酸化岩心驱替系统

p 　　8月17日，牛津仪器(Oxford Instruments)和绿色成像技术(Green Imaging Technologies)宣布推出GeoSpec2+产品，这是知名的GeoSpec系列 a title=" " href=" http://www.instrument.com.cn/zc/43.html" target=" _self" strong NMR /strong /a 岩心分析仪的最新产品。这两家公司结合他们世界领先的NMR知识和经验，再一次推进NMR在石油和天然气领域的应用。 /p p style=" TEXT-ALIGN: center" img title=" Core-Analyzer-GeoSpec2Plus.png" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201508/insimg/94279ad8-30b3-4789-812b-18fb96b0806c.jpg" / /p p strong 　　更多的功能,更少的空间 /strong /p p 　　GeoSpec2+拥有全新的紧凑型电子控制台，性能进一步提升，还配备一套新的监测和诊断软件，这意味着用户可以更好的控制结果的质量和可追溯性。操作软件也已经升级，经过改进，高级用户可以定义他们自己的协议和应用程序,所以内部开发的方法可以很容易在其他网站上应用。 /p p 　 strong 　型号范围扩大 /strong /p p 　　现在的GeoSpec系列NMR分析仪包括行业标准2MHz (样本直径从半英寸到6英寸)、12MHz(低孔隙度样品增加灵敏度)和20MHz(最紧密的岩石样本也可以分析)。专用的覆盖层单元(P5单元)对大多数型号都可用。P5单元为NMR用户提供技术，给岩心样品加压至5000 psi，加热至100& amp #176 C，测量时尽可能接近储层条件。 /p p 　　牛津仪器磁共振市场销售总监Barry Jones说:“这一最新的GeoSpec产品证明了牛津仪器和绿色成像技术的承诺：保持GeoSpec在全球工业和学术用户选择NMR岩心分析仪时的地位”。 /p p 　　 strong 从基本的岩心分析到先进的方法 /strong /p p 　　所有GeoSpec型号交付完成都配备LithoMetrix软件，用以控制和监视仪器设备，并执行基本的岩石物性测量，如孔隙度、自可动/束缚流体、孔隙大小分布和T2截止值。先进的GIT系统软件也可用于测量饱和度剖面、空间T2分布、毛细管压力，以及进一步的应用研究。所以无论你需要怎样的NMR岩心分析仪, GeoSpec都会有相应的硬件和软件组合来满足你的需求。。 /p p & nbsp /p

由中国地质调查局南京地调中心承担的国家重大科学仪器设备开发专项 “岩心光谱扫描仪研发与产业化”项目启动会，于2013年1月28日在南京国际会议中心召开。来自国家科学技术部、国土资源部和江苏省科技厅等主管部门的负责人，以及国土资源部航空物探遥感中心、国土资源实物地质资料中心、北京航空航天大学、南京大学、南京农业大学、南京理工大学、紫金矿业等单位70多人参加了会议。 　　岩心光谱扫描仪研发与产业化项目由南京地调中心牵头，项目周期2012年10月至2017年9月止。项目总经费4280万元，其中国家重大科学仪器设备开发专项资金3530万元。项目拟通过攻克岩心光谱实时在线检测技术，开发成像光谱探测、波谱探测两个关键部件，通过系统集成和工程化开发，研制出具有自主知识产权的岩心光谱扫描仪，项目验收后3年内，建成生产线1条，生产仪器50台套，实现产业化应用，为我国地质科学研究提供支撑。 　　科技部条件财务司就国家重大仪器专项的总体思路和相关要求进行了解读，专家对项目分解的8个任务的仪器研发、应用开发和工程化开发进行了指导并提出具体建议。 会议现场

近日，The Lancet Rheumatology发表一项研究预测到2050年全球骨关节炎的患病率情况，研究显示，截止到2020年，全球骨关节炎患者增加到5.95亿，约占全球人口的7.6%，增幅高达132%。由此可见，开发针对骨相关疾病的精准无创诊疗技术迫在眉睫，因为它不仅可以连续监测骨代谢、生长、转移、给药和指导手术，而且可以实现骨疾病的高效治疗。然而，设计精准无创的骨疾病诊疗探针是极具挑战的工作。应 用 报 道今年9月，青岛科技大学袁勋教授团队在《Aggregate WILEY》报道了一种新型的金团簇基骨靶向诊疗探针[1]，实现了高时空分辨的体内骨靶向近红外二区（NIR-II）荧光成像和增强的类风湿性关节炎治疗。图1. Au44MBA26-P团簇的体内特异性骨靶向和高分辨率成像该探针的设计关键在于将原子级精确的NIR-II发射Au44团簇的表面进行磷酸化。一方面，Au44团簇的表面磷酸化大大增强了探针的骨靶向能力，使骨主要成分羟基磷灰石对磷酸化前后的Au44团簇探针的理论max吸附量提高了1.36倍，使该团簇探针实现了高对比度和高分辨率的体内骨靶向NIR-II荧光成像（信噪比提升1.4倍，见图1）。图2. Au44MBA26-P团簇对胶原免疫诱导大鼠类风湿性关节炎(CIA)模型的治疗作用另一方面，该团簇探针作为一种新型纳米药物，具有直接的生物效应，可显著抑制脂多糖诱导的小鼠巨噬细胞促炎因子的产生。在II型胶原诱导的大鼠类风湿性关节炎治疗中，该团簇探针表现出优异的抗炎和免疫调节作用，可将破坏的软骨恢复到接近正常状态，比临床治疗药物甲氨蝶呤效果更为显著（图2），且具有良好的肾脏清除率和优良的生物相容性。本研究提出了一种金属纳米团簇基诊疗探针的设计范例，为高分辨率骨靶向荧光成像和类风湿性关节炎治疗提供了新思路。图3.睿光NirVivo-Pro 近红外二区小动物活体荧光成像系统助力科研研究[1]: Phosphorylation of NIR-II emitting Au nanoclusters for targeted bone imaging and improved rheumatoid arthritis therapyhttps://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0142961223001382产 品 推 荐近红外二区小动物活体荧光成像系统NirVivo-Pro 活体荧光成像系统是北京睿光科技自主研发的一款专门用于近红外二区的光学成像系统。该系统可实现高质量荧光图像的采集及图像处理，实时地观察基因在活体动物体内的表达、肿瘤的发生、生长、转移及药物的治疗效果，对同一个动物进行时间、环境、发展和治疗影响跟踪，可用于生命科学、医学研究及药物开发等应用领域。产品特点

“过去只见过在医院里给患者做核磁，这次给岩芯做核磁，我还是第一次干。”5月8日，在中油测井天津分公司工程技术交流会上，从事一线工作近20年的作业队长周海对负责该项目解释评价的工程师宋连猛说道。周海提到“给岩芯做核磁”设备，是指中油测井自主研发的车载岩石物理实验室搭载的移动式岩心核磁共振测井仪器。宋连猛看着岩芯说，“别看这一颗颗小岩芯个头不大，里面蕴藏的内容可丰富极了，这些从数千万年、乃至上亿年的地下取出的样品，不但拥有多种矿物组分，还隐藏着地质变迁、油气成藏、乃至地下环境分布的‘大秘密’！”位于大港油田的测井作业现场 姚东江 摄位于大港油田的测井作业现场 姚东江 摄在5月8日刚刚完成的中国石油某重点风险探井测井作业中，随着按照采样深度向岩芯分组送入仪器，各项复杂数据和曲线也精准被测出。接下来，解释评价人员将对各类数据进行综合比对和分析，在不同层位分析出相关数据和参数，为油气井射孔和试油提供数据支撑。据了解，该项装备可实现在现场对井下岩芯进行快速、连续、无损、高精度的一维与二维核磁测量与资料快速处理解释，可以获取地层孔隙度、孔隙结构、流体性质、含油饱和度等地质信息。自今年初步应用以来，已在河北、陕西、辽宁等地多次完成作业，助力多口油气井实现油气资源的评价和开发。解释评价工程师对岩芯进行检查 姚东江 摄解释评价工程师对岩芯进行检查 姚东江 摄“咱们国产核磁装备已经从单一的下井测量，发展至车载和便携式，测量越来越精准，使用越来越方便。今后，我们会为更多的地层和岩芯做核磁，为地质分析和资源开发提供更优质的数据支撑。”宋连猛自信地说道。

p 　　 span style=" font-family: 楷体,楷体_GB2312, SimKai " 回顾2017年，基于质谱的临床研究有一项突破性发现。普渡大学陶纬国教授团队在2017年3月20日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上发表文章称，他们从人体血液中发现2400多种磷酸化蛋白。该发现首次证明了磷酸化蛋白可以作为基于液体活检的疾病标志物，能用于对癌症等重大疾病更早、更精准的非侵入性诊断，为 “液体活检”提供了全新的检测维度。近日，仪器信息网专访了陶纬国。 /span /p p style=" text-align: center " img title=" 1.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201801/insimg/a21a903c-0479-4776-9e2a-5b5c719f76fc.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong 普渡大学 陶纬国教授 /strong /p p 　　 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 磷酸化蛋白突破性发现 /strong /span /p p 　　通过液体活检来诊断肿瘤和癌症等疾病一直是临床科学家关注的焦点，研究对象多集中在循环肿瘤细胞(CTC)和循环肿瘤DNA(ctDNA)，但是二者都有局限性：由于CTC在血清中的浓度非常低，取少量血液对其检测难度很大 癌症有很多基因突变，而这些突变不一定会显现出来，因此基于ctDNA进行的液体活检的诊断结果只能预测患病的概率，并不能确诊。 /p p 　　蛋白质磷酸化是调节和控制蛋白质活力和功能的最基本，最普遍，也是最重要的机制，同时，与许多疾病的发生密切相关。在众多肿瘤致病机理中，当前学术界对蛋白质磷酸化机理的研究最为清楚，80%-90%的癌症都跟蛋白质磷酸化有关。因此，许多抗肿瘤药物的研制都着眼于磷酸化蛋白。理论上，磷酸化蛋白作为相关基因突变的表达，在临床上能够帮助医生做出更明确的诊断。但是，有关基于液体活检的磷酸化蛋白研究还很少。此前，有个别报道在血液中发现几十种磷酸化蛋白，均是高丰度蛋白，生物学意义不大。“原因就是磷酸化蛋白一旦从细胞进入血液中就被肝脏分泌的磷酸酶水解了。”陶纬国解释说，“所以虽然磷酸化蛋白跟癌症关系非常密切，但人们无法对其进行检测。” /p p 　　陶纬国团队是如何从人体血液中检测到大量磷酸化蛋白的呢?这要从三年前的一篇文献报道说起，当时陶纬国从这篇文章中了解到外泌体和微囊的结构，“当我看到类似于纳米微粒的外泌体、微囊结构时，我认为可能会有磷酸化蛋白被包裹在外泌体中，然后进入血液。如果真是这样，被外泌体包裹的磷酸化蛋白可能会避免被血液中的磷酸酶水解。”于是陶纬国团队对血液中的外泌体、微囊进行了超速离心分离、提取，然后用质谱进行检测。一周以后，实验结果让所有人都惊呆了，他们从中发现了几千个磷酸化蛋白。这个突破性的发现使得临床科学家们今后可以在1毫升血浆里找到几千个磷酸化的位点，并从中筛选出不同疾病的生物标志物。之后，陶纬国团队对乳腺癌病人血清中的磷酸化蛋白做了研究，发现乳腺癌病人体内的磷酸化蛋白与其病症密切相关。 /p p 　　那么，磷酸化蛋白液体活检何时能够应用临床呢?陶纬国回答说：“虽然现在还不好断言，但我认为3-5年内都有可能。”他进一步解释，随着质谱技术的显著提升，一些原来检测不到的生物标志物现在能够检测了，后面的工作主要是考察重复性有多好，假阳性有多低。 /p p 　　谈及未来的工作，陶纬国表示，一方面会继续做乳腺癌的磷酸化蛋白生物标志物确认的工作 另一方面也会做其他疾病磷酸化蛋白生物标志物找筛的工作，“还有很多其它疾病，比如阿尔茨海默病、帕金森综合征等，也都是蛋白磷酸化有关。” /p p 　　 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 质谱用于生物大分子检测的思考 /strong /span /p p 　　陶纬国教授做蛋白组学研究至今已有十几年，用到的研究工具主要是质谱。在攻读博士期间，陶纬国师从普渡大学著名质谱专家Graham Cooks教授。博士毕业后，陶纬国加入了西雅图系统生物研究所，在Leroy Hood教授(自动DNA测序仪发明人)和Ruedi Aebersold教授(著名蛋白质组学专家)课题组继续博士后研究。从那时起，陶纬国就开始了他的磷酸化蛋白质组学检测的研究，“重回普渡教书以后，我的工作基本上是围绕着怎么去提高磷酸化蛋白分析手段来开展的。质谱在我的工作扮演着中心角色，包括方法开发，蛋白生物标志物早筛，全靠质谱来做。”首先是早筛，用质谱(Orbitrap)筛选出相关的生物标志物(磷酸化蛋白) 然后对病人的样本进行检测，用统计学的方法对检测结果进行分类 最后，分析统计学上有意义的、跟病人相关的磷酸化蛋白。 /p p 　　在过去二三十年里，质谱在生物大分子检测方面有几个重要的技术突破。首先，80年代末90年代初， ESI和MALDI的出现，使质谱能够用于分析生物样品 第二，近十几年来，高分辨质谱的飞跃发展，大大提升生物大分子的分析效率。“我读博士后时(2002年)，很多仪器还是低分辨的，生物样品还是挺难做的，做完一个磷酸化的蛋白，单是数据库检索就要三天，而且，相对来说，得到的数据假阳性高。现在的高分辨质谱解谱很容易，差不多半个小时就够了，假阳性也降低很多。”此外，陶纬国还说到，“UPLC与质谱的结合在技术上是很大的进步，使色谱的分离效率赶上了质谱的速度，现在一个小时能检测到几千个蛋白，非常快。” /p p 　　同时，陶纬国也指出了目前利用质谱来检测生物大分子的难点。第一，生物样品基体复杂。“像我们实验室做磷酸化蛋白，它本身丰度就很低，假如样本不经过任何分离的话，谱图上将会只能看到高丰度蛋白。”第二，质谱检测假阳性比较高。“其实还是需要统计学算法方面的开发，来解决假阳性率高的问题，这也是现在很多质谱开发者在做的工作。” /p p 　　现如今质谱产品更新迭代非常快，对于质谱工作者来说，是好，也是坏。“新产品的确扫描速度更快了，精度更高。但是，也给质谱工作者带来了不小的压力。特别是像我们这种使用高分辨大仪器的，没有那么多钱换来换去。可是如果你想要紧跟前沿，这些新仪器又十分必要。”陶纬国说，这是目前质谱工作者普遍面临的两难境地。 /p p 　　 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 整合临床大数据 /strong /span /p p 　　2017年，陶纬国作为海外高层次人才被东南大学引进回国。谈及回国的初衷，陶纬国表示，国内拥有更多、更丰富的病人样本，这是他选择回国的原因之一。此外，国内对于高分辨质谱等大型仪器的投入力度也更大，有助于前沿研究的开展。谈到选择东南大学的原因，陶纬国说到：“东南大学的生物医学工程学院有转化医学，有生物，然后又有工程，包括产业化，比较适合我。” /p p 　　现在国内，整合医学大数据来服务大健康的概念很热，“在全国，包括南京，都已经有相关工作在开展”。从临床检测这个角度来说，陶纬国希望找到办法来整合DNA检测，microRNA检测，磷酸化蛋白检测几个维度的数据，从而获得更为精准的临床诊断结果。“比如检测一个肿瘤，通过对DNA、mRNA、磷酸化蛋白、糖基检测多维度数据的不断积累，数据会越来越多，结合人工智能、计算机算法，检测结果会越来越精准。 我回来能赶上这个机会也是不容易。”陶纬国如是说到。 /p p 　　目前，医学大数据的采集方式主要为第二代、第三代测序。“但是，质谱也是很重要的一块儿。”陶纬国指出，“比如乳腺癌，基因突变仅仅代表一种患病的可能性，但是到底有没有癌症还是要通过蛋白检测来确定，所以用质谱来检测蛋白的存在、活性、功能，比基因层面更可靠。所以，质谱检测肯定会慢慢跟上来。” /p p 　　陶纬国在东南大学生物医学工程学院的新实验室是电子生物国家重点实验室。对于自己的工作重心，陶纬国表示，现在是过渡时期，未来会逐步将重心转至国内。“国内实验室刚刚开始，看起来前途光明。” /p p 　 span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 　热衷学界公益事务 出任CASMS主席 /strong /span /p p 　　作为质谱生物大分子检测方面的专家，陶纬国于2017年6月份当选北美华人质谱学会(CASMS)主席。该学会汇聚了众多顶尖的华人质谱学者，已经成为质谱学界重要的华人力量。在一年一度的“美国质谱年会(ASMS)”期间举行“北美华人质谱学术会议”已经成为CASMS的传统。据陶纬国介绍，CASMS已有二三十年的历史，目前注册人数在800人左右，覆盖了北美地区绝大部分优秀的华人质谱学者。ASMS每年参会人数6000-7000人，相当一部分是华人，中国面孔越来越多。“在美国，有很多华人学者做了非常出色的工作，但他们并没有获得相匹配的影响力和威望。” 陶纬国说，“我们学会的宗旨就是提升华人质谱学者在世界质谱领域的影响力。当然， 中国本身的国际地位的重要性是显而易见的。” /p p 　　CASMS的另一个宗旨是促进世界华人质谱界的互相交流。每两年召开一次的“世界华人质谱学术研讨会”是全世界华人的质谱盛会，汇聚了中国内地、台湾、香港、新加坡和北美地区的质谱学者，CASMS是该会议4个主办方之一。2016年，CASMS主办了第六届“世界华人质谱学术研讨会”，这是该会议首次在美国召开，恰逢该会议召开十周年。“我认为非常有意义，促进了两岸三地华人质谱学者的交流合作。我的亲身体会是通过这个会议结识了很多优秀学者，而在此前很多同仁相互间是不认识的。” /p p 　　未来，除了重要的线下会议组织工作，陶纬国希望通过加强线上日常交流，来使学会内部联系更为紧密。 /p p 　　 span style=" font-family: 楷体,楷体_GB2312, SimKai " strong 后记： /strong 临床质谱技术被认为是医学诊断的下一个“基因测序”，应用前景被普遍看好。质谱用于临床检验具有灵敏度高、特异性高、重现性好的优点，可在临床多个领域对传统诊断方法学进行替代。陶纬国教授团队的磷酸化蛋白研究进一步提升了临床质谱应用的含金量。基于该研究，临床科学家们将会找到更多可靠的疾病标志物，从而实现癌症等重大疾病的早期发现和精准诊断。 /span /p p style=" text-align: right " 采访编辑：李博 /p

据《自然》网站近日报道，全球海洋学家努力追踪海洋酸化状况的计划正在逐步成型，他们本周拟定将搭建国际监测网络，借助远程传感器等测量二氧化碳所致的海洋酸化对于水生生物的影响。 　　海洋酸化是指由于吸收大气中过量的二氧化碳，导致海水酸碱度降低的现象。海洋表层水的pH值约为8.2，呈弱碱性。研究人员估计，自19世纪工业革命以来，海洋的酸度已经上升了30%。以此种酸化速度，2100年这一数字或将下降到7.8。海水酸性的增加，将改变海水化学的种种平衡，使依赖于化学环境稳定性的多种海洋生物乃至生态系统面临巨大威胁，例如，越来越酸的海水能够破坏珊瑚和牡蛎贝壳中包含的碳酸钙，或是损坏某些海洋浮游生物的骨骼等。因此，科研人员需要更清晰的数据来评估海洋酸化严重的地区，并利用模型对未来的发展趋势进行推测。 　　美国国家海洋和大气管理局下属太平洋海洋环境实验室的理查德费利表示，科研人员经过数十年的巡航考察发现，大部分的海水酸化发生在少数的几个公海地点，但这种监测方式十分昂贵。他说：“我们正在尝试建立大量具有自动化系泊设备的监测点，其可以通过卫星将数据传输给研究人员，使科学家基于相关数据验证海洋的酸化模型。”费利等人期望，监测点的数量能够在未来10年从20个攀升至60个，形成追踪海洋酸化状况的全球监测网络，并使每个国家都能支持自己的酸化监测，令酸化监测成为巡航舰载测量的例行部分。这一监测计划将由海洋酸化国际协调中心领导，由国际原子能机构主持。 　　费利坦言，目前沿海生态系统的监测功能最弱，然而这些区域却最需要对于海洋酸化程度的追踪。以太平洋西北地区为例，酸化程度可因上升流携带的大量溶解的二氧化碳而增强，致使牡蛎培育的收益率在2005年至2008年间下降80%左右。而当地研究小组提供的有关上升流的监测设备，可使培育机构及时调整运营部署，避开酸性海水的突袭。这一战略能在2011年为太平洋西北地区的牡蛎产业节省3500万美元，可谓是监察观测系统十分实用的一个方面。

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海洋酸化威胁全球，国际海洋检测网应运而生 全球海洋正在迅速酸化，其速率是过去3亿年来最快的，甚至快于5600万年前极热时期。 　　据《Nature》网站近日报道，全球海洋学家共同努力追踪海洋酸化状况的计划正在逐步成型，他们将于本周拟定搭建国际监测网络的具体方案，希望借助远程传感器等检测二氧化碳所致的海洋酸化对于水生生物的影响。 　　海洋酸化是指由于吸收大气中过量的二氧化碳，导致海水酸碱度降低的现象。海洋表层水的pH值约为8.2，呈弱碱性。研究人员估计，自19世纪工业革命以 来，海洋的酸度已经上升了30%。以此种酸化速度，2100年这一数字或将下降到7.8。海水酸性的增加，将改变海水化学的种种平衡，使依赖于化学环境稳 定性的多种海洋生物乃至生态系统面临巨大威胁，例如，越来越酸的海水能够破坏珊瑚和牡蛎贝壳中包含的碳酸钙，或是损坏某些海洋浮游生物的骨骼等。因此，科 研人员需要更清晰的数据来评估海洋酸化严重的地区，并利用模型对未来的发展趋势进行推测。 　　美国国家海洋和大气管理局下属太平洋海洋环境实验室的理查德费利表示，科研人员经过数十年的巡航考察发现，大部分的海水酸化发生在少数的几个公海地点， 但这种监测方式十分昂贵。他说：“我们正在尝试建立大量具有自动化系泊设备的监测点，其可以通过卫星将数据传输给研究人员，使科学家基于相关数据验证海洋 的酸化模型。”费利等人期望，监测点的数量能够在未来10年从20个攀升至60个，形成追踪海洋酸化状况的全球监测网络，并使每个国家都能支持自己的酸化 监测，令酸化监测成为巡航舰载测量的例行部分。这一监测计划将由海洋酸化国际协调中心领导，由国际原子能机构主持。 　　费利坦言，目前沿海生态系统的监测功能最弱，然而这些区域却最需要对于海洋酸化程度的追踪。以太平洋西北地区为例，酸化程度可因上升流携带的大量溶解的二 氧化碳而增强，致使牡蛎培育的收益率在2005年至2008年间下降80%左右。而当地研究小组提供的有关上升流的监测设备，可使培育机构及时调整运营部 署，避开酸性海水的突袭。这一战略能在2011年为太平洋西北地区的牡蛎产业节省3500万美元，可谓是监察观测系统十分实用的一个方面。 　　《Science》杂志近期发布的一份研究报告显示，全球海洋正在迅速酸化，且速率是过去3亿年来最快的，甚至快于5600万年前温室气体急剧增加的时期。 　　迅速被酸化的海水将腐蚀能给许多动物和植物提供栖息地的珊瑚礁，让贝类和牡蛎难以长出保护性的外壳，还可能损害鱼类的生长。尽管已有少量研究发现，一些浮 游生物会逐渐适应海洋酸化，例如一种叫做海洋球石藻的微小浮游生物，与未经进化的同类相比，其维持钙质外壳的能力要高出50%。但是研究人员依旧强调出对 海洋酸化的警惕不容质疑。 　　据路透社报道，美国国家海洋和大气管理局局长简.卢布琴科(Jane Lubchenco)在近期美国国会的一次有关海洋酸化的听证会上强调目前这种现象需要引起人们的强烈关注。 　　研究者们对5600万年前一次长达5000年的温暖时期进行了研究。他们认为，那一时期气温偏高的主要原因可能是大规模的火山活动导致碳元素大规模泄漏到 大气中，那也是过去3亿年来与目前的状况最为相似的一段时间。当时大气中的碳元素含量翻了一倍，平均气温升高了6摄氏度。同时，在这5000年的时间里， 海洋的酸性PH值上升了0.4个单位。 　　这些数据十分惊人，可是本次调查报告的作者、来自美国哥伦比亚大学拉蒙—多尔蒂地球观测所的巴尔贝尔.霍恩斯基(Baerbel Hoenisch)认为，与大约150年前开始的工业革命时期排放到地球大气中的碳元素含量相比，当时造成全球变暖和海洋酸化的碳元素含量就是小儿科了。 　　霍恩斯基说，这一时期被称为古新世到始新世极热时期，约在恐龙灭绝900万年后。在那段时间里，海洋的酸性PH值平均每个世纪约上升0.008个单位。当 时酸化的海水导致不少珊瑚种类灭绝，生活在海底的许多种单细胞有机体从此消失，这也使得居于食物链更高层的其它植物和动物渐渐走向灭亡。 　　这项研究还显示，20世纪以来，海洋的酸性PH值增加了0.1个单位。据预测，到2100年，这一数值还将增加到0.2或0.3个单位。而根据联合国气候变化委员会发布的预测，本世纪全球气温可能会上升1.8到4摄氏度。 　　霍恩斯基说：“在5600万年前的极热时期所发生的温度变化与今天相比小得多，但当时仍然因为温度上升而出现了生态系统的改变，这让我很担心我们的未来会发生些什么。” 　　有些质疑气候变化的人常将过去由自然事件引起的温暖时期作为证据，指认现在的变暖趋势也不是由人类活动所引起。尽管霍恩斯基也注意到大规模的火山活动等自 然因素很有可能是造成古新世/始新世极热时期的首因，但是她认为当时气候变暖和海水酸化的速率与现在相比仍相当温和，因为那一时期长达5000年，而现在 才不过一个世纪。 　　美国国家海洋和大气管理局的海洋学家理查德.菲力(Richard Feely)并未参与这项研究，但他认为了解过去有助于更好地预测未来：“这些研究能让你从时间上把控过去海洋的酸化，因为酸化是一个缓慢长期的过程。我 们在未来几十年中做出的决定可能在长远上来说会造成深刻的影响。”

大家好，本周为大家介绍一篇本课题组发表在ACS Chem. Biol.上的文章，Insights into Phosphorylation-Induced Protein Allostery and Conformational Dynamics of Glycogen Phosphorylase via Integrative Structural Mass Spectrometry and In Silico Modeling1。变构调节在自然界中广泛存在，可以用于调控细胞过程。糖原磷酸化酶（GP）是第一个被鉴定出的与变构调节相关的磷酸化蛋白。GP是一个分子量约196kD的同源二聚体蛋白，是糖代谢中重要的组分，也是2型糖尿病及癌症的靶点。AMP结合以及Ser14的磷酸化介导了GP的变构调节，使其构象从非活化的T-state GPb（未磷酸化状态）转变为活化的R-state GPa（磷酸化状态）。即使目前X-射线晶体学法解析出了GP的原子级蛋白结构，但受限于较大分子量，其结构动态性的检测较为困难，因此与GP变构调节相关的结构动态变化过程仍较为模糊。核磁共振（NMR）谱及分子动力学（MD）模拟等是探究蛋白质结构动态性的常用方法，但NMR分析存在分子量上限，且样品消耗量大，MD模拟的时间尺度和力场准确度有限。质谱（MS）法具有快速、灵敏的特点，是蛋白质结构、动态性以及构象变化分析中强有力的一款技术。氢氘交换质谱（HDX-MS）通过监测蛋白骨架酰胺氢原子与溶液中氘的交换来反映蛋白质构象动态性，因此适用于探究由配体、蛋白结合或共价修饰引起的蛋白质构象变化。同时，多个软件实现了由HDX-MS数据计算保护因子（PFs）和吉布斯自由能，从而提取残基水平的蛋白动态性信息。此外，在先前的工作中2, 3，我们整合了native MS和top-down方法（native top-down，nTD-MS技术），成功实现了多个蛋白复合物的一级序列到高阶结构等多方面信息的检测（包括测序、翻译后修饰、配体结合、结构稳定性、朝向等）。整合多种结构质谱法（整合结构质谱法）可以有效填补传统生物物理法中结构到动态性联系中的空缺，更好地表征变构调控现象。本文整合了HDX-MS、nTD-MS、PF分析、MD模拟以及变构信号分析检测了磷酸化介导的GP变构调控的结构和动态性基础，为GP的变构调控过程提供了见解。根据X-射线晶体学结构报道（图1a），T-state GPb转变为R-state GPa时，二聚体界面中N-末端尾部、α2、cap’（图1b）以及tower-tower helices区（图1c）发生了明显的结构重排，导致催化位点开放，从而底物磷酸吡哆醛（PLP）可以结合。尽管有晶体学报道，但与变构调控关联的构象动态性仍有待探寻。图1.（a）磷酸化介导T-state GPb（PDB：8GPB）向R-state GPa（PDB：1GPA）的构象转变；亚基相互作用界面：（b）C端区域和（c）tower-tower helices，GPb为蓝色，GPa为绿色。首先我们通过nTD-MS进行了检测。如图2a、b，谱图中观察到了GPb的单体和二聚体信号，其中二聚体为主要形式；GPa除了单体和二聚体外，谱图中还存在少量四聚体，但仍以二聚体为主要形式。当增加sampling cone（SC）电压时，GPb、GPa保留了其二聚体形式（图2c、d）。随后我们选择离子（29+）并在trap池中进行了碎裂（图2e、f、g、h），谱图低质荷比区GPa的碎片相对峰强度较GPb高，说明GP的二聚体互作界面较为稳定，且GPb亚基结构较GPa稳定。nTD-MS不仅能够探究GPb、GPa的结构差异，也能够为接下来的HDX-MS实验做好前期样品质量检查工作。图2.不同活化条件下GPb、GPa的nTD-MS谱图。（a、b）SC=40V；（c、d）SC=150V；（e、f）SC=150V、trap=100eV；（g，h）SC=150V、trap=200eV。左侧为GPb，右侧为GPa。随后我们进行了HDX-MS实验。图3a中展示了五个时间点的HDX heat map。图3b为通过PyHDX软件计算产生的PF值。其中N-端（1-22）以及tower helix前的loop区域（256-261）的氘代值较高、PF值较低，说明这些区域较为柔性或是结构较为无序。此外我们发现，tower-tower helices（262-276）区域的氘代值较低、PF值较高，表明helices的旋转可能是由前端可塑性铰链区触发的，而非helices本身的变形和重塑引起的，这些发现在晶体结构数据中均有吻合之处。除这两个区域外，GPa和GPb基本保持了稳定的整体结构。而从1μs原子级MD模拟计算得到的均方根波动（RMSF）和溶剂可及表面（SASA）中我们也发现（图3c），这两个区域数据与HDX-MS信息有所吻合，但MD模拟中部分区域未和HDX-MS相吻合的区域可能跟序列覆盖不足相关。图3. （a、d）GPb和GPa在不同标记时间下的氘代热图并映射到结构中（PDB: 1GPA）。（b、e）基于HDX-MS数据计算得到的PF值并映射到晶体结构中。（c、f）MD模拟中RMSF和SASA值并映射到结构中。从氘代差异图（图4a）中可以看出，4个区域呈氘代降低趋势（红色方框），多个区域呈氘代上升趋势（蓝色方框）（GPa-GPb）。而PF差的变化趋势与氘代变化趋势基本一致（图4b）。由数据可知，N-端和tower-tower helices的变化说明磷酸化介导的变构稳定了这两个区域，α1-cap-α2区域的动态性轻微下降。除此之外多个区域（尤其是tower-tower helices序列后的区域）均表现为PF值下降，说明相比于GPb，GPa催化位点附近的区域动态性增强了。接下来我们根据HDX kinetic plot特征将其进行了分类，并详细讨论了所属区域的变化。图4.（a）GPa-GPb HDX-MS的氘代差异图。（b）GPb到GPa PF的变化。 首先是N-端和C-端的变化（图5）。N-端残基1-22表现氘代下降，这说明N-端具有一定可塑性。受N-端区域磷酸化和结构变化影响，C-端区域也产生了一定的变化。此外，残基30-50（cap区）和残基111-117（α4back-loop）区表现氘代下降，而103-109（α4front）表现氘代上升。根据晶体结构推测，cap区和α4back-loop的氘代变化受N-末端变化影响，原有的残基相互作用被打破，形成新的残基间相互作用，同时这两个区域也经历了结构重排，因此表现出较明显的氘代变化。残基88-99（β2-α3）和残基125-141（β3-L-α6）氘代上升。总的来说，磷酸化使得cap′/α2界面互作增强了，同时磷酸化基团和精氨酸残基的静电相互作用是cap区产生变化的主要原因，而α1和α2起到锚定作用，其相对位置基本保持不变。图5.GPb（a）和GPa（b）的N-端和C-端区域的局部结构和HDX动力学曲线（c）。 此外，tower-tower helices（α7，残基262-278）区的变化同样值得关注（图6）。250s loop是表面暴露区域，未与其他区域发生接触，其氘代下降可能是因为自身结构的收缩。而肽段262-267和268-274氘代下降提示该区域可能发生了低周转率或强互作的结合反应。280s loop区氘代值上升。这些变化均说明，tower-tower helix的角度的改变不仅影响了二聚体界面结构，而且还影响了其靠近催化位点的周围区域。因此我们结合晶体结构推测，磷酸化和N-端相对位置的改变，使250s loop自身结构收缩，从而打破了Tyr262' -Pro281和Tyr262-Tyr280′之间的相互作用，导致两个亚基的tower helices发生相对滑动，倾斜角度增加。图6.GPb（a）和GPa（b）tower helix区域的局部结构和HDX动力学曲线（c）。 最后是催化位点、PLP结合位点和糖原存储位点的变化情况（图7）。催化位点周围多数区域均表现氘代上升趋势。我们推测，随着Pro281、Ile165和Asn133间的相互作用被打破，Arg569与Ile165、Pro281、Asn133间的互作也随之打破，因此催化位点和PLP结合位点周围的残基溶剂可及性上升，局部区域结构变得更为灵活，催化位点开放并转变为活化构象。糖原储存位点位于GP表面，距离催化位点30Å，除了α23（残基699−708）外，HDX-MS在糖原存储区没有观察到明显的变化。图7.GPb（a）和GPa（b）的催化位点和PLP（橙色）结合位点的局部结构和HDX动力学曲线（c）。结合以上所有数据，我们对磷酸化调节的动态机制进行了推测（流程图1）。磷酸化后，N-端尾部残基与acidic patch的互作被打破，也导致N-端尾部的有序化以及C-端尾部的无序化以及伴随的其他结构变化。通过在pSer14和Arg69和Arg43′之间形成新的盐桥，N-端残基被重定位，随之带来的是Asp838和His36′间的盐桥断裂。随着三级和四级结构的转变，250s loop收缩并发挥类似“门环”的作用，当其收缩时，Tyr262′-Pro281与Tyr262-Tyr280′之间的相互作用、276-279区与162-164区之间的氢键也被打破，导致tower helix发生相对滑动，tower-tower helices之间的作用被打破，同时将结构变化传递到催化位点。最后，280s loop和催化位点以及PLP结合位点附近的残基松动，通往催化位点和底物磷酸盐识别位点的通道打开，酶得以活化。流程图1.GP变构调节过程中，被打破（蓝色）或新形成的（红色）关键残基相互作用。 本文整合nTD-MS、HDX-MS、PF分析和MD模拟检测了GP磷酸化变构调节过程的结构和动态基础，通过该整合结构手段揭示了GP构象柔性、局部动态性以及长程变构调控构象变化中值得关注的信息。各个方法具有各自的优势，但也在一定层面存在局限，我们期待将HDX-MS信息与计算模拟信息进行更深度的整合以实现二者对蛋白质结构更精确的分析。撰稿：罗宇翔编辑：李惠琳原文：Insights into Phosphorylation-Induced Protein Allostery and Conformational Dynamics of Glycogen Phosphorylase via Integrative Structural Mass Spectrometry and In Silico Modeling李惠琳课题组网址：https://www.x-mol.com/groups/li_huilin参考文献1. Huang, J. Chu, X. Luo, Y. Wang, Y. Zhang, Y. Zhang, Y. Li, H., Insights into Phosphorylation-Induced Protein Allostery and Conformational Dynamics ofGlycogen Phosphorylase via Integrative Structural Mass Spectrometry and In Silico Modeling. ACS Chem. Biol. 2022.2. Li, H. Nguyen, H. H. Ogorzalek Loo, R. R. Campuzano, I. D. G. Loo, J. A., An integrated native mass spectrometry and top-down proteomics method that connects sequence to structure and function of macromolecular complexes. Nat. Chem. 2018, 10 (2), 139-148.3. Li, H. Wongkongkathep, P. Van Orden, S. L. Ogorzalek Loo, R. R. Loo, J. A., Revealing ligand binding sites and quantifying subunit variants of noncovalent protein complexes in a single native top-down FTICR MS experiment. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2014, 25 (12), 2060-8.

走进位于北京市西城区文津街7号的国家图书馆古籍馆，转几个弯，绕到文津楼后，看到一扇单门。正值雨季，门口摞着两个防水用的沙袋。单门是通向一个半地下室的。即使是老读者，很多人也都没注意到，近几年，这里多了一个古籍保护实验室。　　不久前，国内首个成型的文献脱酸设备在这个实验室研制成功。全国上千万册正处于“酸化危机”中的典籍文献，将有机会因此延年增寿。古籍保护实验室内的文献脱酸设备。　　“酸化危机”：全球性问题　　实验室摆着一册1936年出版的《宋元明清四朝学案》，书页已经泛黄。工作人员张铭正在对它进行检测。结果不出意料，纸张的pH值仅为4.5。　　在酸碱度检测中，pH值等于7为中性，大于7为碱性，小于7为酸性。在文献保护领域，pH值如果小于5，就意味着纸张已严重酸化。而酸化，是加速文献纸张脆化变质的罪魁祸首。　　“纤维素是纸张的主要组成成分，也是纸张强度的主要来源。在酸性条件下，纤维素很容易发生水解，这就会使纸张老化。”实验室负责人、国家图书馆古籍馆文献保护组组长田周玲介绍，木材、竹子、稻草等造纸原料，有的本身就是酸性物质，有的则通过长期的氧化、水解产生酸性物质，再加上日益严重的环境污染更加速了纸张的酸化。现在，纸张酸化已经成为影响文献保存的世界性问题，全世界三分之二的历史文献和珍贵图书都受到酸化的威胁。　　十几年前，国家图书馆馆员李景仁、周崇润对馆藏各个历史时期的文献酸度进行了全面检测。他们得出的结论是：我国的善本古籍特藏文献大部分已呈现酸化迹象。由于在近现代造纸工艺中，常常会使用酸性添加剂，这使得民国文献的酸化程度比以往更为严重。　　基于这样的现状，研发针对民国文献的脱酸液和脱酸设备，成为这个实验室的当务之急。张铭手上的民国版《宋元明清四朝学案》，是旧书市场买来的样品。经过脱酸处理后，他又对这册书的纸张酸度进行检测：pH值为8，达到了预期的效果。　　“脱酸工艺能否完全中和纸张的强酸和弱酸，pH值是最直观也是最基础的评价指标。如果脱酸后的pH值不达标，其他各项指标性能再好也是妄谈。”田周玲查阅过国外的相关文献，美国国会图书馆等机构的模拟老化试验研究显示，脱酸后，文献的寿命可以延长3到5倍。　　批量处理：与时间赛跑　　试管、试剂、显微镜、电脑，乍看起来，这个实验室与其他生物、化学实验室似乎也没有太大不同。直到走进最里面的房间，才发现一个与众不同的“大家伙”，不锈钢结构，两米多高，长、宽在一米左右——这就是我国首个自主研发的批量文献脱酸设备。　　文献保护是一场与时间的赛跑。常常是还没来得及保护，文献就发生了无可挽回的残损。对海量酸化严重的文献，一页一页地脱酸甚至一本一本地脱酸，无疑都太慢了。美国、德国、法国、英国、加拿大、意大利等国家早已进入规模化脱酸阶段。　　曾有国外厂商找到国家图书馆古籍馆副馆长陈红彦，一台脱酸设备报价3000万元人民币。一旦购买了国外的脱酸设备，就要购买相应的脱酸液，每公斤折合人民币1100元，价格同样十分高昂。自主研发纸张脱酸技术，成为中国古籍保护工作迫在眉睫需要解决的课题。　　“20世纪80年代中期，南京博物院、中国人民大学先后研制成功纸张气相脱酸技术，但由于所用脱酸剂对环境存在安全隐患，推广应用受到了限制。国家档案局、上海图书馆等单位对纸张也进行过脱酸应用的研究，但只限于单页纸张脱酸处理。”田周玲说，该实验室2009年正式投入使用后，就把脱酸工艺作为重要研究方向。2015年，在民国时期文献保护计划的支持下，还承担了“民国时期文献脱酸研究与脱酸设备研制”项目。　　仅仅花费了30多万元，这个实验室就设计制造了这样一台集储液系统、脱酸系统、冷凝系统和控制系统于一体的脱酸设备，填补了国内相关领域的空白。与此同时，自主研制的脱酸液成本也下降为进口产品的十分之一。　　“这个设备有一个脱酸提篮，一次能放入20到50本书图书。不需要拆装订，随着提篮缓慢摇摆，文献的纸张就可以与脱酸液密切接触，达到比较好的脱酸效果。”田周玲说，提篮的摇摆频率还可以根据纸张的脆化程度进行调节，最大限度地避免对文献造成二次伤害。　　田周玲预计，再经过一段时间的检测，这个脱酸设备就能应用到馆藏民国文献的脱酸工作中。随着这种脱酸设备在全国推广开来，古籍特别是民国文献保护的困局将得到进一步缓解。

瓜氨酸化是影响蛋白质结构和功能的关键的翻译后修饰。尽管它与各种生物过程和疾病发病紧密相关，但由于缺乏有效的方法来富集、检测和定位该翻译后修饰，其潜在机制仍然知之甚少。近期，威斯康星大学麦迪逊分校李灵军教授课题组报道了生物素硫醇标签的设计和开发，该标签能够通过质谱法对瓜氨酸化进行衍生化、富集来实现可靠的鉴定。作者对小鼠组织的瓜氨酸化蛋白质组进行了全局分析并且从432种瓜氨酸化蛋白质中识别出691个修饰位点，这是迄今为止最大的瓜氨酸化数据集。作者发现并阐述了这个翻译后修饰的新的分布和功能并且表示该方法有希望为进一步破译瓜氨酸化的生理和病理作用奠定基础。这项工作以“Enabling Global Analysis Of Protein Citrullination Via Biotin Thiol Tag-Assisted Mass Spectrometry”为题发表在国际化学权威杂志Analytical Chemistry上 (https://doi.org/10.1021/acs.analchem.2c03844)，文章作者为Yatao Shi#, Zihui Li#, Bin Wang#，Xudong Shi , Hui Ye, Daniel G. Delafield, Langlang Lv, Zhengqing Ye, Zhengwei Chen, Fengfei Ma，Lingjun Li*。此外，李灵军教授课题组进一步拓展了此方法的实用性。作者通过应用二甲基化亮氨酸(DiLeu)等重标记策略第一次实现了瓜氨酸化的高通量定量研究，并利用这一方法揭示了瓜氨酸化在人体细胞DNA损伤及修复过程中的重要作用。相关成果以“12-Plex DiLeu Isobaric Labeling Enabled High-Throughput Investigation of Citrullination Alterations in the DNA Damage Response”为题同样发表在Analytical Chemistry上(https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c04073)，文章作者为Zihui Li, Bin Wang, Qinying Yu, Yatao Shi, Lingjun Li*。　　研究的主要内容　　作者设计了一种生物素硫醇标签，它可以很容易的以低成本合成并且可以与瓜氨酸残基和2,3-丁二酮发生特异性反应(图 1a)。这种衍生化不仅增加了质量转移以允许更可靠的鉴定，而且还引入了生物素部分，使修饰分子的后续富集成为可能。该生物素硫醇标签设计具有紧凑的结构，在高能碰撞解离 (HCD) 期间仅产生两个碎片/诊断离子(图 1b)。 因此，肽主链可以保持良好的裂解效率，并在 HCD 或电子转移解离 (ETD) 期间分别产生丰富的b/y或c/z离子系列。在 HCD(图 1c)、ETD或电子转移/高能碰撞解离(EThcD)碎裂下，衍生化肽标准品的序列收集质谱图几乎完全覆盖相应的肽序列。实验结果表明生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸化肽可以产生用于解析及标注的高质量的串联质谱图，并且与各种裂解技术相结合时可以提高瓜氨酸化位点的识别可信度。　　图1|用于瓜氨酸化分析的生物素硫醇标签设计。a，使用生物素硫醇标签和 2,3-丁二酮对瓜氨酸肽进行衍生化。 b，HCD、ETD 或 EThcD 片段化后生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸化肽的片段化位点。c，HCD裂解后生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸肽标准品 SAVRACitSSVPGVR 的串联质谱图。　　在接下来的实验中作者使用该生物素硫醇标签和基于质谱的自下而上的蛋白质组学方法对瓜氨酸化进行分析(图2a)。作者在体外利用 PAD(一种可以催化瓜氨酸化的酶)催化的人组蛋白 H3 蛋白来验证这个过程。作为未被PAD催化的阴性对照，未发现组蛋白的肽段被鉴定为瓜氨酸化，证明了生物素标签反应的高特异性(图 2b)。在体外 PAD 处理后，作者 发现许多精氨酸残基被催化为瓜氨酸，并且大量的位点被高可信度的鉴定为瓜氨酸化位点(图 2c)，进一步表明该方法的高效性。在 HCD 碎裂后，其产生了一系列丰富的 b/y 离子，可以帮助准确的表征在同一肽段上单个(图 2d)以及多个(图 2e)瓜氨酸化位点。　　图2|使用生物素硫醇标签进行体外瓜氨酸化分析。a，使用生物素硫醇标签进行蛋白质瓜氨酸化分析的实验工作流程。b、c，在体外 PAD 处理之前 (b) 和之后 (c) 组蛋白 H3 蛋白的瓜氨酸化分析。 已识别的瓜氨酸化位点在序列中以蓝色字母突出显示。 序列下方的红色矩形表示鉴定的瓜氨酸化肽，而瓜氨酸化位点以蓝色显示。 d，PAD处理的组蛋白 H3 (R64Cit) 的已鉴定瓜氨酸化肽的串联质谱图示例。 e，PAD 处理的组蛋白 H3 的同一肽上鉴定的两个瓜氨酸化位点(R70Cit 和 R73Cit)的串联质谱图示例。　　接下来，作者们尝试利用所开发的方法对复杂的生物样本中的瓜氨酸化进行全局分析，并希望能够以此提供阐明生物体中瓜氨酸化调节机制的依据。首先，作者对小鼠的六个身体器官和五个大脑区域进行了深入的瓜氨酸组分析，生成了第一个小鼠瓜氨酸组组织特异性数据库。作者从432种瓜氨酸化蛋白质中以高置信度的方式鉴定了691个瓜氨酸化位点(图 3a)。更重要的是，这些蛋白质中约有 60% 未曾在UniProt 数据库检索并被报道，这一结果极大地扩展了对瓜氨酸化以及这些底物蛋白质如何受到瓜氨酸化影响的理解。作者发现结果中与 UniProt 数据库的已知的瓜氨酸位点重叠部分较少(图 3b)，这可能是因为 UniProt 中描述的近 40% 的瓜氨酸化位点是基于相似性外推理论而没有实际的实验证据。此外，许多报道的位点位于组蛋白上，尤其是蛋白质末端，可能会逃过自下而上质谱策略的检测(图 3b)。图 3c 展示了单位点瓜氨酸化和多位点瓜氨酸化蛋白质分布情况，其中 70% 的已鉴定蛋白质仅有一个瓜氨酸化位点被检测到。　　这个新发现的瓜氨酸化蛋白质组为推测瓜氨酸化的调控机制提供了宝贵的资源。例如，作者在髓鞘碱性蛋白(MBP)上鉴定到了九个瓜氨酸化位点，而在 UniProt 数据库中只有四个(图3d)。作者的结果提供了高质量的串联质谱图，不仅证实了已知修饰位点的存在(图3e)，而且还高可信度的识别了未知的位点(图 3f)。然后作者进行了瓜氨酸化肽段的序列分析，发现在鉴定的瓜氨酸化位点两侧并没有高度保守的氨基酸序列模式(图3g)，但是谷氨酸残基更频繁地出现在瓜氨酸的N末端侧附近。这与Fert-Bober 等人报道的小鼠瓜氨酸组分析结论一致。另一方面，Tanikawa 等人发现在人体组织和血浆中大约五分之一的 PAD4 底物含有 RG/RGG 基序。同样，Lee 等人及相关研究人员观察到天冬氨酸和甘氨酸残基在瓜氨酸化位点出现频率偏高。值得注意的是，这些研究使用了不同的人源细胞系或组织，因此作者的结果可能表明在不同物种之间瓜氨酸化位点周围的序列模式是不同的。为了更好地辨别瓜氨酸化蛋白质所涉及的功能，作者展示了基因本体论(GO)富集分析的热图，其显示了二十个最显著富集的细胞成分(图3h)以及KEGG途径(图3i)。作者发现小鼠大脑组织和身体器官之间存在明显差异，而瓜氨酸蛋白更多地参与大脑功能。具体来说瓜氨酸化蛋白质集中在轴突、髓鞘、核周体和突触中，因此在中枢神经系统中可能发挥着重要的作用。　　图3|不同小鼠组织的大规模瓜氨酸组分析。a，不同小鼠组织中已鉴定的瓜氨酸化蛋白和瓜氨酸化位点的数量。 b，本研究中鉴定的瓜氨酸化位点与 UniProt 数据库中报告的位点比较。 c，每个鉴定的瓜氨酸化蛋白质的瓜氨酸化位点数量分布。d，本研究中确定的瓜氨酸化位点与 UniProt 数据库中关于髓鞘碱性蛋白的瓜氨酸化位点的比较。e、f，在髓磷脂碱性蛋白 R157Cit (e) 和 R228Cit (f) 上鉴定的两个瓜氨酸化位点的示例串联质谱图。g，鉴定的瓜氨酸化肽的序列。瓜氨酸化位点位于中间的“0”位置。字母的高度表示每个氨基酸在特定位置的相对频率。 h,i，使用 Metascape 生成的热图显示不同小鼠组织中显着丰富的(p 值 0.01)细胞成分 (h) (KEGG) 通路 (i)。　　为了进一步拓展该方法的实用性，作者应用了二甲基化亮氨酸(DiLeu)等重标记策略，第一次实现了对瓜氨酸化进行高通量的定量研究。作者首先使用瓜氨酸化标准肽段进行测试，证明在优化反应条件下DiLeu标记和生物素硫醇标记反应可以分步进行而不互相干扰(图 4B，4C)。同时，将标准肽段按照已知比例进行4-plex DiLeu标记并混合，再进行生物素硫醇标记和瓜氨酸化分析，结果显示了非常好的定量准确性(图5)。作者进一步优化了运用该方法在复杂生物样品中进行定量分析的实验方法，并且证明此方法依然可以实现极佳的定量准确度和精确度(图6)。　　图4|瓜氨酸化标准肽段测试DiLeu标记和生物素硫醇标记分步反应的特异性和效率　　图5|瓜氨酸化标准肽段测试DiLeu标记和生物素硫醇标记定量分析的准确性　　图6|复杂生物样品测试DiLeu标记和生物素硫醇标记定量分析的准确度和精确度　　作者接下来应用该方法对DNA损伤中瓜氨酸化的作用进行了研究。作者在MCF7细胞中用三种方法造成了DNA损伤，并定量分析了蛋白质瓜氨酸化的变化。作者一共鉴定到63种瓜氨酸化蛋白以及其包含的78个瓜氨酸化位点，并发现三个实验组中的瓜氨酸化表达相比于对照组呈现出非常不同的趋势(图7A)，这一结果表明瓜氨酸化在不同类型的DNA损伤模型中具有差异性的作用。通过对实验组中显著变化的瓜氨酸化蛋白进行生物过程网络分析，作者发现瓜氨酸化主要对DNA代谢，蛋白结构变化，翻译以及DNA修复等过程进行调控(图 7B，7C)。该实验结果表明蛋白瓜氨酸化对DNA损伤以及相关发病机理具有非常重要的作用。　　图7|高通量定量分析研究瓜氨酸化在DNA损伤中的变化及作用(来源：Anal. Chem.)　　小结　　本文章介绍了一种生物素硫醇标签的设计和开发，该标签可与瓜氨酸化肽段发生特异性反应并极大地提高了瓜氨酸化的富集和检测效率。在使用标准肽和重组蛋白证明该方法的有效性后，作者进一步优化了从复杂生物样品中检测瓜氨酸化的实验过程。通过此方法对小鼠五个大脑区域和六个身体器官的蛋白质瓜氨酸化进行分析，作者鉴定出432个瓜氨酸化蛋白以及691个瓜氨酸化位点，这是迄今为止最大的数据集。该研究揭示了这种翻译后修饰可能在神经系统中发挥的关键作用，并表明它们在包括呼吸和糖酵解在内的许多代谢过程中也可能发挥着重要作用。总的来说，实验结果表明蛋白质瓜氨酸化在不同组织中具有广泛分布并参与各种生物过程，这扩展了目前对蛋白质瓜氨酸化生理作用的认知和理解。此外，作者进一步拓展了此方法的实用性，通过应用DiLeu等重标记策略第一次实现了瓜氨酸化的高通量定量研究，并利用这一方法揭示了瓜氨酸化在人体细胞DNA损伤及修复过程中的重要作用。更重要的是，该方法可以提供一种普适、简单而强大的检测方法来明确鉴定蛋白质瓜氨酸化，这也将启发和有益于未来对这种翻译后修饰在生理和病理条件下的功能作用的研究。　　相关研究成果近期发表在Analytical Chemistry上的两篇文章中, 通过生物素硫醇标签辅助质谱法对蛋白质瓜氨酸化进行全局分析文章的共同第一作者是威斯康星大学麦迪逊分校博士生石亚涛，李子辉，王斌，并与中国药科大学叶慧教授课题组合作 应用二甲基化亮氨酸等重标记策略进行蛋白质瓜氨酸化高通量定量研究文章的第一作者是威斯康星大学麦迪逊分校博士生李子辉，两篇文章通讯作者为李灵军教授。更多关于李灵军教授研究团队的最新研究进展欢迎登陆课题组网站：https://www.lilabs.org/

大家好，本周为大家介绍一篇发表在J. Am. Chem. Soc.上的文章，Transient Structural Dynamics of Glycogen Phosphorylase from Nonequilibrium Hydrogen/Deuterium-Exchange Mass Spectrometry，文章作者是英国埃克塞特大学的Jonathan J. Phillips。　　变构调节指在蛋白质的正构位点上的变化通过蛋白质内部传递，最终影响到变构位点的结构，从而调整白质功能。理解蛋白质功能转换背后的特定结构动态变化对于分子生物学和药物发现领域至关重要。尽管变构现象自从提出以来已有广泛的研究，但是关于信号如何在蛋白质内部长距离传递的具体机制仍然不甚清楚。很大程度上是由于缺乏能够在时间和空间上高分辨率测量这些信号的生物物理方法。糖原磷酸化酶(glycogen phosphorylase，GlyP)是研究变构调节常用的标准蛋白，GlyP与II型糖尿病和转移性癌症的治疗密切相关。GlyP作为一种典型的变构酶，其活性受磷酸化修饰、多种天然配体和药物的调控。本文旨在通过开发和应用非平衡毫秒级氢/氘交换质谱(neHDX-MS)技术，来精确定位GlyP在变构激活和抑制期间的动态结构变化。这项技术能够提供蛋白质在毫秒时间尺度上的局部结构动态信息，有助于揭示变构调节过程中的瞬态结构特征，从而为理解蛋白质的动态行为和设计变构调节剂提供重要的结构信息。　　作者首先确定了能够完全激活或抑制GlyP的条件。25 mM 的AMP能实现GlyPb的最大激活(图1A)。32 mM咖啡因足以完全抑制GlyPa(图1B)。并且观察到50ms内AMP和咖啡因能够达到最佳激活/抑制状态(图1C和1D)。　　图1.糖原磷酸化酶b的变构激活和糖原磷酸化酶a的抑制。　　随后作者通过neHDX-MS捕捉由AMP引起的GlyPb变构激活过程中的局部结构扰动。通过激活过渡态与未激活和激活状态之间的HDX差异，作者将这些肽段分成了七个类群。其中重点值得关注的类群是c、d(其他类群对应区域及趋势不在此详细介绍)，因为他们的HDX行为与未激活和激活时的稳定态都有明显差异，这些局部区域的结构变化是过渡态的独特体现(图2A)。其中，c类群主要涵盖了tower helix区(图2B)，说明该区域在从未激活到激活状态的过渡态中，表现出相较于前后二者皆较高的动态性。d类群涵盖活性位点，说明活性稳点结构在因结合发生了结构稳定化现象。为了从原子水平理解这些瞬态结构变化，研究人员使用了一种基于Energy Calculation and Dynamics(ENCAD)的方法，Climber，来模拟从非活性状态到活性状态转变过程中的过渡态内部作用变化。结果显示，tower helix在激活过程中经历了氢键先断裂后形成的变化，这与观察到的HDX增加相一致(图4A)。　　图2.GlyPB中表现不同结构动力学行为的类群。　　图3.局部区域HDX动力学。　　图4.GlyP在活性和非活性状态之间的结构插值。　　随后作者探讨了咖啡因如何通过变构抑制影响GlyPa的结构动态。同样作者也比较了抑制过渡态与未抑制和抑制状态之间的HDX差异，分成了七个类群。在这几组类群中，仅有m表现出较未抑制和抑制状态都较明显的氘代上升趋势(图2C、图3C&D)。m区域涵盖了tower helix区(图2D)，说明该区域在未抑制状态到完全抑制状态的过渡阶段内，发生了局部去结构化现象。此外，在280s loop和250′ loop区域也表现出类似的瞬时去稳定化现象。结合AMP激活实验中的现象表明，尽管咖啡因和AMP作用于GlyP的不同位点，但它们都可能通过类似的变构路径(即tower helix的去稳定化)来引起GlyP的变构调节，从而实现对该蛋白功能的调控。同样在Climber分析中，可以观察到对应区域发生了氢键重排，与neHDX-MS结果呼应(图4B)。　　本文讨论了GlyP的变构调节中间态涉及的局部结构动态变化，并通过毫秒级neHDX-MS揭示了这些变化。结果表明激活和抑制过渡态都涉及到tower helix的氢键断裂和局部结构重排，这是两个途径的共同特点。本研究的亮点在于开发了一种新的neHDX-MS方法，能够在毫秒时间尺度上观察蛋白质的变构结构动态。这种方法不仅对理解GlyP的变构机制具有重要意义，而且可以广泛应用于不同蛋白质的变构研究，为理解蛋白质的变构调节提供了新的视角和工具。　　撰稿：罗宇翔　　编辑：李惠琳　　文章引用：Transient Structural Dynamics of Glycogen Phosphorylase from Nonequilibrium Hydrogen/Deuterium-Exchange Mass Spectrometry　　参考文献　　Kish, M. Ivory, D. P. Phillips, J. J., Transient Structural Dynamics of Glycogen Phosphorylase from Nonequilibrium Hydrogen/Deuterium-Exchange Mass Spectrometry. J. Am. Chem. Soc. 2023, 146 (1), 298-307.

在国家自然科学基金的大力支持下(项目资助号：21021004)，中国科学院大连化学物理研究所邹汉法研究员在磷酸化蛋白质组分析技术方面获得新进展，相关成果发表在最近一期的Nature Protocols上(2013，8，461-480)。(http://www.nature.com/nprot/journal/v8/n3/abs/ nprot.2013.010.html)。 　　固定化金属离子亲和色谱(IMAC) 是磷酸化蛋白质组学研究中最常用的磷酸化肽段富集技术之一，常规的IMAC使用的螯合基团有三羧甲基乙二胺、次氨基乙酸、亚氨基二乙酸等，在螯合铁、镓等金属离子后可用于磷酸肽的富集。其缺点是特异性不高，在富集磷酸肽的同时也富集了一些酸性肽。研究人员发现了磷酸酯锆或钛表面与磷酸肽之间的高特异性相互作用，并利用这一相互作用建立了以磷酸基团为螯合配体的新一代固定化金属离子亲和色谱技术。实验表明，该新型IMAC对磷酸肽富集的特异性优异，可以有效避免酸性肽段的非特异性吸附。与传统的IMAC相比较，其对磷酸肽的富集能力提高3-10倍，从而大大提高了蛋白质磷酸化分析的检测灵敏度和鉴定覆盖率。该新型IMAC方法自2006年发表首篇论文以来，已在Mol. Cell. Proteomics, J. Proteome Res., Anal. Chem.等蛋白质组学与分析化学权威期刊发表论文20余篇，其中2007年发表在Mol. Cell. Proteomics的一篇论文已经被引用110余次。采用该方法为核心技术进行了人类肝脏蛋白质磷酸化的规模化分离鉴定，建立了迄今为止国际上人类肝脏蛋白质磷酸化的最大数据集 (Mol. Cell. Proteomics，2012，11，1070-1083)。

中国石油勘探开发研究院（RIPED）中国石油勘探开发研究院（Research Institute of Petroleum Exploration & Development）是中国石油面向全球石油天然气勘探开发的综合性研究机构，主要肩负全球油气业务发展战略规划研究、油气勘探开发重 大应用基础理论与技术研发、全球油气业务技术支持与生产技术服务、高层次科技人才培养等职责，综合科研实力在国内石油上游研究领域处于领先地位。研究院成立于1958年，先后经历了石油科学研究院、石油勘探开发规划研究院、石油勘探开发科学研究院和中国石油勘探开发研究院四个发展阶段，是中国石油面向全球石油天然气勘探开发的综合性研究机构。建院以来，研究院直接参与了中国大多数陆上油气田以及中国石油海外油气的勘探发现与开发建设，为中国石油工业持续健康发展发挥了重要作用；建立完善了完整配套的中国陆相石油地质与油气田开发理论技术体系，获得国家和省部级科技成果600余项，在中国石油科技进步中做出了重要贡献；培养造就了一批以16名院士为代表的国内外知名专家，打造了一支强大的人才队伍，拥有技术人员近2000人，为中国石油工业建立了不朽功勋。在中石油勘探院的官网上展示了：提高石油采收率国家重点实验室、国家能源页岩气研发(实验)中心、以及12个公司重点实验室，众多先进的科学仪器设备为科研提供了坚实基础！提高石油采收率国家重点实验室提高石油采收率国家重点实验室是国家科技部于2008年4月批准建设的第一批36个企业国家重点实验室之一，以国家石油供应的需求为出发点，立足国内陆相沉积环境下、非均质严重的油藏特点，以油藏地质和油藏工程理论为指导，发展适合不同类型油藏的提高石油采收率技术，并大力促进提高采收率技术的产学研结合，扩大现场应用规模，通过完全自主的技术创新形成生产力。提高石油采收率国家重点实验室下分：油气藏形成与资源预测研究室，油气储层与渗流研究室，水驱提高采收率研究室，化学驱提高采收率实验室，热力采油研究室，CO2驱油与埋存中心以及综合管理办公室，另外在黑龙江大庆建立提高石油采收率试验基地，作为室内研究应用于油藏现场的试验平台。实验室拥有设备696台/套，其中大型仪器40余台/套（自主知识产权13台/套）和大型数值模拟软件10套；建成支撑油气形成与资源预测、化学驱提高采收率等方向的6个科研条件平台；总体达到了国际一流水平。国家能源页岩气研发(实验)中心2010年7月14日，国家能源局下发了＂国家能源局关于设立22个国家能源研发（实验）中心的通知＂，正式批准设立＂国家能源页岩气研发（实验）中心，于7月23日在北京人民大会堂正式授牌，2010年8月20日在中国石油勘探开发研究院廊坊分院页岩气研发中心揭牌。在国家能源局的领导和支持下，依托中国石油天然气集团公司，在廊坊分院建设页岩气研发中心，立足于页岩气勘探开发关键技术攻关，产学研相结合，科研服务生产为建设原则，建设成为我国页岩气行业的科技研发（实验）中心、页岩气工程技术服务中心、页岩气人才知识培训中心和信息中心。国家能源页岩气研发(实验)中心下设勘探技术研发部、开发技术研发部、钻完井技术研发部、增产改造技术研发部以及综合管理部。这里又有哪些科研设备呢？公司重点实验室官网中共展示了12个公司重点实验室，分别是油气地球化学实验室、油气储层重点实验室、盆地构造与油气成藏重点实验、碳酸盐岩储层重点实验室、测井重点实验室、天然气成藏与开发重点实验室、油层物理与渗透力学、稠油开采重点实验室、采油采气重点实验室、油田化学重点实验室、油气藏改造重点实验室和非常规油气重点实验室。油气地球化学重点实验室（KLPG）成立于1999年，是集团公司成立的第一个重点实验室。现有全二维气相色谱-飞行时间质谱仪、同位素质谱仪、色谱-质谱仪、色谱-质谱-质谱仪、多功能显微镜、生烃排烃热模拟设备、加氢热模拟设备等大中型仪器设备20多台套，达到了国际一流水平。色谱质谱实验室同位素质谱实验室气相色谱实验室全二维气相色谱-飞行时间质谱仪Qattro II 色谱-质谱-质谱仪DSQ II 气相色谱-色谱质谱仪MSSV-气相色谱-色谱质谱仪MAT 253 同位素质谱仪Delta V 同位素质谱仪黄金管热模拟装置油气生成与排驱物理模拟系统油气储层重点实验室是1999年中国石油天然气集团公司成立的首批重点实验室之一。现有储层成岩模拟系统、激光在线同位素质谱仪、电子探针、扫描电镜、X衍射仪、探地雷达、伽玛能谱仪、便携式矿石元素分析仪、阴极发光仪、显微镜、冷热台及沉积储层频谱成像软件、层序地层模拟软件等40台套实验分析软硬件设备，可满足储层实验新技术开发及市场服务的基本要求。储层成岩模拟系统激光-同位素质谱仪电子探针扫描电镜盆地构造与油气成藏重点实验室(KLBSHA)是中国石油天然气集团公司2007年批准建设的重点实验室，从事成藏年代学分析、物理模拟和数值模拟研究。设备共59台套，其中标志性设备2套。 盆地构造变形物理模拟设备 三维高温高压成藏物模设备显微激光拉曼光谱仪MM5400静态真空质谱计碳酸盐岩储层重点实验室于2007年成立，2010年正式试运行。拥有储层分析测试为主的实验设备30台，其中国际先进的实验设备12台，包括高温高压溶解动力学物理模拟装置、热电离同位素质谱仪、激光碳氧同位素仪、定制化工业CT和显微激光拉曼光谱仪等。高温高压溶解动力学物模装置（非标）热电离同位素质谱仪电子探针定制化工业CT显微激光拉曼光谱仪扫描电子显微镜测井重点实验室设计并委托国际著名公司制造了高温高压岩石电学和毛细管压力联测系统、高温高压驱替状态核磁共振测量系统，这两套系统是标志性的非标实验 系统，均居国际领先水平。另有常温高压驱替岩电测量系统、孔隙度测量仪、渗透率测量仪、岩心制备等实验配套设备，可以开展高温高压全直径岩石电学、核磁共 振等实验参数的测量，对提高复杂储层测井处理解释和评价能力有重要意义。高温高压岩石电学和毛细管压力联测系统（RCS-763Z）高温高压驱替状态核磁共振测量系统目前天然气成藏与开发重点实验室拥有大中型实验设备共56台套，新度系数接近0.7，仪器设备总体运行水平和使用率高。主要开展天然气系列分析、源岩生烃系列模拟、天然气成藏物理模拟、包裹体系列分析、储盖层评价、特殊气藏开发机理与储层渗流动态模拟实验研究。天然气组份及轻烃分析仪MAT253同位素质谱仪稀有气体同位素质谱仪天然气成藏模拟系统高温高压扩散系数测定仪全直径长岩心流动模拟实验装置油层物理与渗流力学重点实验室成立于2000年，各实验方法、模拟方法均达到国内领先，并与世界水平同步。长岩心驱替系统高温高压三维胶结物理模型 CT扫描系统地层条件下岩心分析系统高温高压多相流体渗流实验系统核磁共振仪目前，实验室拥有52台(套)先进的设备及软件，新度系数达到0.91，研究手段系列配套，性能指标高端先进，整体达到国际先进水平。稠油油藏高温相对渗透率装置加速绝热量热仪测试系统热重/差示扫描量热同步分析系统高压注气模拟实验装置一维岩心驱替实验装置高温高压注蒸汽二维比例物理模拟实验系统高温高压注蒸汽三维比例物理模拟实验系统三维火驱实验装置采油采气重点实验室从2006年开始建设，共有仪器设备及软件65台（套），拥有调堵摸拟实验系统、油气藏地应力综合测试系统、套管损坏测试系统、转向均匀酸化模拟系统等多套特色和标志性装置，在五个研究方向上仪器设备基本配套、部分实验手段独有，可较长时间保持国内领先、国际先进。调堵模拟实验装置油气藏地应力综合测试系统高温高压注蒸汽二维比例物理模拟实验系统油气生产优化与设计油田化学重点实验室的主要研究工作是根据中国石油天然气集团公司的中、长期发展规划和油田生产需要，研究、开发各类新型实用的油田化学剂及其工业生产应用工艺技术，为集团公司及国内外油田提供技术咨询和服务。HAAKE MARS流变仪CaBER拉伸流变仪TX-500C旋转滴界面张力仪泡沫扫描仪动态接触角与表面张力仪差示扫描量热仪凝胶渗透色谱膜天平 显微镜界面流变仪激光粒度仪电感耦合等离子发射光谱仪Zeta电位仪油气藏改造重点实验室拥有各类实验设备200台（套），其中大型实验设备16套，其中包括导流能力测试系统、岩石力学实验系统、环境扫描电镜、高温高压流变仪、酸蚀裂缝导流能力实验仪、压裂液动态滤失与伤害实验仪。可从事压裂酸化多方面研究与实验测试。同时自主研发了可视化裂缝酸岩反应物模、可视化水平井管路液体流态大型物模、支撑剂气体和液体长期导流能力测试装置、均匀布酸模拟实验装置等设备。为原始创新填补了相关方面的空白，也为基础数据的产生和获得提供了新的手段。岩石力学实验系统支撑剂评价实验系统酸蚀裂缝导流实验系统2008年，中国石油天然气集团公司批准成立非常规油气重点实验室，实验室功能定位是：建设成集煤层气业务、油砂、油页岩业务、页岩气业务、水合物业务等于一体的一个综合性实验研究平台。原有仪器设备51台套，新引进设备26台套，其中标志性设备1台。煤层气成藏模拟仪X射线CT扫描显微镜小颗粒油页岩热灰干馏评价装置激光法导热分析仪近日，在塔克拉玛干沙漠腹地、塔里木河南部一万平方公里的富满地区，中国石油塔里木油田新发现10亿吨级超深大油气区，这是中石油6年集中勘探的结果；在鄂尔多斯盆地长7石油勘探也获得重大成果，探明地质储量超10亿吨的页岩油整装大油田，成为我国目前探明储量规模最大的页岩油大油田，近三年来页岩油气领域接连获得重大发现和突破性成果。

蛋白质磷酸化是在激酶催化下将磷酸基团转移到底物蛋白质上的可逆过程，是能够调控蛋白质结构与功能且参与细胞内信号转导的重要翻译后修饰，在植物的生长、发育、环境适应以及作物的产量和品质调控中发挥着重要作用。深度解析磷酸化蛋白质组，是探讨磷酸化如何参与这些生物学过程以及筛选与作物重要农艺性状相关的关键磷酸化靶点的有效手段。然而，与动物相比，植物磷酸化蛋白质组的深度解析在技术上更具挑战性。这是由于植物细胞具有致密的细胞壁和大量的色素以及其他次生代谢物。前者增加了蛋白质提取的难度，而后者干扰了磷酸肽富集的效率和特异性。 中国科学院遗传与发育生物学研究所汪迎春研究组通过探索一系列的实验条件，研发出高效的植物磷酸化蛋白质组学新技术。该技术的主要特点是利用脱氧胆酸钠高效抽提植物蛋白，同时消除常规方法中导致样品损失和灵敏度降低的两个步骤，即在蛋白酶消化前的样品净化和在磷酸肽富集前的脱盐处理，在色素与其他干扰分子共存的情况下进行高特异性、高灵敏度地磷酸肽富集。 科研人员应用这一方法，在拟南芥、水稻、番茄和衣藻等绿色生物的组织中高效纯化磷酸化蛋白质组（单针质谱可鉴定约11,000个磷酸位点）。由于该技术主要面向高等植物及其他绿色生物（如衣藻），且操作简便，降低了实验所需的人力和试剂费用，因此命名为GreenPhos。GreenPhos可定量分析不同植物的磷酸化蛋白组，分析深度深、定量重复性高，有望成为植物磷酸化蛋白组学的通用技术。研究人员应用该技术，深度解析了拟南芥响应不同时长盐胁迫的差异磷酸化蛋白质组，发现了包括剪接体蛋白和一些激酶响应盐胁迫的磷酸化事件。 11月27日，相关研究成果在线发表在《分子植物》（Molecular Plant，DOI：10.1016/j.molp.2023.11.010）上。研究工作得到国家重点研发计划与中国科学院战略性先导科技专项的支持。中国科学院植物研究所的科研人员参与研究。GreenPhos工作流程及多种绿色生物磷酸化蛋白质组鉴定结果

p 　　 strong 仪器信息网讯 /strong 2018年9月27日，LGC宣布收购位于美国密歇根州的Berry & amp Associates，以加强其核酸化学组合。该交易的财务条款尚未披露。 /p p 　　Berry & amp Associate向制药、临床诊断和学术研究领域的客户销售低聚试剂，其客户还包括寡核苷酸合成公司和合同制造组织。该公司成立于1989年，拥有14名员工。 /p p 　　LGC Genomics总裁兼董事总经理Brian Kim在一份声明中说：“Berry & amp Associate将成为LGC在北美的重要业务中心，它将通过多站点制造以及美国市场的本地服务与技术支持，为我们的客户提高供应链的弹性。” /p p 　　Berry的所有者Lana Berry也指出，该公司目前拥有400多种亚磷酰胺和用于寡核苷酸合成的固相连接单体，以及数百种核苷、间隔基、荧光标记、猝灭剂和杂环化合物，将作为LGC的一部分，扩大产品组合。 /p p 　　近年来，总部位于伦敦的LGC通过大量收购，包括2015年收购Biosearch Technologies，2016年收购Prime Synthesis，2017年收购Link Technologies，以及今年早些时候的BioAutomation，一直在增加其在核酸化学市场的份额。 /p p 　　LGC还在2月收购了Lucigen，扩大了其在新一代测序中的商业足迹。 /p

一、项目基本情况：1.项目编号：JXBJ24121308301-1项目名称：江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所农业农村部酸化土改良与利用重点实验室仪器设备采购项目01包采购方式：公开招标预算金额：4120000.00 元最高限价：4120000.00采购需求：采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算（人民币）技术需求或服务要求赣购2024F001121002稳定同位素比质谱仪1台4120000.00元详见公告附件合同履行期限：合同签订生效后120个日历日内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。2.项目编号：JXBJ24121308301-2项目名称：江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所农业农村部酸化土改良与利用重点实验室仪器设备采购项目02包采购方式：公开招标预算金额：3280000.00 元最高限价：3280000.00采购需求：采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算（人民币）技术需求或服务要求赣购2024F001120994四极杆飞行时间液质联用仪1台3280000.00元详见公告附件合同履行期限：合同签订生效后90个日历日内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。3.项目编号：JXBJ24121308301-3项目名称：江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所农业农村部酸化土改良与利用重点实验室仪器设备采购项目03包采购方式：公开招标预算金额：2580000.00 元最高限价：2580000.00采购需求：采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算（人民币）技术需求或服务要求赣购2024F001120995多功能酶标仪1台480000.00元详见公告附件赣购2024F001120999自动微生物鉴定分析系统1台1400000.00元详见公告附件赣购2024F001120998全自动脂肪酸分析菌种鉴定系统1台700000.00元详见公告附件合同履行期限：合同签订生效后90个日历日内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。4.项目编号：JXBJ24121308301-4项目名称：江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所农业农村部酸化土改良与利用重点实验室仪器设备采购项目04包采购方式：公开招标预算金额：2400000.00 元最高限价：2400000.00采购需求：采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算（人民币）技术需求或服务要求赣购2024F001120996全自动间断化学分析仪1台620000.00元详见公告附件赣购2024F001121001扫描电子显微镜1台1780000.00元详见公告附件合同履行期限：合同签订生效后90个日历日内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。5.项目编号：JXBJ24121308301-5项目名称：江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所农业农村部酸化土改良与利用重点实验室仪器设备采购项目05包采购方式：公开招标预算金额：2350000.00 元最高限价：2350000.00采购需求：采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算（人民币）技术需求或服务要求赣购2024F001121000气相色谱三重四极杆质谱联用仪1台1680000.00元详见公告附件赣购2024F001120997电感耦合等离子体发射光谱仪1台670000.00元详见公告附件合同履行期限：合同签订生效后90个日历日内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。6.项目编号：JXBJ24121308301-6项目名称：江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所农业农村部酸化土改良与利用重点实验室仪器设备采购项目06包采购方式：公开招标预算金额：1800000.00 元最高限价：1800000.00采购需求：采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算（人民币）技术需求或服务要求赣购2024F001120989激光粒度分析仪1台490000.00元详见公告附件赣购2024F001120991傅里叶近红外光谱仪1台445000.00元详见公告附件赣购2024F001120990纳米粒度及ZETA电位分析仪1台410000.00元详见公告附件赣购2024F001120992研究级傅里叶变换红外光谱仪1台455000.00元详见公告附件合同履行期限：合同签订生效后90个日历日内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。7.项目编号：JXBJ24121308301-7项目名称：江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所农业农村部酸化土改良与利用重点实验室仪器设备采购项目07包采购方式：公开招标预算金额：1950000.00 元最高限价：1950000.00采购需求：采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算（人民币）技术需求或服务要求赣购2024F001120988便携式X荧光重金属分析仪1台450000.00元详见公告附件赣购2024F001120993X射线衍射仪1台1300000.00元详见公告附件赣购2024F001120987微波消解仪1台130000.00元详见公告附件赣购2024F001120986全自动石墨消解仪1台70000.00元详见公告附件合同履行期限：合同签订生效后150个日历日内完成安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。二、获取招标文件：时间：2024年04月07日 至 2024年04月12日，每天上午0:00至12:00，下午13:00至23:30（北京时间，法定节假日除外 ）地点：江西省公共资源交易网（网址：https://ggzy.jiangxi.gov.cn/）方式：登陆网站报名并下载招标文件。（下载招标文件时遇到问题可拨打客服电话400-998-0000咨询）售价：0.00元三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系：1.采购人信息名称：江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所地址：江西省南昌市南昌县莲塘北大道1738号联系方式：0791-827286752.采购代理机构信息名称：江西省百巨招标咨询有限公司地址：江西省南昌市红谷滩区庐山南大道1999号保利高尔夫花园配套中心3#商业楼店面110-113室联系方式：0791-852398873.项目联系方式项目联系人：艾汕辉、黄颖慧、马俊、刘玲电话：0791-85239887

仪器信息网讯 近日，中国科学院大连物理研究所生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员和张玉奎院士团队，蛋白组组学分析最新成果发表于《自然-通讯》(Nature Communications)上。团队发展了N-磷酸化肽段高选择性富集新方法，并结合肽段的高效分离和高灵敏度鉴定，实现了N-磷酸化蛋白质组的深度覆盖分析。　　与研究相对深入的发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸侧链氨基上的蛋白质O-磷酸化修饰相比，发生在蛋白质组氨酸、精氨酸和赖氨酸上的N-磷酸化修饰，由于P-N酰胺键具有较高的吉布斯自由能，且易发生水解，目前仍缺乏有效的N-磷酸化蛋白质组分析方法，制约了人们对其生物学功能的认识。　　团队研制了具有核壳结构的亚二微米硅球，并通过在硅球表面键合双二甲基吡啶胺双锌分子，在中性条件下实现了N-磷酸化肽段的高效、高选择性、快速富集 通过基于该材料的on-tip富集方法和液质联用分离鉴定的结合，不仅从HeLa细胞中鉴定到3384个N-磷酸化位点(目前最大的哺乳动物N-磷酸化数据集)，而且还发现N-磷酸化位点附近亮氨酸高度表达 建立的N-磷酸化蛋白质组分析新方法不仅为深入研究其生物学功能提供了基础数据，而且也为推动精准医学、合成生物学等领域的发展提供了技术支撑。　　上述工作得到国家自然科学基金、国家重点研发计划、中科院大连化物所创新基金等项目的资助。文章链接：《自然-通讯》(Nature Communications)。

低场核磁技术：油气专家手中的“听诊器”与“手术刀”[导读] 如何唤醒更多的油气资源?如何做好油气储层的增产改造与保护评价?核磁共振作为一种先进的分析手段，在其中能发挥哪些作用?有研究显示，人的一生中仅衣食住行就要消耗8469千克石油。石油天然气作为重要的战略性矿产资源，不仅关系着人们的日常生活，对经济发展同样具有非凡意义。经过长达百年的开采，油气资源的开发难度不断加大，勘探对象也逐渐从常规转向非常规、从陆地转向海洋、从浅层浅水转向深层深水，对相关技术及装备提出越来越高的要求。如何唤醒更多的油气资源？如何做好油气储层的增产改造与保护评价？核磁共振作为一种先进的分析手段，在其中能发挥哪些作用？带着疑问，仪器信息网近日采访了西南石油大学油气藏地质及开发工程国家重点实验室唐洪明教授，以及西南石油大学副校长郭建春教授团队的赖杰博士。基于低场核磁，对油气储层“望闻问切” 油气藏，地壳上油气聚集的基本单元。我们认知的石油天然气通常从这类圈闭中采集得出，因此油气藏又被称为储存油气的天然“仓库”。地壳中的油气藏可分为常规和非常规两大类型，近年来随着非常规油气的不断发现和研究探索的不断深入，建立在常规油气藏研究基础上的传统石油地质学理论和方法越来越难以适应油气勘探开发新形势的需要，众多学者将兴趣点放到致密油气、页岩油气等非常规油气储层的研究中，而这也是唐洪明教授的研究方向之一。西南石油大学唐洪明教授唐洪明，西南石油大学教授，油气藏地质及开发工程国家重点实验室兼职研究员，四川省学术与技术带头人后备人选，主要从事油气储层损害机理与保护技术、非常规油气储层评价、开发地质学等领域的研究。2000年以来唐洪明教授先后主持、主研国家自然基金等5项，国家油气重大专项3项、国家高科技研究发展计划(863计划)1项。其中《川南海相页岩气开发气藏工程理论、方法与应用》等获省部级一等奖1项，《海上油田含聚污水回注技术研究与应用》等获省部级二等奖4项 授权发明专利10项 公开发表学术论文150余篇，其中SCI近20篇。省部级科技进步一等奖油气层保护技术是唐洪明教授主攻研究方向之一，该技术是个系统工程，从油气藏钻开到开发枯竭的各个环节需要实施储层保护。核心是利用各种技术，保持或者提高储层孔隙的渗流能力，实现油气藏高效持续、科学开发，降低成本，延长油气田开发寿命，提高油气采收率。据唐洪明教授介绍，原西南石油学院张绍槐院长、中国工程院罗平亚院士等专家是该技术的奠基人、开创者，经过一批专家学者的辛勤耕耘和传承，油气层保护已成为西南石油大学的传统优势学科，在国内外处于领xian水平。受老一辈专家鼓舞和以及对研究方向的好奇，1989年西南石油学院本科毕业的他毅然选择了加入油气保护技术的研究大团队，从此开启了整整30年的研究生涯。30年来，唐洪明教授在钻井、注水、修井过程中储层保护技术方面形成了自己的研究特色。组建的研究团队能够将油气地质与石油工程有机结合，将储层地质学、矿物岩石学、储层地质学等知识高度融合，解决石油工程中的技术难题，建立的储层保护与评价方法在中海油渤海、中石油新疆油田和塔里木油田等矿场得到了应用与推广，取得良好的社会与经济效益。唐洪明教授参观四川威远的中国页岩气第一井唐洪明教授的另一研究重点即开篇提到的非常规储层地质学研究，例如针对页岩气、致密油等，开展非常规优质储层控制因素研究，包括沉积、建模、成岩作用、非均质性、孔隙结构、可动流体饱和度等研究。随着研究探索的不断深入，这一部分就需要引入核磁共振设备。唐洪明教授团队基于核磁共振的成果(节选)唐洪明教授回忆说：“早年读研究生时我就对核磁共振设备有所耳闻，但当时设备以进口为主，价格昂贵，我对核磁的印象也一直停留在记忆中。后来随着非常规油气逐渐成为油气行业主角，低场核磁技术在油气勘探与开发中的文献越来越多，拥有一台核磁共振仪器也成了我和团队的梦想。”大口径核磁共振成像分析仪 MacroMR12-150H-I“十二五”期间中央财政资助地方高校进行配套设备采购，唐洪明教授通过多方了解，接触到了纽迈的低场核磁设备。经过多方论证，团队zui终购入纽迈的MacroMR12-150H-I的大口径核磁共振成像分析仪，利用T2谱分析测试储层可动流体饱和度、孔隙度、孔喉分布等参数，同时利用成像技术表征微观驱油、长期水驱孔隙结构、裂缝闭合规律等研究。相比其他分析方法，唐洪明教授认为低场核磁技术有其不可替代的优势：“它能够原位、定量表征储层驱替过程中的流体分布、孔隙结构等参数变化，同时对岩心没有破坏性，很多岩心可以重复使用，对研究成果的重现性奠定了基础。”与纽迈合作的过程中，公司经常在线指导、定期指派工程师上门维护也给唐洪明教授留下了深刻的印象。“能够保证设备长期有效运行，我认为这是一个公司做大、做强的担当与责任”。唐洪明教授补充说：“从国内外文献报道看，核磁共振已经成为研究非常规油气储层，非常重要、必不可少的手段。未来几年，在致密油、页岩气等非常储层地质特征研究、渗流机理、外流体与对岩石矿物反应机理、自吸与返排机理等方面有所突破，期待低场核磁技术在这些领域也能给我们提供强有力的技术支撑。”随着研发能力的不断进步，纽迈也开发了许多具有新功能的核磁共振设备，未来在经费和场地允许的情况下，唐洪明教授团队还有计划对设备进行升级改造。基于低场核磁，为油气储层“活血通脉” 另一位受访者赖杰博士师从教育部长江学者、国家杰出青年基金获得者郭建春教授。郭建春教授带领的课题组主要从事油气储层增产改造技术研究，重点围绕岩石、工作液、支撑剂三者之间的物理化学作用开展试验研究和理论分析，在深层非均质碳酸盐岩转向酸压技术、深层超高温储层压裂技术、水平井压裂缝网渗流与精细分段技术、支撑剂对流沉降规律与高效铺置技术等方面取得突出成果。作为课题组的一员，赖杰博士主要关注碳酸盐岩储层酸化工作液体系和工艺技术的研究。赖杰博士解释说：“碳酸盐岩主要成分是碳酸钙和碳酸钙镁，所谓‘酸化’可以理解成是把空白盐酸、胶凝酸、转向酸等不同酸液体系注入到岩石内部孔隙空间，酸液溶蚀掉部分岩石，扩大孔隙空间，从而增强石油、天然气从地底流出的能力，提高油气开采效率的过程。”酸化是油气储层增产增注的重要措施之一，碳酸盐岩中碳酸钙和碳酸钙镁的总含量通常超过90%，换句话说，大部分岩石组分都能被注入的酸液溶蚀，然而这并非研究者想要达到的zui佳状态。“我们希望酸液既能溶蚀部分岩石，扩大孔隙空间，足以让油气流到地面，又不至于产生过度溶蚀，导致岩石过于疏松而被压碎、垮塌，丧失流动通道。”酸岩反应前(左图)、后(右图)岩样端面图既要保证有序流动，又要维持岩石自身孔隙结构的完整性，就需要对酸岩反应前后岩石孔隙结构的变化规律进行研究。要揭示岩石在微观尺度上的孔隙结构特征，除了高压压汞、气体吸附、场发射电镜、CT扫描等传统方法，还有现在常用的低场核磁共振技术，因储层岩样的孔隙较小、孔隙空间分布非均质性很强，相比之下核磁共振技术具有无损检测、在线实时观测、测试效率高等特点，更能直观、准确地把握岩样整体的孔隙结构特征。“高压压汞、场发射电镜等方法会对测试岩样造成破坏，而开展了核磁共振测试的岩样还可以重复利用，这就保证了不同实验结果间较高的对比度。随着加温加压等配套设备的补齐，核磁共振仪器能还原地下高温高压环境，便于研究人员依据室内实验结果指导现场作业。”　目前，国内外采用核磁共振技术系统开展酸化研究的团队屈指可数，借助于西南石油大学石油与天然气工程学院引进的MacroMR12-150HTHP-I高温高压渗流可视化分析与成像系统，郭建春教授课题组正在这方面开展一系列创新性研究工作。但由于现有研究和应用相对较少，研究过程中也会遇到许多意料之外的问题，对仪器也提出了更高的要求。赖杰博士举例说：“酸液与碳酸盐岩发生化学反应后，产生的钙离子、镁离子导电产生新磁场，会对原有磁场形成干扰。酸液对金属容器、管线等也会造成腐蚀，因此要求仪器整体必须具备耐酸腐蚀性能。”针对这些新问题，石油与天然气工程学院正和纽迈分析仪器公司保持积极沟通，商讨解决方案，开启了高校与企业产学研合作的一种新模式。西南石油大学石油与天然气工程学院MacroMR12-150HTHP-I高温高压渗流可视化分析与成像系统[来源：仪器信息网]

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　　唐洪明，西南石油大学教授，油气藏地质及开发工程国家重点实验室兼职研究员，四川省学术与技术带头人后备人选，主要从事油气储层损害机理与保护技术、非常规油气储层评价、开发地质学等领域的研究。2000年以来唐洪明教授先后主持、主研国家自然基金等5项，国家油气重大专项3项、国家高科技研究发展计划(863计划)1项。其中《川南海相页岩气开发气藏工程理论、方法与应用》等获省部级一等奖1项，《海上油田含聚污水回注技术研究与应用》等获省部级二等奖4项 授权发明专利10项 公开发表学术论文150余篇，其中SCI近20篇。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/97f506a4-a949-4a3c-b08f-ce07cc85b32c.jpg" title=" 省部级科技进步一等奖_副本.jpg" alt=" 省部级科技进步一等奖_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong 省部级科技进步一等奖 /strong /p p 　　油气层保护技术是唐洪明教授主攻研究方向之一，该技术是个系统工程，从油气藏钻开到开发枯竭的各个环节需要实施储层保护。核心是利用各种技术，保持或者提高储层孔隙的渗流能力，实现油气藏高效持续、科学开发，降低成本，延长油气田开发寿命，最大限度提高油气采收率。据唐洪明教授介绍，原西南石油学院张绍槐院长、中国工程院罗平亚院士等专家是该技术的奠基人、开创者，经过一批专家学者的辛勤耕耘和传承，油气层保护已成为西南石油大学的传统优势学科，在国内外处于领先水平。 /p p 　　受老一辈专家鼓舞和以及对研究方向的好奇，1989年西南石油学院本科毕业的他毅然选择了加入油气保护技术的研究大团队，从此开启了整整30年的研究生涯。30年来，唐洪明教授在钻井、注水、修井过程中储层保护技术方面形成了自己的研究特色。组建的研究团队能够将油气地质与石油工程有机结合，将储层地质学、矿物岩石学、储层地质学等知识高度融合，解决石油工程中的技术难题，建立的储层保护与评价方法在中海油渤海、中石油新疆油田和塔里木油田等矿场得到了应用与推广，取得良好的社会与经济效益。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/399d492d-a1c2-47fb-87cc-29af29899c83.jpg" title=" 唐洪明教授参与勘探开发的位于四川威远的中国页岩气第一井：威201井_副本.jpg" alt=" 唐洪明教授参与勘探开发的位于四川威远的中国页岩气第一井：威201井_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong /strong /p p style=" text-align: center " strong 唐洪明教授参观四川威远的中国页岩气第一井 /strong /p p 　　唐洪明教授的另一研究重点即开篇提到的非常规储层地质学研究，例如针对页岩气、致密油等，开展非常规优质储层控制因素研究，包括沉积、建模、成岩作用、非均质性、孔隙结构、可动流体饱和度等研究。随着研究探索的不断深入，这一部分就需要引入核磁共振设备。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/baf27b44-6044-498d-9c10-f81eb99e3ae0.jpg" title=" 唐洪明教授团队基于核磁共振的成果（节选）.png" alt=" 唐洪明教授团队基于核磁共振的成果（节选）.png" / /p p style=" text-align: center " strong 唐洪明教授团队基于核磁共振的成果(节选) /strong /p p 　　唐洪明教授回忆说：“早年读研究生时我就对核磁共振设备有所耳闻，但当时设备以进口为主，价格昂贵，我对核磁的印象也一直停留在记忆中。后来随着非常规油气逐渐成为油气行业主角，低场核磁技术在油气勘探与开发中的文献越来越多，拥有一台核磁共振仪器也成了我和团队的梦想。” /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/22bf5cb5-2375-41ae-a27b-bd70409a8d65.jpg" title=" 大口径核磁共振成像分析仪 MacroMR12-150H-I_副本.jpg" alt=" 大口径核磁共振成像分析仪 MacroMR12-150H-I_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong 大口径核磁共振成像分析仪 MacroMR12-150H-I /strong /p p 　　“十二五”期间中央财政资助地方高校进行配套设备采购，唐洪明教授通过多方了解，接触到了纽迈的低场核磁设备。经过多方论证，团队最终购入纽迈的MacroMR12-150H-I的大口径核磁共振成像分析仪，利用T2谱分析测试储层可动流体饱和度、孔隙度、孔喉分布等参数，同时利用成像技术表征微观驱油、长期水驱孔隙结构、裂缝闭合规律等研究。 /p p 　　相比其他分析方法，唐洪明教授认为低场核磁技术有其不可替代的优势：“它能够原位、定量表征储层驱替过程中的流体分布、孔隙结构等参数变化，同时对岩心没有破坏性，很多岩心可以重复使用，对研究成果的重现性奠定了基础。”与纽迈合作的过程中，公司经常在线指导、定期指派工程师上门维护也给唐洪明教授留下了深刻的印象。“能够保证设备长期有效运行，我认为这是一个公司做大、做强的担当与责任”。 /p p 　　唐洪明教授补充说：“从国内外文献报道看，核磁共振已经成为研究非常规油气储层，非常重要、必不可少的手段。未来几年，在致密油、页岩气等非常储层地质特征研究、渗流机理、外流体与对岩石矿物反应机理、自吸与返排机理等方面有所突破，期待低场核磁技术在这些领域也能给我们提供强有力的技术支撑。”随着研发能力的不断进步，纽迈也开发了许多具有新功能的核磁共振设备，未来在经费和场地允许的情况下，唐洪明教授团队还有计划对设备进行升级改造。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px " span style=" color: rgb(255, 0, 0) font-size: 18px " strong 　　基于低场核磁，为油气储层“活血通脉” /strong /span /p p 　　另一位受访者赖杰博士师从教育部长江学者、国家杰出青年基金获得者郭建春教授。郭建春教授带领的课题组主要从事油气储层增产改造技术研究，重点围绕岩石、工作液、支撑剂三者之间的物理化学作用开展试验研究和理论分析，在深层非均质碳酸盐岩转向酸压技术、深层超高温储层压裂技术、水平井压裂缝网渗流与精细分段技术、支撑剂对流沉降规律与高效铺置技术等方面取得突出成果。 /p p 　　作为课题组的一员，赖杰博士主要关注碳酸盐岩储层酸化工作液体系和工艺技术的研究。赖杰博士解释说：“碳酸盐岩主要成分是碳酸钙和碳酸钙镁，所谓‘酸化’可以理解成是把空白盐酸、胶凝酸、转向酸等不同酸液体系注入到岩石内部孔隙空间，酸液溶蚀掉部分岩石，扩大孔隙空间，从而增强石油、天然气从地底流出的能力，提高油气开采效率的过程。” /p p 　　酸化是油气储层增产增注的重要措施之一，碳酸盐岩中碳酸钙和碳酸钙镁的总含量通常超过90%，换句话说，大部分岩石组分都能被注入的酸液溶蚀，然而这并非研究者想要达到的最佳状态。“我们希望酸液既能溶蚀部分岩石，扩大孔隙空间，足以让油气流到地面，又不至于产生过度溶蚀，导致岩石过于疏松而被压碎、垮塌，丧失流动通道。” /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/fcb0cc3b-e946-4a1f-a6b4-7ff4862466de.jpg" title=" 酸岩反应前（左图）、后（右图）岩样端面图.png" alt=" 酸岩反应前（左图）、后（右图）岩样端面图.png" / /p p style=" text-align: center " strong 酸岩反应前(左图)、后(右图)岩样端面图 /strong /p p 　　既要保证有序流动，又要维持岩石自身孔隙结构的完整性，就需要对酸岩反应前后岩石孔隙结构的变化规律进行研究。要揭示岩石在微观尺度上的孔隙结构特征，除了高压压汞、气体吸附、场发射电镜、CT扫描等传统方法，还有现在常用的低场核磁共振技术，因储层岩样的孔隙较小、孔隙空间分布非均质性很强，相比之下核磁共振技术具有无损检测、在线实时观测、测试效率高等特点，更能直观、准确地把握岩样整体的孔隙结构特征。“高压压汞、场发射电镜等方法会对测试岩样造成破坏，而开展了核磁共振测试的岩样还可以重复利用，这就保证了不同实验结果间较高的对比度。随着加温加压等配套设备的补齐，核磁共振仪器能还原地下高温高压环境，便于研究人员依据室内实验结果指导现场作业。” /p p 　　目前，国内外采用核磁共振技术系统开展酸化研究的团队屈指可数，借助于西南石油大学石油与天然气工程学院引进的MacroMR12-150HTHP-I高温高压渗流可视化分析与成像系统，郭建春教授课题组正在这方面开展一系列创新性研究工作。 /p p 　　但由于现有研究和应用相对较少，研究过程中也会遇到许多意料之外的问题，对仪器也提出了更高的要求。赖杰博士举例说：“酸液与碳酸盐岩发生化学反应后，产生的钙离子、镁离子导电产生新磁场，会对原有磁场形成干扰。酸液对金属容器、管线等也会造成腐蚀，因此要求仪器整体必须具备耐酸腐蚀性能。”针对这些新问题，石油与天然气工程学院正和纽迈分析仪器公司保持积极沟通，商讨解决方案，开启了高校与企业产学研合作的一种新模式。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/12a6853b-d262-4293-8c03-97615e184db3.jpg" title=" 西南石油大学石油与天然气工程学院MacroMR12-150HTHP-I高温高压渗流可视化分析与成像系统_副本.jpg" alt=" 西南石油大学石油与天然气工程学院MacroMR12-150HTHP-I高温高压渗流可视化分析与成像系统_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong 西南石油大学石油与天然气工程学院MacroMR12-150HTHP-I高温高压渗流可视化分析与成像系统 /strong /p

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2020年6月23日习近平总书记在全国禁毒工作先进集体和先进个人表彰会议上就禁毒工作做出了重要指示，要求坚持厉行禁毒方针，打好禁毒人民战争，完善毒品治理体系，深化禁毒国际合作，推动禁毒工作不断取得新成效，为维护社会和谐稳定、保障人民安居乐业作出新的更大贡献。在国家“十四五”规划中污水检毒也已经成为了禁毒工作的重要手段，污水验毒可以客观、全面的反应城市毒情，为公安机关锁定“毒源”提供有利的技术支持。目前，污水验毒已成为各省监控毒情的重要技术手段，很多省市在2018年就已经开始开展对全省的污水样本进行检测，并取得了一定的成效，目前该技术已经开始得到大范围的推广。污水中主要检测的毒品包括：吗啡、可待因、、O6-单乙酰吗啡、苯丙胺、甲基苯丙胺、MDMA、苯甲酰爱康宁、氯胺酮、去甲氯胺酮、MDA、可卡因、美沙酮等，同时需要检测常量的可替宁，作为人群基数标志物。目前，较常见的污水毒品检测方法有离线固相萃取法和在线固相萃取法两种方案，两种方案前处理流程如下：离线固相萃取法：在线固相萃取法：两种前处理方法对比：离线固相萃取法在线固相萃取法污水取样量50ml10ml是否需要对水样进行酸化需要不需要单个样本耗时175分钟18分钟前处理耗材（按照每个样品做两次平行计算）一次性过滤器3-5个一次性酸性SPE小柱 2个一次性碱性SPE小柱 2个分析色谱柱 1套一次性过滤器1个在线富集柱 1套分析色谱柱 1套需要配置的前处理设备全自动固相萃取仪离心浓缩仪移液枪移液枪每天可处理和分析的样品数量20个100个自动化程度中等高综上所述，在线固相萃取法相较于离线固相萃取法，具有明显的方法学优势，样本检测耗时只有离线法的十分之一，检测成本只有离线法的十分之一，每日检测速度是离线法的十倍。目前，成都珂睿开发的双鱼-I在线固相萃取系统，在与质谱联用后，可以非常方便而有效的将污水验毒工作开展起来，可同时监测多达近30种毒品，且可随着工作的深入，形势的变化，对监测的毒品种类进行扩展，有效达到毒情监测的目的。目前珂睿可以检测的毒品包括但不限于：a. 常见毒品及代谢物15种：吗啡、可待因、O6-单乙酰吗啡、苯丙胺、甲基苯丙胺、MDMA、MDA、可卡因、苯甲酰爱康宁、氯胺酮、去甲氯胺酮、美沙酮、甲卡西酮、卡西酮、四氢大麻酸。b. 芬太尼类毒品6种：芬太尼、去苯乙基芬太尼，呋喃芬太尼，舒芬太尼、卡芬太尼、瑞芬太尼。c. 新精活物质8种：氟硝西泮、MDPV、对甲氧基甲基苯丙胺、甲氧麻黄酮、1-（3-三氟甲基苯基）哌嗪、1-（3-氯苯基）哌嗪、苄基哌嗪、氟胺酮。d. 制毒原料5种：麻黄碱、伪麻黄碱(冰毒原料)、邻酮（氯胺酮原料）、NPP和4-ANPP（芬太尼原料）本方案完全满足公安部JD/Y JY02.10-2021“水样中21种毒品及代谢物与可替宁的测定”技术规范要求。我们按照方法要求，对污水中12种毒品进行了方法学相关的一系列测试，包括准确性、方法检出限、定量限、污水中基质效应、标准曲线线性相关系数、每种毒品保留时间偏差、样品重复性和双样平行相对相差等，得出了一系列数据，充分证明了双鱼-I在线固相萃取系统的方法可靠性。本次测试所用仪器设备为：双鱼-I在线固相萃取系统+API4000型三重四级杆串联质谱仪。样本情况：A、B、C三个污水样本（每瓶200ml），其中含有的12种毒品已知浓度。操作步骤：1.取样本10ml，过0.22um水相膜，至进样瓶中2.进样瓶中加入氘代内标（12种氘代含量均为25ng/mL），振匀3.取进样瓶中2mL样本进样目标物检出限ng/L（S/N≥3）定量限ng/L（S/N≥10）内标在盲测污水样本中基质效应%（回收率）线性关系方程线性相关系数吗啡0.3183.2Y=0.02679X-0.048700.9997706-单乙酰吗啡0.51109Y=0.01876X+0.006400.99864可待因0.51101Y=0.02034X+0.003560.9986美沙酮0.21123Y=0.01639X+0.105360.99903甲基苯丙胺0.2194Y=0.01933X+0.117440.99929苯丙胺0.2187.3Y=0.0187X+0.109710.99924氯胺酮0.2190.1Y=0.01889X+0.094030.99967去甲氯胺酮0.5179.5Y=0.02229X+0.069610.99981MDMA0.2197.5Y=0.02199+0.016020.99762MDA0.5199.5Y=0.01991X+0.050.99985可卡因0.21106Y=0.02293X+0.016480.99718苯甲酰爱康宁0.5168.8Y=0.02117X+0.026960.99847方法检出限、定量限、污水中基质效应、线性关系考察（定量限均可达1ng/L, 回收率均在68%-125%之间，线性相关系数均优于0.998）目标物保留时间偏差(%)样品重现性（RSD, %, n=6）平行双样相对相差（%）ABCABCABC吗啡0.1290.1210.1932.5171.9893.5920.680.982.0406-单乙酰吗啡0.1280.0370.0372.0521.6260.9682.983.380.47美沙酮0.1560.2150.1952.2641.1311.531 4.551.030.74甲基苯丙胺0.1560.0670.0373.391.7643.0054.711.035.79苯丙胺0.1970.1970.1970.8210.6161.484.923.282.78氯胺酮0.1240.1240.1471.4120.6512.3282.431.982.75去甲氯胺酮0.110.110.111.2230.9611.3752.363.661.11MDMA0.0640.0350.0351.1831.3440.5643.481.493.13MDA0.1810.060.060.5290.9550.7172.222.164.82可卡因0.1040.1040.1040.5030.7342.270 0.111.613.09苯甲酰爱康宁0.1790.1790.1092.9764.1252.574.121.685.22保留时间与标准品的偏差均小于0.2%，样品的重现性RSD均小于3%，双样平行相对相差小于6%珂睿双鱼-I在线固相萃取与Sciex三重四级杆串联质谱系统联用（客户现场）考虑到污水毒品检测中，可替宁为常量组分，不适合采用大体积进样，双鱼-I专门设计了双进样器的高配方案，可以在一次序列分析中实现大体积进样分析痕量毒品和常量可替宁，无需对硬件进行任何手动更换或切换，无人值守，全自动获得检测结果。同时考虑到相关用户除污水毒品检测外，可能会开展其它如毛发毒品检测、理化检测等常量分析，双进样器高配方案用户仅通过系统升级和软件控制，即可方便地实现大体积进样与常规小体积进样分析的快速无缝切换，满足多种应用需要。 成都珂睿科技双鱼-I型在线固相萃取系统目前已经多家客户处开展污水中毒品分析的应用，包括公安局和第三方司法鉴定机构，用户反馈良好。2020年珂睿推出了双鱼-I型在线固相萃取系统以及国产第一套污水中毒品分析的在线固相萃取液质联用方案，希望让国产色谱分析仪器能够更好地助力到关系国计民生的检测项目中，真正做到“中国制造服务于中国崛起”！

一、项目基本情况1.项目编号：OITC-G230661389项目名称：中国科学院海洋研究所海洋生物微区原位代谢组学研究平台（区域中心）高分辨率原位质谱成像系统采购项目预算金额：550.0000000 万元（人民币）最高限价（如有）：550.0000000 万元（人民币）采购需求：包号设备名称数量预算简要要求交货期交货地点第1包高分辨率原位质谱成像系1套550万人民币拟购置的高分辨率原位质谱成像系统主要用于小分子代谢物、短肽或蛋白的鉴定、定量及成像分析功能。具体而言，可以针对各种海洋生物细胞或组织开展各类分子如脂类（磷脂：PC、PE、SM、SE）、多肽、代谢物、药物及代谢产物等数百种分子的同时成像；能实现物质筛选与鉴定同时进行，目标分子可进行多级质谱分析，准确鉴定其组成与结构；实现高空间分辨率、高质量精度、高质量分辨率的非靶向性快速检测，且无需任何标记。合同签订后8个月内交货海洋研究所（青岛）投标人可对其中一个包或多个包进行投标，须以包为单位对包中全部内容进行投标，不得转包、分包，评标、授标以包为单位。技术要求详见本文件第八部分。合同履行期限：合同签订后8个月内交货。本项目( 不接受 )联合体投标。2.项目编号：OITC-G230310496项目名称：中国科学院海洋研究所2023改善科研条件专项-深海岩芯原位分析测试平台微区X射线荧光光谱仪采购项目预算金额：300.0000000 万元（人民币）最高限价（如有）：300.0000000 万元（人民币）采购需求：包号设备名称数量预算简要要求交货期交货地点第1包微区X射线荧光光谱仪1套300万人民币可以对岩心、矿石、沉积物等进行多元素分布成像，还可以自动识别2000多种矿物，进行矿物分布成像、矿物分类统计，突破了以往数字化测试的局限，通过成像的方式带给科研人员元素和矿物分布信息。采购的设备需满足元素分布成像、矿物分布成像功能合同签订后5个月内交货海洋研究所（青岛）投标人可对其中一个包或多个包进行投标，须以包为单位对包中全部内容进行投标，不得转包、分包，评标、授标以包为单位。技术要求详见本文件第八部分。合同履行期限：合同签订后5个月内交货。本项目( 不接受 )联合体投标。3.项目编号：OITC-G230610913项目名称：中国科学院海洋研究所2023改善科研条件专项-深海岩芯原位分析测试平台场发射扫描电镜及能谱系统采购项目预算金额：250.0000000 万元（人民币）最高限价（如有）：250.0000000 万元（人民币）采购需求：包号设备名称数量预算简要要求交货期交货地点第1包场发射扫描电镜及能谱系统1套250万人民币场发射扫描电镜及能谱系统基于扫描电镜的微观形貌和能谱得到的元素分布扫描，全自动快速得到目标材料样品（包括矿物岩心、海底岩石、沉积物、废石废物、冶炼残渣、金属制品、陶瓷器等）的夹杂物（矿物）分布与组成、元素分布信息和夹杂物（矿物）的颗粒尺寸等，配合相关设备，可进行化学和成分分析。合同签订后12个月内交货海洋研究所（青岛）投标人可对其中一个包或多个包进行投标，须以包为单位对包中全部内容进行投标，不得转包、分包，评标、授标以包为单位。技术要求详见本文件第八部分。合同履行期限：合同签订后12个月内交货。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间：2023年07月04日 至 2023年07月11日，每天上午9:00至12:00，下午13:00至17:00。（北京时间，法定节假日除外）地点：登录“东方招标”平台http://www.oitccas.com注册并购买。方式：登陆“东方招标平台”（http://www.oitccas.com/），点击“获取采购文件”链接图标，或直接输入访问地址（http://www.oitccas.com/pages/sign_in.html?page=mine）完成投标人注册手续（免费），然后登陆系统寻找有意向参与的项目，已注册的投标人无需重新注册。招标文件售价：每包人民币600 元。如决定购买招标文件，请完成标书款缴费及标书下载手续。售价：￥600.0 元，本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名 称：中国科学院海洋研究所　　　　　地址：青岛市市南区南海路7号 　　　　　　　　联系方式：王老师；0532-82898629 　　　　　　2.采购代理机构信息名 称：东方国际招标有限责任公司　　　　　　　　　　　　地　址：北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层　　　　　　　　　　　　联系方式：李雯、王军、郭宇涵； 010-68290530；010-68290508　　　　　　　　　　　　3.项目联系方式项目联系人：王老师电　话：　　0532-82898629

流体在岩石孔隙中的运移规律及其流固耦合效应是地下油气储备与开发的核心科学问题，也是导致不同工程灾害或工程难题的重要因素。精确表征岩石微观孔隙结构，揭示微观孔隙结构与流体输运特性的内在关联，是开展深部岩体相关工程研究的基础。近期，中国科学院武汉岩土力学研究所的宋睿副研究员、刘建军研究员、杨春和研究员联合西南科技大学的汪尧博士等人提出了一种利用3D打印和微CT成像技术实现致密砂岩复杂孔隙结构定量表征和多相流体输运特性的可视化研究方法。研究团队利用新型的面投影微立体光刻技术（PμSL，nanoArch S130，摩方精密）实现了致密砂岩孔隙模型的原位尺度打印（~2μm光学分辨率），再现了致密砂岩复杂孔隙系统的三维拓扑结构特征与空间连通性。研究人员对比分析了3DP岩心与数字岩心（DRP）模拟得到的孔径分布（PSD）、孔隙度和绝对渗透率的差异；同时结合原位CT成像技术开展了3DP岩心可视化CO2驱油实验，并与实验基准数据进行了比较。研究成果为定量表征岩石复杂孔隙结构特征及其中多相流体输运机制提供了新的工具，具有广阔的应用前景。论文研究工作得到国家自然科学基金，武汉市知识创新专项（基础研究）和四川省自然科学基金等项目的支持。相关研究成果以“3D Printing of natural sandstone at pore scale and comparative analysis on micro-structure and single/two-phase flow properties”为题发表在《Energy》期刊上。图1. 基于CT图像与面投影微立体光刻技术的致密砂岩微观孔隙结构提取与3D打印制备流程(a)天然致密砂岩的微CT扫描；(b)数字图像处理与岩心重建；(c)面投影微立体光刻3D打印成型该研究中所采用的天然岩心样本为海相致密砂岩。通过从原始岩心中钻取直径约为5mm的小岩心柱塞样本，利用蔡司Xradia MICROXCT-400三维成像系统进行微CT扫描成像，获取天然岩心孔隙结构的微CT图像（如图1a所示），并将其用于孔隙空间提取、数字岩心重建与模拟（如图1b）；然后，基于数字图像处理转化为3D打印通用的.stl文件，利用BMF公司的面投影微立体光刻成型技术完成孔隙模型的3D打印（如图1c所示）。图2. 3D打印岩心与天然岩心微观孔隙结构的对比分析(a)基于偏光显微镜和CT成像得3DP岩心孔隙结构表征；(b)基于图像校准的3DP岩心与原始岩心孔隙结构拓扑形态特征的对比分析；(c)孔隙结构特征参数的计算与分析为表征3D打印岩心在复刻天然岩心孔隙结构特征方面的准确性，该团队分别采用偏光显微镜和微CT成像对3DP岩心的2D/3D微观孔隙结构特征进行了定量表征（如图2a所示）。基于团队自行开发的数字图像处理与模型重建技术，分别研究了3DP岩心孔隙分布特征，并与天然样品的实验室测试结果进行了对比分析，结果表明3DP岩心和原始样品的PSD分布总体上一致（如图2c所示）。在对3DP岩心和原始岩心CT图像手动校准的基础上，团队采用开源图像处理软件（Fijiyama）中的块匹配算法（Block-Matching Algorithm）实现了3DP岩心CT图像与原始样品CT图像的自动配准，并作为后续分析的基准数据（如图2b所示）。结果表明，3DP岩心与原始岩心孔隙特征吻合较好，验证了3DP岩心在微米尺度下再现岩石微观结构的可行性和适用性。在此基础上，团队以分割的微CT图像为数据蓝本，引入峰值信噪比（peak signal-to-noise ratio, PSNR）和结构相似性指数度量（structural similarity index measure, SSIM）两个关键参数对3DP岩心孔隙结构特征进行表征，以量化3DP岩心与原始岩心孔隙结构的保真度（如图2c所示）。PSNR用于衡量相同空间位置上孔隙特征参数（大小和坐标位置）的绝对误差。SSIM用于测量两个图像之间的相似性，用于评估相应位置上的孔隙是否由3D打印机识别。计算结果表明：本文中3DP岩心的PSNR值介于[9.010，14.983]之间，其SSIM值介于[0.870，0.925]之间。大多数孔隙特征被打印识别，但一些孔隙并不在原始尺寸或位置上。由于后处理过程中，样品近端部的液体树脂更容易被去除，因此顶/底部结构的打印精度优于其他部分，显示出更高的SSIM值。图3. 基于原位CT成像的微观可视化多相渗流试验(a)团队自行设计的用于原位CT成像的微观可视化渗流试验系统；(b)3DP岩心饱和油状态（上部）和CO2驱油后（下部）3DP岩心中油相分布的微CT图像；(c)CO2驱油后3DP岩心中CO2分布及对应的孔隙网络模型，以及3DP岩心和原始岩心中残余油相原位润湿角计算结果的对比在3DP岩心与原始岩心孔隙结构特征对比分析的基础上，团队针对3DP岩心的流体输运特性开展了进一步的研究。利用自行设计的基于原位微CT成像的可视化渗流试验系统分别进行了3DP岩心的饱和油和CO2驱油试验（如图3a所示）。分别采集了饱和油状态与驱替完成时3DP岩心的微CT图像（如图3b所示）。为了消除不同扫描阶段样品放置的人为误差，研究人员对获取的CT图像也进行了手动校准和图像配准操作。分析结果表明：注入CO2气体主要沿孔隙中部流动，导致颗粒表面出现大规模残余油。考虑到制备3DP岩心使用的HTL树脂是强油湿性，残余油相优先附着到固体表面。当注入流体发生突破时，样品中会留下很大部分以油膜形式分布的残余油。在油湿性岩心中，毛细管压力是注入CO2的阻力，导致大量残留油块被毛管力卡断在小孔中。此外，研究团队对3DP岩心和原始岩心的原位接触角进行了计算与对比分析，讨论了微观润湿性在残余流体捕获机制中的影响（如图3c所示），并进一步提取了CO2驱替后3DP岩心的孔隙网络模型，对驱替过程中CO2气体的主要渗流通道以及微观赋存状态进行了讨论与分析。结果表明，注入气体主要沿3DP岩心的左侧分布，注入CO2沿优先通道突破，与剩余油分布一致。考虑到注入CO2的操作压力低于最小混相压力，驱替过程为不混相气-液流，界面张力和注入流体粘度的降低有助于提高波及效率和采收率。（如图3c所示）。

SKYSCAN 2214 是布鲁克推出的新纳米断层扫描系统，是显微 CT 技术领域的先行者，在为用户带来了终级分辨率的同时,提供非常好的用户体验。SKYSCAN 2214 的每个组件都融入的新的技术，使其成为当今市场上性能很强、适用性很广的系统。■多用途系统，样品尺寸可达300mm，分辨率（像素尺寸）可达 60 纳米■金刚石窗口x射线源，焦斑尺寸500nm■创新的探测器模块化设计，可支持 4 个探测器、可现场升级。■全球速度很快的 3D 重建软件（InstaRecon® ）。■支持精确的螺旋扫描重建算法。■近似免维护的系统，缩短停机时间并降低拥有成本。地质、石油和天然气勘探■常规和非常规储层全尺寸岩心或感兴趣区的高分辨率成像■测量孔隙尺寸和渗透率，颗粒尺寸和形状■测量矿物相在3D空间的分布■原位动态过程分析聚合物和复合材料■以500 nm 的真正的 3D 空间分辨率解析精细结构■评估微观结构和孔隙度■量化缺陷、局部纤维取向和厚度电池和储能■电池和燃料电池的无损 3D 成像■缺陷量化■正负极极片微观结构分析■电池结构随时间变化的动态扫描生命科学■以真正的亚微米分辨率解析结构，如软组织、骨细胞和牙本质小管等■对骨整合生物材料和高密植体的无伪影成像■对生物样品的高分辨率表征，如植物和昆虫创新点：SKYSCAN 2214 是布鲁克推出的新纳米断层扫描系统，是显微 CT 技术领域的先行 者，在为用户带来了终级分辨率的同时,提供非常好的用户体验。SKYSCAN 2214 的每个 组件都融入的新的技术，使其成为当今市场上性能很强、适用性很广的系统。 Bruker多量程X射线三维纳米显微成像系统（3D XRM）

SKYSCAN 2214 是布鲁克推出的新纳米断层扫描系统，是显微 CT 技术领域的先行者，在为用户带来了终级分辨率的同时,提供非常好的用户体验。SKYSCAN 2214 的每个组件都融入的新的技术，使其成为当今市场上性能很强、适用性很广的系统。■多用途系统，样品尺寸可达300mm，分辨率（像素尺寸）可达 60 纳米■金刚石窗口x射线源，焦斑尺寸500nm■创新的探测器模块化设计，可支持 4 个探测器、可现场升级。■全球速度很快的 3D 重建软件（InstaRecon® ）。■支持精确的螺旋扫描重建算法。■近似免维护的系统，缩短停机时间并降低拥有成本。地质、石油和天然气勘探■常规和非常规储层全尺寸岩心或感兴趣区的高分辨率成像■测量孔隙尺寸和渗透率，颗粒尺寸和形状■测量矿物相在3D空间的分布■原位动态过程分析聚合物和复合材料■以500 nm 的真正的 3D 空间分辨率解析精细结构■评估微观结构和孔隙度■量化缺陷、局部纤维取向和厚度电池和储能■电池和燃料电池的无损 3D 成像■缺陷量化■正负极极片微观结构分析■电池结构随时间变化的动态扫描生命科学■以真正的亚微米分辨率解析结构，如软组织、骨细胞和牙本质小管等■对骨整合生物材料和高密植体的无伪影成像■对生物样品的高分辨率表征，如植物和昆虫创新点：SKYSCAN 2214 是布鲁克推出的新纳米断层扫描系统，是显微 CT 技术领域的先行 者，在为用户带来了终级分辨率的同时,提供非常好的用户体验。SKYSCAN 2214 的每个 组件都融入的新的技术，使其成为当今市场上性能很强、适用性很广的系统。 Bruker多量程X射线三维纳米显微成像系统（Nano-CT）

今年6月8日，是第十四个“世界海洋日”和第十五个“全国海洋宣传日”，主题为“保护海洋生态系统 人与自然和谐共生”。目前，全球海洋治理领域还包括海水酸化、海洋微塑料污染和非法、不报告、不管制捕鱼等热点问题，而海洋生物多样性保护、国际海底区域和南北极治理，也是持续受到关注的重点议题。海洋区域范围大，需要大范围的快速监测，又需要局部的精细监测，因此，需要各种不同类型的仪器设备，来辅助人们监测海洋环境的变化。奥谱天成开发的生态环境立体感知与预警系统，采用天空 ( 无人机载 )、海面 ( 船载设备、智能浮标 ) 及海底 ( 水下无人船载 ) 立体监测方式，搭载了多种光谱融合技术的高端传感设备，实现对生态环境时间和空间全方位立体感知。应用场景演示系统亮点该系统创新性地采用高光谱成像技术、多光谱成像技术、远程深紫外荧光技术、远距离偏振成像技术、水下荧光技术、水下地物光谱、水下高光谱等多种光谱融合技术的传感设备，具备了工作性能稳定、自动化程度高、故障率低、分析速度快和维护成本低等特点。测量参数可视化信息平台奥谱天成“立体海洋感知与预警系统”可以实现海陆空三位一体的全方位海洋生态环境监测，不仅可以助力海洋生态环境保护，更是提升了我国海洋高端探测设备在全球市场的竞争力和占有率。奥谱天成“海洋项目”正是凭借着立体海洋感知与预警系统，通过厦门市海洋局审批，获批总经费4576万元！

p & nbsp & nbsp & nbsp 陕西省今年将开始建设该省的第一台大科学装置——高精度地基授时系统，未来这个系统的建成将有助于使我国各行各业的用时能力达到世界先进水平。这是记者9日从中科院西安分院获悉的。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 高精度地基授时系统是国家重大科技基础设施“十三五”规划的十大项目之一，将建立与星基授时系统相对独立、融合公用、互补增强的地基授时系统，它能够有效整合国内时频资源，提高自主创新能力，彻底摆脱对国外系统的依赖。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 日前，中科院与陕西省政府签署协议，决定共同建设中科院西安科学园。根据规划，科学园将建设科研机构聚集区、科学装置聚集区、创新平台聚集区、丝路科技合作区、科教融合聚集区等。其中的科学装置聚集区将以大科学装置建设为目标，培育建设一批高效率开放共享、高水平国际合作、高质量创新服务的重大科技创新平台。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 据中科院西安分院副院长杨青春介绍，科学园将加快大科学装置高精度地基授时系统的建设，今年即将开始建设；加快加速器质谱中心集群、西安阿秒光源、大陆环境钻探岩心标本库及分析测试设备集群、大型太阳能城市空气清洁系统等大科学装置的培育；积极引进筹建新的大科学装置，包括医用重离子加速器装置、飞秒激光精密制造装备的工业化可靠性研究测试中心、西部质子（医疗）中心等科学装置等。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 根据协议，科学园将围绕大科学装置建设，在时间频率科学、资源与生态环境领域谋划争取建设国家实验室，在光电子信息、先进制造、新材料等领域争取建设若干国家重点实验室（国家工程中心）；加快推进陕西省加速器质谱应用重点实验室、陕西省光谱成像工程技术研究中心建设，积极筹建陕西省超快激光装备制造工程中心、陕西省大气污染与雾霾防治重点实验室和陕西省先进大气污染控制技术工程中心。 /p

p style=" text-align: center " img width=" 450" height=" 300" title=" W020151217632860915782.jpg" style=" width: 450px height: 300px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201512/insimg/242370ef-1198-401a-b257-50a6b7a52555.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " strong 细胞通过GPADH磷酸化位点调节与Sirt1的相互作用，从而激活了自噬过程 /strong /p p style=" text-align: left " 　　11月25日，国家蛋白质科学研究(上海)设施质谱系统用户，浙江大学 a title=" " style=" color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " href=" http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-1-1-1.html" target=" _self" span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 基础医学 /span /a 系刘伟教授研究组在国际期刊Cell子刊Molecular Cell在线发表了最新研究成果“AMPK-Dependent Phosphorylation of GAPDH Triggers Sirt1 Activation and Is Necessary for Autophagy upon Glucose Starvation”，该研究发现一条激活组蛋白脱乙酰化酶Sirt1启动细胞自噬的新的信号途径。 /p p 　　自噬体形成调控是细胞自噬研究的重要内容。与长寿和衰老等密切相关的组蛋白脱乙酰化酶Sirt1，通过使LC3等主要自噬相关蛋白脱乙酰化，在饥饿诱导的自噬体形成中发挥关键作用。然而，细胞饥饿时Sirt1被迅速激活进而启动自噬的分子机制一直未能解决。 /p p 　　在本研究中，博士后常春美和博士生苏华等人在刘伟教授的指导下研究发现，在葡萄糖缺乏时，细胞内激活的能量感受器分子AMPK激酶能磷酸化定位于胞质的经典糖酵解酶GAPDH，使得GAPDH移位细胞核。在核内，GAPDH直接作用于Sirt1，造成Sirt1与其抑制蛋白DBC1的分离而得到激活，并继而启动细胞自噬。该研究阐明了一条Sirt1不依赖于其辅酶浓度而被迅速激活的新的途径，揭示了GAPDH作为一个传统糖酵解酶，在细胞自噬调控中的重要功能。 /p p 　　上海设施质谱系统彭超博士通过基于质谱技术的 a title=" " style=" color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " href=" http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-1-1-1.html" target=" _self" span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 蛋白质组学 /span /a 方法帮助解析确定了GAPDH的磷酸化位点以及GAPDH和Sirt1的互作蛋白质网络，提供了强有力的专业技术支持，为成果的发表做出了积极贡献。该研究还得到国家重点基础研究发展计划和国家自然科学基金的资助。 /p

12月10日，由外专千人翟佩斯利领衔的青岛科技大学地质能源研究院在高新区揭牌并投入使用。　　国家“外专千人计划”翟佩斯利是荷兰代尔夫特理工大学油气开采工程系主任，其在页岩油气领域，采取二氧化碳泡沫增产、聚合物驱油方法方面取得了一批世界领先的研究成果。　　青岛科技大学地质能源研究院依托国家“外专千人”翟佩斯利教授设立，将在页岩油地质能源领域建设成为具有世界一流水平的研究院。研究院配置了精密X射线三维显微镜，高压高温多功能岩心驱替试验装置，岩心气体孔隙度、渗透率全自动测定系统，高温覆压隙度、渗透率全自动测定系统精密天平，泡沫观察系统，高温高压数字表面张力仪等实验仪器，可以完成油气藏流体高压物性分析、岩心孔隙度测试实验岩心渗透率测试、二氧化碳泡沫驱油技术的建模和数值模拟、岩心驱替、岩心CT微观驱替等实验。　　附：　　揭牌项目情况简介　　青岛科技大学地质能源研究院　　青岛科技大学地质能源研究院成立于2016年3月，是学校依托引进的国家“外专千人”翟佩斯利教授成立的校级研究院，建设目标为地质能源领域具有世界一流水平的研究院。研究院拥有精密X射线三维显微镜，高压高温多功能岩心驱替试验装置，岩心气体孔隙度、渗透率全自动测定系统，高温覆压隙度、渗透率全自动测定系统精密天平，泡沫观察系统，高温高压数字表面张力仪等实验仪器，可以完成油气藏流体高压物性分析、岩心孔隙度测试实验岩心渗透率测试、CO2泡沫驱油技术的建模和数值模拟、岩心驱替、岩心CT微观驱替等实验。　　滨革能源(中国)有限公司　　滨革能源(中国)有限公司是荷兰投资公司 --- 滨革控股集团的全资子公司，集团总部位于荷兰首都阿姆斯特丹。滨革能源致力于引领采掘勘探、碳氢化合物生产及其工业处理等相关产业的发展，在众多石油、天然气田的开发方面发挥着积极作用，为欧洲、非洲、亚洲和南美洲提供超过10亿桶石油或天然气，日产量可达5万桶，其中80%为原油。滨革能源(中国)公司生产和销售包括生物燃料精制车间在内的相关炼油设备，该设备可提供燃料和润滑剂，还可提供高附加值的化学品。　　青岛市碳捕集、利用与封存(CCUS)技术中心　　青岛市碳捕集、利用与封存技术中心是由山东成林低碳环保产业股份有限公司与青岛科技大学联合成立的技术中心。注册资金500万。主要负责烟气二氧化碳捕集、利用、封存(CCUS)与石油、天然气开采技术装备的研发、科技信息交流、技术咨询、技术孵化、科技评估、科技鉴定、技术推广、技术转让与技术展览活动，同时开展相关联的能源工程技术、化学工程技术、环境科学与工程技术、安全科学与工程技术、材料科学与工程技术、机械工程技术、动力与电气工程技术、测绘技术等技术研发、装备孵化、科技咨询、科技评估、科技鉴定、工业监制、技术推广和技术转让工作。　　山东省万贝青科危废鉴定中心　　山东省万贝青科危废鉴定中心是由万贝科技发展(天津)集团有限公司控股、青岛科技大学参股来共同组建的股份制有限责任公司。公司及山东省万贝危废鉴定中心依据国际国内法规提供危险废物鉴定及危险废物资源综合利用检测、分析、监测等服务。鉴定中心的成立有助于山东省建立健全《国家危险废物名录》，为今后环境治理及危废物处置管理工作提供有力依据，同时提升山东省危废处理鉴定及处置技术水平，减少危废物对生态环境的影响，对于山东省化工企业的化工生产工艺安全方面提供有力的技术保障。在鉴定中心正常开展业务的同时，公司还会利用青岛科技大学强大的科研技术研发平台开展相关危废处理及鉴定工作，例如：危废物的物化无害化处理、生物化绿色填埋处置、重金属废液处理及资源回收再利用等，为实现山东省改善生态环境、减少环境污染、提升危废鉴定技术水平的目标作出努力。