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质谱肽段分析

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质谱肽段分析相关的资讯

  • 基于超高效液相色谱-质谱法的肽段分析中非特异性吸附评估及通用型最小化策略
    近年来,蛋白质组学技术在肽和蛋白质类新型治疗药物的蓬勃发展以及临床新型大分子生物标志物的深入发掘中被日益广泛应用。应用方式的迭代对生物大分子的分析技术提出了更高的要求。基于蛋白质特征肽段检测的自下而上的蛋白质组学技术(bottom up proteomics)是现有研究中具有较高灵敏度与分辨率的蛋白质定性定量方法。开发多肽的生物分析方法是极具挑战的,除了所需的低检出限外,多肽的非特异性吸附性质,使其极易在接触到的材料表面发生吸附,进而导致分析全流程中待测物的丢失或干扰,给定性和定量分析引入巨大风险。例如在蛋白组学研究的质谱数据库搜索中,即使系统中微量肽段的损失或残留亦可能导致假阳性或假阴性结果。而在高灵敏度的多肽定量方法的开发中,肽段的非特异吸附对定量分析的线性、准确度和精密度均有负面影响。低浓度肽段溶液的吸附性质会更加明显,表现形式为标准曲线的非线性,最终导致定量限的不必要升高以及方法的重复性差。已有一些研究在分子水平上解释这种吸附行为,然而目前对其潜在的机制和相互作用仍然知之甚少。Eeltink等基于分子动力学模拟,提出了一种三相分子机制解释肽段从溶液吸附到强相互作用不带电固定相上的原理。Kristensen等研究了样品容器对阳离子多肽吸附的影响,当1 μmoL/L肽溶液在硼硅酸盐或聚丙烯瓶中存储1 h后,肽段的回收率仅有10%~20%。也有研究通过在溶剂中添加有机试剂、酸/碱性溶液、表面活性剂、吸附竞争剂或调整流动相组成等方法减少这类吸附。这些研究论文大多对一组特定的多肽和/或表面材料进行研究,但均未给出可用来预测多肽吸附特性的规律,也未给出通用的解决吸附的方法。本研究选择牛血清白蛋白(BSA)作为模型蛋白质,以其酶解后的肽段作为包含亲水性和疏水性多肽的“典型”多肽组样本。首先通过超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)的测定,分析常见多肽理化参数与上述多肽组的非特异吸附程度的关联性。然后基于超高效液相色谱-三重四极杆质谱(UPLC-QQQ-MS/MS)建立对强吸附肽段吸附程度的评估方法,从样品制备至分析测定建立全过程试验设计,考察不同材质的制备、储存耗材对肽段吸附的影响,以及考察不同色谱条件对肽段残留的影响,最终提出多肽全流程分析中减少非特异性吸附的通用型策略。01样品制备方法取10 mg BSA溶于10 mL水中,制得1 mg/mL蛋白储备液,进一步以水稀释为100 μg/mL的工作液。取200 μL上述工作液于蛋白质低吸附离心管中 加入65 μL 500 mmol/L碳酸氢铵和60 μL 50 mmol/L二硫苏糖醇,于60 ℃水浴加热60 min对蛋白质进行还原 放冷至室温后加入120 μL 50 mmol/L碘代乙酰胺,于暗处反应30 min进行烷基化 加入100 μg/mL的胰蛋白酶5 μL,于37 ℃水浴中酶解8 h,加入甲酸20 μL终止反应,12000 g离心15 min后,取200 μL上清置于蛋白质低吸附的进样瓶中作为混合肽段溶液待测。02超高效液相色谱-高分辨质谱方法参数色谱条件:色谱柱采用Waters Acquity Premier Peptide CSH C18(100 mm×2.1 mm, 1.7 μm) 柱温为40 ℃ 流速为0.25 mL/min 流动相A、B两相分别为0.1%甲酸水溶液和0.1%甲酸乙腈溶液。洗脱梯度为0~1 min, 1%B 1~13 min, 1%B~40%B 13~13.1 min, 40%B~90%B 13.1~16 min, 90%B 16~16.1 min, 90%B~1%B 16.1~20 min, 1%B。进样器温度10 ℃ 进样量5 μL。质谱条件:毛细管电压3 kV,锥孔电压30 V,离子源温度120 ℃,脱溶剂气温度450 ℃,锥孔气流速25 L/h,脱溶剂气流速800 L/h。电喷雾电离(ESI)源、正离子模式下测定,MSE模式采集,扫描范围m/z 50~2000 数据采集时使用亮氨酸脑啡肽校正液进行实时质量校正,以保证采集质量数的准确性与重复性。采集后的数据使用Unifi软件处理。03相对残留量的测定和肽段分级策略将上述混合肽段溶液经上述条件采集、Unifi软件分析后,可得BSA酶解后肽段组的实际肽段组成和每个肽段的响应值Area(供试品溶液)。在进样上述供试品溶液后连续进样3针空白溶剂,以3针空白溶剂中检测到的对应肽段响应之和Area(Blank 1+Blank 2+Blank 3)计为该肽段的残留总量,该肽段的相对残留量为肽段的残留总量与肽段响应值的比值。基于肽段的响应与相对残留量,可将BSA酶解后的肽段组分为如下四类:Class Ⅰ,响应高且无残留的肽段 Class Ⅱ,响应高但有残留的肽段 Class Ⅲ、Class Ⅳ分别为响应低,无吸附和有吸附的肽段。响应的高低以是否大于中位数计,有无残留以Area(Blank 1+Blank 2+Blank 3)是否有检出判断。04超高效液相色谱-三重四极杆质谱方法参数色谱条件:色谱柱采用Waters ACQUITY UPLC BEH C8(100 mm×2.1 mm, 1.7 μm) 柱温30 ℃ 流速0.4 mL/min 流动相A、B两相分别为0.2%甲酸水溶液和0.2%甲酸乙腈溶液。洗脱梯度为0~2 min, 2%B 2~5 min, 2%B~60%B 5~5.1 min, 60%B~90%B 5.1~8 min, 90%B 8~8.1 min, 90%B~2%B 8.1~11 min, 2%B。进样器温度10 ℃ 进样量5 μL。洗针液为90%乙腈水溶液(含0.2%甲酸)。质谱条件:离子化电压5500 V 气帘气压力0.14 MPa 离子源温度500 ℃ 喷雾气、辅助加热气压力0.38 MPa。ESI源正离子模式下测定,多反应监测(MRM)模式采集,12条Class Ⅱ类肽段的离子对、碰撞能量(CE)、去簇电压(DP)值经Skyline软件协助优化后结果如原文表1所示。文章信息色谱, 2022, 40(7): 616-624 DOI: 10.3724/SP.J.1123.2021.12012张莹1,2, 杨静1,2, 马跃新1,2, 曹玲2*, 黄青2*1.南京中医药大学药学院, 江苏 南京 2100232.江苏省食品药品监督检验研究院, 国家药品监督管理局化学药杂质谱研究重点实验室, 江苏 南京 210019
  • 激活您云端的超高分辨质谱分析服务及培训
    激活您云端的超高分辨质谱分析服务及培训 “蛋白质药物质谱分析培训班”由北京亦庄生物医药园公共技术服务平台主办,赛默飞世尔科技有限公司协办。北京亦庄生物医药园公共技术服务平台基于赛默飞 Q Exactive Orbitrap的超高分辨质谱平台将于2014年8月正式投入运营,该平台将为北京乃至全国生物制药企业提供蛋白质药物质谱分析服务。为使超高分辨质谱平台的服务更具效率,平台将推出“云质谱”模式,并且于2014年8月-11月举办“蛋白质药物质谱分析培训班”,为质谱使用者提供理论知识学习和上机实践的机会。 目前国内的质谱分析服务普遍模式是:客户提供原始样品,服务方给出最终报告。亦庄生物医药园超高分辨质谱平台不但提供此类服务,更进一步推出了“云质谱”模式。“云质谱”服务形式为:用户提供处理后样品,服务方出具原始质谱数据,客户自行分析质谱数据 目前很多用户缺乏使用超高分辨质谱的经验,尤其是数据分析的能力不足,为减少用户使用超高分辨质谱的技术障碍,使平台发挥最大的效能,平台将举办“蛋白质药物质谱分析培训班”。该培训班作为“云质谱”模式的启动按钮:课程将贯穿样品处理、质谱采集、数据分析全过程。培训重点为样品处理与数据分析,相关内容如下: 主要内容:单克隆抗体结构分析、ADC药物分析、肽指纹图谱解析及蛋白药物的修饰、二硫键和寡糖的分析。延伸内容:残留细胞蛋白鉴定、蛋白代谢分析、未知肽段测序等。讲师聘请:聘请的讲师具有10年以上大分子质谱应用经验。教材编写:为本课程专门编写国内唯一的蛋白质药物分析中文教程。授课方式:小班授课(不超过15人),人人上手操作。 “蛋白质药物质谱分析培训班” 现已启动报名(由于名额有限,目前优先亦庄地区企业,8月8日之前报名或一次性选择三阶段课程可享受8折优惠),费用及课程安排请点击网址了解详细:http://www.etownbio.com/AdviceCentre/Technicalexchanges/2014/0717/100.html 电话咨询:徐女士:400-808-5631/010-56315257/13301051769牛博士:010-56315258/13810097007 (pFind、pNovo、pLinks为中国科学院计算技术研究所pFind团队版权所有系列软件,特授权使用。在此对pFind团队表示感谢!)
  • 使用超高效合相色谱分析短杆菌肽
    使用超高效合相色谱(UPC2)分析短杆菌肽 Sean M. McCarthy, Andrew J. Aubin, 和 Michael D. Jones 沃特世公司(美国马萨诸塞州米尔福德) 应用效益 ■ 快速分离短杆菌肽 ■ 载量线性响应 ■ 准确、高精度分析短杆菌肽的方法 ■ 有可能用于其它疏水性肽和蛋白质 沃特世解决方案 ACQUITY UPC2系统 ACQUITY® SQD ACQUITY UPC2 CSH氟苯基色谱柱 Empower&trade 3软件 关键词 超高效合相色谱、UPC2、疏水性肽、短杆菌肽 简介 用反相液相色谱(RPLC)分析疏水性肽和蛋白质难度很大,因为溶液中经常需要使用洗涤剂保持疏水性物质的稳定性,而这些洗涤剂容易发生聚集和/或沉淀,严重影响它们的回收,这些因素以及其它原因使得难以用RPLC分离疏水性肽和蛋白质。 在本应用纪要中,我们为您介绍一种在ACQUITY UPC2TM系统上使用沃特世(Waters® )超高效合相色谱技术分离典型跨膜肽-短杆菌肽的方法。 短杆菌肽是由芽孢杆菌产生的一种常见和已被良好表征的跨膜肽物质,它被用作对抗革兰氏阳性和某些革兰氏阴性细菌的局部用抗生素,短杆菌肽包括通用组成为甲酰-L-缬氨酸-甘氨酸-L-丙氨酸-D-亮氨酸-L-丙氨酸-D-缬氨酸-L-缬氨酸-D-缬氨酸-L-色氨酸-D-亮氨酸-L-X-D-亮氨酸-L-色氨酸-D-亮氨酸-L-色氨酸-氨基乙醇的一族化合物,其中X取决于短杆菌肽分子,即分别占总短杆菌肽量约87.5%、7.1%和5.1%的革兰氏A(X=色氨酸)、革兰氏B(X=苯丙氨酸)和革兰氏C(X=酪氨酸),1需要交替的D和L氨基酸单元构成_-螺旋状。 我们研究了色谱柱化学品、流动相改性剂和梯度斜率对分离短杆菌肽的影响。采用优化方法分离市场上销售的非处方药物(OTC),将测定的短杆菌肽浓度与标示量进行对比。采用质谱仪测定短杆菌肽的浓度,采用选择离子谱表征每种物质。在ACQUITY UPC2系统上使用我们的方法,可得到线性和可重复的结果&mdash &mdash 测定的OTC制剂浓度为标示量的98.4%。 试验 测试条件 除非另有说明,以下是用于所有色谱最终方法的最佳条件。 UPC2测试条件 UPC2系统: ACQUITY UPC2 检测器: PDA、ACQUITY SQD PDA @ 280nm,分辨率为6 nm(补偿400至500 nm) 色谱柱: ACQUITY UPC2 CSH 氟苯基,3.0 x 100 mm, 1.7 &mu m 柱温: 50 ° C 样品温度: 15 ° C UPC2 ABPR: 1885 psi 进样量: 1 &mu L 流速: 2.0 mL/min 流动相A: CO2 流动相B: 含0.1%TFA的甲醇(除非另有标示) 梯度: 20%至30% B,1.5min SQD条件 离子源: ES+ 锥孔电压: 20 V 毛细管电压:3.7kV 源温度: 150 ° C 脱溶剂气温度: 500 ° C 脱溶剂气体流速: 400 L/hr 锥孔气体流速: 25 L/hr SIR: 922.6,930.3,941.9 数据管理 Empower 3软件 样品描述 用解硫胺素芽孢杆菌(短芽孢杆菌)制备的短杆菌肽从Sigma Aldrich公司购买,将样品溶解在甲醇中制成0.5mg/mL浓度的溶液,如需要,可用甲醇稀释。含有短杆菌肽的非处方软膏是从当地药店购买的。将0.2g软膏溶解在10mL正己烷中,然后用5mL甲醇萃取短杆菌肽,去除甲醇层,用0.2-&mu m的烧结玻璃盘过滤,然后直接进样ACQUITY UPC2系统。 结果与讨论 我们系统性地筛选了四种色谱柱,测定哪种分离效果最佳,结果如图1所示,色谱柱筛选过程可在1小时内非常快速地完成。在我们设定的筛选条件下,BEH 2-EP和BEH色谱柱未检测到谱峰,由于其它色谱柱表现出合适的色谱性能,因而未对这两者的非洗脱原因深入研究,其中ACQUITY UPC2 CSH氟苯基色谱柱检测的色谱峰形最佳,因此采用该色谱柱继续研究。 图1.通过短杆菌肽标准物的色谱峰形和保留时间筛选各种化学特性色谱柱。所有色谱柱规格为3.0x100mm,填装亚-2-微米填料;所有分离条件都采用流动相 A:CO2、流动相 B、含0.1% FA的MeOH、2 mL/min, 3%B至25% B,5min。 为了分离短杆菌肽物质,对酸性改性剂的影响进行了研究,结果表明:使用三氟乙酸(TFA)可得到稍好的峰形,提高了短杆菌肽A和短杆菌肽C之间的分离度,结果如图2所示。已知TFA会抑制质谱电离,但每种物质的信号都足以定量检测治疗制剂,后续将对此进行讨论。对于要求更高灵敏度的应用,可能需要降低TFA浓度或使用甲酸,以达到希望的检测限值。 图2.酸性改性剂对分离短杆菌肽的影响。 当设置好合适色谱条件后,通过减少梯度时间优化分离过程,结果如图3所示,我们能够在1.5分钟时间内使每种短杆菌肽组分的分离度达到1.4或更高,在相同流速下通过减少运行时间增加梯度斜率,不但实现有效分离,同时还将短杆菌肽A的信噪比从336提高至605。 图3.UV 280-nm痕量检测优化分离短杆菌肽A、B和C。 我们测试了最佳分离条件,能够使用单四极杆质谱(SQD)检测每种物质,图4显示:每种物质都被质谱良好分离和检测到,另外每种短杆菌肽物质都显示含有绝大多数的M+2H离子,后续的研究将使用这些参数进行选择离子监测。 图4:每种短杆菌肽物质的总离子图谱-A和加合离子图谱-B-D。选择强度最高的离子评估市场上销售的抗菌制剂中的短杆菌肽含量,对于多肽序列,红色残基是L型同分异构体,黑色残基是D型同分异构体。 为了评估我们的方法是否适用于定量分析市场上销售的非处方药中的短杆菌肽,我们在ACQUITY SQD上使用选择离子监测,结果如图5A所示。我们绘制浓度-峰面积曲线,得到每种物质的校正曲线。结果发现:如图5B-D所示,每种成分在测试范围内都呈线性响应。另外还使用校正曲线测定了非处方药物中的每种短杆菌肽物质浓度。 图5,图A-25.0、12.5、1.25和0.625mg/mL浓度的标准溶液中含有短杆菌肽物质的叠加选择离子谱。图B、C和D-每种短杆菌肽A、B和C各自的MS峰面积线性拟合图。 使用开发的方法评估非处方药物中的短杆菌肽物质的浓度和相对丰度。如图6所示,重复分析结果表明:每种短杆菌肽%RSD值小,计算浓度与标签上的标称值相吻合;我们还发现短杆菌肽物质的相对丰度与文献报道的丰度非常吻合1。 图6. 从抗菌软膏中萃取的短杆菌肽A、B和C的叠加选择离子谱重复进样分析的计算RSD值(N=3)在可接受限值以内,计算丰度与文献报道数值非常吻合1。 结论 正如本应用纪要所展示的,ACQUITY UPC2系统与ACQUITYUPC2色谱柱化学结合使用,可为短杆菌肽提供简单、准确和可重现的分析方法。该工作表明ACQUITY UPC2系统可用于分析疏水性肽,还可能用于分析疏水性蛋白质,例如膜蛋白。 参考文献 1. The Merck Index and Encyclopedia of Chemicals, Drugs, and Biologicals.13th ed. Whitehouse Station, NJ : Merck Research Laboratories 2001. 关于沃特世公司 (www.waters.com) 50多年来,沃特世公司(NYSE:WAT)通过提供实用和可持续的创新,使医疗服务、环境管理、食品安全和全球水质监测领域有了显著进步,从而为实验室相关机构创造了业务优势。 作为一系列分离科学、实验室信息管理、质谱分析和热分析技术的开创者,沃特世技术的重大突破和实验室解决方案为客户的成功创造了持久的平台。 2010年沃特世拥有16.4亿美元的收入和5,400名员工,它将继续带领全世界的客户探索科学并取得卓越成就。 联系人: 叶晓晨 沃特世科技(上海)有限公司 市场服务部 xiao_chen_ye@waters.com 周瑞琳(GraceChow) 泰信策略(PMC) 020-83569288 13602845427 grace.chow@pmc.com.cn
  • 非变性质谱高通量、定量分析肽交换MHCI复合物
    大家好,本周为大家分享一篇最近发表在Analytical Chemistry上文章,High-Throughput, Quantitative Analysis of Peptide-Exchanged MHCI Complexes by Native Mass Spectrometry1。该文章的通讯作者是美国基因泰克公司的Wendy Sandoval研究员。  癌症疫苗是通过利用肿瘤细胞相关抗原,来唤醒人体针对癌症的免疫系统。常见的策略是通过对病人的肿瘤细胞样本进行基因测序来寻找特征性抗原肽,该抗原肽会与I类主要组织相容复合体(MHCI)相结合并呈递至CD8+细胞表面,通过与CD8+细胞表面受体相结合从而诱导免疫反应。为了实现整个过程,研究人员通常会结合基因测序和计算机预测结果设计多个候选抗原肽,每个候选肽都需要通过实验测试来确认它与MHCI分子的结合能力以及相关免疫原性。此外,考虑到编码MHCI的基因具有多态性,候选抗原肽还需要与不同等位基因编码的MHCI分子进行测试。因此,本文开发了一种高通量方法,利用非变形质谱快速筛选候选抗原肽并表征形成的肽-MHCI复合物(pMHCI)。  pMHCI复合物中抗原肽的体外载入一直以来都是难点,因为MHCI复合物(包括HLA和β2M亚基)本身并不稳定,需要长度为8~10的多肽链载入到MHCI的凹槽以保持完整。本文则通过利用紫外光裂解肽-MHCI复合物(UV-MHCI)的肽交换实现抗原肽的载入,具体步骤如图1A所示,通过紫外光照,UV-MHCI中的高亲和肽被切割转为低亲和肽段,该低亲和力肽段极易发生肽交换,通过监测新的pMHCI复合物的形成实现对候选肽的评估。目前常用的检测pMHCI形成的工具包括ELISA、TR-FRET以及2D-LC-MS。然而这些方法仅能提供有限的信息关于肽交换、pMHCI分子质量,对形成的pMHCI复合物无法进一步的表征。事实上,pMHCI复合物对后续诱导免疫反应至关重要。  图1. 癌症疫苗的免疫监测的示意图:A) 筛选流程,B检测方法。  为了确认非变性质谱(nMS)能否用于pMHCI复合物表征以及肽交换率的检测,作者对UV-MHCI以及6个标准肽段进行了考察(图2)。未经UV照射的UV-MHCI MS谱图(图2A)可以观察完整的UV-MHCI复合物以及丢掉紫外光裂解肽的MHCI。MHCI复合物被认为是气相解离产生的,因为没有活性肽的稳定作用,MHCI很难存在于溶液相中,溶液中没有MHCI,“空壳”的MHCI只有可能是质谱中UV-MHCI的气相裂解产生的。图2B证实了这一观点,经紫外光照射后,紫外光裂解肽由高亲和力转为低亲和力,从MHCI上脱落,MHCI解离成HLA和β2M亚基,谱图中能观察到HLA和β2M亚基信号。确认了MHCI是由peptide-bound population产生的信号,作者开始用该方法去定量标准肽的肽交换率。如图2C为UV-MHCI与标准肽孵育并过夜UV照射得到的谱图,仅观察到完整的pMHCI以及“空壳”MHCI的信号,说明实现了100%的完全肽交换。如图2D,肽交换率随孵育时间改变,2小时孵育时间足以实现最大肽交换。  图2. nMS表征UV光照A)前B)后的UV-MHCI复合物,C)nMS测定UV-MHCI与标准肽的肽交换率,D)标准肽肽交换率随时间的变换情况。  为了提高分析通量,减少样本消耗,作者在nMS基础上开发了SEC-nMS和CZE-nMS系统。作者用SEC-nMS系统测定了50个候选肽的交换率,说明该系统能够进行中或大规模的数据采集。相比较SEC-nMS而言,CZE-nMS系统具有更高的灵敏度和通量,样品体积消耗从微升减少至纳升,分析时间也缩短为2 min(图3A)。检测信号与进样量呈线性关系,注射体积为3 nL时,最低检测限为6 ng(图3BCD)。作者测定了67个候选肽跨越4种等位基因编码的MHCI分子的肽交换率(图3E)。此外,通过将UV-MHCI复合物同时与四种以上的候选肽进行孵育可在单个实验中同时检测它们的相对肽交换率以及与MHCI结合的亲和力(图3F)。作者还提出Vc50这个概念,即导致50%的pMHCI复合物发生解离的碰撞电压,可作为评估pMHCI复合物稳定性的重要参数。  图3. 使用CZE-MS系统高通量分析pMHCI复合物  除了检测pMHCI复合物的形成,测定肽交换率,nMS还可以对形成的复合物进行进一步的结构表征。如图4所示,native top-down的分析策略可获得多层次的结构信息。本文使用的Orbitrap Eclipse “Tribrid” 质谱,图4A为完整pMHCI的MS1谱图,图4B为施加源内电压(SID)促使蛋白解离为亚基,图4C是将14+ pMHC单独分离出,为后续HCD活化做准备。图4D为pMHCI复合物经HCD解离后的MS2谱图。图4E和图4F则分别为对肽段以及HLA亚基进行top-down测序的结果。这些多层次的结构信息能够帮助区分HLA亚型、阐明候选肽的序列,包括一些PTMs、二硫键信息。这些结构细节可能会影响候选肽与MHCI分子间的亲和力甚至是后续T细胞受体的识别。  图4. Native top-down分析策略获得pMHCI复合物的多层结构信息  总之,本文将非变性质谱(nMS)与分子排阻(SEC)或毛细管电泳(CZE)分离技术相结合用于高通量筛选pMHCI复合物中的候选肽。该方法能够直观确认pMHCI的完整性,Vc50可作为评估复合物气相稳定性的重要指标,通过native top-down分析策略可获得多层次的结构信息。以上所有确保了后续临床T-细胞实验的正常进行。  撰稿:刘蕊洁  编辑:李惠琳  原文:High-Throughput, Quantitative Analysis of Peptide-Exchanged MHCI Complexes by Native Mass Spectrometry  参考文献  1. Schachner LF, Phung W, Han G, et al. High-Throughput, Quantitative Analysis of Peptide-Exchanged MHCI Complexes by Native Mass Spectrometry. Anal Chem. 2022 10.1021/acs.analchem.2c02423. doi:10.1021/acs.analchem.2c02423
  • 华质泰科参加第三届全国质谱分析学术报告会
    2017年12月9日,由中国化学会质谱分析专业委员会主办、厦门大学承办、中国质谱学会和中国分析测试协会协办的“第三届全国质谱分析学术报告会”在厦门翔鹭国际大酒店盛大开幕。来自全国的质谱技术与应用专家学者、质谱厂商与用户共1500余人参加了此次会议,规模相比往届再攀新高。大会现场本届会议为期3天(12月9日-11日),邀请18个大会报告,并开设主题为新仪器新技术、蛋白组学与代谢组学、新型离子源、质谱在医药研究中的应用、有机/生物质谱新方法、无机质谱、环境与食品安全分析的七个分会场报告。会议同期还设置了青年论坛专场和学术墙报展示,以促进我国质谱分析技术的快速发展,展示我国在该领域取得的成绩及增进同行间的学术交流。作为国内专业的原位电离质谱分析技术推广团队,华质泰科积极参与此次会议,带来产品包括 DART 实时直接分析质谱,TriVersa NanoMate 芯片多通道纳喷质谱,DESI 解吸电喷雾质谱,AP/MALDI 大气压基质辅助激光解吸电离源等等,吸引了众多参会者的高度关注和浓厚兴趣。华质泰科展台交流此外,在10日上午的环境与食品安全分析分会场,DART 工厂的CEO Brian Musselman 博士作了题为“固相涂网及分散相富集新技术串接DART-MS/MS快速高敏分析农产及海产中的痕量污染物”的报告。DART-MS 实时直接分析质谱满足快速、现场、直接、无损、高通量、高灵敏度和高特异性分析的需求,在食品、药品、材料、物证、环境等领域的安全检测与品质控制等领域得到了广泛的关注和应用。Brian Musselman 博士报告2017年12月11日,第三届全国质谱分析学术报告会圆满落幕,此次会议全景呈现了高速发展的中国质谱分析,以期下一阶段再上新台阶。关于华质泰科:华质泰科是国内较早开展原位电离质谱分析技术推广并产业化的团队之一,致力于引领行业领域中的实时科学发展潮流。公司承担国家十二五863等重大质谱专题项目,与大学研究院等国家级研究机构达成了20多个合作研究和应用专项,发起并与中国质谱学会共同组织承办了中国原位电离质谱学术会议,获得了广泛的国际赞誉。
  • 利用数据非依赖质谱技术定量分析化学合成B型利钠肽中的杂质肽
    p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 相对于数据依赖质谱(Data-dependent& nbsp acquisition,DDA)技术,在数据非依赖质谱(Data-independent& nbsp acquisition,DIA)采集中,预先设定好的离子采集范围将被切分为若干小窗口,质谱仪可匀速、高频地对每个窗口中的的母、子离子进行选择、碎裂和记录,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。这样,在前端色谱分离度良好的情况下,便无需使用理化性质相同的同位素标记物作为内标进行定量(Label-free),极大的拓宽了定量灵活度,可以节约成本、减少定量环节,理论上也可以减少结果的不确定度。比较形象的描述是:DIA就像地毯式轰炸,无遗漏地打击全部目标。2015年,《Nature Method》将DIA技术评为未来几年中最值得期待的方法之一[1]。 /p p style=" text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 588px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202010/uepic/7e2121df-7505-45b8-9462-425f5998dce0.jpg" title=" 图片1.png" alt=" 图片1.png" width=" 600" height=" 588" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em text-indent: 0em " 图1& nbsp DDA与DIA技术的应用对比示意图[2] /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " B型利钠肽(B-type& nbsp natriuretic& nbsp peptide,BNP)是心衰临床检测和治疗过程中极为重要的多肽分子,其含量水平将直接作为心衰患者心肌功能的分级依据。因此,建立高准确度定量分析方法,研制量值准确可靠的标准物质,为临床检测进行量值传递和校准,不但符合ISO17511的要求,也是目前临床化学界的共识。尽管化学合成多肽已经广泛用于临床诊断、药物研发、化学检测等领域,但其中所含结构类似肽的分离、分析,一直是行业内关注的焦点。因为杂质肽往往与主成分的活性不一致,其他理化性质也存在一定差异。尤其在药物和临床诊断研究中,各国药典、诊疗指南、专家共识等,对结构类似杂质肽的含量及检出能力均有明确要求。 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 中国计量科学研究院李红梅团队采用DIA技术,建立了内标肽辅助的MS2-High3定量策略,对化学合成B型利钠肽中的杂质肽进行了定量分析。由于作者在待测BNP样本中加入了已知量的内标肽,且该内标肽的量值可溯源至氨基酸国家标准物质,因此,后续的杂质肽定量结果同样具备计量学溯源性。该方法的最大特点是分析高效与准确,在2小时内,可对合成BNP中的10种含量较高的杂质肽进行平行定量,非常适合对BNP药物(奈西利肽)、标准物质、校准品等开展质量控制与分析。目前,该研究已被“欧洲临床化学与检验医学联合会”的官方期刊《Clinical& nbsp Chemistry& nbsp and& nbsp Laboratory& nbsp Medicine》接收并先期在线发表(图2)。 /p p style=" text-align: center text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " & nbsp /p p style=" text-align: center margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 195px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202010/uepic/e325ef64-df1b-4118-8d4a-7c778606669c.jpg" title=" 图片2.png" alt=" 图片2.png" width=" 600" height=" 195" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em text-indent: 0em text-align: center " 图2& nbsp 基于Label-free& nbsp DIA质谱技术分析BNP中杂质肽 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " & nbsp /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 参考文献 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " [1] Allison Doerr,& nbsp DIA mass spectrometry. Nature Methods,& nbsp 2015 (12): 35. /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " [2] Jarrett D Egertson, Brendan MacLean, Richard Johnson, Yue Xuan, Michael J MacCoss, Multiplexed peptide analysis using data-independent acquisition and Skyline. Nature Protocols, 2015 (10): 887-903. /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " & nbsp /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 2020年11月10-12日,中国计量科学研究院和国际计量局拟联合举办 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 第三届 “药物及诊断试剂研发与质控——测量与标准,质量与安全(TD-MSQS 2020)” /strong /span 国际研讨会,以期进一步促进该领域的学术交流和技术发展,提升企业的研发水平和产品质量。本次会议将在南京市政府的支持下,在江苏省南京市举行。 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 本次会议可通过官方网站http://tdmsqs.ncrm.org.cn注册或扫描二维码注册,注册成功后请填写参会回执发送至会议邮箱pptd@nim.ac.cn。 span style=" text-align: center text-indent: 0em " & nbsp /span /p p style=" text-align: center text-indent: 0em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202010/uepic/ccf4bd70-dddd-45f4-ba22-f780937c770b.jpg" title=" 图片3.png" alt=" 图片3.png" / /p p style=" text-align: center text-indent: 0em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " strong 欢迎各位专家、同仁报名参会! /strong /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 更多信息请关注会议官方网站: a href=" http://tdmsqs.ncrm.org.cn。" _src=" http://tdmsqs.ncrm.org.cn。" http://tdmsqs.ncrm.org.cn。 /a /p p style=" text-indent: 2em text-align: right margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 供稿:中国计量科学研究院化学所 /p p style=" text-indent: 2em text-align: right margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " 肖鹏 宋德伟 李红梅 /p p style=" text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.75em " & nbsp /p
  • 汇健科技与热景生物达成战略合作,合力共创糖链短肽质谱诊断新价值
    3月5日,杭州汇健科技有限公司(以下简称“汇健科技”)与北京热景生物技术股份有限公司(以下简称“热景生物”)在北京签署战略合作协议,双方将充分发挥核心研发和技术优势,共同开发基于异常糖链短肽的质谱诊断产品。汇健科技董事长兼首席科学家邬建敏教授与热景生物董事长兼总裁林长青先生代表双方正式签约。作为介于蛋白组和代谢组的多肽组,蕴藏着与疾病相关的大量信息。血液中的多肽包括基因表达的直接产物及某些高丰度蛋白在胞内的降解产物。相比于分子量较大的蛋白质,不同组织与器官产生的多肽更易分泌到胞外并透过血管内皮细胞进入血液系统,血液循环多肽(BCP)种类与分布和肿瘤发生时的基因突变及蛋白酶表达量的变化密切相关。此外,血液肽段的磷酸化和糖基化修饰也与肿瘤的发生和发展紧密相关。通过检测血清肽谱和血液中异常糖链糖蛋白水平对肿瘤的早期发现、辅助诊断、疗效评估、预后跟踪、复发转移监测有较大意义。 汇健科技通过底层技术创新,开发了高效和可靠的微量血清样本前处理Bio-pSi微纳材料和血清肽谱检测试剂、稳定的质谱仪器和机器学习算法,首次将血清肽谱应用于肿瘤液体活检领域,同时建立了蛋白、多肽组学产品开发、生产、注册报证全链条的转化能力,为质谱产业链上下游和临床转化提供整体解决方案。此次战略合作充分整合了热景生物在糖组学、汇健科技在高通量临床质谱和组学技术领域拥有的原创性技术和核心研发优势。在糖生物学领域,热景生物具有丰富的技术积累和产品研发经验,拥有异常糖链蛋白分离检测技术(专利号:201810691539.4)和适用于糖肽质谱检测的样本处理方法(专利号:201811649280.3)。汇健科技综合运用纳米材料技术、高通量生物检测技术、数据库及AI算法,已经构建了多元样本诊断及健康监测的高通量临床质谱平台,适用于微量样本的短肽富集、检测、分析一体化技术拥有原创自主知识产权,在硅基微纳材料、质谱检测试剂盒、AI算法获得多项国内发明专利(ZL201810163433.7、ZL202010054067.9、ZL202310389621.2, 以及高价值专利(ZL201210252926.0)。众行致远,合力共为,双方将通过优势互补、深度协作,聚焦肿瘤诊断应用场景,共同致力于新一代质谱诊断产品研发,引领技术创新升级,为临床诊断提供更卓越、更多元化的解决方案,用科技力量守护患者健康。关于热景生物北京热景生物技术股份有限公司(股票代码:688068),成立于2005年6月,是一家以“发展生物科技,造福人类健康”为使命的生物高新技术企业。公司不断探索自主创新诊断技术平台,积极研发拓展液体活检癌症早筛技术,建立包括蛋白标志物、糖链外泌体、DNA甲基化的多组学诊断技术平台;同时,成立未来技术研究院,探索前沿科技,积极布局抗体药物、核酸药物、活菌药物等生物制药领域,打造从诊断到治疗的全产业链发展战略。公司于2019年在科创板上市,近年来荣获2021最具价值科创板上市公司,荣登2022年科创板上市公司百强榜单,上榜2021中国新经济企业500强,被认定为北京市专精特新“小巨人”企业,入选北京民营企业百强。公司始终聚焦科技创新,持续探索新的诊断技术、发现新的诊断标志物;同时不断探索新的业务领域,加快在生物制药领域的全面布局。用科技助力国家“十四五”发展战略,为构建人类卫生健康共同体奋斗!
  • 超短链全氟烷基化合物“三氟乙酸”分析利器——超临界流体色谱质谱联用技术
    近年来,以三氟乙酸(TFA)为代表的超短链全氟烷基化合物(超短链PFAS)大量赋存于城市河水中这一问题已对城市生态及饮用水生产带来了巨大挑战,监测和精确定量饮用水源中的超短链PFAS已经迫在眉睫。针对高极性的超短链PFAS,高效环保的超临界流体色谱质谱联用技术可以提供良好保留和高灵敏度检测结果。背景介绍PFAS是一类广泛用于消费品和工业生产的含氟有机化合物。全氟辛烷磺酸(PFOS)和全氟辛酸(PFOA)是两种含八个碳的全氟烷基酸类化合物(PFAA),因具有较高的环境持久性和毒性,已在全球范围内逐步淘汰。然而,取而代之的是一些超短链(C1&minus C3)(图1)和短链(C4&minus C7)PFAA,其在环境、血液及尿液样本中正在被广泛检出【1,2】,引发了人们对健康影响的担忧。图1 超短链(C1&minus C3)全氟烷基化合物特别是含量较高的三氟乙酸被认为含有损坏生育能力和儿童发育毒性,正在全球范围内引起广泛关注。据欧洲新闻网报道,欧洲农药行动网络(PAN Europe)及其成员于5月27日联合发布了一项研究报告,对来自10个欧盟国家的23个地表水样本和6个地下水样本的联合调查发现,所有检测的水样中均检测到PFAS,其中23个样本(79%)的TFA浓度超过了欧盟饮用水指令中“PFAS总量”的拟议限值;而在检测到的总PFAS中,TFA占总量的98%以上【3】。TFA是含有两个碳的全氟羧酸,属于超短链(C1&minus C3)全氟烷基化合物。其在环境中普遍存在,主要来源包括PFAS农药、氢氟碳化物制冷剂、污水处理和工业污染(图2)。尽管目前对TFA的生物毒性效应研究有限,考虑到其持久性和全球传播特性,正在引起全球多国的密切关注【4,5】。图2 杀虫剂、杀菌剂和药品中的碳键全氟甲基在环境条件下通过氧化裂解转化为TFA特色应用方案使用高效环保的超临界流体色谱(SFC)分离技术,结合超高灵敏度三重四级杆质谱检测器,岛津中国创新中心开发了包括TFA在内的五种超短链PFAS快速分析方法。与反相液相色谱不同,SFC可以充分保留仅有一到三个碳的超短链PFAS,有效降低基质的干扰(图3)。图3 SFC-MS/MS和LC-MS/MS分析超短链PFAS色谱对比图(1ng/mL标液)使用SFC-MS/MS对纯水配置的系列标准溶液进行分析,可得到良好线性和较低检测限(见表1),进一步,对不同地表水样品进行检测,结果发现,均检测到一定量TFA,使用内标法定量,分别为几百个到几千个ppt,说明TFA在城市水体都存在较为严重的污染(图4、图5)。图4 SFC-MS/MS分析地表水样品1中超短链PFAS图5 SFC-MS/MS分析地表水样品2中超短链PFAS表1 SFC-MS/MS分析水样中超短链PFAS线性和检出限总结采用超临界流体色谱串联三重四极杆质谱仪(SFC-MS/MS)建立超短链(C1&minus C3)全氟烷基化合物的快速分析方法。由于超临界流体色谱独特的分离选择性,使用SFC-MS/MS分析种类繁多的PFAS,可以得到与反相色谱截然不同的溶出顺序和出峰行为。SFC-MS/MS可作为反相液相色谱质谱联用技术一种有力补充,对超短链PFAS进行更准确定量。随着对PFAS及其降解产物(TFA等)认识的不断深入,全球各国需要加强对这些持久性化学品的监管和限制, 旨在减少PFAS污染,保护生态系统和人类健康。超临界流体色谱串联三重四极杆质谱仪(SFC-MS/MS)注解*:超临界流体色谱(SFC):使用超临界流体作为流动相的色谱分离技术。以超临界流体CO2为流动相的SFC分离技术不仅高效而且节能环保,作为一种绿色分离技术在制药、食品和石油领域得到越来越广泛的应用。参考文献1. Guomao Zheng, Stephanie M. Eic, Amina Salamova. Elevated Levels of Ultrashort- and Short-Chain Perfluoroalkyl Acids in US Homes and People. Environ. Sci. Technol. 2023, 57, 42, 15782–15793.2. Isabelle J. N., Daniel H., Hanna L. W., Vassil V., Ulrich B., Karsten N., Marco S., Sarah E. H, Hans P. H. A., and Daniel Z., Ultra-Short-Chain PFASs in the Sources of German Drinking Water: Prevalent, Overlooked, Difficult to Remove, and Unregulated. Environ. Sci. Technol. 2022 56, 10, 6380-6390.3. 欧洲水体中的PFAS污染引发关注:塞纳河等河流中令人惊讶的三氟乙酸浓度.【微信公众号:新污染物监测与分析】4. Cahill, T. M. Increases in Trifluoroacetate Concentrations in Surface Waters over Two Decades. Environmental Science & Technology, 2022, 56,9428-9434.5. Thomas M. Cahill. Assessment of Potential Accumulation of Trifluoroacetate in Terminal Lakes. Environ. Sci. Technol. 2024, 58, 6, 2966–2972.本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。
  • 暨南大学胡斌副研究员:面向新冠肺炎诊断与研究的人体呼气质谱分析
    近日,暨南大学胡斌副研究员团队在Journal of Analysis and Testing 2021年第4期发表综述论文“Mass Spectrometry‑Based Human Breath Analysis: Towards COVID‑19 Diagnosis and Research”。该文总结了新冠肺炎呼气质谱分析方法的研究进展,并从有机代谢物、蛋白质、微生物和无机元素等多个维度讨论了质谱技术在新冠肺炎诊断与研究中的应用前景和挑战。面向新冠肺炎诊断与研究的人体呼气质谱分析新冠肺炎(COVID-19)是由新型冠状病毒(SARS-Cov-2)引发的传染病,已给全球带来了严重的生命财产与经济损失并且仍在继续发展。研究证实新冠肺炎可通过人体呼气及飞沫传播。人体呼气是一种生物气溶胶,含有大量挥发性物质、水汽以及融合在水汽小液滴中的不挥发性物质如有机代谢物、生物大分子和微生物等等。这些人体呼气成分与人体的生理病理及行为密切相关,并且可通过简单便捷和活体无创的方式采集。因此,人体呼气分析在疾病诊断、生命科学、临床医学、药物研究、环境健康和刑侦法医等涉及人体健康与分子医学领域具有重要的应用。特别地,受新冠肺炎这一与呼吸系统及呼气传播密切相关的疾病挑战,基于人体呼气分析新冠肺炎诊断与研究是新兴的前沿热点和难点。表1 新冠肺炎的诊断技术质谱是同时具备灵敏度高、特异性好、信号响应快的仪器分析方法,是研究新冠肺炎的基因组学、蛋白质组学、代谢组学和微生物组学的强大分析工具,并取得了重要进展。与其他新冠肺炎的诊断技术相比,基于质谱技术的人体呼气分析具有无创、活体、操作简单、分析性能好、适用性强等优点(表1)。质谱技术结合不同的采样方法、分离技术、或电离技术可在不同维度对人体呼气进行分析(图1),为新冠肺炎在快速诊断与分子生物学研究提供新的视角。图1 基于质谱技术新冠肺炎呼气的多维分析直接质谱技术直接质谱(DI-MS)技术包括原位电离质谱(AI-MS),是指无需样品前处理条件下直接分析样品的质谱技术,已成功地发展应用于人体呼气成分的实时在线监测,例如质子转移反应质谱(PTR-MS),选择离子流动管质谱(SIFT-MS),电喷雾萃取电离质谱(EESI-MS),以及二次电喷雾电离质谱(SESI-MS)等。这些直接质谱技术可以连续、无创、实时地直接引入人体呼气,实现呼气的在线质谱监测,为快速获取呼气信息提供新的技术手段。在直接质谱技术监测呼气的同时,结合质谱数据的统计方法和机器学习(图2),为筛查新冠肺炎的生物标志物提供了新手段。直接质谱技术是新冠肺炎快速诊断有力的诊断工具,将有望在呼吸疾病诊断和筛查取得新的突破。图2 新冠肺炎呼气质谱数据处理方法:a. PCA, b. OPLS-DA, c. 使用三种机器学习算法的完整模式, d. 只使用最重要特征的模型气相色谱质谱技术人体呼出气中的挥发性物质主要来源于内源性代谢物(由呼吸道和内脏系统及其微生物产生)和外源性物质(由食物、药物、环境及其代谢物产生),而新冠肺炎病毒可能产生特殊的挥发性代谢标志物。监测人体呼出代谢物产物可以深入理解新冠病毒引起的生理病理变化。气相色谱质谱(GC-MS)技术具有稳定性好、分离能力强、灵敏度高、特异性好等特点,并配备有强大的数据库,是一种呼出代谢物分析的有力手段。此外,耦合新型呼气采集技术,如口罩微萃取技术(图3),气相色谱质谱还有望实现超痕量代谢物的精准分析。特别地,随着便携式气相色谱质谱的发展,可以根据需求将便携式质谱转移到社区、学校、医院等场所进行现场诊断,进一步提高新冠肺炎的诊断能力。图3 新型质谱呼气分析新方法:a. SPME探针, b. 口罩微萃取呼气采样, c. SPME-DART-MS分析, d. 台式SPME-GC-MS分析, e. 便携式SPME-GC-MS分析液相色谱质谱技术人体呼气中还包括多种非挥发性有机物和生物基质,为呼吸系统疾病提供了生物化学信息。液相色谱质谱(LC-MS)通常用于分析呼出气溶胶中的有机代谢物和蛋白质。由于呼气中的有机代谢物和蛋白质含量低,通常需要对呼气进行预处理,例如呼气冷凝浓缩。研究表明,呼气冷凝物的收集是呼气蛋白质组学和代谢组学研究的关键因素之一。因此,呼气冷凝物结合LC-MS分析可能成为研究新冠肺炎呼气中蛋白质组学和代谢组学的有力工具,从而发现呼气中的生物标志物,为新冠肺炎的生物学研究提供新认识。基质辅助激光解吸电离质谱技术由于新冠肺炎可以通过呼出气溶胶和飞沫传播,从呼气样本中直接鉴别新冠肺炎病毒是迫切的需求。基质辅助激光解吸电离质谱(MALDI-MS)具有灵敏度高、准确度高、和质量范围广的特点,可以分析包括细菌、真菌和病毒等微生物。鼻咽拭子样品、血浆或血清中的病毒特异性蛋白/核酸也可通过MALDI-MS分析。MALDI-MS在新冠肺炎临床诊断和冠状病毒研究中已经取得许多重要进展。在MALDI-MS分析过程中,通过将微生物的肽质量指纹图谱、蛋白质、核酸序列等信息与数据库进行匹配鉴定。MALDI-MS可以用于准确筛选已知的冠状病毒,为出现未知的人类冠状病毒提供病理和生理学依据。电感耦合等离子体电离质谱技术电感耦合等离子体电离质谱(ICP-MS)是一种强大的元素分析技术,可以检测人体组织、体液和呼气中的无机元素。研究发现,新冠肺炎患者体内会出现矿物质状态失衡,可能受到一种尚未发现的无机生物学机制的影响。目前新冠肺炎患者呼气中无机元素的变化机制尚不清楚,ICP-MS有望成为筛查新冠肺炎呼气样本中无机元素变化的有力工具,并且发现新型无机生物标志物。ICP-MS有望成为新冠肺炎呼气诊断与研究的新手段,并为更好地理解新冠肺炎的潜在无机生物学过程提供新的视角。小结自从新冠肺炎爆发以来,质谱技术在新冠肺炎的诊断应用与基础研究方面飞速地发展。本文从有机代谢物、蛋白质、微生物、无机元素等多个维度评述了人体呼气质谱分析在新冠肺炎诊断与研究的进展。在诊断方面,呼气质谱技术已经在临床检验方面取得了很大的进展,然而如何实现快速、准确、现场的诊断应用仍然有待进一步的改进和验证。在研究方面,呼气质谱分析为更好地理解新冠肺炎病毒在人体的生理学、生物化学和无机生物学的机制提供了新的视角,如何深入地揭示新冠病毒对人体健康的影响,在样品采集、质谱分析、数据处理方面仍需要深入系统的研究。新冠肺炎的呼气质谱分析在未来仍然充满机遇,包括但不限于分析化学、仪器研制、生物化学、临床医学和人工智能等领域不同学科的交叉融合,将有望更好地诊断和理解新冠肺炎。本文引文信息Yuan, ZC., Hu, B. Mass Spectrometry-Based Human Breath Analysis: Towards COVID-19 Diagnosis and Research. J. Anal. Test. 5, 287–297 (2021). https://doi.org/10.1007/s41664-021-00194-9作者简介胡斌,博士,暨南大学质谱仪器与大气环境研究所副研究员。长期从事质谱分析及相关交叉学科研究工作。研究方向包括:样品采集与制备新方法、离子化技术、生命健康与公共安全质谱分析研究等。相关工作以(共同)第一或通讯作者在Analytical Chemistry, Trends in Analytical Chemistry, Nature Protocols等期刊上发表SCI论文40多篇;论文总引用2500多次,个人H指数25。曾获中国青少年科技创新奖和中国分析测试协会科学技术奖(CAIA奖)一等奖等奖项。担任香港研究资助局、广东省科技厅、广东省基础与应用基础研究基金委员会等评审专家,以及Advanced Materials, Analytical Chemistry, Food Chemistry, Environmental Science & Technology等20余国际SCI期刊审稿专家。
  • 谱育科技展现首台(套)风采:双通道走航质谱分析仪
    “首台(套)”是指国内实现重大技术突破、拥有知识产权、尚未取得市场业绩的装备产品,包括前三台(套)或批(次)成套设备、整机设备及核心部件、控制系统、基础材料、软件系统等。自2018年4月发改委等8部门联合印发《关于促进首台(套)重大技术装备示范应用的意见》以来,首台(套)重大技术装备受到了社会各界的广泛关注。各省份接连出台落地举措和认定名单,不仅给予政策上的支持,还有多达数百万的资金奖励 同时,获得首台(套)认定,也彰显着一家企业的领先科技和硬实力。  近年来,科学仪器行业也涌现了多批首台(套)仪器装备,为此,仪器信息网特别策划“聚焦科学仪器首台(套)”专题,向广大同行及用户展示这些仪器“尖子生”的创新风采。  谱育科技EXPEC 3500高性能双通道走航质谱分析仪于2018年上市,2020年12月获浙江省制造业首台(套)认定。  1、请介绍公司获首台(套)认定的产品推出及获认定时间,攻克了哪些技术难关,解决了国家哪些重要问题?  EXPEC 3500高性能双通道走航质谱分析仪上市的时间是2018年,首台(套)认定时间为2020年12月。  高性能双通道走航质谱分析仪产品针对挥发性有机物(VOCs)的实时走航监测所面临的问题创新研制,集单质谱分析、气相色谱质谱联用(GC-MS)分析于一体,在快速走航监测分析技术、多模式动态吸附热解析技术、径向聚焦脉冲内离子源技术、双极性射频电压动态平衡技术及质谱增益自动调谐技术上具有重大突破。同时,产品集成了自主开发的智能化走航软件及定制化改装载体,具有快速响应、高时空分辨、准确定性与定量、全污染因子覆盖等特点,实现了VOCs区域污染画像、异味精准溯源、连续在线监测等功能,相关技术指标达到了国际先进水平,填补了国内该领域装备的空白,对推动我国VOCs精准管控与执法具有重要的意义。  2、该产品研制推出的背后,有哪些意义深刻的里程碑事件,或者有哪些令人难忘的研发、生产等故事可以分享?  高性能双通道走航质谱分析仪从2015年研发立项到2018年产品研制成功共历时3年:开始方案设计和开发探索,生产加工、系统测试验证和升级乃至完成产业化发展。为满足国内走航监测市场的需求,实现高性能双通道走航质谱分析仪的产业化,项目从核心器件、关键部件、仪器整机到仪器应用为轴线的"全链条式"创新设计新模式,攻克了双通道走航质谱分析仪的核心器件和关键技术研究,开展了双通道走航质谱分析仪的研制与应用方法研究,实现了双通道走航质谱分析仪的研制和产业化,填补国内该领域空白。  3、该产品能够实现在哪些领域的关键应用,可以帮助用户解决哪些重要问题?相比以往,在应用上有哪些变化和创新?  为快速捕获区域污染源头,获取空气中挥发性有机物的时空分布。高性能双通道走航质谱分析仪研制过程中,采用直接进样(无需富集)和富集+分离进样的多(两个或更多)通道走航监测系统,可实现VOCs等的快速检测,同时能解决传统质谱走航监测仪器无法区分分子量相同物质的问题。直接进样通道实时分析空气中的污染物,当污染物等待测物超过阈值时,和富集+分离通道实现联动,确保目标VOCs等待测物及时采集、无遗漏 配合移动工具(如监测车)“边走边测”的特点,实现VOCs等待测物快速检测和精确定性、定量分析。该方法可以满足国家相关标准要求,能监测包括芳香烃类、卤代烃类、酯类、醛类、酮类、有机硫等污染因子在内的近千种以上环境大气挥发性有机物。  VOCs 监测技术是开展 VOCs 污染防治工作的重要基础。传统常用的VOCs监测分析方法 “手工采样、仪器分析、数据解析”在实际应用中存在一定的局限性,例如分析过程繁琐,周期长,样品采集,时效性低,耗费大量人力物力,且指向性较差,影响监测结果的准确性。  近年来,VOCs走航监测技术具有现场实时快速检测、移动进行区域快速排查等优势,在VOCs污染防治领域获得了快速发展。搭载广谱型VOCs监测设备,进行移动监测的技术手段。双通道走航监测车搭载质谱分析技术因其检测速度快、可实时在线监测、灵敏度高等优点,在VOCs监测方面具有强大优势。走航监测结合监测数据、GPS信息和电子地图,可实现对大气污染物的“边走边测”,摸清整体的挥发性有机物污染物分布情况,实现对监测区域、工业园区、重点企业实行地毯式快速监察,有效提升了环境监测部门的效率。  4、企业往往都希望采购成熟产品,首台(套)问世后,大规模应用和市场推广是主要难题。那么,您认为该产品的应用和市场推广层面,面临哪些挑战,公司采取了哪些手段积极应对?  高性能双通道走航质谱分析仪定位于高端VOCs监测设备市场,主要解决VOCs的全时空、快速走航监测需求,弥补传统在线、移动监测手段的不足,为VOCs的精准防控提供有力监测手段。国内外同类产品仅适用单通道质谱分析方法,由于该方法不涉及色谱分离,分析速度极快,单次分析时间可实现秒级响应,适合环境空气、厂界等多种场合的VOCs快速筛查。但是由于缺少色谱分离过程,直接进样质谱法的缺点也很明显,例如无法有效区分同分异构体以及分子量相同的化合物,从而无法实现这两类化合物的准确定性定量,存在明显的技术缺陷。  本设备将直接进样质谱法和GC-MS法相结合,优势互补,建立双通道分析模式,用于VOCs快速准确定性定量,是较为理想的监测技术方案。选用双通道VOCs质谱分析仪,分析仪能够同时支持GC-MS法和直接进样质谱法,可同时发挥GC-MS法定性定量准确、灵敏度高、监测因子覆盖范围广,以及直接进样质谱法分析速度快等优势。关键监测技术的升级,有效保证设备分析结果准确可靠,在同类型走航市场上具有明显优势。  在推广上公司积极发挥产品价值,发挥GC-MS法定性定量准确、灵敏度高、监测因子覆盖范围广等优势,也能发挥直接进样质谱法分析速度快的优势。本产品具备环境空气监测、污染源(有组织、无组织)监测及污染物实时走航监测等功能模式。利用双通道走航质谱的工作性能,不断带动走航设备行业的发展走向双通道质谱设计。  5、获首台(套)重大技术装备认定对公司而言意味着怎样的激励?带来了哪些实质性的助力?下一步公司在企业发展和产品研制层面还将有哪些计划?  首台套重大技术装备认定是对谱育科技双通道走航质谱的重要认可,一定程度上可定了双通道走航质谱在污染溯源筛查、环境监测、应急监测等领域的作用,同时助力监测设备市场更加认可双通道走航质谱的性能和价值,助力更好的推广产品。  围绕十四五及长期环境监测规划,谱育科技不断进行了技术平台提升,围绕环境管理的综合性和复杂性问题,探索走航技术与激光雷达技术、傅里叶红外遥感技术、半导体激光遥测技术等技术联用,研发多参数走航联用技术平台,实现高时空分辨、多类型污染物、天地空的多维度综合分析和评价,为达标管控和环境管理提供更详实的数据。
  • 基于电荷检测质谱(CDMS)对AAV提取的DNA的分析揭示基因组的截断
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章,Analysis of AAV-Extracted DNA by Charge Detection Mass Spectrometry Reveals Genome Truncations1,文章的通讯作者是来自印第安纳大学化学系的Jarrold, Martin F.教授。  腺相关病毒(AAV)是一种小的(26纳米)、无包膜二十面体病毒。由于其低免疫原性和高组织亲和性,AAV已成为一种很有前途的基因治疗载体。AAV衣壳包含三种病毒蛋白质,VP1、VP2和VP3。对于来自HEK细胞的重组AAV (rAAV),VP1-3的比例约为1:1:10。AAV包裹单链(ss)DNA基因组。野生型基因组的长度约为4.7 kB。基因组两侧有两个倒置末端重复序列(ITRs),它们在复制和基因组包装中起着重要作用。目前,主要用于rAAV研究的生产平台是人HEK293细胞的瞬时转染,然而其HEK293细胞的制造限制其大规模地用于AAV载体的生产。杆状病毒感染的Sf9细胞系已被发现是一种可行的生产方法,但是研究发现在生产过程中出现的ITR丢失和基因组截断现象,似乎成为了Sf9细胞系必须关注的一个问题。因为包裹着不完整的基因组的载体,会使得治疗的有效性降低。  在本研究中,作者提出了一种利用电荷检测质谱(CDMS)直接检测从AAV中提取的DNA的方法。CDMS可以使用静电线性离子阱(ELIT)同时检测单个粒子的电荷数和质荷比,从而直接获得粒子的质量。测量是在一个自制的仪器上进行的,简单地说,纳喷雾(Advion Triversa Nanomate)产生的离子通过金属毛细管进入仪器,然后通过几个不同真空区域。第一个区域包含FUNPET(an ion-funnel ion-carpet hybrid),随后是射频六极杆和分段射频四极杆。FUNPET会破坏气体通过毛细管时形成的气体射流,样品离子随即在六极杆中被热化,最终的离子能量由六极杆上的直流电位决定。离子束在分段四极杆中的径向分布被压缩,经过四极杆的离子通过非对称艾泽尔透镜聚焦到双半球形偏转能量分析器中,并设置传输具有较窄动能分布的离子(以100 eV/z为中心)。传输的离子被聚焦到ELIT中,其中一些离子被捕获并通过位于ELIT端帽之间的检测圆筒来回振荡。振荡离子产生的信号被电荷敏感放大器接收。信号被放大和数字化,然后用快速傅里叶变换(FFTs)进行分析。短时间窗口FFT通过每个捕获事件的信号进行转换,以确定离子是否在整个事件中被捕获。没有在整个事件中存活的离子信号将被丢弃。振荡频率与m/z有关,振幅与电荷成正比。用这种方法测量了数千个离子,并将其分成直方图以给出质量分布。    图1. 来自Sf9细胞的AAV8-CMV-GFP的CDMS测量。(a,b)未孵育样品的质量分布和电荷与质量散点图。电荷与质量散点图中的橙色线是球形离子瑞利电荷极限的预测。(c,d)在45°c孵育15分钟后测量的质量分布和散点图。(d)中的插图显示了基因组从衣壳挤出的示意图。(e,f) 80°C孵育15 min后的结果。绿色虚线表示释放的ssDNA GOI的序列质量,紫色虚线表示互补DNA链碱基对进入溶液后的序列质量。图1第一排的图片显示了用CDMS测量的Sf9细胞制备的AAV8-CMV-GFP的质量分布。在4.5MDa处的主峰是由于rAAV对GOI进行了包装,在5.2MDa处的峰值是由于异质DNA的包装达到了包装容量,在3.7处MDa的肩峰是由于空颗粒。对应的电荷-质量散点图如图1第二排所示。其中空颗粒和包装了DNA的颗粒在电荷上的数值比较接近是因为DNA被包裹到了衣壳的内部。图1c显示了AAV8-CMV-GFP在45°C孵育15min后测量的质量分布。rAAV已经开始分解,存在大量质量低于3 MDa的离子。在3.7 MDa处的空颗粒的数量也大幅增加,这表明基因组正在被释放。而在80℃孵育15min后可见AAV已经完全分解,对应峰也消失了,而剩下的峰与推测的互补DNA链的分子量相当。图2显示了培养后为提取GOI而测量的rAAV载体的CDMS质量分布和电荷-质量散射图。值得注意的是,AAV8-CMV-CRE和AAV8-CAG-GFP(来自Sf9细胞)的平均电荷约为400 e, AAV8-CMV-GFP(来自HEK细胞)的平均电荷约为900 e。平均电荷的差异可能反映了dsDNA的整体几何结构,电荷越高的GOIs具有更广泛的结构。    图2. 在80°C孵育15分钟后记录的代表性质量分布和电荷与质量散点图。结果显示AAV8-CMV-CRE、AAV8-CAG-GFP和AAV8-EF1a-GFP来源于Sf9细胞,AAV8-CMV-GFP来源于HEK细胞。紫色虚线显示dsDNA GOI的序列质量。插图显示了dsDNA GOI的峰值的扩展视图。图3a显示了测量到的dsDNA GOI与AAV样本序列质量的偏差的柱状图,对于大多数AAV样本,测量的dsDNA GOI大于序列质量。这种偏差可以用反离子来解释。DNA在中性溶液中带负电荷,因为它的一些主链磷酸被电离,dsDNA GOI有2219−3443个碱基对,因此它们可能有多达4438−6886个反离子。最可能的反离子是NH4+因为样品是用醋酸铵溶液电喷涂的。如果所有的dsDNA GOI主链磷酸都被电离并且有NH4+反离子,则附加质量(超出完全电离序列质量)为80 ~ 124 kDa。而有些dsDNA的分子量低于预测的序列质量,这是因为序列发生了截断导致的,图3d显示了为该样品测量的DNA峰值的扩展视图。峰宽可以提供截断分布的信息。如果所有的DNA链都损失了425 nt,峰值就会很窄。另一方面,如果截短长度分布较宽,则会产生较宽的峰值。图3d中的峰值相对较窄,说明分布较窄。有一个高质量拖尾,这可能表明一些基因组被截断了小于425 nt。    图3. 来自Sf9和HEK细胞的一系列GOIs的AAV8、AAV9和AAVDJ血清型的dsDNA质量测量总结。(a)测量质量与序列质量偏差的柱状图。(b)考虑反离子的测量质量与预期质量的偏差的柱状图。(c) AAV基因组结构示意图。(d)来自HEK细胞的AAV8-CMV-CRE的dsDNA GOI峰的扩展视图。最后,将CDMS测量的基因组截断与来自第三代测序方法的信息进行比较将具有指导意义。尽管CDMS测量可以判断基因组是否被截断以及缺失的数量,但它不能确定截断发生在哪里。关于截断发生位置的信息可以从第三代测序中获得,这些信息反过来可以深入了解其机制。因此,CDMS测量全基因组MW和第三代测序是互补的。CDMS测量可用于筛选截断的基因组,以便通过第三代测序进行后续深入分析。  撰稿:李孟效  编辑:李惠琳  文章引用:Analysis of AAV-Extracted DNA by Charge Detection Mass Spectrometry Reveals Genome Truncations  李惠琳课题组网址www.x-mol.com/groups/li_huilin  参考文献  1. Barnes, L. F. Draper, B. E. Kurian, J. Chen, Y. T. Shapkina, T. Powers, T. W. Jarrold, M. F., Analysis of AAV-Extracted DNA by Charge Detection Mass Spectrometry Reveals Genome Truncations. Analytical Chemistry, 4310-4316.
  • Obitrap超高分辨质谱平台:多肽药物特立帕肽的定量分析
    多肽药物是介于大分子蛋白/抗体类药物和小分子药物之间的一 类重要的药物分子,因其生物活性高、靶向专一性高、选择性 高、毒副作用低等优点而被广泛应用于疾病治疗领域[1]。Ther mo Obitrap因其超高的分辨率,质量轴稳定性,已经广泛应用 在了多肽药物结构表征中。Obitrap 作为高分辩还具有极高灵敏 度和线性范围,因此也被越来越多的应用到药物的定量研究中。  PTH 是甲状旁腺主细胞分泌的由84个氨基酸组成的多肽类 激素,其对于维持钙磷代谢的稳定起着至关重要的作用。 特立帕肽(SVSEIQLMHNLGKHLNSMERVEWLRKKLQDV HNF,4117.7 Da)是一种人工重组合成的人PTH 1-34多 肽,是第一个被美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)批准的抗骨质疏松性骨折的骨合成药物。 Thermo Scientifific Q Exactive Focus 四极杆 Orbitrap 组合型质 谱仪专为常规分析应用而设计,最高分辨率为7万,最大分辨 率12Hz,可以在同一系统中同时实现准确可靠的定性和定量分析。  Obitrap Fusion Lumos是赛默飞世尔科技在2015年推出的三合 一的静电场轨道阱超高分辨质谱仪。Lumos搭载的分段式四级 杆技术(Advanced Quadrupole Technology,AQT)使离子传 输效率至少提高了 2 倍,超高场的Obitrap拥有50万分辨率和 20Hz的超快扫描速度,使Lumos在具有极佳的灵敏度同时,还 拥有稳定性和动态范围。  本实验将基于两款Obitrap高分辩质谱Q Exactive Focus和Obit rap Fusion Lumos建立多肽药物特立帕肽的定量分析方法,考 察高分辩质谱Obitrap的定量能力。  实验结果  1、特立帕肽标准品在Focus,Lumos上的线性与准确度。  用稀释剂(含0.1ug/μL BSA,1% FA,5% ACN)的稀释剂逐级 稀释特立帕肽标准品,配置成一系列浓度标准品,上样分析。 结果表明,Focus对特立帕肽的定量下限为50 pg/mL, 上样5μL,上柱约60 amol,标准曲线线性良好,R2=0.997,标 准曲线各点回算的浓度在理论值的15%以内。  特立帕肽的LOQ点在Focus和Lumos上的提峰图如图,峰型良 好,信噪比S/N10,重复5针的RSD10%,表现出了 良好的稳定性。图 Focus,Lumos上LOQ的峰图  2、特立帕肽血浆样品在Lumos上的线性与准确度。   同时在Lumos上考察了特例帕肽血浆样品的定量下限。取150 μL的空白人血浆,加入一系列浓度梯度的特立帕肽标准品,配 置成血浆标曲,用1:6体积的75% 乙腈沉淀后,离心去上清, 挥干,复溶后进样。 结果显示,Lumos对于基质复杂的血浆样品仍表现出良好的线 性,精密度,稳定性。特立帕肽最低定量下限为50 pg/mL,线 性范围50 pg/mL-50 ng/mL,1000倍的线性范围,上柱 量约60 amol,标曲各点Diff值 10%。  结论 本文分别在Obitrap Focus,Lumos上建立了大分子多肽类药物 特例帕肽的定量分析方法。结果表明,高分辩Obitrap对特立 帕肽表现出良好的定量能力,定量下限可以分别达到上柱60 amol,24 amol。同时,对于基质更为复杂的血浆样品,Lumos 上可以达到定量下限上柱60 amol,灵敏度满足临床上对特立帕 肽的检测要求。Obitrap作为高分辨质谱,在拥有超高分辨率的 同时,兼具出色的灵敏度和稳定性,可以应用大分子多肽类药 物的定量分析与检测。
  • PerkinElmer 推出 AxION 质谱分析平台
    马萨诸塞沃尔瑟姆 - 专注于提高人类健康及其生存环境安全的全球领先公司 PerkinElmer Inc. 今天宣布将在 6 月 5 日 至 9 日于科罗拉多州丹佛市举行的美国质谱学会 (ASMS) 年会上推出 AxION&trade 质谱分析平台。AxION 硬件和软件平台经过专门设计,能执行快速准确的质量识别与定量分析,可用于监控水质,确保生产生活用水以及药品和食品的安全。 &ldquo 在设计新款 AxION MS 硬件和软件过程中,我们致力于使仪器可以得出更加可靠的分析结果,从而让用户可以更好地保护环境和人类健康,&rdquo PerkinElmer 分析科学与实验室服务部总裁 Dusty Tenney 说。&ldquo AxION MS 平台可在较广动态范围内对复杂分子进行明确测定,因此更容易鉴别污染物和杂质。&rdquo 最先进 AxION 硬件与软件套件的结合使得质量控制和研究机构可以进行针对性明确又快速准确的定量分析。AxION 平台能帮助各公司为环境、食品和制药领域的客户提供更优质的产品和服务。 AxION 系统的速度和特异性可保证对已知和预料外的化合物进行明确地识别和定量分析,从而了解样品的全部特性。将分辨率和灵敏度完美结合的 AxION 平台有助于确定各种样品(包括环境土壤与水体、药物成分、食品的农药分析)的临界污染水平。 AxION 平台由下列旨在带来灵活性,实现定制工作流的硬件和软件组成: AxION 2 飞行时间质谱 (TOF-MS) 仪,有多种已获专利的离子源可供选择,包括双探针 Ultraspray&trade 2 ESI 和无场大气压化学电离 (APCI) 离子源。每个离子源均有可互换卡扣式探针,通过减少交叉污染提高了效率和用户灵活性。 AxION Solo&trade 软件拥有可用于单目标或多目标分析的结果实时查看系统,能够识别并量化许多样品中存在的已知物质。 AxION XPO&trade 软件具有可由用户定义的以颜色区分的结果视图,使实验室管理者能够方便地筛查大量样品。 AxION eDoor&trade 包可用于&ldquo 开放式存取&rdquo 环境。联网环境下,直观的用户界面可为客户提供从登录、方法选择到样品设置的整个分析过程的指导,并且可将结果通过电子邮件发送给客户。 有关 AxION 的详细信息,请访问 http://www.perkinelmer.com.cn/TOFMS?utm_source=instrumentDotComNews&utm_campaign=PR128638 关于 PerkinElmer, Inc.PerkinElmer, Inc. 是一家专注于提高人类健康及其生存环境安全的全球领先公司。据报道,该公司 2010 年收入约为 17 亿美元,拥有约 6,200 名员工,为超过 150 个国家/地区的客户提供服务,同时该公司也是标准普尔 500 指数的成员。有关其它信息,请致电 800-820-5046 或访问 www.perkinelmer.com.cn。 # # # 媒体联系人: Amanda L. Connolly Edelman(代表 PerkinElmer, Inc.) 电话: (404) 832-6785 电子邮件:amanda.connolly@edelman.com
  • MALDImini-1数字离子阱质谱仪糖肽分析
    聚糖是蛋白质的一种翻译后修饰产物,是一类拥有高结构异质性的分子,由葡萄糖、甘露糖和其他单糖复合键形成。已知此类复杂结构与蛋白质调节功能相关,且可根据不同疾病和其他因素,产生各种不同现象。其中包括蛋白质主链出现异常聚糖结构,并且可能在认为应该发生此类键合的位点却不存在聚糖键。关于复杂聚糖结构和聚糖与蛋白质结合位点的信息并非直接编码于基因中,而是在蛋白质生物合成过程中起效的大量聚糖转移酶发生反应时产生的。因此,必须对目标糖蛋白实施直接分析,进而了解糖蛋白上聚糖的结构与结合位点。 从抗体中提取的糖肽组分质谱图 糖肽的MS/MS质谱图(前体离子m/z 2796.2) 糖肽的MS3质谱结果 顶部:肽主链(前体离子m/z 1189.7)底部:包含根GlcNAc部分结构的肽主链(前体离子m/z 1272.7) 糖肽结构预测 MALDImini-1基质辅助激光解吸/电离数字离子阱质谱 MALDImini-1数字离子阱(DIT)技术是岛津的原创技术,紧凑迷你的体积,即可实现MS多级的检测。宽范围的分子量范围提供更多新可能,应用范围广泛:糖肽分析、抗体化学修饰位点、未知生物分子结构分析,蛋白质、多肽、翻译后修饰肽、脂质等。
  • 叶明亮团队开发N-糖肽质谱谱图解析新软件 解析率提升31%
    近日,大连化物所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)叶明亮研究员团队开发了一款具有高灵敏度的N-糖肽质谱谱图解析新软件——Glyco-Decipher。该软件可实现在解析谱图的过程中不依赖糖库,利用不同糖肽的同一肽段骨架具有相似碎裂规律的特点,发展出基于“模式识别”的肽段序列鉴定新方法,实现谱图拓展,从而提高完整糖肽的鉴定灵敏度,并且可发现未知的糖链及糖链修饰。Glyco-Decipher为深度解析位点特异性糖型,揭示糖基化修饰的微观不均一性,以及研究糖生物学功能等提供了新工具。  蛋白质糖基化与疾病的发生发展密切相关,临床上使用的大多数肿瘤标志物是糖基化蛋白质。在组学层次上进行位点特异性糖型的分析对发现新型疾病标志物,提高基于蛋白质糖基化的精准医学研究水平等具有重要作用。 N-糖肽质谱谱图高度复杂,谱图解析率低,且常规N-糖肽解析软件依赖糖库,无法实现未知糖链及修饰糖的鉴定。为解决上述问题,本工作开发了非糖库依赖的肽段序列鉴定方法,实现了未知糖链肽段及其上可能带有的修饰基团的鉴定。为解决N-糖肽质谱谱图解析率低的问题,团队系统研究了糖肽的碎裂规律,发现糖链的种类、组成、母离子价态等对肽段骨架的碎裂模式没有显著的影响,建立了肽段序列相同的完整糖肽谱图之间的联系,发展了基于“模式识别”的肽段序列鉴定策略,实现了完整糖肽的谱图拓展,在原有基础上将完整糖肽的解析率提升了31%。  本工作还以蛋白Prosaposin为例,展示了蛋白Prosaposin在老鼠的五个不同的组织中糖基化差异,进一步揭示了该蛋白上各个位点特异性糖型的丰度分布,展示了Glyco-Decipher在蛋白糖基化分析领域的应用潜力。通过对同一个N-糖肽质谱数据进行对比分析,发现Glyco-Decipher的谱图解析效率比其它软件提升了34-179%。该软件具有友好的用户界面和较好的定量比较功能,学术界可以免费使用(软件可从github下载)。  叶明亮团队长期致力于位点特异性糖型分析方法的发展,包括糖肽的富集方法和谱图的解析方法:在O-GlcNAc糖肽的富集方面发展了酶促标记结合化学氧化法(Anal. Chem., 2021)、可逆酶促化学标记法(Angew. Chem. Int.Edit., 2022)等方法;在O-GalNac糖肽的富集方面发展了酶解辅助的亲水作用色谱法(Anal. Chem., 2017)、酶化学方法(Anal. Chem., 2018)、Ti-IMAC富集方法(Anal. Chem. 2021)等;在N糖肽的富集方面发展了适合大样本分析的自动化富集方法(Anal. Chem., 2021);在O-GalNac糖肽的谱图解析方面,发展了O-search检索策略(Anal. Chem., 2019),有效地减小了检索空间,提高了鉴定灵敏度。最近,上述检索策略被集成于一款具有自主知识产权的谱图检索软件——MS-Decipher(Bioinformatics, 2022)中。  相关研究成果以“Glyco-Decipher Enables Glycan Database-independent Peptide Matching and in-depth Characterization of Site-specific N-glycosylation”为题,于近日发表在《自然-通讯》(Nature Communications)上。该工作的共同第一作者是大连化物所1809组博士研究生方正和秦洪强研究员。上述工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、大连化物所创新基金等项目的支持。
  • 江苏省环境监测中心采购7台质谱及35台水质分析仪
    江苏省环境监测中心环境监测系统及仪器招标公告 JSZCG2011152   江苏省政府采购中心受江苏省环境监测中心的委托,决定就其所需的环境监测系统及仪器进行公开招标采购,现欢迎符合条件的合格供应商投标。   一、招标项目名称及编号   项目名称:环境监测系统及仪器   标书编号:JSZC-G2011-152   二、招标项目简要说明   本项目为江苏省环境监测中心环境监测系统及仪器系统,包含设计、生产、安装、调试及相关服务。 分包号 名称 数量(套) 备注 1 在线固相萃取/高效液相/质谱联用仪 1 安装在湖心观测站,要求连续在线监测,质保期(三年),质保期内负责仪器的运行维护,应包含三年期间的备品备件更换及报价 ,须详细列出确保本包仪器设备质保期正常运行所需的备品备件型号、数量和报价 2 高效液相/复合质谱仪 1 1、高效液相色谱仪1台(包括二元高压梯度泵,在线脱气机,柱温箱、自动进样器);2、二极管阵列检测器1台;3、荧光检测器1台;4、三重四极杆质谱仪1台,独立的ESI源和APCI源各1个 3 高效液相/飞行时间质谱联用仪 2 液相色谱仪、QTOF飞行时间质谱仪各2套,每套配大流量氮气发生器 4 高效液相/质谱联用仪 3 高效液相色谱仪和三重四极杆质谱仪各3套,每套配大流量氮气发生器 5 便携式多参数水质分析仪 35 6 振荡器 2  本次采购共6个分包,按分包中标。   三、供应商资格要求   投标人必须符合《政府采购法》第二十二条的有关规定并具备以下条件   符合政府采购法第二十二条规定并具备以下条件   (1)投标人必须是在中华人民共和国境内注册的、具有独立法人资格   (2)若投标人不是投标产品原厂家的,投标人必须具有所投主要产品的生产者或驻中国办事机构对其参加本项目出具的授权书。   (3)投标人具有独立完成设备供货、安装、调试及维护其正常运行的能力,中标后不允许分包、转包   (4)本次招标不接受联合体投标。   (5)本次采购接受进口产品投标   四、招标文件发布信息   招标文件发布时间:自招标公告在“江苏政府采购网”发布之日起至投标截止时间止。招标文件在“江苏政府采购网”上免费下载,供应商如确定参加投标,请如实填写参与投标确认函并按要求传真回复(传真号码:025-83633800)。如供应商未按上述要求去做,将自行承担所产生的风险。有关本次招标的事项若存在变动或修改,敬请及时关注“江苏政府采购网”发布的信息更正公告。   五、投标文件接收信息   投标文件接收时间:2011年10月13日上午8:30-9:30整   投标文件接收截止时间:2011年10月13日上午9:30整   投标文件接收地点:南京市虎距关21号金盾饭店六楼会议室   投标文件接收人:付钢   六、开标有关信息   开标时间:2011年10月13日上午9:30整   开标地点:南京市虎距关21号金盾饭店六楼会议室   七、本次招标联系事项   江苏省政府采购中心地址:南京市山西路43号4楼   邮编:210009 网址:http://www.ccgp-jiangsu.gov.cn:8081/   采购中心联系人:付钢 联系电话:025-83633820   技术咨询:江苏省环境监测中心 唐梦涵 咨询电话:025-86575221   八、投标文件制作份数要求:   正本份数:1份 副本份数:6份   九、本次招标投标保证金   投标保证金金额为人民币贰万元整   投标保证金必须在投标截止期前与投标文件一起送达开标地点(不要密封在投标文件中)。   户名:江苏省政府采购中心   开户行:招商银行南京分行城西支行   账 号:07797251081455910001   投标保证金应以在中国注册的银行出具的银行本票(同城)、银行汇票(异地)。采购中心不接受转帐\现金\转帐支票或其他形式的保证金.
  • 大庆市生态环境局预算328万元购买在线式气相色谱质谱联用分析仪等多台仪器
    3月27日,大庆市生态环境局VOCs自动监测站公开招标,购买在线式气相色谱质谱联用分析仪、在线式气相色谱分析仪、氮氧化物分析仪等多台设备,预算328万元。  项目编号:DZC20201539  项目名称:大庆市生态环境局VOCs自动监测站仪器设备采购项目  采购需求:序号名称规格参数/项目特征/服务要求单位数量1在线式气相色谱质谱联用分析仪1.仪器应用要求1)#适用于挥发性有机物的在线分析,满足环境空气挥发性有机物的定性定量分析;满足环保部《2018年重点地区环境空气挥发性有机物监测方案》(环办监测函〔2017〕2024 号)规定的VOCs在线监测设备的应用要求,仪器采用GC-MS/FID法。2)连续24小时在线监测环境空气中可挥发性有机物。监测项目应满足通用的臭氧前驱体标准(PAMs)监测项目,同时可监测环境空气中卤代烃、含氧化合物等挥发性有机物,监测项目≥116种。3)产品须满足《环境空气挥发性有机物气相色谱连续监测系统技术要求及检测方法》(HJ 1010-2018)中的要求。2.仪器工作环境1)工作环境温度: 20-30℃。2)工作环境湿度:≤ 85%R.H. (无冷凝)3)电源:单相200-240V@50 Hz,电流大于10A。3.仪器主要技术指标采样模块1)进样捕集模块:采用低温除样品中水分,低温填料富集目标VOCs;不使用液氮富集冷阱装置,采用单级小型制冷机实现低温,降温至少至摄氏-40℃,可浓缩富集 C2-C12 碳氢化合物,保证目标化合物有效捕集及脱附,满足高挥发性化合物的捕集需要;2)软件可全自动进行系统状态和性能检查,自动完成多点校准曲线绘制和方法切换;3)热解析模块:可在15秒内快速加热至除水、解吸样品等过程所需要的温度,保证干扰物去除,目标化合物被迅速解析、进样,达到良好的分离效果;4)系统控制软件可完成采样、捕集、热解吸、分析,加热反吹等全过程自动控制;5)采用高精度电子质量流量模块精确控制采样流量和采样体积;6)采用分流进样,分流比可设置为5:1到90:1,可有效应对高浓度污染因子监测。色谱分离模块1)色谱柱模块正常分析时,功耗小于80W;2) 色谱柱温度控制:室温+10℃到300℃;从300℃降温到50℃不超过1分钟;3)色谱柱系统:低热容毛细管柱,柱上直接加热,低功耗,高集成度,无需柱箱;FID检测器模块1)全自动电子压力控制;2)全自动点火,熄火自动保护;3)在线仪器专用FID检测器。质谱检测器1)离子化方式:EI;2)质量分析器:四极质谱检测器;3)为确保测试间隔无残留,除离子源及传输模块可高温加热外,质量分析器可独立高温加热;最高温度可加热至240度;4)质量稳定度≤0.1amu/12 h;5)质谱最大扫描速度不低于:10000amu/s;6)质量准确度≤0.1amu;7)质量范围:10-500amu;8)质量分辨率:优于单位质量分辨率;9) 真空系统:无油涡卷泵(或隔膜泵)+分子泵组合,真空系统无油设计;10)启动及恢复时间:开机抽真空到分析,时间不超过20分钟。意外断电后可以自行恢复测试,确保数据获取率达到国家要求;4.仪器性能1)可分析组分:大气中挥发性有机物,包括PAMS(57种),TO15组分(65种),OVOC(12种)等有机物;满足《2019年地级及以上城市环境空气挥发性有机物监测方案》(环办监测函〔2019〕11 号)规定的在线监测物种要求;2) 方法检出限:C2-C5,采用FID检测器;MSD测量C6-C12范围的碳氢化合物、C2-C5碳氢化合物:≤0.08ppb(丙烷); 碳氢化合物:≤0.06ppb(丙烯);C6-C12碳氢化合物:≤0.09ppb(甲苯)、≤0.03ppb(苯)、≤0.06ppb(正壬烷);卤代烃类挥发性有机物:≤0.08ppb(1,2-二氯丙烷)、≤0.08ppb(四氯化碳);含氧(氮)类挥发性有机物:≤0.13ppb(甲基叔丁基醚)、≤0.09ppb(丙酮);硫化物类VOCs:≤0.06ppb(二硫化碳);3)量程范围:不低于50 nmol/mol;4)长时间保留时间漂移:≤0.5min;5)方法线性:全部目化合物的线性相关系数≥0.98;6)重复性和稳定性:连续7次以上测定同一浓度目标化合物的标准气体,不少于90%的目标化合物RSD小于10%;7)所有物种系统残留均小于0.1nmol/mol;8)数据有效率≥85%;9)分离度≥1.0(以分离环戊烷及异戊烷为准);10)供电及功率:220VAC±10%,50Hz ,≤1000瓦(含峰值)11)色谱-质谱联用仪主机及前处理设备宽度不超过480mm,系统可集成在19英寸机柜内,与空气常规因子监测仪器安装形式保持一致,便于产品后期的安装与运维。 5. 数据分析1)数据分析系统具有报警管理功能,当设备出现故障、数据超过限定值,会通过短信或者邮件方式告知用户;2)基于自动寻峰算法,通过指数算法自动识别,可以快速筛查同分异构体,进行VOCs组分的准确定性定量分析;3)能够分析VOCs随时间变化规律,计算OFP臭氧生产潜势等参数,反映光化学污染状况及演变规律;4)能够集成气象五参数分析仪,O3/NOx等常规分析仪,GPS及GIS等监测数据进行关联分析。套12在线式气相色谱分析仪(甲烷/非甲烷总烃)1)监测项目:环境空气甲烷、总烃、非甲烷总烃;2)#分析方法:气相色谱法;采用总烃扣除甲烷差值法,符合《环境空气 总烃、甲烷和非甲烷总烃的测定 直接进样-气相色谱法》(HJ604-2017)方法要求;3)温控系统:阀箱和柱箱独立控制,柱箱最高温度≥175℃;阀箱最高可控温度≥175℃;4)色谱柱:非甲烷总烃采用填充柱带反吹功能;总烃采用空柱;仪器带反吹功能可对甲烷柱进行反吹;5)压力/流量控制:满足全自动在线监测的需求,仪器采用全电子压力/流量控制(载气,氢气,空气),具有保留时间锁定和自动校准功能;6)FID检测限:优于0.01ng/s;7)数据捕获率:≥99%;8)检出限:≤0.015mg/m3;9)检测限:≤6.4×10-13g/s;10)基线漂移:≤6.0×10-14A/30min;11)噪声:≤8.0×10-15A;12)重复性:≤0.5%;13)量程漂移(非甲烷总烃):≤0.5% FS;14)实际测试3台设备平行性:≤2%;15)停电后,能自动保存数据;停电恢复后,监测仪能自动恢复到原来的工作状态;具备自动校准功能;能够记录储存半年以上的数据,具有历史数据查询、导出功能;16)进样流量、供电电压影响:≤2% FS;17)氧气的影响:≤2% FS;18)绝缘电阻和绝缘强度符合要求;19)人机交互要求:分析仪表具有内置工业PC机和触摸操作显示屏;20)分析软件采用全中文操作,能进行所有维护诊断功能操作,能监控并记录仪器的阀箱温度、柱箱温度、载气压力、柱前压力等各项运行参数,可设置自动控制仪器的运行参数,自动进行数据处理,实现对外通讯。套13SO2分析仪设备用途1)用于空气中二氧化硫浓度的监测配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:紫外荧光法2)量程范围:0-500ppb到0-20ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.5ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S.6)检测下限:1.0ppb7)零点漂移:≤1ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:12)样气流量:(650±65)sccm产品性能要求1)具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级;6)具备光源光强衰减自检功能7)产品中软件系统获得计算机软件著作权登记证书8)产品通过CCEP认证。套14氮氧化物分析仪设备用途1)用于空气中NO、NO2、NOx浓度的监测;配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)分析方法:化学发光法2)量程范围:0-500ppb到0-20ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.2ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S.6)检测下限:≤0.4ppb7)零点漂移:≤0.5ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级。6)产品中软件系统获得计算机软件著作权登记证书。7)产品通过CCEP认证。套15一氧化碳分析仪设备用途1)用于空气中一氧化碳浓度的监测配置要求1)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:气体滤波相关红外吸收法,对环境空气中的一氧化碳进行实时监测。2)量程范围:0-50ppm到0-1000ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb、ppm、μg/m3、mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.1ppm(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S6)检测下限:≤0.1ppm7)零点漂移:≤0.1ppm/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:产品性能要求1)具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级;6)具备光源光强衰减自检功能;7)产品具有GFC轮定位及同步采样功能;8)产品中软件系统获得计算机软件著作权登记证书;9)产品通过CCEP认证。套16臭氧分析仪设备用途1)用于空气中臭氧浓度的监测配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:紫外吸收法2)量程:0~500ppb到0~10ppm,可选双量程和自动量程3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.3ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S6)检测下限:≤0.6ppb7)零点漂移:≤2ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级;6)具备光源光强衰减自检功能。7)产品中软件系统获得计算机软件著作权登记证书;8)产品通过CCEP认证。5) 水箱容积:2.5L6) 压缩机:旋转式7) 体积:330*300*520mm8) 重量:10kg套1
  • 汇健科技:构建完善的质谱平台,为肿瘤早筛及精准诊断提供解决方案
    质谱技术作为重要的生命科学分析工具,在灵敏性、特异性、准确度、检测速度、检测通量等方面独具优势。目前基于LC-MS平台的靶向质谱方法已在临床检验中得到应用,基于非靶向质谱技术的创新应用也已初露锋芒。汇健科技基于激光解吸离子化质谱平台,融合了纳米材料、质谱技术、人工智能等多种技术,形成了仪器+试剂+软件+算法模型的完整非靶向质谱检测系统。所构筑的高技术壁垒质谱平台,以其高通量、高稳定性、高准确性、易操作及低成本的优势,为肿瘤早筛及精准诊断提供新的解决方案。本文摘录了汇健科技创始人邬建敏的采访内容,深入了解汇健科技提供的肿瘤早筛创新的解决方案。  “3T”构建肿瘤早筛创新技术平台,让“一平台,多组学联检”成为可能  质谱技术可输出丰富的分子定性及定量信息,因而在临床检测领域正扮演着越来越重要的角色。近年来,临床质谱检测已经逐渐成为一颗极富潜力的新星,有望成为IVD领域的下一个爆发点。  基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是近年来发展起来的一种新型的软电离生物质谱,该质谱技术能对生物样本中的蛋白、多肽、核酸、代谢小分子等的进行分析。由于其分析速度快、通量高,操作简便等特点,MALDI-TOF质谱是现阶段最有希望大规模走进医院检验科开展临床诊断和筛查的质谱技术。  自21世纪以来,国际学术界及科技创新公司一直在探索MALDI-TOF质谱技术在临床诊断领域的应用潜能。例如,美国Bruker公司率先在MALDI-TOF质谱平台建立了微生物质谱数据库,并获得了FDA医疗器械注册证。随后全球多家IVD公司涉足了微生物质谱领域,极大地推动了质谱技术的临床应用。  Agena(原Sequenom Bioscience)公司建立了核酸质谱分析平台,开展SNP分型检测业务,但更多地在LDT服务领域应用。在肿瘤诊断领域,国际上也有少数公司曾基于MALDI-TOF质谱平台开展肿瘤诊断产品的开发。比如,澳大利亚的HealthLinx公司曾利用该质谱平台开发卵巢癌诊断试剂和诊断方法。美国Biodesix公司曾开发了一款基于蛋白谱分析的诊断产品,用于非小细胞肺癌患者的用药指导和预后判断的产品。  我国近年来加大了质谱在精准医疗应用的政策支持力度。国家科技部2017年设立了“精准医学临床质谱专项”,大力推动质谱在精准医疗领域的应用。一些大型第三方医学检验实验室利用相对成熟的LC-MS靶向质谱平台开展临床检验服务,如新生儿遗传代谢物,药物浓度,激素浓度,维生素浓度等检测。基于MALDI-TOF平台,国内一些成熟的上市公司获得或正在报批微生物及核酸质谱的NMPA医疗器械注册证,如安图生物、华大基因等。难能可贵的是,最近几年国内涌现了一批致力于质谱仪器、临床质谱新技术及新产品研发的创新型公司。上述公司在质谱产业链中各有侧重,自主研发质谱仪器、质谱方法学、质谱试剂及耗材、质谱数据分析及诊断解读软件等。  汇健科技采用了国际领先的颗粒原位MALDI-TOF MS分析技术(On-particle Detection-MS,简称OPD-MS)及芯片原位检测技术(On-chip Detection-MS,简称OCD-MS),大大简化了临床样本预处理和检测过程,为多肽、代谢、基因等多组学标志物的发现和检测提供高效的技术手段。    基于“3T” 技术的全新一代肿瘤精准诊断及筛查平台  汇健科技的质谱技术平台由“3T”组成——BT(Biotechnology 生物学技术)、MT(Materials Technology 材料学技术)、IT(Information Technology信息学技术),邬建敏详细讲述了采用“3T”技术搭建肿瘤早筛平台的过程。  汇健科技研发人员前期做了大量的文献检索及生物信息学相关的基础研究(比如组学代谢通路及信号通路的研究等),并参考了大量中外文献,发现血清中的内源性多肽、尿液以及唾液中的多肽及代谢物与疾病,尤其是与肿瘤具有极强的相关性。这为探索肽谱及代谢谱在肿瘤等疾病筛查、诊断、分型等的临床应用奠定了生物学基础。  然而血清中的内源性多肽在血清中丰度低、易降解、受高丰度蛋白干扰大,因而血清内源性多肽质谱检测的稳定性和重现性难以实现,限制了肿瘤肽谱的临床应用。为满足体外诊断的检测质量要求,实现肿瘤肽谱在临床诊断中真正应用,汇健科技运用半导体材料原理,开发了Bio-pSi® 纳米材料显著提升了捕获、富集、保护内源性多肽的效果,使得多批次大量样本检测的重现性和准确度有了质的飞跃。目前,汇健科技对血清多肽质谱检测的CV控制水准达到领先水平。  此外,汇健科技针对代谢物在MALDI-TOF平台检测易受传统有机基质背景干扰、信号强度低、代谢物种类覆盖率低等问题,开发了一些列纳米质谱芯片和耗材,实现了血清、唾液、尿液、细胞、组织等多元样本中的小分子代谢物及脂质代谢物高通量检测,极大地扩展了激光解析离子化质谱技术的应用领域。同时,汇健科技还开发了微生物质谱芯片和核酸质谱芯片,性能达到国际对标产品的水准。上述质谱芯片系列产品让“一平台,多联检”成为可能,并有望扩展MALDI-TOF质谱的临床应用场景。上述材料技术(MT)的创新使汇健科技具备了核心差异化优势。  由于非靶向质谱技术数据量庞大,标志物的发现、寻找、确认及诊断模型的建立均需经过大数据分析及AI算法建立模型。因此,汇健科技的生信研发团队在质谱信息的数据挖掘方面具有深厚的积累,建立了一批用于质谱数据评价、分析、数据库构建、建模和判别等软件,获得了一批临床质谱软件著作权,并构建了云数据库。汇健IT技术的赋能使得MALDI-TOF质谱具备了数据学习和智能诊断的能力。 ClinMS-Plat® I 肿瘤肽谱检测应用系统,筑起技术高壁垒  基于先进的半导体纳米技术和人工智能算法,汇健科技的科学家团队建立了高通量临床质谱及人工嗅觉传感系统两大技术平台,依托上述平台型技术获取多元样本、多组学、多维质谱数据库,解决临床质谱产业化瓶颈,开发了国内首套ClinMS-Plat I 肿瘤肽谱检测应用系统。这套应用系统集ClinMS-Plat I 全自动多肽分析质谱仪、Bio-pSi® 血清肽谱检测试剂盒和 HJ Cloud™ 分析软件为一体,形成“试剂+仪器+软件(AI算法)+数据+服务”的闭环产业模式,拥有专利、软著、商标等自主知识产权四十余项,构成技术与商业模式双壁垒。    汇健科技聚焦高通量多肽组和代谢组学,通过对多元样本的双组学分析,构筑肿瘤质谱数据库,并通过AI算法建立和优化诊断模型,实现对多种肿瘤的高敏感性和高特异性的辅助诊断,可以广泛应用于疾病筛查及监测、精准诊断、预后判断、用药指导和疗效监测等多个临床环节,有望成为下一代无创诊断的液体活检平台。  邬建敏说,汇健科技ClinMS-Plat I 肿瘤肽谱检测系统仅需微升级别血清样本,操作简便、每批血清样本通常可在半个工作日内即可出检验报告,同时,产品稳定性及重复性好,诊断正确率远高于现有的肿瘤标志物,检测价格显著低于同类液体活检产品。血清样本更容易被医院的检验科接受,而且患者的依从性比较好。另外,汇健科技这套ClinMS-Plat I 肿瘤肽谱检测系统还可拓展至肺癌、胃癌、肝癌和乳腺癌等多癌种的筛查。初步数据显示多种瘤种的诊断准确性超过或接近90%。目前,公司研发人员正在开展大规模临床样本测试,已经证明了基于肿瘤肽谱的液体活检技术兼顾了敏感性和特异性,优势明显,是比较理想的全新一代液体活检技术。  启动常津采-LungScr项目, 推动肿瘤筛查  为推动肺癌肿瘤早筛,2021年3月,汇健科技旗下的杭州汇健智谱医学检验实验室有限公司发起了常津采-LungScr真实世界研究项目,国内多家知名三甲医院共同参与进行回顾性及前瞻性临床研究。该项目致力于利用唾液无创诊断技术提供院外肺癌筛查和肺结节管理,辅助医生进行患者管理、减少诊疗压力。公司利用OCD-MS平台,仅需少量唾液就能采集到丰富的人体代谢组信息,并通过机器学习等算法挖掘与疾病关联的代谢标志物。    常津采-LungScr项目招募10000名志愿者,涵盖了健康人群、肺结节等肺部良性疾病患者、肺癌患者。通过线上与线下收样模式对志愿者唾液进行代谢组检测,构建基于唾液代谢组的肺结节管理模型,可在完全无创的情况下快速区分早期肺癌患者与健康志愿者,进而实现肺部健康评估。  邬建敏说,汇健科技目前组建了超过8家多中心的临床研究团队,常津采-LungScr™ 项目分为四个阶段开展工作,包括流程验证、检测模型的稳定性验证、准确性验证、规模化服务等环节。研究团队利用汇健科技自主研发的唾液代谢组高通量质谱平台,已经检测数百例临床唾液样本,在唾液中发现了多种与肺癌相关的特异性标志物,对早期肺癌的检测敏感性达90%以上。同时,公司也正在进行前期的市场教育、宣传的工作,让基于硬科技的健康管理模式被更多的医疗机构、社区、个人所接受。  邬建敏表示,常津采项目是系列项目,除了目前正在进行的常津采-LungScr项目,之后也会开展更多的子项目,包括常津采胃癌项目等。  肿瘤肽谱与多组学联检相结合,建立肿瘤全流程管理系统  肿瘤到癌变是非常复杂的生物学过程,从系统生物学来看,肿瘤的发生可能会在基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多个组学层面发生一系列的变化,用单一指标可能很难真正判断出肿瘤的状态,多标志物及多组学联检可以进一步提升筛查及诊断的敏感性和特异性。汇健科技聚焦在多肽组学及代谢组学开展多元样本(血液、尿液、唾液、细胞、组织等)的多指标肿瘤联合检测。未来,汇健科技也将与更多不同组学的公司展开合作,为医生及患者提供更丰富的多组学疾病信息,推动癌症早筛技术的发展。  多组学诊断技术除了可用于肿瘤筛查与诊断之外,还可以对同一种肿瘤进行分型。许多恶性肿瘤有多个不同的亚型,不同的肿瘤亚型的用药方案、治疗方案都不一样。另外,还可以通过多组学技术监测肿瘤的复发、转移等。邬建敏说:“多组学联检的应用场景更加广泛,肯定是未来早筛及精准医学的一个方向。”  基于多组学技术的肿瘤早筛仍处于萌芽阶段,其发展有很大的空间。邬建敏表示,组学诊断技术的发展并不会阻碍现有的血清肿瘤标志物在临床检验中的应用。我们在对肠癌诊断的数据表明,血清多肽组学与传统的血清肿瘤标志物相结合,可以进一步提高诊断的准确性、敏感性、特异性。  未来,汇健科技将通过两方面推动质谱技术在肿瘤早筛及精准诊断中的应用,一是把组学标志物与传统肿瘤标志物进行联检。目前,汇健科技拟与大型IVD企业合作,推动组学技术与传统肿标技术的联合运用 二是通过组学技术的数据挖掘开发肿瘤全流程管理的联合应用场景,覆盖筛查、诊断、分型、愈后、疗效监测、复发转移监测等。邬建敏说,目前大型医院的肿瘤内科和肿瘤外科都希望建立一整套肿瘤全流程管理系统,汇健科技将以肿瘤肽谱和代谢谱作为新一代液体活检产品的发力点,可以满足这样的临床需求。  汇健科技将纳米材料技术、质谱技术和人工智能技术相结合,构筑具备临床价值和产业化价值的体外诊断产品和服务管线。未来,汇健科技将基于自主研发的组学诊断产品和服务,撬动临床质谱在肿瘤早筛的应用市场。  关于汇健科技  杭州汇健科技有限公司是一家由科学家和企业家联合创建的高科技公司,企业的宗旨是服务于人类健康、生活质量和生命安全。公司坚持以技术创新为核心,以感知-汇知-智慧为理念,服务全球医疗健康产业。基于自主研发的新型纳米芯片和微纳颗粒可实现体液和组织样本的高通量高灵敏质谱数据采集,结合深度学习和机器学习等AI技术以及即将推出的ClinMS-Plat I 临床质谱系统,将构成新一代的液体和组织活检平台。相比于传统的体外诊断和组织活检工具,该平台将提供更为丰富和准确的诊断信息,未来将应用于疾病筛查、精准诊断、用药指导、药物反应监测和手术指导等医学领域。
  • 天瑞诊断携手扬州大学共建呼气质谱检测平台
    2023 年," 产研 " 融合仍在加速。  越来越多高校科研人员正走向产业端,试图实现理论落地 与此同时,更多企业也在选择与高校科研院所联手,布局源头创新。  在临床检测领域,同样的故事也在上演。  4 月 10 日,天瑞诊断与扬州大学达成战略合作,双方将共建气质联用检测平台,针对基于 " 气相活检 " 呼出气体 VOCs 的肺结节性风险识别与早诊的关键技术进行应用研究,力图建立高危人群肺结节恶性风险评估及精准早诊的指标体系和关键技术,构建肺癌早诊预测模型及筛查评分体系,最终形成基于我国人群的临床肺结节恶性风险评估方案,并在扬州地区形成应用示范。随着技术突破和临床应用推广,呼气检测在癌症、感染性疾病、重症医学疾病、慢病等领域,有望成为如同影像诊断、血检诊断常见应用的新型 IVD 辅助诊断方式。近十年来,全球呼气检测技术迎来极大飞跃,呼气诊断新蓝海隐隐浮现。  携手扬州大学,加速推动呼气 VOC 检测进展  现有的 IVD 诊断方法很难在精准性、可及性和低成本实现三角平衡。而呼气检测以其无创性、取样简单、速度快等优势提高患者依从度高。若通过技术创新使检测仪器在保证精确度的前提下,实现小型化和成本的有效控制,便能平衡呼气检测在大范围临床应用上所需的精准性、可及性和低成本。这不仅能改变现有的诊断产业,也将改变整个医疗和健康体系的诊断治疗生态。  在过去的几年,呼气这一全新的疾病诊断载体得到了迅猛发展。2022 年,FDA 紧急授权首个基于呼吸 VOC 分析的新冠病毒检测产品,可在医院、医生办公室、公共场所、移动检测站等多个场景下使用,不到三分钟即可获取检测结果。这一事件,是官方对呼气 VOC 检测的肯定,让行业清晰看到了呼气 VOC 检测在临床的具体落地场景。  扬州大学医科有着 70 多年办学历史,拥有临床医学一级学科博士学位授权点,临床医学博士专业学位类别,中西医结合、临床医学 2 个博士后流动站,7 个硕士学术学位授权一级学科、5 个硕士专业学位授权类别、7 个本科专业。近年来承担国家重点研发计划、国家自然科学基金等省部级以上课题 400 余项,取得了一大批高水平科研成果,产生了重要的社会和经济效益。  扬州大学测试中心始建于 1982 年,拥有现代化实验室 6259㎡,组建了一支高水平的专业技术队伍,硕博占比超过 90%,可开展无机物分析、有机物分析、材料微区与物相分析、生物材料分析、环境检测、机械产品检测等项目,其中 8 大类 29 小类 196 项通过了《中国国家认证认可监督委员会》的审查,取得了《国家检验检测机构资质认定证书》(CMA),是具备高水平的一流检测实验室。  天瑞诊断是临床质谱诊断整体解决方案综合服务提供商,具备从样本前处理环节到产出报告的整体解决方案,旗下拥有镇江、扬州、盐城、淮安四家精准医学实验室平台,可提供包括生化、免疫、质谱、微生物、分子病理、科研等在内的千余项检验项目及百余项特色项目,同时提供第三方检验、临床科研和合作共建精准医学中心等服务。  新冠病毒流行期间,基于天瑞诊断旗下开设的扬州地区精准医学实验室平台,天瑞诊断与扬州大学附属医院进行相关检测项目合作。恰逢 2021 年 6 月,扬州大学成立公共卫生学院,疾病预防成为学院临床研究的重点方向之一,扬州大学与天瑞诊断达成合作共识,建立大学、医院与公司 " 三位一体 " 气质联用检测平台,利用产学研合作加速推动气质 VOC 产品开发及临床落地。  呼气 VOC 检测平台:GC-MS 与医学诊断 AI 一体化  常见的呼气检测在临床上已有广泛的应用,大多集中在幽门螺旋杆菌检测、醉酒检测、CO 检测新生儿黄疸、NO 检测哮喘等项目,这些呼气检测对于大众来说并不陌生,技术也较为成熟。呼气 VOC 检测与呼气检测的根本区别在于,前者检测的是有机物而非无机物分子。  呼气 VOC 能被发现诊断疾病,离不开高精密度的色谱和质谱分析技术,这些技术对仪器本身以及数据分析都有着极高的要求。呼气中 VOC 的含量通常非常稀少,低至百万分之一(ppm~10-6)甚至十亿分之一(ppb~10-9)的水平,需要应用特殊的样本前处理技术及灵敏度极高的仪器对其进行检测。  目前,已有 VOC 检测设备主要包括气相色谱仪(GC)、气相色谱质谱联用仪(GC-MS)、质子转移反应质谱仪(PTR-MS)、离子迁移谱技术、气体传感器等。  在这几种检测仪器中,科研应用最广泛的是高灵敏气相色谱质谱联用分析系统(GC – MS)。GC – MS 分析系统,结合了气相质谱和质谱的优点,能够同时对样品进行色谱分离和质谱数据采集,也足够灵敏地去量化 ppb 水平的 VOC,具备临床使用的技术特征。  如果要将气体 VOC 检测用于临床疾病辅助诊断,则首先需要在科研中寻找到生物标志物。此次合作,天瑞诊断将利用基于 GC – MS 气相色谱质谱联用仪打造的完整呼气检测平台,全流程覆盖从气体收集、吸附管、热脱附系统将气体释放到数据分析环节。  考虑到检测目标为非靶向的检测所有标志物,在样本量庞大且复杂的情况下,进行人工智能(AI)的数据分析就成为获取可信结果的重要手段。通过打造医学诊断 AI 一体化,天瑞诊断开发了智能诊断平台和大数据可视化软件,主要通过数据清洗与预处理、特征性 VOC 筛选、模型验证等操作,进行 VOC 海量数据的智能分析,以有效发现并验证可信的生物标志物。  目前,天瑞诊断通过前期摸索的数据分析方法,已经取得 1 项发明专利。同时天瑞诊断还提前开发出人群筛查的管理软件,能够实现无缝对接气体检测的相关数据。  基于目前天瑞诊断已成熟的呼气 VOC 检测平台,天瑞诊断与扬州大学将通力合作,力图建立高危人群肺结节恶行风险评估及精准早诊的指标体系和关键技术,形成基于我国人群的临床肺结节恶性风险评估方案,推动我国气相检测应用于临床的进一步发展。  天瑞诊断:自研样本制备系统已实现全自动化,提供临床质谱整体解决方案  提供完备整体解决方案的天瑞诊断,除了具备利用气质联用平台进行智能诊断开发的能力外,在液相色谱串联质谱上,天瑞诊断也有一整套完备的解决方案。  天瑞诊断提供的整体解决方案包括质谱专用实验室的新建 / 改造、质谱技术人员培训、前处理设备(全自动智能样品制备系统)、液相色谱串联质谱仪及全自动智能样品制备系统配套试剂。其中,前处理设备全自动智能样品制备系统 RZ-01 是天瑞诊断目前进展最快的仪器设备,可实现样品全自动化前处理,无需人工干预。  天瑞诊断全自动智能样品制备系统 RZ-01  RZ-01 是根据液相色谱串联质谱平台自动化处理的需求,结合天瑞诊断自身在质谱临床检验方面多年的经验积累而开发的前处理系统,它以自动化的搬运、夹爪机构为中心,配备轨道式的移动传输设备,将可替代人力完成液质样品全自动前处理,涉及样品开盖、传输、离心、震荡、移液、浓缩、氮吹、过 SPE 装置等 整个处理过程将样本前处理进行全自动化,替代目前的人工处理,可有效解决临床质谱在临床检验中的应用遇到的问题,提高临床质谱标准化应用。  利用天瑞诊断提供的整体解决方案,天瑞诊断已经与浙江大学、东南大学、江南大学等国内多所高校建立合作关系,在寻找各类疾病生物标志物、打造实验室等项目上,共同推动中国精准医学进一步发展。
  • 瑕瑜团队新成果:基于质谱的脂质异构体分析有助于疾病诊断与靶点发现
    近期,清华大学化学系瑕瑜教授课题组与清华大学药学院尹航教授课题组以及北京清华长庚医院王韫芳研究员团队合作在Angew. Chem. Int. Ed杂志上发表了题为 “sn-1 Specificity of Lysophosphatidylcholine Acyltransferase-1 Revealed by a Mass Spectrometry-based Assay” 的文章。第一作者为清华大学化学系博士生赵雪与梁家琦,通讯作者为瑕瑜教授。该工作首次揭示磷脂酰胆碱酰基转移酶1(LPCAT1)在合成胆碱甘油磷脂 (PC)时对甘油骨架的sn-1位置具有选择性 该选择性与LPACT1在人肝细胞癌组织中的高表达直接导致了sn位置异构体PC 18:1/16: 0的显著升高。以上研究对于发展基于脂质异构体分析的新型疾病诊断与靶点发现具有启示意义。  LPCAT1是细胞内PC的合成通路中脂质重塑过程关键的酶。已有相关研究表明,LPCAT1在多种癌症组织中表达上调并且对饱和或单不饱和的酰基辅酶具有选择性。然而LPCAT1对甘油骨架sn位置的选择性还尚不明确,这主要是由于sn位置异构体难以区分与定量。2019年瑕瑜教授课题组利用PC碳酸氢根加合物([PC+HCO3]-)在串级质谱中碎裂产生的“sn-1 frag.”实现了sn位置异构体的定性与定量(Zhao X, Xia Y, et al. Chemical Science, 2019, 10:10740)。基于此,本工作建立了测定LPCAT的sn位置选择性的LC-MS流程。作者以sn-1 LPC和sn-2 LPC的混合物为底物,LPCAT1过表达的HEK 293T细胞膜碎片作为酶源,加入酰基辅酶,37℃下进行孵育。酶反应产物通过反相液相色谱(RPLC)中分离及质谱检测 其与内标的色谱峰面积比对总的合成产物(sn位置异构体之和)进行定量。继而对酶反应产物的碳酸氢根加合物进行串级质谱分析,通过“sn-1 fragment”的百分比对sn位置异构体进行定量(分析流程如图1)。继而通过建立sn-1 LPC和sn-2 LPC的酶反应动力学曲线,比较动力学常数来确定sn位置选择性。  图1. LC-MS/MS流程用于定量分析LPCAT催化所产生的PC sn位置异构体  鉴于不同分子量的PC分子可以在RPLC中分离,该流程可以同时测定LPCAT1对多种酰基辅酶(如,17:0-CoA, 18:1-CoA和20:4-CoA)的选择性。结果显示LPCAT1对三种酰基辅酶均表现出活性,20:4-CoA的活性最低。当LPCAT1将三种酰基辅酶连接到甘油骨架上时,均选择性的加在了sn-1位置,即只合成了PC 17:0/16:0,PC 18:1/16:0和PC 20:4/16:0。因此,基于图1的LC-MS/MS分析流程,该研究首次明确了LPCAT1对甘油骨架的sn-1位置具有选择性。  已有研究表明LPCAT1在肝细胞癌组织中表达上调。为了探究肝细胞癌中PCsn位置异构体的组成是否会受到LPCAT1对sn-1位置选择性的影响,该工作对人肝细胞癌组织和正常肝组织中PC的sn位置异构体进行LC-MS/MS分析。结果显示PC 18:1/16:0在肝细胞癌组织中显著上升。该工作进一步对常用的肝癌细胞系HepG2中的LPCAT1进行敲降,敲降后PC 18:1/16:0的含量显著下降。这表明肝细胞癌组织中PC 18:1/16:0的含量与LPCAT1对sn-1位置的选择性以及LPCAT1的表达上调直接相关。更重要的是,解吸电喷雾电离质谱(DESI)对PC 18:1/16:0的分布成像与人肝细胞癌组织连续切片的LPCAT1的免疫荧光成像以及H&E染色高度吻合(图2)。因此PC 18:1/16:0可能作为新型生物标志物,用于划分癌变区域和癌旁区域。  图2. 人肝细胞癌组织连续切片H&E染色(a)组织中LPCAT1的免疫荧光成像(b)以及DESI MS2 对PC 16:0_18:1的sn位置异构体分布的成像(c, d)  总的来说,该工作建立了用于测定LPCAT的sn位置选择性的快速、灵敏、高通量的LC-MS/MS分析流程。它深度剖析了组织中sn位置异构体的组成、分布与酶的功能、分布的关系 阐明了脂质异构体作为新型生物标志物用于疾病的诊断与治疗的巨大潜力。不过其他几种LPCAT在连接酰基辅酶时对sn位置选择性还有待进一步研究。
  • 禾信、毅新博创、东西分析、融智生物及英盛等联合起草微生物质谱鉴定平台国家标准
    近日,国家标准全文公开系统正式发布了国家标准GB/T 42580-2023《智能实验室 微生物质谱鉴定平台》,该项标准将于2023年12月1日起正式实施。国家标准《智能实验室 微生物质谱鉴定平台》 由TC526(全国实验室仪器及设备标准化技术委员会)归口 ,主管部门为中国机械工业联合会。微生物质谱具有高通量、高分辨率、高灵敏度、低成本的优势,在国内临床诊断的应用越来越广泛,如何利用好微生物质谱技术,为临床提供快速,准确的诊断结果,是微生物检测从业人员一直在努力的方向。将微生物鉴定质谱平台与智能实验室设备或终端相连接,实现信息交互,能有效提升实验室效率及诊断准确性。  该项标准的主要起草单位有:北京鑫汇普瑞科技发展有限公司 、机械工业仪器仪表综合技术经济研究所 、秦皇岛海关技术中心 、广州莱伯世开科技有限公司 、北京鑫汇迈科生物科技有限公司 、北京毅新博创生物科技有限公司 、浙江泰林生命科学有限公司 、北京理工大学 、广州禾信仪器股份有限公司 、之江实验室 、北京奥特美克科技股份有限公司 、北京东西分析仪器有限公司 、厦门金诺花生物技术有限公司 、融智生物科技(青岛)有限公司 、山东英盛生物技术有限公司 。  主要起草人 朱家强 、刘利勤 、张桂玲 、卢铁林 、曹蕊 、钱云开 、唐郡 、何颖 、马庆伟 、沈志林 、徐伟 、孔令琴 、程阳 、李磊 、李振廷 、吴玉晓 、高利艳 、刘洪涛 、李运涛 、郭启雷 。
  • 赛默飞亮相2014美国质谱大会,彰显全新质谱分析能力
    2014年7月28日,中国上海——近日,科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技(以下简称:赛默飞)亮相2014年第62届美国质谱大会。期间,赛默飞发布并展示了全新仪器、软件和耗材,进一步为客户在研发和应用市场方面带来更高性能。 “新产品的推出,让我们不断突破和拓展,在质谱分析方面取得长远发展。我们致力于此,也凭借这样的创新能力帮助客户实现在研发和应用市场方面的目标。”赛默飞总裁兼首席执行官Marc N.Casper先生表示:“我们的能力涵盖了包括仪器、软件和耗材等多个方面,这使赛默飞具备独有优势,既助力客户加速取得成果,又能提升整体实验室工作效率。”赛默飞此次发布的新品包括: Q Exactive HF(高场)液质联用(LC-MS)系统是此次新品中的亮点。该系统通过将Q Exactive Plus平台与一个超高场轨道阱质量分析器结合,显著提高了这一平台的性能。Q Exactive HF系统设计用于加快定性、定量和确定过程,以帮助生命科学研究员们在诸如蛋白鉴定等应用中显著提高分析速度和敏感度。 全新应用程序——赛默飞特定软件能帮助研究员利用大量光谱数据解答科学难题。例如,PepFinder 1.0肽段图谱软件能增加生物治疗蛋白定性的质量和准确性,是药物开发和生产质量控制的关键。随着质谱分析法开始成为鉴定复杂生物样品的首选方法,Proteome Discoverer 2.0软件用以提供出色的灵敏度、大量的生物信息学工具和可定制的工作流程。 新款耗材。赛默飞认识到样品准备对于实验结果精确性的重要性,因此还推出了用于在分析过程中富集目标蛋白、肽段和抗体的全新耗材。质谱免疫分析移液器吸头采用了专有的微柱技术,用以在LC-MS分析之前对生物样品进行强化、反复的目标纯化。另外,串联质谱标记试剂经特别设计,能够实现从方法开发过程快速过渡到高通量蛋白定量过程。 对于应用市场方面的客户,Thermo Scientific TSQ 8000 Evo三重串联四极杆气相色谱 - 质谱联用系统再次升级。升级后采用全新EvoCell技术,可提供比上一代仪器增加三倍的生产力,并能使用户在单次运行中同时筛选和定量一千多种复合物。该系统是实验室分析食物、环境、药物和司法鉴定样品中诸如二噁英和杀虫剂等复杂化合物的理想工具。 在质谱大会上展出产品的完整清单请访问www.thermoscientific.com/asms 获取;相关新闻和信息,请访问www.thermofisher.com/news 查询。关于赛默飞世尔科技 赛默飞世尔科技(纽约证交所代码:TMO)是科学服务领域的世界领导者。公司年销售额170亿美元,在50个国家拥有员工约50,000人。我们的使命是帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。我们的产品和服务帮助客户加速生命科学领域的研究、解决在分析领域所遇到的复杂问题与挑战,促进医疗诊断发展、提高实验室生产力。借助于Thermo Scientific、Life Technologies、Fisher Scientific和Unity? Lab Services四个首要品牌,我们将创新技术、便捷采购方案和实验室运营管理的整体解决方案相结合,为客户、股东和员工创造价值。欲了解更多信息,请浏览公司网站:www.thermofisher.com 赛默飞世尔科技中国赛默飞世尔科技进入中国发展已有30多年,在中国的总部设于上海,并在北京、广州、香港、台湾、成都、沈阳、西安、南京、武汉等地设立了分公司,员工人数超过3800名。我们的产品主要包括分析仪器、实验室设备、试剂、耗材和软件等,提供实验室综合解决方案,为各行各业的客户服务。为了满足中国市场的需求,现有8家工厂分别在上海、北京和苏州运营。我们在全国共设立了6个应用开发中心,将世界级的前沿技术和产品带给国内客户,并提供应用开发与培训等多项服务;位于上海的中国创新中心结合国内市场的需求和国外先进技术,研发适合中国的技术和产品;我们拥有遍布全国的维修服务网点和特别成立的中国技术培训团队,在全国有超过2000名专业人员直接为客户提供服务。我们致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。欲了解更多信息,请登录网站www.thermofisher.cn
  • 质谱分析法又立功!新的帕金森病诊断尿液蛋白质标记物被发现
    普渡大学和Tymora Analytical Operations的科学家团队通过对尿液胞外囊泡(EVs)蛋白质和磷酸化蛋白质进行质谱分析识别了一组可用于诊断帕金森病的蛋白质标志物。该项工作于本月发表在Communication Medicine,其中详细介绍了研究工作。该研究的部分资助来源于迈克尔J福克斯帕金森研究基金会,该组织的一部分工作就是探究EVs分析是否能识别新型的帕金森病标志物。EVs是由细胞分泌到各种体液中,被认为能反映来源细胞的分子组成。鉴于检测源自癌细胞的外泌体中的蛋白质或核酸比检测患者血液或尿液中自由循环的癌细胞相关核酸或蛋白质可能更容易的想法,胞外囊泡已成为液体活检研究的一个热门领域。同样的思路也适用于神经退行性疾病,尤其是从血液或尿液样本中寻找这些疾病的标志物,血液或尿液相比于脑脊液易于获取,但含有的相关标志物浓度通常较低。总部位于印第安纳州威斯特拉法叶市的Tymora是普渡大学化学生物学和分析化学教授安迪陶(Andy Tao)实验室的衍生企业。Tymora的首席执行官是Communication Medicine论文的通讯作者之一Anton Iliuk。Tymora专注于EVs的蛋白质组学和磷酸化蛋白组学分析,将其作为研究服务出售给外部合作伙伴以及用于其内部生物标志物和诊断方法的开发工作。2018年,该公司及其合作者在Journal of Proteome Research杂志上发表了一项研究,在该研究中,他们在尿液中收集的EVs中鉴定出约860种磷酸化蛋白质和超过2,000种未修饰的蛋白质。迈克尔J福克斯帕金森研究基金会的研究项目副总裁Shalini Padmanabhan是该论文的作者之一,她表示,基金会的研究人员在阅读该研究时“对结果很有兴趣”,因为鉴定到的蛋白中包括几种与帕金森病有关的蛋白质。Padmanabhan指出,当时基金会已经收集了大量来自帕金森病患者的尿液样本,并由Tymora技术看到一个检验新方法(识别帕金森病患者EVs蛋白质特征相对于健康对照组的变化)的机会。研究人员使用Tymora的EVtrap技术从哥伦比亚大学欧文医学中心收集的82个尿液样本中分离出EVs(21个健康对照组,13个携带与帕金森病相关的LRRK2突变但健康的人,28名没有LRRK2突变的帕金森病患者和20名携带LRRK2突变的帕金森病患者)。EVtrap方法使用包被疏水和亲水基团的磁珠来结合EVs的脂质双层膜。该方法可灵敏且可重复地捕获EVs,同时限制高浓度循环蛋白的捕获,这是相对于其他一些EV富集方法的优势。在分离出外泌体后,研究人员在赛默飞Q-Exactive HF-X仪器上进行LC-MS分析其蛋白质。他们识别4,476个独特的蛋白质和2,680个独特的磷酸化蛋白质,从中筛选出48个潜在的标记物,并最终确定了6个最佳标志物。他们发现,这六个标志物组合可以在曲线下面积为0.94的情况下区分健康人群和帕金森病患者。随后,研究人员用两个实验验证了这些表现最佳的蛋白质和与帕金森有关的其它蛋白质。其中一个实验利用靶向质谱技术测定13名健康对照组和23名帕金森病患者的蛋白质,另一个实验使用免疫方法测定10名健康对照组和10名帕金森病患者的蛋白质。Tao 表示,他的实验室继续与哥伦比亚大学的研究小组合作获取更多的样本,并且正在与普渡大学的同事Jean-Christophe Rochet合作研究蛋白质聚集在帕金森病、阿尔茨海默病和Lewy小体痴呆等神经退行性疾病中的作用。Tao 和 Rochet 正在探讨的一个问题是外泌体是否可能成为突触核蛋白α-synuclein(α-syn)的有用来源。在帕金森病患者中,错误折叠的α-syn聚集形成路易氏小体在大脑中积累,被认为会引起神经元损伤,也被认为是潜在的药物靶标和生物标志物。对于帕金森病的诊断,α突触核蛋白种子扩增检测方法前景光明。该方法通过将来自患者的αSyn与正常αSyn孵育并观察其是否产生帕金森病的特征性聚集物。通常,αSyn突触核蛋白样品从患者脑脊液中收集,需要进行脊髓穿刺。这促使研究人员探索通过血液或尿液样品等微创性的方式收集这种蛋白质,其中外泌体是一种潜在的采样途径。Padmanabhan指出,“虽然α-synuclein的分布范围及与帕金森病生物学相关性的全面了解仍不充分,但已有人提出外泌体可能富集有α-synuclein,包括病理性形式。”她补充说,到目前为止,福克斯基金会将外泌体用作αSyn的样本来源的主要工作侧重于在血液中的外泌体,“血液中α Syn的存在已经有研究支持”。然而,她表示该组织“继续探索所有可能的CSF替代方案,以改进临床使用的检测,作为我们持续开展的突触核蛋白生物学研究项目的一部分”。CEO Iliuk表示Tymora不打算继续开发Communication Medicine论文中确定的标记物,但他指出,神经退行性疾病,特别是阿尔茨海默病,已成为Tymora内部生物标志物开发工作和为外部客户工作的重点。Iliuk指出,虽然血浆被广泛认为是临床诊断阿尔茨海默病生物标志物的最切实可行的替代样本,但帕金森病的研究显示了尿液EVs作为神经退行性疾病生物标志物来源的潜力。他说:“我们在血浆方面做了相当多的工作,我认为那是主要关注的地方。但是我们最近一直在研究尿液。现在还处于非常初期的阶段,人们对其作为一种可行的样本还存在很多犹豫,因为它距离大脑太远了,所以并不是一个合情合理的选择。但我认为帕金森病的研究表明神经退行性疾病的标志物可以传播到尿液中并被检测到。”福克斯基金会支持了许多其他在尿液中寻找帕金森病蛋白标记物的努力,包括2021年由马克斯普朗克生物化学研究所蛋白质组学和信号转导部门主任Matthias Mann实验室发表的蛋白质组学研究,该研究确定了几种潜在的帕金森病蛋白标志物。文章链接:https://www.nature.com/articles/s43856-023-00294-w
  • 质谱分析可能帮助指导脑瘤手术
    使用一种基于质谱分析的技术探测肿瘤的代谢物,科研人员报告称,实时诊断可能有助于外科医生在手术室跟踪人类大脑肿瘤的范围。外科切除肿瘤常常需要诊断信息,目前是通过病理学家辛苦而耗费时间的活检显微检查获得的。   Nathalie Agar及其同事使用一种称为电喷雾解吸电离质谱(DESI-MS)的技术,用最少的样本处理在手术室迅速执行,从而检测2-HG,这是一种见于IDH-1 和IDH-2基因突变的人类大脑肿瘤的代谢物,这两种基因为参与细胞生长和分化的酶编码。   研究人员使用电喷雾解吸电离质谱(DESI-MS)在数分钟时间里区分了有IDH突变的人类大脑肿瘤样本和没有IDH突变的样本,而这种代谢物清晰地勾画出了肿瘤的范围,并且探测到了渗透的肿瘤细胞&mdash &mdash 这类能力被认为对于优化肿瘤切除和手术的结果具有关键意义。使用安装在美国波士顿的Brigham和女性医院的一间手术室的一台质谱仪,研究人员在手术期间测量了来自两名患星形细胞瘤的脑瘤病人的活检样本中的2-HG,他们提出这种方法可能用于实时诊断,并且有可能清除用其他方法可能会遗漏的肿瘤细胞。   研究人员说,电喷雾解吸电离质谱(DESI-MS)仪器可能有助于描述肿瘤,比组织病理学检查更有效,它们可以安装在手术室中,成本只有用于间接神经外科导航的外科手术MRI机器的一小部分。   原文检索:   Sandro Santagata, Livia S. Eberlin, Isaiah Norton, David Calligaris, Daniel R. Feldman, Jennifer L. Ide,Xiaohui Liu, Joshua S. Wiley, Matthew L. Vestal, Shakti H. Ramkissoon, Daniel A. Orringer,Kristen K. Gill, Ian F. Dunn, Dora Dias-Santagata, Keith L. Ligon, Ferenc A. Jolesz,Alexandra J. Golby, R. Graham Cooks, and Nathalie Y. R. Agar. Intraoperative mass spectrometry mapping of an onco-metabolite to guide brain tumorsurgery. PNAS, June 30, 2014 doi:10.1073/pnas.1404724111
  • 高端质谱领导者赛默飞与您共享学术盛宴-第十七届亚太生物分离与生物分析国际会议
    11月11-12日,第十七届亚太生物分离与生物分析国际会议(APCE2017)在上海盛大召开,此次会议以“精准分析、卓越科研、品质生活”为主题,展现生物分离生物分析及其生物医药应用的最新成果,国内外各大科研机构及著名高校专家云集,共享学术盛宴。赛默飞作为赞助商鼎力助阵此次会议,并由市场产品经理范超带来了关于“新一代Orbitrap 质谱仪Q Exactive HF-X 如何推动二代蛋白质组学发展”的报告,吸引了众多行业内专家前来交流技术和心得。大会现场赛默飞市场产品经理 范超赛默飞Q Exactive HF-X超高分辨质谱仪https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/0726042?SID=srch-srp-0726042 Q Exactive™ HF-X质谱仪使用大容量传输管可使更多离子通过,增加信号强度。 电动离子漏斗设计,可在更广泛的质量范围聚焦和传输离子,以及高场Orbitrap质量分析器。这些组合在一起, 可以快速识别和分析肽, 进行非标和TMT的组学定量,Top-down的蛋白质组分析, 精密的DDA和DIA数据采集,动态保留时间PRM和生物药物的表征得到巨大提升。Q Exactive™ HF-X质谱仪新增三大性能重新定义赛默飞高端质谱领导者的地位,为面临真实世界复杂基体(如复杂蛋白质组、代谢组、脂质组等)的研究者提供优质的平台保障。 关于赛默飞世尔科技 赛默飞世尔科技(纽约证交所代码:TMO)是科学服务领域的世界领导者。公司年销售额170亿美元,在50个国家拥有员工约50,000人。我们的使命是帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。我们的产品和服务帮助客户加速生命科学领域的研究、解决在分析领域所遇到的复杂问题与挑战,促进医疗诊断发展、提高实验室生产力。借助于Thermo Scientific、Life Technologies、Fisher Scientific和Unity™ Lab Services四个首要品牌,我们将创新技术、便捷采购方案和实验室运营管理的整体解决方案相结合,为客户、股东和员工创造价值。欲了解更多信息,请浏览公司网站:www.thermofisher.com 赛默飞世尔科技中国 赛默飞世尔科技进入中国已超过30年,在中国的总部设于上海,并在北京、广州、香港、台湾、成都、沈阳、西安、南京、武汉等地设立了分公司,员工人数超过3800名。为了满足中国市场的需求,现有8家工厂分别在上海、北京和苏州运营。我们在北京和上海共设立了9个应用开发中心,将世界级的前沿技术和产品带给国内客户,并提供应用开发与培训等多项服务;位于上海的中国创新中心结合国内市场的需求和国外先进技术,研发适合中国的技术和产品;我们拥有遍布全国的维修服务网点和特别成立的中国技术培训团队,在全国有超过2000 名工程师提供售后服务。我们致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。欲了解更多信息,请登录www.thermofisher.cn
  • 安捷伦研发下一代质谱:智能质谱将改变分析领域
    随着自主技术的全球趋势,质谱领域也不例外。仪器智能的进步,如诊断和故障排除能力,使分析实验室能够简化工作流程,节省时间,提高准确性和再现性,并延长仪器正常运行时间。  在Select Science访谈中,安捷伦科技公司四极杆质谱仪助理研发副总裁Shane Tichy博士讨论了仪器智能的趋势和挑战,以及它们将如何影响食品安全、环境、制药/生物制药、生命科学、临床诊断、法医学等领域的科学家。 Shane Tichy博士,安捷伦科技公司四极杆质谱仪助理研发副总裁  质谱专长  在安捷伦科技公司,Tichy领导着一支由化学家、科学家、项目经理、电气工程师、软件程序员和机械工程师组成的的团队,这些才华横溢的人员在做质谱创新的前沿工作。在过去十年中,该小组开发并引进了十种新型四极杆质谱仪。“我很幸运能在安捷伦从事多个最先进的项目。” Tichy分享道。  在此期间,他最喜欢的部分项目包括灵敏的6495C三重四极杆LC/MS、紧凑且功能强大的Ultivo三重四极杆液质联用LC/MS(LC/TQ)以及为方便使用而设计的InfinityLab LC/MSD iQ。这些仪器结合了推进分析应用的关键技术和特点。Tichy强调,“6495C三重四极杆LC/MS系统在灵敏度、可靠性和准确性方面处于领先地位,是许多应用的完美选择,包括肽定量、食品安全、环境测试、临床研究和法医学。”Ultivo和LC/MSD iQ同时为分析实验室提供了一个紧凑但功能强大的解决方案,并结合了多项创新技术和智能功能。Tichy说:“它们提供了适用的、简单的、强健的LC/MS分析,而且相比于同类更高性能的产品,尺寸要小得多。”  结合智能功能  该团队的最新项目旨在进一步改变分析领域。Tichy分享道:“我们最近一直在研究新一代LC/MS三重四极杆,它可以进一步提高灵敏度、精度和仪器智能。”  新系统将集成可编程智能芯片,实现高级监控和反馈。Tichy充满热情道,“我们很高兴将智能芯片纳入我们的质谱仪,因为它提供了更高的精度、重复性和长期稳定性。同时,它可以减少重新校准的频率,通过故障自诊断降低维护成本,以及存储调谐和校准数据的能力,这些数据可以在下次校准期间进行评估。”  这些智能功能将有助于满足所有市场质谱仪用户的需求。Tichy解释道:“除了提高精度和灵敏度外,他们还需要反馈,‘嘿,我的仪器是在最高水平上运行的。而且,当分析性能下降时,系统出了什么问题?’这就是仪器智能真正发挥作用的地方。”  仪器智能化趋势  “过去几年来,围绕仪器智能的讨论相当热烈。”Tichy分享道:“不管你信不信,30多年前出现了第一台智能仪器。”  虽然昂贵的可编程芯片最初阻碍了分析仪器行业的发展,但自那时以来,随着功率的增加,成本也在下降。Tichy解释道:“我们看到的是,这些设备的价格大幅下降,而其功率却有所增加,使得智能设备和传统设备之间的成本差异相对较小。”  将智能芯片纳入质谱仪的能力为用户提供了丰富的优势,从物理上更小的仪器和快速双向数字通信,到仪器自校准。这将提高在不同环境条件下的测量精度,以及仪器自我诊断,同时可以指示系统的健康状况,并提醒操作员测量质量的变化和潜在问题。  质谱仪将更易使用  采用质谱仪的一个关键挑战是,缺乏经验的用户往往将质谱仪视为复杂的仪器,难以操作和维护。 “一些操作人员努力手动优化仪器调谐或源参数,以达到最高的性能水平。”Tichy解释道:“另一个挑战是对仪器进行故障排除。当系统性能下降时,客户不知道该去哪里查找。是柱吗?是脏污吗?是否有透镜污染?可能与机械或电气组件有关?对于这些原因,即使质谱是解决其挑战的最佳分析工具,他们也会怯于使用该系统。”  在这里,仪器智能有助于克服这些挑战,并增加质谱的可及性。通过在安捷伦科技公司的系统中使用智能芯片,Tichy和他的团队增强了自动调谐和校准算法,使他们能够始终如一地设置最佳仪器参数。通过早期维护反馈跟踪系统的健康状况,最大限度地减少了停机时间,同时,自我感知即插即用技术也避免了使用新系统进行质谱检测的冗长学习时间。  Tichy强调:“仪器智能化使质谱分析变得更简单,并帮助我们的客户克服威胁因素。它从本质上将高度复杂的质谱仪转变为易于使用的质量检测设备。”。  未来趋势  展望未来,Tichy预计仪器智能将在实验室和未来仪器发展中发挥关键作用。Tichy总结道:“我会保持简单。我看到了一种更自主、更复杂的技术趋势,它让人们在实验室的工作更容易。质谱也不例外。我们将继续创新,让我们的客户保持在未来趋势的领先地位。”
  • 新型蛋白质结构分析手段-氢氘交换质谱技术进展
    贾伟、陈熙 沃特世科技(上海)有限公司实验中心 氢氘交换质谱法是一种研究蛋白质空间构象的质谱技术。它在蛋白质结构及动态变化研究、蛋白质相互作用位点发现、蛋白表位及活性位点鉴定方面有着广泛的应用。随着氢氘交换质谱技术的不断发展,它正在成为结构生物学家及生物药物研发的重要手段。 氢氘交换质谱(HDX MS,hydrogen deuterium exchange mass spectrometry)是一种研究蛋白质空间构象的质谱技术。其原理是将蛋白浸入重水溶液中,蛋白的氢原子将于重水的氘原子发生交换,而且蛋白质表面与重水密切接触的氢比位于蛋白质内部的或参与氢键形成的氢的交换速率快,进而通过质谱检测确定蛋白质不同序列片段的氢氘交换速率,从而得出蛋白质空间结构信息[1]。这个过程就像将握着的拳头浸入水中,然后提出水面并张开手掌。这时,湿润的手背表明它在&ldquo 拳头&rdquo 的结构中处于外表面,而较为干燥的手心表明它是&ldquo 拳头&rdquo 的内部。除样品制备外,氢氘交换质谱法的主要过程包括:交换反应、终止反应、将蛋白快速酶切为多肽、液相分离、质谱检测、数据解析。其中交换步骤需要在多个反应时长下进行,如0s、10s、1min、10min、60min等,以绘制交换率曲线,得到准确全面的信息。氢氘交换质谱技术在蛋白质结构及其动态变化研究[1]、蛋白质相互作用位点发现[2]、蛋白表位及活性位点鉴定方面有着广泛的应用[3]。 与经典的蛋白质结构研究方法相比,如X射线晶体衍射(X-Ray Crystallography)和核磁共振(NMR. Nuclear Magnetic Resonance)等方法,氢氘交换质谱不能够提供精确的蛋白空间结构,它直接提供的主要信息包括哪些氨基酸序列位于蛋白质空间结构的表面位置(包括动态变化中的)、可能的活性位点和蛋白-蛋白相互作用位点等。但是氢氘交换质谱技术有着其他经典方法不具备的优点:首先,可以进行蛋白质结构动态变化的研究是氢氘交换质谱的一个突出优点,包括变化中的活性位点及表位;其次,氢氘交换质谱在蛋白复合体构象的研究中也具有独到的优势;此外,氢氘交换质谱还具有对样品需求量小、纯度要求相对较低、研究对象为溶液环境下的蛋白质的天然构象而非晶体中构象等优势[1,4,5]。自1991年第一篇研究论文发表起,氢氘交换质谱技术不断发展,已经成为结构生物学及质谱技术中一个非常重要的应用领域[6]。但是氢氘交换质谱实验的复杂的实现过程在一定程度上影响了其应用的广泛度。主要的难点有:1、如何避免交换后氘代肽段的回交现象;2、实验控制的高精确性和重现性要求;3、交换后造成的叠加的质谱峰如何准确分辨;4、简易高效的分析软件需求;5、以氨基酸为单位的交换位点辨析。沃特世公司自2005年起,针对以上难点不断进行攻关,推出了目前唯一商业化的全自动氢氘交换质谱系统解决方案&mdash &mdash nanoACQUITY UPLC® HD-Exchange System(图1)。在全世界范围内,这套系统已经帮助科学家在包括Cell、Nature等顶级研究期刊中发表研究论文[7,8]。除科研需求外,沃特世氢氘交换质谱系统也受到众多国际领先制药公司的认可,并用于新药开发中蛋白药物活性位点及表位的研究工作中。 氢氘交换实验中的回交现象将严重影响实验数据的可信度,甚至导致错误结果的产生。要避免回交需要做到两点:尽量缩短液质分析时间和保证液质分析中的温度和pH为最低回交反应系数所要求的环境。沃特世UPLC® 系统采用亚二纳米色谱颗粒填料,较HPLC使用的大颗粒填料,UPLC具有无与伦比的分离度。因此UPLC可以做到在不损失色谱分离效果的要求下,极大缩短液相分析时间的要求[9]。对于对温度和pH控制问题,在多年的工程学改进中,nanoACQUITY UPLC HD-Exchange System已经实现了对酶切、液相分离等步骤的全程控制[10]。 对氢氘交换质谱实验精确性和重现性的要求是其应用的第二个主要难点。在实验中一般需要采集0s、10s、1min、10min、60min、240min等多个时间点的数据。如果进行人工手动实验,很难做到对10S-10min等几个时间点的精确操作。再考虑到重复实验的需求,人工手动操作会对最终数据可信度产生影响。而且实验过程重复繁琐,将给实验人员带来非常大的工作压力。nanoACQUITY UPLC HD-Exchange System完全通过智能机械臂,精确完成交换、终止交换、进样、酶切等一系列实验过程,而且始终保证各个步骤所需不同的温度环境。这些自动化过程不但保证了实验数据的可靠性,提高了实验效率,也将科学家从繁琐的重复实验中解放出来。 氢氘交换实验的质谱数据中,随着交换时间的延长,发生了交换反应的多肽,由于质量变大,其质谱信号将逐渐向高质荷比方向移动。因此,这些质谱峰可能与哪些未发生交换反应的多肽质谱峰逐渐叠加、相互覆盖。相互叠加的质谱信号,不但影响对峰归属的判断,更会增加交换率数据的误差。因为交换率判断需要通过对发生交换的多肽进行定量,毫无疑问因叠加的而混乱的质谱数据将极大的影响对质谱峰的准确定量。这点对于单纯通过质荷比进行分析的质谱仪来说完全无能为力。但是,这个看似不可能完成的任务却被沃特世 nanoACQUITY UPLC HD-Exchange System攻克了。这是因为,不同于其它常见质谱,沃特世的SYNAPT® 质谱平台还具备根据离子大小及形态进行分离的功能(行波离子淌度分离)。在数据处理时,除多肽离子的质荷比信息外,还可以通过离子迁移时间(离子淌度维度参数)将不同离子区分。因此这种SYNPAT独有的被命名为HDMSE的质谱分析技术可以将因质荷比相同而重叠的多肽分离开,轻而易举地解决了质谱信号叠加的问题,得到准确的交换率数据[11,12](图2)。SYNPAT质谱平台一经推出就夺得了2007年PITTCON金奖,目前已经推出了新一代的SYNAPT G2HDMS、SYNAPT G2-S HDMS等型号,并具备ESI、MALDI等多种离子源。除氢氘交换技术外,SYNAPT质谱系统在蛋白质复合体结构研究中也是独具特色,已有多篇高质量应用文献发表[13,14,15]。 实现氢氘交换质谱技术的第四个关键点,是如何高效分析实验产生的多时间点及多次重复带来的大量数据。人工完成如此巨大的信息处理工作,将消耗科学家大量的时间。沃特世氢氘交换质谱解决方案所提供的DynamX软件可以为科学家提供简便直观的分析结果,并包含多种呈现方式。 在某些特殊研究中,要求对蛋白氢氘交换位点做到精确到氨基酸的测量,这是氢氘交换质谱研究的又一个难点。在常规的研究中采用CID(碰撞诱导解离)碎裂模式,可能导致氘原子在多肽内重排,而致使不能对发生交换的具体氨基酸进行精确定位。SYNPAT质谱提供的ETD(电子转移解离)碎裂模式可以避免氘原子重排造成的信息混乱,并具有良好的碎裂信号[16]。 沃特世的nanoACQUITY UPLC HD-Exchange System为氢氘交换质谱实验提供了前所未有的简易的解决方案,强有力地推动了氢氘交换技术在蛋白质结构及动态变化研究、蛋白质相互作用位点发现、蛋白表位以及活性位点鉴定方面的应用,正在成为众多结构生物学科学家和生物制药企业必不可少的工作平台。 参考文献 (1) John R. Engen, Analysis of Protein Conformation and Dynamics by Hydrogen/Deuterium Exchange MS. Anal. Chem. 2009,81, 7870&ndash 7875 (2) Engen et al. probing protein interactions using HD exchange ms in ms of protein interactions. Edited by Downard, John Wiley & Sons, Inc. 2007, 45-61 (3) Tiyanont K, Wales TE, Aste-Amezaga M, et al. Evidence for increased exposure of the Notch1 metalloproteasecleavage site upon conversion to an activated conformation. Structure. 2011, 19, 546-554 (4) Heck AJ. Native mass spectrometry: a bridge between interactomics and structural biology. Nat Methods. 2008, 5, 927-933. (5) Esther van Duijn, Albert J.R. Heck. Mass spectrometric analysis of intact macromolecular chaperone complexes. Drug Discovery Today. Drug Discovery Today: Technologies Volume 3, 2006, 21-27 (6) Viswanat ham Katta, Brian T. C hait, Steven Ca r r. Conformational changes in proteins probed by hydrogen-exchange electrospray-ionization mass spectrometry. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1991, 5, 214&ndash 217 (7) Chakraborty K, Chatila M, Sinha J, et al. Chaperonin-catalyzed rescue of kinetically trapped states in protein folding. Cell. 2010 Jul 9 142(1):112-22. (8) Zhang J, Adriá n FJ, Jahnke W, et al. Targeting Bcr-Abl by combining allosteric with AT P-binding-site inhibitors. Nature. 2010,463, 501-506 (9) Wu Y, Engen JR, Hobbins WB. Ultra performance liquid chromatography (UPLC) further improves hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry. J Am Soc Mass Spectrom. 2006 , 17, 163-167 (10) Wales T E, Fadgen KE, Gerhardt GC, Engen JR. High-speed and high-resolution UPLC separation at zero degrees Celsius. Anal Chem. 2008, 80, 6815-6820 (11) Giles K, Pringle SD, Worthington KR, et al. Applications of a travelling wave-based radio-frequency-only stacked ring ion guide. Rapid Commun Mass Spectrom. 2004, 18, 2401-2414 (12) Olivova P, C hen W, C ha kra borty AB, Gebler JC. Determination of N-glycosylation sites and site heterogeneity in a monoclonal antibody by electrospray quadrupole ion-mobility time-offlight mass spectrometry. Rapid Commun Mass Spectrom. 2008, 22,29-40 (13) Ruotolo BT, Benesch JL, Sandercock AM, et al. Ion mobilitymass spectrometry analysis of large protein complexes. Nat Protoc.2008, 3, 1139-52. (14) Uetrecht C, Barbu IM, Shoemaker GK, et al. Interrogatingviral capsid assembly with ion mobility-mass spectrometry. Nat Chem.2011, 3,126-132 (15) Bleiholder C, Dupuis NF, Wyttenbac h T, Bowers MT. Ion mobility-mass spectrometry reveals a conformational conversion from random assembly to &beta -sheet in amyloid fibril formation. Nat Chem. 2011, 3, 172-177 (16) Kasper D. Rand, Steven D. Pringle, Michael Morris, John R., et al. ETD in a Traveling Wave Ion Guide at Tuned Z-Spray Ion Source Conditions Allows for Site-Specific Hydrogen/Deuterium Exchange Measurements. J Am Soc Mass Spectrom. 2011, in press
  • 迪安诊断:质谱和基因测序技术均为可应用于多个领域的平台化技术
    有投资者向迪安诊断(300244)提问, 质谱和基因测序技术有什么区别?哪个更有优势?  回答表示,尊敬的投资者,您好!质谱和基因测序技术均为可应用于多个领域的平台化技术,质谱可以直接对体内各种代谢、蛋白等物质进行定量检测,从表型组学层面全程对疾病的诊断、治疗、预后进行监测 而基因检测通过对疾病的本质与起源进行检测分析,基于基因组学获得精确的诊断结果和合适的治疗方案 两者在特定场景下的优势各有不同。谢谢!
  • 鱼贝类毒素之质谱分析
    导读春季是细菌病毒等滋生的活跃期,对于吃河鲜海鲜来说不是好季节,中毒事件往往会在每年的这段时间频发。那么如何避免吃到有毒海鲜?对吃了染毒的海鲜中毒的病人如何快速检测从而采取有效的救治措施呢?让我们从毒素本身说起。 对人类有毒害的鱼、虾及贝类食品一般是因有毒藻类污染产生的,海洋中的有毒藻类通过食物链传递给藻食性的鱼、虾及贝类等生物,并在其体内蓄积形成的有毒高分子化合物。由于这些毒素最早是从摄食有毒微藻的鱼类和贝类体内发现的,往往被大家习惯性地称为鱼类毒素或贝类毒素。对水体或鱼贝类进行有害物质的监测,或者发生群体性中毒事件后能迅速检测并协助临床进行救治是应对的关键。 鱼类毒素质谱分析 世界上可食用的鱼类约有3万种,其中约有600种鱼类体内含有毒素不可食用。鱼体内含有两大天然毒素,即雪卡毒素和河豚毒素。另外还有一种常见的鱼类过敏物质毒素—组胺,当人体摄入较多组胺时会产生组胺中毒。【1】 ①雪卡毒素雪卡毒素(Ciguatoxin,CTX,亦称西加毒素)是目前赤潮生物产生的主要毒素之一。属神经毒素,是已知的对哺乳动物毒性最强的毒素之一,比河豚毒素强100倍。中国南海诸岛、台湾海峡和香港地区常有雪卡毒素中毒事件发生,【1】已成为影响渔业经济发展和公共卫生的一大障碍。由于毒素在鱼体内含量低,而染毒鱼类在感官、嗅觉、味觉上均没有什么异常,用常规化学分析法很难检测出来,需要使用质谱仪器进行高灵敏度的分析。但是,由于对于雪卡毒素的检测尚缺少相应的检测标准,【2】以及很难购买标准品,有关检测还处于研究阶段。岛津使用液相色谱三重四极杆质谱进行了两种雪卡毒素的分析。【3】 仪器:LCMS-8050色谱柱:L-column 2 ODS (100 mmL. x 2.1 mmI.D., 3μm)流动相:A: 2 mmol/L Ammonium formate aqueous solution;B: Methanol containing 2 mmol/L ammonium formate洗脱梯度:B conc. 70%(0 min)→ 95%(10-20 min)→ 70%(20.01 - 25 min)离子源:ESI+接口电压:+1 kV雾化气流速:2.5 L/min加热气流速:15 L/min样品分析结果:CTX1B 43 ng/mL C60H86O19 单同位素质量 1110.57CTX3C 39 ng/mL C57H82O16 单同位素质量 1022.56 ②河豚毒素春季是河豚鱼产卵季节,此时河豚鱼的毒性最强,是河豚鱼中毒的高危险期,因鱼体内毒素含量高且热稳定性好,不能通过加热烧煮解毒,中毒两三小时就会导致死亡,无快速治疗药物。【4】 仪器:LCMS-8050色谱柱:XBridge Amide column (2.1x100 mm, 1.7 μm)流动相:A-acetonitrile B-water containing 10 mM formic acid / 5 mM ammoniumformate in channel B. 0-5min: 85 %-60 % A 5-8 min: 60 % A 8-8.5 min: 60 %-85 % A离子源:ESI+加热气流量:10 L/min干燥气流量:10 L/min 河豚毒素实际样品检测结果鱼干24 μg/kg织纹螺 387μg/kg ③组胺鱼体不新鲜或腐败时,污染鱼体的细菌如组胺无色杆菌,产生脱羧酶,使组氨酸脱羧生成组胺。在某些罐装食品中也会含有少量的组胺。【5】 岛津开发了液质质的方法应对包含组胺在内的多种生物胺的同时分析技术。 仪器:LCMS-8045色谱柱:HILIC 2.1 mm I.D. × 100 mm L., 1.7 μm流动相:A相:乙酸铵水溶液;B相:乙腈离子源:APCI干燥气流速:5 L/min雾化气流速:3 L/min 实际样品中9个生物胺化合物检测结果,定量限值在2-10 μg/L之间。 贝类毒素质谱分析 每年的4-6月份我国经常发生群体性贝类中毒事件,这类食源性中毒事件大多是由于食用了被污染的贝类食品导致。 贝类毒素按中毒症状分为以下四类:• 麻痹性贝毒(PSP):石房蛤毒素STX、河豚毒素TTX等• 腹泻性贝毒(DSP):软海绵酸OA、鳍藻毒素DTXs等• 神经性贝毒(NSP):Brevetoxin A&B(BTX-A&B)• 失忆性贝毒(ASP):多莫酸(DA) 已发生了群体中毒事件,如何能快速对样本中的微量或痕量目标物进行检测以协助临床进行救治? 首先要保存好中毒样品,首选样本如剩余的鱼或者贝类食物、吃剩的残渣、汤汁,中毒后第一次抽的血和留尿等,同时注意保存治疗前后和治疗过程中的血尿样本,样本经前处理后进质谱分析。理化实验室通常使用在线SPE-LCMSMS系统,用于生物样本中微量或痕量目标物的检测。样本经前处理后大体积上样,通过在线固相萃取系统净化以祛除干扰物,从而获得比常规LCMSMS分析灵敏度更高的分析结果。以水溶性麻痹性贝类毒素(PSPs)分析举例。【6】【7】 在线SPE-LCMSMS系统 2mL样品通过样品环实现大体积进样,FCV阀切换使得目标物在SPE柱中捕集,再通过FCV 阀的切换实现SPE柱解析,解析后的样品经色谱柱分离,MS定性定量分析。【8】 仪器:LCMS-8050/60色谱柱:Amide column 2.1 × 100 mm, 1.7 μm或相当色谱柱流动相:A(含6 mmol/L甲酸铵,10 mmol/L甲酸的水溶液);B:乙腈离子源:ESI正负同时扫描方式 经在线SPE-LCMSMS分析的典型阳性样品结果见下图。阳性的是GTX2&3, GTX1&4, NEO和STX。 使用在线SPE-LCMSMS方法进行食品或者血尿样本检测时灵敏度更高,前处理快速,能迅速协助临床医生判断病因,从而进行有效的救治。 微囊藻毒素 水中的微囊藻毒素是鱼贝类毒素产生的罪魁祸首,如何检测水中的多种微囊藻毒素也非常重要。通常使用LCMSMS进行多种微囊藻毒素的分析,如使用岛津的LCMS-8045/50/60检测水中10种微囊藻毒素举例(参数略)。 更多分析数据请登录岛津官网或与岛津相关工作人员联系获取。 注:以上产品仅供科学研究,不用于临床诊断。 参考文献【1】李春媛,周玉,张磊等。雪卡毒素的研究概况[J].上海海洋大学学报,2009,18【2】吕颂辉,李英。我国雪卡鱼毒流行现状研究进展[J].中国公共卫生,2006,22【3】Analysis of Diarrhetic Shellfish ToxinUsing Triple Quadrupole LC/MS/MS (LCMS-8050). LAAN-A-LM-E075, ShimadzuApplication News.【4】Profile differences in tetrodotoxintransfer to skin and liver in the pufferfish Takifugu rubripes [J]. RyoheiTatsuno, Wei Gao, Kotaro Ibi, Tomoka Mine, Kogen Okita, Gregory Naoki Nishhara,Tomohiro Takatani, Osamu Arakawa. Toxicon. 2017【5】崔成祥,于夕娟,曹珊珊食用变质鲐鱼引起急性组胺中毒87例报告[J],预防医学论坛,2012, 18(10):781-782. 【6】Xiao-min Xu?, et al. Fast and quantitativedetermination of saxitoxin and neosaxitoxin in urine by ultra performanceliquid chromatography-triple quadrupole mass spectrometry based on the cleanupof solid phase extraction with hydrophilic interaction mechanism.Journalof Chromatography B 1072 (2018) 267–272.【7】岛津脂溶性和水溶性贝类毒素测定标准操作程序【8】Screening of pesticides in water using SPEon line, PO-CON 1360E, Shimadzu Application News.岛津超快速液相质谱联用仪LCMS-8050
  • 岛津细胞上清液质谱分析平台,助力国产培养基研发与质控
    细胞培养基是生物制药的重要原料,影响生物药的产量和质量,更是规模化生产成本控制的重要环节。 长期以来,国内无血清培养基主要依赖进口,易受国际形势和贸易政策的影响,尤其是2020年以来新冠疫情爆发,国内各单位和企业都在加速推进疫苗和生物药生产的进度,因此对培养基的需求也日益增大,为了保证培养基安全和持续供应,国产培养基迅速发展。 但要与占主导地位的进口培养基竞争,需要优越的产品性能和良好的批次间质量稳定性作为保证。因此,对细胞培养基中糖类、氨基酸、维生素、核苷酸、脂类、代谢物等有机组分,以及钠、镁、钾、钙等无机元素组分进行监测和质控至关重要。 但是目前常用的细胞培养基和培养上清液的检测技术存在以下问题:▷ 检测指标少,仅分析葡萄糖、谷氨酰胺和乳酸等少数化合物;▷ 无同时分析方案,一种培养基需要多种仪器多种方法完成检测;▷ 耗时费力,一种培养基大致需3天的时间才能完成检测。 为解决上述问题,岛津开发了细胞培养上清液多组分同时分析技术,可快速检测细胞培养上清液中有机组分和无机元素的含量。 岛津自首次在业内推出细胞培养上清液分析技术以来,紧贴用户需求,深入研究,目前已形成以下解决方案: ★ 有机组分分析解决方案,包括细胞培养上清液LC-MS/MS分析方法包,可以分析糖类、氨基酸、维生素、核苷酸和细胞代谢物等125种有机组分;以及脂质介质LC-MS/MS分析方法包,可以分析196种脂类及其代谢物;★ 无机元素分析解决方案,可以同时分析多种无机元素。 以上解决方案,助您揭开细胞培养上清液组分及其在培养过程中变化趋势的神秘面纱。 该技术真的如此神奇吗?接下来为您细细道来。 1有机组分分析解决方案 大家已知晓细胞培养上清液分析方法包的大致轮廓,接下来让我们认识它丰富的内涵: ★ 岛津专利技术(申请号:201610888146.3,申请日:2016.10.11);★17分钟内,同时分析125种培养基组分及代谢物;★专属数据处理软件,快速绘制化合物含量变化 趋势图;★ 内置液相分离条件、质谱参数和前处理方法,即装即用,无需优化;★ 化合物种类全,包括糖类、核苷酸、氨基酸、有机酸、抗生素等,支持自行扩展。 该方法包不仅囊括了您所关注的各类组分,而且分析时间短、分析参数无需优化… … 就连前处理也是简单到没朋友呢!只需要简单蛋白沉淀和离心,即可上机分析。 下面给大家分享两个细胞培养上清液分析方法包的应用案例: 抗体药物生产用三种不同培养基组分含量差异对比 部分分析结果展示如下: 上图中纵坐标为目标物和内标物的峰面积比,横坐标代表三种不同的培养基。结果显示1#和2#培养基各组分的含量相近,而3#培养基各组分的含量与1#和2#培养基相差较大。 由此可见,该技术既可用于培养基组分检测,也可用于不同品牌和不同批次培养基组分含量差异检测,更好地进行培养基质量控制。 融合蛋白药物补料工艺优化 该药物生产过程中需要在第3、5和8天添加补料。每天取样后添加补料,含量变化在补料后一天体现。连续14天取样,采用本方法进行分析,并绘制含量变化趋势图。部分结果如下所示。 三个代表化合物的含量均在第4、6和9天有明显提升,与补料工艺相符。通过添加补料,葡萄糖含量在整个培养过程中较为稳定。胱氨酸含量需酌情增加。天冬氨酸含量可酌情减少。可见,该技术可以指导补料工艺优化,也可以用于培养基配方优化,助力药物表达量的提高,同时更好地进行培养基成本控制。 除上述“细胞培养上清液分析方法包”包含的糖类、氨基酸、核苷酸和维生素等物质外,脂类物质也是细胞培养基常见添加物质。 对细胞培养来说,脂类化合物是一类水不溶性的、与生物合成相关的脂肪酸及其衍生物的总称。这类化合物可作为能量储存,也可作为细胞膜的结构组分,还可以在运输和信号系统中起作用。 因此,越来越多的客户开始关注细胞培养上清液中脂类化合物的分析。《岛津脂质介质LC-MS/MS分析方法包》,包含花生四烯酸、DHA、EPA、乙酰醇胺和其他脂肪酸及它们的代谢物,共196种脂质介质化合物,可用于细胞培养上清液中脂类物质的分析,揭示其在培养过程中的含量变化趋势,从而助力培养工艺优化。 2无机组分分析解决方案 细胞培养液中除了含有糖类、氨基酸、维生素等有机营养成分,还含有微量和痕量的无机元素,它们对细胞培养又有什么作用呢? ▷钠、钾、镁、钙、铁等微量元素,可以维持细胞渗透压平衡;▷钴、铜、铅、镉等痕量元素,影响代谢途径、某些酶和信号分子的活性;▷ 额外补充的Zn2+、Cu2+、Mn2+等,还可以提高产率和改善蛋白质量。 可以说这些微量和痕量元素,对细胞培养可是少而精,万万不可缺少的呢! 岛津公司作为细胞培养上清液分析领域的领军者,率先推出了元素分析解决方案,开发了ICPMS-2030 测定细胞培养液中多种元素含量的分析方法。 应用该技术测定了市售某细胞培养液中钠、镁、钾、钙等多种元素含量。样品平行处理6份,测定结果的RSD3%,加标回收率在94%~109%之间。 本方法操作快速简便,样品前处理简单,可以满足细胞培养液中多元素含量的测定要求。 基于岛津LC-MS/MS和ICPMS开发的细胞培养上清液分析平台,可以用于细胞培养基组分含量测定,也可以用于培养基配方优化,还可以用于培养基批间质量稳定性监控。该技术可以实现多组分同时检测,方法简单、快速、易上手。助力国产培养基研发和质控,迈上新台阶,迎来新发展,创造新奇迹!
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