生物质谱暨蛋白质组数据处理学术交流会

仪器简介：作为全球最大的实验室过滤及超滤产品供应商，Millipore 可为您提供l. 0.5mL至1000L处理量的实验室除菌过滤装置，可用于血 清、组织培养基及其他溶液的除菌过滤。高通量，低吸附的除菌滤膜，使蛋白质损失最少。可选择即用式过滤器或可更换膜的过滤装置。2. 0.5mL至3000mL处理量的实验室超滤装置，用于蛋白质，核酸的分离、纯化、浓缩和脱盐，专利 的结构设计和新型的超滤膜，使超滤速度更快，产物回收率更高。单片超滤膜和膜包可清洗并反复使用。3. 高通量纯化系统，特别适合大规模样品纯化实验室的应用，可快速有效地同时处理多达96个样品，大大减轻了实验室的负担。主要产品包括：* Amicon 系列超滤离心装置： 浓缩，脱盐一部到位,* DNA Extraction Kit： 从琼脂糖凝胶中回收DNA,只需10分钟即可回收100bp-10,000kb DNA* Micropure -EZ：从DNA中去除常用的42种限制性内切酶，可与Amicon超滤离心装置连用，一步离心即可完成去酶，浓缩及脱盐。* Immobilon 系列转印膜： Ny+ 用于Southern和Northern Blotting PVDF 用于Western Blotting* ZipTip 微量固相萃取吸嘴：只需数秒即可纯化fmol至pmol的蛋白质样品，提高质谱分析的灵敏度* Montage Plasmid kit:用于质粒DNA纯化2 Montage BAC kit:用于BAC DNA纯化2 Montage SEQ kit:用于测序反应后PCR纯化* Montage In-Gel Digest Kit: 同时处理96个1-D或2-D胶中的蛋白质样品* Millex GP33: 超大面积，超高流速的针头式除菌过滤器。技术参数：1.96孔PCR 纯化板---纯化96个样品只需10分钟2.无须离心，只需真空抽干3.不需要使用任何有机试剂及任何盐溶液，也无须洗涤步骤4.纯化后的PCR样品回收率90%（500bp以上）5.纯化后的DNA纯度极佳--Primer的去除率98%主要特点：1.Albumin Deplete Kit--有效去除人血清中65%以上的白蛋2.预装好亲和层析小柱，只需15分钟离心，洗脱操作3.非特异性蛋白吸附极低4.提高低峰度蛋白质在电泳，层析及质谱分析中的解析度5.此Kit同样可适合于其他多种哺乳动物

蛋白组学样本前处理工作站是一款具备高通量、高回收率、安全性能强、抗干扰能力强，适用范围广等优势，适用大队列样本的高通量处理设备，可实现质谱蛋白样本前处理的全自动化和标准化操作。蛋白组学样本前处理解决方案适用于血浆、血清、尿液、细胞、组织等类型样本从蛋白到多肽混合物的质谱检测前处理工作，试剂盒利用新型固相烷基化试剂SPA材料与蛋白的特异性共价反应，实现蛋白质的高效捕获，通过清洗磁珠表面，快速去除干扰物质，并进行原位固相酶解，获得蛋白酶解产物，仪器整合制冷模块、磁吸附模块、加热振荡模块、抓扳手，进而实现蛋白质组提取、还原、烷基化、酶解等流程自动化操作，提高蛋白质样品的处理效率和回收率。 优势特点高通量■96通道移液头，一次可处理最多96个样本，高效完成实验流程中吸废等步骤；■兼具8通道移液功能，可以实现试剂的精准分装；■ 全流程4-5小时可完成96个蛋白样本的前处理（具体时间根据具体实验流程）；自动化程度高■ 整合抓板手，用于对标准SBS板子的转移；■ 整合蛋白前处理所需的试剂制冷模块、磁吸附模块、加热振荡模块等功能模块；■均一化操作，减少实验过程中的误差，提高准确性和稳定性；灵活性强■ 盘面包含18个SBS标准盘位，除功能模块外，有15个盘位放置试剂和耗材；■开放式平台，配有多样化适配器，可适配多种不同品牌试剂耗材；■软件界面人性化设计，拖拽式布局，操作简单，每个步骤可独立进行参数设置，实验流程可进行存储，按键式启动运行；安全性■可配置避光外罩，搭配紫外消毒灯；■可根据实验需求选配正、负压HEPA过滤系统，有效避免交叉污染； 数据测试样本批内测试数据材料：293T 细胞实验方法：手工操作3 组，仪器操作3 组Q Exactive质谱结果如下：表1：手工操作和仪器操作后蛋白数及零漏切率对比图1 Venn diagram（蓝色：手工；绿色：仪器）试验总结手工操作和仪器操作蛋白样本预处理后可检测到的蛋白数及零漏切率基本一致，达到预期要求；手工操作与仪器操作蛋白种类皮尔斯相关系数大于0.97，与预期一致；样本批间测试数据图2 96孔板检测示意图如图2所示共处理96个样品，分三组进行实验，随机选取36个样品进行Q Exactive质谱检测，结果如下：图3 36个样本检测蛋白数（个）图4 36个样本零漏切率（%）图5 随机样品日间比较实验总结36个随机样本检测蛋白数3074±89个，零漏切率78.32±2.66%，样本预处理的结果正常且稳定；36个样品的皮尔斯相关系数及日间随机样品皮尔斯相关系数均介于0.955-0.989之间，达到指标要求，具有较好的均一性。 应用领域临床诊断/用药指导/病理机制研究/疾病标志物的发现/药物机理研究特别说明，此页面中所有展示的图片和信息仅供参考。

timsTOF fleX 实现 MALDI 引导的空间定位组学高灵敏度：timsTOF fleX 空间定位组学方案，结合特征区域 MALDI 成像和 PASEF 组学分析，能从有限样本中获得高鉴定率。空间分辨率：高空间分辨率的 MALDI 源和平台机械设计获得分子分布图，增加组学空间维度信息。多功能：双离子源设计使您在同一个质谱平台上完成分子空间分布和 ESI 多组学鉴定。microGRID -- 精准、可靠的硬件升级，使高空间分辨成像实验唾手可得实现高空间分辨的成像实验并不是一件容易的工作。布鲁克推出了全新 microGRID 技术 -- 整合了 MALDI 机械平台和 smartbeam 3D 激光器的光束定位系统，进一步提升了质谱成像实验的图像质量，可获得 5 μm 的超高空间分辨率。microGRID 是一款适用于所有 timsTOF fleX 系列质谱仪的选配功能模块，将它整合进布鲁克现有的质谱成像工作流程中，展现出了突破极限的超高空间分辨率。该技术与布鲁克的自动一体化的成像数据采集流程 SCiLS™ autopilot 无缝衔接，使它不仅适用于成像专家，也同样适用于新购入成像仪器的用户及常规的成像数据采集应用。该技术与布鲁克的 SCiLS™ Lab 软件配合使用，可实现对于高分辨成像数据的深度挖掘。从 4D-组学到分子成像的无折中解决方案双离子源设计将无标记分子定位与 PASEF LC-MS/MS 鉴定匹配，解析生物样本的分子变化。 建立在 shotgun 蛋白组学标准上的 timsTOF fleX 将布鲁克一流的 4D-组学分析与尖端的 MALDI 成像技术整合于一个平台，包括高频率的 smartbeam 3D 激光器。配置有双离子源的 timsTOF fleX，把持久稳定的 ESI 分析和组织分子空间分布集成于一体，是进行空间定位组学研究的理想平台。在此之前，没有质谱仪能为组学研究者同时提供这两种能力。 ESI 和 MALDI 的切换操作，只需在软件中开启 smartbeam 3D 激光源，仅需几秒即可完成。简单的切换操作意味着从组学深度鉴定和定量流程到组织高清成像的方便转换，又不影响效率和功能，从而发现真正有用的信息。增加 MALDI 成像新维度，挖掘更多信息由 MALDI 和 ESI 产生的离子，经过同一路径从离子源到达探测器，因此 MALDI 工作流程可以利用 timsTOF HT 的主要优势，包括根据分子碰撞截面 ( CCS ) 来进行捕集离子淌度分离（ trapped ion mobility separation，TIMS ）。调谐和校准可在 ESI 模式下进行，并用于 MALDI 模式，方便了仪器的优化。TIMS 允许根据离子形状分离分子。离子与气流一起进入双 TIMS 装置，在第一个TIMS 分析器通过电场进行累积。实际分离发生在第二个 TIMS 分离器。通过降低电位以时间和空间的方式释放离子。可变扫描速度和淌度范围适应性可对不同种类分子优化，为用户带来更多灵活性。为组学增加空间维度信息将特征区域 MALDI 成像和深度多组学分析结合现在变得容易可行。MALDI 成像适用于类型广泛的分析物，包括代谢物、脂类或聚糖，并与显微工作流程无缝衔接。针对空间定位组学，MALDI 成像可识别特征区域化合物分布。timsTOF fleX 采用双离子源设计，与可靠的高品质消耗品和用户友好软件一起使用，方便了研究工作，节省了研究人员的时间。使用布鲁克 IntelliSlides™ 预制玻片，使 MALDI 成像和空间定位组学流程在 timsTOF fleX 上完全自动化。分离相近质量或同分异构体离子捕集离子淌度谱（ TIMS ）有助于复杂样品（ 如组织切片 ）的分析。通过分离近质量或同分异构的代谢物、脂质、肽段或糖苷，以获得分析物的真实空间定位。高质量分辨率无助于这些问题的解决，timsTOF fleX 提供了唯一的机会来区分同分异构体的分布。碰撞横截面（ CCS ）是 TIMS 给出的测量结果，提供了从另一角度来验证质谱分析结果。CCS 关联软件智能地将空间 MALDI-TIMS 成像数据与多组学结果相匹配，并使鉴定结果与重要的形态学内容相关联。从色谱分离技术到在像素点的原位分析，一切变得触手可得 … … timsTOF fleX 是一台多功能的质谱仪，用于测量样品的分子情况。timsTOF fleX 建立在布鲁克开创性 timsTOF HT 平台上，功能齐全、速度快、灵敏度高的 ESI 质谱，可用于所有 多组学分析。结合了高空间分辨率的 MALDI 源和平台机械专业设计，用于解析分子分布和带来组学分析的空间维度。将蛋白质组学分析转换为空间蛋白质组学，将脂质组学转换为空间脂质组学，将代谢组学转换为空间代谢组学，并获取数据的组织学背景。与其它学科相结合，从你的分析数据中获取更多信息以达到科研目标。为质谱成像初学者量身打造的自动一体化成像数据采集流程 SCiLS™ autopilot我们提供 “ 购入即用 ” 的成像耗材和软件产品，帮您迅速采集数据，并随后挖掘出组织的分子表型信息。我们推出了基于 IntelliSlides 预制载玻片的自动一体化成像数据采集流程，不仅大大减少了对用户输入的操作要求，还能确保所采集数据的高品质和可重现性。我司还推出了预制的 fleXmatrix 基质，高品质的基质可以保证实验效果并简化基质施加过程。作为质谱成像数据处理的 “ 行业金标准 ”，SCiLS™ Lab 软件可以实现原始数据的可视化以及后续的数据统计分析操作。此外，SCiLS™ Lab 可以与 MetaboScape 软件联用，实现了通过数据库检索信息或 LC/MS 实验结果直接对高分辨的 MALDI 成像热图进行快速分子注释的功能。将这种联用机制应用于空间定位组学工作流程中，可实现生物背景信息与整体组学或单细胞组学信息的有效整合。多组学性能和高灵敏度 MALDI 的结合timsTOF fleX 实现 SpatialOMx无论蛋白组学、脂质组学、糖组学还是代谢组学，timsTOF fleX 都是空间定位组学分析的理想平台。使用专利的smartbeam 3D 技术进行快速、无标记的 MALDI 成像，以绘制样品的分子分布图，并鉴定感兴趣的区域，对它们进一步深入分析。由 PASEF 技术支持的 LC-MS/MS 分析可以进行最高水平的鉴定并得到最可靠的结果。肿瘤远比看到的还复杂癌症的微环境是由健康细胞、肿瘤细胞、结缔组织、血管和炎症在不同时间点以不同的比例组合而成。每一种成分都有其独特的化合物分子标记。研究人员对疾病状态的判断在很大程度上依赖于组织病理学的解释，并在生物分子的背景下创建这些图谱，从而在传统的组学和理解疾病之间架起了桥梁。CCS 关联空间多组学发现差异癌细胞和其它疾病状态具有显著的遗传和表观遗传修饰，影响基因组表达层次。无论你观察的是蛋白质组、脂质组还是代谢组，化合物的空间分布都包含了有价值的解释信息。要了解复杂的样品，除了质量和电荷外，还需要有 timsTOF fleX 的离子淌度功能提供无与伦比的分析深度。近质量干扰可被区分，同分异构体可被分离。这有助于组织中近质量脂质的准确定位。原位 MS/MS 以及 PASEF 技术支持的 4D 多组学研究方案使您能够识别更多感兴趣的分析物。SpatialOMx 的自动分子注释工作流程布鲁克的业界领先的应用软件，现在可以直接对组织中的目标分子注释。只需将数据导入到 SCiLS™ Lab 软件，定义感兴趣的区域，并将峰列表数据导出到 MetaboScape。使用 LC-MS/MS 建立的数据库或成分列表对各个峰进行注释，然后导出注释表并送回到 SCiLS™ Lab 进行可视化。从 SCiLS™ Lab 软件中，可以使用通路和熟悉的命名法而不是分子量可视化实验结果，从而缩短从数据到最终结果的时间。