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质谱结构预测

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  • 2020-2025全球质谱市场趋势预测

    质谱市场规模预计将从2020年的41亿美元增长到2025年的56亿美元,复合年增长率为6.5%。全球药品研发支出增加,政府对药品安全的监管,对食品质量的日益重视,原油和页岩气产量增加,在预测期内,不断增长的政府污染控制和环境检测举措是质谱市场的高增长前景。[align=center][url=https://www.antpedia.com/batch.download.php?aid=285254][img]https://i2.antpedia.com/attachments/2021/02/171857_202102261424281.jpg[/img][/url][/align][align=center][font=黑体, SimHei]COVID-19的意外爆发极大地影响了质谱市场。预计到2020年,市场将见证一系列多样化的采用。在医疗保健和制药、生物研究以及食品和饮料行业,采用质谱技术进行测试应用的可能性很大。新药开发,药物再利用,以及药物制剂产量的增加,使得制药行业对安全和质量措施的需求日益增加。严格的政府法规和这些行业对质量维护需求的增加推动了质谱法的采用。然而,石化行业供应链的中断,以及污染监测监管的放松,预计将限制质谱仪的采用。[/font][/align][color=#0070c0][b]  质谱市场动态[/b][/color][b]  驱动因素:制药和生物技术行业研发投资增加[/b]  近两年来,医药企业的研发支出大幅增加几十年。研究制药和生物技术行业的活动是由对关键领域的投资推动的,如生物制药和个性化医药。根据2018年欧盟工业研发投资记分牌,制药和生物技术行业占全球研发支出总额的18.9%。从药物发现的早期阶段到药物开发和临床试验的后期阶段,质谱技术在制药工业中发挥着关键作用。因此,增加医药和生物技术行业的资金有望推动质谱市场的增长。[b]  限制:产品的高定价[/b]  质谱仪器配备了先进的特点和功能,因此价格昂贵。除了系统成本外,系统符合行业标准的成本也非常高。由于技术的进步和操作效率的提高,对质谱仪的需求在过去几年中不断增长。然而,技术的发展提高了系统的价格。质谱仪的价格影响最终用户的购买决策。制药公司需要许多这样的系统,因此,资本成本大大增加。此外,学术研究实验室发现很难负担得起这样的系统,因为它们控制着预算。这些是限制最终用户采用质谱系统的主要因素。[b]  机遇:新兴国家的增长机遇[/b]  中国和印度等发展中国家为质谱市场的增长提供了各种机会。由于在这些国家的各个终端用户行业正在建立绿地项目,中国和印度对单一质谱仪和混合质谱仪器产生了巨大的需求。这些国家的生物制药工业很强劲,预计将对质谱和色谱分析市场的增长作出重大贡献。主要行业参与者正在建立新的设施、研发中心和创新中心,以利用这一机会,并与亚洲市场的参与者进行合作。 [b] 挑战:缺乏熟练的专业人员[/b]  有效使用质谱分析设备需要有相关经验和知识的熟练人员。在[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]GC-MS[/color][/url]或[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]中错误的操作会影响最终结果的质量。此外,在质谱法中,样品制备(包括等分、稀释和提取)是分离感兴趣的分析物的关键步骤。它消除了可能影响结果精度的干扰。缺乏正确选择技术的知识也会影响结果,并可能给最终用户带来直接和间接的费用。目前,在方法开发、验证、操作和故障排除活动方面缺乏熟练的人员,预计这将在未来几年在一定程度上抑制质谱市场的增长。 [b] 以终端用户分类,预计2020年至2025年,制药行业终端用户部门的复合年增长率将达到最高水平。[/b]  以终端用户为基础,质谱市场被细分为制药行业、生物技术行业、科研院所、环境检测行业、食品饮料检测行业、石化行业等终端用户。制药行业是质谱仪的主要终端用户之一。在预测期内,政府和企业为药物研究提供资金的可行性、制药行业的增长以及药物开发和安全方面存在严格的监管准则是推动该领域增长的一些关键因素。[b]  以质谱种类分类,在预测期内,混合质谱细分市场预计将以质谱市场最高的复合年增长率增长。[/b]  以产品为基础,质谱市场细分为混合质谱、单一质谱和其他技术。混合质谱部分预计在预测期内增长最快。混合质谱仪的优点,如快速和高分辨率的测试能力,更准确和精确的结果,正在增加其采用。因此,用于高通量筛选的质谱设备的需求也在增长。混合质谱部分进一步分为三重四极、四极杆飞行时间(Q-TOF)和傅里叶变换质谱(FTMS)。[b]  以应用分类,在预测期内,生命科学研究部门预计将以最高的复合年增长率增长。[/b]  以应用为基础,质谱市场已细分为生命科学研究、药物发现、环境检测、食品检测、应用产业、临床诊断等应用领域。其中,生命科学研究板块在2019年占据市场主导地位。组学技术在诊断学和生物标记物鉴定中的应用日益广泛,蛋白质组学的研发支出和政府资金的增加预计将推动这一领域的市场。  预计在预测期内,北美将是最大的市场。[b]  以地区划分,在预测期内,预测北美仍是质谱法的最大市场。[/b]  北美的质谱市场主要是由以下因素推动的:美国研究和政府举措的资金不断增长,代谢组学和石油行业中质谱的广泛使用,以及加拿大质谱项目的CFI资金。此外,美国食品和药物管理局(FDA)等监管机构正在鼓励使用分析技术,以确保市场上投放的药品符合质量要求。最近,随着油田的增加,美国页岩气和原油产量显著增加,这导致了质谱仪等分析工具的使用随之增加

  • 【求助】求助质谱解析-有没有可以分析出小分子量残片的分子结构的软件?

    wsearch软件可以根据分子量预测出分子式,但不能给出分子结构,有没有软件可以直接给出可能的分子结构的。这样分析残片时可以知道是什么,毕竟小的分子量的元素组合也没多少,可能的就更少了。或者网上有没有什么地方可以用分子量检索出可能结构的。例如:质谱中最小的峰为87,那么可能的分子式是什么呢?

  • 求助正离子质谱分析产物结构与底物对比

    求助正离子质谱分析产物结构与底物对比

    [color=#444444]如题 直接上图,预测的物质与质谱分析的结构有差异,请帮助分析下,谢谢!!![/color][color=#444444]底物ST:分子量是324,底物的结构见图底物;[/color][color=#444444]产物分子量是:352,质谱图见产物图;[/color][color=#444444]请问:产物如果是双羟基化合物或者是开环物(二者的分子量都是358),分子量与分离的产物的正离子-MS所示的分子量(352)不是很符合,请指教。[/color][color=#444444]因为产物的积累量不够,还没有作核磁,先把MS图贴上,请大神给分析分析,或者能帮着分析下可能的产物结构,谢谢。[/color][color=#444444][img=,690,426]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/09/201909091002250247_7652_1843534_3.jpg!w690x426.jpg[/img][/color][color=#444444][color=#008000]底物:MW=324,结构如图,已知[/color][/color][color=#444444][color=#008000][img=,690,409]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/09/201909091002449526_3497_1843534_3.jpg!w690x409.jpg[/img][/color][/color][color=#444444][color=#008000][color=#008000]产物的MS:MW=352,结构可能是ST-二羟基化合物或者是开环物(自己猜的)[/color][/color][/color]

  • 【原创大赛】质谱定性:结构式和免费解析工具

    【原创大赛】质谱定性:结构式和免费解析工具

    [align=center][b][font=宋体][size=14px]质谱定性:结构式和免费解析工具[/size][/font][/b][/align][font=宋体]在实际分析中,有机化合物的主要组成元素为[/font]CNOSP[font=宋体]且化合价≥[/font]2[font=宋体],原子之间连接形式丰富多样,如何确定原子之间的连接方式,解析化合物结构并得出结构式是鉴定化合物的关键。分析化学通过光谱、波谱和质谱等多种技术手段确定化合物结构。对于质谱技术,在《质谱定性:分子式及免费资源和工具》我们谈到质谱通过测量分子量定性化合物,高分辨高精度质谱数据在一定条件下可以计算出分子式,对于结构式,质谱技术通过把化合物分子“碎片化”并测量这些碎片化的质量来鉴定物质或者推测化合物结构,[b]这部分我们讨论质谱定性解析结构式和免费的解析工具,主要介绍免费的网络资源[/b]。[/font][font=宋体]限于篇幅,本文集中讨论论坛大家的关注热点,主要内容如下:[/font]1[font=宋体]讨论大家比较关注的[b]小分子[/b],质谱技术主要指的是[/font]ESI/APCI[font=宋体](常规大气压电离)—[/font]MS/MS[font=宋体](串联质谱)技术;[/font]2[font=宋体]讨论多级谱图(主[b]要是二级谱图[/b],但不讨论二级技术如:[/font]CID[font=宋体]、[/font]HCD[font=宋体]、[/font]ECD[font=宋体])的解析及未知物质的鉴定,对信号的处理及数据统计分析不讨论。[/font][b]1[font=宋体]多级质谱技术鉴定化合物策略[/font][/b][font=宋体]质谱主要测定的是质量,如果只能得到化合物的质量(即质谱图上的分子离子峰),在没有其它数据作支撑的情况下,即使提高测量的精度,符合分子量要求的化合物数量随着分子量增加急剧增加;现代化学认为化合物的分子结构(化学键和功能团)决定了化合物的性质和用途,对同一名义分子量化合物知道元素组成仅仅是完成最粗浅的测量(以上内容有兴趣了解的请参阅论坛帖子:质谱定性:分子式及免费资源和工具[/font][url]https://bbs.instrument.com.cn/topic/7560694[/url][font=宋体])。因此,用质谱技术来分析化合物结构比测量分子量意义更加重大。[/font][font=宋体]多亏了在质谱分析中,大家发现给化合物能量,会解离化合物结构,产生“碎片”。这些碎片信息和化合物结构直接相关。不同的碎片质量和信号强度组成了质[b][color=red]“谱”[/color][/b],质谱和光谱一样成了化合物的[color=red]指纹[/color],具有结构特异性,解析指纹进一步通过指纹鉴定化合物([/font]CompoundIdentification[font=宋体])成为质谱学的基本研究方向。[/font][font=宋体]质谱产生“碎片”能力为质谱的多级质谱能力,现代串联质谱不论是时间串联和空间串联常用的技术为[/font]MS/MS(MS2[font=宋体]二级质谱图[/font])[font=宋体],对于三级以上谱图因为仪器功能或者操作难度使用不普遍。电子攻击源([/font]EI[font=宋体]源)质谱一次给的能量要有些“富余”,除了分子离子峰,也会产生丰富的碎片信息,有的时候有些种类化合物甚至找不到分子离子峰。对于带碎片的质谱图(二级及以上质谱图),化合物的鉴定有以下策略:([/font]1[font=宋体])基于碎片产生的规则解析。在对一系列纯的化合物进行质谱分析后,发现相似的化合物有相似的碎片模式,通过总结发现了一些规律:奇偶电子、[/font]N[font=宋体]律、丢失重排还有不同化学功能团的碎裂等(这部分可以温习大学分析化学质谱课程),对于有经验的人员加上一定的目标化合物背景信息,可以对碎片进行比较好的解析,目前有些商品化软件如[/font][i]Mass Frontier[/i][font=宋体]才取类似基于碎片产生机制的软件专家系统辅助解析质谱。([/font]2[font=宋体])基于数据库搜索。基于碎片产生的规则,需要很强的经验,工作量挺大的,而且犯错的可能性挺大,如果我有足够数量的化合物,而且化合物纯度足够,我把这些化合物都预先在固定的仪器种类固定的实验条件下实验获得谱图并整理成数据库,在后续质谱实验拿获得质谱图与前期数据库进行比对来鉴定确认化合物。数据库搜索比对的算法(即打分方法)最经典的是把谱图向量化,计算两个向量化谱图的[/font]cos[font=宋体]值(参见论坛帖子:二极管阵列检测器与峰纯度分析[/font][url]https://bbs.instrument.com.cn/topic/4302951[/url][font=宋体]),分值越高,可能性越高。打分算法是质谱解析软件的重要组成,它关系着计算时间[/font]FDR[font=宋体],这些年新的打分算法发展很快。因为我不懂这里就不讨论了。目前大家使用最多的数据库有[/font]NIST[font=宋体]和[/font]Wiley[font=宋体]的[/font]EI[font=宋体]电离源数据库用于匹配[/font]GCMS[font=宋体]实验数据搜索,[/font]NIST[font=宋体]最新发布的[/font]2020[font=宋体]数据库包含了[/font]350643[font=宋体]张[/font]EI[font=宋体]谱图,有意思的是[/font]NIST[font=宋体]谱图收费,而搜库软件免费。对[/font]MS/MS[font=宋体]数据库,[/font]NIST[font=宋体]收录了[/font]652000[font=宋体]张谱图(很多事多肽),别的收录[/font]MS/MS[font=宋体]谱图库信息资源有[/font]MassBank[font=宋体],[/font]METLIN[font=宋体],[/font] Madison[font=宋体],[/font]MetabolomicsConsortium Database (MMCD)[font=宋体]等。[/font][b][font=宋体]搜库是质谱鉴定化合物最便捷最有效的方式,但是这种策略在[/font]MS/MS[font=宋体]分析小分子却遇到了极大困难。[/font][/b][font=宋体]首先,高质量的可重复的谱图不容易获得,其主要原因是质谱仪器多样。以[/font]EI[font=宋体]源为代表的[/font]GC-MS[font=宋体]技术电离能量固定,质量分析器绝大部分是四级杆(近些年也有[/font]QQQ[font=宋体],[/font]QTOF,Orbitrap[font=宋体]的高端[/font]GCMS[font=宋体]),谱图在不同实验室的可重复性较好,与之对应的是[/font]ESI/APCI[font=宋体]——[/font]MS/MS[font=宋体]技术质量分析器种类丰富,串联质谱的不同质量分析器组合更是眼花缭乱,产生[/font]MS/MS[font=宋体]碎片技术也是种类繁多,即使是同一种[/font]CID[font=宋体]碎裂技术,各家仪器公司设计的碰撞池和不同的碰撞能量标定也千差万别,[/font]CID[font=宋体]在不同质量分析器产生的碎片差别也会很大(如在[/font]QQQ[font=宋体]和离子阱同一化合物碎片离子差别较大;其次,相比蛋白质组学主要分析对象——多肽,小分子的结构预测和谱图预测非常困难,因为可以死磕蛋白质的基本结构肽键及氨基酸残基,加上有基因组学对蛋白质序列有很强的指导标定,所以搜库对以[/font]MS/MS[font=宋体]技术为基础的蛋白质组学也是很方便实用的,小分子结构千变万化,也没有什么资料可以预判结构,在没有相关背景信息时候,解析谱图,鉴定小分子基本上是连蒙带猜,可信度自己把握。[/font][b][font=宋体]解决以上问题的方案是把搜库和结构解析结合发展信息学工具[/font][/b][font=宋体]。扩大搜索化合物数据库([color=red]不是质谱图库[/color])范围,如[/font]PubChem[font=宋体],[/font]KEGG[font=宋体]等数据库,检索的主要参数是分子量;对于结构解析,化学信息学发展让直接计算([/font]in silico[font=宋体])碎片成为可能,通过计算的碎片与实际质谱数据匹配打分,解析鉴定化合物。在处理计算化合物[/font]MS/MS[font=宋体]碎片过程中,不同研究者和课题组有不同的处理方案,有的采用人工智能和机器学习方案对既有数据进行挖掘总结,形成算法解析匹配碎片离子,有的对既有化合物结构采用图论的方式,结合化学键能理论,把化合物分解成理论上碎片,有的从特征中性丢失片段([/font]MS/MS[font=宋体]中性丢失信息比[/font]EI[font=宋体]质谱丰富)、大碎片产生模式等把小分子进行分类,预测谱图,交叉验证。[b]在这些信息学工具发展过程中,提出了碎片树([/b][/font][b]Fragmentation trees[font=宋体],不同于基于多级质谱的碎片树)力求对所有碎片精心解析,同时也要发展具有特色的打分系统,提高鉴定成功率。[/font][/b][font=宋体]化学信息学在[/font]MS/MS[font=宋体]解析方面发展多年,有多重商业或者免费的软件,基于使用方便,我向大家推荐几款基于[/font]WEB[font=宋体]的信息学工具。[/font]2[b][font=宋体]基于[/font]WEB[font=宋体]的免费[/font]MS/MS[font=宋体]分析工具[/font][/b]2.1[size=14px] MetFrg [/size][font=宋体]发布于[/font]2010[font=宋体]年,是第一个结合搜库和串联质谱碎片预测技术鉴定小分子的软件,有[/font]WEB[font=宋体]版本和程序版本,[/font]WEB[font=宋体]网页地址:[/font][url=https://msbi.ipb-halle.de/MetFragBeta/%20%EF%BC%8C2016]https://msbi.ipb-halle.de/MetFragBeta/[font=宋体],[/font]2016[/url][font=宋体]更新了新的版本。我们以诺氟沙星和诺美沙星(二者[/font]MS/MS[font=宋体]谱图见图[/font]1[font=宋体])为例简单介绍使用过程,主要界面见图[/font]2[font=宋体],第一部分是化合物数据库搜索([/font][color=#00B050]Database Setting[/color][font=宋体]),一般建议选择比较大的数据库如[/font]Pubchem[font=宋体],增加搜索范围,也可以搜索自己比较熟悉的数据库,如[/font]LipidMaps[font=宋体],减少搜索范围,数据库越大,搜索计算时间越长。在[/font][color=#00B050]Parent Ion[/color][font=宋体]输入一级质谱分子量[/font]([font=宋体]诺氟沙星[/font]320.140429)[font=宋体],选择加和离子形式[/font]([M+H]+)[font=宋体],点击[/font][color=#00B050]Calculate[/color],[font=宋体]页面会自动就算[/font]Neutral Mass[font=宋体],输入质量准确度(默认为[/font]5ppm[font=宋体],建议不要低于[/font]10ppm[font=宋体]),点击[/font][color=#00B050]Retrieve Candidates[/color],[font=宋体]后台搜索选择的数据库,如果只有[/font]1[font=宋体]个选项,化学式[/font]Formula[font=宋体]会出现,在我们例子中共有[/font]9795[font=宋体]个候选化合物。点击[/font]DownloadCandiate[font=宋体]可以下载结果。[/font][img=,690,279]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291101157581_2325_2265735_3.jpg!w690x279.jpg[/img][font=宋体]图[/font]1. [font=宋体]诺氟沙星和诺美沙星[/font]MS/MSZ[font=宋体]质谱图。仪器[/font]LTQ-Orbitrap XL [font=宋体],[/font]ESI[font=宋体]电离源,[/font]HCD[font=宋体]碎裂模式。[/font][font=宋体]完成第一部分后,进入网页的第二部分碎片匹配注释([/font]FragmentationSetting & Processing[font=宋体])。左边的搜索条件同第一部分,其中[/font][color=#00b050]Tree Depth[/color][font=宋体]是碎片树([/font]Fragmentation trees[font=宋体])的层级,默认[/font]2[font=宋体],碎片离子较少可以选择[/font]1[font=宋体]。右边输入[/font][color=#00b050]MS/MS Peak list[/color][font=宋体],最多可以输入[/font]40[font=宋体]个碎片,一般选择[/font]S/N[font=宋体]大于[/font]3[font=宋体]的峰(诺氟沙星输入[/font]6[font=宋体]个碎片峰,其中一个为分子离子峰),可以[b]把[/b][/font][b]excel[font=宋体]数据直接复制进框[/font][/b][font=宋体],点击[/font][color=#00b050]Process Candidates[/color][font=宋体]。后台开始计算,第一部分候选结果越多计算时间越久,计算完毕,显示结果,共匹配到[/font]9469[font=&]个候选化合物。下拉[/font]WEB[font=&]页面,显示结果(图[/font]3[font=&]),结构式,命名等信息列表,其中倒数第二列[/font][color=#00b050]FinalScore[/color][font=宋体]显示打分情况,最高分为[/font]1[font=宋体],分数越高,可信度越高。在最后一列[/font]Details[font=宋体]点击[/font]Fragments[font=宋体],会弹出窗口显示碎片峰的归属注释,按照分子量从小到大排列,断裂片段显示为绿色(图[/font]4[font=&])。[/font][font=&][img=,690,431]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291103044054_6384_2265735_3.jpg!w690x431.jpg[/img][/font][font=宋体]图[/font]2 MetFrg WEB[font=宋体]使用界面(已经输入诺氟沙星质谱结果数据)[/font][font=宋体][img=,690,431]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291104030596_917_2265735_3.jpg!w690x431.jpg[/img][/font][font=宋体][font=宋体]图[/font]3 MetFrg WEB[font=宋体]诺氟沙星质谱图计算结果[/font][/font][font=宋体][img=,690,431]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291104312661_8999_2265735_3.jpg!w690x431.jpg[/img][/font][font=宋体][font=宋体]图[/font]4 MetFrg WEB [font=宋体]质谱图碎片峰注释结果[/font][/font][font=宋体][font=宋体]从输出结果显示测定分子是第[/font]29[font=宋体]个候选化合物,打分也很高,说明[/font]MetFrg[font=宋体]工具需要进一步优化。在诺美沙星的分析中,我们设定相同的分析参数,但是[/font]MS/MS[font=&]碎片更丰富,[/font]9[font=&]个碎片峰,候选化合物从[/font]8875[font=&]减少到[/font]8707[font=&](图[/font]5A[font=&]),但是目标候选化合物在第[/font]16[font=&]位,所以提高碎片的种类对鉴定结果具有重要意义。[/font][/font][font=宋体][img=,690,852]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291106411933_5743_2265735_3.jpg!w690x852.jpg[/img][/font][font=宋体][font=宋体]图[/font]5 [font=宋体]诺美沙星[/font]MetFrg分析结果[/font][font=宋体][/font][font=宋体]2.2[size=14px]CFM-ID[/size][font=宋体]相比[/font]MetFrg,CFM[font=宋体]对[/font]MS/MS[font=宋体]谱图数据要求更高,要[b]求提供低中高碎裂电压的[/b][/font][b]MS/MS[font=宋体]谱图[/font][/b][font=&]。[/font]WEB[font=宋体]地址为[/font][url]http://cfmid.wishartlab.com/[/url][font=宋体],目前版本为[/font]3.0([font=宋体]新版本强化了对脂类的谱图计算和鉴定[/font])[font=宋体],主要功能分三大部分(图[/font]6[font=宋体])[/font]:[color=#00b050] Spectra Prediction[/color]([font=&]谱图预测[/font])[font=宋体]、[/font][color=#00b050]PeakAssignment[/color][font=宋体](峰注释)和[/font][color=#00b050]CompoundIdentification[/color][font=宋体](化合物鉴定),点击页面功能区[color=#00b050]☆[/color][/font][color=#00b050]Utilities[/color][font=宋体],可以到达各个功能应用模块。[/font]CFM-ID[font=宋体]比[/font]MetFrg[font=宋体]在质谱图处理更加专业,区分[/font]EI[font=宋体]和[/font]ESI[font=宋体]源,对[/font]MS/MS[font=宋体]质谱图获得、模拟计算和比对更加侧重实际实验,在物质鉴定模块,它所应用的数据库如[/font]HDMB[font=宋体]、[/font]NIST[font=宋体]、[/font]DrugBank[font=宋体]等都是质谱图数据库,做的有“图”可依,鉴定过程更加接近商业化[/font]GCMS[font=宋体]过程,对于有准确度要求,更专业的用户,我更加推荐[/font]CFM-ID[font=宋体]。[/font][/font][font=宋体][/font][img=,690,358]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291110415660_6534_2265735_3.jpg!w690x358.jpg[/img][font=宋体]图[/font]6 CFM-ID WEB[font=宋体]界面。[/font][font=宋体][size=14px]以双硬脂酸磷脂酰乙醇胺([/size][/font][font='Calibri',sans-serif][size=14px]DSPE[/size][/font][size=14px])为例,获取不同碎裂能量谱图后计算,对碎片峰注释,结果如图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7[/size][/font][size=14px],输入不同碎裂能量的[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]MS/MS[/size][/font][size=14px]碎片峰(图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7A[/size][/font][size=14px]),点击运行后,输出重新绘制的[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]MS/MS[/size][/font][size=14px]图,点击峰,弹窗会碎片峰的结构信息(图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7B[/size][/font][size=14px])[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px],[/size][/font][size=14px]后续会有碎片峰(质量从小到大)的列表代码信息及打分(图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7C[/size][/font][size=14px]),最后是代码所指的结构式列表(图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7D[/size][/font][size=14px])。如果把图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7A[/size][/font][size=14px]检索的质量误差缩小,检索的碎片匹配会更少,打分越高(对比图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7C[/size][/font][size=14px]和图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7E[/size][/font][size=14px])。[/size][img=,690,403]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291111211908_5136_2265735_3.jpg!w690x403.jpg[/img][font=宋体]图[/font]7 CFM-ID MS/MS[font=宋体]谱图注释功能。[/font]2.3 [font=宋体]质量测定的精度提高了搜索与计算碎片的匹配度,[/font][size=14px]CSI: FingerID[/size][font=宋体]对质量精度要求更高,与前两个免费资源相比,在输入分子离子峰时,还要求输入所有同位素峰的质量即相对强度(图[/font]8[font=宋体]红框部分),从而更加精确的计算分子式([/font]fourmula[font=宋体]),力求做到元素精确。[/font]CSI: FingerID[font=宋体]的[/font]WEB[font=宋体]网址为[/font][url]https://www.csi-fingerid.uni-jena.de/[/url][font=宋体],界面逻辑性很好数据输入,分子式到结构式,值得一提的是[/font]CSI: FingerID[font=宋体]支持多级质谱([/font]MS[sup]n[/sup][font=宋体])输入(图[/font]8[font=宋体]绿框部分),算法是以[/font]QTOF[font=宋体]的数据为基本数据采用机器学习获得,鉴定比较精准,但是有局限性。值得一提的是软件版本是[/font]SIRIUS,[font=宋体]功能非常强大,提供多种模式计算分子式,保证了结构鉴定的准确度。[/font][img=,690,365]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291112077367_4334_2265735_3.jpg!w690x365.jpg[/img][font=宋体]图[/font]8 CSI: FingerID WEB[font=宋体]界面。[/font]3[font=宋体]总结[/font] [font=宋体]([/font]1[font=宋体])分子式是结构式的前提,在使用信息学工具时候,分子离子峰的质量峰是第一要输入的参数,要求质谱数据高准确度高分辨率(详细请参阅论坛帖子:质谱定性:分子式及免费资源和工具[/font][url]https://bbs.instrument.com.cn/topic/7560694[/url][font=宋体])。[/font][font=宋体]([/font]2[font=宋体])[/font][size=14px]MetFrg[/size][font=宋体]使用简便,数据库全,功能多,界面友好(我的最爱),鉴定准确度略低;[/font][size=14px]CFM-ID [/size][font=&]功能强大,[/font]EI[font=宋体]和[/font]ESI-MS/MS[font=宋体]谱图都可以运行,专业性强,在使用中对[/font]QTOF[font=宋体]数据有一定的偏好性,因为没有软件版,在使用中尤其是是有质谱图数据库检测常会抽风;[/font][size=14px]CSI: FingerID[/size][font=&]同样偏向[/font]QTOF[font=宋体]数据,页面设计逻辑性好,只奔着未知物鉴定的终极方向而去,功能稍显单一。[/font][font=宋体]([/font]3[font=宋体])不怕麻烦最好安装软件版本,[/font]WEB[font=宋体]因为浏览器和网络的原因,不是很稳定。[/font][font=宋体]([/font]4[font=宋体])条件允许最好自己建立数据库,三个都支持自建数据库,搜索效率更高,建立的数据库也是一笔宝贵资源。[/font][b][font=宋体]([/font]5[font=宋体])对立体异构的化合物,信息学工具目前没有好的解决方案,因为质谱鉴定立体异构体成功实验不够多(偶尔有成功的都发文章了),解析理论也不够充分。[/font][font=宋体]写在最后[/font]:[/b][font=宋体]疫情期间,有疫情发论文之争,我们测出来的病毒核酸序列是按照指定格式上传到国外生物信息学网站,也有美国对我们技术封锁新闻,华为的芯片设计软件是国外公司的,哈工大竟然被禁止使用[/font]MATLAB[font=宋体]……;个人,因为不能去公司上班,通过通信工具和同事交流并辅助“鉴定物质”,在使用国外数据库时,尤其是[/font]Pubmed[font=宋体]突然想到如果老美禁止我们登录他们的网站怎么办(奥巴马时期,因为美国政府停摆,有些公共服务网站服务器停摆了一周)。遂写了质谱定性系列帖子,期望可以引起对实验技术人员对数据整理及相关信息学研究的重视。[/font][font=宋体]帖子的内容大部分来自和同事的问答,限于篇幅,也为了增加可读性,删减了大量内容,在四月中旬上班补充了谱图,质谱定性[/font]-[font=宋体]分子式及免费资源在[/font]5[font=宋体]月底完成,剩下的准备[/font]10[font=宋体]月底之前完成,[/font]6[font=宋体]月底看到回帖有网友想看到谱图解析及鉴定的后续,在努力赶工完成疫情加班落下的工作间隙,匆忙在[/font]7[font=宋体]月份尾巴把第二部分写完。[/font][font=宋体][size=14px]大数据时代,数据就是知识,数据就是财富,我们有丰富的物质基础,期望我们有自己的数据库,有自己的信息学工具。[/size][/font]

  • 质谱四级杆结构

    有安捷伦6120单四级杆的质谱结构示意图,想看看Waters SQdetector2质谱结构图。或者其他质谱仪的。[img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2017/10/201710201425_01_2983142_3.jpeg[/img]

  • 【分享】蛋白质结构预测学习讲义

    蛋白质结构预测学习讲义--英文版的。[img]http://www.instrument.com.cn/bbs/images/affix.gif[/img][url=http://www.instrument.com.cn/bbs/download.asp?ID=112364]蛋白质结构预测学习讲义[/url]

  • 【资料】质谱仪结构与工作原理

    质谱分析法主要是通过对样品的离子的质荷比的分析而实现对样品进行定性和定量的一种方法。因此,质谱仪都必须有电离装置把样品电离为离子,有质量分析装置把不同质荷比的离子分开,经检测器检测之后可以得到样品的质谱图,由于有机样品,无机样品和同位素样品等具有不同形态、性质和不同的分析要求,所以,所用的电离装置、质量分析装置和检测装置有所不同。但是,不管是哪种类型的质谱仪,其基本组成是相同的。都包括离子源、质量分析器、检测器和真空系统。本节主要介绍有机质谱仪的基本结构和工作原理。 9.2.1.1 离子源(Ion source)   离子源的作用是将欲分析样品电离,得到带有样品信息的离子。质谱仪的离子源种类很多,现将主要的离子源介绍如下。 电子电离源(Electron Ionization EI) 电子电离源又称EI源,是应用最为广泛的离子源,它主要用于挥发性样品的电离。图9.1是电子电离源的原理图,由GC或直接进样杆进入的样品,以气体形式进入离子源,由灯丝F发出的电子与样品分子发生碰撞使样品分子电离。一般情况下,灯丝F与接收极T之间的电压为70伏,所有的标准质谱图都是在70ev下做出的。在70ev电子碰撞作用下,有机物分子可能被打掉一个电子形成分子离子,也可能会发生化学键的断裂形成碎片离子。由分子离子可以确定化合物分子量,由碎片离子可以得到化合物的结构。对于一些不稳定的化合物,在70ev的电子轰击下很难得到分子离子。为了得到分子量,可以采用1020ev的电子能量,不过此时仪器灵敏度将大大降低,需要加大样品的进样量。而且,得到的质谱图不再是标准质谱图。   离子源中进行的电离过程是很复杂的过程,有专门的理论对这些过程进行解释和描述。在电子轰击下,样品分子可能有四种不同途径形成离子: 样品分子被打掉一个电子形成分子离子。 分子离子进一步发生化学键断裂形成碎片离子。 分子离子发生结构重排形成重排离子。 通过分子离子反应生成加合离子。   此外,还有同位素离子。这样,一个样品分子可以产生很多带有结构信息的离子,对这些离子进行质量分析和检测,可以得到具有样品信息的质谱图。   电子电离源主要适用于易挥发有机样品的电离,GC-MS联用仪中都有这种离子源。其优点是工作稳定可靠,结构信息丰富,有标准质谱图可以检索。缺点是只适用于易汽化的有机物样品分析,并且,对有些化合物得不到分子离子。 化学电离源(Chemical Ionization , EI )。   有些化合物稳定性差,用EI方式不易得到分子离子,因而也就得不到分子量。为了得到分子量可以采用CI电离方式。CI和EI在结构上没有多大差别。或者说主体部件是共用的。其主要差别是CI源工作过程中要引进一种反应气体。反应气体可以是甲烷、异丁烷、氨等。反应气的量比样品气要大得多。灯丝发出的电子首先将反应气电离,然后反应气离子与样品分子进行离子-分子反应,并使样品气电离。现以甲烷作为反应气,说明化学电离的过程。在电子轰击下,甲烷首先被电离: CH4+e CH4+ + CH3+ + CH2+ + CH++ C+ + H+ 甲烷离子与分子进行反应,生成加合离子: CH4+ + CH4 CH5+ + CH3 CH3 + + CH4 C2H5+ + H2 加合离子与样品分子反应: CH5+ + XH XH2+ + CH4 C2H5+ + XH X+ +C2H6   生成的XH2+ 和 X+ 比样品分子XH多一个H或少一个H,可表示为(M1),称为准分子离子。事实上,以甲烷作为反应气,除(M+1)+之外,还可能出现(M+17)+,(M+29)+ 等离子,同时还出现大量的碎片离子。化学电离源是一种软电离方式,有些用EI方式得不到分子离子的样品,改用CI后可以得到准分子离子,因而可以求得分子量。对于含有很强的吸电子基团的化合物,检测负离子的灵敏度远高于正离子的灵敏度,因此,CI源一般都有正CI和负CI,可以根据样品情况进行选择。由于CI得到的质谱不是标准质谱,所以不能进行库检索。   EI和CI源主要用于[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相色谱[/url]-质谱联用仪,适用于易汽化的有机物样品分析。快原子轰击源(Fast Atomic bombardment, FAB)  是另一种常用的离子源,它主要用于极性强、分子量大的样品分析。其工作原理如图9.2所示:   氩气在电离室依靠放电产生氩离子,高能氩离子经电荷交换得到高能氩原子流,氩原子打在样品上产生样品离子。样品置于涂有底物(如甘油)的靶上。靶材为铜,原子氩打在样品上使其电离后进入真空,并在电场作用下进入分析器。电离过程中不必加热气化,因此适合于分析大分子量、难气化、热稳定性差的样品。例如肽类、低聚糖、天然抗生素、有机金属络合物等。FAB源得到的质谱不仅有较强的准分子离子峰,而且有较丰富的结构信息。但是,它与EI源得到的质谱图很不相同。其一是它的分子量信息不是分子离子峰M,而往往是(M+H)+或(M+Na)+等准分子离子峰;其二是碎片峰比EI谱要少。  FAB源主要用于磁式双聚焦质谱仪。 4.电喷雾源(Electron spray Ionization,ESI)   ESI是近年来出现的一种新的电离方式。它主要应用于液相色谱-质谱联用仪。它既作为液相色谱和质谱仪之间的接口装置,同时又是电离装置。它的主要部件是一个多层套管组成的电喷雾喷咀。最内层是液相色谱流出物,外层是喷射气,喷射气常采用大流量的氮气,其作用是使喷出的液体容易分散成微滴。另外,在喷嘴的斜前方还有一个补助气喷咀,补助气的作用是使微滴的溶剂快速蒸发。在微滴蒸发过程中表面电荷密度逐渐增大,当增大到某个临界值时,离子就可以从表面蒸发出来。离子产生后,借助于喷咀与锥孔之间的电压,穿过取样孔进入分析器(见图9.3)。演示动画(请点击画面)   加到喷嘴上的电压可以是正,也可以是负。通过调节极性,可以得到正或负离子的质谱。其中值得一提的是电喷雾喷嘴的角度,如果喷嘴正对取样孔,则取样孔易堵塞。因此,有的电喷雾喷嘴设计成喷射方向与取样孔不在一条线上,而错开一定角度。这样溶剂雾滴不会直接喷到取样孔上,使取样孔比较干净,不易堵塞。产生的离子靠电场的作用引入取样孔,进入分析器。   电喷雾电离源是一种软电离方式,即便是分子量大,稳定性差的化合物,也不会在电离过程中发生分解,它适合于分析极性强的大分子有机化合物,如蛋白质、肽、糖等。电喷雾电离源的最大特点是容易形成多电荷离子。这样,一个分子量为10000Da的分子若带有10个电荷,则其质荷比只有1000Da,进入了一般质谱仪可以分析的范围之内。根据这一特点,目前采用电喷雾电离,可以测量分子量在300000Da以上的蛋白质。图9.4是由电喷雾电离源得到的肌红蛋白的质谱图: 5.大气压化学电离源(Atmospheric pressure chemical Ionization, APCI)   它的结构与电喷雾源大致相同,不同之处在于APCI喷咀的下游放置一个针状放电电极,通过放电电极的高压放电,使空气中某些中性分子电离,产生H3O+,N2+,O2+ 和O+ 等离子,溶剂分子也会被电离,这些离子与分析物分子进行离子-分子反应,使分析物分子离子化,这些反应过程包括由质子转移和电荷交换产生正离子,质子脱离和电子捕获产生负离子等。图9.5是大气压化学电离源的示意图:   大气压化学电离源主要用来分析中等极性的化合物。有些分析物由于结构和极性方面的原因,用ESI不能产生足够强的离子,可以采用APCI方式增加离子产率,可以认为APCI是ESI的补充。APCI主要产生的是单电荷离子,所以分析的化合物分子量一般小于1000Da。用这种电离源得到的质谱很少有碎片离子,主要是准分子离子。  以上两种电离源主要用于液相色谱-质谱联用仪。

  • 【征集质谱仪器结构原理图的不同版本2】秀出你的质谱仪器结构原理图片(PPT)

    [font=黑体][size=4]本次活动以质谱仪器结构原理图为主题,征集各类型质谱仪器结构原理图和PPT,谁在最短时间内回复,根据回答情况将会获得此次活动的1-10分的奖励。[/size][/font]奖励方法:积极参与回答的,也将获得参与奖!1--5分最短时间回答全面正确的,将获得全部积分(10分)(活动结束)。[color=#00008B]质谱类型:质谱仪器结构原理图/PPT[/color]:[color=#DC143C]如果你有好的idea或者创意,想发起活动,那么我们热烈欢迎和支持,需要任何帮助或者有任何疑问,请跟我们的版主联系,我们将为板油提供大力的支持![/color]

  • 【分享】各种质谱仪、各种结构图

    【分享】各种质谱仪、各种结构图

    http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091744_281695_2197752_3.jpg离子阱质谱仪基本结构图----------------------------------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091747_281696_2197752_3.jpg反射式飞行时间质谱仪原理图-----------------------------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091749_281697_2197752_3.jpgob ius设计的TOF质谱仪横截面图------------------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091750_281699_2197752_3.jpg汤姆逊质谱仪--------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091751_281700_2197752_3.jpg硅同位素质谱仪---------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091752_281701_2197752_3.jpg反射式飞行时间质谱仪结构示意图---------------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091753_281702_2197752_3.jpg回旋质谱仪原理图-------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091754_281703_2197752_3.jpg激光解吸飞行时间质谱仪结构图--------------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091756_281705_2197752_3.jpg中性粒子质谱仪工作原理---------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091757_281706_2197752_3.jpg高分辨电喷雾离子源串级飞行时间质谱仪的结构图---------------------------------------------------------------------------------------http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103091758_281708_2197752_3.jpgACE卫星上的太阳同位素质谱仪---------------------------------------------------------------------------

  • 质谱仪五大组成结构及作用

    [font=&][size=18px]质谱仪的组成:真空系统、进样系统、离子源或电离室、质量分析器、离子检测器。[/size][/font][font=&][size=18px]1、真空系统作用,是减少离子碰撞损失。若真空度低:大量氧会烧坏离子源的灯丝;会使本底增高,干扰质谱图;引起额外的离子-分子反应,改变裂解模型,使质谱解释复杂化;干扰离子源中电子束的正常调节;用作加速离子的几千伏高压会引起放电等。[/size][/font][font=&][size=18px]2、进样系统[/size][/font][font=&][size=18px]高效重复地将样品引入到离子源中并且不能造成真空度的降低。间歇式进样系统——气体及低沸点、易挥发的液体;直接探针进样——高沸点的液体、固体;色谱进样系统——有机化合物。[/size][/font][font=&][size=18px]3、离子源或电离室作用是使试样中的原子、分子电离成离子,其性能影响质谱仪的灵敏度和分辨率本领。电子电离源的特点:电离电压:70eV;加一小磁场增加电离几率;EI源电离效率高,碎片离子多,结构信息丰富,有标准化合物质谱库;结构简单,操作方便;样品在气态下电离,不能汽化的样品不能分析,主要用于气-质联用仪;有些样品得不到分子离子。[/size][/font][font=&][size=18px]4、质量分析器作用将离子源产生的离子按质荷比m/z的大小分开。[/size][/font][font=&][size=18px]5、离子检测器[/size][/font][font=&][size=18px]法拉第杯(直接电测法)离子流直接为金属电极所接收,并用电学方法记录离子流大小。二次电子倍增器(二次效应电测法) 一定能量的正离子打击阴极的表面,产生若干二次电子,然后用多级瓦片状的二次电极(或称打拿极)使二次电子不断倍增,后为阳极所检测。 二次电子倍增器的检测极限更低。好点的质谱会同时配备这两种检测器[/size][/font]

  • 请教这个质谱图可能的结构式

    请教这个质谱图可能的结构式

    [color=#444444]我在做生物降解方面的研究,但由于谱库里没有目标化合物的谱图,也没找到代谢中间产物的谱图,请教各位,下面的质谱图有几个羟基?可能的结构式[/color][color=#444444][img=,690,486]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/08/201908221509066907_1178_1823055_3.jpg!w690x486.jpg[/img][/color]

  • 【分享】生物质谱在糖蛋白结构分析中的应用

    【分享】生物质谱在糖蛋白结构分析中的应用

    生物质谱在糖蛋白结构分析中的应用项目完成人:桑志红 蔡 耘项目完成单位:国家生物医学分析中心 随着人们对糖蛋白参与生命活动机理的日益深入了解,对天然糖蛋白及重组糖蛋白类药物的分析越来越受到重视。重组糖蛋白类药物的质量控制更是直接关系到药物的疗效及至人类的健康。九十年代以来,随着带有反射功能的基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和纳升电喷雾串联质谱(nano-ESI-Q-TOF)等具有软电离方式的现代质谱 技术的发展,质谱以其高灵敏度和强有力的分析混合物的能力,提供了生物大分子的分子量、序列、一级结构信息以及结构转换、修饰等方面的信息,使糖基化分析有了重要的进展。 通常研究糖蛋白的方法是把蛋白链上的寡糖切下来,分别研究蛋白部分和寡糖部分的结构,因此无法研究与两部分共同相关的结构问题,也不能区分不同糖基化位点上切下来的寡糖。自90年代初,国外有人开始用质谱法研究糖蛋白的结构,同时描述了各个位点的不均一性。我们用建立的现代生物质谱技术研究糖蛋白一级结构的方法,将其应用与基因重组糖蛋白的结构分析。为糖蛋白结构分析及基因重组糖蛋白类药物的质量控制提供新的手段。一、 生物质谱研究糖蛋白结构方法的建立实验所用仪器为:1.德国BRUKER 公司的REFLEXIII型基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱仪,N2激光器,波长337nm,线性飞行距离150cm,加速电压2kv。2.英国Micromass 公司Q-TOF型电喷雾串联质谱仪。源温80°C,气体流速40L/h,枪头电压650V,检测频率2.4S,氩气碰撞池压力6*10-5mbar。1. 基质的选择,在MALDI-TOF-MS分析中,基质起着相当重要的作用。不同的基质对不同类的物质响应不同,a-氰基-4-羟基肉桂酸用于测定糖蛋白核糖核酸酶B效果相对较好。2. 糖蛋白分子量的测定,糖蛋白核糖核酸酶B由124个氨基酸组成,在34位Asn处连有一个高甘露糖型N-糖链。由于糖链的微不均一性,与普通蛋白质及核酸不同,其分子离子峰在MALDI-TOF-MS 质谱图上表现为一簇峰,各峰之间约相差一个糖基。正是由于这种微不均一性,使得其分子离子峰变宽,灵敏度降低。糖链分子量越大,峰越宽,灵敏度越低,所以一般只有糖链较短,蛋白的质量不太大的糖蛋白才能测定其平均分子量。用MALDI-TOF可直接测定糖蛋白核糖核酸酶B的平均分子量为 15208.6Da。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/03/201103211511_284179_1604317_3.jpg3. 糖含量的测定,采用O聚糖酶及内糖苷键酶F分别作用于核糖核酸酶 B,只有内糖苷键酶F能够是其分子量发生变化,表明核糖核酸酶B分子中不存在O-连接糖链存在着N-连接糖链。内糖苷键酶F切断N-糖链五糖核心最内侧的GlcNAc-GlcNAc糖苷键,得到含一个GlcNAc的肽链,减去GlcNAc,可以计算出准确的肽链分子量T=13695.6,与糖蛋白平均分子量之差为糖链的平均分子量G=1513.4,平均糖含量为:(糖链大小/糖蛋白分子量)×100%=9.95%。4. 糖基化位点的确定,研究糖基化类型及糖基化位点的策略:采用蛋白酶酶解与糖苷内切酶酶解相结合的方法,通过酶切前后含糖肽片的位移,结合网上数据库检索,可以确定糖基化类型和糖基化位点。以不同类型的糖苷内切酶作用于糖蛋白(N-糖苷键酶或O-糖苷键酶),在MALDITOF-MS 上观察其质量的变化,可以直接确定糖蛋白中是否含有响应类型的糖链,这是我们确定糖蛋白中糖苷键类型的基础。我们采用先将核糖核酸酶B还原烷基化,加Glu-C酶切,产物再用内糖苷肩酶F酶切,可观察到含糖肽段出现位移,将核糖核酸酶B的肽质量指纹图进行数据库检索,证实发生位移的肽段中含有N-糖链特异连接位点,由此确定34位Asn为糖基化位点。另外我们采用内糖苷键酶F及肽-N-聚糖酶F两种酶进行差位酶切法对含糖肽段进行验证,两种酶酶切后分子离子峰的差值除以GlcNAc的质量,结果就是N-糖基化位点的个数5. 质谱测定氨基酸序列, 我们对核糖核酸酶B肽质量指纹谱中的含糖肽段进行了串联质谱测定,首先在一级质谱图中选择离子4972.23,在串联质谱的碰撞活化室以氩气与其碰撞产生碎片,从碎片的质荷比推算出此肽片中的一段氨基酸序列,检索结果为核糖核酸酶B,从而判断其理论序列是否一致。6. 糖链结构的研究,凝集素对糖肽的亲和提取,进一步分析糖肽序列及糖链结构的关键是含糖肽段的提取。核糖核酸酶B中糖链为高甘露糖型,我们选用对其有特异性吸附的伴刀豆球蛋白对其进行提取利用这种简捷的亲和质谱的方法,对糖肽段进行了分析。建立了亲和质谱分析糖肽类物质的方法,为今后糖肽序列分析及糖链结构分析奠定了基础。二、基因重组糖蛋白人促红细胞生成素(rhEPO)的结构分析。 利用以上建立的方法,我们对样品重组人促红细胞生成素进行了分析,断定此样品为非完全糖基化,样品中只存在N-连接的糖链,无O-糖链。应用酶切法用肽-N-聚糖酶处理后,得到两个含糖肽段,进行数据库检索,测得38位及83位为N-糖基化位点,与文献报道相符,结果可靠。因此,该项课

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    最近用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相色谱[/url]检-质谱联用检测了一种具有顺式、反式结构农残类物质,出现了两个分离不好的色谱峰,保留时间相差0.03秒,两个峰的响应值基本相同,用质谱检测抽取的离子是一样,调整升温程序也无法分开。不知道各位有没有碰到过类似的情况,给点建议如何处理,是同时取两个峰的响应值还是有什么其它的办法?谢谢

  • 请求好心人帮我推测一下化合物的质谱碎片结构

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  • NIST MS search检索质谱图后不显示结构式

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  • 如何通过一二级质谱图来推断未知物的结构?

    各位大佬,求教如何通过二级质谱图来推断未知物的结构呢?有没有一个大致的推断思路?比如最容易断哪些键,然后形成多少质荷比的峰这种的,经验或者资料都可以,面试时候有问到,我说还不会,只会已知化合物的检测方法优化。。。

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