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核酸合成仪修饰原理

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  • 【资料】多肽合成仪发展史

    [size=5][b]多肽合成仪发展史[/b][/size][font=楷体_GB2312][size=3][color=black][b]多肽合成仪简介[/b][/color][/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 美国洛克菲勒大学教授Bruce Merrifild 在1963年发明的多肽固相合成技术(SPPS)是多肽合成领域的一个重大突破,对化学,生化,医药,免疫和基因科学等学科和领域都起了巨大的推动作用. 他本人也因此项发明荣获1984化学诺贝尔奖。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 多肽固相合成技术的发明同时促进了肽合成的自动化。世界上第一台真正意义上的多肽合成仪出现在1980年代初期,它是利用氮气鼓泡来对反应物进行搅拌,用计算机程序控制来实现有限度的自动合成。虽然在搅拌方式和其他各项功能方面有着明显的缺陷,但是它毕竟把人从实验室里解放出来,极大地提高了工作效率,所以受到了多肽科学家的一致赞扬。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 多肽合成仪的问世大大促进了多肽科学的发展。反过来,随着多肽科学的发展,科学家也对合成仪提出了更高的要求,从而带动了合成仪的发展。目前多肽合成仪品种繁多。从合成量上分,可分为微克级的,毫克级的,克级的和公斤级的;从功能上分,可分为研究型的,小试型的,中试型的,普通生产型的和GMP生产型的;从自动化程度上分,可分为全自动的,半自动的和手动的;从通道上分,可分为单通道的和多通道的;从技术角度上分,可分为第一代的,第二代的,和第三代的;等等。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3][/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3][color=black][b]第一代多肽合成仪[/b][/color][/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3]标志性特点是采用氮气鼓泡的搅拌原理来对反应物进行搅拌,即合成仪上反应器是固定的,氮气从反应器的下方通过反应器到上部排出,在这一过程中产生的汽泡把固相和液相混合起来。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 它有着消耗成本大,有死角等严重缺陷,已大部分退出了市场。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3][/size][/font][b][font=楷体_GB2312][size=3]第二代多肽合成仪[/size][/font][/b][font=楷体_GB2312][size=3]标志性特点是用不完全性的机械搅拌来取代氮气鼓泡,一般可分为接触式搅拌与非接触式搅拌两种。 接触式搅拌常见的搅拌方式是伸入反应器内部的螺旋桨由上部的电机带动进行快速旋转,使反应器内部的固液两相进行混合。但这种方式会严重降低合成产量,清洗也比较麻烦,还会缩短反应器的寿命,最主要这种方式也会产生反应死角。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3][/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 目前全世界共17个多肽合成仪生产厂商有16个放弃了接触式搅拌方法。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3][/size][/font][b][font=楷体_GB2312][size=3]第三代多肽合成仪[/size][/font][/b][font=楷体_GB2312][size=3] 是由美国[/size][/font][font=楷体_GB2312][color=#000000][size=3]ABI[/size][/color][/font][font=楷体_GB2312][size=3]公司制造的无死角多肽合成仪为标志诞生的。其反应器转动方式有别于前两代的多肽合成仪,即反应器上方相对固定,而下方作圆周360度快速旋转,带动反应器里的固液两相从底部向上作螺旋运动,一直达到反应器的最上方。换句话说,溶液可以达到反应器内部的任意点,真正做到了无死角。由于搅拌速率可达每分钟1800转的高速,反应得以充分完全。其合成肽的纯度相当高,对于ACP65-74型肽的粗肽纯度可达87.6% (ABI433使用者手册)。由于无死角的搅拌方式保证的肽的合成纯度,ABI433型多肽合成仪(其退出多肽合成仪市场后最后一款仪器)至今在世界上还占有着很大的比例。当然,ABI产品的售价也是最高的。由于部件使用频率高,电磁阀会经常损坏,而ABI将7个电磁阀做成模块化的设计,坏掉一个电磁阀必须要更换整个模块,无形中增加了维修成本。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3]因此,成本过高,也已停止生产。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3][/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 无死角多肽合成仪的另一款方式是反应器在数控马达的带动下作上下180度的翻转运动。固相和液相在运动过程中不断从反应器的一端到达另一端,再返回来。所以在上下180度的翻转运动中溶液可以达到反应器内部的任意点。数控马达的转速可根据需要任意调节。一般用这种仪器合成出来的肽纯度是最高的。由于反应器越大,溶液作180度的翻转运动所得到的惯性也越大,搅拌也越来越剧烈,产品的纯度也会越来越高,所以只要小试能成功,就可以跳过中试这一步,直接放大生产。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3][/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3]微波法多肽合成仪[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 另一种革新式的产品,微波多肽合成仪的问世,是区别与之前任何一类合成仪的新产品。其采用微波加热方式,大大提高了反应速度,将多肽合成的速率增加到之前多肽合成仪的几倍甚至十几倍。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 这种仪器目前在中国市场还比较受欢迎,但在国际上,其实已经不认可这种方式生产多肽了,因为它有个致命缺点。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] 在加热的情况下副反应也相应增多,多肽纯度不能与之前的第三代甚至第二代产品媲美。另外,微波加热方法无法放大,故不适合用作多肽药物的研发。[/size][/font][font=楷体_GB2312][size=3] (部分内容摘自:百度百科-多肽合成仪)[/size][/font]

  • 多肽修饰-多肽修饰合成

    供应各种修饰型多肽。1.磷酸化的Ser、Tyr和Thr修饰的多肽:我们提供单磷酸化和多磷酸化多肽服务,目前我们已经能够提供四个磷酸化位点修饰的多肽。2.5(6)-FAM,FITC,CY5,RhodamineB,PNA,EDNAS/dabcyl等荧光标记修饰的多肽:荧光标记修饰多肽技术是我们国肽生物的代表性多肽合成技术,我们的这项技术已经相当成熟。【详情请咨询国肽生物】3.生物素Biotin,Lys(Biotin)修饰的多肽:生物素是维生素B2的组成部分,Biotin,Lys(Biotin)修饰的多肽也是客户经常定制的多肽。我们提供生物素修饰的多肽已经有将近100%的成功率。4.含有一对或多对二硫键修饰的多肽:二硫键在蛋白质的结构稳定中起到重要作用,目前我们已经能够为客户提供四对二硫键修饰的多肽。5.含有同位素C13,N15修饰的多肽:同位素标记的多肽主要应用于医学和生物学领域,通常价格较高,为了满足客户需要,我们接受微克级的同位素多肽定制。6.含有特殊氨基酸修饰的多肽:例如,D型氨基酸,氨基酸衍生物,脂肪族羧酸等等,都在我们接受的定制范围内。

  • 希施多肽合成仪使用

    各位老师好,有没有熟练操作希施CS336X多肽合成仪的,我们单位想学习一下这台仪器的使用,南京的最好,方便交流。走过路过的朋友多多发言,或提供学习交流的渠道,非常感谢!

  • 有机合成新技术--流动合成仪

    前段时间实验室试用了一家仪器公司代理的进口流动合成仪,效果蛮好的。就是类似于微管道反应器,反应液边流动边反应。之前做了两个实验,都是平时很迟钝的那种,一天一夜或者两天两夜那种,后来使用流动合成仪,增加了系统压力从而可以大大升高反应温度,实验进行了一个小时就达到甚至比之前的反应效果还好。正好我们实验室有一个才从国外回来的博后,他以前就用过流动合成,效率提高很多,也完成了一些平时烧瓶条件不好进行的反应,尤其是在新药研发和条件优化时具有很大的优势。大家有没有知道这款仪器的呢?想多交流交流。加上最近听到的关于流动化学的讲座,我觉得这样的仪器在国内市场上会有很大前景的哦,不过需要一个过程,不知道大家怎么看。

  • 【讨论】微波合成仪

    [size=1][size=4]请大家发表一下看法: 现在微波合成越来越被人们重视了,以前微波消解比较多,现在微波合成也逐年增加,对于做合成的人来说,希望所用微波合成仪都具备哪些功能呢?大家踊跃参加,一起讨论。还有谁用过微波合成仪觉得哪些功能不错也可以罗列!谢谢!积极参与![/size][/size]

  • 寻找国产微波化学合成仪

    请问国产微波化学合成仪有哪几家的产品比较好?我单位拟购买,正在选型,但手中厂家的资料太少,请教一下是否有关这方面的信息?

  • 【原创】常压微波合成仪问题?

    现在用一款国内的微波合成仪,对于顶部开口处是否会泄露微波我真的感觉很害怕,请教专家,为何微波不会通过顶部泄露出来,平时做实验我们应该注意什么?

  • 【求助】向大家请教关于多肽合成仪!谢谢哈

    我知道有很多公司生产多肽合成仪,像cs bio, PTI, PSI, AAPPTEC, CEM, 好像还有中国的公司海南建邦,还有德国的一些公司,产品还是蛮多的。所以我想请教一下了解的人士,这些公司在中国有没有代理?哪些品牌比较好?哪些品牌性价比高?都适合什么领域的,比如高校研究、研究所、药厂啊什么的?谢谢各位!

  • 湖北三七七生物技术有限公司刚刚发布了合成仪技术工程师职位,坐标无锡市,敢不敢来试试?

    [b]职位名称:[/b]合成仪技术工程师[b]职位描述/要求:[/b]职位描述:1.负责本公司合成仪、氨解仪、PCR仪、定量PCR仪等产品的现场维修;2.能独立前往客户单位进行上述仪器的安装、调试并对客户进行培训:如何使用及日常维护、保养仪器。负责技术支持及远程现场维修的指导;3.能独立前往客户单位进行合成仪的检查维修、维护保养、软件升级及远程4.配合销售开发市场,协助重点用户的维护。5.领导交待的其他工作。职位要求:1、大专或以上学历;2、生物、材料、化学、电气、机械类或相关专业;3、熟悉ABI、Biolytic等品牌的荧光定量PCR仪、合成仪等任意一类产品;4、有生物化学类仪器维修或相关企业工作经验;5、具备良好的电脑软、硬件知识及技能;6、具有较强的技术应用能力及一定的沟通能力;7、能适应频繁出差。[b]公司介绍:[/b] 北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,在美国,巴西,印度等国拥有多家兄弟公司。仪器销往及提供服务给欧美,日本,韩国,新加坡等多个国家。同时是美国 Biolytic 公司 Dr.Oligo 系列 DNA/RNA 合成仪,氨解仪等产品在中国唯一的授权代理商和服务商。我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。...[url=https://www.instrument.com.cn/job/user/job/position/59274]查看全部[/url]

  • 多肽合成-合成多肽定制

    多肽合成-合成多肽定制

    国肽生物 提供 多肽合成、多肽修饰、cGMP多肽、目录肽、药物肽/化妆品肽、多肽文库构建、中间体定制及合成、抗体服务、氨基酸、糖肽、订书肽、多肽核酸等.详情请咨询合肥国肽生物多肽合成服务种类多肽合成服务通常有线性肽合成服务、多种难肽合成服务、修饰肽合成服务、以及部分多肽合成公司还会提供多肽定制服务,定制出有针对性的合成肽。目前有多肽合成公司提供的线性肽合成可达150个氨基酸,在修饰肽合成上,能提供常见修饰,磷酸化(Ser/Thr/Tyr),环化(酰胺环/二硫键环),荧光标记(5(6)-FAM,FITC,CY5,RhodamineB,PNA,EDNAS/dabcyl等),生物素标记(Biotin,Lys(Biotin))/复合抗原(MAP)/含D型氨基酸,及各种氨基酸衍生物均可合成。多肽产物纯度选择常见的质谱级多肽纯度,一般要求95%用于抗体筛选纯度,一般85%即可NMR和结晶试验中,纯度一般98%粗品肽,一般50%即可用于多肽筛选国肽生物 提供 多肽合成、多肽修饰、cGMP多肽、目录肽、药物肽/化妆品肽、多肽文库构建、中间体定制及合成、抗体服务、氨基酸、糖肽、订书肽、多肽核酸等优越的领先技术合成方法(固相合成/液相合成)修饰性多肽(常见的N端修饰,C端修饰及其他特殊修饰)偶联技术(KLH,BSA,OVA偶联)首位环化技术,3个磷酸化,3对二硫键胰岛素工艺提供技术转让服务优质的产品服务合成质量:毫克至克级甚至kg合成纯度:Crude,脱盐,70%, 75%, 80%,85%, 90%, 95%,98%,99%定制长度:2-150个氨基酸免费提供:合格的HPLC和MS,COA文件,质量控制包含合格的纯度,合成的质量,分子量,溶解度等((如有特殊需要,可提供核磁,红外,紫外,元素分析,水分含量测定以及氨基酸分析服务))交货期限:1-30个长度最快1-2周交货合成数量:月通量可达8000-10000条药用肽,大批量肽。协助客户建立科研肽库。抗原多肽及其与蛋白的交联:KLH,BSA, OVA服务流程确定合成序列,我们将在12小时内容提供准确报价。合肥国肽生物官网:http://www.bankpeptide.com欢迎咨询服务热线:0551-62626599[img=,690,522]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/07/201907181006059901_2592_3531468_3.jpg!w690x522.jpg[/img][img=,690,517]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/07/201907181006182915_5959_3531468_3.jpg!w690x517.jpg[/img]

  • 引物合成常见问题解析

    Q1.引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种,无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不同和单个循环用时的多少。(1) 去保护:加入Deblocking脱去碱基上5'- OH的保护基团DMT,获得游离的5'- OH;(2) 耦合:同时加入活化剂和新的碱基,新的碱基5'-OH仍然被DMT保护,3'端被活化与溶液中游离的5'-OH发生耦合反应;(3) 封闭:耦合反应中极少数5'- OH没有参加反应,用封闭试剂终止其后继续发生反应;(4) 氧化:加入氧化剂使其由核苷亚磷酸酯形成更稳定的核苷磷酸酯。Q2.引物合成后如何处理?切割与脱保护基:将合成好的寡核苷酸链从支持物上化学切割下来。常用新鲜的浓氨水来裂解CPG与初始核苷之间的酯键。断裂下来的寡核苷酸带有自由的3'羟基。纯化:根据所合成寡核苷酸的组成和应用来选定纯化的方法。常用的纯化方法有:C18、OPC、PAGE和HPLC。定量:根据寡核苷酸在260nm处的紫外吸收来定量。储存:分装抽干。Q3.需要什么级别的引物?根据实验需要,确定订购引物的纯度级别。应用引物长度要求纯度级别要求一般PCR扩增60 basePAGE诊断PCR扩增 40baseHEPD, PAGEDNA测序20base左右HEPD亚克隆,点突变等根据实验要求定HEPD, PAGE,HPLC基因构建(全基因合成)根据实验要求定HEPDPAGE反义核酸根据实验要求定HEPDPAGE修饰引物根据实验要求定PAGE, HPLC Q4.引物的质量是不是跟序列有关?四种碱基的性质和各自保护基的性质都有差别。所以合成难度是不一样的。难度最大的当属GC重复多的和序列中还有多个连续的G的引物。尤其对于后者,国内公司一般都做不了20个G以上的引物。实验证明,如果引物中有超过三个连续G的结构,传统方法得到的产物质量就会开始下降。而且目前通用的脱盐、OPC和PAGE方法都无效。鼎国昌盛生物公司拥有的HEPD专利技术能够克服高GC或者高G含量引物的合成和纯化障碍,对普通引物、高GC引物和无论长短的oligo d(G)都能得到同样的非常好的结果。Q5.需要合成多少OD数?根据实验目的确定。一般PCR扩增,2 OD引物,可以做500-1000次50ul标准PCR反应。如果是做基因拼接或退火后做连接,1 OD就足够了。Q6.如何计算引物的浓度?引物保存在高浓度的状况下比较稳定。一般情况下,我们建议将引物的浓度配制成100pmol/ul,称为保存浓度,而引物的工作浓度一般配制成10-50pmol/ul。加水的体积(微升)可直接参照合成报告单上推荐的体积,也可按下列方式计算:V (微升)= OD数x 33 x 10000 /引物的分子量引物的分子量可以从合成报告单上获得。注意:1 OD260= 33 ug/ml。Q7.如何计算引物的Tm值?引物设计软件都可以给出Tm,与引物长度、碱基组成及所使用缓冲夜的离子强度有关。长度为25base以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:Tm = 81.5 + 16.6 x Log10 + 0.41 (GC%) - 600/size**公式中,Size =引物长度。

  • 蛋白修饰与蛋白质鉴定

    现在,在实验研究基础上,借助多方面的生物信息学方法,可以快速高通量的预测和进行蛋白质鉴定蛋白翻译后修饰。分泌蛋白和膜相关蛋白附着于细胞膜上的或将被排泄出去的蛋白质是由细胞内质网膜上附着的核糖体合成。附着有核糖体的内质网被称为糙面型内质网。这类蛋白质都含有一个N-末端(或氨基端),我们称之为信号序列或信号肽。这个信号肽通常情况下含有13-36个主要疏水性残基,同时它含有多蛋白复合物,我们称之为信号识别粒子(SRP)。这种信号肽在通过内质网膜之后会被去除。信号肽的去除过程是在信号肽酶催化作用下完成的。含有一个信号肽的蛋白质被称为前蛋白,有别于原蛋白。然而,某些用于分泌的蛋白在分泌之后会进一步被蛋白水解,因此包含有原蛋白的序列。这类蛋白质被称为前原蛋白。蛋白水解性裂解许多蛋白质在翻译之后会经历水解性裂解过程。其中最为简单的形式是去除起始蛋氨酸。许多蛋白质合成了不活跃的前体细胞,这些细胞只能在合适的生理条件下通过限制性蛋白水解过程产生活性。在凝血过程中使用到的胰腺酶和酶类就是后者的例证。多肽去除时产生活性的不活跃的前体蛋白,我们称之为原蛋白。前原蛋白的翻译后加工过程的一个复杂的例子就是脑垂体分泌合成的前阿黑皮素原的裂解过程(有关前阿黑皮素原的讨论,见肽类激素页)。这类前原蛋白经过复杂的裂解,根据合成的前阿黑皮素原的细胞定位而不同,其路径也有所不同。另一个前原蛋白的例子就是胰岛素。由于胰岛素是由胰腺分泌的,因此它有一个前肽。随着含24个氨基酸的信号肽的裂解,这类蛋白也折叠成了胰岛素原。胰岛素原进一步分裂,产生活跃的胰岛素,它包含两个肽链,由二硫键进行连接。但仍有其他的蛋白(酶类)被合成为非活跃的前体细胞,被称为酶原。酶原在蛋白水解性裂解时会产生活性,在凝血串联蛋白质链的若干蛋白质中都会发生这种现象。甲基化作用蛋白翻译后的甲基化过程主要发生在氮原子和氧原子上。活性甲基供体是活性腺苷甲硫胺酸(SAM)。最常见的甲基化作用发生在赖氨酸残基的ε-amine上。脱氧核糖核酸组蛋白中赖氨酸残基的甲基化作用可调节核染色质结构,因此可调节其转录活性。赖氨酸原本被认为是一种常设共价标记,可提供长期信号,甚至包括转录记忆时的组蛋白依赖机制。然而,最近的临床研究表明赖氨酸甲基化作用与其他共价修饰体相似,作用时间短,并能通过反脱甲基化活动进行动态调节。最近的组学研究发现表明,赖氨酸残基的甲基化作用不仅发生在核染色质层面,而且还通过修订转录因子影响基因表达。组氨酸的咪唑环,精氨酸的胍基部分以及谷氨酸盐和天冬氨酸盐的R组酰胺(R-group amides )上,都发现了额外的氮甲基化作用。谷氨酸盐和天冬氨酸盐的R组羧化物也会发生氧甲基化作用并形成甲基酯。蛋白可能在半胱氨酸的R[

  • 引物篇(引物合成及各种问题总结) [精华

    引物篇1.引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种, 主要都是由ABI/PE 公司生产,无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不同和单个循环用时的多少。亚磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。亚磷酰胺三酯法是将DNA固定在固相载体上完成DNA链的合成的,合成的方向是由待合成引物的3'端向5'端合成的,相邻的核苷酸通过3'→5'磷酸二酯键连接。第一步是将预先连接在固相载体CPG上的活性基团被保护的核苷酸与三氯乙酸反应,脱去其5'-羟基的保护基团DMT,获得游离的5'-羟基;第二步,合成DNA的原料,亚磷酰胺保护核苷酸单体,与活化剂四氮唑混合,得到核苷亚磷酸活化中间体,它的3'端被活化,5'-羟基仍然被DMT保护,与溶液中游离的5'-羟基发生缩合反应。 第三步,带帽(capping)反应,缩合反应中可能有极少数5'-羟基没有参加反应(少于2%),用乙酸酐和1-甲基咪唑终止其后继续发生反应,这种短片段可以在纯化时分离掉。第四步,在氧化剂碘的作用下,亚磷酰形式转变为更稳定的磷酸三酯。经过以上四个步骤,一个脱氧核苷酸被连接到固相载体的核苷酸上。再以三氯乙酸脱去它的5'-羟基上的保护基团DMT,重复以上步骤,直到所有要求合成的碱基被接上去。合成过程中可以观察TCA处理阶段的颜色判定合成效率。通过氨水高温处理,连接在CPG上的引物被切下来,通过OPC, PAGE等手段纯化引物,成品引物用C18浓缩,脱盐,沉淀。沉淀后的引物用水悬浮,测定OD260定量,根据定单要求分装。2.引物纯化方式有哪些,如何选择?◆ C18柱脱盐:有人称其为简易反相柱,它对DNA有特异性的吸附,可以被有机溶解洗脱,但不会被水洗脱,所以能有效地去除盐分。它不能有效去除比目的片段短的小片段。实际上,它是一种脱盐的作用。这种方法一般不会对普通PCR反应产生影响。对于需要用于测序、克隆的引物不能使用这个级别。 ◆ OPC纯化: OPC纯化是根据DNA保护基(DMTr基)和Cartridge柱中树脂间的亲合力作用的原理进行纯化目的DNA片段。OPC法纯化的DNA纯度大于95%。适用于40mer以下引物的纯化。◆ PAGE纯:PAGE纯化法是使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,对DNA片段进行分离,然后从凝胶中回收目的DNA的方法。PAGE纯化法也是一种非常有效的DNA纯化方法,纯化后的DNA纯度大于95%,对长链Oligo DNA (大于50mer)的纯化特别有效。 ◆ HPLC纯化:HPLC纯化是使用高效液相色谱的原理,对DNA片段进行纯化。纯度可以大于99%。主要用于短链和修饰引物的纯化。该法的弱点是成本较高,批量生产效率不高。3.引物的OD数如何定量?答:引物合成引物OD数是这样测定的:用紫外分光光度计,波长260nm,石英比色杯,光程为1厘米,测定溶液的光密度。测定时溶液的光密度最好稀释到0.2-1.0之间。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,用1ml水稀释测OD值。需要根据稀释倍数换算出母液的OD值。4.需要什么级别的引物?答:引物常用的纯化方式C18脱盐,OPC纯化,PAGE纯化,HPLC纯化。根据实验需要,确定订购引物的纯度级别。应用 引物长度要求 纯度级别要求一般PCR扩增 45 base PAGE诊断PCR扩增 40base OPC, PAGEDNA测序 20base左右 OPC亚克隆,点突变等 根据实验要求定 OPC, PAGE,HPLC基因构建(全基因合成) 根据实验要求定 PAGE反义核酸 根据实验要求定 PAGE修饰引物 根据实验要求定 PAGE, HPLC5.最长可以合成多长的引物?答:引物越长,出现问题的概率就越大。我们合成过120base的引物,但是产率很低。除非需要,建议合成片段长度不要超过80mer,按照目前的引物合成效率,80mer的粗产品,全长(还不一定正确)引物的百分比不会超过40%,后续处理还有丢失很多,最后的产量是很低。6.需要合成多少OD数?答:根据实验目的确定。一般PCR扩增,2 OD引物,可以做200-500次50ul标准PCR反应。如果是做基因拼接或退火后做连接,1 OD就足够了。但是有些研究人员,就做几次PCR,但是却要5-10 OD。做全基因构建的引物都比较长,但是我们有些研究人员也要求高OD数。片段越长, 最后全长得率就越低,出错的几率就越大。超出需要之外的OD数要求,其实也是对社会资源的一种浪费,同时也从一个侧面反映了部分研究人员,特别是新手的自信心不足,总觉得需要重复多次才能成功。7.如何检测引物的纯度?答:实验室方便的作法是用PAGE方法。使用加有7M尿素的16%的聚丙烯酰胺凝胶进行电泳。取0.2-0.5OD的引物,用尿素饱和液溶解或引物溶液中加入尿素干粉直到饱和,上样前加热变性(95℃,2mins)。加入尿素的目的一是变性,二是增加样品比重,容易加样。600V电压进行电泳,一定时间后(约2-3小时),剥胶,用荧光TLC板在紫外灯下检测带型,在主带之下没有杂带,说明纯度是好的。如果条件许可,也可以用EB 染色或银染方式染色。8.如何计算引物的浓度?答:引物保存在高浓度的状况下比较稳定。引物一般配制成10-50pmol/ul。 溶解前您需要核对合成报告单和引物标签上的引物OD数是否一致。如果不一致,请和我们联系。我们可以根据生产记录查到实际产量是多少。一般情况下,我们建议将引物的浓度配制成50pmol/ul,加水的体积(微升)按下列方式计算:V (微升)= OD数*(乘)33 *(乘)*(乘)20000 / (除) 引物的分子量。引物的分子量可以从合成报告单上获得。如果需要配制成其他浓度,按上述公式换算。注意:1 OD260= 33 ug/ml.9.如何计算引物的Tm值?答:引物设计软件都可以给出Tm,引物长度,碱基组成,引物使用缓冲的离子强度有关。长度为25mer以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:Tm = 81.5 + 16.6 x Log10 + 0.41 (%GC) – 600/size 公式中,Size = 引物长度。Tm的定义:Tm = Temperature at which 50% of a given oligonucleotide is hybridized to its complementary strand. In the absence of destabilizing agents, like formamide or urea, Tm will depend on 3 major parameters: The sequence: a GC-rich sequence has a higher melting temperature. The strand concentration: high oligonucleotide concentrations favor hybrid formation, which results in a higher melting temperature. The salt concentration: high ionic strength results in a higher Tm as cations stabilize the DNA duplexes. 10.引物(含修饰)的分子量是如何确定的?答:非修饰的引物的Molecular Weight在随引物提供的报告单上都有明确的标示。如果需要估计一个引物的分子量按每个碱基的平均分子量为324.5,引物的分子量=碱基数 x 碱基的平均分子量。或按下列公式计算MW= (NA * WA) + (NC * WC) + (NG * WG) + (NT * WT) +(Nmod * Wmod) +(Nx * Wx)+( Ni* Wi) +16* Ns– 62. NA, NG, NC, NT, Ni分别为引物中碱基A或G或C或T或I的数量,WA, WC, WG, W, Wi分别为引物中碱基A或G或C或T或I的分子量,Nmod,Wmod 分别为修饰基团的数目和分子量。对于混合碱基的分子量为混合碱基的分子量总合除以混合数,例如G+A混合的分子量为(313.21+329.21)/2 = 321.21。Ns为硫代数目,硫代每个位置增加分子量16。常规碱基分子量Base Molecular Weight A 313.21C 289.18G 329.21T 304.19I 314.2U 290.17常规修饰基团分子量5’-Biotin 405.45 3’-TAMARA 623.605’-(6 FAM) 537.46 3’-Dabsyl

  • 引物合成常见问题解析

    Q1.引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种,无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不同和单个循环用时的多少。(1) 去保护:加入Deblocking脱去碱基上5'- OH的保护基团DMT,获得游离的5'- OH;(2) 耦合:同时加入活化剂和新的碱基,新的碱基5'-OH仍然被DMT保护,3'端被活化与溶液中游离的5'-OH发生耦合反应;(3) 封闭:耦合反应中极少数5'- OH没有参加反应,用封闭试剂终止其后继续发生反应;(4) 氧化:加入氧化剂使其由核苷亚磷酸酯形成更稳定的核苷磷酸酯。Q2.引物合成后如何处理?切割与脱保护基:将合成好的寡核苷酸链从支持物上化学切割下来。常用新鲜的浓氨水来裂解CPG与初始核苷之间的酯键。断裂下来的寡核苷酸带有自由的3'羟基。纯化:根据所合成寡核苷酸的组成和应用来选定纯化的方法。常用的纯化方法有:C18、OPC、PAGE和HPLC。定量:根据寡核苷酸在260nm处的紫外吸收来定量。储存:分装抽干。Q3.需要什么级别的引物?根据实验需要,确定订购引物的纯度级别。应用引物长度要求纯度级别要求一般PCR扩增60 basePAGE诊断PCR扩增 40baseHEPD, PAGEDNA测序20base左右HEPD亚克隆,点突变等根据实验要求定HEPD, PAGE,HPLC基因构建(全基因合成)根据实验要求定HEPDPAGE反义核酸根据实验要求定HEPDPAGE修饰引物根据实验要求定PAGE, HPLCQ4.引物的质量是不是跟序列有关?四种碱基的性质和各自保护基的性质都有差别。所以合成难度是不一样的。难度最大的当属GC重复多的和序列中还有多个连续的G的引物。尤其对于后者,国内公司一般都做不了20个G以上的引物。实验证明,如果引物中有超过三个连续G的结构,传统方法得到的产物质量就会开始下降。而且目前通用的脱盐、OPC和PAGE方法都无效。鼎国昌盛生物公司拥有的HEPD专利技术能够克服高GC或者高G含量引物的合成和纯化障碍,对普通引物、高GC引物和无论长短的oligo d(G)都能得到同样的非常好的结果。Q5.需要合成多少OD数?根据实验目的确定。一般PCR扩增,2 OD引物,可以做500-1000次50ul标准PCR反应。如果是做基因拼接或退火后做连接,1 OD就足够了。Q6.如何计算引物的浓度?引物保存在高浓度的状况下比较稳定。一般情况下,我们建议将引物的浓度配制成100pmol/ul,称为保存浓度,而引物的工作浓度一般配制成10-50pmol/ul。加水的体积(微升)可直接参照合成报告单上推荐的体积,也可按下列方式计算:V (微升)= OD数x 33 x 10000 /引物的分子量引物的分子量可以从合成报告单上获得。注意:1 OD260= 33 ug/ml。Q7.如何计算引物的Tm值?引物设计软件都可以给出Tm,与引物长度、碱基组成及所使用缓冲夜的离子强度有关。长度为25base以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:Tm = 81.5 + 16.6 x Log10 + 0.41 (GC%) - 600/size**公式中,Size =引物长度。Q8.引物(含修饰)的分子量是如何确定的?非修饰的引物的分子量(MW)在随引物提供的报告单上可以找到。如果需要估计一个引物的分子量按每个碱基的平均分子量为324.5,引物的分子量=碱基数 x碱基的平均分子量,或按下列公式计算MW= (NA * WA) + (NC * WC) + (NG * WG) + (NT * WT) +(Nmod * Wmod)+(Nx * Wx)+( NI* WI) +16* Ns-62.NA, NG, NC, NT, NI分别为引物中碱基A或G或C或T或I的数量,WA, WG ,WC, WT, WI分别为引物中碱基A或G或C或T或I的分子量,Nmod,Wmod分别为修饰基团的数目和分子量。对于混合碱基的分子量为混合碱基的分子量总合除以混合数,例如G+A混合的分子量为(313.21+329.21)/2 = 321.21。Ns为硫代数目,硫代每个位置增加分子量16。常规碱基分子量BaseMolecular WeightA313.21C289.18G329.21T304.19I314.2U290.17常规修饰基团分子量5’-Biotin405.453’-TAMARA623.605’-(6 FAM)537.463’-Dabsyl498.495’-HEX744.133’-(6 FAM)569.465’-TET675.243’-Amino Modifier C3153.075’-Cy5533.633’-Amino Modifier C7209.185’-Cy3507.593’-Thiol Modifier C3154.12Q9.如何溶解引物?干燥后的引物质地非常疏松,开盖前最好瞬时离心一下,或管垂直向上在桌面上敲敲,将引物粉末收集到管底。根据计算出的体积加入去离子无菌水或TE(pH8.0)缓冲液,室温放置几分钟,振荡助溶,离心将溶液收集到管底。溶解引物用的水一般不要用蒸馏水,因为有些蒸馏水的pH值比较低(pH4-5),引物在这种条件下不稳定。Q10.如何保存引物?引物合成后,经过一系列处理和纯化步骤,旋转干燥而成无色或白色絮状干粉。干 粉:运输时常温运输,-20℃可以保存一年。储存液:配好后分装成几管,避免反复冻融,-20℃可以保存半年。工作液:常规使用,4℃保存,也可-20℃保存,但应避免反复冻融。修饰荧光引物:需要避光保存,尽快使用为宜。Q11.最长可以合成多长的引物?我们合成过100base的引物,但是产率很低。除非需要,建议合成片段长度不要超过80base。引物越长,出现问题的概率就越大,按照目前的引物合成效率,大于80base的粗产品,全长引物的百分比不高,后续处理还有丢失很多,最后的产量很低。Q12.为什么修饰引物的产量要比一般引物低,价格要高?主要因为是修饰单体稳定性较差,偶连时间长,效率低,最后得到的产量自然低于一般的引物。修饰引物通常需要PAGE或HPLC纯化,纯化过程损失大。修饰引物使用的原料是一般引物原料的几百倍,所以产品的价格也高。Q13.引物片段退火后不能连接到载体上是什么问题?连接反应需要引物的5'磷酸基团。如果需要将合成的引物退火直接连接相应的载体上,引物需要磷酸化。磷酸化的产物如果还不能连接载体上,需要检查载体的酶切效果,需要改善引物退火的条件。SiRNA分子具有特殊的对称结构,退火的难度较大,退火时需要提高退火温度。Q14.为什么引物的OD260/OD280小于1.5?需

  • 核酸蛋白检测仪应用和原理

    核酸蛋白检测仪是层析分析的主要装置,核酸蛋白检测仪配上层析柱、恒流泵、部分收集器、层析谱分析系统(根据需要选配)和电脑打印设备即构成一套完整的核酸蛋白检测仪分离层析系统。它是当今从事生命科学研究、药物测定、化工、食品科学及医学研究等行业的现代分析实验仪器。核酸蛋白检测仪分析系统广泛用于工业、农业、科研和大专院校的科学研究和教学实验。其原理是根据物质(样品)对紫外光有明显吸收的特征,实现对样品成份含量比对分析,以便进行样品蛋白、核酸物质识别检测和含量测定。在生化分析、环保科学、食品研究、毒理研究、新药开发等领域中对核酸、蛋白检测、纯化和提取提供了一种独特的分析手段。

  • 培安有限公司正在寻找多肽合成仪器产品专员/经理(上海)职位,坐标上海,谈钱不伤感情!

    [b]职位名称:[/b]多肽合成仪器产品专员/经理(上海)[b]职位描述/要求:[/b]职位描述:1.从事化学合成相关仪器的市场开发; 3.及时了解、分析市场动态并汇报,及时反馈客户需求及其他相关信息; 4.维护责任区域内客户,并为客户提供全面的技术方案及服务; 5.积极配合公司各部门开展仪器展会、学术会议等活动。 职位要求:1.本科及本科以上学历,生物、化学等相关专业毕业; 2.具有1年以上生命科学仪器市场工作经验,市场敏锐度高;3.熟悉国内生命科学仪器领域的情况,了解相关学术的最新动态; 4.良好的英文表达能力,能够阅读并翻译与所销售仪器相关的资料; 5.具有良好的沟通能力,有责任心、进取心,遵守职业道德; 6.有合成产品背景为佳 熟悉相关产品仪器如:微波多肽合成(LIBERTY)、蛋白水解、蛋白酶解、PBI等。[b]公司介绍:[/b] 培安公司自成立以来,一直致力于为国内用户提供最先进的科研仪器和最新的科研技术,旨在提高祖国的科研实力。 培安一贯坚持“质量为本,信誉致上,服务第一”的企业宗旨,弘扬“团结诚信,求实创新”的企业精神,奉行“用户的需求就是我们的目标”的经营理念,竭诚为用户提供最优质的产品及服务。 培安以最快的速度将世界上尖端的技术及设备引进日新月异的中国,经过多年的发展,公司的产品已涉及到...[url=https://www.instrument.com.cn/job/user/job/position/67579]查看全部[/url]

  • 【求助】跪求 瑞典Biotage 全自动微波合成仪器使用说明书PDF

    各位版友,我们公司买了一台瑞典Biotage 全自动微波合成仪器,说明书在给仪器搬家的时候弄没有了,经销商电子文档也没有留份,再要的时候客服磨机磨机迟迟不发,请问那位版友有的话能否传份给我,非常感谢,正在编写该仪器的SOP,唉~~没有资料凭借自己经验还是有点不足。。。。。

  • 核酸提取仪的工作原理

    核酸提取(核酸的分离与纯化)主要是指将核酸与蛋白质、多糖、脂肪等生物大分子物质分开,但在分离核酸时,应保证核酸分子一级结构的完整性,并排除其他分子污染。核酸提取方法一般包括细胞裂解、酶处理、核酸与其他生物大分子物质分离、核酸纯化等几个主要步骤,而每一步骤又可由多种不同的方法单独或联合实现。操作过程中首先通过物理、化学或酶解作用裂解细胞,使核酸释放出来,并去除与核酸结合的蛋白质以及多糖、脂肪类等生物大分子的过程。在此基础上,沉淀核酸、去除盐类和有机试剂等杂质,从而得到纯化的核酸。核酸提取仪是应用配套的核酸提取试剂来自动完成样本核酸的提取工作的仪器。在传统的手工核酸提取过程中通常采用离心澄清的方法,操作时费时费力。近年来,出现了磁珠分离技术,利用磁珠在一定条件下对核酸具有很强亲和力的特点,吸附核酸。当条件改变时,磁珠又可以与其吸附的核酸分离,从而得到纯化的核酸。这种方法简便、高效、易于操作,是目前核酸提取仪采用的主要方法。具体来说,磁珠法提取核酸是通过细胞裂解液裂解细胞,从细胞中游离出来的核酸分子被特异的吸附到磁性颗粒表面,而蛋白质等杂质不被吸附而留在溶液中。反应一定时间之后,再在磁场作用下,使磁性颗粒与液体分开,回收颗粒(即磁珠-DNA 混合物),再用洗脱液洗脱即可以得到纯净的DNA。磁珠法不需要离心、不需要加入多种试剂,操作简单,符合核酸自动化提取要求,是未来核酸纯化方法发展的一个重要方向。

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  • 培安有限公司刚刚发布了多肽合成仪产品专员/经理(北京)职位,坐标北京,敢不敢来试试?

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  • 人工合成多肽

    人工合成多肽

    国肽生物 提供 多肽合成、多肽修饰、蛋白多肽、cGMP多肽、多肽化学合成、目录肽、药物肽/化妆品肽、多肽文库构建、中间体定制及合成、抗体服务、氨基酸、糖肽、订书肽、多肽核酸等多肽及蛋白质的人工合成多肽及蛋白质的人工合成,指以氨基酸为原料,用化学方法合成多肽或蛋白质。以氨基酸为原料,用化学方法合成多肽或蛋白质。其目的是:①确证天然多肽或蛋白质的结构;②生产天然的、在生物体内含量极微但有医疗或其他生物效用的多肽;③改变部分结构,研究其结构与功能的关系,并设计更有效的药物。[img=,625,151]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/06/201906190944309669_566_3531468_3.jpg!w625x151.jpg[/img]我们主要提供:多肽合成、定制多肽、同位素标记肽、人工胰岛素、磷酸肽、生物素标记肽、荧光标记肽(Cy3、Cy5、Fitc、AMC等)、目录肽、偶联蛋白(KLH、BSA、OVA等)、化妆品肽、多肽文库构建、抗体服务、糖肽、订书肽、药物肽、RGD环肽等。详情请咨询合肥国肽生物www.bankpeptide.com

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