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芯片杂交仪

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芯片杂交仪相关的资讯

  • 比朗简述核酸分子杂交技术及未来展望
    核酸分子杂交技术是20世纪70年代发展起来的一种崭新的分子生物学技术。它是基于 DNA分子碱基互补配对原理,用特异性的核酸探针与待测样品的DNA/RNA形成杂交分子的过程。分子杂交实验依据其形式的不同可以分为液相杂交、固相杂交、原位杂交,而固相杂交又可以分为菌落杂交、点/狭缝杂交、Southern印迹杂交和Northern印迹杂交。各类型杂交稻基本原理和步骤是基本相同的,只是选用的杂交原材料、点样方法有所不同。   核酸分子杂交的技术应用:   (1)Southern印记杂交   1、单基因遗传病的基因诊断:早在1978年,简悦威等医学家在镰状细胞贫血症的基因诊断中就采用过Southern杂交的方法,取得了基因诊断的突破。   2、基因点突变的检测:例如ATP敏感性钾离子通道的亚单位内向整流钾通道基因A635G突变的检测   (2)Northern印记杂交Northern印记技术多用来检查基因组中某个特定的基因是否得到转录以及转录的相对水平。   目前,Northern印记技术仍然被认为是检测基因表达水平的金标准。(3)液相杂交 以液相杂交技术为基本工作原理设计的多功能悬浮点阵仪是液态芯片技术应用的典范。这一技术平台已被应用于遗传突变的分子诊断,如出生缺陷干预工程中的Down&rsquo s综合征、珠蛋白合成障碍性贫血、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺陷的基因诊断,也已被用于SNPs分析、感染性疾病的鉴别诊断、药物敏感性和亲子鉴定。此外,还可以应用于基因表达谱的分析,从而进行肿瘤性疾病如血液病、乳腺癌、肝癌、胃癌、肺癌、膀胱癌和结肠癌的分子病理学研究。   比朗小编总结到尽管核酸分子杂交技术的应用越来越广泛,但其在临床实用中仍存在不少问题,必须提高检测单拷贝基因的敏感性,用非放射性物质代替放射性同位素标记探针以及简化实验操作和缩短杂交时间,这样,就需要在以下三方面着手研究:   第一,完善非放射性标记探针   第二,靶序列和探针的扩增以及信号的放大   第三,发展简单的杂交方式,只有这样,才能使DNA探针实验做到简便、快速、低廉和安全。   上海比朗仪器有限公司专业生产分子杂交仪、分子杂交箱、紫外交联仪厂家,了解分子杂交技术更多信息请链接:http://www.canytec.info
  • 四维杂交技术推动基因检测进入临床时代
    我国科技工作者自主创新研发成功的四维参数系统核酸分子杂交技术,一改传统DNA检测技术检测结果再重复性差的弱点,做到了被测物在不同时间、不同地点、不同操作者以及不同种类反应之间的再重复性,从而实现了临床应用反应体系与实验室检测关键参数的反应体系的一致性。为基因检测技术在临床上真正适用提供了可能。   自1953年发现生物遗传分子脱氧核糖核酸(DNA)的双螺旋结构,提出生物遗传基因的分子机理以来,DNA检测技术就成为当代生命科学研究的重要技术手段。从上世纪八十年代开始,DNA检测技术在生命科学、农业、轻工业、医药、法医、考古等行业得到广泛应用。但由于现有的DNA检测技术采用的是三维参数系统杂交技术,大都是通过基因扩增(PCR)技术进行检测,经常会受到假阳性信号的困扰。使得被测物在同样的检测技术手段下,会因检测时间、检测地点、操作者的不同出现不同的检测结果,检测结果准确度较低。英国《自然》杂志今年发表的一篇论文就指出,依靠现有基因检测技术对人类30亿个对碱基对检测结果编制的人类基因组图谱,其准确率最高不超过85%。   由北京广博世纪基因芯片科技有限公司研发成功的四维参数系统核酸分子杂交技术,突破性的引入了温度因子。被测物在能提供稳定反应微环境的四维参数系统杂交反应试剂处理后,做到了被测物在各种情况下检测数据的一致性。实验表明,相关被测物在冰箱冷冻一年以上,解冻后仍可重复一年前的测试过程和测试结果。   四维杂交技术业经中国医学科学院北京协和医院历时一年多的检测证明,该技术具备理化标准的准确度、溯源性和可靠性。为临床DNA检测提供了坚实可靠的基础,其显著特点,使之既可为实际系统做质量控制,也可以为仪器系统做质量控制和校正,从而实现了DNA检测技术的一次革命。
  • 杂交水稻国家重点实验室通过验收
    2014年5月29日,依托湖南杂交水稻研究中心和武汉大学联合共建的&ldquo 杂交水稻国家重点实验室&rdquo 通过了科技部组织的专家验收。   验收专家组按照《国家重点实验室建设与管理办法》和国家重点实验室验收的总体要求,对实验室建设期间的运行情况进行了认真细致的考察评估。专家组一致认为,实验室研究方向明确,特色鲜明,圆满完成实验室建设任务,实现了预期目标。   杂交水稻国家重点实验室于2011年获科技部批准建设。根据国家粮食安全重大需求和杂交水稻学科前沿发展趋势,结合自身优势,实验室主要从水稻杂种优势机理、水稻发育与育性机理、杂交水稻种质创新与基因挖掘、超级杂交稻育种、杂交水稻繁育与种子学、杂交水稻超高产生理生态6个方向,开展杂交水稻基础与应用基础研究。建设期间,实验室承担973、863计划等国家级、省部级及国际合作课题110余项,发表学术论文162篇(其中SCI收录论文120篇),获授权发明专利32项,审定以超级杂交稻Y两优2号为代表的杂交稻品种35个,获国家科技进步特等奖、二等奖各1项,省部级科技奖8项。在水稻不育系育性调控关键基因的克隆及作用机理研究、两系法广适性超高产杂交水稻技术研究与应用等方面取得了重要研究进展。
  • 罗云波:都吃杂交稻怕啥转基因
    转基因食品是什么东西?不少市民在超市看到转基因食用油时,恐怕都会有如此疑虑,也因此不敢选购。“其实这种恐惧完全没有必要”,中国农业大学食品科学与营养工程学院院长罗云波认为,转基因食品其实和杂交水稻原理一样,“天天都在吃杂交水稻,为啥就不能接受转基因?”   它和杂交水稻差不太多   转基因食品到底是高科技福音?还是健康和环境隐患?罗云波说,其实大可不必把它看得太神秘。和杂交水稻一样,转基因食品也是希望通过基因交换改良品种。不同的是,它的目的性更强,是把某种功能的基因找出来,放进想改造的品种里。   罗云波认为,老百姓之所以不敢吃转基因食品,是因为对它不了解。“大部分人可能连基因是什么都不知道,以为科学家把一个叫基因的东西放到食品里去了,这个食品很危险!实际上所有食品都来自生物体,一口进去,满嘴都是基因。”   标准比任何食品都苛刻未出现过一例安全事故   据了解,多数国家对转基因食品持谨慎态度。“转基因产品要上市,必须经过严格的安全性评价。”   首先要检测转了什么基因,这个基因的功能、来源、有无不良记录,等等。此外,作为食品,还要经受毒理学、致敏学、营养学等方面的评价,建立相关规范。罗云波说,转基因食品的安全性评价极其严格,“比任何一种食品都苛刻”。   由于上市要求严格,目前我国市场上转基因食品相对还比较少。老百姓经常见到的主要为转基因菜籽油、转基因大豆油等产品。   然而,作为一种人造的生物,转基因食品真的安全吗?如果今后人们吃的都是转基因食品,会给人类带来什么影响?   罗云波称,转基因食品发展至今已接近30年,还没有一例因吃了转基因食品生病或是死亡的案例。至于转基因食品对食用者的下一代或者再下一代能否保证安全,专家无法直接断言,但是可以用科学的方法研究,比如正在做的以细胞模型的形式,看10代、20代甚至50代的细胞,看转基因的成分对细胞有没有影响。   对于一些环保组织极力反对转基因食品,罗云波认为,这与他们强调“原生态”、反对一切人为干预的宗旨有关。他认为,这种完全拒绝科学技术的做法比较绝对,有失偏颇。   未来转基因食品可防病   “有转基因和非转基因的食品,我肯定选转基因的。”罗云波说,转基因食品发展的第一阶段是抗虫、抗病,也就意味着农民可以少用农药,少些残留。“农药残留的害处清清楚楚,但转基因的害处还没有发现”。   现在已出现的第二代转基因食品,则会改变食品的品质。比如说强化了某种营养素,国外已经有了转基因赖氨酸的小麦,赖氨酸是人类必需的氨基酸,只能从食物中补充。   而当第三代转基因出现时,“那时老百姓看到‘转基因’的标牌就会抢购了”。通过转基因技术,食物也可以附加治疗、保健作用。   罗云波介绍,科学家正在想办法把胰岛素基因转移到植物或动物中,比如转移到西红柿中或奶牛体内,吃个西红柿、喝杯牛奶就能得到胰岛素的补充,对糖尿病病人来说是一个福音。同样,把乙肝疫苗表面抗原的基因转移到西红柿里去,吃几个西红柿,就有了乙肝的免疫。   面对面   记者:现在市场上出现了生态食品、无公害食品、绿色食品、有机食品,划分的标准是什么?   罗云波:企业推销一个商品,一定要把它的特点和优点说出来,所以就出现了形形色色的各种食品。但目前公认的、比较规范的是有机食品、绿色食品、无公害食品。其中,有机食品标准最高、最苛刻,基本上不用农药、化肥。绿色食品是有限地使用化学物质。而无公害食品可以使用化肥、农药,但是要按照规范使用,对大家的健康有保障。无公害食品可以说是食品最起码的标准。   记者:您提到的有机食品等,老百姓根本没办法鉴别,用普通蔬菜换个包装,贴上标签就可以“变身”,这个问题怎么解决?   罗云波:从外观上确实很难看出来。要让老百姓放心,目前还得靠商家诚信,大的卖场对它的供货商是有要求的,也是知根知底的。今后食品可追溯体系的建立也可以杜绝这方面的问题。只要刷一下条码,就能知道食品的来源和基本信息。
  • 深圳先进院发展出可容错编码的序贯荧光原位杂交技术
    3月17日,中国科学院深圳先进技术研究院合成微生物组学研究中心、深圳合成生物学创新研究院戴磊课题组,在《自然-通讯》(Nature Communications)上,发表了基于成像的空间微生物组最新研究成果(Spatial profiling of microbial communities by sequential FISH with error-robust encoding)。   该团队发展了一种可容错编码的序贯荧光原位杂交(SEER-FISH)技术,用于解析复杂微生物群落的空间结构。该方法可识别复杂群落中的不同微生物物种,在单细胞尺度上原位解析微生物物种之间以及微生物-宿主之间的相互作用,是探究微生物群落的生态和功能的重要工具。   自然界中的微生物群落具有丰富的物种多样性。各种微生物独特的生存方式和相互作用关系构成了群落特定的空间结构。尽管现有的高通量测序技术能够描绘微生物群落的物种组成及丰度,但缺乏解析群落空间结构的有力工具。由于传统荧光显微成像技术可分辨的物种数量受限于荧光基团的颜色种类,绘制高物种分辨率的复杂微生物群落的空间结构颇具挑战性。   基于此,研究发展了新的SEER-FISH成像技术并将其用于复杂微生物群落,在微米尺度上绘制了拟南芥根系定植的微生物群落的空间分布,观测到不同物种在根表上的空间异质性定植以及在受到宿主代谢物扰动后的空间分布变化和物种空间关联改变。SEER-FISH技术可以精准解析复杂微生物群落的空间结构,为探讨植物根际、人体肠道等宿主共生微生物组的生态规律和生理功能提供了有力工具。   SEER-FISH通过序贯荧光原位杂交的方式实现微生物群落空间结构的解析。它的工作原理是为每种微生物分配特定的多色编码,每轮使用带有相应颜色荧光基团的寡核苷酸探针来标记对应的微生物,再通过多轮荧光原位杂交成像获取每个细胞的多色编码,从而确定其对应的物种(图1a-c)。该团队进一步对编码进行优化,使用不同汉明距离(HD,hamming distance)的纠错编码可以提高物种准确识别率,且具有高度的可扩展性(图1d)。   研究在不同微生物群落的体外成像实验中对SEER-FISH技术进行系统评估。实验验证了该方法对群落组成识别的准确性和可重复性,能够准确量化群落物种组成的变化(图2a-c),使用不同的编码方案所得到的群落组成高度一致(图2d-f)。   植物根际定植着高度多样的微生物群落。它们既受到植物宿主的调控又影响植物的生理健康。然而,科学家对于根际微生物群落的空间结构却鲜有研究。研究将SEER-FISH应用于根表微生物的空间成像,勾勒了不同生理分区分布定植的微生物群落组成 (图3a-c)。   研究发现,定植在根表的微生物群落并非随机分布,而是倾向于形成聚集体。这些微生物聚集体的尺度在几十到几百微米,并存在多个物种(图3d-f)。微生物聚集体的形成的具体原因有多种假说,包括偏好性定植、提高在根际环境下的适应性等。此外,研究通过对群落中的微生物进行邻近关系分析,发现了显著的菌-菌空间关联(图3g)。   通过外源添加拟南芥根际分泌的代谢产物植保素(camalexin)和香豆素(fraxetin),研究发现根际微生物的组成和空间分布均发生了显著变化(图4a-c)。例如,中华根瘤菌主要定植于靠近根尖的位置,而这种偏好性的定植在加入植保素和香豆素后发生改变(图4d)。农杆菌本身在根上的定植没有偏好性,但在受到香豆素扰动后表现出更多的定植于根成熟区(图4e)。根际微生物空间分布的高度异质性和物种之间的差异,与环境异质性、微生物本身的特性均有关。   研究进一步对定植微生物的空间关联进行分析,发现植保素和香豆素均不同程度地影响改变了物种之间的空间关联(图4f)。微米尺度下的空间关联暗示了微生物群落中不同物种之间广泛存在的短程相互作用(如营养竞争与互养、接触抑制、群体感应等),对于进一步的机制研究有重要的指导意义。   研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、广东省自然科学基金及深圳合成生物创新研究院的支持。
  • 上海比朗新型分子杂交仪即将上市 今日已预抢购12台
    上海比朗新型分子杂交仪即将上市,今日已提前提前预抢购12台。上海比朗仪器有限公司将致力于打造分子杂交仪中国第一品牌,公司2013年投入资金将近1000万与上海交大、复旦等名校联合开发自主创新的技术和品牌,根本解决国内目前分子杂交仪性能不稳定、质量不可靠的问题。   今日上午9点26分,安徽的刘先生提前预定6台比朗新型分子杂交仪。我公司将按照客户要求一对一定制,针对用户需求提出专业化的解决方案。比朗将刘先生要定的低温槽信息公布如下,有关问题请及时与我公司客服联系021-52965776.   上海比朗仪器有限公司研发、生产的BILON品牌LF系列分子杂交仪是依据核酸分子杂交仪技术原理,采用智能型数字温度控制器,可作分子杂交,也可作酶联反应的孵育器。并且与酶免结合可建立全定量或半定量PCR检测方法。在病毒、细菌疾病的基因诊断的临床检测中具有良好的应用效果。 技术参数: 型 号 LF-I LF-III 温度范围(℃) 室温+5-100 控温精度(℃) ± 0.5 温度均匀性误差(℃) ± 0.03 温度显示分辨率(℃) 0.1 温度平衡时间(min) <20 旋转速度 6.5± 0.5r/min 5-20r/min 带酶标板振荡且振幅可调 杂交瓶规格(mm) ¢35× 220 (可定做) 电源电压 220VAV,50HZ   上海比朗关于分子杂交仪产品促销的规定,我公司新型分子杂交仪将于11月初上市,促销时间为十月十日至十一月中旬,再次期间我公司将对新老客户提供最大的优惠。关注分子杂交仪更新资讯链接http://www.canytec.info
  • 新一代高效多重荧光原位杂交技术研制成功
    近日,华中农业大学教授曹罡、副研究员戴金霞团队在《自然—通讯》发表新一代效率高、特异性强、信号强和背景噪音低的荧光原位杂交方法—p-FISH rainbow,突破了现有的技术壁垒,克服了目前荧光原位杂交技术领域的缺陷和不足,可广泛应用于动物、植物和病原微生物中多种生物分子的高效检测、细胞亚群和空间图谱的原位注释、染色体变异原位验证、多重蛋白共同检测和短核酸序列的检测,为生命科学研究和临床诊断提供了有力的工具。生命体的细胞功能多样性源于细胞的异质性和组织环境的复杂性,确定组织环境中细胞类型和分子特性对于解析细胞—细胞相互作用和组织的功能机制尤为重要。近年来,尽管单细胞RNA测序(scRNA-seq)促进了细胞异质性的解析,却伴随着组织微环境和细胞空间信息的缺失,限制了对生命信息的深度解读。荧光原位杂交技术(FISH,fluorescence in situ hybridization)通过特异性杂交解析生物分子的表达水平和空间位置,极大地促进了细胞中基因空间表达信息的探究,加速了我们对组织微环境和功能机制的深入理解。尽管目前荧光原位杂交技术经过不断地改进已经取得了巨大的进步,但仍存在一些挑战:当前方法通常需要大约1kb或更长的核酸序列用于多个靶标探针的杂交,才能产生足够的信号强度,限制了对短核酸序的检测;只能单独检测DNA、RNA和蛋白质,或共同检测RNA和蛋白质,还没有有效方法同时检测DNA、RNA和蛋白质;如何在实现高杂交效率和高信号强度的同时,保证低背景噪音仍然是原位杂交技术的一个关键挑战。针对当前荧光原位杂交技术面临的挑战,该团队开发了杂交效率高、信号放大能力强、背景噪音低、特异性好、检测通量高、应用范围广的新型荧光原位杂交方法—π-FISH rainbow。该方法具备高度创新性和优越性。新型π型靶探针(含2-4个互补碱基对)和U形放大探针的设计使该方法比目前主流的FISH方法,如smFISH和HCR等,杂交效率更高、背景噪音更低和信号放大能力更强。该方法可以实现DNA、RNA和蛋白质多重分子的共同检测,这一突破对破译生物大分子复合物参与生命活动调控机制的研究具有十分重要的意义。目前的荧光原位杂交技术方法还无法克服短序列的限制,难以实现对短序列RNA(如microRNA)、短序列DNA(如DNA突变、倒位、异位)以及可变剪接等分子的检测。π-FISH rainbow方法可以高效检测上述短核酸序列分子的空间信息。该方法应用范围非常广泛,可用于动物、植物和微生物(细菌,病毒和寄生虫等)样品的检测,并且不拘泥于样本制备的限制,可适用于冰冻样本、石蜡样本和整体胚胎样本的检测。该研究利用π-FISH rainbow方法探究了重要的生物学问题并获得了新的发现。他们成功鉴定了前列腺癌患者循环肿瘤细胞中雄激素治疗抵抗标志物雄激素受体剪接变体7 (ARV7),解决了前列腺癌治疗中缺乏精准诊断的难题,为前列腺癌患者雄激素耐药性治疗提供了重要的临床指导。该方法通过4个荧光通道组合编码,每轮可同时实现15个基因的检测,从而在同一张小鼠初级感觉皮层(S1)组织切片上通过两轮杂交检测了21个神经元的标记基因,不仅再现了小鼠S1皮层不同亚层神经元的空间分布,而且绘制了小鼠S1皮层中13个抑制性神经元亚群的空间图谱由于π-FISH rainbow的高灵敏度,该研究首次发现肿瘤细胞周期关键调控因子lncRNA MALAT1具有三种不同的亚细胞定位模式。其中,MALAT1的核聚集模式显示与miR145-5p的高度共定位。这些研究展现了π-FISH rainbow技术在基础科学研究和临床诊断中的巨大应用潜力。曹罡、戴金霞为共同通讯作者,博士研究生陶影峰和周小六为共同第一作者。该研究得到了国家自然科学基金、广东省重点研发计划、中央高校基本科研业务费专项资金项目的资助。
  • 中国组建首个杂交水稻国家重点实验室
    中新社长沙6月25日电 (记者 邓霞)经科技部批准成立的中国首个杂交水稻国家重点实验室,25日在湖南长沙挂牌。这个集合国内杂交水稻最强科研力量的专业机构将致力于实现超级杂交水稻亩产1000公斤的目标。   由湖南杂交水稻研究中心、武汉大学共同组建的杂交水稻国家重点实验室,将围绕杂交水稻持续增产这一核心目标,启动杂交水稻种子创新与基因挖掘、杂交水稻繁育、杂交水稻超高产等6大基础理论和应用技术研究,为中国水稻持续增产和粮食安全提供技术支撑。“杂交水稻之父”袁隆平院士担任该实验室的学术委员会主任。   湖南省副省长郭开朗指出,湖南杂交水稻研究中心是国内外第一家杂交水稻专业科研机构,一直处于国际领先地位 武汉大学水稻研究历史悠久,基础理论研究实力雄厚。两方合力组建实验室,有利于整合双方在资源、技术和人才上的优势。他表示,要将其建设成国际一流的实验室。   实验室实行学会委员会指导下的主任负责制,袁隆平院士担任学术委员会主任,湖南杂交水稻研究中心符习勤研究员担任实验室主任。实验室奉行“开放、流动、联合、竞争”的方针,培养和引进高层次人才。袁隆平表示,这个开放式的实验室不仅和武大合作,还会引进全国的优势单位和专家来此工作,共同研究杂交水稻。   中国工程院院士、武汉大学教授朱英国表示,实验室成立后,将尽快把杂交水稻父本、母本和杂种的基因分析清楚,进一步提高杂交稻的产量,为实现袁隆平院士培育亩产1000公斤的超级杂交稻的愿望努力。   由袁隆平院士领衔的中国杂交水稻技术研究在国际上领先,这一技术的推广应用帮助世界上人口最多的国家解决了温饱问题。中国每年种植杂交水稻所增产的粮食可多养活7000万人口。
  • 生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心生物芯片培训班
    生物芯片北京国家工程研究中心 新疆分中心生物芯片培训班 主办:生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心 协办:生物芯片北京国家工程研究中心   生物芯片技术凭借着显著的优势和巨大的潜力,已经成为在医学、农业、微生物等相关研究领域快速增长的一项重要技术。随着基因组学、蛋白质组学的不断深入研究,生物芯片技术的应用范围不断扩大,已经广泛应用于重大疾病预警、产前诊断、食品安全检测、作物经济性状关联研究(GWAS)、遗传育种;动植物病理学、农作物病虫害防治、种质资源鉴定、转基因作物等领域。   以生物芯片为工具的研究已经渗透到生命科学领域研究中的每个角落,随着研究的不断深入,产生了大量的科研成果,几乎每天都有大量高水平研究文章发表。为了扩大交流,促进科研成果转化,搭建科研成果与成果转化之间的桥梁,由生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心举办&ldquo 生物芯片技术在生命科学领域的应用&rdquo 培训班。本培训班将系统讲解基因芯片的设计、制作以及相关实验操作,旨在为您打造一片属于您的&ldquo 芯&rdquo 天地。   在此次培训班的尾声,2012' 喀纳斯科学与艺术论坛恰在乌鲁木齐举行。此次论坛特邀请了多位院士、科技部领导及三甲医院院长,将围绕新疆特高发疾病等重大科学问题开展学术探讨和合作交流。欢迎各位在8月10日前来观会。 培训内容 | 生物芯片技术培训 1.1 理论部分:生物芯片技术在生命科学领域中的应用 1.2 理论部分:表达谱芯片构建、探针设计、数据分析等基础理论知识讲解 2.1 实践部分: 观摩芯片点制过程 2.2 实践部分:晶芯表达谱实验整个实验流程(视频) 2.3 实践部分: 芯片杂交、清洗、扫描(培训学员模拟杂交、扫描) 2.4 实践部分: 数据分析(培训学员亲自对数据进行分析) 2.5 实践部分: SAM、Cluster等数据分析软件使用 2.6 实践部分:分子功能注释系统(MAS)分析 注册方法:申请培训学员填写培训回执表后,发到培训联系人吕国栋邮箱中,进行确认,培训联系人在收到回执表后3天之内给 予回复。 培训时间:2012年8月7-9日 培训地点:新疆医科大学第一附属医院 科技楼4楼 省部共建国家重点实验室培育基地会议室 (新疆乌鲁木齐市新市区鲤鱼山路1号)。 培训费用:培训费用免费,食宿费用自理。 培训规模:20人左右,为保证培训班质量,采取小班模式。请学员自带电脑。 培训资料:包括培训讲师幻灯、培训教材、培训学员通讯录、培训证书(生物芯片北京国家研究中心印)、精美礼品一份。 注意事项 报到时间:2012年8月6日 报到地点:新疆医科大学第一附属医院 科技楼7楼生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心。 住宿地点:新疆医科大学第一附属医院附近宾馆酒店(仅供参考): 1、新疆昆仑宾馆(三星级) 地址:乌鲁木齐市新疆维吾尔自治区 友好北路146号 电话:0991-5190000 2、乌鲁木齐宇豪馨怡酒(四星级) 地址:乌鲁木齐市新疆维吾尔自治区 新市区新医路359号 电话:0991-4328555 行车路线: 1、火车站(距新疆医科大学第一附属医院8公里左右):(1)、乘出租车到达新疆医科大学第一附属医院(车费大约15元左右)。 (2)、乘坐906,52路公交车均可以到达新疆医科大学第一附属医院(车费1元)。 2、机 场(距新疆医科大学第一附属医院13公里左右): (1)、乘坐出租车到新疆医科大学第一附属医院(大约21元左右); (2)、从乌鲁木齐地窝堡国际机场535路公交车通往新疆医科大学第一附属医院。 联系方式:联系人: 新疆医科大学第一附属医院 生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心 吕国栋 电话: 0991-4366042 邮箱:xjmicroarray@163.com 客户培训回执表 姓名: E-mail: 单位: 电话: 地址: 邮编: 是否需要帮助预定宾馆(协议宾馆): 是 否备注:如果需要安排宾馆,请注明入住时间: 您感兴趣的领域:
  • 基因芯片及其最新进展
    注:最新的测序技术会实现全自动化、实时化、微型化,虽然与传统的芯片技术并不相同,但其理念有共通之处,所以也将其纳入&ldquo 芯片&rdquo 范畴。&mdash &mdash 彭雷   80年代中期,俄罗斯科学院恩格尔哈得分子生物学研究所和美国阿贡国家实验室(ANL)的科学家们最早在文献中提出了用杂交法测定核酸序列(SBH)新技术的想法。当时用的是多聚寡核酸探针。几乎与此同时英国牛津大学生化系的Sourthern等也取得了在载体固定寡核苷酸及杂交法测序的国际专利。   基因芯片利用微电子、微机械、生物化学、分子生物学、新型材料、计算机和统计学等多学科的先进技术,实现了在生命科学研究中样品处理、检测和分析过程的连续化、集成化和微型化。   1997年世界上第一张全基因组芯片&mdash &mdash 含有6166个基因的酵母全基因组芯片在斯坦福大学Brown实验室完成,从而使基因芯片技术在世界上迅速得到应用。   基因芯片技术主要包括四个基本要点:芯片方阵的构建、样品的制备、核酸分子反应和信号的检测。1、芯片制备,先将玻璃片或硅片进行表面处理,然后使核酸片段按顺序排列在芯片上。2、样品制备,可将样品进行生物处理,获取其中的DNA、RNA,并且加以标记,以提高检测的灵敏度。3、生物分子反应,芯片上的生物分子之间的反应是芯片检测的关键一步。通过选择合适的反应条件使样品中的核酸分子与芯片上的核酸分子反应处于最佳状况中,减少错配比率。4、芯片信号检测,常用的芯片信号检测方法是将芯片置入芯片扫描仪中,通过扫描以获得有关生物信息。   基因芯片技术发展的最终目标是将从样品制备、杂交反应到信号检测的整个分析过程集成化以获得微型全分析系统(micro total analytical system)或称缩微芯片实验室(laboratory on a chip)。使用缩微芯片实验室,就可以在一个封闭的系统内以很短的时间完成从原始样品到获取所需分析结果的全套操作。   近年,基因芯片技术在疾病易感基因发现、疾病分子水平诊断、基因功能确认、多靶位同步超高通量药物筛选以及病原体检测等医学与生物学领域得到广泛应用。   一、第一代基因芯片   第一代基因芯片基片可用材料有玻片、硅片、瓷片、聚丙烯膜、硝酸纤维素膜和尼龙膜,其中以玻片最为常用。为保证探针稳定固定于载体表面,需要对载体表面进行多聚赖氨酸修饰、醛基修饰、氨基修饰、巯基修饰、琼脂糖包被或丙烯酰胺硅烷化,使载体形成具有生物特异性的亲和表面。最后将制备好的探针固定到活化基片上,目前有两种方法:原位合成和合成后微点样。根据芯片所使用的标记物不同,相应信号检测方法有放射性核素法、生物素法和荧光染料法,在以玻片为载体的芯片上目前普遍采用荧光法。   相应荧光检测装置有激光共聚焦显微镜、电荷偶合器( charge coup led devices, CCD)、激光扫描荧光显微镜和激光共聚焦扫描仪等。其中的激光共聚焦扫描仪已发展为基因芯片的配套检测系统。经过芯片扫描提取杂交信号之后,在数据分析之前,首先要扣除背景信号,进行数据检查、标化和校正,消除不同实验系统的误差。   对于简单的检测或科学实验,因所需分析基因数量少,故直接观察即可得出结论。若涉及大量基因尤其是进行表达谱分析时,就需要借助专门的分析软件,运用统计学和生物信息学知识进行深入、系统的分析,如主成分分析、分层聚类分析、判别分析和调控网络分析等。   芯片数据分析结束并不表示芯片实验的完成,由于基因芯片获取的信息量大,要对呈数量级增长的实验数据进行有效管理,需要建立起通行的数据储存和交流平台,将各实验室获得的实验结果集中起来形成共享的基因芯片数据库,以便于数据的交流及结果的评估。   典型如SuperArray公司的功能分类基因芯片:   1、引物设计   SYBR Green可与所有的双链DNA反应(包括引物二聚体),为了使扩增反应集中于目的基因,避免非特异性扩增,引物设计成为关键因素。为得到单一特异的扩增产物,避免扩增出序列相似的非特异性产物,采用BLAST或者其他比对方法,检测引物在相应物种(如人,小鼠或大鼠)全基因组中的特异性。为了保证在相同的PCR条件下(特别是统一的退火温度),不同基因均能扩增出相应的特异性产物,对引物的CG值,解链温度(Tm),以及其他化学和物理的特性都进行了优化调整。为了获得高扩增效率,对扩增片段的长度也进行了优化,一般为100到200bp,确保在统一的循环反应的时间范围内,不同基因均能扩增出完整片段。   2、反应体系   为避免非特异性扩增,使用化学修饰的热启动Taq酶,只有经过热激步骤,Taq酶才能发挥扩增活性。同时,反应体系经过优化,可最大限度减少引物二聚体形成,并且保证较难扩增的片段都得到极高的扩增效率。   3、定量结果可靠   在标准的96孔PCR反应仪中进行实时定量PCR实验,为了获得高通量,无法为每个样品单独制备标准曲线。在完全相同的PCR反应条件下,希望表达量不同的多个基因均获得可靠的结果,需要确保每个基因都有较高的扩增效率,从而可采用简单的△△Ct方法计算基因表达量。   其灵敏度高,样品的使用量低,每张芯片使用的总RNA最少可为0.5ng 可观察到的动态线性范围超过105,可以同时检测表达量差异较大的基因 Ct值的平均差异只有0.25个循环,可检测超过两倍的基因表达量变化。因此,第二代功能分类基因芯片是研究特定信号通路或者一组功能相关基因表达量的理想方法。   二、第二代基因芯片   尽管基因芯片技术已经取得了长足的发展,但仍然存在着许多难题和不足。目标分子的标记是重要的限速步骤,如何绕过这一步是人们一直期望解决的问题。其次是检测灵敏度不高,重复性差,无法检测单碱基错配的基因样品。再者,待检测的基因样品必须经过PCR扩增技术的处理以获得足够量的待检测样品,使检测过程相对复杂。我们称具备以上特征的基因芯片技术为第一代基因芯片技术,这些特征充分说明基因芯片技术本身存在着较大的发展空间。   第二代基因芯片包括如下几种:   1. 电极阵列型基因芯片:将微电极在衬底上排成阵列,通过对氧化还原指示剂的电流信号的检测实现基因序列的识别   2. 非标记荧光指示基因芯片:利用荧光分子作为杂交指示剂,在不需对靶基因进行荧光标记的前提下,通过对荧光分子的检测实现基因序列的识别   3. 量子点指示基因芯片:利用量子点作为杂交指示剂,在不需对靶基因进行荧光标记的前提下,通过对量子点的扫描实现基因序列的识别   4. 分子灯塔型基因芯片:利用探针DNA片断的发夹结构,获得单碱基突变检测的能力。   三、第三代基因芯片   目前,众多的第三代基因芯片现在也推向了市场。第三代基因芯片代表了测序的最高水平和未来走向。   1、Illumina微珠基因芯片技术   这是Illumina公司核心技术之一,博奥生物基于Illumina微珠芯片平台,推出SNP分型检测服务以及定制SNP分型检测服务。   它首先用微机电技术在光纤末端或硅片基质上蚀刻出微孔(深度约为3毫米的相同凹槽),将&ldquo 微珠池&ldquo 内的微珠&ldquo 倒&rdquo 入光纤束微孔,每个微孔恰可容纳一个微珠,在范德华力和与微孔壁间流体静力学相互作用下,微珠以&ldquo 无序自组装&rdquo 的方式在微孔内组装成芯片。每种类型的微珠平均有 30 倍左右的重复。   每一个微珠上都偶联有80万左右拷贝数的探针。每一个探针由特异的地址序列(对每种微珠进行解码,29mer)和特异序列(代表不同的检测信息,如SNP 位点序列、基因序列等)组成。用专利的解码技术对芯片上的微珠进行解码,完成对芯片微珠定位信息的收集和确认,也实现芯片生产过程中100%质控。   以四种荧光标记进行16种微珠解码为例,解码过程使用与地址序列互补的且分别标记4种荧光染料的探针进行。把标记4种荧光的不同地址序列探针进行组合,每次杂交后探针清洗下来进行下一轮杂交,通过多轮杂交达到指数型区分能力。   2、Ion Torrent半导体基因芯片   Ion Torrent半导体基因芯片是最新一代的测序技术,它的问世给测序技术的应用带来了激动人心的进展。它采用了半导体技术和简单的化学试剂进行DNA测序,而不是使用光作为媒介。在半导体芯片的微孔中固定DNA链,随后依次掺入ATCG。随着每个碱基的掺入,释放出氢离子,在它们穿过每个孔底部时能被检测到,通过对H+的检测,实时判读碱基。   Ion Torrent个人化操作基因组测序仪(PGMTM)是第一台基于半导体技术的测序仪。与其他测序技术相比,使用该项技术的测序系统更简单、更快速、及更易升级。该测序仪与其他高通量测序仪特征互补,可以迅速完成应急服务项目,缩短服务周期,增加服务效率。   3、实时单分子测序基因芯片   太平洋生物科学公司(PacBio)实时单分子测序基因芯片是直接测由DNA聚合酶将荧光标记的核苷酸掺入互补测序模板。该技术的核心是一个零点启动模式的波导(Zero-mode Wavelength,ZMW)纳米结构的密集排列, 这一排列阵可以进行单个荧光分子的光学审视。   在过去,零点启动模式波导结构被用于从大量高密度的分子中分辨出单一的荧光分子,还没有被用于大量平行分析的操作。为使之用于大量平行分析和数据输出通量(测序数据生成能力),太平洋生物科学公司开发出一种方法,能有效地将零点启动模式波导结构排到表面上,他们采用了电子束光刻技术(Electron beam Lithography)和紫外光电子束光刻技术(Ultraviolet Photo lithography) 以及高度平行的共焦成像系统, 这样可以对零点启动模式纳米结构中的荧光标记分子进行高灵敏度和高分辨率的探测,并采用了一个沉重的稳定平台来确保良好的光学聚焦效果。   4、纳米球基因芯片   全基因组学公司(Complete Genomics)的纳米球基因芯片是以杂交和连接反应为核心的。当通过杂交和连接进行测序的方法出现以后,全基因组学公司推出了新的样品处理方法和纳米阵列平台。基因组DNA首先经过超声处理,再加上一些接头,然后模板环化,酶切。最后产生大约400个碱基的环化的测序片段,每个片段内含有4个明确的接头位点。环化片段用&Phi 29聚合酶扩增2个数量级。一个环化片段所产生的扩增产物称为DNA纳米球(DAN nanoball, DNB)。纳米球被选择性地连接到六甲基二硅氮烷处理的硅芯片上。   5、纳米孔基因芯片技术   另外,还在发展中的纳米孔基因芯片技术是很有潜力的第四代技术。因为这种方法不再需要光学检测和同步的试剂洗脱过程了。   这是一种基于纳米孔(纳米洞)结构的完全不同的测序技术,单个碱基的读取可以靠测定经由纳米级别的孔洞而跨越或透过薄膜的电导率来进行。纳米孔技术可以广泛地归纳为两类:生物类和固态类。   &alpha 溶血素是一种能天然性地连接到细胞膜中继而导致细胞溶解的蛋白质,它第一个被用来做成生物纳米孔模型。第二类纳米孔是以硅及其衍生物进行机械制造而成。 使用这些合成的纳米孔可以降低在膜稳定性和蛋白定位等方面的麻烦,而这些正是牛津纳米孔公司所创立的生物纳米孔系统一直遇到的问题。   例如,Nabsys就发明了一套系统,他们以汇聚的离子束将硅片薄膜打成纳米孔,用于检测与特异性引物进行了杂交的单链DNA穿过纳米孔时的阻断电流变化。 IBM创建了一个更为复杂的系统,能有效地使DNA位移暂停,并在暂停的时候通过隧道电流检测识别每个碱基。   四、基因芯片市场分析   1、国外市场美国illumina公司一家独大   在SNP芯片研究领域,美国illumina公司毫无疑问是霸主,illumina公司凭借自己开发的GoldenGate技术和infinium专利技术一直在SNP芯片领域处于垄断地位。   illumina的全基因组表达谱芯片是目前唯一一种可以达到探针30倍重复的表达谱芯片,其他的芯片都只能达到1-8倍技术重复。因此illumina的全基因组表达谱芯片的重复性是所有芯片中最高的,其重复性R20.996,并且基于第三代基因芯片独特的微珠芯片生产工艺,芯片生产成本较低,信噪比和灵敏度都非常高,其灵敏度&le 1:250,000,芯片检测结果和qPCR相关系数R2=0.97。   因为illumina所占的市场份额越来越多,2012年6月另一基因芯片大厂家Nimblegen公司,正式宣布退出基因芯片市场。   2、国内市场刚刚起步   国内基因芯片制造水平低,相关的企业规模小、投入也少,远达不到国外的水平。所以国内的相关公司均以引进国外基因芯片,提供检测服务为主。不过,随着基因芯片的应用推广,一些公司也开始涉足基因芯片制造。   上市公司达安基因,业务以体外诊断为主,产品主要是试剂盒,但也开始涉足基因芯片制造。达安基因2013年申报的三个专利:一种用于基因检测的电路板 ZL201320244125.X 一种电化学基因芯片 ZL201320244116.0 一种基于基因芯片的检测装置 ZL201320244734.5。   而另一以基因检测服务著称的大企业华大基因,则通过收购国外公司进入基因芯片制造领域。美国上市公司Complete Genomics 公司有自己基因芯片和芯片检测设备。但该公司2011年的业绩只有2000多万美元,其基因测序服务成长大大低于预期,股票跌破发行价,最后被中国华大基因收购。   联川生物在microRNA芯片领域也小有名气,也是唯一一家国产的microRNA芯片,该芯片最大的特点就是更新速度极快,一般新的数据库发表后,第一个将芯片更新到最新版本的就是联川生物。illumina公司于2010年退出了microRNA芯片市场,因illumina公司2006年收购了高通量测序领域NO.1的Solexa公司,成为唯一一家即拥有芯片平台又拥有高通量测序平台的供应商,illumina认为在microRNA领域,高通量测序有不可比拟的技术优势,必然会取代芯片,所以于2010年停产了microRNA芯片。
  • 生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心生物芯片培训班
    生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心生物芯片培训班 &mdash &mdash 打造一片属于您的&ldquo 芯&rdquo 天地   生物芯片技术凭借着显著的优势和巨大的潜力,已经成为在医学、农业、微生物等相关研究领域快速增长的一项重要技术。随着基因组学、蛋白质组学的不断深入研究,生物芯片技术的应用范围不断扩大,已经广泛应用于重大疾病预警、产前诊断、食品安全检测、作物经济性状关联研究(GWAS)、遗传育种;动植物病理学、农作物病虫害防治、种质资源鉴定、转基因作物等领域。   以生物芯片为工具的研究已经渗透到生命科学领域研究中的每个角落,随着研究的不断深入,产生了大量的科研成果,几乎每天都有大量高水平研究文章发表。为了扩大交流,促进科研成果转化,搭建科研成果与成果转化之间的桥梁,由生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心举办&ldquo 生物芯片技术在生命科学领域的应用&rdquo 培训班。本培训班将系统讲解基因芯片的设计、制作以及相关实验操作,旨在为您打造一片属于您的&ldquo 芯&rdquo 天地。 培训内容: 生物芯片技术培训 1.1 理论部分:生物芯片技术在生命科学领域中的应用 1.2 理论部分:表达谱芯片构建、探针设计、数据分析等基础理论知识讲解 2.1 实践部分: 观摩芯片点制过程 2.2 实践部分:晶芯表达谱实验整个实验流程(视频) 2.3 实践部分: 芯片杂交、清洗、扫描(培训学员模拟杂交、扫描) 2.4 实践部分: 数据分析(培训学员亲自对数据进行分析) 2.5 实践部分: SAM、Cluster等数据分析软件使用 2.6 实践部分:分子功能注释系统(MAS)分析 1:注册方法:申请培训学员填写培训回执表后,发到培训联系人于晶晶(yujingjing333@163.com)邮箱中,进行确认,培训联系人在收到回执表后3天之内给予回复。 2:培训地点:宁夏医科大学总医院 生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心实验室(宁夏银川市兴庆区胜利街804号)。 3:培训时间:2012年7月25-27日 4:培训费用:2000元/人,收费包含培训期间芯片试剂耗材费,实验操作及数据分析培训费,中午工作餐、听课费。住宿费自理。 优惠措施: 宁夏地区培训学员培训费用:1000元/人。 报到时现金缴纳培训费,也可提前转账支付。 缴纳培训费账户信息 用户名:宁夏医科大学总医院 开户行:中国工商银行银川胜利街支行 人民币帐号: 2902006919100004647 (请注明缴费用于参加宁夏分中心生物芯片培训班) 5:培训班规模:20人左右,为保证培训班质量,采取小班模式。请学员自带电脑。 6:培训资料:包括培训讲师幻灯、培训教材、培训学员通讯录、培训证书(生物芯片北京国家研究中心印)、精美礼品一份。 7:报到时间:2012年7月24日。(提前转账支付者请在报到时务必携带出示缴费收据证明)   报到地点:宁夏医科大学总医院 生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心(宁夏银川市兴庆区胜利街804号, 科技楼三楼)。 8:住宿地点:宁夏医科大学总医院附近宾馆酒店: 1)银川御泉湾温泉假日酒店(四星级) 地址:银川市兴庆区胜利南街541号 电话:0951-6734888 2)银川天豹酒店(三星级) 地址:宁夏银川市兴庆区清和南街1352号 电话:0951-7899555 3)如家快捷酒店(银川南门广场店) 地址:银川市兴庆区清河南街345号 电话:0951-6082333 4)兰花花大酒店延安店 地址:银川市兴庆区胜利南街739号 电话:0951-4076588;0951-4076388 具体前往报名地点的路线如下: 1)火车站(距宁夏医科大学总医院8公里左右):乘出租车到达宁夏医科大学总医院(大约30元左右)。 2)机场(距宁夏医科大学总医院20公里左右): a:乘坐出租车到宁夏医科大学总医院(大约80元左右); b:从宁夏河东机场乘机场大巴至民航大厦(25元), 再转乘出租车(8元)。 3)12路,23路,302路,37路,38路,3路,中巴5路,15路公交车通往医科大学总医院。 9:联系方式: 联系人: 宁夏医科大学总医院 生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心实验室 于晶晶 电话: 13895193050 邮箱: yujingjing333@163.com 备注:宁夏医科大学总医院附近交通示意图: 客户培训回执表: 姓名: E-mail: 单位: 电话: 地址: 邮编: 是否需要帮助预定宾馆(协议宾馆): 是 否 备注:如果需要安排宾馆,请注明入住时间: 您感兴趣的领域: 主办方:生物芯片北京国家工程研究中心分中心宁夏分中心 协办方:生物芯片北京国家工程研究中心
  • 中国水稻研究所王克剑:让杂交稻优良基因代代相传
    “最近,我们团队正在整理刚从海南南繁基地收回来的杂交稻种,准备这几天播种下去,以查看无融合生殖水稻的综合性状。实验人员会对稻种进行实验室育苗监测,跟踪其生长情况… … ”刚见到记者,中国水稻研究所研究员王克剑便迫不及待地分享团队的工作进展。◎洪恒飞 科技日报记者 江 耘绘图:央美互动  过去十几年,“杂交水稻种子”几乎占据了王克剑人生的全部。“我们团队深耕无融合生殖水稻种子创制,致力于培育杂种优势固定作物。”他说。  杂交水稻对推动农业生产作出了重要贡献,但由于其种子后代会发生性状分离,无法保持杂种优势,因此种子公司必须每年花费大量的人力、物力和财力进行制种工作。  “无融合生殖能解决这个难题。”王克剑说,“无融合生殖是一种通过种子进行无性繁殖的生殖方式,可以随着世代更迭而不改变杂交品种的杂合基因型,从而固定杂种优势,这将给农业生产带来一次新的革命。”  面向需求,解决农户生产难题  上世纪三十年代,国外科学家提出利用无融合生殖固定杂种优势的设想,随即引发研究热潮。然而,由于其形成机制复杂,科学家们钻研多年,相关研究依然进展缓慢。  生长在江苏农村的王克剑,从小在稻田间奔跑,大学期间又在机缘巧合下“结识”农学,尤其在发现遗传学的妙趣后,决心在此领域继续深造。2009年,在中国科学院遗传与发育生物学研究所获得博士学位后,他选择留所工作,开展水稻前沿基础理论的系统研究。  2013年,王克剑遵循导师“面向生产需求,迎接更多挑战”的建议,毅然南下,在位于浙江省杭州市富阳区的中国水稻研究所任研究员,将基因组编辑以及无融合生殖固定杂种优势作为研究方向。  入职后,王克剑做的第一件事是下乡。他走进田间地头,和水稻种植户交流。农户们向他“投诉”最多的,就是杂交作物的育种问题——杂交水稻的优良基因不能遗传给下一代,农民不得不每年购买昂贵的杂交种子。  “理论上讲,通过克隆种子进行无性繁殖,永久固定杂交种的杂种优势,将大幅降低制种成本,也就能减轻农户负担。”王克剑认为,杂交水稻无融合生殖并非不可行,以往研究进展缓慢的原因是实验技术不成熟。  王克剑决定奋力一试。  不断突破,努力实现从0到1再到10  实验室内的测试数据看似完美,一到田间实验就状况频出——对农业领域的科研人员而言,这种情况不可避免,但一次次的推倒重来,团队成员难免情绪低落。  对此,王克剑的处理方式是自我勉励、带头反思、查漏补缺。项目攻坚期间,他带领团队成员在稻田和实验室交替试验,累了就在单位宿舍就近休息。  2018年,王克剑团队利用基因编辑技术,敲除了籼粳杂交稻品种——“春优84”中4个内源基因,获得了可以进行无融合生殖的水稻材料,建立起水稻无融合生殖体系,得到杂交稻的克隆种子,实现了杂交水稻无融合生殖“从0到1”的关键突破。  彼时,“杂交稻之父”、中国工程院院士袁隆平对该成果给予了高度评价。  “从应用角度来看,仅实现‘从0到1’的突破是不够的。近两年,我们仍在跟进这项研究,相继建立了水稻多基因编辑系统,创建了多个变体基因组编辑系统,大幅提高了水稻遗传重组频率。”王克剑表示,按研究程度划分,如果将10视作达到大规模产业化水平,8视作小范围生产水平,目前团队的研究进度处于4这一阶段,正朝着小范围生产的目标迈进。
  • 比朗十二月中举行2013分子杂交仪发展趋势商讨会
    比朗最新消息:中国仪器行业协会会员、中国分子杂交仪领域技术专家将于十二月中旬会聚上海比朗仪器,共同研讨分子杂交仪,杂交炉等产品技术改革、产品销售渠道以及未来发展趋势。   本次商讨会包括两天,第一天有行业协会会员交流目前行业内分子杂交仪发展现状、技术科技含量、销售渠道,发展中的进步以及问题做专业报告 第一天下午,参观上海比朗实业有限公司生产研发部 第二天上午由上海交通大学技术专家做实验室设备商学院研究课程启动课演讲 第二天下午,企业家们自由座谈茶话会。   上海比朗仪器专业从事实验室设备生产知名厂商,公司配备了先进的技术设备及拥有大量的技术人才。公司一直以不断追求,不断创新为基点,为新老客户打造出质量更上乘,外观更新颖的实验设备产品。公司作为国内知名厂商,为客户提供一站式服务!更多分子杂交仪信息链接:http://www.canytec.info
  • 比朗联合科研所隆重推出国内首创新品分子杂交仪
    新品分子杂交仪是我公司与北京大学生物系、复旦大学遗传所等科研单位参照国外最新产品联合研制推出的国内首创产品。分子杂交仪,分子杂交仪的各项技术指标均达到国外同类产品水平。可替代进口杂交仪,本仪器采用独特的滚动式反应架装置,配套特制密封杂交管在水平轴上旋转,使杂交管内壁上的杂交反应膜各处能均匀地杂 交液反复地接触,充分反应。本仪器广泛应用于生物大分子的杂交反应或其它长时间 振摇的化学、生化及免疫学反应,是开展分子生物学技术不可缺少的仪器。   比朗分子杂交仪特点:   1、仪器结构采用模块化设计,外观新颖、温度控制稳定、操作简单可靠、转速稳定、不受外界电源电压影响   2、杂交过程在连续旋转的杂交瓶内进行,膜与探针完全混合,彻底避免了杂交袋的繁琐封装及放射同位素的泄漏   3、该仪器工作室具有防辐射功能.可一次装六只杂交管。   比朗分子杂交仪参数:   型 号LF-ILF-III   温度范围(℃)室温+5-100   控温精度(℃)± 0.5   温度均匀性误差(℃)± 0.03   温度显示分辨率(℃)0.1   温度平衡时间(min)20   旋转速度 6.5± 0.5r/min5-20r/min   带酶标板振荡且振幅可调   杂交瓶规格(mm)¢35× 220 (可定做)   电源电压220VAV,50HZ   上海BILON品牌LF系列分子杂交仪是依据核酸分子杂交仪技术原理,采用智能型数字温度控制器,可作分子杂交,也可作酶联反应的孵育器。与酶免结合可建立全定量或半定量PCR检测方法。在病毒、细菌疾病的基因诊断的临床检测中具有良好的应用效果。关注分子杂交仪更多信息:http://www.china17center.info
  • 袁隆平点赞 长春光机所仪器助力中国杂交水稻发展
    p   5月17日—26日,长春光机所梁静秋研究员、曹乃亮助理研究员携第三代杂交水稻繁殖系种子荧光检测分选仪样机到国家杂交水稻工程技术研究中心完成了约600公斤水稻种子分选,圆满完成了分选仪工程样机的试选任务。确保了今年第三代杂交水稻种子的分选与种植。 /p p   袁隆平院士被誉为“杂交水稻之父”,其最新的第三代杂交水稻是以遗传工程不育系为遗传工具的两系法杂交稻,克服了三系杂交稻配组难度大和两系杂交稻育性不稳定的弱点,双季晚稻亩产超1000公斤。袁隆平院士表示,第三代杂交水稻的综合优势,可以推动我国的水稻生产向更加优质、高产、绿色和可持续方向发展。但在第三代杂交水稻繁殖系种子育种过程中,实现荧光种子100%的识别与分选,确保种子中不含转基因成分,是该品种推广应用的核心技术难题。在此背景下,2019年11月26日国家杂交水稻工程技术研究中心与长春光机所签署《第三代杂交水稻繁殖系种子荧光检测分选仪》研制任务。 /p p   此次研制成功的种子荧光检测分选仪耗时6月,由国家杂交水稻工程技术研究中心与长春光机所应用光学国家重点实验室牵头,联合长春光机所内图像部韩广良,刘培勋团队共同研制。设备研发得到了袁隆平院士的高度重视与支持。试选期间设备运行正常,性能稳定,得到了国家杂交水稻工程技术研究中心各位领导的高度评价。该设备是第三代杂交水稻大面积推广应用的关键仪器,具有极大的应用前景以及广阔的市场价值。 /p p   分选仪样机试选期间,袁隆平院士亲自接见长春光机所研究人员,并伸出大拇指高兴的说:“这个设备好”。袁隆平院士还指派秘书杨耀松来到样机试选现场,实时了解样机试选情况,对样机试选取得的成绩给予了高度评价和赞许。 /p
  • 北大研发出全球一流基因芯片 速测300余种病毒
    据香港文汇报报道,于常海教授在香港出生,后赴笈美国,在史丹福大学学习和任教。1997年,香港回归祖国,他毅然放弃在美的高薪厚职,回流香港,先在香港科技大学任教,之后赴北京大学从事神经科研究。10年来,他奔波京港,与他的研发团队努力不懈,终于研发出全球一流的基因芯片检测技术,为快速测试各种病毒带来福音。   于常海表示,基因芯片因快捷、简便和低成本,未来产业化后将带来数十亿元的销售收入。香港文汇报记者李昌鸿 摄   组京港百人科研团队   现任北京大学神经科学研究所教授于常海在过去10年,一直从事基因芯片研发,他说,1997年香港爆发禽流感和2003年的非典,许多人丢了性命,令他十分痛心,其中关键是检测技术水平落后,延误了许多人的疾病诊断和治疗。为此,于教授创办了一家公司,在香港和北京组建了100人的研发团队,从事医学基因芯片检测技术。   西方国家早在上世纪90年代已研发出用于医学检测的基因芯片,但价格昂贵,检测耗时也很长,并且需要专业人员才能操作,因此导致基因芯片很难在医学上获得应用。于常海认为,其中最关键技术是检测过程中核酸杂交时间过长,如果能把核酸在极短的时间内杂交成功,检测耗时便可以大幅缩短。   全球申60项技术专利   抱着自己能解决这一难题的信念,于常海和他的研发团队深入学习各种跨学科专业知识,并向各相关专业,如电子、生物学、光学、材料学、化学等专家请教,将各专业技术融入到基因芯片研发中。后来,他还聘请两位诺贝尔奖顾问进行研发指导,共计花了逾亿元投资,研发团队经反复的讨论和实验,不断地寻求突破,不厌其烦默默地研究,并将以往通过昂贵的荧光显示看核酸杂交的方法改用纳米技术放大显现,使成本大幅下降。前后经过长达10年的潜心联合攻关,他们终于研发了全球一流的基因芯片,在全球申请了60项技术专利,为中国人在生物技术研究领域争得了一席之地。   10分钟测病毒利诊断   于教授说,他们研发的基因芯片既便宜、耗时又短且操作简便,在只有1/4大拇指指甲片大小的基因芯片内,存储有300多种病毒、病菌基因 普通的医生将病人带疾病的基因送来检测时,通过与基因芯片中的原有病毒进行比对时,仅需10分钟,便可迅速地判断它是哪一种疾病,较传统检测需要10小时至1天时间快了数十倍,医生因而可快速诊断,并降低病人就医成本。于常海称,该技术因操作简便,即使在偏远的农村和山区,一般的医生都会操作,快速准确的诊断令患者能够快速获得诊治。   10年培养两地新才俊   于常海强调,科学研究是十分严谨的,没有快捷方式,只要自己的研究方向、理念和方法正确,并夜以继日地研究,长期坚持下去,才有机会迈向成功。他认为,目前,转化医学是全球医学发展的方向,只有将高深的医学技术简化普及为平民百姓能接受和使用的技术和产品,才能体现医学研究的价值。   现在最教于常海感到骄傲的是,经过10年的研发,他们培养了一批年轻的内地和香港转化医学人才,在生物科技研究方面积累了丰富的经验,未来可带领新的医学研发人才进行研究,为转化医学作出贡献。
  • “小贝开讲”之自动化工作平台在杂交瘤高通量筛选中的应用
    时间:2018年11月8日 14:00 - 15:00内容简介:单克隆抗体具有高度专一性,它被广泛应用于生物学、药学、医学等领域。杂交瘤技术发明于上世纪70年代,到目前为止仍然是研制单克隆抗体的重要技术之一。细胞筛选是杂交瘤技术中的关键步骤,传统的手动筛选方法效率低,筛选通量小,且难以对操作过程进行数据追踪,已经不能满足新时代抗体新药发现的需求。本次讲座将介绍如何通过高通量自动化工作平台,大大减少在杂交瘤细胞筛选过程中的手动工作量,并能准确记录每一个操作步骤,极大的提高筛选通量,为杂交瘤单抗制备提供有利的帮助。主讲人简介:邓小芳 上海普铭生物科技有限公司 单抗研究员邓小芳在BioRad公司从事过多年杂交瘤小鼠单克隆抗体的研发,现就职于上海普铭生物科技有限公司,负责公司杂交瘤平台建设和管理,并主持参与多个单抗生物药的相关研发工作。上海普铭生物科技有限公司(PUREmAb Biotech)位于上海市浦东张江高新技术产业开发区,是专注于抗体药物早期研发的初创企业。公司现拥有1000平米的实验室,世界先进水平的高通量筛选仪器平台,以及杂交瘤制备和人源化改造、噬菌体展示抗体库和酵母亲和力成熟等工程技术平台。公司未来5年内将致力于申报若干新药的IND,对接集团中下游CMC研发生产企业(德斯特力生物技术有限公司),建立完整的抗体药物早期发现与临床产品生产链。
  • “小贝开讲”之自动化工作平台在杂交瘤高通量筛选中的应用
    时间:2018年11月8日 14:00 - 15:00内容简介:单克隆抗体具有高度专一性,它被广泛应用于生物学、药学、医学等领域。杂交瘤技术发明于上世纪70年代,到目前为止仍然是研制单克隆抗体的重要技术之一。细胞筛选是杂交瘤技术中的关键步骤,传统的手动筛选方法效率低,筛选通量小,且难以对操作过程进行数据追踪,已经不能满足新时代抗体新药发现的需求。本次讲座将介绍如何通过高通量自动化工作平台,大大减少在杂交瘤细胞筛选过程中的手动工作量,并能准确记录每一个操作步骤,极大的提高筛选通量,为杂交瘤单抗制备提供有利的帮助。主讲人简介:邓小芳 上海普铭生物科技有限公司 单抗研究员邓小芳在BioRad公司从事过多年杂交瘤小鼠单克隆抗体的研发,现就职于上海普铭生物科技有限公司,负责公司杂交瘤平台建设和管理,并主持参与多个单抗生物药的相关研发工作。上海普铭生物科技有限公司(PUREmAb Biotech)位于上海市浦东张江高新技术产业开发区,是专注于抗体药物早期研发的初创企业。公司现拥有1000平米的实验室,世界先进水平的高通量筛选仪器平台,以及杂交瘤制备和人源化改造、噬菌体展示抗体库和酵母亲和力成熟等工程技术平台。公司未来5年内将致力于申报若干新药的IND,对接集团中下游CMC研发生产企业(德斯特力生物技术有限公司),建立完整的抗体药物早期发现与临床产品生产链。
  • 3.69亿!发改委同意杂交水稻工程建设及仪器设备购置项目
    据发改委7月21日消息,发改委原则同意建设国家杂交水稻制种基地(四川)建设项目。项目建设地点为成都、绵阳、眉山、德阳、遂宁和泸州等6市、11县(区)。项目建设期为2016-2019年。  主要建设内容及规模方面,建设国家杂交水稻制种基地27万亩,以及配套的种子监管服务体系。主要建设内容为,土地平整、小型农田水利、培肥地力、田间道路和农田防护林等工程建设,以及品种真实性、转基因检测、种子质量追溯等仪器设备购置。项目建成后,杂交水稻种子标准化、规模化生产水平和种子质量明显提高,亩产良种稳定在250公斤以上,年产杂交水稻良种6750万公斤,比项目实施前增加1350万公斤,水稻供种保障能力明显提升,同时带动项目区农民增收。  项目总投资36927.5万元,其中工程建设费用35449.3万元,基本预备费886.2万元,其它费用592万元。资金来源为,中央预算内投资定额补助26334万元,由该省包干使用,超支不补 省级财政投资7824.3万元 企业及农户自筹2769.2万元。
  • 袁隆平国际杂交水稻种业硅谷项目在成都开工建设
    p style=" text-align: center " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/0b140a78-b88e-446a-88aa-07b8bedc1f8d.jpg" title=" 640-6.jpeg" /    /p p   3月23日,袁隆平国际杂交水稻种业硅谷项目(国家杂交水稻工程技术研究中心成都分中心新址)在成都市郫都区启动建设,项目计划投资5000余万元,预计于今年8月底前完工,将建设硅谷研发中心、院士工作坊、杂交水稻展览馆、硅谷双创中心等功能区,同时建设水稻育苗中心以及日处理量30吨的水稻烘干加工中心。 /p p   据了解,袁隆平国际杂交水稻种业硅谷项目位于成都市郫都区德源街道,建设用地29.1亩,总建筑面积8570平方米,建设中还将保留其川西林盘原始田园风貌,并收集保留当地川西传统的劳动生产工具。根据规划,项目将分为两个林盘,西侧林盘重点修建硅谷研发中心等,东侧林盘重点修建国际会议中心、杂交水稻展览馆、硅谷双创中心等,同时,还将在周边建设200亩的水稻试验田。 /p p   “以袁隆平国际杂交水稻种业硅谷项目为核心,将带动周边形成1900亩的农创产业园和4600亩的现代农业产业基地。”德源街道党工委书记姜克锦介绍。 /p
  • 安捷伦科技公司推出用于分子分析的新一代荧光原位杂交检测技术
    安捷伦科技公司推出用于分子分析的新一代荧光原位杂交检测技术 2012 年 3 月 5 日,加尼福利亚州圣克拉拉市 &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日推出新一代荧光原位杂交(FISH)技术&mdash &mdash 安捷伦 SureFISH 探针,为众多分子分析应用带来种类繁多的业内最高分辨率的探针。 探针的性能显著优于现有的 FISH 探针。探针能够特异性检测出小至 50kb 的基因组区域中的变异,也能检测出高度重复的基因组区域附近的变异。与同类技术相比,这些探针的分辨率更高且杂交时间更快,是为了使用户满足美国医学遗传学学会指南有关临床细胞遗传学的规定专门设计。 华盛顿大学圣路易斯医学院细胞遗传学和分子病理学、临床基因组学和医学系主任,美国医学遗传学院专家委员(FACMG)Shashikant Kulkarni 博士是安捷伦SureFISH探针技术的早期用户,他谈到:&ldquo 基于我们使用安捷伦高分辨率寡核苷酸 FISH 技术的经验,我们相信 SureFISH 采用的寡核苷酸设计方法将成为分析此前难于分析的基因组区域的有力工具。&rdquo 安捷伦SureFISH 探针是 I 类分析物特定试剂,由安捷伦德克萨斯州锡达河工厂生产制造,该工厂已获得美国食品和药品管理局(FDA)医疗器械设施注册认证,严格按照质量标准规定和现有的优良制造标准制造探针。 安捷伦基因组学副总裁和总经理 Robert Schueren 谈到:&ldquo 我们提供的全套高性能解决方案,便于细胞遗传学研究人员选择最贴合需求的分子分析方法,这将对细胞遗传学领域带来重大影响。我们完善的细胞遗传学组合产品包括 SureFISH 探针、CGH 和 CGH+SNP 阵列、扫描仪和安捷伦细胞遗传学软件。现在用户可以一站式获得所有需要的细胞遗传学产品。&rdquo 安捷伦为先天性疾病和癌症相关应用提供了各式各样的 FISH 探针。目前的探针产品列表包括几百种 SureFISH 探针用于检测最常见的基因组区域,能够满足众多细胞遗传学研究的需求。安捷伦计划在年底继续推出其他 SureFISH 探针。客户可以登录新的 SureFISH 网站 www.agilent.com/genomics/SureFISH 轻松选择所需 SureFISH 探针,SureFISH 染色体浏览器便于进行探针选择和在线购买,网站上还列出了所有探针杂交 4 小时和 14 小时的图片,帮助用户在购买前了解探针性能。 有关 Agilent SureFISH 探针的更多信息,请访问 www.agilent.com/genomics/SureFISH。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A) 是全球领先的测量公司,同时也是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,700 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度,安捷伦的业务净收入为66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。 编者注:更多有关安捷伦科技公司的技术、企业社会责任和行政新闻,请访问安捷伦新闻网站:www.agilent.com.cn/go/news。
  • 基因芯片,百姓受益的检测技术
    复杂的医学诊断可以再快些、精准些、费用再低些吗?基因芯片的出现及广泛应用或将解决这个问题。   去年11月,昆明寰基生物芯片开发有限公司基因芯片医学检测中心在云南国家级经济技术开发区海归创业园落成。这是我省首个专业基因芯片医学检测中心,也是国内唯一以基因芯片技术为核心的第三方医学检验机构,设计检测规模达到每年70万份临床标本。这是继去年云南省第一人民医院临床基础医学研究所“基因芯片诊断技术”获卫生部临床应用能力资格认证后,我省第二家计划利用基因芯片进行疾病诊断的机构。   和普通医疗诊断技术相比,基因芯片诊疗技术究竟高明在哪里?它的出现及推广应用对老百姓来说又意味着什么?带着问题,记者走访了昆明寰基生物芯片开发有限公司。   疾病检测   新技术带来的新革命   虽说生物芯片早在20世纪末就成功问世,并应用于药物筛选和实验室研究,但普通人对它还是知之甚少。基因芯片,又被称为DNA芯片或DNA微阵列,是DNA分子杂交技术与基因扩增标记等技术相结合的结晶。简单的说,基因芯片就是在一块特制玻璃片或其他支撑介质上有序的固定许多生物分子探针,然后由一种仪器收集探针捕获的待测样本信号,用计算机分析数据结果。也就是说,原来要在很多个试管中发生的反应,现在被移至一张芯片上同时完成了。和传统的医学检测手段相比,基因芯片的优点也就由此体现。据公司负责人介绍,基因芯片技术具有高通量、高灵敏性和特异性等基本特征,在感染性疾病、遗传性疾病、重症传染病和恶性肿瘤等疾病的临床诊断方面具有独特的优势。因此,基因芯片临床检测试剂盒就具有了检测准确率高、快速且比较稳定等特点。   据介绍,生物芯片的研究始于20世纪80年代中期,自从1996年美国Affymetrix公司成功地制作出世界上首批用于药物筛选和实验室试验用的生物芯片,并开发出了配套的芯片检测系统,此后世界各国在芯片研究方面快速前进,不断有新的突破。中国是世界上较早批准生物芯片进入临床应用的国家之一,到目前为止,国内已有多款基因芯片产品获得不同形式的医疗器械证书。   临床应用   产业化制约的慢发展   进医院,病人最焦虑的莫过于检查或等待检测结果。正常情况下,一项普通检查需时30分钟至1个小时,一项复杂检查结果则需等待一周或半月。而生物芯片呢?因为它对样品的需要量非常少,且一次检测能够对多种病原体感染情况作出判断,因此患者不必多次重复检测 同时,由于基因芯片检测主要是依靠先进的激光扫描读取信号,计算机分析检测结果,整个检测过程仅需花时5小时,大大减少了患者的等待时间。正因如此,其临床应用将以实现节约医疗资源支出、提高临床诊疗水平的目的。   2010年,云南省第一人民医院临床基础医学研究所“基因芯片诊断   术”获卫生部临床应用能力资格认证,成为当时国内第二家、云南省唯一具备“基因芯片诊断技术”临床应用能力的机构。这既标志着基因芯片检测技术能在有效地质量保证体系和监督管理机制下,服务于临床,为遗传病诊断、感染性疾病诊断、个性化治疗方案制定等提供快速、准确的辅助诊疗。也意味着基因芯片从技术到产品再到临床,有着极艰难的推广应用之路。在昆明寰基,记者了解到,虽然基因芯片因其在疾病诊断方面独有的特性,被专家誉为行业的终极产品。但由于一是目前许多传统的检测手段已运用较为成熟,二是基因芯片因产业化进程缓慢难以形成规模导致单价过高。那基因芯片何时才能真正造福于普通人的疾病诊断呢?   合力推进   新思路拓宽的新天地   据统计,目前我国生物芯片企业不少于50家,但获得国家有关部门认证的只有极少数。目前,70%—80%的生物芯片还只是用于科学研究领域,离完全产业化还有一段不短的距离。由于研发成本高,其产品价格也较高。   尽管生物芯片的未来发展之路不平坦,但是有关专家在展望生物芯片的前景时却认为,生物芯片在基因表达谱分析、基因诊断、药物筛选及序列分析等诸多领域已呈现出广阔的应用前景。昆明寰基生物芯片开发有限公司总经理滕仕喜认为,一个基于第三方的医学检测服务体系或将实现造福百姓这一目的。作为国内较早从事生物芯片开发的科技公司,昆明寰基从零起步,在省市两级科技项目经费支撑下,与省内相关科研单位合作,于2006年成功研发出了首个泌尿生殖系统基因检测芯片,到今年6月,公司将推出系列基因检测芯片新产品,并将逐步应用于临床检测。去年1月,公司在经开区投资兴建了基因芯片检测中心和基因芯片生产基地,已成功形成从生物芯片技术理论研究到产品研发再到应用的完整产业链。作为参与国家药监局起草《生物芯片技术标准》的生物芯片研发生产企业,昆明寰基对基因芯片的平民化运用很有信心。   在滕仕喜的设想中,第三方的医学检测服务体系不仅可以最大限度地降低成本,还会最大可能地造福患者。因为具备自有技术支撑的第三方医学检测,服务范围较大医院而言拓宽了很多。通过在各地开设的检测取样点,它的服务触角可延伸至缺乏检测技术和手段的中小医院,既减少了检测费,综合检测费用只需原有的30%。又提高了检测效率及精确度。基于此理念,不久前刚刚成立的昆明寰基生物芯片开发有限公司基因芯片检测中心正在按这个思路开展工作。在不久的将来,患者或将普遍受益于这项新技术和新模式。
  • BLT小课堂 | 蛋白芯片技术原理及应用
    概念蛋白质芯片技术是在DNA芯片技术基础上发展的一项蛋白质组学技术。其原理是将大量不同的蛋白质分子(如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等)通过微阵列的形式有序排列在固相载体表面,利用蛋白质与蛋白质或者蛋白质与其他分子之间的特异性结合,获得与之特异性结合的待测蛋白(如血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等)的相关信息,便于我们分析未知蛋白的组分、序列,体内表达水平、生物学功能、与其他分子的相互调控关系、药物筛选、药物靶位的选择等。蛋白质芯片技术的出现,为我们提供了一种比传统的凝胶电泳、Western blot和Elisa更为方便和快速研究蛋白质的方法。该方法具有高通量,微型化和快速平行分析等优点,不仅对基础分子生物学的研究产生重要影响,也在临床诊断、疗效分析、药物筛选及新药研发等领域有着广泛应用。特点①蛋白芯片具有高特异性、重复性、准确性。这是由抗原抗体之间、蛋白与配体之间的特异性结合决定的。②蛋白芯片具有高通量和操作自动化的特点,在一次实验中可对上千种目标蛋白同时进行检测,效率极高。③可发现低丰度、小分子量蛋白质,并能测定疏水蛋白质,特别是膜蛋白质。④蛋白芯片具有高灵敏性,只需0.5-5μL样品,或2000个细胞即可检测。蛋白芯片技术在分子生物学及生物化学基础研究中的应用01 在蛋白质水平上检测基因的表达由于基因转录产物mRNA数量并不能准确反映基因的翻译产物蛋白质的质与量,因此在蛋白质水平上检测基因的表达对于了解基因的功能非常重要。蛋白质芯片技术产生前,蛋白质双向电泳技术是蛋白质组规模上进行蛋白质表达研究的唯一方法,但这种技术操作繁琐而且难以快速检测样品中成百上千种蛋白质的表达变化。蛋白质芯片的特异性、灵敏性和高通量等特点,在检测基因表达终产物蛋白质谱的构成及变化中发挥着不可替代的作用。02 高通量筛选抗原/抗体相互作用目前蛋白质芯片检测利用最广泛的生物分子相互作用是抗原抗体的特异性识别和结合,单克隆抗体是蛋白质芯片检测中使用最广泛的生物分子。运用蛋白质芯片可以研究不同抗原/抗体的特异性作用,而且对于检测样品中极微量的抗原/抗体分子作用非常有利。03 蛋白质/蛋白质相互作用分析酵母双杂交系统是近年来基因组规模上研究蛋白质相互作用的主要方法,但存在体内操作、假阳性、假阴性和外源蛋白质折叠、修饰等局限。蛋白质芯片技术不依靠任何生物有机体而在体外直接检测目标蛋白质,实验条件可随意控制,同时实验步骤自动化程度高,一次分析的蛋白质数量巨大,因而成为目前除酵母双杂交系统外进行大规模研究蛋白质相互作用的主要方法。04 酶/底物作用分析耶鲁大学的Snyder小组用蛋白芯片对酵母基因组编码的119种蛋白激酶的底物专一性进行了研究。实验中将蛋白激酶表达为谷胱甘肽转移酶(GST)融合蛋白,针对17种不同的底物,平行测定了119种GST2蛋白激酶融合蛋白的底物专一性,发现了许多新的酶活性,大量蛋白激酶可以对酪氨酸进行磷酸化,而这些激酶在催化区域附近有共同的氨基酸残基。也证明了蛋白质芯片可作为高通量筛选酶-底物作用的良好平台。蛋白芯片的检测目前蛋白芯片的检测主要有两种方式。一种是以质谱技术为基础的直接检测法,采用表面增强激光解析离子化-飞行时间质谱技术,用激光解析电离的方法将保留在芯片上的蛋白质解离出来。具体过程为:芯片经室温干燥后,加能量吸附因子如芥子酸,使其与蛋白质结合成混合晶体,以促进蛋白质在飞行时间质谱检测中的解析和离子化,利用激光脉冲辐射使芯池中的分析物解析成荷电粒子,根据不同质荷比离子在仪器场中的飞行时间长短不一,通过飞行时间质谱来精确地测定出蛋白质的质量,并由此绘制出一张质谱来,以分析蛋白质的分子量和相对含量。另一种为蛋白质标记法,样品中的蛋白质预先用荧光染料或同位素等标记,结合到芯片上的蛋白质就会发出特定的信号,用CCD照相技术及荧光扫描系统等对激发的荧光信号进行检测。与飞行时间质谱相比,该方法定量更加准确,操作也更加简便。与DNA芯片一样,蛋白质芯片同样蕴含着丰富的信息量,必须利用专门的计算机软件进行图像分析、结果定量和解释。其中应用最广的是荧光染料标记法,原理较为简单、使用安全、灵敏度高,且有很好的分辨率。可直接用广州博鹭腾 GelView 6000Plus进行拍摄。图1.GelView 6000Plus智能图像工作站GelView 6000Plus 配备600万像素科学级制冷CCD相机,制冷温度为环境温度下 55℃,极低的暗电流,很大程度降低背景干扰。而且独有的红外感应开关,自动控制样品台的开启与关闭,同时也减少了实验时对仪器的污染。
  • Resonon | 基于Resonon PIKA XC2高光谱成像预测苹果杂交后代香气
    苹果是一种常见而又神奇的水果。很多人学会的第一个英语单词可能就是Apple;从树上掉下来,砸到牛顿,启发牛顿的也是苹果;引领消费时代数码潮流的苹果公司,logo是被咬了一口的苹果~对于这种大家经常吃的香甜水果,追本溯源,是来自蔷薇科苹果属的杂交水果。苹果的祖先,是一种叫做“新疆野苹果”的植物,生长在我国新疆和中亚地区,后来伴随人类活动扩散开来,果农们也一代代与苹果树斗智斗勇,通过杂交等方式把他们调教的越来越美味。现代农业,为满足大家更多需求,苹果的杂交育种依旧在进行,人类学会了利用更先进的技术,今天推荐大家了解一篇通过高光谱成像来预测苹果杂交后香气的优秀文章。基于Resonon PIKA XC2高光谱成像预测苹果杂交后代香气苹果是世界上最受欢迎且有价值的水果之一。质地、风味和营养是苹果最重要的品质。一般来说,香气在苹果风味中发挥着重要的作用。提高苹果香气是育种和筛选的目标。因此,构建苹果香气成分评估模型至关重要。高光谱成像技术(HSI)结合二维成像技术实现光谱全图像信息获取,因其快速、有效和无损特征而广泛应用在农业、食品和化学领域。基于此,在本文中,来自西北农林科技大学园艺学院的研究人员利用高光谱成像(PIKA XC2 高光谱相机,Resonon Inc., Bozeman,MT,USA)建立了‘Honeycrisp’ × ‘Maodi’杂交后代的香气成分预测模型,初步实现了苹果成分的即时检测,以提供理论基础。【结果】高光谱图像光谱预处理酯(a)、醛(b)、酮(c)和乙醇(d)测量值和预测值散点图。酯(a)、醛(b)、酮(c)和乙醇(d)特征光谱带分布。【结论】在育种中,杂交后代香气成分的快速无损检测可以简化筛选过程并有效降低成本。在本研究中,作者利用高光谱成像来评估‘Honeycrisp’ × ‘Maodi’杂交后代的香气成分。基于光谱的SNV-RF模型在化学类别预测方面表现良好,但在单个化学物质预测方面表现不佳。在化学类别的预测中,酒精的结果最可靠,其次是酯类。分析化学基团的特征光谱,酯类的特征光谱为413、493、512、551、592、600、721、727、729、733 nm,醇类的特征光谱为519、562、570、571、660、676、700、737、738 nm,均在可见光范围内。醛和酮的特征光谱数量相对较多,分别为20和19个。在单个挥发性成分的预测中,大部分化学成分的预测效果较差,仅对环辛醇和2-十一烯醛预测结果基本可用。为了改进本工作的方法研究,今后将考虑和实践更多的杂交后代、建模方法和指标。结果表明,高光谱技术可用于杂交后代芳香化学类别和单个香气成分检测,但模型的稳定性和可靠性有待提高,为苹果育种过程中香气特征的初步筛选提供新选择,为基于苹果香气的自动分级提供理论依据。
  • 走近生物芯片技术——访中国军事医学科学院放射医学研究所马立人教授
    随着人类基因组(测序)计划(Human genome project)的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而,怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题。为此,建立新型杂交和测序方法对大量遗传信息进行高效、快速的检测和分析就显得格外重要了。生物芯片技术的兴起大大加速了基因序列的破译,揭开了生物体中巨大遗传语言之谜,揭示了生命本质,生物芯片技术是20世纪末21世纪初生物技术领域迅速升起的一颗的明珠,它的光芒渗透到生命科学的各个领域。那么,该项技术是如何发展的,目前的状况、发展趋势以及与之密切相关的生命科学仪器的发展又是怎样的状况呢?带着这些问题,近日,本网(以下简称:instrument)专程走访了药物分析学学科带头人,军事医学科学院放射医学研究所马立人教授(以下简称:马)。  Instrument:马教授,您好!我们知道您从事了多年的生物芯片方面的工作,编写了国内第一本系统介绍生物芯片技术的书—《生物芯片》,那您先给生物芯片下个定义,好吗?  马:生物芯片的概念来自于计算机芯片,发展至今不过10年左右。最初的芯片技术主要目标是DNA序列的测定,基因表达谱鉴定和基因突变体的检测和分析,所以它又被称为DNA芯片或基因芯片。但目前这一技术已经扩展到免疫反应、受体结合等非核酸领域,以至在阐明疑难杂症机理中都起到了重要作用,所以按现状改称为生物芯片更符合发展趋势。  芯片分析的实质是在面积不大的基片表面上有序地点阵排列了一系列固定于一定位置的可寻址的识别分子。结合或反应在相同条件下进行。反应结果用同位素法、化学荧光法、化学发光法或酶标法显示,然后用精密的扫描仪或CCD摄像技术记录,通过计算机软件分析,综合成可读的IC总信息。芯片分析实际上也是传感器分析的组合,芯片点阵中的每一个单元微点都是传感器的探头,所以传感器技术的精髓往往都被应用于芯片的发展。阵列检测可以大大提高检测效率,减少工作量,增加可比性。所以芯片技术也是传感器技术的发展。  Instrument:生物芯片技术的发展过程是怎样的呢?主要应用在哪些领域?  马:基因表达分析恐怕是生物芯片应用最多的一个方面,细菌、霉菌、植物、哺乳动物等都进行过科学研究。我们知道原计划于2005年才能完成的人类基因计划,由于DNA测序技术和测序效率的迅速提高,于2001年12月就宣布完成框架图和初步分析结果。在阐明人类基因组核酸全序列的前后几年中,有近百种动物、植物及微生物的基因全序列也已经定出。但这些基因序列中,其生物学意义多数是不清楚的。不少公司根据阐明的序列制作基因芯片供应市场,希望通过表达分析来了解其生物意义,但很快就认识到基因仅仅是遗传信息的载体,而生命活动的执行是基因的表达产物-蛋白质,因此蛋白质组计划及蛋白芯片就提高到重要的位置;随着生物芯片技术在病理组织和组织化学方面的应用,又出现了组织芯片,不同的组织做成不同的芯片,比如大脑、前列腺、肝脏等,用于蛋白表达研究、抗体筛选、组织型特异研究及小鼠模式实验研究等;另外,还有一些新原理的生物芯片,如微流路芯片、细胞芯片、多肽芯片、质谱芯片、电芯片等随着生物芯片技术的发展也快速发展起来。  杂交测序是发展DNA芯片技术的初衷,但由于众多的核苷酸的组成各不相同,各有自己的最佳杂交条件,这就使得每一对双链杂合子都是最佳,这样一种条件很难找到,其结果是出现一定数目的假阴性和假阳性杂交结果,引起误导,加之芯片技术自动化程度和成熟程度等方面还有不足,因而生物芯片技术在核酸测序技术中,未能被选为法定方法,真正建功立业的主要技术却是多通道毛细管电泳。但生物芯片技术也有自己的优点,高通量、平行对比分析,可以获取其他方法无法取得的资料,因此它仍是一项先进的高通量分析手段。  近年来,已经证明基因芯片的最佳应用领域是单核苷酸变异多态性的研究、差异表达分析的研究及改变模式,尽量向临床诊断和临床研究靠拢及开拓其他领域的应用。从经济效益来讲,最大的应用领域是制药厂用来开发新药,目的是在基因水平上寻找药物靶标以及查找药物的毒性和副作用,进行独立学研究;在农业和林业上,生物芯片技术也有广阔的应用天地,应用芯片于基因测序将大大加快DNA多肽性的鉴定,从而促进动植物育种和植物新品种的产生;在医学上,芯片研究也广泛被应用于遗传病、肿瘤、炎症等方面的研究。可以说生物芯片的应用目前已经遍及生物、医学研究的各个领域。  Instrument:那您所从事的生物芯片技术和您前面讲的一样吗?  马:我选择的方向和前面说的这些不太一样。前面讲的这些基因芯片是用在基因序列测定,基因组的研究,用的是高密度芯片,要几千个点,几万个点,价格都很昂贵,目前国外已经有很多基因芯片厂商,做的都是高密度芯片,我们不想往这个方向努力,想做一些实际有用的东西应用在临床诊断上。比如引起腹泻、呼吸道传染病的细菌或病毒,用高密度芯片来检测,成本非常昂贵,不是普通人可以接受的,而且也是一种浪费。因此我们想是否可以做一种低密度芯片(100个点以下),既能很好地检测细菌或病毒,指导诊断和治疗又经济实惠呢?实验表明:是完全可以的,而且这种低密度芯片我们已经做好了,并申请了国家专利。  Instrument:请您详细介绍一下低密度生物芯片?都可以用于哪些病的诊断呢?  马:我们做的这个低密度生物芯片分两部分:一是仪器部分,由几个部分组成,首先是手工点样器,点起样来很方便;还有就是杂交仪,杂交仪是为样品里的病菌通过PCR扩增以后与芯片杂交用的;再有一个就是芯片的道,再加上仪器设备工作软件,就组成了工作平台。这个平台是个通用的,在各种疾病的诊断过程中不需要更换。第二部分就是芯片,也是这个整台仪器设备的核心设施。不同的细菌或病毒用不同的芯片,比如:鉴别SARS病毒的芯片和其他呼吸道传染病的芯片不一样,鉴别禽流感的芯片和SARS的又不一样。在实际应用中,通过检测知道病症是哪一种细菌或病毒引起感染,用药就很有针对性了,青酶素敏感的细菌,就用青霉素,时间长了,有抗药性了,再换一种药,这样治疗容易成功,抗生素就会有目的的使用。  低密度芯片主要是想应用在临床诊断上,如消化道、呼吸道、烧伤、血液、肝炎等方面;也可以用在动物上面,来预防动物之间的传染病,比如鸡、猪和宠物等,效果也是非常好的。  Instrument:用于临床诊断的生物芯片技术和传统的诊断相比有什么优势和特色呢?目前的推广程度及国内外的状况是怎样的呢?  马:总体来说,我们做的这个产品有以下几个优点:  1、 用起来比较方便,不同的传染病病毒或细菌用不同的芯片,没有交叉。  2、 灵敏度高。样品经过PCR扩增,再杂交,大大减少了干扰,这个仪器可以做到50个细菌或病毒的检测。现在通过输血传染的病很多,比如肝炎,丙肝就很不好查,有一个潜伏期,刚得了肝炎,没有发病,处于窗口期,还没有产生抗体,按照卫生部的标准,就符合采血标准,实际上有病毒存在,用常规的方法查不出来,但用我们这个芯片办法,就可以查出来。  3、 检测的速度快,整个这个过程从取样到检测完毕只需要半天的时间。扩增需要1个多小时,杂交也要1个多小时,早晨采样中午就可以出结果。而通常的病理检测要培养细菌或病毒这个过程,时间就长了,起码要3-4天才能出结果。芯片技术完全可以代替传统的检测。有的病发病很快,最好当天检查中午出结果,这样就可以及时采取治疗措施。  4、 价格便宜。以前都是在玻璃上做芯片,玻璃的缺陷是目前国产的玻璃片不过关,进口的一张玻璃片很贵,加上做成芯片,成本很高,且灵敏度低。我们做了一个小发明,在膜上做芯片,灵敏度好且价格便宜。  5、 提取任何组织核苷酸的试剂是个通用试剂,这是通过大量的实验找到的,这个试剂既可以溶解组织又可以裂解细菌或病毒,算是我们这项技术的一个特色吧,样品处理和检测的试剂我们都有自己的一套成型的东西。  目前这个产品还没有大范围地推广,主要是因为芯片技术还没有大规模推广。在临床诊断方面,基本处于规划和起步阶段。有的血库希望建立一个能快速检测爱滋病、丙肝、乙肝、梅毒4种病毒的芯片,有些医院也想和我们一起做消化道、呼吸道等方面的芯片。我们做的比较好的是在动物传染病的防治上,主要用在养鸡、养猪厂。因为这种地方一旦有传染病,传播速度非常快,损失很大,所以养殖厂希望每天监控,一旦发现,赶快打疫苗,以便最大限度的减少损失。这个现在我们已经通过了成果鉴定,也在小范围内进行了应用,但要真正大规模还需要农业部的批文。还有一块就是用在宠物身上,也是计划要做。现在养宠物的很多,狗的病有十几种,很难治好,要是能及时发现并赶快打疫苗就可以治好,打疫苗家要查清楚应该打什么疫苗,这就要用到生物芯片技术了。  低密度芯片技术的推广还有很多工作要做,还有很长一段路要走,我们的技术并不比国外的差,我查过国内外相关资料,没有发现国外有做这一块的,我们是最先做低密度芯片的,要真正推广还需要用户、仪器厂商、科研人员大家一起努力。  Instrument:马教授,都说21世纪是生命科学世纪,国内外各大仪器公司分分成立生命科学仪器部,生物芯片技术是生命科学的重要分支,您又是行业内公认的从事生命科学分析的专家,那您那对于生命科学仪器您是如何理解的?如果让您给生命科学仪器做一个分类,您觉得应该怎么分呢?   马:这个问题就比较大了,我只谈一下我自己的看法。生命科学仪器有意义能出结果的有几个方面,一是用于生物工程产品,包括发酵-纯化-测定整个过程中所需要的分析仪器产品;二是用于蛋白质组学、基因组学,主要是用在基因测序上,但这些只是学术上的储备,并不是一个创造财富的工具。还有就是用在临床诊断上的。要是对生命科学仪器分类,我觉得可以从用途上对其分类,可以分为如下三类:  1、临床生化类:主要用于医院,包括洗板机/酶标仪、血气分析仪、微生物自动分析仪、生化分析仪、病毒免疫荧光分析仪、尿液分析仪、电解质分析仪、血球计数器、生理/药理/神经仪器、高压灭菌锅、均质器等;  2、生物工程用设备:主要用于生物制品的研制和生产,包括摇床/振荡器、发酵罐、冷冻干燥机、冰箱、PCR、凝胶电泳仪、生化培养箱、超滤/过滤统、反应器、收集器、低温恒温循环泵等;  3、分子生物学和生物化学类:主要用于科研、教学单位,包括蛋白/肽测序仪、多肽合成仪、DNA测序仪、细胞分析、凝胶成像系统、生物芯片分析系统、基因导入仪、DNA合成仪、紫外观察灯、分子杂交仪、光标记装置、化学发光分析仪、紫外检测仪、菌落计数器等。  Instrument:马教授,请您总体评价一下我国目前生命科学仪器及通用分析仪器行业的现状?  马:生命科学仪器和通用仪器是不能完全分开的,生命仪器的发展在一定程度上也带动了通用分析仪器的发展。总体来讲,我国的分析仪器行业还比较落后。通用仪器,我就简单说一下色谱和光谱。色谱做的多一些,气相色谱相比较而言好一些,北分、上分等分析仪器公司都在做,液相色谱国内也在做,大连依利特、东西电子、上海伍丰等,可以这样说中档的色谱产品目前国内基本都可以做,但高档的还有一些差距;光谱的话,紫外、拉曼还可以,傅立叶变换红外光谱做的还不是太好,做光谱的厂家有北京瑞利、普析通用等,但和软件结合这块还需要进一步做工作。生命科学仪器我们国家做的很少,有一些做发酵罐的,但没有什么品牌,大型仪器我们目前基本做不了,国外在这些方面比我们做的要好的多,投入也大。   在整个采访过程中,马立人教授一直强调“要做实际有用的东西,不做华而不实的,不想当然,做科学研究也要根据中国国情、根据具体情况来做”,笔者被马教授这种做学问的精神深深打动。试问,在这个浮躁的社会里,有多少人做科学研究不过是为了发表论文而做科学研究,笔者虽然只是个小人物,但也和马立人教授一样,希望分析行业内所有从事科研的人员能真正做一些对社会有意义的东西!马立人教授简介:  军事医学科学院放射医学研究所研究员,博士生导师,国内外知名的药物分析学家和生物化学家。  编写的《生物芯片》一书,2000年获国家石油和化学工业局(化工部)第六届优秀图书一等奖。  研制出我国独有的抗辐射药物;从事血制品及血液代用品研究;在基因诊断方面取得突破性进展,并迅速向国内外推广;担任过第三届分析仪器学会副理事长,指导过上海、南京、北京分析仪器厂、江苏电分析仪器厂、北京市新技术应用研究所等国内分析仪器厂研究设计出实用性强的分析仪器及配套试剂,其中自动基因扩增仪、固液相分子杂交仪获国家实用型专利,抗体导向蛇毒溶纤剂及纤维素微孔亲和滤膜获国家专利;先后培养研究生12名,博士研究生11名及博士后7名,多次承担国家重大课题,获包括国家科技进步特等奖在内的国家与军队奖励20项。  担任过国家生物医学分析中心副主任、学委会主任、《分析仪器》杂志副主编,《现代科学仪器》、《色谱》、美国《Drug Development and Industrial Pharmacy》杂志、《国际医疗器械》杂志编委。       马教授联系地址: 北京太平路27号6-甲-201(100850)
  • 145万!山东大学全自动免疫组化及原位杂交染色科研平台采购项目
    项目编号:SDJDHF20220450-Z219/HYHA2022-2547项目名称:山东大学全自动免疫组化及原位杂交染色科研平台采购采购方式:竞争性磋商预算金额:145.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):145.0000000 万元(人民币)采购需求:采购全自动免疫组化及原位杂交染色科研平台,具体参数详细见“第四章 采购内容及项目要求”合同履行期限:自合同生效之日起至本项目质保期满为止。本项目( 不接受 )联合体投标。凡对本次采购提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名称:山东大学地址:山东大学中心校区明德楼联系方式:王老师0531-883697972.采购代理机构信息名称:海逸恒安项目管理有限公司地址:山东省济南市历下区华润置地广场A5-6号楼27楼招标三部联系方式:徐玉镯、吕宁、李雨莹0531-82661997、187658755653.项目联系方式项目联系人:徐玉镯、吕宁、李雨莹电话:0531-82661997、18765875565全自动免疫组化及原位杂交染色平台-附件.pdf
  • ELISA方法学开发实践版3:杂交瘤和噬菌体展示筛选方法开发
    双十一结束小奥的购物车都清空了没法儿给你抄了我借ELISA实践笔记给你抄快到期末/年底了实验汪们可要抓紧搬砖咯前面三份笔记拉到文末看哦以下,可都是尖货儿哟!??Part 1 —— 前 言 | ELISA方法用于杂交瘤和噬菌体展示筛选是最为广泛的高通量的抗体发现的筛选方法,其实质是亲和力测定方法的一种变种,其目的是需要建立ELISA信号值和样品亲和力大小之间的正相关性。相对于采用ELISA进行抗体的亲和力测定方法,用于杂交瘤和噬菌体展示筛选的ELISA方法有以下难点:1.待测样本极具多样性,且单一样品通常也是混合物,有很大的可能存在非特异吸附;2.不同的待测样品之间可能存在较大的浓度差异,浓度的大小和亲和力的大小均会对检测结果产生影响。在进行杂交瘤和噬菌体展示筛选方法开发时,需要选择合适的条件使信号值主要能够表征亲和力的大小而一定程度上忽略浓度差异造成的影响。本文是ELISA定量测定方法开发和亲和力测定方法开发的进阶版本,配体受体反应的基本原理解析,和两种应用的差异性区分是进行ELISA筛选方法的开发的基础。 Part 2 - 原理解析 - ELISA信号值和亲和力大小的关系 无论是进行杂交瘤的筛选还是噬菌体展示的筛选,其化学原理的实质是抗体和抗原可逆的相互作用,John McCafferty在Phage Display of Peptides and Proteins A Laboratory Manual一书的第七章节Phage Display:Factors Affecting Panning Efficiency中对可逆反应的数学原理有过理论的推导和实验的验证,简而概之可以用下面的公式进行描述:Abinput代表可逆反应中抗体的加入量,Aginput 代表可逆反应中抗原的加入量,Kd代表Ab和Ag的亲和力大小。由公式可知,当反应完成时,形成的抗原抗体偶联物占抗体的加入量的比值(proportion bound),是一个与抗原的加入量和亲和力大小这两个参数相关的特征函数。具体在ELISA测定过程中当抗体的加入量是恒定值时,proportion bound可以用检测的信号值来等价表示,在ELISA反应中抗原的加入量和Kd将决定信号的大小。相同浓度的抗体,因为亲和力不一样,在同一抗原浓度下其proportion bound的比例也不一样,用具体的图形演示如下图:红色实线是亲和力为1nM的抗体Ab1随抗原浓度变化其proportion bound的函数曲线,蓝色实线是亲和力为10nM的抗体Ab2随抗原浓度变化其proportion bound的函数曲线,绿色虚线为在相同抗原浓度下,Ab1/ Ab2 proportion bound的比值。在抗原浓度为10nM的条件下,90%的Ab1(Kd=1nM)和50%的Ab2(Kd=10nM)能够形成抗体抗原偶联物,作为ELISA检测的信号值,Ab1,Ab2亲和力10倍的差异反应到ELISA信号值上1.8倍的信号差异;在抗原浓度为1nM的条件下,50%的Ab1(Kd=1nM)和9.1%的Ab2(Kd=10nM)能够形成抗体抗原偶联物,作为ELISA检测的信号值,Ab1,Ab2亲和力10倍的差异反应到ELISA信号值上5.5倍的信号差异;在加入的抗体浓度是相同的情况下,加入反应的抗原的浓度越少,ELISA信号比值的差异和抗体亲和力比值的差异更具相关性。抗原的浓度决定了ELISA筛选方法的选择性!以上是关于杂交瘤和噬菌体展示筛选理论状态的推导,也是ELISA筛选结果出来了做出客观解读的理论依据,在实际的筛选应用过程中由于不同的待测抗体样品之间可能存在较大的浓度差异。在抗原浓度较高的情况下ELISA信号差异很多情况下由于抗体样品的浓度差异导致的,ELISA信号值对于亲和力大小不具有选择性;只有在抗原浓度较低时,信号值主要能够表征抗体亲和力的大小而一定程度上忽略浓度差异造成的影响,而在ELISA方法开发时当抗原浓度较低时,相对于抗原浓度较高时,其ELISA信号值要弱很多,提升ELISA方法信号的灵敏度,如何通过优化酶联抗体的浓度,挑选显色液和选择显色时间以增强ELISA检测的信号值是一个有区分度的ELISA筛选方法的关键。当ELISA检测的信号值得到提升时,由于筛选样品复杂性,往往其背景信号也会极大的提升,如何通过封闭液,酶标板材等降低背景信号值,得到好的信噪比是一个高质量的ELISA筛选方法的另一个关键。Part 3 - 实例分享 - ELISA用于噬菌体展示筛选布 局——————(Note 1)一 般 操 作 流 程1.酶标板的制备取浓度为100 ug/ml抗原,室温溶解,混匀用包被液按如下步骤稀释至0.2ug/ml,0.5ug/ml,1ug/ml,按加样布局表加入100ml/孔,分别加入酶标板条中 (Note 2),其中加入包被液做包被抗体的空白对照,2-8℃过夜。2.用洗涤液洗板3次,拍干,加入300ml/孔封闭液(Note 3)室温封闭1小时;洗涤液洗板3次,拍干待用;3.取出包含有阴性对照和阳性对照过夜孵育制备含有噬菌体的深孔96孔板,在奥豪斯高速离心机中2000g离心15min,取上清,稀释10倍,一一对应加入包被好酶标板中。(Note 4)4.放入奥豪斯微孔板振荡器内 (如ISLDMPHDG- 30391935),设置37℃、600rpm振荡1小时; 5.用洗涤液洗板3次,拍干;6.抗M13 p8酶联抗体稀释到合适的浓度(Note 5),在漩涡混合器上(如VXMNFS-30392112)混匀,100ul/孔。7.放入微孔板振荡器内,设置37℃、600rpm振荡1小时; 8.用洗涤液洗板4次,拍干;9.取酶联抗体对应的TMB显色液,临用前20分钟拿出平衡到室温,在漩涡混合器上混匀;(Note 6)10.使用8道排枪以100 ml/孔加入TMB显色液;11.显色液室温避光放置10-30分钟 (Note 7);12.使用8道排枪以100ml/孔加入终止液终止反应;13.用酶标仪测定信号值;14.结果分析(Note 8)。Note1:由于不同的噬菌体样品有不同的亲疏水性,其对酶标板材的非特异吸附强度不一样,做一块没有抗原包被的阴性对照板是十分有必要的。Positive和Negtive是和样品有同样噬菌体制备过程,Positive Stock为早已经制备好的分装保存的阳性噬菌体,前者目的是监控在不同时间内噬菌体样品制备过程的差异,后者是监控在不同时间内ELISA检测操作的差异。Note2:在包被过程中,建议选择疏水性酶标板材(polysorp),这样可以极大的减少背景信号值,提高整个方法的信噪比。在实验初期包被的抗原浓度需要少量0.2-1ug/ml,然后根据不同包被条件下同一样品信号大小来进行判断优化。一个已知亲和力的展示阳性抗体的噬菌体是十分有必要的,根据该阳性展示噬菌体样品的信号值来确定最终筛选过程中抗原的包被浓度。抗原直接包被酶标板材上会屏蔽部分结合位点,造成部分假阴性的结果,如果条件允许可采用生物素化抗原,首先5ug/ml的链霉亲和素包板,然后加入0.05-0.2 ug/ml不等的生物素化抗原。抗原直接包被和间接包被其效率不太一样,采用间接包被可适当降低生物素化抗原的包被浓度。Note3:在有生物素化抗原参与的ELISA实验中,不要加入含脱脂奶粉的封闭剂,脱脂奶粉含有微量生物素,会干扰整个检测体系。Note4:噬菌体上清液的稀释比例,可提前根据阳性噬菌体样品做好稀释预实验进行确定。Note5:应选择抗噬菌体的P8蛋白的酶联抗体,噬菌体有2000个以上的P8蛋白,适当的增加酶联抗体的浓度可以提高方法的灵敏程度,笔者曾增加5倍的酶联浓度得到了3倍的信号提升。Note 6:市面上TMB底物最低和最高有10倍的显色差异,建议选择市面上最强的TMB显色底物。需要提前确认检测仪器的信号线性范围,比如一般的酶标仪吸光度值的信号线性范围在0-3,吸光度值在3-4之间为非线性的,信号值超过3时,信号和亲和力的相关性变差。Note 7:显色时间可适当的延长,一般来说在30分中内显色的信号值和显色的时间成线性。Note 8:条件的选择最终是通过阳性噬菌体的信号值决定的,阳性噬菌体的亲和力大小是一个非常重要的选择参数。如阳性噬菌体的亲和力为1nM时,筛选的目的是得到高亲和力的抗体,可以选择阳性噬菌体的信号在OD值为0.5时的条件作为最终的筛选条件,这样很多OD值很小的低亲和力的抗体均被过滤掉;筛选的目的是尽可能得到多的亲和力抗体,可以选择阳性噬菌体的信号在OD值为2-3时的条件作为最终的筛选条件,低亲和力的抗体在OD值上也不会太小,可以得到体现。不论如何抗原的浓度大小决定了选择性,选择较小的抗原浓度进行反应是信号和亲和力大小匹配的关键和趋势性选择,信号大小的调节可以通过酶联抗体浓度,高显色能力的显色液和显色时间进行调节。如果在一块板的检测中未知样品的信号值大小呈合理的分布是ELISA条件较好的表现。Part 4 - 总结 - ELISA用于杂交瘤和噬菌体展示筛选是ELISA用于亲和力测定方法的一种变种,想要得到好的信号和亲和力大小的相关性,低抗原浓度条件下进行方法学开发是必须的。低抗原浓度条件下会有低的信号值,通过增加酶联抗体浓度,选择高显色能力的显色液和延长显色时间,增加ELISA灵敏程度是ELISA优化的技术方向。由于检测样品的多样性和复杂性,高灵敏的ELISA检测体系必然会导致背景信号的增加,无法得到很好的信噪比,疏水性的酶标板条,尽可能低的样品的稀释倍数是解决这个问题的关键。一个稳健的能用于杂交瘤和噬菌体展示筛选方法是ELISA各种耗材,试剂和实验条件的完美组合,需要对试剂耗材的多种可能进行探索,也是平台经验的系统汇总,以下是用于筛选方法的优化方向的汇总。 以上,就是小奥带给大家的第四篇ELISA方法学开发的干货内容!我们下期再见哦!
  • 岛津4in1代谢组学高效分析方案,为杂交水稻的高水平研究提速增效!
    导读代谢组学分析,尤其是非靶向代谢组学样品分析对仪器、方法有极高的要求:色谱分离、质谱检测需要尽可能覆盖未知化合物,组学样品又存在样品珍贵、总分析时间长、样品基质复杂、对质谱负荷较重等问题;因此如何在最短的分析时间内,消耗最少的样品,覆盖尽可能多的未知物,对质谱端产生最小的污染负荷并维持数据稳定性,是非靶向代谢组学分析一直面临的挑战。岛津4in1技术方案:全谱二维+高分辨质谱或三重四极杆质谱岛津4in1技术方案,通过全谱二维宽极性分离+LCMS-9050的正负极同时扫描功能,相比常规液质分析方法,可以节省3/4的样品和总分析时间,减少质谱3/4的分析负担,并通过平行设计实现充分平衡和清洗,减少了交叉污染和记忆效应,提高了系统稳定性和重现性。利用4in1技术方案,岛津与杂交水稻全国重点实验室检验检测中心合作开展不同口感黑米非靶向代谢组学研究,结果优异,一起来看看吧!代谢组学包含非靶向和靶向代谢组学,前者对不同组别样品中的未知目标物或全组分进行分析,后者针对已知目标物进行分析检测,两者最终目的均是通过对比不同组别样品中的成分差异,通过统计分析得到具体差异代谢物,从而指导、分析、解读组别差异的因果、机理并展开差异物的实际筛查应用。目前的通用分析配置是:液相色谱作为前端分离系统,高分辨质谱或三重四极杆质谱作为检测器(前者用于非靶向,后者用于靶向)。非靶向代谢组学分析的三大难点代谢组学分析对色、质谱的分离检测能力、软件数据里处理和统计分析功能、应用人员方法设置等均有较高的门槛和要求,而非靶向代谢组学还有以下几个特殊需求,增加了分析难度:01对液相色谱的分析要求:因非靶向代谢组学面对的是完全未知的目标物,其极性范围、化合物数量、分离条件等均无法预设,因此无法使用单一色谱柱,如反相色谱柱或亲水色谱柱做分离;02对质谱端的分析要求:同样因为目标物完全未知,无法判断目标物的电离能力,因此正离子和负离子必须都要扫描检测;03样品特殊性:样品通常较珍贵,如动物组织样品、细胞样品、血液样品等,因此要求样品消耗量/进样量尽可能少;样品数量多,通常有2-5组样品,每组样品数必须大于6个,因此总分析时间长,如果样品分析循环次数增加,则总分析时间更为成倍增加;样品基质复杂,对质谱污染负担较大。样品特殊性在非靶向和靶向样品都存在。基于以上原因,如何在最短的分析时间内,消耗最少的样品,覆盖尽可能多的未知物,对质谱端产生最小的污染负荷并维持数据稳定性,是非靶向代谢组学分析一直面临的挑战。岛津4in1代谢组学技术方案两大硬件部分为了解决以上非靶向代谢组学三方面的难点,岛津推出了4in1代谢组学技术方案。该方案硬件组成分为两部分:前端系统为全谱二维液相系统。该系统基于两个授权发明专利:极性分流技术、在线稀释技术,是岛津独家产品,适合于未知物和全组分分析,可作为宽极性多目标物数据库的通用分离平台,并适用于极限相差较大的两类关联物质的同时分析,而且该系统内含一个UHPLC子系统,方便日常常规检测;而且该系统具有平行设计,可实现1D和2D的充分平衡和清洗,减少了交叉污染和记忆效应,提高了系统稳定性和重现性。全谱二维液相系统质谱端为LCMS-9050高分辨质谱(非靶向)或三重四极杆系列产品(靶向)。LCMS-9050是岛津最新推出的新一代高分辨QTOF。这一款高分辨四极杆-飞行时间液质联用仪传承了岛津LCMS-9030的优秀设计,依然保持准确度高,稳定性好,灵敏度高、高分辨率的卓越性能。相对于其他品牌Q-TOF,其优势是极性切换时间大大缩短,最大采集速度提升至200Hz,可在同一时段进行正负离子同时扫描,完成普通Q-TOF需要两次进样才能完成的工作。方案优势基于以上两个技术,组合成为岛津4in1技术方案。对于普通色谱系统,为了覆盖高低极性化合物,需要分别用HILIC和RPLC进行分离;为了完成未知物正负离子扫描,需要各进一针完成正离子和负离子分析,而岛津4in1方案=全谱二维+LCMS-9050,具有以下两方面优势:(1)通过宽极性分离+正负极同时扫描,实现4in1分析模式,从而节省3/4的样品和总分析时间,并减少质谱3/4的分析负担;(2)通过平行设计实现1D和2D的充分平衡和清洗,减少了交叉污染和记忆效应,提高了系统稳定性和重现性。岛津4in1一针分析=普通系统4针分析案例分享-不同口感黑米非靶向代谢组学研究杂交水稻全国重点实验室检验检测中心杂交水稻全国重点实验室是国家首批批复建设的20家重点实验室之一,其检验检测中心的分子检测与品质安全两项工作在杂交水稻科技创新中起到了关键支撑作用,为杂交水稻的高质量发展保驾护航。岛津与杂交水稻全国重点实验室检验检测中心合作,利用4in1技术方案,尝试不同个口感黑米非靶向代谢组学研究,取得优异成果,并由此促成成立了“杂交水稻全国重点实验室检验检测中心-岛津合作实验室”。岛津企业管理(中国)有限公司分析计测事业部营业部副部长朱精华(左)与杂交水稻全国重点实验室执行主任孙传清(右)为合作实验室揭牌利用4in1方案分析杂交水稻全国重点实验室检验检测中心提供的30个不同口感黑米,并混合制作了一个QC样品。为了评估、校准系统稳定性,在批处理过程中加入10针QC样品分析,进样序号分别是1-4号,20号,36-40号,时间跨度26小时。最后将正负离子同事采集的10个QC样品的TIC图做叠加展示,可见数据重现性非常优越;另外,在样品中添加两个内标,一个为高极性正离子响应,一个为低极性负离子响应,并提取计算10个QC样品中这两个内标的质量稳定性,结果两个内标质量偏差均小于0.85ppm,结果理想,符合4in1分析的预期。基于稳定的色、质谱表现,通过统计分析得到了优异的代谢组学分析结果:正离子模式共检测到代谢特征峰11780个,负离子模式共检测到代谢特征峰13637个;统计分析显示组内相对聚集,组间区分明显,满足后续代谢组学分析要求;最后通过分组PLS-DA分析及置换验证模型验证,两两对比(好口感黑米vs差口感黑米)得到1473个差异代谢物,并通过数据库鉴定了其中767个差异物,包含了脂肪酰基、黄酮类、氨基酸、萜类、芳香族、苯类等物质。10针QC样品TIC重叠图10针QC样品中内标质量数偏差分析对比筛选出大量差异代谢物 (其中BMZ、SB为口感好黑米、YHM、HH为口感差黑米)结语为了解决非靶向代谢组学难点,岛津推出了4in1代谢组学技术方案:通过全谱二维宽极性分离+LCMS-9050的正负极同时扫描功能,可以节省3/4的样品和总分析时间,减少质谱3/4的分析负担;另外,系统采用了1D和2D的平行设计,实现了充分平衡和清洗,减少了交叉污染和记忆效应,提高了系统稳定性和重现性。将该方案应用于不同口感黑米非靶向代谢组学研究,数据优异,结果可靠,获得了合作方杂交水稻全国重点实验室检验检测中心的高度肯定!如对本技术感兴趣,欢迎联系技术负责人钟博士skczqs@shimadzu.com.cn. 撰稿人:钟启升本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。如需深入了解更多细节,欢迎联系津博士sshqll@shimadzu.com.cn
  • 安捷伦扩展用于临床检测的原位杂交探针产品组合
    p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(31, 73, 125) " strong 用于淋巴瘤的全自动 CISH 和 IQFISH 基因组合集多项创新于一体 /strong /span /p p   2018年5月4日,北京——安捷伦科技公司(NYSE: A)日前宣布推出用于 Dako Omnis 的 EBER RNA CISH、κ 和 λ mRNA CISH 探针,以此扩展其原位杂交探针产品组合。此外还推出了用于淋巴瘤的手动 IQFISH 基因组合,该组合在欧洲拥有代表体外诊断的 CE 标志。 /p p   EBER RNA CISH、κ 和 λ mRNA CISH 产品的推出进一步提高了 Dako Omnis 仪器的诊断能力,这款仪器现可同时进行显色原位杂交 (CISH)、荧光原位杂交 (FISH) 和免疫组织化学 (IHC) 的检测。通过最优化的和经过验证的实验方案,Dako Omnis可以加快病例分析周期,并帮助实验室拥有始终如一的质量并获得最佳结果。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/191f31ea-fe48-4929-9f60-2fd6561e909f.jpg" title=" dako-omnis-advanced-staining.jpg" / /p p   丹麦奈斯特韦兹西兰大学医院病理学部医学实验室技术人员 Dorthe Strue-Nielsen 表示:“对我们的实验室来说,同时在 Dako Omnis 上进行 CISH 和 IHC 是一项完美的解决方案,可以节约很多手动操作时间。” /p p   用于淋巴瘤的 IQFISH 基因组合是一系列基于寡核苷酸的 FISH 探针,可用于检测涉及 MYC、BCL2、BCL6、MALT1、CCND1 和 IGH 基因的重排。这些探针既用于福尔马林固定石蜡包埋的组织切片,也可用于分裂和双融合方法。 /p p   这些探针使用合成的寡核苷酸制成,而非更常见的细菌人工染色体。这项创新技术消除了探针中的重复序列,可以降低背景信号。 /p p   安捷伦基因组学事业部营销主管 Jeff Heimburger 谈道:“CISH 探针生产采用的是安捷伦独特的工艺。将它们作为FISH 和 IHC工作流程的一部分,同时在 Dako Omnis 上运行,可提高实验室分析效率,为患者提供更快速地诊断。” /p p   安捷伦是第一家将快速杂交技术带入病理学实验室的商业供应商。安捷伦的 IQFISH 缓冲液可以改进杂交效率,使通常需要花费两天的检测在 5 小时内完成。对大多数实验室来说,这项创新的推出使病理学家在有需求时即可进行 FISH 检测,让患者更快获得检测结果。 /p p   关于安捷伦科技公司 /p p   安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者,拥有 50多年的敏锐洞察与创新,我们的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。在2017财年,安捷伦的营业收入为44.7亿美元,全球员工数为14200人。 /p
  • 哀悼!杂交水稻之父袁隆平院士因病离世 享年91岁
    据湖南日报讯,“共和国勋章”获得者、中国工程院院士、国家杂交水稻工程技术研究中心主任、湖南省政协原副主席袁隆平,因多器官功能衰竭,于2021年5月22日13时07分在长沙逝世,享年91岁。 袁隆平是我国研究与发展杂交水稻的开创者,也是世界上第一个成功地利用水稻杂种优势的科学家,被誉为“杂交水稻之父”。直到今年年初,他还坚持在海南三亚南繁基地开展科研工作。他冲破经典遗传学观点的束缚,于1964年开始研究杂交水稻,成功选育了世界上第一个实用高产杂交水稻品种“南优2号”。杂交水稻的成果自1976年起在全国大面积推广应用,使水稻的单产和总产得以大幅度提高。20多年来,他带领团队开展超级杂交稻攻关,分别于2000年、2004年、2011年、2014年实现了大面积示范每公顷10.5吨、12吨、13.5吨、15吨的目标。最新育成的第三代杂交稻叁优一号,2020年作双季晚稻种植平均亩产达911.7公斤,加上第二代杂交早稻亩产619.06公斤,全年亩产达1530.76公斤,实现了周年亩产稻谷3000斤的攻关目标。 “发展杂交水稻,造福世界人民”是袁隆平毕生的追求。为了实现这一宏愿,他长期致力于促进杂交水稻走向世界。目前,杂交水稻已在印度、孟加拉、印度尼西亚、越南、菲律宾、美国、巴西、马达加斯加等国大面积种植,年种植面积达800万公顷,平均每公顷产量比当地优良品种高出2吨左右。 袁隆平1981年获得国家发明特等奖,2001年获得首届国家最高科学技术奖,2014年获得国家科学技术进步特等奖,2018年获“改革先锋”称号,2019年被授予“共和国勋章”。他还相继获得联合国教科文组织“科学奖”等二十余项国内国际大奖。
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