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稀有细胞捕获系统

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稀有细胞捕获系统相关的资讯

  • 长春光机所在多色拉曼微流控稀有细胞分选研究获得进展
    近期,长春光机所吴一辉研究员团队在国际顶级期刊《Biosensors and Bioelectronics》以“Multistage microfluidic cell sorting method and chip based on size and stiffness”为题发表了研究论文,报道了他们在基于微流控芯片的肿瘤细胞无标记分选领域的重要研究进展。   这项研究建立了细胞在侧向位移芯片内的流体动力学模型,定量分析了基于细胞体积、杨氏模量等物理参数下的微流控芯片无标记高通量、无堵塞分选方法,优化了芯片阵列,研制出了一种多物理参数分级分选的微流控阵列分选芯片,解决了高通量与高准确性的矛盾;这项研究将细胞刚度有效地纳入分类依据,给出了一种控制流体流速使癌细胞与正常细胞间微小刚度差得以在微流动中体现和放大的细胞分离方法和理论依据,构建了从外周血细胞中捕获和分析肿瘤细胞的分选分析系统,并进行了实际临床血液样本测试,这是目前报道的全微流体无标记CTCs较为完整的分选分析系统,结合拉曼光谱分析系统,该系统有可能发展成一站式无标记高性能CTCs分类分析设备。这项工作为利用多种物理性质来分选CTCs提供了一个新的视角,这些物理性质的组合使用可以提高分离特异性并减少细胞异质性的影响。图1 多级侧向位移微流控分选及拉曼光谱无标分析系统研究人员使用液滴形微柱新开发了临界尺寸为8μm和13μm的两级阵列DLD芯片,该芯片结构简单,重复性好,对CTCs的分选纯度为98.25±2.48%,回收效率为96.30±2.10%,通量高达2mL/min,性能达到国际先进水平。该文研究的相关内容是在国家自然科学基金国家重大科研仪器研制项目《多色拉曼光谱微流控芯片高通量稀有细胞分选系统》的支持下,联合清华大学、吉林大学团队于今年3月完成。
  • 单细胞测序:少量细胞和稀有细胞的解决方案
    单细胞测序:少量细胞和稀有细胞的解决方案做单细胞测序的时,您是否遇到下列情况: ü 细胞样本量较少,不够做一次高通量单细胞测序… … ü 没有简便易用的设备分选单个细胞… … ü 保护细胞的基因完整性难度大… … ü 分选到单细胞后,找不到合适的试剂进行下一步操作… … 如果这些问题曾给您带来困扰,4月28日由Namocell联合Qiagen带来的关于“少量细胞和稀有细胞的单细胞测序解决方案”的讲座,一定会让您有所收获。 近年来的单细胞研究表明,生物体由数千种独特且不可重复的细胞类型组成。由于单细胞中核酸数量有限,使用二代测序(NGS)方法进行单细胞分析(类似于低样本量测序)传统上具有挑战性。当研究群体较小时,这种限制变得更加明显,例如稀有细胞样本(阳性细胞占比0.1%以下)。高保真度(HiFi)和高质量的DNA扩增对于单细胞测序至关重要,这在很大程度上取决于分离细胞的质量。因此,用于分离单个细胞的方法对于确保细胞活力和核酸完整性至关重要。 美国Namocell公司专利的轻柔分选和细胞富集技术为您克服上述挑战,为单细胞测序提供了更高数量和质量的细胞样本,让您能够轻松获得细胞样品的完整且准确的遗传信息。 无论您是单细胞分析的初学者还是专家,相信都能在这个信息丰富的网络研讨会中有所收获。让我们一起了解和探讨少量样本和稀有单细胞测序的重要因素和新技术。 会议时间2022.4.28 16:00-17:00(注册时选择观看时间为Thursday, April 28, 2022, 10:00 AM CEST) 报名通道(点击) 主讲人介绍
  • 循环肿瘤细胞(CTC)捕获及检测技术进展
    p style=" text-indent: 2em " 在过去的一年中,循环肿瘤细胞(CTC)捕获和检测市场飞速增长,多个公司将此类技术推向临床并应用于癌症的诊断,与此同时,一大批新兴公司凭借其独有技术从科研机构中脱颖而出,开启了循环肿瘤细胞捕获和检测的商业化之路。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/80851a5e-ad37-4e21-86db-fe75c5d75d14.jpg" title=" 细胞.jpeg" alt=" 细胞.jpeg" width=" 419" height=" 279" style=" width: 419px height: 279px " / /p p   传统上,临床医生采用组织活检进行癌症诊断。但这种方法对患者具有侵入性,不仅耗时且价格高昂。在过去的十年中,液态活检技术的发展为这些问题带来了突破性的解决方案,并有望为不同患者的疾病提供了更加精准的个体化信息。 /p p   加拿大多伦多大学生物化学教授Shana Kelley一直致力于CTC捕获和检测技术的研究,她认为,“ strong 液体活检将有望带来一次彻底的模式转变,因为患者可以在接受治疗的同时以一种非侵入式的方式进行持续监测 /strong 。这样可以监测肿瘤的动态特征,帮助医生们制定更多治疗方案,而组织活检由于技术的风险和侵入性无法做到这些。”她还表示:“ strong 我们发现越来越多的技术能够在单细胞水平分析CTCs的基因型和表型特征 /strong 。考虑到这些细胞的异质性以及追踪患者样本中目标亚群微量水平的重要性,这一点极其重要。” /p p   一般而言,研究人员可以通过CTC的生物或物理特征(如基因表达、大小、密度、变形性或电荷)进行正向富集或负向富集,然后利用免疫、分子或功能性实验对这些细胞进行检测。虽然CTC富集和捕获技术前景广阔,但与利用ctDNA的液体活检技术相比,研究人员却遇到了挑战。 /p p   2017年发表在Cancer Discovery期刊的一项研究中,来自德国汉堡大学医学中心的Klaus Pantel及其研究团队对CTCs在液体活检领域的临床应用进行了研究,并指出了 strong CTCs应用的局限性 /strong : strong 建立癌细胞系或异种移植需要成百上千个CTCs,这使该方法适用于极少数疾病的晚期患者身上 /strong 。作者还指出,对基于CTC生物学发现的新技术研发的关注,常常会延缓CTC检测进入临床诊断的进程。但研究人员也表示,有关CTC生物学的新研究已经开始衍生出“集CTCs富集、检测和定性于一体”的平台。 /p p   美国医疗和生命科学咨询公司Health Advances副总裁Kristen Amanti认为,CTCs临床应用的问题和障碍主要取决于如何使用这些细胞。“ strong 如果公司试图利用CTCs来进行癌症筛查,而不是监测已经被诊断出患有某种特定癌症患者的治疗,那么公司将面临更大的困难 /strong 。”Kristen Amanti说到,“如果没有针对特定类型癌症的筛查机制,那么在证明临床证据有效方面会很困难。如果你提前了解已有一个筛查机制,那你可能还要去证明你比这种筛查更好,或者能够提供某种经济优势。” /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(192, 0, 0) " 商业化进程加速 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 虽然在临床开展上面临着不少障碍,但是CTC富集和检测的商业前景仍然十分强劲。2018年,多家公司都在CTC捕获和检测技术的临床转化方面取得了重大进步。 br/ /p p   美国Epic Sciences公司的CTC技术在2018年取得了一系列积极进展。2018年6月,Epic Sciences公司及合作伙伴发布了一项多机构队列研究,验证了基于CTC的AR-V7检测方法的有效性。根据该公司的信息, strong 这项研究是首个证实液体活检能够预测治疗效果并显示对患者具有生存受益的研究之一 /strong 。此外,Epic Sciences在2018年初时曾获得5200万美元E轮融资,目前该公司正在将其技术用于研究血液中肿瘤细胞和人类免疫细胞的综合分析,进而用于免疫治疗药物的研发和伴随诊断中。2018年11月,该公司还与加拿大四家乳腺癌治疗中心合作进行了一项临床试验,以检测其技术是否能预测转移性乳腺癌患者的复发风险。 /p p   与此同时,美国液体活检公司Celsee Diagnostics在CTC富集工具商业化方面取得了进展。在与单细胞诊断公司IncellDx达成一项可行性研究合作后,Celsee Diagnostics在2018年1月份签订了一系列产品的 strong 联合商业化协议,包括基于CTC的乳腺癌、结直肠癌、前列腺癌和其他癌种的筛查产品 /strong 。 /p p   2018年5月,CellMax Life公司启动了一项美国临床试验,用于验证其基于CTC的结直肠癌筛查产品。该公司CMx平台目前只在亚洲销售,采用于一种“混合微流体芯片”,能够从10亿个正常细胞背景中分离出1~10个CTCs。CellMax Life还在2018年4月份与IncellDx达成合作,共同开发和和销售几种实体瘤的CTC检测产品,用于个性化治疗方案选择和监测。近日,CellMax Life还宣布,作为公司细胞疗法临床试验的一部分,公司已经与台湾Medigen Biotech公司达成合作。Medigen将结合Cellmax Life的CMx平台及其液体活检panel,用于患者的的治疗决策及疗效监测。 /p p   另一家计划进军CTC液体活检领域的公司是Precision for Medicine。2018年9月,Precision for Medicine收购了ApoCell公司及其ApoStream CTC富集技术。 strong 该技术可利用介电电荷差分离肿瘤细胞和正常细胞 /strong 。根据Precision for Medicine公司高级副总裁Darren Davis的说法,公司收购ApoCell主要在于其开发的一款基于免疫组织化学和免疫荧光成像的新型液体活检技术。 /p p   Vortex Biosciences也在推广基于CTC的VTX-1液体活检平台方面取得了进展。该公司在2018年3月份与BioView合作开发一种整合流程,以识别CTCs的临床生物标志物。2017年11月份,该公司和Stratec Consumables签订了一项供货协议,计划开发一款适用于Vortex平台的微流体芯片。该芯片最初由加州大学洛杉矶分校(UCLA)开发,新版芯片将帮助该平台适用于商业生产规模。此外,在2018年早些时候,Menarini Silicon Biosystems公司宣布已经将最近收购的技术整合到一款细胞型液体活检流程中,其中包含CellSearch CTC纯化工具。该公司表示,CellSearch strong 利用细胞外抗原表位和免疫磁珠,以一种自动化方法从血液样本中提取肿瘤细胞 /strong 。 /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(192, 0, 0) " 初创公司潜力巨大 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 位于美国密歇根州的初创公司Akadeum计划通过公司的微气泡平台进入液体活检市场。公司称微气泡平台可以识别和分离CTCs和其他分子分离。目前Akadeum的这款工具只限于研究使用,与微流控芯片不同的是,该平台使用的是低密度的玻璃板和空气泡,气泡表面带有特定抗体,能够与靶细胞结合,然后“浮到表面”。Akadeum公司CEO Brandon McNaughton表示,该公司计划在未来两到三年内在全美国推广产品甚至销往国外。 br/ /p p   来自威斯康星大学的 Capio BioSciences公司也开发了一种类似的技术,名为CapioCyte。该技术整合了细胞滚动和多价结合功能。Capio BioSciences创始人Seungpyo Hong解释道,CapioCyte与其他CTC捕获技术不同之处在于,该技术结合了仿生学和纳米技术。癌症筛查和早期诊断是一个极大的市场,但Hong指出,每个患者的CTCs所呈现的高度变异数量和表型表明,CTCs的预后价值将在未来得到进一步探索。 /p p   除此之外,美国堪萨斯大学还在2018年5月公布了一项关于 strong 微流体平台的研究 /strong , strong 该平台可以对包括多发性骨髓瘤在内的克隆性浆细胞疾病患者的循环浆细胞进行检测 /strong 。在堪萨斯大学大学化学与机械工程专业教授Stephen Soper主导下,研究团队在2016年创建了Biofuidica公司,进一步开发一款使用正弦微流控技术的诊断工具。 /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(192, 0, 0) " 学术成果不断涌现 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 商业进程之外,关于CTC的学术成果在去年同样不断涌现。例如,来自加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员便开发了一款 strong CTC富集系统 /strong 。研究团队认为,通过结合生物物理富集和激光捕获显微切割(LCM),该系统在一定程度上克服目前液体活检技的局限性。在本研究中,课题组通过溶解红细胞从前列腺癌血样中富集CTCs,使用一种特殊的微流体细胞分类方法分离白细胞和CTCs。为了提取单个CTC用于激光捕获显微切割,研究小组通过免固定染色选择肿瘤细胞,将细胞样本嵌入水凝胶基质中,使细胞固定。随后,研究小组然后使用一款短距离散焦UV激光提取包埋的细胞。 br/ /p p   此外,在去年4月份,来自加拿大多伦多大学的一个研究小组发布了一项关于 strong mRNA细胞计数法的检测方法 /strong ,将CTC分离和基因表达分析结合起来。研究人员使用两种磁性颗粒,选择性杂交肿瘤细胞中mRNA的不同区域,帮助分离细胞并评估每个细胞中RNA的含量。研究小组利用免疫荧光法以及mRNA方法或EpCAM捕获法检测到CTCs。研究人员发现mRNA细胞计数方法能够同时提供CTC数量和临床相关mRNA的缺失或存在的准确情况。但研究小组表示,他们还将需要在CTCs含量较少的早期癌症患者中测试这种方法。 /p p style=" text-align: center " strong span style=" color: rgb(192, 0, 0) " 结语 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 肿瘤液态活检的概念起源于CTC,相比ctDNA,发现较早却浮沉多年的CTC在几番打磨后逐渐发挥出自己的优势。借着二代测序技术的东风,ctDNA后来者居上占尽风头,但是CTC也完全没有落后。CTC分离和鉴定技术的发展使得相关研究再次成为肿瘤领域的焦点。如今,越来越多新的检测产品正在被使用,未来可能还会出现更多。随着更多数据的积累与临床证据的支持,液体活检的使用或将变得更加常规化。 br/ /p
  • 稀有细胞检测,不做无谓的牺牲
    p   有些细胞在血液和组织中的含量很少但却很重要,比如干细胞、循环内皮细胞、循环肿瘤细胞和残留病变细胞。准确检测和分析这些稀有细胞,是理解疾病进程和发育机制的关键。然而稀有细胞检测并不是一件容易的事,会受到样本质量等多种因素的影响。 /p p   流式细胞技术能对每个细胞进行多种定量分析,是在血液、骨髓等组织中检测稀有细胞的有力工具。稀有细胞检测往往需要大量样本才能采集到足够的数据,这个时候传统流式细胞仪也有些发怵,因为大样本意味着处理时间长,如果不想牺牲检测灵敏度,就不能贸然加快进样速率。 /p p   strong  声波聚焦技术,不做任何无谓的牺牲 /strong /p p   样本溶液注射到流式细胞仪的时候,细胞是随机分布在三维空间内的。让这些细胞逐个穿过激光束,对于准确采集数据非常重要。绝大多数流式细胞仪通过快速流动的鞘液实现这一点。鞘液带动细胞并将其限制在中心位置,进而建立单细胞流,这一过程称为水动力聚焦。 /p p   与传统水动力聚焦不同的是,声波聚焦技术利用超声波将细胞紧密聚集在样本流中间,汇聚成一条直线。这种超声波大于2 MHz,与医学成像中的超声波类似。声波聚焦流式细胞仪基本不受进样速率的影响,能使细胞强聚焦于激光检测点,与样本-鞘液的比率无关。 /p p strong   不牺牲通量和精度 /strong /p p   传统的水动力聚焦技术受到了不少限制。流速提高会增大样本流的宽度,使细胞的聚焦效果下降。细胞偏离激光中心越远,激发光强度变化就越大,CV值也越高。研究人员经常需要在分析通量和精度之间寻求平衡。 /p p   声波聚焦技术在很大程度上与进样流速无关,不论样本流与鞘液流的比例如何,都能使细胞紧密地聚集于激光检测焦点,避免分散。这样可以采集更多光子,在极高的样本通量下保证高精度分析。 /p p   声波聚焦流式细胞仪在高达1 mL/min的进样速率下也能维持精确聚焦,让研究人员能够获得更小的CV值,更好地鉴别弱阳性信号和背景,实现更小的差异和更好的信号分离。 /p p   不牺牲检测速度稀有细胞检测一般需要采集大量细胞,才能获得准确而可靠的结果。在这种情况下,传统流式细胞仪需要很长的处理时间。不过,声波聚焦流式细胞仪的样本运行速率非常快(可达1,000μL /min),每次运行可采集2000万个细胞。这么高的样本采集速率和样本量可以帮助人们快速准确地检测稀有细胞,不会影响数据的质量。 /p p   不牺牲珍贵样本样本制备对稀有细胞检测有很大的影响。举例来说,洗脱和裂解红细胞(RBC)会造成严重的细胞损失和损伤。声波聚焦流式细胞仪支持无洗脱、无裂解的流式实验方案,可以最大程度的保留珍贵样本,避免不必要的细胞损失,简化样本制备步骤。 /p p   研究人员可以通过有目的地稀释样本来取代洗脱和裂解步骤,快速而有效地分析浓度较低的样本,比如脑脊液(CSF)、干细胞以及细胞数量较少的稀释样本。对于小鼠血液、骨髓等难以采集的样本、细针抽吸样本或低细胞产量样本,研究人员可以直接染色和稀释,无需洗脱或红细胞裂解。 /p p   值得一提的是,声波聚焦流式细胞仪处理全血样本可省去样本制备,既没有样本损失,也不会影响数据质量。 /p p strong   选择流式细胞仪需要知道的事 /strong /p p   近三十年来,流式细胞仪已经成为科研和临床领域不可或缺的重要工具。不论你是不是第一次购买流式细胞仪,入手一个新平台都需要考虑很多因素。为了找到最适合自己的那一款,我们需要了解一些事: /p p   流式细胞仪主要由三个部分组成:液流系统、光学系统和电子系统。液流系统将颗粒或细胞送给激光束进行检测。光学系统负责照明并将光信号引导到适当的检测器。而电子系统将光信号转变为电脑可以处理的电信号。 /p p   检测参数同时检测多种细胞参数,是流式细胞仪的一大优势。我们在选择流式细胞仪时一定要明确自己对参数的需求。因为一次实验能检测多少参数,取决于流式细胞仪配备的激光器和检测器。比如Attune® NxT声波聚焦流式细胞仪采用模块化设计,能够配置多达4种激光和14色荧光检测,适用于多参数分析。 /p p   检测性能了解流式细胞仪的灵敏度、分辨率、动态范围、检测能力和检测速度,可以帮助我们缩小选择范围。购买流式细胞仪是一笔不小的投资,我们不仅需要认清目前的研究需求,还应全面考虑到未来几年的应用。 /p p   样本类型现在绝大多数流式细胞仪都能处理几微升到几百微升的样本。如果细胞非常稀少,我们就需加大样本量同时尽量避免细胞损失。在这种情况下,Attune® NxT声波聚焦流式细胞仪将是不错的选择。这种流式细胞仪特别适用于稀少细胞和珍贵样本的检测。 /p p   系统软件流式细胞仪用起来顺不顺手,在很大程度上取决于其系统软件。除了方便性以外,我们还需要了解软件是否能呈现我们所需的数据,以及可不可以定时更新升级。Attune的采集和分析软件很直观而且功能强大,适合各种经验水平的用户。 /p p   实验室空间每一个实验室的空间都是有限的,越来越紧凑正是流式细胞仪的发展趋势。Attune声波聚焦流式细胞仪就是这样一种小巧方便的台式设备。 /p p   除此之外,购买流式细胞仪之前我们还需要了解多方面的信息,比如仪器的自动化程度,厂家提供的技术支持和培训,仪器的兼容性和可拓展性等等。 br/ /p
  • 650万!《多色拉曼光谱微流控芯片高通量稀有细胞分选系统》国家重大科研仪器研制项目获批
    p   2017年8月17日,国家自然科学基金委员会发布2017年度国家自然科学基金申请项目评审结果的通告,其中国家重大科研仪器研制项目(自由申请)共计83项,总批准金额5.9亿元。 /p p   从详细名单得知,83个项目中有多项涉及类别的科学仪器,其中《多色拉曼光谱微流控芯片高通量稀有细胞分选系统》名列其中,项目负责人为吴一辉,依托单位为中国科学院长春光学精密机械与物理研究所,批准金额650万元。 /p p   更多详细名单请查看如下链接: /p p    a title=" " style=" color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " href=" http://www.instrument.com.cn/news/20170817/226928.shtml" target=" _blank" span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 2017自然科学基金国家重大科研仪器研制项目全名单公布 总投资5.9亿 /strong /span /a /p p & nbsp /p
  • 哈工深圳陈华英团队: 单细胞连续捕获, 弹性模量测量和可寻址分选打印
    研究背景细胞的机械特性对其生物学功能(如增殖、分化和凋亡)和形态状态(如迁移、附着和病理状态)至关重要。目前常用的细胞弹性模量测量技术包括原子力显微镜、微管吮吸、光镊和磁镊等。这些技术可以有效测量单个细胞的机械性质,但是通量低,限制了其实际应用。近年来,微流控芯片因其在小体积液体操控方面的独特优势,也被用于测量细胞弹性模量。现有的微流控芯片主要侧重于平台开发,虽然通量大幅提高,但很少将测量后的细胞进一步收集以实现后续分析。单细胞分析技术的发展要求能够准确地打印单个细胞。传统单细胞打印技术包括荧光激活细胞分选、有限稀释和手动细胞挑选,这些方法打印效率较低且难以实现自动化。近年来,各种微流控技术被开发用于高通量精确打印单个细胞,如喷墨打印、精确分配、双阀门筛选和移液管式单细胞分离等。这些技术可以根据目标细胞的荧光、形态等特征进行识别并打印,但是大多技术难以获得单细胞的机械信息。因此,本研究报道了一款基于 U 型阵列的微流控系统,集成了单细胞连续捕获,弹性测量和可寻址打印。该装置在研究细胞力学与其他生物学特性的关系方面具有强大的应用潜力。研究内容近日,哈尔滨工业大学(深圳)陈华英课题组在英国皇家化学会(RSC)期刊 Lab on a chip 上发表题为“Continuous trapping, elasticity measuring and deterministic printing of single cells using arrayed microfluidic traps” (《单细胞连续捕获、弹性模量测量和可寻址分选打印》)的研究论文,报道了一款创新的微流控芯片,实现了基于精确调节的压力对微球/细胞进行捕获和逐个打印,并将已知弹性模量的单细胞确定性地打印到孔板中(图 1)。该论文第一作者是哈工大(深圳)在读硕士研究生蔡逸珂和硕士毕业生余恩。陈华英副教授为通讯作者。微流控芯片(图 1A)由冲洗入口、样品入口、打印入口、压力维持口和两个平行的主通道组成,下游有打印出口。在所有入口通道中设计了宽度从 200μm 减小到 25μm 的微通道阵列,以过滤介质中较大的颗粒/细胞碎片。如图 1A 和 B 所示,在每个主通道的一侧有 16 个 U 型捕获陷阱,且吮吸通道的高度比分流通道的高度低 15 μm,以保证细胞停留在 U 型陷阱中并诱导其微小变形。▲图1 单细胞连续捕获、弹性测量和可寻址打印系统。(A)微流控芯片连接到压力泵,将单细胞精确分配到孔板中;(B)通过调节打印压力(Po)捕获(Pi-Po0)和释放(Pi-Po0)单个细胞的机制;(C)用于捕获和分离细胞的吮吸通道;(D)用于捕获和分离微球的分流通道。
  • 微流控技术助力中国科研人员成功实现单颗粒或细胞高效捕获
    p   记者从中国科学技术大学获悉,该校工程科学学院微纳米工程实验室在单颗粒或细胞捕获研究领域取得重要进展。他们提出使用实时飞秒激光双光子光刻技术,成功实现了单颗粒或细胞的捕获,该技术还可以实现可控多颗粒或细胞团簇的实时捕获,用于细胞通讯或颗粒之间的相互作用研究,有望极大地推动细胞捕获研究领域的发展。研究成果日前发表在微流控领域国际期刊《芯片实验室》上,并被选为封面,同时被《自然· 光子学》刊发。 /p p   在单细胞分析研究中,捕获目标细胞是实现单细胞分析的第一步。微流控芯片具有传统实验方法所不具备的一些优点,已经被广泛研究并应用于单细胞捕获领域中。其中,基于微流控的捕获阵列方法是实现细胞或者颗粒捕获分离最简单、最常用的方法。然而,目前的微捕获阵列面临着几个难题:首先是极低的捕获效率(低于10%);其次是无法实现针对目标结构尺寸和几何结构的实时可调控性 再者,同时捕获可控的颗粒团簇很难实现。 /p p   研究团队首先设计制造了一定高度的微流控芯片,向芯片中通入包含有目标微颗粒或细胞的光刻胶或水凝胶 通过图像实时观测筛选目标颗粒,然后快速控制液体停流;使用飞秒激光在目标颗粒或细胞周围加工微柱阵列;最后洗掉光刻胶或水凝胶,得到目标结构用于后续单细胞分析。单细胞或颗粒的捕获效率接近100%,且捕获目标的几何尺寸和形状实时可调,另外还可以实现可控数目的颗粒团簇的捕获。 /p p br/ /p
  • 华微发布海风系列I型_单细胞捕获孵育_定向进化_滴内PCR新品
    创新点:海风HW-SeaBreeze 芯片实验室。可实现单细胞柔性捕获、液流/液滴精准控制、滴内PCR、无标记筛选、器官芯片、仿生环境建立等操作。 关键技术: (1)研究对象——直径0.1-2000um生物颗粒:细胞/细菌/病毒/线虫; (2)单核液滴——高通量,绝对单细胞液滴制备, 可删除空液滴及多核液滴; (3)精准控温——恒温孵育:微流培养池/器官芯片 液滴数字PCR); (4)柔性操控——保持活性;液滴/液流,电场/气压/激光多场景控制 (5)多类筛选——支持 拉曼/影像/阻抗等无标记筛选,荧光标记筛选 (6)器官芯片——液滴/液流 ,液/气/氧/温/光/电/时:多维精准控制 (7)耗材定制——芯片内生物存活7日,按需定制, 价格远低进口 ■ 应用领域:细胞培养、药物开发、器官芯片、肿瘤细胞医疗、仿生微环境、文库、单细胞(菌)液滴包裹/操控/筛选、单亲克隆、滴内PCR、定向进化等。 海风系列I型_单细胞捕获孵育_定向进化_滴内PCR
  • Life Tech Attune声波聚焦细胞分析更快更准确地检测稀有细胞
    Trouble viewing this email? Read it online. Learn more about the Attune® Acoustic Focusing Cytometer. 更快更准确地检测稀有细胞-只有Attune® 声波聚焦细胞分析仪能够做到尊敬的客户, 在您样品中检测稀有细胞群,提升稀有细胞的检测下限,更加快速地得到实验结果,而且在您的实验台上就能进行流式细胞分析, Attune® 声波聚焦细胞分析仪可以做到. Attune® 声波聚焦细胞分析仪每次进样可以分析检测2千万个细胞, 流速可以调整,范围可从 25 µ L/min到1,000 µ L/min。 获得详细产品资料及报名参加演示培训班 下表比较了传统液体聚焦型流式细胞仪和Attune® 声波聚焦细胞分析仪的细胞分析采集速度, 样品为再生障碍性贫血病人的血液样品,各实验均在采集到1百万个粒细胞后停止收集数据。 仪器/样品分析速度 采集1百万个粒细胞所需时间 相对速度比 高流速下常规液体聚焦流式细胞分析仪 63 min 33 sec 1x 声波聚焦细胞分析仪200 µ L/min 13 min 20 sec 快4.8倍 声波聚焦细胞分析仪500 µ L/min 5 min 47 sec 快11.0倍 声波聚焦细胞分析仪1000 µ L/min 3 min 13 sec 快19.7倍
  • 微流控技术大有可为——第三届微流控细胞分析学术报告会成功召开
    仪器信息网讯 金秋九月,两年一度的行业盛会,第十九届分析测试学术报告会暨展览会(简称:BCEIA 2021)于2021年9月27-29日在北京中国国际展览中心(天竺新馆)召开。作为BCEIA的重要组成部分,9月28日,由中国分析测试协会和清华大学化学系联合举办的第三届微流控细胞分析学术报告会在中国国际展览中心天竺新馆召开,旨在为从事相关领域专家学者、科研人员等提供多学科交叉学术交流平台,展示微流控细胞分析领域的最新科研成果。会议当天参会人员逾百人,现场座无虚席。 开幕式现场清华大学化学系林金明教授致辞会议首日,共有10余位专家分别作精彩主题报告:报告人:东北大学 王建华教授 报告题目:《等离子体质谱(单)细胞分析研究》王建华教授介绍了基于等离子体质谱(ICP-MS)的单细胞分析研究。基于流式进样,用时间分辩ICP-MS分析单细胞中微量铬,发现细胞铬浓度与培养液中Cr(III)或Cr(VI)密切关联。三维微交叉液滴发生与ICP-MS联用,使多细胞事件概率小于0.005%,发现MCF-7细胞摄取金纳米粒子时存在明显异质性。利用平面和三维螺旋通道-惯性流辅助单细胞操控,实现高通量单细胞进样,结合ICP-MS分析单细胞对金属纳米粒子的摄取及分布。结合核酸适配体修饰的金纳米粒子与肿瘤细胞表达的biomarker蛋白的相互作用,可检测单个循环肿瘤细胞。报告人:复旦大学 刘宝红教授报告题目:《基于微流控芯片的单细胞检测》刘宝红教授介绍了一系列单细胞单分子成像技术。在生物体内,细胞生活在复杂的微环境中,细胞通过感知周围微环境的变化而调节自身行为和功能,从而影响细胞的形态、基因表达、蛋白质水平和定位,因此,需要发展微纳尺度的微环境模拟和测量方法。在这些变化过程中,蛋白质及其微环境中分泌的特异性生物分子的差异表达起到了关键的作用。该课题组发展了一系列单细胞单分子成像技术,实现了对细胞内外代谢小分子、miRNA、蛋白质等的成像与监测;研究了在微纳限域条件下细胞及其关键生物分子的高灵敏度测量。报告人:上海交通大学医学院分子研究院 张鹏研究员(代厦门大学 杨朝勇教授) 报告题目:《单细胞精准捕获与测序》张鹏教授介绍了该课题组在开发高通量单细胞捕获和分析研究的进展。张鹏教授介绍了利用分子凝胶,实现适体文库三维结构精确调控;利用焓变驱动筛选,提高适体环境适应性。应用机器辅助学习,提高筛选效率。提出协同捕获策略,构筑系列仿生多价和刺激影响界面,实现临床外周血样品CTC高效捕获,开发了无创肿瘤筛查试剂盒。报告人:西安交通大学 赵永席教授报告题目:《单细胞核酸扩增分析》赵永席教授介绍了该课题组在单细胞核酸扩增分析工作进展。核酸是携带遗传信息的重要物质,参与细胞生长、发育、增殖等基本过程。系统分析胞内的核酸序列、碱基修饰以及空间邻近关系等多层次特征,是理解细胞状态、探索生命过程的基础。此次报告将围绕细胞内核酸种类多、同源序列差异小、碱基修饰结构相似、空间邻近距离小所导致的分析检测难题,发展DNA编码扩增分析方法,实现核酸的精准识别与高灵敏定量分析,在单细胞水平解析生命过程与疾病进程中的核酸信息。报告人:中科院大连化学物理研究所 陆瑶研究员报告题目:《基于微流控芯片的单细胞分泌分析技术研究》陆瑶研究员介绍了该课题组在基于微流控芯片的单细胞分泌分析技术研究工作进展。在单细胞水平对这一小部分细胞分泌的生物分子信号实现高灵敏的检测,不仅有助于更清晰认识这些细胞的状态、个体之间的差异/联系等群体细胞研究方法无法分辨的信息,也将有助于发现细胞分泌的异常及其与疾病、药物反应的关系。该课题组利用条形码微流控芯片围绕单细胞分泌谱多组学分析、单细胞分泌谱动态分析、单细胞仿生微环境构建及单细胞操控等方面开展研究,加深了对细胞分泌、通讯异质性规律的认识,并有望为稀有细胞分析等应用提供技术支持。报告人:华中科技大学 刘笔锋教授报告题目:《微流控芯片高通量单细胞分析新方法》刘笔锋教授介绍了该课题组在微流控芯片高通量单细胞分析新方法开发工作进展。单细胞分析是当前分析化学研究的热点,对于揭示细胞异质性及其机制具有重要科学意义,在肿瘤、神经科学、发育生物学和精准医学等领域具有重大应用。刘笔锋重点介绍基于微流控芯片的单细胞分析新技术,聚焦如何实现高通量单细胞分析,包括单细胞水平的化学灌流刺激、药物评价和微生物筛选与分选等及其在生物医学与环境中的应用。报告人:深圳大学 张学记教授报告题目:《微流控芯片细胞多维度分析》张学记教授介绍3D打印技术快速制备可拆卸的微流控装置用于重构肿瘤微环境,该方法极大的便利了以无标记的方式对细胞进行分析和测定。报告人:清华大学 何彦教授 报告题目:《单个纳米颗粒细胞摄取的动态过程分析》何彦教授采用单颗粒暗场成像技术,系统地分析了等离子激元金纳米棒 (AuNR) 在不同条件下的内吞动力学,为细胞摄取纳米颗粒提供了完整的物理图像,为纳米毒性和精准纳米医学的进一步发展提供了重要参考。报告人:国家纳米科学中心 孙佳姝研究员报告题目:《基于微纳传感技术的肿瘤液体活检》孙佳姝研究员介绍了细胞外囊泡作为生物标志物在疾病诊断方面的应用。孙佳姝课题组开发了快速、灵敏、低成本微流控热泳适体传感器与机器学习算法相结合,提高了对乳腺癌和前列腺癌的精准检测,该方法为无创活检提供了新思路。报告人:武汉大学 赵兴中教授 报告题目:《从循环肿瘤细胞到有核红细胞》外周血中的稀有细胞对作为精准医疗的前提和基础的精准诊断,具有不可替代的作用。赵兴忠教授就循环肿瘤细胞和核红细胞这两种外周血稀有细胞的研究进展做了报告。报告人:哈尔滨工业大学 朱永刚教授 报告题目:《细胞代谢物的微流控检测》朱永刚教授介绍了用于检测细胞代谢物(如葡萄糖和乳酸)的微流控装置,并且介绍了基于液滴技术的单细胞蛋白质分析的发展现状。报告人:北京工商大学 林玲教授 报告题目:《3D微流控肿瘤微环境用于细胞代谢产物的研究》林玲教授介绍了基于微流控技术构建的3D细胞共培养模型以及3D肿瘤微环境模型,并介绍了这些模型在药物诱导以及代谢检测等方面的应用。报告人:岛津(中国)公司 韩美英博士 报告题目:《微流控芯片质谱联用细胞分析仪器的研制与应用》韩美英博士详尽介绍了岛津公司和清华大学林金明教授研发的CELLENT CM-MS微流控芯片质谱联用仪的功能、特点。CM-MS能够更准确地反映生物的真实状态,可为细胞代谢研究、药物代谢研究、疾病机理研究等领域提供强大有效的实验工具。随后,来自海南大学的周诗正分享了题目为《基于深度学习神经网络的图像激活微流控微藻细胞检测系统》的口头报告。至此,第三届微流控细胞分析学术报告会第一天日程圆满落幕,会议受到了众多学者嘉宾以及参会人员的一致热烈反响。期待明日精彩报告继续!会议现场座无虚席参会者踊跃提问本文涵盖了9月28日当天第三届微流控细胞分析学术报告会报告的部分精彩内容,而为期两天的报告会还将继续在会场二楼的E203会议室内进行,欢迎持续关注。
  • 集成"降噪"功能!德运康瑞自研创新高通量单细胞测序平台发布
    单细胞测序技术以前所未有的分辨率揭示了细胞组成和功能状态的异质性,已广泛应用在肿瘤、免疫、神经和发育生物学等研究领域。但现有的高通量单细胞测序平台还存在一定局限性,基于液滴捕获的方法依赖泊松分布实现细胞-微球配对,存在大量空液滴不可利用,导致试剂浪费和细胞损失;基于微孔捕获策略的平台利用细胞重力沉降随机捕获,存在有限稀释导致的微孔利用率低的问题,且存在微孔交叉污染的可能性;此外组织解离过程中细胞破裂产生游离的mRNA导致背景干扰,掩盖细胞之间真实的异质性。为克服上述问题,德运康瑞自主研发成功打造出一款创新性的高通量单细胞测序平台Well-Paired-Seq。该平台包括自动化单细胞测序文库构建系统DECODER, 芯片试剂盒、反转录与扩增试剂盒、文库构建试剂盒及相关生信分析工具。Well-Paired-Seq基于双孔嵌套式芯片,协同局部准静态流体力学和尺寸排阻原理,实现细胞和编码微球高效精准“配对”,利用准静态流体力学特性有效清洗背景,具有高效的细胞捕获率、细胞/微球配对效率以及游离RNA去除等优势,实现高通量细胞捕获、高灵敏基因检出和单细胞高保真分子解析。Well-Paired-Seq高通量单细胞测序解决方案平台技术优势(1)高通量,单张芯片即可完成1万个细胞捕获和单细胞测序分析;(2)高灵敏,基因检出数量优异,且有效检出稀有细胞类型;(3)高效率, 细胞捕获效率稳定在60%左右,提高样本细胞利用率;(4)高保真,在芯片上直接清洗游离RNA等杂质,降低背景干扰;(5)高质量,专利技术减少微孔交叉污染还原细胞真实分子表达信息。小结Well-Paired-Seq高通量单细胞测序技术基于双孔嵌套式芯片的创新设计,在细胞捕获、细胞/微球配对、游离mRNA去除等方面具有出色的效率,并显著地降低了细胞损失和背景噪音,以较低的双胞率实现了高通量单细胞测序分析,在细胞捕获效率和基因检出数量等多项指标表现稳定并领先行业。德运康瑞始终立足自主创新,此次重磅推出整合硬件设备、捕获芯片、配套试剂盒和生信工具的高通量单细胞测序整体解决方案,为单细胞测序技术推向精准医学应用奉献中国创新智慧。关于德运康瑞苏州德运康瑞生物科技有限公司(http://www.dynamic-biosystems.com/)是一家单细胞与空间多组学技术平台型企业,围绕单细胞富集与检测、单细胞测序、空间多组学技术,满足不同应用场景下的分析需求,公司聚焦挖掘在肿瘤精准医学、优生优育以及药物发现领域的巨大潜力,致力于推动精准医疗向单细胞与空间组学时代迈进,助力生命科学和临床医学,为人类健康事业贡献中国智慧。
  • 温和细胞分选,开启单细胞测序成功的第一步!
    随着单细胞测序技术的快速发展,科研工作者们可对每个独一无二的单细胞进行分析,认识到细胞间的异质性,深入了解如胚胎发育早期的分化特征、肿瘤微环境中的非均质性、罕见循环肿瘤细胞的转录组等等以往传统高通量测序方法难以攻克的领域。单细胞分析的应用已进入百花齐放的时代,涵括神经生物学、癌症、免疫学、微生物学、胚胎发育、临床诊断等多个领域。单细胞测序分析的第一步,即是单细胞样品的制备,同时确保其生物完整性不被破坏。高质量的样品制备影响着后续单细胞分析成功与否。高活性、无细胞碎片且均一的单细胞悬液可使测序结果在完整性、真实性、数据可重复性得到提升。最常见细胞分离的方法可用MACS磁珠或流式细胞仪进行目的细胞分选与富集。单细胞测序流程利用流式细胞分选法富集目的细胞群体缩小研究范围,对单细胞群体可进一步精细化解读。尤其在研究罕见细胞族群,单细胞测序前先以流式细胞分选富集稀有细胞,可大大增加实验数据真实性与可靠性。现今已有愈来愈多单细胞测序研究结合流式细胞分选,筛选目的细胞、过滤死细胞减少样本中無效细胞的比例,提高单细胞文库构建的成功率以及后续的数据质量,让单细胞测序更有深度与广度分析实验数据,推动进一步研究范畴。传统高压液滴分选仪分选单细胞传统液滴式流式细胞分选(Droplet cell sorter),将目的细胞利用适宜的荧光标记。经荧光染色或标记的单细胞悬液,被高压压入流动室内,在鞘液的包裹和推动下,细胞被排成单列,以一定速度从流动室喷口喷出。通过相应荧光检测及充电,获得目的细胞,实现单细胞分离。然而操作过程中,分选的细胞相继受到高压、充电带有电荷、减压的刺激,常导致分选的目的细胞在分类过程中的损伤和溶解,活细胞回收率不高;即使回收的活细胞也因分选过程受刺激影响细胞基因转录图谱表现,无法维持其生物完整性。传统高压液滴分选仪进行单细胞分选Adapted from Technologies for Single-Cell IsolationInt. J. Mol. Sci. 2015, 16美天旎MACSQuant® Tyto® 革命性的细胞分选仪专利的微芯片技术,精准地控制阀门开合以进行细胞分选,该仪器的特性在于整个分选过程在一次性使用的全封闭样本舱(cartridge) 中进行,且无需鞘液、避免了样本污染和残留风险。上样简单、自动进行分选设置,无需操作人员进行高强度与长时间的培训就能轻松操作。由于实际分选过程都在样本舱进行,不会损失珍贵的样本材料;阳性和阴性分选组份均可在无菌洁净操作台内轻松回收。细胞不会受到高压、电荷及减压刺激,不同于传统的液滴分选仪,这种温和的分选方法可最大保持细胞活性和功能,即使经过多次分选,细胞活性也不会受影响,充分表明这种阀门介导的分选机制具有温和性质。美天旎MACSQuant® Tyto® 细胞分选仪与样本舱功能示意图。A. 美天旎MACSQuant® Tyto® 细胞分选仪;B. 样本舱;C.独特微芯片技术的分选示意图。单细胞测序前,使用美天旎MACSQuant® Tyto® 细胞分选仪(MQ Tyto)进行目的细胞分选富集。分选过程不受到高压、电荷、减压与剪切力刺激,作用温和不影响细胞生物功能完整性,维持细胞基因转录图谱表现,提高细胞存活率与回收率。位于美国加州大学(University of California, Irvine- UCI)的Dr. Kai kessenbrock研究团队致力于研究机体正常组织内环境稳态和乳腺癌中的细胞通讯。他们在单细胞水平上系统性分析研究乳腺干细胞微环境(stem cell niche)中细胞通讯的机制和乳腺上皮組織内的异质性,进一步加深对早期肿瘤发生过程中系统性变化的理解;最终目的是开发用于早期检测的生物标记物以及改善乳腺癌的治疗策略。Dr. Kai kessenbrock团队在FVB小鼠取出小鼠乳腺组织,分别以美天旎MACSQuant® Tyto® 细胞分选仪(MQ Tyto)与传统液滴式流式细胞分选(Droplet cell sorter)分离乳腺上皮细胞(CD49f+/EpCAM+)后,标记建库并进行单细胞测序;比较两种不同的流式细胞方法分选后,所获得的测序数据真实性与可靠性,也进行分选后的细胞培养,观察细胞存活与功能。小鼠乳腺上皮细胞分离与单细胞建库 (Data kindly provided by Quy Nguyen, UCI)1. MQ Tyto可有效分选出不同乳腺上皮细胞亞型(Luminal 1, Luminal 2, Basal-like subtypes),基因转录图谱完整呈现。聚类分析与差异基因热图展示2. 经由MQ Tyto分选,每个单细胞可捕获更多的mRNA数量(UMI),获得更多可分析的基因数(Genes);显示MQ Tyto保留了细胞的完整性。质控图3. 传统液滴式流式(Droplet cell sorter)细胞分选后细胞应激基因表现明显上调。这主要是来自于细胞分选操作过程中所受到的外力刺激,而非原始组织环境细胞的真实表现。应激基因表现量展示4. 细胞分选后,持续培养七天乳腺上皮细胞并形成乳腺球(mammosphere formation)进行计数。结果显示MQ Tyto组形成更多的乳腺球,表示其MQ Tyto分选后的上皮细胞维持其功能性与高存活率。综上,利用MQ Tyto对目的细胞进行分离与富集,作用温和不影响细胞生物功能完整性,维持细胞基因转录图谱表现,提高细胞存活率与回收率,开启单细胞测序成功的第一步。
  • 新品发布!亲眼见证单克隆性——CloneSelect高通量单细胞分离系统
    众所周知,细胞株开发在单抗领域是一个至关重要的环节。现有的细胞株开发流程存在很多弊端,如单细胞分离效率低下、单细胞存活率低以及缺乏单克隆性证据等。近日,Molecular Devices推出了新品CloneSelect高通量单细胞分离系统c.sight及f.sight两款仪器,它们能提高单细胞分离的效率及活率,且增加单克隆性的可信度。系统采用一次性分离槽设计,省却清洗验证程序,降低交叉污染的风险。此外,系统具备除静电装置,保证高精度的接种,尤其是针对PCR孔板。CloneSelect高通量单细胞分离系统高效接种单个活细胞至微孔板后,用CloneSelect Imager细胞生长分析系统对孔板进行成像记录单个细胞及后续的细胞分离过程。结合单细胞接种前后的图像,以及单细胞在微孔内增殖最终形成细胞团的序列图像,可以为细胞株的单克隆性提供更高的可信度保证。CloneSelect高通量单细胞分离系统的高效率和高活率,可以在不增加工作量的前提下提升细胞筛选的通量,从而有助于发现更多更优质的细胞株或者稀有细胞。主要特点: • 单细胞分离、成像并接种至96或384孔板 • 克隆成活率提高至最多8倍 • 一次性无菌微流控分离槽确保细胞健康无污染 • 明场或荧光分离细胞 工作原理: 使用专有的喷墨式单向分离槽及微流控技术和智能图像分析技术将单个活细胞高效地接种至微孔板或PCR板,轻柔而高效地分离单个细胞。使用高分辨率的明场或荧光成像对细胞进行成像和分析,记录细胞分离过程的连续5张图像,用于增加单克隆性的可信度。应用领域:单细胞分离/分选,用于细胞株开发 单个B细胞技术,用于抗体发现 筛选稀有活细胞,如干细胞、基因编辑的细胞等 单细胞测序,尤其是转录组测序。 下载产品资料请联系美谷分子仪器
  • 单细胞分离的特点应用以及小技巧
    单细胞分离采用类似喷墨打印机以及一次性分配分离槽,温和高效地接种单细胞,使用明场高分辨率成像或可选荧光分选细胞,每个单细胞分离捕获 5张图像,单克隆性,提高工作效率,保持并增强细胞活率,且防止交叉污染。  采集单细胞分离的证据,在接种细胞时记录5张连续图像,以96或384孔板的形式提供直接的单克隆性图像证据,提高克隆形成率,与传统方法相比,在克隆形成率上可实现高达8倍的提升。  保持细胞健康和无菌,正如克隆生长实验所见,通过温和的分离维持细胞活性,并使用无菌的一次性单向分离槽防止交叉污染,简便、快速、可选择以及无损分离单细胞,简化遗传和克隆培养、分析中分离过程。快速高效接种单个活细胞至微孔板分离系统的主要功能为高效柔和地分离或分选活的单细胞。该系统通过微流控技术柔和地形成细胞液滴,同时利用白光和荧光成像实时分析细胞数量和荧光强度,将符合要求的单细胞液滴准确接种至96孔板。  主要特点  1.分离效率85%,单细胞活率75%;  2.记录分离前后的连续5张图像,用于支持细胞株的单克隆性;  3.采用一次性分离槽,省却系统的清洗验证,减小交叉污染的风险;  4.采用白光成像和荧光成像,可根据细胞直径、圆度以及荧光强度筛选出感兴趣的细胞;  5.内置除静电装置,消除微孔板静电,确保细胞液滴接种至微孔正中间,尤其是PCR板。  单细胞分离系统可代替传统的有限稀释法,高效地将单个活细胞接种至微孔板中。得益于分离系统的高效率和高活率,可以将每块微孔板中可获得的单克隆细胞团提高至多8块,从而在相同的工作量下可筛选更多的细胞克隆,从中发现更多更优质的细胞株。分离过程中记录的连续5张图像,可以与后续的孔板成像的图像证据互相补充,从而提高单克隆性的可信度。  应用范围:连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。  单细胞分离的小技巧  1. 缩短制备单细胞悬液的时间,以保留细胞活力  2. 考虑使用细胞筛来过滤出细胞团块或双细胞  3. 注意缓冲液的选择,包括分选和收集溶液  4. 如果您打算在分选后培养细胞,请使用对数生长期的细胞,并确定最佳培养条件  5. 在分选转染后的细胞时,通常在转染后72小时进行,以提高细胞群的生存能力  6. 如果采用荧光抗体来分离稀有细胞,请在染色前离心抗体,以便去除任何可能被误认为是靶细胞的荧光颗粒  7. 对于单细胞基因组学应用,在分选后别忘了离心平板,以确保细胞在孔的底部  8. 选择一种可靠的分析技术来评估分选细胞的数量和质量
  • 美谷分子发布DispenCell 单细胞分离系统新品
    DispenCell专为快速、简单、温和地分离单细胞而开发,可应用于细胞株开发、CRISPR编辑的细胞筛选、稀有细胞分离、单克隆抗体筛选和单细胞基因组学等多种单细胞分离场景。基于阻抗技术的分离方式可以更加温和的处理细胞样品,小于0.1psi的分离压力让自动分离也能拥有高细胞活率。DispenSoft软件可提供即时可追溯的克隆性证明图谱,搭配CloneSelect Imager FL高通量单克隆验证系统,在第0天即可准确检测到单细胞并验证单克隆性。DispenCell主机紧凑小巧,可放置在生物安全柜等无菌环境中,软件操作界面简单直观,易于学习和使用。1. 温和高效DispenCell可实现对细胞样品更加轻柔的处理,小于0.1psi的分离压力与手动移液相当,但效率更高(~5min/96孔板)。分离过程无激光照射,保证细胞的完整性,因此,细胞活性和生长得以保持。2. 克隆性证明DispenSoft单细胞分析软件可提供即时和可追溯的克隆性证明图谱,允许用户在细胞分配后立即检查克隆性。3. 基于阻抗的分离吸头DispenCell 配有一个检测细胞通过的感应吸头,随着每个细胞的通过将触发一个独特的信号并被软件记录。无菌一次性分离吸头可确保清洁的单细胞分离,且无交叉污染,经认证不含动物源产品和细胞毒性材料。4. 小巧、简单、易用DispenCell体积小巧,可放置在生物安全柜等无菌环境中工作。仪器和软件操作简单,易于设置,无需清洁和校准,样品制备简单,易于学习和快速上手使用。简化工作流程的组合解决方案单细胞分离和单克隆验证在很多应用中都至关重要!例如细胞株开发过程,不仅需要分离和处理大量的单细胞,还需要验证单克隆性并形成证据来用于最终申报。CloneSelect Imager FL 和 DispenCell 的组合,能够提供高效的过程以及可信的证据,在第 0 天即可自信地验证单克隆性。CloneSelect Imager FL 单克隆验证系统全新的 CloneSelect Imager FL,在标准白光成像基础上,增加了高对比度多通道荧光技术,可在第 0 天准确的检测到单细胞并验证单克隆性。通过比较汇合度分析来识别和验证基因编辑。• 数字化记录单细胞证据,以便提交给监管机构• 在多个时间点对细胞进行非侵入式成像,以监测克隆形成• 使用高分辨率白光成像进行筛选• 通过动态分析提供实时结果• 可进行自动化整合
  • 广域实时精密定位系统捕获芦山地震信号
    北京时间4月20日8点02分,四川省雅安市芦山县(北纬30.3度,东经103.0度)发生7.0级地震,震源深度13千米。   国家卫星定位系统工程技术研究中心——武汉大学卫星导航定位技术研究中心利用“广域实时精密定位系统”成功捕获芦山地震信号。图中显示的是四川天全GNSS观测站(SCTQ)在地震期间的水平运动曲线和水平运动速度曲线。该测站为“中国大陆构造环境监测网络”观测站,位于震中的西部,距震中约33公里,观测站建设在基岩上,地震造成的最大振幅为2-3cm。   “广域实时精密定位系统”是“十一五”国家863计划支持完成的重点科研成果,该系统以广域差分和精密单点定位技术为基础,集成先进GNSS实时数据处理、互联网和卫星通信等技术,可实现全国范围厘米级到分米级的实时精密定位服务。该项研究成果可广泛应用于精密农业、交通运输、空中交通管理、国土资源调查、物联网、精确位置服务等重要领域,使其向信息化、服务型结构转变,实现跨越式发展。
  • 安捷伦科技顺利交付首批中国本土生产的靶向捕获产品
    2021年9月9日,浙江杭州——安捷伦科技公司 (纽约证交所:A)今日,安捷伦于杭州生产基地成功交付首批国内生产的SureSelect靶向捕获探针产品。此次完成的生产交付,标志着近期落成的国内生产线,实现了与安捷伦全球标准一致的生产水平和质量保障。未来,国内生产线将生产供应高质量的SureSelect靶向捕获产品,更加快速地响应国内二代测序客户对靶向捕获产品的需求。SureSelect 靶向捕获探针试剂盒安捷伦科技副总裁兼基因组学事业部总经理Kevin Meldrum表示:“随着中国精准医疗的高速发展和二代测序的技术进步,中国成为安捷伦全球最重要的战略市场之一。此次安捷伦在国内建成和投产使用的SureSelect靶向捕获产品生产线,让我们未来可以更快速及时地响应国内客户的需求,践行了我们扎根中国、持续为中国用户提供最优质服务的承诺。在国内进行和扩大生产,也是安捷伦响应中国制造2025的政策号召,从而进一步助推国内精准医疗和科技创新的不断发展”。安捷伦科技大中华区诊断与基因组学事业部总经理郑晓玮表示:“2020年,安捷伦中国诊断与基因组学事业部(DGG)在总部的支持下,完成了国内业务的5年发展战略规划-DGG China 2025。将‘升级本土化建设和提升客户关爱与服务’作为5年规划中最为重要的一项。今日交付的国内生产靶向捕获产品,正是DGG China 2025战略实施的真实体现。国内生产线的成功使用,将为从事肿瘤测序、分子遗传检测、病原微生物检测和生命科学研究的广大用户,提供更加快速的产品交付周期,及时满足产品定制化需求,进一步提升客户服务的能力与客户体验的满意度”。安捷伦生物(杭州)有限公司总经理王小波,与安捷伦科技基因组学产品生产总监Bruce Jerpseth共同表示,在SureSelect靶向捕获产品国内生产线的建设与运营过程中,安捷伦中国与全球团队紧密协作,共同克服了全球疫情对生产线建设带来的巨大挑战,包括国外同事无法亲临现场与越洋沟通的时差等诸多困难。在项目组国内外成员的集体努力下,严格按照ISO 13485:2016质量标准体系,完成了生产线的规划、建设、调试、质检与生产,确保由国内生产线交付的产品,与全球的品质标准一致。安捷伦生物(杭州)有限公司外景全新SureSelect 靶向捕获产品生产线所在的安捷伦生物(杭州)有限公司,是安捷伦全球流式细胞系统和实时细胞分析系统的研发、制造和运营中心,也是安捷伦在中国的两个制造中心之一。随着SureSelect产品线的加入,安捷伦生物(杭州)有限公司的制造能力得到了进一步扩展,其制造产品将广泛运用于新药研发、免疫治疗、肿瘤标志物检测与开发、基因检测、疫苗研发、毒理学、安全药理学、质控和基础生命科学研究。未来,安捷伦还将对中国市场持续投资,进一步升级本土化建设和引入创新性解决方案;加强对国内合作的拓展与创新的支持;充分利用DGG上海与广州卓越客户体验中心进一步加强对客户的支持、服务与培训,进一步改善客户体验与提升服务效率。安捷伦将按照计划不断实施DGG China 2025的各项战略举措,继续践行“信托所托,成就所望”的品牌承诺,与国内市场和用户一起拓展业务合作与发展的机会。关于安捷伦科技安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者,致力于提供敏锐洞察与创新,帮助提高生活质量。我们的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。在 2020 财年,安捷伦的营业收入为 53.4 亿美元,全球员工数为 16400 人。如需了解安捷伦公司的详细信息,请访问安捷伦官网。关于安捷伦诊断与基因组学事业部(Diagnostic & Genomics Group, DGG)安捷伦诊断与基因组学事业部是生命科学与疾病诊断的市场领导者之一,致力于不断创新基因组学、病理诊断、抗体技术基因编辑和合成生物学等各种前沿科技,推动人类疾病和动植物学等生命科学领域的突破与发现,积极拓展在肿瘤、生殖健康与遗传、血液学疾病、传染性疾病等的临床诊断应用。
  • 循环肿瘤细胞(CTC)蛋白质表达分析系统
    p   早前,美国ProteinSimple公司推出全球第一款可以对循环肿瘤细胞、外泌体等微量样本进行蛋白质表达水平定量检测的Milo系统。一经推出,此产品立即获得《The Scientist》杂志年度创新产品第一名、生物通2016年度生命科学十大创新产品奖、中国仪器协会年度创新新产品奖等。它的发明人之一Kelly Gardner博士也获得MIT Technology Review 35岁以下创新人才奖。 /p p style=" text-align: center " img width=" 400" height=" 284" title=" 1.jpg" style=" width: 400px height: 284px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/b89d84ca-1b3f-49c0-b5b1-82a689442e01.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p   通过检测血液中的循环肿瘤细胞(CTC)及循环肿瘤DNA发展起来的液体活检,对于肿瘤病人无痛诊断及靶向治疗有非常重要的意义。各国科学家在CTC富集、DNA测序和DNA分析方面做了很多的工作,但是CTC蛋白质研究一直因为检测灵敏度问题停滞不前,影响CTC在肿瘤诊断及治疗中发挥更重要的作用。 /p p   美国ProteinSimple Milo系统的推出解决了这一问题。最近,加州大学伯克利分校和斯坦福大学医学院的研究人员利用Milo系统在《Nature Communications》上发表文章,证实在一次普通的抽血后(2-4 ml血液),可对血样中罕见的CTC进行蛋白质表达水平分析,以检测其中一组与癌症相关的蛋白质。 /p p   实验方案如下:科学家们从乳腺癌患者的血液中分离出循环肿瘤细胞,然后将循环肿瘤细胞接种到Milo芯片western blot细胞捕获孔中。微流体设备裂解细胞,让其内容物流出,之后进行电泳将蛋白质根据分子量大小进行分离。然后在凝胶中原位捕获蛋白,再进行抗体孵育杂交,最后通过荧光信号值进行定量,检测了癌症蛋白标志物的含量。 /p p style=" text-align: center " img title=" 2.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/1045381e-1f3a-40c1-a07f-82df916660d6.jpg" / /p p style=" text-align: center " (图片来自Nature Communications) /p p   这项研究检测的蛋白靶标有12个,包括已被用于癌症分型(如ER、HER2、EGFR)、循环肿瘤细胞鉴定(如EpCAM、panCK、CK8)、白细胞标记(如CD45)的蛋白和普遍表达于哺乳动物细胞的蛋白(GAPDH、β-tubulin、mTOR、ERK-1/2、eIF4E)。研究者计划将这一名单继续扩大,以便最终能够更精确地对癌细胞进行分类,选择针对的靶向治疗药物。 /p p style=" text-align: center " img title=" 3.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/60121d8a-3a5f-4b8b-9f0f-453af71e6bed.jpg" / /p p style=" text-align: center " (图片来自Nature Communications) /p p   这篇文章的通讯作者、加州大学伯克利分校的Amy Herr表示:“微流体设计是本研究的关键。我们能够将每个阶段所需的功能整合在一起。这样,我们才能很快、很快地开展每一步。如果慢一点,细胞中的蛋白质将弥散,变得无法检测。” /p
  • 安捷伦科技推出新一代测序产品,完善靶向序列捕获系统
    安捷伦科技推出新一代测序样品制备、靶向富集和自动化方案,完善靶向序列捕获系统 2010 年 11 月 3 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日发布新一代测序产品的新成员——安捷伦 SureSelect XT 靶向序列捕获系统,继续保持快速的新产品推出步伐。SureSelect XT 在成熟可靠的 SureSelect 靶向序列捕获系统的基础上,整合了测序文库制备系统和基因组 DNA 制备试剂。将该系统与安捷伦自动化产品搭配使用,即可畅享高性能靶向富集方案带来的超高效率和前所未有的便捷操作。 安捷伦SureSelect XT 靶向序列捕获系统 “安捷伦一直致力于帮助科学家简化样品制备流程,”安捷伦 SureSelect 平台业务经理 Fred P. Ernani 说道,“SureSelect XT 系统配备完全整合并经过验证的试剂,使工作流程效率达到一个新的水平。这套系统使研究人员有理由相信,他们的样品和资源必能产生高质量的数据。” 靶向富集使研究人员可以仅对目标基因组区域(而非整个基因组)进行测序,从而简化了工作流程。结合先进的新一代测序系统不断提升的性能,SureSelect XT 平台的多样本检测能力使基因学家可以在一次实验中相比以前探索更多样品的基因组。文库制备和靶向富集步骤一直是限制此类实验速度的瓶颈之一。为了实现高通量样品处理,安捷伦现已发布综合式工作站,用于SureSelect XT 文库制备和靶向富集工作流程的自动化。 “我们将安捷伦的自动化液体处理平台与 SureSelect XT 工作流程相结合,创造出了充分优化且成熟可靠的解决方案,从而使科学家能够平行处理多个操作步骤,最大程度地实现无人干预的自动化,”安捷伦全球自动化解决方案业务部营销经理 Todd P. Christian 说道,“这套系统的通量高于以往,每个工作站每周可处理 192 个样品,并可快速生成数据,显著提高实验室工作效率,其强大的性能有目共睹。” 安捷伦的自动化液体处理平台与 SureSelect XT 工作流程相结合 SureSelect XT 发布后,安捷伦 SureSelect 试剂盒的种类升至 32 种(第一种试剂盒于 2009 年 2 月发布)。本年内就有 17 篇文献引用了该系统,涉及多种遗传性疾病研究。与此同时,安捷伦“通过指定元素降低序列复杂性的方法”的专利申请获得美国专利局通过,专利号为 10/927809,从而进一步扩大了靶向富集知识产权的范围。该专利包括了一种制备指定核酸混合物的方法。在某些实例中,该方法使用与固相载体相连的寡核苷酸探针作为序列特异性亲和物,来分离指定核酸片段混合物并促使其扩增。多年以来,安捷伦不遗余力地在基因组学研究领域进行突破性的技术创新,获得该项专利授权实至名归。 安捷伦 SureSelectXT 靶向序列捕获系统提供目前市场上最全面的靶向富集产品以及针对多种不同测序方法和平台的最优化方案。SureSelect XT 产品实现在单管中富集从 200 Kb 到超过 50 Mb 的靶向序列。本方案除了可以支持Illumina单末端测序、双末端测序和索引方案外,还支持SOLiD系统上的片段文库格式、双末端测序和条形码方案。 SureSelect XT 还为客户提供高度灵活的定制化产品。用户使用安捷伦eArray xD桌面设计工具,可以轻松设计出在单管中捕获任意目标基因组的定制产品,从而提高研究效率。安捷伦还提供eArray在线设计工具,用户使用该工具可定制和安捷伦目录SureSelect试剂盒类似的产品,例如 SureSelect 人全外显子系列产品。 关于安捷伦科技公司 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18500 名员工在 100 多个国家为客户服务。2009 财政年度,安捷伦的业务净收入为 45 亿美元。要了解更多安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • 成果速览|基于微滤-单细胞弹射分选技术的肿瘤早筛研究入选IEEE MEMS 2023国际顶级会议
    第36届IEEE International MicroElectro Mechanical Systems Conference (IEEE MEMS 2023)将于1月15-19日在德国慕尼黑召开。IEEE MEMS是微纳系统领域最具影响的国际会议,从1987年以来至今已举办36届,长期以来以创新性高、中选率低著称,是微机电系统(MEMS)领域的顶尖会议。近日,由中科院长春光机所李备研究员团队与北京大学王玮教授团队合作,在MEMS上发表了题为"PICKING SINGLE CELLS FROM 10 ML SAMPLE BASED ON A MICROFILTRATION- LIFT COMBINATION PLATFORM"的文章,文章旨在基于微滤-LIFT组合平台从 10 mL 样品中分离单细胞。循环肿瘤细胞(CTC)是外周血中丰度极低的稀有细胞,并且显示出广泛的分子异质性。迄今为止,已经提出了许多CTC分离方法,如梯度离心法,过滤,微流控技术和标记免疫亲和技术,它们已实现了细胞捕获。然而,由于非特异性捕获的白细胞(WBC)引入的污染,CTC相关研究在CTC的定量表征阶段相对停滞。众所周知,仅仅计数CTC并不能反映肿瘤生物学的异质性。为了揭示CTC的异质性,迫切需要开发一种单个CTC分离方法,以更好地了解单个CTC在分子生物学水平中的作用。目前,单CTC拾取的工作原理包括手动显微操作,激光捕获显微切割(LCM),机械细胞选择器和激光诱导前向转移(LIFT)。不幸的是,广泛使用的手动显微拾取细胞的效率很低,这极大地影响了其实际应用。据报道,由于切割面积大,LCM和机械单元拾取器倾向于每次拾取收集多个细胞。相比之下,激光诱导前向转移(LIFT)技术可以在高分辨率下自动拾取单个细胞。因此,LIFT是从预处理样品中挑选单CTC的一种很有前途的方法。图1:微滤-激光诱导前向转移(微滤-LIFT)组合平台的示意图(a-d):(a)双层微孔阵列器件封装,(b-c)基于尺寸的细胞分离和富集,(d)单细胞的识别和拾取。L1 至 L4,镜片 HP,半波片 PBS,偏振分束器 M1到 M3,镜子 DM,二向色镜 EF,发射滤光片 MO1至MO2,显微镜物镜。上部(e-f)和下部(g-h)滤膜的照片和SEM图像在这项研究中,我们开发了一种新型的微滤-激光诱导前向转移(微滤-LIFT)组合平台,该平台允许从大体积样品(超过 10 mL)中高通量分离和自动拾取单个 CTC。微滤-LIFT平台将双层微孔阵列滤膜与荧光识别LIFT系统耦合。除了计数之外,该平台的初步性能表明,在重力下,微孔阵列过滤器可以快速分离和浓缩目标细胞,并使用LIFT技术在几秒钟内以单细胞分辨率精确拾取。微滤-LIFT平台为高效的单CTC拾取提供了独特的途径,为CTC的生物学特性分析奠定了基础。该研究中应用长光辰英核心产品—PRECI SCS单细胞分选仪PRECI SCS单细胞分选仪成果与讨论通过 COMSOL 仿真分析,以评估单细胞拾取过程中对细胞的损伤(图2a)。激光作用金属膜温度约为2700°C(图2b),而距离金属层0.6μm的液体在100 ns内低于27°C(图2b)。脉冲激光器的传输时间(6 ns)远小于100 ns。整个流体域的温度变化如图2c所示,表明LIFT操作对目标细胞是安全的。图 2:细胞分选过程的有限元分析。分拣过程中的温度场模型(a)和分拣过程中不同位置的温度场随时间变化(b)。激光烧蚀金属膜的最高温度小于2700°C,而距离金属层0.6 μm的液体在100 ns内保持在27°C以下。(c)整个流体域在不同时间的温度变化。超过0.6um的激光烧蚀金属膜的液体域温度低于27°C。下图显示了微滤-LIFT平台用于单细胞拾取的整个过程。过滤后,将接触的双层微孔阵列过滤器连接到LIFT系统的透明载玻片上(见图3(a)和(j))。通过荧光染色法鉴定靶细胞,如图3(b-c)、(f-g)和(k-l)所示。然后目标单细胞瞬间以350 nJ从微滤装置转移(参见图3(m))。图3(n)显示成功拾取目标细胞,并在载玻片正下方的细胞接收器上找到细胞(见图3(o-p))。接触的双层微孔阵列过滤器能够在30 s内使用LIFT系统拾取单个细胞,而单层微孔阵列过滤器只能在6分钟内移动细胞。图 3:用于单细胞拾取的微孔 LIFT平台的动态过程。(a-i)基于单层微孔阵列过滤器的单细胞拾取:目标细胞拾取失败,细胞在开始时没有移动(a-e),而细胞在一段时间后产生小位移(f-i),由于液层随着时间的推移而减少。(j-p)基于接触双层微孔阵列过滤器的单细胞拾取:由于上部微孔阵列可以切割捕获细胞的液体层,因此实现了目标细胞拾取。拾取的单个细胞由细胞接收器(o-p)接收。细胞用细胞追踪器绿色和Hoechst预染。
  • “三高”单细胞基因测序上游市场达5.19亿美元 各路玩家争相入场
    近年来,单细胞基因组学是十分热门的研究方向,以“三高”著名——高逼格、高门槛、高分文章。此外,对于下游测序公司来说,还存在高利润的优势。单细胞基因组学在免疫学、肿瘤学和神经学研究等各个科学领域发挥着关键作用。2013年,Nature杂志将年度技术授予了单细胞基因测序,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。单细胞基因组研究主要技术单细胞基因测序主要步骤为:单细胞的分离--DNA/RNA的提取和扩增(全基因组扩增和全转录组扩增)---测序以及后续的分析和应用。其中,单细胞的捕捉和分离是第一步,具有一定挑战性,目前主要包括流式细胞术、激光捕获显微切割技术和微流控技术。全基因组和全转录组扩增是单细胞测序的难点,近几年也取得了较大突破,目前扩增技术已逐渐成熟。全基因组扩增技术主要有:简并寡核苷酸引物PCR扩增(DOP-PCR),多重置换扩增(MDA);和基于多次退火和成环的扩增循环(MALBAC)几种技术。全转录组扩增技术,从PCR扩增(SMART-SEQ2等)到IVT扩增(CEL-SEQ2等),到现在的高保真DNA聚合酶扩增(SPLIT-SEQ等)。单细胞测序上游市场及主要供应商由于单细胞基因测序技术的应用前景被广泛看好,多家上游科技企业纷纷投入研发单细胞基因测序产品,2017年以后,更多商业化单细胞测序平台陆续走向市场。目前,国外品牌在单细胞基因组学技术中占主导地位,包括10x Genomics、伯乐、富鲁达、Illumina和凯杰、BD、安捷伦等。2020年,全球单细胞基因组学产品的销售额为5.19亿美元,预计到2025年将以高个位数的年复合增长率增长。富鲁达的 C1平台,是世界上第一个商业化的用于基因组学研究的自动化单细胞样本制备系统。通过采用创新的微流控专利技术,能够快速可靠地分离、处理、并对单细胞进行基因组分析。利用微流控芯片(IFC),可快速捕获并实现96或800个单细胞的核酸样本制备。一步法完成从捕获、裂解到逆转录和预扩增的过程,进行各类单细胞测序建库。该平台的商业化开始让更多人涉足单细胞测序领域,但该技术成本较高,通量相对较低,目前一些非RNA类单细胞测序仍会采用该技术。Fluidigm C1平台10X Genomics是一家年轻的公司,于2012年成立,2019年9月在美国纳斯达克上市,同年营业收入为2.46亿美元,一开始就专注于单细胞测序。2016年2月10X Genomics推出主要产品Chromium单细胞转录组测序平台,该平台利用微流控、油滴包裹和baecode标记等技术来实现高通量的细胞捕获技术,能够一次性分离、并标记500–10000个单细胞,从而获得每个细胞的3’端的转录组信息。10X Genomics 近两年也多次陷入专利纠纷的官司中,2020年后,其单细胞测序产品 Chromium开始全部使用Next GE微流控芯片。为了解决常规测序系统读长限制所带来的的无法满足组装、结构变异、多态性等问题,10X Genomics推出了GemCode平台,通过条形码信息将Illumina短序列再次连接,获得更有研究价值的长片段信息。10X Genomics还推出了升级版的Chromium系统,在GemCode的基础上整合单细胞测序。每次实验可分析1000至10000个细胞,增加了检测稀有细胞的灵敏度和准确度。10X Genomics Chromium单细胞测序产品BD Rhapsod单细胞捕获系统比10X晚一年推出,2018年3月进入中国市场。BD Rhapsod平台采用分子标签技术,为单细胞中每个转录本标记特异性分子标签,实现单细胞水平上基因表达谱的绝对定量。平台源于Cytoseq蜂窝板技术,采用20万+个微孔(远超过细胞数量,目的就是为了一孔一个细胞),因此可以叫做“微孔捕获”,效率更高。捕获后也是裂解细胞,再进行mRNA抓取。结合Rhapsody特有的单细胞分离技术,单次实验可制备100-10000个单细胞文库,用户可根据需求定制引物,将检测范围集中在目标基因,大幅降低后续测序成本。BD Rhapsody单细胞分析平台2017年1月,Illumina和伯乐在JP摩根健康大会上发布了Illumina® Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution。该综合解决方案是单细胞分析的第一个新一代测序(NGS)工作流程。解决方案包括ddSEQ™ Single-Cell Isolator和SureCell™ WTA 3’Library Prep Kit。伯乐最好的液滴分离技术,Droplet Digital™ 技术,可以对单细胞进行隔离和编制条形码,然后在Illumina的许多主要NGS仪器上进行下游测序。全面的工作流程解决方案包括使用BaseSpace® Informatics Suite,Illumina的云端基因组学计算环境进行初级和中级数据分析,使用流式细胞分析技术的领先公司FlowJo, LLC所开发的SeqGeq™ 进行高级数据分析和可视化处理。该测序系统可一次性检测8个样本,每个样本可以得到500~10000个细胞,研究单细胞在组织功能、病情进展和治疗反应方面的协同作用。与其他高通量捕获平台相比:Illumina® Bio-Rad® 捕获效率低,仅为3%,但测序成本相对较低。Illumina® Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution包括全新的ddSEQ Single-Cell Isolato(与NextSeq 500合照)宝生物(Takara Bio),是一家集试剂、耗材、仪器和服务为一体的生物技术公司,旗下的Clontech品牌拥有单细胞RNA-Seq文库构建的核心专利——SMART技术,由此发展处单细胞全基因组扩增技术、高通量单细胞捕获分选技术等。2015年2月份,宝生物收购的Wafergen公司开发出ICELL8 Single-Cell System单细胞分选平台,平台基于微流控芯片的技术,ICELL8利用WaferGen SmartChip TE平台筛选细胞,平台拥有5184个反应孔,可进行单细胞RNA测序样本的制备、扩增、表达谱建库测序、生物信息分析,快速得到样本间的基因表达差异。该平台具有通量高,周期快等特点,解决了传统单细胞扩增中通量低,价格贵的问题,为需进行大量细胞捕获筛选的研究提供了高效单细胞分选平台。该平台的细胞捕获效率为30%,成本相对较低。ICELL8 Single-Cell System2017年11月,英国Dolomite Bio公司推出Nadia单细胞自动制备仪,可平行运行1,2,4,8个样品, 每个样品18min内可生成6000个单细胞库;专为DropSeq方案设计;使用一次性试剂盒,防止污染;自动检测试剂盒状态,触摸屏控制,全自动运行。Nadia创新平台,可以使用自己的试剂,开发新的方法,可调节液滴大小、频率、温度、搅拌和时间等参数,一旦条件摸索成功,可通过Nadia单细胞自动制备仪在相同条件下平行运行2,4,8个样品。此前,该公司已推出单细胞RNA测序系统和μEncapsulator细胞包裹系统。Nadia单细胞自动制备仪Namocell是专注于单细胞分离分选技术的生物仪器公司,其自主研发的微流体单细胞分离平台,在单细胞基因组产前基因筛查方面已有所应用。 单细胞分选分离仪是集流式细胞术和微流控技术于一体的新一代细胞分离技术,仪器能够通过光电检测系统,识别标有荧光抗体的目的细胞,在激光照射的后的微流体通道中,设有电子开关,能够将目的细胞所在液体捕获,并且单个分离出来。Namocell单细胞分选分离仪除了细胞分选、建库和测序的仪器产品,凯杰、安捷伦等公司也在单细胞基因组研究领域有所布局,凯杰公司有单细胞全基因组扩增试剂盒,安捷伦公司除了之前的高通量寡核苷酸微阵列芯片和试剂盒等产品外,就在今天(1月26日)还宣布与一家叫新格元的分子诊断公司合作,共同开发针对单细胞测序的一站式解决方案,其中安捷伦将提供质量控制产品仪确保获得高质量测序文库,同时可改进样品处理和文库制备流程。此外,还有众多初创公司瞄准单细胞基因组学市场,以下为来源于某网站的不完全统计名单:国内也有科研团队正在从事相关领域的研究。如2020年12月,厦门大学杨朝勇教授团队研发的Digital-WGS样品前处理平抬,可基于数字微流控的自动化处理功能来简化高性能单细胞的WGS。该平台集成了并行纳升体积多重置换扩增(MDA)的所有主要步骤,包括从单细胞分离到全基因组扩增(WGA)的自动处理。通过在DMF芯片上结合流体动力学和表面润湿性,无论细胞类型和输入如何,都可以通过液滴操作自动有效地(100%)分离单个细胞。Digital-WGS允许在所有步骤中对液滴进行可寻址的控制,以大大提高裂解效率和反应的均匀性。可寻址和非接触式工作流程减少了与污染物或内源性背景的竞争,从而提高了基因组模板的有效浓度,为执行单细胞测序提供了一种有效的途径,对于单细胞基因组测序有广阔的应用前景。小结总体来讲,单细胞基因组学市场的快速发展,主要得益于政府及科研单位的重视和资金投入、测序技术成本的降低以及RNA测序技术的进步。此外还有多组学分析的专门技术,涉及利用各种“组学”学科,如基因组学、蛋白质组学和转录组学来收集和分析复杂、大量的生物数据。虽前景大好,单细胞基因组学市场目前仍面临诸多挑战,如相较于群体细胞测序,单细胞样品的分离、获取难度会大幅度增加,由于管理大量测序数据输出而导致的潜在数据分析错误,相关企业卷入了各种涉及知识产权、并购和其他商业交易的诉讼案件,以及新冠疫情导致2020年初产品销售中断等可能存在的持续影响。目前,单细胞基因测序更多应用还处于基础科研阶段,预计到2025年,单细胞基因组学将在整个科学技术市场占有重要地位。
  • 宸安生物与欧易/鹿明生物达成战略合作,推进质谱流式细胞技术发展与应用
    7月29日,上海鹿明生物科技有限公司(简称“鹿明生物”)与上海宸安生物科技有限公司(简称“宸安生物”)在宸安生物上海总部正式完成战略合作签约仪式。此次战略合作致力于推进以质谱流式细胞技术为核心的单细胞蛋白质组学科研技术服务及临床诊断平台布局,运用优势系统加速临床诊断研究及创新药物研究,本次鹿明生物与宸安生物合作也将进一步联合助力临床专家和创新药企研发。图 | 鹿明生物与宸安生物签约仪式签约伊始,鹿明生物总经理舒烈波博士及宸安生物创始人&CEO王宇翀博士就目前转化医学、临床诊断以及单细胞领域的发展做了深入的探讨,期望通过单细胞技术的力量解决复杂生物学问题,助力各种用户在科学研究、制药/生物技术、临床诊断上取得突破性的成果。舒烈波博士表示:“我们希望通过相互合作,用自己的品牌,用国产的品牌,为中国生命科学提供服务。”同时王宇翀博士也表示:“独行者步疾,携行者路远。通过互相的支持和合作,将自身的产品和服务不断提升,迈上新台阶。”图 | 签约现场深入探讨现场掠影近几年单细胞技术飞速发展,将生物学的科学认知从宏观层面提升到“单细胞”维度,为转化研究、治疗诊断带来革命性的突破。质谱流式细胞技术(Mass Cytometry)结合了传统流式技术高效的单细胞研究能力和飞行时间质谱的全谱高分辨率优势,采用金属标记抗体与待测抗原结合,实现了单细胞水平的高通量分析,能够同时获得单个细胞的多种参数,识别不同靶蛋白,成为新一代高通量单细胞蛋白质组研究利器。与单细胞转录组测序相比,质谱流式技术能够直接获得蛋白水平的信息,捕获更丰富的生物信息。质谱流式能够更灵活、更准确、更快速地对单细胞多组学信息进行分析,目前已应用于免疫分型、稀有亚群鉴定、生物标志物发现、患者分层、疗效预测、疾病进展检测、T细胞抗原筛选和疫苗研发等方向,所涉及的生命科学领域包括肿瘤免疫、感染免疫、自身免疫、神经免疫、免疫衰老、血液系统疾病和新生抗原等。图 | 签约后,舒博与王博开箱仪式助力质谱流式单细胞蛋白质组学鹿明生物继2022年4月推出基于布鲁克tims TOF Pro2 4D蛋白质组质谱平台的单细胞蛋白质组后,再度推出基于质谱流式平台的新一代高通量单细胞蛋白质组技术服务。鹿明生物与宸安生物达成战略合作,引进Starion星瀚质谱流式系统,具有高通量高分辨率超高速的特点,可实现在单细胞分辨率下同时对数十种目标蛋白的深度分析。由此进一步丰富欧易集团单细胞多组学技术服务产品线,实现了单细胞转录组、单细胞蛋白质组、质谱流式细胞技术,以及空间多组学等全方位检测分析,为科研工作者提供全面深入的科研技术服务。图 | 鹿明生物与宸安生物签约仪式本次签约仪式现场实时报道,观看签约现场更多精彩及开箱全程~宸安生物是一家领先的单细胞精准诊断科技公司,专注于自主研发质谱流式技术平台,通过高通量单细胞蛋白组学与人工智能算法的结合,深度解析免疫系统个体化差异和动态变化,为复杂疾病的生物学机制解析、疾病的精准分型、伴随诊断和创新治疗提供科研和临床级的产品和服务。上海鹿明生物科技有限公司是欧易生物旗下从事蛋白质组及代谢组质谱检测业务的专业质谱组学服务公司。以“鹿明质谱”服务品牌,携手母公司,实现了中心法则上、中、下游多层组学的串联,从基因组、转录组、表观组、微生物组,到蛋白质组、代谢组,为客户提供全面的创新多组学技术服务。经过多年发展,鹿明生物建立起了单细胞蛋白质组学、4D-DIA/LFQ/PRM、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白质组学技术平台,空间代谢组学、全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组、精准靶向等代谢组学技术平台,以及相应的大数据整合分析平台。通过持续的设备引进、技术开发、流程优化、人才汇聚、管理提升,建立起了成熟的质量标准、严格的质控体系以及科学的服务流程,广泛服务生命科学基础研究、疾病标志物发掘、疾病分型诊断、精准用药、药代药动、药物表征等多个领域。
  • 罗氏NimbleGen定制捕获芯片用于白血病亚型分子标记发现
    许多白血病的致病机制尚不清楚,其中慢性中性粒细胞白血病(Chronic Neutrophilic leukemia)及非典型慢性髓性白血病(BCR-ABL1-negative atypical Chronic Myeloid Leukemia)的诊断通常仅仅基于粒细胞的恶性增殖,以不含有其他白血病的基因标记作为诊断标准,而缺乏对其本身驱动基因的认识。 近期在新英格兰杂志上发表的一篇文章1对这类白血病的分子机制进行的深入研究。作者对27例慢性中性粒细胞白血病以及非典型CML骨髓或血液样本进行了部分基因定向高深度测序,分析基因突变的情况,发现一个基因CSF3R的突变在这个类群病人中的尤其常见。而CSF3R基因的功能正是细胞生长因子的受体,可以刺激中性粒细胞分化和增殖,这与这类病人的临床表型一致。 同时对病人分离的肿瘤细胞进行tyrosine kinase&ndash specific small interfering RNAs 或 small-molecule kinase inhibitors筛选实验。对于突变进行体外细胞转化实验验证,并用原始细胞克隆进行药敏试验。这些实验验证了这一基因的突变改变下游信号通路,也可造成细胞的增殖。药敏试验也证实了该基因的多种突变可对不同的下游通路中的抑制剂敏感,尤其一个病人在接受相应的抑制剂治疗后临床症状得到改善。作者认为,CSF3R突变在CNL及atypical CML的常见,而在其他白血病亚型中相对罕见,可用于慢性中性粒细胞白血病及非典型慢性髓性白血病白血病分型的重要分子诊断参考。 在CSF3R基因突变的发现过程中,主要利用NimbleGen的定制型序列捕获芯片,对1683个基因的外显子序列进行富集后,再进行二代测序仪进行深度测序。突变分析结果中,这一病人群体中的59%携带CSF3R突变,可活化这一受体,突变主要分布在CSF3R的两个独立区域内,分别导致CSF3R下游的SRC family-TNK2或者JAK Kinase的活化。 图:显示不同CSF3R基因突变对于细胞通路的影响。1 随着生物技术的发展,将为越来越多疾病的致病机制探索提供更加有效地手段,其中之一是利用高深度的定向测序方法寻找疾病相关基因。通过NimbleGen序列捕获芯片,可对人类全外显子组序列,或者所感兴趣的部分基因进行高效富集,衔接二代测序,可以更加经济有效地进行研究工作,同时也减少的数据分析的压力,这方法已经为国内外越来越多的研究人员所采用。 1.Oncogenic CSF3R mutations in chronic neutrophilic leukemia and atypical CML. Maxson JE, Gotlib J, Pollyea DA, Fleischman AG, Agarwal A, Eide CA, Bottomly D, Wilmot B, McWeeney SK, Tognon CE, Pond JB, Collins RH, Goueli B, Oh ST,Deininger MW, Chang BH, Loriaux MM, Druker BJ, Tyner JW.N Engl J Med. 2013 May 9 368(19):1781-90. doi: 10.1056/NEJMoa1214514.
  • 携手共进!墨卓生物 X 因美纳联名举办单细胞测序产业化论坛
    10月16日,墨卓生物与因美纳联名举办微流控单细胞产业化论坛,推动行业向多组学、高通量、高可及性迈进。论坛报告横跨科学研究、药物研发、临床诊疗三大领域,有助于推动单细胞测序技术在重大疾病中的研究和转化应用。这是因美纳首次与中国液滴微流控单细胞测序企业联名举办线下论坛,也是客户期待已久的墨卓生物MobiNova单细胞测序建库系统首次公开亮相,为产品发布进行预热。10月16日,为了促进高通量单细胞测序技术在重大疾病研究、药物开发、临床诊断等领域的应用,由墨卓生物与因美纳联名举办的“第一届微流控技术创新与应用高峰论坛“之“单细胞测序产业化论坛”在乌镇皇冠假日酒店举行。报告嘉宾和参会人员来自清华大学、华中科技大学、四川大学、南京大学等双一流高校,复旦大学附属中山医院、上海瑞金医院等顶级临床机构,因美纳、HiFiBio、墨卓生物等行业领军企业。“单细胞测序产业化论坛”现场论坛中,墨卓的MobiNova单细胞测序建库系统首次公开亮相,以出色稳定的性能表现,端到端、多组学的功能覆盖,赢得与会嘉宾的一致好评。目前MobiNova已支持早期用户发表了多篇高分学术期刊的学术论文,产品正在开展内测,明年年初将正式发布。本次论坛也是由墨卓生物与因美纳首次联手举办,深入探讨单细胞测序与多组学技术的最新成果和产业化的进展。因美纳是全球基因测序和芯片技术的领导者,并长期关注支持单细胞测序领域,墨卓拥有其中非常优秀的解决方案。本次论坛是双方合作的良好起点。未来,双方也将进一步就长期的深度交流与合作展开对话,期待实现单细胞多组学和二代测序技术的创新整合。重磅嘉宾莅临现场!解答单细胞测序技术应用场景因美纳大中华区资深测序专家余菽亮带来了“单细胞多组学分析拓展生物学多维度研究”的报告,为我们介绍了因美纳的NextSeq 2000,DRAGEN等分析系统在单细胞测序领域的解决方案与应用实例。华中科技大学李一伟教授进行了“力学挤压调控肿瘤单细胞异质性的研究”分享,从独特的角度研究了非小细胞肺癌受力学调控的皮质间充质转化;其中,单细胞RNA转录组建库测序工作由墨卓MobiNova完成。高诚生物总监沈冰清博士进行了“微流控在单细胞抗体发现中的应用”报告,分享了利用微流控进行高通量抗体筛选,液滴内完成抗体亲和力与生物学性能测试的经典应用。因美纳大中华区资深测序专家余菽亮作精彩报告华中科技大学李一伟教授作精彩报告高诚生物总监沈冰清博士作精彩报告单细胞测序技术发展之路:机遇与挑战并存!随后举行的圆桌讨论环节,贝克曼库尔特大中华区前总经理吴应光博士、高诚生物总监沈冰清博士、墨卓生物COO刘寒博士就“单细胞测序的发展与应用“进行精彩对话。“单细胞测序发展与应用”圆桌讨论环节吴应光:应用前景广阔,单细胞测序潜力巨大在现阶段生命科学工具的发展中,细胞已经成为基础研究、临床研究以及生物制药等领域非常重要的载体,单细胞技术作为最小颗粒度的新兴技术,未来可期。从商业转化的角度来讲,关键在于打破technology obsession的思维惯性,真正接地气的关注和解决用户的痛点,而非满足开发者对于技术的执着追求。 贝克曼库尔特中华区前总经理 吴应光博士沈冰清:新技术新平台,助力药物快速发现现有抗体筛选技术从小鼠免疫开始,时间长、流程复杂,免疫多样性丢失达到80-90%,在面对新冠等重大的公共卫生危机时捉襟见肘。基于微流控的通量和单细胞技术,HiFiBio的单细胞抗体药物筛选技术可以非常快速的从病人血清中筛选出亲和力高、生物性能好的稀有抗体,是解决公共卫生危机很好的手段。高诚生物总监 沈冰清博士领创单细胞测序全新时代,MobiNova产品预热最后,墨卓生物COO刘寒博士重点介绍了“MobiNova 高通量单细胞测序解决方案”,为产品的上市进行了预热。MobiNova解决方案由MobiNova-100 单细胞测序仪、MobiCube 转录组试剂盒、MobiVision 生信分析软件组成,拥有通量高、速度快、体积小、多胞率低(<5%)、细胞捕获率高(>60%)、可实现多样本同时检测等特点,是全球技术领先的、高质量、高性价比的单细胞测序解决方案,将在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用。 墨卓生物COO 刘寒博士介绍MobiNova 高通量单细胞测序解决方案MobiNova单细胞测序平台即将开启内测,预计明年年初上市,将全面助力基因测序进入单细胞时代和走进千家 万户,欢迎关注公众号获取内测名额。
  • 安捷伦科技将华大基因(BGI)指定为中国首家新一代测序靶向序列捕获系统的认证服务
    安捷伦科技将华大基因(BGI)指定为中国首家新一代测序靶向序列捕获系统的认证服务提供商 2011 年4 月4 日,北京 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布知名的基因组学研究中心深圳华大基因(BGI)正式成为新一代测序技术安捷伦 SureSelect XT 靶向序列捕获系统的认证服务提供商(CSP)。安捷伦CSP 计划是一项针对全球服务提供商的合作计划,旨在为其客户提供更高质量的数据和服务。 位于深圳的BGI是世界上最大的基因组学研究机构,也是中国第一家SureSelect XT 的认证服务提供商。该机构已通过了所有SureSelect XT 靶向序列捕获操作方案的认证,其中包括人类全外显子捕获、SureSelect 索引捕获、DNA 捕获、RNA 捕获、激酶组RNA捕获和定制捕获。 &ldquo 我们非常高兴能够成为安捷伦的认证服务提供商,&rdquo BGI 的基因组测序运营总监李京湘说道,&ldquo 安捷伦SureSelect XT 靶向序列捕获系统是性能卓越的国际著名产品,借助此系统我们能够为客户提供最好的外显子靶向测序服务。&rdquo &ldquo 我们非常高兴地看到,这座顶尖的测序中心正在将SureSelect XT 靶向序列捕获技术的优势推广到极其广泛的基因组学实验中。&rdquo 安捷伦基因组学SureSelect 平台市场总监Fred P. Ernani 博士说道。 自2009 年该平台发布以来,安捷伦至今已推出35 种SureSelect 靶向序列捕获试剂盒。包括涉及各种遗传性疾病研究和发现的论文在内,已有超过45 篇同行评审的相关论文发表。 SureSelect XT 简化了靶向序列捕获流程,研究人员可以仅针对目标基因组区域(而非整个基因组)进行测序。结合领先的新一代测序系统不断增加的样品容量,SureSelect XT 平台的多重检测支持功能使科学家们可以在每次实验中分析更多样品的基因组,这在过去是难以实现的。迄今为止,文库制备和靶向序列捕获一直是此类实验的一个瓶颈。为了实现高通量的样品处理,安捷伦还提供了集成式工作站,用于自动化完成SureSelect XT文库制备和靶向序列捕获工作流程。 SureSelect XT 还能实现最大程度的定制化。用户使用安捷伦 eArray xD 桌面设计工具可轻松设计靶向任意目标基因组(均在单管内进行)的定制产品,从而有效提高研究效率。安捷伦还提供 eArray 在线设计工具,用户使用该工具可对预定义的 SureSelect XT 试剂盒,例如SureSelect XT 小鼠全外显子系列产品进行自行定制。 《科学》杂志12 月17 日刊登的2010 年十大科学突破中,其中两项突破&ldquo Reading the Neandertal Genome&rdquo (解读尼安德特人基因组)和&ldquo Homing In on Errant Genes&rdquo (外显子组测序/罕见疾病基因)均采用了SureSelect 靶向序列捕获系统。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的 18500名员工为 100多个国家的客户提供服务。在2010 财政年度,安捷伦的业务净收入为54 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。
  • 安捷伦科技新一代测序靶向序列捕获系统在两年内已被 100 篇学术论文引用
    安捷伦科技新一代测序靶向序列捕获系统 在两年内已被100 篇学术论文引用 2011 年8 月1 日,安捷伦科技公司(纽约证交所:A)宣布了用于新一代测序的SureSelect 靶向序列捕获系统自2009 年初面世后已被100 篇发表的学术论文引用,成为一个重要的里程碑。 第100 篇论文发表于2011 年7 月的《自然遗传学(电子版)》,作者是加拿大蒙特利尔大学卓越神经科学研究中心的Simon J. Girard 等人。研究人员利用SureSelect 全外显子试剂盒分析精神分裂症患者和他们健康的父母,从而确认突变。 Girard 说到:&ldquo 在高通量测序和外显子捕获时代以前,进行如此大规模的分析是根本不可能的。正是凭借SureSelect 试剂盒,我们能够捕获14 名精神分裂症患者的外显子并确认了15 个新生(de novo)突变。这些突变可视为是开创精神分裂症遗传学领域新纪元的重要标志。&rdquo 安捷伦应用与化学研发部主管Emily Leproust 表示:&ldquo 我们很高兴SureSelect 能迅速被遗传学领域所接受。我们推出首款商用液相靶向序列捕获产品才两年,SureSelect 就因其强大功能和高度灵活性成为市场上被论文引用次数最多的靶向序列捕获工具。我们非常乐于知道研究人员如何使用SureSelect 应对巨大难题。&rdquo 研究人员通过SureSelect 靶向序列捕获系统已经确认了和50 多种孟德尔疾病、10 种不同癌症类型以及其他复杂疾病比如精神分裂症和老年痴呆症相关的突变。这些研究所取得的突破性进展发表在影响力很大的期刊上,文中表明使用SureSelec 进行靶向重测序对于确认不同疾病相关的变异具有重要研究意义。 SureSelect 平台提供最全面的产品目录和定制捕获试剂盒,包括人、小鼠和其他模型生物的外显子试剂盒,灵活定制的DNA 或RNA 靶向序列捕获溶液,均可用于所有主要的新一代测序平台。此外,安捷伦还提供文库定量qPCR 试剂盒及其Bioanalyzer 系列产品进行新一代测序文库质量控制。安捷伦Bravo 液体处理系统实现了新一代测序工作流程自动化。 关于安捷伦SureSelect 安捷伦SureSelect 靶向序列捕获系统是一种溶液型杂交捕获技术,由安捷伦与麻省理工学院-哈佛大学博德研究所共同开发,研究成果随后刊登在《自然生物技术》上。该技术使研究人员能够将测序范围缩小到感兴趣的基因组区域,从而简化新一代测序。120-mer RNA 寡核苷酸能够可靠地捕获更多大小变异,包括SNP、CNV 和Indel,具有无与伦比的等位基因平衡。SureSelect XT 提供完整的靶向序列捕获工作流程,包括SureSelect 靶向序列捕获试剂盒、gDNA 提取试剂盒和文库构建试剂盒。还提供用于各个研究阶段的自动化友好的试剂。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的18500 名员工为100 多个国家的客户提供服务。在2010 财政年度,安捷伦的业务净收入为54 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。
  • 珀金埃尔默携手Honeycomb Biotechnologies推出用于单细胞分析的HIVE scRNAseq解决方案
    日前,珀金埃尔默和Honeycomb Biotechnologies联合推出首个用于单细胞分离和分析的商业解决方案HIVETM scRNAseq。该解决方案利用便携式手持设备对多种类型的细胞(包括肝细胞、神经元、粒细胞以及肾单位等脆性和不稳定的细胞)进行捕获、存储以及RNA-Seq文库制备。HIVE解决方案无需专门的仪器即可实施,并为实验室进行基础研究、转化研究、临床和临床前研究提供了更广阔的平台。HIVE scRNAseq解决方案个体细胞水平上的分辨率正在推动精准健康的发展。HIVE解决方案可以将样本采集和保存集成到一次性设备中,从而实现从多个地点收集样本,并且能够在中心实验室完成对样本的处理以及在存储和运输过程中保持样本的完整性。这可以极大地提高工作流程效率、确保样本处理的一致性,对于多中心研究而言尤其重要。Honeycomb Biotechnologies的首席执行官Jim Flanigon博士说:“我们很高兴与珀金埃尔默合作,共同推出首个HIVE应用方案—单细胞RNA-Seq。HIVE scRNAseq解决方案将样本存储集成到单细胞工作流程中,将样本收集时间、地点与样本分析处理分开。”另外他还表示,“我们相信该方案能够为下一代单细胞分析技术赋能,同时极大地减少变异性和批次效应,这对于多站点研究尤为重要,例如分布式临床试验、学术合作和为远程客户提供服务的供应商。”珀金埃尔默高级副总裁兼首席创新官Karen Madden说:“在进一步扩展在细胞分析和应用基因组学方面的核心能力的过程中,我们很高兴能够与像Honeycomb Biotechnologies这样正在对单细胞分析技术进行革命性变革的公司合作。单细胞和临床研究市场正在迅速增长,将这款产品推向市场将能让更多实验室通过HIVE平台,对更多类型的样本、细胞进行分析,这无疑是令人兴奋的。” HIVE解决方案能够在采集和保存样本的同时确保每一个样本中细胞的多样性。基于微流体的平台和其他保存方法的使用条件比较苛刻,且容易丢失脆性细胞,导致数据的不完整性。而HIVE平台能够在重力作用下轻柔地将多至4ml的细胞装载到HIVE装置中,从而实现对脆性细胞的捕获和对稀有样本(例如细针抽吸物、细胞刷和流式分选细胞)的处理。HIVE平台在诊断和治疗方面具有潜在应用,它简化了单细胞分析,让实验室能更好地在单细胞水平上了解健康和疾病。关于Honeycomb BiotechnologiesHoneycomb Biotechnologies致力于为了全球范围内的基础研究、转化研究以及临床前和临床研究提供更好的解决方案。Honeycomb由麻省理工学院和博德研究所的科学家共同创立,其总部位于美国马萨诸塞州沃尔瑟姆市。如需更多信息,请访问www.honeycomb.bio。关于珀金埃尔默珀金埃尔默致力于为打造更健康的世界而持续创新。我们为诊断、生命科学、食品及应用市场推出独特的解决方案,助力科学家、研究人员和临床医生解决最棘手的科学和医疗难题。凭借深厚的市场了解和技术专长,我们助力客户更早地获得更准确的洞察。在全球,我们拥有约15000名专业技术人员,服务于190个国家,时刻专注于帮助客户打造更健康的家庭,改善人类生活质量。2020年,珀金埃尔默年营收达到约38亿美元,为标准普尔500指数中的一员,纽交所上市代号1-877-PKI-NYSE。了解更多有关珀金埃尔默的信息,请访问www.perkinelmer.com
  • 安捷伦靶向序列捕获系统现已支持454 Life Sciences的下一代测序平台
    安捷伦靶向序列捕获系统现已支持 454 Life Sciences 的下一代测序平台 2010年12月15日,北京&mdash &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布其SureSelect靶向序列捕获系统现已支持454 Life Sciences公司的下一代测序平台,借助该系统,用户可以仅测序目标基因组区域而非整个基因组,从而提高效率,节省成本。 安捷伦 SureSelect 平台业务经理 Fred P. Ernani 博士说道:&ldquo SureSelect 靶向序列捕获试剂盒已经过优化和验证,可用于所有三种主要的下一代测序平台。这将推动生命科学界持续快速地采纳我们的靶向序列捕获系统。相应地,我们将继续积极研发新型 SureSelect 产品,帮助客户应对更广泛的重大科学难题。&rdquo 除 454 公司的测序平台之外,安捷伦 SureSelect 靶向序列捕获系统还与 Illumina 公司的基因组分析仪和 HiSeq 平台以及 Life Technologies 公司的 SOLiD 测序仪完全兼容。本年内,有 25 篇涉及各类遗传性疾病研究的出版物使用了 SureSelect 试剂盒。 SureSelect 系列产品包括针对用户指定的基因组区域、人类激酶组、人类 X 染色体以及人全外显子的靶向测序试剂盒。 安捷伦 SureSelect 靶向序列捕获产品系列拥有业内最全面的的靶向序列捕获产品以及针对多种不同测序方法和平台的最优化分析方案。SureSelect 产品能够在单管中实现从不到 200 Kb 到超过 50 Mb序列的靶向序列捕获。 用户使用安捷伦eArray 桌面版或在线版设计工具,可以轻易地设计出靶向任意感兴趣基因组区域的 SureSelect 靶向序列捕获试剂盒。 要了解更多信息,请访问:www.agilent.com/genomics/sureselect 了解eArray:www.agilent.com/genomics/earray 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所: A)是全球领先的测量公司,同时也是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的18500名员工为100多个国家的客户提供服务。在2010财政年度,安捷伦的业务净收入为54亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。
  • 6项基因测序相关国标出炉 涉基因提取、纯化、捕获、高通量测序等
    p   近日,国家市场监督管理总局(国家标准化管理委员会)批准了501项国家标准。其中6项标准规定了包括 strong 核酸提取、核酸纯化、核酸检测、高通量测序、目标基因捕获等方法或试剂盒质量评价规范 /strong 。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 207px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201909/uepic/f1dcb8ec-9e38-452e-8fcf-83903cd80e93.jpg" title=" 微信图片_20190927151454.png" alt=" 微信图片_20190927151454.png" width=" 600" height=" 207" border=" 0" vspace=" 0" / /p p   这6项标注分别是 strong 核酸检测试剂盒质量评价技术规范(标准号:GB/T 37871-2019)、个体鉴定的高通量测序方法(标准号:GB/T 37870-2019)、目标基因区域捕获质量评价通则(标准号:GB/T 37872-2019)、合成基因质量评价通则(标准号:GB/T 37873-2019)、核酸提取纯化方法评价通则 /strong strong (标准号:GB/T 37874-2019)、核酸提取纯化试剂盒质量评价技术规范(GB/T 37875-2019) /strong 。 /p p    strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 1. 核酸提取纯化试剂盒质量评价技术规范 /span /strong strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " (GB/T 37875-2019) /span /strong /p p   该标准由中国计量科学研究院、北京康为世纪生物科技有限公司起草,规定了核酸提取纯化试剂盒的评价指标和评价方法。 /p p   评价指标:产量、纯度、完整度、重复性、再现性、批间差异和细菌内毒素残留。 /p p   评价方法 /p p   产量:紫外分光光度法、荧光法 /p p   纯度:对多糖、蛋白质、多酚、异硫氰酸等残留杂质采用紫外分光光度法 对残留核酸采用琼脂糖凝胶电泳法检测。 /p p   完整度:琼脂糖凝胶平板电泳法 /p p   细菌内毒素残留:光度测定法 /p p   仪器:微量紫外分光光度计、微量移液器、平板电泳仪、凝胶成像系统 /p p style=" text-indent: 2em " a href=" http://(GB/T 37875-2019)(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online& hcno=3101B767728F9C1349E4CE2E431AF84E)" target=" _self" style=" color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 详情请点击此处 /span /strong /a /p p    strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 2. 个体鉴定的高通量测序方法 /span /strong strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " (标准号:GB/T 37870-2019) /span /strong /p p   标准结合核酸生物技术和高通量测序技术,对人体样本的STR位点和SNP位点进行鉴定。该标准由深圳华大生命科学研究院、中国计量科学研究院、深圳华大智造科技有限公司、深圳华大基因科技有限公司、深圳基因产学研资联盟起草。 /p p   具体包括选择分子遗传标记位点、DNA提取、文库制备与DNA测序、位点分型及结果分析整个流程操作及仪器、试剂。 /p p   仪器:PCR仪、高通量测序仪、离心机、漩涡震荡机、冰箱。 /p p style=" text-indent: 2em " a href=" http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online& hcno=729A515C8246ADF310B3D2E94E843D24)" target=" _self" style=" color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 详情请点击此处 /span /strong /a /p p   strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) "  3. 目标基因区域捕获质量评价通则(标准号:GB/T 37872-2019) /span /strong /p p   该标准规定了基于液相捕获技术的目标基因区域捕获质量评价的术语、质量要求和评价方法。适用于高通量基因测序对人类基因组DNA样本进行目标基因区域捕获的质量评价,不适用于单分子测序。 /p p   标准由深圳华大生命科学研究院、中国计量科学研究院、深圳华大智造科技有限公司、深圳华大基因科技有限公司、深圳华大临床检验中心有限公司、艾吉泰康生物科技(北京有限公司)起草。 /p p   测序质量要求包括平均测序深度、测序覆盖度、捕获特异性。评价方法包括文库制备、高通量测序、数据过滤、序列比对。 /p p style=" text-indent: 2em " a href=" http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online& hcno=D30847645D9A4E6B36D79257F8A46D74)" target=" _self" strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 详情请点击此处 /span /strong /a /p p    strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 4. 合成基因质量评价通则(标准号:GB/T 37873-2019) /span /strong /p p   该标准规定了合成基因相关的术语和定义、质量要求和评价方法。适用于100bp~20kb片段长度的生物基因合成。 /p p   该标准由深圳华大生命科学研究院、中国计量科学研究院、深圳华大基因科技有限公司、青岛华大基因研究员起草。 /p p   合成基因质量要求 /p p   纯度:在pH值为7.0-8.5条件下,OD260/OD280在1.8~2.0,且OD260/OD230& gt 2.0. /p p   总量:一般不低于1μg. /p p   完整性:电泳条带明亮大小与目标条带一致,且亮度集中程度高。 /p p   序列一致性:与设定基因序列完全匹配 /p p   仪器:紫外分光光度计、凝胶成像系统、电泳仪、微波炉、微量移液器 /p p style=" text-indent: 2em " a href=" http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online& hcno=F6657ACDAB4112EDBC1E2B5455AC98C7)" target=" _self" strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 详情请点击此处 /span /strong /a /p p    strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 5. 核酸提取纯化方法评价通则(标准号:GB/T 37874-2019) /span /strong /p p   该标准由中国科学院北京基因组研究所、中国计量科学研究院起草。标准规定了核酸提取纯化方法评价的指标参数和评价方法。包括常规的新鲜动植物组织样本、细胞样本、血液样本、唾液样本和分辨样本等。 /p p   规定的参数指标包括DNA完整度、总RNA 完整度、提取产量、DNA纯度、RNA 纯度。 /p p   仪器:水平电泳仪、凝胶成像系统、微量移液器、荧光定量仪、紫外分光光度仪。 /p p style=" text-indent: 2em " a href=" http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online& hcno=27E460FBEE9D8C005E88A14303347EAF)" target=" _self" strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 详情请点击此处 /span /strong /a /p p   strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) "  6. 核酸检测试剂盒质量评价技术规范(标准号:GB/T 37871-2019) /span /strong /p p   本标准规定了核酸检测试剂盒质量评价的术语和定义、评价要求、评价指标和评价方法等,适用于核酸检测试剂盒产品和服务,但不适用于高通量测序的核酸检测试剂盒。 /p p   该标准由中国计量科学研究院、北京康为试剂生物科技有限公司、北京市医疗器械检验所起草。 /p p   核酸检测试剂盒分为定量和定性检测试剂盒。定量检测试剂盒的评价指标包括线性、准确度、分析特异性、定量限、检出限、重复性。定性检测试剂盒的评价指标包括准确度、分析特异性、检出限、重复性。 /p p style=" text-indent: 2em " a href=" http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online& hcno=A95B2D758535933A2FFBE427584A44AE)" target=" _self" style=" color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 详情请点击此处 /span /strong /a /p
  • 单细胞测序系统一站式解决方案——走访新格元生物
    细胞是生命活动的基本单位,随着精准医疗的发展和测序水平的提高,人们越来越深刻地认识到组织水平反应的信息有限。单细胞测序技术在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析,可以更精细地揭示细胞间的异质性。新格元(南京)生物科技有限公司(以下简称:新格元)作为国内首家、全球第三家拥有成熟商业化高通量单细胞测序平台的公司,2023年推出全球首款自动化从细胞装载到单细胞cDNA合成平台Singleron JavaTM,提高了实验室单细胞数据生产效率。近日,仪器信息网一行走进新格元苏州设备开发制造基地,与公司高级副总裁张龙对话,深入了解这家高新技术企业的技术、产品创新和未来发展。新格元高级副总裁张龙单细胞测序技术的演进历程2009年,北京大学汤富酬教授在《Nature Methods》杂志上发表了第一篇单细胞转录组测序文章,自此开启了单细胞技术的新时代。随后的十几年,单细胞技术以更高分辨率、更高通量,深入揭示了个体的发育过程、功能机制,并且在疾病的检测与监控研究方面发挥了重要作用,被《Nature Methods》评为2013年最受关注的技术成果,与之对应的,全球单细胞测序潜在科研市场体量预计至2031年达到136.2亿美元。早期单细胞测序的主要策略为:通过流式细胞术或者激光捕获显微切割技术将单细胞逐个分离出来再分别建库测序,该策略不仅通量非常低,而且随着待测单细胞的个数的增长,测序的成本几乎呈线性提升。随后,基于标签(barcode)的单细胞识别技术解决了通量和成本难题,其技术原理为通过微流控芯片技术获得单细胞反应体系,并在传统文库构建的基础上引入barcode,通过追溯barcode序列将众多mRNA、表面蛋白等定位回原来的单个细胞。然而,该技术前处理方法流程复杂,“油包水”的方式不利于捕获脆弱及损伤的细胞,局限了其应用。“油包水”式单细胞测序原理示意图从微流控芯片到单细胞技术平台2018年,方南博士、樊荣教授和周璟研究员(加州大学伯克利分校机械工程博士,耶鲁大学研究员)携手创立了新格元,新格元的名字取“格物致知,识微通元”之意,自成立以来,迅速在全球范围内建立了多个研发和生产基地,遍及南京(总部)、苏州、德国、美国和新加坡,产品与服务覆盖20多个国家和地区,3000多家实验室。此前,方南博士在凯杰负责二代测序及单细胞产品研发,樊荣教授是耶鲁大学微流控单细胞多组学技术的专家,为新格元GEXSCOPE® 单细胞技术平台的建立奠定了坚实的技术基础。之后,新格元与耶鲁大学签署了微流控单细胞处理专利的使用协议,并利用该专利联合自主知识产权的单细胞扩增技术开发出基于微流控芯片的创新性GEXSCOPE® 单细胞技术平台。GEXSCOPE® 单细胞技术平台基于“泊松分布”原理,通过微流控芯片实现精准的单细胞分离。其分子标签磁珠可在完成RNA捕获的同时完成标记,并且避免了“油包水”液滴形成过程中,压力对脆弱细胞的损伤,为单细胞分析技术在临床检测上的应用扫除障碍。GEXSCOPE® 单细胞分离原理从科研定制化到精准医疗突破单细胞技术通量、成本和周期上的瓶颈后,新格元致力于提供定制化服务,通过改变芯片孔径大小、设计特异标签,满足客户更大细胞、更多样的实验需求,其FocuSCOPE® 靶向高通量单细胞测序可在获得单细胞转录信息的同时获得靶基因突变信息。“科研的需求是多样的,我们会根据不同研究者的需求,提供一些定制化服务。”张龙称,“这也是我们区别于其他竞争对手的地方。”FocuSCOPE® 靶向高通量单细胞测序原理谈及单细胞技术在临床应用上的困难,张龙介绍称样本的保存和解离很关键:“实际上临床的流程是从手术或者活检开始,取样之后如果不能去马上做实验怎么办?样本的保存和解离,都不是我们主要竞争对手的关注点,而我们在公司成立之初就认识到样本处理的重要性,经过我们的研发及验证,我们开发的保存液可以维持细胞状态长达三天。” 组织解离更是重中之重,“组织解离做不好,后面做得再好也没用”,张龙解释道:“组织解离依赖机械剪切和酶解,为后续的单细胞分析提供最基本的保障。我们在组织解离领域有多年实战的经验,不仅在单细胞测序领域做了多种不同的物种、组织,并且在流式平台上有很多研发投入及实际验证数据。更是在原代细胞培养、类器官培养等领域积累了大量的经验。”当前,组织解离仪比较重要的应用场景是临床领域,“解离样本最低限度是10mg,满足临床组织穿刺的需求,是行业内做得最低的!”张龙自信地介绍道。Singleron PythoN Junior® 自动化组织解离系统从自动化系统到一站式解决方案2023年,Singleron Matrix NEO® 自动化单细胞测序文库构建系统、Singleron JavaTM自动化单细胞测序文库构建平台陆续上市。Singleron JavaTM是全球首款自动化完成从细胞装载到单细胞cDNA合成的平台。细胞分离、裂解、核酸捕获、反转录合成cDNA等操作全部自动化,轻松完成百万级单细胞实验。“其实mRNA是不稳定的,有了Singleron JavaTM,实验人员晚点再过来处理都没问题,还能同时做8个样品。”张龙说。Singleron JavaTM自动化单细胞测序文库构建系统 除了单细胞建库仪器、单细胞建库多组学试剂盒外,新格元还提供包括CeleScope® 可视化分析软件、SynEcoSys® 单细胞数据库在内的单细胞数据科学工具箱,“除了提供产品和服务之外,我们还会提供培训,不仅仅是实验的培训,还有生信的培训,这样才能让老师能真正用起来复杂的单细胞平台”,至此,新格元真正成为全球首家一站式、多组学单细胞测序产品提供商。新格元单细胞测序系统化一站式方案路线图在过去的10多年间,国内外单细胞测序平台的踊跃发展,助推了单细胞测序技术在肿瘤、胚胎发育、免疫治疗、感染、药物研发、干细胞治疗等的应用,验证了单细胞技术在精准医疗时代的价值。目前,新格元已服务1000余家知名医院、药企及科研院所,此外,新格元实验室于2024年通过美国病理学家协会CAP认证,同年6月参与人类细胞图谱(HCA)计划,为这项旨在绘制人体中所有细胞的图谱,以便于更好地了解人类健康以及进行疾病的诊断、监测和治疗研究的大型国际合作项目提供助力。纵观未来,张龙表示随着单细胞技术在肿瘤学、免疫学、感染、神经领域和其他医学研究领域应用的深入,行业市场将更加广阔,“早期只做科研的话应用市场就这么小,期待将来能够应用到临床,解决更多的精准医疗相关的难题,扩展单细胞测序的临床应用。”而这恰好符合新格元的初衷:“将创新的单细胞分析技术应用于临床检测、健康管理和药物开发等关键领域。”走访合影(从左至右:新格元生物工程师俞苏敏、仪器信息网客户成功经理康龙、新格元工程研发总监储冬东、新格元高级副总裁张龙、仪器信息网生命科学编辑李兆坤、仪器信息网生命科学编辑樊雪竹)
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