观北京蛋白质组研究中心   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置,以及搜库技巧等。   二、注意事项   1. 为了尽可能多的解答学员疑问,请在报名回执表中填写您的问题,我们汇总后将其交到相关专家手中以便在课中回答。   2. 培训结束后颁发北京蛋白质组研究中心和蛋白质组学国家重点实验室培训证书,如果需要中国生物化学与分子生物学会证书的学员需要另交2张2寸免冠照片,及20元工本费。   3. 中心于2006年通过了ISO/IEC 17025(CNAS- CL01)实验室认可,为社会各界提供科研技术服务。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。技术服务项目请看网站 http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27   4. 参会学员可以凭代表证以优惠价格购买正旦国际蛋白质组学任意一款产品。产品列表请看网站:http://www.bprc.ac.cn/guidance/show.php?itemid=21   三、时间和地点   报到:2011年11月15日13:30-21:00,20日9:00-10:00,北京海燕药业海诺康会馆(北京市昌平区生命园路16号,与北京蛋白质组研究中心隔湖相望)   讲座:2010年11月16-19日,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路33号)   四、参加办法及培训费用   填写回执后Email/邮寄/传真至北京蛋白质组研究中心,提前注册截止日期:2010年10月15日,以银行汇款凭证为准。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的请在回执中填写住宿信息。   (一)讲座   2010年10月15日前注册:每人1100元,学生900元   2010年10月16日后注册:每人1200元,学生1000元。   (二)实验演示观摩   2010年10月15日前注册:每人¥650元/项/半天,学生450元/项/半天   2010年10月16日后注册:每人¥700元/项/半天,学生500元/项/半天。   学生报到时须持学生证。   五、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   六、联系方式   联系人及电话:注册:周建平(010)80705888 张雪莉(010)80705188   咨询:史冬梅(010)80727777-1520   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)   北京蛋白质组研究中心   蛋白质组学国家重点实验室   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会   2010年8月25日 报名回执表.doc 报到及住宿酒店位置.doc
  • Nature Reviews Methods Primers|Top-Down 蛋白质组学
    在生物学的中心法则中,信息从DNA流向RNA,最终转化为执行生物学功能的蛋白质。由于遗传变异、RNA可变剪接和翻译后修饰(PTMs)的存在,蛋白质形成了多样的蛋白分子形式(proteoforms)。目前,Top-Down 蛋白质组学(TDP)已经成为了全面研究蛋白分子形式的最强大技术,它通过Top-Down质谱(TDMS)的实验,不需要酶切,直接分析完整的蛋白质,以提供蛋白分子形式的整体视图。TDMS既需要对完整蛋白的精确质量分析(Top),也需要控制下游气相离子的碎裂来获取序列的信息和PTMs的位点(Down)。与TDP不同,Bottom-Up蛋白质组学(BUP)通过分析酶切后的肽段(通常小于3 KDa)来获取蛋白质的信息,由于多肽相对于完整蛋白更加容易分离、电离和断裂,BUP有着比TDP更加广泛的应用。但是由于BUP获取的肽段数量有限,因此提供的序列覆盖普遍偏低,这就导致了蛋白分子形式信息的丢失。此外,相较于TDP来说,BUP无法提供组合的PTMs信息。(如图1) 图1. TDP和BUP的对比TDP的基本实验流程如图2所示,包括前端样品制备和分离,完整质量分析和碎片分析,以及关于蛋白分子形式的鉴定表征和定量的信息学。 图2. TDP的基本工作流程样品制备传统的蛋白质提取方法使用Good’s缓冲液,它具有高盐浓度(100 mM),蛋白酶抑制剂、磷酸酶抑制剂和表面活性剂,用于总蛋白质的溶解。这些常规试剂往往与TDP不相容,因为它们会干扰蛋白质离子检测并抑制质谱信号。不相容的盐和小分子可以通过超滤管离心或使用尺寸排除色谱(SEC)自旋柱去除。在样品制备过程中应注意尽量减少人工引入的蛋白分子形式。例如,蛋白酶和磷酸酶抑制剂通常包括在萃取缓冲液中,以尽量减少体外蛋白质降解和去磷酸化。蛋白应该低温保存,以减慢任何的修饰反应。表面活性剂能促进疏水膜蛋白的细胞渗透和增溶,但是表面活性剂会对蛋白的质谱分析造成信号抑制。蛋白质沉淀法通常使用氯仿/甲醇混合物或丙酮,可以去除表面活性剂和其他质谱不相容的污染物。然而,蛋白质沉淀方法耗时且可能导致蛋白质损失、实验变异性或溶解性问题。因此,可切割表面活性剂已被开发出来,如可酸降解的Rapigest、ProteaseMAX、MaSDeS;可光降解的4-己基苯基偶氮磺酸酯;可氧化还原降解的N-十二烷基二硫-β-d-麦芽糖苷等。样品分离和富集前端分离和富集策略可以选择性地分离亚蛋白质组,在质谱分析之前从复杂的生物样品中捕获和富集低丰度蛋白质。例如,可以通过差速离心的方式获取细胞器,蛋白再从细胞器中提取。另一种方式是通过亲和纯化的方式,基于抗体的方式已经在完整蛋白的靶向分析上得到了应用,但是该方法受到高特异性和高质量抗体需求的限制。为了解决这些挑战,可特异性捕获蛋白的表面功能化的多价超顺磁性纳米颗粒和集成纳米蛋白质组学的方法被开发出来。仪器早期的TDP实验依靠单四极杆和三四极杆(分别为Q和QqQ)质谱仪进行完整蛋白分析。这些系统具有较差的质量分辨能力,使得电荷状态测定困难,并且有限的质量电荷比(m/z)范围导致对大蛋白质的适用性较低。高质量分辨能力对于TDP尤为重要,因为完整蛋白质产生的片段离子可以产生卷曲的质谱,其中具有不同电荷态的各种离子可以部分重叠。许多现代质谱仪器可以可靠地实现高分辨率,包括傅里叶变换质谱系统,如离子回旋共振(FTICR)和Orbitrap质谱仪,以及飞行时间(TOF)和四极杆-飞行时间 (Q-TOF)仪器。完整蛋白的分离蛋白质组的复杂性给TDP带来了巨大的挑战,需要在质谱分析之前分离完整的蛋白质。当处理较大的蛋白质(≥30 kDa)时,这一挑战尤其明显,因为随着蛋白质大小的增加,ESI质谱中的离子信号迅速减少。早期的分离方法使用凝胶电泳技术,例如二维凝胶电泳分离、虚拟的二维凝胶电泳分离、直接利用MALDI MS的干胶法和PEPPI-MS等。还可以通过SEC(尺寸排阻色谱)、RPLC(反相液相色谱)、HIC(疏水相互作用色谱)、IEX(离子交换色谱)以及多维的LC方法来分离。例如一个3D LC方法,通过耦合HIC - IEX - RPC,相较于2D IEX -RPLC MS将蛋白质的鉴定数目提高了14倍。此外,CE-MS的最新进展可以用于变性和非变性的TDP分离。离子淌度质谱(IMS)是基于分子在电场作用下的气相运输性质和碰撞截面积(CCS)分离蛋白质,高分辨率的IMS已被证明可以用于分离高序列同源性的蛋白。串联质谱技术串联质谱(MS/MS)技术,在TDP中通常包括通过选择前体蛋白离子,将其解离成更小的片段离子并分析片段离子,从而得出蛋白质的初级结构和修饰(如图3a)。有多种活化/解离方法可用于生成产物离子。大多数仪器可以进行碰撞诱导离解(CID),也称为碰撞激活离解,通过与中性气体分子(如氮气或氩气)相互作用的碰撞激活来产生b/y离子(图3b)。红外多光子解离(IRMPD)涉及吸收低能红外光子产生b/y离子,并可能在吸收多光子后产生二级和高阶片段离子,从而产生更广泛的蛋白质序列信息。基于电子的解离方法(ExD),如电子捕获解离(ECD)和电子转移离解(ETD),在产生高序列覆盖率方面往往优于CID。ExD产生的c/z产物可用于确定的蛋白质形态表征和PTM定位。使用193 nm或213 nm激光,紫外光解离(UVPD)可以生成更复杂的串联质谱,序列覆盖率与ExD方法相当或更高。此外,结合四极质量过滤器、线性离子阱和Orbitrap的混合平台可以进行质子转移电荷还原(PTCR),以简化产物离子谱。图3. a, 串联质谱技术示意图。b, 不同解离方式产生的碎片离子。数据采集可采集的谱图数量取决于仪器的占空比和峰的宽度。最常见的TDP数据采集方法是数据依赖的采集(DDA)。在DDA中,收集一个完整的质谱扫描,并选择几个前体离子(通常是最丰富的)进行片段化。与数据非依赖的采集(DIA),即不分离前体离子的质谱扫描碎片,正在迅速发展并在BUP工作流程中采用,为TDP提供了令人兴奋的机会。结果处理TDP的数据信息丰富但是解析难度大,考虑到同位素和电荷态的影响,以及人类蛋白质组的高动态范围,使得谱图分析和对于低丰度蛋白的检测更加困难。TDP的谱图往往有更加复杂的同位素包络,通常不会观察到单同位素峰。大多数工具依赖于Averagine模型来解同位素并预测理论同位素分布。当谱图不能进行同位素分解时,谱图去卷积可以使用多个电荷态离子来推导出一种蛋白分子形式的平均质量。目前正在开发用于存储质谱数据的标准化文件格式。最通用的文件格式是mzML(最新版本1.1.1),这是一种由人类蛋白质组组织蛋白质组学标准倡议(HUPO-PSI)支持的XML格式。几个开源软件库可以转换,读取和写入质谱文件格式,包括ProteoWizard,JmzML,mzJava和pymzML。获得去卷积谱图后的下一步是针对蛋白质或蛋白质序列数据库搜索去卷积质谱,以识别具有错误发现率(FDR)控制的蛋白分子形式并表征PTMs,具体的搜索原理的概述可以查看原文Results-data analysis部分,在这里不再赘述。最后,定量分析不同样品间丰富度的差异。数据库可以使用来自UniProt、RefSeq、GENCODE或相关资源的蛋白质序列数据库。这些数据库只包含序列,不包含PTMs的信息。可以根据PTMs位点和类型,构建可用的数据库,但要注意限制PTMs的可变数目,否则产生的组合数据会过于庞大。DNA或RNA-seq数据可用于构建具有样品特异性基因突变和备选剪接事件的蛋白分子形式序列数据库。定性与定量分析TDP提供了对蛋白分子形式的全面了解,使鉴定、新蛋白分子形式的发现和深入的序列表征成为可能。TDP具有独特的优势,因为它可以表征组合PTMs与多基因家族中不同基因编码的同型异构体,这些异构体通常具有高序列同源性。例如,肉瘤蛋白具有多种亚型和PTMs,如N端二甲基化、乙酰化、磷酸化和甲基化。单个肌肉细胞的蛋白质形态变化可以通过TDP进行研究。当单个蛋白分子上存在多个PTMs时,TDP是唯一可以解析复杂蛋白形态和组合PTMs的技术。例如,TDP可以鉴定组蛋白的多种蛋白分子形式,以及定量描述PTMs之间的化学计量学。TDP的定量方式和BUP类似,主要有非标记定量(label free):采用不同蛋白分子形式的信号强度定量;同位素标记(isotope labeling):采用不同分子量的同位素标记来定量;化学标记(chemical labeling):采用化学报告基团来定量,尤其是在MS2水平上。(如图4)其他标记技术——如氨基酸稳定同位素标记(SILAC)、同量异位(isoabric)标记、假同量异位(pseudoisobaric)标记和NeuCode SILAC——已经显示出定量TDP的潜力。图4. 不同定量方法统计学分析和错误率计算TDP的软件通常会使用E值和P值来反映串联质谱和蛋白分子形式的匹配程度,此外FDR值也常被用来描述鉴定的可靠性。对于定量的TDP.对于定量TDP分析,统计分析通常使用单向方差分析和Stundent’s 检验(双尾)。多次测试调整通常使用benjamin - hochberg方法进行。如有必要,可采用非参数Kruskal-Wallis单因素方差分析和Wilcoxon秩和检验进行组间比较。对于人类临床样本的定量TDP,随机截距的线性混合效应模型可以进一步表征人类个体之间的异质性。作者还介绍了一些TDP软件,例如,TopPIC、MSPathFinder、TopMG和pTop等。应用作者在这一部分列举了许多相关研究,考虑到篇幅限制,感兴趣的读者可以在原文中的Application部分查看。主要包括(1)全球蛋白分子形式的发现。(2)癌症:例如,一项全球TDP研究从结直肠癌细胞的2332种蛋白质中鉴定出23000多种蛋白分子形式,并揭示了转移性和非转移性细胞之间蛋白分子形式水平的巨大差异。(3)心血管疾病:将蛋白质组学应用于心脏生物学和临床诊断已经取得了进展。例如,TDP分析了“CARDIA研究”中的配对血清样本,揭示了载脂蛋白AI和AII与心脏代谢指标之间的蛋白分子形式特异性关联。(4)神经退行性疾病:失调的PTMs可以影响神经退行性疾病中的蛋白质聚集,许多PTMs是神经退行性疾病中蛋白质病变的调节剂。例如,阿尔茨海默病受到β或tau淀粉样蛋白磷酸化和β淀粉样蛋白中异天冬氨酸形成的影响。(5)传染病。(6)生物制剂:例如单克隆抗体,抗体偶联药物等基于蛋白的药物。(7)临床TDP,例如,使用MALDI-TOF-MS鉴定病原体,它可以直接从完整的细菌细胞表面快速检测到蛋白分子形式。重现性与数据存储TDP是一个相对较新的领域,与成熟的BUP方法不同,普遍接受的实验方法和数据报告标准尚未制定。由CTDP(Consortium for TDP)领导的标准化工作正在推动实验室间的比较,以更好地了解挑战并提高重现性。蛋白分子形式易受样品处理和仪器方法变化的影响,因此科学的严谨性和充分的数据报告实践非常重要。所有TDP数据都应公开提供。许多期刊已经实现了这一要求,但这需要共同的努力来确保正确的数据处理和报告实践得到执行。CTDP的Proteoform Repository为科学家提供了一个独特的中心,可以浏览存储的蛋白分子形式并提供TDP数据集。数据存储库对于TDP数据遵守FAIR数据存储标准是必不可少的。将TDP数据集平台化并作为中央存储库的新途径和举措将对促进TDP数据的可访问性和共享非常有价值,这反过来将使TDP领域受益。面临的挑战与优化策略TDP的新技术在不断地发展,但是仍旧面临着诸多的挑战:(1)灵敏度。传统的TDP工作流程需要大量的样品(微克级的总蛋白或者数百万的细胞),以获得高质量的数据。新的高灵敏度的方法正在开发,例如CE-MS可实现对于单个细胞的检测,Nanopots技术可用于TDP,还有可以提高蛋白提取率的表面活性剂与尿素联用。(2)高分子量的蛋白质分子形式。高分子量的蛋白质难分离、信号差、仪器负担大。这就需要超高分辨率的平台,如FTICR质谱仪。在质谱分析之前,基于SEC或凝胶技术的基于尺寸的分离方法,例如,整合蛋白质组学方法或PEPPI-MS,可以解决大离子分析的挑战。但是没有单一的分离策略或者MS/MS仪器可以分析整个蛋白质组,需要开发新方法、新仪器以及改进的信息学工具来克服。(3)蛋白质的串联质谱。蛋白质在序列末端的片段化效率较高,而在中间的片段化覆盖率有限。这种差异在较大的蛋白质中更为明显,并且被认为是由于在变性条件下仍然存在的。内部碎片离子是由至少两个骨干断裂产生的,没有N或C端,在TDP碎片离子中越来越多地被考虑。最近开发的TDP软件ClipsMS可以将内部片段质量分配给蛋白质序列,从而提高整体覆盖深度。(4)定位修饰位点。由于不稳定的PTMs,低丰度的蛋白形式,PTMs的实验定位和蛋白质分子形式化学成分的精确表征具有挑战性。富集策略可以增强低化学计量或低丰度信号;还需要优化特定的碎片方法,例如,通过使用更温和的基于电子的方法,如ETD或ECD。(5)通量问题。TDP相对较低的吞吐量和较高的数据复杂性是新老用户的主要障碍。基于发现的TDP数据处理包括去卷积和数据库搜索,这可能需要几个小时到几天,具体取决于软件性能和搜索参数。自动制备和分离系统的发展,以及软件性能的提升都有助于改善通量的问题。展望TDP是目前唯一能够确定蛋白质形分子形式特征并量化其丰度的技术。由于蛋白质分子形式的基本重要性及其作为细胞、环境或生物系统健康标志的潜在作用,TDP技术有望继续快速发展。需要解决的两个关键领域是改进复杂蛋白质分子形式混合物的深度表征和大分子量蛋白的识别和表征。一个令人兴奋的发展是单离子测量,它可以在现有的商业仪器和专门的前体类型上实现。液相色谱固定相、CE-MS、基于IMS的分离的发展以及与多维方法的整合将继续改善蛋白质组学的测量。利用基因组、转录组以及BUP的信息,可以构建更精准的数据库,用于分析一些更复杂的PTMs,例如蛋白的糖基化,这也是TDP的一个优化方向。为了将蛋白质分子形式与相关的可测量输出(例如转录物和代谢物)联系起来,并破译生物学的基本原理,可以将多组学的测量结合起来。此外,通过结合微流体、质谱成像和单离子测量等先进技术,有望将单细胞和空间生物学扩展到蛋白质分子形式分析。本文发表在Nature Reviews Methods Primers 上,Top-Down Proteomics[1] ,通讯作者是美国威斯康辛大学麦迪逊分校化学系的Lloyd M. Smith和Ying Ge教授。文章介绍了Top-Down蛋白质组学的基本工作流程、应用以及面对的挑战。[1] Roberts, D.S., Loo, J.A., Tsybin, Y.O., et al. Top-down proteomics[J]. Nature Reviews Methods Primers,2024,4(1):38.
  • 蛋白质组学技术在病毒研究中的应用
    p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong span style=" text-indent: 2em " 仪器信息网讯 /span /strong span style=" text-indent: 2em " 蛋白质组学是生命科学领域中的一门新兴学科,可以高通量的分析正常及病理条件下机体、组织、细胞或亚细胞成分中全部蛋白质,对不同空间、不同时间上动态变化的蛋白质组的整体进行比较,分析不同蛋白质组之间在表达数量、表达水平和修饰状态下的差异。蛋白质组学可以发现与疾病相关的特异性蛋白质,对病变相关蛋白的研究可以为探索病毒本身及其感染机制提供信息,且这些蛋白还可能作为疾病诊断潜在的生物标志和治疗的药物靶点。 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 蛋白质组概念的提出及常用技术 /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 蛋白质组(proteome)这一概念由Wilkins和Williams等在1994年首次提出,以它作为研究对象的蛋白质组学是后基因组时代产生和发展的一门新兴学科,其从整体上分析组织,细胞内动态变化的蛋白质组成、表达水平与翻译后修饰,探索蛋白质的功能及蛋白质之间相互作用与联系。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 蛋白质组学中对蛋白表达分析方面的研究应用较多的技术有双向凝胶电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)、基于2-DE将其重复性和精确性加以改进的双向差异凝胶电泳(two-dimensional difference electrophoresis,2D-DIGE),以及对筛选到的差异表达蛋白进行快速精确鉴定的串联质谱技术(mass spectrometry,MS),其中质谱技术是蛋白质组学研究中的核心技术。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 在质谱技术中的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrum,MALDI-TOFMS)是分析多肽和蛋白质混合物的主要方法,此外,使用标记的氨基酸在细胞中进行稳定同位素标记(stable-isotope labeling by amino acids in cell culture,SILAC)& nbsp 是一种鉴定和定量病毒感染后细胞蛋白中表达差异的有效方法。蛋白质组学技术在病毒学中的应用有助于病毒感染及病毒宿主间的相互作用机制研究。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 蛋白组学技术在及其感染机制研究中的应用案例 /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 病毒寄生于宿主细胞中,需要不断地适应和改变宿主的环境。他们能够编码多种多功能蛋白质,这些蛋白能与宿主蛋白发生一系列的相互作用以完成病毒的各种功能。目前,许多病毒的基因组已完成测序,但由于受到病毒影响而发生相应改变的宿主蛋白组、宿主蛋白翻译后修饰等还未被完成阐明。近年来,高通量技术的兴起,如基于质谱技术的定量或半定量蛋白组方法,已被广泛应用于病毒宿主相互作用的研究中。依托质谱技术的蛋白质组学飞速发展,不仅促进了病毒蛋白质组学研究的不断进步,同时也加快了对于病毒相关的宿主蛋白鉴定。今后相关研究数据仍会急速增加,这需要更加先进的生物信息学技术对数据进行处理,更全面地了解病毒感染过程。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 案例1: SARS(severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus,SARS-CoV)冠状病毒研究中的蛋白组学技术 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " SARS基因组的基因产物包括20多种蛋白质,据报道,有研究学者首次应用DIGE技术分析了SARS-CoV感染的Vero E6细胞,鉴定出355个在SARS-CoV感染后表达发生变化的蛋白,其中186个显著差异表达蛋白,为理解SARS-CoV的感染和致病机制提供了线索。对感染SARS-CoV的BHK21细胞进行SILAC定量分析及进一步功能分析表明,BAG3可以抑制SARS-CoV的复制。对感染病人的血清蛋白质组分析,有助于返现可用于病毒感染的诊断、预后及治疗的生物标记。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 案例2: 禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)研究中的蛋白质组学技术 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 据报道,研究学者利用2-DE技术筛选H9N2感染人源细胞系后不同时间点的差异表达蛋白,运用质谱技术鉴定到22种蛋白,主要包括细胞骨架蛋白、RNA加工途径相关蛋白和代谢相关蛋白等,其中表达差异显著的蛋白主要参与细胞骨架网络的构成。这些蛋白的鉴定有助于理解禽流感病毒在哺乳动物中的复制及其宿主之间的相互作用。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 案例3: 揭示新型寨卡病毒宿主因子的蛋白质组学技术 /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 寨卡病毒(ZIKV)是一种与登革热病毒,西尼罗河病毒和丙型肝炎病毒(HCV)有关的黄病毒,具有单链RNA基因组,编码多蛋白,共翻译和翻译后加工成三个结构蛋白,前体膜和包膜以及七种非结构蛋白。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 据报道,有研究学者使用人类神经前体细胞和神经细胞 SK-N-BE2 进行整合蛋白质组学方法,以表征细胞在病毒侵染后的蛋白质组和磷酸化蛋白质组变化,并使用亲和蛋白质组学来鉴定ZIKV蛋白的细胞靶标。通过亲和纯化结合液相色谱和串联质谱技术(AP-LC-MS / MS)鉴定与人SK-N-BE2神经母细胞瘤细胞中表达的10种ZIKV蛋白中的每一种相互作用的细胞蛋白和相关复合物,研究鉴定到了386种 ZIKV 相互作用蛋白、ZIKV 特异性和泛黄病毒活性相关的宿主因子,这些宿主因子已知与神经元发育、视网膜缺陷和不育相关。由此,相关论文作者绘制了神经元细胞中的ZIKV蛋白-宿主蛋白相互作用网络。此外,研究还分析确定了在 ZIKV 感染后特异性上调或下调的1,216个磷酸化位点,表明病毒感染引起基本信号传导通路为 ZIKV 感染引起的增殖停滞提供了新的见解。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 当前, span style=" text-indent: 2em " 通过比较蛋白质组学对病毒感染前后的蛋白表达图谱进行鉴定,进一步对病毒感染引起的差异表达蛋白进行功能分析和验证,探索其在病毒感染中的潜在作用机制、寻找病毒的作用靶标,为病毒的预防诊治提供理论依据和解决途径。& nbsp /span 因此,在继病毒感染细胞的差异蛋白质组分析后,为更能反映真实的变化规律,更到位的解释病毒感染和致病机制,进行病毒感染宿主机体的差异及功能蛋白质组分析将是研究发展的趋势。 /p p br/ /p p br/ /p p br/ /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " span style=" text-indent: 2em " /span br/ /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " strong 参考文献: /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " 董 书 伟 ,荔 霞 ,刘 永 明 ,等 .蛋 白 质 组 学 研 究 进 展 及 其 在 中 兽 医 学 中 的 应 用 探 讨 [J ] . 中 国 畜 牧 兽 医 , 2 0 1 2 , 3 9 (1 ) : 4 5 ~ 4 9 . /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " Liu H.Advances of SARS-Cov genome[J].Journal of Chinese General Practice,2003,2(11):1~4. /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " Liu N,Song W,Wang P,et al.Proteomics analysis of diferen- tial expresion of celular proteins in response to avian H9N2vi- rus infection in human cels[J].Proteomics,2008,8(9):1851~ 1858. /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " Pietro S ,Alexey S , Haas D A , et al. An orthogonal proteomic survey uncovers novel Zikavirus host factors[J]. Nature, 2018. /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " & nbsp /p p br/ /p
  • 远慕技术:电泳后的凝胶染色实验
    实验概要本文介绍了电泳后主要的凝胶染色方法,包括:标准考马斯亮蓝染色法、快速考马斯亮蓝染色法、凝胶铵银染色法、凝胶中性银染色法及凝胶铜染色法。实验步骤1. 标准考马斯亮蓝染色法 1) 电泳后,将凝胶转入一洁净的玻璃或塑料容器中。加入5倍于凝胶体积的0.25%考马斯亮蓝R-250(溶解于50%甲醇和10%乙酸中); 2) 室温下振摇温育4h至过夜; 3) 去除染色液,收集保存可重复使用20-40次; 4) 依次在25%甲醇和7.5%乙酸中室温振摇下脱色。灵敏度为0.1-0.5ug蛋白/每条带。注:使用加热的染色液或脱色液可以缩短染色或脱色时间。将染色液或脱色液在微波炉或水浴中加热,(大约50-60℃),染色时间可缩短至20min,脱色时间约 1-2h。2. 快速考马斯亮蓝染色法 1) 电泳后,将凝胶转入一洁净的玻璃或塑料容器中。加入5倍于凝胶体积的0.25%考马斯亮蓝R-250(溶解于50%三氯yi酸中); 2) 室温下振摇温育20min; 3) 去除染色液,收集保存可重复使用多次; 4) 加入数倍体积的脱色液(25%甲醇、7%乙酸)室温振摇下脱色。必要时可更换脱色液。灵敏度为1.0ug蛋白/每条带。3. 凝胶铵银染色法 1) 电泳后,将凝胶转入一洁净的玻璃或塑料容器中。加入5倍于凝胶体积的50%乙醇和10%乙酸,振摇30min至过夜; 2) 去除50%乙醇和10%乙酸,用去离子水清洗凝胶。加入20%乙醇, 室温振摇30min; 3) 去除20%乙醇,再加5倍体积的20%乙醇,室温振摇30min; 4) 去除20%乙醇,将凝胶转入通风柜内,加入5倍体积的用去离子水配制的5%戊二醛,室温振摇30min; 5) 去除戊二醛,用去离子水清洗凝胶。加入5倍体积的20%乙醇,室温振摇20min; 6) 去除20%乙醇,重复6两次; 7) 去除20%乙醇,用去离子水清洗凝胶。再加入5倍体积的用去离子水,室温温育10min; 8) 去除去离子水,加入4倍体积新鲜配制的氨水/银溶液,室温振摇30min。配制100ml:加1.4ml 14.8mol/L氢氧化铵到100ml水中,再加入190ul 10mol/L氢氧化钠;放置涡旋器上缓缓加入1ml新鲜配制的硝酸银溶液(0.8g硝酸银/ml水),直至出现沉淀物,但很快溶解。 9) 去除氨水/银溶液,用去离子水清洗凝胶20min以上,其间更换水数次; 10) 去除水,加入5倍体积新鲜配制的0.005%柠檬酸,0.019%的甲醛。轻柔混匀,数分钟内条带即显现出。当背景开始变化时,去除显影剂,用用去离子水清洗凝胶。在10%乙酸和20%乙醇中温育凝胶,以终止反应。灵敏度为1-10ng蛋白/每条带。注:操作时,应戴手套并使用洁净的玻璃器皿,以免污染,影响反应的灵敏度。4. 凝胶中性银染色法 1) 电泳后,将凝胶转入一洁净的玻璃或塑料容器中。加入5倍于凝胶体积的30%乙醇和10%乙酸,振摇30min至过夜; 2) 去除乙醇/乙酸溶液,加入5倍体积的30%乙醇, 室温振摇30min; 3) 去除乙醇,再加5倍体积的30%乙醇,室温振摇30min; 4) 去除乙醇,加入10倍体积的去离子水,室温振摇10min;重复用去离子水清洗两次; 5) 去除去离子水,加入4倍体积新鲜配制的0.1%硝酸银溶液(用室温下贮存于棕色瓶内的20%原液稀释而得),室温振摇30min; 6) 去除硝酸银溶液,用去离子水清洗凝胶20s; 7) 去除水,加入5倍体积的2.5%碳酸钠和 0.02%的甲醛(pH4.0),室温振摇温育,数分钟内条带即显现出。当背景开始变黑时,停止温育; 8) 在1%乙酸内清洗,停止反映。用去离子水清洗,更换数次,每次10min 灵敏度为1-10ng蛋白/每条带。5. 凝胶铜染色法凝胶铜染色法为考马斯亮蓝或银染色法的替代染色方法。将凝胶氯化铜溶液中温育,在Tris和SDS同时存在时可形成明显的白色不透明的沉淀物。蛋白条仍然清晰,留下一个多肽分离模式的附染图象。由于蛋白质未结合在凝胶上,可通过EDTA去除Cu离子而得以洗脱,因而该方法特别适合需快速定位蛋白条带用于免疫反应,或进一步进行蛋白质化学研究。其染色模式如同考马斯亮蓝或银染色法的凝胶,易进行拍照。 1) 电泳后,凝胶用蒸馏水短时清洗数次,每次30s,勿洗过长时间; 2) 将凝胶转入一洁净的玻璃或塑料容器中。加入5倍于凝胶体积的0.3mol/L CuCl2; 3) 室温振摇5min,较厚的凝胶可适当延长时间。当CuCl2进入凝胶时,在不含蛋白的区域会出现白色沉淀; 4) 用蒸馏水清洗数分钟,在黑色背景下观察结果。灵敏度为10-100ng蛋白/每条带(0.5mm厚的凝胶)或1ug蛋白/每条带(1mm厚的凝胶)。注:将凝胶在0.25mol/L EDTA、0.25mol/L Tris溶液中温育可使铜染逆转。
  • 第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第三轮通知)
    北京蛋白质组研究中心   第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第三轮通知)   报到时间、地点:   外地学员请于7月18日13:30-21:00,在北京扬子江海燕药业海诺康会馆(中关村生命科学园内)大堂办理报到手续。地址:北京市昌平区科学园路16号(从生命科学园区大门向北约50米见丁字路口左转约200米,扬子江海燕药业院内,与北京蛋白质组研究中心隔湖相望)。由于园区位置距离市区较远,晚上报到的学员请注意提前自行准备晚餐。   本地学员请于7月19日8:30前在北京蛋白质组研究中心一楼1107室办理报到手续。地址:北京市昌平区科学园路33号(从生命科学园区大门向北约50米见丁字路口右转约150米,路西三层暗红色楼,上写“Proteome”)。   住宿安排:   需住宿人员直接到海诺康会馆办理住宿手续,每个标准间可住两位代表,298元/天/间。海诺康会馆电话:010-80728999。   报到流程:   签到、交费、领资料(包括讲义、餐券、代表证、笔)。20日下午茶歇时间,领取会议发票。   上课地点:北京蛋白质组研究中心多功能厅1109室。   日程安排: 时 间 内 容 授课专家 7月19日 (1109室) 9:00-10:00 蛋白质组学理论策略与应用 钱小红 10:00-11:00 蛋白质组研究中的样本制备技术 姜 颖 11:00-11:10 茶歇 11:10-12:10 蛋白质组学研究中的分离技术 张养军 12:10-13:10 午餐 13:10-14:10 生物质谱及其在蛋白质组研究中的应用 蔡 耘 14:10-15:10 蛋白质组信息学 朱云平 15:10-15:20 茶歇, 15:20-16:20 定量蛋白质组学研究方法与应用 应万涛 16:20-17:20 学员合影,参观BPRC实验室 7月20日 (1109室) 9:00-10:00 定量蛋白质组学研究中的实验设计 徐 平 10:00-11:00 蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建 11:00-11:10 茶歇 11:10-12:10 蛋白质相互作用数据分析 李 栋 12:10-13:10 午餐 13:10-14:10 多肽组学技术与应用 魏开华 14:10-15:10 蛋白质组学前沿与热点 秦 钧 15:10-15:30 茶歇,领发票 15:30-16:40 讨论、答疑 16:50-17:00 发证书,交调查表 7月21日、 22日 9:00-12:00 13:30-16:50 二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)-1126 色谱分离技术—1142里间 MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用--1132 液质联用质谱仪鉴定蛋白--1136   就餐安排:7月19-22日 早餐:7:30-9:00,海诺康会馆一楼宴会厅,住宿含早餐券 午餐:12:10-13:10,北京蛋白质组研究中心多功能厅1107室 晚餐:17:30-18:30,北京蛋白质组研究中心多功能厅1143室   报到及住宿酒店位置:   提示:如需乘做出租车,请随身携带路线图,以便指引司机。   北京中关村生命科学园地址:北京市海淀区北清路(昌平区路段)   扬子江海燕药业集团海诺康会馆位置:北京市昌平区生命科学园路16号(从生命科学园区大门向北约50米见丁字路口左转约500米即到)   乘车路线:   1、从北京站:从北广场出站乘地铁2号线至“西直门”站下车,换乘城铁13号线至“西二旗”站下车,出站后换521路至“生命科学园”站或乘出租车至生命科学园扬子江药业集团海诺康会馆(车费约16元) 从北京站直接乘坐出租车至中关村生命科学园约30公里。   2、从北京西站:从北广场出站乘320路或特6路至“中国农科院”站下车,换乘运通205路至“生命科学园”站 从北京西客站直接乘坐出租车至中关村生命科学园约30公里。   3、从首都机场:乘坐机场大巴到“中关村二桥”站下车,换乘出租车直接到中关村生命科学园(约18公里),或者下车后在公交车站“中关村南站”乘运通205路到“生命科学园”站 或从机场直接乘坐出租车至中关村生命科学园(约37公里)。   4、北京市内:建议乘坐乘铁13号线至西二旗站下车,出站后换521路至“生命科学园”站或换乘出租车至生命科学园扬子江药业集团海诺康会馆(车费约18元)。   自驾车路线:市区经八达岭高速---北安河出口(九号)下高速---辛庄桥下左转向西---沿北清路直行约1.5公里见生命科学园---入园后约50米到丁字路口左转约200米即到。   其他问题请联系:   电话:周建平(010)80705277 史冬梅(010)80705888   传真:(010)80705155   电邮:sky_proteomics@sina.com   地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)   再次感谢大家的参与,祝大家北京之行愉快!   北京蛋白质组研究中心   蛋白质组学国家重点实验室   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会   2011-6-25   注: 感谢您对蛋白质组研究中心培训班的支持,由于第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班报名人数已满,请感兴趣学员继续关注2011年11月15-18日期间举办的第四期蛋白质组学培训班!
  • 第一期蛋白质组学技术与应用高级培训班第二轮通知
    为进一步促进我国蛋白质组学技术发展及应用,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2010年7月20-23日在北京中关村生命科学园联合举办“第一期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。   北京蛋白质组研究中心(BPRC)于2004年成立,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金项目等100余重要科研项目。中心于2006年通过了ISO/IEC 17025(CNAS- CL01)实验室认可,以标准化的管理面向社会各界开放提供科研技术服务。   本期培训班由北京蛋白质组研究中心、军事医学科学院等国内从事蛋白质组学研究的一线专家授课,7月20-21日将就“蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点”等主题进行讲座,22-23日实验演示观摩。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。   一、培训内容   (一)讲座 时 间 内 容 授课专家 7月20日 9:00-10:00 蛋白质组技术策略与应用概述 钱小红 10:00-11:00 蛋白质组研究中的样本制备技术 姜 颖 11:00-11:10 茶歇 11:10-12:10 蛋白质组研究中的分离技术 张养军 12:10-13:30 午餐 13:30-14:30 蛋白质组研究中的鉴定技术 蔡 耘 14:30-15:00 UPLC原理及其在生物学研究中的应用 waters15:00-15:10 茶歇, 15:10-16:10 蛋白质组研究中的数据分析技术 朱云平 16:10-17:30 学员合影,参观BPRC实验室 7月21日 9:00-10:00 SNP相关技术及应用 周钢桥 10:00-11:00 蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建 11:00-11:10 茶歇 11:10-12:10 疾病蛋白质组研究技术与应用 孙 薇 12:10-13:30 午餐 13:30-14:40 多肽组学研究进展 魏开华 14:40-15:10 高清质谱SYNAPT G2 HDMS在蛋白质组学中的应用 waters 15:10-15:30 茶歇,领发票 15:30-16:40 蛋白质定量研究 徐 平 16:40-17:00 发证书,交调查表   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置,以及搜库技巧等。   二、培训特点   本次培训注重前沿技术分析,在系统梳理原理的基础上让学员掌握前沿技术 研讨班在北京中关村生命科学园内举行,培训结合蛋白质组学理论讲解和实验现场演示,形成有效的技术支持 培训班针对具体技术问题可提供个性化实验设计。研讨班结束后颁发蛋白质组学培训证书。   三、时间和地点   报到:2010年7月19日9:00-18:00,20日9:00-10:00,北京海燕药业海诺康会馆(北京市昌平区生命园路16号,与北京蛋白质组研究中心隔湖相望)   讲座:2010年7月20-21日,北京海燕药业海诺康会馆   实验观摩:2010年7月22-23日,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路33号)   四、参加办法及培训费用   填写回执后Email/邮寄/传真至北京蛋白质组研究中心,提前注册截止日期:2010年6月18日,以银行汇款凭证为准。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的请在回执中填写住宿信息。   (一)讲座   2010年6月18日前注册:每人1100元,学生900元   2010年6月18日后注册:每人1200元,学生1000元。   (二)实验演示观摩   2010年6月18日前注册:每人¥650元/项/半天,学生450元/项/半天   2010年6月18日后注册:每人¥700元/项/半天,学生500元/项/半天。 会 议 注 册 注册类型 2010年6月18日前 2010年6月18日后 注册费包含 标准票 学生票 标准票 学生票 会议资料、午餐、茶歇 技术讲座(元) 1100 900 1200 1000 实验演示观摩 (元/项/半天) 650 450 700 500   学生报到时须持学生证。   五、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   六、联系方式   联系人及电话:注册:周建平(010)80705888 张雪莉(010)80705188   咨询:史冬梅(010)80727777-1520   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206) 报名回执表.doc   北京蛋白质组研究中心   蛋白质组学国家重点实验室   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会   2010年6月11日
  • 毛细管电泳技术在蛋白药物分析中的应用
    毛细管电泳技术在蛋白药物研发和质量控制中的发展 随着蛋白药物的开发热潮在全球兴起,毛细管电泳技术(Capillary Electrophoresis, CE)作为一种新兴的研发和质控的分析技术也越来越受到各大生物制药公司的青睐和法规机构的重视。全球大部分生物制药公司均已使用毛细管电泳系统用于蛋白药物的研发及质量控制分析。从培养基优化、克隆筛选、配方稳定性研究和纯化过程监测,到蛋白表征、相关杂质检测、蛋白结构鉴定和蛋白质药物产品的质量控制,蛋白药物的各个环节都需要使用到毛细管电泳。例如蛋白的纯度测定,已经从SDS-PAGE转变为十二烷基硫酸钠-毛细管凝胶电泳(CE-SDS)方法;蛋白质的等电点测定,毛细管等电聚焦(CIEF)比传统胶条方法更为准确;糖蛋白药物的糖基异质性表征,毛细管电泳是高分辨率分析方法之一。在各国药典中,毛细管电泳技术用于蛋白药物的检测方法也不断丰富与发展。药典中最早出现其对蛋白药物检测方法是促红细胞生成素(EPO)的糖异构体测定。糖蛋白的异构体差异小,普通的分析方法很难将EPO中的多种异构体分离定量。欧洲药典和美国药典将毛细管电泳方法确定为EPO异构体分析的标准,解决EPO产品中各种糖基化异构体的分离和定量问题。此外,生长激素的相关杂质检测标准也采用了毛细管电泳的方法。对于单克隆抗体药物的分析,在2006年,由惠氏、安进、基因技术、礼来、辉瑞、强生及加拿大卫生署等十几个实验室对“CE-SDS方法对单抗药物纯度分析”进行了联合验证。他们对方法的稳定性、可靠性、准确性等多方面进行了研究和考察。研究结果表明CE-SDS方法比传统的SDS-PAGE更适合单抗药物的表征与质量控制,其结果的稳定可靠性要远远超过SDS-PAGE,建议各生物制药公司使用CE-SDS代替原有的SDS-PAGE作为研发与质量分析的平台。随后,上述生物制药公司及机构又针对“CIEF方法进行单抗药的等电点测定及电荷异质性分析”、“CZE方法快速分析单抗药的电荷异质性”,“毛细管电泳技术进行单抗药中的糖基分析”进行了多实验室联合验证,结果展现了CE技术用于单抗药质量控制的优势及可行性。美国药典于2013年发布了利妥昔和曲拓珠等单克隆抗体药物的纯度检测、等电点/电荷异质性分析和糖基分析采用毛细管电泳方法。在中国,中国食品药品检定研究院于2012年联合国内外生物制药机构对“CE-SDS方法对单抗药物纯度分析”进行了验证,确认了CE-SDS方法在分辨率、定量准确性及自动化程度等方面的优势,并指出CE可以对单抗非糖基化重链进行准确定量。基于以上工作以及毛细管电泳技术在单抗药分析中的强大优势,中国药典2015版的第三部中增加了CE技术,明确了CE是单克隆抗体药物大小变异体、电荷变异体、鉴别与一致性和糖基化修饰分析中的重要方法。随着CE技术在生物制药领域的快速发展,以及新的蛋白质药物的不断上市,将会有更多的CE方法出现在各国药典中。毛细管电泳技术在单克隆抗体药物分析中的应用(1)单克隆抗体药物的纯度及大小异质性分析SDS-PAGE方法对单抗药物进行纯度分析,在分辨率、定量准确性和自动化程度上,已经不能满足生物制药研发和质量控制的要求。CE-SDS方法基于蛋白分子量的差异分离,用于还原和非还原单抗药物的纯度分析,免去了复杂的人工操作、定量更加准确,具有更高的分辨率,在还原模式中可对非糖基化重链进行分离和准确定量。图1. CE-SDS对还原单克隆抗体药物的纯度分析[1]选用不同的毛细管长度,可以实现高分辨率模式和快速模式的纯度分析。高分辨模式的CE-SDS方法提供最高的分辨率,快速模式的CE-SDS方法提供更短的冲洗和分离时间,提高了分析的通量。CE-SDS结合激光诱导荧光检测器(CE-SDS-LIF),通过5-Tarma或FQ染料对蛋白进行标记,可以获得更高的灵敏度,可以检测到含量在0.01%的杂质碎片。此外,LIF检测器的使用,可以最小化基线波动,使积分和定量更加准确。(2)单克隆抗体药物等电点的测定和电荷异质性的分析单抗药物在结构上会发生糖基化、脱酰胺化、异构化、氧化等翻译后修饰,造成蛋白表面电荷的改变,引起单抗的电荷异质性。每个变异体具有不同的等电点。基于等电点分离的毛细管等电聚焦技术(cIEF),可以对单抗药物的变异体进行高分辨率的分离和定量,可分离0.03个pI差异的变异体。方法使用等电点Marker制作校准曲线,对变异体的等电点进行准确的测定。是单抗药物等电点测定和电荷异质性分析的重要方法。图2. CIEF方法对单克隆抗体药物的等电点和电荷异质性分析[5]针对不同pI范围的蛋白样品,可以通过选用适当的两性电解质来实现高分辨率的分析。如对于大部分单抗,其pI值位于7-10之间,可使用pH 3-10范围的两性电解质;对于pI 在5-7范围内的蛋白样品,可使用pH 5-8的窄范围两性电解质;而对于pI 小于5的酸性蛋白,则可以使用反向聚焦和迁移模式,实现更好的分析。 (3)CZE方法对单克隆抗体药物电荷异质性的快速分析毛细管区带电泳(CZE)基于分析物电荷/体积的比进行分离,是毛细管电泳技术中最简单、快速的模式。由于单抗药物的各个变异体分子体积近乎相同,因此在CZE分离模式中,电荷变异体的分离取决于表面电荷的差异,与CIEF模式的变异体分离相一致。因此,CZE成为快速电荷异质性分析的平台方法被生物制药行业所使用。此外,由于CZE方法简单快速的特点,它也被用于单抗药的鉴别分析中。图3. 同一种CZE方法对23种单抗药物的电荷异质性分析[3](4)单克隆抗体药物的糖基异质性分析单克隆抗体等糖蛋白药物中,糖基的种类和排列顺序会导致糖基异质性。单抗药物的糖基化修饰对其安全性和药效有着很大的影响。因此对糖基异质性的质量控制十分重要。毛细管电泳方法对糖基异质性分析的流程包括糖蛋白中糖基的释放、糖基的标记和毛细管电泳分离。磁珠辅助的糖基释放和标记,使得前处理可在1小时内完成,加快了前处理的时间。采用APTS作为荧光标记物,不仅可以通过增加电荷提高分离效率, 还通过LIF检测实现了高灵敏的糖基分析。毛细管电泳技术对糖基分析的优势在于分辨率高,速度快。不但可以区分出一个糖基的差别,相同分子量的糖基异构体也可以得到分离,整个分离过程可在5-20分钟内完成。图4. CE-LIF方法对单抗药糖基分析的电泳图毛细管电泳技术在重组蛋白类药物分析中的应用重组人促红细胞生成素(rhEPO)是高度糖基化的蛋白药物。糖基化的异质性导致了多种变异体的存在。采用CZE方法可对EPO的变异体进行分离和定量,该方法已经成为欧洲药典中EPO变异体分析的标准方法。此外,CIEF方法也可以实现对EPO中各个变异体的高分辨分离,不但可以获得与CZE方法相同的变异体数目和定量信息,还可以提供每个变异体的精确的等电点数值。在对不同来源的EPO产品与参考品的比较中,可使用等电点对变异体进行鉴定。图5. CZE方法对EPO变异体的分析重组人生长激素(rhGH)的纯度及异质性分析中,CZE方法分离度高、定量准确,也已为欧洲药典所采用。图6 CZE方法对rhGH的电荷异质性分析总结在蛋白药蓬勃发展的今天,毛细管电泳技术以其分辨率高、模式多等优势,在蛋白药研发和质控的过程中起到了不可或缺的作用,被越来越多的企业和监管机构所认可,用于蛋白药的纯度、等电点及电荷异质性、糖基等分析中。随着蛋白药物、细胞/基因治疗以及新型疫苗等生物制品的不断发展,毛细管电泳技术将会具有更大的应用空间,在蛋白、核酸及病毒颗粒等分析中,发挥它的优势,提高生物制品的质量控制标准。
  • 第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第二轮通知)
    蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2011年7月19-22日在北京中关村生命科学园联合举办“第三期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。   北京蛋白质组研究中心(BPRC)于2004年成立,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金项目等100余项重要科研项目。   本期培训班由北京蛋白质组研究中心、军事医学科学院等国内从事蛋白质组学研究的一线专家授课,7月19-20日进行“蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点”等主题讲座,21-22日实验演示观摩。培训班结束后颁发蛋白质组学培训证书。   一、培训内容   (一)讲座   蛋白质组学理论、策略与应用 钱小红   蛋白质组学研究中的样本制备技术 姜 颖   蛋白质组学研究中的分离技术 张养军   生物质谱及其在蛋白质组研究中的应用 蔡 耘   蛋白质组信息学 朱云平   定量蛋白质组学研究方法与应用 应万涛   定量蛋白质组学研究中的实验设计 徐 平   蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建   蛋白质相互作用数据分析 李 栋   多肽组学技术与应用 魏开华   蛋白质组学前沿与热点 秦 钧   参观北京蛋白质组研究中心   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置,以及搜库技巧等。   二、注意事项   1. 培训结束后颁发北京蛋白质组研究中心和蛋白质组学国家重点实验室培训证书,如果需要中国生物化学与分子生物学会证书的学员需要另交2张2寸免冠照片,及20元工本费。   2.中心通过了ISO/IEC 17025(CNAS-CL01)实验室认可,为社会各界提供科研技术服务。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。技术服务项目请看网站 http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27   3.参会学员可以凭代表证以优惠价格购买正旦国际蛋白质组学任意一款产品。产品列表请看网站:http://www.bprc.ac.cn/guidance/show.php?itemid=21   http://www.bprc.ac.cn/guidance/show.php?itemid=29   三、时间和地点   报到:2011年7月18日13:30-21:00,北京扬子江药业海诺康会馆(北京市昌平区中关村生命科学园生命园路16号 19日8:30-10:00,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区中关村生命科学园科学园路33号)。   培训:2011年7月19-22日,北京蛋白质组研究中心。   四、参加办法及培训费用   网上注册地址: http://61.50.138.116/training/cn/   优惠截止日期:2011年6月17日,以银行汇款凭证为准。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。   (一)讲座   2011年6月17日前注册:每人1300元,学生1100元。   2011年6月18日至7月19日之间注册:每人1400元,学生1200元。   (二)实验演示观摩   2011年6月17日前注册:每人¥650元/项/半天,学生450元/项/半天。   2011年6月18日至7月19日之间注册:每人¥700元/项/半天,学生500元/项/半天。   学生报到时须持学生证。   五、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   六、联系方式   联系人及电话:注册:周建平(010 )80727777-1512   咨询:史冬梅(010)80705888 80727777-1520   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)   北京蛋白质组研究中心   蛋白质组学国家重点实验室   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会   2011年5月9日 附件:BPRC The 3rd Advanced Training Workshop in the Technology and Applications of Proteomics.doc
  • 第五期蛋白质组学技术与应用高级培训班第二轮通知
    北京蛋白质组研究中心   第五期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第二轮通知)   蛋白质组学是揭示生命现象和规律的必由之路,广泛应用于生命科学各个领域,已成为21世纪生命科学与生物技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国蛋白质组学发展,北京蛋白质组研究中心于2012年7月17-20日在北京举办“第五期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。 培训班由蛋白质组学国家重点实验室、军事医学科学院等从事蛋白质组学研究的一线专家亲自授课,通过技术讲座结合实验操作,展示应用实例,现场解答科研疑问,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。   一、 主办单位   北京蛋白质组研究中心(BPRC)   蛋白质组学国家重点实验室(SKLP)   中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)   北京蛋白质组研究中心成立于2004年,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金等100余项重要科研项目,拥有行业内高端实验设备及研究人才。   二、培训内容   (一)技术讲座   蛋白质组学理论、策略与应用 钱小红   蛋白质组学前沿与热点 秦 钧   蛋白质组学研究中的样本制备技术 姜 颖   蛋白质组学研究中的分离技术 张养军   生物质谱及其在蛋白质组研究中的应用 蔡 耘   蛋白质组信息学 朱云平   定量蛋白质组学研究方法与应用 应万涛   定量蛋白质组学研究中的实验设计 徐 平   蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建   蛋白质相互作用数据分析 李 栋   多肽组学技术与应用 魏开华   参观北京蛋白质组研究中心   (二)实验演示观摩(每项半天时间)   1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)   在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。   2、色谱分离技术   结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。   3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用   主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。   4、液质联用质谱仪鉴定蛋白   液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置以及搜库技巧等。   三、时间和地点   培训:7月17-20日,北京蛋白质组研究中心。   报到:7月16日全天,北京扬子江药业海诺康会馆(北京市昌平区生命园路16号中,关村生命科学园内) 17日8:30-10:00,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路33号,中关村生命科学园内)。   住宿:北京扬子江药业海诺康会馆,标准间298元/天(含早餐)   四、培训费用   (一)讲座   6月15日前注册:每人1300元,学生1100元。   6月16日至7月17日之间注册:每人1400元,学生1200元。   (二)实验演示观摩   6月15日前注册:每人650元/项/半天,学生450元/项/半天。   6月16日至7月17日之间注册:每人700元/项/半天,学生500元/项/半天。   其他优惠:同一单位2人参加相同课程,每人可以享受10%的优惠 3人以上参加相同课程,每人可以享受20%的优惠。   提前注册截止日期:2012年6月15日,以银行汇款凭证为准。   网上注册地址: http://61.50.138.116/training/cn/   学生报到时须持学生证。   培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。   五、注意事项   1. 培训结束后颁发北京蛋白质组研究中心和蛋白质组学国家重点实验室培训证书,如果需要中国生物化学与分子生物学会证书的学员需要另交1张2寸免冠照片及20元工本费。   2. 中心通过了ISO/IEC 17025实验室认可,为社会各界提供科研技术服务。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。技术服务项目请看网站 http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27   六、汇款信息   帐 号:0200004909200041055   账户名称:北京蛋白质组研究中心   开户银行:工商银行北京市永定路支行   注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。   七、联系方式   联系电话:注册:董 微(010)80705277   咨询:史冬梅(010)80705888   传 真:(010)80705155   电子邮件:sky_proteomics@sina.com   通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)   报到及住宿酒店位置   提示:如需乘做出租车,请随身携带路线图,以便指引司机。   地点:北京扬子江药业海诺康会馆   地址:北京市昌平区生命园路16号,中关村生命科学园内   会馆电话:010-80728999   住宿:标准间298元/天(含早餐)   乘车路线:   外地学员:   1、从北京站:从北广场出站乘地铁2号线至“西直门”站下车,换乘城铁13号线至“西二旗”站下车,出站后乘出租车至生命科学园扬子江药业集团海诺康会馆(车费约22元)或换521路至“生命科学园”站 从北京站直接乘坐出租车至中关村生命科学园约30公里。   2、从北京西站:从北广场出站乘320路或特6路至“中国农科院”站下车,换乘运通205路至“生命科学园”站 从北京西客站直接乘坐出租车至中关村生命科学园约30公里。   3、从首都机场:乘坐机场大巴08号线到“回龙观(华联商场门前路边)”站下车,换乘昌61路直接到中关村生命科学园,或者在“回龙观(华联商场门前路边)”站下车,直接乘出租车至中关村生命科学园 或从机场直接乘坐出租车至中关村生命科学园(约37公里)。   北京市内学员可培训当天报到   1、城铁13号线:在“西二旗”站下车,换521路至“生命科学园”站,或换乘出租车至BPRC(车费约22元) 在“回龙观”站下车,换昌61路至生命科学园内第二站下车回走80米。   2、自驾车路线:市区经八达岭高速---北安河出口(九号)下高速---辛庄桥下左转向西---沿北清路直行第二个红绿灯见中关村生命科学园---入园后约50米到丁字路口左转约500米即到海诺康会馆(丁字路口右转200米到北京蛋白质组研究中心)。
  • 【安捷伦】抗击新型冠状病毒,安捷伦核酸/蛋白质质量控制产品从这些方面入手!
    针对 2019 新型冠状病毒(2019-nCoV),研究人员正在紧锣密鼓地研究病毒致病机理、疫苗及治疗药物等。在这个过程中,靶标样本的质量一如继往地决定了研究的最终成败及可靠性。无论是疫苗开发,抑或是核酸与细胞层面的致病机理研究,都离不开对蛋白质与核酸样本的质量控制。自动化电泳产品线控制靶标样本质量 针对新冠肺炎的研究争分夺秒,利用自动化的质量控制平台控制靶标样本质量可大大节省获取结果的时间,同时保障结果的准确性与重现性。安捷伦自动化电泳产品线可以快速对 DNA、RNA、蛋白质样本进行分析,获得包括浓度与分子量在内的数字化信息,并直观显示样本在电场下迁移形态的数字化图像信息,同时针对二代测序技术(NGS)等对核酸完整性程度依赖性高的应用,还提供以 0-10 的数值来直观反映样本完整性的参数,以实现对样本质量的快速且全面的评估(参见 RIN 值 与 DIN 值 )。一、助力测序文库的质量控制,缩短病毒基因测序时间在此次“战疫”中,基于二代测序技术(NGS)的宏基因组测序大大缩短获取病毒序列的时间,为核酸检测试剂盒的开发与病人的确诊赢得了宝贵的时间。病毒变异的监测工作仍将持续、大规模地使用二代测序技术,甚至包括纳米孔测序技术和三代测序技术。无论采用何用技术,对测序文库的上机前质量控制是保证最终结果可靠、问题可追溯的必不可少的环节。目前疫情仍旧不容乐观,研究人员面临着样本量激增、测序压力大、质控样本多的情况,针对这些问题,安捷伦 4200 TapeStation 中-高通量和 Fragment Analyzer 5300/5400 高-超高通量自动化核酸质控平台可以为新冠病毒文库的质量控制提供有力的保障。图 1. 利用 4200 TapeStation 系统对来源于肿瘤FFPE样本的最终上机前的二代测序文库进行质量控制,所得到的结果确认了全部 80 个样品和 6 个阳性对照样品的 DNA 文库均已成功制备。质控数据包括样本的浓度及分布、分子量及分布。二、缩短蛋白质检测与质控时间,加快抗体研发在抗体的研发过程中,对抗体蛋白的检测与质量控制必不可少。针对蛋白质分析,传统的 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE) 制胶过程繁琐、电泳时间长。安捷伦 2100 生物分析仪可以替代 SDS-PAGE 的工作,通过蛋白质分子量大小的变化查看蛋白质的糖基化,对抗原抗体等进行质量控制,并提供从考马斯亮蓝级到银染色级蛋白质含量和纯度的检测灵敏度。图 2. 在还原剂二硫苏糖醇 (DTT) 存在的条件下,使用 2100 生物分析仪系统配合 Protein 80 (P80)、Protein 230 (P230) 和高灵敏度 Protein 250 (HSP-250) 试剂盒对人骨髓瘤 IgG2 进行分析。所示为每种分析的代表性电泳图。在还原条件下,所采用的全部三种蛋白质分析均能够清晰分离 IgG2 的轻链 (LC)和重链 (HC)。P230 和 HSP-250 分析中均可观察到高分子量聚合物,而 P80 分析则分辨出与 IgG2 样品相关的低分子量(摩尔质量)杂质。 三、控制转录产物 RNA 的质量,确保下游分析的成功在病毒致病机理、机体免疫应答和信号通路调节的研究中,转录产物 RNA 的质量控制对下游分析的成败至关重要。安捷伦最早在 2100 生物分析仪上推出了 RNA 完整性参数 RIN 值(RNA Integrity Number),经过在全球 20 年的应用, RIN 值已成为业内公认的 RNA 完整性参数。安捷伦最新一代 TapeStation 核酸分析系统,不仅能够提供 RNA 完整性参数,更满足了样本数量变化大的实验室对通量灵活性的需求,可在单个样本检测成本不变的情况下,实现 1-96 个任意数量样本的检测。图 3. 4 组总 RNA 浓度相同(300 ng/μL)但质量(降解程度)不同的大鼠总RNA样本使用安捷伦 4200 TapeStation 系统分析。分析所得的 RIN 完整性当量RINe如胶图中所示。可以看到,RNA 的完整性随着 RINe 数值的降低在胶图与峰图中都呈现明显的递降。安捷伦自动化电泳产品线可以满足不同客户的通量与应用需求,应用类型包括:- 二代测序样本质控(样本片段化文库构建的各环节,以及终文库等的质控) - 三代测序的长片样本质控(测序前样本制备的各环节质控) - 常规片段分析(PCR 产物,酶切产物等) - 生物样本库(样本入库、出库,以及保存过程中的质控) - 基因分型( AFLP、RFLP、STR、SSR 等) 寡核苷酸大小与纯度分析 - 通过蛋白分子量大小的变化查看蛋白的糖基化,抗原抗体等的质控 分子光谱产品用于疫苗生产的质控环节 在疫苗研发及之后的生产过程中,安捷伦分子光谱产品可以帮助研究机构和生产企业做好核酸和蛋白质定量,保证生产率和准确性。其中,安捷伦 Cary 60 UV-Vis 和 Cary 630 FTIR 凭借其可靠性,已部署在全球众多制药 QA/QC 实验室中,并具有可选软件来满足中国数据完整性法规要求。紫外可见分光光度计是现代分子生物实验室的常规仪器,主要用于测定核酸的纯度、含量以及蛋白质的含量,为检测试剂盒的研发和生产提供质量保证。一、纯度检测核酸的最大吸收峰在 260 nm,蛋白质的最大吸收峰在 280 nm 处。纯的 RNA 样品,260 nm 与 280 nm 吸光度比值(A260/A280)为 2.0;纯的 DNA 样品,A260/A280 为 1.8,所以,A260/A280 可以作为 DNA、RNA 纯度检测的重要指标。核酸和蛋白质在 320 nm都没有吸收,在测试中,可以选择性的将 320 nm 的吸光度用于背景扣除。二、浓度检测对于标准样品来说,当 260 nm 处的吸光度值(A260)为 1 时,dsDNA 浓度约为 50μg/mL,ssDNA 浓度约为 37 μg/mL,RNA 浓度约为 40 μg/mL,寡核苷酸浓度约为 30 μg/mL(底物不同有差异)。据此,测定提纯后样品在 260 nm 处的吸光度值,可以计算出 RNA/DNA 的浓度。紫外可见分光光度计可以快速得到样品在 190-1100 nm 范围内每个波长下的吸光度值,为试剂盒中 RNA 纯度和核酸浓度检测提供快速解决方案。图 4. 安捷伦紫外可见分光光度计 5 次扫描 400 μL DNA 样品光谱图表 1. 安捷伦紫外可见分光光度计 5 次测试 400 μL DNA 样品纯度和浓度图 5. Agilent Cary 3500 UV-Vis(左)和 Agilent Cary 630 FTIR(右)推荐阅读:1. 快速测定口罩中的环氧乙烷残留,让医务人员和大家更安心https://www.instrument.com.cn/netshow/SH100320/news_521849.htm 2. 重要通知:疫情期间安捷伦售后服务安排https://www.instrument.com.cn/netshow/SH100320/news_521419.htm3. 重要通知 :疫情期间安捷伦采购直通车 -- 网上订购耗材https://www.instrument.com.cn/netshow/SH100320/news_521418.htm 关注“安捷伦视界”公众号,获取更多资讯。
  • GS-Smart小型自动凝胶染色仪与台式水平脱色摇床在CBB染色法中的应用对比
    GS-Smart小型自动凝胶染色仪与台式水平脱色摇床在CBB染色法中的应用对比 台式水平脱色摇床是生物学实验室常见的仪器设备,常用于普通凝胶电泳条带固定、考马斯亮蓝(CBB)染色脱色、硝酸银染色、蛋白质免疫印迹(Western Blot)、细胞培养和放射自显影等实验中。一般的台式水平脱色摇床主要是通过调节定幅载具的摆动频率,从而控制样品在溶液中的摆动快慢,这既是该仪器的基本工作原理,也是她在以上实验中主要发挥的作用。 在普通考马斯亮蓝染色、脱色实验中,台式水平脱色摇床是科研工作者们经常会用到的设备。一般是设定工作池的摇摆频率后,先后加入CBB染色液、脱色液,使摇床工作池持续摇摆,再置入蛋白凝胶使其在摇摆的液体中充分浸润洗涤,从而实现染色脱色。但一般的台式水平脱色摇床除了工作池的摆动频率可调外,没有其他参数能设置,虽然某些型号摇床还增加了定时功能,但也无法设置自动完成复杂的步骤。因此,前期进液、换液和排液都需要实验人员手动操作,另外,染色、脱色时间也只能靠实验人员自己把握。 再者,台式水平脱色摇床的工作池一般裸露在外,摇摆过程中,有可能溅出溢出CBB染色液、脱色液,还有可能挥发出有毒化合物。这样不仅容易造成污染,甚至可能产生安全隐患,进而危害实验人员的健康。 相比之下,鼎昊源GS-Smart小型自动凝胶染色仪无论在功能上、设计上还是外观上均领先台式水平脱色摇床,例如: 1.智能编程功能: GS-Smart内置3种标准的染色程序,可编程存储47个自定义程序,可以轻松实现进液、换液、出液、定时摇动和废液回收等步骤,无人值守,让实验全程自动完成,这将为那些还在使用传统台式水平脱色摇床做CBB染色脱色实验的科研工作者们节省大量时间精力。 2.可封闭可定制的染色池: GS-Smart染色池可封闭,既能防止液体溅出溢出、阻隔挥发物质,还可选择并定制各种尺寸。有些科研工作者为实现&ldquo 快速&rdquo CBB染色脱色,习惯将CBB染色液或脱色液加热至沸腾然后进行染色脱色处理,而高温状态的液体会加速挥发甲醇乙酸等化合物,如果此时使用台式水平脱色摇床,无疑具有一定的安全隐患。 3.机身与储液瓶一体化设计: 该设计属于国际首创,与市场同类产品相比,减少了分散在外的瓶瓶罐罐,从而整机占地面积与普通台式水平脱色摇床相当。不仅节省了实验室空间,同时也美化了整体外观。 综上,在CBB染色脱色实验应用方面,鼎昊源GS-Smart小型自动凝胶染色仪无论在功能上、设计上还是外观上均全面领先于台式水平脱色摇床。事实上,GS-Smart从2013年春季推出之初,就定位成了一款为考马斯亮蓝染色脱色实验而生的仪器,她的最终使命是全面取代CBB染色脱色实验中的台式水平脱色摇床,从而让所有CBB染色脱色自动进行! 本文关键词:摇床,脱色摇床,水平脱色摇床
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