自动长度检测仪

近日，约翰霍普金斯大学医学院Carol W. Greider团队在Science发表了题为“Human telomere length is chromosome end–specific and conserved across individuals”的文章，介绍了一种基于纳米孔测序技术的端粒分析方法——Telomere Profiling，可以单核苷酸分辨率测量细胞中每个端粒的长度。Carol W. Greider曾与Elizabeth Blackburn、Jack Szostak以”发现端粒和端粒酶是如何保护染色体的“这一研究成果，获得2009年诺贝尔生理学或医学奖。研究团队利用这一新方法对 147 个个体的染色体端粒长度进行分析，发现端粒中位长度为 4.7kb，但不同染色体端粒长度差异极大，平均值相差超6kb。特别地，这种染色体末端特异性端粒长度差异具有个体保守性，在出生时就已确定，随年龄增长也得以保持。这一发现对于理解端粒生物学、衰老过程以及相关疾病的发生具有重要意义。综上，Telomere Profiling方法易于实施、结果精确并且成本较低，可广泛应用于科学研究和临床诊断，将使探索端粒生物学的全新领域成为可能。文章发表在Science主要研究内容:1.纳米孔端粒分析准确且可重复报告端粒长度为确定人类端粒是否在所有染色体上保持共同的长度分布，或者特定的染色体末端是否保持自己独特的长度分布，研究团队开发了一种富集、分析端粒的方法Telomere Profiling：首先使用生物素化的寡核苷酸（TeloTag）标记端粒末端；随后用链霉亲和素分离标记的端粒，并通过限制性内切酶酶切将其释放；最后通过牛津纳米孔技术（ONT）长读长测序方法对端粒进行测序。据悉，使用该方法检测每个样本的成本约为75美元。此外，研究团队还开发了新生物信息学分析流程来确定染色体末端特异性端粒长度。接下来，研究团队通过对0岁至90岁人群的外周血单核细胞（PBMC）进行了端粒分析，并将其与Southern印迹法、FlowFISH检测的结果进行对比。结果显示，经不同方法所检测的端粒长度高度一致，表明Telomere Profiling方法具有高度准确性及优异可重复性。此外，研究团队还通过检测7个样本的端粒长度来检测实验室间的差异性，确认了该方法的广泛适用性和可靠性。图1. 纳米孔技术进行端粒分析是准确和精确的2.端粒长度随年龄增长而发生变化已知端粒长度随着年龄的增长而缩短，但先前方法无法在核苷酸分辨率上测量端粒长度。为检测端粒长度动态范围，研究团队使用Telomere Profiling对11个个体（0-84岁）的DNA样本进行分析，并根据端粒长度进行排序；通过Southern印迹法对相同的DNA进行测量，并将其作为验证。结果显示，Telomere Profiling预测了端粒长度的等级顺序，捕获了Southern印迹的动态范围，并测量端粒随年龄增长而缩短的情况，这对于理解衰老过程中的生物学变化至关重要。此外，Telomere Profiling还确定了端粒长度的第1、第10和第50百分位数。研究团队还将该方法与FlowFISH进行了比较，使用先前诊断为短端粒综合征的特发性肺纤维化（IPF）患者的5μg存档DNA样本进行分析。结果显示，大多数IPF样本的整体端粒长度与FlowFISH测量结果相似，表明Telomere Profiling能够检测出患病个体，有望助力临床诊断和治疗。图2. 纳米孔端粒分析检测端粒长度随年龄的动态变化3.人类端粒具有染色体末端特异性长度和单倍型特异性长度差异为确定人类是否具有染色体末端特异性端粒长度，研究团队分析了来自二倍体HG002细胞系的端粒，从HG002细胞系中分离DNA，并对端粒进行测序，将平均总长度为16.4 kb的reads映射到HG002参考基因组中，共有77个染色体末端通过质量筛选。结果显示，每条染色体的末端表现出不同的端粒长度分布；端粒中位长度为 4.7kb，有66个端粒的长度分布与均值有显著差异，平均长度差异超过6kb。除染色体末端特异性长度外，一些端粒在母系和父系单倍型之间也存在显著差异。上述结果表明，人类端粒具有染色体末端特异性长度分布。图3. 染色体末端特异性端粒长度4.染色体特异性端粒长度在个体间是保守的研究团队将150个个体的端粒序列与最近发布的泛基因组中的亚端粒序列进行了比对，将300个单倍体基因组的全基因组序列与3个高质量单倍体参考T2T基因组CHM13、HG002母基因组和HG002父基因组的序列进行比对，以确定每个参考基因组中相同亚端粒的可重复性。在所有reads中，87%在泛基因组和CHM13中定位到相同的染色体末端，90%在泛基因组和HG002母系中定位到相同的染色体末端，88%在泛基因组和HG002父系中定位到相同的染色体末端。这些数据表明，经Telomere Profiling检测的reads均可映射到一个特定的泛基因组染色体图谱，具有很高的可信度。研究团队建立了相对平均端粒长度，分析了147个个体PBMC样本每个染色体末端端粒长度，并根据端粒的相对长度对染色体末端进行排序。结果显示，17p、20q和12p往往是群体中最短的端粒，而4q、12q和3p往往是最长的端粒。因此，虽然在单个个体中可以看到端粒长度的单倍型特异性差异，但在整个群体中，某些染色体末端更有可能比总体平均值短，而其他染色体末端更有可能比总体平均值长。研究团队还分析了不同年龄段的样本，在婴儿脐带血样本发现了同样的端粒长度差异，说明随着年龄增长，端粒长度普遍缩短，但长度差异保持不变。这些结果表明，个体端粒长度的差异是在出生时就已存在，且在不同个体间是保守的。图4. 染色体特异性端粒长度在人群中是保守的综上所述，研究团队开发了一种简单通用的端粒富集分析方法Telomere Profiling，并跨越了广泛的年龄范围，基于该方法发现了染色体特异性和单倍型特异性的端粒长度分布，其中一些端粒长度之间存在显著差异，拓展了端粒长度的临床意义。综上，Telomere Profiling将帮助人们更深入地了解端粒生物学，并有望推动相关领域发展，从而有望找到治疗疾病的新方法。研究团队指出：“Telomere Profiling可使精确的端粒长度研究广泛应用于实验室、临床和药物发现工作中。因此，在未来的研究中，应该加强不同人群的检测，以证实某些染色体末端是否始终是最短的还是最长的。”原文链接：K. Karimian et al., Human telomere length is chromosome end–specific and conserved across individuals. Science (2024). https://www.science.org/doi/10.1126/science.ado0431

吉林省政府采购中心关于拟采用单一来源方式对省地质环境监测总站地下水自动检测仪进行采购的公示公告 　　按照吉林省财政厅政府采购管理办公室下达的政府采购任务通知书的要求，吉林省政府采购中心现对吉林省地质环境监测总站申请采用单一来源方式采购的下列货物予以公示，以确定是否还有其他供应商能够并且愿意提供所公示拟采购的货物。现就有关事项公告如下： 　　1、拟采购的货物名称及主要技术要求： 　　货物名称：地下水自动监测仪 　　品牌型号：GWS ecolog 500地下水自动监测仪 　　数量及数量单位：57台套 　　详细配置和主要技术参数要求： 　　仪器配置：数据采集器、GSM\GPRS调制解调器、OTT GWS 传感器和内置传输单元四部分组成。 　　技术参数： 　　水深量程： 0 ~ 40 米 　　准确度(压力)： 0.05 % FS 　　温度量程： -25 ℃~+70 ℃ 　　温度准确度：± 0.5 ℃ 　　电源： 4节5号电池(3.6V) 　　使用寿命：(读数间隔为1 小时)至少10 年 　　输出端口：红外接口，防止腐蚀和生锈 　　内存：4 MB 　　测量值的数量：约500000 个 　　读数间隔：1 秒钟到24 小时 　　尺寸： 　　通讯单元：L ×? 400 mm × 22 mm 　　压力传感器：L ×?195 mm × 22 mm 　　系统长度：1~200 m 　　电缆材质：凯尔拉夫专业电缆，内置导气管 　　重量： 　　通讯单元 ( 包括电池 ) 约 0.360 kg 　　压力传感器约 0.260 kg 　　EMC 标准：EN61000-6-2:1999 和 EN61000-6-3:2001 　　通讯模块传输方式：GSM 短信传输、GPRS网络传输、短信报警、CSD反控 　　执行的技术标准：符合行业标准：EG204/108/EG、ETSI EN301 486-1/-7、EN 61326-1 　　2、公示期为3个工作日，自2012年2月29日起至2012年3月5日止。 　　3、凡能够提供并且愿意提供本公告拟采购货物的供应商，必须在公示期内以书面形式(信函、传真，加盖公章，下同)向本中心提交申请。以传真方式提交申请的，请务必在发送传真文件的同时,以快递方式或者当面交接的方式递交申请书原件，并随附能够证明拟提供货物符合本公告第1条“拟采购的货物名称及主要技术要求”的详细资料，以确保本中心能够在公示期满后3个工作日内收到。 　　4、超过上述第3条规定期限提交的申请，或者虽然在规定期限内提交申请但没有提交能够证明其拟提供货物符合本公告第1条“拟采购的货物名称及主要技术要求”的详细资料的，将不予接受。 　　5、在公示期内，如果只有一家供应商以书面形式明确表示能够并且愿意提供所公示拟采购的货物，将采用单一来源方式采购 如果有两家以上(含两家)供应商以书面形式明确表示能够并且愿意提供所公示拟采购的货物，将报告吉林省财政厅政府采购管理办公室批准后采用其他方式采购。 　　吉林省政府采购中心联系方式： 　　地址：吉林省长春市文化街158号二楼 　　项目联系人：杨宁 　　电话：0431- 88904779 　　传真：0431-88904779 　　邮政编码：130051 　　网 址: www.jlszfcg.gov.cn

近日，质检总局发布了《氨氮自动监测仪检定规程》等9个国家计量技术法规的公告，公告全文如下： 　　计量技术法规的公告 　　质检总局关于发布JJG631-2013 　　《氨氮自动监测仪检定规程》等9个国家 　　计量技术法规的公告 　　根据《中华人民共和国计量法》有关规定，现批准JJG631-2013《氨氮自动监测仪检定规程》等9个国家计量技术法规发布实施。 编 号 名 称 批准日期 实施日期 备注 JJG631-2013 氨氮自动监测仪检定规程 2013-08-15 2014-02-15 代替 JJG631-2004 JJG825-2013 测氡仪检定规程 2013-08-15 2014-02-15 代替 JJG825-1993 JJG853-2013 低本底&alpha 、&beta 测量仪检定规程 2013-08-15 2014-02-15 代替 JJG853-1993 JJG1087-2013 矿用氧气检测报警器检定规程 2013-08-15 2013-11-15 JJF1261.9-2013 家用燃气快速热水器和燃气采暖热水炉能源效率标识计量检测规则 2013-08-15 2013-11-15 JJF1261.10-2013 家用和类似用途微波炉能源效率标识计量检测规则 2013-08-15 2013-11-15 JJF1261.11-2013 家用太阳能热水系统能源效率标识计量检测规则 2013-08-15 2013-11-15 JJF1261.12-2013 微型计算机能源效率标识计量检测规则 2013-08-15 2013-11-15 JJF1424-2013 氨氮自动检测仪型式评价大纲 2013-08-15 2013-11-15 　　特此公告。 　　质检总局 　　2013年8月20日