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冷冻浓缩仪原理

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冷冻浓缩仪原理相关的资讯

  • 真空冷冻离心浓缩仪实验室设备提高实验的操作应用效率
    真空冷冻离心浓缩仪是一款常用于化学分离和纯化技术应用的实验室设备;该技术可通过将化学物质置于离心管中,利用离心力可将混合物中的各种化学物质分离开来,提高纯度。冷冻型的设备则是利用低温环境和真空状态可使化学物质在离心管中迅速冷冻、快速蒸发,从而提高实验的操作应用效率。本篇文章将深入探讨这款低温冷冻型离心浓缩设备的原理应用。      冷冻真空离心浓缩仪利用离心和真空技术可将化学混合物中的化合物迅速分离,从而达到对样品的纯化和浓缩目的;该设备被广泛应用于分析化学、医药、生物学等行业领域。冷冻型的实验设备相比较于其他款,它是利用低温环境和真空状态分离化学物质,并将它们冷冻起来以提高实验效率。  在使用冷冻真空浓缩设备时,需要先将样品置于离心管中,塞进盖子中央的叶轮上,接着运转机器,对离心管内的化合物进行旋转,在加入真空度后,通过减压和外部加热的方式来提高该系统内的温度以及气体流通性;随后可将化合物冷冻蒸发出来,达到样品的浓缩效果。    真空冷冻离心浓缩仪是一款常用于制备RNA和DNA等高浓度浓缩样品的实验设备,该设备使用温度较低功率较少的真空泵和离心机器,可有效提高了实验对样品的纯度和浓缩效率;实验设备基于不同的原理应用,旨在提高化学物质的纯度;而冷冻型真空离心浓缩仪则比其他设备的应用更为高效。
  • 【瑞士步琦】当你浓缩多肽与蛋白质时,你会是“旋转蒸发党”还是“冷冻干燥党”呢?
    浓缩多肽与蛋白质你会是“旋转蒸发党”还是“冷冻干燥党”呢?多肽与蛋白质应用”多肽和蛋白质是自然界中四种基本分类的大分子之一。人们经常研究它们作为潜在的治疗药物。在合成蛋白质后,分离蛋白质是一个关键步骤。为了确保高效的分离步骤,了解两种常用干燥技术——旋转蒸发和冷冻干燥之间的差异非常重要。蛋白质在几乎所有细胞的基本过程中起着重要作用,其中大部分信息都被编码在核酸中,并由蛋白质控制。蛋白质由称为氨基酸的组成单元构成。在溶液中,蛋白质形成高度有序的三维结构,这与它们的生物功能密切相关。肽是蛋白质的较小版本,因为它们包含较少的氨基酸。尽管肽的三维结构比蛋白质的结构简单,但其生物重要性并不少于蛋白质。蛋白质和多肽在身体中负责各种生命必需功能和过程的重要分子,包括信号转导、心率调节、食物摄入和生长。它们在生物医学、生物技术、生物工程、药物发现、药物传递、化妆品和营养等领域中也被广泛应用。例如胰岛素或阿斯巴甜等分子是蛋白质和多肽在药物和食品应用中被使用的众所周知的例子。在药物开发中,蛋白质和多肽通常被认为是对抗各种疾病的有吸引力的治疗药物。在生物医学或生物化学研究中,这些生物分子可以用作定量研究的参考物质、细胞培养的生长因子和细胞因子、生化分析中的活性酶、分子移动的载体蛋白质、阻断通路的抑制剂或与抗体配对使用的抗原。通过化学合成、利用重组微生物或无细胞表达系统进行制造,以及通过从其自然环境中提取,可以实现蛋白质和多肽的制造。最适合的制造策略在很大程度上取决于所需分子的大小和化学特性。1多肽与蛋白类样品的常见浓缩法制作多肽或蛋白质需要进一步处理以达到高纯度,进行下游分析。处理步骤包括纯化、浓缩和制剂,如下图所示:浓缩步骤可以通过几种技术来完成,如喷雾干燥、旋转蒸发、并行蒸发和冻干。在这篇文章中,我们将重点介绍旋转蒸发和冻干这两种技术,并以 R-300 旋转蒸发仪和 L-200 冷冻干燥机为例,对比二者的区别,找出最合适多肽和蛋白质的浓缩方法。旋转蒸发仪自从 50 年代末期,旋转蒸发仪就被广泛应用于实验室中,它是一种已知、可靠且坚固的技术。步琦作为其发明者,一直致力于开发最高质量和最强性能的旋转蒸发仪。旋转蒸发的过程是溶剂的减压蒸发,然后溶剂蒸汽再冷凝回液体。R-300 旋转蒸发仪加热温度室温 -220℃水浴锅大小5L旋转速度10-280 rpm标准冷凝器面积1500 cm² 升降方式电动升降支持泡沫传感器/自动蒸馏传感器/蒸汽传感器支持7种不同冷凝器支持开源型 API,能接入第三方控制设备冷冻干燥冷冻干燥,又称为冻干,是一种最温和的干燥方法。冷冻干燥的原理基于物质直接从固态转变为气态的过程,称为升华。首先,将产品冷冻,然后在降低的压力环境中通过升华进行干燥。低压使冻结溶剂直接转变为蒸汽。在大多数冷冻干燥应用中,从产品中去除的溶剂是水。但是,其他溶剂如乙腈在一定程度上也可以使用。L-200 冷冻干燥机制冷能力≥ 6公斤/24 小时冷阱温度-55 摄氏度制冷面积1410 cm² 抽真空时间(至0.1mbar) ≤ 10 分钟系统最低真空度≤ 30 微米汞柱模块化干燥室,丙烯酸室/阻塞装置/加热隔板/多歧管自由组合支持 Infinite-Control TM 可远程监视样品状态2对比旋转蒸发仪和冷冻干燥机的关键参数旋转蒸发和冷冻干燥之间的主要参数区别:_旋转蒸发仪冷冻干燥机可以达到的最小压力最小可达5 mabr最小可达 0.03 mbar温度范围通常为 40-60℃室温应用范围干燥或浓缩干燥样品准备无需需预冻旋转蒸发仪蒸发不同溶剂的速度:_常压下溶剂的沸点(℃)蒸发速率(L/h)水1000.75甲醇64.71.8乙醇78.371.8* 蒸发速度测得条件:水浴锅60℃,冷却温度20℃,1L蒸发瓶,转速280 rpm通过上述的对比,再结合常见的处理步骤,我们很容易能找到合适我们多肽或蛋白质样品的浓缩方法。处理时间:旋转蒸发仪在浓缩和干燥时间上有非常明显的优势,常规实验量的反应液(1L以内),在旋转蒸发仪上可以在1小时以内处理完毕。除此之外,旋转蒸发仪免去了冷冻干燥的预冻步骤,可直接上机处理,这进一步加快了处理效率。应用范围:相对于旋转蒸发仪,冷冻干燥机在应用面上会显得狭窄很多。但其干燥样品的程度,特别是针对含水量较高的样品,冷冻干燥具有绝对的优势,这有助于后续的处理。因此在针对多肽和蛋白类化合物时,我们可以根据不同的步骤采取多种干燥手段。在纯化分离前,往往有大量的液体样品需要浓缩,才能保证样品不在分离柱内扩散,获得较好的峰型,这时我们可以采用旋转蒸发仪来处理。而在纯化分离完毕后,我们会获得高纯度的少量液体样品,此时我们就可以采用冷冻干燥来处理。温度范围:温度条件对于多肽和蛋白质类的样品至关重要,很多此类样品无法承受过多的热应力。针对这类样品,冷冻干燥机是最适合的选择,其室温的处理条件可以完全杜绝样品变性或分解的可能性。我们可以通过下图来查看最合适您的多肽和蛋白样品的浓缩方式:3多肽与蛋白浓缩的小贴士01旋转蒸发仪小贴士样品起泡:蛋白类样品在蒸发过程中极易起泡,为了避免样品暴沸,我们可以采用防暴沸传感器或者E型冷凝器。步琦 R-300 E 型冷凝器:▲R-300 E 型冷凝器E型冷凝器在冷凝器前连接了一个缓冲空腔,可以有效避免样品暴沸进入蒸发瓶内。干燥样品:在干燥样品的过程中,样品容易附着在蒸发烧瓶上,特别是蛋白类的粘性样品。为了防止这种情况发生,可以使用干燥型蒸发烧瓶。干燥蒸发烧瓶上有凸起的部分,可以减少粉末在玻璃壁上的堆积,配合 R-300 的正反转干燥模式,可以进一步避免样品凝结。▲图示:干燥型蒸发瓶02冷冻干燥机小贴士样品表面积:多肽和蛋白质的干燥速率通常取决于表面积与样品体积之比。表面积越大,样品干燥越快,因为更多的水分子可以离开基质。为了增加样品在预冻过程中的比表面积,建议使用 R-300 的杜瓦罐套件,可同时实现高效预冻和高比表面积。▲R-300 杜瓦罐套件▲经过杜瓦罐套件干燥的样品(左)具有更大的比表面积4结论相信通过以上介绍,您已经找到了最适合自己蛋白或多肽样品的浓缩与干燥的方法。如果您希望进一步为自己的应用定制一套解决方案,欢迎通过下面的联系方式咨询我们的产品专家,也可以关注我们的公众号,了解更多蛋白与多肽样品的相关信息。
  • 冷冻干燥机的类型——上海田枫整理
    冷冻干燥是利用升华的原理进行干燥的一种技术,是将被干燥的物质在低温下快速冻结,然后在适当的真空环境下,使冻结的水分子直接升华成为水蒸气逸出的过程. 冷冻干燥得到的产物称作冻干物,该过程称作冻干。 物质在干燥前始终处于低温(冻结状态),同时冰晶均匀分布于物质中,升华过程不会因脱水而发生浓缩现象,避免了由水蒸气产生泡沫、氧化等副作用。干燥物质呈干海绵多孔状,体积基本不变,极易溶于水而恢复原状。在最大程度上防止干燥物质的理化和生物学方面的变性。 冷冻干燥机原理简单易懂,但是在应用在具体行业里时,却也有着很多的区别。 近代干燥机开始使用的是间歇操作的固定床式干燥机。19世纪中叶,洞道式干燥机的使用,标志着干燥机由间歇操作向连续操作方向的发展。回转圆筒干燥机则较好地实现了颗粒物料的搅动,干燥能力和强度得以提高。一些行业则分别发展了适应本行业要求的连续操作干燥机,如纺织、造纸行业的滚筒干燥机。 20世纪初期,乳品生产开始应用喷雾干燥机,为大规模干燥液态物料提供了有力的工具。40年代开始,随着流化技术的发展,高强度、高生产率的沸腾床和气流式干燥机相继出现。而冷冻升华、辐射和介电式干燥机则为满足特殊要求提供了新的手段。60年代开始发展了远红外和微波干燥机。 用于进行干燥操作的机械设备类型很多,根据操作压力可分为常压和减压(减压干燥机也称真空干燥机)。根据操作方法可分为间歇式和连续式。根据干燥介质可分为空气、烟道气或其他干燥介质。根据运动(物料移动和干燥介质流动)方式可分为并流,逆流和错流。 按操作压力,干燥机分为常压干燥机和真空干燥机两类,在真空下操作可降低空间的湿分蒸汽分压而加速干燥过程,且可降低湿分沸点和物料干燥温度,蒸汽不易外泄,所以,真空干燥机适用于干燥热敏性、易氧化、易爆和有毒物料以及湿分蒸汽需要回收的场合。 在具体应用中,如:海参冻干,机械冻干,药物冻干,食品冻干,都是应用着不同的类型的冻干设备。 简单的说,就是冻干所需要技术条件,科技条件。难度越大,要求越高,产品的成本自然也更高,价格也更高。 产品的捕水量,最低温度也是有区别的。具体的需求量,还是要看产品的要求。
  • 随时随地,深冷聚焦 | 谱育科技Pre 4000 三级冷阱大气预浓缩仪 新品上市
    仪器研发背景HJ 759-2015要求实验室分析VOCs,预浓缩仪要采用三级冷阱技术和液氮制冷方式,经过市场长期证明,三级冷阱技术路线可靠,但准备液氮耗时且成本极高,市场亟需一款既能继承优点,又能弥补缺点的仪器...集十年积淀技术,经五代轮番升级谱育科技乘新而来首推Pre 4000 三级冷阱大气预浓缩仪采用三级冷阱技术 及 斯特林制冷技术有效达到液氮冷冻VOCs的效果满足30ppt以下痕量分析要求免操心,即开即用,无需日常维护体积小,功耗低,样品轨迹可溯源# 系统集成,全面溯源 #谱育科技Pre 4000 三级冷阱大气预浓缩仪可与自动进样器、静态稀释仪、多通道采样系统和自动清罐仪组成苏码罐系统,配套强大的溯源系统,从清洗、采样、配气到进样,自动记录样品全流程轨迹,解决了传统手抄笔录,难以溯源的问题。仪器可广泛应用于环境监测站、空气站、第三方检测单位、企事业单位、科研高校等单位的VOCs检测。# 技术亮点 #Technological Superiority三级冷阱技术一级冷阱低温除水,二级冷阱特殊填料,捕集VOCs的同时,有效去除CO2、O2、N2,三级冷阱为毛细空管,凭借超低温的优势,同时达到高效捕集和脱附的效果,实现脉冲不分流进样。灵活的内标进样可采大体积、低浓度内标气,也可直连高浓度内标钢瓶,定量环定体积,免去标气稀释的烦恼。低吸附设计8路加热,全系统无冷点,所有流路硅烷化镀膜。自动化检漏可通过加压或者真空的方式,对系统进行自动化检漏。# 规格参数 #Product Parameters温度控制一级冷阱:-80℃~150℃ 二级冷阱:-90℃~280℃ 三级冷阱:-160℃~200℃流量控制采样流量:0.2~60mL/min采样体积:10~2500mL采样时间:≥50%循环时间# 应用案例 #Application■ 《2019年地级及以上城市环境空气挥发性有机物监测》要求78个城市监测PAMS、TO-15和醛酮,谱育科技推出的三级冷阱大气预浓缩仪,FID检测C2-C3,MS检测其他物质,一次进样得到116种VOCs分析结果,x overflow-wrap: break-word !important "|
  • 科研瓶颈怎么破?真空离心浓缩仪如何助我摆脱浓缩烦恼?
    在科研领域中,样品的浓缩与提纯是实验过程中不可或缺的一环。而真空离心浓缩仪,凭借其高效、精准的特点,成为了众多科研人员的得力助手。本文将带您深入了解真空离心浓缩仪的工作原理、操作步骤及其在科研中的应用。真空离心浓缩仪常规款(触摸屏)  真空离心浓缩仪的工作原理    真空离心浓缩仪的工作原理巧妙结合了离心力和真空蒸发技术。首先,待处理的溶液或悬浮液被置于离心杯中,通过高速旋转产生的强大离心力,使溶液中的固相和液相得到有效分离。随后,通过调节真空系统,降低离心杯内的压强,使得溶剂在较低的温度下迅速蒸发,从而实现样品的浓缩和提纯。这一过程中,流体动力学原理发挥了关键作用,确保了溶剂蒸发的效率和稳定性。冷冻真空离心浓缩仪  使用真空离心浓缩仪进行样品处理,通常遵循以下步骤:    1、开机准备:首先,打开冷阱开关,待其达到操作温度后,指示灯亮起,表示准备就绪。    2、样品准备:根据需要预热样品,并将其放入专用的样品管中。确保样品管在转子上平衡放置,以维持良好的对称性,避免运行时产生震动。    3、设置参数:根据溶剂的性质,设置合适的加热温度。在不破坏样本的前提下,尽可能提高运行温度,以加快蒸发过程。同时,设定好加热时间和运行时间,确保样品在蒸发过程中不会受到过量热量的影响。    4、启动运行:将上好样的转子放入样品室中,关闭浓缩仪盖子,按下运行按钮。随着转子的启动,当达到操作速度时,真空阀关闭,真空泵开始运行,系统进入真空状态。    5、监控与结束:运行设置时间到达后,设备会自动停止运行,并发出声音提示。此时,可以打开盖子,取出样品进行检查。若未达到浓缩要求,可重新设置参数再次运行。    6、后续处理:使用完毕后,关闭电源开关,并填写仪器使用记录。同时,注意清理和维护设备,以保证其长期稳定运行。耐酸碱真空离心浓缩仪  真空离心浓缩仪广泛应用于DNA/RNA、核苷、蛋白、药物、代谢物、酶等样品的浓缩与提纯。其优势在于:    1、高效性:结合离心力和真空蒸发技术,大大提高了溶剂的蒸发速率,缩短了实验周期。    2、精准性:通过精确控制加热温度和运行时间,确保了样品在浓缩过程中的稳定性和一致性。    3、多功能性:可同时处理多个样品,且有效防止交叉污染,提高了实验效率。    4、保护样品:在真空状态下进行蒸发,降低了溶剂的沸点,减少了样品受热的时间,有利于保护热敏感样品。部分安装图  真空离心浓缩仪以其独特的工作原理和显著的优势,成为了科研领域中不可或缺的重要工具。掌握其正确的使用方法,将有助于提高实验效率,推动科研工作的顺利开展。
  • 生物物理所开发冷冻结构光照明与电镜关联成像新技术
    面向原位结构解析的冷冻电子断层成像(cryo-ET)是研究生物大分子复合物的原位高分辨率结构及其相互作用关系的关键技术。但受限于电子束穿透能力,需要先利用聚焦离子束(cryo-FIB)将细胞和组织样品减薄成200纳米左右的薄片后才能进行cryo-ET数据采集。冷冻光电关联成像技术可以为cryo-FIB精准制备包含特定目标结构的冷冻含水切片提供荧光定位指导,但是冷冻荧光显微镜的光学分辨能力以及光镜、电镜图像的对齐精度是制约冷冻光电关联实验成功率的关键因素。  为了解决上述技术瓶颈,中国科学院生物物理研究所蛋白质科学研究平台生物成像中心一直致力于开发新型冷冻光电关联成像技术,在前期自主研发的冷冻光电关联成像高真空光学冷台HOPE(Journal of Structural Biology,2017)基础上,通过引入结构光照明成像技术,成功研制了冷冻结构光照明成像系统HOPE-SIM,实现了横向优于200纳米的光学分辨率,以及优于150纳米的光镜-聚焦离子束三维关联对齐精度,相关研究成果于4月29日在线发表在《通讯-生物》(Communications Biology)上。   光镜-电镜关联成像技术(Correlative Light and Electron Microscopy,CLEM),是利用荧光特异标记对特定生物大分子或亚细胞结构进行荧光示踪,实现对整个细胞的三维荧光定位成像,之后通过荧光图像和电镜图像的配准,获得荧光标记信号和电镜超微结构的关联信息。冷冻光电关联成像技术的应用方向之一,是通过关联图像,指示出荧光标记的结构在电镜图像中的具体位置,实现对荧光示踪目标物的电镜高分辨率结构解析。而得益于光镜成像对生物样品的无损特性,可以在不损伤样品的前提下获得样品内部的三维荧光定位信息,再通过光电关联成像流程和关联对齐软件,将三维荧光图像与扫描电镜图像关联匹配,实现在荧光信号的指导下进行cryo-FIB对目标区域的减薄加工。如此,便可以避免“盲切”,实现对荧光指示目标物的指导切割,以期提高冷冻聚焦离子束技术用于电子断层成像切片样品制备的效率。   目前,光电关联成像指导cryo-FIB减薄技术流程的实现方式有多种类型,根据系统构成可以分为光镜电镜分体式光电关联成像系统和集成型光电关联成像系统。生物成像中心技术团队自2013年开始专注于冷冻光电关联成像技术方法学研究,在光镜电镜分体式光电关联成像系统研制方面, 于2017年自主研制了一款可搭载在倒置荧光显微镜上的高真空光学冷台HOPE(High-vacuum Optical Platform for cryo-CLEM),HOPE可与透射电镜冷冻样品杆适配连接,完成荧光定位后样品将随冷冻样品杆被转移进电镜当中进行高分辨率数据采集,同时结合光电关联定位软件,可以实现大视野光学定位成像与电镜成像的匹配。HOPE采用冷冻样品杆来实现冷冻光镜成像、冷冻传输以及冷冻透射电镜成像,有效避免了光电关联成像过程中对冷冻载网的反复夹取,保证了冷冻样品的完整性和同一性,有效提高了关联成功率和实验效率。  然而,基于宽场成像技术的HOPE系统受限于光学衍射极限和冷冻光学成像装置的空间限制等,仅能使用长工作距离、低数值孔径的冷冻荧光成像系统,所能达到的横向分辨率约为400-500纳米,纵向分辨率则达微米级,这对于精准捕获数微米厚度细胞内百纳米尺度的目标结构而言,是非常不利的。  结构光照明超分辨荧光成像技术在能提高宽场荧光显微镜一倍分辨率的前提下,还具备不需要特殊的荧光探针、成像速度快、辐照密度低等技术优势,是所有超分辨成像技术中最适合应用到冷冻环境中对冷冻样品进行高分辨率成像的技术。因此,研究团队选择了结构光照明成像技术作为提高冷冻荧光成像分辨率的手段,基于倒置荧光显微镜自主研制了大腔室高真空冷台,腔室内置0.9NA长工作距离光学物镜和防污染器系统(ACS和cryo-box)、外接真空传输系统(TPS)以及冷冻电镜样品杆(cryo-holder)适配器。同时,借助三维结构光照明(SIM)光路,实现了真空环境下对冷冻样品的三维结构光照明成像,在提高冷冻光镜分辨率的同时,有效增强了光电关联成像样品传输过程中对冷冻样品的保护。图1 冷冻结构光照明成像系统HOPE-SIM。a.HOPE-SIM硬件组成,b. HOPE-SIM设计原理图,c. HOPE-SIM光路原理图   借助HOPE-SIM高分辨率冷冻光电关联成像系统以及自主编写的三维关联对齐软件3D-View,团队成功制备了包含宿主细胞内鼠疱疹病毒(图2)和海拉细胞内荧光标记的中心体(图3)的细胞切片样品,通过冷冻电子断层原位结构分析图像处理流程和软件分析其在原位结构。实验结果表明,基于HOPE-SIM技术的高精度冷冻光电方法可以实现优于150nm的三维对齐精度,为尺寸较大、胞内丰度高的目标物的原位捕获提供了一种高效、精确的靶向冷冻聚焦离子束减薄技术方案。图2 基于 HOPE-SIM冷冻光电联技术捕获宿主细胞中的MHV-68病毒颗粒。a.冷冻明场透射光图像;b.HOPE-SIM荧光图像的z投影。绿色,荧光微球。红色,MHV-68病毒;c将b中的荧光图像与a中的明场图像合并,以显示目标信号的位置;d.冷冻SIM和冷冻FIB图像之间的三维关联匹配;e.对目标区域减薄后的冷冻FIB图像;f.减薄后冷冻扫描电镜图像,与b中冷冻SIM图像的融合;g.制备的冷冻含水切片的冷冻透射电镜显微照片(3600倍);h.冷冻断层扫描成像,放大倍率为64000倍,显示了被捕获的病毒颗粒。 图3 基于HOPE-SIM技术流程精准捕获海拉细胞内红色荧光标记的中心体。a.3D-View光-电关联软件获得的冷冻结构光-cryo-FIB关联配准图;b.cryo-FIB对红色荧光标记所在区域进行减薄;c.cryo-FIB减薄获得的200nm冷冻含水切片;d.冷冻含水切片在透射电镜下8700倍成像,黄色框线内为目标中心体;e.目标中心体的cryo-ET数据采集(53000倍)激光指向位置主动稳定系统示意图。   相关研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、中科院战略性先导科技专项(B类)等项目的资助。  值得一提的是,在集成型光电关联成像系统研制方面, 2023年1月,《自然-方法》(Nature Methods)报道了中科院院士、生物物理所研究员徐涛和研究员纪伟团队研发的cryo-CLIEM系统和生物成像中心技术团队自主研发的三束共焦成像系统ELI-TriScope系统,在双束扫描电镜真空腔室内集成了光学成像系统,避免了样品传输过程,有效提高了冷冻光电关联成像的精度和成功率。其中生物成像中心技术团队自主研发ELI-TriScope系统集成了一个基于冷冻样品杆的传输系统(cryo-transfer system),并在冷冻样品下方嵌入了一个倒置荧光成像系统(cryo-STAR system),从而实现电子束(E)、光束(L)和离子束(I)被精确地聚焦到同一点上,可以在cryo-FIB减薄的同时实时监控目标分子的荧光信号,显著提高了cryo-FIB减薄技术对特定目标物的捕获精度,将制备冷冻含水切片的时间成本从每片2-2.5小时降低到约0.8小时。   生物成像中心技术团队研发的基于结构光照明技术的HOPE-SIM系统可以实现三维高分辨率冷冻荧光成像,同时还可以通过冷冻样品杆直接衔接三束共焦光电关联成像系统ELI-TriScope,实现高分辨三维冷冻荧光成像的同时,完成后续原位荧光实时监控聚焦离子束减薄全技术流程,有效提高了冷冻聚焦离子束减薄的效率、准确性、成功率和样品制备通量,为原位结构解析研究提供了成功的解决方案,在未来的原位结构生物学中有巨大应用潜力。
  • 生物物理所重大进展:90S核糖体前体冷冻电镜结构获解析
    核糖体是由RNA和大量蛋白质构成的大型分子机器,负责地球上所有生物的蛋白质合成。在真核生物中,核糖体组装是个非常复杂的过程。核糖体在成熟过程中需要和大量的组装因子暂时结合,形成了一系列核糖体前体复合物。小亚基核糖体在组装过程中形成两个主要的中间体:早期的90S和晚期的pre-40S前体。90S前体是个巨大的复合物,除了含有核糖体RNA和蛋白质组分,还含有约50个非核糖体蛋白质和U3 snoRNA,分子量高达5百万道尔顿。  中国科学院生物物理研究所叶克穷实验室利用冷冻电镜和单颗粒重构技术获得了出芽酵母90S核糖体前体的3个电子密度图,其中最好的密度图的整体分辨率达到4.5埃。研究人员利用已知的晶体结构、从头建模和化学交联质谱数据构建了接近完整的90S结构模型。  90S的结构显示新生核糖体小亚基折叠形成多个分离的亚结构,并和大量组装因子结合。核糖体前体RNA的5' 间隔区域、U3 snoRNA和大量组装因子形成巨大的基座,支撑新生核糖体的结构。结构还揭示了U3 snoRNA和核糖体前体RNA结合的新颖方式。该结构对理解核糖体小亚基的早期组装原理和组装因子的功能具有里程碑的意义。  报道该工作的论文Molecular architecture of the 90S small subunit pre-ribosome 于2月28日在eLife 杂志在线发表。  叶克穷是该论文的通信作者,孙奇、朱星、奇佳和安卫东是共同第一作者。合作者董梦秋和谭丹以及叶克穷课题组多位研究人员对该研究也有重要的贡献。中科院生物成像中心为该研究提供关键的冷冻电镜研究设备和技术支持。该研究得到了国家自然科学基金委、中科院战略性先导科技专项(B类)、科技部和北京市政府的资助。  文章链接 90S核糖体前体的冷冻电镜结构
  • 德祥携手SP Scientific成功举办蒸发浓缩和冻干技术研讨会
    2016年4月11号,德祥科技携手美国SP Scientific厂家在成都成功举办技术研讨会。研讨会主要介绍了英国Genevac蒸发浓缩和美国Virtis,FTS冻干技术在样品处理中的应用和解决方案。  英国GeneVac公司成立于1990年,隶属SP Scientific旗下,一直专注于研究和生产各种离心蒸发浓缩设备,其产品广泛的应用于生命科学、制药、化学、分析等领域。主要产品有: Rocket/EZ-2/HT系列溶剂蒸发工作站和miVac真空离心浓缩仪。  美国SP Scientific公司旗下的VirTis公司是*的冻干机的生产厂家,其成立于1953年,拥有*的冷冻干燥技术,能完善的开拓和研究工业冷冻干燥所需要的技术。VirTis产品包括:实验室系列BenchTop,制备系列Freezemobile,小型药品研发型Advantage,中试生产型Genesis,小型生产型Ultra,产业型Hull. 及FTS旗下智能研发型Lyostar系列。
  • 真空冷冻干燥机在保健品领域的应用
    近年来随着经济的发展及生活水平的提高,人们对保养、身体的调理也逐渐注重,使得保健品行业飞速发展。但保健品在制备过程中也会浪费较多原材料,无法更大程度发挥利用原材料本身的营养价值。随着冻干机的出现,以其的独特的冻干技术可以生产出更有营养价值、药用价值的保健品。也因此有“保健品冻干机之称”。 上海田枫实业有限公司是一家专业的冻干机厂家,主营冻干机系列包括:家用型冻干机,实验型冻干机、中试型冻干机、生产型冻干机。提供优质的售后服务,产品解决方案。下面为大家列举下保健品冻干机的应用: 1、维生素和矿物质为主要成分的营养型保健品冻干 利用保健品冻干机制备可以让这类保健品所含有的多种维生素和矿物质,更综合性地补充 可以让缺乏这类营养素的人群更大程度的吸收。 2、以天然或珍贵植物为原料,冻干提取出有效营养成分的保健品  这些保健品主要是把天然植物中最有用的营养精华提取浓缩,在冷冻干燥制备。如从大豆中提取蛋白,从红豆、黑豆、银杏叶等植物中提取营养物。 3、名贵中药或有药用价值的动植物为主要原料的补养型冻干保健品  如冻干人参、冻干鹿茸、冻干灵芝、冻干银杏、冻干乌鸡、冻干鳖等。 4、从海洋生物中提取有效成分冻干制成的保健品 5、以动物初乳为原料冻干制成的保健品  动物初乳中含有优质蛋白和免疫蛋白,前列腺增生 可提高机体免疫力。如冻干牛初乳; 6、以“第七营养素”——膳食纤维为主的冻干保健品  膳食纤维被称为第七营养素,膳食纤维不但能加速肠道废物排出,还有清理人体内环境的作用,所以,又被称为“清道夫”。如五谷杂粮的冻干。来源:上海田枫仪器有限公司www.tfyqchina.cn www.tfsye.com关键词:[冷水机][小型冷水机][工业水冷机][实验室冷水机][制冰机][超低温冰箱][冻干机] [实验室冻干机][生产型冻干机]
  • 冷冻电子显微学与结构生物学
    冷冻电子显微学近年来在电子显微镜的硬件设备及结构解析的软件算法等方面取得了多个重要的技术突破, 正在成为结构生物学研究的重要技术手段, 为越来越多的生物学研究者所重视. 冷冻电子显微学的技术特点决定了它所具备的一些独特优势和发展方向, 同时作为一个正在迅速发展的科学技术领域, 需要多学科的交叉促进.   近期来自清华大学生科院的王宏伟发文介绍了冷冻电子显微学的研究现状及面临的技术挑战, 并提出未来可能实现结构生物学与细胞生物学不同尺度的研究在冷冻电子显微学技术上融合的新方法.   结构生物学是 20 世纪后半叶, 尤其是在 80~90年代蓬勃发展起来的重要学科. 通过对生物大分子(蛋白质、核酸及其复合体)的三维空间结构的测定, 结构生物学可以在微观尺度上精确地描述复杂生物大分子的形状, 原子与分子组合方式, 及其表面带电、亲疏水等物理性质, 从而为生物大分子发挥生物学功能的机理提供关键的解释. 进入 21 世纪以来, 结构生物学研究的技术手段日益成熟, 在现代生物学研究的各个分支领域中均发挥着重要的作用. 至今为止, 国际蛋白质结构数据库中的结构数据已经超过 100000, 其中绝大部分结构由 X 射线晶体学及核磁共振波谱学解析而来.   近年来, 技术的进步使得结构生物学新的研究手段取得了长足的进展. 2013 年 12 月份发表在Nature 上的利用冷冻电子显微学解析获得 TRPV1 原子分辨率结构的两篇文章, 在结构生物学领域造成了巨大的反响. 美国加州大学旧金山分校的程亦凡研究组与 Julius 研究组合作, 利用冷冻电子显微学技术首次获得了 300 kD膜蛋白 TRPV1的 3.4 Å 分辨率的三维结构, 并建立了该分子的原子模型.   其实在过去的几年间, 已经有若干工作报道了利用冷冻电子显微学解析病毒、蛋白酶体复合物、核糖体等近原子分辨率模型. 这些工作的里程碑式意义在于: 高分辨率结构解析过程不需要生长三维晶体, 样品用量非常少, 而且可以在短时间内同时获得多个复合体状态的三维结构. 短短一年里, 冷冻电子显微学技术作为直接解析生物大分子原子分辨率结构的技术手段受到人们的广泛关注.   事实上, 电子显微学是结构生物学研究中的老兵. 该技术自从 20 世纪 50~60 年代以来, 一直在研究细胞、 亚细胞及生物大分子结构的研究中扮演着独特的角色, 揭示了很多重要的细胞内精细结构. 在研究生物大分子的结构方面, 该技术采取与 X 射线晶体学及核磁共振波谱学迥然不同的原理, 在过去的几十年里逐渐建立了成熟的图像处理及分析算法, 成为结构研究的一种独特技术手段. 近 10 年来, 该领域的日臻成熟以及科研团队的扩大更快地催生了冷冻电子显微学成像技术与结构解析技术的革命性突破. 自从 2008 年以来, 冷冻电子显微学已经连续获得多种生物大分子复合体的原子分辨率结构, 而且高分辨率结构的解析速度正在呈现迅速上涨的趋势。   冷冻电子显微学从 20 世纪中叶开始, 经历了 80年代到 90 年代的技术方法建立时期, 21 世纪初的技术成熟期, 在过去的两年里发生了革命性的技术进步, 进入了快速发展期. 结构生物学和细胞生物学研究者如何抓住这个契机, 如何尽快适应新的局面, 掌握新的技术, 充分发挥该技术的优势从而更加更深入地研究生命现象, 将是未来几年里的一个主题. 数学、物理学、计算机科学、材料科学、化学等众多领域的研究者们必将在未来冷冻电子显微学的新技术新方法的开发中发挥重要的作用, 成为该技术的进一步完善与成熟的重要力量.   冷冻电子显微学领域研究者们则需要以主动开放的态度吸引其他领域研究者的合作, 并积极迎接来自更多领域研究者的挑战, 保持并发展自己的技术特长, 站在技术发展的制高点上选准研究方向, 始终在冷冻电子显微学的技术前沿上开疆拓土.   原文检索:   王宏伟. 冷冻电子显微学在结构生物学研究中的现状与展望. 中国科学: 生命科学, 2014, 44: 1020&ndash 1028   Wang H W. Current status and future perspective of cryo-electron microscopy in structural biology. SCIENTIA SINICA Vitae, 2014, 44: 1020&ndash 1028 doi: 0.1360/052014-140
  • 真空冷冻干燥冻干样品的时间由哪些因素决定?
    真空冷冻干燥机也称为冻干机,冷冻真空干燥的基本原理是在低温低压条件下的传热传质。由于被冻干物料性质、冻干方法和对冻干产品质量要求的不同,描述冻干过程的模型及其解法也不相同。通常情况冷冻真空干燥过程的三大阶段冷冻阶段、升华干燥阶段、解析干燥阶段。整个过程其实就是传热和传质同时进行的过程,热和质的传递速率共同影响干燥速率,从而影响整个冻干周期,所有影响热和质传递的因素均会影响干燥速率。简单分析如下:冻干仓压力真空冷冻干燥机冻干仓内压力高低影响到传热和传质的速率,对于传质来说,压力越低越好 对于传热来说,压力越高越好。传质速率的大小,主要由升华界面与干燥层表面的温度和压力差所决定。要提高干燥层中水蒸气的逸出速率,可以提高升华界面的温度,使界面水蒸气压增大 也可以提高冻干仓的真空度,降低干燥层表面的蒸汽压。传热方式按传统的分类可划分为:热传导(有温度不同的质点在热运动中引起的,在固体,液体,气体中均能产生)、热对流(对流是由于温度不同的各部分流体之间发生相对运动,互相掺和而传递热能)、热辐射(凡是温度高于零度的一切物体,不论他们的温度高低都在不间断地向外辐射不同波长的电磁波)和介质加热(微波加热)。由于升华干燥的过程涉及到热和质(水蒸气)的传递,因此,通过哪种传热方式将热量更为有效地传递给物料,对干燥速率有较大的影响。样品内有机溶剂的浓度样品内有机溶剂的浓度对冷冻干燥速率的影响较大,浓度越高冻干速率越慢,反之浓度越低,冻干的速率越快。晶体大小预冻时形成的晶体大小在很大程度上影响冻干的速率和冻干后产品的溶解速度。速冻和慢冻过程有以下区别:速冻产生的冰晶较小,慢冻产生的冰晶较大。大的冰晶有利于升华,小的冰晶不利于升华,快速冻结会导致升华速率低,解析速率快 慢速冻结导致升华速率快,解析速率慢。样品量多少样品在冻干时,分装到容器中后存在一定的表面积与物质厚度比,即冻干与样品量有关。表面积大、厚度小有利于水分升华,容易冻干且质量理想。干燥时,单位面积料盘上被干燥的装载量是决定干燥时间的重要因素:一般情况下,物料堆积的厚度越薄,传热和传质速度越快,干燥时间越短。但是,物料越薄则单位冻干面积上每批次干燥的样品少,对提高单位冻干面积和单位时间产量不利。
  • 中国结构生物学冷冻电镜培训班与国际冷冻电子显微镜高级图像处理研讨会在京圆满结束
    由中国生物物理学会、中科院生物物理研究所、清华大学和FEI 公司联合主办的第一次中国结构生物学冷冻电镜培训班(Get acquainted with Cryo-Electron Microscopy:First Chinese Workshop for Structural Biologists)于2015 年5 月29 日-6 月3 日在北京顺利举行。本次培训班主任由中科院生物物理所孙飞研究员、清华大学王宏伟教授和美国FEI公司Marc Storms博士担任,讲授队伍来自中科院生物物理所、清华大学、北京大学、中科院上海生化细胞所、中国科技大学、英国剑桥大学LMB实验室和FEI公司等工作在冷冻电镜一线的教授和工程师们,并精心地为学员们准备了包括讲义、课件、学习资料、实习材料和数据在内的教学材料。本次培训班得到了FEI公司的独家赞助和大力支持。   作为生物大分子结构研究的手段之一,冷冻电子显微镜三维重构技术,尤其是单颗粒三维重构技术(SPA),近期取得了非常瞩目的成果。近两年来,利用SPA技术解析的重要生物大分子复合体层出不穷,分辨率也日益提高。在此契机下,中国生物物理学会生物超微结构显微成像专业委员会与FEI公司进行合作,利用中科院生物物理研究所和清华大学生命科学学院在国际上领先的冷冻电子显微平台,联合发起了此次培训班,旨在为零基础学员提供全面了解和学习电镜三维重构理论和技术的机会,系统地将冷冻电镜前沿技术带给国内的相关研究人员,特别是X射线晶体学、NMR等非电镜领域的专家学者和学生们。这无疑将极大地推动我国冷冻电镜和结构生物学领域的发展。   培训班为期四天,包括上午讲座报告、下午实际操作和上机实习、以及晚上的答疑讨论会。来自全国百余学员参加了此次培训活动。5月30日上午,北京大学的尹长城教授对冷冻电镜的发展历史、现状进行总结并对未来的发展进行展望,提出电镜技术已经进入&ldquo 黄金时代&rdquo 。随后,清华大学的王宏伟教授和中国科技大学的蔡刚教授分别对负染色和冷冻两种电镜制样方法进行了非常详尽的介绍。5月31日上午,清华大学的雷建林教授详细讲解了透射电子显微镜(TEM)的光学系统、成像原理等关键理论,FEI公司的应用工程师王庆博士则介绍了如何操作电镜,如何进行拍照成像等具体的工作流程。6月1日上午,清华大学的高宁教授介绍了如何评估电镜数据质量,李雪明教授介绍了目前最前沿的直接电子探测相机技术及其相关的motion 校准技术,英国MRC的白晓晨博士分享了解析高分辨率电镜结构涉及到从前期制样到后期图像处理的大量技术细节。利用前三天下午的实习操作时间,学员们不仅零距离看到工程师们现场演示制作电镜样品和电镜操作,而且还亲自练习制样方法并实际操作电镜。6月2日,中科院生物物理所的孙飞研究员、中科院上海生化细胞所的丛尧教授介绍了单颗粒三维重构的基础知识和原理,中科院生物物理所的朱平研究员系统讲解了如何对重构结果进行分析和展示。2日下午学员们在老师们的指导下上机练习了两个冷冻电镜三维重构软件EMAN2和Relion,对三维重构的流程有了更加直观的认识。除此之外,每天晚上的讨论会,学员们都带着问题来的,互动交流的主动性很高,积极发言,深入讨论,将白天所学知识消化掌握,反响很好。   (中国结构生物学冷冻电镜培训班)   国际冷冻电子显微镜高级图像处理研讨会(International Workshop of Advanced Image Processing of Cryo-Electron Microscopy 2015)由清华大学隋森芳教授担任组委会主席,由清华大学王宏伟教授、中科院生物物理所孙飞研究员共同担任执行主席,于2015 年6月3日-6 月7日在北京顺利举行。教师队伍来自MRC分子生物学实验室(英国)、Brandeis University(美国)、University of Colorado Boulder(美国)、脑科学MPI 研究所(德国)、University of Basel(瑞士)等多所国外大学与研究机构。研讨会为期五天,包括上午讲座报告、下午软件操作与上机实习、及晚上的答疑讨论会,围绕近原子分辨率单颗粒重构技术、三维模型建立与精修、电子断层扫描与sub-tomo平均计算等主要议题,分别就DED图像的信息分析与处理方法、单颗粒锐化及电子密度图校正、低分辨率冷冻电镜图像的模型建立与验证、冷冻电镜图谱原子模型的搭建、近原子分辨率冷冻电镜图谱的结构细化与验证、电子断层扫描技术的理论与原理、电子断层扫描数据采集与处理中重要影响因素、sub-tomo平均计算的流程与应用、及其理论、方法与前景等多项话题展开深入的交流与细节探讨。来自日本、印度、美国等多个国家一百四十余名学员参加了本次研讨会,反响热烈。   (国际冷冻电子显微镜高级图像处理研讨会)   作为生物大分子结构研究的重要手段之一,冷冻电子显微镜技术近年来取得了非常瞩目的成果,分辨率获得极大提高。在此契机下,中国生物物理学会生物超微结构显微成像专业委员会与FEI等公司进行合作,利用中科院生物物理研究所与清华大学生命科学学院在国际上领先的冷冻电子显微镜平台,联合发起中国结构生物学冷冻电镜培训班与国际冷冻电子显微镜高级图像处理研讨会,不仅为零基础学员提供全面了解和学习电镜三维重构理论与技术的机会,同时为电镜结构生物学领域青年科学家们系统地介绍冷冻电镜前沿技术与图像处理最新研究方法与进展,积极促进国际交流与合作,极大的推动我国冷冻电子显微镜和结构生物学领域的进步与发展。
  • 服务土壤“三普”--新芝冷冻干燥机
    2022年,我国全面启动土壤“三普”工作,对全国所有土壤进行普查建库。根据《HJ 834-2017土壤和沉积物半挥发性有机物的测定气相色谱-质谱法》和《HJ 1021-2019 土壤和沉积物 石油烃(C10-C40)的测定 气相色谱法》标准相关要求,土壤样品需采用冻干法进行样品干燥。单次分析测试过程中,半挥发性有机物测定往往需要至少20g冻干后土壤样品、石油烃测定往往需要至少10g冻干后土壤样品,并且根据相关质控等要求,需留出复验样品量,因此一般单个土壤样品至少需要冻干60g。  在土壤样品的干燥过程中,如若土壤样品水分大于30wt.%则需要进行离心处理除去大量水分。样品在进入冻干前,需要进行预处理,其处理过程中所需工具主要有铲子、搪瓷盘、尼龙筛、玻璃培养皿、塑料薄膜、空气压缩机等。  在搪瓷盘铺上塑料薄膜,将样品瓶中的土壤样品平铺在搪瓷盘中混匀后,以四分法取对角土壤样品。    然后将土壤样品装入培养皿(d=90mm)中,每个培养皿盖上塑料薄膜,防止交叉污染。在薄膜上扎小孔避免影响样品干燥过程中的水分升华。冻干后样品经过筛分后分别获得20目、60目的土壤样品,每个样品筛分结束后用空气压缩机冲洗筛子。  采用新芝的SCIENTZ-50YG,土壤样品经12小时冻干后,干物质含量≥99%,单机处理样品数量最多可达64个。    钟罩款/原位款冷冻干燥机的土壤样品处理应用场景  土壤样品经预处理后,在下班前放入冻干机,第二天上班即可过筛、分袋进行后续分析,提高时间利用率及样品处理效率。  Advantage  土壤样品冻干优势  留存率高:干燥过程中可保留易挥发物质,保持土壤性状,使检测结果更精确。  含水率低:冻干后样品含水率低,样品酥脆,便于研磨。  简单高效:是真空干燥、模拟自然风干燥、晾干及烘干效率的几倍。  上样量大:一台专业型设备一天可制备上百个土壤样本,一台设备即可满足样本前处理的需要。  避免交叉污染:可完全避免不同批次及同批次的交叉污染。  方便快捷:对于半挥发性有机物检测,专用的土壤冻干瓶即可用于采用,也可用于冻干,还可以用来封存样本。    部分应用场景  What  什么是土壤|“三普”  土壤普查是对土壤形成条件、土壤类型、土壤质量、土壤利用及其潜力的调查,包括立地条件调查、土壤性状调查和土壤利用方式、强度、产能调查。普查结果可为土壤的科学分类、规划利用、改良培肥、保护管理等提供科学支撑,也可为经济社会生态建设重大政策的制定提供决策依据。  第三次全国土壤普查是一次重要的国情国力调查,对全面真实准确掌握土壤质量、性状和利用状况等基础数据,提升土壤资源保护和利用水平,落实最严格耕地保护制度和最严格节约用地制度,保障国家粮食安全,推进生态文明建设,促进经济社会全面协调可持续发展具有重要意义。  2022年,启动土壤三普工作,完成技术规程制订、工作平台构建、外业采样点规划布设及培训宣传等工作,在31个省(自治区、直辖市)选择若干个县开展全面试点。对重点区域开展盐碱地调查,完成全面盐碱地普查。  2023-2024年,各省(自治区、直辖市)全面开展普查,2024年底前完成全部外业采样和内业化验等工作,初步建成省级土壤普查数据库与样品库。  2025年,完成省级普查成果汇总、验收,初步建成国家级数据库、样品库,形成全国耕地质量报告和土壤利用适宜性评价报告等,汇总形成全国土壤普查各类成果。  Brief Introduction  土壤样品分析流程  土壤样品需要经过“样本采集与保存-试样制备-样本分析”三个过程进行土壤性状分析,依据不同的土壤类型及应用方面选择不同的土壤检测标准,例如:环保方面主要遵循《HJ/T 166-2004 土壤环境监测技术规范》、农用地重金属含量检测遵循《GB-15618-2018 土壤环境质量-农用地土壤污染风险管控标准(试行)》、企业用地依据建筑用地标准《GB36600-2018建设用地土壤》标准等。    样品制备过程主要有如下图所示,有“脱水-提取-净化-浓缩”四个过程。在具体样品制备过程中,需针对不同的样品检测要求,以不影响目标污染物分析为选用原则将不同的制备过程相结合。    新芝冻干系列全家福    新芝土壤全家桶*  ▼End
  • 酶剂研发,探索真空冷冻干燥机的无限应用
    S系列真空冷冻干燥机,作为北京四环起航科技的匠心之作,专为生物医药、食品保鲜、多肽提取及酶制剂制备等领域的冻干需求量身打造。这款实验型设备以其独特优势,在行业内脱颖而出。其最显著的创新点在于物料干燥舱与冷阱的分舱设计,这一巧妙布局彻底打破了传统设计的局限,实现了两舱间温度与气流变化的完美隔离。这种设计不仅确保了干燥舱与冷阱各自温度调节的独立性与精准性,更为用户提供了前所未有的灵活性和控制精度,使得整个冻干过程更加细腻可控。S系列在性能上同样令人瞩目,其冷阱极限温度可达惊人的-83℃,而达标温度稳定在-78℃,配合极限真空度1Pa的卓越表现,为高效、高质量的冻干作业奠定了坚实基础。通过先进的中间介质循环技术,以高稳定性硅油作为热传导介质,实现对搁板温度的精确调控,确保板层温度均匀一致,进一步提升冻干效果。此外,双机复叠制冷技术的运用,使得压缩机不仅制冷迅速,且冷阱温度更低,捕水能力显著增强,有效缩短了冻干周期,提高了生产效率。同时,压缩机配备的二级启动延时保护及压力过载保护功能,为设备的安全运行提供了双重保障,也更好地保护了珍贵的实验物料不受损害。值得一提的是,S系列真空冷冻干燥机的物料干燥舱采用了耐高温、耐低压的航空级亚克力材质高透明有机玻璃罩,这一设计不仅确保了实验过程的可视化,让用户能够全程观察冻干细节,还大大提升了操作的便捷性和实验结果的直观性。在智能化控制方面,S系列搭载了先进的PLC可编程逻辑控制系统,系统运行稳定可靠,能够实时监测并记录真空度、冷阱温度、物料温度及搁板温度等关键参数,每分钟自动存储一次数据,形成详尽的冻干曲线,为科研工作者提供了宝贵的数据支持。同时,通过USB及TCP接口,用户可轻松导出数据,实现数据的快速共享与分析。最近,LGJ-S20型号真空冷冻干燥机已在丹彤(天津)医药有限公司顺利安装并投入使用。我公司的专业售后工程师不仅现场为操作人员详细讲解了设备的使用方法及注意事项,还亲自驻场完成了设备的3Q验证工作,确保了设备在最佳状态下运行。如今,这台高效能的冻干机已成为天津丹彤酶剂研发项目中的得力助手,助力其在科研道路上不断突破,迈向新的高度。
  • 赫西发布 新一代真空离心浓缩系统ZLS-4新品
    方法原理 样品蒸发、干燥、浓缩和纯化的方法,常用的有:●在高温和接近常压条件下的蒸馏和旋转蒸发方法,但仅能处理单一样品;●在低温和高真空条件下冷冻干燥方法,虽然升华能够保持样品活性,但比较耗时;●在低温下快速蒸发,氮吹仪方法,但仅能处理少量样品, 使用费用高,操作麻烦;●在室温真空条件下蒸发,真空离心浓缩方法,样品溶剂蒸发速度较快;蒸发是一种吸热的过程,在样品中水份蒸发时会带走产品自 身热量,从而使产品自身温度降低,以保持样品性质和活性。但 为使蒸发速率加快,设备需要提供蒸发所需要吸收的热量,一般 通过腔体加热或红外加热,特别适合浓缩纯化热敏感的生物样品 或临床药品。真空离心浓缩仪提供中等转速(1500~2000r/min),相应的离心力可以防止样品分散和暴沸,可以用冷阱收集溶剂再利用。 经济高效的真空离心浓缩仪 ●样品不产生泡沫,最少的样品损失●同时进行多种样品干燥●样品全部浓缩在离心管底部●适用于1毫升到3000毫升样品的干燥●通过控制工艺参数进行可重复性干燥,如控制转子腔温度(提供蒸发能量)和真空度(自动设置最优压力)●安全简单的溶剂回收应用范围●DNA/RNA(溶剂主要是水,乙醇,甲醇)● 寡聚合物或肽● PCR产物● 高效液相色谱(HPLC)产物● 有机底物的合成和分离● 底物的保存和处理● 化学合成物● 高通量筛选(HTS)● 毒理学鉴定,法医鉴定● 食品和环境样品的分析● 通用的实验室蒸发 真空离心浓缩系统 ZLS-4真空离心浓缩系统具有可以把样品中的水和有机溶剂快速安全蒸 发的功能。处理后的样品可方便的用于各种定性和定量分析化学、生 物化学、生物分析、免疫筛查、食品安全、残留分析等。适用于免疫球蛋白的浓缩、药物代谢物的浓缩、SPE固相萃 取 、 液 相 色 谱 的 前 后 处 理 、ADMET/毒 理 学 、 高 分 子 化 学 、 DNA/RNA纯化浓缩、寡聚合成、法医学/药物滥用测试、通用实验室浓缩。主要特点●分体式设计,自由组合搭配,灵活方便。●聚甲基丙烯酸甲脂透明盖板,方便监控浓缩过程。●智能化的微处理器控制以及简单直接的操作界面。●可实现真空样品加热(选购),具备超温预警功能。●采用均匀加热方式,加热快,控温精度高,可加热腔体至60℃。●浓缩时间:1min-99h59min,搭配低温冷阱,浓缩效率大幅提升。●离心腔采用合金铝材质,阳极电泳表面处理工艺则可抵御大多数化学试剂和溶剂的腐蚀。●可选配试管品种多(1.5mL、10mL、20mL、50mL、250mL,充分满足实验需求。●采用英锐恩公司单片机及英飞凌公司驱动模块,配合自主研发控制板及大力矩直流无刷电机,运行稳定噪音低,提供舒适的实验室环境。●TFT-LCD真彩显示屏,触屏按键及实体按键双操作模式,设有离心力显示专用键,同时显示设定参数和运行参数 ;免维护非接触式驱动旋转系统。●低温浓缩避免样品丢失变性、活性下降、氧化。高通量可同时处理几十个样品,无交叉污染。样品无泡沫产生,无损失。安全简单的冷阱溶剂回收方式。技术参数产品型号ZLS-4转子容量(五选一) 2×96孔62×1.5mL12×10mL6×50mL6×250mL6×2×50mL适配器(选配)6×5×20mL适配器(选配)最大功率1.5KW最大电流5A环境温度0℃~40℃噪音<50dB(A)温控范围室温 ~+60℃或不加温 真空接口φ12mm真空泵(三选一)隔膜泵、国产油泵、进口油泵 冷肼(二选一)CT40/CT50 电源AC220V/50Hz创新点:可以配超低温冷阱,极限温度可以到-40度或者-50度,这个是之前的型号所不能达到的。 新一代真空离心浓缩系统ZLS-4
  • 四大常见电镜制样方法简介:TEM、SEM、冷冻、金相
    应用电子显微镜高分辨本领和高放大倍率,对物体组织形貌和结构特征进行分析和研究的近代材料物理测试方法。但样品的制作直接影响着结果的准确性,所以制作满足要求的样品就成了整个试验的重点。现将一些常见电镜制样方法简介如下。透射电镜(TEM)TEM放大倍数可达近百万,可以看到在光学显微镜下无法看清的0.1~0.2nm的细微结构。它的样品制备工作量非常大,约占全部测试工作的半数以上或90%以上,是十分关键的。图 透射电镜样品台常用样品台分为两种:顶入式样品台和侧插式样品台顶入式样品台要求样品室空间大,一次可放入多个(常见为6个)样品网,样品网盛载杯呈环状排列,使用时可以依靠机械手装置进行依次交换。优点:每观察完多个样品后,才在更换样品时破坏一次样品室的真空,比较方便、省时间。缺点:但是需要的空间过大,使样品远离下方物镜,不宜减小物镜焦距而影响电镜分辨力。侧插式样品台样品台制成杆状,样品网载放在前端,只能盛放1~2个铜网。优点:样品台体积较小且占用空间较少,可布置于物镜内上部,利于提高电镜分辨率。缺点:不可能一次投入多个样品网中,每换一个样品都要打破一次样品室内真空,稍有不方便。支撑网的选择:支撑网有多种材质如Cu、Ni、Be、尼龙等,选择时要与待分析样品的成分分开。图 筛网尺寸制备原则• 简单• 不破坏样品表面• 获得尽量大的可观测薄区主要制备方法• 支持膜法:• 复型法:• 超薄切片法:• 薄膜试样(电解双喷减薄,离子减薄,FIB等)1. 支持膜法适用范围:纳米颗粒(防止样品从铜网缝隙中漏出)支持膜种类:• 微栅膜• FIB微栅膜• 纯碳微栅膜• 多孔碳膜• Quantifoil规则多孔膜• C-flat纯碳多孔支持膜等图 筛网尺寸制备过程:• 制备支持膜:在铜网上覆盖一层有机膜后喷碳• 选择分散剂:根据样品性质选择,常用无水乙醇• 分散:使用超声波或搅拌将粉末分散成悬浮液液滴上支持膜(两种方法):(a)滴样:用镊子将覆盖支持膜的铜网夹住,并用滴管向支持膜上滴入数滴悬浮液,使其保持夹持状态直至干燥为止(推荐)(b)捞取:用镊子夹持载网浸入溶液捞取液滴(缺点:双面挂样制备关键和注意事项:• 样品粉末能否在支持膜上均匀分布• 确保实验过程中未带入污染物2.复型法基本原理:利用电子束透明膜(碳、塑料、氧化物薄膜)复制材料表面或者断口形态的间接试样制备方法。适用范围:在电镜中易起变化的样品和难以制成薄膜的试样。样品要求:非晶态、分子尺寸小、导电性、导热性良好,耐轰击,有足够的强度和刚度。复型法分类:塑料一级复型、碳一级复型、塑料-碳二级复型、萃取复型。(1)塑料一级复型样品上滴特定溶液,溶液在样表面展平,多余的用滤纸吸掉,溶剂蒸发后样品表面留下一层100nm左右的塑料薄膜。图 塑料一级复型(2)碳一级复型利用真空镀膜装置将碳膜蒸镀于试样表面,将试样置于真空镀膜装置内,将试样置于所配的分离液内经电解或者化学分离得到分离碳膜便可应用于分析。图 碳一级复型(3)萃取复型图 萃取复型(4)塑料-碳二级复型通俗地说,塑料的一级复型中又制造出碳复型即为二级复型。分辨率相当于塑料的一级复型,对试样无损害,耐电子束辐照,复型带重金属投影。图 碳二级复型3. 超薄切片法适用范围:生物组织、较软的无机材料等。1.取材 2.固定 3.漂洗 4.乙醇或丙酮系列脱水 5.渗透 6.包埋 7.聚合 8.修块 9.切片 10.捞片染色 11.电镜观察注意事项:• 迅速:最短时间内取样,投入固定液• 体积小:所取样品体积不超过1mm3• 轻:轻轻操作,使用锋利器械,避免拉、锯、压• 准确:所取部位有代表性• 低温:在0~4℃内操作4.离子剪薄法适用范围:用于非金属材料或非均匀金属制备过程:• 预处理:按预定取向切割成薄片,机械抛光减薄到几十μm,把边长/直径切割至3mm。• 装入离子轰击装置:• 抛光:获得平坦而宽大的薄区。图 离子剪薄法5.电解双喷减薄法适用范围:只能制备金属试样,首选大块金属。样品准备:• 磨抛厚度均匀,避免穿孔偏• 样品保证清洁• 多准备一些试样,试合适的条件制备步骤:• 样品接正极、电解液接负极,电解液从两侧喷向样品• 样品穿孔后,自动停机• 获得中间薄,边缘厚,呈面窝状的TEM薄膜样品电解液选择:根据样品;不损伤仪器优点:条件易控制,快速,重复性好,成功率较高。图 电解双喷减薄法原理图6. 聚焦离子束法(FIB)适用范围:适用于半导体器件的高精度切割与线路修复。原理:采用从液态金属镓中提取离子束,并通过调节束流强度对指定区域进行快速精细处理。方法:铣削阶梯法,削薄法(H-bar)铣削阶梯法:• 预处理:铣削出两个反向的阶梯槽,中间留出极薄的TEM试样• 标记:刻蚀出定位标记• 定位:用离子束扫描定位标记,确定铣削区域• 铣削:自动或手动完成铣削加工图 铣削阶梯法制备的样品TEM照片削薄法(H-bar):• 使用机械切割和研磨等方法将试样做到50-100μm厚• 使用FIB沉积一层Pt保护层• 使用FIB铣削掉两侧的材料图 削薄法工作示意图扫描电镜(SEM)扫描电镜样品制备比透射电镜样品制备简单,无需包埋和切片。样品要求:样品须为固体;达到无毒、无放射性、无污染、无磁性、无水分、组分稳定。制备原则:• 表面受到污染的试样,要在不破坏试样表面结构的前提下进行适当清洗,然后烘干;• 新断开的断口或断面,一般不需要进行处理,以免破坏断口或表面的结构状态;• 要侵蚀的试样表面或断口应清洗干净并烘干;• 磁性样品预先去磁;• 试样大小要适合仪器专用样品座尺寸。常用方法:块状样品块状导电材料:无需制样,用导电胶把试样粘结在样品座上,直接观察。块状非导电(或导电性能差)材料:先使用镀膜法处理样品,以避免电荷累积,影响图像质量。图 块状样品制备示意图粉末样品直接分散法:• 双面胶粘于铜片表面,借助棉球使被测样品颗粒直接撒布于其上,并用洗耳球对样品进行轻吹以去除粘附的、没有被牢固地固定的粒子。• 将装有颗粒的玻璃片翻起,对着已准备好的试样台用小镊子或者玻璃棒轻敲,使细颗粒能够均匀地落入试样台上。超声分散法:将少量颗粒放入烧杯内,加乙醇适量,超声震荡5分钟,然后用滴管加入铜片内,使其自然干燥。镀膜法真空镀膜真空蒸发镀膜法(简称真空蒸镀)就是将蒸发容器内需要成膜的原材料在真空室内进行加热,将蒸发容器内的原子或分子气化并从表面逸出,一种形成蒸气流并将其射入固体(称为衬底或基片)的表面以冷凝成固态薄膜的工艺。离子溅射镀膜原理:离子溅射镀膜在局部真空溅射室内辉光放电生成正向气体离子;在阴极(靶)与阳极(试样)之间电压加速时,荷正电离子轰击阴极表面并原子化阴极表面材料;生成的中性原子,向四面八方飞溅,射落在样品表面,从而在样品表面生成了均匀的薄膜。特点:• 对任何待镀材料来说,溅射都是可能的,只要它能够制成靶材即可(适用于难蒸发材料和不容易获得高纯度化合物的相应薄膜材料的制备);• 溅射所获得的薄膜和基片结合较好;• 消耗贵金属少,每次仅约几毫克;• 溅射工艺具有良好的可重复性,膜厚可控,同时能在大范围基片表面得到厚度均一的膜。• 溅射方法:直流溅射、射频溅射、磁控溅射、反应溅射。1.直流溅射图 直流溅射沉积装置示意图已经很少使用了,由于沉积速率过低~0.1μm/min、基片加热、靶材导电、直流电压和气压都必须很高。优点:装置简单,容易控制,支模重复性好。缺点:工作气压高(10-2Torr),高真空泵不起作用;沉积速率低,基片升温高,只能用金属靶(绝缘靶导致正离子累积)2.射频溅射图 射频溅射工作示意图射频频率:13.56MHz特点:• 电子作振荡运动,延长了路径,不再需要高压。• 射频溅射可制备绝缘介质薄膜• 射频溅射的负偏压作用,使之类似直流溅射。3.磁控溅射原理:用磁场使电子移动方向发生变化,电子移动轨迹被束缚与拉长,工作气体中电子电离几率增加,电子能量得到高效利用。由此使得正离子轰击靶材产生的靶材溅射变得更高效,可以在更低气压下溅射,而被正交电磁场捆绑的电子则会被束缚于靶材周围,仅能在它们能量消耗殆尽后沉积下来的基片中溅射。图 磁控溅射原理示意图特点:低温,高速,有效解决了直流溅射中基片温升高和溅射速率低两大难题。缺点:• 靶材利用率低(10%-30%),靶表面不均匀溅射;• 反应性磁控溅射中的电弧问题;• 薄膜不够均匀• 溅射装置比较复杂反应溅射溅射气体添加氮气、氧气、烷类等少量反应气体,反应气体和靶材原子共同沉积于衬底上,对于某些不容易发现块材而制造靶材的物质,或者溅射时薄膜成分易偏离靶材原成分,均可用此法进行。反应气体:O2,N2,NH3,CH4,H2S等镀膜操作将制备完成的样品台放置在样品托上,放入离子溅射仪,加盖,旋紧螺丝并开启电源抽真空。当真空趋于稳定时,在5 X10-1mmHg左右,按下“启动”键,用调节针阀把电流调节到6~8mA,开始镀金,镀金1分钟后即自动停止镀金,关好电源、打开顶盖螺丝、放掉气体、取下试样即成。图 Cressington 108Auto高性能离子溅射仪冷冻电镜制样冷冻电镜是扫描电镜超低温冷冻制样传输技术(Cryo-SEM)可以实现液体,半液体和电子束敏感样品的直接观测,例如生物和高分子材料。样品经超低温冷冻,断裂和镀膜制样(喷金/喷碳)后可由冷冻传输系统置于电镜中的冷台上(温度可至-185°C)观察。适用范围:塑料,橡胶及高分子材料,组织化学,细胞化学等样品制备要求:能够保持本身的结构,又能抗脱水和电子辐射方法:(a)通过快速冷冻使含水样品中的水处于玻璃态,也就是在亲水的支持膜上将含水样品包埋在一层较样品略高的薄冰内。图 液氮冷冻(b)采用喷雾冷冻装置(spray-freezing equipment),结合基质混合冷冻技术(spray-freezing),可在极短时间内将两种溶液(如受体和配体)混合(ms量级),然后快速冷冻。图 喷雾冷冻装置金相制样金相分析是材料研究领域中非常重要的一个环节,也是材料内部组织研究的一种主要方法。利用定量金相学原理通过对二维金相试样磨面或者薄膜进行金相显微组织测量与计算,确定合金组织在三维空间中的形态,进而建立合金成分,组织与性能之间定量关系。制样过程:样品切割、镶嵌样品、机械制样、检验样品样品切割方法:金相最适合的切割方法是湿式切割轮切割法。优点:所造成的损伤与所用的时间相比是最小的切割片的选择:主要依据材料的硬度和韧性进行选择。图 砂轮片的选择• 陶瓷和烧结碳化物:金刚石切割片• 钢铁材料:氧化铝(Al2O3)切割片和CBN切割片• 有色金属:碳化硅(SiC)切割片镶嵌样品金相样品镶嵌技术(以下简称镶样)是将试样尺寸小或形状不规则造成研磨抛光痛苦时镶嵌或夹持,以便于试样抛磨,提高工作效率和实验精度的一种工艺方法。镶样一般分为冷镶和热镶。冷镶应用:对于温度和压力极为敏感材料、和微裂纹试样要进行冷镶,会使试样组织不发生改变。图 冷镶示意图冷镶材料:一般包括环氧树脂、丙烯酸树脂、聚脂树脂。• 环氧树脂:收缩率低,固化时间长;边缘保护好,用于真空浸渍,适用于多孔性材料;• 丙烯酸树脂:黄或白,固化时间较短,适合批量大、形状不规整样品镶样;对于含裂纹或者孔隙的试件渗透性更好;尤其是对印刷电路板的封装;• 聚酯树脂:黄色、透明、固化时间较长;适用于大批量无孔隙的试样制样,适用期长;真空浸渍:多孔材料(如陶瓷或热喷涂层)需真空浸渍。树脂能增强这些脆弱材料并能尽量减少制备缺陷(例如抽出,开裂或未开孔等)。只有环氧树脂由于其低粘度、低蒸汽压的性质,才能在真空浸渍中使用。荧光染料和环氧树脂可以被混合以方便地发现荧光灯中所有被充填的孔隙。图 冷镶制样 图片来源:司特尔公司热镶应用:适用于低温及压力不大的情况下不发生变形的样品。图 热镶示意图镶材料:目前,通常多用塑料做镶嵌材料。镶嵌材料包括热凝性塑料(如胶木粉),热塑性塑料(如聚氯乙烯),冷凝性塑料(环氧树脂加固化剂)和医用牙托粉与牙托水。胶木粉不透光、色泽多样、且较坚硬、样品不易倒角、但抗强酸、强碱耐腐蚀性较差。聚氯乙烯呈半透明或透明状,抗酸碱耐腐蚀性能良好,但柔软。热镶试样图片来源:司特尔公司机械制样机械制样可分两种操作:研磨和抛光1.研磨研磨的终极目标就是要得到损伤最小的平表面。这些小损伤会在后续抛光中短时间内被去除。研磨分为粗磨和细磨两个过程。• 粗磨粗磨过程就是把全部试样表面变成一个类似的面,用比较粗的固定研磨颗粒就能快速磨去材料。• 精磨 精磨会使样品有些微变形,但这些变形在抛光过程中就会消除掉。2.抛光抛光就像研磨,还得除去前道工序造成的伤害。它可以分为金刚石抛光与氧化物抛光两大工序。• 金刚石抛光唯有把金刚石当作研磨料来抛光才有可能在最快的时间内得到最佳研磨平面。其原因是金刚石非常坚硬,几乎能切割所有的物质和相态。• 氧化物抛光 对于特别软、韧性的样品,须采用氧化物抛光法。抛光在抛光布上完成。金刚石抛光时还须用到润滑剂。研磨和抛光设备检验样品打磨后的检测部位变的发亮,在观察组织的时候需要先将试样的检测部位腐蚀掉,做好之后使用酒精冲淋,使用吹风机吹扫。
  • RETSCH推出新型全自动冷冻研磨仪cryomill
    骨头、塑料、生物、植物,这些商检、质检、高校等检测机构最常见样品您处理好了吗?处理后您的样品变性了吗?前处理的结果满足后续检测的需要了吗?您想让处理过程更简单吗? 您希望一款仪器能一次解决以上所有问题,并能让样品前处理的过程更简单更安全吗? 答案就是2009年RETSCH推出的新型研磨仪——全自动冷冻研磨仪cyomill。 她能轻易为您处理各类软性及中硬性材料的样品,特别对于塑料等热敏性材料,与cryomill更是绝佳的搭档。因为cryomill有专为冷冻研磨设置的一套智能系统! 全自动冷冻研磨仪cryomill 现代化的设计外形让人眼前一亮:一个研磨平台,一个平衡平台;特殊接口与液氮罐相连;透明保护盖,可视研磨过程;图形显示菜单,令操作更简单,研磨程序尽在掌握之中。 利用高速撞击的球磨原理对样品进行粉碎,振动频率最大可达25HZ,能量大,可在极短的时间得到极高细度的样品,结果还可用于光谱分析样品制备。并且研磨过程始终处在-196℃液氮中,保证样品绝不变性。 突破样品前处理史上最先进的技术,cryomill可以设置程序,控制整个研磨过程,根据样品的性质及数量你可以设置预冷却时间、研磨频率和研磨时间、冷冻研磨循环次数等。仪器运行时,您只通过图形显示的面板就可以知道研磨所处的阶段,所以在整个研磨过程中你都无需与液氮接触,避免了手动操作的繁琐和危险。 每一个细节,cryomill都为您设想周全:智能系统可以储存9组参数,简化了您的实验室工作;配套液氮罐autofill自动进气功能;多种研磨配件可供选择,根据您的实际需要可以选择25ml、35ml、50ml研磨罐,选用适配器使用4个5ml 的研磨罐。 以韧性的多糖为例,使用全自动冷冻研磨仪cryomill将多糖冷冻2分钟,研磨1分钟,设置3个循环,研磨结果小于100um。 研磨前后的多糖对比 除了低温冷冻研磨之外,cryomill依然可以进行常温的干磨和湿磨,例如对纺织品、PCB板、土壤、矿石等软性、中硬性和硬性样品都能达到要求的粉碎细度。 金属矿样用cryomill常温研磨5分钟,出样尺寸小于150um。 研磨前后的矿石对比 如此智能又方便的仪器您怎能错过,记住RETSCH,记住全自动冷冻研磨仪cryomill——低温粉碎技术的新里程碑。 为让RETSCH的产品帮助到更多的实验室人员,RETSCH在推出的新品的同时举办全球客户回馈活动——”WE R PREPARED”, 登录www.retsch.cn 参与答题您就有机会参加RETSCH全球旅行,选择拉斯维加斯冒险之旅或者瑞典冰雕旅馆的非凡体验,或者直接赢取现金5000.00欧元! 关注RETSCH, 关注2009!
  • 冷冻干燥机应用范围
    冷冻干燥机是目前较为先进的一种物质脱水干燥的设备,其原理是将含水物质在低温下冻结,而后使其中的水份在真空状态下直接升华,并用冷凝的方法捕凝升华的水汽,达到物质脱水干燥的目的。冷冻干燥机也因此被广泛应用到各行各业. 冷冻干燥机应用范围: 食品行业:冷冻干燥机常用于果蔬、肉禽、水产、调味品、方便食品及名优特产等干燥,因此冷冻干燥机也称为食品冻干机,保持食品原有的色、香、味、形、新鲜度不变的目的,且复水性好,成品便于储存和运输,费用降低,保存期延长。 药材保健:在干燥蜂王浆、人参、龟、鳖、蚯蚓等营养保健品,采用真空冷冻干燥工艺,更好的保留了原有的营养价值,更使人们相信该营养品纯真自然。 制药行业:用于血清、血浆、疫苗、酶、抗生素、激素等中西药品的脱水与保存。 生物研究:利用真空冷冻干燥技术长期保存的血液、细菌、动脉、骨骼、皮肤、角膜、神经组织和各种器官,在使用时只需供给水份即可再生,仍保持其生物理特性。 文章原创:上海田枫实业有限公司 www.tfsye.com上海田枫实业有限公司,专业生产各类制冷设备,包括层析冷柜,冻干机,冷水机,超低温冰箱,恒温槽等,一流的专业,一流的服务,上海田枫是您的最佳选择!
  • 冷冻电镜的分辨率革命
    p   精确认识细胞当中的大分子结构对于理解它们的功能至关重要。Amunts等人利用冷冻电镜获得线粒体核糖体大亚基3.2埃的分辨率结构,还有最近利用冷冻电镜获取的其他一些高分辨率结构,这些成就预示着分子生物学研究的新时代,获取近原子分辨率的大分子结构将不再是X射线晶体学和核磁共振的特权。 /p p style=" text-align: center " img alt=" " src=" http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/2014912171159.jpg" style=" width: 600px height: 350px " / /p p   图:利用冷冻电镜获得的近原子分辨率结构:(A)酵母线粒体核糖体大亚基,分辨率3.2 埃。(B) TRPV1离子通道,分辨率3.4 埃。(C)F sub 420 /sub -还原[NiFe]氢化酶,分辨率3.36埃。注:该图并不是按比例绘制的。 /p p   核糖体是古老的,大规模的蛋白RNA复合物,它将线性遗传密码翻译成三维蛋白质。线粒体——半自主细胞器,为细胞提供能量,拥有它们自己的核糖体,这一点和细菌非常类似。许多抗生素,如红霉素,通过阻止细菌的核糖体翻译机器来抑制细菌的生长。当设计新的抗生素,不能让他们同时阻断线粒体核糖体很重要。因此,认识这两种核糖体的详细结构是很有价值的。其他核糖体的结构已经通过X射线晶体学确定。Amunts等利用冷冻电镜确定了线粒体核糖体的高分辨率结构,这在不到一年前,很少有人会想到可能实现。 /p p   不用晶体而能够做到这一点无异于是一场革命。主要是因为采用了新的探测器——具有前所未有的速度和灵敏度的直接电子探测器。直接电子探测器能够直接检测电子,而不是需要先将它们转换成光子,然后再转化为光电子探测进行,目前广泛使用的CCD(电荷耦合器件)相机就是这样,但它们的分辨率不是很好。照相胶片从工作原理上来说,高分辨率成像效果应该更好,但它很难和越来越重要的快速读出电子速度及高数据吞吐量相兼容。 /p p   大约10年前,Henderson和Faruqi意识到,应该有可能设计出一种结合了CCD相机和胶片优点的直接探测电子的传感器。他们和两个竞争团队研发的探测器,采用了和大多数手机中的摄像头芯片基本相同的有源像素传感器技术。然而,手机的芯片不能用于电子显微镜,因为强烈的电子束会瞬间破坏它们。因此,首先探测器必须能够抗辐射。第二,探测器所需的像素要大很多,以防止富含能量的电子一次激发多个像素。第三,摄像头采用的芯片必须非常薄,完成每次读出电子160万像素,否则电子散射将会使图像模糊并降低分辨率。目前传感器的厚度大约是一张纸厚度的一半。 /p p   冷冻电镜只需要少量的样品,因此那些无法分离得到大量样品,利用X射线晶体学方法进行分析的物质,现在可以利用冷冻电镜得到高分辨率结构。这同样适用于不容易结晶的非均相样品或柔性复合物,因为不同颗粒或构象的物质的冷冻电镜图像在图像处理阶段很容易分离开。 /p p   新的检测器提供了另一种决定性的优势:当电子束撞击薄的、不支持冷冻的样品时,它们的快速读出能够补偿小的不可避免地移动。在新的相机问世前,由于电子束诱导移动引起的模糊是一个看似不可逾越的问题。现在,通过快速连续拍摄,可以得到一个区域的数十张图像,并且电子束诱导移动被检测到并反转在电脑上。这种去除模糊的影响戏剧性的和天文学哈勃望远镜相类似,尽管在这两种情况下引起模糊的原因是不同的。 /p p   新的相机也促使了低温电子断层扫描成像的重大突破,低温电子断层扫描能够得到全细胞、细胞片、或细胞区室的三维图像,如线粒体。利用断层成像识别分子特征,采用标准CCD相机甚至已达到亚纳米细节,新的探测器问世也必然给断层成像研究带来巨大的变化。 /p p   在新相机问世的同时,强大的极大似然图像处理程序也被开发出来。这些程序定义可靠客观的标准,来对几万或几十万个的单粒子图像进行平均处理,为的是要实现高分辨率。先进的检测器和软件相结合,获取的冷冻电镜结构,在相同的标称分辨率下,其清晰度和map definition比采用X射线晶体学解析的结构要好,因为在冷冻电镜图像中包含着高质量的相位信息。 /p p   冷冻电镜的分辨率革命是否意味着X射线蛋白质晶体学时代即将结束?当然不是。在可预见的将来,分子量小于100kD的小蛋白,分辨率达到2 Å 或更好将依然是X射线晶体学的领域。但是对于大的,易碎的,或者柔性结构蛋白(如膜蛋白复合物),它们很难形成晶体,但却在生物医学中起着关键的作用,新技术将对此带来重大突破。在未来,对分子量大、已知的蛋白复合物,如核糖体,进行结晶将可能不再是必要的。相反,它们的结构可以从容并迅速的通过冷冻电镜来确定。这真是激动人心的时刻。(编译:秦丽娟) /p p & nbsp & nbsp 原文检索: a href=" http://www.sciencemag.org/content/343/6178/1443.short" http://www.sciencemag.org/content/343/6178/1443.short /a /p
  • 中科院遗传发育所2320万采购1套冷冻透射电镜
    p   日前,中国科学院遗传与发育生物学研究所发布冷冻透射电镜系统采购项目公开招标公告,预算2320万元。 /p p   公告中要求:冷冻透射电镜系统包括120kv冷冻透射电子显微镜和200kv冷冻透射电子显微镜,是目前生物医学研究中非常重要的大型仪器设备。其中120kv冷冻透射电子显微镜主要用于冷冻电镜负染色样品的观察以及简单冷冻样品的筛选,200kv冷冻透射电子显微镜主要用于冷冻蛋白样品的筛查和数据收集工作。 /p p   项目名称:中国科学院遗传与发育生物学研究所冷冻透射电镜系统采购项目 /p p   项目编号:OITC-G190311076 /p p   预算金额:2320.0 万元(人民币) /p p   开标时间:2019年08月20日 13:30 /p p   采购项目的名称、数量、简要规格描述或项目基本概况介绍: /p p /p table border=" 1" cellspacing=" 0" cellpadding=" 0" align=" center" width=" 605" tbody tr class=" firstRow" td width=" 6%" p style=" text-align:center " 包号 /p /td td width=" 7%" p style=" text-align:center " 货物名称 /p /td td width=" 8%" p style=" text-align:center " 数量 br/ & nbsp & nbsp & nbsp (套) /p /td td width=" 40%" p style=" text-align:center " 简要技术规格 /p /td td width=" 5%" p style=" text-align:center " 交货 br/ & nbsp & nbsp & nbsp 期 /p /td td width=" 9%" p style=" text-align:center " 交货(竣工)地点 /p /td td width=" 13%" p style=" text-align:center " 是否允许采购进口产品 /p /td td width=" 8%" p style=" text-align:center " 采购 br/ & nbsp & nbsp & nbsp 预算 /p /td /tr tr td width=" 6%" p style=" text-align:center " 1 /p /td td width=" 7%" p style=" text-align:center " 冷冻透射电镜系统 /p /td td width=" 8%" p style=" text-align:center " 1 /p /td td width=" 40%" align=" center" valign=" middle" p style=" text-align:center " 冷冻透射电镜系统包括120kv冷冻透射电子显微镜和200kv冷冻透射电子显微镜,是目前生物医学研究中非常重要的大型仪器设备。其中120kv冷冻透射电子显微镜主要用于冷冻电镜负染色样品的观察以及简单冷冻样品的筛选,200kv冷冻透射电子显微镜主要用于冷冻蛋白样品的筛查和数据收集工作。 /p /td td width=" 5%" p style=" text-align:center " 合同签订后9个月 /p /td td width=" 9%" p style=" text-align:center " 用户指定地点 /p /td td width=" 13%" p style=" text-align:center " 是 /p /td td width=" 8%" p style=" text-align:center " 2320万元 /p /td /tr /tbody /table p br/ /p p /p p br/ /p
  • EYELA仪器应用---香精香料的化学浓缩和干燥
    香料香精普遍存在于我们的日常生活中,作为重要的香味添加剂使用,比如食品用香精、烟用香精、饮料用香精、香水用香精、化妆品用香精等众多领域。香精的来源可以从天然香料植物中提取也可以进行人工的合成。所以香料的制作过程变还原为了一个化学过程。那看看我们浓缩、干燥设备在香料提取中发挥的作用吧。 浓缩薄膜浓缩系统薄膜浓缩装置主要针对易发泡和热敏性样品、植物香料的浓缩,推荐系统配置如下:1、薄膜浓缩蒸发仪MF-1000型2、冷却水循环装置CCA-1112A型3、温水循环装置HS-1000型4、真空控制器NVC-3000型5、隔膜真空泵NVP-1000型 旋转蒸发仪系统普通样品也可以使用配置了溶媒回收装置的旋转蒸发仪系统,经石油醚、乙醇、丙酮等对鲜花、芳香植物树脂、辛香料等提取后的浓缩,溶媒回收装置吸收真空泵排出的尾气,即使不放到通风厨内仍然保持实验室无污染。推荐系统配置如下:1、旋转蒸发仪N-1300型2、冷却水循环装置CCA-1112A型3、真空控制器NVC-3000型4、隔膜真空泵NVP-1000型5、溶媒回收装置DPE-1250型 干燥冷冻干燥系统运用冷冻干燥机对浓缩完成的样品进行冷冻干燥处理,预冻和冻干一气呵成,便可以得到干燥样品。推荐系统配置如下:1、冷冻干燥机FDU-2110型2、真空油泵GCD-136XN型3、程序冻干仓DRC-1100型4、预制冷旋转装置PFM-1000型 真空干燥箱系统干燥样品也可以选用EYELA新型真空干燥箱VOS系列,采用创新设计的门把手设计,精确的温度控制、程序控制。推荐系统配置如下:1、真空定温干燥箱VOS-310C型2、隔膜真空泵NVP-2000型 香料已经深入到我们生活的方方面面,无论在过去现在和未来,都会在我们的日常生活中发挥着重要的作用,提升我们对生活的品质。香料研究也必然是个永不消失和永远年轻的课题,我们的科学仪器也将在这人类幸福的舌尖科研中留下浓墨的一笔。
  • 冷冻电镜单颗粒技术的发展、现状与未来
    p   作者:黄岚青,刘海广(北京计算科学研究中心 复杂系统研究部) /p p    span style=" background-color: rgb(112, 48, 160) color: rgb(255, 255, 255) " strong 1 引言 /strong /span /p p   在低温下使用透射电子显微镜观察样品的显微技术,就叫做冷冻电子显微镜技术,简称冷冻电镜(cryo-electron microscopy, cryo-EM)。冷冻电镜是重要的结构生物学研究方法,它与另外两种技术:X射线晶体学(X-ray crystallography)和核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)一起构成了高分辨率结构生物学研究的基础,在获得生物大分子的结构并揭示其功能方面极为重要。 /p p   电子显微三维重构技术起源于1968 年,D.J. De Rosier 和Aaron Klug 在Nature 上发表了一篇关于利用电子显微镜照片重构T4 噬菌体尾部三维结构的著名论文,提出并建立了电子显微三维重构的一般概念和方法。Aaron Klug 本人也因为这个开创性的工作获得了1982 年的诺贝尔化学奖。 /p p   为了降低高能电子对分子结构的损伤,Kenneth A. Taylor 和Robert M. Glaeser 于1974 年提出了冷冻电镜技术,并且用于实验研究。经过三十多年的发展,冷冻电镜技术已经成为研究生物大分子结构与功能的强有力手段。冷冻电镜本质上是电子散射机制,基本原理就是把样品冻起来然后保持低温放进显微镜里面,利用相干的电子作为光源对分子样品进行测量,透过样品和附近的冰层,透镜系统把散射信号转换为放大的图像在探测器上记录下来,最后进行信号处理,得到样品的三维结构。 /p p   在超低温的条件下,电子带来的辐射损伤被有效控制。即便如此,分子样品所能承受的辐射剂量也是非常低的,导致信噪比非常低。另外,随着观测的进行,额外的电子会累积而造成分子的移动,导致获得的图像变得模糊。这就好比用一个简单的傻瓜相机拍摄在雨中飞驰的子弹,得到的影像必然是模糊的并且充满噪音。因此,冷冻电镜的方法技术在很长时间内只能确定个头比较大的样品的结构,比如病毒颗粒的结构,而且通常分辨率都不高。然而随着工程技术和算法的不断发展,能够确定的分辨率也越来越高(图1(a)),2016 年发布的谷氨酸脱氢酶结构的分辨率甚至已经达到了1.8 Å 。与此同时,也有越来越多的通过冷冻电镜技术得到的研究成果发表在高水平的期刊上(图1(b)),冷冻电镜正备受科学界的关注。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/5b2ef847-cad0-4d88-b1ad-ebf14bd21e9c.jpg" title=" 1.jpg" / /p p   图1 冷冻电镜技术和单颗粒重构技术越来越备受关注(统计数据来源于EMDataBank )(a)不同年份中利用冷冻电镜单颗粒重构技术能够达到的最高分辨率 (b)通过冷冻电镜技术进行的研究成果在不同杂志上发表的论文数 /p p   在最近几年,冷冻电镜技术有了革命性的进步,主要得益于三个方面的突破。首先是样品制备,通过利用薄膜碳层甚至石墨烯可以用更薄的冰层包裹分子样品来提高信噪比。第二个突破是电子的探测技术,也就是电子探测器的发明。在300 keV 电子的轰击下,传统的器件都会被高能量打坏,因此在电子探测器出现之前,冷冻电镜中使用的CCD相机需要将电子打在探测器上变成光信号,再通过CCD 把光信号转成电信号后得到图像,“电光—光电”转换的过程降低了信噪比。而现在电子探测器能够直接探测电子数量,同时,互补型金属氧化物半导体(CMOS)感光元件的应用使得探测器支持电影模式(movie mode),可以在一秒钟之内获得几十张投影图片。通过后期对样品进行漂移修正,再把这几十张图片叠加起来,从而大幅提高成像的信噪比。模糊的子弹一下子变得清晰,冷冻电镜的分辨率不断上升。第三个突破是计算能力的提高和软件算法的进步。冷冻电镜的模型重构通常需要对几万甚至几十万张投影图片进行分析、组装和优化。这需要先进的计算资源配合有效的算法才能实现。基于贝叶斯理论的模型重构框架解决了这个问题,我们在下文中详细介绍。综上所述,冷冻电镜技术不仅提高了空间分辨率,而且可以应用于很多以前不能解决的生物大分子的结构研究。 /p p   具有里程碑意义的成果是,2013 年加州大学旧金山分校(UCSF) 程亦凡和David Julius 的研究组首次得到膜蛋白TRPV1 的3.4 Å 近原子级别高分辨率三维结构,结果发表在Nature 上。我国在冷冻电镜的应用领域也有很大突破,代表性工作包括清华大学的施一公研究组和剑桥大学MRC 实验室Sjors H.W. Scheres 研究组合作在2015 年获得的γ 分泌酶复合物结构( 图2(c)), 以及2015 年清华大学高宁研究组和香港科技大学戴碧瓘研究组合作得到的3.8 Å 的真核生物MCM2-7 复合物结构 2015 年北京大学毛有东研究组、欧阳颀研究组与哈佛医学院吴皓研究组合作得到炎症复合体的高分辨率三维结构(图2(a)) 2014 年中国科学院生物物理研究所朱平研究组和李国红研究组合作得到的30 nm 染色质左手双螺旋高级结构(图2(b))以及2016 年中国科学院生物物理研究所柳振峰、李梅、章新政三个研究组合作得到3.2 Å 的捕光复合物II 型膜蛋白超级复合体结构。这些成果在结构生物领域得到巨大的反响,这也使得冷冻电镜高分辨率成像技术获得空前的关注。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/44d05be3-281b-4507-b0fc-9d200025422f.jpg" title=" 2.jpg" / /p p   图2 我国在冷冻电镜领域中获得高质量的研究成果(a)近原子分辨率的炎症复合体结构(图中NBD为核酸结合结构域,HD1 为螺旋结构域-1,WHD为翼螺旋结构域,HD2 为螺旋结构域-2,LRR为亮氨酸重复序列) (b)30 nm 染色质左手双螺旋高级结构 (c)3.4 Å 的人源γ 分泌酶复合物结构(图中NCT是一种I 型单次跨膜糖蛋白,APH-1 为前咽缺陷蛋白-1,PS1为早老素-1,PEN-2 为早老素增强子-2) /p p   strong span style=" background-color: rgb(112, 48, 160) color: rgb(255, 255, 255) "  2 图像处理技术 /span /strong /p p   经过多年的发展,目前冷冻电镜的数据处理部分主要包含了以下的流程(图3): /p p   (1) 衬度传递函数的修正(CTF correction) /p p   (2) 样品分子投影数据的筛选(particle selection) /p p   (3) 二维投影数据的分类和降噪(2D analysis) /p p   (4) 三维模型的重构和优化(3D reconstruction and refinement) /p p   (5) 多重构象的结构分析(heterogeneity analysis) /p p   (6) 对重建结构分辨率的分析(structure resolution assessment) /p p   (7) 结合生物化学原理和实验数据对三维结构的解读(model interpretation and validation) /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/ef81cf1e-580c-4eda-9e77-e2edc542f953.jpg" title=" 3.jpg" / /p p style=" text-align: center "   图3 冷冻电镜数据分析处理流程 /p p   图像处理软件的发展对冷冻电镜单颗粒重构技术极其重要,当前广泛使用的电镜分析软件系统主要包括SPIDER,EMAN2, FREALIGN,SPARX,RELION等。对于刚刚接触单颗粒重构技术的人来说,更偏好集成的软件套装来完成整个分析流程。我们在表1 中列出了大部分主流的综合冷冻电镜图像处理软件,以供参考。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/f4fafde5-da41-422a-acc4-bcd118be0c8e.jpg" title=" 4.jpg" / /p p style=" text-align: center "   表1 冷冻电镜中流行的图像处理软件 /p p    strong 2.1 衬度传递函数估计与修正 /strong /p p   衬度传递函数(contrast transfer function,CTF)是在数学上描述通过透射电子显微镜得到样品图像上的像差变化。准确地判断衬度传递函数对于确认显微图像的质量以及后续的三维结构重建极为重要。常用的估算衬度传递函数的参数软件是CTFFIND4。确定了CTF 的参数以后,就可以对采集到的冷冻电镜图像进行修正。这个修正过程其实就是图像处理中的图像复原技术。 /p p    strong 2.2 颗粒挑选 /strong /p p   接下来需要从原始数据中筛选出颗粒投影,也被称为“颗粒挑选”,颗粒挑选的好坏也将影响所有后续的分析和处理过程,是一个重要并且繁琐的步骤。颗粒挑选方式可以分为手动挑选、半自动挑选和完全自动挑选这几种。 /p p   在早期的分析中,对于结构的了解还非常少,优先考虑的都是人工挑选。但是自动的颗粒图像获取方法的出现使得在很短时间内可以收集数十万张颗粒图像,人工挑选大量的颗粒图像不太现实,并且人工的挑选通常会过于集中于某一类颗粒图像,导致遗漏和偏差。 /p p    strong 半自动和全自动的方法主要有以下三类: /strong /p p   (1)通过例如降噪、反衬增强、边缘算子等图像形态学方法搜索区域,基于数字图像处理学的原理,将颗粒图像与背景分离开来。 /p p   (2)基于模板的方法,通过扫描数据图像和已知的模板比较来挑选出潜在的颗粒图像,模板的来源通常为手动选出的数据图像中较为清晰的颗粒图像,或者是已知结构的投影。 /p p   (3)结合无模板和有模板的方法,通过一些有监督的机器学习算法进行颗粒挑选。 /p p   随着图像识别领域中深度学习方法的流行,各类基于深度学习的颗粒识别框架也被引入到颗粒挑选的过程中。随着深度学习方法的发展,相信如何把深度学习方法应用到单颗粒冷冻电镜图像分析领域的研究将会越来越多。 /p p    strong 2.3 二维图像分析——颗粒图像的匹配与分类 /strong /p p   二维颗粒图像的分类是获取三维结构过程的第一步。对二维图像的分析包括两部分:颗粒图像的匹配和颗粒图像的分类。 /p p   匹配的过程通常会对颗粒图像应用一些变换操作,通过关联函数去判断不同颗粒图像之间的相似程度。图像匹配的算法主要分为两种,即不依赖模型的方法和基于模型的方法,取决于是否存在利用样本先验信息得到的模板。 /p p   随着图像匹配的完成,颗粒图像需要进行分类。主要利用多元统计分析和主成分分析方法等算法,其他流行的二维颗粒分类技术还有神经网络分类,将图像在二维空间自组织映射(self-organising mapping,SOM)再进行分类和排序。 /p p   二维图像分析的目的是,首先通过图像匹配消除旋转和平移的误差,利用类内紧致、类间离散的原则进行图像分类,最终可以对类内颗粒图像进行平均,提高信噪比,从而实现对高分辨率三维结构的构建。 /p p    strong 2.4 模型重构和优化 /strong /p p   模型三维重构的基础是中心截面定理,重构过程中的关键问题是如何确定每个颗粒图像的空间角(orientation determination)。大多数模型重构和优化算法都是基于投影匹配(projection matching)的迭代方法。简单说就是,先利用粗糙的三维结构模型,进行投影得到参考的图像,和实验颗粒图像进行比对,根据结果来更新空间方位参数,继而构造新的三维结构,对实验图像的空间方位修正,形成迭代的过程,直至收敛就获得了最终的三维模型。 /p p    strong 2.5 分辨率的确定及二级结构的确定 /strong /p p   在模型优化的过程中,通常有很多指标给出结构的分辨率信息。目前一个较为广泛使用的分辨率信息参数是被称为傅里叶壳层关联函数(Fourier shell correlation,FSC)曲线,并通过在曲线上选取一个合适的阈值来判定分辨率。 /p p   在模型优化中经常伴随着过拟合的问题。过拟合的出现通常由于在优化过程时无法分辨“噪声”与“信号”。为了避免过拟合对分辨率的误判,最近一种被称为“黄金标准”(gold standard)的优化过程开始被广泛使用。 /p p   根据不同的分辨率,可以从结构中得到不同的信息量。按照分辨率数值大致分为三个范围: /p p   (1)结构分辨率大于10 Å 的生物大分子结构被视为低分辨率的结构,在低分辨率的结构范围内只观察得到一个大致的整体形状,以及有可能分辨出主要成分的相互位置关系。 /p p   (2)一个中等分辨率的生物大分子结构精度大约在4—10 Å 之间,在这个分辨率范围内的生物大分子结构已经可以得到一些二级结构的信息和分辨出大部分组成结构的相对位置关系。分子结构之间如果存在构象变化也可以分辨出来。 /p p   (3)高精度甚至是近原子级别的分子结构分辨率可以达到4 Å 以下。在高分辨率的三维结构中,可以准确地看见如α肽链等的二级蛋白质结构以及部分单独的残基,多肽链的结构变得清晰起来。同时高分辨率的分子结构可以描述精确的构象变化。 /p p   总之,FSC 曲线等标准提供的分辨率是一个有指导意义的数字,不可作为绝对参考来评价所获得的模型质量,需要批判地对待,尤其是要与生物分子系统的生物化学知识相结合。 /p p    strong 2.6 三维结构的多构象性和动态分析 /strong /p p   生物大分子通常具有内禀的柔性,所以生物分子的动态结构变化以及结构的不均一性一直是结构生物学的研究重点之一。在晶体状态下,生物分子的结构变化被晶格约束,一般只提供一个静态的结构和有限的动力学参数。冷冻电镜相比晶体学方法的优势在于可以捕捉生物分子在溶液中的形态,并记录下不同构象下的投影。因此针对冷冻电镜的数据可以进行多构象的重构,现有的一些算法是通过聚类分析、最大似然法分析等对多构象进行分析,得到的生物大分子结构形态和构象差异还需要结合分子功能来检验分子结构的合理性。 /p p    strong span style=" background-color: rgb(112, 48, 160) color: rgb(255, 255, 255) " 3 最新进展和突破 /span /strong /p p    strong 3.1 最大似然估计理论 /strong /p p   近年来在单颗粒分析中取得重大突破的应当是最大似然估计(maximum likelihood)理论。最大似然估计的理论可以贯彻整个单颗粒技术图像分析的过程,在图像匹配,2D、3D分类 和模型优化上均可以应用,是一个强有力的理论工具。最大似然估计的算法已经在RELION、FREALIGN 等软件中实现,方便普通用户使用,这对于推动冷冻电镜成像技术的应用有重大意义,近三四年来有许多突破性的近原子级别分辨率的分子结构大多是由基于最大似然估计理论的分析软件得到。 /p p   3.1.1 减少计算需求 /p p   最大似然估计算法的计算量很大,如何降低计算量是一个重要问题。过多的计算资源消耗曾经阻碍这个方法在冷冻电镜单颗粒重构中的广泛应用。在减少最大似然算法在冷冻电镜应用中的计算需求方面,有两个重要的贡献是空间降维(domain reduction)算法和网格插值(grid interpolation)算法。 /p p   我们最近在研究一个新的方法来对旋转参数进行分步处理,初步的结果显示这种方法可以把计算复杂度降低一个维度,这个方法可很好地应用于高信噪比的数据处理,但对于低信噪比的数据分析还需要对该方法进行改进。 /p p   3.1.2 对最大似然方法的未来展望 /p p   在未来的研究中,关注点是减少计算的耗时和增加准确度。通用图形处理器(GPU)的应用和CUDA 编程框架已经显示出了在高性能计算领域的威力,研究表明GPU 技术可以显著减少计算时间,而RELION 也将发布支持GPU 计算的2.0 版本。 /p p   在加快计算速度的同时,提高模型的重构的准确性则更为重要。如何提高颗粒图像的准确性以及最大似然方法在这些方面的应用还有待深入探索。总而言之,最大似然方法独特的、可扩展的统计理论框架可以适用在冷冻电镜的各种问题上,如多构象、低噪声、信息缺失中均有很好的应用。 /p p    strong 3.2 流形嵌入方法(Manifold Embedding) /strong /p p   自然界的分子过程通常是连续的,比如三磷酸腺苷(ATP)合成酶等分子结构的状态变化通常都是连续的。现有的方法只能得到有限的、若干个离散的构象变化,限制了我们对于分子结构的进一步观察。而流形嵌入法则是通过将颗粒图像映射到具有特定拓扑结构的参数空间(manifold space),可以分辨出更为细致的动力学变化,进而实现对生物分子连续的结构变化过程的研究。Ali Dashti 等人已经利用这种方法成功刻画出核糖体的结构变化路径。 /p p    strong 3.3 揭开表面看实质 /strong /p p   冷冻电镜对更为复杂的结构并没有很好的处理方式,在一些分子量比较大,包含多层的病毒结构研究中,一直没有高分辨率的三维模型,这也是由于病毒普遍具有对称失配的特性,基因结构被壳体完全覆盖,无法通过二维图形处理的方式对内部结构直接进行重构。刘红荣教授通过改进衬度分离方法展示出了解决该类问题的途径,其发展的新方法已经成功应用在一个多面体衣壳NCPV的病毒颗粒(图4)上,通过该重构方法,使得外部的衣壳结构(图4(a))和内部的基因组结构(图4(b))分离,成功得到包含在内部的dsRNA 近原子级高分辨率结构和分布。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/7ab0c5f3-c403-4231-924f-9900a3758eb7.jpg" title=" 5.jpg" / /p p   图4 利用衬度分离方法得到对称失配情形下的病毒颗粒结构(a)外部的衣壳结构 (b)内部的基因组结构 /p p    strong 3.4 罗马不是一天建成的(Building Protein in One Day) /strong /p p   最近的研究成果显示,最大似然估计算法能够更好更快地完成三维重构,多伦多大学的Marcus A. Brubaker 教授针对最大似然估计算法提出了优化,有效地缩短了三维重构所需的时间。对传统迭代算法极度依赖于初始模型结构的缺点进行改进,同时通过采样优化的方式降低了计算量,减少计算时间,据称这些优化可以达到100000倍的加速,利用一台计算机工作站在一天内就能完成模型重构。 /p p   strong span style=" background-color: rgb(112, 48, 160) color: rgb(255, 255, 255) "  4 展望与总结 /span /strong /p p   冷冻电子显微镜技术已经发展成为一个成熟的方法,应用于各种复杂的生物分子体系的高分辨结构研究。按照目前的发展势头,解决生物分子结构组(structural proteome)的问题已经不是遥不可及的了。在解决单一静态结构的基础上,冷冻电镜也展示了其研究多构象体系的潜力。下面对冷冻电镜在结构生物学研究领域的应用做一些大胆的展望,希望能抛砖引玉。 /p p    strong 4.1 解决膜蛋白的结构 /strong /p p   由于膜蛋白是镶嵌在磷脂分子构成的细胞膜内,目前在冷冻电镜领域的样品制备还没有很好的处理方法,因此还很少见到对膜蛋白的结构解析。随着技术的发展,新的试剂分子或者纳米尺度的容器可以用来制备单一性很高的稳定的细胞膜以及镶嵌在内的膜蛋白。这样就可以利用冷冻电镜的方法对膜蛋白进行结构研究。目前在纳米盘(nanodiscs)的研究领域已经取得了一定的进展,对 /p p   冷冻电镜解析高精度的膜蛋白结构,我们拭目以待。 /p p   strong  4.2 细胞内分子结构测定:从溶液内(in vitro)到细胞内(in situ) /strong /p p   当前的高分辨分子结构基本都是在溶液中提纯出来的分子样品,也就是通常所说的in vitro 实验。现在可以利用快速冷冻的方法把细胞固定,再用高能粒子枪对细胞进行高精度切片。在细胞的某些部位,常常有大量同类分子聚集,比如在内质网(endoplasmic reticulum,ER)部分有很多核糖体,在细胞骨架上会有大量的肌动蛋白(actin)分子。对这些切片进行成像研究可以获取这些分子在细胞环境的结构信息。 /p p   strong  4.3 细胞结构和分子在细胞内的分布:从部分到整体 /strong /p p   电镜可以用来做断层成像(cryogenic computed tomography,cryo-CT),应用于亚细胞层面的研究,比如细胞器的结构,蛋白质分子的分布,以及一些细胞骨架的构成。与超低温样品操作结合,cryo-CT 可以提供更高分辨率的信息,衔接分子层面和细胞层面的知识,对于了解细胞功能至关重要。在电镜成像研究领域,这将是一个有广阔前景的课题。 /p p   strong  4.4 多构象的识别和自由能景观确定 /strong /p p   人们开始不满足于近原子级别分辨率能够提供的信息,想要进一步刻画分子结构连续变化的状态。得益于冷冻电镜的成像特性,相对其他技术而言,冷冻电镜技术在时间尺度的系综上具有优势。在冷冻电镜下分子结构的动力学研究中,有两个值得关注的趋势,分别是能够获取分子结构“ 慢” 反应过程(10—1000 ms) 时间分辨(time-resolved)的冷冻电镜技术,以及能够分析出连续构象变化的分类算法。获取短期反应过程(10—1000 ms)分子结构的基础是在准备样本过程中分子反应的速度慢于冷冻样本的时间,目前混合喷雾(mixing-spraying)等快速冷冻技术的实现使得一些较慢的反应过程可以看到动力学变化。而流形嵌入算法在分类过程中取得突破,在更好地利用冷冻电镜观察分子的平衡态结构动力学变化和展现自由能景观上取得了令人鼓舞的成果。 /p p   strong  4.5 从静态结构到动态分子电影 /strong /p p   生物分子在室温下是活跃的,而且大多数的分子功能是通过结构的变化来实现的。基于X射线, 尤其是最近发展的X 射线自由电子激光(XFEL)的结构生物学的研究重点之一便是实现时间分辨的结构生物学研究(time-resolved structure determination)。到目前为止,基于X 射线的研究取得了很大的进展,但主要还是局限在对晶体的衍射方面,比如对光合作用过程中水分子分解的研究和光敏黄蛋白的光吸收过程的研究。三维冷冻电镜的单颗粒成像技术最有希望在单分子水平上实现对时间分辨的结构变化研究,同时,这对于样品制备和实验操作提出了非常高的要求。 /p p   strong  5 结束语 /strong /p p   冷冻电镜的技术突破及其在生物分子结构领域的应用把我们对分子生物学的研究推进了一大步,开始探索未知的区域。立足于解决单一构象的基础,对多构象以及动力学过程和热力学的研究也需要展开,这需要对现有技术进行提升并与其他方法进行结合,计算建模和模拟的方法也需要紧密结合起来,实现对生物分子系统的集成研究。 /p p   致谢 感谢北京大学欧阳颀教授对文章写作提出的宝贵意见。 /p
  • 【巴爷爷的博客】如何寻找合适的压力判定冷冻干燥终点?
    在适当的时候结束初级和次级干燥步骤是提高冷冻干燥过程效率的一个关键方面。使用压力作为终点判定标准是确定这两个冻干步骤终点的一个很好的方法。下文中会描述原理和相关的工具来进行压差测量。文中的实验数据对建立最合适的终点标准时会起到作用。上周末我和一群朋友去山里徒步旅行。我们走了几个小时,午饭时间到了一间小屋。此时,我们已经完全没有体力活动和呼吸新鲜的空气了。我们坐下来,点了很多好吃的东西,然后开始把自己弄得傻乎乎的。当我发现肚子里有压力和疼痛时,我才停下来。我的胃不舒服地扩大了我徒步旅行短裤的腰围,并成为这个午餐时间暴食的一个明显的终点标准。当我坐在那里,试图消化和准备继续前行时,我陷入了沉思。老实说,每当我陷入思考的时候,我通常都在想着实验室。当我感觉到胃里的压力逐渐减轻时,我回想起的不仅是一顿丰盛的饭菜,还意识到压力对于判定终点非常有帮助。我在之前已经讨论了冷冻干燥后使用温度来确定次级干燥步骤的终点。在这里,我想给您介绍一个基于压力差的替代方法。冷冻干燥事实上,压力差测试是一种非常好的无损终点检测方法,用于确定初级或次级干燥阶段的结束。该技术使用两种不同的压力计,一个皮拉尼传感器和一个电容压力计。皮拉尼传感器的工作原理是气体的热导率随压力变化。压力计用一根细导线悬挂在气体中,用电流加热来测量压力。在高压下,由于周围气体分子与金属丝的高碰撞率,金属丝将热能损失给气体。这一原理如下图所示。当真空降低时,气体分子的数量和周围介质的导电性一起减少。然后,媒介开始慢慢失去热量。由于这一过程依赖于气体分子的热导率和气体成分,皮拉尼传感器只能在其校准条件下显示正确的压力,而校准条件通常设置在纯氮或空气环境中。除了皮拉尼传感器外,电容式压力计还用于独立于气体成分测量压力。对于这种类型的压力计,电容信号的差异是由压力计内部的物理变化产生的,而不是气体性质的变化。因此,用电容式压力计测量压力与气体成分无关。如果您像我一样,您可能会想知道这两种工具在这种终点确定中是如何协同工作的。在冷冻干燥过程中,由于冰的升华,干燥室内的气体几乎完全由水蒸气组成。样品干得越多,气体成分的变化就越大。水蒸气被氮气或空气代替,直到干燥过程结束时,室内气体只含有纯氮气或空气。由于水蒸气的热导率比氮气的热导率高约 1.6 倍,皮拉尼压力计在纯水环境中的测量偏差约为 60%。皮拉尼压力计和电容式压力计只能在样品干燥后测量相似的压力,并且室内气体的成分主要是纯氮或空气。因此,当到达终点时,两个工具显示的压力相同。下图以图形方式描述了该过程。重要的是,压力波动阻止了这两种测量工具之间的差异达到零。一个合适的终点标准应高于压力波动引起的差值。该值还应足够低,以确保在切换到下一个冻干步骤之前,两个显示压力之间的差异在给定的时间内最小。听起来很简单。但是如何真正建立一个合适的终点标准呢?为了找到合适的压差,我们使用测试方案进行多次测试:我用甘氨酸溶液(去离子水中 5%W/V)作为试验溶液。将溶液在 -40°C 下冷冻 24 小时以上,并在冷冻干燥机上以 0.3mbar 的压力进行干燥。重要的是,在每次冻干循环之前,应进行真空试验,以校准皮拉尼压力计。此步骤是强制性的,以确保皮拉尼压力计在干燥阶段前后显示正确的压力。为了找到一个合适的终点标准,我以不同的压差作为终点标准进行了多次试验。当隔板的温度与样品的温度一致,两个压力计的压力合并时,终点检测成功。结果如下图所示:上图所示为压差为 0.05 mbar 的结果,中间图为 0.03 mbar,底图为 0.025 mbar 作为终点标准。在达到终点标准之前,压差至少保持 60 分钟。隔板温度用黄线表示,样品温度用红线表示,干燥箱压力用绿线表示,皮拉尼压力计在初级干燥(白色阴影)和二级干燥(灰色阴影)上用蓝线表示。同时显示达到压力(黑线)和温度终点标准(黑色虚线)的时间,以及该点相应的温度和压力差。结果表明,只有在压差为 0.025mbar 的循环中,压力曲线和温度曲线在切换到二级干燥之前同时合并。在 0.30 mbar 的设定压力下,0.025 mbar 或更小的压差保持 60 分钟以上可被视为合适的终点标准。对于简单的甘氨酸溶液来说,这没问题,但是对于那些需要二级干燥的更具挑战性的样品呢?嗯,我决定用美味的草莓进行冷冻干燥实验。草莓在 -40°C 下冷冻 24 小时以上,并在 0.3 mbar 的压力下冷冻干燥,初级干燥时隔板温度为 25°C,二级干燥时为 40°C。选择 0.025mbar 的压差作为终点标准。最大的草莓带着一个热电偶,这样样品的温度就可以与隔板温度相比较。上图显示了整个冻干循环,下图显示了二级干燥步骤的截取图。隔板温度用黄线表示,样品温度用红线表示,干燥箱压力用绿线表示,皮拉尼压力计用蓝线表示。图中的白色阴影表示初级干燥,而灰色阴影表示二级干燥。同时还显示了达到终点标准(黑线)的时间以及该点对应的温差。另,下图中的顶部线显示 37 小时后到达终点。此时,温度曲线和压力曲线在循环转换为二级干燥之前同时合并。在草莓的二级干燥过程中,当隔板温度升高(下图)并开始蒸发时,皮拉尼压力计出现一个明显的峰值。当使用温度测量来确定终点时,通常会忽略这个峰值,这表明了比较压力测量可以用于评估具有挑战性的样品的终点标准。我想指出的是,一个合适的终点标准是高度依赖于冷冻干燥循环中的干燥箱室压。这是因为干燥阶段的压差不是绝对的,但始终是在 60% 的室压下。因此,如果冷冻干燥方法的干燥腔室压力发生变化,则需要重复实验过程寻找适当终点标准。二级干燥阶段的终点标准也应适用。在这里,最大压差通常不会达到干燥箱压力的 60%,因为样品中只剩下小部分水。与一级干燥相比,考虑较小的压差可能是有必要的,压差需要持续较长的时间,作为二级干燥的终点标准。这种方法也应该首先通过测试运行来验证。抱歉,我要去吃午饭了。这一次,我将尽量保持我的腹部和裤子之间的压力差达到最小。希望您能对更多的冻干和色谱知识保持渴望,并继续通过步琦学堂满足您的胃口。下次见!扫描左侧二维码可直接拨打电话联系我们或直拨:400-860-5168 分机号:0728仪器信息网认证,请放心拨打
  • 冷冻电镜:结构生物学研究的利器——访中国科学院生物物理所朱平研究员
    4月25日,Science杂志以长幅研究论文(Research Article)形式发表了中科院生物物理所朱平研究组和李国红研究组合作利用冷冻电镜三维重构技术解析的30nm染色质左手双螺旋高清晰三维结构这一重要研究成果。   在这项研究当中,朱平研究员长期从事冷冻电镜三维重构应用研究,李国红研究员长期从事30nm染色质及表观遗传调控研究,他们二人通过多年的紧密合作,发挥各自专长和优势,在国际上率先解析了30nm染色质的高清晰三维结构,使我国在相关领域的研究处于世界前列。   日前,仪器信息网编辑特别采访了从事冷冻电镜(注:下文提到的冷冻电镜特指300kV和200kV场发射冷冻透射电子显微镜)应用研究的朱平研究员,请他为我们介绍了自己与冷冻电镜结缘的故事,以及冷冻电镜的特点和应用情况,希望使广大网友能对冷冻电镜有更多的了解。 中国科学院生物物理所朱平研究员   因对三维重构技术的喜爱,与冷冻电镜结缘   Instrument:朱老师,您好!首先请您为我们介绍一下您和冷冻电镜结缘的故事。   朱平:其实我并不是生物专业出身,我的本科是在浙江大学学习金属材料热处理,1990年毕业后,我被保送到西安交通大学断裂疲劳国家重点实验室读硕士研究生,博士研究生期间又到清华大学机械系开始学习焊接专业,研究焊接接头断口分析,当时有一个很热门的研究方向是断裂表面的分形研究,断裂表面的分形维数和断裂性能被认为是密切相关的。开始我们只是做断口轮廓线的分形研究,但发现由于断裂表面不是各向同性的,不同的方向可能会对应不同的分形维数,所以我们就尝试利用扫描电镜立体对照相方法将断裂表面三维形貌重构出来,来研究断裂面的二维分形维数。   博士毕业后我在清华做了一年讲师,由于对电镜三维重构比较感兴趣,我就据此联系国外的进一步研究机会。恰好这时美国佛罗里达州立大学一个研究艾滋病毒结构的实验室需要做电镜三维重构的人员,于是我就将在材料研究中积累的关于电镜和三维重构的知识转到了对生物样品的研究,从而有机会开始接触冷冻电镜。   Instrument:到美国佛罗里达州立大学后,您主要开展了哪些方面的研究工作?   朱平:当时,我所在的实验室是比较早开始艾滋病毒表面包膜蛋白结构重构研究的单位。开始我们只是想通过电镜技术来研究艾滋病毒表面很重要的一个包膜蛋白gp120的结构。后来,研究者发现虽然不同的艾滋病毒抗体具有毒株特异性,但有几种抗体它们对于多种艾滋病毒都有中和活性,所以我们也开始研究这些广谱中和抗体的结构特点。   在最初的研究中,我们主要利用普通电镜,通过负染色方法研究表达纯化出来的艾滋病毒表面包膜蛋白gp120以及它们与不同的中和抗体形成的复合物的结构。后来我们的研究发现这些包膜蛋白在真实病毒表面的三维结构及分布对艾滋病毒的感染非常重要,所以就转向研究整个艾滋病毒颗粒及表面蛋白的三维结构。我们是最早将电子断层成像方法应用于艾滋病毒三维结构重构的研究组,并利用负染色电子断层成像方法获得了艾滋病毒表面的包膜蛋白的一个高清晰三聚体结构和分布图,发在美国科学院院刊上。由于负染色法对病毒结构影响很大,虽然观察到了艾滋病毒表面的gp120蛋白的结构为三聚体,但同时结构信息损失也很多。所以之后我们逐渐开始采用冷冻电镜电子断层成像法来开展研究,并做出了一个艾滋病毒冷冻电镜三维重构图像,于2006年在Nature上发表了一篇文章,也产生了较大影响。   Instrument:2008年您以&ldquo 百人计划&rdquo 身份加入到生物物理所生物大分子国家重点实验室,请问促使您回国发展以及加入生物物理所的原因主要有哪些?  朱平:在美国待了几年后,我也有了回国工作的念头,于是就开始和国内的相关研究单位联系。结构生物学研究是生物物理所的传统优势研究学科,所里也非常看好冷冻电镜在结构生物学研究方面的发展前景,已经在采购相应的设备,可以说这里有一个非常好的平台。   回国后,我们依然做一些艾滋病毒及疫苗的研究工作,同时也开展一些其他病毒的研究,如高对称性病毒的高分辨结构解析等。   另外,回国后我参加了以&ldquo 千人计划&rdquo 身份回国的许瑞明老师主持的科技部的一个&ldquo 973&rdquo 项目,其中我负责的一个课题就是利用冷冻电镜研究染色质的结构。后来,李国红老师回国,我们一起开始做染色质的冷冻电镜三维重构研究。   冷冻电镜是结构生物学研究的重要手段,但入门和上手都有一定难度   Instrument:请问和普通电镜技术相比,冷冻电镜在生物研究当中有哪些特点和优势?   朱平:普通电镜主要用于观察样品形貌,要看到原子分辨率的细节很难做到 另外制样方法如染色、固定等对样品的结构破坏很严重。而冷冻电镜可以将样品瞬间冻成玻璃态,冷冻速度平均可达以几万摄氏度每秒,这样样品所有的结构细节则都被保留下来。但是由于没有经过染色,直接观察样品的衬度就会差很多,所以需要三维重构来慢慢挖掘它的结构信息。   另外,结构生物学研究当中最常用的方法蛋白质晶体学的一个很大的瓶颈就是样品结晶,如将蛋白质产生结晶,需要各种各样的条件 此外在生物体中蛋白质往往不是单独起作用,而是多个蛋白质结合到一起的超大分子复合体,这样的超大分子复合物要长晶体就更难。但冷冻电镜不需要长晶体,直接将样品冰冻即可进行分析。 300kV Titan Krios场发射冷冻透射电子显微镜   Instrument:目前,国际上冷冻电镜研究的热点主要集中在哪些方面?   朱平:这两年冷冻电镜的应用主要集中在结构生物学研究,分析的样品类型从病毒、核糖体扩展到了其它蛋白。冷冻电镜三维重构早期比较多的应用是病毒分析,因为病毒结构比较对称,可以得到比较高的分辨率。近年来,随着仪器硬件及软件性能的提升,冷冻电镜结构解析的分辨率越来越高,现在我们可以做到近原子级别的分辨率。对于一些不对称的样品也能获得比较高的分辨率,所以冷冻电镜三维重构在其它蛋白质的结构分析研究上也比较热。   Instrument:冷冻电镜技术应用的难点有哪些?要让冷冻电镜更好的在科学研究当中发挥作用,需要哪些积累?   朱平:冷冻电镜的操作程序比较多,入门和上手都有一定的难度。先从制样来说,单冷冻这一步,就有许多的玄机在其中。冻的冰层太厚,电子束穿不过去,冰层太薄又会被完全蒸发 而冷冻的速度如果慢了就会形成冰晶,冰晶遇到电子束发生衍射,我们就无法观察到样品 此外,环境的变化,如空气的温度和湿度变化,甚至每次使用的滤纸如果不同都会对制样效果有影响。   在照片的拍摄中,要调节好电镜的状态,掌握照相的细节,这样才能拿出一张好的二维冷冻电镜照片。如,电子束照射在样品表面时,如果调节不好很可能就把样品轰坏了。所以需要调焦,找准位置,然后慢慢放大。得到好的二维照片后,接着还有一大堆的图像处理工作。   当然现在软件自动化程度更高了,仪器的操作也比以前容易了。比如制样,有专门的制样设备,通过计算机控制温度、湿度、滤纸吸收的时间长短,使制样的可重复性高了很多。不过要使用好电镜,还是有许多的经验在其中。北京大学丁明孝老师正在组织国内优秀的专家撰写一部电镜实验操作手册,虽然这本书以普通电镜为主,但其中至少会有一章来介绍冷冻电镜的基本情况,以及如何使用好冷冻电镜,希望更多的人了解这一技术。   Instrument:请问目前我国冷冻电镜的研究和应用水平怎么样?   朱平:近年来,为推动我国生物学快速发展,国家不断加大投资力度。一方面引进了不少人才,另外在仪器配置方面,我国不少单位已经或将要建设国际一流的冷冻电镜设备平台,如清华大学、生物物理所、北京大学、上海生命科学研究院等。   其实十几年前,我们就有很多优秀的电镜人才,只是国家没有这么大的投入。就是在&ldquo 小米加步枪&rdquo 的条件下,他们也做的非常好。现在我们的高端电镜配置已在世界前列,但人才依然是最重要的,目前国内在冷冻电镜研究方面确实也没有那么多的人才,希望有更多的年轻人被培养出来。   科学的竞争也很残酷,团队合作才能走得更快更远   Instrument:最后,请问对于在高水平期刊上发表文章,您有哪些心得体会,以及团队合作在科学研究当中的重要性。   朱平:一是要有好的项目,好的科学问题 二要有好的设备 三要有好的团队 最后还要坚持。首先要敢于挑战科学难题,另外也要敢于面对挑战中的困难,要耐得住性子去做,要有长时间做不出来的准备。我们这个项目,前后花了5年时间,期间遇到了很多的困难。   在30nm染色质结构解析研究中,不同的研究组分工合作,发挥各自的特长也是我们这个项目的重要特点。在我们的研究当中,染色质样品的组装非常重要,我们需要均一的样品,否则电镜状态再好,再会调节操作和计算处理,也无法获取样品真正的结构信息。   我对组装染色质样品没有太多的经验,而李国红老师长期从事30nm染色质及表观遗传调控方面的研究,但冷冻电镜三维重构也需要一个较为长期的积累和经验,面对30nm染色质这么一个复杂的超大分子复合体,其结构解析有很多技术上的困难和挑战,若要让李老师重头来学电镜也不是很容易的事。还有许瑞明老师参加了我们很多的项目讨论,给了我们很多的鼓励,这也很重要。   科学的竞争也很残酷,我们知道世界上还有其他的团队也在做同样的研究,而我们能够先做出来,一个重要的因素就是我们是几个团队一起在做。 采访编辑:秦丽娟   附录:朱平研究员个人简历   1986.9-1990.6 浙江大学 学士   1990.9-1993.6 西安交通大学 硕士   1993.9-1997.6 清华大学 博士   1997.7-1998.12清华大学 讲师   1999.3-2008.5 美国佛罗里达州立大学生物系 博士后、助理研究员、副研究员(Non tenure-track faculty系列)   2008.6-至今  中国科学院生物物理研究所课题组长、&ldquo 百人计划&rdquo 研究员
  • 冷冻干燥vs喷雾干燥——谁更适合你的产品?
    冷冻干燥(也称为冻干)行业对生产力和盈利能力的需求正在增加。这种增加促使业内从业者考虑冷冻干燥与喷雾干燥相比的优势。因此,在本文中,我们在考虑两者的优势,以帮助您选择最适合您的项目和产品的干燥技术。冷冻干 燥or喷雾干燥如何抉择? 干燥在生物制药行业被广泛认为是保存各种药物制剂和生物制品的首选方法。当液态稳定性不足、储存要求过于严格或需要固体形式的产品以延长保质期或实现不同气候和环境之间的运输时,就需要使用合适的干燥技术。 冷冻干燥无疑是各种材料和应用中公认的“首选”干燥工艺。然而,由于成本、API的可用性以及有时加工和生产量,对替代方法进行评估以确保使用最适合产品和/或项目的干燥方法。 *的冷冻干燥替代方法是喷雾干燥。喷雾干燥具有多种优势。尽管与冷冻干燥相比,它是行业中的新手,但它展示了在可扩展级别(连续而不是逐批处理)处理更高吞吐量的能力。因此,喷雾干燥也可被视为产品干燥的可行选择,具体取决于相关加工要求和产品应用。两者的干燥过程冷冻干燥冷冻干燥的原理涉及以受控方式对产品进行初始冷冻,以控制冰晶结构。 然后将其置于真空中,在真空中进行升华(或初步干燥)以去除未结合的水。接下来是二次干燥以升华结合水,将材料降至用户定义的残留水分水平。此阶段的目标是结合水而不是未结合/游离水,因此需要更多的能量来通过将搁板温度提高到+20°C或更高来驱动该过程。当加上低气压时,它会导致冰直接变成水蒸气(通过液相),这个过程叫做升华。 根据在给定冻干周期中干燥的样品的性质,温度和真空之间的微妙平衡对于确保在干燥后生产成功的批次而不影响产品功效和活力至关重要。为实现这一点,不同类型的产品及其体积可能需要根据其固有的样品特性进行12小时到5天的冷冻干燥。喷雾干燥喷雾干燥通常被认为是一个更简单(和更快)的过程,涉及在一个步骤中将液体制剂转化为干粉。溶液被雾化成细小的液滴,然后在一个大室中使用热气体快速干燥。然后用旋风分离器收集所得干燥颗粒。尽管根据经验,喷雾干燥比冷冻干燥更快且更便宜,但其中一个显着缺点是它需要高加工温度和剪切力。当然,在受到严格控制的制药和生物技术行业中,这些是许多客户力图避免的,在这些行业中,有效性的可行性和工艺参数与敏感的 API 和配方相关;因此,喷雾干燥更适合用于相当耐寒的产品。冷冻干燥中的产品温度在初级干燥中通常低于0°C,在二级干燥中通常为20-30°C,而喷雾干燥中的产品温度通常高于 80°C。在这些较高 (80°C) 温度下工作的直接影响可能是干燥后样品质量在固有产品特性方面的整体损失,例如:1.功效/生存力;2.味道/气味/颜色;3.一致性;4.营养价值,即食品相关产品中的营养素;5.生物产量—更高水平的细胞(即细菌)对数减少;6.蛋白质降解。 行业中的应用这两种工艺都可用于广泛的应用。例如,冷冻干燥通常用于保存不同类型的细胞、精细化学品、实验室试剂和注射疫苗,以及食品工业和乳制品。因为它通常是用直接装在小瓶或其他容器中的产品进行的,所以这种加工方法最适合干燥后不需要进一步加工的配方;此外,小瓶可以在冷冻干燥机的原位密封,从而避免循环完成时的潜在污染。另一方面,喷雾干燥更常与批量加工相关,而不是基于小瓶的加工。 然而,一个普遍的误解是喷雾干燥仅适用于食品和稳定的原料药,而当代研究表明它可能是用于某些复杂产品(例如微囊化细菌和纳米颗粒)的有效方法。 效率、质量与成本人们普遍认为与喷雾干燥相关的成本低于冷冻干燥的成本,这使得该技术成为某些市场感兴趣的技术之一。与冷冻干燥相关的分批形式不同,喷雾干燥对更大的吞吐量潜力更开放,可以被视为“连续过程”。此外,冷冻干燥的优势在于产品的稳健质量。 精确控制低加工温度可*限度地降低产品固有特性的任何风险,例如塌陷、共晶熔化或超过玻璃化转变温度,从而使冻干产品加工成最高质量。生物制药在喷雾干燥过程中可能会受到剪切应力,再加上所需的高加工温度会使蛋白质等化合物不稳定并损害产品性能,*降低产品功效。总结总之,两种产品干燥工艺方法在正确使用且适用于合适的产品时都是有效的。为了在包括干燥阶段的产品加工中获得*结果,*决定哪种方法最适合项目或持续加工需求的因素将是*产品的质量及其如何到达*用户 。
  • 冷冻饮品需防菌落超标
    冷冻饮品是以饮用水、食糖、乳制品、水果制品、豆制品、食用油等中的一种或多种为主要原料,添加或不添加食品添加剂,经配料、灭菌、凝冻而制成的冷冻固态制品。近些年来,微生物超标依然是冷饮食品质量安全的主要问题之一。   质监局有关专家介绍,每年质监部门都不定期对市场上的冷饮进行抽查,每次抽查的结果都没有100%达到合格。问题主要集中在生产、运输和销售的环节上。菌落总数、霉菌、酵母菌等微生物超标是冷饮常见的问题。菌落总数超标,冷饮爽口不爽心夏天吃冷饮固然爽口又爽心,吃到不合格产品,一只冰糕下肚,等于吞下去不计其数的霉菌、酵母菌。   存在的主要问题是细菌菌落总数和大肠菌群超标。细菌菌落总数的超标可能是生产过程中设备的通道、包装容器材料、空瓶、瓶盖消毒不彻底,生产工艺落后所致,因此必须加强生产工具、容器机械清洗消毒和机械设备的清洗消毒,改进落后的生产工艺,提高机械清洗消毒和机械化的生产能力。大肠菌群超标可能与水源直接或间接受到污染,从业人员个人卫生习惯较差有关,为此应加强法制教育,严格执行《食品卫生法》和国家对冷饮食品的卫生管理办法,坚持对从业人员体检和冷饮卫生知识的培训。应加强冷饮食品卫生预防性监督管理力度和卫生知识宣传教育的深度,把重点放在防止微生物的污染和个体私营单位的管理。   冷饮在加工过程中,需要经过复杂的过程,对调料的配置、配料的粉碎等等,都需要经过较长的过程,且加工的过程中,冷饮直接裸露于空气之中的时间较长,容易造成菌落数超标和二次污染的问题,在包装之前,需要不间断的对于整个加工过程进行消毒灭菌。   所以,需要找到一种正确实用高效的消毒灭菌方式才能很好解决冷饮菌落总数超标问题。   动态消毒灭菌方式能够很好地应用于冷饮的加工过程,在包装之前,能够对于整个生产环境进行不间断消毒灭菌。据上海康久消毒技术有限公司工程师周立法介绍,这种消毒灭菌技术的杀菌原理是通过特殊的脉冲信号使得NICOLER发生腔产生逆电效应,生成大量的等离子体。在负压风机的作用下,污染空气被抽进发生腔内,带负电细菌被分解击破,整个杀菌过程只需0.1秒,再经药物浸渍型活性炭等组件二次杀菌过滤后,受控环境保持在“无菌无尘”标准。由于在对车间消毒时,人可同时在车间内工作,所以,该杀菌技术也可称作为“食品动态杀菌机”。   定期清理奶垢能有效的防止微生物的滋生,而在清理奶垢时应注意空气杀菌,可大幅度减少微生物超标的可能性。
  • 微生物气溶胶浓缩器工作原理怎样使用
    青岛路博的马德我不敢说我们的产品一定如何但我敢说,我们的服务一定真诚只要您有需要,我们有能力,一定让您满足 我们的产品不仅仅您看到的这条,还有许多对于环保的器材,有关环保的仪器仪表您有需要,尽管联系公司名称:青岛路博环保科技有限公司地址:青岛市城阳区金岭工业园锦宏西路与微生物气溶胶浓缩器是基于虚拟冲击浓缩法原理 ,为解决低浓度微生物气溶胶采集问题而研制的一种具有微生物气溶胶前置浓缩功能、且与标准微生物采样器配套的新型仪器,旨在提供一种高效率生物浓缩器,为微生物污染的检测和研究提供支持。 本产品符合标准《GB/T 18204.5-2013 公共场所卫生检验方法 第5部分:集中空调通风系统》和卫生行业标准《WS 394-2012 公共场所集中空调通风系统卫生规范》要求,采集集中空调送风,检测其中的嗜肺军团菌。采集流量大,使需要的粒子短时间浓缩到采样器中,避免长时间采样带来的生物活性损失,提高采样器的现场实用性。 主要技术指标:l 总气路流(50~130)L/min可调,允许误差±5%;l 接生物采样器(采样瓶)后浓缩气路流量(5~15)L/min可调,允许误差±5%;l 总气路流量及浓缩气路流量重复性误差±2%l 输入气路负载能力(接分离器):≥2KPal 浓缩气路负载能力:≥50KPal 对于3um以上生物粒子的捕集效率大于80%,理论浓缩比1:10。l 定时功能:1秒-99小时59分59秒l 双路同时采集l 流量手动调节l 备可升降云台,可根据现场情况调节采样头高度3米(或4米选配) 青岛路博建业有限公司是一家集环保科研、设计、生产、维护、销售和系统集成为一体的综合性高科技企业。我们不仅有的销售团队,还有专业的技术团队和售后服务人员,为你的购买使用提供一站式服务。为什么选路博1.路博有自己的工厂,有专业的技术团队,保证产品质量。2.路博有的销售团队和售后服务,一年质保,终身维护,可以视频教授产品使用方法或现场指导。3.厂家直销,没有中间商赚差价,保护客户利益.
  • 祝建:关于原位冷冻电镜技术的一点想法
    仪器信息网讯 2015年5月29日-6月2日,&ldquo 2015全国生物医学农林电镜技术研讨会暨生物电镜前沿技术培训班&rdquo 在浙江大学举行。本次会议特别邀请了国内外知名专家教授和电镜工作者讲授生物电子显微镜技术的最新发展,交流生物样品制备和应用方面的技术经验,并安排部分学员参加实验操作及演示。   上海同济大学生命科学学院祝建教授作了题为&ldquo 关于原位冷冻电镜技术的一点想法&rdquo 的报告。 祝建教授   祝建介绍说:&ldquo 冷冻电镜技术可以分为单颗粒冷冻电镜技术和原位冷冻电镜技术。其中单颗粒冷冻电镜技术目前国际上做了许多工作,近来也比较火。近年来,我国为了开展这方面工作,购置了许多相关的高端仪器设备。该技术需要将细胞内的活性蛋白分子提纯后在体外分析,但是在体外做的不错的结构最终还需要到体内去验证,如在体内蛋白质是否也是按照相应的结构来执行功能。所以这方面的工作还需要进一步深入。&rdquo   祝建表示,原位冷冻电镜的最终目的是研究大分子的结构、功能和机制统一的问题,从而解释生命现象。原位冷冻电镜技术包括冷冻固定、超薄切片,再加上电镜分析、数据采集、三维重构等。冷冻固定可以分为快速冷冻和高压冷冻。高压冷冻技术就是为了使组织的冷冻成为可能而问世,可以冷冻200&mu m厚的样品。而快速冷冻技术只能冷冻30&mu m厚的单细胞层。从冷冻速度来看,快速冷冻的速度稍快一些。   祝建说:&ldquo 目前,国内购买了多台高压冷冻仪。其实并不是所有的样品都适合高压冷冻,大组织块、一定厚度的样品用高压冷冻最好,其他的单细胞样品用快速冷冻一样能达到很好的效果,而且快速冷冻技术更简便。&rdquo   &ldquo 冷冻固定之后,如果在冷冻电镜下分析需要与冷冻超薄切片技术相结合。如果在常温电镜下分析,则还需要冷冻置换、包埋、切片等步骤,现在买高压冷冻仪的单位基本都是要和冷冻置换结合起来。冷冻置换是冷冻固定之后非常必要的低温脱水技术,脱水过程中脱水剂中所含有的固定成分还将在合适的低温温度下对样品进行二次固定。如果要减少样品收缩,则需要快速冷冻固定,慢慢脱水。&rdquo 祝建说道。   另外,祝建还谈道:&ldquo 原位分析的另外一种途径是标记,通过标记实现定位、定性、定量分析。因为我们无法看到一些结构细节和大分子,所以用抗体来标记连接我们能看到的荧光分子或金颗粒来实现间接原位分析。&rdquo   最后,祝建总结说,在实际应用中,要根据样品的特点,从快速冷冻、高压冷冻、冷冻置换、超薄切片、冷冻超薄切片、离子束切片等制样技术中选择合适的组合方法来制样。还有我们要考虑将原位冷冻电镜与单颗粒冷冻电镜结合起来获取有效的分析结果。 撰稿:秦丽娟
  • 中科院微生物研究所采购Eppendorf 5424R高速冷冻离心机
    中国科学院微生物研究所于2016年6月9日从我公司采购Eppendorf 5424R高速冷冻离心机 1台Eppendorf 5424R高速冷冻离心机的制冷特性专利的压缩机技术最大限度的减少了离心机的震动 – 保护您珍贵的样本!温度范围: –9 °C 至 +40 °C由于制冷装置在设备背面,使得离心机的设计小巧,进口高度为 26 cm所有转子高速运转时,设备可恒温保持在 4 °C通过 “Fast Temp” 快速达到预定温度(8 分钟内由环境温度为 23 °C 降到预定温度)不在离心工作状态时,设备保持冷却恒温
  • 徕卡课堂——冷冻断裂与冷冻蚀刻基础介绍
    揭示生物学样本和材料样本原本无法观察到的内部结构冷冻断裂是一种将冰冻样本劈裂以露出其内部结构的技术。冷冻蚀刻是指让样本表面的冰在真空中升华,以便露出原本无法观察到的断裂面细节。金属/碳复合镀膜能够实现样本在SEM(块面)或TEM(复型)中的成像,主要用于研究如细胞器、细胞膜,细胞层和乳胶。这项技术传统上用于生物学应用,但现在逐渐在物理学和材料科学中展现出重要意义。近年来,研究人员通过冷冻断裂电子显微镜,尤其是冷冻复型免疫标记(FRIL),对膜蛋白在动态细胞过程中所发挥的作用有了新的见解。作者:Gisela Höflinger图1:麦叶上的蚜虫适合于电子显微镜的环境电子显微镜的样品室通过抽真空处理降至极低压力。置于这种环境下的活细胞无法有效保全结构,因为细胞构成中的大部分水分会快速蒸发。生物样本的制备方法有很多种。样品材料被(固定)保存,这样后续脱水对原位结构的破坏最小,同时可以使用环境扫描电镜(SEM)或者将水冷冻。高压冷冻是观察自然状态下含水结构的唯一方法。高压冷冻所形成的冰不是六边形冰(从水变为六边形冰时体积会增加)而是无定形冰,因此体积保持不变。所以,对渗透和温度变化敏感的结构得以保留(见文章“高压冷冻基础介绍”)。要观察诸如细胞器、细胞膜、乳胶或液体的表面界面等结构,冷冻断裂是唯一的方法。通过刀片(或类似物)或释放弹簧负载的外力来破开冷冻样本,并沿着最小阻力线断裂样本。图2:冷冻断裂(来源:http://en.wikibooks.org/wiki/Structural_Biochemistry/Lipids/Membrane_Fluidity) 水的升华与凝结 – 冷冻蚀刻与污染要暴露冷冻断裂面,需要把冰去除。这就需要通过把断裂面的冰升华去除以保存样品的结构。升华的过程是冰不经过液态过程直接转化为气态。而液态过程会导致样品体积和结构的破坏。图3:ES,细胞外表面;PF,细胞膜冷冻断裂面;EF,细胞膜外层冷冻断裂面;FS,细胞膜内表面;Cyt,细胞质水的升华/冷凝过程取决于特定温度下的饱和压力,以及水或冰在室内的有效水分压。注意:良好的真空度会降低水分压。例如:温度为-120℃的冰或冰冻样本饱和压力约为10-7 mbar。如果样品室内达到这个压力,则冷凝和蒸发处于平衡状态。蒸发的分子数量等于冷凝的分子数量。在更高压力下,冷凝速度要快于升华速度 – 因此冰晶会在样本表面上生长。必须采取一切手段来避免这种情况。样本上方一个较冷(比样本更冷)的冷阱会降低局部压力,从而起到了冷凝阱的作用。从样本中带出的水分子优先附着在较冷的表面上。在低于饱和压力的压力下,更多的分子升华而不是冷凝,同时会发生冷冻蚀刻。执行冷冻蚀刻直到样本完全无冰,这一过程称为冷冻干燥。仅适用于合理时间内执行的小样本。该过程分为几个步骤,需要从大约-120℃加热到-60℃,同时在每个步骤上使温度保持一定时间。该过程需要几天的时间来完成。图4:饱和蒸汽压力(感谢Umrath 1982提供的图片)样本温度低于-120℃时,蚀刻速度非常慢,蚀刻持续时间会增加到不切实际的程度。如果真空室的压力固定,则可以通过提高样本温度来提高蚀刻速度。对于生物样本,要特别小心温度高于-90℃。蚀刻速度会大幅提高。另外,要注意玻璃态冰中形成六边形冰晶从而导致脱水伪像。纯水的理论升华速度会降低,因为:• 样本深处的水升华速度比表面的水更慢。• 盐和大分子溶剂会降低升华速度。• 生物样本中大量存在的结合水会降低升华速度。通过冷冻断裂生成图像冷冻断裂和冷冻蚀刻技术往往采用高真空精细镀膜技术,将超细腻重金属和碳薄膜沉积于断裂表面。冷冻断裂样本在一定角度下用金属覆盖,然后在碳背衬膜(徕卡EM ACE600冷冻断裂或徕卡EM ACE900与徕卡EM VCT500)上生成复型进行TEM成像或在SEM的试块面上进行成像。对于这两种方法,冷冻断裂表面经过一定的蚀刻时间后以相同的方式进行镀膜。首先在一定角度下进行一层薄的(2-7nm)重金属镀膜,以形成地形对比度(阴影)。其次再针对重金属薄膜,在90°下进行一层厚的碳层(15-20nm)镀膜,以稳定超薄电子束蒸发。此时的蚀刻处理会停止。要对极小的结构进行成像,需要在极低的角度(2–8°)镀膜重金属并在镀膜期间旋转样本。这样可增加细丝状及其它细小结构的对比度。此项技术又称为小角度旋转投影。蒸镀重金属薄膜需要采用电子束蒸发镀膜技术。这种镀膜技术可实现精细定向沉积。碳的支撑层稳定了未被金属覆盖的结构。随着温度的升高,这些结构会改变它们的轮廓,样本不会完全导电,复型也不会粘在一起。冷冻断裂酵母的单向投影图5:低温SEM,BSE(背散射电子)图像。Walther P, Wehrli E, Hermann R, Müller M.(1995)双层镀膜获取高分辨率低温SEM。J Microsc. 179, 229-237。图6:复型,TEM图像(感谢Electronmicroscopy ETH Zürich提供图片)。Walther P, Wehrli E, Hermann R, Müller M.(1995)双层镀膜获取高分辨率低温SEM。J Microsc. 179, 229-237。图7:徕卡高压冷冻,真空冷冻传输至冷冻断裂系统中,利用电子束发射枪和旋转样本底座来进行冷冻蚀刻和低温镀膜。徕卡真空冷冻传输至低温SEM。油/水基样品,–100℃(升华)3分钟暴露油脂结构。图8:徕卡高压冷冻,真空冷冻传输至冷冻断裂系统中,利用电子束发射枪和旋转样本底座来进行冷冻蚀刻和低温镀膜。徕卡真空冷冻传输至低温SEM。原生生物游仆虫混合培养的羽纹硅藻。感谢英国波特斯巴NIBSC的Roland Fleck博士提供图片图9:徕卡冷冻断裂系统及徕卡真空冷冻传输至低温SEM的HPF、冷冻断裂、冷冻蚀刻和低温镀膜。油/水基乳液破裂,露出洋葱状薄片结构,形成液滴。感谢汉堡拜尔斯多夫Stefan Wiesner博士提供的图片。图10:TEM中的酵母细胞复型。经徕卡高压冷冻和徕卡冷冻断裂复型制备。感谢Elektronenmikroskopie ETH Zürich提供的图片。图11:大麦叶上的真菌。安装于徕卡冷冻断裂仪样本台上,并通过冷却样本台在液氮下进行冷冻。徕卡冷冻断裂仪对样品进行部分冷冻干燥(在更高的样本温度下冷冻干燥)。使用钨镀膜。徕卡真空冷冻传输至低温FESEM 5keV。相关产品徕卡EM ACE900 高端EM样本制备冷冻断裂系统徕卡EM VCT500了解更多:徕卡官网
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