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多病原检测

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多病原检测相关的资讯

  • 768万!铜仁市疾控中心2024年实验室能力提升仪器设备及多病原检测试剂耗材采购项目
    一、项目基本情况 项目编号:TRZFCG-2024-026 项目名称:铜仁市疾控中心2024年实验室能力提升仪器设备及多病原检测试剂耗材采购项目 项目序列号: P520600202400029O 预算金额(元):7689080 最高限价(元):1400000,6289080 采购需求: 标项一 标项名称: 铜仁市疾控中心2024年实验室能力提升仪器设备及多病原检测试剂耗材采购项目1包 数量: 1 预算金额(元): 1400000 简要规格描述或项目基本概况介绍、用途:2024年实验室能力提升仪器设备及多病原检测试剂耗材采购 备注: 标项二 标项名称: 铜仁市疾控中心2024年实验室能力提升仪器设备及多病原检测试剂耗材采购项目2包 数量: 1 预算金额(元): 6289080 简要规格描述或项目基本概况介绍、用途:2024年实验室能力提升仪器设备及多病原检测试剂耗材采购 备注: 合同履约期限:标项 1、2,详见采购文件 本项目(否)接受联合体投标。二、获取招标文件 时间:2024年04月02日至2024年04月11日 ,每天上午08:00至12:00 ,下午13:30至17:00(北京时间,法定节假日除外) 地点:全国公共资源交易平台(贵州省铜仁市)网上交易大厅(https://ggzy.guizhou.gov.cn/hallweb/#/login) 方式:无 售价(元):0 三、对本次采购提出询问,请按以下方式联系 1.采购人信息 名 称:铜仁市疾病预防控制中心 地 址:铜仁市碧江区川硐街道敬业路312号 联系方式:15286736297 2.采购代理机构信息 名 称:铜仁市公共资源交易中心 地 址:贵州省铜仁市桃源大道铜仁市公共服务中心四楼铜仁市公共资源交易中心 联系方式:0856-3912922 3.项目联系方式项目联系人: 黄丽电 话:0856-3912922
  • 310万!湛江市疾病预防控制中心采购荧光定量PCR仪、多病原快速核酸检测系统等仪器设备
    项目概况湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目招标项目的潜在投标人应在广东省政府采购网https://gdgpo.czt.gd.gov.cn/获取招标文件,并于2021年12月09日 09时30分(北京时间)前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号:0724-2101D98N5565项目名称:湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目采购方式:公开招标预算金额:3,106,750.00元采购需求:合同包1(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包一)):合同包预算金额:1,320,000.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)1-1临床检验设备多病原快速核酸检测系统1(套)详见采购文件692,000.00-1-2临床检验设备荧光定量PCR仪1(台)详见采购文件628,000.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:项目采购合同生效之日起至甲乙双方义务履行完毕。合同包2(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包二)):合同包预算金额:480,000.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)2-1临床检验设备蛋白印迹仪1(台)详见采购文件300,000.00-2-2医用低温、冷疗设备超低温冰箱2(台)详见采购文件180,000.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:项目采购合同生效之日起至甲乙双方义务履行完毕。合同包3(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包三)):合同包预算金额:398,000.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)3-1其他试验仪器及装置智能机器人分析系统(高锰酸盐指数)1(套)详见采购文件398,000.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:项目采购合同生效之日起至甲乙双方义务履行完毕。合同包4(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包四)):合同包预算金额:132,750.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)4-1水质污染防治设备便携式余氯分析仪7(台)详见采购文件36,400.00-4-2水质污染防治设备便携式二氧化氯分析仪7(台)详见采购文件24,850.00-4-3水质污染防治设备便携式PH检测仪1(台)详见采购文件900.00-4-4环保监测设备照度计4(台)详见采购文件4,000.00-4-5激光仪器激光测距仪7(台)详见采购文件12,600.00-4-6噪声控制设备噪声分析仪4(台)详见采购文件39,200.00-4-7环保监测设备数字风速仪4(台)详见采购文件8,400.00-4-8环保监测设备温湿度计4(台)详见采购文件6,400.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:项目采购合同生效之日起至甲乙双方义务履行完毕。合同包5(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包五)):合同包预算金额:776,000.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)5-1其他试验仪器及装置水中微生物膜过滤装置2(台)详见采购文件210,000.00-5-2显微镜暗视野显微镜1(台)详见采购文件95,000.00-5-3其他试验仪器及装置空气微生物采样器4(台)详见采购文件65,000.00-5-4其他试验仪器及装置恒温水浴箱1(台)详见采购文件41,000.00-5-5其他试验仪器及装置恒温摇床培养箱2(台)详见采购文件142,000.00-5-6其他试验仪器及装置水平摇床1(台)详见采购文件45,000.00-5-7其他试验仪器及装置定量采样机器人1(台)详见采购文件160,000.00-5-8医用低温、冷疗设备低温冰箱(-40℃)1(台)详见采购文件18,000.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:项目采购合同生效之日起至甲乙双方义务履行完毕。二、申请人的资格要求:1.投标供应商应具备《政府采购法》第二十二条规定的条件,提供下列材料:1)具有独立承担民事责任的能力:在中华人民共和国境内注册的法人或其他组织或自然人, 投标(响应)时提交有效的营业执照(或事业法人登记证或身份证等相关证明) 副本复印件。分支机构投标的,须提供总公司和分公司营业执照副本复印件,总公司出具给分支机构的授权书。2)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录:提供投标截止日前6个月内任意1个月依法缴纳税收和社会保障资金的相关材料。 如依法免税或不需要缴纳社会保障资金的, 提供相应证明材料(如投标人出具承诺函:已对接“粤省事”“粤商通”“粤信签”等系统且能通过系统查询到相关内容,则无须提供该项证明文件)。3)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度:供应商必须具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度(提供2020年度财务状况报告或基本开户行出具的资信证明,如投标人出具承诺函:已对接“粤省事”“粤商通”“粤信签”等系统且能通过系统查询到相关内容,则无须提供该项证明文件) 。4)履行合同所必须的设备和专业技术能力:按投标(响应)文件格式填报设备及专业技术能力情况。5)参加采购活动前3年内,在经营活动中没有重大违法记录:在经营活动中没有重大违法记录:参照投标(报价)函相关承诺格式内容。 重大违法记录,是指供应商因违法经营受到刑事处罚或者责令停产停业、吊销许可证或者执照、较大数额罚款等行政处罚。(较大数额罚款按照发出行政处罚决定书部门所在省级政府,或实行垂直领导的国务院有关行政主管部门制定的较大数额罚款标准,或罚款决定之前需要举行听证会的金额标准来认定)2.落实政府采购政策需满足的资格要求:合同包1(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包一))落实政府采购政策需满足的资格要求如下:本项目非专门面向中小企业采购的项目合同包2(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包二))落实政府采购政策需满足的资格要求如下:本项目非专门面向中小企业采购的项目合同包3(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包三))落实政府采购政策需满足的资格要求如下:本项目非专门面向中小企业采购的项目合同包4(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包四))落实政府采购政策需满足的资格要求如下:本项目非专门面向中小企业采购的项目合同包5(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包五))落实政府采购政策需满足的资格要求如下:本项目非专门面向中小企业采购的项目3.本项目的特定资格要求:合同包1(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包一))特定资格要求如下:(1)供应商未被列入“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)“记录失信被执行人或重大税收违法案件当事人名单”记录名单; 不处于中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)“政府采购严重违法失信行为信息记录”中的禁止参加政府采购活动期间。 (以采购代理机构于投标(响应) 截止时间当天在“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn) 及中国政府采购网(http://www.ccgp.gov.cn/) 查询结果为准, 如相关失信记录已失效, 供应商需提供相关证明资料) 。(2)单位负责人为同一人或者存在直接控股、 管理关系的不同供应商,不得同时参加本采购项目(或采购包) 投标(响应)。 为本项目提供整体设计、 规范编制或者项目管理、 监理、 检测等服务的供应商, 不得再参与本项目投标(响应)。 投标(报价) 函相关承诺要求内容。(3)如投标人为代理经销商,应具有医疗器械经营许可证或医疗器械经营备案凭证;如投标人为制造商,应具有医疗器械生产许可证。合同包2(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包二))特定资格要求如下:(1)供应商未被列入“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)“记录失信被执行人或重大税收违法案件当事人名单”记录名单; 不处于中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)“政府采购严重违法失信行为信息记录”中的禁止参加政府采购活动期间。 (以采购代理机构于投标(响应) 截止时间当天在“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn) 及中国政府采购网(http://www.ccgp.gov.cn/) 查询结果为准, 如相关失信记录已失效, 供应商需提供相关证明资料) 。(2)单位负责人为同一人或者存在直接控股、 管理关系的不同供应商,不得同时参加本采购项目(或采购包) 投标(响应)。 为本项目提供整体设计、 规范编制或者项目管理、 监理、 检测等服务的供应商, 不得再参与本项目投标(响应)。 投标(报价) 函相关承诺要求内容。(3)如投标人为代理经销商,应具有医疗器械经营许可证或医疗器械经营备案凭证;如投标人为制造商,应具有医疗器械生产许可证合同包3(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包三))特定资格要求如下:(1)供应商未被列入“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)“记录失信被执行人或重大税收违法案件当事人名单”记录名单; 不处于中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)“政府采购严重违法失信行为信息记录”中的禁止参加政府采购活动期间。 (以采购代理机构于投标(响应) 截止时间当天在“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn) 及中国政府采购网(http://www.ccgp.gov.cn/) 查询结果为准, 如相关失信记录已失效, 供应商需提供相关证明资料) 。(2)单位负责人为同一人或者存在直接控股、 管理关系的不同供应商,不得同时参加本采购项目(或采购包) 投标(响应)。 为本项目提供整体设计、 规范编制或者项目管理、 监理、 检测等服务的供应商, 不得再参与本项目投标(响应)。 投标(报价) 函相关承诺要求内容。合同包4(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包四))特定资格要求如下:(1)供应商未被列入“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)“记录失信被执行人或重大税收违法案件当事人名单”记录名单; 不处于中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)“政府采购严重违法失信行为信息记录”中的禁止参加政府采购活动期间。 (以采购代理机构于投标(响应) 截止时间当天在“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn) 及中国政府采购网(http://www.ccgp.gov.cn/) 查询结果为准, 如相关失信记录已失效, 供应商需提供相关证明资料) 。(2)单位负责人为同一人或者存在直接控股、 管理关系的不同供应商,不得同时参加本采购项目(或采购包) 投标(响应)。 为本项目提供整体设计、 规范编制或者项目管理、 监理、 检测等服务的供应商, 不得再参与本项目投标(响应)。 投标(报价) 函相关承诺要求内容。合同包5(湛江市疾病预防控制中心仪器设备采购项目(包五))特定资格要求如下:(1)供应商未被列入“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)“记录失信被执行人或重大税收违法案件当事人名单”记录名单; 不处于中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)“政府采购严重违法失信行为信息记录”中的禁止参加政府采购活动期间。 (以采购代理机构于投标(响应) 截止时间当天在“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn) 及中国政府采购网(http://www.ccgp.gov.cn/) 查询结果为准, 如相关失信记录已失效, 供应商需提供相关证明资料) 。(2)单位负责人为同一人或者存在直接控股、 管理关系的不同供应商,不得同时参加本采购项目(或采购包) 投标(响应)。 为本项目提供整体设计、 规范编制或者项目管理、 监理、 检测等服务的供应商, 不得再参与本项目投标(响应)。 投标(报价) 函相关承诺要求内容。(3)如投标人为代理经销商,应具有医疗器械经营许可证或医疗器械经营备案凭证;如投标人为制造商,应具有医疗器械生产许可证。三、获取招标文件时间:2021年11月18日至2021年11月25日,每天上午00:00:00至12:00:00,下午12:00:00至23:59:59(北京时间,法定节假日除外)地点:广东省政府采购网https://gdgpo.czt.gd.gov.cn/方式:在线获取售价:免费获取四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点2021年12月09日 09时30分00秒(北京时间)地点:湛江市赤坎区体育北路2号天润中心六楼湛江市公共资源交易中心3号开标室。五、公告期限自本公告发布之日起5个工作日。4.需要落实的政府采购政策:
  • 研究人员开发出对水、土壤中的病原体检测的快速方法
    以色列本-古里安大学和美国麻省理工学院的研究人员开发出一种高敏感度,节约成本的技术,只需在24小时之内,就能快速完成空气、土壤、水和农产品中的细菌性病原体检测。  根据这项研究的领导者,正在本-古里安大学扎克伯格水研究所攻读博士学位的以斯拉奥洛夫斯基博士介绍,“现场样本中快速可靠的病原体检测对于公共卫生、安全和环境监测是至关重要的。目前在食品、水或临床应用上使用的方法需要依赖实验室以及花费大量的时间培养技术,比如在乳品业、废水和径流处理这样的活动中,需要在环境样本中实时监测病原体。  这项发表在《水、空气&土壤污染》期刊网络版上的研究,定义了一个准确的、价格低廉的、高通量的以及快速的替代方法来检测不同环境样本中的病原。“这是首次在种类广泛的环境样本类型中,全面评估病原体浓度的研究,通过标准(或传统)方法,利用完整的并行测试,实现多病原检测。  “我们能够在24小时内准确地确定土壤样品中的沙门氏菌,而传统的方法需要四到五天,而且需要分类,”以斯拉奥洛夫斯基博士说。“我们还成功地确定了一种致命的感染,铜绿假单胞菌,存在于气溶胶中,是国内污水处理系统中的产生的。结果表明,我们开发的技术提供了一种广泛的方法,在具有挑战性的环境样品中的快速,高效,可靠地检测出相对低浓度的致病微生物。  为了评估这项技术,各种类型的环境样本,包括气溶胶,各种土壤类型,废水和蔬菜表面(番茄),被同时侵入了沙门氏菌或铜绿假单胞菌。研究人员选择了这些病原是因为他们是主要的致病病原,在环境中有着较高的生存潜能,而且在浓度低的时候很难被准确地检测出来。  “当这个方法应用于没有侵入病原的现场样本时,我们的方法显著优于标准方法,能够在收到样本一天之内检测出病原,” 以斯拉奥洛夫斯基博士说。“由于这个集中而且经济的检测程序告诉我们在一天之内重点检测哪里,因此我们不需要花费几天时间来检测数以百计的样本和子样本。”  这个快速检测方法同时使用了两种技术,一个是用于微生物检测的进化的“MPN-type enrichment”技术,再加上广泛用于分子生物学用于实时监测DNA扩增的“qPCR”技术。  “我们大大缩短了之前的方案,也不再使用任何名牌昂贵的试剂对DNA进行提纯和净化,也不用增加工作流程,从原始样品很容易地进行到qPCR实验,” 以斯拉奥洛夫斯基博士说。  土壤、水和蔬菜样本的检测是高度敏感的(低至每一个细胞的测试),研究人员认为需要额外的步骤来进一步提高检测水平,使得这项技术能够反映出气溶胶中的低病原浓度(特别是低浓度感染剂量)。  研究人员推荐今后用这种方法来检测其他病原,如军团菌,金黄色葡萄球菌和空肠弯曲杆菌,其中第二个病菌是食源性疾病的最常见原因。
  • 核酸质谱下一站:病原体检测——访中国医学科学院病原生物学研究所彭俊平研究员
    由于传播途径多样、影响范围广泛,症状发展迅速,传染病仍然是世界范围内引起人类大量死亡的重要原因。21世纪以来多次严重疫情给我们留下深刻印象:一是2003年的“非典”(SARS),二是2009年的甲型H1N1流感(人感染猪流感),再有就是现在席卷全球的新型冠状病毒肺炎疫情。因此,传染病的防控一直是医学科学工作者面临的巨大挑战。其中,对病原体进行快速准确的鉴定是传染病精准防控的基础。中国医学科学院病原生物学研究所彭俊平研究员自2000年起即深耕于病原体检测技术方法及基因组学、耐药机制相关的研究工作。近日,仪器信息网特别采访了彭俊平研究员,与他就核酸质谱技术在病原体检测领域的应用现状及前景进行了深入交谈。中国医学科学院病原生物学研究所 彭俊平研究员“国内最早开展核酸质谱病原体检测研究的团队之一”随着各项科学技术的进步,病原体检测技术也在不断发展,由病原分离、电镜观察、免疫学检测等传统生物学方法发展到PCR技术、芯片技术、测序技术、质谱技术等分子生物学方法。“因为引起疾病的病原体种类繁多,单一的平台技术不能解决所有问题,所以,我们的主要工作是利用各种平台技术对病原体进行筛查。”彭俊平介绍到,“多年来我们课题组一直致力于搭建一个病原体组合筛查技术体系,这也是我国在传染病防控领域的一个重要工作。另外,我们利用多重PCR反应结合飞行时间质谱技术(以下简称:核酸质谱)在病原体检测领域开展了10多年的工作,这也是我们多年来的一个重点发展方向。”核酸质谱是什么?彭俊平为笔者解答到,核酸质谱其实是基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)在核酸水平的应用,是一种将多重PCR反应与质谱结合的复合技术。此前,MALDI-TOF主要应用于蛋白质水平的微生物鉴定研究,应用发展不过30多年,而MALDI-TOF在核酸水平的相关应用则是近些年提出的概念,应用发展时间就更短。最初,MALDI-TOF在核酸研究领域开展的应用是SNP基因分型,其首先通过PCR扩增含有SNP的基因组片段,再通过检测核酸分子在真空管中的飞行时间而获得样品分析物的精确分子量,从而检测出SNP位点信息。因为MALDI-TOF本身的高灵敏度和高通量等特点,使其非常适合应用于SNP多位点的筛查。而MALDI-TOF在病原体检测领域的研究则鲜少有报道。彭俊平课题组是国内最早开展核酸质谱病原体检测研究的团队之一。“我们是在2009年引进的这个技术平台,正好是H1N1全球大流行的时候,当时核酸质谱的技术水平还不足以帮助我们开展相关工作,因此我们就开始自己开发方法。”核酸质谱病原体检测的原理是利用MALDI-TOF检测多重PCR反应的产物,即单碱基延伸的产物质量大小,来判定检测靶基因的有无,从而进一步判定样本中目标病原体的有无。与传统的病原体检测技术相比,核酸质谱在灵敏度、检测通量以及操作简便性等方面均有一定优势。此外,核酸质谱检测的核酸序列均来源于公共数据库,不需要依赖其他的数据库。 “开发了7种人冠状病毒的检测方法,成功申请专利”经过多年的技术摸索,彭俊平团队利用核酸质谱在病原体检测领域做出了很多成果。最近其团队开发了7种人冠状病毒的检测方法,并申请了发明专利。目前,已知可以感染人的冠状病毒共有7种,其中包括2003年的“非典”SARS冠状病毒、2012年在中东地区出现的MERS冠状病毒以及2019年12月爆发的严重性呼吸系统综合征冠状病毒SARS-Cov-2。彭俊平介绍到,课题组是从2012年开始开展人冠状病毒的检测技术研究,其中一部分工作内容就是利用核酸质谱进行检测应用。该部分成果是与岛津公司合作开发的,利用一步法多重反应PCR与MALDI-TOF质谱联用鉴定7种人冠状病毒与新型冠状病毒的重要突变位点。“本次合作中我们将多重PCR反应从两步法改进为一步法,既缩短了实验时间,又减少了人为操作的工作。而且我们改进的方法适用于所有的RNA病毒,可以说是摸索出了一种通用的解决方案。”彭俊平介绍到,“和岛津合作成果的应用价值很明确,我非常期待未来该方法的推广。接下来我们也将继续和岛津合作在MALDI-TOF平台上开发出更多病原体检测解决方案,并合力推动核酸质谱在临床领域的应用。”笔者追问到目前国际上核酸质谱在病原体检测领域的应用现状如何?彭俊平坦言道,国际上相关的成果并不多,而团队于2009年就开展了相关研究,可以说是走在了国际前列。不过,目前核酸质谱病原体检测的应用还以科研阶段为主,临床应用正处于拓展阶段。此外,彭俊平也谈到他认为核酸质谱走向临床所面临的瓶颈,一是MALDI-TOF本身的硬件设备比较贵;其次,基于MALDI-TOF平台提供给临床应用的成熟方法不多。因此,核酸质谱这样的技术平台想要真正推广到临床,首先需要提供“一揽子”的解决方案,这样应用场景就会被打开。不过,彭俊平也观察到,无论国内还是国外,越来越多的团队和厂商开始关注这一领域,相信核酸质谱的临床应用情况将在短短几年之内得到很大的改变。最后彭俊平表示,未来核酸质谱病原体检测值得重点关注的方向有呼吸道感染疾病、腹泻性疾病和性传播疾病等,其涉及的病原体种类繁多,是核酸质谱可以“大展身手”的方向。后记:采访中彭俊平反复提到“病原体的组合筛查技术体系”,他也为笔者解释到,为了获取更全面的生物信息,往往需要多种技术平台共同解决问题,而不是希望用一个技术平台去解决所有的问题。回到MALDI-TOF这一技术来说,总有人拿质谱与NGS测序相比较,其实它们的应用场景和目标都不一样,发展核酸质谱也并不是为了替代测序技术。事实上,核酸质谱只需要在中高通量的检测中建立并巩固其“王者地位”,在此基础上能够再提升灵敏度和分辨率等性能,就为自身的发展开辟了新天地。
  • 130万!佛山市禅城区疾病预防控制中心购置多重PCR多病毒核酸检测鉴定分析仪等设备
    项目编号:ZFXL2022045项目名称:佛山市禅城区疾病预防控制中心购置多重PCR多病毒核酸检测鉴定分析仪等设备采购方式:公开招标预算金额:1,300,000.00元采购需求:合同包1(佛山市禅城区疾病预防控制中心购置多重PCR多病毒核酸检测鉴定分析仪等设备):合同包预算金额:1,300,000.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)1-1临床检验设备多重PCR多病毒核酸检测鉴定分析仪1(台)详见采购文件800,000.00-1-2临床检验设备全自动化学发光分析仪1(台)详见采购文件300,000.00-1-3临床检验设备高速冷冻离心机1(台)详见采购文件200,000.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:合同所约定的全部义务履行完毕之日止。
  • 化学发光探针检测技术速查病原菌
    吉林检验检疫局建立的金标法检测单核细胞增生性李斯特氏菌技术作为当今检测病原体和诊断疾病方面最为敏感的免疫学技术之一,不仅操作简便、快速、特异,更为重要的是适用于广大基层食品监管部门的现场检测和诊断,这些特点都是其他免疫学方法所无法比拟的。   该技术不仅具有巨大的发展潜力,而且还具有广阔的市场和应用前景,如可适用于医疗卫生行业,出入境食品口岸抽查和鉴定、流通领域卫生监督和工商行政部门和质监部门的食品企业监管等,甚至可以走进餐馆、家庭进行简易的食品自控和检测等。   由吉林出入境检验检疫局承担的国家质检总局科研课题《应用化学发光探针及免疫金标法检测食品中多种致病菌的研究》在2011年获得了国家质检总局“科技兴检”三等奖。该课题建立的化学发光探针检测技术能够快速检测食品中常见的四种病原菌:空肠弯曲菌、单核细胞增生性李斯特氏菌、大肠杆菌O157和金黄色葡萄球菌。其中对单核细胞增生性李斯特氏菌还建立了应用免疫胶体金试纸条的快速检测方法。   急需速测技术   我国的食品生产加工企业数量多,规模小,较分散,而且为数较多企业过分追求利润法律意识淡薄,社会责任心不强导致其产品质量良莠不齐。   据报道,我国45万个食品生产企业中,员工人数10人以下的食品生产加工小作坊就有35万家,约占80%,因而导致食品安全事故时有发生,给社会和消费者的健康造成了巨大危害。   而目前的食品卫生监管的检测手段主要依据国家标准或行业标准规定方法进行,虽然这些方法准确可靠,但这些方法一般都需要建设专门的微生物检测实验室,配备专业的检测技术人员,需要较长的检测周期,由此造成的检测成本过高,缺乏时效性等问题,使一些突发的食品安全事件不能迅速得以解决。因此发展和建立一种快速、简便、灵敏准确的检测技术,作为标准检测方法的初筛技术,是解决上述问题的有效手段之一。   食品检验新兵   化学发光探针技术的原理是互补的核酸单链会特异性识别并结合成稳定的双链复合物。这一检测系统利用一个标记有化学发光物的单链DNA探针,可以特异性的识别和结合目标微生物的核糖体RNA。微生物中的核糖体RNA释放出来后,化学发光标记的DNA探针就与之结合形成稳定的DNA-RNA杂合体。标记的DNA-RNA杂合体会与非杂交探针分离,并在化学发光检测仪中进行测量。样本的检测结果通过计算与阴性对照进行比较得出结果。利用化学发光剂标记和检测核酸使得许多非放射性标记检测的灵敏度达到甚至超过了同位素标记测定。   在众多的化学发光体系中,应用最多的化学发光体主要有三类:增强鲁米诺发光体系、吖啶类化合物发光体系和碱性磷酸酶催化的1,2-二氧环己烷发光体系。吉林检验检疫局建立的化学发光技术使用吖啶酯标记核酸探针。   利用化学发光杂交保护分析的原理检测空肠弯曲菌、单核细胞增生性李斯特氏菌、大肠杆菌O157和金黄色葡萄球菌4种致病菌特异性RNA序列,这种方法无需物理分离,利用吖啶酯标记DNA探针,通过核酸杂交保护分析法,即应用人工合成的靶DNA保守区的寡核苷酸,在合成时引入一个烷氨基的手臂,经活化后接上吖啶酯,制成化学发光探针。   杂交后无需分离步骤,而是利用差分水解来鉴别,即加入碱性溶液,游离的发光探针遇碱水解失去发光特性,而与特异性目的片段结合的探针形成DNA-RNA杂交体,由于吖啶酯是平面结构很容易进入双螺旋的内部而获得杂交保护,水解速度缓慢(半衰期达10分钟以上),仍有发光性能,可以在发光仪上显示化学发光信号,从而实现对病原菌的检测。   应用前景广阔   该项目利用胶体金技术研制了胶体金检测试纸条,用于单核细胞增生性李斯特氏菌的快速检测,该检测试纸条的灵敏度高,具有很强的特异性,不同批次生产的免疫胶体金具有良好的检测重现性,稳定性好,操作简单,检测时间只需10至20min即可报告结果,胶体金法无污染,不会危害操作者以及环境。胶体金抗体复合物在冻干状态下室温储存相当稳定,有效期长 此外胶体金技术还具有检测迅速、灵敏、不需要复杂仪器设备、产品永不褪色等优点,适合于食品中单核细胞增生性李斯特氏菌的初筛检验。   吉林检验检疫局建立的基因探针化学发光检测方法可在30分钟内快速确定病原体,并可直接于固体或液体培养基上鉴定目标微生物。该方法可直接应用于国外生产的LEADER 50i检测仪上,仪器自动注入检测试剂,立刻测量标记物所产生化学反应的化学发光强度,并自动计算结果及打印报告,该检测方法敏感性高,特异性强,检测成本低,操作简便、快速,对我国食品安全快速检测和监控工作具有重要意义,具有广泛的推广前景。 胶体金快速检测试纸
  • 数字PCR首次被写入呼吸道病原检测专家共识
    成人呼吸道感染类型多样,不同感染类型及不同基础疾病患者病原谱各具特点,在临床常规诊疗过程中,应以患者临床症状体征为基础,联合应用影像学、传统微生物学、免疫学和分子生物学等检测技术,依据相应检测标准做出快速、精准诊断。分子生物学诊断技术在临床的应用目前仍有较多问题亟待解决,尤其是对临床结果的正确解读。不同检测技术所提供的结果具有不同临床意义,如何做到合理应用是所有相关临床医生和检测工作者共同思考的问题。于2023年8月在《协和医学杂志》最新发布的《成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识(2023)》参考国内外指南及文献, 分析了实时荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术、等温扩增技术、数字PCR技术、核酸即时检测技术和病原体高通量测序技术的临床应用场景、技术特点和性能验证要求,以及该类技术在成人急性上呼吸道感染、气管支气管炎、社区获得性肺炎、医院获得性肺炎/呼吸机相关肺炎、慢性阻塞性肺疾病急性加重、肺结核和免疫功能受损人群呼吸道感染中的应用,供临床借鉴参考。其中数字PCR作为新兴的核酸检测技术,第一次被写入呼吸道病原检测的专家共识中,为不同的应用场景提供了更多的选择。共识内容摘要一、不同核酸检测技术性能特征和应用场景的比较PCR:聚合酶链反应 TAT:检验结果回报时间。说明和补充: 数字PCR除了检出限远低于其它检测方法外,能够精准定量的优势让它还可以用来做疗效评估。此外,随着技术的发展,以新羿生物D50为代表的新机型能够实现高通量的检测,检测时间缩短到了1h左右。二、核心推荐意见PCR:聚合酶链反应;mNGS:宏基因组高通量测序。说明和补充: 相较于实时荧光PCR,数字PCR更适合多靶标呼吸道病原体核酸检测。随着数字PCR仪器自动化水平和检测通量的升级,它也可以用于门急诊,住院患者和大规模人群筛查。三、成人呼吸道感染病原体核酸检测技术应用建议PCR:聚合酶链反应;mNGS:宏基因组高通量测序;tNGS:多重病原靶向测序;BALF:支气管肺泡灌洗液;ESBL:超广谱β-内酰胺酶;HIV:人免疫缺陷病毒。说明和补充: 数字PCR可以实现对上表中各种感染类型病原体的检测,并且可以做到单个样本的检测数量更少、样本量要求更低以及对病原体的精准定量。总结分子诊断技术在呼吸道感染性疾病,尤其是全球应对新型冠状病毒大流行中发挥了重要作用,高灵敏度和高特异度的核酸扩增试验(nucleic acid amplification tests,NAATs)已成为诊断新冠病毒感染的参考标准。随着基因组学、工程学和纳米科学等前沿学科的交叉融合快速发展,NAATs 呈现出多种多样的检测方法和日新月异的技术手段,以PCR为基础发展出的实时荧光PCR、多重PCR、数字PCR和等温扩增技术,以及高通量测序、基因芯片、核酸质谱、生物传感器等检测技术,在大型实验室批量检测或现场核酸即时检测(point-of-care testing, POCT)中得以广泛应用。除呼吸道病毒外,一些系统还能检测细菌性肺炎的常见病原体及特定耐药基因。不同检测技术所提供的结果具有不同临床意义,联合应用可进一步提高病原学检测的灵敏度和特异度,更好的解释患者的病程发展并进行治疗监测。其中数字PCR以其灵敏度高(检出限 1copies/mL)、同时检测靶标较多(病原体数个~数十个)、用时短和定量准确等优点,被推荐用于“直接定量检测呼吸道标本中病原体个数,适用于低浓度样本、低丰度基因或突变基因的检测,和其他核酸检测方法的检测限标定”,以及对“造血干细胞及实体器官移植后患者 ”进行病毒(包括巨细胞病毒和其他呼吸道病毒)的定量、动态检测。应用场景包括“定量检测,疗效评估,环境检测,参考品或标准品定标”。
  • 借助Illumina测序平台,8人公司开启微生物检测新领域
    Trace Genomics公司称已获400万美元的种子投资,将开始启动第一项检测服务。其内容为对12种会导致莴苣、草莓等作物生病的土源性病原体进行检测分析。  Trace Genomics介绍  Trace Genomics公司是一家专门针对土壤微生物检测的公司,其最初的目标是服务加利福利亚州中央谷的种植者,但后面发现这些检测也能为更多的人所用。除了种植者,一些与种植者的工作相关的跨国企业集团,比如可口可乐,对公司的检测服务也非常感兴趣。  Trace Genomics公司使用Illumina公司的NGS技术,不过它真正的优势在于其在分子生物学,样本准备,定量以及生物信息学方面获得的专利技术,这些专利技术使得他们不仅仅是一个测序外包服务公司。  公司总部位于旧金山,目前有8名全职员工,但它正迅速成长。  检测项目介绍  第一批开展的检测包含12种病原体,这些病原体会导致莴苣和草莓患上疾病。目前该检测售价199美元,需要2到3周出检测结果。  目前,大部分的土壤检测实验室都是依赖基于培养法及PCR法去检测病原体。但是这要求必须成功培养这些病原体,但是很多病原体是无法成功培养的。而使用NGS的优势在于可以发现未知病原体以及同时检测多种病原体。  然而,土壤是一个非常富挑战性的检测物质,它含有太多的化学物质会抑制测序反应。因此,分离细胞以及基因组物质提取的技术显得非常重要。关于该技术,公司称,正在与相关学术机构合作验证,验证后会将成果发表。  虽然目前提供给客户的数据只针对这12种病原体。但是公司的目标是全球范围内价值40亿美元的农作物检测市场。测序除了针对一些已知的物种,其还具有广泛性的特征。公司对细菌的检测也不局限在那些病原菌上,同时那些对植物生长有益的菌株也在检测范围内。公司一直致力发展期分子生物学技术,为有益微生物的检测提供行之有效的方法。
  • DNA纳米球“携手”电子技术检测病原体
    瑞典卡罗林斯卡研究所科学家开发了一种使用DNA纳米球检测病原体的新方法,旨在简化核酸和病原体检测技术。这一最新研究有望催生一种低成本的检测方法,在不同情况下简单、快速地识别各种核酸。相关论文发表于最新一期《科学进展》杂志。新方法将分子生物学(DNA纳米球生成)和电子学(基于电阻抗的定量)相结合,产生了一种开创性的检测工具。为此,团队修改了一种名为环介导等温扩增技术(LAMP)的DNA扩增反应,如果样本中存在病原体,就会产生1—2微米的DNA纳米球。然后,这些纳米球被引导通过微小的通道,并在穿过两个电极时被识别出来。该系统紧凑高效,能在1小时内检测出多达10个目标分子,非常灵敏且快速。在新冠疫情期间,基于蛋白质的诊断方法被广泛采纳,但这些方法需要耗时开发高质量的抗体。相比之下,基于核酸的方法更容易开发,灵敏度更高且更灵活。这种检测方法有望加快新诊断试剂盒的推出。这些试剂盒将能大规模生产的电子产品与冻干试剂相结合,或成为一种廉价、可广泛部署和可扩展的检测方法。研究人员表示,快速准确地检测出遗传物质是诊断的关键,尤其在新型病原体出现时。目前,他们正在积极探索将这项技术整合到环境监测、食品安全、病毒和抗微生物耐药性检测等领域,并为其申请了专利。
  • 融智生物亮相2021年病原检测与传染病监测学术交流大会
    5月29-30日,2021年病原检测与传染病监测学术交流大会在山城重庆隆重启幕。本次会议由中华医学会杂志社、北京协和医学院群医学及公共卫生学院主办,数十位来自疾控、临床的专家分享了在病原检测方面的技术经验,吸引了300余专业观众到场。大会现场融智生物携手战略合作伙伴硕世诊断亮相此次大会,并展出了QuanID微生物质谱系统。目前,更新后的QuanID微生物质谱数据库拥有超过1800属、6600种、44000个菌株的微生物,独有的二级菌库可对基因型相近的难分辨微生物做出准确鉴定。展台另外在此次大会上,融智生物合作单位江西省疾病预防控制中心营养与食品安全所副所长刘道峰博士还进行了主题演讲,报告题目是《质谱技术在沙门氏菌检测与分型领域的应用》。江西省疾病预防控制中心营养与食品安全所副所长 刘道峰博士沙门氏菌是世界上食源性腹泻最常见的病原菌之一。全球每年估计发生13亿因沙门氏菌导致的急性肠胃炎病例,其中300万患者死亡。2016年起,沙门氏菌引起的食源性疾病病例数超过了诺如病毒,成为了我国食源性疾病的“头号元凶”。迄今为止世界上已鉴定出2500多个不同的沙门氏菌血清型,血清型的正确鉴定对确定人和动物沙门氏菌病的感染源和控制减少发病率具有重要意义。为此,许多国家和地区采取了众多措施以正确鉴定来自不同国家和地区、不同动物和外环境的沙门菌血清型。报告重点介绍了基于MALDI-TOF MS技术的“网鱼式”检测方法。该方法操作简单、鉴定速度快、鉴定概率高、结果准确,尤为适合医院、卫生防疫系统。沙门氏菌致病性、毒力、传播途径、耐药性在不同型别间有较大差异,因此,除沙门氏菌的检测外,沙门氏菌的致病菌分型是病原体溯源的关键环节。江西省疾病预防控制中心营养与食品安全所通过扩大采集范围,改变培养条件等,比对核糖体蛋白和非核糖体蛋白,寻找出某些血清型区别于其他沙门氏菌的特征蛋白进行建库,用于鉴定部分沙门氏菌血清型,完善沙门氏菌血清型质谱数据库。目前,共采集了285株不同血清型的沙门氏菌,经过血清型和测序验证,包含28种血清型;已成功鉴别至少三类沙门氏菌(肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌变种);已发现若干可以区分沙门氏菌血清型的核糖体蛋白特征峰。沙门氏菌数据库的建立得益于QuanID微生物质谱系统对每个靶孔都进行了大量Shots数的采集,保证了靶孔间质谱图的重复性,尤其是沙门氏菌不同血清型之间的差异更多的是来源于丰度很低的蛋白多肽,只有保证了质谱图的重复性以及对于低丰度蛋白的检测灵敏度才能够实现对于沙门氏菌血清型的鉴定。
  • 南京食源性病原微生物检测技术研讨会
    2012年11月14-16日,德国耶拿公司参加了第三届全国食源性病原微生物检测技术与实验室质量控制学术研讨会。此次研讨会在南京黄埔大酒店举行,出席会议的有各省检验检疫局及分支局、质监系统从事食品微生物学工作的科研技术人员和企业代表110余人。其中多名国内外专家就食源性病原微生物检测的新技术应用、食品安全的研究现状及发展趋势等议题进行了深入的交流与探讨。 作为会议赞助商之一的德国耶拿公司,针对本次研讨会特别带来了本公司最新推出的产品&mdash MobiLab 微生物现场快速检测系统,它是符合现场检测的理想产品。MobiLab是紧凑、一体化的便携箱内装备的移动实验室,从样品采集、核酸抽提、高速PCR扩增到检测结果显示,全部操作在同一系统平台上完成,将原本需要24-48h完成的病原微生物检测,缩短到1h即可完成。该仪器配有耐用电池及各种车载和常规充电器,保证在各种现场能完成检测工作。该仪器操作简便,无需特殊培训,可提供沙门氏菌、李斯特菌、大肠杆菌、流感病毒等多种常用的检测试剂盒,也可根据用户的要求定制检测试剂盒。在展台现场,各位专家和老师都对MobiLab有非常浓厚的兴趣。 展台现场 本次研讨会上德国耶拿公司生命科学部门的产品专员吴潇韫做了专题报告,主要介绍了微生物现场快速检测系统MobiLab的特点及应用。同时还介绍了德国耶拿公司的其他产品,我们可以为客户提供整套的生命科学解决方案,从样品处理、核酸提取、核酸定量、核酸扩增到功能基因组分析。 研讨会现场------吴潇韫做专题报告
  • 病原微生物检测车进驻震区 保障饮水安全
    8月11日,一名采集员(左)将采集的灾区水样送至检测车。 8月11日,工作人员在检测车内对采集的水样进行分析。 8月11日,一名工作人员走下在龙头山镇驻扎的病原微生物检测车。   8月10日,国家卫生应急队病原微生物检测车抵达鲁甸地震震中龙头山镇,开展卫生学检测,监控灾区饮用水安全。截至11日中午,已完成11份水质样本检测,为水源地消毒提供了可靠依据。
  • 守护食品安全,杭州大微提供高效病原菌检测方案
    夏秋季气温高、湿度大,加之近期长江流域进入梅雨季节,气候潮湿闷热,有利于肠道致病菌和霉菌的生长繁殖,若食物加工贮存不当、生熟交叉污染,或未完全加热,致病菌都在食物上大肆生长繁殖,不仅会造成食物变质,还会引起食物中毒。常见的食物中毒可分为四类:细菌性食物中毒、霉菌毒素与霉变食品中毒、化学性食物中毒与有毒动植物中毒。其中细菌性食物中毒是我国食物中毒事件的最主要原因。数据显示,2018年全国25个省通过突发公共卫生事件信息报告管理系统报告食物中毒事件共291起,中毒人数7856人,其中细菌性食物中毒事件107起,中毒人数4958人。在细菌性食物中毒中,常见的病原菌为沙门氏菌、副溶血性弧菌、蜡样芽孢杆菌、致泻大肠埃希菌等,其中我国近年来较为常见和高发的是沙门氏菌引起的食物中毒。在食品安全领域,国家颁布了多项法律法规文件,如《中华人民共和国食品安全法》、 GB 29921-2021《食品安全国家标准预包装食品致病菌限量》、GB 4789《食品安全国家标准 微生物检测方法》、卫生行业标准等,其中对病原菌具体的检测方法主要参照GB 4789食品安全国家标准。《WS/T 81-1996 副溶血性弧菌食物中毒诊断标准及处理原则》《GB 4789.7-2013 食品安全国家标准 食品微生物学检验 副溶血性弧菌检验》在对病原菌进行检测时多采用传统培养法,存在大量人工操作,费时费力。检测时间往往需要两天以上,而对食物中毒事件的处理需要快速、高效地完成,这让微生物检测领域的自动化设备成为一种更优选择。【杭州大微食物中毒快速检测】DW-ES800型 微生物实时检测系统DW-BT100型 快速微生物定量检测系统食物中毒检测流程【杭州大微食物中毒解决方案】第一步:样本采集DW-28系列 水中微生物膜过滤装置仪器是对“包含少量微生物污染”水样进行微生物检测的新一代仪器,用于食品、化妆品、环境监测等水中微生物质量控制。第二步:重量稀释DW-JURAY系列 微生物样品自动重量稀释仪仪器用于食品、药品、化妆品等含微生物样品的前处理自动稀释,仪器可自动计算并完成对任意重量样品的准确稀释,使工作简易化,提高效率。第三步:样品均质DW-4型 拍击式均质器仪器是微生物实验室进行“样品匀液”制备的最佳工具,可对样品进行均质处理,独有的静音设计可使您摆脱噪音困扰。第四步:螺旋接种DW-L2000型 全自动微生物平皿螺旋接种仪仪器是依据阿基米德螺旋,以递减比率自动接种样本,可实现标准化生成大量单颗菌落,方便后续菌落计数、分离纯化等需求,广泛用于食品、化妆品、药学实验等微生物实验室。第五步:培养DW-100A-K系列 智能厌氧微生物培养系统仪器服务于食品安全国家标准所需的厌氧菌和微需氧菌培养,可根据需要选择特定氧气浓度(1%-15%可选)和CO2浓度(5%-15%可选),能够快速生成环境,微需氧最快约2min,厌氧最快约4min,仪器稳定可靠,确保重现性100%。第六步:生化鉴定/药敏分析DW-M80型 自动微生物生化鉴定系统仪器通过生化反应原理捕获细菌生化表型特征,对微生物进行鉴定,可用于食源性致病菌的分离鉴定和耐药分析,可鉴定550种以上常见微生物,广泛运用于食品安全、市场监督管理部门、疾控等微生物实验室。【如何预防细菌性食物中毒?】养成良好的卫生习惯,用餐前应洗手,改变生食等不良饮食习惯。选用新鲜食材,对食物进行彻底清洁、加热熟透后才能食用。食物加工环节保持清洁,定期做好食具、加工工具以及容器的消毒。加工后的食物应尽快食用,或低温储存,并尽可能缩短储存时间,再次食用前应彻底加热。生熟食物应分开保存,防止交叉污染。
  • 相约重庆|2021年病原检测与传染病监测学术交流大会(PDIS)
    近些年来,类似新冠肺炎疫情(COVID-19)的突发传染病事件频繁发生。如2003年的“非典”(SARS)、2009年的甲型流感(H1N1)、2014年的埃博拉(EBOLA)、2015年的寨卡(ZIKA)等。自从《国际卫生条例(2005)》(IHR)颁布以来,世界卫生组织(WHO)已宣布包括COVID-19在内的共6次国际关注的突发公共卫生事件(Public Health Emergency of International Concern, PHEIC)。以上传染病的迅速传播给全国乃至全球造成公共卫生危机,严重威胁人类生命健康。加强病原体的鉴别筛查能力,完善传染病监测系统,是各种传染病防治的重要措施,对守护人类健康至关重要。天隆与您相约首届PDIS线上线下同步精彩2021年5月28日至31日,由中华医学会杂志社和北京协和医学院群医学及公共卫生学院共同主办的“2021年病原检测与传染病监测学术交流大会(PDIS)”在重庆融汇丽笙酒店举办。天隆科技作为基因检测、分子诊断行业的领军企业,届时将携带传染病检测整体解决方案参会,期待您莅临展位参观交流。值得一提的是,亮相本次展会的大体系高灵敏全自动核酸提取仪——GeneRotex 48,是天隆科技专为HPV、脑脊液等大体积样本或多样本混检而量身定制的最新方案,助力IVD行业各位“打工人”更快、更准、更便捷完成核酸提取。天隆科技推出的全自动样品处理系统——GeneMix 48也可以在本次展会上一睹芳容。GeneMix 48可一次实现48个采样管的开关盖、样品分杯、蛋白酶K/内参添加等功能。全程自动化,有效提高工作效率,将您从繁琐机械操作中解放出来,为医护健康创造新动力。同时,“天隆科技传染病分子诊断试剂家族”也将一起赴会。此外,此次会议线下线上将同步进行,通过扫描下方二维码即可参观天隆科技线上展厅,还可实时观看展会动态。
  • 病原微生物来袭,Are you ready? ——显微技术发展助力科学家对抗病毒
    传染病(Infectious Diseases)是由各种病原体引起的能在人与人、动物与动物或人与动物之间相互传播的一类疾病。中国目前的法定报告传染病分为甲、乙、丙3类,共40种。此外,还包括国家卫生计生委决定列入乙类、丙类传染病管理的其他传染病和按照甲类管理开展应急监测报告的其他传染病。新型冠状病毒肺炎虽然纳入乙类传染病,但仍采取甲类管理措施。 中国法定传染病分类类别病种甲类鼠疫、霍乱乙类新型冠状病毒肺炎、布鲁氏菌病、艾滋病、狂犬病、结核病、百日咳、炭疽、病毒性肝炎、革登热、新生儿破伤风、流行性乙型脑炎、人感染H7N9禽流感、血吸虫病、钩端螺旋体病、梅毒、淋病、猩红热、流行性脊髓膜炎、伤寒和副伤寒、疟疾、流行性出血热、麻疹、人感染高致病性禽流感、脊髓灰质炎、传染性非典型肺炎丙类感染性腹泻病、丝虫病、麻风病、黑热病、包虫病、流行性和地方斑疹伤寒、急性出血性结膜炎、风疹、流行性腮腺炎、流行性感冒、手足口病其他寨卡病毒、鼻疽和类鼻疽、人兽共患病、基孔肯亚热、广州管圆线虫病、阿米巴性痢疾、人猪重症链球菌感染、德国肠出血性大肠杆菌O104感染、美洲锥虫病、诺如病毒急性肠炎、鄂口线虫病、西尼罗病毒、马尔堡出血热、拉沙热、黄热病、裂谷热、埃博拉出血热、中东呼吸综合征、埃可病毒11型数据来源:中国疾病预防控制中心数据来源:中国疾病预防控制中心引起这些传染病的病原体中微生物占绝大多数,包括病毒、衣原体、立克次体、支原体、细菌、螺旋体和真菌,另外一小部分是寄生虫。历史上,病毒引发的疫情在全球各地造成了恐慌和浩劫。流感、天花、麻疹和黄热病的影响持续了几个世纪,给经济造成巨大负担。21世纪多起高致病性、高传染性的人兽共患病暴发,包括非典型肺炎病毒(SARS-CoV)、埃博拉病毒、中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)、尼帕病毒和年初爆发的2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)。 其中天花被认为是人类最具毁灭性的疾病之一。它在人群中的传播,可能是由动物宿主传播几千年之后,伴随着地区和大陆间的人口流动、贸易和战争才开始的。这种古老的疾病,至少可以追溯到公元前三世纪。从古至今,天花影响了过去社会的各个阶层,包括著名的顺治皇帝。自200多年前天花疫苗的研制,经过密集的疫苗接种后,该病在1980年被正式宣布消灭。 相似的,近期一项针对新冠病毒的系统发育分析在S蛋白进化角度显示,新冠病毒可能已经在人群中进化了至少7年。之前的研究证实,新冠病毒与蝙蝠冠状病毒(RaTG13)基因组相似度为96%,与穿山甲-CoV基因组相似度为90%。为了确定具体驱动其最近适应人类宿主的重要突变,研究人员重建了所有感染人类的病毒株的共同祖先Spike-RBD序列,称为N1,将与其最接近的动物病毒RaTG13的共同祖先标记为N0。N1与新冠参考序列中的Spike-RBD相同,而N0的Spike-RBD序列是唯一的,两者在4个位点上的变化将进化的新冠病毒Spike蛋白与和RaTG13的共同祖先区分开来,而这个祖先病毒至少在2013年就已经存在(其后代RaTG13在那一年被分离出来)。意外的是,N0变为N1降低了Spike-RBD与ACE2受体的亲和力,可是为什么最近才演变成重大公共卫生问题,这种潜在的流行又该如何被发现并预防?显微镜下观察到的病毒示意图目前条件下,对病毒暴发的长期控制需要使用疫苗,以提供免疫耐受和保护。流行病发生后,对特定疾病建立的免疫力可以限制传播并显著降低死亡率。过去,疫苗的接种大大减轻了世界各地传染病的负担,包括控制了脊髓灰质炎、破伤风、白喉和麻疹等疾病。大量的研究工作集中在改进已有疫苗和发现新疫苗,例如2006年的HPV疫苗。近年来,新冠病毒、寨卡病毒等严重感染的迅速蔓延突出了全球预防大流行病的迫切需求,这就需要极其迅速地研制和全面普及疫苗,以预防可能未知的病原体。并且抗生素耐药细菌的出现也需要新方法来预防感染。鉴于这些变化,确定新候选疫苗的现有方法已不足以保证大规模防护。 而治疗性抗体也在短期预防和被动免疫治疗中发挥出重要作用,通过中和病毒,杀伤感染细胞,调节免疫等机制达到治疗目的。其中,联合抗逆转录病毒疗法(cART)在控制HIV复制和传播方面的效果使其得到普遍推荐。 然而,快速治疗、高效预防、精准溯源等的研究,都需要以快速的鉴定并全面认识病原微生物为基石。 1884年,Robert Koch在肺结核研究中提出了科赫法则的雏形。同年,Friedrich Loffler将其发扬光大,写下了著名的分离、培养和接种三步法,作为确定病原体存在的条件。这一理论的本质是疾病本体论,即建立人类疾病动物模型具有实际意义。依据科赫法则鉴定传染病的病原体流程 100多年来,科赫法则一直指导着微生物学研究,以鉴定传染病的病原体,常常提供可靠的证据。后来这些法则被病毒学及分子医学方向的研究人员引用,将自己的研究与科赫的细菌学联系起来,演变为权威实践指南,证明微生物及后来的基因在疾病中的作用,是现代实验医学的起源。 20世纪随着显微技术的发展,人们开始对病毒形态学产生认识。30年代末电子显微镜的出现,标志着病毒学的另一项技术突破,其在病毒鉴别诊断、抗原的定位、病毒-宿主细胞互作以及病毒形态发生学的研究中扮演着重要角色,当然这些认识是以临床数据及光学显微镜和共聚焦显微镜为基础的。由于受到光学衍射的限制,普通显微镜分辨率只能达到200nm,而一般病毒的尺寸只有十几到200纳米(痘病毒达300nm),而电镜却以其高昂的价格让诸多病毒研究爱好者研究受限。超高分辨显微技术的出现,为观测精细结构提供了可能,因此在病毒研究中的应用越来越广泛。随着科学的进展,关于病毒的研究技术也不再仅限于传统的病毒分离与血清学,还包括后期出现的分子方法等等。超高分辨共聚焦显微镜广泛应用于现代病毒研究 时至今日,科学家对病毒研究热情不减。PebMed数据库中,病毒相关研究数量逐年走高,重点研究集中在疫苗、抗体、病毒作用机制等基础生命科学,同时包括临床诊断及流行病学研究等,但最大占比仍为病毒本身的研究。近日公布的国家自然科学基金数据显示,批复的新冠疫情专项课题共110项,总资金近亿元。国家对公共卫生服务与传染病防控投入逐年加大,热点研究背景有了宏观政策的加持,论文发表呈“井喷式”增长,研究结果不断推陈出新。数据来源:PebMed.gov(截止时间:2020年6月30日)写在最后的话:“如果有什么东西在未来几十年里可以杀掉上千万人,比较有可能是个高度传染的病毒,而不是战争。也不是导弹,而是微生物。一部分原因是我们在核威慑上投入了很大的精力和金钱,但在防止疫情的系统上却投资很少。我们还没有准备好预防下一场大疫情的发生。”——比尔盖茨 参考文献:1. http://www.chinacdc.cn/jkzt/crb/2. Medizinhist J . 2008 43(2):121-48.3. Volume 65, Issue 1, January 2018, Pages 6-74. Volume 42, April 2018, Pages 47-525. Microbiol Spectr. 2016 Aug 4(4)6. Viruses . 2020 Apr 20 12(4):4657. doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.22.1657878. https://courses.lumenlearning.com/9. https://www.leica-microsystems.com.cn/cn/applications/life-science/
  • Science:一滴血检测病毒感染史
    霍华德休斯医学研究所(HHMI)的研究人员开发了一项新的技术,使人们有可能通过一滴血来检测目前和曾经任何已知人类病毒的感染情况。这个方法称为VirScan,是一种有效的测试病毒感染的替代诊断方法。文章发表在最新一期的Science杂志上。   VirScan工作原理是筛查血液中存在的针对任何206种已知感染人类的病毒的抗体。我们的免疫系统在检测到病毒首次入侵的时候,会产生病原体特异性抗体,即使病毒感染清除后,它仍然可以继续生产那些抗体持续几年或几十年。所以说VirScan不仅能识别免疫系统正在积极应对的病毒感染,而且还提供了个人过去的感染史。      Elledge和他的同事合成了超过93000个病毒编码蛋白的DNA短片段。他们将这些DNA片段插入细菌感染病毒&mdash &mdash 噬菌体中。每个噬菌体生产相应的蛋白质肽单位,并会将肽表露在其表面外壳上。这些噬菌体将1000多种人类病毒中发现的所有蛋白质序列都表露了出来。血液中的抗体通过识别嵌在病毒表面抗原决定簇,找到病毒目标。为了执行VirScan分析,所有的被改造过表露一定肽的噬菌体被混合到血液样品中。血液中的病毒抗体发现并结合特定的病毒抗原决定簇上(这个抗原决定簇是在改造表达的肽结构内)。然后,科学家提取抗体,洗去除了少数结合在抗体上的噬菌体以外的其他物质。通过测序这些噬菌体的DNA,便可以识别哪些病毒肽片段能被血样中的抗体识别结合。这便告诉我们到底一个人的免疫系统以前遇到过那些病毒,无论是通过感染还是通过接种疫苗。 Elledge估计需要大约2-3天处理100个样本,假设在测序工作保持在最佳状态。   为了测试方法的可行性,研究人员使用它来分析从已知感染了病毒(特别包括HIV和丙肝)患者那得到的血样。事实证明,它的检测很准确。准确度保持在95%至100%,而且特异性灵敏&mdash &mdash 对于没有感染的个人,并未得到错误地识别。因此研究人员表示相信它的真实性。   Elledge和他的同事们用VirScan分析569个来自四个国家的个人的抗体,检查了大约1亿的潜在抗体/抗原决定簇的相互作用。他们发现,平均每个人有针对十个不同病毒的抗体。正如预期的,抗某些病毒更常见于成年人而非儿童,这表明孩子尚未暴露于这些病毒中。位于南非、秘鲁、泰国的个人,多半在美国的个人有抗更多病毒的抗体。研究人员还发现,艾滋病病毒感染者有比非HIV感染者存在更多的抗病毒抗体。   Elledge说,这个方法其实不限于对抗体的检测。他们正在用它来寻找那些攻击人体自身的组织并与癌症相关的某些自身免疫性疾病的抗体。类似的方法也可用于筛选其它类型的病原体抗体。   借助VirScan,科学家可以通过运行一个测试就能确定哪些病毒感染了个体,而不受限于必须对特定病毒进行分析。这种中立的方法可以有助于发现影响个体健康的意外因素,同时也增加了分析比较大量人口病毒感染情况的可能。这个全面的病毒分析大约耗费25美元/每血样。
  • 新加坡研发病毒检测芯片可快速检验上万种病原体
    据新加坡媒体日前报道,新加坡研究人员研发出一种病毒检测芯片,可一次性快速检验上万种病原体。   据介绍,这种病毒检测芯片由新加坡基因组研究所的研究团队研制,通过快速分析病患DNA样本,可在24小时内详细检测出患者感染何种病毒或细菌。   研究人员表示,这种检测芯片可以一次性检测高达7万种病毒和细菌等病原体,其中包括最新出现的H7N9禽流感病毒。   相比之下,传统的病毒或细菌测试方法,一般针对某一种特定的病原体进行测试,难以同时检测多种病原体。   研究人员说,这种新的检测手段可以尽快明确病因,减少确诊时间,并且成本也不高。目前这种病毒检测芯片还只用于实验用途,研究人员希望该芯片通过相关部门批准后尽快投入市场。
  • 饲料中主要病原微生物快速检测方法 -微生物快速检测系统(MBS)
    1. 饲料中主要病原微生物快速检测方法-微生物快速检测系统(MBS) 1.1 中文名称 饲料中主要病原微生物快速检测方法-微生物快速检测系统 1.2 英文名称 Rapid detection method of main pathogenic microorganisms in feed-Micro Biology Survey (MBS) 2.范围 本标准规定了饲料中细菌总数、沙门氏菌、大肠菌群、金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、 单核增生李斯特菌微生物快速检测系统(MBS)检测方法。 本标准适用于配合饲料(蛋鸡配合饲料、肉鸡配合饲料、猪配合饲料、肉鸭配合饲料)、 动物源性饲料(血粉、肉骨粉、鱼粉、羽毛粉、乳清粉)、植物源性饲料(玉米、麸皮、豆 粕、花生粕、棉籽粕)中细菌总数、沙门氏菌、大肠菌群、金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、 单核增生李斯特菌含量的快速检测。 3.规范性引用文件 下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期 的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括 所有的修改单)适用于本文件。 GB 19489 实验室 生物安全通用要求 4 原理 MBS 方法通过氧化还原指示剂测量微生物主要代谢途径中氧化还原酶的催化活动。氧 化还原指示剂会根据介质的氧化状态改变指示剂颜色。颜色变化耗时与微生物污染程度的 Log 值呈负相关关系,从而可获得观察到的酶活性与检测样本中活细胞的数量之间存在的确 定相关性。 微生物快速检测试剂瓶内的营养物,维持目标细菌的生长;选择性药剂,抑制非目标细菌的 生长;而其中的还原剂,作为递氢体,能在细胞色素 C 后把电子转移到细菌呼吸链,而又不被氧分子氧化。如果目标细菌存在,那么检测瓶中的氧化还原反应色素会根据媒质的 氧化还原状态改变颜色。MBS 主机通过三光波探测颜色变化,最后根据整合颜色变化 的时间确定细菌的含量。5 试剂和材料 除另有规定外,试剂为分析纯或生化试剂。 5.1 20%无菌甘油:水:甘油=5:1。 5.2 微生物快速检测试剂瓶。 6 仪器和设备 6.1 微生物快速检测系统(MBS):MBS-MR 主机、笔记本电脑、MBS 中文操作软件和微 生物快速检测试剂瓶。 6.2 冰箱:2-5℃或-20℃。 6.3 涡旋振荡器。 6.4 电子分析天平:感量 0.01g。 7 检验 7.1 饲料中细菌总数的检验 7.1.1 将 MBS-MR 主机、笔记本电脑接通电源,并用数据线将两者连接,在电脑上启动 MBS 中文操作软件,点击“参数”录入相关信息(包括:操作员姓名、操作员职务、检测样 本所属客户等信息);在软件操作界面的样品设置选项中对样品进行基本信息设置,在分析 设置选项中设置细菌总数,并选择定量分析。 7.1.2 将配套 20%无菌甘油加入到细菌总数试剂瓶中,溶解试剂。 7.1.3 带好无菌手套,用消毒后的药匙或无菌镊子取待测饲料样品,并准确称取 1g(精确 到 0.01g),加入到细菌总数试剂瓶中。 7.1.4 摇动试剂瓶(手摇 1-2 分钟或涡旋振荡器振荡 20-30 秒),直到饲料样品溶解完全或 与试剂充分混合。 7.1.5 设置相应的参数后,将处理好的试剂瓶放入 MBS-MR 主机中,进行孵育,MBS-MR 主机会自动控温,然后开始进行分析。 7.1.6 分析完成后,按下试剂瓶顶部,瓶盖内部的消毒灭菌物质会释放至试剂瓶内,5-10 分钟即可充分灭菌,将灭菌后的试剂瓶丢弃到生物垃圾箱中集中处理。 7.1.7 检测结束后,系统可以输出检验报告,报告的内容包括用户设定的全部信息、检测结 果,如变色时间、样本中微生物的浓度和检测中的所有参数。 7.2 饲料中沙门氏菌的检验7.2.1 在 7.1.1 中的分析设置选项中设置沙门氏菌,并选择定量分析,其他步骤同 7.1.1—7.1.7。7.3 饲料中大肠菌群的检验7.3.1 在 7.1.1 中的分析设置选项中设置大肠菌群,并选择定量分析,其他步骤同 7.1.1—7.1.7。7.4 饲料中金黄色葡萄球菌的检验7.4.1 在 7.1.1 中的分析设置选项中设置金黄色葡萄球菌,并选择定量分析,其他步骤同7.1.1—7.1.7。7.5 饲料中大肠埃希菌的检验7.5.1 在 7.1.1 中的分析设置选项中设置大肠埃希菌,并选择定量分析,其他步骤同7.1.1—7.1.7。7.6 饲料中单核增生李斯特菌的检验7.6.1 在 7.1.1 中的分析设置选项中设置单核增生李斯特菌,并选择定量分析,其他步骤同7.1.1—7.1.7。8 结果记录微生物快速检测系统(MBS)自动给出定量分析检测报告,读取数据,记录结果。9 质量控制本方法在 1-108cfu/ml(g)添加浓度水平上的回收率为 87.19%-97.66%(n≥10),变异系数为 7.18%-10.28%(n≥10)。附录 A 微生物快速检测(MBS)孵育温度/检测时间快查表
  • 【干货】数字PCR用于病原微生物检测那些你不可不知的优势
    图源:网络侵删病原体(pathogens)是指可造成人或动植物感染疾病的微生物(包括细菌、病毒、立克次氏体、真菌)、寄生虫或其他媒介(微生物重组体包括杂交体或突变体)。(来源:百度百科)传统的病原体检测金标准方法是“涂片镜检法+分离培养法”,但这种方法耗时长,细菌培养一般需要1-3天,真菌培养一般需要1-3周,对于发病较快结核杆菌等则需要1个月,同时还存在镜检和分离培养等方法还不易对相关病原体进行分型检测的问题,特别是临床上对于急性感染疾病一般无法用这种方法在就诊前获得检测结果。图源:网络侵删随着技术的发展,陆续出现了分子诊断技术、免疫学检测方法和化学法检测等病原体检测手段,目前使用最多的是分子诊断技术。第三代PCR技术-数字PCR,作为分子诊断领域的佼佼者,在病原体核酸检测方面彰显出巨大优势:1、摆脱病原微生物检测对标准品的依赖病毒等微生物的载量对于阐释疾病病程,后续治疗及疗效评估是至关重要的, qPCR技术的最大瓶颈在于需要依赖标准曲线,而且扩增效率的差异会直接导致实验室内或者不同实验室之间的荧光定量PCR检测结果的偏差。数字PCR基于单分子层面的检测可以摆脱对标准品的依赖,且不受PCR抑制物的影响,尤其是在缺乏标准品的检测项目中,数字PCR可用于直接定量病原微生物的拷贝数。2、灵敏度高在病原微生物的检测方面,数字PCR利用其灵敏度高的特点,对各种样品中的病原微生物展开广泛的研究,可以用于早期诊断和用药的低拷贝病毒的监控。如人类免疫缺陷病毒(HIV)抗逆转录病毒治疗过程中病毒残留的监控;抗甲氧西林金黄色葡萄球菌的感染监控。(详细内容见文末相关文章链接)3、大大缩短报告周期使用数字PCR检测临床标本无需经过病原微生物培养过程,大大缩短了报告周期,使快速检测潜在的病原微生物成为可能,且利于从大量不同的背景核酸中检出病原微生物,对于感染性疾病的诊断和控制意义重大,有助于及时减少患者服用无效药物的数量,及早采用其他备用药物。naica® 微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司naica® 微滴芯片数字PCR系统,源于Crystal微滴芯片数字PCR技术,自动化微滴生成和扩增,每个样本孔可实现6荧光通道的检测,智能化识别微滴并进行质控,3小时内即可获得至少6个靶标基因的绝对拷贝数浓度,融合传统微滴式和芯片式优势,被称为下一代数字PCR技术。深蓝云病原体分子生物学检测解决方案naica® 数字PCR 10x Mix和5x Mix为您的多重检测体系提供更大上样空间,现货供应,欢迎订购。订购信息:naica® PCR Mix也可订购。
  • 呼吸道病原体快速检测企业英诺特登陆科创板
    7月28日,英诺特生物科创板IPO上市,股票代码688253,发行价26.06元/股,开盘后市值一度超46亿元。英诺特是一家专注于 POCT 快速诊断产品研发、生产和销售的高科技生物医药企业,公司紧紧扎根 POCT 快速检测领域,以呼吸道病原体检测和多种病原体联合检测为特色,以急门诊,尤其是儿童急门诊检测作为切入点,致力于打造中国呼吸道病原体快速联合检测领导品牌。1)政策加码 POCT市场快速扩张近年来,国家加大了对国内体外诊断企业的扶持力度,出台了《“十三五”生物产业发展规划》《国家突发急性传染病防治“十三五”规划(2016-2020 年)》等多项鼓励政策以推动行业发展。随着分级诊疗的推进及医疗资源下沉,我国即时检测(下称“POCT”)行业快速发展。根据统计,我国POCT市场规模从2015年的43亿元增长至2019年的112亿元,年复合增长率达到27.04%。未来预计将继续以超过20%的增速增长,到2024年,行业规模将达到290亿元。作为POCT行业的细分领域,我国呼吸道病原体检测市场也保持快速增长态势。近年来,在分级诊疗体系不断推进、检测范围扩大、早诊早治趋势凸显等因素驱动下,我国呼吸道病原体检测试剂市场规模由2013年的1.78亿元增长至2019年的12.97亿元,复合增长率达到39.24%;我国呼吸道病原体检测试剂需求量由2013年的875万人份增长至2019年的4942万人份,复合增长率达到33.45%。2)深耕研发 拥有多个国内独家品种近年来,英诺特深耕快检产品的研发销售,同时也逐步提升研发投入。截至报告期末,公司拥有研发人员 75 名,占员工总数的19.43%。2020年初新型冠状病毒肺炎疫情发生后,公司快速响应,开展对新冠病毒检测产品的研发攻关,在短时间内克服多个技术难题,并于 2020 年 2 月 22 日通过国家药监局应急通道审批,获得国内首批新型冠状病毒 IgM/IgG 抗体检测试剂盒注册证,并随后参与了 3 项新型冠状病毒抗体检测试,剂盒国家标准的制定,后续陆续取得了包括 FDA 的 EUA 授权在内的多个海外市场准入许可,支援全球抗疫,是唯一一家被中共中央、国务院、中央军委授予“全国抗击新冠肺炎疫情先进集体”的体外诊断试剂生产商。另外,对呼吸道病原体感染的临床症状和体征较为相似但治疗方法截然不同的特点,英诺特重点发展呼吸道病原体联合检测产品,掌握多种联检技术,拥有多个国内独家品种,通过一个产品、一次检测快速准确地鉴别多种病原体,帮助医生尽早确定治疗方法和用药方案。针对呼吸道疾病在儿童中更为高发,且更易造成严重并发症的特点,公司将儿童急门诊作为呼吸道病原体检测产品的切入点。报告期内,公司以全血呼吸道五联检测卡、流感病毒三联检测卡、病毒血清五联检测卡、呼吸道病原体九联间接免疫荧光试剂盒等多个独家联检产品为代表的呼吸道病原体检测产品成功进入了包括首都医科大学附属北京儿童医院、首都儿科研究所附属儿童医院、复旦大学附属儿科医院等在内的众多区域性重点儿童医院,并获得其认可。经过多年发展,英诺特现已构建起了免疫层析平台、间接免疫荧光平台、液相免疫平台、核酸分子检测平台、基因重组蛋白工程平台以及细胞和病原体培养平台 6 大技术平台,基于技术平台进行专业分工提升研发的广度和深度。 公司同时开展多个在研项目,与现有产品形成了良好的互补,为公司未来新产品的持续推出、产品结构的优化提供保障。截至本招股意向书签署日,公司取得了16 项发明专利,拥有 71 项医疗器械产品注册/备案证,其中三类医疗器械注册证 56 项。未来,公司将以客户应用场景需求为中心,不断对标国际一流企业,实现产品线的丰富与覆盖。公司计划依托在呼吸道特别是儿科领域建立的市场网络优势,切入肠道疾病检测领域、过敏检测领域,夯实公司在儿科领域的优势地位。
  • 科研人员研发出4套基于CRISPR/Cas系统的病原体核酸检测工具
    近日,中国农业科学院作物科学研究所作物分子育种技术和应用创新团队鉴定了RfxCas13d靶向RNA引发“反式切割”活性的基本特征,研制出基于RfxCas13d、LwaCas13a、LbCas12a与AsCas12a的多套核酸检测工具,并研发出田间实时可视化灵敏定性定量检测方法,为动植物病原体检测提供了高效、低成本的开发途径,具有广阔的技术开发场景与应用价值。相关研究结果在线发表在《中国科学:生命科学(Science China-Life Sciences)》上。 据谢传晓研究员介绍,植物真菌性病害、细菌性病害及病毒性病害严重危害作物生产与品质安全,如禾谷镰孢菌和拟轮枝镰孢菌是玉米穗粒腐、茎腐病、小麦赤霉病的罪魁祸首;水稻黑条矮缩病毒则通过灰飞虱在水稻、小麦和玉米宿主之间迁移传播,严重威胁水稻、小麦和玉米生产。建立快速、准确、灵敏及便携的病原体诊断技术,可为病害的早期预警与绿色防控提供重要依据。   针对以上植物病害病原体,团队成员研制了多套基于CRISPR-Cas12a和CRISPR-Cas13系统“反式切割”活性的病原体核酸诊断技术。通过优化样本处理方法,可实现田间实际样本粗提物稀释液的灵敏检测,且可利用小型手持式荧光仪或试纸条进行田间现场定性读取结果。此外,以禾谷镰孢与拟轮枝镰孢菌复合侵染为样本,建立了基于Cas12/Cas13联合应用的复合检测,实现了一个检测能诊断判读多种病原,进一步拓展了检测工具的应用场景与潜力。此外,该系列检测方法还可应用于食品安全质量检验、动植物检疫、转基因检测、动植物群体的基因分型与基因表达检测等,具有重要的应用价值。   该研究得到国家自然科学基金和中国农科院科技创新工程等项目资助。
  • 烟台市疾控中心微生物检验科:“医”线坚守,尽忠职守,检验检测一锤定音
    在疾控战线上,有这样一群人,他们不是公共卫生医师,却是公卫医师的亲密战友和坚强后盾,在重大疫情处置中“一锤定音”,他们就是烟台市疾控中心微生物检验科的专业技术人员。多年来,微生物检验科承担着全市卫生监测、传染病防控以及突发公共卫生事件应急处置等检验检测任务,他们不断强化实验室能力建设,食源性疾病、新发突发传染病和不明原因疾病的检测能力持续提升,为疾病防控与疫情处置提供了最科学可靠的保障。科室2021年荣获“烟台市建功立业标兵岗”荣誉称号,多人先后荣获省市“先进工作者”“山东省三八红旗手”“烟台市五一劳动奖章”“烟台好医生”等荣誉称号。日常监测,做守护百姓健康生活的“火眼金睛”近年来,随着我国经济的快速发展,人民群众对生活质量有了更高的要求,“吃的食物健不健康”“喝的水卫不卫生”,这些都是大家关注的热门话题,也是微生物检验科的重点工作之一。“我们每周都会制定工作计划,对不同种类的食品开展采样检测,如群众日常消费量大的肉蛋奶、蔬菜水果等都在我们的检测范围内。”微检科负责食品安全风险监测工作的刘文娟介绍说。同时,他们还定期对全市的生活饮用水,包括来自各个自来水厂的出厂水和居民家中的末梢水,开展卫生状况检测。他们每年开展食品、水质等卫生检测样品都在1500份以上,检测结果为政府部门决策提供了科学依据。疫情当前,做保护群众生命健康的白衣卫士疫情就是命令,检验人就是冲锋在前、白衣执甲的战士。在流感、手足口、出血热、发热伴、病毒性肝炎、猪链球菌感染等疫情处置中,微生物检验科都出色完成了各项检测任务,充分发挥了实验室检测“一锤定音”的关键作用。2020年初始,新冠疫情突如其来,微生物检验科再次成为了“没有硝烟的战场”,他们是全市最早直面病毒的一拨人,也是离病毒最近的人。身穿防护服、全程佩戴防护面屏、N95口罩和橡胶手套,这是他们的标准装备,在这样密不透风的防护下和精神高度集中的状态下,他们在实验室内要连续工作四五个小时以上,出来后稍事休整,下一批任务又开始了……“我们的手机都是24小时开机,必须保持电话畅通。对我们来说,加班加点是常事,这对每个人的体力和心理都是极大的考验。不过,好在我们都挺过来了。”微生物检验科负责核酸检测和基因测序的孙振璐说。新冠疫情以来,他们累计完成疑似阳性标本复核4000余份、开展基因测序600余例,为全市疫情的快速处置和精准溯源提供了有力保障。提升能力,确保关键时刻“拉得出、冲得上、打得赢”作为专业的检测科室,要保证快速完成检测任务、准确出具检测数据,微生物检验科深知这其中的关键在于检测能力的不断提升。2021年,利用新冠疫情间隙,微检科组织市、县两级疾控中心50余名检测技术骨干,赴山东大学公卫学院开展实验室检测能力提升现场培训。2022年,组织开展了全市核酸检测技能竞赛,进一步规范提升核酸检测人员操作技能。2023年,组织编写下发了烟台市食源性疾病微生物检测技术手册,通过现场演示、带教、实操等方式对各区市疾控检测人员分期开展现场操作技能培训。“把功夫用在平时,在完成各项常规检测任务的同时,坚持不懈的抓好能力提升,才能确保关键时刻能够又快又好地完成任务,让人民群众放心。”微生物检验科负责人田云龙很有信心地表示。经过多年的不懈努力,微生物检验科建立起了一支技术过硬、充满活力的检测队伍,拥有博士1人、硕士17人,高级职称10人,具备了霍乱、细菌性痢疾、伤寒/副伤寒、猩红热、流感、手足口、病毒性腹泻等多种病原体的分离、分型和鉴定能力,能够通过基因测序、微流体多病原检测、多重病原PCR检测和微生物质谱鉴定等多种技术手段实现对各种新发突发传染病和食源性疾病的快速检验检测。微生物检验科将继续以人民健康为中心,高标定位,苦练内功,用实际行动诠释“预防为主人民至上忠诚担当守护健康”的烟台疾控精神,筑牢守护港城人民健康的坚强壁垒。
  • 邀请函 | 深蓝云与您相约2021年病原检测与传染病监测学术交流大会
    数字PCR技术(Digital PCR)作为新一代核酸分子绝对定量技术。相较于qPCR,数字PCR可直接数出含有DNA分子的微分区的个数,通过泊松分布算法对起始样品进行绝对定量。具有灵敏度高、精确度高、对抑制物的耐受度高等优势。在感染性疾病中病原体检测和传染病预防监测中,数字PCR技术可针对病原微生物核酸拷贝数直接定量,从而实现灵敏、精准、快速、特异性地鉴定和分型,同时实现难培养和不能培养的病原微生物的快速检测。基于naica® 微滴芯片数字PCR系统深蓝云提供全自动封闭式的三色和六色荧光通道高灵敏数字PCR检测病原体解决方案,无需标准品和标准曲线,只需一步上样,将PCR反应体系分成~30000个纳升级单层平铺的微滴阵列,实现核酸的单分子扩增,通过泊松分布获得核酸的拷贝数,是真正的绝对定量检测方法,具备高灵敏度、高精准度、高分辨力、高耐受力等技术特征。在保持高特异、快速检测的同时,实现全自动化、全封闭,确保环境和样本安全。同时深蓝云提供病原体数字PCR检测试剂,快速、特异、高灵敏地区分感染何种病原体,有助于病原体的早期鉴定,降低误诊、漏诊的发生概率,提供自动质控和原始结果可视化回溯功能,排除假阳性结果,同时由于不同病原体的治疗方案不同,同样有助于患者的临床治疗和地方流行性传播的预防。工作流程:北京深蓝云生物科技有限公司将携带相关产品亮相在此次会议,我们将在17号展位恭候您的参观咨询。深蓝云展台产品展示naica® 下一代数字PCR平台naica® 全自动微滴芯片数字PCR系统,以Sapphire芯片(全自动)或Opal(高通量)芯片为耗材,形成由25,000-30,000个微滴组成的单层二维阵列,该单层微滴阵列形成后直接进行PCR扩增实验。反应完成后对微滴进行三通道成像,从而对起始核酸浓度进行绝对定量。仅需2.5小时即可获取结果。▲ naica® 微滴芯片数字PCR系统Echo正倒置一体显微镜Echo正倒置一体显微镜兼具正置和倒置显微镜的功能,方便小巧,一机多能,可以非常便利地通过旋转实现正倒置配置的切换;无传统目镜设计,拥有明场,相衬,荧光,偏光等观察方式,可兼容活细胞观察,病理切片,免疫组化,免疫荧光,荧光原位杂交等。▲ Echo正倒置一体显微镜Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统来自于美国Azure Biosystems公司,配备高品质温度模块,采用光纤和CMOS的检测系统,高能LED的激发,提供高灵敏和可靠的数据。▲ Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统
  • 真迈生物与诺禾致源联合开展FASTASeq 300 病原检测能力测试
    11月28日,我们发布了第三款基因测序产品FASTASeq 300,FASTASeq 300极简灵活、极速交付的特点能够很好地满足病原微生物的检测需求。近期,我们与诺禾致源联合开展了FASTASeq 300病原微生物检测性能的测评工作,测评结果显示,FASTASeq300表现优异,其单Lane单样、Pooling上样两种模式和GenoLab M在致病菌检测结果上一致性达100%。本次联合测评,诺禾致源选用了8种不同类型的临床样本来制备宏基因组文库,制备的文库分别在GenoLab M和FASTASeq 300上进行SE50测序。FASTASeq 300四流道芯片支持灵活的分Lane加载样本,因此,基于FASTASeq 300开展“单Lane单样本(FASTASeq 300 0 index)测序”和“Pooling 混样(FASTASeq 300 8+8 Dual index)测序”。以上三种测试方式共产生27份下机数据,均由诺禾致源进行分析评估。测评结果FASTASeq 300 & GenoLab M 样本微生物组成与相对丰度结果在测试样本中挑选微生物含量较高且组成较丰富的4例临床样本进行微生物组成展示(相对丰度TOP 10),GenoLabM和FASTASeq300单Lane单样/Pooling上样测序方式检出的TOP10微生物物种组成和丰度分布一致性高。图1. 肺泡灌洗液(S1550)样本不同测序方式检测结果图2. 肺泡灌洗液(S1553)样本不同测序方式检测结果图3. 尿液(S1555)样本不同测序方式检测结果图4. 手术组织(S1556)样本不同测序方式检测结果左右滑动查看更多测评结果致病微生物判读结果GenoLab M和FASTASeq 300单Lane单样/Pooling上样测序方式的致病菌检测结果一致性达100%。图5. 不同测序方式下的样本致病菌检测结果(RPM)* 为了使物种检出数据在不同平台、不同样本间具有可比性,基于RPM(Reads per million mapped reads)对下机数据进行均一化处理。FASTASeq 300具有极简灵活、极速交付的特点,用户可根据检测场景需求灵活调整测序策略。本次联合测评验证了FASTASeq 300的极速测序和稳定的致病菌检出能力。FASTASeq 300将为病原检测应用提供强有力的国产平台支撑。基于多年在测序技术上的探索与创新积累,真迈生物完成多款基因测序系统的研发制造和商业化。未来,真迈生物将一如既往地秉承以用户为中心,与合作伙伴共同推动测序技术在基因检测领域的应用,进一步实现基因检测全流程国产化,为科研用户及临床工作者提供更便捷、更灵活、更精准的核心工具。
  • 生物梅里埃GENE-UP:食品病原微生物检测“利器”
    p   在如今快速发展的食品市场中,产品的安全是最重要的。为了保护客户安全,需要一种快速、简单的方法来检测病原微生物。在IAFP2016会议上,生物梅里埃重点展示了的食品微生物解决方案——GENE-UP。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201608/insimg/469deae9-b6b9-4e81-b584-3d1a94f1ac87.jpg" title=" gene-up-interactive-sheet-iafp_副本.jpg" / /p p   GENE-UP于2015年11月4日在法国由生物梅里埃推出。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201608/insimg/bbddb2e8-c1f0-43b2-beb2-a46c064d6fea.jpg" title=" gene-up.png" / /p p   这款产品以PCR技术为基础,用于病原微生物的检测(细菌及病毒)。这款产品使食品、原材料及生产环境中的微生物控制成为可能。产品首先在美国销售,计划2016年上半年在欧洲、拉丁美洲及亚洲推出。 /p p   GENE-UP由生物梅里及美国BioFire联合开发。美国BioFire以PCR分析生物学系统而知名,并在2014年1月由生物梅里埃收购。这个创新的解决方案大大简化了实验室工作流程,可提高生产力,并可控制样品间污染的风险。GENE-UP易于使用,拥有灵活的系统,实验室主管和生产团队可远程获得试验结果,加速产品放行。 /p p   GENE-UP可检测食物链中大多数常见病原微生物,如沙门氏菌、O157:H7型大肠杆菌及李斯特菌。目前此名单还在继续扩大测试,以满足食品行业的各种特定需求。其中用于检测沙门氏菌和O157:H7型大肠杆菌的方法已经通过AOAC-RI认证(NO.061504和NO.061505),它在许多国家(包括美国)被认为是技术性能优秀的表现。 /p p   IAFP是国际食品保护协会每年都会举办的会议,为与会者提供当前最新的食品安全、科学技术及创新解决方案的相关信息。每年在北美不同地点举行,此会议多年来已成为全球领先的食品安全会议。IAFP2016于2016年7月31日至8月3日在美国圣路易斯密苏里州举办。 /p p br/ /p
  • 新型酵母生物传感器有望高效检测病原真菌
    “生物传感器的广泛开发与应用,主要归功于生物元件对于其敏感的分析物具有很强的特异性,不会识别其他分析物。利用生物传感器,可以快速、实时获得有关分析物准确可靠的信息。”袁吉锋说。合成生物学的发展推动了细胞生物传感器的开发。这种生物传感器以活细胞为生物元件,基于活细胞受体检测细胞内外的微环境状况和生理参数的变化,并通过两者之间的相互作用产生细胞信号转导,进一步激活不同的信号输出模块,从而产生不同的信号。袁吉锋介绍,从本质上讲,其他类型的生物传感器使用的是从生物中提取出的生物元件。而基于活细胞的细胞生物传感器是一种独特的生物传感器,它可以通过模拟细胞正常的生理生化变化来检测信号。目前,这种生物传感器已成为医疗诊断、环境分析、食品质量控制、化学制药工业和药物检测领域的新兴工具。“用于构建细胞生物传感器的生物元件包括细菌细胞、真菌细胞以及哺乳动物细胞。我们这次所构建的工程化酵母生物传感器,正是基于酿酒酵母细胞所构建的真菌细胞传感器。”袁吉锋说,酿酒酵母细胞用于生物传感器的构建,在细胞性能上具有优势。作为一种真核生物,酿酒酵母细胞与哺乳动物细胞的大多数细胞特征和分子机制一致,特别是与感知和响应环境刺激密切相关的GPCR信号通路具有极高的相似性;酿酒酵母是酵母物种中第一个基因组已完全测序的真核生物,并且遗传修饰工具非常完备;酿酒酵母的培养条件简易、培养成本低、生长速度快、温度耐受范围宽,可以通过冷冻或脱水等方式进行储存和运输,具有生物安全性。可进一步设计改造成检测试纸基于工程化酵母细胞构建生物传感器多年来一直是研究热点。袁吉锋团队此次通过人工转录因子,将GPCR信号通路与高效基因转录模块——半乳糖调控模块进行耦合,在酵母生物传感器中引入了一个额外的正反馈回路,以此来增强酵母生物传感器的灵敏度和信号输出强度。袁吉锋解释说:“我们相当于设计了一种正反馈放大器,让酿酒酵母细胞中GPCR在识别到白色念珠菌的信息素信号之后,不仅能通过人工转录因子激活下游信号报告模块的表达,同时还能驱动半乳糖调控模块自身的转录因子Gal4表达。两个转录因子协同作用,就能持续激活和放大报告基因的输出信号。”数据显示,相比于初始传感器的性能,改造后的酵母生物传感器的检测限提升了4000倍,激活浓度提升了9700倍,信号输出强度提升了近3倍,尤其是信号输出的持续时间得到了明显提升。初始传感器在检测使用2小时后就出现荧光信号的衰退,而改造后的传感器在使用12小时后仍可产生明显的荧光信号。“此次构建的酵母生物传感器,可以设计成一种简单、低成本的检测试纸,用于检测医疗样本或环境样本中的病原真菌。”袁吉锋介绍,只需将试纸浸入待检测液体样本中,即可实现对该样本快速灵敏和可视化的检测。
  • 核酸质谱快速检测新型冠状病毒变异株
    新型冠状病毒肺炎(Coronavirusdisease2019,COVID-2019)是由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒(SARS-CoV-2)所引起的高传染性病毒疾病,对世界人口造成了灾难性影响,导致全球380多万人死亡,成为继1918年流感大流行以来影响最大的全球卫生危机。 新冠病毒不断变异的RNA病毒 作为单链结构的RNA病毒,新型冠状病毒的一大特点就是极其容易变异。随着感染人数的增加和疫情的持续,新型冠状病毒不断进化和变异,陆续产生多种新冠病毒变异株。世界卫生组织(WHO)根据新冠病毒变异株的传播力、致病力等将其分为VOCs(Variant of concern)和VOIs(Variant of interest)。新冠病毒VOCs的分类 新冠病毒VOIs的分类 目前市场对新冠病毒筛查主要采用荧光 PCR 方法,该方法检测灵敏度高,但成本也相对较高,并且单机通量小,容易被污染,制约了大规模病毒检测速度,对当前不同变异毒株区分荧光PCR方法存在一定难度。随着病毒感染多元化和疫情防控常态化的推进,市场急需一种更快速、准确、高通量的检测方法,用于满足大样本量的检测、基层的日常防控筛查,以及不同变异株的区分。 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)主要用于分析包括蛋白质及核酸在内的生物大分子,该技术应用于核酸检测具有高通量、高灵敏、高准确率的特点。其主要工作原理是结合延伸分析法和碱基特异裂解分析法,将扩增后的核酸产物通过离子源使样品离子化,产生不同质荷比的离子,再经过质量分析器测定该样品中不同种类离子的分子量,按照从小到大的顺序依次排列从而得到一幅质量图谱,并根据检测项目不同给出相应的检测报告。该技术在遗传病筛查、肿瘤变异检测、甲基化检测、用药指导、病原体检测及功能医学健康管理等多个领域的应用日益深入,已经成为精准医学不可或缺的分子诊断技术。MALDI-TOF MS检测新型冠状病毒方法为通过特定引物扩增目标基因片段,再通过靶向位点探针特异性单碱基延伸,然后通过质谱技术检测延伸位点的碱基,判断病毒种类和变异类型。该方法灵敏度高、操作简单、成本低廉、人员需求低、通量高,可实现6小时384样本出报告,以后每1小时出384份样品报告。新冠病毒流行初期,Autof ms1000系统建立了完成病毒检测检测体系,对病毒毒株进行了精准检测(图3)。随着研究深入,Autof ms1000检测核酸的体系也日渐成熟,针对当前多变异毒株情况,研究人员通过合理设计扩增引物和探针,可实现单个样品,单芯片位点检测,一次区分当前所有可认知的新冠病毒变异株。随着疫情斗争的持续进行,病毒变异也不断发生,后续可能出现更多更复杂的病毒变异株,MALDI-TOF MS技术基于其检测原理,在大样本多病毒变异株检测方面的优势将日渐突出。随着人们对该技术的认知度的日渐加深,未来该技术在核酸检测方向的应用将出现更多的思路和方法,MALDI-TOF MS在临床应用领域中将会发挥更大的作用。
  • 甘肃:紧急采购100万元病原微生物检测设备在舟曲使用
    中国疾病预防控制中心紧急调运的食品卫生、水质以及霍乱等传染病快速检测设备和甘肃省紧急采购的100万元人民币的病原微生物检测设备,已全部于今天抵达灾区并投入使用,有效保障了灾区食品、饮水和病原微生物的检测工作。   国家卫生部今晚披露这一信息时称,目前正在灾区的该部副部长尹力提出:要严防传染病暴发流行和突发公共卫生事件发生,必须持续做好灾区公共卫生风险评估,结合实际情况不断完善卫生防疫工作方案,重点加强传染病预防控制、食品饮水卫生保障和病媒生物防制,科学开展环境消杀灭工作。   甘肃省卫生厅已组织成立督查组,对灾区分成23个片区开展了消杀灭工作的检查指导,确保消杀工作科学规范、不留死角。根据灾区传染病疫情防控需要,已设立3个疫苗接种点开展预防接种,于昨天启动6岁以下儿童甲肝疫苗应急接种 。卫生部防疫专家组对灾区4个大量积水地的蚊幼虫进行了采样检测,并根据检测评估结果提出了蚊虫控制措施建议,指导灾区卫生部门做好病媒生物防制工作。   截至8月17日16时,累计救治伤员2321人,现住院治疗72人,治愈出院50人,医疗队和门诊治疗2198人。灾区医疗服务点累计诊治病人5067人次。灾区累计开展心理援助1530人次,消杀灭面积238.25万平方米,消毒水源121点次,检测食品和饮用水175份,监督检查餐饮单位40家。灾区无重大传染病疫情和突发公共卫生事件报告。
  • 中疾控应急联合演练圆满成功!齐碳纳米孔测序助力野外检测和移动快速部署
    据中国疾病预防控制中心官网消息,近日,“2023 年中国疾控中心与内蒙古自治区综合疾控中心卫生应急联合演练”在内蒙古鄂尔多斯市圆满完成。图1:中国疾控中心11台卫生应急车辆行驶在开往内蒙古的途中此次演练由中国疾控中心、内蒙古自治区综合疾控中心共同组织,有关单位(部门)卫生应急队员,以及西藏自治区、宁夏回族自治区、新疆维吾尔自治区疾控中心卫生应急队员共 260 余人参加。本次活动旨在通过演练,探索并完善移动式高等级生物安全实验室开展自然疫源性传染病野外监测、现场病原快速筛查、基因测序和分析研判等的工作模式和基本条件,为野外传染病生态学调查和突发急性传染病处置队伍开展实地检测工作积累经验。 图2:中国疾控中心李群副主任在开幕式上致辞,并宣布联合演练活动开始为期一周的应急演练中,齐碳科技自主研发的桌面式纳米孔基因测序仪QNome-3841hex因其小巧便携、无需凑样、灵活快速的优势,承担了此次演练中基因测序和数据分析环节的主要任务,助力疾控专家们顺利完成野外传染病生态学调查、未知病原的快速检测和宏基因组测序等演练工作,实现了针对自然疫源性传染病病原菌的现场快速筛查和野外监测调查,为野外自然疫源性传染病病原菌防控提供科学依据。图3:现场采样演练期间,QNome测序平台无论是在1000公里的长途运转颠簸中,还是从华北平原到内蒙古高原的地理环境条件改变下依旧保持稳定的运行状态。应急演练队员完成野外采样处理后,立即在驻地移动测序车内开展宏基因组测序检测和分析工作,不仅大大节省了时间,也有效避免样品长途运输可能带来的生物安全问题,充分展现了齐碳纳米孔测序平台在野外环境下高效稳定工作的潜力。图4-5应急演练队员在移动测序车内开展现场样本检测与宏基因组测序野外病原学调查可以及时发现潜在的人畜共患病病原菌及其流行情况,为公卫专家提供科学决策依据,在其造成大规模危害之前,提前干预、将损失降至最低。将宏基因组测序和病原鉴定发现建立在野外现场:目前野外监测工作中,面临着监测点固定、监测覆盖面小、样本采集后需要运输、检测时间长、且仅对特定病原体进行检测、检测病原种类不全面不灵活的问题。疾控移动实验室监测专家团队搭建CLOSS模型,解决了上述难点。图6-7CLOSS模型野外采样、基因组测序及病原检测流程[1]CLOSS为Co-Localization of Sampling and Sequencing的缩写,CLOSS模型由中疾控移动实验室监测专家团队提出,是指在开展野外环境病原体检测中,利用移动测序车在现场点完成采样和测序工作,并且是通过高通量宏基因组测序技术,在野外就地对野生动物携带病原体进行检测,通过移动实验室的转移开展多点连续监测,从而扩大监测面,能够对多种病原体及其环境分布情况进行调查。CLOSS模型通过建立移动实验室,可以实现流动监测,在采样地直接开始检测,节省时间,避免样品运输带来的生物安全问题,扩大监测覆盖度;且在移动监测中开展高通量宏基因组测序,可以实行病原一网打尽式的检测,突破目前检测中仅针对固定病原检测、缺乏多病原筛查和整体数据的限制。此次应急演练在去年的CLOSS模型基础上引入齐碳科技纳米孔基因测序平台,将高等级生物安全实验室基因测序技术拓展至最新一代,推动了CLOSS模型的进一步发展与完善。未来,不断完善的CLOSS模型计划整合进国家致病菌识别网,在多个网络节点(也就是多地野外环境中)实现对野外病原菌流行情况的实时监测和调查,可做为致病菌识别网监测中深入野外的灵活触角,是对疫情监测多点触发的有效补充。此次卫生应急联合演练圆满完成,齐碳QNome测序平台在执行野外病原体检测任务中积累的宝贵实践经验,将有助于不断完善基于齐碳纳米孔测序平台的疫病防控应急处理方案,并将成为病原微生物溯源和监测预警的有力工具。【参考文献】:1.Xin Lu, Yao Peng, Yuanyuan Geng, Hongqun Zhao, Xiaona Shen, Dongmei Li, Zhenpeng Li, Liang Lu, Mengguang Fan, Wenbin Xu, Jin Wang, Lianxu Xia, Zhongbing Zhang, Biao Kan. Co-Localization of Sampling and Sequencing for Zoonotic Pathogen Identification in the Field Monitoring Using Mobile Laboratories[J]. China CDC Weekly, 2022, 4(12): 259-263. doi: 10.46234/ccdcw2022.059
  • 破解家禽的“生病密码”提高检验检测仪器技术创新
    2014年山东省鸡肉产量386.14万吨,居全国第一位,是山东省畜牧业中的支柱产业。但这两年,肉鸡产业遭受产能过剩、消费萎靡双重挤压,种禽企业、养殖场户、加工企业、产品市场等多个环节均陷入低迷,损失惨重。山东的肉鸭、蛋鸡产业占据全国第一、第二的位置,但也面临同样境遇。  拯救三大产业,是解决产业背后的千万就业人口的饭碗问题,也是扶正畜牧业大省的支柱产业问题。2015年底,宋敏训主持的山东省农科院科技创新重点项目“家禽重大疾病防控关键技术研究”取得突破性进展,让全社会看到了科学家在破解家禽“生病密码”方面的努力和贡献:  传统方法检测、确诊复杂的禽流感病症,需要有资质的实验室7—14天才能得出结果,团队的发明专利将检测时间缩短到2—3小时;现代养殖环境在变,“适者生存”的病毒越来越顽强,宋敏训团队通过病毒的全基因组序列测定分析,从“根”上找到了治“毒”的方法;一头连着专家、成果、市场,另一头连着千千万万养殖户、企业,宋敏训团队建立的“山东省家禽专业信息服务系统”笼络了与家禽业相关的重要人和事,打通了治家禽病、成果转化的“最后一公里”,实现了近100%的成果转化率。  结合现代科技,快速确诊疑难杂症  宋敏训研究团队针对家禽多种传染病,研制了鉴别禽流感病毒、新城疫野外感染病毒与弱毒疫苗株、马立克氏病毒、传染性贫血病毒、鸭新型呼肠孤病毒、1型和3型鸭肝炎病毒等十多种禽源病毒的核酸检测试剂,在短短数小时内就能对家禽传染病进行确诊,为控制家禽传染病的发生和传播赢得了时间。  近几年,禽流感是一种人人谈之色变的传染病。这种病毒的复杂性在于病毒血清亚型很多,病毒极易发生变异,导致现有疫苗免疫抗体无法识别,病毒迅速繁殖开来。团队成员黄兵博士告诉记者,禽流感病毒概念中的H和N都是指病毒的糖蛋白(蛋白质),一种糖蛋白叫血凝素(HA),另一种叫神经氨酸酶(NA)这两种糖蛋白容易发生变异,因此,根据糖蛋白的抗原特性,目前HA有16个型别,NA有10个型别,H和N的排列组合可产生几百种亚型的禽流感病毒。在家禽中常见报道的多为H9和H5亚型禽流感。然而,当前家禽中出现的几种亚型病毒又可划分为多个簇群分支,因此它们的检测必需依赖于现代的科技手段。检测诊断时间越快,将越早“斩断”病毒传播的途径。将传统的检测时间从7—14天缩短为2—3小时,这是2015年,该所申请的三项国家发明专利的核心之一。  破译病毒遗传密码,为疫病防控提供依据  对肉鸭来说,长了“大舌头”可不是好事。舌头长,上下喙短,舌头“被迫”长长的露在外面,这是近年来发病率极高的一种流行疑难疾病,它的直接后果是因无法进食、饮水而死亡。  “新的疫情发生,需要先确认其病原是由病毒还是细菌引起的;是普通病还是传染病;如果是传染病,就要找到传染源;如果发现新的病原,就需要找到快速、特异性的诊断方法和针对性的疫苗或药物进行有效防治”宋敏训说,但要找到这种“致命病症”的源头却并非易事。好在他们发现疫情后,短期内就捕捉到了“鸭细小病毒”这个罪魁祸首,并推荐了有效的预防和控制措施,及时避免了养殖户的重大损失。  相关的研究成就还有很多,例如该研究团队在国内外首次完成了鸭肠炎病毒的全基因组序列测定,揭示了鸭肠炎病毒基因组结构符合α -疱疹病毒亚科水痘病毒属的特征;在山东省鸭群中首次分离到鸭甲肝病毒3新毒株,并完成其全基因组测序。这些研究成果为禽病的防控奠定了重要的生物信息基础。  家禽信息互联互通,搭建家禽健康养殖的重要桥梁  研究团队基于计算机技术、网络通讯技术和物联网技术,建立“山东省家禽产业专业信息服务系统”,研建了家禽公众信息的自动采集、审核与分类发布技术,市场行情、供求信息等注册用户在线发布技术,开发了技术咨询与服务系统、家禽生产信息异地远程监控系统、家禽生产智能决策系统以及我国家禽品种资源查询系统、山东省种禽企业信息检索系统及自助管理系统。这些系统均填补了国内外空白。系统上线没几年,便实现了数十万的点击量。它的价值在于连接专家、成果与养殖户、企业,把家禽业相关的专家和问题放到这一平台上“同心聚力”去解决生产中出现的问题。  对公益性科研院所来说,科技成果“藏在深闺无人识”为人所诟病,但手握一大把专利成果的家禽所却实现了近100%的成果转化率。  怎么打疫苗既省事又能产生足够的免疫抗体,这里面蕴含着大学问。这支团队一直重视研发“一针治多病”的疫苗,先后研制出“鸡新城疫、传染性支气管炎、减蛋综合征三联灭活疫苗”、“禽流感、鸡新城疫、传染性支气管炎、减蛋综合征四联灭活疫苗”,不但获得了国家新兽药证书,同时节省了人力、物力,避免了反复免疫对家禽造成的应激反应。  拯救“水深火热”的家禽产业,科学家任重而道远。但对山东省农业科学院家禽研究所和宋敏训团队来说,他们在正确的道路上正稳扎稳打,这是最重要的。
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