质谱测序平台

有投资者向迪安诊断(300244)提问， 质谱和基因测序技术有什么区别?哪个更有优势?　　回答表示，尊敬的投资者，您好!质谱和基因测序技术均为可应用于多个领域的平台化技术，质谱可以直接对体内各种代谢、蛋白等物质进行定量检测，从表型组学层面全程对疾病的诊断、治疗、预后进行监测 而基因检测通过对疾病的本质与起源进行检测分析，基于基因组学获得精确的诊断结果和合适的治疗方案 两者在特定场景下的优势各有不同。谢谢!

8月18日，以“孔窥万物 洞见未来”为主题的“READs2023中国纳米孔基因测序大会”在四川成都隆重举行。作为我国纳米孔基因测序技术的开拓者，齐碳科技联合院士、行业专家学者，进行多场学术交流与思想碰撞，全面呈现纳米孔测序技术及应用的最新进展，挖掘纳米孔测序技术未来潜力以及其在临床与科研应用端的诸多可能性，共促前沿科技从研究到成果转化的高质量发展。同时，齐碳科技进一步扩充产品矩阵，在会上发布中通量纳米孔测序平台QPursue，涵盖便携式纳米孔测序仪QPursue-6k、桌面式纳米孔基因测序仪QPursue-6khex及配套芯片QCell-6k。其中，QPursue-6k支持单张芯片测序，设计通量60Gb，QPursue-6khex可以灵活选择1-6张芯片进行测序，可产出360Gb数据，满足了更高通量、更灵活的测序需求。得益于测序通量的大幅提升，QPursue中通量纳米孔测序平台极大拓宽了适用范围，在微生物群研究、孟德尔遗传病、肿瘤研究、物种鉴定、生物多样性等应用场景，进一步赋能科研与临床工作。新思想 大咖云集 以前瞻视野把脉行业发展READs2023中国纳米孔测序大会现场“READs2023中国纳米孔基因测序大会”由中国医疗保健国际交流促进会分子诊断学分会、四川大学疾病分子网络前沿科学中心和齐碳科技共同举办，邀请中国科学院、中国疾病预防控制中心、国家生物分析中心、扬州大学、南方科技大学等多领域优秀机构的资深专家学者齐聚一堂，站在基因测序代际变革当下，以前瞻视野把脉新一代测序技术如何释放潜力、惠及人类健康。中疾控病毒所中心实验室主任、中国医促会分子诊断学会主任委员马学军致辞大会主席、中疾控病毒所中心实验室主任、中国医促会分子诊断学会主任委员马学军首先作大会致辞，他表示，当前，基因测序技术已经在疾控、医学、农业、环境科学等多个领域发挥了重要作用，纳米孔测序技术不仅为基因测序带来重要的突破，也为生命科学研究和应用提供了诸多可能性。READs大会将搭建一个汇聚各方智慧和创新的交流平台，共同推动新一代测序技术的进步和多元应用。四川大学华西医院副院长郭应强教授在致辞中表示，基因测序技术是精准医学发展的关键基础，经过近50年发展，目前在病原体研究、感染性疾病的诊断与防治等领域发挥重要作用。希望READs2023通过学术交流探讨，加速前沿技术的应用成果向临床转化，推动精准医学发展。作为大会特邀嘉宾，中国科学院院士、国家生物医学分析中心主任张学敏也对大会充满期待，他认为，新冠疫情让人类意识到，我们仍有许多科学问题未解答，纳米孔测序技术的巨大发展潜力，可能革新甚至颠覆重大疾病的防控方式，期待这项技术和设备的发展能提供突破性的解决办法和技术手段。在学术报告环节，来自病原检测、肿瘤诊治、法医遗传、公共卫生、环境微生物研究等生命科学各个领域的学术大咖，分享了各自基于齐碳纳米孔基因测序平台的最新研究进展。中国科学院微生物研究所研究员胡松年分享纳米孔测序前沿应用人类基因组计划中国部分总工程师、中国科学院微生物研究所研究员胡松年从测序技术的角度，对比了二代、三代测序技术在微生物基因组测序中的应用现状，他表示，基因组相当于是医学里的解剖图，化学里的元素周期表，是基础中的基础。近五年来，几乎所有基因组测序项目都有三代测序的身影，当下完成一个高质量基因组测序已经变得“简单粗暴”——就是以三代测序为主。纳米孔测序作为三代测序最具代表性的测序技术，其边测序边分析、小巧便携的特性，在高质量的微生物基因组测序中，十分具有竞争力。四川大学华西基法学院副研究员王正分享纳米孔测序前沿应用四川大学华西基法学院副研究员王正现场分享了纳米孔测序在法医刑侦领域的最新研究进展。值得一提的是，8月14日，王正所在的四川大学基法学院侯一平教授团队使用齐碳纳米孔测序平台对线粒体基因组进行研究的文章，刊登于法医遗传TOP期刊。此外，在为期一天的学术分享中，扬州大学特聘教授李瑞超、中科院昆明动物所研究员杨兴娄、中疾控病毒所中心实验室副研究员王佶、南方科技大学环境科学与工程学院副研究员夏雨，美因基因总裁黄宇峰等专家，激荡思维，碰撞观点，呈现了一场测序技术与生命科学的思想盛宴。新动能 国内第一个商业化中通量纳米孔测序平台重磅发布大会现场，齐碳科技联合创始人谢丹博士宣布，齐碳科技推出自主研发的中通量纳米孔基因测序平台QPursue，该平台涵盖纳米孔基因测序仪QPursue-6k和QPursue-6khex及其配套芯片QCell-6k。这是齐碳科技继QNome-3841hex后，再次隆重发布商业化纳米孔测序仪，代表着国内纳米孔基因测序技术的最前沿水平，标志着国产纳米孔基因测序仪向中高通量进阶。齐碳科技联合创始人谢丹博士发布QPursue中通量测序平台谢丹博士在发布中表示，此次推出的QPursue中通量纳米孔基因测序平台，是齐碳团队经多年打磨的又一项重磅产品，一次性推出两款机型，希望能满足用户多元、灵活、更高通量的测序需求。齐碳科技自主研发的中通量纳米孔基因测序仪QPersue-6k其中，QPursue-6k搭载1张芯片，设计通量为60Gb，QPursue-6khex可以灵活选择1-6张芯片进行测序，可产出360Gb数据。测序平台通量的提升，最主要得益于配套测序芯片QCell-6k的性能提升。QCell-6k采用密度更高的ASIC电路排布方式，将生物芯片和电路芯片合二为一，单芯片搭载孔数超过6000个，实现通量的大幅提升，同时，测序抗干扰性更强，信噪比更高，测序表现更加稳定。在准确率方面，QPursue中通量测序平台适配齐碳研发的最新一代K2生化体系，搭载全新算法套件，单次准确率达97%，一致性准确率（70x）在Q50以上，通量的大幅提升，加之原本长读长的特性，在大基因组测序的应用场景中，潜力无限。在高通量、高准确率的基础上，QPuesue-6k仍保持小巧便携的特性，仪器长、宽仅为15cm，芯片的装卸方式改为一步卡嵌式，让测序操作更流畅。虽然测序通量有数量级的提升，但配合高效的算法和计算设备，仍然可以实现实时测序，是现场测序和小型实验室的首选。通量的大幅提升，也将为用户带来单位测序成本的大幅度下降，能够满足大型基因组测序对于数据量的需求，极大拓宽了纳米孔测序的适用范围，可在微生物群研究、孟德尔遗传病、肿瘤研究、物种鉴定、生物多样性等应用场景，提供快速、可靠的测序支持。在业界广泛关注的应用表现方面，齐碳使用人类标准基因组、细菌混合标准品（zymo）进行测序，数据结果展示，QPursue中通量测序平台在大型复杂基因组组装及变异检测、微生物群落物种构成分析及宏组装等应用场景的性能得到验证，上述测序结果均达到了预期的结果或指标，这表明QPursue中通量测序平台应用的广泛性和可靠性。在发布会上，谢丹博士还发布了齐碳科技自主研发的小型自动化建库设备QPrenano-100，该设备可实现1-24个任意数量文库的自动化构建，搭配齐碳建库试剂盒、快速建库测序试剂盒等产品，将实现建库全流程自动化运行，大幅解放人力，提高操作效率。QPrenano-100具有体积小巧、精准移液的特征，普通实验台即可摆放，可帮助用户实现高效、全自动化的样本制备。新突破 新一代基因测序技术处于爆发前夜大会现场，齐碳科技联合创始人兼首席科学家白净卫博士分享了纳米孔基因测序的发展现状及未来趋势，从测序技术的代际变革着手，分享了每一代测序技术的原理与特点，以及基于纳米孔基因测序技术的最前沿科学研究成果。齐碳科技联合创始人&首席科学家白净卫博士分享纳米孔测序技术提到纳米孔测序仪的研发，他表示，“纳米孔测序技术的特点是超长读长、小型化、速度快，在开发产品的过程中，我们对自己提出了更高的要求，比如提到速度，不仅仅是测序速度本身，而是从产出数据到分析结果的实时快速；提到操作简单，不仅仅样本处理简单，而是从样本到结果的一键式测序；提到成本，是单位数据成本、设备成本如何进一步降低。”白净卫博士认为，作为创新赋能工具，纳米孔测序技术的时代已经来临。该观点引起参会者的广泛共鸣，以纳米孔基因测序技术为代表的新一代基因测序，正凭借其长读长、实时测序、小巧便携等突出优势已经步入提速发展的新阶段，处于爆发前夜。现场嘉宾还表示，虽然当下市场仍以二代测序为主流，但随着以纳米孔测序技术为代表的新一代测序技术，在市场成熟度、市场拓展等方面均进入加速状态，到达一个拐点之后，必然将迎来爆发式增长。齐碳科技自2016年起便踏入我国纳米孔基因技术无人区，通过持续的技术攻关，2021年底推出国内首款商业化纳米孔基因测序仪QNome-3841，叩开国产纳米孔基因测序仪商业化的大门，成为国产纳米孔测序的引领者。商业化一年多以来，齐碳纳米孔测序平台已在多个领域发挥出重要作用，在病原体研究、动植物疫病防治、司法刑侦、公共卫生防疫等领域服务超200家机构用户，为了让更多用户直观地体验和学习纳米孔测序技术，今年6月，齐碳科技首个客户体验中心在成都正式启用，截至目前，已接待了百余位来自全国各地的用户。快速的商业化布局背后，一方面是齐碳科技扎实的技术积累与持续的创新攻关能力，另一方面则是广阔的市场需求，数据显示，全球基因测序仪及耗材市场在过去数年内年复合增速达20%。预计到2030年，全球基因测序仪及耗材市场将达到245.8亿美元的市场规模，中国基因测序仪及耗材市场将达到303.9亿元的市场规模。未来，齐碳科技将以中通量纳米孔测序平台发布为新的起点，持续深耕产品，不断降低测序成本，提升测序性能，以打造样本进、结果出的一站式纳米孔基因测序解决方案为目标，持续推动纳米孔测序技术的商业应用转化，真正实现人人可及的基因测序，为人类健康保驾护航。

p style=" text-align: center " img width=" 500" height=" 362" title=" 1.jpg" style=" width: 500px height: 362px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201601/noimg/624d8c18-130a-4ca9-b8a3-5073ff7943f5.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p 　　武汉未来组今天正式宣布引进最新的美国三代测序平台Sequel，借助于独家开发的基于“天河二号”平台的 a title=" " style=" color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " href=" http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-1-1-1.html" target=" _self" span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 三代测序 /span /a 基因组组装流程，未来组即将提供“一周一个动植物基因组”的特色服务。 /p p 　　2016年1月21日，中国首家三代测序服务公司武汉未来组与美国PacBio公司在中国的独家代理商基因公司顺利签约引进了Sequel测序仪。根据协议，未来组将引进至少3台最新的PacBio公司的三代测序平台Sequel，以满足呈指数增长的三代测序服务需求，从而继续领跑中国三代测序服务市场。这是未来组在采用“天河二号”超级计算机，顺利解决高度复杂动植物基因组组装问题之后，又一次进行技术平台的升级，以实现未来组构建中国最有影响力的三代测序平台的战略目标。 /p p 　　本次引进的三代测序平台，包含3台Sequel测序仪及其附属配套仪器与软硬件，将部署在武汉光谷生物城的未来组生产研发中心，面积超过1000平方米，采用10万级洁净实验室，以确保生产过程中达到最高的环境标准，从而确保最高的测序质量。 /p p 　　与PacBio RS II平台相比，Sequel测序平台虽然体积只有约1/3，测序通量却提高了7倍。目前每台测序仪的通量超过8,000Gb/年，相当于每年大约可以完成100个动植物基因组的测序(按1Gb估算)。目前，武汉未来组已经开始接受新测序平台的服务预定，在优先保证老客户使用的前提下，公司还将优先支持高度复杂的动植物基因组项目、人类基因组测序项目、复杂微生物组测序项目等领域。同时，该Sequel测序平台也将提供给兄弟公司北京希望组用于精准医疗方面的前瞻性科学研究，成为国内首家将三代测序用于医疗健康领域的机构。 /p p 　　 strong 关于第三代测序技术 /strong /p p 　　第三代测序技术也称为单分子实时测序技术。美国Pacific Biosciences公司是目前唯一正式商业化的第三代测序仪厂商，已在全球范围内为多个基因组学中心提供PacBio RS II测序仪，并于2015年10月推出新产品Sequel测序仪。PacBio测序具有超长读长(平均读长10-15Kb，最长读长可超过40Kb)、无PCR扩增偏差的单分子测序、直接分析碱基修饰等技术优势，已经快速应用于基因组de novo组装、转录组学研究等领域，随着性价比的不断提高，第三代测序技术将在未来的2-3年内快速普及。 /p p 　　 strong 关于武汉未来组 /strong /p p 　　武汉未来组生物科技有限公司(Nextomics Biosciences)成立于2011年8月8日，总部位于武汉光谷生物城，目前在北京生命科学园和美国洛杉矶设立有分支机构，是中国首家第三代测序服务公司。 /p p 　　武汉未来组通过三代测序生物信息学工具和流程的开发，解决了复杂基因组组装、微生物完成图组装、全长转录组分析、人类基因组变异检测等领域的技术瓶颈，推动了基因组学研究的升级换代，目前已经完成数百个三代测序科研项目，发表了多篇三代测序的科学文献。因为专注于三代测序技术开发和应用推广，武汉未来组已经成为中国三代测序技术应用的领导者。 /p

p style=" line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px " 近日，华大基因公布2019半年度报告。2019年上半年，华大基因全面优化自主平台，持续推进技术革新，公司整体经营业绩保持稳定发展态势。报告期内，公司实现营业收入129,143.94万元，同比增长13.20%；实现归属于上市公司股东的净利润 19,797.25万元，同比下降4.70%；归属于上市公司股东的扣除非经常性损益后的净利润为17,799.64万元，同比增长6.24%。 报告期内，公司继续加大研发投入力度，研发投入总金额为15,212.83万元，同比增长51.63%，占营业收入比例为11.78%。 /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 383" title=" 华大整体.png" style=" width: 600px height: 383px max-height: 100% max-width: 100% " alt=" 华大整体.png" src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/71194db2-07ad-49c4-831f-55a881b46eef.jpg" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px " 深圳华大智造科技有限公司系华大基因同一控制人下的关联公司，本次报告中对该公司的经营情况没有单独披露。但在报告中，增加披露报告分部“精准医学检测综合解决方案”，此报告分部主要包含仪器试剂及综合解决方案服务收入，此报告分部收入占营业收入比例约17%。 /p p style=" line-height: 1.5em text-indent: 0em margin-bottom: 10px " br/ /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 355" title=" 精准.png" style=" width: 600px height: 355px max-height: 100% max-width: 100% " alt=" 精准.png" src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/6d5a382b-9944-4a12-b137-e49061e6d316.jpg" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px " 基因组相关产业已形成了包含科学发现、技术发明、产业发展的完整产业链条。高通量基因测序仪的代表企业是华大智造、美国Illumina等。 /p p style=" line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px " 高通量基因测序技术目前最广泛的应用是在临床医学服务，代表性的应用有无创产前基因检测，此外还有肿瘤防控基因检测。目前肿瘤辅助诊断手段包括分子检测（包含高通量测序）、质谱、免疫检测、生化检测等，各技术在应用场景上有所互补。我国肿瘤基因检测处于行业生命周期中的成长阶段，尚未建立统一的行业规范。 /p p style=" line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px " & nbsp 随着精准医疗概念的提出及测序技术的不断发展，感染防控类基因检测已成为基因测序技术在临床医学服务中的重要应用领域。除此之外，以多重PCR、微流控等技术为依托的新型基因检测技术的市场份额逐渐提升。 /p p style=" line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px " strong 由于中美之间不断产生的贸易摩擦， 依赖于国外进口仪器和试剂耗材的中下游企业未来发展面临的不确定性加大。基于自主国产测序平台，从事技术开发产品和服务的机构因政策扶持和成本可控未来有望提升在行业内的主动权。 /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px " 推广国产测序平台，发展多组学大数据业务是华大基因2019年上半年的主要经营成果之一，多组学大数据服务业务依托DNBSEQTM自主平台测序仪、BGI Online生物信息云计算平台及多组学数据挖掘系统Dr.Tom，在实验和数据分析环节上实现了全面替代。 /p

p 　　自二代测序的技术问世以来，就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展，二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中，上游做检测，中游做分析，下游做应用。在测序价格持续下降的情况下，中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。 /p p 　　传统的测序数据分析依赖于本地服务器的性能。而可以预见的是不断下降的测序价格将会带来更多海量测序数据的产生，而巨大数量的测序数据无疑会延长获得测序分析结果的时间。目前可能较好的解决方法是通过云计算的方式去做，云计算的优势在于能够通过分布式计算对大数据进行处理，从而极大提升运算效率以及降低成本。 /p p 　　目前国外的云计算平台Seven Bridge已经做的比较成熟，对二代测序数据也能够进行快速分析。缺点是作为典型的pipeline式分析，对用户的要求比较高，对于国内用户群体的使用会有一些障碍。而在国内的云计算平台中，GCBI将于2016年2月底发布新的全基因组测序分析平台，虽然还没有公布具体的信息，但是希望能够体现基本功能的高效率和高可用性。 /p p 　　接下来我们看看在不同的领域，测序的云计算平台可能带来的变革与进步。 /p p 　　 strong 科研领域 /strong /p p 　　科研研究者一直是测序的重要使用群体，由于测序成本的持续降低及更多的测序服务供应商选择，可以预见的是测序数据的产量与规模大幅度提升。而这部分数据是必然需要分析的，在没有大规模数据分析平台之前，分析的效率受限于本地服务器的规模，数据量越大，分析的时间也越久。而测序的云计算平台将有望突破这个瓶颈，100个样本，1000个样本，分析的时间都仅跟1个样本的分析时间类似，这将极大降低用户的时间成本。预计随着数据分析平台化的出现，科研研究的周期将大大缩短。 /p p 　　 strong 临床应用领域 /strong /p p 　　在传统的诊疗模式下，临床医生需要各种检查数据以及查体来对病人进行诊断。一旦分子层面的检测在临床进行开展，云计算平台可以通过对同一种疾病临床数据及分子检测数据的收集和快速分析，对特定的病人给出相应的辅助诊断参考，甚至给予相应的用药方案。临床医生在合理应用的情况下，整个诊断的过程将会变得更快速以及更准确。如果未来疾病的发展演变成依据分子水平的变化进行分类，那么诸如GCBI等云计算平台对临床的帮助会更大。 /p p 　　 strong 个人健康 /strong /p p 　　随着测序技术在医疗领域的应用，市面上已经有不少针对个人健康的检测业务了，检测方法包括个人全基因组测序、定制化基因芯片等等。而这些数据的分析与解读也会随着检测成本的下降变得越来越普遍。当每个人都会去做这样的检测时，云计算平台将有望对这部分数据的快速解读提供可行的解决方案。个人用户将更快速地获取自己的结果报告。 /p p 　　 strong 合作模式 /strong /p p 　　鉴于生物信息云计算平台的强大功能，有望在平台与科研单位、临床研究者甚至企业之间搭建各种各样的合作模式。科研单位与云平台的合作能加快科研成果的输出，云平台可以帮助科研单位进行成果的转化与应用 临床研究者可以借助云平台进行辅助诊断，云平台通过临床数据的输入不断使诊断模型优化 企业通过云平台可以推广自有产品，云平台也可以给用户提供更多样的供应商选择。 /p p 　　可以预见的是，生物信息云计算平台的强大能力不仅仅会体现在其计算能力上，临床应用，合作转化等方面都可以展现其潜力。就让我们拭目以待看看云计算平台的发展吧。 /p

2023年3月，布鲁克公司(纳斯达克股票代码：BRKR)在美国HUPO会议上宣布为基于timsTOF平台的4D-蛋白质组学推出十分重要的生物信息学工具：　　1. 与Rapid Novor公司合作开发了一种新型从头测序算法，使用超过170万个PASEF数据点来提高实时免疫肽组学分析的准确性和速度。timsTOF SCP系统无与伦比的灵敏度与新的PaSER Novor算法相结合带来免疫肽组学分析性能的全面提升，尤其是针对微量肿瘤活检样本 　　2. 用谱图库非依赖(Library-free)的TIMS DIA-NN软件进行dia-PASEF数据分析进一步提高了定量的准确性 　　3. Mass Dynamics图形可视化和统计云软件与4D-Proteomics的dia-PASEF数据可实现无缝集成。　　A. 应用于免疫肽测序的PaSER Novor　　凭借PaSER Novor，布鲁克推出在免疫肽组学分析的高级功能，它是由布鲁克与Rapid Novor(快序生物，一家加拿大软件和提供抗体测序服务的CRO公司)合作开发完成的。　　免疫肽组学在timsTOF SCP超高灵敏度平台上对微量肿瘤活检样品中非蛋白水解肽进行测序。基于蛋白质组学数据库算法可能由于搜索空间太大导致无法进行精确搜索，造成重复性低和搜索时间长等问题。PaSER Novor使用基于GPU的布鲁克PaSER蛋白质组学软件平台，在训练了超过170万个timsTOF数据点后，可以直接从碎片离子谱图中从头测序获得多肽序列，从而得到实时结果。　　莫纳什大学(Monash University)免疫蛋白质组学实验室主任Tony Purcell教授说："从头测序分析是我实验室多年来研究的一个重要方面。这种新的算法在实时采集数据条件下，以更快的速度提供准确的结果，实现了大规模和实时的免疫肽组学分析。这对我的团队如何快速地将科学研究向临床转化具有重要意义，这一工作流程提供的检测结果也会对临床患者产生深远影响。”　　　　　　图1：A 9-mer peptide sequenced by PaSER Novor　　图2：timsTOF SCP ultra-high sensitivity MS　　B. TIMS-DIA-NN 2.0 实现谱图库非依赖的dia-PASEF分析　　TIMS DIA-NN是以CCS为中心的DIA–NN [1] 新版本，与之前版本相比具有显著的改进。TIMS DIA-NN 2.0通过新的机器学习，可以实现library-free dia-PASEF数据分析流程，并进一步提高定量准确性。加州大学戴维斯分校蛋白质组学核心实验室主任Brett Phinney博士评论道：“蛋白质组学已经取得了长足的进步，但色谱和数据分析具有与质谱仪相同的重要性。大队列样本分析时稳定的色谱系统，与DDA和DIA的实时搜索相结合，使我的实验室效率达到了更高的水平，而这只有通过TIMS DIA-NN的library-free搜索功能才能达到更好的结果。”　　C. Mass Dynamics对4D-Proteomics的大规模图形知识可视化　　通过与澳大利亚Mass Dynamics软件公司的联合创始人、WEHI公司的Andrew Webb教授合作，布鲁克timsTOF 4D-Proteomics通过Mass Dynamics的统计分析、交互式和可视化技术，可以直观地提取蛋白质组学信息。除了蛋白质列表、火山图、蛋白质相互作用图、PCA图，其它一系列可视化视图都有助于研究者们了解生物学过程和疾病机理。　　Mass Dynamics联合创始人兼首席执行官Paula Burton表示：“PaSER的实时搜索功能和Mass Dynamics的发现服务相辅相成，形成强大的联盟。科学家们现在可以专注于生物学问题，借助蛋白质组学来寻求答案。”　　布鲁克生命科学质谱生物信息学总监Dennis Trede博士评论道："我们很高兴与Rapid Novor和Mass Dynamics的合作。本次合作将为蛋白质组学的发展带来意义非凡的影响。Rapid Novor与超高灵敏度timsTOF SCP相结合，现在可在活检小肿瘤样本中获得大规模的免疫肽组学数据。在美国HUPO发布的所有布鲁克软件解决方案适用于所有型号timsTOF平台：timsTOF Pro 2、timsTOF HT、timsTOF SCP和timsTOF fleX。在国际HUPO坎昆会议上发布的Biognosys Spectronaut® 17软件拥有全新的Direct DIA+功能，且完全支持timsTOF平台上的dia-PASEF数据。”　　　　图：Mass Dynamics visualization for TIMS DIA-NN data

2009年，单细胞测序技术问世。2013年被Nature Methods评为年度技术。2015年以来，10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现。2018年以来，以新格元为代表的国内单细胞平台如雨后春笋般涌现。Fig 0 单细胞平台一览图详细了解厂商和各家产品之前，预告一下“第六届基因测序网络大会”，会议上德运康瑞、墨卓等企业的专家代表将有精彩的分享。马上免费报名吧！报名页面：https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/一、低通量单细胞平台低通量的单细胞平台主要是基于smart-seq2技术原理开发而来，典型代表有Fluidigm C1™ 单细胞全自动制备系统和WaferGen ICELL8® Single-Cell System两大平台。1、Fluidigm C1™ 单细胞全自动制备系统Fig1.1 富鲁达C1单细胞系统  2012年6月13日，Fluidigm 在日本横滨举行的国际干细胞研究学会 (ISSCR ) 上发布了C1™ 单细胞全自动制备系统，是真正第一个实现商业化的平台。  C1单细胞自动制备系统微流体技术，可以同时捕获多个单细胞（IFC：~96 cells；HT-IFC：~800 cells），在同一张芯片上完成细胞捕获、裂解、逆转录及预扩增的全过程，完成smart-seq全步骤的自动化。2、WaferGen ICELL8® Single-Cell SystemFig1.2 宝生物iCell8单细胞平台  2015年2月份，Wafergen公司开发出ICELL8 Single-Cell System单细胞分选平台，后被TaKaRa公司收购。  利用WaferGen Smart Chip TE平台筛选细胞，5184个反应孔，可进行单细胞RNA测序样本的制备、扩增、表达谱建库测序、生物信息分析，可快速得到样本间的基因表达差异。  每次运行可分离500~1800个细胞； 细胞的捕获效率大约37%； 细胞适用范围为5-100um； 样本通量为8（一枚ICELL8芯片上一次最多可以分析8种细胞样品）； 没有整合试剂，使用Takara试剂，需进行试剂优化； 自动成像技术系统：可实现单细胞反应孔可视化； 单细胞挑选软件：只挑选活的单细胞进入后续的处理，从而可以节约反应试剂，缩短数据分析时间。[点评]：虽然低通量测序现在不是市场上的主流，但是由于其实验的精密度是非常高的，已依旧没有被社会淘汰。二、高通量单细胞平台（进口）  2017-2018年，两大商业化的单细胞测序平台（10X Genomics, BD Rhapsody）出现，最终让单细胞测序技术进一步达到更大商业化。1、 Mission bio：专注于高通量单细胞DNA测序的平台Fig2.1 Mission bio Tapestri Single-cell Multi-omics Solution  Tapestri平台基于微液滴的微流控装置，利用油包水体系对细胞进行捕获与封装。封装时，细胞和蛋白酶等会被一起装入微液滴中，每一个微液滴相当于一个微容器。之后，细胞在微液滴中进行裂解、加条形码（barcoding）等步骤，再结合靶向 PCR 扩增技术，对特定的DNA目标序列与蛋白产物进行单细胞水平的建库。建库完成后，即可进行高通量测序和后续的生物信息学分析。• 专注单细胞DNA测序。• 高灵敏度，可检测含量低至0.1%的罕见亚克隆，以及突变的合子型和突-变共发生情况。• 多种检测类型，可检测SNV、InDel及CNV等多种变异类型。• 高通量，每个样本可测量5,000~10,000细胞。• 灵活性强，可定制化设计疾病基因检测靶点及CRISPR靶点 。2、Illumina® Bio-Rad®：基于数字PCR的高通量单细胞平台  2017年1月17日，Illumina公司和Bio-Rad实验室公司在JP摩根健康大会上发布了Illumina® Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution。Fig2.2 Illumina Bio-Rad Single-Cell Sequencing Solution该系统包含Illumina® Nextseq 500和Bio-Rad® ddSEQ™ Single-Cell Isolator；Bio-Rad最好的液滴分离技术，Droplet Digital™技术，可以对单细胞进行隔离和编制条形码，然后在Illumina的许多主要NGS仪器上进行下游测序。• 可一次性检测8个样本，每个样本可以得到500~10000个细胞。• 捕获效率低，仅为3%，但测序成本相对较低。3、10x Genomics Chromium 高通量单细胞平台(controller/connect/X series)10X面对市场不同的需求推出了三款仪器。最早的这一款就是chromium controller，这款仪器配备了是标准通量和低通用的两款试剂盒。2021年的时候，10X上又推出了chromium X series这款仪器，目前这款仪器也是市场主推的一款。它适配的试剂盒的规格也更丰富。Fig2.3 10x Genomics Chromium 高通量单细胞平台另外10X推出的chromium connect仪器最大特点就是它能够实现从单细胞分离以及到最后NGS文库构建的一个全流程的过程，因此更加适合于一些大通量的实验室。• 每次运行提供8个通道，每个通道可以收集100-10000个细胞。（注：Chip M是16个通道）• 每次细胞分装运行时间为18min左右；• 细胞捕获效率最高可达65%；• doublet比例为0.9%/1000个细胞；• 针对单细胞ATAC分析，线粒体污染率低于2%；4、BD Rhapsody™：基于微孔板法的高通量单细胞分析系统  BD Rhapsody™单细胞分析系统包括BD Rhapsody™扫描仪和BD Rhapsody™ Express单细胞分析系统。BD Rhapsody™ Express 系统配备的专有单细胞捕获技术，以微孔为基础，稳定，能够捕获数百到数千个单细胞并为其打上条形码，分析基因组和蛋白质组信息。BD Rhapsody™扫描仪旨在可视化单个细胞捕获工作流程中的所有步骤，为每个步骤提供详细的分析度量，以便用户在整个工作流程中做出关键决策。Fig 2.4 BD Rhapsody™单细胞分析系统• 单细胞捕获效率：最高可达~80%• 单细胞检测通量：100-40000• 双细胞比例： ~2-3% for 10k cells load； ~8-10% for 40k cells load[点评]：1）10x Genomics仍是主力军，在国内拥有众多代理商和服务商，占据着80%左右的国内科研市场份额。同时该平台近两年注重空间组学平台开发，2022年推出了一系列新产品；10x Chromium X系列产品有多种应用类型，支持低中高3通通量模式，在推广上又与之前的Controller进行联动（增加保修年限），是10x的主力机型。2）BD Rhapsody™平台坚持微流控微孔板的原理，配备有扫描仪，可以实时监测单细胞状态，保证细胞的分离捕获效率；同时其配套有抗体和流式平台，在单细胞实验的组合解决方案上有明显优势（混样、与流式仪器上下互动组合）。3）Mission Bio单细胞平台专注单细胞基因组测序，在血液肿瘤方向深耕多年，接触临床应用时间较早；近些年在逐步增加国内服务商的覆盖，已有多家知名服务商与之合作。4）Bio-Rad与illumina合作推出的单细胞建库平台捕获效率较低，市场占有率及市场声音较低。点击图片即可报名参会，8位嘉宾将带来单细胞测序内容！三、高通量单细胞平台（国产）截止到2022.12.31，国内的单细胞平台共有10个，分为微流控微孔平台（以新格元Matrix系统为代表）和液滴微流控平台（以华大C4系统为代表）。1、新格元Singleron Matrix® 自动化单细胞测序文库构建系统可完成将单细胞悬液分散到微流控芯片的高密度微孔阵列中，并自动完成细胞分离、细胞裂解、细胞标记至mRNA捕获步骤，无需实验人员干预。Fig3.1 Singleron Matrix自动化单细胞测序文库构建系统• 单个样本单张芯片可捕获细胞数量500-30000个 • 每份样本捕获效率最高可达75% • 检测1000个细胞中含有双细胞的比例低于0.2％；[点评]新格元生物是国内首家一站式全方位的单细胞整体解决方案提供商，在产品方面既有单细胞转录组、核转录组、免疫受体等常规产品，同时也有单细胞转录动态监测、单细胞糖基化、单细胞靶向基因检测试剂盒等特色产品，能够给科研者提供更加多样的组学研究选择。是国产单细胞的主要玩家之一。2、华大智造：DNBelab C4高通量单细胞平台DNBelab C4是华大智造推出的基于负压的微流控单细胞技术。小巧轻便（长230mm、宽42mm、高57mm），无需电源，重量不到220g，操作简单，可随时开始单细胞建库。Fig3.2 DNBelab C4 Pocket Single-Cell Lab• 有效捕获细胞数：1000~12000 cells/run；• 细胞直径范围：5µm-25µm ；• 多胞率（Multiplet Rate）：8% ；• 捕获效率：30~60% ；3、寻因生物：SeekOne双平台体系（微孔板平台+液滴油包水平台）寻因生物有单细胞标记两大主流技术：油包水法SeekOne® DD和微孔芯片法SeekOne®MM（Microwell & Magnetic Beads)。1）微孔芯片法MM  SeekOne MM（Microwell & Magnetic Beads)高通量单细胞转录组试剂盒基于微孔技术原理，通过微孔芯片SeekOne Chip实现单细胞捕获，并利用核酸修饰的Beads 对不同细胞来源的RNA 进行分子标记，最终构建兼容Illumina及华大智造测序仪的高通量单细胞转录组文库。Fig3.3.1 SeekOne MM平台（手动法）• 单次可放置1-4张芯片，单人操作可同时处理1-4个样本；• 单张芯片微孔数：17w；• 单张芯片捕获细胞数：500-10000 cells；• 捕获率：最高可达60%；• 双胞率： 0.7% / 1000 cells；• 无需其他昂贵硬件配套2）油包水法DD  液滴油包水平台（DD）是寻因生物的主力平台，并基于该平台开发了相应试剂盒，其主要有单细胞3‘转录组试剂盒和单细胞5’免疫受体试剂盒。• 芯片通量：1~8个样本，可以拆卸不会有芯片浪费；• 运行时间：3 min生成15万个油包水液滴；• 单通道细胞捕获：500-12000 Cells；• 双胞率：0.3% / 1000 cells；[点评]寻因生物尽管对外宣称具有MM和DD双平台，但整体推广上仍侧重DD平台，并依托其可拆卸的芯片实现更加灵活的实验安排。目前该公司产品相对较单一，公司在推广上发力比较多，推出了相当多的视频专题进行客户教育，算是不错的行业先行者。4、墨卓生物在过去的2022年中，墨卓生物对外发布了单细胞液滴微流控平台及其试剂盒、微生物高通量单细胞基因组测序产品。其中单细胞液滴平台MobiNova-100引入了光激发分离（Light-CUT专利技术）原理，可以在单细胞核酸捕获阶段将分子标签与微珠进行分离，因此在实验中需要专门的配套设备。Fig4.1 墨卓生物单细胞仪器• 芯片通量：1~4个样本；• 试剂盒种类：目前仅有单细胞3‘转录组试剂盒；• 运行时间：10 min；• 单通道细胞捕获：500-20000；• 双胞率：5% / 10000 cells；此外墨卓生物还推出了MobiMicrobe 微生物高通量单细胞基因组测序解决方案及其仪器产品M1，主要是在菌株水平分析宿主-噬菌体关联信息及转录转移事件。• 样本通量：每次可处理1个样本；• 捕获通量：每个样本可捕获微生物细菌数量≥6000个；• 仪器配套高速相机，能够观测微芯片中微滴发生和融合；• 仪器配有低温存储模块能，可同时放置4个0.2 mL PCR反应管和4个1.5 mL离心管；• 仪器配有扩增模块（96x0.2ml，12x8连管或96孔 PCR板）• 仪器带有自检功能：仪器在开机和运行过程中会自动检测，遇到异常会发出报警提示。5、其他除了以上4个国产单细胞平台之外，在过去的两年中还出现过一些平台公司，他们均采用液滴法来作为技术源头，并处于早期产品阶段，以单细胞转录组、免疫受体等作为主推产品，为客户提供产品或者服务。这些厂家有万乘生物（10K genomics）、百迈克生物、跃真生物（m20 genomics）、德运康瑞、纯迅生物等。总结  截至2022年12月，目前国内市场共有2个低通量进口品牌、4个高通量进口品牌和10个国产品牌，均有各自的公司定位和产品体系以及对应领域解决方案。  纵览2022年国内市场单细胞信息，主要特点有：• 单细胞新平台频出。如墨卓，M20，百迈客均是2022年推出单细胞平台。• 单细胞平台特点突出，各有产品和市场定位，有从单品到一站式解决方法成长的趋势。• 单细胞市场更为成熟。各家单细胞平台对内完善了团队建设，对外加强服务商或产业端的合作。• 空间技术应用。10X主推空间原位，德运康瑞收购先能原位，华大和百迈客主推基于测序的空间技术。• 单细胞多组学，有单细胞平台的厂家基本在或计划开发单细胞多组学（免疫，表观，蛋白，突变，全长）产品矩阵。• 单细胞技术应用方向扩展到动物，植物，微生物。如联川，诺禾推出农口单细胞激励计划，BD联合华南农大推出经济作物单核文库构建方案。（信息来源于生物医学小站）第六届基因测序网络大会进入报名页面：https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/点击图片报名

临床检验技术的发展可谓日新月异，作为检验技术的代表之一，质谱检测平台因其快速、准确、特异的优点，受到越来越多的重视。质谱作为诊断领域的一种新兴技术，由科研逐渐走向临床，业界很多专家认为其和基因测序技术有许多共同点，也意味着质谱很有可能复制基因测序的发展，拥有很大的发展潜力，而目前处于快速发展阶段。据调研报告显示，2021年全球质谱在临床检验应用的市场规模在150亿美元左右，未来行业增速将在20%左右。其中，美国临床质谱检验市场约为55亿美元，占据整体医学检验市场约15%；而中国质谱检验在医学检验市场占比仅为1-2%，渗透率较低，未来市场潜力巨大。根据不同的离子源及质量分析器搭配的不同，质谱分成多种类型，不同类型的分析特性不同，适用于不同的临床领域，比如液相色谱串联质谱（LC-MS）适用于小分子定量分析，包括新生儿筛查、微生物检测、药物浓度监测等；基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF）常用于微生物鉴定；电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）适用于微量元素检测等。随着精准医学的发展、多组学研究上的突破，临床质谱迎来了发展机会。2004-2022年，我国陆续涌现出几十家临床质谱创新企业，从产业链角度来看，大致分为上游的仪器/试剂企业，中游的第三方医学检验中心，作为产业链下游的用户端，国内标杆的医院基本都有开展质谱项目，如解放军总医院、复旦大学附属中山医院等质谱检测平台从技术水平、仪器规模、开展项目等都处于领先水平，也发挥着非常大的示范作用，带动了一大批三甲、二甲医院开展质谱检测。此外，随着国产质谱仪器的陆续推出，仪器售价较进口品牌有较大优势，也降低了准入门槛，未来可以预见仪器的成本还将持续下降。不仅如此，质谱的临床应用也得到快速发展，从最初的新生儿筛查、维生素检测，已经扩展到激素、药物浓度监测、遗传性疾病检测以及痕量元素检测等诸多领域，可检测项目已扩展到几百项且，而且还在不断增加。在此背景下，仪器信息网组织召开“临床质谱技术及应用进展”主题网络研讨会（2022年5月19日），就质谱在临床领域的最新技术及应用进展等大家关心的话题共同探讨，为用户、专家和厂商搭建优质、有效的交流平台。本次会议汇集多位来自医院检验科、科研院校的著名质谱专家，聚焦质谱在临床中的热点应用，如质谱技术在激素检测、新生儿疾病筛查、维生素监测、药物浓度监测、微量元素、核酸检测、蛋白快速定量等方面的最新应用进展。点击链接，进入官网了解更多。会议日程：时间主题报告嘉宾9:30-10:00MALDI-TOF质谱在病原体检测领域的应用现状及前景中国医学科学院病原生物学研究所彭俊平 研究员10:00-10:30岛津临床质谱助力疾病早期诊断和精准治疗岛津企业管理（中国）有限公司沈晶晶 应用工程师10:30-11:00临床质谱实验室建设之我见四川大学华西医院CTC中心秦永平 教授11:00-11:30Waters在临床质谱检测中的整体解决方案介绍沃特世科技（北京）有限公司李倩倩 临床应用工程师11:30-12:00质谱技术在心血管疾病领域的应用与进展上海透景生命科技股份有限公司 詹红 高级工程师12:00-14:00午休14:00—14:30常压敞开式电离质谱新方法开发及其在癌症快速筛查与分子诊断中的应用研究复旦大学 宋肖炜 博士14:30—15:00液质联用系统如何实现真正的临床场景化-全自动临床质谱流水线系统成都珂睿科技有限公司 吕辉 市场营销总监15:00—15:30质谱在激素检测领域的应用现状及发展趋势中国医学科学院北京协和医院检验科 禹松林 助理研究员15:30—16:00标准物质及内标在临床质谱中的应用北京曼哈格生物科技有限公司 刘静文 临床质谱事业部工程师16:00-16:30质谱成像空间分辨代谢组学新技术及其临床应用研究进展中国医学科学院药物研究所 贺玖明 研究员16:30-17:00安捷伦LC-MS/MS技术助力临床体外精准诊断安捷伦科技（中国）有限公司 徐聪 LC/MS应用工程师17:00-17:30临床质谱实验室自建方法的过去、现在与未来国家卫生健康委员会临床检验中心张天娇 副研究员点击图片报名参会！

一、项目基本情况项目编号：ZB0107-202304-ZCHW0367项目名称：武汉大学流式平台和单细胞测序平台采购项目预算金额：2020.0000000 万元（人民币）最高限价（如有）：2020.0000000 万元（人民币）采购需求：本项目分成2个包，投标人可兼投兼中，如投两个包则需分开编制标书 ，本项目接受进口包号包号名称货物名称单位预算（限价）是否接受进口备注01包流式平台高端分选型流式细胞仪1套450万元接受核心产品高端分析型流式细胞仪1套350万元接受02包单细胞测序平台单细胞测序建库系统1套780万元接受核心产品高通量测序仪1套440万元接受合同履行期限：交货期：合同签订后90日内 ，质保期：验收合格后至少1年本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间：2023年04月19日 至 2023年04月24日，每天上午8:00至12:00，下午12:00至17:00。（北京时间，法定节假日除外）地点：阳光招采电子招标投标交易平台（网址：https://www.yangguangzhaocai.com/）方式：1.拟参加本项目的投标人须在阳光招采电子交易平台免费注册（网址：https://www.yangguangzhaocai.com ---【新用户注册】，相关操作帮助详见：帮助中心--- 投标人注册操作指南）； 2.注册完成后，请于 2023 年 4 月 19 日至 2023 年 4 月 24 日17:00时止（北京时间）登录电子交易平台，点击【投标人】，在【公告信息】---【采购公告】栏下载采购文件，300元/份（包），售后不退。联合体参与响应的，由牵头人注册及下载采购文件。未按规定获取采购文件的，其响应文件将被否决； 3.本项目非全流程电子标，投标人无须办理CA数字证书； 4.在电子交易平台遇到的各类操作问题（登录、注册认证、报名购标、制作及上传标书等问题），请拨打技术支持电话010-21362559（工作日:08:00～18:00；节假日:09:00～12:00，14:00～18:00)； 5.企业注册信息审核进度问题咨询电话：027-87272708； 项目具体业务问题请向代理机构联系人咨询（联系方式详见本公告第七条）。售价：￥300.0 元，本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名 称：武汉大学本级　　　　　地址：武汉市武昌区八一路299号　　　　　　　　联系方式：吴老师 027-68754589　　　　　　2.采购代理机构信息名 称：湖北国华项目管理咨询有限公司　　　　　　　　　　　　地　址：武汉市武昌区中北路109号中铁1818中心10楼　　　　　　　　　　　　联系方式：杨楚君 王丹萍 王刚 刘晓栋 张靖佶 027-87271918　　　　　　　　　　　　3.项目联系方式项目联系人：杨楚君 王丹萍 王刚 刘晓栋 张靖佶电　话：　　027-87271918

安捷伦科技针对台式测序仪推出靶向序列捕获平台 2012 年 2 月 14 日，佛罗里达州马科岛（基因组生物学和技术，AGBT）- 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）推出SureSelect 靶向序列捕获系统，支持台式测序仪的HaloPlex 靶向序列捕获系统。该产品将于明日在基因组生物学技术进展年会上正式亮相。 独特的HaloPlex 技术完美融合了聚合酶链反应系统的速度和特异性以及基于液相杂交体系的可扩展性和捕获片段大小的灵活性。该实验方案无需文库构建，利用单管操作，从而解决了多重 PCR 由于存在交叉杂交问题而使靶向序列数量受限的问题。该方案使样品制备时间缩短到不到一天，适用于 Illumina MiSeq 台式测序仪以及 HiSeq 和 GAIIx 测序仪。 &ldquo 虽然新一代测序技术使全基因组分析成为可能，但是当我们想要在数量庞大的个体中测定少部分基因时，我们通常会遇到如何富集的问题。&rdquo Hubrecht 研究所基因组生物学首席研究员 Edwin Cuppen 说，&ldquo 对于几个到几十个范围的目标基因捕获，当前的杂交捕获技术有其局限性。HaloPlex 技术很好地填补了这个空白，可以帮助我们实现了在单次反应中捕获 2 至 20 个基因的完整编码序列，而且其在目标序列片段的的测序效率超过 90 %。 &ldquo HaloPlex 富集技术与 Ion Torrent 半导体测序技术联用，这种灵活高效的组合非常适用于高通量的小片段靶向基因重测序。&rdquo Cuppen 博士参与了安捷伦针对Ion Torrent 平台推出的 HaloPlex 技术的早期测试项目。 &ldquo HaloPlex只是我们为进一步巩固 SureSelect市场 领先地位而制定雄心勃勃的产品开发项目的一个例子。&rdquo Olle Ericsson 说道。他是 Halo Genomics 创始人，目前在安捷伦担任 DNA 测序市场总监一职。&ldquo 面世后的短短两年时间内，SureSelect 就已被超过200 篇的重要学术论文引用，在研究领域发挥了重要作用。在台式测序和靶向序列捕获技术通往临床研究的道路中，HaloPlex 这一创新技术使安捷伦成为领跑者。 HaloPlex 是一款定制产品，用户使用免费的在线设计向导（Web Design Wizard），在不到 10 分钟时间内就可完成设计，富集数以千计的目标基因组序列。 安捷伦于 2011 年 12 月收购了位于瑞典乌普萨拉的 Halo Genomics，从而获得了该产品。HaloPlex 技术完美补充了 Agilent SureSelect 靶向序列捕获系统。这项新产品如今也受益于安捷伦强大的研发、生产和分销资源。 要了解更多信息，请访问 www.agilent.com/genomics/ngs。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）是全球领先的测量公司，同时也是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,700 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度，安捷伦的业务净收入为 66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息，请访问：www.agilent.com.cn

2021年，是人类基因组计划草图首次发布的第20个年头，也恰逢中国“十四五”规划的开局之年。过去两年，基因测序技术在全球抗击新冠疫情中的重要作用揭示了生命科学时代的真正到来。与此同时，中国“十四五”规划将生物基因科技发展，公共卫生建设以及健康预防等内容提到了极为重要的位置，基因测序技术和应用均贯穿其中。自因美纳创立之初，公司即通过持续的技术创新不断推动测序成本的下降。如今，因美纳的技术已使测序成本下降了99%。此次进博会上，因美纳展示其主要的测序仪系列产品，让参观者得以了解基因检测的奥秘。图说：因美纳在进博会上展示其主要的测序仪系列产品 新民晚报记者 陶磊 摄（下同）去年，中国科学家向全球第一时间分享的首个新冠病毒基因组序列就是在因美纳的技术平台上完成测序的，为后续的疫情防控、疫苗研发奠定了基础。此次进博会展出的NextSeqTM 550Dx，是因美纳在全球最多国家和地区通过临床注册的中通量新一代测序平台（NGS），迄今为止已在超过40个国家和地区获得临床认证，是一款久经考验的临床测序平台。记者在展台看到，获得2021年红点设计大奖的基因测序平台——NextSeqTM 2000也收获了不少关注。这也是因美纳首个将文库扩增、测序以及快速基因组分析整合在一个平台上的测序仪。图说：参观者有机会获得互动纪念品——基因测序产品模型的盲盒去年进博会前夕，因美纳NextSeq 550Dx获得中国国家药品监督管理局的批准，用于临床人源样本的人类DNA检测诊断，成为因美纳在中国第二款获临床应用批准的测序产品。随着该产品在进博会的成功展出，在不到三个月内，首台NextSeq 550Dx即在上海复旦大学附属华山医院成功安装开机。未来，因美纳计划将包括测序试剂以及测序仪在内的产品逐步推进本土化生产制造。目前，位于上海浦东的因美纳中国生产基地正在积极筹备，预计将于明年第三季度投入生产。

p 　　近期迪安诊断牵手国际质谱龙头丹纳赫子公司SCIEX，安图生物发布新产品微生物质谱，质谱到底是什么?主要应用在什么领域?哪些企业将是优先布局者?哪些企业有望首先分享这个市场?本文作为市场首篇质谱行业报告，我们将和您一同探讨这个市场的潜力。我们认为质谱有望成为诊断市场中的下一个“基因测序”，是具有很大市场空间的平台型技术。2018年有望成为中国质谱行业发展元年，先布局的企业如迪安、安图、金域等有望率先成为吃螃蟹的人，分享这个潜在的大的新技术市场。 /p p strong 　　一、技术已经成熟，市场拓展在即 /strong /p p 　　临床质谱，诊断中的下一个“基因测序”，技术已经成熟，市场拓展在即。临床质谱检测高灵敏度、高特异性、重现性好，兼具高通量、高效率和低成本，可在临床多个领域对传统诊断方法学进行部分替代，我们认为目前临床质谱检测发展类似于基因测序的早期发展阶段，在诊断领域与其具有同等重要的地位：1、临床应用的探索与开发仅十年左右，主要由第三方检测服务推动 2、可应用于多个领域的平台化技术，且与大数据积累关联性强 3、设备技术壁垒高，操作专业性强，行业处于寡头垄断格局。 /p p strong 　　二、临床应用增速有望超20% /strong /p p 　　美国临床质谱占检验比重15%，中国潜在市场300亿。全球市场质谱产品临床应用有望实现20%以上增速 ，其中美国临床质谱市场占医学检测市场15%，且占比仍在持续扩大，中国临床质谱仅占医学检测市场不到1%，我们按15%占比预测，国内临床质谱中期潜在空间300亿元，长期市场有望继续扩容。考虑到国内临床质谱相关政策有望在短期完善出台，多家质谱仪及相关试剂盒有望于2018年陆续获批，我们预计2018年有望成为中国质谱行业快速发展的元年。 /p p strong 　　三、最先商业化的三大领域 /strong /p p 　　微生物鉴定、新生儿筛查和维生素检测是国内临床质谱最先商业化的三大领域。其中微生物鉴定由外企主导已经开始对传统方法学进行替代，质谱设备出厂口径市场规模大约 24亿元 新生儿筛查和维生素检测逐步开展，新生儿筛查在部分省市已有单独定价，终端口径潜在市场约30亿元，维生素检测暂无明确单独定价和管理办法。 /p p strong 　　四、投资建议 /strong /p p 　　国外临床质谱处于快速发展阶段，国内临床质谱还处于发展早期，不管是新增市场还是对传统方法学的替代，均存在大量的空白市场，综合目前国内政策背景和产品布局情况，我们认为2018年有望成为临床质谱发展元年，率先布局的企业有望分享行业的快速增长，重点推荐自主研发或合作开发进度较快的迪安诊断，安图生物和金域医学，同时建议关注积极布局质谱的华大基因、博晖创新。 /p p /p

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3月2日，芯像生物在上海浦东成功举办了国产基因测序平台新品发布会，重磅推出了基于高精度、高性能、高灵敏度显微成像技术的国产基因测序仪——StarSeq ® -100。新平台将从科研和体外诊断两大方面整合NGS解决方案。芯像生物创始人兼CEO严媚博士为新品发布会致开幕词时介绍了芯像生物的企业、产品布局及专利壁垒，并强调了芯像生物“加速实现从科研向临床的应用转化”的企业定位，致力打造低成本、高精度、易解读、检测快的多场景适用产品。严媚博士表示，人类基因组计划至今25年，我们正在经历从科研到临床转化的关键时期；芯像承载的使命，是把昂贵、复杂的科学设备设计成简单、耐用的医疗仪器，改变当前中心化的测序方式，让测序技术更加亲民。芯像生物首席科学家陈更新博士代表芯像生物向大家做了详细的新产品介绍。StarSeq ® -100为国产小型台式NGS基因测序仪，配置高灵敏度光学显微扫描成像系统，拥有灵活开机双载片四通道，可实现一体化文库加载、循环测序及数据生成。 StarSeq® -100具有领先的技术优势：通过半导体先进光电技术和高集成测序系统，实现扩增测序一体机小型化、智能化；自主研发测序化学反应体系高密度测序芯片，实现对主流NGS文库的精准、快速、低成本兼容，并为本地量产供应、GMP流程管理提供快捷、高质量的服务。 StarSeq® -100具有国内外多项自主知识产权，支持包括生殖、病原微生物、肿瘤、遗传病、转录组测序等在内的多种适配场景；其高GC极端复杂文库数据质量等指标与进口品牌相比持平，Dup以及Clean reads等指标优于进口平台。关于芯像生物：上海芯像生物科技有限公司总部位于上海张江, 是一家从事新型体外临床诊断仪器及配套试剂研发、 转化和产业化的高科技公司。公司核心团队由多位欧美海归的业界精英组成，在核心技术研发、 产品化及临床应用等方面有丰富的实战经验，技术背景涵盖半导体芯片、光学设计、电子、微流控、生物生化试剂、生物信息、医学应用等多交叉学科。芯像以半导体芯片技术与体外诊断的技术融合为核心，发挥半导体产业优势，赋能体外诊断技术的创新，目标打造检测结果快速精准、仪器运营低成本高产出、运行流程集成自动与智能化的基因测序平台，推动技术的普及，为人类生命健康护航。深圳分公司坐落粤港澳大湾区发展核心地带，位于河套深港合作区内国际生物医药产业园二期，致力于开发前沿生物传感器相关技术，为新型测序及生物传感器应用提供有力支撑。

8月18日，由中国医疗保健国际交流促进会分子诊断学分会（下称“中国医促会分子诊断学分会）、四川大学疾病分子网络前沿科学中心、齐碳科技共同举办的“READs2023中国纳米孔基因测序大会”在成都举行。会议现场，齐碳科技发布了国内首个商业化中通量纳米孔测序平台QPursue，该平台涵盖QPursue-6k、QPursue-6khex两款新品测序仪及其配套测序芯片QCell-6k。中通量纳米孔基因测序平台由齐碳科技自主研发，搭载单张芯片，设计通量为60Gb，可在微生物群研究、孟德尔遗传病、肿瘤研究、物种鉴定、生物多样性等应用场景提供快速测序支持。据悉，该项目代表着国内纳米孔基因测序技术的最前沿水平，标志着国产纳米孔基因测序仪向中高通量进阶。齐碳科技联合创始人谢丹博士在发布中表示，齐碳此次发布的QPursue平台，通量实现大幅提升，一次性满足用户更高通量且灵活多元的测序需求。其中，QPursue-6k搭载单张芯片，设计通量为60Gb，QPursue-6khex则支持灵活选择1-6张芯片进行测序，可产出360G数据。准确率方面，QPursue中通量测序平台适配今年3月齐碳发布的最新一代K2生化体系，搭载全新算法套件，单次准确率达97%，一致性准确率(70x)达Q50。时隔一年，齐碳再发商业化新品测序仪，从低通量QNome测序平台扩展到中通量测序平台QPursue，展现了齐碳强劲的研发能力和创新能力，使国产纳米孔测序仪的应用广度大幅拓展、用户使用成本进一步降低。

近日，国家药品监督管理局（NMPA）官网公开信息显示，已批准吉因加自主品牌国产基因测序仪Gene+Seq-2000和Gene+Seq-200的适用范围变更申请。两款仪器分别于4月14日和4月27日通过审批，新增了“对核糖核酸（RNA）进行测序”的适用范围。在基因检测应用场景不断扩展的今天，单纯的DNA测序无法满足迅猛增长的临床需求，而RNA测序扮演者越发重要的角色，国产测序平台在该领域获批应用，为临床提供了更加丰富的选择，必将更好地支撑起相关产业的发展，推动NGS技术在临床合规落地。 吉因加表示：根据《医疗器械监督管理条例》、《医疗器械注册管理办法》等相关法律法规的要求，应用于临床的医疗器械产品应具备相应的适用范围并获得国家药品监督管理局批准。但是，目前市面上的测序仪大多是“在临床上用于对来源于人体样本的人的脱氧核糖核酸(DNA)进行测序”，例如聚焦生育领域DNA检测、肿瘤DNA检测以及遗传病DNA检测等，不包含人的RNA，也不包含来源于人体样本的病原的DNA和RNA检测等应用，不能够完全满足目前临床合规开展各类基因检测的需求。 本次Gene+Seq-2000和Gene+Seq-200获批 “可用于人体样本的不仅限人的DNA和RNA测序”，可以检测包括肿瘤融合基因、病原RNA、全转录组等多种需求，可以真正实现DNA和RNA基因检测需求的全覆盖。测序仪适用范围/预期用途Gene+Seq-200该产品采用联合探针锚定聚合测序技术，在临床上用于对来源于人体样本的脱氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）进行测序Gene+Seq-2000该产品采用联合探针锚定聚合测序技术，在临床上用于对来源于人体样本的脱氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）进行测序测序仪A该产品用于对来源于福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织的人基因DNA测序测序仪B该产品用于人脱氧核糖核酸（DNA）测序测序仪C该产品基于边合成边测序技术，在临床上用于对来源于人体样本的人的脱氧核糖核酸（DNA）进行测序在临床应用方面，其实已经有较为成熟的RNA应用场景，比如对肿瘤融合基因的检测。DNA测序在检测融合基因时，对于仅发生在RNA或DNA层面融合丰度低的情况，以及对于存在长内含子或重复序列融合的情况均存在局限性，而RNA测序除了能够有效检出这些融合之外，还能发现更多未知融合，为未来的药物研发提供更丰富的信息。目前，已有多项研究证明，将DNA检测与RNA检测相结合，可以实现核心治疗靶点及罕见、有效的融合变异的同时测定，弥补常规检测方法可能出现的漏检、融合基因不明确等不足，有效提高融合基因检出率，更好地帮助医生进行临床诊断及治疗。因此，多项指南都在推荐将DNA检测与RNA检测相结合，以更全面覆盖基因融合/重排，更大程度地提高临床获益。

2022年10月25日 ，测序解决方案开发商PacBio（纳斯达克股票代码：PACB）宣布将对 Onso™ 测序系统进行外部测试。这一创新的台式短读长 DNA 测序平台通过利用 PacBio独特的结合测序（SBB）技术有望达到惊人的准确率水平。PacBio 总裁兼首席执行官 Christian Henry表示：“我们很高兴看到研究人员将如何利用我们期望 Onso 系统提供的突破性测序准确性。Onso 推出后，PacBio 预计将成为市面上唯一一家能够同时提供高精度、原生短读和长读测序技术的公司，这将使我们能够为客户的挑战提供更完整的解决方案。Onso 测序系统旨在提供高度准确的测序读数，支持可扩展、灵活和成本优化的操作，并使客户对他们的科学更有信心。该系统旨在改变基因组学行业的游戏规则，我们很高兴开始向我们的测试合作伙伴提供测试系统。”Onso 测序系统在设计上与目前短读测序仪的丰富产品生态系统相兼容，并支持多样化的文库制备类型、单细胞分析方案、全基因组测序和其他靶向测序应用，如扩增子和杂交捕获Panel。预计每次运行可提供5亿条 reads，并提供200和300个测序循环试剂盒，实现双端和单端测序，每套系统的美国上市价格为25.9万美元。PacBio 首席运营官 Mark Van Oene表示：“我们相信差异化的准确性和工作流程将使科学家们能够通过 Onso 比市场上其他短读测序平台在相同的数据通量下处理更多的样本。Onso 测序系统有望带来数据质量和效率的新标准，可以更好地审视基因组，而无需过度测序和复杂的纠错方法。在肿瘤学研究应用中，我们很高兴能展示 Onso 在研究遗传变异和推进诊断工具发展方面的非凡敏感性和特异性，以改善治疗方案选择和复发监控。”Broad研究所首席基因组学官兼基因组学平台高级主任Stacey Gabriel 博士表示：“我们很高兴看到测序技术领域的持续创新。随着我们继续完善基因组的目标区域，这些区域孕育着可操作的和其他临床相关的变体，提高准确性和调用挑战性变体的能力将特别重要。”Corteva Agriscience 基因组学技术经理Gina Zastrow-Hayes 博士表示：“PacBio 公司新的 Onso 系统的高精确度为农业生物技术带来了新的机遇。我们期待着将该技术引入 Corteva，并将其应用于基因编辑特异性分析等可以从提高准确性中受益的应用。”PacBio 还在其网站上发布了一份演示文稿，提供了关于 Onso系统的更多细节。有兴趣的人士可以阅读 PacBio 的投资者关系网站上的演示文稿，以及产品信息。PacBio 还在其网站上发布了一份演示文稿，提供了关于 Onso系统的更多细节。有兴趣的人士可以阅读 PacBio 的投资者关系网站上的演示文稿，以及产品信息。

英国初创公司CS Genetics正致力于将一种无需专单细胞专用析仪器的单细胞分析技术商业化，该公司称这种技术简单、灵活、易于扩展。 预计该公司将在2024年发布首个单细胞RNA测序试剂盒。首席执行官杰里米-普雷斯顿（Jeremy Preston）于2022年加入CS Genetics公司，此前曾在Illumina公司工作十多年，他表示："我们的第一款产品将是SimpleCell™ 3′基因表达产品，名为SimpleCell，这个名字展示了我们拥有最简单的单细胞技术，没有之一。CS Genetics 技术的核心是一种单细胞索引方法，它借助所谓的动力学约束（kinetic confinement）来控制三维溶液空间内的反应动力学。"公司的基础技术是由公司创始人兼首席技术官卢卡斯埃德尔曼（Lucas Edelman）博士开发的。总体而言，CS Genetics 的动力学约束技术利用了两种专有解决方案：一种名为 CPair 的索引试剂，可将索引序列直接传递给单个细胞；另一种是动能封闭缓冲液 (KCB)，这是一种双功能试剂，可实现热激活细胞裂解和动力学约束索引。更具体地说，CPair解决方案包含细胞结合分子，这些分子锚定在所谓的编码链的末端（这正是CS Genetics的名字来源），这些编码链是附着在珠子上的工程化DNA链。编码链还包含用于对核酸进行条形码处理的索引寡核苷酸。当细胞被引入CPair 试剂时，经过优化的化学计量促使 CPair 与细胞以一比一的比例结合。随后加入一种专有的粘性缓冲液，这种缓冲液的设计目的是防止索引寡核苷酸在细胞-CPair 复合物之间的空间扩散。细胞与CPair 试剂结合后，可在进一步处理前冰冻或冷藏保存。细胞配对后，加入动力学约束缓冲液，通过热激活裂解细胞，释放细胞中的核酸成分。温度升高也会释放编码链上的索引寡核苷酸，然后通过冷却反应将条形码与目标核酸杂交。之后，用户可以使用标准分子生物学技术制备测序就绪的单细胞文库。据普雷斯顿介绍，该方法的一个优点是，不需要物理分离细胞来进行单细胞定位，因此不需要专用的单细胞处理设备。此外，他还表示，该方案以溶液为基础，不涉及组合索引或乳状液，执行起来相对简单。"只要你有一台可以旋转条形试管或平板的离心机，有吸管，精准的多通道移液器，和一台热循环PCR机，你就可以进行测定，基本上就是这样。"他还表示，在细胞配对和热激活裂解之间停止这一过程的能力 "非常有价值"。"通常情况下，单细胞检测一旦开始，工作量就很大。CPair解决方案给了你巨大的灵活性——可以批量处理更多样品，也可以进行一些时间点和多参数实验。"到目前为止，该公司已在人和小鼠细胞上 "广泛"测试了这项技术，包括外周血单核细胞（PBMC）、神经元、小鼠脑组织离体细胞和脾脏组织细胞。该公司还没有在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织样本上测试过这种方法，但普雷斯顿表示 "没有理由说它行不通"。至于灵敏度，内部数据显示，该方法可以常规地捕获每个细胞中的2000多个基因，不过普雷斯顿认为这一指标还可以更高。虽然该公司尚未最终确定其产品规格，但他表示公司的目标是每个样本最多能捕获约 5000 个细胞，此外，细胞捕获率达到 40% 以上。就周转时间而言，从进行实验到测序的工作流程大约需要七个小时，CS Genetics将努力进一步缩短周转时间。普雷斯顿表示，自动化也还有 "很大的空间"，有可能为 "更大规模的单细胞研究 "采用这种方法打开大门。虽然公司的初始产品是基于Illumina测序平台开发的，但单细胞文库可以通过商业化工具包去适配到其他测序平台。他补充说，内部研究表明，使用 Element Biosciences 和 Illumina 平台对相同样本进行测序时，数据质量 "完全相同"。此外，普雷斯顿声称该公司的方法可以 "自然地获得最长的 RNA 片段"，因为它 "对细胞非常温和"，没有任何微流体或剪切成分。该公司还用 PacBio 测序技术测试了该产品，在没有任何优化的情况下，测序结果 "很好"，读取长度达到 2 kb。定价方面，普雷斯顿表示该技术将比市场领先者 "便宜很多"，同时与其他无仪器单细胞技术 "相当"。CS Genetics公司在 6 月份启动了一项技术开放计划。由于 "资源有限"，该公司只接受了十几家早期客户，包括英国癌症研究中心、斯托沃斯医学研究所、苏黎世大学和纽卡斯尔大学。普雷斯顿说："我们正在努力解决一些小问题，并提高产品的稳定性和可重复性。"该实验的 "占地面积极小"，只有两个盒装组件。第一款产品设计可容纳 8 个样本，但该公司计划随后推出 16 个样本的版本。最初的目标客户将是核心实验室，但该公司也瞄准了可能在药物研发流程中部署单细胞分析的制药公司。据悉，CS Genetics 已经获得了一笔 "小额 A 轮投资"，计划在 2024 年进行 B 轮融资。普雷斯顿表示，随着公司筹集到更多资金，他们将在欧洲和美国建立并扩大一支跨洲团队。目前，公司在英国剑桥设有小型研发总部，约有 20 名员工，另外，包括普雷斯顿在内的五名员工在加利福尼亚州负责商业运营。除转录分析外，该公司还计划进一步开发动力学约束技术的其他应用，如利用抗体选择性捕获单细胞。该公司还在单细胞水平上开展了蛋白质组学分析的概念验证工作。征稿通知：基因测序仪是解码生命科学的利器，因其技术壁垒高、开发难度大，市场长期被少数几家跨国企业垄断。近些年，基因测序仪市场格局正在快速发生变化，涌现出许多新企业并纷纷推出自主研发的商品化测序仪。基于此，仪器信息网特别策划“基因测序仪新势力”专题，并向测序技术研究专家、测序仪应用专家和基因测序仪企业广泛约稿，充分了解基因测序新企业、新仪器、新技术及新应用进展。投稿邮箱：lizk@instrument.com.cn点击图片了解详情

近日，深圳赛陆医疗科技有限公司（以下简称：赛陆医疗）宣布完成数亿元A轮融资。本轮融资由深创投领投，前海母基金和博远资本共同领投，邦勤资本、敦行资本、崖州湾创投跟投，行远致同作为本轮独家财务顾问。融资资金将用于赛陆医疗自主知识产权的基因测序平台和空间组学产品的持续研发和注册申报，以及全球商业化拓展。本轮是赛陆医疗继去年十月完成融资之后的又一个重要里程碑。赛陆医疗成立于2020年10月，距今仅三年的时间，发展速度之迅猛有目共睹，不仅完成了高壁垒技术的基因测序仪的商业化，还实现了2轮亮眼的融资。在今年早些时候仪器信息网对赛陆医疗CEO赵陆洋的采访中问及这其中的原因，他表示有三方面，一是人才，二是持续保持知识和技术的更新，三是政府和客户的大力支持。立足创新，构建全面国产化测序产业链近年来，全球基因测序市场保持高速增长态势，技术不断迭代创新，应用前景广阔。据Markets and Markets的报告以及灼识咨询《全球及中国生命科学综合解决方案行业报告》数据，预计到2030年，全球基因测序仪及耗材市场规模将达到245.8亿美元，中国基因测序仪及耗材市场规模将达到303.9亿元。 长期以来，全球基因测序仪市场一直被Illumina、Thermo Fisher等跨国巨头垄断。基因测序作为生命科学领域的技术之巅，且基因组数据具有特殊性，力争产业链上游，实现设备、零部件的全面国产化对行业未来的良性发展至关重要。同时，随着基因组学和多组学的研究从科研向临床快速过渡和转化，细分应用对于工具提出了多样化需求，为测序等技术平台提出新的挑战。 赛陆医疗利用自主技术创新解决“卡脖子”和“新挑战”等问题。公司成立三年来飞速发展，已搭建起产业闭环链条，实现光学、流体、芯片、试剂等的全面国产化，并将大视野成像、高效测序酶、快速化学等多项创新技术应用于产品中。同时，我们用真实场景对产品研发和定位提出要求，并使用平台化的研发方式利用局部结构一致性提高研发速度和提升效能，产品在客户端展现了准确、快速、灵活的优势，更贴近市场终端需求。商业化加速，引领组学平台再迭代在空间组学领域，赛陆医疗在整合自有测序平台的基础上，推出了亚微米级分辨率的空间转录组学一站式解决方案，覆盖芯片、生化、测序和生信全流程，能提供全维度多视角组学信息。目前已在科研领域取得瞩目成果，并进入商业转化阶段。公司始终追求技术创新与迭代，同时也在快速拓展业务合作和商业化能力。公司在测序和空间组学领域的不断突破，源于团队在光学、生化、芯片、算法等领域的不断变革和引领，这也将助推中国生物医药行业在科研和临床端的良性发展。与此同时，赛陆医疗注重技术和商务两个层面的海内外结合，关注全球市场的不断延伸，利用技术和供应链优势，推动赛陆测序仪和空间组学解决方案的出海。关于本轮融资，深创投红土医疗基金总经理周伊表示：“‘基因技术’是未来产业之一，基因数据对于国家遗传信息安全至关重要，基因测序设备是兼具高端科学仪器和高端医疗装备的国之重器。红土医疗基金践行深创投‘国家需要什么，深创投就投什么’的投资理念，聚焦硬科技。赛陆医疗团队在测序设备制造领域取得的突破和创新，将打破国产企业长期被海外企业卡脖子的局面，对信息安全和民生健康具有十分重要的战略意义。”前海方舟董事总经理李胜男表示：“高通量测序的下游应用极其广阔，覆盖生育健康、肿瘤检查、感染检测三大高速发展领域，更延伸到空间组学、分子育种、基因合成等成长中的潜力细分领域。测序仪及配套耗材技术屏障高，产品成本高，我们坚定看好国产测序仪企业的未来发展前景。赛陆医疗的团队背景多元平衡，在底层化学、酶学、光学、机械等多个方面有充分的技术积累和创新，且执行力极强，仅两年时间就完成了测序仪从零到商业化的飞跃，我们相信公司必将成为测序领域极具影响力的高科技企业。”博远资本投资副总裁李瀚表示：“很荣幸参与赛陆医疗本轮融资，赛陆医疗是博远资本在生命科学工具领域的又一重要布局。基因测序行业横跨生命科学研究和临床诊断两大领域，具备百亿市场空间和极高技术壁垒。在兼具深厚技术积累与卓越执行力的创始人团队带领下，公司高通量基因测序系统得到广泛客户认可，另一核心产品空间组学也在国内领先进入商业化阶段。我们相信在下游需求持续增长与国产替代双重利好的推动下，赛陆医疗也将迎来高速成长期，为行业高质量发展贡献自己的力量。”邦勤资本总经理刘明宇表示：“我们看好这个赛道，不仅是因为其处在‘基因测序临床应用持续普及’和‘国产品牌快速崛起’这两个驱动力的交叉点，还因为空间组学等新技术、新方法正在成为科研、临床的重要工具。赛陆医疗作为测序行业的新锐力量，在短短两年时间内完成了近两百人复合团队的组建，并成功推出了一流性能的测序仪和空间组学产品，展现了创始团队极高的号召力、执行力和创造力。我们相信赛陆医疗的创新产品一定会带动下游临床早筛的普惠推广和基础研究的快速发展，跟邦勤资本‘安邦济世，成众人之美；饮水思源，为世界之光’的理念高度一致。”敦行资本总经理施泰磊表示：“生命科学研究核心工具是基因测序仪，中国企业具备弯道超车的可能性。赛陆医疗技术创新能力很强，在短期内成长为市场上仅有的3个完成低中高通量测序产品全覆盖的企业之一，我们看好企业的长期发展。”崖州湾创投相关负责人认为：“赛陆医疗是国内测序领域领先企业，崖州湾创投本次参与赛陆医疗投资，旨在促进崖州湾生物育种产业链上下游深度合作，推动基因组学在生物育种领域的应用和成果转化。”征稿通知：基因测序仪是解码生命科学的利器，因其技术壁垒高、开发难度大，市场长期被少数几家跨国企业垄断。近些年，基因测序仪市场格局正在快速发生变化，涌现出许多新企业并纷纷推出自主研发的商品化测序仪。基于此，仪器信息网特别策划“基因测序仪新势力”专题，并向测序技术研究专家、测序仪应用专家和基因测序仪企业广泛约稿，充分了解基因测序新企业、新仪器、新技术及新应用进展。投稿邮箱：lizk@instrument.com.cnhttps://www.instrument.com.cn/news/20231107/690955.shtml（点击图片了解详情）

fieldset legend span style=" color: rgb(105, 105, 105) " strong 背景 /strong /span /legend 　　 span style=" color: rgb(105, 105, 105) " strong span style=" font-family: arial, helvetica, sans-serif " 2015年1月12日-15日，第33届JP摩根健康投融资大会在美国旧金山举行，往年大会上，各家公司都派出重量级阵营，公布上年度经营业绩，发布最新产品，给市场打入强心剂，以获得投资人的青睐。 /span /strong /span /fieldset p & nbsp /p p span style=" font-family: arial, helvetica, sans-serif " 　　JP摩根健康大会开场，重量级公司Illumina发布了4款最新的测序仪器，推出HiSeq X Five系统，HiSeq3000，HiSeq4000，Nexseq550。HiSeq3000/4000采用HiSeq X上的测序芯片，可以低成本开展个人基因组、外显子组测序；而Nexseq550则可以在测序的同时扫描基因芯片。 /span /p p style=" text-align: center " img style=" width: 502px height: 326px " alt=" " src=" http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/201511310420.jpg" / /p p span style=" font-family: arial,helvetica,sans-serif " 　 strong 　HiSeq X Five /strong /span /p p span style=" font-family: arial,helvetica,sans-serif " 　　HiSeq X Five是HiSeq X Ten的低版本商业套装，还是同样的测序仪，同样的通量，只是可以5台起打包销售，每台的价格不是X Ten的100万美元，而是120万美元，每个基因组的测序成本涨到了1400美元。这是典型的商业套路，无关技术。对于一次性掏不出1000万美元的客户是个选择，对于追求更高性价比的客户则是个痛苦。还是有钱的人，可以任性! /span /p p span style=" font-family: arial,helvetica,sans-serif " 　　Illumina官方表示：HiSeq X Five是专注于大规模人全基因组测序。HiSeqX FIVE系统由5台HiSeq X组成，可升级到HiSeq X TEN从而实现1000美金人全基因组测序。 /span /p p style=" text-align: center " img style=" width: 600px height: 181px " alt=" " src=" http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/2015113104224.jpg" / /p p span style=" font-family: arial,helvetica,sans-serif " 　 strong 　HiSeq 3000/4000 /strong /span /p p span style=" font-family: arial,helvetica,sans-serif " 　　HiSeq3000/4000采用了HiSeq X 系列的Patterned Flowcell，通量提高到每个RUN0.75-1.5Tb，可以开展全基因组、外显子组、转录组等测序，速度是3.5天，2500以前的型号系列还可以销售，但以后会逐渐转向3000\4000系列。 /span /p p span style=" font-family: arial,helvetica,sans-serif " 　　HiSeq 3000和HiSeq 4000在可靠的HiSeq 2500的基础上使用了创新的有序流动槽技术，可提供无可比拟的测序速度和性能。HiSeq 4000系统配备2个流动槽，可为多种应用提供最高的测序通量以及最低的测序成本。配备1个流动槽的HiSeq3000系统具备同样的性能。 /span /p p style=" text-align: center " img style=" width: 600px height: 447px " alt=" " src=" http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/2015113104236.jpg" / /p p 　 strong 　 span style=" font-family: arial,helvetica,sans-serif " NextSeq550 /span /strong /p p span style=" font-family: arial,helvetica,sans-serif " 　　NextSeq550在原有高通量测序平台NextSeq 500 的基础上，增加了芯片扫描功能。该系统为用户基于芯片应用转化到测序技术平台上来，搭建了新的桥梁。在临床市场，使用同一系统可以互相补充不同的应用，如细胞遗传学分析和胚胎植入前遗传病筛查等应用。因此这款为临床应用设计的平台可以开展NIPT业务，不过价格比测序仪NextSeq500高了一些。 /span /p

SJC2011060186南京中医药大学高通量测序平台项目中标公告 　　江苏省省级行政机关政府采购中心受南京中医药大学委托，就南京中医药大学高通量测序平台进行公开招标采购，按规定程序进行了开标、评标、定标，现就本次招标的中标结果公布如下： 　　一、项目名称：南京中医药大学高通量测序平台 　　采购编号： SJC2011060186 　　二、招标项目简要说明：略。 　　三、招标公告媒体及日期：2011年07月19日江苏省省级机关政府采购中心网站、《中国财经报》、中国政府采购网站、江苏政府采购网。 　　四、评标信息： 　　评标日期： 2011年08月12日 　　评标地点：江苏省南京市中央路42号江苏省省级行政机关政府采购中心413电子评标室 　　评标委员会名单： 　　毕向东、李丽、王书奎、蒋理、华子春、徐斌、梁照林 　　五、中标信息： 　　分包1： 　　中标供应商名称：江苏苏美达仪器设备有限公司 　　中标供应商地址：南京市长江路198号7楼 　　中标金额：陆佰捌拾玖万柒仟圆整(￥6,897,000.00) 　　六、本次招标联系事项： 　　联系人：赵国文 　　联系电话：025-83286913 　　传真电话：025-83286920 　　联系地址： 南京市中央路42号江苏省省级行政机关政府采购中心 　　邮政编码： 210008 　　网址： www.jszfcg.gov.cn

7月31日晚，国内基因测序领域的佼佼者诺禾致源(股票代码：688315)发布2023年上半年业绩报告。财报显示，得益于全球本地化战略带来的持续动力，报告期内，诺禾致源实现营业收入9.3亿元，同比增长9.44% 实现归属于上市公司股东的净利润7503.4万元，同比增长32.34%。报告期内，公司持续研发投入，研发投入总金额为4968.61万元，占营业收入比例为5.34%。　　近年来，诺禾致源始终把全球本地化战略放在至关重要的位置，旨在全面提升全球测序服务能力和规模。不仅深耕国内市场，在天津、广州、上海等地扩建、新建实验室，也持续开拓海外市场，在美国、英国、新加坡增设实验室或实验基地并部署新平台，持续优化全球区域性服务能力。目前公司业务已经覆盖全球六大洲约90个国家和地区，服务全球客户近7000家，包括3700余家科研院所和高校、2600余家企业和650余家医院。而这一战略所构建的全球化市场布局优势与规模优势也为利润的稳步增加埋下了良好的伏笔。　　诺禾致源业务覆盖生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务，为全球研究型大学、科研院所、医院、医药研发企业、农业企业等提供基因测序、质谱分析和生物信息技术支持等服务。半年报指出，公司通过不断加强信息化运营和自动化、智能化生产，巩固高效和稳定的服务优势，在Falcon、Falcon II等智能自动化平台的助力下，进一步降本增效，助推利润增长。　　此外，诺禾致源还从客户角度出发，持续创新技术和解决方案体系，拓展多组学服务边界，全方位优化服务质量。诺禾致源积极丰富产品和解决方案，依托多组学解决方案完善的服务体系，在代谢组学、单细胞测序、空间组学等领域不断探索，并基于基因测序核心技术开拓临床应用，充分满足全球客户多样化的需求。同时，诺禾致源紧随行业技术发展，全球性布局新技术平台。报告期内，诺禾致源引入因美纳 NovoSeq X Plus 测序平台、PacBio Revio三代测序平台、赛默飞Orbitrap Astral高分辨质谱仪等行业领先设备，并部署至诺禾致源在全球范围内的多个实验室，以大陆首批、中国首台等先发优势夯实高效、稳定、优质的竞争壁垒。　　得益于诺禾致源完善的基础设施和不断追求创新的理念，诺禾致源获得了全球科学家的广泛认可，科研成果不断涌现。报告期内，诺禾致源新增发明专利5项，累计共获得62项 新增软件著作权26个，累计共获得软件著作权320个 联合署名发表或被提及的SCI文章累计近20,000篇 累计影响因子近120,000。分析师认为：海外占比持续提升，业务逐步恢复高增长。营收增长主要系报告期内中国港澳台及海外地区营业收入增长所致，其中中国港澳台及海外地区营收46,346.18万元，同比增长30.79% 净利润同比提高主要系公司营业收入增长、资金使用效率提高带来的投资收益增加及外币汇兑收益增加所致 每股收益增加主要系公司营业收入增长、资金使用效率提高带来的投资收益增加及外币汇兑收益增加带来归属于上市公司股东净利润增长影响。海外业务占比持续提高，2023H1公司中国港澳台及海外业务占比已提升至49.8%，全力推动实验生产自动化体系。公司是业内首次开展全流程生产自动化尝试的企业，开创性地开发了全球领先的柔性智能交付系统，实现自动化。2020年，公司推出高通量测序领域多产品并行的柔性智能交付平台Falcon，满足四大产品类型(WGS、WES、RNAseq、建库测序产品)共线并行的交付，极大的缩短了产品交付周期、提高了数据质量。

p 　　2016年的十大创新产品包括了大胆的新平台，有望为基础生物学、药物研发和临床实验领域带来更多新发现。遗传学家们可能会陶醉于一台单分子长读长的测序新平台，而合成生物学家正渴望着CRISPR-Cas9技术的发展 这就如同生物学它本身，生物科学技术往往超过其各部分之和。 /p p style=" text-align: center" img style=" width: 248px height: 400px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/934e051e-cc16-46be-8a49-001c2d987d9e.jpg" title=" 1.jpg" hspace=" 0" height=" 400" width=" 248" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　值得一提的是，今年的十大创新产品名单中，出现了越来越多的临床相关技术，如合成人肾组织给培养皿里的组织赋予了器官特性。这些发明提醒着我们，创新和发展出现的时候，得益的不仅是生产商、开发商和学者，得益的还有人类。 /p p 　　从单细胞Western blotting机器，到简化质谱的微流控设备，今年的十大创新产品榜单是革命性的生物科学进步的颁奖礼。 /p p 　 strong 　ProteinSimple 》 Milo /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 450px height: 241px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/6f28e7d4-c5ba-4ee4-a60e-a9ceb966e9ad.jpg" title=" 2.jpg" hspace=" 0" height=" 241" width=" 450" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　Milo由加州大学的Amy Herr实验室研发，是一部单细胞Western blotting台式机器，研究者可以一次性在约1，000个单细胞找到特定的蛋白，他只需用移液枪加一滴细胞液到1x3英寸的玻片上，玻片上覆盖有30 um厚、点有6，400个微孔的凝胶层。细胞加到凝胶后，约有1，000个孔能够收集到单独的细胞，用于分析。然后实验人员加试剂，化学裂解细胞，让蛋白变性 用电荷把蛋白拉入孔间，再用UV灯激活凝胶里的化学药物，固定蛋白条带。 /p p 　　ProteinSimple的市场总监说：“传统Western不能体现异质性，而Milo可以鉴定亚单位。” Zephyrus Biosciences公司没有给出Milo的具体价格，只表明它与一部台式流式细胞仪的价格差不多。 /p p 　　 strong 评价员观点： /strong /p p 　　Unger(下称U)评价：价格降下来的话，Milo可以用于蛋白的高效检测，并得到单个细胞的应答信息，这是现今很重要的一个探究领域。 /p p 　　Fishman(下称F)评价：这是让已有的技术价格更低，所占空间更小的一个例子，同时还节约了研究者检测细胞样本中蛋白表达异质性的时间。 /p p 　　 strong Organovo 》 ExVive Human Kidney Tissue /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 600px height: 152px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/5dbf78f3-be5f-4b89-993b-af6a0f392846.jpg" title=" 3.jpg" hspace=" 0" height=" 152" width=" 600" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　药物开发的一个关键是检测药物是否会损害肾脏，但现有的细胞培养和动物模型只能近似于人类的肾脏。来自Organovo 公司的ExVive Human Kidney Tissue是一种使用3D生物打印的肾脏近端小管复制品，为药物开发人员提供了一种可靠的肾毒性测试方法。 /p p 　　目前，很少有临床前测试可以确定一个药物对人体是否有毒，投资临床测试对研发商来说是一项风险，如果在早期发现肾毒性，就能让风险降低，更重要的是知道你在做的事对将要进行临床实验的患者真的没有危害。 生物打印的工作原理类似于3D塑料打印，但放进打印机不是聚合物珠子，而是小的细胞聚体。这个肾组织复制品还可应用于毒理学意外的领域，作为一个肾组织实验平台。 /p p 　　“它似乎和天然的肾组织一样完整。”Caroline Lee说。她是Ardea Biosciences的代谢和药物动力学研究员，检测人工组织中的转运蛋白表达。她发现定向运输蛋白可以沿着膜准确定向。“你可以看到药物往正确的方向走，这非常了不起。” /p p 　　 strong 评价员观点： /strong /p p 　　U评价：用一个这么创新且大胆的方法，复制形态和功能都有的肾组织，这项产品远优于传统的细胞培养法，具备了组织水平的预测能力。 /p p 　　F评价：这项技术可替代临床前动物试验，减低我们对实验动物检测新化合物的依赖性，有望更好地模拟人类肾脏生物学、检测新药物的肾毒性，给药物研发带来一场变革。 /p p 　　 strong Pacific Biosciences 》 The Sequel System /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 318px height: 300px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/dda0f7b7-13e3-4fec-b759-1d2423e2c322.jpg" title=" 4.jpg" hspace=" 0" height=" 300" width=" 318" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　Pacific Biosciences最新推出的单分子实时(SMRT)测序仪Sequel System比它家原始的长读长测序仪尺寸和重量至少小了1/3，价格减少了一半。 /p p 　　Sequel在去年秋天推出，与称为PacBio RS II的老SMRT测序仪有着相同的长读长和单分子分辨率，但它是SMRT的高通量版本，产出更快，能应对更大的基因组和更高的分子深度需求，如宏基因组样本。 /p p 　　PacBio的员工Sebra在过去的6年将SMRT技术应用于多个实验，包括人类基因组从头测序，他说：“它能灵活应用于研发和生产测序，基本上没有系统误差，做到了高质量测序数据与长读长融合，帮助发现新的基因组特征。” /p p 　　Jonas Korlach，SMRT测序的发明人之一，说Sequel特别适用于宏基因组和传染病研究，最近用于韩国个体参考基因组的研究中(Nature， 538：243-47， 2016)。10月份，Genome 10K (G10K) 和Bird 10，000 Genomes (B10K)的领导人宣布选择SMRT测序作为主体技术。 /p p 　　PacBio测序仪在价格表上为US$350，000，将惠及更多的实验室。 /p p 　 strong 　评价员观点： /strong /p p 　　Str.mvik(下称S)评价：虽然小的实验室很难负担，但是高通量、长读长测序仪是任何团队研究大型和复杂的基因组、宏基因组和宏转录组所必需的。 /p p 　　 strong Axion BioSystems 》 Lumos /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 450px height: 262px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/c93382bd-5eea-4597-beb7-e63fea8e53e2.jpg" title=" 5 (2).jpg" hspace=" 0" height=" 262" width=" 450" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　Axion BioSystems在2015年12月首次发布的Lumos light-delivery system使体外光遗传学比以往更精确、重复性更好。这项设备上有48个孔，每个都有4个单独可控的LED，能闪烁不同波长的光：蓝、绿、橙、红，精确至微秒。把它放微阵列培养皿(microarray culture plate)上，recorder在下方固定，研究者就能刺激、操纵和测量各种细胞。 /p p 　　遗传学家David Goldstein已准备利用Lumos在他哥伦比亚大学的实验室里研究癫痫突变神经元网络的行为，他说：“我们已经花了很长时间找一个精准的癫痫药物环境，用于体外配培养基模型中，同时有足够高的通量可以筛选化合物。” /p p 　　培养神经元网络趋于与它们的突触发射(firing)同步，这样实验者从它们的行为中获得的信息数量就会变少。为了获得更多的复杂行为，揭示突变带来的影响，研究者想要在检测应答的时候优化网络里的活动，而Lumos有望帮助研究者达到这个效果。 /p p 　　Lumos价格为US$26，000。 /p p 　 strong 　评价员观点： /strong /p p 　　U评价：这个在多孔培养皿中的高通量光学刺激系统，是新兴的生物光子学领域出现的首台大范围的实用的仪器。 /p p 　　 strong Thermo Fisher Scientific 》 LentiArray CRISPR Libraries /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 450px height: 250px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/34f19386-91e0-4b6a-8e82-57f865af6d0e.jpg" title=" 5.jpg" hspace=" 0" height=" 250" width=" 450" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　CRISPR-Cas9技术因其易用性，被誉为让基因编辑大众化的技术。Thermo Fisher Scientific 九月推出的LentiArray CRISPR库，让筛选实验变得更简单。Thermo研发的试剂适用于多种人类细胞，从HeLa到诱导多能干细胞，都能使用CRISPR将基因逐个敲除。 /p p 　　来自美国西北大学的Simone Sredni正研究横纹肌样瘤(rhabdoid tumor)。她参与了这文库的优化测试，筛选患者肿瘤细胞中突变的160种激酶的作用，找出其中影响细胞增殖和生长的激酶。她在3个月后得到了原始数据，有几种酶的损伤确实使生长变慢。她说，这真的很快。她花费了一年多一点的时间，做到了体内动物模型这一步，检测抑制这几种酶之后的效果。她认为没有这个筛选实验的话，她无法找到这几种酶。 /p p 　　这个文库有不同的款。客户可以选择19个不同的基因集，定制化芯片，或者进行约18，000个基因的筛选。Thermo的合成生物学研发总监说：这不仅是市面上最高效的筛选技术，还为我们各种实验提供了更多选择。 /p p 　　Sredni认为，一个文库US$10，000起步有点贵，但是对实验室进行高通量筛选来说还是值得的。 /p p 　 strong 　评价员观点： /strong /p p 　　S评价：任何将CPISPR运用到高通量水平的技术，至少值得一看! /p p 　　 strong NanoString Technologies 》 nCounter Vantage 3D Panels /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 450px height: 385px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/80704840-5aa3-4ddd-b596-8f06954e90e9.jpg" title=" 6.jpg" hspace=" 0" height=" 385" width=" 450" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　在2008年，当NanoString首次推出它的nCounter分析系统：一台能计算与靶分子结合的彩色条码的自动显微镜，目的是让量化 mRNA和DNA序列、蛋白计数的技术更成熟。今年，NanoString达到了这个目的，发布了nCounter Vantage 3D Panels。 /p p 　　Vantag试验扩展到能数字计数mRNA、DNA、蛋白，甚至同时检测蛋白的磷酸化情况。4月份，NanoString发布了首个Vantag试验，用于数字计数肺癌白血病样本的RNA、实体瘤生物学和免疫细胞信号通路相关蛋白，以及DNA的单个核酸突变。 /p p 　　Gordon Mills是安德森癌症中心的系统生物学系主任，参与研发Vantage panels，并应用于安德森个性化癌症治疗研究所。他说：“有很多平台可以用于人类样本检测，但是它们中没有谁具有nCounter Vantage system的鲁棒性、易用性和同时处理DNA、RNA和蛋白的能力。” /p p 　　nCounter analysis system价格范围为US$149，000~$280，000，而nCounter Vantage 3D Panels每个样本的运行价格为US$275或以上。在不久的将来，NanoString 和Mills的实验室计划开展新的Vantage panels，添加单细胞范围的分子组成空间定向检测维度。 /p p 　　 strong 评价员观点： /strong /p p 　　Wiley评价：这项产品可能是同时检测一个小样本中的DNA、RNA和蛋白丰度的最大的技术突破。 /p p 　　 strong 908 Devices 》 ZipChip /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 450px height: 265px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/ffcec052-2324-4cf9-8ee5-2108826562b3.jpg" title=" 7.jpg" hspace=" 0" height=" 265" width=" 450" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　zipchip是一个微流控装置，彻底地加快质谱的速度，只需要最小的样本量，扩大了质谱仪能掌握的样本范围。这个小盒子，不到1英尺长，直接搭载到质谱仪，能在一个显微镜玻片大小的微流控芯片上处理样本。 /p p 　　一般来说，准备质谱样本十分耗时，且容易出错。ZipChip减少了这种情况的发生。ZipChip的创造者Petty说：“有了这个前端，我们可以几乎不用怎么处理样本就进行分析，即使含有盐、去垢剂或其他基质。ZipChip利用毛细管电泳能在2~3分钟内分离样本组分，而液相色谱柱起码需要1 个小时。这个设备能更好地分离样本，例如蛋白、抗体、抗体和药物的交联物，这些都是其他技术很难分离的。不仅如此，它只需要几纳升的样本量。”这个设备售价US$30，000，自动进样器另外需要US$20，000。 /p p 　　Michael Pacold在纽约大学研究代谢组学，他说实验室里有一台ZipChip能让他的课题范围更广阔，因为他能从更多的资源中更快地获得数据。“很多临床实验你只能从库里拿到几纳升的血浆，没有像ZipChip这样的设备，无法完成这些实验。” /p p 　　 strong 评价员观点： /strong /p p 　　Platt评价：毛细管电泳，分离样品，只需一点样本就能直接快速完成质谱，费用可能更低，减少样本准备时间还能提高实验的准确性。 /p p 　　 strong Horizon Discovery 》 Turbo GFP Tagged HAP1 Cells /strong /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/6d07e04b-06b1-4a05-b13a-89eda14b1347.jpg" title=" 8.jpg" / /p p 　　Horizon的HAP1细胞已经连续第3年赢得了The Scientist的十大创新产品称号了。在2014年，CRISPR基因敲除细胞系(由Haplogen发售)赢得了此称号 去年，Horizon的定制敲除细胞出现在十大榜单上 去年的10月，Horizon推出Turbo GFP Tagged HAP1细胞，不需要基因过表达就能让目标蛋白带上荧光标签，让Horizon又登上今年的榜单。 /p p 　　Horizon的细胞株产品经理说，使用这些细胞而不用抗体标记的其中一个主要原因就是简便。你不需要像使用抗体那样进行筛选和优化，你可以看到这些细胞活着的动态。 /p p 　　瑞典皇家理工学院的Emma Lundberg最近收到一批用于她的人类蛋白质图集计划(Human Protein Atlas project)工作的细胞。她负责使用共聚焦显微镜进行蛋白亚细胞定位，她说过表达有时会导致人工蛋白或蛋白的错误定位。而这些细胞产品的好处就是知道标签在哪里，且内源表达的时候它会在哪里。 /p p 　　 strong 评价员观点： /strong /p p 　　F评价：Turbo GFP使用CRISPR-Cas9 self-releasing tag，内源标签蛋白比外源模型更好，结果更可信，价格更低。 /p p 　　 strong Photometrics 》 Prime sCMOS Camera /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 450px height: 276px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/5cbf1917-067f-4981-a6c7-f5322f6ca89e.jpg" title=" 9.jpg" hspace=" 0" height=" 276" width=" 450" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　研究者利用现代显微镜的高性能相机捕获样本的图片。Photometrics的产品经理Mohindra说：“每一年这些相机都变得越来越好，接近完美。”他承认，做到完美是很难的，但是他认为他和同事的研发的4.2 megapixel Prime sCMOS camera做到了。在2016年初发布的这台相机有内置的算法，能减少快门噪音，而无需增加光强度导致样本损伤。Mohindra说：“你可以维持低的光度，让细胞存活得更久，获得更好的数据。”Prime camera将信噪比提高了3至5倍，等于让光下调至10分之1。 /p p 　　Prime sCMOS camera的内置算法还减少了研究者收集的数据总量，加快运行和分析的次数。脱机加工时每一帧费时30秒，如果你的相机每秒获得100帧，那就需要50分钟来处理1秒的有效数据。如果使用Prime camera，研究者就能马上完成数据处理。 /p p 　　Photometrics Prime sSMOS camera的实时过滤和高帧速率可以捕获更多的超像素显微镜数据，更好地鉴别出染色体结构的变化。它的售价为US$15，950。 /p p 　 strong 　评价员观点： /strong /p p 　　STR.MVIK评价：对高质量科学成像的需求同时增加了需要处理的信息。添加field-programmable gate array-technology到相机上，似乎可行。 /p p 　 strong 　Thermo Fisher Scientific 》 GeneArt Platinum Cas9 Nuclease /strong /p p style=" text-align: center" img style=" width: 450px height: 218px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/53fdc3ee-e56b-44cb-a9b0-abae4cbd464e.jpg" title=" 10.jpg" hspace=" 0" height=" 218" width=" 450" vspace=" 0" border=" 0" / /p p 　　除了LentiArray CRISPR Libraries，Thermo的另一个突出的CRISPR试剂同时获得了今年的十大创新产品——GeneArt Platinum Cas9 Nuclease。从E. coli提取的重组Streptococcus pyogenes Cas9 蛋白研发的GeneArt Platinum Cas9含有核定位信号，有助于靶细胞的核呈递。 /p p 　　Thermo的基因编辑研发经理Potter说：“我们知道这项产品最重要的是稳定的质量、活性和纯度，所以我们通过大量的试验确保提取的过程是高效的。”Potter的团队去年发表的文章表明GeneArt Cas9对多种细胞株的切割效率达到了85% (J Biotech， 208：44-53， 2015)。 /p p 　　Matthew Porteus是斯坦福大学的干细胞生物学家，他将GeneArt Platinum Cas9用于他的血液疾病活体外(ex vivo)基因编辑研究，目前使用的是小鼠细胞，已与Thermo合作进行临床试验。使用CRISPR/Cas9系统完成基因组编辑是高效而且具特异性的。他说：“我们的问题在于商用的Cas9蛋白前期准备，这对它们有毒性。GeneArt Platinum Cas9确实成为了金标准蛋白，我们获得了用其他试剂达不到的效果。” /p p 　　一管25g的GeneArt Platinum Cas9 Nuclease售价US$150，客户可以咨询Thermo的专家，进行实验设计和整个实验步骤的咨询。 /p p 　　 strong 评价员观点： /strong /p p 　　WILEY评价：这个试剂无需Cas9载体表达，至少能在特定的细胞株中极大的加快传统CRISPR-Cas9的工作流程。 /p p 　　 strong 评价员 /strong /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/71dbc5d9-75bf-4de7-9f7e-5dd2851b9981.jpg" title=" 11.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong JENNIFER FISHMAN /strong /p p 　　Associate Professor in the Biomedical Ethics Unit and the Department of the Social Studies of Medicine and an Associate Member of the Sociology Department and the Institute for Health and Social Policy at McGill University. Fishman holds a Ph.D. in Sociology from the University of California， San Francisco. /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/31de23f3-626c-4ec7-ba7b-da8189c9d3d9.jpg" title=" 12.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong BARRY UNGER /strong /p p 　　Associate Professor of Administrative Services at Boston University. Unger has founded and participated in numerous companies， including Kurzweil Computer Products， Inc.， which became Xerox Imaging Systems. He is also cofounder and chair emeritus of the MIT Enterprise Forum. /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/19173ecc-1744-4a12-aa50-2fae2e9ecb86.jpg" title=" 13.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong MARTINA STR.MVIK /strong /p p 　　Associate Professor and Chair of the Department of Plant Science at McGill University& #39 s McGill Centre for Bioinformatics. Str.mvik studies functional anatomy resulting from gene expression in crop and forest plants. /p

p 　　近日，国产高通量基因测序仪平台厂商赛纳生物科技(北京)有限公司宣布完成B轮融资。继2015年获得通用技术创业投资有限公司及其管理基金的5000万元A轮投资后，赛纳生物B轮再获1.3亿元投资。本轮融资由东方翌睿(上海)基金和中关村发展集团启航基金联合领投，龙磐投资、京工弘元和比邻星创投跟投，A轮主投通用创投继续追加投资。 /p p 　　赛纳生物是国内一家专业从事基因测序仪平台研发及产业化的高科技公司，响应国家精准医疗战略，致力于自主研发创新型基因测序仪及配套芯片和试剂，全面升级基因测序技术在疾病检测、疾病诊断和疾病筛查的临床应用。赛纳生物的核心测序技术来自于美国两院院士、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心主任、国际著名科学家谢晓亮教授，和北京大学工学院教授、北大基因诊断高精尖创新中心研究员、曾任国家863计划“新一代测序仪及配套试剂研发”首席专家的黄岩谊教授团队研发的原创性基因测序技术，打造完全自主知识产权的测序技术平台。公司联合创始人兼CEO吴镭博士是美国芝加哥大学博士、麻省理工学院博士后，业内资深科学家和企业家，曾在美国创建AVIVA公司，归国后曾任Fortebio(中国)总裁，领导公司完成实时蛋白检测仪研发和企业并购。 /p p 　　经过团队不断积累和苦心历练，赛纳生物在技术创新、产品研发和人才储备上有了长足的进步。目前，公司已经建立起一支多学科交叉型的高素质专业化团队，拥有各类专业技术员工近百人，其中研发部门博士和硕士学历人才各占1/3以上，仪器工程团队全部来自于国内顶级IVD企业，具有多年临床医学设备开发经验。赛纳生物已完成核心技术--荧光发生Fluorogenic技术和纠错编码ECC技术的研发、验证工作，并成功研制出了初代样机，样机在测序成本、测序精度、测序耗时等方面达到甚至超越国际可比机型。2017年9月，公司得到北京市科委对科技型中小企业促进专项的立项支持。本轮融资将帮助赛纳生物完成临床注册和产品上市。 /p p 　　赛纳生物CEO吴镭博士表示：“自主开发具有高科技、低成本、技术上可以媲美国外同类设备、价格上适应中国市场临床实践和老百姓需求的高端基因测序技术平台是我们的梦想和追求的目标，这个目标与国家创新发展、提升中国智造水平的战略紧密结合。本轮融资成功，也说明这些优秀投资机构对我们实现目标充满信心。我们独有的创新技术，不断壮大的卓越的研发团队，以及各类合作伙伴所提供与嫁接的资源，都是我们成功实现战略目标的有力保障。” /p p 　　通用技术创业投资有限公司总经理包景明表示：“赛纳生物的测序平台和产品，将推动精准医疗更快更好的普及到中国广阔的临床医疗市场。” /p p 　　东方翌睿(上海)投资管理有限公司总经理张路表示：“赛纳生物所从事的原创型基因测序仪及配套芯片和试剂的研发，是整个基因测序服务产业链的制高点，技术壁垒高，增值能力强。我们非常看好这一领域，我们的投资目标就是要助力于类似赛纳生物这样的拥有核心专利、核心技术和核心产品的科技型公司加速发展。赛纳生物完全符合我们的期望。” /p p 　　中关村发展集团总经理助理龙宜彬表示：“未来中关村发展集团布局的核心产业是信息技术产业与大健康产业，集团在服务北京市建设全国科技创新中心的使命驱动下，正在积极布局相关产业链。我们惊喜地看到赛纳生物在短期内取得的研发成果，也切实感受到科学家严谨求实的工作态度和脚踏实地的作风。有北京大学这样的技术支撑和商业领头羊的成功经验指导，我们对赛纳生物的成长、对国家精准医疗的战略落地充满信心。” /p p 　　龙磐投资执行事务合伙人余治华表示：“赛纳生物的基因测序仪产品在基础构架、试剂、应用算法等各个环节都有自主创新的领先技术，基于新型的发光机制及算法初步形成了可与国际主流基因测序平台竞争的成本及效率优势，期望公司产品尽快推向市场。” /p p 　　 strong 关于通用创投 /strong /p p 　　通用技术创业投资有限公司于2012年3月注册成立，以“技术引领创新，资本成就未来”为经营理念，其前身为通用技术集团投资管理有限公司股权投资部。通用创投公司的投资管理团队具有二十年专业投资经验。重点投资医药医疗、信息技术、高端制造等领域。 /p p 　　 strong 关于东方翌睿 /strong /p p 　　东方翌睿(上海)投资管理有限公司成立于2016年5月，由东方国际集团和上海东方证券资本投资有限公司联合发起设立，聚焦于健康医疗领域的先导性投资布局和战略性产业整合。主要股东包括：东方睿德(上海)投资管理有限公司、东方国际集团上海投资有限公司、东方国际创业股份有限公司、上海新农村建设投资股份有限公司、上海化工研究院有限公司、上海航盈信息科技有限公司。 /p p 　　 strong 关于中发展启航基金 /strong /p p 　　中关村发展集团成立于2010年4月，是北京市委市政府为进一步加快中关村示范区建设，加大市级统筹力度，运用市场化手段配置创新资源的国有大型企业。中关村发展启航产业投资基金是由中关村发展集团主导设立、倾力打造、独立市场化运作的高科技企业股权投资基金。基金立足于中关村国家自主创新示范区，依托发展集团广泛的政府背景及雄厚的产业资源，重点投资海内外前沿颠覆性的技术项目及有良好产业化发展前景、经济社会效益明显的高科技项目。 /p p 　　 strong 关于龙磐投资 /strong /p p 　　龙磐投资总部位于北京，是一家专注于中国境内生物医药领域投资机会的人民币风险投资公司。目前龙磐投资在管3只基金，管理总规模超过人民币20亿元，投资阶段覆盖早中期、成长期和成熟期。基金投资专注于技术先进型生物医药企业，重点市场细分包括化药创新药、生物创新药及高端医疗器械。现已投资生物医药企业数十家，投资的在售化药一类新药品种约占国内全部未上市药企化药一类新药品种的一半。龙磐投资可为被投资的中国创新药和创新器械企业提供其所亟需的全方位增值服务。 /p

北京肿瘤医院中心实验室新引进两套大型质谱：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)和液相色谱四极杆飞行时间质谱仪(micrOTOFQ II LC/MS QTOF)，已于3月11日结束培训，目前进入试运行阶段。　　MALDI-TOF/TOF (Bruker 公司)质谱平台是新一代标准化飞行时间质谱仪，具有smartbeam，配有MALDI离子源、线性和反射操作模式、源后裂解(PSD)串联质谱和高能量碰撞诱导解离(CID)。主要用途：1)结合磁珠即液体芯片用于从复杂体液发现潜在的生物标志物 2)蛋白质样品分子量测定 3) 肽质量指纹图谱(Peptide Mass Fingerprinting，PMF)分析 4)蛋白质的鉴定。 micrOTOFQ II (Bruker 公司) 属于四级杆-飞行时间串联质谱(Q-TOF MS)类质谱。其主要组成部分包括电喷雾离子漏斗源、四级杆、TOF质量分析器、注射泵和数据采集与处理部分。该质谱与液相色谱联用自动进样，适合于多肽的分离、检测与测序，可应用在大规模药物开发、蛋白质组学等新兴技术领域。主要用途：1)分子量的测定 2)精确质量测定及元素组成分析 3)肽质量指纹谱 4)蛋白质的鉴定。目前，该仪器已检测了近40例一维和二维胶内蛋白样品(包括考染和银染胶)，同份样品在军事医学科学院和北京大学医学部分析测试中心进行测定，结果一致。

p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 美国时间2月26日，在基因测序技术领域的全球盛会Advances in Genome Biology and Technology (AGBT)上，华大智造首席科学家Rade Drmanac博士联合多位海外科学家共同分享了基于DNBSEQ测序平台上的CoolMPS& #8482 测序数据。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 450px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/8745ea62-26dc-47e6-95f3-da5c710d9e28.jpg" title=" 1华大智造926c.jpg" alt=" 1华大智造926c.jpg" width=" 600" height=" 450" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " CoolMPS& #8482 是DNBSEQ平台上首款基于抗体的大规模平行测序试剂，它利用天然碱基来进行更清晰的碱基识别，有效避免传统测序方法中的DNA“疤痕”积聚对后续读取准确性的影响，实现更准确和更长的测序。该方法使得在每个测序循环中，与抗体相连的多个荧光染料分子能提供更高的信噪比；同时结合天然碱基，每个测序循环之间没有干扰，错误率低。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 258px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/d5730851-b302-46a3-b179-9b640d91125e.jpg" title=" 2 CoolMPS高通量测序试剂套装.jpg" alt=" 2 CoolMPS高通量测序试剂套装.jpg" width=" 600" height=" 258" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em text-align: center " CoolMPS高通量测序试剂套装 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 华大智造首席科学家Rade Drmanac博士表示凝聚独特的DNB文库技术、低深度高精度的PCR-free技术、Patterned Array规则阵列技术，以及本次推出的基于抗体技术的CoolMPS& #8482 方法，有望重新定义大规模平行测序(MPS, Massively Parallel Sequencing)，尽快实现百万基因组测序，迈入人人基因组时代。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 450px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/a27ca322-b092-41e2-aa0c-86a8a7a5c577.jpg" title=" 3 华大智造首席科学家Rade Drmanac博士在AGBT上发表演讲b.jpg" alt=" 3 华大智造首席科学家Rade Drmanac博士在AGBT上发表演讲b.jpg" width=" 600" height=" 450" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em text-align: center " 华大智造首席科学家Rade Drmanac博士在AGBT上发表演讲 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 华大智造DNBSEQ测序平台 span style=" text-indent: 2em " 获海外用户高度认可 /span /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 英国癌症研究所肿瘤分析团队（the Tumour Profiling Unit at the Institute of Cancer Research in the UK）的Nik Matthews博士，基于华大智造DNBSEQ-G400测序平台，分别利用StandardMPS和CoolMPS测序反应通用试剂套装，进行了WGS全基因组分析。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/7db73405-b7b7-4e82-963b-c35e0a83440c.jpg" title=" 4 Q30提升44a4.jpg" alt=" 4 Q30提升44a4.jpg" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em text-align: center " Q30提升 br/ /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " “这完全让我感到震惊。”Nik说，“当我第一次看到数据结果时，我才发现，原来仅将测序试剂的化学方法更换为CoolMPS版本，就可以进一步提高Q30、降低错误率，也就是说，通过‘几乎不做任何事情’，就获得了更多的数据，这太酷了。” /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/a83b1b01-c80c-422b-ac1c-de2defbc1346.jpg" title=" 5 错误率进一步降低6d8.jpg" alt=" 5 错误率进一步降低6d8.jpg" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em text-align: center " 错误率进一步降低 br/ /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 加拿大卑诗省癌症研究所（BC Cancer Agency）迈克尔史密斯基因组科学中心（Genome Sciences Centre，GSC）副主任、生物信息学负责人Steven Jones博士在他的实验室利用DNBSEQ& #8482 平台展开了一系列针对肿瘤样本的研究工作，包括WGS，RNA和单细胞ATAC测序。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 通过对比分析基于华大智造DNBSEQ-G400和Illumina HiSeq的下机数据，Steven博士表示：数据表明肿瘤基因组分析结果在不同平台间“基本一致”。特别是基于华大智造DNBSEQ-G400的PCR-free方法获得的WGS数据，在15X的测序深度就可以达到传统的PCR WGS 30X的数据质量，重复读取的次数则更少、产生的有效数据更多，更具成本效益。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/1db17d42-7a08-4289-becc-35d2523d7347.jpg" title=" 6 错误率进一步降低.jpg" alt=" 6 错误率进一步降低.jpg" / /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/a015843c-380d-4a5b-ae35-f3b8676b3d5f.jpg" title=" 7 错误率进一步降低0084.jpg" alt=" 7 错误率进一步降低0084.jpg" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 蒙特利尔麦吉尔大学（McGill University）的基因组学负责人Jiannis Ragoussis教授在AGBT发表了关于在DNBSEQ-G400上评估单细胞RNA测序性能表现的主题演讲，并将该数据与Illumina NovaSeq 6000进行了比较。 span style=" text-indent: 2em " & nbsp /span br/ /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 结果表明，MGI DNBSEQ-G400和Illumina NovaSeq 6000这两个平台之间的性能可比，数据相似，而MGI DNBSEQ-400实际上更加灵活且实用。“基于MGI平台，我们以可控的测序成本，获得了更多的reads数。我们不再囿于昂贵的试剂耗材而不得不混合多个文库。” /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 346px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/c53e7fa4-64f1-4764-a801-454cb6764b0d.jpg" title=" 8 03.jpg" alt=" 8 03.jpg" width=" 600" height=" 346" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 288px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/e6a246ec-7151-4783-95b8-bab2ccf13dc5.jpg" title=" 9 4.jpg" alt=" 9 4.jpg" width=" 600" height=" 288" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 高性能产品& nbsp & nbsp 满足用户更高要求 /span /strong /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " PCR-Free是华大智造在2019年推出的一款文库制备技术，在测序全流程无PCR扩增，使用1μg 基因组DNA仅需3.5个小时就能获得高准确度的全基因组文库。相比于传统个人全基因组测序（WGS），利用MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装获得的变异检测性能，尤其是InDel检测灵敏度和准确性等方面已达到业界领先水平，无PCR扩增错误累积，基因组覆盖均一性好，变异检测性能优。 /p

单细胞测序技术以前所未有的分辨率揭示了细胞组成和功能状态的异质性，已广泛应用在肿瘤、免疫、神经和发育生物学等研究领域。但现有的高通量单细胞测序平台还存在一定局限性，基于液滴捕获的方法依赖泊松分布实现细胞-微球配对，存在大量空液滴不可利用，导致试剂浪费和细胞损失；基于微孔捕获策略的平台利用细胞重力沉降随机捕获，存在有限稀释导致的微孔利用率低的问题，且存在微孔交叉污染的可能性；此外组织解离过程中细胞破裂产生游离的mRNA导致背景干扰，掩盖细胞之间真实的异质性。为克服上述问题，德运康瑞自主研发成功打造出一款创新性的高通量单细胞测序平台Well-Paired-Seq。该平台包括自动化单细胞测序文库构建系统DECODER, 芯片试剂盒、反转录与扩增试剂盒、文库构建试剂盒及相关生信分析工具。Well-Paired-Seq基于双孔嵌套式芯片，协同局部准静态流体力学和尺寸排阻原理，实现细胞和编码微球高效精准“配对”，利用准静态流体力学特性有效清洗背景，具有高效的细胞捕获率、细胞/微球配对效率以及游离RNA去除等优势，实现高通量细胞捕获、高灵敏基因检出和单细胞高保真分子解析。Well-Paired-Seq高通量单细胞测序解决方案平台技术优势（1）高通量，单张芯片即可完成1万个细胞捕获和单细胞测序分析；（2）高灵敏，基因检出数量优异，且有效检出稀有细胞类型；（3）高效率, 细胞捕获效率稳定在60%左右，提高样本细胞利用率；（4）高保真，在芯片上直接清洗游离RNA等杂质，降低背景干扰；（5）高质量，专利技术减少微孔交叉污染还原细胞真实分子表达信息。小结Well-Paired-Seq高通量单细胞测序技术基于双孔嵌套式芯片的创新设计，在细胞捕获、细胞/微球配对、游离mRNA去除等方面具有出色的效率，并显著地降低了细胞损失和背景噪音，以较低的双胞率实现了高通量单细胞测序分析，在细胞捕获效率和基因检出数量等多项指标表现稳定并领先行业。德运康瑞始终立足自主创新，此次重磅推出整合硬件设备、捕获芯片、配套试剂盒和生信工具的高通量单细胞测序整体解决方案，为单细胞测序技术推向精准医学应用奉献中国创新智慧。关于德运康瑞苏州德运康瑞生物科技有限公司（http://www.dynamic-biosystems.com/）是一家单细胞与空间多组学技术平台型企业，围绕单细胞富集与检测、单细胞测序、空间多组学技术，满足不同应用场景下的分析需求，公司聚焦挖掘在肿瘤精准医学、优生优育以及药物发现领域的巨大潜力，致力于推动精准医疗向单细胞与空间组学时代迈进，助力生命科学和临床医学，为人类健康事业贡献中国智慧。

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，产生长片段信息(10-100 kb)，实现结构变异和单体型等分析。 　　由于现有技术的局限性，基因组上仍然有不少缺口。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据，实现SNP的大规模鉴定。然而，对于结构变异这种大片段的DNA改变，我们还是无法轻松检出。 　　GemCode平台是一套分子条形码和分析系统，由仪器、试剂盒和信息学软件组成。它带来了结构变异、单体型以及其他一些有价值的长片段信息，适用于靶向、外显子组和全基因组测序。这个平台并非单独使用，而是与短读取的测序仪结合使用，能轻松整合到现有的测序流程中。目前，它只与Illumina测序系统兼容。 　　GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区，形成皮升(pl)大小的液滴，其中包含分子条形码。凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。这些凝胶珠在分区之后溶解，释放oligo，启动文库构建。 　　GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。在8样品卡盒中上样凝胶珠、GemCode试剂和DNA混合物，以及分区的油。微流体通道的网络形成了&ldquo 双十字&rdquo 交叉。在第一个交叉，凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。第二个交叉将反应包裹在油中，形成数千个独立的反应。这些油滴就称为GEM。在每个GEM中，凝胶珠溶解，释放带条形码的oligo，实现后续的DNA priming。后面便是传统的文库构建。 　　之后，数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合，产生一种强大的新数据类型：Linked-Reads。在比对和变异检出后，新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。所产生的读取长度在10-100 kb。 　　这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。以25倍的覆盖度进行全基因组测序，就能分辨5 Mb的单体型板块。同时，缺失、重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定，从而更准确地了解基因组复杂性。 　　目前，多个机构已经开始使用GemCode平台，Broad研究院便是其中一个。主管Stacey Gabriel表示，Broad的研究人员都很兴奋。&ldquo 随着GemCode平台的安装，我们将很快提供Linked-Reads，实现结构变异检测和单体型分相等应用，&rdquo 她说。 　　也许，不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。据悉，GemCode平台的售价约为75,000美元，而耗材成本大约是每个样品500美元。

近日，在中国科学院条件保障与财务局的支持和推动下，中科院基因组测序平台联盟成立大会暨签约仪式在中科院北京基因组研究所召开。条财局副局长曹凝及中科院广州、武汉、上海、昆明及北京各区域中心专家代表和部分研究所代表共计20余人出席会议。 　　会上，北京基因组所副所长、党委副书记王丽萍首先对各位领导和专家的到来表示欢迎，并向大家介绍了本次测序平台联盟成立的背景及意义。接着，曹凝指出，随着测序仪的更新换代和测序技术的迅猛发展，对相关生命科学研究所在基因测序仪购置、共享以及技术交流等方面提出很多挑战，也出现很多机遇，希望借助测序联盟的成立，统筹规划推进基因组测序平台建设，增强院内技术协同交流，统筹实施&ldquo 十三五&rdquo 规划。 　　随后，各区域中心代表以及各研究所代表进行了联盟成立签约仪式。 　　签约仪式完成后，北京基因组所科技处处长吴佳妍汇报了联盟2015年年度工作计划，与会专家代表进行了充分的交流讨论，并给出了建设性意见建议。 　　该联盟的成立将促进中科院院内各测序平台间的交流和共享，减少仪器设备重复购置，实现资源整合和有效配置，继而提升中科院基因组研究的整体能力。