病毒载量检测

#本文由马尔文帕纳科应用专家冯慧庆供稿# 基因治疗是生物制药行业中一个快速增长的领域，通过基因治疗可实现疾病的治疗或预防。其中，重组腺相关病毒(rAAV)是目前基因治疗领域研究较多的一类病毒载体。腺相关病毒（adeno-associated virus, AAV）是微小病毒科（Parvoviridae）家族的成员之一，一般，研究中采用的重组腺相关病毒载体（Recombination adeno-associated virus, rAAV）是在非致病的野生型AAV基础上改造而成的基因载体，由于其种类多样、免疫原性极低、安全性高、宿主细胞范围广、扩散能力强、体内表达基因时间长等，rAAV被视为最有前途的基因研究和基因治疗载体之一。目前，rAAV的准确定量分析和表征的难度是阻碍基因治疗快速发展的关键因素。我们常常需要对rAAV进行综合全面表征，比如衣壳数量、实心率、颗粒尺寸、聚集体比例等。传统情况，rAAV滴度和病毒载量采用ELISA、ddPCR、AUC和EM等技术进行测量。但这些方法通常费时费力，而且精确度不高。本文通过GPC/SEC和多角度动态光散射（MADLS）两种分析技术分析rAAV5样品，展示了快速、准确和可靠地定量测量AAV的病毒滴度（AAV Titer）和实心率(% full AAV)的方法。 01仪器参数OMNISEC GPC/SEC多检测器系统非常适合于生物医药行业，可用于全面表征rAAV样品。OMNISEC包含一个示差折光检测器(RI)，紫外线全波长阵列检测器(UV-Vis 190-900 nm)和光散射检测器，仅需一次进样，可精确测量绝对分子量、聚集体比例、病毒滴度和实心率。与传统HPLC不同，测量过程不依赖柱保留体积，也不需要一系列标样进行色谱柱校正。图1显示了使用OMNISEC测量的CQA关键质量参数。02检测方法我们采用Empty和Full rAAV5两个样品作为分析案例。Full rAAV5 载有已知分子量为785 kg/mol的PFB-GFP ssDNA。经qPCR和ELISA测量方式可知，该样本的病毒滴度为2.5x1013。采用色谱柱P4000和P3000串联，对rAAV样品的进行色谱分离。由OMNISEC软件采集分析测试结果，其中硬件系统包含OMNISEC RESOLVE(包含泵、自动进样器和柱温箱)和OMNISEC REVEAL（包含示差、UV/PDA和直角90°/小角7°光散射检测器）。样品经过分离洗脱后，使用共聚物分析方法确定样品两种不同组分的浓度和分子量。计算方法如下：其中，ConcCapsid是衣壳浓度(mg/mL)，NA是阿伏伽德罗数，Mwcapsid是衣壳的分子量(g/mol)，ConcDNA是DNA浓度(mg/mL)，MwSeqDNA是来自序列的ssDNA的分子量。因此，通过计算出的颗粒浓度，可以很容易地得出样品实心率的百分比。 03检测结果案例一：图2显示了Empty rAAV5的三检测色谱图。RI信号由红色曲线表示，260 nm紫外信号由紫色曲线表示，直角光散射(RALS)信号由绿色曲线表示。样品包含四个部分：单体峰保留体积(RV)在12.5ml，碎片在16ml ，二聚体在10.5ml ，聚集体在8.5ml 。使用共聚物分析方法，可以得到表1结果。单体的分子量为3.84×106g/mol。衣壳的理论分子量为3.8×106g/mol，证实分析结果与预期相符。MW/Mn为分子量分布，描述了样品的分散性，单体和二聚体的值接近1，而聚集体和片段均显着高于1，表明在同一峰内有多个不同分子量的组分。Fraction of Sample表示样品组分百分含量，单体所占百分比为84.7%。Fraction of Protein显示了样品中衣壳的百分比，单体包含99.8%的衣壳。这证实了样本确实是Empty rAAV5。最后Empty rAAV5样品总滴度为5.91x1013Vp/ml。 案例二：第二个样品Full rAAV5的三检测器色谱图如图3所示。图中显示了与Empty rAAV5截然不同的色谱峰。分析色谱图可以看出，只包含两个不同的组分，其中单体峰，大概12.5ml RV处，包含Full 和Empty rAAV5的混合物，而聚集体出现在8ml RV处。测试结果见表2。对于主体的单体峰，计算出其混合物分子量为4.49×106g/mol，其中86%为衣壳。rAAV5的蛋白质组分的分子量为3.89×106g/mol，这与表1中Empty rAAV5 的数据一致。单体是总体的93.2%，样本的总滴度为7.48x1013VP/ml。其中单体包含78% Full rAAV5，22% Empty rAAV5。需要注意的是，这种分析方法假设样品要么是Full ，要么是Empty ，忽略部分装载或过度装载情况。Zetasizer Ultra纳米粒度及电位仪可以使用MADLS方式快速确定病毒滴度。从OMNISEC获得的数据与Zetasizer Ultra的粒子滴度进行了比较，两种技术之间有很好的相关性，见图4。另外，本文将Full rAAV5和Empty rAAV5以确定比例混合，来对Full rAAV5样品进行分析。表3显示了每个样品的预期值和实际值Full rAAV百分比。图5显示了期望值和实际值之间有很强的相关性，证实了OMNISEC确定样品实心率结果的可靠性。为了进一步评估OMNISEC对rAAV样品准确表征能力，我们进行了rAAV5样品的热应力稳定性研究，同时，基于ZS Ultra对聚集体的极高灵敏度，我们利用了ZS Ultra表征rAAV5聚集体的微小变化。测试条件是将rAAV5样品置于25oC到80oC之间进行测试。在不断加热过程中，在每个温度下测量rAAV5样品的粒径。在25oC和35oC之间，没有观察到粒径的变化。从35oC开始，可以观察到粒径开始增大，这表明样品开始发生变化(图6A)。30oC和45oC下的数据比较清楚地显示了这些样品之间的大小差异(图6B)。我们选择45oC条件，对OMNISEC进行进一步稳定性研究。将rAAV5样品在稳定在45oC，分别在2min 、5min、10min和15min后，取样品到OMNISEC上测试。图7色谱叠加图显示样品发生了明显的变化，聚集体百分含量增加，单体浓度含量降低。表4显示MW在此潜伏期内保持稳定，单体峰中的AAV百分比也保持稳定。结论：在这项研究中，我们展示了OMNISEC和Zetasizer Ultra在综合分析表征rAAV5样品的能力，以及将两者联合使用的应用价值。 OMNISEC多检测SEC系统将示差折光检测器、紫外全波长检测器、光散射检测器集成一体化设计，具有更高的灵敏度和准确度，通过一次进样分析，可提供各种血清型AAV样品的绝对分子量、衣壳大小、滴度、实心率、聚集体、片段和样品稳定性等关键质量属性。虽然这些参数中很多都可以使用传统的生物化学方法来确定，但OMNISEC提供了更为简单、可靠的方法，正逐渐成为一种表征分析AAV通用的技术工具。

COVID-19大流行中断了对艾滋病病毒感染者的常规护理，严重影响了对艾滋病病毒感染者的诊断和治疗。如果感染SARS-CoV-2, 艾滋病病毒感染者的发病率和死亡率会增加。据报道，近日在南非发现新冠新型变异毒株Omicron可能由艾滋患者体内进化而来。因此密切监测HIV血浆病毒载量（VL）并筛查SARS-COV-2感染就显得尤为迫切。近日，来自华盛顿大学的Gaurav K Gulati和Nuttada Panpradist等科学家在medRxiv平台上提交文章《Inexpensive workflow for simultaneous monitoring of HIV viral load and detection of SARS-CoV-2 infection》的预印本。通过开发一种新的工作流程，同时定量艾滋病毒载量和检测SARS-CoV-2。文中使用naica微滴芯片数字PCR系统对RNA浓度进行精准定量，用于新方案的评估。文章中作者基于Boom方法开发了一种内部RNA提取方法，从血浆、鼻腔分泌物（NS）或二者混合物中进行RNA提取，对HIV长末端重复序列（LTR） 、SARS-CoV-2核衣壳基因区域（N1、N2）和人类核糖核酸酶 P(RP)进行RT-qPCR分析，估计血浆病毒载量并对HIV/SARS-CoV-2状态进行分类（HIV为病毒学失败或抑制，SARS-CoV-2为阳性、假定阳性、阴性或不确定）。首先，作者将包含HIV LTR检测扩增区域或N1/N2检测的DNA片段作为RNA生成的起始DNA构建体。使用 T7 RNA聚合酶将DNA构建体转化为RNA。为了对体外转录的RNA浓度进行精准定量，作者使用naica微滴芯片数字PCR系统对RNA浓度进行绝对定量（图1）。从图中可以看出通过检测OD值并不能对RNA浓度进行精准定量，因此最终利用数字PCR的结果对RNA的浓度进行了校正。图1:数字PCR量化体外转录的RNA标准浓度随后将合成的不同浓度的HIV RNA与血浆样本进行混合构成人造血浆样本，合成的不同浓度的SARS-CoV-2 RNA与NS进行混合构成人造NS样本，分别采用内部提取方法和标准提取方法对血浆样本中HIV、NS样本中SARS-CoV-2和血浆和NS混合样本中HIV和SARS-CoV-2进行灵敏度检测。同时采用133个临床样本，其中40个血浆样本（30个HIV血清阳性），67个NS样本（31个SARS-CoV-2阳性）和26个血浆和NS混合样本（26个HIV阳性，10个SARS-CoV-2阳性）进行评价（图2）。结果表明：内部提取对HIV的检测限为200拷贝/mL，对SARS-CoV-2的检测限为100拷贝/mL。对于血浆样本，两种方法测量的HIV病毒载量水平呈正相关（人造样本的R2：0.98, 临床样本R2: 0.81）。在对NS样本使用内部提取方法时，排除不确定结果，与标准提取方法相比，95%的一致性（25个阳性，6个假定阳性和31个阴性）。对于血浆和NS混合样本，两种方法测量的HIV病毒载量水平呈正相关（人造样本的R2：0.98, 临床样本R2: 0.71）。SARS-CoV-2检测结果显示阳性和阴性分类是100%一致性。图2：使用两种不同提取方法从血浆和NS混合样本中共同提取的RNA中获得的HIV LTR 和SARS-CoV-2 Cq值的比较.（a）比较标准与内部提取方法性能的实验设计方案。（b）来自内部提取方法的SARS-CoV-2 LTR、N1、N2和人 RP （阴性样本的对照）测定的Cq值。（c）基于两种提取方法的结果对样本进行分类。通过两种方法提取的样本中测得的（d）LTR、（e）N1和（f）N2的散点图。综上所述，作者开发的内部提取方法可以从单独的血浆或血浆和NS混合样本提取RNA来确定艾滋病病毒感染者是否存在SARS-CoV-2感染，从而有可能简化HIV管理和SARS-CoV-2检测。将这两种病毒的检测结合起来可以有效的减少COVID-19对艾滋病毒治疗的影响。medRxiv是由耶鲁大学（Yale University）、非营利研究和教育机构冷泉港实验室(The Cold Spring Harbor Laboratory，CSHL)和BMJ出版集团（英国医学会下属专业医学出版机构，British Medical Journal）创建的，服务器由CSHL拥有和操作。medRxiv为研究人员在期刊出版前分享、评论和接收有关其工作的反馈提供了一个平台。medRxiv旨在提高科学发现的开放性和可及性，加强研究人员之间的协作，记录想法的来源，并通过更及时地报告已完成的研究，为正在进行和计划的研究提供信息。原文：https://doi.org/10.1101/2021.08.18.21256786naica六通道微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司naica六通道微滴芯片数字PCR系统，源于Crystal微滴芯片式数字PCR技术，自动化微滴生成和扩增，每个样本孔可实现6荧光通道的检测，智能化识别微滴并进行质控，3小时内即可获得至少6个靶标基因的绝对拷贝数浓度。

一、项目基本情况项目编号：XJHY-JKZX-BDSJ-01项目名称：新疆维吾尔自治区疾控中心艾滋病检测试剂-病毒载量检测试剂项目采购方式：公开招标预算金额（元）：7934400最高限价（元）：/采购需求： 标项名称:新疆维吾尔自治区疾控中心艾滋病检测试剂-病毒载量检测试剂项目 数量:1 预算金额（元）:7934400 简要规格描述或项目基本概况介绍、用途：采购病毒载量检测试剂一批,具体详见采购文件。 备注：合同履约期限：标项 1，具体详见采购文件。本项目（否）接受联合体投标。二、获取招标文件时间：2024年02月22日至2024年02月29日，每天上午00:00至12:00，下午12:00至23:59（北京时间，法定节假日除外）地点：政采云平台线上方式：供应商登录政采云平台https://www.zcygov.cn/在线申请获取采购文件（进入“项目采购”应用，在获取采购文件菜单中选择项目，申请获取采购文件）售价（元）：0三、对本次采购提出询问，请按以下方式联系1.采购人信息名 称：新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心地 址：碱泉一街380号联系方式：0991-26230102.采购代理机构信息名 称：新疆华域建设工程项目管理咨询有限公司地 址：乌鲁木齐市五星北路194号联系方式：18899517090、176909709993.项目联系方式项目联系人：张伟、杨猛、马成武电 话：18899517090、17690970999

一、项目基本情况项目编号：XJHY-JKZX-BDSJ-01-2项目名称：新疆维吾尔自治区疾控中心艾滋病检测试剂-病毒载量检测试剂项目（二次）采购方式：公开招标预算金额（元）：7934400最高限价（元）：/采购需求： 标项名称:新疆维吾尔自治区疾控中心艾滋病检测试剂-病毒载量检测试剂项目（二次） 数量:1 预算金额（元）:7934400 简要规格描述或项目基本概况介绍、用途：采购病毒载量检测试剂一批,具体详见采购文件。 备注：合同履约期限：标项 1，具体详见采购文件。本项目（否）接受联合体投标。二、获取招标文件时间：2024年03月14日至2024年03月21日，每天上午00:00至12:00，下午12:00至23:59（北京时间，法定节假日除外）地点：政采云平台线上方式：供应商登录政采云平台https://www.zcygov.cn/在线申请获取采购文件（进入“项目采购”应用，在获取采购文件菜单中选择项目，申请获取采购文件）售价（元）：0三、对本次采购提出询问，请按以下方式联系1.采购人信息名 称：新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心地 址：碱泉一街380号联系方式：0991-26230102.采购代理机构信息名 称：新疆华域建设工程项目管理咨询有限公司地 址：乌鲁木齐市五星北路194号联系方式：18899517090 176909709993.项目联系方式项目联系人：杨猛 马成武电 话：18899517090 17690970999

2021年4月13日，深蓝云Gene-π数字PCR学堂——数字PCR病毒载量精准检测工具（北京站）在国家疾控中心成功举办。为更好的服务于用户，本次培训班以理论结合实践的形式，聚焦数字PCR原理系统、实验操作、结果分析，病毒载量精准检测等核心内容，受到了用户的一致好评。数字PCR技术的诞生和发展为核酸精准定量和核酸检测提供了全新的思路。无需标准品和标准曲线，可提供比qPCR更精准的核酸定量，直接读取阳性信号，通过泊松分布校正得到目标基因的绝对拷贝数，并具有高灵敏度、高精确度等特点。本次训练营对第三代数字PCR技术及naica® ️微滴芯片式数字PCR技术介绍、naica® ️数字PCR核酸绝对定量技术中的病原体检测应用、病毒载体绝对拷贝浓度数字PCR检测实验设计、特别是一步法数字PCR新冠病毒检测试剂盒的使用和结果判读等方面进行了详细介绍，同时进行实操。▲ 专家在进行精彩的分享▲ 实验操作作为数字PCR头部企业技术开创者的法国Stilla Technologies公司于2019年提出数字PCR在线学习资源中心——www.gene-pi.com，为使用和即将使用数字PCR技术的专家学者提供有效的途径，同时开展Gene-π数字PCR线下实操培训课堂，为用户提供完善的服务以及优化的应用解决方案。naica® 微滴芯片式数字PCR系统naica® 微滴芯片式数字PCR系统，以Sapphire芯片（全自动）或Opal（高通量）芯片为耗材，形成25,000-30,000个微滴的2D阵列，以单层平铺方式进行PCR扩增实验。反应完成后对微滴进行三色通道或六色通道检测，从而对起始核酸浓度进行绝对定量。2.5小时内，可快速获得结果。数字PCR学堂为了方便大家更好的学习数字PCR相关知识，我们为大家提供了Gene-π数字PCR学堂（www.cycloudbio.com数字PCR学堂快速入口），您可以选择感兴趣的应用教程，其中包含从实验设计到数据分析的详细工作流程。您还可以通过搜索导航工具直接搜索特定的项目（"dPCR的DNA准备"，"荧光溢出"等），或点击我们的"HOW TO" 选择您需要的部分（设计、分析、报告）。

2023年3月，美国威尔康奈尔医学院的研究人员在Cell 期刊上发表" HIV-1 remission and possible cure in a woman after haplo-cord blood transplant "的论文。研究显示，一名混血女性艾滋病患者在接受干细胞移植37个月后，停止了抗艾滋病毒治疗，之后她的体内连续18个月没有检测到HIV-1。根据伯乐生命科学公众号发文表示，在接受 CCR5Δ32/Δ32 单倍相合脐带移植(脐带血细胞结合成人单倍干细胞)治疗急性髓系白血病(AML)后，经 ddPCR 确认血液中 HIV 载量极低不可检出，艾滋病可能得到了治愈。该患者成为继“柏林病人”、“伦敦病人”、“杜塞尔多夫病人”之后，第四例经发表的艾滋病治愈病例，被称为“纽约病人”。同时，也是全球首次成功治疗的女性艾滋病患者。此前，有两名男子通过 CCR5 Δ 32 纯合子突变异体成体干细胞移植治愈了艾滋（注：作者投稿时为 2 名男子治愈者，现为 3 名）。但是，CCR5Δ32 纯合子突变在人群中十分罕见，这严重限制了干细胞移植治愈 HIV 的可行性。Hsu Jingmei 团队将 CCR5Δ32/Δ32 脐带血细胞结合病人亲属的干细胞进行移植，同时解决 CCR5 Δ 32 纯合突变和 HLA 配型的难题，使患者的肿瘤和艾滋病都得到了缓解，目前缓解已持续 4.8 年。移植后 37 个月，患者停止服用抗艾滋病病毒药物（ATI），停药后超过 18 个月，病人血液中仍然没有出现 HIV-1 载量反弹。Hsu Jingmei 团队曾在2021年开发了基于 Bio-Rad QX200 平台的 ddPCR HIV-1 检测 assay，用于检测和监测隐匿性 HIV-1 感染。经过实验室和临床评估，该 assay 结果稳定可靠，重复性好，表现出非常高的分析特异性和接近单拷贝水平的检测灵敏度，检测下限（LoD）为 4.09 拷贝/百万外周血单核细胞（4.09 copies/million PBMCs）。

4 月 6 日，国家卫健委法规司发布“关于发布推荐性卫生行业标准《污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法标准》的通告”，其中规定了污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法，适用于生活污水、医疗机构污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测。点击此处下载高清PDF电子版：WST799—2022 《污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法标准》新冠病毒严重威胁人类健康，迫切需要更多的监测途径作为疫情监测预警新冠病毒疫情已发展成“全球性大流行病”，严重威胁人类健康和社会经济发展，且近日国内部分城市疫情出现反弹现象，众多地区无症状感染者数量增加，可见防控形势具有长期性和复杂性。至今为止，临床病毒筛查是疫情预警防控的主要手段，但是基于临床检测的预警是在已出现病例之后再对其居住社区及密切接触人员开展流行病学回溯，考虑到新冠病毒3-14天潜伏期和出现明显症状之后再去医院诊断的时间，这种预警方式具有一定的滞后性，所以当下迫切需要更多的监测途径作为疫情监测预警的补充，从而有效阻断病毒传播、降低疫情发生的损失。污水站的新冠病毒密度已成为新冠病毒传播的一个早期预警信号据《科学通报》报道，2021年6月份香港大学张彤教授团队在一栋未出现确诊者大楼的多份污水样本中检测出新冠病毒，此举为社区公共卫生防控监测提供早期预警信息,亦成为采取后续防疫措施的重要依据；武汉疫情期间，湖北省环科院等在武汉疫区医院化粪池上层泥水和污水处理设施污泥样品中检出了病毒核酸；广州疾控中心的流行病学调查证明了粪便排泄物是新冠病毒传播的重要载体；清华大学也在北京新发地疫情暴发之前的小红门污水处理厂进水中检出了病毒核酸；国外同样已有多家研究机构在疫情爆发伊始或爆发前就在市政污水中检出新冠病毒，今年1月21日，美国疾病控制与预防中心 (CDC)就曾经发布报告称，新冠病毒的变种奥密克戎(Omicron)很有可能在美国首例确诊病例官宣的一周多前，就已经存在于纽约市的废水中了。由此可见，通过监测城镇污水站进水中新冠病毒的密度变化可以及时反映出污水处理厂服务区域人群的病毒感染情况污水站的新冠病毒密度已成为新冠病毒传播的一个早期预警信号。而且，城镇污水厂能够覆盖大部分人群，与基于临床检测的病毒预警相比，基于污水中新冠病毒监测的疫情预警覆盖面更广，时效性更强，经济社会成本更低，这对于公共部门开展防疫工作有重要意义。随着新一轮新冠疫情的猛烈来袭，生活污水中新冠病毒密度正在大幅增加，污水处理厂站一线工作人员感染风险大幅上升，大家应该提高警惕，并做好相关的防护工作。在美国，据央视财经3月17日报道，美国疾控中心在过去两周内对各地污水处理站进行检测后公布的数据显示，超过三分之一的污水处理点检测出新冠病毒密度增加，其中有 37% 的涨幅在 100% 以上，有 30% 的涨幅超过 1000% 。而在3月1日至3月10日期间，美国疾病控制与预防中心 (CDC)监测的超过三分之一的废水样本点都显示出新冠病毒呈上升趋势。如何防止新冠病毒通过污水传播？首先，尽可能接种加强针疫苗。相关研究显示，2针mRNA疫苗或腺病毒载体疫苗对奥密克戎产生的中和抗体下降明显（三针灭活对奥密克戎的中和能力待研究确认），原有疫苗接种方式效果大减。因此， 接种加强针就成为了污水处理工作人员的必要任务之一，尤其是感染风险较高的运维人员、化验人员，更是应该优先安排接种疫苗。其次，规范操作流程，降低感染风险。相对来说，污水处理厂的污水提升泵站、粗细格栅、旋流沉沙池等预处理段，以及污泥脱水间属于高风险场所，最有可能造成病毒等病原体暴露并引发操作人员感染风险，所以应该更加规范操作流程。结合实际情况，可以采取以下防护措施：1、现场操作人员加强自我防护意识，在上岗前佩戴好口罩和手套等基本防护用品，尽量做到不与污水、污泥、砂砾、栅渣等直接接触；2、针对进水泵房、预处理段、污泥脱水工段操作以及化验取水采样，提高防护等级，除口罩和手套外,配备护目镜和防护服；3、由于污水厂需要经常记录数据，建议保持给笔消毒，并且人手一只笔，防止交叉感染；4、加强集中排气口的消毒，要求人员尽可能避开排放口的气流；5、作业完毕后，及时对防护用具进行全面清洗消毒，加强个人卫生，勤洗手、勤消毒；6、定期对预处理段产生的栅渣进行消毒处理，及时安排运输车辆对栅渣进行清理转运。第三，污水处理厂加强消毒杀菌。根据国家卫健委发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案》，新型冠状病毒对紫外线和热敏感， 56 ℃ 30min 、乙醚、 75% 乙醇及含氯消毒液等脂溶剂均能有效灭火病毒。应该说，污水处理行业虽然不像医务人员那样身处抗疫第一线，但 作为应战新冠病毒的 “第二战场”，污水处理人员同样面临着巨大的感染风险。在之前的疫情中，尽管困难重重，但污水处理行业仍然克服艰难险阻，保持了全国5000多座污水厂的正常运行。如今，新的一轮疫情卷土重来，污水处理行业再次面临巨大的考验。建议各地环保部门在加强监管的同时，还要给予一定的帮助扶持，并在医疗废水处理环节加强预处理，尽可能保证达标排放，从而避免对下游污水处理厂造成冲击，减少污水处理环节的压力。

非洲猪瘟PCR检测仪-一款屠宰场神器猪瘟病毒现场检测仪#2022已更新بكرللكشفعنحمىالخنازيرالأفريقية-قطعةأثريةمنذبحالخنازير【品牌型号：天合环境TH-P800】在2018年，非洲猪瘟疫病席卷了我国生猪养殖行业，并且给我国各大中小型养殖场带来了严重的打击，使养殖者损失惨重，此次非洲猪瘟不仅导致了猪肉价格一路飙升，而且还导致了我国众多生猪养殖人员对其所养殖的生猪进行了紧急扑杀，对于全国的生猪养殖者都造成了无法估量的损失，同时也在很长时间内造成了养殖者停养的现象。但是随着目前疫病的消退以及养殖利润的客观性，很多养殖者都有再次养殖的想法，所以，在新的养殖工作中，必须掌握对于非洲猪瘟的防控技术，对非洲猪瘟的检测工作，避免悲剧的再次发生。一、仪器用途非洲猪瘟病毒检测是非洲猪瘟防控工作的重要举措，意义重大。为进一步提高非洲猪瘟病毒检测结果准确性，规范非洲猪瘟病毒诊断制品生产、经营和使用行为，2021年1月1日起，各有关部门和单位在动物检疫或疫病监测、诊断中，对生猪及其产品开展非洲猪瘟病毒检测，应当使用已取得农业农村部核发的产品批准文号的非洲猪瘟病毒诊断制品，确保检测结果准确。天合非洲猪瘟PCR检测仪(实时荧光定量PCR仪支持变温检测)用于运行病毒检测实验，并对实验数据进行分析 仪器既可在实验室内操作，又可用于野外科学实验，配合相应试剂，对取自待检测样本的分析物或其他分析物中的目标核酸进行快速、准确的定性检测。天合非洲猪瘟检测仪配套非洲猪瘟病毒荧光pcr检测试剂盒、非洲猪瘟病毒荧光pcr核酸检测试剂盒均已经获得农业农村部产品批准，可以满足非洲猪瘟核酸现场快速检测需求。可定量快速畜牧类疾病诊断如非洲猪瘟、禽流感、猪瘟、猪蓝耳、伪狂犬等疾病，广泛应用于养殖场、屠宰场、食品加工厂、肉产品深加工企业、农业农村部、畜牧局、检验检疫单位使用。实验员需要经过实验室技术和仪器、软件操作的专门培训，具备熟练的相关操作技能。二、仪器特点1.体积小，重量轻，易于携带。轻松满足外出实验的需求。2.内置7寸高清电容屏PDA，触屏操作，简便快捷。3.Marlow高品质Peltier制冷片，结合德国高端PT1000温度传感器以及电性电阻加热补偿边缘的温度控制模式，最大升温速度7℃，最大降温速度5℃，大大缩短实验时间。4.整板3s快速采光模式，保证实验结果孔位一致性。5.简洁直观的软件引导，轻松开启检测实验。三、非洲猪瘟PCR检测仪应用领域□基础科学研究□病原体检测□肉制品掺假□转基因检测□食品安全检测□药物开发及合理用药□基因表达□水体监测四、技术参数样品容量：8x0.2ml、支持8联管适用耗材：常见透明PCR耗材，8x0.2ml排管，0.2ml单管反应体系：5-120ul反应模式体系加热/制冷模块：进口半导体热电模块温度控制范围：4°C-99℃升降温平均速率≥2°C/秒温控精度：≤±0.1°C温度均匀性：≤±0.2°C温控区域数量：多点(2点)梯度数：0个梯度温度范围：无梯度孔数：无激发光源：免维护led激发光波长范围：400-700nm检测部件：进口光电检测器检测通道数：标配1通道(FAM)适用染料和探针：FAM/SYBR Green I软件功能：荧光定量PCR系统软件 实时扩增反应曲线功能 特定标本实时反应曲线显示 数据分析功能 阴阳结果自动判定功能 图形化显示功能。噪音：45 dB屏幕尺寸：7英寸(HD)触摸屏：电容式外接USB：支持数据导入导出热盖：自动压力调节外观尺寸：（长宽高）355X200X124mm净重：约2.5Kg

导读中国疾病预防控制中心国家病毒病预防控制研究所和中国首都儿科研究所的科学家在Canadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology上发表了题为The Viral Load of Human Cytomegalovirus Infection in Children following Hematopoietic Stem Cell Transplant by Chip Digital PCR的文章。文中应用naica® 微滴芯片数字PCR系统建立了芯片数字PCR（cdPCR）方法，能够精准定量HSCT前后儿童HCMV感染的病毒载量。质粒pUC57-UL83的cdPCR检测限为103拷贝/ml，qPCR检测限为297拷贝/ml。cdPCR检测HCMV AD169毒株的结果为146拷贝/ml，表明cdPCR的灵敏度高于qPCR。人类巨细胞病毒（HCMV）是一种普遍存在的β-疱疹病毒，已感染发展中国家高达90%的人口。作为一种常见病原体，HCMV感染在免疫抑制个体中引起了显著的发病率和死亡率，特别是在接受了造血干细胞移植（HSCT）的患者中，原因是原发感染后潜伏感染的主要靶细胞是造血细胞。对于HSCT后的高危儿童，应在出现临床症状之前检测HCMV感染，因为HCMV病毒的载量及变化与HSCT儿童HCMV感染的发展和严重程度高度相关。因此，HCMV病毒载量的定量检测对患儿的治疗至关重要。应用亮点：▶ 使用naica® 微滴芯片数字PCR系统开发了一种快速、直观、简便和准确的检测HSCT前后儿童HCMV病毒的绝对定量方法。▶ 通过质粒和培养毒株验证naica® 微滴芯片数字PCR系统灵敏度、特异性和重复性。实验方法：作者从首都儿科研究所儿童医院收集了122名异体造血干细胞移植患儿、3名自体造血干细胞移植患儿样本（男/女:73/52），中位年龄7.5岁。该研究通过质粒和培养毒株验证naica® 微滴芯片数字PCR系统灵敏度、特异性和重复性均优于qPCR。在HSCT前后，通过qPCR和cdPCR检测所有供体和受体血清中的HCMV病毒载量。实验结果：作者通过含有pUC57-UL83基因的质粒DNA分别评估cdPCR和qPCR的动态范围。cdPCR的检测限 (LOD) 为103拷贝/ml (2.0拷贝/反应)，qPCR的LOD为297拷贝/ml。结果表明，cdPCR的灵敏度高于qPCR。为了评估cdPCR数据的重现性，作者使用质粒建立了HCMV DNA拷贝数的标准曲线。分析cdPCR检测的变异系数（CV、标准差/平均值）。结果表明，cdPCR检测具有良好的重复性（CVHCMV在125个HSCT患儿的检出率为30.40% (38/125)，HCMV病毒载量范围为107拷贝/ml-6600拷贝/ml。男性组的检出率为30.14% (22/73)，女性组的检出率为30.77% (16/52)。在0-12岁HSCT后HCMV阳性儿童中，HCMV的检出率为89.47% (34/38)。在0-6岁组中，男性的检出率为25.64% (10/39)，女性的检出率为22.58% (7/31)。在7-12岁组中，男性的检出率为39.29% (11/28)，女性的检出率为40% (6/15)。12岁以上患儿HCMV检出率为33.33% (4/12)，男性检出率为16.67% (1/6)，女性检出率为50% (3/6)。结果如表3所示。综上所述， cdPCR方法在HCMV检测领域比qPCR更敏感，能快速、直观、简便和准确的检测HSCT患儿HCMV感染率及病毒载量。参考文献：1.P. Griffiffiffiths, I. Baraniak, and M. Reeves, “,e pathogenesis of human cytomegalovirus,” Journal of Pathology, vol. 235, no. 2, pp. 288–297, 2015.2.L. Dupont and M. B. Reeves, “Cytomegalovirus latency and reactivation: recent insights into an age old problem,” Reviews in Medical Virology, vol. 26, no. 2, pp. 75–89, 2016.naica® 六通道微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司naica® 六通道微滴芯片数字PCR系统，源于Crystal微滴芯片式数字PCR技术，自动化微滴生成和扩增，每个样本孔可实现6荧光通道的检测，智能化识别微滴并进行质控，3小时内即可获得至少6个靶标基因的绝对拷贝数浓度。

导读自2019年底新冠肺炎疫情爆发以来，已经在人类粪便和城市废水中广泛检测到SARS-CoV-2。新冠病人的粪便可以重复检测到SARS-CoV-2 RNA（有时甚至在呼吸道样本已经检测不到的情况下），并且与疾病的临床严重程度无关。在多个国家的城市废水中也广泛检测到SARS-CoV2 RNA，但检测到的浓度比人的粪便低几个数量级。未经处理的废水中SARS-CoV-2 RNA的存在导致了基于废水的流行病学（WBE）的发展，以早期检测社区新型冠状病毒肺炎的传播，这也引起了人们对废水处理(WWT)过程尤其是在其终产物WWT污泥中SARS-CoV-2的命运以及相关风险的关注。法国巴黎地区跨省废水处理工会(SIAAP)和巴黎萨克莱大学的科学家在Environmental Research发表了题为Fate of SARS-CoV-2 coronavirus in wastewater treatment sludge during storage and thermophilic anaerobic digestion的文章。文中应用naica®微滴芯片数字PCR系统对WWT污泥中SARS-CoV-2进行绝对定量，为持续监测WWT污泥中的新冠病毒载量提供了具有应用价值的检测方法。应用亮点：▶ 使用naica®微滴芯片数字PCR系统开发了一种快速、直观、简便的WWT污泥中SARS-CoV-2绝对定量的方法。▶ naica®微滴芯片数字PCR系统可以实时监测高热厌氧消化后WWT污泥中SARS-CoV-2载量，不受抑制剂影响，特别适合低浓度，低丰度样本。实验方法：作者采集了不同的废水处理厂的新鲜污泥，研究WWT污泥在储存 (4℃、室温) 或高热厌氧（AD）消化 （50℃）后SARS-CoV-2稳定性。部分污泥中掺入了新型冠状病毒肺炎患者中分离出的SARS-CoV-2颗粒和/或BCoV（牛冠状病毒）作为加标对照。作者通过RT-qPCR测定了新鲜WWT污泥在4℃和室温条件下SARS-CoV-2颗粒RNA的载量。为了降低可能含有的PCR抑制剂对样品中SARS-CoV-2检测的影响，作者使用灵敏度更高的naica®微滴芯片数字PCR系统，持续监测高热厌氧消化5天过程中SARS-CoV-2颗粒的RNA水平。实验结果：新鲜WWT污泥在4℃ 55天和20℃左右环境温度25天储存条件下SARS-CoV-2颗粒的RNA的载量维持在一个相对稳定的水平。但在高热厌氧消化过程中，SARS-CoV-2和BCoV RNA水平迅速下降，持续5天处理后最终水平接近检测极限。▲图1 部分污泥中掺入了新型冠状病毒肺炎患者中分离出的SARS-CoV-2颗粒和/或BCoV（牛冠状病毒）作为加标对照。该图展示了加标或未加标的新鲜 WWT 污泥在高热厌氧消化过程中SARS-CoV-2和BCoV RNA 水平的动态变化。为了降低可能含有的PCR抑制剂对样品中SARS-CoV-2检测的影响，作者使用抑制剂耐受能力更佳的naica®微滴芯片数字PCR系统来检测高热厌氧消化过程中的SARS-CoV-2水平。GU/g:厌氧消化反应器样品中每克含有的基因组单位。期刊介绍：Environmental Research创刊于1967年，隶属于爱思唯尔出版集团。该杂志的主要发表评估化学品和微生物污染对人类健康影响的文章，2022年影响因子8.431，JCR分区为Q1。参考文献：1.Adelodun B, Kumar P, Odey G, et al. A safe haven of SARS-CoV-2 in the environment: prevalence and potential transmission risks in the effluent, sludge, and biosolids. Geosci, 2022, 101373.2.Ahmed W, Bertsch P M, Bibby K, et al. Decay of SARS-CoV-2 and surrogate murine hepatitis virus RNA in untreated wastewater to inform application in wastewater-based epidemiology. Environ, 2020a, 191, 110092.

在基因治疗领域，慢病毒载体(Lentivirus)是一种复制较慢的逆转录病毒，由HIV-1改造而来，常作为基因治疗的载体使用。慢病毒载体的制备流程需要对病毒的物理滴度和感染滴度进行检测。1. 现有的检测手段（如p24 ELISA）因病毒中p24蛋白的含量不同、含有p24蛋白的杂质（如外泌体）等因素的影响，无法地表征病毒的物理滴度，且此类方法均无法对空载病毒（无p24蛋白）进行表征，这就给感染滴度的检测带来了误差。2. 在复杂的病毒工业化制备流程中，只测量末端纯化产品的滴度，无法真实反映各个生产环节的生产效率，而对各个生产环节的样品都进行纯化表征会浪费大量人力物力。目前研究者亟需一种无纯化、快速、检测下限低的病毒表征手段。3. 目前的病毒表征手段，均无法将病毒的物理参数如粒径(与载体聚合相关)与蛋白质组分析联系起来。因此，这些技术无法分析病毒滴度受样品聚集或病毒破裂与分解影响的情况，因此无法区分单分散制剂与聚集样品。 对于上述问题，美国NanoView公司所开发的全自动病毒荧光检测分析系统是一款无需纯化的、全自动的可对病毒进行表征分析的全新设备。该设备能够提供全方位的病毒表征信息，包括病毒粒径、病毒表面和内部病毒蛋白、病毒物理滴度、空载比检测、病毒转导效率及假型定量表征等。操作简单，结果可靠。全自动病毒荧光检测分析系统的基本原理是一种基于特异性免疫捕获技术，允许研究者直接分析特定群体的病毒。通过配套的试剂盒，客户一次性能够分析多达16个不同的样本，大大节省了时间和经济成本。和传统的病毒表征手段相比，全自动病毒荧光检测分析系统有如下优势： 无需纯化NanoView的LentiView™ 技术可以对慢病毒进行检测，将蛋白质组信息与物理病毒滴度结合起来，无需样品纯化。只需 35 µl 未纯化或纯化的样品，检测浓度低至106VP/ml。无需担心纯化带来的误差，更地测量样品间的表征和表达信息的差异。慢病毒示意图 全方位的病毒粒径分析全自动外泌体荧光检测分析系统能够对20 nm的病毒进行全方面的表征，无论是粒径分布、空载病毒与完整病毒的假型分析均可在一次测试中得到。并且所用来测试的样本无需进行纯化，避免因纯化带来的样本偏差。 病毒滴度病毒物理滴度的常用检测方法是p24 ELISA。该方法测量p24衣壳蛋白的浓度并将其转化为病毒物理滴度。样品中溶解的p24、不同病毒p24含量的不同以及病毒聚集会影响检测准确性。此外， p24 ELISA无法检测缺少衣壳(空载)的颗粒。LentiView™ 可对样品中病毒进行高灵敏度的定量检测，获得滴度数据，区分完整和空载病毒并识别样品中杂质如可能经过纯化带有的外泌体等。 红色荧光抗体标记病毒的内部p24衣壳蛋白，用蓝色荧光抗体标记VSV-G，同时表达p24和VSV-G的病毒显示粉红色，并由 NanoView专用软件计数。 完整/空载病毒颗粒的比例NanoView的LentiView™ 技术可以简单快速地分析出完整/空载病毒颗粒的比例，区分完整(成功转导)和空载病毒并识别样品中杂质，而完整/空载病毒颗粒的比例是确定转导效率的主要依据。 完整病毒是表达VSV-G和/或ETL，且表达衣壳蛋白p24的病毒颗粒，空载病毒是表达VSV-G和/或ETL，未表达衣壳蛋白p24的病毒颗粒LentiView™ 芯片表面固定的抗VSV-G抗体捕获病毒后，即可检测表面和内部蛋白标记物。在LentiView™ 获得荧光图像中，绿色荧光点代表没有衣壳的VSV-G+病毒颗粒，黄色荧光点代表含有衣壳的完整病毒颗粒。 病毒转导效率我们使用LentiView™ 对三种不同的慢病毒样品进行了表征，检测病毒颗粒亚群，进而研究这些载体的转导效率。三种不同的慢病毒样品分别为野生型慢病毒 (VSV wt)、含高浓度质粒的工程化靶向配体 (ETL-HC)、含低浓度质粒的工程化靶向配体 (ETL-LC)。三种慢病毒载体的转导效率 转导效率与物理滴度的对比 根据病毒碎片粒径和病毒粒径的差别，对每一种载体中的病毒和病毒碎片数量进行统计。50nm以上的病毒与50nm以下的病毒碎片的比例和载体的转导效率之间存在很强的相关性。载体转导效率和病毒与病毒碎片比例的对比 完全定制化客户通过ViroFlex技术使用连接蛋白连接任意定制化的捕获抗体，并结合到ViroFlex芯片表面进而捕获所需的病毒，在自己的实验室里轻松进行高度定制化的检测。 ViroFlex的芯片捕获抗体排布示意图 ViroFlex定制化检测原理：先将连接蛋白与所需的定制抗体连接再将连接抗体的连接蛋白与ViroFlex芯片表面的连接蛋白抗体连接所需的定制抗体从而结合到了芯片上将样品在芯片上孵育，定制抗体即可特异性捕获病毒每个芯片多可结合两种定制化捕获抗体ViroFlex芯片的捕获原理(左)与普通芯片的捕获原理(右)示意图 ExoViewTM参数信息：颗粒大小分辨范围：20nm低检测浓度为106 VP/mL所需样本体积：35 μL激发波长：410 nm，488 nm，555 nm，640 nm，750nm可一次检测16个样本，每个样本可同时检测6个不同亚型及4种生物标记的荧光定位捕获抗体：一个芯片多允许6种捕获抗体（+阴性对照）荧光通道：4个荧光通道

报告简介：在基因治疗领域，慢病毒载体(Lentivirus)是一种复制较慢的逆转录病毒，由HIV-1改造而来，常作为基因治疗的载体使用。慢病毒载体的制备流程需要对病毒的物理滴度和感染滴度进行检测。1) 现有的检测手段（如p24 ELISA）因病毒中p24蛋白的含量不同、含有p24蛋白的杂质（如外泌体）等因素的影响，无法地表征病毒的物理滴度，且此类方法均无法对空载病毒（无p24蛋白）进行表征，这就给感染滴度的检测带来了误差。2) 在复杂的病毒工业化制备流程中，只测量末端纯化产品的滴度，无法真实反映各个生产环节的生产效率，而对各个生产环节的样品都进行纯化表征会浪费大量人力物力。目前研究者亟需一种无纯化、快速、检测下限低的病毒表征手段。3) 目前的病毒表征手段，均无法将病毒的物理参数如粒径(与载体聚合相关)与蛋白质组分析联系起来。因此，这些技术无法分析病毒滴度受样品聚集或病毒破裂与分解影响的情况，因此无法区分单分散制剂与聚集样品。对于上述问题，美国NanoView公司所开发的全自动病毒荧光检测分析系统是一款无需纯化的、全自动的可对病毒进行表征分析的全新设备。该设备能够提供全方位的病毒表征信息，包括病毒粒径、病毒表面和内部病毒蛋白、病毒物理滴度、空载比检测、病毒转导效率及假型定量表征等。操作简单，结果可靠。本次报告内容丰富，包括了目前病毒研究过程中遇到的困难及挑战，常规的检测方法及其限制，病毒前沿的进展及Exoview R200如何助力科研工作者取得更加突出的研究成果。Exoview R200的优势：▪ 无需样品纯化。▪ 一次性输出，包括病毒粒径、病毒表面和内部病毒蛋白、病毒物理滴度、空载比检测、病毒转导效率及假型定量表征等数据▪ 高通量检测▪ 高度定制化的检测▪ 可以区分外泌体的干扰 直播入口：您可通过点击此处或扫描下方二维码进入直播界面；或通过知乎观看直播https://www.zhihu.com/theater/66313/forecast/29924寇享观看渠道知乎观看渠道主讲人： Clayton Deighan博士是美国NanoView Biosiences的外泌体科学家和销售总监。2015年，他在俄亥俄州立大学的Jeff Chalmers博士的指导下完成了关于分离稀有细胞和纳米颗粒的课题论文，在Malvern Panalytical工作了4 年，负责颗粒粒径和计数仪器的技术支持，然后加入NanoView Biosiences工作至今。自ExoView检测平台被推出以来，他一直是NanoView的重要推动力量，与各地的外泌体科学家合作，揭示这些微小颗粒的用途。 报告时间：2022年5月31日 14:00-14:40精选案例 ☛ 病毒转导效率☛ 完整/空载病毒颗粒的比例☛ 病毒滴度

2014年以来美洲多个国家相继发生寨卡病毒（Zika）感染病例，世界卫生组织近日警告，寨卡病毒正呈现“暴发式传播”，预计美洲地区将有至多400万人感染这种病毒。截至目前，中国大陆尚未发现病例，但疾病预防控制中心指出我国仍存在病例输入风险。　　目前关于这种病毒传播的疑问不少，比如怀孕期间感染与造成婴儿小头畸形之间的关联，但由于目前诊断方法的局限性，还很难给出一个答案来。一组研究人员正在攻关，希望能以最快的速度研发出免疫试剂，检测是否感染Zika病毒。　　来自德州大学加尔维斯顿医学分校的Nikos Vasilakis表示，“我们正尽全力尽快给临床医师们一些答案。”　　目前，检测寨卡病毒的标准检测方法是对样本进行PCR，分析样本中的病毒RNA探针是否存在，虽然这种方法能很好的检测到病毒，但是病原体的RNA很快就会被降解掉。“在患者把样品送入临床时，病毒也许已经消失，或者只能抓住它的尾巴了，这超过了检测时间限制，”Vasilakis说。　　临床医师和流行病学家希望能在出生前几个月里就确定婴儿是否感染了寨卡病毒，为此美国疾病控制与预防中心CDC的科学家们进行了一种称为蚀斑减少中和试验(Plaque Reduction Neutralization Test) 的检测，这种方法是检测血清中和抗体的一种敏感性较高的方法，能检测之前的感染。　　从原理上说，这一检测方法以使蚀斑数减少50％的血清稀释度作为其中的效价。试验使用定量的病毒(100PFU)与不同稀释度的等量血清混合后感作, 接种预先准备好的单层细胞，再覆盖上营养琼脂置37度二氧化碳培养箱培养，数天后分别统计蚀斑数，用Karber法计算该血清的蚀斑中和效价。　　患者的血清中混有病毒，几天时间里研究人员观察病毒是否会感染培养基，如果没有，那么病毒就已经被血清中的抗体中和了，这表明患者曾经接触过寨卡病毒。　　CDC甲类病毒实验室主任Ann Powers表示，使用这种方法的问题在于“你必须有活体病毒，和合适安全的环境，”这意味着只有少数几个实验室能进行这种试验。　　其它更加方便的血清学测试也能检测特定病原体中的抗体，但是对于寨卡病毒来说，很难判断患者携带的黄病毒是登革热病毒，寨卡病毒还是其它病毒。“而且寨卡病毒出去的区域也正是登革热出现的地区，”来自华盛顿大学圣路易斯分校的免疫学家Mike Diamond说。　　Vasilakis 正在尝试ELISA方法，也就是检测体液中微量物质的固相免疫测定的方法，这种方法利用抗原与抗体的特异反应将待测物与酶连接，然后通过酶与底物产生颜色反应，用于定量测定，可以在感染后几个星期内检测到Zika病毒。虽然这也有可能会与其它感染发生一定程度的交叉反应，但如果Zika病毒特异性抗体浓度高就能指示出近期发生的Zika病毒感染，Vasilakis说。　　Vasilakis预计在未来几周内，Diamond研究组就会有结果，研发出一种针对Zika病毒的单克隆抗体检测方法，这能与ELISA方法结合，检测发生过的感染，“我们很早就开展了这项研究，这个月就能得到结果，”Diamond说，“初步结果表明我们的一些抗体能特异性识别Zika病毒。”　　不过即使Diamond研究组的抗体能特异性检测Zika病毒，他们也需要一些时间来建立诊断方法，“这可能还需要几个月的时间。”　　与此同时，一些生物公司也开始销售Zika血清学检测，比如MyBioSource 公司已经有售一种针对Zika的IgM ELISA检测，来自加拿大的Biocan 公司也在出售一种检测IgM和IgG抗体（后者比前者在感染后提升水平更高）的扎手指检测方法，能在5到10分钟得到结果。　　Diamond表示他们还未接触任何商业产品，Biocan目前还未给出有效数据，但是其销售部总经理Bhavjit Jauhar表示他们已经将实验室和现场检测结果呈递给巴西监管当局，“我们过去几年间一直致力于Zika病毒的研究，因为我们认为这种疫情会暴发。”

鉴定血样中埃博拉病毒的金标准方法要求把血样封在冷藏容器内送到远离患者居所的专科化验室。这类化验室采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检查是否有病毒。血液中检测不到病毒后，体液中仍可能藏有病毒，冗长的化验过程会延误对病毒载量的检测、治疗和实时监控。　　韩国科学技术院欧洲分院(KIST, Saarbr cken, Germany)的科学家及其同行设计了一台仪器并做了测试，这台仪器能同时执行四路RT-PCR，包括两份对照和两份病人血样。传统化验需要几小时到一天多的时间才能得到结果。而新化验过程只需30分钟即可完成。所需血量为100纳升，可能只需从指尖采集。　　实验显示该设备能同时执行四路PCR，包括一份阳性对照、埃博拉RNA和甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH) RNA以及一份阴性对照。该设备成功检测到埃博拉核糖核酸(RNA)。该检验不光能诊断疾病，还能生成每份样本含多少份RNA拷贝的信息。专家说这件工具还有望帮助医疗工作者在病人康复后追踪精液、乳汁和眼液中的病毒载量。　　通过比较两份样本的临界循环数(CT)得到相对量化。整个过程包括逆转录、PCR扩增和融化曲线分析(MCA)，不到37分钟即可完成。下一步是集成样品制备装置，形成一套一体化系统，输入样本后直接得到结果，供床旁诊断传染病之用。

7月26日，美国国际临床实验室设备及用品展AACC(Annual Scientific Meeting&Clinical Lab Expo)在芝加哥迈考密展览中心盛大开幕。此次展会上，热景生物美国子公司团队携备受关注的新冠检测系列解决方案、猴痘病毒检测方案以及免疫检测仪器平台精彩亮相。本次亮相展会的热景生物新冠自测试剂，先后通过欧盟CE、德国BfArM、法国ANSM、英国MHRA、泰国TFDA、新加坡卫生科学局HSA、巴西卫生局ANVISA等多个全球主流注册/备案，远销德国、法国、意大利、奥地利、香港、新加坡、越南、泰国、巴西、秘鲁等全球近40个国家和地区，受到广泛认可，已成为欧洲家用自测市场主流产品。新冠病毒仍在肆虐全球之际，多国又突然爆发猴痘疫情，新冠疫情的防控经验告诉我们早发现早隔离的重要性，对于一种传播快速、致病性较强的传染性疾病，提高防范意识、尽早识别和有效管控对阻断疫情至关重要。热景生物第一时间开发出猴痘病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法），先后通过欧盟CE、英国MHRA认证。该产品在此次展会上吸引了众多参会者的关注。新冠病毒仍在肆虐全球之际，多国又突然爆发猴痘疫情，新冠疫情的防控经验告诉我们早发现早隔离的重要性，对于一种传播快速、致病性较强的传染性疾病，提高防范意识、尽早识别和有效管控对阻断疫情至关重要。热景生物第一时间开发出猴痘病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法），先后通过欧盟CE、英国MHRA认证。该产品在此次展会上吸引了众多参会者的关注。热景生物一直秉持“发展生物科技，造福人类健康”的企业使命，展示了构建人类健康命运共同体的决心和愿景。我们将立足本土，放眼世界，不断创新，向世界展现中国自主研发实力和中国品牌力量。

艾滋病（AIDS）是一种危害性极大的传染病，由感染艾滋病病毒（HIV）引起，自从引入(联合)抗逆转录病毒疗法(ART)以来，HIV-1感染已从一种致命疾病转变为一种(可控制的)慢性疾病。然而，尽管抗逆转录病毒疗法在抑制病毒在个体中的复制方面是有效的，但它并不能治愈HIV-1感染。这是由于存在一个持久的(潜伏的)库，其中包含一小部分具有复制能力的完整前病毒(1-5%)，在抗逆转录病毒治疗停止后为病毒复制提供燃料。为了消除这一病毒库我们应该对于这些完整原病毒有准确的评估。在这里，提出了两种三色数字PCR检测方法，这两种方法是由两种现有方法组合而成的，IPDA(基于2色数字PCR的方法)和Q4PCR检测(4色qPCR方法)，并在naica微滴芯片数字PCR平台上测试了功能。验证了它们在潜伏感染的Jurkat细胞系模型和HIV-1患者样本上的性能。数据证明了增加IPDA中HIV-1亚基因组区域数量的潜力和灵活性，以获得对HIV-1库的敏感检测，同时受益于dPCR设置的优势。研究方法和结果：结合IPDA(基于2色数字PCR的方法)和Q4PCR检测(4色qPCR方法)，并在naica微滴芯片数字PCR平台上进行实验。结果表明，对于三重分析的初始验证，对每个分析、原始的双色IPDA分析和新的IPDA分析进行了单效反应，在两个独立的实验中对50 ng J-Lat 8.4 gDNA进行了两个三重分析：定量结果和理论值一致，重复性好，各靶标阴阳性微滴区分良好。j - lat8.4基因组DNA检测性能为了深入了解这两种三重检测在更复杂样品中的功能，我们将工作流程应用于来自HIV-1患者的5个PBMC样品，由于这些样品的病毒载量较低无法检测，并且正在接受ART治疗，检测结果均检测出了HIV-1。在此之后，我们观察到ENV试验对于PSI分析，SLR_26几乎没有检测到GAG或POL，这表明在PSI和ENV序列中可能存在缺失或突变，如果仅有这两个基因的话，可能该病人会被判定为阴性，但经多重数字PCR检测后，GAG和POL均被检测出来，因此数字PCR检测的必要性不言而喻。文章结论：在这项研究中，成功地实施了三重数字PCR分析，通过在三色dPCR平台上整合先前描述的IPDA和Q4PCR方法，来定量HIV-1患者样本中的HIV-1 DNA库。受益于dPCR设置的优势，这种方法增加了IPDA上HIV-1亚基因组区域的数量，提高了对库的敏感检测，降低了结果误判的可能性。尽管研究中纳入的患者样本有限，但展示了多重定量分析在HIV-1病毒库分析中的潜力，因为这些完整性分析甚至可以在dPCR系统中进一步扩大使5或6色复用。

2020年注定是不平凡的一年，而在每个平凡工作岗位上的我们，总希望能在这个特殊的时期做点什么，哪怕微小的贡献，汇集在一起，一定会成为改变的推动力。所以，小编梳理了一下在抗病毒药物、疫苗研发生产等相关领域的工作中，我们的微孔板检测及成像设备能够开展的实验和项目，希望能够对在攻坚岗位上奋斗的老师们有所帮助。病毒，可以是恶魔，也可以是工具我们都知道，病毒（virus)由一种核酸分子（dna或rna）与蛋白质（protein）构成或仅由蛋白质构成（如朊病毒）的有机形态，它介于生命与非生命之间，超然在五界之外（传统的五界分类法）。这样一种看起来无比“简单而低级”的东西，却在人类历史上留下持续至今挥之不去的阴影，比如ebola，比如hiv，比如，现在全国上下一心对抗的新冠病毒。但是，拥有高级智慧的人类，怎会轻易被这些简单而低级的玩意儿打败？所以，我们有了疫苗，有了抗病毒药物，聪明的人类还利用病毒感染宿主细胞进行自我复制的机制，把恶魔变成工具，应用到人类的生产生活中，比如通过病毒进行花卉育种，利用病毒作为载体进行生物研究、基因治疗等等。所以今天，我们首先分享一些围绕抗病毒药物研发、疫苗生产等相关领域，微孔板检测和成像设备的应用方向，后续我们会为大家继续分享微孔板相关设备在如何“利用”病毒开展生物研究工作。病毒的数量与感染性测定病毒感染哺乳动物细胞后，除了通过rt-pcr的方法，可以通过细胞病变效应、红细胞吸附和免疫标记检查法等评价病毒在细胞中的增殖情况。细胞病变效应（cytopathic effect, cpe），是指病毒在敏感细胞内增殖引起的光镜下可见的细胞病理改变。大多数动物病毒感染敏感细胞培养都能引起其显微表现改变，例如细胞聚集成团肿大圆缩脱落及细胞融合成为多核细胞，细胞内出现包涵体（inclusion body），乃至细胞裂解等，正是因为cpe的表现，我们可以在体外细胞水平评价病毒感染宿主细胞的情况。病毒毒价测定是病毒学相关研究中最基本的技术手段，无论疫苗研发、抗病毒药物评估或者是病毒重组载体构建，均需要在不同环节评定病毒毒价，而目前主要方法包括蚀斑实验、tcid50测定和免疫染色法等。病毒蚀斑实验病毒蚀斑是一种检查和准确滴定病毒感染性的方法。方法：将稀释的病毒悬液加入单层细胞培养瓶中。病毒吸附后，再覆盖一层融化的半固体营养琼脂，使病毒在单层细胞培养中有限扩散。结果是每一个有感染性的病毒在单层细胞中可产生一个局限性的感染灶。用活性染料 (如中性红) 染色，则活细胞着色，受病毒感染而破坏的细胞不着色，形成肉眼可见的蚀斑(plaque)。每个蚀斑是由一个感染性病毒颗粒形成的，称作蚀斑形成单位 (plaque forming unit,pfu)。通常以每毫升病毒液的空斑形成单位既 pfu/ml表示。上图来自武汉大学基础医学院，病毒感染6孔板细胞后形成空斑病灶，使用中性红染色后，通过cytation的4x物镜明场模式对全孔进行拼接成像，软件分析识别孔中的空斑病灶个数。tcid50法tcid50法是测定病毒能使50%的组织培养细胞发生感染的最小量。方法：一般是将病毒悬液作10倍的系列稀释，分别接种细胞，经一定时间后观察cpe、血细胞吸附等指标，以最高稀释度能感染50%细胞的量为终点。最后用统计方法（reed muench法）计算出50%组织细胞感染量（ 50%tissue culture infectious dose,tcid50)。免疫染色法空斑实验法或常规tcid50测定滴度依赖于病毒在感染细胞中的复制以及感染周边细胞形成局灶型病变；而免疫染色法只需要病毒感染靶细胞并表达病毒所编码的蛋白。因此，免疫染色法（infectious units per ml, or ifu/ml）测定病毒滴度需要的时间比空斑法（pfu/ml）更短。其中，免疫染色法包括hrp组化或免疫荧光染色等。同样类型方法也适用于表达荧光报告基因的重组病毒的毒价测定。例如，以针对杆状病毒囊膜蛋白gp64的单克隆抗体标记被病毒感染的细胞，然后以hrp-标记的二抗与感染细胞进行染色。通过底物显色，在光学显微镜下计数感染斑点的数量，经过稀释倍数的换算，即可得出病毒的滴度（ifu/ml）。输问题：无论是plaque assays还是tcid50，均涉及较多微孔的细胞计数或阴/阳性孔判断，常规的显微镜观测法，操作不便且对研究者伤害较大。因此biotek为大家提供了更加自动化的解决方法：通过cytation/lionheartfx自动化成像设备进行cpe或者plaque的成像及计数。上图：cytation5自动化成像系统支持明场、彩色明场、荧光场等模式自动化成像检测，并且可选择大视野成像模式，4倍镜一个视野可覆盖384孔板整孔，提高全孔、整板成像的检测速度。上图：两种病毒感染细胞后，通过红色/绿色荧光探针标记的抗体进行免疫荧光染色，采用cytation双荧光通道自动成像，并对病毒感染的细胞病灶进行识别成像。抗病毒药物筛选相关应用

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诺如病毒诺如病毒是属于杯状病毒科的单链正股ＲNA病毒，是引起全世界病毒性急性胃肠炎散发和暴发的主要病原体之一。诺如病毒潜伏期为12～48小时，症状包括腹泻、呕吐、无血便、恶心、腹痛和低烧。诺如病毒在外环境抵抗力较强，在水、食物和环境中可存活2～4周，缺乏有效的诺如病毒的疫苗和人群对其普遍易感，预防和控制诺如病毒暴发和散发都极具挑战性。近年来我国诺如病毒暴发呈上升趋势，2012年广州大学城6所学校发生的涉及652人的疫情因诺如病毒感染的厨师通过污染食物而引起【1】。目前仍是诺如病毒高发期，又是开学季，美正提醒学校和公众注意预防！食物可通过几个方式被诺如病毒污染，包括被人的粪便污染、与粪便污染的表面( 包括人的手) 接触、被呕吐物污染、接触患者出现过的环境和患者产生的气溶胶以及被感染的食物操作者接触。诺如病毒不会在食品中生长，因此在食物的生产和贮藏过程中病毒污染量不会增长，但是诺如病毒很低剂量就可以使人发病。水果和蔬菜在加工之前被灌溉水或有机肥料中的诺如病毒污染，如葡萄、草莓等通常被认为是诺如病毒暴发的载体。诺如病毒污染海产品可分为两个途径，一是贝壳类生活在被诺如病毒污染的海洋环境，二是除了贝类以外的海产品被感染了诺如病毒的食品操作人员二次污染所致【2】。诺如病毒目前还不能体外培养，无法进行血清型分型鉴定。根据基因特征，诺如病毒被分为6个基因群（Genogroup, GI-GVI），GI和GII是引起人类急性胃肠炎的两个主要基因群，GIV也可感染人，但检出率较低。GIII、GV和GVI分别感染牛、鼠和狗。根据衣壳蛋白区系统进化分析，GI和GII进一步分为9个和22个基因型，除GII.11、GII.18和GII.19基因型外，其他可感染人。GIV分为两个基因型，GIV.1感染人，GIV.2感染猫和狗【3】。诺如病毒如何检测？食品安全国家标准GB4789.42-2016中规定，食品中诺如病毒检测主要采用实时荧光RT-PCR检测方法。接下来，我们看看国家标准中关于诺如病毒的检验流程。不同类样本检测的操作主要在于样本前处理 下面以“双壳贝类”操作为案例，看下前处理操作流程：美正生物为您提供诺如病毒检测整体解决方案，来了解一下吧~参考文献：【1】蔡文锋，谢华萍，刘于飞，等． 一起食源性诺如病毒 GⅡ． 4 /Syd- ney_2012 变异株感染暴发的调查［J］． 中华流行病学杂志，2013， 34( 8) ∶ 804 － 807．【2】孔翔羽,靳淼,段招军.诺如病毒与食源性疾病[J].中国临床医生杂志,2015,43(07):21-23.【3】Mesquita JR, Barclay L, Nascimento MS & Vinje J. Novel norovirus in dogs with diarrhea. Emerg Infect Dis 2010,16:980-2.

新型冠状病毒肺炎(Coronavirusdisease2019,COVID-2019)是由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒（SARS-CoV-2）所引起的高传染性病毒疾病，对世界人口造成了灾难性影响，导致全球380多万人死亡，成为继1918年流感大流行以来影响最大的全球卫生危机。 新冠病毒不断变异的RNA病毒 作为单链结构的RNA病毒，新型冠状病毒的一大特点就是极其容易变异。随着感染人数的增加和疫情的持续，新型冠状病毒不断进化和变异，陆续产生多种新冠病毒变异株。世界卫生组织（WHO）根据新冠病毒变异株的传播力、致病力等将其分为VOCs(Variant of concern)和VOIs(Variant of interest)。新冠病毒VOCs的分类 新冠病毒VOIs的分类 目前市场对新冠病毒筛查主要采用荧光 PCR 方法，该方法检测灵敏度高，但成本也相对较高，并且单机通量小，容易被污染，制约了大规模病毒检测速度，对当前不同变异毒株区分荧光PCR方法存在一定难度。随着病毒感染多元化和疫情防控常态化的推进，市场急需一种更快速、准确、高通量的检测方法，用于满足大样本量的检测、基层的日常防控筛查，以及不同变异株的区分。 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）主要用于分析包括蛋白质及核酸在内的生物大分子，该技术应用于核酸检测具有高通量、高灵敏、高准确率的特点。其主要工作原理是结合延伸分析法和碱基特异裂解分析法，将扩增后的核酸产物通过离子源使样品离子化，产生不同质荷比的离子，再经过质量分析器测定该样品中不同种类离子的分子量，按照从小到大的顺序依次排列从而得到一幅质量图谱，并根据检测项目不同给出相应的检测报告。该技术在遗传病筛查、肿瘤变异检测、甲基化检测、用药指导、病原体检测及功能医学健康管理等多个领域的应用日益深入，已经成为精准医学不可或缺的分子诊断技术。MALDI-TOF MS检测新型冠状病毒方法为通过特定引物扩增目标基因片段，再通过靶向位点探针特异性单碱基延伸，然后通过质谱技术检测延伸位点的碱基，判断病毒种类和变异类型。该方法灵敏度高、操作简单、成本低廉、人员需求低、通量高，可实现6小时384样本出报告，以后每1小时出384份样品报告。新冠病毒流行初期，Autof ms1000系统建立了完成病毒检测检测体系，对病毒毒株进行了精准检测（图3）。随着研究深入，Autof ms1000检测核酸的体系也日渐成熟，针对当前多变异毒株情况，研究人员通过合理设计扩增引物和探针，可实现单个样品，单芯片位点检测，一次区分当前所有可认知的新冠病毒变异株。随着疫情斗争的持续进行，病毒变异也不断发生，后续可能出现更多更复杂的病毒变异株，MALDI-TOF MS技术基于其检测原理，在大样本多病毒变异株检测方面的优势将日渐突出。随着人们对该技术的认知度的日渐加深，未来该技术在核酸检测方向的应用将出现更多的思路和方法，MALDI-TOF MS在临床应用领域中将会发挥更大的作用。

导读由流感病毒引起的急性呼吸道传染病每年会呈季节性流行。中国国家流感中心发布的2024年第14周中国流感监测周报显示，近期甲流、乙流的来势比较凶猛。如何快速检测流感病毒种类并预测其传播趋势是各国研究者共同关注的热点。瑞士苏黎世联邦理工学院生物系统科学与工程系、巴塞尔城市州立实验室环境微生物学系和巴塞尔州卫生局的研究者在SWISS MED WKLY发表了题为Influenza transmission dynamics quantified from RNA in wastewater in Switzerland的文章。作者使用naica® 微滴芯片数字PCR系统量化了瑞士三家最大的污水处理厂流入的甲型和乙型流感病毒（IAV和IBV）载量，估算了监测时间内这些区域的感染发病率和有效生殖数（Re）的趋势，并将估算结果与临床流感监测数据进行了比较。流感疫情的发现和监测是一项至关重要但具有挑战性的任务，因为轻症和无症状病例的比例很高，其症状也容易和其他常见循环呼吸道疾病症状相混淆。因此在人群层面监测流感感染具有挑战性。流感样疾病(ILI)和实验室确诊流感病例的报告系统可用于监测流感传播的时间趋势，而在临床报告外追踪病例的方法可以改善对流感传播的动态监测。排放到污水中的流感病毒是一个很有前景的信息来源，它能够区分具有重叠症状的疾病，并且可以捕获未报告的病例。一个社区污水样本中病原体负荷可以预示社区的疾病负担。在该研究中，作者检测了瑞士三个最大的污水处理设施中IAV和IBV的浓度应用亮点：▶ 使用naica® 微滴芯片数字PCR系统量化了污水中甲型和乙型流感病毒（IAV和IBV）载量。▶ 污水中流感病毒监测对瑞士IAV发病率的峰值更为敏感，与相同地理位置的确诊病例数据相比，可以得到更精确的估算结果。▶ 首次采用统计模型从污水数据中量化了流感传播动力学。这项研究的目的是在瑞士范围内实施污水流感监测，并估算污水中的IAV和IBV传播动力学。作者从瑞士苏黎世、日内瓦和巴塞尔（Zurich、 Geneva、Basel）的污水处理设施收集的污水样品中提取RNA用于IAV和IBV定量。先前的研究表明，污水中可检测到IAV用于研究社区传播动力学。但污水中IBV的浓度很低，经常无法检测到。作者在naica® 微滴芯片数字PCR系统上使用了IABV和RESPV4两种assay，通过逆转录数字PCR(RT-dPCR) 进行病毒核酸绝对定量。IABV assay是针对IAV和IBV的双重检测。RESPV4是一种四重检测方法，可以同时定量IAV、IBV 、SARS-CoV-2核蛋白座2(N2)和呼吸合胞病毒基质蛋白(RSV)。IAV分析使用了IABV和RESPV4 两种assay的结果，而IBV在IABV assay中阴阳性微滴分离度不够，只使用了RESPV4 assay的检测结果。实验结果：在检测时间范围内，作者能够在超过90%的采样日检测到污水中的IAV(苏黎世37/38天，从日内瓦39/42天，从巴塞尔45/50天。在污水中检测到IBV的频率较低(苏黎世7/35天，日内瓦9/33天，巴塞尔1/50天)。污水负荷数据和每周确诊病例数据都表明，每个集水区都有一个或多个IAV爆发高峰(图A)。区域层面的确诊病例数据比全国ILI（流感样疾病）更好地与污水检测值相对应 (图B)。▲图.污水与临床监测流感数据的比较。(A)用于估计Re的两个数据源。蓝色：污水检测流感平均值(点)和范围(误差线)。没有检测到病毒的天数显示为交叉点。红色：每周报告确诊病例数连接的折线。(B)同期全国每周流感样疾病发病率(橙色)和经校正的流感样疾病拭子每周流感阳性率(棕色)。结论：在这项工作中，作者提出了基于污水病毒载量的流感传播动力学量化的概念证明结果，能够在瑞士三个最大的污水集水区估计感染发病率的趋势。作者通过naica® 微滴芯片数字PCR系统定量了IAV的有效繁殖数量，也可检测到低浓度IBV。综合起来，这些数据与确诊病例数据相比，描绘了不同的流感爆发动态，基于污水的动态变化更好地符合研究时间范围内SARS-CoV-2变种造成的人口流动限制带来的流感感染趋势。艾普拜生物提供甲型流感、乙型流感检测试剂，同时提供多种病原微生物检测试剂和试剂盒，欢迎订购和咨询。个性化定制服务艾普拜生物数字PCR个性化定制服务覆盖多种检测试剂需求 ( 如鉴定、易位、突变检测、多重突变、高阶多重等 )，更多信息请联系您身边艾普拜生物工作人员或电话联系我们。

新冠病毒的快速检测对于对于病毒携带或感染者的筛查至关重要，也是影响疫情防控的关键因素。当前，实时荧光RT-PCR依然是病毒检测的主要方法，而分析科学家正尝试利用MALDI-TOF的简单、快速、准确和灵敏等特点，将Affi-BAMS这一靶向蛋白组学的研究方法应用于新冠病毒的检测和分析中。与核酸检测不同，Affi-BAMS可以特异性的检测病毒抗原的S蛋白，为新冠病毒的检测和研究提供新的思路。图1. 左图为SARS-CoV-2病毒，右图为病毒的S蛋白（spike S glycoprotein）Affi-BAMS是什么？Affi-BAMS是Affinity-Bead Assisted Mass Spectrometry（亲和磁珠辅助质谱技术）的简称，是一种利用免疫亲和技术对靶蛋白（多肽）进行特异性检测的解决方案。该方案是基于布鲁克MALDI-TOF质谱技术，由布鲁克和Adeptrix公司共同开发。Affi-BAMS将免疫磁珠，微阵列和MALDI-TOF质谱三种常见生化分析技术结合起来，可以实现多靶点的蛋白检测和定量。Affi-BAMS怎么做？生物样本首先进行细胞裂解，裂解后的蛋白溶液进行酶解，被抗体包被的磁珠加入酶解后的多肽溶液中形成悬浮液，经孵育后，目标多肽被磁珠上的抗体捕获。结合多肽的磁珠被转移至可导电的载玻片上，这一载玻片与多孔格硅橡胶垫片紧密贴合，每个磁珠被硅胶网格独立隔开，经过多孔格硅橡胶垫片的介导，磁珠在载玻片上呈微阵列分布。通过基质喷雾仪对磁珠阵列进行MALDI基质的喷涂，磁珠阵列暴露在含有MALDI基质的气溶胶里，其上结合的多肽会被洗脱到各自的微孔中。待溶剂蒸发后，洗脱得到的多肽与MALDI基质在载玻片上形成共结晶的斑点。将硅橡胶垫片移除，空气流吹走载玻片上残留的磁珠，通过MALDI-TOF分析载玻片上的每个独立的阵列斑点，可以得到相应斑点中存在的多肽的质谱信息。图2为Affi-BAMS工作流程的示意图。图2. Affi-BAMS工作流程，生物样本经过蛋白提取和酶解后，通过免疫磁珠富集目标多肽（蛋白），磁珠通过多孔格硅橡胶垫片介导，转移至导电载玻片上，通过基质喷雾仪进行基质喷涂后，目标多肽从磁珠上洗脱下来，在载玻片上形成阵列斑点，经MALDI-TOF分析以实现对靶蛋白的快速检测和定量。Affi-BAMS有何用？Affi-BAMS在靶向蛋白组学中有广泛的应用，目前已经研发出一系列试剂盒，可以实现对特定靶蛋白的检测和定量分析。以阿尔兹海默症的研究为例，图3为经过免疫磁珠富集后，正常人和患者脑脊液中β-淀粉样蛋白MALDI-TOF分析结果的对比情况，该方法可以特异性地鉴别从aa672到aa713的19个多肽片段。以其中Aβ1–40多肽为基准对其他多肽的MALDI-TOF质谱图进行归一化处理后，可以看出正常人和患者样本中β-淀粉样蛋白的含量存在明显差异。图3. 通过Affi-BAMS可以检测最多18种β-淀粉样蛋白的多肽，红色质谱图为对照组，蓝色质谱图为患者组。Affi-BAMS还能检测病毒？Affi-BAMS可以用于新冠病毒抗原的检测，使用免疫磁珠特异性结合病毒的S蛋白（spike S glycoprotein），可以实现微量样本中S蛋白的富集，大大提高质谱分析的灵敏度，富集后的蛋白采用MALDI-TOF进行分析，从而实现新冠病毒的快速检测。目前，针对于新冠病毒S蛋白的免疫磁珠已经处于最终测试阶段。图4. SARS-CoV-2的S蛋白被免疫磁珠富集后，通过MALDI-TOF检测的质谱图，上图为阳性结果，下图为阴性对照。

艾滋病病毒原位分析技术再次取得突破。美国科学家在上周召开的国际艾滋病会议上，展示了他们开发的全新检测技术及检测结果，这个被称为“分子显微镜”的探针能够准确检测到艾滋病病毒在细胞内外的隐藏之地。　　美国过敏性和传染性疾病研究所疫苗研究中心副主任瑞查得普表示，这一分子显微镜新技术堪称神奇，它的超能力完全可以洞察到艾滋病病毒在任何细胞内的蛛丝马迹，最终能帮助弄清艾滋病病毒长时间存留的谜底，从而将其从体内彻底清除。　　新技术几乎不受干扰　　目前所用的检测组织中艾滋病病毒的原位分析技术都面临共同的大难题。这些探测技术，无论是利用荧光物质作标记物，还是放射性物质作标记，在精确定位组织样本中艾滋病病毒的位置时，经常难以将周围的细胞物质与目标检测物，如艾滋病病毒的RNA和DNA区别开来。这些标记物会将细胞组织当作病毒进行错误识别，对结果分析造成背景干扰。　　据《科学》杂志网站报道，会议上展示的猴子不同组织中获得的艾滋病病毒的详细图片表明，新技术几乎没有受到任何干扰。美国国家癌症研究所弗雷德里克国家实验室的免疫学家杰克伊斯特，与拥有RNA显微镜的美国高级细胞诊断公司(ACD)合作开发出这一新技术，能分别或同时检测到组织中艾滋病病毒的DNA和RNA。得益于ACD公司独特的探针设计专利，RNA显微镜是目前最先进的RNA检测技术工具，实现了单个RNA在原位的可视化和量化，能够同时实现信号放大并降低背景干扰，可检测任何组织的任何基因。检测艾滋病病毒的分子显微镜就是在RNA显微镜的基础上开发的。　　DNA和RNA都由互补的核苷酸对构成。捕获遗传物质的传统方法都是用称为寡聚体的核苷酸长链，在组织样本中寻找与之配对DNA或RNA链并相互配对。这些寡聚体携带着标记物，当它检测到目标物后，标记物会发出信号并拍照，研究人员可从图片中找到病毒遗传物质在组织样本中的分布位置。但是这些寡聚体分子太长，它们偶尔会犯错，与其他细胞物质结合时，并不理会那些要检测的目标序列。　　分子显微镜作用原理　　伊斯特的新技术包含一种更复杂的探针系统，能完全消除寡聚体带来的误打误撞。该技术的基本原理在于，先将寡聚体切成两等分，再将这两等分送到样本内寻找目标序列，只有当被分开的两段都停留在目标检测序列附近时，它们才能分别与目标序列成功配对后再重新连接起来。这意味着，寡聚体的两段只有遇到艾滋病病毒时才能分别配对并重新相遇，其他细胞物质再也无法造成干扰。　　艾滋病病毒本身是RNA病毒，但它会转换成DNA形式，以便随时“潜入”人类染色体。伊斯特还与病毒学家杰弗瑞立夫逊合作，成功开发出可视化艾滋病病毒DNA的DNA显微镜。这些潜伏的病毒前体会融入人体细胞，并在受到免疫系统或抗逆转录病毒药物攻击前安然隐藏数十年之久，抗逆转录病毒无法消除艾滋病传染并治愈艾滋病患者的一大重要原因，就是这些将病毒前体“隐藏”起来的细胞的大量存在。　　不放过任何一个病毒　　伊斯特、立夫逊和同事们向一些猴子注射了猿类艾滋病病毒，然后对这些猴子体内的许多组织进行了原位分析。结果表明，RNA显微镜和DNA显微镜能清楚区分出细胞中潜伏的艾滋病病毒前体(即病毒DNA)、病毒RNA以及细胞外的病毒。伊斯特说：“我坚信我们的新技术不会放过任何一个病毒，它完美地将灵敏性和特定性集于一身。”　　这些全新的分子显微镜能够克服治愈艾滋病道路上的几大障碍。第一大障碍是无法检测出接受抗逆转录病毒疗法的艾滋病患者血浆中的艾滋病病毒，因此研究人员难以评估一些艾滋病新疗法的具体效果，新显微镜技术将是克服现有技术障碍的有力补充。另一大障碍是无法确切知道病毒前体隐藏在体内何处，新技术能揭开这一由来已久的谜底，有助于大大缩小感染艾滋病病毒的细胞数量，更有针对地治疗患者。

埃博拉（Ebola virus）又译作伊波拉病毒，这种病毒来自“Filoviridae”族。“埃博拉”属于丝状病毒，这是一种十分罕见的病毒，1976年在苏丹南部和扎伊尔即现在的刚果（金）的埃博拉河地区发现它的存在后，引起医学界的广泛关注和重视，“埃博拉”由此而得名。 埃博拉病毒是引起人类和灵长类动物发生埃博拉出血热（EBHF）的烈性传染病病毒，其致死率高达50%至90%，[LD{1] 是当今世界上最致命的病毒性出血热，感染者症状与同为纤维病毒科的马尔堡病毒极为相似，人类感染埃博拉病毒几天后会出现发烧、头疼、关节和肌肉及喉咙疼痛、周身虚弱等症状，许多患者还会出现体内或体外出血；另有人打嗝、眼睛又红又痒。感染一周后病人会胸痛、休克，甚至死亡。 埃博拉病毒包含扎伊尔埃博拉病毒、苏丹埃博拉病毒、雷斯顿埃博拉病毒、塔伊森林埃博拉病毒、本迪布焦埃博拉病毒5种类型。近期爆发的是最厉害的扎伊尔埃博拉病毒。该病毒不会经由空气进行人与人的传播，但能通过汗液、血液、唾液以及性接触等途径进行传播。一旦感染，埃博拉病毒会迅速瓦解体内的免疫系统细胞，并进行快速繁殖，对身体内细胞进行攻击，最终导致多器官功能衰竭。美国范德比尔特大学感染病学专家 William Schaffner 博士认为，埃博拉病毒非常危险，即使防护做的再完美，也存在感染的风险。 根据WHO官方网站数据，截止2014年8月1日，西非埃博拉病毒出血热总共感染（含疑似）1,323人，其中729人死亡。疫情涉及4个西非国家：几内亚、利比里亚、塞拉利昂和尼日利亚，几内亚死亡人数最多（339人），塞拉利昂感染人数最多（533人）。 为了防止埃博拉病毒的进一步肆虐，我国的各口岸也都已经提高了戒备等级，保证病毒不能轻易传播入国内人群；各疾病预防控制中心也在积极准备，一些疾控中心已经具备了检测病毒的能力。[LD{2] 8月4日，国家质检总局、外交部、国家卫计委、国家旅游局联合发布关于防止非洲埃博拉出血热传入我国的公告。中国质检总局下发《关于加强口岸埃博拉出血热疫情防控工作的通知》，要求各检验检疫局切实做好口岸卫生检疫工作，严防埃博拉出血热疫情传入中国。 由于现阶段尚无有效疫苗，只能通过维持患者体内体液和电解质进行辅助治疗。因此，早期的迅速诊断和隔离就显得非常重要。使用实时荧光PCR检测方法是目前最快也是最准确的检测诊断方法。罗氏诊断生命科学部凭借其在生命科学领域的悠久研究历史及经验，针对目前正在迅速传播的扎伊尔埃博拉病毒（Zarie EBOV）及时研发并提供了全面的检测解决方案：从MagNA Pure全自动核酸提取系统或High Pure系列手动提取试剂盒上进行血清或血浆的核酸提取，使用成品化的扎伊尔埃博拉病毒检测试剂盒到结合罗氏诊断全线LightCycler家族荧光定量PCR仪进行病毒核酸定量，整个过程最快在2小时内即可完成。罗氏诊断最新的埃博拉病毒检测试剂盒中含有引物、探针、内对照以及临床检测最重要的阳性质控，符合澳大利亚职业安全和卫生管理局危险告知标准以及欧盟包装安全标准。 埃博拉来势汹汹，罗氏诊断将积极与中国政府与各研究单位紧密合作，配合有关部门在第一时间做好捍卫工作，将其危害降低到最低程度。

如果有能嵌入面料的核酸生物传感器，那么其可以检测空气中的细菌、病毒病原体，包括新冠病毒吗?根据英国《自然生物技术》杂志29日发表的一篇论文，美国科学家团队使用CRISPR技术成功研发了可穿戴、冻干、无细胞的合成生物学传感器，其检测结果不但能与被视为金标准的实验室结果一致，还可以嵌入柔性基质中，用于实时、动态监测目标病原体。在不久的将来，这项技术能与口罩结合，供工作环境病原体暴露风险较高的人群使用，如基层医护人员等。　　利用合成生物学技术，检测病原体的核酸生物传感器可以达到很高的灵敏度和准确性。这类诊断工具包含可检测病原体核酸的基因编码电路，常在传统的即时诊断中用于检测新冠病毒这类病原体。　　如果将这种合成生物学技术整合到可穿戴设备中，则可以极大改善对病原体或毒素的监测。不过，尽管研究人员多次报道将冻干后的病原体检测电路嵌入到柔性的服装面料中，之前也研发过能封装有感知能力细菌的面料，但是，工程改造微生物的整合和保持难度都非常大。　　现在科学家们认为，无细胞合成生物学传感器能克服这些限制。此次，美国麻省理工学院研究人员詹姆斯柯林斯及其同事，制作了一组使用CRISPR技术的可穿戴、冻干、无细胞的合成生物学传感器，这些传感器通过再水化激活，能发现病毒特异性遗传物质的存在。　　可穿戴、无细胞合成生物学穿传感器示意图。图片来源：《自然生物技术》在线版　　实验表明，目前这些可穿戴传感器的表现，与被视为金标准的实验室检测结果保持了一致，而且，这一传感器可以嵌入硅橡胶和硅织物等柔性基质中，实现对目标病原体暴露的实时、动态监测。　　研究人员表示，这一技术还能与口罩结合，检测空气中传播的新冠病毒。而在可穿戴面料中成功嵌入合成生物学传感器，正是创造多功能智能服装的第一步，这些服装有望实现生物医学等更大范围的应用。

2020年伊始，由新型冠状病毒（2019-nCoV）所引发的肺炎疫情牵动着每一个人的心。随着各个医疗及隔离场所疫情防治工作的逐步展开，在此过程中产生的各种废水及废弃物对环境生态所产生的影响也逐渐受到关注。为了避免污染物对水源地、地表水、地下水和土壤等产生的污染和破坏，1月31日生态环境部印发了《应对新型冠状病毒感染肺炎疫情应急监测方案》，研究部署应对新型冠状病毒感染肺炎疫情应急监测工作，防止疫情次生灾害对生态环境和人民群众造成不良影响。在该应急监测方案中，明确提出加强饮用水水源地水质预警监测，方案中表明在疫情防控期间，在饮用水水源地常规监测的基础上，增加余氯和生物毒性等疫情防控特征指标的监测，控制风险，切实保障人民群众饮水安全。Modern Water 作为先进水质生物毒性监测设备的所有者，所有用的Microtox® 生物毒性检测技术起源于20世纪60年代，是生物毒性检测行业内的“黄金标准”。这项技术应用生物传感原理（发光细菌法），可对水中广谱污染物质进行快速测定。产品Microtox® 系列检测产品包括：Microtox® LX/Microtox® M500 台式毒性仪，适用于实验室；Microtox® FX/Delatox 便携式毒性仪，适用于应急监测和小型水厂化验室；Microtox® CTM 在线毒性仪，适用于水源地监测，大型水厂进/出水口监测。应用Microtox® 系列生物毒性分析仪自2007年进入中国以来，广泛应用于水源地、净水构筑物出水、出厂水的应急监测，在环境监测、供水、疾控和公共卫生管理等领域中发挥了重要作用。2008年北京奥运会，2010年广州亚运会，2010年上海世博会均采用了Microtox毒性检测仪；2008年汶川地震期间，国家环监总站、震区及国内多家检测机构应急小组均配备了Microtox便携毒性仪对震区进行了全面全程的水质毒性监控；美国911事件以后，美国各水司、水厂将Microtox® 毒性仪大量应用于公共场所、饮用水源、出厂水等的检测。Microtox® 生物毒性检测技术通过了工业界、研究单位和政府的验证，截至05年已有超过500篇的关于Microtox系统应用和评价的论文。

全球新冠疫情肆虐之际，也让很多人了解到了核酸检测，目前它已经成为新型冠状病毒检测的“金指标”，早在5月11日，武汉市提出对全市1000万左右的市民进行全面检测，其具有早期诊断、灵敏度和特异性高等特点。也在这场疫情战中起到了关键性的作用。Avantor作为全球高质量的实验室产品供应商，为科学事业提供优质的实验产品和解决方案，助力病毒检测 ，与世界科学实验者一起抗击病毒。那么病毒检测包括核酸检测的过程是什么样的呢？本期小编将带大家了解检测的过程。病毒采样：提取病人唾液鼻咽拭子，并保存于病毒采样管核酸提取：裂解细胞，提取样本中的遗传物质，并且防止遗传物质降解通常核酸裂解液的主要成分是异硫氰酸胍，能迅速破碎病毒使核蛋白与核酸迅速分离，同时抑制释放出的核酸酶活性，保证核酸一级结构的完整性，提高核酸提取效率。EDTA作为螯合剂，能防止Mg，Ca等金属离子激活核酸酶，同时，盐酸胍能抑制核酸酶，DTT能防止延缓酶的失活。扩增：由于原始样本中的核酸含量非常低，所以需要通过扩增将核酸浓度扩大，使其能够被后续检测方法检测到。检测：根据检测结果判断样本是否含有病毒。了解VWR Life Science（原Amresco）在病毒检测过程中的相关产品。点击产品名称，查看更多信息。产品列表品名货号异硫氰酸胍0380EDTA0322EDTA二钠盐 0105Tris0497Tris盐酸盐0234盐酸胍E424

中国医院协会临床微生物实验室专业委员会通信作者：徐英春1,2，胡继红3作者单位：北京协和医院1检验科2疑难重症及罕见病国家重点实验室 3国家老年医学中心 中国医学科学院老年医学研究院 北京医院 国家卫生健康委临床检验中心项目基金：中国医学科学院医学与健康科技创新工程（2021-I2M-1-038）文章来源：协和医学杂志, 2022,13(3):402-411.独家访谈：徐英春教授新型冠状病毒肺炎（COVID-19）是由新型冠状病毒（SARS-CoV-2）感染引起的一类呼吸道传染性疾病，自2019年12月疫情暴发以来，截至目前仍在全球广泛流行，疫情防控工作任重道远。SARS-CoV-2实验室检测可为疫情防控方案的制订提供重要参考，其中核酸检测阳性是SARS-CoV-2感染者的确诊依据[1]。为进一步优化SARS-CoV-2检测策略，根据疫情防控需要，国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制综合组于2022年3月10日印发了《新冠病毒抗原检测应用方案（试行）》[2]，决定推进“抗原筛查、核酸诊断”的监测模式，在核酸检测基础上增加抗原检测作为补充，以提高SARS-CoV-2感染者“早发现”的能力[3]。全球范围内，SARS-CoV-2抗原快速检测已获得广泛认可，截至2022年4月7日，我国国家药品监督管理局（NMPA）已批准23款抗原快速检测试剂[4]，通过世界卫生组织（WHO）紧急使用清单（EUL）[5]、美国食品药品监督管理局（FDA）紧急使用授权（EUA）[6]及欧盟（CE）认证[7]的抗原检测试剂盒分别有5款、48款和203款。基于目前实验室检测SARS-CoV-2积累的经验和常见问题，并结合国内外最新研究进展和应用实践，中国医院协会临床微生物实验室专业委员会组织相关领域专家共同制定了《新型冠状病毒抗原快速检测专家共识（2022）》。本共识明确了目前SARS-CoV-2抗原快速检测方法的性能特点，可为不同场景下的快速抗原检测应用、结果解读及处置提供技术支撑，促进疫情防控中抗原快速检测的专业化、规范化和标准化。共识核心意见(1) SARS-CoV-2抗原检测主要靶标为N蛋白，以保证较高的检测敏感性、特异性和对病毒变异株较高的包容性（共识度：100%）。(2) 抗原快速检测主要采用免疫层析技术（共识度：100%）。(3) 抗原检测特异性较高，敏感性受患者疾病严重程度、采样时机、样本类型、样本处理技术、样本病毒载量、病毒变异情况和检测试剂盒差异等因素的影响（共识度：100%）。(4) 抗原检测方法主要推荐用于发病早期、病毒载量较高的感染者（共识度：100%）。(5) 抗原检测主要适用标本类型为鼻腔拭子、鼻咽拭子和口咽拭子等（共识度：100%）。(6) 抗原、核酸和抗体检测结果解读及处置建议，根据被测者临床症状、疫苗接种史及接触史不同而采取不同措施（共识度：98.63%）。(7)对于疑似病例，抗原检测结果无论阳性或阴性，均应进行核酸检测确认（共识度：98.63%）。(8) 抗原检测推荐在高风险、高流行区域人群中应用，一般人群不建议进行抗原检测（共识度：94.52%）。(9) 抗原检测主要适用场景：基层医疗卫生机构就诊的有症状人员、隔离观察人员、有自我检测需求的社区居民等（共识度：98.63%）。(10) 抗原检测其他适用场景：高风险工作人员监测，封闭/半封闭场所人员监测，疫情流行期间发热门诊、急诊聚集患者快速分流管理等（共识度：98.63%）。(11) 抗原检测应选择经NMPA审批的试剂盒，严格按试剂说明书操作（共识度：100%）。(12) 医疗机构开展抗原检测应进行试剂性能评价和质量控制（共识度：100%）。(13) 建议对抗原自测流程及结果进行有效管理，以保障检测的准确性和对疫情的及时监控（共识度：100%）。1 共识形成方法本共识由中国医院协会临床微生物实验室专业委员会发起，共识专家组由专委会委员及其推荐的相关领域专家共同组成，并通过共识形成会议法达成共识意见[8]。2022年2月专家组召开线上会议就SARS-CoV-2抗原快速检测主题拟订关键性问题和提纲，并进行任务分工，组建共识撰写组、编审组、外审组和秘书组，成员来自医学检验、临床医学、感染控制、公共卫生及体外诊断产品研发等领域的相关专家。共识撰写组以“新型冠状病毒抗原”“新型冠状病毒肺炎”“severe acute respiratory syndrome corona-virus 2 antigen”“SARS-CoV-2 antigen”“coronavirus disease 2019”和“COVID-19”为关键词，检索2019年12月至2022年3月PubMed、Embase、Cochrane Library、MedRxiv、中国知网、万方数据知识服务平台和维普数据库中的中、英文文献，以及国家卫生健康委员会、NMPA、WHO、FDA、欧洲疾病预防与控制中心（ECDC）及国内外学术组织现行的感染控制、生物安全相关标准、指南和共识等，经去重处理及阅读摘要和/或全文，最终纳入符合本共识主题的文献45篇。2022年3月至4月，撰写组经多次会议讨论及反复修订，统一意见后形成共识草案，然后由编审组专家对草案进行函审并提出书面意见，共收到函审意见407条（含重复意见），全部意见经撰写组逐条讨论确认，采纳其中的284条，草案修订后再次提交外审组专家审核。共形成13条共识核心意见，由撰写组、编审组和外审组专家进行“背对背”无记名投票，投票等级分为：a）完全同意；b）基本同意；c）不确定；d）不太同意；e）完全不同意。如a、b、c、d中任一项票数超过50%，或a+b、c+d票数超过70%，即视为达成共识；其余情况均视为未达成共识，相关意见进入下一轮投票。以a+b或d+e票数占回收有效票数的百分比，作为共识意见的专家共识度[9]。限于目前对新冠病毒抗原快速检测的认知程度及参与共识编写人员的专业背景，本共识的制订可能存在局限性。2 新型冠状病毒抗原检测方法及主要性能2.1 技术原理抗原检测是指应用特异性抗体直接对样本中的病原体抗原进行检测，检测结果可作为发病早期是否感染的直接证据。SARS-CoV-2的主要结构蛋白包括核衣壳蛋白（N）、刺突蛋白（S）、胞膜蛋白（E）和囊膜蛋白（M），部分研究表明SARS-CoV-2存在血凝素酯酶蛋白（HE），但目前仍存在争议[10-11]。SARS-CoV-2抗原检测的主要靶标是N蛋白，极少数针对S蛋白[12]。N蛋白是SARS-CoV-2的核心成分，其与病毒基因组RNA结合后将RNA包装为核糖核蛋白（RNP）复合体。由于N蛋白合成数量多，具有多个特异性抗原决定簇且稳定性高，因此N蛋白是理想的抗原检测靶标，具有较高的检测敏感性和特异性[13-14]。S蛋白由S1、S2两个功能亚基组成，其中S1亚基关键结构域S1-受体结合域（RBD）和/或S1-N末端结构域（NTD）可与宿主细胞的血管紧张素转换酶2(ACE2)受体结合，将病毒和宿主细胞的细胞膜融合，介导病毒进入宿主细胞[15-16]。SARS-CoV-2变异株突变位点多位于S蛋白，采用抗N蛋白联合抗S蛋白双抗体检测，虽可提高检测的敏感性，但如果病毒突变速度较快、类型较多，针对变异株S蛋白的抗原检测敏感性即会下降。因此，选择对SARS-CoV-2变异株具有更高包容性的检测靶标，对于保证检测的高敏感性尤为重要。此外，由于SARS冠状病毒（SARS-CoV）与SARS-CoV-2的N蛋白序列相似度高达91%[17]，二者存在抗原与抗体交叉反应。有研究对7款SARS-CoV-2抗原检测试剂性能评价后发现，所有试剂均对SARS-CoV有交叉反应，但对其他4种人类流行冠状病毒（HcoV-229E、HCoV-NL63、HCoV-OC43和HCoV-HKU1）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）基本无交叉反应[18]。由于目前并非SARS-CoV的流行期，SARS-CoV-2抗原试剂仍具有较高的特异性。2.2 技术分类与特点SARS-CoV-2抗原检测主要采用基于免疫层析技术的快速检测方法，具有检测快速、操作便捷等特点。非专业人员亦可操作，通过目视或使用便携设备即可判读结果，可快速、便捷地对有症状疑似人员、隔离观察人员和有自我检测需求的人员进行筛查，以便及时采取相应措施，助力疫情防控。根据检测试剂所使用的标记物，可分为胶体金免疫层析法、乳胶免疫层析法和荧光免疫层析法（表1）。此外，基于新型传感器和生物传感器技术的快速检测方法可实现数十秒至数分钟内完成SARS-CoV-2抗原检测，并保证检测的高敏感性[19-20]，但目前尚未进入商品化与临床验证阶段。表1常用新型冠状病毒抗原快速检测方法及技术特点2.3 技术性能SARS-CoV-2抗原检测试剂具有较高的特异性，但敏感性在不同临床评价研究中存在较大差异，其影响因素包括患者疾病严重程度以及采样时机、样本类型、样本处理技术、样本病毒载量、不同时期变异株流行情况、检测试剂盒差异等[21-23]。抗原检测敏感性与感染者病毒载量呈正相关，对于传染性强的高病毒载量样本，检测的敏感性更高[23]。系统综述和Meta分析显示，抗原检测对SARS-CoV-2核酸扩增循环数（Ct）＜20、＜25、≥25和≥30样本的总体灵敏度分别为96.5%（95% CI：92.6%～98.4%）、95.8%（95% CI：92.3%～97.8%）、50.7%（95% CI：35.6%～65.8%）和20.9%（95% CI：12.5%～32.8%）[24]。因此，SARS-CoV-2抗原检测主要推荐用于发病早期、病毒载量高的感染者[14]。此外，可通过提高检测频次的方式提高阳性检出率，有研究显示检测频率为每3天一次或更高时，抗原检测与核酸检测对感染早期患者的总体灵敏度相当（均＞98%）；对处于病毒培养阳性阶段的感染者，若每天进行抗原检测，其灵敏度约为90%[25]。2.4 不同类型样本间的检测性能差异SARS-CoV-2抗原检测的样本类型主要包括鼻腔拭子、鼻咽拭子和口咽拭子等，针对下呼吸道样本、唾液、口腔液、血清等样本的抗原检测研究正在开展中[14]。不同类型样本的SARS-CoV-2抗原检出率存在差异，其中鼻腔拭子和鼻咽拭子的检测敏感性最高[24,26]。近期一项荟萃分析显示，常见样本的SARS-CoV-2抗原检测敏感性由高至低分别为鼻腔拭子（83%）、鼻咽拭子（71%）、口咽拭子（69%）和唾液（68%）[26]。血清中的SARS-CoV-2抗原一般在感染急性期（抗体产生前）出现，相较呼吸道样本，血清样本可降低样本采集因素对于检测结果的影响，具有一定诊断价值[27-28]。目前，在国内获批上市的SARS-CoV-2抗原检测试剂适用样本类型为鼻腔拭子、鼻咽拭子和口咽拭子，建议依据产品说明书推荐的标本类型进行检测。不推荐使用棉拭子，鼻腔拭子采样时应注意从双侧鼻腔采集。2.5 变异株抗原检测性能SARS-CoV-2变异株抗原检测的性能主要受病毒蛋白变异、检测试剂靶点及受检者人群中变异株流行情况等影响。SARS-CoV-2变异株突变位点多发生于S蛋白编码基因，N蛋白具有更高的稳定性，且N蛋白突变位点多集中在N-末端，而抗原检测试剂靶点多位于N蛋白C-末端，对检出率的影响较小。目前，对于阿尔法(Alpha)、贝塔(Beta)、德尔塔（Delta）等国际流行变异株，未发现抗原检测试剂对其检测性能产生显著影响[29-30]。奥密克戎（Omicron）变异株于2021年11月首次在南非发现，该变异株在S蛋白处发生了30多个突变，其中15个突变位点位于RBD，变异后的病毒传染性显著提升[31-32]。作为目前的主要流行株，尚未出现Omicron变异株 N蛋白编码基因存在明确影响抗原检测性能的缺失（如Del31-33）和突变（如P13L）。虽然少量研究提示，抗原检测试剂对Omicron变异株的检测敏感性有所下降，但多数研究显示多种抗原快速检测试剂对Omicron和Delta变异株的检测性能相当[33-35]，灵敏度分别为22.2%~88.9%和52.9%～91.2%[34]。由于不同抗原检测试剂间存在性能差异，实验室应对所采用试剂进行充分评估，并密切关注SARS-CoV-2毒株变异趋势及对抗原检测可能产生的影响。2.6 假阴性与假阳性影响因素假阴性影响因素[36]：（1）样本病毒载量较低；（2）检测时间处于窗口期；（3）标本采集、运输、保存或裂解不当；（4）检测试剂敏感性低；（5）检测过程中操作不当；（6）未严格按试剂说明书规定的时间判读结果；（7）钩状效应（抗原抗体比例不合适）。假阳性影响因素[37-38]：（1）检测试剂的特异性受限，发生了交叉反应；（2）样本或试剂污染；（3）试剂阳性设定的判定值过低；（4）检测过程中操作不当；（5）在试剂说明书规定时间之后超时判读结果。2.7 抗原、核酸和抗体检测结果解读及处置建议采用抗原、核酸和抗体检测进行SARS-CoV-2感染实验室诊断时，其结果解读及后续处置建议详见表2。表2疫情流行期间新型冠状病毒抗原、核酸、抗体检测结果解读及处置建议[1-2]由于抗原检测的方法学局限性，其检测敏感性低于核酸检测，因此抗原检测不能用于疫情“清零”策略的筛查目的。核酸检测阳性是SARS-CoV-2感染的确诊依据[1]，如被测者核酸阳性，无论抗原与抗体检测结果是阳性还是阴性，均需按照SARS-CoV-2感染者或COVID-19确诊患者的标准采取相应措施[2]。3 抗原检测应用策略SARS-CoV-2抗原检测（包括自我检测）能有效提高检测覆盖范围，将关口前移，是对公共卫生防控的有益补充，已成为多个国家或地区疫情防控的重要手段[1,29,37]。依据《新冠病毒抗原检测应用方案（试行）》[2]和《关于印发新型冠状病毒肺炎诊疗方案（试行第九版）》[1]，SARS-CoV-2抗原检测主要适用场景、应用及处置策略见图1。图1新型冠状病毒抗原快速检测主要应用场景与处置建议[1-2]需特别注意，虽然SARS-CoV-2抗原检测具有较高的特异性，但在疫情低流行区域，广泛的人群抗原检测可能出现一定比例的假阳性，因此抗原检测推荐在高风险、高流行区域人群中应用，一般人群不建议进行抗原检测。对于已出现呼吸道、发热等临床症状的人员，仍建议至医疗机构就诊、核酸检测；明确密接、次密接等流行病学史人员，应尽快主动按当地疫情防控管理要求进行上报。3.1 基层医疗卫生机构检测受限于实验室场地、人员配备、检测设备和物流运输等条件，乡村诊所、乡镇卫生院、社区卫生服务中心等基层医疗机构常无法在短时间内进行SARS-CoV-2核酸检测，并快速获得检测结果，而抗原快速检测试剂可常温储运，且操作便捷、检测快速，为可疑人群的快速筛查提供了便利工具。虽然抗原检测的敏感性不如核酸，但可有效提高对疑似感染者的排查效率，对于疫情的有效防控具有重要意义[39-40]。抗原检测适用人群：至基层医疗卫生机构就诊，伴呼吸道、发热等症状且出现症状的时间不足5 d的人员。具体技术人员、环境与设施要求、人员配置与防护、样本采集流程与方法、样本管理规范、抗原检测流程、结果报告与处置等参见《新冠病毒抗原检测应用方案（试行）》[2]及其附件1《基层医疗卫生机构新冠病毒抗原检测基本要求及流程》[41]。目前，SARS-CoV-2抗原检测试剂在我国尚处于应急研发和特定情形人员的应用阶段，为满足疫情防控需求，NMPA紧急批准了部分SARS-CoV-2抗原检测试剂的使用。医疗机构在开展抗原检测时，需加强质量管理，应选择经NMPA审批且相关研究证实、性能符合临床检测要求的产品。在临床应用前，原则上应按定性免疫学试剂要求进行性能评价[42]。目前各级临床检验中心暂未开展室间质评活动，国内尚无SARS-CoV-2抗原商品化第三方质控品，必要时可使用中国食品药品检定研究院研发的“新型冠状病毒抗原检测试剂国家参考品”作为第三方质控品。出于生物安全考虑，不建议生物安全防护BSL-2级及以下实验室使用患者的阳性样本作为质控品。对于不具备试剂性能评价条件的基层医疗机构，可在检测中通过试剂内置质控（C线）评价试剂的有效性，质控合格方可报告，失控结果应更换试剂进行复检[14]。

近日，大连化物所化学传感器研究组(106组)冯亮研究员团队与蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组(02T5组)刘宇研究员团队合作在病毒核酸快速检测研究中取得新进展。团队发展了一种低成本、快速和便携式病毒检测策略，该策略依赖蛋白功能化修饰的纸基对荧光信号的生物正交富集，辅以实验室自制的微型DNA加热装置和手持荧光检测仪，可以实现对病毒核酸阴阳性的快速区分。 　　实时荧光定量PCR(qPCR)以及一些恒温扩增检测手段(RPA、LAMP等)在病毒检测的准确性和灵敏度方面都具有很大的优势，然而，其操作高度依赖昂贵的分析仪器和训练有素的工作人员，极大阻碍了在发展中国家以及资源有限地区的应用。纸基比色传感器以其成本低廉，构建简单，检测快速等优势引起研究者们的广泛关注。 本工作中，合作团队提出一种基于功能化纸基比色传感器的病毒检测新策略，通过在纸基上修饰以TR512多肽为核心的融合蛋白，创新性的将TR512多肽与Texas red荧光团之间的生物正交化学反应，转化为功能化纸基上的信号放大，并将该功能化纸基与自制的微型扩增加热装置和手持式荧光检测仪相结合，实现了对预扩增核酸溶液的生物正交富集，提高了检测灵敏度，极大缩短了检测周期。团队将该策略成功应用于不同的病毒核酸(HBV、ASFV、HPV16、HPV18等)阳性序列的检测中，以及乙肝病毒核酸(HBV)实际样品的检测中。 　　冯亮团队长期致力于传感器敏感膜的表界面调控及分析物分子的高效捕获研究，在纸基传感器快速检测方面进行了深入探究并部分取得了产业化应用：通过静电吸附作用固载显色底物，在纸纤维表面形成敏感薄膜，基于酶介导过氧化氢显色实现赭曲霉毒素的可视化检测(Anal. Chem.，2022；Biosens. Bioelectron.，2021)；通过化学交联方式在纸纤维表面构建富含苯基的硅胶溶胶凝胶微孔通道，实现三氯杀螨醇农药残留的微量检测(Food Chem.，2022)；通过物理包埋方法在纸纤维表面包埋显色剂形成三点纸基检测阵列，实现自来水中Cu2+，Fe2+，Cl-的同时快速检测(Sens. Actuators B: Chem.，2019)。 　　相关研究成果以“A Novel Virus Detection Strategy Enabled by TR512-Peptide-Based Bioorthogonal Capture and Enrichment of Preamplified Nucleic Acid”为题，发表在《分析化学》(Anal. Chem.)上。该工作的第一作者是106组博士研究生朱明珍。上述工作得到中科院科研装备研制等项目的资助。

新冠病毒核酸检测的重要性不言而喻。那么，随着一天中的时间和人体昼夜节律的变化，病毒的行为会有所不同吗？是否会影响新冠肺炎核酸检测结果呢？据26日发表在《生物节律杂志》上的论文，美国范德堡大学的研究人员发现，新冠病毒核酸检测灵敏度随人体昼夜节律而异。人们在中午进行检测获得准确阳性测试结果的可能性比晚上高2倍。　　研究人员认为，这些数据支持一种假设，即新冠病毒根据自然昼夜节律在人体内的行为有所不同，对其他病毒和细菌感染的研究也暗示了这一点。受感染的细胞将传染性病毒颗粒释放到血液和黏液中，即“病毒散播”，在中午似乎更活跃，因为人体生物钟调节了免疫系统。　　研究结果表明，晚上8点以后病毒载量较低。如果人们选择在这时候进行检测，出现假阴性结果的可能性可能会更高。这不仅不利于患者本人及时接受相应的治疗，也会给周围人群的健康带来威胁。此外，在下午“病毒散播”的高峰期，潜在新冠肺炎患者更有可能与他人接触，也可能会引起病毒传播。　　研究人员表示，还需要进一步的研究来证实导致新冠病毒白天活跃的原因。范德堡大学生物科学教授卡尔约翰逊说，对感染新冠肺炎的患者进行实验测试，看看个人在一天中是否以不同的方式排出病毒，这将对公共卫生产生重要影响。　　研究人员认为，可以利用时间因素来最大限度地发挥干预策略甚至疫苗策略的有效性。为了提高结果的准确性，应该在一天中的最佳时间进行检测，同时还能避免假阴性测试结果的出现，尤其是在无症状感染人群中。