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分子梳平台相关的资讯

  • 中药快速分子鉴定开始纳入省级药检平台
    近日,广东省药品检验平台上线了蛇类PCR快速鉴定方法,标志着中药分子快速检测方法正走出实验室,逐步走向实践应用,是一重大的标志性突破。  该蛇类PCR快速鉴定方法由中国中医科学院中药资源中心开发,相关PCR快速鉴定试剂盒由博奥晶典生产。随着中药分子鉴定技术的不断走向成熟,未来除中药材和饮片外,还将广泛运用于中药材种子种苗的鉴定 同时,分子技术快速鉴定中药品种数量也将不断增加,这一创新的技术方法可望为更多的机构、单位采用。  广东药检系统中的中药快速检验方法  中药快速检验是破解中药监管难题的突破口  近年来,中药的质量问题引起多方关注,甚至“中医将亡于中药”的说法甚嚣尘上,也从另一方面反映出中药的品种、品质的确存在一些问题,很多人诟病对中药的监管不力。然而,中药监管实践中存在的一系列实际困难,集中体现在“抽样难”和“时效性差”等方面,大大的影响了监管的效率与实际效果。而如果能在监管现场或附近进行快速检验,则是破解中药监管难题的重要突破口。  中药分子鉴定技术已进入成熟期  传统中药材及饮片的鉴别仅限于对药品性状上的鉴别以及化合物的含量测定。中药材从原料制成饮片,经多种制剂工艺,其本身的性状已难以辨别。中药真伪鉴定几千年来一直都是依靠专业人士人工鉴别,需要多年的经验积累专业壁垒高,普及程度低。  与传统中药鉴别方法相比,中药分子鉴别具有准确性高、重现性好等特点,且不受样品形态的限制,原药材、饮片、粉末乃至含有生药原型的中成药(丸剂、散剂等)均可应用,由于其所需检样量少,对珍稀药材的鉴定更具应用价值。  近年来,分子生物学技术和方法不断更新并得到广泛应用,其理论和实验技术不断渗透到中药鉴定领域,根据药材DNA进行鉴别为传统的中药材鉴定行业提供了新的技术和方法 以其独具的准确性和可靠性弥补了传统重要鉴定中的许多不足,展现了其他方式难以比拟的优势。  中药分子鉴定不仅要准,还要快  作为传统鉴别技术的有益补充,中药分子鉴别不仅要在实验室中使用,而且被要求进一步运用于野外、药材市场、药房和生产企业等各个环节。  为了寻求在中药分子检测方面技术突破和推进产业应用,北京博奥晶典生物技术有限公司和中国中医科学院中药资源中心形成了战略合作,充分发挥双方在研发、技术和产业化能力等方面优势,共同推进中药快速分子检测技术的发展。  中药快速PCR鉴定方法结合DNA快速提取、快速PCR技术和荧光染料技术对中药DNA进行快速检测。 其中蛇类PCR快检试剂盒(PCR法)是专业用于蛇类快速分子检测的产品,可以完成快速DNA提取、快速PCR扩增和荧光检测,实现中药材分子鉴别的现场应用,为中药行业中药材鉴定的发展提供了新的技术和新方法。  已经推向市场的中药饮片分子鉴定试剂盒  展望  未来,中药快速PCR鉴定方法的开发和标准的制定将重点关注动物类药材、多来源药材、名贵药材的物种鉴别。除中药材和饮片外,还将广泛运用于中药材种子种苗的鉴定,为中药材生产流通全过程的质量监督管理和保障中药材质量安全提供技术支撑。  随着中药分子鉴定技术的不断走向成熟,未来,应用于实践环节的中药品种数量将不断增加,随着对这一技术认知水平的不断提升,未来可望有更多的机构、单位采用这一创新的技术方法。
  • 成都先导:构筑底层万亿分子库平台 加速新药研发(下篇)
    进军核酸药领域今年7月16日,成都先导与成都国为生物医药有限公司 (以下简称“国为医药”)共同签署新药研发合作协议,以期针对国为医药关注的靶点发现一种全新的干扰核酸疗法。成都先导将利用其核酸药物开发平台为国为医药开发靶向特定致病基因的mRNA的小核酸新药分子。成都先导与国为医药在核酸药物发现领域的合作,这一合作印证了成都先导核酸药物研发平台的不断完善和走向转化。图3:成都先导与国为医药在签署新药研发合作协议 对于成都先导进军核酸药物领域,李进博士表示:我们观察到,特别是新冠疫情期间,核酸药和以核酸作为分子形态为基础的疫苗开发、新药开发甚至其它领域的应用,带来明显的治疗效果,核酸药物开发的效率非常高。因此对整个制药业来说,核酸药物不仅作为治疗手段,并且作为治疗靶点受到了非常多的关注。作为在这个领域不断探索新分子空间、新治疗手段的生命技术公司,成都先导自然要关注如何将我们构建的平台和研究基础,更有效地在核酸药物领域里应用起来。 成都先导的技术基础来自于DNA编码化合物库(DEL)技术,已经实现一万亿的DNA编码化合物库,除了一万多亿的小分子库,我们在试剂合成、质控、表征方面也积累超一万亿的小核酸分子库,核酸分子库此前是为了做标志的,但亦可以转过来应用于核酸药物,成为分子的试剂合成、优化的能力。所以成都先导积累了很好的基础。 除此之外,在核酸药研发的其它领域,成都先导的技术基础也可以得到有效的应用。因此,我们希望通过这种方式围绕我们的核心技术,不仅仅是在小分子应用方面,在得到快速发展的核酸药领域也能够做出新药研发的推进工作。这样不仅为我们的合作伙伴,也为我们自己未来的新药研发管线提供创造价值的机会。 对中国创新药的几点认识“十四五”开局之年,结合目前国内创新药快速发展的大环境,李进博士分享了对新药研发的认识以及未来趋势的看法:“最近几年中国医药行业经历着非常大的变化,这种变化与国家的政策导向相关。以前我们是仿制药大国,很多药物公司主要做仿制药。近年来国家提出科技强国、科技创新以及企业转型升级,这一系列的政策变化对生物药行业的影响非常明显。” 第一,总的趋势是围绕国家政策导向,在整个医药行业更强调创新,创造更有价值的创新药,向高质量发展的方向推进。 第二,由于国家政策导向,引起资本的大规模介入,使得早期生物医药的创新创业态势火热。另外,国家也建立了各种资本市场的通道,使生物医药公司能够在更大的资本平台上获得支持,支持自有产品和技术开发。最终,更多的创新平台、创新技术进入市场创造价值。在这样的环境下,主要是围绕如何快速地创造医疗领域需要的创新产品,给患者带来显著治疗效果、安全效果甚至治疗的可持续性等,这是结果导向。 第三,创新层次和范围是多元化的,那么药物的形态也越来越多。早期的重点是化学药,近几年除了小分子化学药物以外,各种各样的生物制药、单抗、双抗、细胞治疗、基因治疗、疫苗等,药物创新的方向变得越来越多。尤其是健康中国2030等大的指导方针和原则下,整个领域创新团队的组建可能从疾病治疗转向疾病防御,这方面也需更多同仁的努力。 第四,走向国际化。中国早期好多年都主要做仿制药,随着近几年创新药的投入和积极参与,不仅仅是创业者,包括高校和学术机构也逐渐参与进来,将他们的基础研究产业化,形成了庞大的创新浪潮,这些创新不仅走向中国,还将走向全球。 紧抓机遇:围绕两大核心 发展横向技术在中国创新药发展的大背景下,成都先导未来的发展也将以上述四大方向发展:主要围绕国家政策导向、从患者的切实需求出发,提升创新能力不断推陈出新,打造国际化能力。 李进博士强调:“对于成都先导而言,我们在未来的发展围绕以底层基础驱动来推动小分子核酸药物的创新,注重临床前发现或优化。” 第一,强化夯实提升两大主要核心技术平台,即DNA编码小分子化合物库的设计和筛选和Vernalis公司的分子片段和三维结构信息的药物设计(FBDD/SBDD),通过不断强化两大领先技术平台,夯实成都先导的领先地位。 第二,扩大应用技术,将应用于更多的合作伙伴的新药研发项目,不断完善自有的新药项目,包括临床前项目和推动临床阶段的项目。 第三,继续扩大已经建立的全球和中国的合作伙伴,将上述几点结合不断发展。 李进博士总结道:“未来3-5年,除了围绕核心技术之外,不断注重横向技术的发展空间,例如开发蛋白降解技术,强化和优化小分子核酸药等,围绕这个平台提升竞争力。最近几年基于IT领域的AI、机器学习等也不断应用于药物发现与优化,我们也会不断吸收新的发展方向,结合我们的内部能力,把这些新技术融合在我们的分子发现、分子优化等整个技术平台上。” 最后,李进博士展望了成都先导未来3-5年的发展规划: 第一,继续夯实、完善、提升、强化新药发现与优化平台,不断深化和提升两大基础平台;同时横向发展开发一些新的技术应用,比如强化蛋白质降解、小分子核酸药技术,围绕上述平台提升竞争力、有效率。 第二,建立越来越完善的质量价值观和自主研发药物的管线,包括临床前、临床后、临床阶段。 第三,不断扩大全球合作伙伴。成都先导现有200余家合作伙伴,希望未来3-5年能够翻翻甚至更多,构建覆盖面更宽、更深厚的业务合作伙伴基础。 第四,作为上市公司,成都先导要加强资本对接能力,把资本用好,来促进企业更快更高效的发展。 参考知识:DEL+ FBDD+ SBDD2013 年,葛兰素史克开启可溶性环氧化物水解酶抑制剂 GSK2256294 首次临床试验研究,这也是首个由DNA编码化合物技术发现并进入临床试验的小分子化合物。随后,DNA 编码化合物技术逐渐成为新药筛选的焦点之一。 图4:DNA 编码化合物技术筛选原理 DNA 编码化合物技术筛选的原理和优势是什么?“很多疾病的靶点是蛋白,我们要做的是针对这个靶点找到一个新的分子来和它产生作用。假设一个化合物分子有 A、B、C 三个部分,这三个部分形成一个三维结构。用 DNA 序列将不同的分子打上‘标签’,再把这些标记后的分子与靶点进行混合,能与靶点匹配的分子就是我们要筛选的分子,通过读取 DNA 序列信息就能找到它们,这就是 DNA 编码化合物技术的筛选方式。DNA 编码化合物技术在分子的设计上是一般没有目的性的,所以可以进行大规模的化合物筛选。相较于传统高通量筛选技术是从几百万种不同的分子形状和属性中进行筛选,DNA 编码化合物技术可以从几千亿甚至上万亿的分子中进行筛选。选择范围变宽,但筛选成本和时间并没有增加,这本身就是一种进步。” DEL筛选技术有两个优势:第一,把以前难成药的靶点变成可成药的靶点,这意味着一些以前没有办法治疗的疾病可能有新的治疗机会。 第二,对于传统成药的靶点,这项技术可能会在更短的时间内更高效的找到新的分子,推动新药进入临床。我们 3-6 个月就能完成筛选,而传统筛选技术可能需要 9-18 个月。” 此外,DNA 编码化合物库技术还可以做一定程度的分子优化。 基于分子片段和结构的筛选方法(FBDD/SBDD)与 DNA 编码化合物技术 (DEL) 原理恰恰相反。DNA 编码化合物技术筛选的是一个完整的分子,但基于分子片段或结构的筛选方式利用的是分子的某一个片段或结构来进行筛选。靶点上有‘结合口袋’,空间上是一个凹凸的形状,像一个一个洞。利用 DNA 编码化合物技术筛选时,一整个分子与‘结合口袋’完全匹配才能结合在一起;而利用基于分子片段或结构的技术进行筛选时,只需要分子的一部分与‘结合口袋’能匹配就可以。当筛选出可以与靶点结合的分子片段时,可以在此片段基础上增加结构,一步一步延伸最终形成一个可以与靶点完全匹配的完整分子。” “DNA 编码化合物库是先把各种可以想象的形状都准备好,让这些不同形状一个个去匹配靶点,这样筛选出来的分子与靶点的亲和力会更高一些。但即使我们做到几千亿、上万亿的分子,它仍然代表不了所有可以穷尽的分子形状和空间形态。在这种情况下,从基础的小切块甚至是分子片段做起,再一步步累积成适合的分子,也是另一种方法。” “从药物发现角度来看,这三种技术都是互补的。针对一个靶点,如果通过 DNA 编码化合物技术筛选了整个库之后依旧没找到适合的分子,可以通过分子片段或结构再去寻找可以和这个靶点结合的片段或结构,在此基础上进行延伸,并重建一个库,快速找到更好的分子。” “从分子优化的角度来看,这三种技术也是互补的。基于分子片段和结构的筛选方式必须要获得结构化信息,就是这个分子片段是如何与靶点结合在一起的。这个信息对于下游的优化起到了非常强的指导作用,能帮助更好地设计下一代分子。” 岛津企业管理(中国)有限公司作为成都先导药物开发股份有限公司全方位的战略合作伙伴,目前已与成都先导在核酸化学合成的质量及表征方面开展了系列合作,我们期待在此基础上,不断巩固和完善双方的合作成果,让此技术服务于更广阔的客户。核酸药物研发平台(部分)
  • 成都先导:构筑底层万亿分子库平台 加速新药研发(上篇)
    不久前的热播剧《功勋》中,再现了屠呦呦在筛选治疟新药青蒿素过程中历经的艰辛。新药研发是从底层巨量级的化合物筛选开始的,药物研发人员总是期望更快的筛选,这其中需要先进的方法和设备。成立于2012年的成都先导,在全球第一家实现了DNA编码小分子库万亿分子的实体规模,于去年4月成功登陆科创板,并与默克、白云山、国为医药等多家企业签约,通过发挥DEL/FBDD/SBDD核心技术平台的整合效应,加速新药研发。 今年5月,成都先导药物开发股份有限公司(以下简称“成都先导”)携手岛津企业管理(中国)有限公司(以下简称“岛津”)共建创新药物开发平台联合实验室,标志着成都先导和岛津的合作迈入新征程,共同推动和加速新药研发。近日,分析测试百科网采访了成都先导董事长兼CEO李进博士,他分享了成都先导的发展历程和核心研发平台,以及与岛津合作实现企业技术的优势互补,共同推动前沿研究的深化与应用。 本期人物介绍李进 博士成都先导药物开发股份有限公司董事长兼首席执行官 以下文字根据对成都先导董事长兼CEO李进博士的个人专访整理而成。 上篇:DEL/FBDD/SBDD核心技术协同构建新药发现底层能力 两大领先平台支持同行 开发自主新药成立于2012 年的成都先导,2020 年 4 月成为 “科创板西南第一股”,从早期的CRO,到今日新药研发的全国前50强,这同成都先导创始人、董事长兼CEO李进博士密不可分。他曾在世界 500 强企业阿斯利康担任高管 11 年,具有分子设计、分子合成与分子筛选 20 余年的专长和工作经验,拥有海外近 30 年新药研发及管理经验。同时,他也是四川大学特聘教授、英国皇家化学协会会士、荣誉科学博士。1988 年取得英国阿斯顿大学博士学位之后,他又于英国曼彻斯特大学医学院完成了博士后研究。 李进表示:经过8年多时间,成都先导打造了小分子药物核心技术平台——DNA编码化合物库(DEL),另外不仅有DNA编码库,还把DEL筛选结果进行优化产生新型临床前候选物以及IND申报的临床候选物。 自2020年4月登陆资本市场以来,成都先导进一步强化公司的核心技术平台,为新药的发现与优化领域提供更强劲的技术平台。比如去年10月在英国剑桥并购了Vernalis公司。Vernalis 是一家基于分子片段(FBDD)和三维信息结构(SBDD)技术的药物发现和新药项目开发的生物技术公司。该公司正基于分子片段、结构生物学、测定技术等方法针对肿瘤、神经退行性疾病、抗感染剂和炎症的靶点产生先导化合物和临床阶段候选物。 收购后,成都先导拥有两大技术平台:DNA编码化合物库(DEL)和FBDD/SBDD;除此之外还有优化的分子技术和研发能力。整体而言,成都先导打造了小分子药物、核酸药物的分子发现与分子优化技术平台。 李进表示:建立强劲的技术平台后,成都先导同广泛的伙伴合作,来推动和支持他们的新药研发。同时,成都先导也有一些自己的新药研发项目,包括临床前、进入临床阶段的20多个项目,其中有4个项目在临床阶段。 总体而言,成都先导是一个有底层新药发现技术平台的公司,通过不断完善技术平台来参与、支持合作伙伴的新药发现与研发,同时亦开发自己的新药项目。 深耕DNA编码化合物库 积累四大技术优势近几年,DNA编码化合物库技术(DEL)逐渐获得高度重视,而成都先导自创立之初就致力于DNA编码化合物库(DEL)设计及技术筛选平台,其首席科学家Barry A. Morgan更是DEL工业化技术的主要发明人。2021年10月15日,成都先导登上全国工商联医药业商会颁布的2020年度中国医药研发50强榜单。 图1:成都先导荣登2020年度中国医药研发50强榜单 李进表示:DNA编码化合物库(DEL)近几年得到工业领域的高度重视,相对其它公司,成都先导具有如下优势: 这些在DNA编码化合物库(DEL)技术领域的深耕,都是成都先导不断积累的丰厚的经验和优势,主要体现在以下4个方面。 第一,源于技术聚焦和巨大投资,成都先导是第一家实现DNA编码小分子实体库达到万亿级规模的业内领先公司。 第二,丰富DNA编码化合物库的内容,具有设计新颖、多样性、成药性高等优势。除了传统杂环小分子化合物之外,成都先导利用该技术建立蛋白降解库、共价键化合物库、大环化合物库,编码分子片段等应用在不同领域。 第三,大规模分子库涉及合成、试剂、流程等多方面,如何保证合成化合物库的质量是非常关键的因素。因此,成都先导通过高通量自动化的系统建设和应用确保分子库的整个流程的质量和效率的控制。 第四,成都先导建立了广泛的全球用户,将分子库用于诸多靶点的筛选,并获得了相当高的成功率,比如从靶点筛选到找到活性化合物的成功率达到70%-80%。成都先导在此过程中亦获得了大量反馈,这种实际应用反馈积累了一定的先发优势,使得成都先导的筛选技术,筛选结果数据分析等不断叠加,并在该领域中保持领先。 携手岛津优势互补 实现合作共赢2021年5月25日,成都先导携手岛津共建创新药物开发平台联合实验室,双方将按照研发需求、协同攻关、市场验证的理念,在新药技术开发、研究平台共建、人才培养交流和成果转化等各方面开展深入合作,打造技术协同、价值交互、合作共赢的创新性新药研发合作平台。图2:成都先导-岛津联合实验室揭牌 成都先导-岛津联合实验室致力于打造国内创新药物合作研发平台新典范,通过对精密分析仪器、前沿应用研发方案等系统化运用,提升创新药物研发能力与效率。 “岛津在高端仪器、精密分析仪器中有着非常悠久的历史,在行业里也有巨大的影响力,不论在科学技术的创新和新产品方面都是大家有目共睹的。成都先导早在创业初期就已经与岛津开展合作了,合作时间非常悠久,也有着深厚的合作关系。通过多年来同岛津在高精尖分析仪器方面的合作,我们了解到在整个公司的发展技术平台建设上,上述仪器能够发挥重大的作用。”李进博士回顾双方的合作时讲到。 对于成都先导和岛津建立联合实验室,李进表示:“这是双方长久合作的结晶。我们将继续通过尖端的分析仪器、分析技能、专业知识,结合岛津和先导在实际应用中积累的观察和经验,用新的技术解决前沿问题。联合实验室的成立将进一步提升DNA编码化合物(DEL)库的质量以及核酸药物研发相关的分析工作,促使我们研发产出更高质量的产品。” 岛津中国副董事长井上统雄表示,“成都先导-岛津联合实验室”的成立,是成都先导、岛津双方合作多年的期盼,标志着岛津和成都先导的合作进入了一个全新里程。岛津将用先进的技术能力、稳定的售后支持服务于联合实验室,为双方的进一步合作科研提供助力。 谈到对合作实验室未来的期望李进表示:分析团队、化学团队和岛津的相关团队将保持密切沟通,聚焦双方关心的问题,针对问题制定比较清晰的研究计划。有效地结合双方的科学知识、实验观察,真正地解决问题,从而有助于新方法的开发,产生新的结果,共助于双方的未来发展,实现合作共赢。
  • 盘点:分子诊断5大主流技术平台
    p style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  未来3-5年IVD行业最具发展潜力的产品线是什么?答案无疑是分子诊断。狭义的分子诊断是基于核酸的诊断技术。随着基因组学、蛋白组学、代谢组学等新兴学科的发展,分子诊断的内涵已经从DNA/RNA拷贝、突变等检测,拓展到核酸与DNA片段、蛋白与多肽、抗原与抗体、受体与配体等生物大分子的检测。从目前市场分子诊断产品来看,基于核酸诊断技术的产品仍占主要。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  截止2019年3月,分子诊断产品获批数量达1197项。按照技术原理,可以将上市分子诊断技术大致划分为PCR技术、分子杂交、基因测序、核酸质谱、生物芯片5大类。/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 398px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/30f4477b-d170-4c6e-834b-bade1d20ce50.jpg" title="分子诊断技术.jpg" alt="分子诊断技术.jpg" width="600" height="398" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "分子诊断技术体系/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(227, 108, 9) "strongPCR/strong/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  从各类技术类别来看,PCR技术由于壁垒相对较低,国产化程度高,国内企业布局相对较早,因此基于PCR技术的分子诊断产品占总产品量的70%以上。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  PCR技术是一种用于扩增特定DNA片段的分子生物学技术,基本原理是在反应室中模拟细胞内的DNA复制,即人为创造核酸半保留复制条件,使目的DNA在细胞外完成扩增的过程。通过PCR技术进行分子诊断的流程如下:核酸提取——核酸扩增——核酸检测。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  按照靶标数量划分,PCR技术平台通常可分为qPCR和ddPCR。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  span style="color: rgb(227, 108, 9) "实时荧光定量PCR(qPCR)/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  Real-time PCR,美国PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出来的一种新的核酸定量技术,该技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针来实现其定量功能的,与普通PCR相比,实时定量PCR具有许多优点:利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,最终对起始模板的定量分析。/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/bb1b124d-1741-4b1b-8671-ead2601ccad8.jpg" title="赛默飞QuantStudio 3实时荧光定量PCR仪.jpg" alt="赛默飞QuantStudio 3实时荧光定量PCR仪.jpg"//pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "a href="https://www.instrument.com.cn/netshow/SH100650/C243140.htm" target="_self"赛默飞QuantStudio 3实时荧光定量PCR仪/a/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "a href="https://www.instrument.com.cn/zc/133.html?SidStr=1684&AgentSortId=&SampleId=&IMCityID=&IMShowBCharacter=&IMShowBigMode=" target="_self" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "点击进入“荧光定量PCR仪”专场,查看更多/span/strong/a/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  span style="color: rgb(227, 108, 9) "ddPCR(数字PCR)/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  ddPCR系统利用油包水技术,在传统的PCR扩增前将一个大的反应体系进行微滴化处理,将此反应体系分割为成千上万个微滴,即成千上万个独立的PCR反应体系。在此过程中,样品被稀释至单分子水平,并被平均分配到这几万个反应体系中,每个微滴中不含或者含有至少一个待检测的核酸靶分子,这样也相当于变相的对靶基因进行富集。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  目前,国内市场已现10余家数字PCR仪厂商,其中领航基因自主研发的数字PCR系统已获NMPA认证,锐讯生物、新羿生物、STILLA、伯乐还在申报中。/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/9e1b125a-2e91-40ec-bed1-ecbde05b0a44.jpg" title="领航基因iScanner 5数字PCR系统.jpg" alt="领航基因iScanner 5数字PCR系统.jpg"//pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "a href="https://www.instrument.com.cn/netshow/C319981.htm" target="_self"领航基因iScanner 5数字PCR系统/a/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "a href="https://www.instrument.com.cn/zc/133.html?SidStr=8144&AgentSortId=&SampleId=&IMCityID=&IMShowBCharacter=&IMShowBigMode=" target="_self" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "点击进入“数字PCR仪”专场,查看更多/span/strong/a/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  strongspan style="color: rgb(227, 108, 9) "核酸测序/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  经典的Sanger测序技术,被称作是测序届金标准。随着高通量测序技术应用拓展,基因测序技术将不断升级,也将进一步提高占比,成为未来肿瘤检测的主要技术。目前测序市场主流为NGS测序平台。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " span style="color: rgb(227, 108, 9) " NGS(下一代测序,也被称为“二代测序”)/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  二代测序(NGS)在临床领域的应用快速增涨,其在临床上的应用主要包括疾病目标基因集测序(disease-targeted gene panels)、全外显子组测序(whole exome sequencing , WES)和全基因组测序(whole genome sequencing , WGS)。总体来说,NGS技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,可以在短时间内对感兴趣的基因进行精确定位。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  在二代测序领域,笔者知道的测序平台就达三十多个,Illumina毫无疑问是行业巨头,其市场规模甚至达到垄断地步。目前已获中国国家药品监督管理局医疗器械批准的基因测序仪包括:Illumina MiSeq™ Dx 华大智造BGISEQ-100、BGISEQ-1000、BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2000、MGISEQ-200共6款基因测序仪。/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 385px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/ae5f4cdf-ee19-4bf2-8b5f-044423b36f2e.jpg" title="Illumina MiSeq™ Dx测序平台.jpg" alt="Illumina MiSeq™ Dx测序平台.jpg" width="600" height="385" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "a href="https://www.instrument.com.cn/netshow/SH103701/C241668.htm" target="_self"Illumina MiSeq™ Dx测序平台/a/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "a href="https://www.instrument.com.cn/zc/134.html" target="_self" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "点击进入“基因测序仪”专场,查看更多/span/strong/astrongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  span style="color: rgb(227, 108, 9) "单细胞测序/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  第三代测序技术的核心理念是以单分子为目标的边合成边测序,单分子测序平台给测序技术带来新思路,部分已经开始商业化推广,但尚未达到NGS的规模。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  相比二代测序,第三代测序技术在临床上的应用有明显优势:第三代测序技术不需要PCR扩增,可直接对单个分子进行测序 样品制备简单,测序成本进一步降低;可直接读取RNA的序列和包括甲基化在内的DNA修饰。这些优势可以大大改善临床基因测序的成本、速度和质量,但单分子测序有通量限制,所以并不适合独立做全基因组测序,更适于针对有限的、个性化的、目标性的应用。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  几家重要的单分子测序平台一览:/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  Helicos BioSciences:第一台真正的单分子测序仪/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  Pacific Biosciences(PacBio):首个单分子实时测序系统/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  Oxford Nanopore Technologies:纳米孔测序、迷你测序仪/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " strongspan style="color: rgb(227, 108, 9) " 分子杂交/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  核酸分子杂交技术是利用DNA 变性与复性的原理,把不同的DNA 单链分子或者DNA 与RNA 的混合物放在同一溶液中,在某种理化因素作用下DNA 双链分子解链变性,这样互补序列的DNA 之间或DNA 与RNA 之间形成杂化的双链。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  核酸分子杂交技术可分为Southern 杂交——DNA和DNA分子之间的杂交;Northern杂交——DNA和RNA分子之间的杂交。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  蛋白杂交,也叫Western 杂交,蛋白质分子杂交是一种借助特异性抗体鉴定抗原的有效方法,即蛋白质分子(抗原—抗体)之间的杂交。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  strongspan style="color: rgb(227, 108, 9) "核酸质谱/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  目前核酸分析所使用的质谱电离技术主要还是采用 ESI 和MALDI。 简单来讲,两种电离技术都是软电离,ESI 检测的特点是生物大分子带多个电荷,质荷比范围基本在2000 Da 以下区间,从而能检测几万乃至更大的生物分子;而MALDI 常得到单电荷峰,与飞行时间(TOF)分析器搭配,检测范围可以到几十万道尔顿。/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 399px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/4653e43a-06df-430b-b2b5-4d3b61d6e612.jpg" title="Agena MassARRAY 核酸质谱.jpg" alt="Agena MassARRAY 核酸质谱.jpg" width="600" height="399" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "Agena MassARRAY 核酸质谱/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  质谱技术相比于其他检测技术具有快速、准确、灵敏度高、高通量等优点,近年来在核酸的高级结构鉴定、寡核苷酸与小分子的相互作用、DNA 损伤与修饰等领域有着广泛的应用。由于生物样品的复杂性,质谱技术还面临着一些挑战和困难。但生物质谱技术是科学研究的有力工具,随着临床实验室对质谱的了解和应用不断的加深,未来该检测平台或可成为规范实验室不可或缺的标准装备。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em " strongspan style="color: rgb(227, 108, 9) " 生物芯片/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  span style="color: rgb(227, 108, 9) "微阵列芯片/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "也就是常说的基因芯片,又称DNA微阵列(DNA micro-array)、SNP芯片,是把大量已知序列探针集成在同一个基片(如玻片、膜)上,经过标记的若干靶核苷酸序列与芯片特定位点上的探针杂交,通过检测杂交信号,对生物细胞或组织中大量的基因信息进行分析。/pp style="text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/36d02754-b5b9-4703-ab50-4855030a9751.jpg" title="0.jpg" alt="0.jpg"//pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  与传统的染色体核型分析技术相比具有更高的分辨率,可识别Kb级别以上的染色体细微失衡。基因芯片目前已成为国内外临床遗传学诊断的一项常规的技术,在遗传病检测、疾病筛查、疾病分型、病原体检测、个性化用药等方面均呈现出广阔的应用前景。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  全球知名的芯片公司有 Illumina、Affymetrix(于2016年被赛默飞收购)、安捷伦等。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  span style="color: rgb(227, 108, 9) "微流控芯片/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  微流控芯片( microfluidic chip) 由微米级流体的管道、反应器等元件构成,与宏观尺寸的分析装置相比,其结构极大地增加了流体环境的面积/体积比,以最大限度利用液体与物体表面有关的包括层流效应、毛细效应、快速热传导和扩散效应在内的特殊性能,从而在一张芯片上完成样品进样、预处理、分子生物学反应、检测等系列实验过程。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  目前使用微流控芯片进行指导用药的多基因位点平行检测是主要临床应用领域。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "分子诊断的高速发展离不开分子生物学技术日新月异的进步。在过去的50 年中分子诊断技术取得了三大转化与3项提升:报告信号检测从放射核素标记向荧光标记转化、操作方法由手工操作向全自动化转化、检测分析通量从单一标志物向高通量多组学联合判断转化。不仅如此,仪器检测灵敏度、精密度、特异性的也有快速提升。随着分子诊断技术的进一步发展,分子诊断将会出现理念的革命性进步,高通量技术将更多的进入临床的实际应用中。具体如何发展,我们拭目以待。/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color:#ff0000"span style="text-decoration: none color: rgb(0, 112, 192) "strongspan style="text-decoration:underline "span style="text-decoration: none color: rgb(0, 176, 80) "/span/span/strong/span/span/pp style="text-align: center"/pp style="text-align: center "/p
  • SLST分子影像平台招聘生物电镜制样工程师
    上海科技大学生命学院分子影像平台主要为科研工作者提供高效率、高质量的光学显微镜技术支撑服务,除了多台高级光学成像设备之外,平台还配备了针对3D电镜成像的SEM、连续超薄切片机等制样和成像设备,以及Imaris、Amira等专业三维重构图像软件。现面向社会招聘生物电镜制样方向技术人员,欢迎转发、推荐或自荐。岗位职责1.负责常规化学固定制样、高压冷冻、低温替代固定、超薄切片(含连续超薄切片)等技术服务和支持; 2.负责电镜的日常操作和使用管理,协助平台电子显微镜及相关设备的管理维护和培训考核; 3.协助建立三维电子显微成像实验解决方案及光电联合等相关新技术开发,平台将提供相应的光学成像技术和软件培训; 4.根据需要,参与学院的服务工作。招聘条件1.生物、化学或材料等相关专业背景,硕士及以上学历,特别优秀者可以放开到本科学历;2.有生物或材料电镜制样经验,愿意长期从事电镜制样工作,如有超薄切片机使用经验更佳;3.具有扫描电镜、透射电镜等大型仪器设备的操作及数据分析工作经验优先;4.具有Imaris、Amira、ImageJ、Matlab、Python等图像处理经验者优先;5.积极上进、有责任心、善于沟通、乐于学习新技术、动手能力强。工作条件和工资待遇1.按照上海科技大学相关规定执行,根据个人具体情况,提供具有竞争力的薪酬、津贴和福利;2.提供良好的工作环境,研究平台设施完善,具有很好的发展前景。应聘方式1.请应聘者通过人才招聘系统(http://jobs.shanghaitech.edu.cn/)上传个人简历、学历和工作经验的相关证明及2位推荐人联系方式,并提交应聘申请。应聘流程为:注册、填写并提交基本信息、应聘选择岗位。2.请同时将相关申请材料的电子版发至lixm@shanghaitech.edu.cn,邮件标题请注明:生物电镜工程师申请+姓名。3.对应聘者进行资格审查,对初审通过者,将另行通知面试时间;未通过初审者,恕不另行通知。招满即止。欢迎转发、推荐或自荐!!!【仪器信息网|行业征稿】若您有生命科学、医药、临床等行业相关研究、技术、应用、管理经验等愿意以约稿形式共享,欢迎自荐或引荐投稿联系人:刘编辑word图文投稿邮箱:liuld@instrument.com.cn微信/电话:13683372576
  • 220万!东南大学医学与生命科学平台微量热泳动分子互作仪采购项目
    项目编号:JC066022096341项目名称:东南大学医学与生命科学平台微量热泳动分子互作仪采购项目预算金额:220.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):220.0000000 万元(人民币)采购需求:预算金额:220万元(不含外贸代理费)采购需求:项目地点:东南大学浦口校区项目概况:东南大学医学与生命科学平台采购微量热泳动分子互作仪一套,主要技术要求如下:(1)技术原理:基于微量热泳动(MST)技术原理进行检测,在溶液中研究生物分子的相互作用,获得平衡解离常数Kd(2)测定平衡解离常数(Kd值)范围:1pM-mM(3)样本通道数:24个(4)红外激光光源寿命:≥40000小时接受进口产品投标,技术参数详见招标文件合同履行期限:进口产品在开具信用证后90天内设备安装调试合格,国产设备签订合同后20天内交付并安装调试合格。本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 中科院苏州医工所研发生物分子“检测平台”
    p  “有没有一种东西,在一个事物的萌芽状态,就能检测出它的存在,从而加以预防与干预?”昨天,中国科学院苏州生物医学工程技术研究所发布信息,他们不仅研制出拥有完全自主知识产权、达到国际先进水平的“生物分子界面分析仪”,还研制出世界上最小的能产业化的便携式“生物分子界面分析仪”,体积只有“生物分子界面分析仪”的八分之一,检测灵敏度则要比现在最先进的光学检测还要提高40%。/pp  “‘生物分子界面分析仪’其实是一个科技含量非常高的检测平台,花了我们四五年时间攻关。”中科院生物医学检验技术重点实验室副研究员张威博士介绍,例如,天热,湖中有蓝藻,而且突然发展很快,“生物分子界面分析仪”就可在看不到蓝藻时,通过水样微囊藻毒素检测,快速检测出其藻毒素变化,从而预先知道蓝藻发展趋势。/pp  记者在实验室看到,这个便携式“生物分子界面分析仪”像一个微型小锅,只有450克。“我们采用了薄膜压电技术,利用薄膜压电晶片实现生物分子界面分析,分析的是分子与分子间的结构变化。”张威从专业角度介绍其工作原理。/pp  只见实验人员将不同水质的水,引入已采过样的芯片上,电脑上很快出现不同的曲线。“通过分析频率变化,可获得吸附层相应的质量、吸附层厚度、粘弹性等信息。”实验人员向记者介绍,目前世界上这样一台先进的同类产品,售价在100万元以上。而苏州医工所研发的“生物分子界面分析仪”价格只有同类产品的一半。许多参数,甚至还要优于国外产品。/pp  根据第三方检测结果,其温度测定设定在37℃,1小时内温度波动度只为± 0.04℃,而国际同类产品温度波动度要达± 0.08℃,频率1小时内测量频率最大值与最小值的差值为1.5Hz,部分指标超过了国际同类产品的先进水平。/pp  张威告诉记者,针对高校和企业、个人研究人员,他们还研发了便携式“生物分子界面分析仪”,专门用于某类定向测试。“该‘迷你’产品的单项性能与‘生物分子界面分析仪”相当,但价格仅5万元,进一步拉低了检测门槛。”/pp  “我们开发出的这两款产品,最核心的技术还是在自主研发的芯片上,该芯片突破了国外垄断产品的技术壁垒。”中科院苏州医工所相关负责人说,目前,这两款产品已获15项发明专利授权,申请的国际PCT专利也已进入日本和美国。/p
  • 见“微”知著——默克发布Erenna单分子免疫检测平台新品
    p  strong仪器信息网 /strong2016年4月12日,默克在北京举办生命科学新产品发布会,来自各科研院所、高校等的100余位代表出席会议。/pp style="text-align: center "img title="IMG_14321.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201604/insimg/6aa4a5bb-e0b7-4ea0-a1f2-39382acc0e42.jpg"//pp style="text-align: center "strong光影开场秀/strong/pp  “见微 至臻 致远”,本次新品发布会继续传承默克生命科学的创新风格,以一段创意无限的光影开场秀拉开序幕。在光与影的殿堂里,默克将科学与艺术完美融合,诠释了以“匠人”之心打造的两款生命科学研究工具:Erenna单分子免疫检测平台和CellASIC ONIX2 微流控活细胞实时分析系统。/pp style="text-align: center "img title="IMG_14541.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201604/insimg/6808f359-8e28-4449-8732-1a08c11f4840.jpg"//pp style="text-align: center "strong默克生命科学市场部总监郭鸣霏先生致开幕辞/strong/pp  默克生命科学市场部总监郭鸣霏先生在致辞中介绍到,Erenna,原是深海中的一种水母,在几千米的海底发出荧光,照亮深海海底未知的世界。本次默克发布的单分子免疫检测平台的名字也叫Erenna,Erenna(水母)潜在的含义与默克相关产品在蛋白质组学领域的探索潜能不谋而合。/pp  从上世纪40年代开始,随着免疫组化等经典蛋白检测技术的发展,蛋白作为生物标志物的价值逐渐被人们所重视。尽管免疫组化、ELISA、Luminex等蛋白检测技术已经实现了数以千计的蛋白生物标志物的检测,但蛋白生物标志物的开发速度仍显缓慢:年均仅有1-2个新的生物标志物进入实际的临床应用。据统计,在400000多种已知的人类蛋白中,约有300000种因为表达丰度过低而无法实现传统方法的检测。在现有技术可以检测的约100000种蛋白中,大多数又无法在健康个体的样本检测到,而仅仅出现在特定的疾病时期。大量蛋白生物标志物的重要功能,如同海平面下的冰山,无法被现有技术准确界定。不论临床还是基础研究,蛋白生物标志物的应用都拥有可观的发展前景,但现有技术的瓶颈极大限制了蛋白生物标志物的发展。/pp style="text-align: center "img title="IMG_14741.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201604/insimg/5b125750-dbfb-46c2-a10f-e28972e8fbeb.jpg"//pp style="text-align: center "strong默克高级科学家、Erenna单分子免疫检测平台资深专家Ali Vahedi先生/strong/pp  2015年,默克密理博收购a title="" href="http://www.instrument.com.cn/news/20160413/188581.shtml" target="_self"strong单分子检测技术(SMCsupTM/sup)/strong/a 。而今天发布的Erenna单分子免疫检测平台也是收购之后发布的首款具有里程碑意义的产品。/pp  据默克高级科学家、Erenna单分子免疫检测平台资深专家Ali Vahedi介绍,Erenna采用专利的“爱里斑”单分子检测技术(Single Molecular Counting ,SMCsupTM/sup),突破了蛋白检测的极限,将生物标志物检测提升到飞摩尔级别。相较于传统免疫检测技术,SMCsupTM/sup技术的信噪比有了很显著的改善,使得在一个系统里可以同时检测低表达和高表达的蛋白靶标,可以用于揭示疾病相关生物标志物的微小变化,并可创领生物标志的新发现。/pp  检测事件(DE),事件光子含量(EP),以及总光子含量(TP),三套检测数据得到三条标准曲线,外加专有的算法,Erenna可以实现高灵敏度、大动态范围的检测。此外,Erenna单分子免疫检测平台还可以根据不同的实验条件灵活选择孵育形式。据介绍,由于Erenna平台卓越的单分子检测能力以及磁珠的低背景,基于磁珠的孵育形式比使用同样抗体的ELISA灵敏度提高大约1000倍。而基于96孔板板底的孵育形式大约比同等抗体条件的ELISA灵敏度也能提高50-100倍,同时试剂成本低于ELISA。/pp style="text-align: center "img title="IMG_15351.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201604/insimg/ab2ad927-41e4-47d2-a2d0-bb13d622c373.jpg"//pp style="text-align: center "strong默克全球产品经理Victor Koong先生/strong/pp  本次发布会中,默克还介绍了另一款新产品:CellASIC ONIX2 微流控活细胞实时分析系统,这是CellASIC ONIX的升级产品。/pp  据默克全球产品经理Victor Koong介绍,目前,细胞培养技术的发展还存在一些问题,如传统培养体系体积较大,快速更换培养基比较困难;静态培养与在体培养差异较大;成像状态下很难控制细胞的生长环境等。而CellASIC ONIX2 微流控活细胞实时分析系统可以实现活细胞成像时的细胞生长环境精细调控,包括气体、温度、培养基和试剂的快速切换,长时程、免操作实验条件的程序化控制等,从而使细胞保持良好的生长状态。/pp  采用芯片培养板上的微流控设计,CellASIC ONIX2具备高精度活细胞成像与多功能分析的系统特征,可同时进行四个独立的加药实验,适用于所有倒置显微镜。/pp  据介绍,CellASIC ONIX2在控制演进过程的自噬、活细胞成像过程中的自动化免疫染色等研究中具有很好的应用前景。目前,顶级科研机构的超过60篇顶尖文献已经使用了该系统。/pp style="text-align: center "img title="IMG_14431.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201604/insimg/4756031b-b60f-4bed-98d5-28f829bfc6e1.jpg"//pp style="text-align: center "strong发布会现场/strong/pp style="text-align: center "img title="IMG_15261.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201604/insimg/c61746a7-bde2-490e-919a-c11a2f59459c.jpg"//pp style="text-align: center "strong瑞士巴塞尔大学医学院医学博士& 公共健康硕士 David Conen先生/strong/pp  在新品发布会的过程中,瑞士巴塞尔大学医学院医学博士& 公共健康硕士David Conen先生还专门分享了心血管疾病生物标志物研究的新进展。br//pp  此外,新品发布会之后,默克还组织了成像流式高峰论坛,与行业专家共同探讨最新的研究进展。br//p
  • 照亮生命科学前进之路 三大分子诊断技术平台浅析
    随着基因组学、生物信息学、蛋白质组学等多学科的交叉和融合,分子诊断学技术得到长足的发展。越来越多的分子技术应用于疾病的诊断、疗效监测和预后判断,这为分子诊断学的发展提供了新的机遇与挑战。分子诊断20年,经历三个发展阶段分子诊断技术是指以DNA和RNA为诊断材料,用分子生物学技术通过检测基因的存在、缺陷或表达异常,从而对人体状态和疾病作出诊断的技术。其基本原理是检测DNA或RNA的结构是否变化、量的多少及表达功能是否异常,以确定受检者有无基因水平的异常变化,对疾病的预防、预测、诊断、治疗和预后具有重要意义。分子诊断学20余年的发展历史,大致经历了3个阶段:(1)利用DNA分子杂交技术进行遗传病的基因诊断;(2)以PCR技术为基础的DNA诊断,特别是定量PCR和实时PCR的应用,不仅可以检测存在于宿主的多种DNA和RNA病原体载量,还可检测多基因遗传病细胞中mRNA的表达量;(3)以生物芯片(biochip)技术为代表的高通量密集型检测技术,生物芯片技术包括基因芯片、蛋白质芯片、组织芯片等,由于其工作原理和结果处理过程突破了传统的检测方法,不仅具有样品处理能力强、用途广泛、自动化程度高等特点,而且具有广阔的应用前景和商业价值,因此成为分子诊断技术领域的一大热点。通俗简单的讲所有基于分子生物学水平的方法学技术都属于分子诊断技术。目前常见核酸分子诊断技术涉及三个技术:PCR技术、基因测序技术和基因芯片芯片技术。划时代的PCR技术 照亮生命科学前进之路PCR技术是一种用于扩增特定DNA片段的分子生物学技术,基本原理是在反应室中模拟细胞内的DNA复制,即人为创造核酸半保留复制条件,使目的DNA在细胞外完成扩增的过程。由1983年美国Mullis首先提出设想,1985年由其发明了聚合酶链反应,即简易DNA扩增法,意味着PCR技术的真正诞生。通过PCR技术进行分子诊断的流程如下:核酸提取——核酸扩增——核酸检测。从各类技术类别来看,PCR技术由于壁垒相对较低,国产化程度高,国内企业布局相对较早,因此基于PCR技术的分子诊断产品占总产品量的70%以上。按照靶标数量划分,PCR技术平台通常可分为qPCR和ddPCR。实时荧光定量PCR(qPCR):Real-time PCR,美国 PE (Perkin Elmer)公司1995年研制出来的一种新的核酸定量技术,该技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针来实现其定量功能的,与普通PCR相比,实时定量PCR具有许多优点:利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,最终对起始模板的定量分析。ddPCR(数字PCR):ddPCR系统利用油包水技术,在传统的PCR扩增前将一个大的反应体系进行微滴化处理,将此反应体系分割为成千上万个微滴,即成千上万个独立的PCR反应体系。在此过程中,样品被稀释至单分子水平,并被平均分配到这几万个反应体系中,每个微滴中不含或者含有至少一个待检测的核酸靶分子,这样也相当于变相的对靶基因进行富集。基因测序进入高速发展期 基因技术即测定DNA序列的技术。在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法和 Maxam和 Gilbert(1977)发明的化学降解法。这二种方法在原理上差异很大,但都是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生 A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得DNA序列。目前 Sanger测序法得到了广泛的应用。简单讲基因测序技术是针对DNA片段进行测序和分析,使得DNA序列得以清晰。经典的Sanger测序技术,被称作是测序届金标准。随着高通量测序技术应用拓展,基因测序技术将不断升级,也将进一步提高占比,成为未来肿瘤检测的主要技术。目前测序市场主流为NGS测序平台。NGS(下一代测序,也被称为“二代测序”)。二代测序在临床领域的应用快速增涨,其在临床上的应用主要包括疾病目标基因集测序(disease-targeted gene panels)、全外显子组测序(whole exome sequencing , WES)和全基因组测序(whole genome sequencing , WGS)。总体来说,NGS技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,可以在短时间内对感兴趣的基因进行精确定位。第三代测序技术的核心理念是以单分子为目标的边合成边测序,单分子测序平台给测序技术带来新思路,部分已经开始商业化推广,但尚未达到NGS的规模。相比二代测序,第三代测序技术在临床上的应用有明显优势:第三代测序技术不需要PCR扩增,可直接对单个分子进行测序 样品制备简单,测序成本进一步降低;可直接读取RNA的序列和包括甲基化在内的DNA修饰。这些优势可以大大改善临床基因测序的成本、速度和质量,但单分子测序有通量限制,所以并不适合独立做全基因组测序,更适于针对有限的、个性化的、目标性的应用。基因芯片技术大有可为基因芯片(Gene chip)技术是指通过微阵列(Microarray)技术将高密度DNA片段通过高速机器人或原位合成方式以一定的顺序或排列方式使其附着在如膜、玻璃片等固相表面,以同位素或荧光标记的DNA探针,借助碱基互补杂交原理,进行大量的基因表达及监测等方面研究的技术。其测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧光强度最强的探针位置,获得一组序列完全互补的探针序列。据此可重组出靶核酸的序列。基因芯片类型较为繁多,可以依据不同的分类方法进行分类,一般可分为以下几种:1.按照载体上所添加DNA种类的不同,基因芯片可分为寡核苷酸芯片和cDNA芯片两种。2.按照载体材料分类:载体材料可分为无机材料和有机材料两种。3.按照点样方式的不同可以分为原位合成芯片、微矩阵芯片、电定位芯片三种。随着二代测序价格的降低,现在这基因芯片技术和基因测序技术的应用重叠度越来越高。基因芯片技术在一些领域逐步被二代测序替代,但是芯片有自己的优势:技术较为成熟,样本处理和数据分析相对测序更加简单、快速,在大规模样本的固定位点基因检测速度上有很大优势,在基因表达检测上对中低表达峰度的基因检测可靠性更高、在基因拷贝数变化的研究方面速度较快,成本相对较低。而微流控芯片技术的引入可以实现检测自动化和一体化,整体效率有较大提升。稿件来源:上海远慕生物科技有限公司附:PCR仪专场基因测序专场基因芯片专场
  • 1640万!南昌大学手性分子功能材料平台仪器设备采购项目
    一、项目基本情况:1.项目编号:JXJM20230780项目名称:南昌大学手性分子功能材料平台仪器设备购置1包采购方式:竞争性磋商预算金额:8100000.00 元最高限价:7552500.00采购需求:采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算(人民币)技术需求或服务要求赣购2022F000767734原子力显微镜 ( 魏振宏 )1台2600000.00元详见公告附件赣购2022F000767736圆二色谱仪( 魏振宏)1台2500000.00元详见公告附件赣购2022F000767735振动圆二色谱仪( 魏振宏 )1台3000000.00元详见公告附件合同履行期限:合同签订生效后10个月内完成安装调试并交付使用。2.项目编号:JXJM20230790项目名称:南昌大学手性分子功能材料平台仪器设备购置2包采购方式:竞争性磋商预算金额:8300000.00 元最高限价:7647500.00采购需求:采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算(人民币)技术需求或服务要求赣购2022F000767732变温粉末衍射仪(魏振宏)1台2500000.00元详见公告附件赣购2022F000767733变温单晶衍射仪(魏振宏)1台4800000.00元详见公告附件赣购2022F000767731激光器(魏振宏)1台1000000.00元详见公告附件合同履行期限:合同履行期限:合同签订生效后15个月内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。二、获取采购文件:时间:2023年05月25日 至 2023年06月01日,每天上午0:00至12:00,下午13:00至23:30(北京时间,法定节假日除外 )(磋商文件的发售期限自开始之日起不得少于5个工作日)地点:江西省公共资源交易网(网址:http://jxsggzy.cn/web/)方式:网上报名和下载招标文件三、凡对本次采购提出询问,请按以下方式联系:1.采购人信息名称:南昌大学地址:江西省南昌市红谷滩新区学府大道999 号联系方式:0791-839693642.采购代理机构信息名称:江西骏马招标咨询有限公司地址:南昌市红谷滩新区丰和中大道912号地铁大厦17楼联系方式:0791-886159953.项目联系方式项目联系人:熊泽东电话:0791-88615995
  • 970万!南昌大学手性分子功能材料平台仪器设备采购项目
    一、项目基本情况:项目编号:JXJM20230800项目名称:南昌大学手性分子功能材料平台仪器设备购置3包采购方式:竞争性磋商预算金额:9700000.00 元最高限价:8702000.00采购需求:采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算(人民币)技术需求或服务要求赣购2022F000767726电化学工作站1台400000.00元详见公告附件赣购2022F000767727高效液相色谱仪(魏振宏)1台800000.00元详见公告附件赣购2022F000767728600M核磁共振波谱仪(魏振宏)1台8500000.00元详见公告附件合同履行期限:合同履行期限:合同签订生效后15个月内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。二、获取采购文件:时间:2023年05月25日 至 2023年06月01日,每天上午0:00至12:00,下午13:00至23:30(北京时间,法定节假日除外 )(磋商文件的发售期限自开始之日起不得少于5个工作日)地点:江西省公共资源交易网(网址:http://jxsggzy.cn/web/)方式:网上报名和下载磋商文件售价:0.00元三、凡对本次采购提出询问,请按以下方式联系:1.采购人信息名称:南昌大学地址:江西省南昌市红谷滩新区学府大道999 号联系方式:0791-839693642.采购代理机构信息名称:江西骏马招标咨询有限公司地址:南昌市红谷滩新区丰和中大道912号地铁大厦17楼联系方式:0791-886159953.项目联系方式项目联系人:王慧、熊泽东、马诗勇电话:0791-88615995
  • 国内首创高通量临床质谱分子诊断平台将落户福州
    3月24日,品生医学项目落地暨中美精准医疗与诊断研究中心项目启动仪式在滨海新城中国东南大数据中心举行。或许在不久的将来,该中心将为福建省乃至全国医检市场带来不一样的新体验。  据介绍,福建中美精准医疗与诊断研究中心是由福建品生医学联合美国密苏里大学精准医疗与诊断研究院,以及福建多家重点医疗机构合作共建。  品生医学负责人成晓亮表示,临床质谱技术是一种新的医疗检测科技,在临床检验中具有高特异性、高准确度、高灵敏度、高简便性、线性范围宽及高通量的优点,比如可通过尿液、血液检测部分癌症及心血管病。质谱检测进入临床诊断领域,已是业内公认的新热点。  成晓亮介绍,品生医学选择落户福州滨海新城,是因为这里有优良的投资环境、人文环境以及巨大的市场潜力,加上国家东南大数据中心的落户,让他们看到了很好的发展前景。品生医学项目在福州滨海新城注册福建品生万福医学检验有限公司,一期将投资5000万元建立医学检验所,搭建国内首创的高通量临床质谱分子诊断平台 开展第三方临床检验业务,检验项目覆盖心血管病、肿瘤、神经病、代谢病、新生儿遗传病等领域 联合本地医疗机构,共同建设福建大健康生物样本库,构建分子诊断层面的健康大数据,推动区域精准医疗、临床医疗的发展。
  • 华裔创业家为分子鉴别诊断试剂开发平台及全新商业模式寻战略投资
    生物技术的麦加:JP摩尔根医疗大会&mdash &mdash 韩健  上个星期,我去参加了JP摩尔根医疗大会(JP Morgan Healthcare Conference)。这个会我去过几次了,这回是头一次全程参加,还是在外围,没有正式注册听讲。我是趁开会大家都在一个城市的机会去见人的,而会议的本意则是一些上市公司跟股票分析师介绍新一年的展望的。  这是一个有着三十多年历史的会议已经成为健康医疗行业的一个盛会,有如人们到麦加朝圣一样,似乎成了生物技术和药物开发公司产业化的必经之路。这篇文章介绍了一些有关这个会议背景:今年的会至少有5000人参加,代表投资方,药厂,生物技术公司等所有和医疗卫生产业化有关的几百家公司。  会议每年都是一月份在旧金山举行,市区会场附近的酒店每年都因此大赚一笔,每晚费用高达七八百美金!酒店和会场附近咖啡馆,公园到处是谈生意的公司高管们,当然还有我们这样的创业者:  参加这个会,让我亲身体会到美国医疗行是一个共生体,许许多多不同行业的人,为了一个目的来到一起。他们分工很细,个有各自的能耐,赚自己该赚的钱。  就拿我们来说,这次去参会主要是两个目的:(1)为iCubate公司市场推广和FDA报批集资 (2)为iCubate寻找战略合作伙伴。可是如果我们单枪匹马自己上阵,很可能空手而归。我们这次是和一家对口生物医药的, 位于纽约的投资银行(EVP)合作,由他们出面为我们联系风险投资公司和潜在的战略合作伙伴。而这家投资银行之前又找到另外一家在分子诊断行业很有影响的咨询公司合作,由这家公司帮助寻找像我们这样的生物技术小公司。  EVP负责在主会场附近租了一间会议室(下图),便于风投公司和合作公司的人来面谈,我们也出门去别人租用的会议室或者酒店交谈。四天会议一共约谈了十八次,效率极高。  每次会谈,多是投行的伙伴开头:介绍一下在座的人,介绍一下他们投行的背景,包括通过那些关系联系上了对方。然后由咨询公司的Jorge大概介绍一下iCubate公司的卖点。这个Jorge在分子诊断领域是神通广大的一个人,他先前是美国最大的分子诊断服务公司Quest的资深副总裁,负责在Quest引进分子诊断技术和平台。所以他在任十三年下来积累了很多经验和人脉,也成为他做咨询公司的资本。有他作为第三方来推荐我们iCubate技术平台,可信度一下子就提高了很多。他也是一个极有个人魅力的人,美国有一个很有名气的啤酒广告,叫做 &ldquo The most interesting man in the world", 他和那个演员在长相和神态上都很像。  广告里面有总是这么结尾:&ldquo I do not usually drink beers, but when I do, I drink Dos Equis" ;Jorge在介绍我们公司的时候总是说:&ldquo 我不随便推荐绍公司的,每年我都只选一个公司,iCubate是我今年的选择。&rdquo 他的可信度很高,因为很多经他推荐的公司都得到很好的市场认可,包括BioFire,Fundation Medicine等。BioFire去年四亿五千万美金卖给了法国的生物莫里埃公司;Foundation Medicine去年上市获得极大成功。  有了Jorge和John的铺垫,接下来就是我主讲技术和市场了。我先简要介绍一下我的创业经历(包括创办Genaco和Diatherix公司),介绍我的特长是做多重PCR,然后介绍iCubate的技术原理,产品目录,竞争优势,最后介绍iCubate2.0开放平台。总结的时候重点讲我们的特点是多重PCR和开放的商业模式:有了好用的多重PCR技术,不仅我们可以快速开发产品,其他人也可以借助这个开放平台开发出很多很多优质产品来的。大家都说&ldquo 内容为王&rdquo ,iCubate正是一个能迅速累积无数内容(诊断试剂)的技术平台。  三四天的JPM会议,我们一共有18个&ldquo 会外会&rdquo ,拜会的潜在战略合作伙伴包括罗氏,雅培,BD,Beckman Coulter,Qiagen,Bioneer,Promega等,另外还有许多风投,PE等投资公司。绝大多数会谈对我们的技术和商业模式都很欣赏,我有充分信心随访后会后很好的结果。这是一个很成功的会,即使花费不菲,也非常值得,没有投行和咨询公司的合作,我们iCubate市场化的进程至少要慢两年。  这样的合作共赢的机会在国内就很难得到。这里面当然也有许多巧遇:Jorge是过去两年曾经帮助一个投资公司看项目,接触到Diatherix公司,才发现我是他们使用的多重PCR技术的发明人。后来他刚巧在华盛顿举办的一个分子诊断会议上听到了我的演讲,演讲后和我有短暂交流,交换了名片。后来我们就成为他的&ldquo the pick of the year",推荐给了和他合作的投行公司。如 果我不去参加那个会议,如果他不是主动接触小公司,就可能失去这个合作的机会。而EVP公司也很精明,知道自己在体外诊断领域缺少人脉和相关知识,能够和Leomics建立起战略合作伙伴关系,给他们提供下游(小公司)和上游(大公司)客户。这样他们才能专心致志地做他们的deal,他们的特长是熟悉投资公司管钱的。  而JPM大会更是一个医疗市场的大熔炉:生物技术公司,新药开发公司,国际大药厂,风险投资公司,信息技术公司,律师事务所,会计师事务所,医疗保险公司,医院集团,政府部门,科研院所,各色人等统统到会。会上会下各种生意都有,大家都忙得不亦乐乎。每个平常一个小时的会,几乎都是提前十几分钟结束,因为大家要赶场跑到下一个聚会地点。注:iCubate开放平台的特点:没有技术转让费,产品上的技术使用费,多重PCR试剂设计软件免费,卡盒便宜,网上商店,开发者定价,销售完成后开发者得70%, iCubate 30%.
  • 中科院分子细胞卓越中心俞珺璟博士:流式细胞技术平台发展与使用心得分享
    生命科学基础研究与人类健康和社会经济发展密切相关,在科学和经济社会领域中的重要性日渐增强。Science 曾发布125 个挑战全球科学界的重要基础问题,其中涉及生命科学的问题约占 54%。生命科学研究过程离不开各类科学仪器的帮助,今年,仪器信息网特别策划话题:“生命科学技术平台经验分享”,邀请高校、科研院所公共技术平台的老师分享技术心得和经验,方便生命科学领域研究人员了解相关技术进展、学习仪器使用方法。本篇为中国科学院分子细胞科学卓越创新中心细胞分析技术平台副主任俞珺璟撰写,俞老师根据多年工作经验,详细介绍了流式细胞术的发展,并分享了长期工作中仪器使用的心得体会。以下为供稿内容:流式细胞术最初诞生于20世纪60年代末,发展之初主要应用于计数和评估颗粒的大小。随着硬件和软件的不断升级发展以及各种荧光试剂的迭代更新,流式细胞术作为一种能够对细胞群、细胞亚群及单个细胞或者颗粒进行多参数、快速的定性/定量的分析手段,已经被深入应用于细胞生物学、免疫学、病毒学、肿瘤生物学、传染病检测、食品和环境监控及生物制药等多个研究领域。流式细胞技术部门作为中国科学院分子细胞科学卓越创新中心细胞分析技术平台的一个重要分支,从成立最初的只有一台2激光4色流式细胞检测仪和2激光7色流式细胞分选仪发展至今已经具备了高低不同配置的流式细胞检测仪8台、流式细胞分选仪7台、高活性全自动磁珠分选仪1台(http://sjzx.sibcb.ac.cn/Cn/Index/pageView/catid/32.html/list/48 ),最大程度地满足中心及周边乃至全国科研院所在流式细胞仪方面的实验需求。平台流式的建设和发展与流式技术的不断更新、科研方向的转变是息息相关的。现就平台在流式方面的使用心得进行分享及对未来流式潜在的需求做一些展望。一、流式细胞检测传统流式细胞仪的硬件系统通常由一个或者多个激光器组成的光照系统、二向色镜以及带通/长通滤光片组成的分光光学器件、高灵敏度光电倍增管(PMT)或雪崩光电二极管组成的检测系统组成。传统流式细胞仪内一个激光器可以搭配2个或多个PMT通道,一个PMT对应一个检测通道,接收发射光谱的峰值信号。激光器越多检测通道越多,可检测荧光信号也越多。平台根据中心各课题组的实验需求配置了不同型号的基于传统检测原理的流式细胞检测设备。1.1 细胞內源荧光蛋白或自发荧光的流式细胞检测细胞内源荧光蛋白或自发荧光的检测主要包括三个方面的应用:1.细胞系转染质粒后阳性比例的检测;2.组织来源带有内源性荧光标记蛋白的细胞比例情况,例如细胞示踪实验;3.细胞自发荧光的测定,比如细胞富含某类化合物,而该类化合物具有较强的自发荧光,可以作为该类细胞的识别标志物。这三类实验基本只用单色或者两色的流式设备配置就可以开展实验。通常转染了只带有GFP标签蛋白的质粒细胞进行流式检测时,只需有488nm激光器,但是如果有mCherry之类的荧光蛋白,必需要有561激光器进行激发。如果带有GFP和mCherry两种融合荧光蛋白的小鼠组织来源细胞进行实验时,要注意两种荧光蛋白的表达水平,尤其是mCherry表达强而GFP表达弱时,mCherry的荧光溢漏会影响GFP通道,所以要利用合适的单荧光样品管作为单染管进行补偿调节。对于一些自发荧光的细胞,例如富含维生素A的细胞类型,可以用405nm激光器激发,450/50带通滤光片进行收集。对于这些荧光蛋白检测的实验,平台需要配备405nm/488nm/561nm的流式检测设备即可。1.2 常规细胞生理健康的流式细胞检测细胞凋亡、倍型、周期是流式平台做的最多的和细胞生理健康相关的实验。细胞凋亡实验一般会采用PI/Annexin V-FITC双指数染色,只有488nm激光器的设备就可以满足实验需求,但是如果有488nm/561nm独立光斑的仪器就可以省略调补偿的过程。细胞倍型一般会采用Hoechst 33342进行染色,以区分单倍体、二倍体等。Hoechst和双链DNA结合后最大激发波长为350nm,最大发射波长为461nm,因此需要配备了355nm激光器的设备,450/50带通滤光片收集。细胞周期一般会采用PI染色的方法,488nm或者561nm激光器都可以激发。因此,对于细胞生理健康的检测,如果使用上述染料基本配备355nm/488nm/561nm激光器的流式检测设备即可。1.3 多色流式细胞检测平台在多色流式细胞检测上主要围绕免疫细胞、造血干细胞、成体干细胞等的分型鉴定。多色流式检测从配色方案设计、设备选择、样品制备、上机和数据分析,过程相对更为复杂。因此,平台配备了4激光12色,4激光14色,5激光18色,5激光19色,5激光28色等多参数流式细胞仪,以满足各种实验需求。在实验过程中,如果多色实验,补偿调节依然是许多用户困惑的地方。如何获得正确的补偿矩阵是保证后期样品数据分析准确性的前提。现在的流式细胞分析仪基本都具备自动调节补偿的功能,因此可以用样品来确定各检测通道的电压后,用补偿微球进行补偿调节可以避免细胞阳性群不明显的困扰。随着仪器光路结构/检测器、电子元器件和分析软件的不断迭代,光谱流式技术的实用性得到了发展。在2005年的时候,Robinson等人提出了可以通过使用棱镜或光栅系统进行分光,配合32通道PMT或CCD检测器阵列可实现500-800nm波长范围内的全光谱信号检测技术。与棱镜分光相比,光栅分光系统可以通过单缝衍射原理对复合荧光实现均匀色散分光,在保证荧光信号真实性的基础上确保所有波段的荧光信号可以同时到达PMT检测器阵列中,实现全光谱信号检测的时空一致性,确保染料光谱的真实性。全光谱流式细胞仪可以跨越所有激光线,检测到可见光波长范围内(360-920nm波长)的全光谱信息,获得每一种荧光的整个发射光谱信息,最后利用WLSM算法(最小加权二乘法)对多个光谱进行拆分,获得每个单一荧光探针的完整光谱信号,从而避免使用传统的补偿计算矩阵,收集到更加全面与准确的荧光信号。因此,通过引入光谱流式技术,可以避免传统流式实验中高参数实验的补偿困扰。比如,通过光谱流式,平台已经实现了小鼠肠道23色免疫细胞分析方案、28色肿瘤免疫细胞亚群分析实验等。但是值得注意的是,光谱流式需要正确的光谱信息,比如样品固定会影响光谱信号,所以固定前后需要建立不同的荧光光谱库。1.4 高通量流式细胞检测流式分析上样方式除了传统的5ml流式管上样外,现在的注射泵和蠕动泵进样方式还可以支持1.5ml EP管上样。而对于一些高通量筛选的时候,尤其是悬浮细胞,利用高通量上样器可以很好地解决这类实验数据采集问题。尤其是带有声波聚焦技术的出现,可以将待测细胞精确聚焦在样本流的中心位置,每个细胞样本都可以准确地聚焦在激光检测区,即使在高流速1ml/min进样速度也能保证信号的变异系数较小,数据质量更高。同时伴随注射泵式的上中下三点混匀模式和推入式进样可以最大限度避免细胞堵塞,从而实现提高样本通量的同时,保证读取样品速度及获取的数据质量和精度。平台配备这种高通量流式检测设备可以提升科研的效率,有效节约科研工作者的时间成本。二、流式细胞分选2.1 传统流式细胞分选常规流式细胞分选早期是基于空气激发原理,此类流式分选仪低压高频的分选特点保证样品分选速度快,对分选后细胞的活性保持得更好。但是它需要手动校准光路和液路,对仪器操作者的技术要求很高,对环境条件的要求也比较苛刻。随着技术发展,现在大型仪器平台都会配备基于石英杯激发原理的流式分选仪,因为是固定光路,只需对仪器进行基本的质控校准和液滴延迟校准,使得分选仪开机工作变得相对简便。加电式的分选模式基本对细胞的活性都会有损伤,所以在分选速度、纯度和活性三者之间如何进行条件优化也是对仪器操作者的一种考验。对激光器的配置要求可以根据实验需求来决定。以我们平台为例,因为有大量的分选实验涉及单倍体细胞的分选,需要使用核酸染料Hoechst 33342,以区别不同倍型细胞中处于不同减数分裂时期的细胞,因此需要功率可调的355nm激光器进行激发,保证此类核酸染料的激发效率。根据DNA浓度和DNA构型,使用450/50(Hoechst Blue)和670/30 (Hoechst Red)带通滤光片双指数显示获取数据。但是核酸染料的使用也往往造成管路、流动室等位置会有样品或染料残留,需要更多的维护时间和人力成本,同时不可避免地减少了可使用机时。因此从平台的用户群角度出发,可以将355nm激光器和405nm激光器分开配置到两台设备,这样可以兼顾保证核酸染料用户群和多色分选用户群的使用需求,也最大程度地避免了两类样品的交叉污染。2.2 芯片式流式细胞分选芯片式流式分选仪最大的特点在于“分选芯片-喷嘴一体化”代替传统的石英杯与喷嘴,因此避免了因流动室或喷嘴支架无法更换造成的样品残留和污染。更换了新的芯片后,可以真正将样本在流动室中的残留率降低到零,这种设计对细胞移植和生物危害性样本分选等对交叉污染零容忍的分选应用更为友好。传统流式细胞分选仪在实验前须对仪器进行一系列复杂的调试步骤,包括光路校准,液流断点优化、侧液流校准和液滴延迟计算等,对仪器操作人员的依赖性更大,普通用户短时间内难以掌握。微流体芯片分选仪已经实现了上述所有调试和校准步骤自动化,并能在分选过程中对液滴状态进行实时监控和自动调节,简化了仪器操作过程,保证了每日仪器状态的稳定性,而且还能匹配不同规格的微流体芯片(70um,100um,130um)可以适用于更多的细胞类型。校准模式中还设计了大液滴模式,液流会更加稳定,更加适用于大细胞和多孔板(96或者384孔板)的分选。鉴于这种芯片式流式分选的特性,平台中一些抗体的单克隆筛选,384孔板测序建库,原代神经细胞等实验会借助这种分选平台进行。2.3 磁珠分选免疫磁珠分选主要基于细胞表面抗原能与连接有磁珠的特异性单抗相结合,在外加磁场中,通过抗体与磁珠相连的细胞被吸附而滞留在磁场中,而没有这种表面抗原的细胞由于不能与连接着磁珠的特异性单抗结合而没有磁性,先被洗脱下来,撤离了磁场后,带有抗体的细胞再被洗脱下来。因此,可以快速地分选得到阴选和阳选的细胞。作为一种功能较为独立的分选设备,磁珠分选主要应用于简单抗体标记的细胞分选和稀有细胞样品前期的富集,提高目的细胞的比例,可以帮助缩短在后期的流式细胞分选的时间提高获取细胞的纯度。分选后细胞纯度高、活性大,通过阳选,还能有效去除细胞碎片。但是对于一些需要内源蛋白标记的细胞还不能通过这种技术实现快速的分选。三、流式平台管理心得和未来可提升空间第一、 在流式使用方面,日常的维护是必不可少的,特别是使用频率特别高或者使用核酸染料样品较多的设备,可以将仪器维护频率提高到一周一次大清洗,同时在每一个用户实验结束后配合使用高浓度clean液-Rinse液-去离子水的冲洗流程,最大程度地保证管路和流式室的清洁,保证仪器正常的使用状态。第二、 对流式技术人员的要求日渐提升,除了会日常的开关机、维护、指导学生上机实验外,需要技术人员对不同样品的特性有更多的认知,判断其数据采集或分选过程中结果不如预期的潜在关键所在,此外还需要具备简单故障排除和硬件故障断定的能力,以缩短流式维修时间成本。第三、 平台设备需要密切结合用户群的实验特性、使用频次、科研目的等关键指标进行合理的配置,同时也要关注平台的技术空白和短板,予以填补和提升。第四、 随着对外泌体、病毒、细菌、亚细胞结构如线粒体等天然纳米颗粒检测需求的提升,可识别直径小于100nm颗粒的纳米级流式细胞术因其在外泌体研究、囊泡运输、纳米药物开发等方面的应用,可以作为纳米尺度小颗粒检测的金标准。第五、 随着光谱分析技术的提升,解决了光谱数据实时解析的问题后,整合了空气激发、低压高频、全自动校准、生物安全等功能的全光谱流式细胞分选仪势必在高参数高速流式分选中发挥更重要的作用。最后,国产流式技术团队在整机开发、配套试剂、技术能力、科研应用、售后服务等方面的不断提升,例如国产光谱流式、国产质谱流式在科研平台的落地化比例逐年上升。作者简介:俞珺璟 细胞分析技术平台副主任/高级工程师俞珺璟,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学和细胞生物学研究所)细胞分析技术平台副主任,博士,高级工程师。2004-2009中国科学院生物物理研究所获博士学位;2007-2009年美国密苏里州Stowers Institute for Medical Research访问学者;2010-2018在中国科学院生物物理所感染与免疫重点实验室从事细胞生物学及天然免疫学相关研究;2018年9月加入中科院生物化学和细胞生物学研究所细胞分析平台,副主任,主要负责流式平台仪器运维、大型仪器理论及实操培训,承担院级功能开发研制项目等,曾作为特邀主编,编撰《流式细胞术实验手册》,已在线发表于Bio-Protocol。2021年被评选为"中国科学院关键技术人才"。相关阅读:细胞生物学研究的利器——仪器平台负责人经验谈点击进入话题页面
  • 北大国家重点实验室王静博士:分子相互作用技术平台发展与使用心得分享
    分子相互作用技术是创新药物研发与产业化中必不可少的研究工具,贯穿药物开发的全过程。北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室的分子相互作用技术平台有13台大型仪器,包括表面等离子共振仪、生物膜干涉分析仪、等温滴定量热仪、微量热泳动仪、石英晶体微天平、蛋白纯化系统、动静态光散射和差示扫描荧光等。现就分子相互作用技术在创新药物研发中的实践进行分享。分子相互作用技术平台发展1.表面等离子共振(SPR)技术SPR技术是法规与药典推荐的药物活性评价方法,可实时、原位检测各种生物分子如蛋白、核酸、多糖、多肽、脂类、病毒、纳米药物、小分子、离子之间的结合与解离过程,提供亲和力、动力学、特异性、活性浓度、作用机制研究(竞争/别构/表位)等信息。SPR技术具有较高的精度、灵敏度和稳定性,广泛应用于药物靶点发现与确认、天然产物活性组分发现、药-靶亲和力和动力学检测、高通量药物筛选、杂交瘤筛选与定量、抗体生物活性分析、仿药一致性评价、免疫原性检测、药物生产过程中的质控等。2.生物膜干涉(BLI)技术BLI技术也是药典里药物结合活性检测的推荐方法,主要用于生物分子间相互作用的亲和力、动力学性质以及蛋白浓度测定。近两年,基于BLI开发的垂钓方法也可以实现中药活性组分发现与验证以及靶标垂钓。BLI通过浸入即读的方式提高了检测速度,具有实时分析、高通量、样品适用性广、操作简便灵活、耗材成本低、样品可回收等优点。3.等温滴定量热(ITC)技术ITC技术是基于热量检测的通用技术。通过检测分子结合过程中吸收或放出的热量,得到亲和力KD、化学计量比N以及全套热力学参数(焓值∆ H、熵值∆ S 和吉布斯自由能∆ G)。其中,∆H反映了氢键和范德华力等特异性相互作用的贡献,∆S反映了疏水效应的贡献以及构象改变、位阻的影响,因此能为分子间相互作用提供全面而深入的作用信息。4.微量热泳动(MST)技术MST技术是基于分子热泳动现象。在MST实验中需要给其中一个分子标记荧光。MST的优势在于样品无需固定,能保持样品天然状态,并且样品消耗量低,检测速度快,不受缓冲液限制。对于难表达纯化或不稳定的蛋白,可以通过基因转染方法给细胞内目的蛋白标记his tag或GFP,然后无需纯化、直接使用细胞裂解液进行相互作用检测。此外,有些样品的相互作用需要提前孵育一段时间,这样的样品也适合用MST进行检测。分子相互作用实验使用心得1. 样品质量高质量的样品对于获取高质量的分子相互作用数据至关重要。对于蛋白样品,实验前可以通过圆二色谱、动静态光散射、差示扫描荧光或差示扫描量热技术对蛋白进行分析,以确保蛋白结构和活性没问题。对于核酸样品,实验前可采用加热变性和缓慢冷却复性来保证其空间结构。对于难溶性小分子样品,需保证小分子在最高浓度下完全溶解,不能出现沉淀或析出。2. 缓冲液选择缓冲液常用PBS、Hepes或Tris体系。为了保持样品活性,有时需要额外调整缓冲液成分,包括pH、盐离子、盐浓度、去垢剂、还原剂、表面活性剂等。3. 分子互作技术和实验方法选择通常根据样品具体情况(类型、数量、多少、标签、纯度等)选择合适的分子互作技术和实验方法。分子相互作用实验,需要在实验过程中边做边摸索和优化条件。多种分子互作技术可以优势互补,相互验证。北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室-王静 博士王静,副主任技师,2016年博士毕业于中科院国家纳米科学中心,2016年8月起在北京大学医学部药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室大型仪器平台工作,负责生物分子相互作用技术平台的建设管理、测试服务和新方法新体系开发。利用表面等离子共振仪(SPR)、生物膜干涉分析仪(BLI)、等温滴定量热仪(ITC)、微量热泳动仪(MST)、差示扫描荧光(nanoDSF)等技术建立了靶标垂钓、中药活性成分发现、药物筛选与验证、竞争抑制研究、表位分析、分子相互作用的亲和力检测等一系列新方法新体系。主持一项国家自然科学基金面上项目和一项国家自然科学基金青年项目。近年来以第一作者/通讯作者在Nat. Commun., Adv. Mater., J. Am. Chem. Soc., Theranostics, Anal. Chem.等国际著名期刊上发表科研论文13篇,其他作者论文20余篇。申请发明专利一项,授权发明专利一项。如有技术干货、科研成果、仪器使用心得、生命科学领域热点事件观点等内容,欢迎相关行业朋友投稿。投稿邮箱:zhaoyw@instrument.com.cn
  • 395万!北京师范大学珠海校区理工实验平台生物分子相互作用分析仪采购项目
    项目编号:CFTC-BJ01-22011048项目名称:北京师范大学珠海校区理工实验平台生物分子相互作用分析仪采购项目预算金额:395.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):395.0000000 万元(人民币)采购需求:简要规格描述或项目基本概况介绍数量预算金额(万元)是否接受进口产品本次采购的设备可完成1、蛋白与蛋白的相互作用。2、癌症研究:直接对临床标本、组织,细胞匀浆等复杂标本进行分析。3、抗体和小分子药物的亲和力和动力学测定。4、抗体的筛选。5、小分子药物的筛选。6、核酸或反义核酸与蛋白的相互作用分析。7、海洋水产保健作用及疾病疗效的机理和研发。8、肿瘤中分子标记物的筛选。1套395是合同履行期限:自合同签订生效后开始至双方合同义务完全履行后截止本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 新羿生物:数字PCR是未来临床分子诊断的关键平台
    p style="text-indent: 2em "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "去年11月,Illumina领投知名数字PCR厂商Stilla Technologies 1600万欧元的A轮融资。同在11月,在美国召开的分子病理学协会年会上,罗氏报告了自家数字PCR仪的研发进展。今年年初,第37届摩根大通医疗保健大会上,凯杰宣布已经从波士顿公司Formulatrix手中收购了数字PCR技术。2月中旬,伯乐数字PCR系统获批FDA。/span/ppspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "  外企动作频出,国产厂商也相继发力。新羿生物、锐讯生物、臻准生物等多家国内厂商相继推出数字PCR系统。/span/ppspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "  近两年来,国内数字PCR厂商已涌现10余家,数字PCR市场开始迸发活力!数字PCR为何如此多娇,引各路厂商竞折腰?仪器信息网特别策划了数字PCR专题。本期,我们邀请国产数字PCR知名厂商新羿生物副总裁杨文军,谈谈她对数字PCR的观点和看法。/span/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201903/uepic/5f7aa1e4-869f-400c-b172-f8533213716a.jpg" title="杨文军.jpg" alt="杨文军.jpg" width="300" height="381" border="0" vspace="0" style="width: 300px height: 381px "//pp style="text-align: center "strong style="text-align: center "新羿生物副总裁 杨文军/strong/pp  strong仪器信息网:请您谈一下您对数字PCR技术的看法。/strong/pp  strong杨文军:/strong从1999年第一篇提出digital PCR(数字PCR)概念的文章发表,至今正好20年。20年来,此项技术从概念转化为产品有多种实现途径,但原理基本一致,即通过各种手段将靶标分子稀释并平均分配到几万个反应腔室中,通过单个模板分子的PCR扩增,可实现不依赖于标准曲线和参照样本的准确、绝对定量。同时分散稀释可以显著地降低了PCR抑制剂的浓度,这使得数字PCR的反应效率大大优于荧光定量PCR(qPCR)。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201903/uepic/079b659a-87c5-45ea-84eb-c730b5e4a98c.jpg" title="微滴数字PCR原理图.png" alt="微滴数字PCR原理图.png" width="531" height="160" border="0" vspace="0" style="width: 531px height: 160px "//pp style="text-align: center "strong微滴数字PCR原理/strong/pp  与其他传统分子诊断技术相比,数字PCR技术吸引人之处主要有三点:span style="color: rgb(0, 176, 240) "一是高灵敏度/span,可实现单分子级检测;span style="color: rgb(0, 176, 240) "二是绝对定/spanspan style="color: rgb(0, 176, 240) "量/span,不依赖标准品和参考曲线;span style="color: rgb(0, 176, 240) "三是高稳定性和较高的抗干扰能力/span,耐受较高的PCR抑制剂,适用于多种复杂样本。因此,数字PCR在临床市场的应用前景巨大,特别适用于低丰度核酸分子的检测和定量。/pp  数字PCR在临床市场的应用有独特的优势,尤其针对具有明确靶向位点信息的基因检测。与二代测序相比,操作简单,不需要进行文库构建、生物信息学解读复杂操作,医院检验科可自己操作,报告时间短,当天可出结果,费用低;与qPCR相比,检测灵敏度高,达到绝对定量,可以增加很多用传统qPCR方法无法胜任的检测项目。/pp  strong仪器信息网:目前,市售数字PCR仪主流产品为进口,国产数字PCR仪的机会在哪里?/strong/pp  strong杨文军:/strong虽然数字PCR市场现在基本上还是被国际大品牌所占有,国产数字PCR仪将会有很多机会。首先,通过技术创新规避了现有成熟品牌目前所有的缺陷,在样本制备、芯片设计、数据采集等各方面有较大的性能提高;其次,利用国内的产业制造优势,仪器、芯片、耗材成本大大降低,使得数字PCR仪进入临床应用具备了经济可行性;另外,一些优秀的国内数字PCR厂商,比如新羿生物,在完全自主知识产权数字PCR系统基础上,大力开发肿瘤液体活检、无创产前筛查、感染性疾病早期诊断等领域的诊断试剂盒,这将迅速推动数字PCR的应用和普及。国产仪器比国际品牌能更好的与国内科研领袖开展学术合作,可以提供更好的服务,对客户需求反应更迅速,技术支持方面更能满足国内客户的需要。/pp strong 仪器信息网:贵公司区别于其他数字PCR仪产品的核心技术是什么?/strong/pp strong 杨文军:/strong新羿TD-1数字PCR系统有过硬的核心技术,一个突出的体现是新羿生物能够对数字PCR仪、芯片、试剂、耗材各方面都做到自主创新。目前新羿已申请50余项相关专利,并已经开始布局PCT国际专利的申请。这些创新涵盖了数字PCR的全流程和整个系统。通过系统性的创新,可以实现更好的自动化、避免临床样本间的污染、提高参数性能(比如微液滴数量、制备均一性、微液滴扩增后稳定性),这些创新的目的是更好的满足临床需求。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201903/uepic/07e97dea-a6ef-486c-9acc-63c3614ead3e.jpg" title="新羿TD-1数字PCR系统.jpg" alt="新羿TD-1数字PCR系统.jpg" width="440" height="260" border="0" vspace="0" style="width: 440px height: 260px "//pp style="text-align: center "a href="https://www.instrument.com.cn/netshow/C289823.htm" target="_self"strong新羿TD-1数字PCR系统/strong/a/pp strong 仪器信息网:您对数字PCR市场的前景有什么看法?看好的细分领域有哪些?/strong/pp  strong杨文军:/strong我们非常看好数字PCR的市场前景,尤其是临床市场,数字PCR在如下领域非常具有吸引力:span style="color: rgb(0, 176, 240) "一、肿瘤的液体活检/span,通过检测血浆中的肿瘤循环DNA(ctDNA),为肿瘤的伴随诊断、疗效监控和预后判断提供可靠数据。span style="color: rgb(0, 176, 240) "二、无创的产前筛查/span,通过检测孕妇外周血胎儿游离核酸,可以比二代测序更快更便宜的开展唐氏综合征等染色体疾病检测。span style="color: rgb(0, 176, 240) "三、感染性疾病的早期和快速诊断/span,为重症和术后病人第一时间提供治疗建议。这三个领域具有非常庞大的市场需求。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201903/uepic/2da86191-f908-42d7-9c0e-2a1ffbaf6f54.jpg" title="12.jpg" alt="12.jpg" width="586" height="336" style="width: 586px height: 336px "//pp style="text-align: center"strong数字PCR应用于无创产前检测/strong/pp  strong仪器信息网:您认为数字PCR仪真正走进应用领域需要克服哪些困难?/strong/pp  strong杨文军:/strong数字PCR仪的技术先进性已经有共识,是未来临床分子诊断的关键平台。要做的这一点,需要更好的满足临床需求,比如防污染、自动化、通量高、稳定性好、成本低,这几年可预期的另一数字PCR突破就是实现多指标检测。好的产品都是在使用中成长起来的,优秀的产品稳定性带来愉快的使用体验,这需要时间的历练。/pp style="text-indent: 2em "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "为方便广大数字PCR用户交流、探讨,我们设立了“strong数字PCR用户交流群/strong”。在群里你可以和各路大神零距离沟通,欢迎广大数字PCR圈内人士加入交流~/span/pp style="text-indent: 2em "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "添加小编微信,备注上单位及姓名,小编会拉你进群哦~以下小编微信二维码,心动不如行动,快快加入吧!/span/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201903/uepic/ade5c1ae-f5cc-4d50-b25d-c0ef14088541.jpg" title="毛晓洁微信二维码.png" alt="毛晓洁微信二维码.png" width="300" height="300" border="0" vspace="0" style="width: 300px height: 300px "/span style="text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center "/p
  • 1000万!云南省天然药物药理重点实验室分子药理学研究平台(共享设备)采购项目
    一、项目基本情况项目编号:C53A00623001502项目名称:云南省天然药物药理重点实验室分子药理学研究平台(共享设备)预算金额(万元):1000最高限价(万元):1000采购需求:采购(1)激光共聚焦双转盘高内涵成像系统1套;(2)多功能微孔板检测系统1套;(3)超速离心机1套;(4)CO2培养箱1套;(5)生物安全柜1套;(6)纯水仪1套;(7)病理扫片分析工作站1套;(8)低氧培养系统1套。具体内容详见第五章 项目需求及技术要求。★注:1、投标人须对所投项目所有产品进行完整投标,不可缺项漏项,否则按不实质性响应招标文件处理。2.本次招标接受进口产品,进口产品是指通过中国海关报关验放进入中国境内且产自关境外的产品;合同履行期限:(交货时间)合同签订后180天内交货。本项目(否)接受联合体投标。二、获取招标文件时间:2023-10-07 15:37至2023-10-12 17:00,每天上午09:00至11:30,下午14:00至17:00(北京时间,法定节假日除外)地点:云南省公共资源交易系统(网址:http://ggzy.yn.gov.cn/#/homePage);方式:进入云南省公共资源交易系统,凭企业数字证书(CA)在网上获取采购文件及其它采购资料。售价(元):0三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:昆明医科大学地址:呈贡新区雨花街道春融西路1168号联系方式:贾老师0871-659228782.采购代理机构信息名 称:云南招标股份有限公司地址:云南省昆明市人民西路328号联系方式:0871-653298703.项目联系方式项目联系人:朱红宇、杨婧、尹号芬、鹿雯、罗红坚电 话:0871-65329870
  • 769万!2022年修购专项-海洋渔业种质资源分子鉴定与功能基因研究平台仪器设备购置项目
    项目编号:HHSC2022-01项目名称:2022年修购专项-海洋渔业种质资源分子鉴定与功能基因研究平台仪器设备购置项目一预算金额:436.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):436.0000000 万元(人民币)采购需求:1、采购内容:共二包,第一包: 大容量立式高速冷冻离心机、化学发光/荧光成像系统、实时荧光定量PCR仪、组织研磨器、细胞观察成像仪;第二包:全自动毛细管电泳分析系统、基因枪PDS-1000、液相氧电极系统、全自动高通量原位杂交仪。2、采购预算及最高限价:436万元,其中第一包243万元,第二包193万元。合同履行期限:自合同签订之日起60个工作日。本项目( 不接受 )联合体投标。项目编号:HHSC2022-02项目名称:2022年修购专项-海洋渔业种质资源分子鉴定与功能基因研究平台仪器设备购置项目二预算金额:333.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):333.0000000 万元(人民币)采购需求:1、采购内容:共二包,第一包: 数字定量PCR仪、基因超算工作站、多功能微孔板检测仪;第二包:自动核酸提取仪、超低温冰箱。2、采购预算及最高限价:333万元,其中第一包229万元,第二包104万元。合同履行期限:自合同签订之日起30个工作日。本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 1130万!南京农业大学国家大豆生物育种产教融合创新平台分子育种平台仪器设备第5批采购项目
    一、项目基本情况项目编号:ZF20230677(采购代理机构内部编号:2340SUMEC/GXGG1285)项目名称:国家大豆生物育种产教融合创新平台分子育种平台仪器设备第5批预算金额:1130.350000 万元(人民币)采购需求:分包品目号产品名称数量简要技术要求★合同履行期限(交货期)分项预算(人民币/万元)分包总预算(人民币/万元)11-1半自动封膜仪1套详见招标文件第四章 招标技术规格及要求合同签订后 120天内5.00512.251-2杂交炉3套75.001-3酸度计10套3.001-4超声波清洗器1套0.391-5粗纤维测定仪1套0.651-6电导率仪1套0.211-7样品磨10套72.001-8蛋白转膜仪2套16.001-9高速自动化加液平台5套75.001-10快速谷物品质分析仪1套45.001-11近红外谷物品质分析仪1套45.001-12快速谷物品质分析仪(多功能)1套45.001-13蛋白检测分析仪(核心产品)1套130.0022-1倒置荧光显微镜(核心产品)2套98.00211.002-2全自动高分辨体视荧光显微镜1套60.002-3正置式荧光显微镜1套49.002-4生物显微镜1套4.0033-1微孔板多功能检测仪1套60.00210.003-2酶标仪3套30.003-3多功能酶标仪(核心产品)1套60.003-4多标记检测系统1套60.0044-1原子吸收光谱仪(核心产品)1套50.00197.14-2生物大分子分析仪1套55.004-3化学发光成像系统2套20.004-4凝胶成像系统3套24.004-5核酸转膜仪1套8.004-6测序电泳仪2套2.004-7电泳仪30套8.14-8超微量核酸蛋白测量仪2套30.00报价超过对应分项预算金额及总预算金额均作无效投标处理。合同履行期限:详见采购需求本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2023年12月29日 至 2024年01月05日,每天上午9:00至11:30,下午14:00至17:30。(北京时间,法定节假日除外)地点:江苏苏美达仪器设备有限公司,南京市长江路198号14楼方式:在线发售,具体要求详见其他补充事宜售价:¥600.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:南京农业大学     地址:江苏省南京市卫岗1号         联系方式:于老师025-84395877       2.采购代理机构信息名 称:江苏苏美达仪器设备有限公司            地 址:南京市长江路198号            联系方式:文件发售:李婧怡025-84532580,技术咨询:谭一凡025-84532547            3.项目联系方式项目联系人:谭一凡电 话:  025-84532547
  • 1224万!南京农业大学国家大豆生物育种产教融合创新平台分子育种仪器设备采购项目
    一、项目基本情况项目编号:ZF20240087(采购代理机构内部编号:2440SUMEC/GXGG1034)项目名称:国家大豆生物育种产教融合创新平台分子育种仪器设备购置第7批预算金额:1224.260000 万元(人民币)采购需求:分包品目号产品名称数量是否接受进口产品投标(是/否)简要技术要求★合同履行期限(交货期)最高限价(万元/套)分包总预算(人民币/万元)11-1超纯水仪7套是详见招标文件第四章 招标技术规格及要求合同签订后120天内10.00410.001-2大容量低温离心机5套是8.001-3植物幼苗高通量动态成像分析系统(核心产品)1套是300.002/高分辨高通量荧光成像仪1套否180.00180.0033-1大豆单株脱粒机5套是0.50169.263-2大豆联合收割机2套是35.003-3大豆小区脱粒机5套是0.803-4种子低温烘干机2套是0.883-5智能低温种子贮存舱(核心产品)3套是25.003-6小型示教无人机5套是3.003-7灭茬机1套是1.0044-1高压冷冻包埋系统(核心产品)1套是240.00465.004-2原子吸收分光光度计3套是75.00报价超过对应最高限价金额及分包总预算金额作无效投标处理。合同履行期限:详见采购需求本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2024年03月30日 至 2024年04月08日,每天上午9:00至11:30,下午14:00至17:30。(北京时间,法定节假日除外)地点:江苏苏美达仪器设备有限公司,南京市长江路198号14楼方式:具体要求详见其他补充事宜售价:¥600.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:南京农业大学     地址:江苏省南京市卫岗1号         联系方式:于老师025-84395877       2.采购代理机构信息名 称:江苏苏美达仪器设备有限公司            地 址:南京市长江路198号            联系方式:文件发售:李婧怡025-84532580,技术咨询:谭一凡025-84532547            3.项目联系方式项目联系人:谭一凡电 话:  025-84532547
  • 1886万!国家大豆生物育种产教融合创新平台分子育种仪器设备采购项目
    一、项目基本情况项目编号:ZF20240097(采购代理机构内部编号:2440SUMEC/GXGG1037)项目名称:国家大豆生物育种产教融合创新平台分子育种仪器设备购置第8批预算金额:1886.000000 万元(人民币)采购需求:分包品目号产品名称数量是否接受进口产品投标(是/否)简要技术要求★合同履行期限(交货期)最高限价(万元/套)分包总预算(人民币/万元)1/超高分辨激光共聚焦显微镜1套是详见招标文件第四章 招标技术规格及要求合同签订后180天内900.00900.0022-1背包激光雷达扫描系统(核心产品)3套是合同签订后120天内 56.00338.002-2无人机激光雷达系统2套否85.0033-1三维激光扫描系统2套否75.00380.003-2微型无人机载高光谱成像仪(核心产品)2套是70.003-3机载高光谱相机2套是45.0044-1种子活力分析仪(核心产品)1套是93.00268.004-2大豆小区脱粒机3套是25.004-3卷盘/绞盘喷灌机全自动淋灌设备10套否10.00注:报价超过对应最高限价金额及分包总预算金额作无效投标处理。合同履行期限:详见采购需求本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2024年04月03日 至 2024年04月11日,每天上午9:00至11:30,下午14:00至17:30。(北京时间,法定节假日除外)地点:江苏苏美达仪器设备有限公司,南京市长江路198号14楼方式:具体要求详见其他补充事宜售价:¥600.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:南京农业大学     地址:江苏省南京市卫岗1号         联系方式:于老师025-84395877       2.采购代理机构信息名 称:江苏苏美达仪器设备有限公司            地 址:南京市长江路198号            联系方式:文件发售:李婧怡025-84532580,技术咨询:谭一凡025-84532547            3.项目联系方式项目联系人:谭一凡电 话:  025-84532547
  • 1570万!北京大学成都前沿交叉生物技术研究院生物分子相互作用测定平台采购项目
    一、项目基本情况项目编号:0730-236012CD0715项目名称:北京大学成都前沿交叉生物技术研究院生物分子相互作用测定平台采购项目预算金额:1570.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):1570.0000000 万元(人民币)采购需求:详见附件。合同履行期限:合同签订后180日内交货并安装调试完毕。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2023年09月19日 至 2023年09月25日,每天上午9:00至12:00,下午12:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:中航招标网(http://bid.aited.cn)方式:凡有意参加本项目者,选择相应的项目缴费购买即可(无需办理会员)。提示:①付款时请使用网银支付,暂不接受支付宝、微信和手机APP付款;②我公司将为购买采购文件的投标人开具电子发票,并推送至投标人下单时预留的电子邮箱,请务必确保邮箱地址正确;③网站注册咨询电话:4006722788,项目具体事宜请咨询采购代理机构。售价:¥300.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:北京大学成都前沿交叉生物技术研究院     地址:成都市双流区高新区新川路        联系方式:联系人:付老师、孙老师;邮箱地址:fuyuanhao1992@163.com、qsun2015@pku.edu.cn      2.采购代理机构信息名 称:中航技国际经贸发展有限公司            地 址:成都市高新区益州大道北段777号中航国际交流中心A座1501-1502、1508-1510号            联系方式:联系人:肖坤良、彭黎明;联系电话:028-86266522/86266520/86246522/83199376-630、638            3.项目联系方式项目联系人:肖坤良、彭黎明电 话:  028-86266522/86266520/86246522/83199376-630、638
  • 分子细胞卓越中心化学生物学技术平台与Bio-protocol联合发布《高内涵成像及分析实验手册》
    ISBN: 978-1-951285-06-7《高内涵成像及分析实验手册》封面高内涵成像分析系统同时具备自动化高速显微成像功能及自动化图像定量分析功能,可对多个样品快速成像,并从图片中提取大量的数据信息,因此可在一次实验中获取多种参数的定量信息,可更好地避免传统高通量筛选检测方式带来的假阳性和假阴性结果,使得高内涵成像分析技术被越来越多地应用到药物筛选及细胞信号通路、肿瘤、神经生物学、免疫学、传染病学、干细胞等基础研究领域。建立高特异性、高灵敏度及稳定可重复的高内涵实验体系对于获得准确可靠的结论至关重要。由中国科学院分子细胞科学卓越创新中心化学生物学技术平台与Bio-protocol中国编辑部共同启动的“《高内涵成像及分析实验手册》(High-Content Imaging and Analysis Protocol eBook)”项目,旨在打造一个高内涵领域技术共享的平台,倡导国内优秀的科研团队分享自己的成熟方案及经验,促进一线科研人员间的交流与互动,有效提升科研效率。本次出版的《高内涵成像及分析实验手册》共收录33份实验方案,分为五个章节。第一章节“高内涵成像及分析概述”部分讨论了高内涵实验设计要点,第二至第五章节按照检测对象的不同分别介绍了高内涵技术在生物大分子表达与定位、细胞亚结构、细胞水平生命活动、3D培养及模式生物中的具体应用。实验方案分别从样品标记与制备、显微成像以及图像分析三个方面分享了实验细节及经验心得。(点击文末阅读原文即可浏览本手册)《高内涵成像及分析实验手册》视频精选(源自Bio-101:e1010855. DOI:10.21769/BioProtoc.1010855)《高内涵成像及分析实验手册》的出版要感谢10位专辑编委的辛苦付出:中国科学院分子细胞科学卓越创新中心的主编韩帅博士和陈铭研究员、科学顾问李林院士,特邀编委—中国科学院生物物理研究所高级工程师王娅老师,浙江大学王毅教授,上海科技大学王瑛博士,中国科学院上海药物研究所臧奕研究员,上海交通大学医学院附属瑞金医院、国家转化医学大设施(上海)张建明研究员,苏州大学张乐帅教授,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心高级工程师赵宏伟老师。还要特别感谢包括多名院士在内的26位专家领导的课题组共87位作者参与这本手册的撰写,以及39位一线科研工作者参与评审工作。在他们的共同努力下,《高内涵成像及分析实验手册》才得以顺利发布。《高内涵成像及分析实验手册》专辑编委会《高内涵成像及分析实验手册》所有文章, 读者可以通过Bio-protocol旗下Bio-101平台,Google Scholar等多种途径免费获取(点击文末阅读原文)。读者还可以通过Q&A功能与作者在线直接交流。Q&A在线交流示例(源自Bio-101:e2003367.DOI: 10.21769/BioProtoc.2003367)后续,我们还将持续择优收录各类优质的高内涵实验方法于本手册中,诚邀更多国内外优秀同行参与本项目,分享成熟的实验方法,一起打造本领域的方法百科全书。中国科学院分子细胞科学卓越创新中心化学生物学技术平台简介为更充分实现原创性基础科研成果的社会价值,促进转化研究的开展,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心化学生物学技术平台于2008年建立。主要以高通量实验技术为手段,利用全基因组siRNA等文库等进行功能基因组学研究,推动各研究组在生命科学各领域的创新性发现和研究,发掘新的潜在药物靶点,同时针对这些原创性新靶点进行活性化合物筛选,为创新驱动的新药筛选研发提供支持。秉承公共平台提供科研服务的理念,本平台已经为国内数十个科研院校/企业单位的上百个研究组/部门提供过技术服务,有效帮助到科研人员的论文专利和新药研发项目。Bio-protocol简介Bio-protocol于2011年在斯坦福大学创建,旨在提高科研的可重复性, 以助力科学发现。Bio-protocol期刊是Bio-protocol旗下一份同行评审的国际学术期刊,发表高质量的生命科学实验方案。至今,已发表了来自全球上万名优秀科研工作者(包括上百名院士及多名诺贝尔奖获得者)的4000多篇实验方案,并且同Science等多家国际权威科学杂志建立长期合作关系。目前,Bio-protocol期刊已被PMC,Web of Science (ESCI) 、Scopus收录。Bio-101是Bio-protocol旗下一个生命科学实验方法的共享平台, 致力于为全球生命科学研究工作者搭建一个分享、查找和讨论实验方法的开放平台, 让科研更高效。平台与Science、eLife 等期刊合作开通了“Request a Protocol”服务,已经为上万名读者解答实验相关的问题。(来源:BioscienceProtocols微信公众号)
  • 广西药用植物园携手德诺杰亿,国产原研核酸检测“金标准”平台助力药用植物进入分子育种新时代
    日前,广西药用植物园与德诺杰亿(北京)生物科技有限公司(以下简称“德诺杰亿”)正式宣布双方在“U2000基因分析仪”平台上关于“中药材分子育种技术、中医药植物基因资源和新基因发掘的理论基础与技术创新项目”进行战略性合作。 中医药作为我国优秀传统文化的非常重要的一部分,强大的理论体系具有很强的系统性,望、闻、问、切等极富特色的诊疗用药方法特点,在几千年源远流长的中华民族历史中留下了炫彩的色彩。中药材是我国传统中医药中的重要组成部分,具有康复和保健的作用。近年来,随着我国经济的飞速发展,人们生活水平不断提高,养生保健意识逐渐增强,对中药材的需求量与日俱增.在这一新时代背景下,想要有效提高中药材质量和产量,就要重视其标准化种植、育种等工作。目前,生物学发展早已进入了系统科学的新时代。海量的“爆炸式”增长的生物信息为中药材分子育种、品种培育、质量评价等研究工作奠定了良好的信息和理论基础。 德诺杰亿和广西药用植物园双发达成的战略合作将依托于广西药用植物园在中药材分子研究领域深厚技术支撑,利用德诺杰亿自主研发、生产、制造的国产分子检测“金标准”平台——U2000基因分析仪筛选一批中药材育种新材料,建立中药材种质资源群圃群;创新一批适合中药材特性的育种方法技术,构建中药材质量评价体系和分子辅助育种体系;建立配套栽培技术和优良繁育技术,构建成熟的中药材分子育种平台,德诺杰亿原研技术的国产化平台也为基因信息数据安全提供了有力保障。 现阶段,我国在中药材分子育种等技术总体研究薄弱,缺乏大规模化国产基因发掘的技术平台,目标性状基因的精细定位不足,拥有自主知识产权的实用分子标记少;缺少有重大利用价值的新基因;缺乏规模化高效率安全的中药材质量评价体系;中药材关键作用因子认识不清等。因此德诺杰亿和广西药用植物园双方的战略合作,将有助于中药材的两种繁育、建立生产技术标准体系和等级评价制度,推动中药质量提升和产业高质量发展。 【广西药用植物园】 广西壮族自治区药用植物园(广西壮族自治区药用植物研究所,中国医学科学院药用植物研究所广西分所),创建于1959年,占地面积202公顷,是广西壮族自治区中医药管理局直属的从事药用动、植物资源收集、保存、展示、科普教育;药用动、植物资源保存与利用、特色中药资源、民族药资源产品开发、中药材产品质量检测技术与标准研究;中药材产品质量标准起草以及检测服务的公益性事业单位。 广西药用植物园致力于药用资源的收集保护,通过“五库一馆”的建设,围绕国家中医药管理局重点学科——药用植物保育学学科,建成了完善的药用资源保护平台,形成了具有世界领先水平的药用植物资源保育体系。广西药用植物园建园至今已保存药用植物物种10021种,腊叶标本保存20万份,其中活植物保存近8000号;种子保存5000多种7000份,离体保存650种,基因保存1385份、馏分保存1000种15000份。2011年被英国吉尼斯总部以药用植物物种保存数量和面积认证为世界“最大的药用植物园”。【德诺杰亿】 德诺杰亿(北京)生物科技有限公司是一家诊断试剂与自动化检测设备的研发、生产与销售的国家级高新技术企业;是分子检测核心技术平台制造商。公司总部位于北京经济技术开发区科创十四街汇龙森科技园,公司基地拥有试剂和设备两个技术平台,试剂匹配仪器或与仪器一体化是公司的核心竞争力。分子诊断分别以PCR-CE(聚合酶链式反应毛细管电泳基因分析)和FISH(荧光原位杂交)金标准技术为平台,通过微流体控制技术集成并实现检测自动化。PCR-CE技术产品通过片段分析应用于临床诊断、公安司法、食品安全、分子育种、疾病(疫病)控制等领域;FISH技术产品通过分子病理技术应用于肿瘤早期发现、肿瘤药物伴随诊断和治疗药效评估;免疫快检以胶体金层析技术为平台,利用自身的基因工程表达平台生产的原材料产业化市场需求的快检产品;POCT设备以相关模块为平台整合需求并产业化小型自动化分子检测设备并匹配相关试剂。德诺杰亿是全球第二家研发生产制造金标准(sanger)测序和毛细管电泳(capillary electrophoresis, CE)设备(U2000基因分析仪)的具有自主知识产权的硬科技公司,目前中国使用的该设备全部被进口垄断,此设备所属的方法学是国际公认的金标准技术。同时,为保证基因检测的稳定性和核酸样本的处理速度,德诺杰亿提供了全自动核酸提取纯化仪及预封板试剂。
  • Nat Methods | 汤富酬课题组开发出基于单分子测序平台的scNanoHi-C技术,可精准检测单细胞高阶染色质互作
    真核生物基因的表达受到基因组中顺式作用元件的复杂调控。哺乳动物基因组中存在大量的顺式作用元件,例如:启动子、增强子、沉默子、绝缘子等等,其数量远远超过蛋白编码基因。目前人类基因组中已知的顺式调控元件就有一百多万个,而蛋白编码基因只有大约两万个。遗传学研究也表明基因调控不仅仅是单个基因之间一对一的简单调控事件,而是以调控网络的形式发挥作用,不同的调控元件以及靶基因之间存在着复杂的相互作用。例如,一个基因的启动子可以整合来自多个增强子或者沉默子的调控作用,一个增强子元件也能够同时影响多个基因的表达1-3。随着三维基因组技术的发展,人们对基因表达调控相关的染色质构象已经有了一定的理解,但由于技术的限制,大部分研究都是集中在成对的相互作用(pair-wise interaction)上,而对于多个顺式调控元件同时与一个基因启动子之间的高阶相互作用(high-order interaction)的研究仍然比较有限。此外,多个基因组元件是如何通过三维基因组构象的变化同时参与基因表达调控的机制目前也尚不清楚。近年来,为了探究更精准和全面的染色质互作情况,检测高阶染色质互作的技术也相继出现。然而这些技术往往局限于基因组的特定位点,或是需要特殊的仪器设备。得益于三代测序平台(单分子测序平台)的日渐成熟,最近开发的基于牛津纳米孔技术 (Oxford Nanopore Technology, ONT) 的Pore-C方法4在检测染色质高阶相互作用方面表现出优异的性能,可以通过应用新的统计方法有效地分析全基因组中多个染色质位点之间高阶相互作用的协同性。尽管上述这些基于大量细胞的研究方法能够有效地检测染色质的高阶相互作用,但它们无法解决细胞间的异质性问题,阻碍了它们在复杂组织器官样品中的应用。而现有的单细胞Hi-C(single-cell Hi-C,scHiC)技术受限于二代测序较短的读长(通常是双端总共300bp)也难以对染色质高阶相互作用进行检测。目前除了单细胞超分辨率成像以外,2022年开发的scSPRITE5是唯一一种可以在单细胞水平检测染色质高阶相互作用的测序方法。但是该方法更适用于远距离的间接染色质高阶相互作用,而对于与基因调控更相关的直接染色质高阶相互作用的检测能力很有限。此外,scHi-C 的另一个挑战是很难平衡捕获细胞群体异质性所需的高通量(每次实验能够检测大量单细胞)与探索高分辨率 3D 基因组结构所需的高深度(每个单细胞中捕获大量染色质相互作用)之间的矛盾。因此,需要一种可扩展的 scHi-C方法来剖析高阶染色质三维结构,并在单细胞水平上研究这些染色质高阶相互作用在不同生物过程中的协同调控机制。为了应对这些挑战,2023年8月28日,北京大学生物医学前沿创新中心汤富酬课题组在Nature Methods上发表题为scNanoHi-C: a single-cell long-read concatemer sequencing method to reveal high-order chromatin structures within individual cells的文章。该研究在国际上率先使用单分子测序平台开发了一种基于邻近连接的单细胞染色质构象捕获方法,称为 scNanoHi-C。该方法实现了在单细胞水平的高阶染色质相互作用检测,并且在通量上具有很好的灵活性,能够满足不同的实验需求。在实验上,scNanoHi-C依次使用 1% 甲醛 (FA) 和 1.5 mM 戊二酸二琥珀酰亚胺酯 (DSG) 孵育进行交联,以降低连接反应的随机噪音并兼顾对短程和长程染色质相互作用的高灵敏度检测。为了尽可能完整地保留单细胞中固定连接后的染色质三维结构信息,该研究设计了一种灵活的单细胞基因组长片段扩增方法。该方法使用两端具有相同接头的低浓度Tn5转座酶以提高DNA片段扩增长度和基因组覆盖度,并通过设计24种带有不同条码标签的 Tn5 酶结合后续PCR扩增中引入的条码标签共同控制测序的通量。通过这种方式,scNanoHi-C 能够在一次 PromethION 测序中对少至几个单细胞进行低通量、高覆盖度测序或者对数千个单细胞(最高可达 24×96=2304个细胞)进行高通量、低覆盖度测序,可以根据实验需求灵活进行选择(图1)。为了评估scNanoHi-C技术的可靠性,该研究首先将scNanoHi-C应用于正常二倍体的GM12878细胞系,并分别使用低深度(~0.2Gb/cell)、中等深度(~1Gb/cell)、高深度(~4Gb/cell)三种策略进行测序,并与基于二代测序平台的大量细胞原位Hi-C标准数据集进行比较,结果显示出很高的一致性。同时每个策略检测到的串联体(含有有效染色质相互作用的测序读段)中大约一半为高阶串联体(包含三个以上不同调控元件间的相互作用)。在这些高阶串联体中,大约58%是三联体,26%是四联体,其余为五联体以上的多联体(基数从5到11不等)。图1:实验流程示意图以及高阶串联体的检测接着该研究在多个方面对scNanoHi-C的应用进行了探索:1.scNanoHi-C可以在单细胞水平上精准捕获染色质三维结构的异质性。scNanoHi-C能够在单细胞水平检测各层级染色质结构特征,包括染色体领域(整条染色体,50Mb-200Mb尺度的结构特征)、A/B区室(常染色质区域与异染色质区域,5Mb-20Mb尺度的结构特征)、以及拓扑关联结构域样结构(TAD-like,0.5Mb-5Mb尺度的结构特征)。同时,scNanoHi-C的单个染色质片段长度(单体长度,平均610 bp)相较于传统基于二代测序平台的scHi-C(测序不超过150bp)显著提高,这大大增加了其在染色质相互作用对中捕获到单核苷酸多态性(SNP)位点的机会,能够在二倍体细胞中直接判定单倍型的单体比例由原来二代测序平台的大约9%提高到了25%。因此,scNanoHi-C也可用于有效地重建单个二倍体细胞的基因组三维构象。同时,利用单细胞A/B 区室化值(single-cell A/B compartment value, scA/B value), scNanoHi-C对GM12878、HG002 和 K562 三种人类细胞系进行了聚类分析,能够在单细胞精度准确将三种细胞分开,并识别了细胞类型间的染色质差异区室化区域。此外, scNanoHi-C也能够准确地检测每个单细胞的基因组拷贝数变异(CNV)特征。分析结果表明,scNanoHi-C准确地捕获了GM12878细胞培养过程中产生的非整倍体亚克隆以及K562细胞的拷贝数变异。同时,scNanoHi-C也可应用于结构变异的检测,如准确检测出了K562 细胞中 BCR-ABL1 和 NUP214-XKR3 的基因融合事件(染色体易位事件)。图2:scNanoHi-C串联体和单体的长度分布、单倍体分型的比例、细胞分群结果和单细胞拷贝数变异(CNV)图谱2.scNanoHi-C能够在单个细胞中准确鉴定高阶染色质相互作用。该研究在GM12878 细胞数据集中,使用scNanoHi-C得到的单细胞高阶串联体信息结合ABC模型(Activity-by-contacts model)6预测的增强子-启动子 (E-P) 相互作用关系共同鉴定了增强子-启动子高阶相互作用。通过这种方式,该研究首次在单个细胞中以20 kb的分辨率直接观察到1,097 个基因的单个启动子能够与多个增强子同时发生相互作用,表明这些基因可能同时受到多个增强子的调控。这些受到高阶调控的基因主要富集在与GM12878这种B淋巴细胞的功能相关的免疫信号通路上,并且通常表现出更高的表达水平。特别地,这些基因中还包括一些B细胞谱系特异性转录因子如EBF1以及EBV 超级增强子相关基因如MIR155HG、IKZF3和ETS1等。这些结果表明,多个增强子的协同调控可能是确保关键基因高水平稳健表达的一种潜在机制。通过类似的方法,该研究还在单个细胞中鉴定出了1,422 个能够与多个启动子同时发生相互作用的增强子。此外,该研究发现部分高阶基因调控作用能够在多个单细胞中被检测到,这可能与细胞中频繁使用的关键转录程序有关,后续可以通过发展基于富集策略的具有更高分辨率的Hi-C技术进行进一步的深入研究。图3: scNanoHi-C技术对多向基因调控网络的检测3.scNanoHi-C能够揭示不同基因组区域之间的协同调控关系以及染色体外环形DNA与线性基因组间的复杂相互作用。倾向于形成高阶相互作用的一组基因组位点称为“基因组协同调控区域”。该研究针对scNanoHi-C的数据特点对鉴定基因组协同调控区域的算法进行了优化,并将该算法运用到GM12878细胞活跃启动子和增强子的集合中,在全基因组范围内共鉴定出了917组增强子-启动子协同调控区域。其中,大约20%(187/917)的协同调控区域包含来自不同染色体的基因组位点(提示不同染色体之间的反式相互作用)。这些协同调控区域在活跃转录的基因组区域、淋巴细胞特异性转录因子和染色质环相关因子(CTCF等)的结合位点区域中高度富集。此外,在917个协同调控区域中,有167个被发现与GM12878细胞特异性的超级增强子有关。接着,该研究将scNanoHi-C运用到携带大量染色体外环形DNA(ecDNA) 的COLO320DM 人类结直肠癌细胞系中,检测到了染色体外环形DNA与线性基因组(染色体内的基因组)之间存在广泛的染色质高阶相互作用,并且首次在单个细胞中观察到四个主要的染色体外环形DNA的基因位点之间存在复杂的高阶相互作用。这些结果表明,染色体外环形DNA可能通过建立复杂的高阶染色质三维结构来驱动癌基因的过量表达。图4: scNanoHi-C技术对染色体外环形DNA(ecDNA)相关的协同作用的检测4.scNanoHi-C能够高效辅助单细胞基因组从头组装。在可用细胞数量有限的情况下,该研究表明使用scNanoHi-C辅助单细胞基因组(single-cell whole genome sequencing,scWGS)从头组装7可以大幅度提高组装质量。例如,使用20个单细胞的基因组长读长测序数据和12个单细胞的scNanoHi-C数据组装的人类基因组支架(scaffold)的NG50要优于使用30个单细胞的基因组长读长测序数据直接组装的效果(2.49 Mb vs. 1.34 Mb)总之,scNanoHi-C具有很好的可扩展性和灵活性,在一次测序中可对少至几个单细胞或多达数千个单细胞进行染色质三维结构测序,并且实验流程相对简单、易于操作,仅需要基本的PCR仪等分子生物学设备,适合于各种生物学实验室使用。scNanoHi-C还是一种强大且多功能的工具,可用于在单细胞分辨率准确区分细胞类型、对单个二倍体细胞进行高效单倍型分型、检测单个正常细胞和肿瘤细胞中的基因组拷贝数变异和各种复杂结构变异以及高效辅助单细胞基因组从头组装。更重要的是,scNanoHi-C 首次实现了在单个细胞中在全基因组水平对增强子-启动子的高阶直接相互作用的检测,在单个细胞中准确鉴定了高阶基因调控事件,同时能够对复杂的染色体外环形DNA与线性基因组间的高阶相互作用进行精准检测。scNanoHi-C显示了单细胞长读长Hi-C测序技术在分析由高阶染色质三维结构介导的不同细胞间基因调控异质性方面的潜力,为将来进一步研究发育和疾病进展过程中高阶染色质结构变化机制,揭开基因组中各种复杂调控关系中的“暗物质”奠定了坚实的基础。北京大学生物医学前沿创新中心、前沿交叉学科研究院生命科学联合中心博士生李文、生命科学学院博士生卢健森为该论文的共同第一作者,北京大学生物医学前沿创新中心汤富酬教授为该论文通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金基础科学中心项目、北京未来基因诊断高精尖创新中心、昌平实验室的资助,北京大学高通量测序平台以及北京大学“北极星”高性能计算平台的协助与支持,北京大学邢栋课题组为本研究提供了重要的帮助。论文链接:https://www.nature.com/articles/s41592-023-01978-w参考文献:1 Hafner, A. & Boettiger, A. The spatial organization of transcriptional control. Nat Rev Genet, doi:10.1038/s41576-022-00526-0 (2022).2 Oudelaar, A. M. & Higgs, D. R. The relationship between genome structure and function. Nat Rev Genet 22, 154-168, doi:10.1038/s41576-020-00303-x (2021).3 Furlong, E. E. M. & Levine, M. Developmental enhancers and chromosome topology. Science 361, 1341-1345, doi:10.1126/science.aau0320 (2018).4 Deshpande, A. S. et al. Identifying synergistic high-order 3D chromatin conformations from genome-scale nanopore concatemer sequencing. Nat Biotechnol 40, 1488-1499, doi:10.1038/s41587-022-01289-z (2022).5 Arrastia, M. V. et al. Single-cell measurement of higher-order 3D genome organization with scSPRITE. Nature Biotechnology 40, 64-73, doi:10.1038/s41587-021-00998-1 (2021).6 Fulco, C. P. et al. Activity-by-contact model of enhancer-promoter regulation from thousands of CRISPR perturbations. Nat Genet 51, 1664-1669, doi:10.1038/s41588-019-0538-0 (2019).7 Xie, H. et al. De novo assembly of human genome at single-cell levels. Nucleic Acids Res 50, 7479-7492, doi:10.1093/nar/gkac586 (2022).汤富酬,博士,北京大学BIOPIC/ICG研究员,国家“优青”(2013)、“杰青”(2016)。1998年本科毕业于北京大学,2003年在北大获得细胞生物学博士学位,2004-2010年间在英国剑桥大学Gurdon研究所从事博士后研究, 2010年回到北京大学组建实验室,主要从事人类早期胚胎发育的单细胞功能基因组学研究。在国际上率先系统发展了单细胞功能基因组学研究体系,并利用一系列技术体系对人类早期胚胎发育进行了深入、系统的研究,揭示了人类早期胚胎DNA去甲基化过程的异质性以及其他表观遗传学关键特征,发现了人类早期胚胎中基因表达网络的重要表观遗传学调控机理,为人们提供了一个全面分析人类早期胚胎表观遗传调控网络的研究框架,加深了对人类原始生殖细胞的发育以及表观遗传重编程过程的认识。
  • 1147万!伍连德生物医学创新研究院细胞与分子影像研究平台和柳州市人民医院科研仪器设备采购项目
    一、项目一(一)项目基本情况项目编号:[230001]LTGC-[GK]20240005项目名称:伍连德生物医学创新研究院细胞与分子影像研究平台二期仪器采购采购方式:公开招标预算金额:7,508,500.00元采购需求:合同包1(细胞与分子影像研究平台二期仪器采购包1):合同包预算金额:3,980,000.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)1-1其他仪器仪表小动物活体X射线断层成像系统1(台)详见采购文件3,980,000.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:自合同签订之日起90个日历日合同包2(细胞与分子影像研究平台二期仪器采购包2):合同包预算金额:3,528,500.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)2-1其他仪器仪表高分辨激光共聚焦显微镜1(台)详见采购文件2,650,000.00-2-2其他仪器仪表倒置荧光成像系统1(台)详见采购文件320,000.00-2-3其他仪器仪表双色红外激光分析仪1(台)详见采购文件400,000.00-2-4其他仪器仪表成像型多色细胞分析仪1(台)详见采购文件158,500.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:自合同签订之日起90个日历日(二)获取招标文件时间: 2024年08月13日 至 2024年08月20日 ,每天上午 08:30:00 至 12:00:00 ,下午 12:00:00 至 16:30:00 (北京时间,法定节假日除外)地点:公告期内凭用户名和密码,登录黑龙江省政府采购管理平台(http://hljcg.hlj.gov.cn/),选择“交易执行-应标-项目投标”,在“未参与项目”列表中选择需要参与的项目,确认参与后即可方式:在线获取售价: 免费获取(三)对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名称:哈尔滨医科大学地址:黑龙江省哈尔滨市南岗区保健路157号联系方式:0451-866232802.采购代理机构信息名称:黑龙江省蓝图工程项目管理有限公司地址:黑龙江省哈尔滨市道里区群力第四大道1479号B3栋C单元23层1号联系方式:0451-51060768 3.项目联系方式项目联系人:黑龙江省蓝图工程项目管理有限公司电话:0451-51060768二、项目二(一)项目基本情况项目编号:LZZC2024-G1-990797-GXDD项目名称:小动物活体成像系统等一批科研仪器设备采购预算金额:397.600000 万元(人民币)最高限价(如有):355.600000 万元(人民币)采购需求:标项名称:小动物活体成像系统等一批科研仪器设备采购数量:1预算金额(元):3976000简要规格描述或项目基本概况介绍、用途:具体内容详见附件。最高限价(如有):3556000备注:本项目为全流程电子化采购项目,采用远程异地评标,有意向参与本项目投标的潜在投标人应当做好参与全流程电子招投标交易的充分准备。合同履行期限:自签订合同之日起60日内安装调试完毕,验收合格并交付使用。 本项目( 不接受 )联合体投标。(二)获取招标文件时间:2024年08月13日 至 2024年08月20日,每天上午8:00至12:00,下午12:00至21:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:广西政府采购云平台(https://www.gcy.zfcg.gxzf.gov.cn/)方式:在获取招标文件截止时间前登录广西政府采购云平台(https://www.gcy.zfcg.gxzf.gov.cn/)在线办理报名:“项目采购”→“获取采购文件”。(注意事项:1.潜在投标人应当在获取招标文件截止时间前通过广西政府采购云平台(https://www.gcy.zfcg.gxzf.gov.cn/)注册登记后再获取招标文件,未通过广西政府采购云平台(https://www.gcy.zfcg.gxzf.gov.cn/)注册登记获取招标文件的投标人,采购代理机构将拒绝接收其投标文件。2.已获取招标文件的投标人不等于符合本项目的投标人资格。)售价:¥0.0 元,本公告包含的招标文件售价总和(三)对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:柳州市人民医院     地址:柳州市文昌路8号        联系方式:葛瑛0772-2662036      2.采购代理机构信息名 称:广西大德项目管理有限公司            地 址:柳州市潭中东路17号华信国际B座910            联系方式:梁斌雄、余明华0772-2120191            3.项目联系方式项目联系人:梁斌雄、余明华电 话:  0772-2120191
  • 浅述分子诊断的前世今生及未来
    分子诊断与治疗是当代医学发展的必然  纵观医学诊断和治疗学科的发展历程,正是由于包括物理学、化学、免疫学、分子生物学等学科在内的一个个犹如星斗般灿烂的重大发现和发明,才使得医学诊断与治疗学科与时俱进,不断丰富、发展与完善。   分子诊断学发展历程  以DNA双螺旋结构的模型提出为标志,分子生物学在半个多世纪的发展历程中,尽显了风流与辉煌!  分子生物学不仅吸引了世界上一大批有志于认识生命本质的科学家和临床医生投入其中,用生命与智慧创造出医学发展史上瀑布般的学术成就,彻底改变了诊断与治疗的传统观念,而且分子生物学领域越来越多的发明和成果正在各类临床疾病的诊断与治疗方面得到应用并极大地推动了临床医学的研究和发展。  与此同时,分子诊断与治疗作为检验医学与临床医学研究和应用的一个专业领域,也有了长足的发展。分子诊断与分子治疗已经作为独立的学科正式登上医学科学的历史舞台。  什么是分子诊断?  分子诊断(molecular diagnosis)狭义上是指基于核酸的诊断(nucleic acid-based diagnosis),即对各种DNA和/或RNA样本的病原性突变的检测以便实现对疾病的检测和诊断。  随着第一张人类基因组测序图以及随后的其他生物基因组测序图的发表,分子诊断学已进入了一个有着空前机会和挑战的新时代。  而在后基因组时代,随着蛋白质组学研究的实施,功能基因组及其相关的表达产物与疾病联系的谜团被破解,分子诊断又赋予了新的外延:分子诊断的对象包括基因及其相关的表达产物:生物大分子。  在广义上包括基因治疗和生物治疗以及针对某些信号转导分子的分子靶向治疗。在过去的几十年里,在治疗包括某些遗传性免疫缺陷尤其是肿瘤性疾病方面显示了独特的效果。    分子诊断在大健康产业链中的位置  蛋白质组学的发展,成为分子诊断的一个必不可少的工具。比如,与癌变相关的DNA、RNA、蛋白质、染色体以及细胞变化谱等将会逐渐被人们所认识,将会出现与肿瘤发生、发展相关的基因突变谱、基因甲基化谱、基因多肽谱、基因表达谱、体液蛋白质(或其他化学成分谱)、染色体谱以及细胞和组织器官的分子影像谱图等。这些变化谱将会成为肿瘤标志谱,更准确地用于指导肿瘤的预防、诊断和治疗。  分子诊断是当前的一种临床实际  从Kan及其同事首次应用DNA杂交实现&alpha -地中海贫血的产前诊断,到Saiki发明PCR技术特别是实时荧光定量PCR的应用,再到高通量自动化的生物芯片技术以及变性高效液相层析、SNP分析等技术的应用   从利用分子杂交、PCR等单一技术和定性诊断发展到多项技术的联合应用和半定量、定量和多基因病分子诊断,再到基因表达产物的生物大分子的诊断   从治疗性诊断,发展到针对高危人群进行疾病基因或疾病相关基因的筛查和预防性分析评价。  分子诊断正处于学科发展的黄金时代  随着分子生物学理论和技术的继续发展,分子诊断还将出现更加辉煌的明天。  与此同时,分子治疗(molecular therapy)的发展则得益于DNA体外重组技术和淋巴细胞杂交瘤两大技术的问世。基因治疗作为一项全新的疾病治疗手段,近20年来发展迅速,人类基因组计划的实施和人类全部染色体的解密,不仅使人类更加清楚地了解自身,而且为基因诊断和基因治疗的研究奠定了基础。基因扩增技术,基因修饰技术,基因克隆技术,基因芯片技术,基因治疗技术,以及新型表达载体等新技术新方法的不断涌现促进了分子治疗学科的发展。  随着对肿瘤发生发展分子机制的深入研究,包括基因治疗在内的生物治疗已经成为肿瘤综合治疗中的第四种模式。生物治疗是以现代分子生物学、细胞生物学和分子免疫学等前沿科学为基础,强调肿瘤发生发展和转归的分子基础和治疗的针对性、特异性(靶向性)和有效性,针对CD分子、膜受体信号传导、基因转导、血管形成等靶位,设计相应药物(单抗或小分子等)、病毒或细胞,用于肿瘤的防治。针对CD分子、膜受体信号传导、基因转导、血管形成等靶位,目前应用比较广泛的是细胞因子治疗、酪氨酸激酶受体的分子靶向治疗、单克隆抗体标记放射性核素治疗。  肿瘤生物化疗(biochemotherapy)是生物治疗和化学治疗联合应用于肿瘤治疗的全新综合治疗模式,是根据肿瘤的病理类型、临床分期、发生部位和发展趋势,结合病人的全身情况和分子生物学行为,有计划地联合应用化疗药物和生物制剂进行治疗。  基因治疗在肿瘤治疗中有着广泛的前景。将外源目的基因导入人体靶细胞或组织以取代有缺陷的基因,通过其正常表达,以达到防治肿瘤的目的。肿瘤基因治疗基本策略主要有以下几种方式:基因替代、基因修饰、基因添加、基因补充、基因封闭等。根据功能基因导入方式不同分为体内基因治疗和体外基因治疗。常用病毒作为运送基因的载体,目前已有基因转导P53(如AV-P53)、基 因转导的DC(如AAV-BA46-DC)、基因转导的TIL(IL-2、TNF-&alpha )等用于各期临床研究。  RNA干扰技术也是基因治疗的重大突破。通过向体内注入微小RNA片段,会干扰生物体本身的RNA&ldquo 信使&rdquo 功能,导致相应蛋白质无法合成,从而&ldquo 关闭&rdquo 特定基因,采用RNA干扰技术直接从源头上使致病基因&ldquo 沉默&rdquo ,因此能更有效地治疗某些疾病。  正是当代一系列科学技术的成就,使得分子诊断与分子治疗学科不断发展与进步,而分子诊断与分子治疗则是当代医学发展的必然。  中国分子诊断市场前景广阔,增速为全球两倍  分子诊断市场是近年来临床诊断领域发展的热点,全球分子诊断市场发展速度达到10%以上,而中国分子诊断市场每年增速超过20%,为全球的两倍,为技术创新和应用带来了许多发展机会。  目前,分子诊断产品的应用在临床各科如肿瘤、感染、遗传等占到70%以上,其次是体检中心、技术服务中心、第三方检测机构及微生物快速检测市场等方面。  中国工程院院士、中国医学科学院副院长詹启敏教授称,&ldquo 国内从政府层面的医疗管理到科技创新领域都非常重视分子诊断技术的应用和普及。&rdquo 传统医学的发展在包括诊断治疗手段、提升有效诊断率、进行有效的预防、疾病预警以及降低发病率等方面都遇到瓶颈,亟待打破。  &ldquo 要做好转化医学,做好个性化治疗,就要把重点放在预防预测,不要等到疾病发展到中晚期才做,这是引导疾病治疗关口前移。同时,还要重心下移,把工作重点放到农村和社区,这几个方面的工作都需要有很好的手段和技术平台来支撑,而分子诊断在这些环节里扮演了非常重要的角色。&rdquo 詹启敏院士强调。  从国家战略层面看,国务院新列出的七个战略新兴产业,生物医药就是其中一块,在这个产业里面,分子诊断又是非常重要的内容。  据介绍,从&ldquo 十一五&rdquo 开始,国家自然科学基金有寻找疾病发生发展过程中的一些分子靶标研究 国家973重大项目中,结合高发疾病进行的临床研究,为分子诊断提供了创新性的成果。863计划则着重于分子诊断成果的应用到临床的一些技术,把分子诊断结合疾病的预防以及个性化治疗作为很重要的发展内容。此外,还有国家卫生与计划生育委员会的行业基金、国家重大专项等运用性和推广性计划,很多内容都和分子诊断的技术创新相关。  詹启敏院士认为,豪洛捷是国际领先的分子诊断技术平台研发生产企业,而苏州科贝生物专注于分子诊断技术平台的搭建,承担了多项国家级科研课题,如国家863项目等,拥有自主知识产权。双方的合作,不仅能够引进国际最先进的分子诊断技术,同时,在国内的推广应用上将更加利于本土化。  使用标准将在近期出台  来自国家卫生与计划生育委员会临床检验中心副主任李金明告诉科技日报记者,百姓在医疗机构看病时,医生都会对病人先进行若干的检查,为临床评估患者疾病风险及确诊提供重要的信息,有助于医师判定既定患者的治疗方案或护理的适用度,也是医保的重要组成部分。  以前分子诊断主要是针对传染病的检测,而现在随着个性化技术的发展,拓展的领域涉及到病理科、药剂科还有相关的研究科室,如内科,外科,妇产科等等。李金明副主任表示,国内主管机构正在对临床分子诊断的规范化起草指导原则和指南,希望以明确的管理办法和规则,推进市场的有序发展。分子诊断技术平台的使用标准也将在近期出台。  跨国合作看好本土化应用  此次豪洛捷与苏州科贝生物的战略合作被普遍看好。詹启敏院士认为,无论是主管部门还是专家,都乐于见到并支持这一国际化合作,相信双方能找到较好的模式,以产生更为积极的效果。李金明副主任希望通过国际先进平台的引进,促使国内相关的技术标准能够与国际接轨。  豪洛捷公司副总裁刘釜均告诉科技日报记者,豪洛捷是一家提供医疗仪器和检测系统的上市公司,市值在57亿美元,其分子诊断核心技术曾荣获了2004年美国国家技术奖。公司的产品重点主要在于疾病诊断,血液筛查,并确保移植兼容性,以通过早期检查筛查,提高早期诊断和微创治疗水平,达到及时挽救生命的目标。  一家跨国企业要想更好地为中国的医疗市场服务,就一定要接地气,真正了解这个市场,了解政策法规,包括市场运作,做到一个强强联合的经典模式。&ldquo 我们最终决定和科贝生物联合是经过慎重考虑的,原因有两个。一是科贝生物背靠北京的国家级研发机构,可以极大地缩短从科研到商业应用的周期。其二,科贝生物拥有独立的第三方检测资质,其商业运作也非常完善,在医院和医疗系统也具有强大的资源,&rdquo 刘釜均说。他希望豪洛捷以先进的分子诊断自动化平台和科贝生物共同进行新的本土化应用开发,把中国的分子诊断事业推向一个新的高峰。  苏州科贝生物总裁姬云认为,该项目是&ldquo 并驾齐驱&rdquo 商业合作模式的一种尝试。一方面是可进行具有自主知识产权产品的研发,另外则要加强国际合作,更快地把国外已经成熟的技术平台、仪器设备和成果向国内进行推广。  他说,&ldquo 科学研究没有国界。我们在医药方面的总体水平目前离欧美等发达国家还有一定差距。但是,中国是临床需求大国,目前正在向强国迈进,科贝生物非常熟悉国内医院和公众对分子诊断技术的需求,双方的合作将不仅是各自公司的发展,更多的将把医疗的新成果普惠于广大老百姓和患者。而引进更为先进技术,求得共同发展,更是我们长期的发展目标。&rdquo   国际巨头公司与国内领先企业的合作,将促成国内分子诊断行业接足地气、强化本土化应用,广泛普及和推广这一新兴科技。
  • 1583万!南京农业大学国家大豆生物育种产教融合创新平台分子育种仪器设备(第6批)采购项目
    一、项目基本情况项目编号:ZF20240037(采购代理机构内部编号:1678-244101004TH)项目名称:南京农业大学国家大豆生物育种产教融合创新平台分子育种仪器设备购置(第6批)预算金额:1583.850000 万元(人民币)采购需求:(1)标的清单包号品目号标的名称数量预算金额(人民币/万元)是否接受进口货物投标11-1核酸提取建库工作站1台160是1-2全自动核酸提取仪1台60是1-3核酸样品制备系统1台50是小计27022-1热循环仪1台20.85否2-2化学发光成像仪1台28是2-3全自动凯氏定氮仪3台75否2-4超微量分光光度计3台45是小计168.8533-1微型无人机载高光谱成像仪3套210是3-2全波段机载高光谱成像仪1套350是小计56044-1无人机激光雷达系统3套255否4-2机载高光谱相机3套135否小计39055-1DNA微波消解仪(1)1套45是5-2DNA微波消解仪(2)2套90是5-3全自动密度梯度制备与分离分析系统1套60是小计195(2)简要技术需求:上述清单中标的的技术需求详见招标文件第三部分(3)本项目共分为5个包,投标人可根据各自产品的特性,以包为单位部分或全部投标。(4)本文件所称进口货物是指通过中国海关报关验放进入中国境内且产自关境外的产品。合同履行期限:收到采购人通知后120天内交货。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2024年03月08日 至 2024年03月14日,每天上午9:00至11:30,下午13:30至17:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:南京市玄武区北京东路22号和平大厦1810室方式:以汇款方式购买招标文件,须购买单位以公对公形式办理汇款(汇款附言:采购代理机构内部编号_包号(如有)_招标文件费),并将汇款凭证发送至采购代理机构邮箱。 邮箱地址:jshtzb18@sina.com 邮件标题:购买单位名称_采购代理机构内部编号_包号(如有) 邮件正文:请明确拟购买文件的项目名称、项目编号、采购代理机构内部编号、包号(如有)、购买单位名称、联系人和联系方式、开票信息、付款截图(直接贴图在正文,不要采用附件)、邮寄地址等信息。 购买招标文件汇款地址: (1)开户名:江苏汉唐国际贸易集团有限公司 (2)开户行:上海浦东发展银行南京莫愁支行(行号:310301000153) 账号:93160 15474 000 1152售价:¥600.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:南京农业大学     地址:南京市玄武区卫岗1号        联系方式:陆老师025-84399008      2.采购代理机构信息名 称:江苏汉唐国际贸易集团有限公司            地 址:南京市玄武区北京东路22号和平大厦1810室            联系方式:王梦珂、徐琳025-86970301            3.项目联系方式项目联系人:王梦珂、徐琳电 话:  025-86970301
  • 托普云农数字助农,蔬菜产业大数据平台让威宁蔬菜产销省力又省心
    农家少闲月,五月人倍忙。随着大地回暖,广袤田野颜色日渐丰富,农耕由南向北陆续展开,在贵州的威宁自治县也不例外,新一轮的蔬菜种植提上日程。“现在种菜啊,可方便了,不用一天跑好几趟地,手机上点一点就能看到地里的情况,菜虫、菜苗都能看。”种植户老李说道。 产业发展,惠农兴农。一直以来,威宁坚持以农业增效、农民增收为中心,利用当地高海拔优势,大力发展高山冷凉蔬菜种植,全力以赴做强蔬菜产业,让蔬菜产业成为助农增收致富、助力乡村振兴的优势产业。近年来更是积极探索物联网、大数据等信息技术与蔬菜产业的融合发展,围绕种植、采收、加工、储存、销售等整个产业链的关键环节,健全基地生产过程档案管理,实现对关键节点的实时监管,提高基地生产效率,降低生产和管理成本,力争建成全省县级蔬菜产业大数据示范基地,为其他地区蔬菜产业发展提供可复制的模式与经验。 作为技术支撑单位,浙江托普云农科技股份有限公司为其搭建了一个蔬菜产业大数据平台,从政府监管和基地生产两端入手实现蔬菜种植科学化、产销服务精jing准化、市场管理透明高效化。 1部智能机,基地生产全掌握 在基地现有设施的基础上,托普云农应用大田智能监控系统、温室大棚监测控制系统以及基地绿色防控系统,对威宁县蔬菜产业的虫情、病情、墒情、苗情/灾情进行实时监测和控制。“你们看,现在在家里我就可以看到我那些大棚里的土壤、环境、光照这些数据,连菜长得怎么样都能看到呢,还可以自主调控大棚温湿度、遮阳、卷被… … ”老李笑着向我们展示。 通过对产地环境、投入品使用、农事生产过程控制、仓储销售、溯源查询等产销过程中的关键控制点进行管控,实现对产品追溯编码和准成确认,有力规范种植主体生产经营活动,实现农产品“来源可追溯、流向可追踪、责任可追究”。 1块数字屏,产销对接更统一 为充分发挥大数据作用,利用大数据服务农业生产,助力扶贫攻坚,促进农业供给侧结构性改革和绿色优质农产品打造。托普云农在威宁县蔬菜产业大数据平台上建立了电子化的质量检测档案,对将要上市销售的蔬菜进行质量检测,避免问题蔬菜上市销售。同时,为公众提供追溯统一查询入口,快捷实时查询农产品的追溯信息,消费者通过扫描二维码就可查询到蔬菜产地信息、生长档案、质量检测等信息。 通过对主体、生产、质检、仓储基础数据的集中管理,搭建统一的内外追溯平台,实现政府监管的智能化、可视化,提升政府科学决策和风险预警能力。 蔬菜产业大数据平台的建设,不仅丰富了消费者的“菜篮子”,还鼓起了当地群众的“钱袋子”,成为助力威宁在乡村振兴上开新局的“绿色引擎”。2021年,威宁蔬菜种植面积稳定在40万亩以上,其中以县城周围9个乡镇打造高标准的7万亩核心基地,品种以‘三白’蔬菜为主,还有西蓝花、辣椒、香葱、菜心等40余个品种,年产量在250万吨左右,年产值40亿元左右。”威宁自治县蔬菜产业发展中心主任谢洪说。转眼间,又是一年初夏农忙时节,当地蔬菜种植户们脸上洋溢着新的期盼。
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