单细胞转录组测序分析

单细胞RNA测序使研究人员能够通过区分异质群体中的不同细胞个体，更加深入的了解细胞功能、疾病进展和治疗效果。illumina Bio-Rad单细胞测序方案由测序技术和微滴数字PCR技术两大各自行业的领军公司共同开发，可在单次实验中对数百个至数万个细胞的转录组进行分析，并为研究人员提供强大的、可拓展性的、用户友好的工作流程。完善的单细胞测序解决方案：从样本制备到数据分析SureCell WTA 3’文库制备试剂盒提供了单细胞测序所需的所有试剂，包括ddSEQ单细胞微滴制备系统所需的分离试剂、编码试剂以及文库构建所需要的Nextera试剂；而BaseSpace Sequence Hub分析平台提供简化的、一键式生物信心数据分析流程。1. 可拓展的、灵活的单细胞分析方案- 5min可完成4个样本的微滴制备- 每个样本可包裹数百至数千个单细胞，每日可处理数万个单细胞- 微滴数字化技术制备稳定、均一的微滴，确保高效的细胞裂解和RNA编码2. 简捷的文库制备流程- Nextera 技术简化建库流程，无需预扩增- 使用特异的标签序列（Index）标识24个样本的文库- 高灵敏的检测技术确保检测更多的基因3. 一体化的测序和数据分析方案- BaseSpace 单细胞分析APP，一键式数据分析- 可视化分析流程、轻松分享数据- 基于云端的数据存储和分析，安全无忧高质量数据1. RNA测序结果无细胞大小偏好HEK 293，NIH 3T3，A20和BJ细胞经由SureCell 3' WTA 文库制备试剂盒处理。A. TC20 自动细胞计数仪测量的细胞粒直径B. 每个细胞测得的基因数中值 2. 可靠的单细胞转录本鉴别物种混合实验中对HEK 293和NIH 3T3细胞进行分析。 3. 高灵敏度和重复性NextSeq 550上分析测序重复样本。

Single Cell ATAC-seqATAC-seq(Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing)是基于高通量测序的染色质开放性研究，染色质开放区域是染色质中呈松散状态、可发生DNA复制和基因转录的区域，ATAC-seq 使用改造 Tn5转座酶，捕获染色质开放区，将测序接头引入开放染色质的两端，用于表观遗传、基因调控研究。ATAC-seq 与其他染色质开放性检测技术相比，具有操作简单、省时省力、无需抗体富集、样本起始量低等显著优势。图1 ATAC-seq技术原理[1]单细胞测序技术优势单细胞测序技术作为微量细胞、稀少样本、细胞异质性的解决方法，自技术推出以来，已广泛应用于肿瘤、免疫、发育、神经、微生物等研究领域。细胞异型性是细胞之间的重要差异，仅使用组织样本进行二代测序，会掩盖样本的真实结果，无法进行细胞层面的研究。如下图所示，进行组织层面的测序，三个样本之间并无差异，但其实样本中存在不同表达状态的细胞，只有使用单细胞测序，才能揭示样本的真实情况，研究细胞异质性。图2 细胞异质性单细胞ATAC技术原理拥有75万种不同的barcode凝胶珠（barcoded gel beads），基于其核心的微流控技术形成油滴包裹的GEM（Gel Beads-in-emulsion），每个GEM中只包含一个核和一个特定序列的barcode凝胶珠，一个特定barcode序列标记一个细胞核的所有序列，因此可通过barcode序列追溯细胞来源。实验流程转座酶处理：使用改造Tn5转座酶，捕获染色质开放区，将测序接头引入染色质开放区的两端。细胞核标记：将Tn5转座酶处理后的样本加入10x芯片，利用barcode标记细胞来源，形成油滴包裹的GEM。文库构建：基于Tn5转座酶引入的测序接头构建文库。 图3单细胞ATAC技术原理 单细胞ATAC优势低成本：每个细胞成本远远低于传统单细胞测序、组织测序；短周期：1h即可完成Tn5转座酶对染色质开放区域的切割；高通量：7min即可完成1,000-80,000个细胞核的标记；大数据：可获得多至万个细胞的数据，不依赖于抗体捕获，全面性研究染色质开放区域；专业软件：配套官方可视化软件。应用方向研究领域应用范围广——干细胞、发育分化、肿瘤、免疫、神经系统等。分析内容基于染色质开放区域和转录因子motif富集进行细胞的分群和鉴定；分析转录起始位点和调控区域；比较不同细胞的染色质开放程度差异。图4 单细胞ATAC部分分析内容展示参考文献： [1] Buenrostro Jason D,Giresi Paul G,Zaba Lisa C et al. Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of open chromatin, DNA-binding proteins and nucleosome position[J]. Nat.Methods, 2013, 10: 1213-8.

星海单细胞测序系统产品简介：星海单细胞建库系统由达普生物全程自主研发。系统基于微流控油包水及微球编码技术，通过配套的星海单细胞3’转录组建库试剂盒，可在几分钟实现数百至数万单细胞的分离，获得大量单细胞特异性表达谱。自主研发的配套Starscope生息分析软件，可完成从原始数据到生信报告输出的数据分析，独特的丰富数据可从全新角度解析肿瘤发生、耐药性机制及鉴定肿瘤生物标志物，解析肿瘤微环境、细胞内分子调控网络关系等，用于深度解析各种疾病机制，发育研究及药物靶点发现等。星海单细胞测序系统产品特点： 原理：基于水凝胶编码微球与油包水液滴生成技术快速分离单细胞进行测序文库构建；通量高：灵活处理1-8样品，单个样品上样2万细胞；细胞捕获率：60%；性能优：灵敏度达国际主流产品水平；成本低：全国产化试剂耗材，供应稳定，【享品质低价】；多应用：转录组、表观组、免疫组库单细胞建库测序。星海单细胞测序系统产品应用：基础科研：肿瘤学、免疫学、干细胞、神经生物学、 发育生物学、类器官等研究；药物开发： 抗体药物开发，小分子药物开发，细胞治疗药物开发；精准医学：疾病诊断，个性化治疗，疾病监测， 耐药性分析等药。

MobiNOVA-100单细胞测序建库系统墨卓MobiNova-100单细胞测序建库系统，采用分子标签（barcode）的单细胞识别，利用分子标签和油包水技术，通过优化微流控芯片的设计和仪器控制，在液滴生成时稳定实现细胞分离和微球、试剂、细胞的共包裹达到较高的细胞捕获率。MobiNova包含完整的单细胞测序解决方案，包括MobiNova-100仪器，MobiCube高通量单细胞转录组试剂盒，MobiVision生信分析软件。单细胞测序工作流程MobiCube高通量单细胞测序试剂盒MobiCube高通量单细胞转录组试剂盒包括组织保存液，组织解离液，微流控微孔芯片，分子标签磁珠，扩增试剂及文库构建试剂。本产品可高效无偏好性地完成反转录、cDNA扩增及文库构建，显著提高测序文库产物得率及同等测序深度下的基因检出率，从而完成对数百至数万个细胞中的mRNA进行测序。MobiVision生信分析软件MobiVision生信分析软件，可从二代测序下机的原始fastq数据开始处理，经过细胞标签的提取、质控与校正，测序数据质控，参考基因组比对，基因定量，UMI纠错与计数后确定细胞数，最终得到数据的质控报告和细胞的表达矩阵，用于后续分析。

将您的单细胞工作流程自动化一、仪器简介单细胞测序仪器设备Chromium Connect，是一款全自动的单细胞建库解码系统。可自动化完成从单细胞悬液到可用于测序的文库制备，从而实现工作效率的提升，可以专注于更重要的工作。简化后的工作流程将单细胞分离和条形码与文库制备相结合，将手动操作时间从8小时以上缩短到1小时之内。同时，自动化工作流程减少了手动移液带来的误差，实现了流程标准化，可以产生一致且可重复的单细胞数据。结合Cell Ranger数据分析软件和Loupe Browser可视化软件，轻松实现单细胞水平转录组、免疫分析、基因组拷贝数变异和染色质开放性等研究。品牌10x Genomics，型号Chromium，产地新加坡，代理商是斑马鱼（北京）科技有限公司。二、工作流程单细胞测序流程是从单细胞或细胞核悬液开始的。采用先进的微流体技术生成含有单细胞或细胞核的微滴。接着按照简化的流程来构建文库。测序后采用整合的数据分析流程和可视化软件来处理和分析数据。三、让您的效率提升10xChromium Connect将您的单细胞测序流程自动化，包括基因表达和细胞表面蛋白的分析，让您可以轻松地从细胞直接生成立即可测序的文库。对于不同的实验和不同的用户，该仪器都能够产生一致且可重复的单细胞基因表达结果。能够减少手动移液的失误，将您的手动操作时间从8小时以上缩短到1小时以内。这个全面整合且经过验证的解决方案将帮助您充分利用时间，充满信心地开展单细胞实验。四、技术原理Chromium单细胞解决方案能够从多个角度捕获细胞活性的分子读数，包括基因表达、染色质可接近性、细胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特异性以及CRISPR编辑。这项技术的核心之处在于能够产生成千上万个单细胞微滴，而每个微滴都含有一个可识别的条形码，便于下游分析。Next GEM技术①每个Chromium解决方案都从高度多样化的凝胶珠（GelBeads）开始，每个凝胶珠都带有独特的寡核苷酸条形码标签序列，以及便于捕获目标分子的功能化序列。②在Chromium系统内，将带有条形码标签的凝胶珠与细胞或细胞核、酶以及分液油混合，产生成千上万个单细胞乳液微滴，这些微滴被称为“GEM”（Gel Bead-in-emulsion）。③每个GEM都作为单独的反应微滴，凝胶珠在其中溶解，捕获每个细胞的目标分子，添加条形码并扩增。④添加条形码后，来自同一细胞或细胞核的所有片段都共享一种10x 条形码。将成千上万个细胞的带有条形码的产物混合，进行下游反应，从而产生与短读长测序仪兼容的文库。⑤在测序后，全方位的生物信息学工具将利用可识别的条形码序列将测序片段定位到原本的单细胞或细胞核。 五、一台自动化系统，多种单细胞分析高效分析成千上万个细胞，通过不同的工作流程揭示细胞异质性。一系列单细胞测序分析可选择连续流程，也可选择灵活的模块化流程，以适应您的日常操作。1. 单细胞基因表达：将您的3’单细胞基因表达工作流程自动化，让您更高效地探索细胞异质性，发现新的靶点和生物标志物，并阐明复杂的细胞进程。2.、单细胞免疫分析：将您的5’基因表达和V(D)J扩增流程自动化，并可选择采用Feature Barcode技术同时测定细胞表面蛋白表达和抗原特异性，以便大规模分析免疫系统的细胞异质性，以及T细胞和B细胞受体多样性。3.也可使用单细胞基因表达与细胞表面蛋白同时分析的5’多组学免疫分析的自动化工作流程。4. 技术培训和支持：Xenium、Visium CytAssist、Chromium Controller，Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑马鱼（北京）科技有限公司是10x Genomics代理商，负责销售仪器和试剂，具备丰富的单细胞测序和空间转录组实验方面经验，可为用户提供单细胞悬液制备，建库，测序，生信分析等一整套解决方案。在购买仪器后，将安排有资质的工程师进行现场安装和培训。培训内容包括样本制备、仪器操作、数据分析。在培训完成后，客户还将获得全方位支持，包括远程技术支持（Technical Support）、现场应用科学家（FAS）、现场服务工程师（FSE）和生物信息学应用（Applied Bioinformatics）团队，覆盖实验工作流程、试剂耗材、仪器和软件的各个方面。六、单细胞分离、标记和文库制备集成于一台经过优化的仪器中集成了专为单细胞流程而定制的组件、自动化专属的试剂和耗材，以及轻松易用的触摸屏计算机。从直观的自行设置到防出错的试剂上样，即便您是新手，也能让您快速启动单细胞测序实验。七、仪器技术参数：1、功能用途：利用微流控芯片对单细胞悬液样本进行精确分区并建立油包水反应体系，每个反应体系含有特定标签序列，对样品中的数千个单细胞mRNA进行建库，通过对文库的测序分析，解读细胞群体的基因表达谱。可自动化完成从单细胞悬液到可用于测序的文库制备，减少了手动操作误差，实现了流程标准化，可以产生一致且可重复的单细胞数据。2、处理样本类型：一种微流体芯片兼容不同大小及不同类型的真核细胞；3、简单的实验操作流程：从单细胞悬液到测序文库的生成在8小时内可以完成；4、样本处理通量：仪器可同时运行1-8个通道，每次运行最多可产生8,0000个单细胞的转录本；5、分区与标签数：每次运行产生8万个纳升级分区，含有75万个独特的序列标签（每个标签由16个碱基构成）；6、集成工作流程中的步骤，从单细胞partitioning和barcoding到测序文库生成一站式完成；7、配备自动化工作流程，易于使用的触摸屏计算机，简易的操作方式；8、通过减少用户操作之间的差异，获得一致的单细胞基因表达结果；9、从单细胞悬液到测序文库全自动化生成不超过9小时；10、手动操作时间≤1小时；11、配备热循环模块，能自动实现PCR反应；12、配备磁力装置，自动完成清洗工作；13、配备2D条形码扫描器，扫描试剂信息并跟踪试剂使用情况；14、可以调节高度和角度，适合各种类型用户；15、软件包括：免费安装，免费升级；八、斑马鱼（北京）科技有限公司，是10x Genomics公司的官方授权经销商，负责产品的推广销售和技术支持，为您提供技术参数，报价、选型、实验指导、安装培训、售后服务等，更多信息可留言或来电咨询。

Nadia是一款基于Droplet技术的单细胞捕获系统，可平行处理1-8个样品，在20分钟时间内即可捕获多达50000个细胞。系统配备了细胞、beads搅拌装置，保证细胞和beads处于悬浮状态，提升捕获单细胞droplet的效率；同时特有的温度控制模块，维持细胞处于转录状态，还原最真实的细胞内mRNA表达情况。捕获的单细胞Droplet兼容市场上商品化的建库试剂盒，如Illumina进行后续建库测序，助力单细胞研究。技术优势：? 多通道：可平行处理1-8个样品? 高通量：一次可捕获多达50000个单细胞，6000个单细胞/样品? 捕获效率高：独有的细胞和beads搅拌混匀系统，维持单细胞状态? 高质量数据：温度控制模块，维持细胞处于转录状态? 开放性：压力、搅拌速度、温度等可灵活调节（Nadia Innovate）? 实时成像：相机实时观察Droplet的形成，方便新应用的开发（Nadia Innovate）? 兼容多种样品：兼容多种类型和大小的细胞 应用领域：应用于单细胞RNA测序（scRNA Seq），单细胞核RNA测序（sNuc-Seq），单细胞琼脂糖包被等研究，具体研究领域包含：? 肿瘤学研究? 免疫学研究? 干细胞研究? 神经生物学 ? 感染与免疫? 微生物学研究

一、仪器简介：单细胞测序仪器设备Chromium Controller，是一款小巧的单细胞建库解码系统，可放置在标准实验工作台上。能够在十几分钟内高效地自动化生成大于10万个含有条形码的纳升级分区，从而实现高度并行的样品分液和添加分子标签。一次处理多达8个样品，每个样本可分析100-10000个细胞。结合Cell Ranger数据分析软件和Loupe Browser可视化软件，轻松实现单细胞水平转录组、免疫分析、基因组拷贝数变异和染色质开放性等研究。品牌10x Genomics，型号GCG-SR-1，产地新加坡，代理商是斑马鱼（北京）科技有限公司。 二、为何选择10X单细胞测序？细胞异质性是造成生物复杂性的一个关键因素，但往往被群体细胞分析技术——比如RNA测序（RNA-seq）或芯片分析等所掩盖。单细胞测序技术并非提供平均数据来显示细胞如何工作，而是让研究人员能够更全面地鉴定组织异质性、识别稀有细胞类型，并逐个细胞地解析分子机制。这种高分辨率能带来突破性的成果，4000多篇采用10x Genomics公司技术的文献便是很好的证明。 三、工作流程单细胞测序流程是从单细胞或细胞核悬液开始的。采用先进的微流体技术生成含有单细胞或细胞核的微滴。接着按照简化的流程来构建文库。测序后采用整合的数据分析流程和可视化软件来处理和分析数据——此软件对新用户来说足够直观，对专家来说又足够强大。四、技术原理Chromium单细胞解决方案能够从多个角度捕获细胞活性的分子读数，包括基因表达、染色质可接近性、细胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特异性以及CRISPR编辑。这项技术的核心之处在于能够产生成千上万个单细胞微滴，而每个微滴都含有一个可识别的条形码，便于下游分析。Next GEM技术①每个Chromium解决方案都从高度多样化的凝胶珠（GelBeads）开始，每个凝胶珠都带有独特的寡核苷酸条形码标签序列，以及便于捕获目标分子的功能化序列。②在Chromium系统内，将带有条形码标签的凝胶珠与细胞或细胞核、酶以及分液油混合，产生成千上万个单细胞乳液微滴，这些微滴被称为“GEM”（Gel Bead-in-emulsion）。③每个GEM都作为单独的反应微滴，凝胶珠在其中溶解，捕获每个细胞的目标分子，添加条形码并扩增。④添加条形码后，来自同一细胞或细胞核的所有片段都共享一种10x 条形码。将成千上万个细胞的带有条形码的产物混合，进行下游反应，从而产生与短读长测序仪兼容的文库。⑤在测序后，全方位的生物信息学工具将利用可识别的条形码序列将测序片段定位到原本的单细胞或细胞核。 五、一个系统可实现多种单细胞应用1. 单细胞基因表达：以单细胞分辨率对数百个至数万个细胞进行全面的3’或5’转录组测序，从而鉴定细胞异质性，探索发育和疾病背后的机制，并追踪细胞谱系。2. 单细胞免疫分析：能够在单细胞基础上对数万个T细胞和B细胞的全长配对受体测序和基因表达谱分析，分析免疫细胞组库，确定B细胞和T细胞的抗原特异性，表征组织微环境，超越传统的流式细胞术。3. 单细胞表观基因组分析：染色质转座酶可接近性分析（ATAC），实现数万个单细胞核的表观基因组分析，定义细胞类型和细胞状态，收录细胞类型特异性的调控因子，鉴定重要的转录因子，绘制基因调控网络。4. 单细胞蛋白表达：全面分析细胞类型和表型，验证单细胞RNA-seq的结果，并阐明细胞信号通路，有助于探索分子机制或改变药物发现。5. 单细胞多组学ATAC + 基因表达解决方案：同时分析数万个细胞的同一细胞内基因表达和开放染色质，关联调控元件和目标基因，表征细胞异质性，发现新的基因调控相互作用，鉴定罕见的细胞类型。5. 技术培训和支持：Xenium、Visium CytAssist、Chromium Connect，Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑马鱼（北京）科技有限公司是10x Genomics代理商，负责销售仪器和试剂，具备丰富的单细胞测序和空间转录组实验方面经验，可为用户提供单细胞悬液制备，建库，测序，生信分析等一整套解决方案。在购买仪器后，将安排有资质的工程师进行现场安装和培训。培训内容包括样本制备、仪器操作、数据分析。在培训完成后，客户还将获得全方位支持，包括远程技术支持（Technical Support）、现场应用科学家（FAS）、现场服务工程师（FSE）和生物信息学应用（Applied Bioinformatics）团队，覆盖实验工作流程、试剂耗材、仪器和软件的各个方面。六、仪器技术参数：1、功能用途：通过对数千上万个细胞的独立分封，逆转录，添加标签序列，建库，实现对每个细胞的cDNA添加标签并建库。系统兼容单细胞3’表达谱测序，单细胞5’表达谱测序，单细胞VDJ全长测序，单细胞CNV测序和单细胞ATAC测序。2、系统可以产生不少于50万个独立的液滴反应体系；3、提供至少300万种序列标签标记每个细胞的转录组；4、分析细胞数量：每个样本可分析100-10000个细胞；5、细胞捕获效率：可达65%以上；6、可同时检测来自同一细胞的 mRNA 和细胞表面蛋白；7、可靶向检测人泛癌、免疫相关、特征性基因等，每种panel 已验证基因数超过 1000 个；8、针对单细胞 V(D)J 分析，可获得单个 T 细胞 TCR 的α链和β链的配对序列信息；9、针对单细胞 V(D)J 分析，可获得单个B细胞 BCR的重链和轻链的配对序列信息；10、针对单细胞 ATAC 分析，线粒体污染率低于 2%；11、针对单细胞多组学ATAC+基因表达分析，可同时检测来自同一细胞的mRNA和染色质可及性；12、通量：一次可处理样本数量不少于8个；13、提供序列完整单细胞分析软件系统；14、仪器大小尺寸：20 x 26.3 x 16.4 cm；15、重量：5.6公斤； 七、斑马鱼（北京）科技有限公司，是10x Genomics公司的官方授权经销商，负责产品的推广销售和技术支持，为您提供技术参数，报价、选型、实验指导、安装培训、售后服务等，更多信息可留言或来电咨询。

Nadia Innovate是一款开放的单细胞捕获系统，可以根据细胞类型、应用等的不同开发个性化的单细胞捕获方案，系统各种参数，如搅拌速度，温度、压力等可以根据需要灵活优化，通过系统配备的相机可以实时观察单细胞Droplet的生成情况。Nadia Innovate提供了无限的可能性和灵活性，优化过的方案可以无缝转移到Nadia标准单细胞捕获系统上。技术优势：? 多通道：可平行处理1-8个样品? 高通量：一次可捕获多达50000个单细胞，6000个单细胞/样品? 捕获效率高：独有的细胞和beads搅拌混匀系统，维持单细胞状态? 高质量数据：温度控制模块，维持细胞处于转录状态? 开放性：压力、搅拌速度、温度等可灵活调节（Nadia Innovate）? 实时成像：相机实时观察Droplet的形成，方便新应用的开发（Nadia Innovate）? 兼容多种样品：兼容多种类型和大小的细胞 应用领域：应用于单细胞RNA测序（scRNA Seq），单细胞核RNA测序（sNuc-Seq），单细胞琼脂糖包被等研究，具体研究领域包含：? 肿瘤学研究? 免疫学研究? 干细胞研究? 神经生物学? 感染与免疫? 微生物学研究

10x Genomics自2016年进军单细胞领域以来，最开始以经典款仪器——Chromium Controller不断开发新应用，解锁单细胞多组学。随后，为了解放科研人员的双手，减少人为误差，又推出了单细胞捕获自动化工作站—— Chromium Connect。然而，就在最近，为了满足科研工作者对更高通量单细胞捕获的需求，10x 推出了Chromium X，即百万单细胞捕获的神器，带您探索更多可能！为什么要用百万单细胞捕获神器——Chromium X？当10x Genomics的Chromium Controller问世以来，科学家就惊叹于它的高通量，一次上机，八个通道，最高通量可做到捕获8万个单细胞。如此高的通量和单细胞分辨率大大提速了科研工作者的研究，新的发现，新的成果层出不穷，高分文章发发发不停！ 但是，通过对近几年单细胞文章捕获的细胞数量的统计，我们也会发现，现在文章中所涉及到的细胞数目也越来越多了，更多的单细胞数据，有助于我们拿到更好的实验结果。并且，在我们面对一些特定的科学问题的时候，我们确实是需要百万级别的单细胞才能解开一个真相，比如说：人类器官图谱构建。对于一个器官而言，其细胞的多样性绝不是几万甚至几十万个细胞就能彻底描绘的，我们需要做到百万级别的细胞数量，才能全面的描绘一个器官所有的细胞类型，这个时候，Chromium X无疑是我们更好的选择！CRISPR筛选。在CRISPR单细胞筛选的过程中，一般需要将一种gRNA导入到80-100个细胞中，然后看其对基因的扰动。如果我们有一个1万条gRNA的库，那么我们就需要捕获百万级别的单细胞来进行CRISPR筛选，这个时候，Chromium X将是我们研究的利器！T/B细胞克隆亚型分析。对于免疫研究的老师，大家都知道TCR/BCR的克隆亚型极其丰富，如果我们只测几万个细胞，是很难覆盖所有的克隆亚型的，这个时候，Chromium X将给您带来更大的帮助！更重要的一点是，如果您使用Chromium X进行高通量单细胞捕获，还可以大大降低单个细胞的捕获成本。Chromium X，捕获原理是什么？ Chromium X的单细胞捕获原理还是基于Next GEM的微流控捕获原理，细胞和反应试剂及Geal Beads被包裹在一个油滴里。每个油滴形成一个微反应体系，同细胞里的RNA被标记上相同的10x Barcoded。测序后，对单细胞数据进行拆分。不过，Chromium X有16个通道，每个通道最多可以捕获2万个单细胞。此外，现在10x Genomics的仪器还支持混样（CellPlex），一个通道最多可以混12个样本，混样后，一个通道最多可以拿到4.6万个单个细胞，一次上机，最多可以拿到73万个单个细胞（该数字是去除双细胞拿到的最终单个细胞数量）。双细胞捕获率为0.4%/1000个细胞。上机一次运行的时间不超过18min。此外，X还加入了温控装置，确保拿到的数据质量更高。Chromium X，可以做哪些应用？ 高通量版本的Chromium X，不仅可以实现之前的Chromium Controller的单细胞3端转录组解决方案，同时还可以进行细胞表面蛋白的检测，CRISPR单细胞大规模筛选，靶向捕获，及混样（CellPlex）；还可以实现基于5端RNA捕获的单细胞免疫组解决方案，检测单细胞全长配对的VDJ序列，细胞表面蛋白检测，抗原特异性检测，靶向捕获，CRISPR筛选（2022年推出），混样（2022年推出）。此外Chromium X还可以兼容Chromium Controller 的试剂和芯片。也就是说，您可以直接将八个通道的Chromium Controller芯片用于Chromium X上，并且这个时候，我们就可以在Chromium X上实现Chromium Controlle的所有应用，如单细胞ATAC，单细胞ATAC+mRNA等。Chromium X 物理参数展示重量 ：18.8 kg体积：宽 x 深 x 高=28.6 厘米x 48.3 厘米x 27.3 厘电气要求：100–240 VAC, 50/60 Hz, 250 W，90–264 V 工作范围（额定值的 +/- 10%），过压类别 II（标准插座）工作温度：18–28°C湿度：30–80% R.H. 非冷凝海拔高度：0-2286 米电源线长度：2 m-包括特定国家/地区的适配器Chromium X 数据展示10x内部数据测试，在Chromium X上用Chromium Controller的芯片和试剂（可以叫做标准试剂芯片）进行单细胞转录组，免疫组，ATAC及ATAC+mRNA的实验，然后与Chromium Controller仪器上获得的数据进行对比，发现二者的相关性系数很高，说明Chromium X完全兼容Chromium Controller的芯片和试剂，所以大家不必有顾虑！此外，10x还在Chromium X上做了使用高通量试剂芯片和标准试剂芯片的数据比较。实验中使用新鲜骨髓穿刺样本，获取单细胞悬液，用130个抗体进行孵育，然后过流式筛选孵育上抗体的细胞，然后分别进行Chromium X高通量单细胞捕获和Chromium X标准通量捕获，最终标准通量捕获到8269个细胞，高通量捕获到17581个细胞，然后进行单细胞转录组，VDJ，细胞表面蛋白的检测。根据检测结果，我们发现，高通量捕获的细胞数量多，更能检测出一些稀有的细胞类型，以及低丰度的TCR克隆亚型。

MobiNova-M1微生物单细胞基因组测序建库系统墨卓Microbe-seq集成多种液滴微流程操作技术，能在不损失分辨率或广泛物种适用性的基础上，从微生物群落中解析出菌株水平的高质量基因组， 助力微生物研究进入单细胞时代。

MobiNovaSP 单细胞测序 液滴预处理器此产品名称为液滴预处理器，用于高通量单细胞测序建库系统液滴生成后的液滴照射处理。与MobiNova-100配套使用。主体结构主要由光源模块、电源适配器、整机框架组成。其中，最多容纳 8 个 1.5mL EP 管的样本同时进行液滴照射处理。

BD Rhapsody&trade 单细胞分析系统细致入微，兼容并济 一. BD Rhapsody单细胞分析平台1.1 BD Rhapsody&trade Express： 小巧便携，无需电源，适合不同实验场景 BD Rhapsody&trade Express 配置组成数量货号Rhapsody样品上样工作站1633702P1200电动移液器1633704P5000电动移液器1633705a .无电子元件，无需电源，便于携带（外带）使用b .无需担心因为通道堵塞而导致样本损失c .配套电动移液器， 所有操作流程都已预先写入，方便快捷，避免人为操作误差1.2 BD Rhapsody&trade Full system 配备实时质控系统，助力高质量的单细胞多组学分析 BD Rhapsody&trade Full System 配置组成数量货号Rhapsody单细胞成像仪（含两个电动移液器）1633701Rhapsody样品上样工作站1633702a .BD Rhapsody Scanner可视化质控 -过程监控、确保质量、避免损失质控数据包括：细胞浓度细胞计数细胞活性双细胞比率细胞回收率磁珠回收率......二. BD Rhapsody单细胞分析流程2.1 单细胞样本制备样本制备成功与否，往往是能否进行单细胞分析的先决条件&bull 碧迪医疗单细胞样本制备 – 集合各项优势，拥有强大的样本兼容性，让单细胞实验不再受样本类型的限制 2.2 单细胞分离 碧迪医疗单细胞经 match 典微孔板分离原理 – 宽广的细胞通量、高效的单细胞分离、极低的双细胞率、保证了卓越的细胞利用率和数据质量。 2.3 单细胞基因捕获BD Rhapsody DNA分子标签 – 在样本水平、细胞水平、基因水平上同时及进行精准标记，实现单细胞定量分析。2.4 单细胞文库制备及测序BD Rhapsody单细胞文库制备 - 高效、灵活，科学优化单细胞实验室流程2.5 单细胞数据分析碧迪医疗单细胞数据分析– 专业可视化软件、个性化生信支持，让您的单细胞数据分析毫无后顾之忧！b. SeqGeq不断丰富的插件提供深度分析，支持多种可视化方式SeqGeq可视化数据分析软件，可分析寻找特征基因、鉴定细胞类型、探索子亚群、导出表达数据、差异数据、热图等。具备强大分析功 能, 如seurat，拟时序分析monocle，可进行热图，火山图，小提琴图，云雨图等分析。 c. 生信培训班，手把手教您分析单细胞数据d. 生信之窗门户网站，一站式体验，数据分析手册，FAQ，教学视频一应俱全三、碧迪医疗单细胞多组学整体解决方案3.1 单细胞高维生物学研究的连续生态系统3.2 单细胞多组学涉及所有试剂，均可从碧迪医疗进行一站式采购清晰的采购流程，让您不需要花费时间和精力在实验本身以外的环节货号试剂名称规格用途633731Rhapsody Cartridge配套试剂盒4 tests/kit单细胞分离捕获633733Rhapsody Cartridge微孔板4 tests/kit单细胞分离捕获633773Rhapsody 反转录试剂盒4 tests/kit单细胞基因捕获633801BD Rhapsody 全转录组扩增试剂盒4 tests/kit单细胞文库制备633781样品标记抗体试剂盒12 tests/kit多样本检测标签（human)633793小鼠多样本标记试剂盒12 tests/kit多样本检测标签（mouse, 免疫细胞）626545碧迪医疗定制单细胞混样试剂盒24 tests/kit多样本检测标签（mouse, 通用）633774Rhapsody 靶向mRNA & AbSeq扩增试剂盒4 tests/kit单细胞文库制备633750Rhapsody 检测人免疫响应相关基因表达的引物4 tests/kit单细胞基因靶向引物633751Rhapsody 检测人T细胞表达相关基因表达的引物4 tests/kit单细胞基因靶向引物633752Rhapsody 检测人乳腺癌表达相关基因表达的引物4 tests/kit单细胞基因靶向引物633753Rhapsody 检测鼠免疫响应相关基因表达的引物4 tests/kit单细胞基因靶向引物940***BD AbSeq 寡核苷酸偶联抗体25 tests/kit单细胞蛋白检测抗体625970BD AbSeq（人）免疫检测组合5 tests/kit单细胞蛋白检测抗体组合3.3全面的单细胞服务团队全流程的售前售后支持，让您毫无后顾之忧，小白也能快速上手单细胞！ 售前售后技术支持：100人仪器安装工程师：40人碧迪医疗单细胞多组学体验及培训中心：碧迪医疗（中国）卓越中心 - 上海、北京、广州、成都24小时400热线电话：4008199900

了解细胞环境 要了解生物学，需要了解它最基本的单位 ——细胞不同尺度的信息——从解剖到分子——必须汇集在一 起，以了解细胞的身份、功能、轨迹和相互作用。 具有空间背景的高分辨率数据是开启神经科学、癌症、 传染病、免疫学和发育生物学新发现的关键。REBUS ESPER&trade 是一个完全集成的，自动化的空间 组学平台，提供定量的单分子、单细胞的亚细胞分辨 率数据 Rebus Esper 使分析细胞在其原生组织背景下的高通 量，并可以运行多个优化的分析。 从发现到验证，再到梳理假设的细节，Rebus Esper 空间组学平台可以在正确的时间为您的研究提供正确 的分析，同时始终提供卓越的分辨率和规模和速度。 1台仪器 轻松操作Rebus Esper空间组学平台的每个组件都是为了协同 工作而开发的，以提供高分辨率、高通量的数据，同 时保持易用性和可操作性。 运行准备遵循一个简单的规程，只需要不到一个小时 的动手时间。 准备好样品并将其安装在流动池中后，将试剂和流动 池装入仪器。然后，对组织进行快速扫描，以确定从 中获取空间数据的区域。然后简单地按开始开始自动 运行。 运行结束后回来收集处理过的数据，准备用您选择的 软件进行分析。 集成化& 全自动化技术先进的成像、系统化学和直观的软件被整合到一个系 统中，提供了一个流线型的端到端解决方案，需要最 少的操作时间。专利化的合成孔径光学技术(SAO)通过SAO技术，样品被一系列高分辨率的光模式照 亮，这些光模式是由激发激光束的干涉产生的。一系 列低分辨率图像被20X空中物镜捕获，并使用专有算 法自动重建以生成单个图像高分辨率图像。 重建图像的分辨率和灵敏度与高数值孔径100X油浸透 镜拍摄的图像相同。系统化学自动化流体自动化流体系统自动处理所有样品处理，并与Rebus 共同开发进行分析和工作。所有的软件分析都经过验证和优化的RebusEsper进 行配对，最大限度地提高方便性。在实验期间，机载制冷装置使溶液保持在合适的温 度。成像液池内的高速温度控制允许最快的反应时间，最大限度地减少从样品到数据所需的时间。直观软件ESPER&trade 空间视频软件包括运行实验所需的一切，从设置到准备分析的数据，您可以用于单细胞分析和空间映射。 Esper控制软件引导用户完成试剂装载，感兴趣区域选择和系统控制。Esper Process软件将原始数据处理成高分辨率图像和使用最先进的技术计算机视觉算法检测特征，如RNA斑点 基于DAPI的节段核 给原子核分配特征。最终输出是一个组织范围CellxFeature矩阵，其中包含数十万个细胞和数百万个细胞特征的单细胞数据。Esper Explore一个基于开源项目Napari的可视化包，可以方便地可视化、探索和编辑Rebus Esper输出的多维数据。

Naida GoNadia Go是一款紧凑、灵活的微流控单细胞制备系统，可用于单细胞转录组测序文库制备、3D细胞培养、细胞间相互作用等。Nadia Go为英国Dolomite Bio公司推出进行单细胞转录组测序文库的优化型号，可进行多个维度的参数调整，包括液滴大小、温度、搅拌速度、压力等，结合配备的高速显微成像系统，实时观察液滴形成过程，为您开发新的单细胞方法和方案。同时可应用于水凝胶微流控液滴，进行细胞3D培养、共培养、细胞间相互作用等。Nadia Go的优势：开放性：温度、压力、搅拌速度、时间可灵活调节实时成像：高速相机实时观察液滴的形成，方便新应用的开发兼容多种样品：兼容多种类型和大小的细胞应用方向：应用于单细胞RNA测序（scRNA Seq），单细胞核RNA测序（sNuc-Seq），细胞3D培养、共培养、细胞间相互作用等研究，具体研究领域包含：肿瘤学研究免疫学研究干细胞研究神经生物学感染与免疫微生物学研究

单细胞可视化分选系统——isoPickisoPick是英国iotaSciences公司新推出的一款基于GRID专利技术（专利号：WO2019197373A1 ）、高通量、高自动化的单细胞可视化分选系统。isoPick采用微射流技术，利用界面张力对细胞培养基（或干细胞涂层）进行重塑，在培养皿上雕刻出单独的细胞腔室GRID。isoPick可以在 6 厘米培养皿上创建 256 个单细胞腔室GRID阵列，并将细胞以纳升体积全自动地分配到各个 GRID 单细胞腔室中，通过isoPick的光学显微镜可以清楚地看到 GRID 室中的单细胞。基于GRID技术和光学成像信息，isoPick可以确保分选出的细胞100%为单细胞。设备特点- 全自动化流程- 操作简单，对细胞无损伤- 结果可追踪- 分离效率高达100%- 直接转移到PCR管或96孔板- 结构紧凑，体积小传统单细胞分离手段无法保证所得的样品内只有一个单细胞，有可能有多个细胞或细胞团，导致下游的实验出现误差。isoPick采用的GRID技术结合图像信息分析，结果可追踪，保证100%准确的单细胞分选。而且isoPick分选条件温和，可以显著提高分选单细胞的存活率。同时isoPick可将单细胞样品按照特定的体积直接转移到96孔板或PCR管中，无缝衔接单细胞下游应用，确保后续单细胞组学信息完整性。应用领域单细胞分选单细胞克隆单细胞组学100%准确的单细胞分选效率显著提升单细胞克隆的存活率（单克隆率）极大地简化单细胞组学步骤技术优势传统单细胞分选方法无法保证所得的样品中只有一个单细胞，而isoPick采用GRID单细胞腔室分离与光学信号验证相结合的分选技术，能够保证分选所得的单细胞样品中只有一个单细胞。isoPick可以高效分离hiPSCs单细胞，用于构建单克隆细胞系。isoPick对敏感单细胞处理温和，能够确保更高的单细胞存活率，达到更佳的克隆生长效果。isoPick可以将1.5~200 µ l的单细胞样品直接转移至PCR管带或96孔板中，无缝衔接后续单细胞测序scWGA流程，极大地简化单细胞组学步骤。单细胞分选前后的GRID细胞腔室包被不同基质的96孔板的单细胞hiPSC集落单细胞的WGA结果部分用户单位部分应用案例人类诱导多能干细胞(hiPSCs)的单细胞克隆人类诱导多能干细胞(hiPSCs)构建单克隆细胞系培养步骤繁琐，细胞对异常的处理和操作非常敏感，传统单细胞分选容易导致细胞和遗传毒性应激的积累，进而导致不良分化和多能性丧失。使用isoPick可以温和、自动地将人类诱导多能干细胞(hiPSCs)进行单细胞分选，以高效率培养hiPSCs单克隆细胞系，显著提高了细胞分离与克隆效率。K562细胞单细胞测序传统单细胞测序需对单细胞进行全基因组扩增（WGA），但传统单细胞WGA受限于如何获得单个细胞并转移到小体积的WGA反应中。使用isoPick自动将K562细胞拾取并转移至含3.5 µ l scWGA试剂的PCR管中，并无缝衔接scWGA反应。琼脂糖凝胶电泳结果显示（下图），单细胞WGA的DNA样本(+)中两种基因均被特异性扩增，而阴性对照(-)没有这两种扩增产物，符合预期。对人类诱导多能干细胞 (hiPSCs) Prime 编辑构建工程细胞系Prime 编辑可在 HEK3 基因座中高效精确插入三个核苷酸，用于构建工程细胞系hiPSCs。通过引入靶标特异性 pegRNA 来编辑单个或多个基因组位点，以进行精确有效的基因组编辑，促进疾病建模和功能遗传学研究。Prime 编辑使用与逆转录酶融合的 Cas9 切口酶，将 DNA 序列从“Prime 编辑”引导 RNA (pegRNA) 复制到特定基因座。通过Prime 编辑将多西环素诱导型 Prime Editor 蛋白 (PE2) 整合到 iPSC 细胞系的AAVS1 基因组，之后使用isoPick分选转入靶基因的hiPSCs细胞系，以确保细胞的单克隆性。（见上图）该研究使用isoPick来确保工程细胞系的单克隆性与准确性。 参考文献：Bharucha N, Ataam J A, Gavidia A A, et al. Generation of AAVS1 integrated doxycycline-inducible CRISPR-Prime Editor human induced pluripotent stem cell line[J]. Stem Cell Research, 2021, 57: 102610.胶质母细胞瘤（GBM）通过表观遗传免疫编辑获得骨髓相关转录程序以引发免疫逃逸研究人员通过将多形性胶质母细胞瘤干细胞 (GSC) 连续移植到免疫活性宿主中，发现 GSC 通过建立增强的免疫抑制肿瘤微环境来免疫逃逸。从机制上讲，GSC通过表观遗传免疫编辑过程引起，其在免疫攻击后强制执行 GSC 中稳定的转录和表观遗传变化。研究中使用Irf8敲除细胞系实验证明，Irf8的激活是细胞免疫逃逸的一个重要因素，且在体内可能通过IFNγ介导的激活发生。该研究使用isoPick构建Irf8克隆敲除系。参考文献：Gangoso E, Southgate B, Bradley L, et al. Glioblastomas acquire myeloid-affiliated transcriptional programs via epigenetic immunoediting to elicit immune evasion[J]. Cell。

产品介绍：单细胞制备仪是一种集成金属浴消化与温和剪切组织的新一代细胞悬液制备设备，应用于流式细胞术/单细胞测序/原代细胞培养等实验，具有起始组织量小，时间短，细胞得率高，细胞活性高的特点。采用国际DIN方法设计，低噪音，使用方便，性能稳定，带加热功能，对样品的消化处理过程始终处在恒温状态。工作原理：样品与高密度氧化锆剪切磁珠与消化酶混合，通过恒温消化，组织剪切，得到高浓度的活细胞悬液。后续经过消化终止，过滤洗涤，必要时加以红细胞裂解等步骤，可得到千万到百万级别的活细胞，不同的组织均可以达到90%以上的细胞得率。样品范围：应用领域：肿瘤研究 心血管研究 干细胞研究 免疫研究 神经科学研究产品应用：单细胞测序（Single-Cell RNASeq)多色流式分析（Multicolor Flow Cytometry)质谱流式细胞计数（Mass Cytometry)原代细胞分离培养（Primary Cell Isolation And Culture)细胞治疗CAR-T优势：组织高利用率、单细胞化过程高效、单细胞高产出操作简易，制备流程全自动，仅需30min即可获取大量单细胞悬液自动控温，保护样品活力，细胞活性可达85%以上多种消化方案，针对不同样品选择不同程序，针对不同组织均有配套试剂盒针对临床穿刺样本，使组织的利用率达到100%，细胞产量可达10万个以上针对原代细胞培养样本，在15min内完成组织到单细胞过程，降低细胞逆境时间，提高细胞存活率针对组织单细胞测序，快速完成单细胞化处理，获得高产且活率在85%以上的单细胞，以小鼠组织为例：

我们的微液滴单细胞包裹系统可对千万数量以上细胞和barcode 水凝胶微珠进行包裹，为后续测序和组学分析提供大批量的样本。微液滴单细胞包裹系统可以连续24 小时运行，报证测序样品的高覆盖度，以及对稀有细胞的发现。我们特有的压电反馈系统，保证了液体在微流控芯片中流动的高度稳定。该系统可以以每分钟12000 个微滴的生成速度连续运行数小时甚至数天。 主要特点：全自动单细胞包裹流速反馈控制快速生成微滴（高达12000/ 分）集成显微成像系统，可随时监控微滴生成过程可根据用户要求定制特定大小的水凝胶barcode 微球和微流控芯片参数规格：应用举例：单细胞测序：单细胞表达组，表现组分析等。生物药物的发现 ：从初始浆细胞（B 细胞或杂交瘤细胞）中发现抗体或转录产物。生物加工：快速鉴定和分离高表达克隆。诊断：探测并测试循环肿瘤和其他疾病相关细胞。抗药性研究：从大量的微生物或肿瘤细胞集群中鉴定和分离稀有的耐药细胞。酶的进化：筛选数百万酶结构以选择Z 高效的突变体。合成生物学：研究工程微生物库中产生的大量有价值的分子。

单细胞活性分析仪 由于细胞自身的复杂性及彼此之间存在的种种差异，单细胞分析存在需要个体化设计识别探针，难以提供胞内生物分子化学信息的技术挑战。目前市面上尚无此类产品，为此我公司联合南京大学院士团队共同开发出首款：单细胞活性分析仪。该设备通过构建“超痕体积 (fL-pL) 电化学反应模块”，首次将宏观维度生物/电化学测量理论与方法引入单细胞分析中，通过电化学分析反应产物来实时测量单细胞及单细胞器内生物分子活性/结构等化学信息。该仪器突破了单细胞分析的技术瓶颈，降低了分析的难度；具有通用性强、通量高、自动化程度高、时空分辨率高、实时、原位检测等特点；为深入理解生命过程中的化学本质提供重要的参数，具有重大的基础科研价值；同时该设备已成功应用于动脉硬化类疾病，早期癌症筛查，癌症个性化用药等研究，未来可应用于临床精准医疗，具有巨大的社会意义和经济价值。一、 应用：1. 微创注药：对细胞进行局部加药或其它液体物质，同步分析细胞因应激反应而导致生理指标的变化。2. 生殖育种：对细胞进行杂交注射，研究生殖机理或育种变化。3. 细胞内组份分析：将细胞内局部物质提取出来进行组份分析（结合质谱仪使用）。4. 细胞内蛋白活性分析：检测细胞内不同位置蛋白质的活性。5. 单细胞测序：进行单个活细胞原位测序（结合测序仪使用）。 二、 技术优势：1. 精准、超微量：非机械注射/提取技术，具有加样、取样量更少，控制更精确的优势，最小加样量为飞升。2. 微创操作：微创注射（探针尖端外径≤200nm），对细胞伤害极小，保证细胞活性。3. 无滞留、无回流现象：瞬时启动/停止注射或提取过程，死体积小于机械泵输送模式，不存在滞留或回流现象。4. 注射提取双功能：一台设备同时兼容注射和提取功能，且可共用一个控制通道。5. 堵塞检测：具有在线堵塞检测功能。三、 基本技术参数l 注射/提取体积：10-15(飞升)-10-9L(纳升）l 最小注射/提取体积：1×10-15L(飞升）l 注射流速：0.1-100×10-18L/s（可根据实验要求调节）l 微提取空间：活细胞内500nm区域，包括细胞的微结构（轴突、树突、伪足等）l 实时监测注射/提取过程l 温度测量范围：-10℃~75℃l 最大相对湿度：温度为 31℃（ 88℉）时相对湿度为 80%，然后线性降低l 电源：220V， 50/60HZl 信号数据采集与分析软件：实时在线分析处理采集到的图像和电学信息数据四、 规格型号荧光显微镜微操作系统CCD成像型号正置倒置左边右边吸附手柄单色彩色FIS100√√√√FIS200√√√√√√FIS300√√√√FIS400√√√√√√

NextSeq 1000/2000 测序系统是汇集75项创新技术于一身的强大仪器。科学发展日新月异，您的需求也将不断变化。您可以现在就了解并开展单细胞、全外显子组和RNA等应用，为未来做准备。研究变的极其简单，助您加快决策制定过程。体验我们简单的工作流程，该流程使用干式仪器、更简便的运行设置和机载DRAGEN，可实现6倍速的二级分析。针对您所需应用的测序能力NextSeq 2000是从零开始设计打造的，能极大限度地满足未来的需求，为高通量应用提供测序能力。它可为不断变化的需求和更广泛的研究提供可扩展性，支持各种各样的应用，包括：1. 单细胞基因表达分析（100个循环）4k细胞；10k read/细胞检测单个细胞的转录组，获得细胞间差异的高分辨率视图。探索复杂组织中单个细胞的不同生物学特性，了解细胞亚群对环境要素的反应。使用P2试剂时，可在约13小时内分析10个样本。使用P3试剂时，可在约19小时内分析25个样本。2. 全外显子组测序（200个循环）平均目标区域覆盖度为50倍当无法进行或没有必要进行全基因组测序时，外显子组测序是一种经济有效的替代方法。能在群体遗传学、遗传病和癌症研究等各种应用领域中高效识别编码变异。使用P2试剂时，可在约21小时内分析16个样本，使用P3试剂时，可在约33小时内获得40个完整外显子组。3. 鸟枪法宏基因组学测序（300个循环）50M read/样本全面检测给定复杂样本中所有生物体的所有基因。评估细菌多样性，检测各种环境中微生物的丰度，或研究其他方法很难或无法分析的不可培养的微生物。使用P2试剂时，可在约29小时内获得8个样本的数据。使用P3试剂可以扩大分析规模，能在约48小时内获得多达20个样本的数据。流程简单直观，充分利用您的时间和资源NextSeq 1000与NextSeq 2000系统同时支持中通量的新兴应用和外显子测序、靶向富集、单细胞图谱分析、转录组测序等一系列方法。流程直观，操作简便，配以图形化运行状态提示。

isoCell是英国iotaSciences公司推出的一款基于GRID专li技术（专li号：WO2019197373A1）、高通量、高自动化的单细胞可视化分选培养系统。isoCell采用微射流技术，利用界面张力对细胞培养基（或干细胞涂层）进行重塑，在培养皿上雕刻出单独的细胞腔室GRID（可以在6厘米培养皿上创建256个单细胞腔室GRID阵列），并将细胞以纳升体积全自动地分配到各个GRID单细胞腔室中。isoCell可以避免边界效应，利用其自带的光学显微镜可以清楚地看到GRID室中的单细胞，以确保isoCell分选出的细胞100%为单细胞。isoCell可以将单细胞在GRID中培养成单克隆细胞系，培养过程中可以根据客户需求进行换液操作，全流程可视化监控以保证每个单克隆细胞系均来自所挑选的单个细胞。通过isoCell单细胞可视化分选培养系统可以实现高通量、自动化、高成活率的单克隆细胞系构建、微生物分选与培养、单细胞分选、单细胞组学等功能。应用领域应用领域单克隆细胞系构建单细胞分选单细胞组学高效、温和、高度自动化地构建单克隆细胞系100%准确的单细胞分选效率极大地简化单细胞组学步骤技术优点传统构建单克隆细胞系技术受限于单细胞的高度敏感性，成功率较低，且无法保证每一个单克隆细胞系均来自单个细胞。isoCell采用GRID单细胞微腔室技术，可以高度自动化、温和地培育单克隆细胞系，确保高达60%-70%的培育成功率。且整个操作流程均进行可视化验证，保证每一个单克隆细胞系都来自单细胞。传统单细胞分选方法无法保证所得的样品中只有一个单细胞，而isoCell采用GRID单细胞腔室分离与光学信号验证相结合的分选技术，能够保证分选所得的单细胞样品中只有一个单细胞。isoCell可以将1.5 μl至200 μl的单细胞样品直接装移至PCR管带或96孔板中，无缝衔接后续单细胞测序scWGA流程，极大地简化单细胞组学步骤。在GRID上培育8天的单克隆细胞系单细胞分选前后的GRID细胞腔室单细胞的WGA结果设备特点 - 全自动化流程 - 操作条件温和，对单细胞无损伤 - 全培养、分析流程可视化追踪 - 单细胞分离效率高达100% - 单克隆细胞系构建成活率高 - 直接转移到PCR管或96孔板 - 结构紧凑，体积小传统单细胞分离手段无法保证所得的样品内100%只有一个单细胞，可能有多个细胞或细胞团，导致下游的实验出现误差。且传统构建单克隆细胞系技术受限于单细胞的高度敏感性，成功率较低，也无法保证每一个单克隆细胞系均来自单个细胞。isoCell采用的GRID单细胞腔室技术，可以保证100%准确的单细胞分选，并在GRID中高度自动化地直接培育单克隆细胞系，成活率高达60%以上，且通过全流程可视化监控，保证每一个单克隆细胞系均来自于挑选的单个细胞。isoCell分选、培养条件温和，可以显著提高单细胞克隆的存活率。同时isoCell可以将单细胞样品按照特定的体积直接转移到96孔板或PCR管中，无缝衔接单细胞下游应用，确保后续单细胞组学信息完整性。应用案例人类诱导多能干细胞(hiPSCs)的单细胞克隆人类诱导多能干细胞(hiPSCs)构建单克隆细胞系培养步骤繁琐，细胞对异常的处理和操作非常敏感，传统单细胞分选容易导致细胞和遗传毒性应激的积累，进而导致不良分化和多能性丧失。使用isoCell可以温和且自动化地将人类诱导多能干细胞(hiPSCs)进行单细胞分选并进行培养，高效地培养hiPSCs单克隆细胞系，显著提高了细胞分离与克隆效率（如下图所示）。K562细胞单细胞测序传统单细胞测序需对单细胞进行全基因组扩增（WGA），但传统单细胞WGA受限于如何获得单个细胞并转移到小体积的WGA反应中。使用isoCell自动将K562细胞拾取并转移至含3.5 μl scWGA试剂的PCR管中，并无缝衔接scWGA反应。琼脂糖凝胶电泳结果显示（下图），单细胞WGA的DNA样本(+)中两种基因均被特异性扩增，而阴性对照(-)没有这两种扩增产物，符合预期。对人类诱导多能干细胞 (hiPSCs) Prime 编辑构建工程细胞系Prime 编辑可在 HEK3 基因座中高效精确插入三个核苷酸，用于构建工程细胞系hiPSCs。通过引入靶标特异性 pegRNA 来编辑单个或多个基因组位点，以进行精确有效的基因组编辑，促进疾病建模和功能遗传学研究。Prime 编辑使用与逆转录酶融合的 Cas9 切口酶，将 DNA 序列从“Prime 编辑”引导 RNA (pegRNA) 复制到特定基因座。通过Prime 编辑将多西环素诱导型 Prime Editor 蛋白 (PE2) 整合到 iPSC 细胞系的AAVS1 基因组，之后使用isoCell分选转入靶基因的hiPSCs细胞系，以确保细胞的单克隆性。（见上图）该研究使用isoCell来确保工程细胞系的单克隆性与准确性。参考文献：Bharucha N, Ataam J A, Gavidia A A, et al. Generation of AAVS1 integrated doxycycline-inducible CRISPR-Prime Editor human induced pluripotent stem cell line[J]. Stem Cell Research, 2021, 57: 102610.胶质母细胞瘤（GBM）通过表观遗传免疫编辑获得骨髓相关转录程序以引发免疫逃逸研究人员通过将多形性胶质母细胞瘤干细胞 (GSC) 连续移植到免疫活性宿主中，发现 GSC 通过建立增强的免疫抑制肿瘤微环境来免疫逃逸。从机制上讲，GSC通过表观遗传免疫编辑过程引起，其在免疫攻击后强制执行 GSC 中稳定的转录和表观遗传变化。研究中使用Irf8敲除细胞系实验证明，Irf8的激活是细胞免疫逃逸的一个重要因素，且在体内可能通过IFNγ介导的激活发生。该研究使用isoCell构建Irf8克隆敲除系。参考文献：Gangoso E, Southgate B, Bradley L, et al. Glioblastomas acquire myeloid-affiliated transcriptional programs via epigenetic immunoediting to elicit immune evasion[J]. Cell, 2021, 184(9): 2454-2470. e26.用户单位

DSC-400 单细胞悬液制备仪瑞沃德 DSC-400 单细胞悬液制备仪，通过采用自研的组织处理管、酶解试剂盒和内置不同组织优化处理程序，可将组织制备成高活性单细胞悬液或组织匀浆。根据实际样本可在15-30min内完成活性高、均一性好的单细胞悬液制备，大大增加实验可重复性。拥有独立运行的四通道，搭配加热套实现全自动处理，提高组织处理效率。● 四通道独立运行● 一机两用，可同时用做组织匀浆● 处理程序全程可见、可自定义设置 -产品特点- 智能●内置标准化的处理流程不但全程可见，操作简单，支持另存1000条自定义程序●USB直接导入并轻松同步程序，实现多台机器协同工作 高效●四通道独立工作，可同步处理不同组织，节约实验时间●可配置加热套，实现全自动样品制备●一机两用，还可进行组织匀浆 温和●专业的控制电机转速平稳可靠，满足从0到4000转/min的不同应用需求●配合多种酶解试剂盒、组织处理管，最大限度保证细胞活性、降低损耗*组织处理管不在美国销售 安全●配件在位检测、抖动识别等多重报警机制全面保障用户和样本安全●全密封组织处理管，防止细胞污染-应用场景- 流式细胞分析/分选根据发射光的荧光强度和波长将复杂样本中的细胞进行鉴定、分类、定量和分离。对细胞的生理生化特性、免疫、分子生物学性状及功能状态等进行定性或定量检测。 原代细胞培养原代细胞指从机体组织经蛋白酶或其它方法，获得单个细胞并在体外进行模拟机体培养的细胞。在3D细胞培养、肿瘤学、病毒学研究以及药物筛选、疫苗生产、干细胞治疗等领域广泛应用。 单细胞测序在单个细胞水平上，对基因组、转录组、表观组进行高通量测序的技术。能够揭示单个细胞的基因结构和表达情况，是研究细胞异质性的有力工具。广泛应用于物种鉴定、病原筛查、病原进化、肿瘤异质性研究，循环肿瘤细胞等研究。 药物测试原代细胞离体时间短且未经永生化过程，其生物学特性仍保持原有的遗传特征，可更好地反映细胞在体内的生长状态，从而获得与体内生理功能更接近的数据，适用于药物测试、细胞分化和转化等研究。-规格参数-

DSC-200单细胞悬液制备仪瑞沃德DSC-200单细胞悬液制备仪，通过采用自研的组织处理管、酶解试剂盒和内置不同组织优化处理程序，可将组织制备成高活性单细胞悬液或组织匀浆。根据实际样本可在15-30min内完成活性高、均一性好的单细胞悬液制备，大大增加实验可重复性。拥有独立运行的四通道，搭配加热套实现全自动处理，提高组织处理效率。● 双通道独立运行● 一机两用，可同时用做组织匀浆● 处理程序全程可见、可自定义设置 -产品特点- 智能●内置标准化的处理流程不但全程可见，操作简单，支持另存1000条自定义程序●USB直接导入并轻松同步程序，实现多台机器协同工作 高效●双通道独立工作，可同步处理不同组织，节约实验时间●可配置加热套，实现全自动样品制备●一机两用，还可进行组织匀浆 温和●专业的控制电机转速平稳可靠，满足从0到4000转/min的不同应用需求●配合多种酶解试剂盒、组织处理管，最大限度保证细胞活性、降低损耗*组织处理管不在美国销售 安全●配件在位检测、抖动识别等多重报警机制全面保障用户和样本安全●全密封组织处理管，防止细胞污染-应用场景- 流式细胞分析/分选根据发射光的荧光强度和波长将复杂样本中的细胞进行鉴定、分类、定量和分离。对细胞的生理生化特性、免疫、分子生物学性状及功能状态等进行定性或定量检测。 原代细胞培养原代细胞指从机体组织经蛋白酶或其它方法，获得单个细胞并在体外进行模拟机体培养的细胞。在3D细胞培养、肿瘤学、病毒学研究以及药物筛选、疫苗生产、干细胞治疗等领域广泛应用。 单细胞测序在单个细胞水平上，对基因组、转录组、表观组进行高通量测序的技术。能够揭示单个细胞的基因结构和表达情况，是研究细胞异质性的有力工具。广泛应用于物种鉴定、病原筛查、病原进化、肿瘤异质性研究，循环肿瘤细胞等研究。 药物测试原代细胞离体时间短且未经永生化过程，其生物学特性仍保持原有的遗传特征，可更好地反映细胞在体内的生长状态，从而获得与体内生理功能更接近的数据，适用于药物测试、细胞分化和转化等研究。-规格参数-

10x Genomics Chromium X 的单细胞捕获原理还是基于Next GEM的微流控捕获技术，利用微流控体系，通过油滴包裹的凝胶珠（Gel Bead In Emulsions，GEM），形成数万个微反应体系。每个细胞的核酸被寡核苷酸条形码标记，实现单细胞的区分。但是，Chromium X 相较于Chromium iX，在通量上有大幅提升。Chromium X可以兼容8通道和16通道的芯片。在8通道的芯片上，可以实现Chromium iX的所有应用；而在16通道的芯片上，可以大大提升单细胞的捕获数量，一次上机可以捕获多达100万个独立有效的单细胞数据。更高的通量，可以有助于我们检出更多的细胞类型，构建更加精细的器官图谱；发现一些稀有细胞和稀有的克隆，助力单细胞免疫学研究；而更高的通量对于药物筛选，CRISPR基因编辑也会有更大的帮助。关于北京易研科技有限公司易研科技专注于为生命科学研究、基础医学研究等领域提供先进的产品及科技服务。作为10x Genomics、bioGenous等知名品牌的官方合作代理商，易研科技为客户提供Chromium单细胞平台、Visium空间平台、Xenium原位检测平台及bioGenous类器官研究相关的仪器和试剂。同时，易研科技也提供单细胞/空间转录组测序、蛋白多因子检测、多色荧光免疫组化、流式细胞分析与分选、细胞成像（激光共聚焦成像、高分辨率活细胞成像、高内涵成像以及超高分辨活细胞成像）以及组织样本病理检测等科研科技服务。电话：4009-215-415

单细胞显微挑取仪（Sc-picker) 型号：CA-20单细胞显微挑取仪（Sc-Picker）基于真空驱动和细胞采集技术，可以从贴壁、悬浮、三维培养体系中精准无损采集目标单细胞或者细胞克隆。可快速、准确地从细胞培养板中直接采集目标单细胞或细胞克隆，并保持细胞活性，可用作下游扩大培养或各种细胞分析，如单细胞基因组分析、单细胞转录组分析、基因表达分析、表观遗传学和蛋白质组学研究等，广泛应用于各种单细胞及细胞生物学研究。本仪器具有功能性强、操作便捷、性价比高，是单细胞和细胞克隆采集系统的首选。应用领域包括但不限于： 1） 单细胞分析； 2） 单细胞克隆挑取； 3） 稀有细胞分离； 4） 干细胞挑选； 5） 细胞纯化； 6） 单细胞粘附试验 7） 原代细胞的挑取 8） 虫卵挑取 9） 病毒纯化 10） 杂交瘤细胞挑取。。。适用场所 从事单抗研究、单细胞测序、重组病毒和病毒纯化的一些高校实验室以及科研机构等； 肿瘤医院、病理科，检验科，血液科，医疗中心，生殖中心等临床医疗机构； 从事抗体原料、抗体药物和疫苗开发，以及细胞测序服务的企业等。技术参数Technical Data Sheet产品名称单细胞挑取仪样本兼容性（贴壁、悬浮、三维）细胞培养体系Z轴直线模组每步运行距离0.005mmZ轴行程范围≥15mmX轴、Y轴行程范围≥15mm无影光源（明场）五档可调真空负压五档可调玻璃毛细管内径10-100um仪器尺寸（mm）W237.3 H530 D340 (MAX)净重11KG显微镜载物平台移动范围：129（X）83(Y)mm,兼容五种微型实验板，多孔板夹和载物台夹，带通用托板：适用于Terasaki板、载玻片、Φ35-65培养皿等多种托架 物镜可选配不同物镜，安装在五孔物镜转换器上光学系统NIS60无限远平场消色差光学系统荧光模块采用转盘式结构，3工位转盘（手动），可从主机取出方便更换各模块；根据需求荧光激发模块可随意拆卸、安装B激发模块：激发BP460-490，分色DM500,截止BA520G激发模块：激发BP510-550，分色DM570,截止BA590U激发模块：激发BP330-385，分色DM400,截止BA420相关资料【1】2021101782256 （一种挑取贴壁细胞的装置---发明）【2】2021203616400 （一种挑取贴壁细胞的装置---实用新型）应用Applications1）收集贴壁培养的单细胞及克隆扩增2）收集贴壁培养的细胞团收集杂交瘤细胞团：A.挑取前 B.挑取后3）挑取单细胞时挑针成像挑取荧光单细胞后细胞在挑针中：A. 明场 B. 荧光

单细胞悬液仪是一种集成金属浴消化与温和剪切组织的新一代单细胞细胞悬液制备设备，应用于流式细胞术/单细胞测序/原代细胞培养等实验，具有起始组织量小，时间短，细胞得率高，细胞活性高的特点。采用国际DIN方法设计，低噪音，使用方便，性能稳定，对样品的消化处理过程始终处在恒温状态。　　工作原理：样品与高密度氧化锆剪切磁珠与消化酶混合，通过恒温消化，组织剪切，得到高活率的单细胞悬液。后续经过消化终止，过滤洗涤，必要时加以红细胞裂解等步骤，可得到千万到百w级别的活细胞，不同的组织均可以达到90%以上的细胞得率。样品范围：人类及小鼠肿瘤组织/正常组织，哺乳动物软组织，植物愈伤及根尖组织。应用领域：肿瘤研究 心血管研究 干细胞研究 免疫研究 神经科学研究产品应用：单细胞测序、多色流式分析、质谱流式细胞计数、原代细胞分离培养、细胞治疗CAR-T消融原理：操作流程：组织消融后： 组织高利用率、单细胞化过程高效、单细胞高产出1、操作简易，制备流程全自动，仅需30min即可获取大量单细胞悬液2、自动控温，保护样品活力，细胞活性可达85%以上3、多种消化方案，针对不同样品选择不同程序，针对不同组织使用不同试剂盒4、针对临床穿刺样本，使组织的利用率几乎达到100%，使细胞产量达到10万个以上5、针对原代细胞培养样本，能在15分钟内实现从组织到单细胞的过程，缩短了细胞逆境时间，提高细胞的存活率6、针对组织单细胞测序的应用中，能快速完成单细胞化处理，获得高产且活率稳定在85%以上的单细胞，为单细胞测序提供高质量的样本支持实验效果：技术参数：主要参数参数范围产品名称：单细胞悬液制备仪产品型号：JX-CKSM-12WK（控温型） 温度范围：22℃-56℃（可调）处理样品量：12*2ML/6*5ML重复性稳定：相同制备程序获得相同近似效果程序：6组预设程序（可升级）噪音等级：＜50db 安全设置：无易损件设计，电磁锁定保护；全铝合金CNC内腔，经久耐用样本量：5mg-1000mg转速： 0-4000转/分钟工作时间：20-300min

功能概述单细胞研究对于理解细胞的组成、生理行为与功能的多样性具有重要意义，基因组、转录组、蛋白组、代谢组学等分析技术为单细胞研究提供了有力工具。实时单细胞多模态分析仪可以实时、连续，定量检测单个活细胞的代谢类小分子含量及酶活性。主要性能1)实时单细胞多指标检测:实时检测单个活细胞内小分子含量(如葡萄糖、乳酸、ATP、胆固醇、Ca2+、K+等)及酶活性(葡萄糖苷酶、鞘磷脂酶、乳酸脱氢酶等)，可匹配160余种商品化试剂盒 2)实时亚细胞原位检测:在亚细胞水平(胞质、胞核、胞膜)实现实时连续，原位检测 3)超微量提取、注射:单细胞水平提取细胞器(如溶酶体、线粒体)、胞质进行质谱或其它平台的联用分析 单细胞注射药物、代谢剂等，并进行药效评估 4)活体水平检测:活体水平实时检测生化指标(用药前后、中医药针灸刺激前后)的变化。1.功能特点1.1单个活细胞小分子含量和酶活实时检测 1.2提取注射模块实现单细胞定点提取和注药分析1.3荧光检测和电化学检测双功能匹配 2.应用方向和参考检测指标3.型号参数

功能概述单细胞研究对于理解细胞的组成、生理行为与功能的多样性具有重要意义，基因组、转录组、蛋白组、代谢组学等分析技术为单细胞研究提供了有力工具。实时单细胞多模态分析仪可以实时、连续，定量检测单个活细胞的代谢类小分子含量及酶活性。主要性能1)实时单细胞多指标检测:实时检测单个活细胞内小分子含量(如葡萄糖、乳酸、ATP、胆固醇、Ca2+、K+等)及酶活性(葡萄糖苷酶、鞘磷脂酶、乳酸脱氢酶等)，可匹配160余种商品化试剂盒 2)实时亚细胞原位检测:在亚细胞水平(胞质、胞核、胞膜)实现实时连续，原位检测 3)超微量提取、注射:单细胞水平提取细胞器(如溶酶体、线粒体)、胞质进行质谱或其它平台的联用分析 单细胞注射药物、代谢剂等，并进行药效评估 4)活体水平检测:活体水平实时检测生化指标(用药前后、中医药针灸刺激前后)的变化。1.功能特点1.1单个活细胞小分子含量和酶活实时检测 1.2提取注射模块实现单细胞定点提取和注药分析1.3荧光检测和电化学检测双功能匹配 2.应用方向和参考检测指标3.型号参数

功能概述单细胞研究对于理解细胞的组成、生理行为与功能的多样性具有重要意义，基因组、转录组、蛋白组、代谢组学等分析技术为单细胞研究提供了有力工具。实时单细胞多模态分析仪可以实时、连续，定量检测单个活细胞的代谢类小分子含量及酶活性。主要性能1)实时单细胞多指标检测:实时检测单个活细胞内小分子含量(如葡萄糖、乳酸、ATP、胆固醇、Ca2+、K+等)及酶活性(葡萄糖苷酶、鞘磷脂酶、乳酸脱氢酶等)，可匹配160余种商品化试剂盒 2)实时亚细胞原位检测:在亚细胞水平(胞质、胞核、胞膜)实现实时连续，原位检测 3)超微量提取、注射:单细胞水平提取细胞器(如溶酶体、线粒体)、胞质进行质谱或其它平台的联用分析 单细胞注射药物、代谢剂等，并进行药效评估 4)活体水平检测:活体水平实时检测生化指标(用药前后、中医药针灸刺激前后)的变化。1.功能特点1.1单个活细胞小分子含量和酶活实时检测 1.2提取注射模块实现单细胞定点提取和注药分析1.3荧光检测和电化学检测双功能匹配 2.应用方向和参考检测指标3.型号参数

功能概述单细胞研究对于理解细胞的组成、生理行为与功能的多样性具有重要意义，基因组、转录组、蛋白组、代谢组学等分析技术为单细胞研究提供了有力工具。实时单细胞多模态分析仪可以实时、连续，定量检测单个活细胞的代谢类小分子含量及酶活性。主要性能1)实时单细胞多指标检测:实时检测单个活细胞内小分子含量(如葡萄糖、乳酸、ATP、胆固醇、Ca2+、K+等)及酶活性(葡萄糖苷酶、鞘磷脂酶、乳酸脱氢酶等)，可匹配160余种商品化试剂盒 2)实时亚细胞原位检测:在亚细胞水平(胞质、胞核、胞膜)实现实时连续，原位检测 3)超微量提取、注射:单细胞水平提取细胞器(如溶酶体、线粒体)、胞质进行质谱或其它平台的联用分析 单细胞注射药物、代谢剂等，并进行药效评估 4)活体水平检测:活体水平实时检测生化指标(用药前后、中医药针灸刺激前后)的变化。1.功能特点1.1单个活细胞小分子含量和酶活实时检测 1.2提取注射模块实现单细胞定点提取和注药分析1.3荧光检测和电化学检测双功能匹配 2.应用方向和参考检测指标3.型号参数

一、产品介绍PRECI SCS-R300拉曼单细胞分选仪是一款集共聚焦拉曼光谱检测系统与单细胞可视化分选系统为一体的细胞识别与分离设备，基于拉曼光谱技术对目标菌进行识别，并在单细胞水平上进行测序、培养等研究，搭建单细胞表型与基因型的桥梁，为各领域单细胞研究提供新策略。此外，拉曼分选技术还可用于微塑料等微小颗粒的识别与分离研究。PRECI SCS-R300的单细胞分选原理二、微生物单细胞研究意义单细胞研究是目前生物学研究热点前沿领域。过去十年来，在动物学研究中利用单细胞技术重新理解了细胞分化、细胞周期和细胞免疫等重要的生命过程。然而对微生物单细胞的研究目前尚处于起步阶段，所以实现微生物单细胞鉴定、功能菌快速筛选、微生物鉴定、可视化单细胞分离和高通量筛选，将为微生物的研究提供技术突破。传统群体研究方法：对微生物群落的整体检测，得到的是平均值无法反应不同细胞在群落中的功能；宏基因测序虽然能反应群落的组成与丰度，但仍无法准确找到哪种微生物发挥关键作用。单细胞研究新技术：能够绕过培养阶段，在单细胞水平上建立表型与基因型的联系，有效解决群体研究存在的问题，为功能微生物、突变株、耐药菌、未/难培养微生物等研究提供新策略。三、微生物单细胞研究策略四、研究领域细胞生物学（细胞种类鉴定、细胞代谢检测等）、植物发育学（遗传育种、遗传机制研究等）、遗传学（干细胞生长、分化、成熟的动态监测等）、微生物学（微生物种属鉴定、药敏检测等）、病理学（肿瘤精准分选、肿瘤术中导航、快速病理分析等）、药代动力学（药物在细胞中的代谢监测等）、免疫学（免疫微环境等）、食品学（食品安全、发酵工程菌等）等。五、实验方案1. 基于形态的微生物单细胞分离根据微生物细胞的长度、宽度、长径比、规则度等形态学指标，进行识别、定位与编号，自动将目标形态的微生物单细胞分离出来。微生物单细胞智能图像识别功能单细胞分选结果 2. 基于拉曼光谱的微生物单细胞识别与分离2.1 耐药菌/功能微生物（如有机物降解菌）的拉曼识别重水标记：对于有代谢活性的微生物细胞，D2O会经代谢进入碳骨架，形成C-D键，使峰位红移至静默区。使用此方法可以检测细菌/细胞在压力环境下（如抗生素、高温、高压等）的代谢活性，从而鉴定耐药菌或极端微生物。13C或15N稳定同位素标记：13C或15N同位素探针能够通过底物完成对生物标志物的标记，带有重同位素的生物标志物，其拉曼特征谱线因同位效应将发生红移动（同位素结合率＞10%时），采用光谱对比分析很容易鉴别出来，进而确定目标微生物单细胞。功能菌拉曼识别流程 2.2 研究样品中的“未知菌”（无法确定目标菌的种属、功能等信息）微生物单细胞内所有化合物的拉曼信号构成的“单细胞拉曼图谱”可作为其“化学指纹”，进行细胞种属的区分和鉴定，具有快速、灵敏、非破坏性等优势，开辟了微生物鉴定的一个全新领域。首先，使用形态特征对细胞进行初筛，再应用拉曼光谱聚类分析法，将样品中的微生物划分为不同类别，应用可视化弹射分选的方式，将各类别的微生物细胞分离出来，进行全基因组扩增及高通量测序分析。“未知菌”单细胞研究方案 3. 基于荧光的微生物单细胞分离根据目标菌的荧光信号（自发荧光、荧光染料、探针标记、FISH等），将单细胞识别并分离出来。荧光菌单细胞分离 六、应用案例1.肠道耐药微生物研究本文应用结合同位素-拉曼光谱、单细胞分选与mini-meta测序分析技术，对人肠道微生物中的耐药菌群进行研究，揭示肠道耐药菌与个人用药史之间的相关性。文献：Raman-activated sorting of antibiotic-resistant bacteria in human gut microbiota2.D2O探针追踪耐药基因的水平转移单细胞拉曼光谱结合逆向D2O标记(Raman- rD2O)是一种灵敏、快速的表型工具，可用于跟踪质粒携带抗生素耐药基因（ARGs）从土壤通过转化向临床细菌的传播。Raman-rD2O敏感地从大量受体细胞中识别出低丰度的表型耐药转化子，随后结合单细胞分选技术获得目标转化菌，并进行基因鉴定，从而探索耐药基因的水平转移。文献：Phenotypic Tracking of Antibiotic Resistance Spread via Transformation for Environment to Clinic3. 嗜冷电活性微生物的mini-metagenome分析采用拉曼单细胞分选技术，层次聚类分析、宏基因组测序相结合的方法，深入研究了嗜冷菌的基因与代谢功能。文献：Mini-metagenome analysis of psychrophilic electroactive biofilms based on single cell sorting 4. 铁还原菌的荧光识别与单细胞分离培养本文合成了一种Fe2+特异性荧光化学探针（FSFC），应用荧光检测与单细胞分选技术，将铁还原菌（FeRM）从群落中识别并分离出来，而且实现了分离单细胞的培养，成功获得了功能菌株。文献：Visualizing and isolating iron-reducing microorganisms at single cell level5. 工程菌筛选使用拉曼技术分别检测产菊粉酶酵母和对照样品的胞体及培养基代谢物，确定产菊粉酶的工程菌拉曼光谱存在差异，用其构建的数据库，结合可视化单细胞分选培养，提高工程菌筛选效率。