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质谱基因富集分析

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质谱基因富集分析相关的资讯

  • 一种膜渗透的、固定化金属亲和色谱富集的交联试剂用于推进体内交联质谱分析
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Angew. Chem. Int. Ed.上的文章,A Membrane-Permeable and Immobilized Metal Affinity Chromatography (IMAC) - Enrichable Cross-Linking Reagent to Advance In Vivo Cross-Linking Mass Spectrometry,该文章的通讯作者是德国莱布尼茨分子药理学研究所的Fan Liu教授。交联质谱 (XL-MS) 已被用于在全蛋白质组范围内表征蛋白质的结构和蛋白间相互作用。目前,由于能够穿透完整细胞的交联试剂和富集交联肽的策略的缺乏,体内交联质谱研究的深度远远落后于细胞裂解液的现有应用。为了解决以上限制,本文开发了一种含膦酸盐的交联剂-tBu PhoX,它能够有效地渗透各种生物膜,并且可以通过常规的固定化金属离子亲和色谱 (IMAC) 进行稳定富集。 文章建立了一个基于 tBu-PhoX 的体内 XL-MS 分析流程,在完整的人类细胞中实现了较高的交联识别数目,并大大缩短了分析时间。总的来说,本文开发的交联剂和 XL-MS 分析流程为生命系统的全面交联质谱表征铺平了道路。细胞蛋白质组通过广泛的非共价相互作用网络进行组织,表征蛋白质-蛋白质相互作用 (PPIs) 对于了解细胞的调节机制至关重要。交联质谱 (XL-MS) 是系统研究细胞 PPIs 的一种强有力的方法,在 XL-MS 中,天然蛋白质接触通过交联剂共价捕获,交联剂是一种由间隔臂和两个对特定氨基酸侧链具有反应性的官能团组成的有机小分子,交联样品经过蛋白酶水解后,可以通过基于质谱的肽测序来定位氨基酸之间的交联。由于交联剂具有确定的最大长度,检测到的交联揭示了蛋白质内部或蛋白质之间的氨基酸的最大距离。以上这些信息提供了对蛋白质构象、结构和相互作用网络的见解。虽然最初仅限于纯化的蛋白质组装,但如今 XL-MS 已经可以应用于复杂的生物系统——这是通过开发先进的交联搜索引擎、样品制备策略和交联剂设计而实现的。特别是,已进行的几项全蛋白质组范围的 XL-MS 研究表明,可以通过使用可富集的交联剂来改进交联产物的鉴定,例如,通过添加生物素或叠氮化物/炔烃标记,使得消化混合物中的交联肽段能够基于亲和纯化或点击化学富集。最近,一种基于膦酸的交联剂 PhoX 被引入作为现有生物素或叠氮化物/炔烃标记试剂的高效和特异性替代品。PhoX 可通过固定化金属离子亲和色谱 (IMAC) 实现交联富集,这是一种非常快速和稳健的富集策略。 然而,尽管 PhoX 已被证明可用于从细胞裂解液中进行交联鉴定,但它无法渗透细胞膜,因此不适合体内的 XL-MS检测。基于以上讨论,本文开发了交联剂 tBu-PhoX ,其中,膦酸羟基被叔丁基保护以掩盖负电荷(图 1)。为了检测 tBu-PhoX 的膜通透性,文章交联了各种膜封闭的生物系统,包括人 HEK293T 细胞、从小鼠心脏分离的线粒体和革兰氏阳性枯草芽孢杆菌,并在 SDS-PAGE 上监测了蛋白质条带的变化(图 2)。在SDS-PAGE中,观察到在交联剂浓度为0.5和1.0mM时,蛋白质向更高分子量的浓度依赖性迁移,这表明了有效的膜渗透和交联。相比之下,将 PhoX 应用于完整的 HEK293T 细胞将产生与非交联对照相同的条带模式。图1 tBu-PhoX交联剂图2 PhoX或tBu-PhoX交联HEK293T细胞的SDS-PAGE在证明了 tBu-PhoX 可渗透各种生物膜系统后,文章接下来开发了一种基于 tBu-PhoX 的体内 XL-MS 工作流程,相比于之前的全蛋白质组 XL-MS 策略,该工作流程提高了样品处理和交联富集的速度和效率(图 3)。首先,按照标准蛋白质消化方案将交联蛋白质消化成肽;其次,使用 IMAC 珠对消化混合物进行预清除步骤以去除内源性修饰(特别是磷酸化);第三,预清除的消化混合物(从 IMAC 流出)在稀释三氟乙酸 (TFA) 溶液中孵育以去除叔丁基并暴露膦酸基团以进行二次 IMAC 富集。第四,使用标准 IMAC 程序丰富交联产物,最后通过 LC-MS 分析以进行交联产物鉴定。图3 与tBu-PhoX进行体内交联和后续样品处理的工作流程接下来,文章优化了体内 XL-MS 工作流程的几个分析参数,以最大限度地提高交联检测的效率。首先,通过使用 IMAC 珠预清除评估了去除磷酸肽的效率;之后,使用 tBu-PhoX 交联完整的 HEK293T 细胞,经酶切成肽后,并应用预清除 IMAC 步骤去除内源性磷酸肽。在去保护步骤之后,利用 IMAC 富集交联,并通过单次 120 min LC-MS 运行测量富集的样品。通过测量 IMAC 洗脱液中磷酸肽和交联产物的数量,发现第二个 IMAC 中只有数百条磷酸肽,而预清除 IMAC 中有 4,128 条磷酸肽,这突出了通过预清除 IMAC 步骤去除磷酸肽的效率。此外,与单阶段 IMAC 结果相比,使用预清除 IMAC 的工作流程鉴定了 22% 以上的交联(1165 对 952 交联),证明了该两阶段工作流程去除干扰修饰肽的好处(图 4A)。其次,文章在肽水平上研究了膦酸盐去保护的功效。使用 tBu-PhoX 制备了体内交联的 HEK293T 样品,并分析了在不同的酸度(TFA 浓度)和孵育时间下,去保护后交联的数量如何变化。结果显示,不同浓度的 TFA 下获得了相似数量的交联。为简化处理(即在接下来的IMAC富集步骤中保持相对较低的样品体积),选择 0.5% TFA 的去保护条件,持续两个小时(图 4B,C)。第三,文章测试了 Orbitrap Tribrid 质谱仪的不同采集参数如何影响交联识别,即在高场非对称波形离子迁移率质谱法 (FAIMS) 中应用的电荷态选择和补偿电压 (CVs)。当考虑电荷状态 +3 和更高时,确定了最多数量的 tBu-PhoX 交联肽(图 4D)。图4 样品处理和LC-MS参数的优化文章将优化参数后的体内 XL-MS 工作流程应用于完整的 HEK293T 细胞。使用 180 min的 LC 梯度和优化后的分析参数,文章从体内 tBu-PhoX 交联的 HEK293T 细胞中获得了 9,547 个交联(图 5A)。基因本体分析表明,交联蛋白参与了广泛的分子功能、生物过程和细胞成分,表明 tBu-PhoX 可以揭示所有细胞区域的 PPIs(图 5A)。另外,文章还考察了完整细胞的体内 XL-MS 是否捕获了与细胞裂解液的 XL-MS 不同的 PPIs。为了验证这一点,从 HEK293T 细胞中制备 tBu-PhoX 交联裂解液,并使用与体内 XL-MS 实验相同的工作流程处理样品。 结果显示,从五个 SEC 部分中确定了 9,393 个交联。这表明 tBu-PhoX 允许以类似的效率进行裂解和体内 XL-MS。比较本文的体内和裂解数据表明,在体内 XL-MS 实验中,蛋白质间交联的数量更高,从而产生了更加相互关联的 PPI 网络(图 5B,C)。这种效应可以通过细胞环境的拥挤来解释,其中蛋白质紧密堆积并参与多种相互作用,这些相互作用被细胞裂解和稀释部分破坏。文章在 8 种选定蛋白质复合物的已知 3D 结构上可视化了 145 个体内检测到的交联(图 5C),另外,还观察到 96.6% 的交联在 35 Å 的最大距离限制内(图 5D),表明此 XL-MS 工作流程对内源性蛋白质复合物的体内结构分析的适用性。最后,文章比较了 tBu-PhoX 与 PhoX 在表征细胞裂解液的 PPI 网络方面的性能。使用与上述 tBu-PhoX 裂解液交联实验相同的交联条件从 HEK293T 细胞制备 PhoX 交联裂解液。为了去除内源性磷酸肽,在单阶段 IMAC 富集之前,用碱性磷酸酶处理消化的肽两小时。使用与 tBu-PhoX 相同的 LC-MS 方法进行 LC-MS 分析。该实验产生了 2,117 个交联,与使用 tBu-PhoX 识别的交联数量(1,942 个交联)相比略高。然而,基于 PhoX 的 XL-MS 流程需要更长的样品制备时间,因为需要进行碱性磷酸酶再处理和之后的额外脱盐步骤。行体内交联综上所述,本文开发并应用了一种新型的、可富集的、用于体内 XL-MS 的膜渗透交联剂 tBu-PhoX。在广泛使用的交联条件下(交联剂浓度为 1-5 mM),tBu-PhoX能够有效地穿透各种生物膜,为完整的细胞器和活细胞提供交联的机会。tBu-PhoX上的叔丁基基团使得高效的两阶段IMAC样品制备方案成为可能;首先,使交联剂对 IMAC 呈惰性,以促进基于 IMAC 快速而彻底地提取不需要的磷酸化肽,然后,通过去除叔丁基暴露膦酸基团,从而有效地二次 IMAC 富集交联剂修饰的肽。通过随后的 SEC 分馏,可以进一步富集交联肽段以进行 LC-MS 分析。XL-MS 在表征生命系统中的蛋白质结构和相互作用方面发挥着越来越重要的作用。为了促进这一发展,迫切需要有效的体内 XL-MS 方法。文章报告的体内 XL-MS 工作流程满足了这一需求,提供了与之前基于裂解液的 XL-MS 研究类似的交联识别能力,但需要的测量时间不到之前报告的十分之一。这一结果突出表明,本文开发并应用的 tBu-PhoX 交联剂和集成样品制备流程为推进体内相互作用组学和结构生物学提供了一种非常有前景的化学方法。
  • 在线富集HTLC- MS -MS分析环境水资源中多种抗生素
    人们日益关注环境水资源中抗生素的存在情况。这迫使环境和政府实验室开发新的液相色谱/质谱(LC/MS)方法,以监测水资源中抗生素的存在状况。   然而,环境水资源中含有的抗生素的通常是很痕量的,往往需要大量的水样进行富集和净化。在液相色谱/质谱(LC/MS)分析之前,需要对大约100-1000mL水样进行富集和清理,以达到被测物质的检测限。即使样本量很多,该提取过程也是耗时耗力的,实现高通量检测非常困难。   本研究提出的方法,使用了可以对样品进行在线浓缩和净化的Thermo Scientific TSQ Quantum Ultra三重四极杆质谱仪,不仅大大缩短了样品处理的时间,而且在高选择反应监测(H-SRM)模式下,可以进行痕量浓度(pg/mL)抗生素检测分析。   详细内容见附件:在线富集HTLC- MS -MS分析环境水资源中多种抗生素.pdf
  • 安捷伦指定华大基因为中国首家认证的靶向富集服务提供商
    2011年4月4日, 安捷伦公司宣布,基因组学研究中心华大基因(BGI)已经正式成为安捷伦认证的SureSelect XT靶向序列捕获系统服务提供商(CSP)。安捷伦CSP计划是一项针对希望提供更高水平数据质量的服务供应商合作计划。   位于深圳的华大基因是世界上最大的基因研究机构,是中国第一家获得安捷伦认证的SureSelect XT靶向序列捕获系统服务提供商。该机构获得了SureSelect XT靶向序列捕获系统协议所涵盖的所有认证,包括人类所有外显子、SureSelect索引、DNA捕集、RNA捕集、kinome RNA和客户定制包。   安捷伦SureSelect XT 靶向序列捕获系统   “我们非常高兴能够成为安捷伦的CSP,”华大基因基因测序业务主管Li Jingxiang说。 “安捷伦SureSelect XT靶向序列捕获系统是一个很出色的,并且是国际上知名的产品,利用此我们可以为客户提供最好的目标测序服务。”   “我们非常高兴地看到,这个重要的测序中心可以通过更广泛的基因组学实验,从安捷伦SureSelect XT靶向序列捕获系统中获利。”安捷伦SureSelect平台及基因组学市场营销总监Fred P. Ernani博士说到。   该平台自2009年成立,目前安捷伦可以提供35 种SureSelect靶向富集包。它已被超过45个同行评审的出版物所引用,包括在遗传疾病等方面的研究和发现工作。   SureSelect XT使靶向富集流程简化,使研究人员可以仅对目标基因组区域(而非整个基因组)进行测序。结合先进的新一代测序系统不断提升的性能,SureSelect XT 平台的多样本检测能力使基因学家可以在一次实验中相比以前探索更多样品的基因组。直到现在,文库制备和靶向富集步骤一直是限制此类实验速度的瓶颈之一。为了实现高通量样品处理,安捷伦现已发布综合式工作站,用于SureSelect XT 文库制备和靶向富集工作流程的自动化。   SureSelect XT 还为客户提供高度灵活的定制化产品。用户使用安捷伦eArray xD桌面设计工具,可以轻松设计出在单管中捕获任意目标基因组的定制产品,从而提高研究效率。安捷伦还提供eArray在线设计工具,用户使用该工具可定制和安捷伦目录SureSelect试剂盒类似的产品,例如 SureSelect 人全外显子系列产品。   SureSelect XT靶向序列捕获系统已经被科学杂志12月17期的两项2010年10大突破所引用,这两项突破为:“Reading the Neandertal Genome”和“Homing In on Errant Genes”。
  • 280万!萍乡市妇幼保健院基因分析仪和三重四极杆质谱系统采购项目
    项目编号:GK-PXCX2022-39项目名称:萍乡市妇幼保健院基因分析仪和三重四极杆质谱系统采购项目采购方式:公开招标预算金额:2800000.00 元最高限价:无采购需求:采购条目编号采购条目名称数量单位采购预算(人民币)技术需求或服务要求萍购2022F000729047政府采购项目1批2800000.00元详见公告附件合同履行期限:签订合同后30个日历天内完成供货、安装调试并交付使用。本项目不接受联合体投标。技术需求.docx
  • 李灵军与叶慧团队合作成果:生物素硫醇标签辅助质谱法对蛋白质瓜氨酸化进行全局分析
    瓜氨酸化是影响蛋白质结构和功能的关键的翻译后修饰。尽管它与各种生物过程和疾病发病紧密相关,但由于缺乏有效的方法来富集、检测和定位该翻译后修饰,其潜在机制仍然知之甚少。近期,威斯康星大学麦迪逊分校李灵军教授课题组报道了生物素硫醇标签的设计和开发,该标签能够通过质谱法对瓜氨酸化进行衍生化、富集来实现可靠的鉴定。作者对小鼠组织的瓜氨酸化蛋白质组进行了全局分析并且从432种瓜氨酸化蛋白质中识别出691个修饰位点,这是迄今为止最大的瓜氨酸化数据集。作者发现并阐述了这个翻译后修饰的新的分布和功能并且表示该方法有希望为进一步破译瓜氨酸化的生理和病理作用奠定基础。这项工作以“Enabling Global Analysis Of Protein Citrullination Via Biotin Thiol Tag-Assisted Mass Spectrometry”为题发表在国际化学权威杂志Analytical Chemistry上 (https://doi.org/10.1021/acs.analchem.2c03844),文章作者为Yatao Shi#, Zihui Li#, Bin Wang#,Xudong Shi , Hui Ye, Daniel G. Delafield, Langlang Lv, Zhengqing Ye, Zhengwei Chen, Fengfei Ma,Lingjun Li*。此外,李灵军教授课题组进一步拓展了此方法的实用性。作者通过应用二甲基化亮氨酸(DiLeu)等重标记策略第一次实现了瓜氨酸化的高通量定量研究,并利用这一方法揭示了瓜氨酸化在人体细胞DNA损伤及修复过程中的重要作用。相关成果以“12-Plex DiLeu Isobaric Labeling Enabled High-Throughput Investigation of Citrullination Alterations in the DNA Damage Response”为题同样发表在Analytical Chemistry上(https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c04073),文章作者为Zihui Li, Bin Wang, Qinying Yu, Yatao Shi, Lingjun Li*。  研究的主要内容  作者设计了一种生物素硫醇标签,它可以很容易的以低成本合成并且可以与瓜氨酸残基和2,3-丁二酮发生特异性反应(图 1a)。这种衍生化不仅增加了质量转移以允许更可靠的鉴定,而且还引入了生物素部分,使修饰分子的后续富集成为可能。该生物素硫醇标签设计具有紧凑的结构,在高能碰撞解离 (HCD) 期间仅产生两个碎片/诊断离子(图 1b)。 因此,肽主链可以保持良好的裂解效率,并在 HCD 或电子转移解离 (ETD) 期间分别产生丰富的b/y或c/z离子系列。在 HCD(图 1c)、ETD或电子转移/高能碰撞解离(EThcD)碎裂下,衍生化肽标准品的序列收集质谱图几乎完全覆盖相应的肽序列。实验结果表明生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸化肽可以产生用于解析及标注的高质量的串联质谱图,并且与各种裂解技术相结合时可以提高瓜氨酸化位点的识别可信度。  图1|用于瓜氨酸化分析的生物素硫醇标签设计。a,使用生物素硫醇标签和 2,3-丁二酮对瓜氨酸肽进行衍生化。 b,HCD、ETD 或 EThcD 片段化后生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸化肽的片段化位点。c,HCD裂解后生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸肽标准品 SAVRACitSSVPGVR 的串联质谱图。  在接下来的实验中作者使用该生物素硫醇标签和基于质谱的自下而上的蛋白质组学方法对瓜氨酸化进行分析(图2a)。作者在体外利用 PAD(一种可以催化瓜氨酸化的酶)催化的人组蛋白 H3 蛋白来验证这个过程。作为未被PAD催化的阴性对照,未发现组蛋白的肽段被鉴定为瓜氨酸化,证明了生物素标签反应的高特异性(图 2b)。在体外 PAD 处理后,作者 发现许多精氨酸残基被催化为瓜氨酸,并且大量的位点被高可信度的鉴定为瓜氨酸化位点(图 2c),进一步表明该方法的高效性。在 HCD 碎裂后,其产生了一系列丰富的 b/y 离子,可以帮助准确的表征在同一肽段上单个(图 2d)以及多个(图 2e)瓜氨酸化位点。  图2|使用生物素硫醇标签进行体外瓜氨酸化分析。a,使用生物素硫醇标签进行蛋白质瓜氨酸化分析的实验工作流程。b、c,在体外 PAD 处理之前 (b) 和之后 (c) 组蛋白 H3 蛋白的瓜氨酸化分析。 已识别的瓜氨酸化位点在序列中以蓝色字母突出显示。 序列下方的红色矩形表示鉴定的瓜氨酸化肽,而瓜氨酸化位点以蓝色显示。 d,PAD处理的组蛋白 H3 (R64Cit) 的已鉴定瓜氨酸化肽的串联质谱图示例。 e,PAD 处理的组蛋白 H3 的同一肽上鉴定的两个瓜氨酸化位点(R70Cit 和 R73Cit)的串联质谱图示例。  接下来,作者们尝试利用所开发的方法对复杂的生物样本中的瓜氨酸化进行全局分析,并希望能够以此提供阐明生物体中瓜氨酸化调节机制的依据。首先,作者对小鼠的六个身体器官和五个大脑区域进行了深入的瓜氨酸组分析,生成了第一个小鼠瓜氨酸组组织特异性数据库。作者从432种瓜氨酸化蛋白质中以高置信度的方式鉴定了691个瓜氨酸化位点(图 3a)。更重要的是,这些蛋白质中约有 60% 未曾在UniProt 数据库检索并被报道,这一结果极大地扩展了对瓜氨酸化以及这些底物蛋白质如何受到瓜氨酸化影响的理解。作者发现结果中与 UniProt 数据库的已知的瓜氨酸位点重叠部分较少(图 3b),这可能是因为 UniProt 中描述的近 40% 的瓜氨酸化位点是基于相似性外推理论而没有实际的实验证据。此外,许多报道的位点位于组蛋白上,尤其是蛋白质末端,可能会逃过自下而上质谱策略的检测(图 3b)。图 3c 展示了单位点瓜氨酸化和多位点瓜氨酸化蛋白质分布情况,其中 70% 的已鉴定蛋白质仅有一个瓜氨酸化位点被检测到。  这个新发现的瓜氨酸化蛋白质组为推测瓜氨酸化的调控机制提供了宝贵的资源。例如,作者在髓鞘碱性蛋白(MBP)上鉴定到了九个瓜氨酸化位点,而在 UniProt 数据库中只有四个(图3d)。作者的结果提供了高质量的串联质谱图,不仅证实了已知修饰位点的存在(图3e),而且还高可信度的识别了未知的位点(图 3f)。然后作者进行了瓜氨酸化肽段的序列分析,发现在鉴定的瓜氨酸化位点两侧并没有高度保守的氨基酸序列模式(图3g),但是谷氨酸残基更频繁地出现在瓜氨酸的N末端侧附近。这与Fert-Bober 等人报道的小鼠瓜氨酸组分析结论一致。另一方面,Tanikawa 等人发现在人体组织和血浆中大约五分之一的 PAD4 底物含有 RG/RGG 基序。同样,Lee 等人及相关研究人员观察到天冬氨酸和甘氨酸残基在瓜氨酸化位点出现频率偏高。值得注意的是,这些研究使用了不同的人源细胞系或组织,因此作者的结果可能表明在不同物种之间瓜氨酸化位点周围的序列模式是不同的。为了更好地辨别瓜氨酸化蛋白质所涉及的功能,作者展示了基因本体论(GO)富集分析的热图,其显示了二十个最显著富集的细胞成分(图3h)以及KEGG途径(图3i)。作者发现小鼠大脑组织和身体器官之间存在明显差异,而瓜氨酸蛋白更多地参与大脑功能。具体来说瓜氨酸化蛋白质集中在轴突、髓鞘、核周体和突触中,因此在中枢神经系统中可能发挥着重要的作用。  图3|不同小鼠组织的大规模瓜氨酸组分析。a,不同小鼠组织中已鉴定的瓜氨酸化蛋白和瓜氨酸化位点的数量。 b,本研究中鉴定的瓜氨酸化位点与 UniProt 数据库中报告的位点比较。 c,每个鉴定的瓜氨酸化蛋白质的瓜氨酸化位点数量分布。d,本研究中确定的瓜氨酸化位点与 UniProt 数据库中关于髓鞘碱性蛋白的瓜氨酸化位点的比较。e、f,在髓磷脂碱性蛋白 R157Cit (e) 和 R228Cit (f) 上鉴定的两个瓜氨酸化位点的示例串联质谱图。g,鉴定的瓜氨酸化肽的序列。瓜氨酸化位点位于中间的“0”位置。字母的高度表示每个氨基酸在特定位置的相对频率。 h,i,使用 Metascape 生成的热图显示不同小鼠组织中显着丰富的(p 值 0.01)细胞成分 (h) (KEGG) 通路 (i)。  为了进一步拓展该方法的实用性,作者应用了二甲基化亮氨酸(DiLeu)等重标记策略,第一次实现了对瓜氨酸化进行高通量的定量研究。作者首先使用瓜氨酸化标准肽段进行测试,证明在优化反应条件下DiLeu标记和生物素硫醇标记反应可以分步进行而不互相干扰(图 4B,4C)。同时,将标准肽段按照已知比例进行4-plex DiLeu标记并混合,再进行生物素硫醇标记和瓜氨酸化分析,结果显示了非常好的定量准确性(图5)。作者进一步优化了运用该方法在复杂生物样品中进行定量分析的实验方法,并且证明此方法依然可以实现极佳的定量准确度和精确度(图6)。  图4|瓜氨酸化标准肽段测试DiLeu标记和生物素硫醇标记分步反应的特异性和效率  图5|瓜氨酸化标准肽段测试DiLeu标记和生物素硫醇标记定量分析的准确性  图6|复杂生物样品测试DiLeu标记和生物素硫醇标记定量分析的准确度和精确度  作者接下来应用该方法对DNA损伤中瓜氨酸化的作用进行了研究。作者在MCF7细胞中用三种方法造成了DNA损伤,并定量分析了蛋白质瓜氨酸化的变化。作者一共鉴定到63种瓜氨酸化蛋白以及其包含的78个瓜氨酸化位点,并发现三个实验组中的瓜氨酸化表达相比于对照组呈现出非常不同的趋势(图7A),这一结果表明瓜氨酸化在不同类型的DNA损伤模型中具有差异性的作用。通过对实验组中显著变化的瓜氨酸化蛋白进行生物过程网络分析,作者发现瓜氨酸化主要对DNA代谢,蛋白结构变化,翻译以及DNA修复等过程进行调控(图 7B,7C)。该实验结果表明蛋白瓜氨酸化对DNA损伤以及相关发病机理具有非常重要的作用。  图7|高通量定量分析研究瓜氨酸化在DNA损伤中的变化及作用(来源:Anal. Chem.)  小结  本文章介绍了一种生物素硫醇标签的设计和开发,该标签可与瓜氨酸化肽段发生特异性反应并极大地提高了瓜氨酸化的富集和检测效率。在使用标准肽和重组蛋白证明该方法的有效性后,作者进一步优化了从复杂生物样品中检测瓜氨酸化的实验过程。通过此方法对小鼠五个大脑区域和六个身体器官的蛋白质瓜氨酸化进行分析,作者鉴定出432个瓜氨酸化蛋白以及691个瓜氨酸化位点,这是迄今为止最大的数据集。该研究揭示了这种翻译后修饰可能在神经系统中发挥的关键作用,并表明它们在包括呼吸和糖酵解在内的许多代谢过程中也可能发挥着重要作用。总的来说,实验结果表明蛋白质瓜氨酸化在不同组织中具有广泛分布并参与各种生物过程,这扩展了目前对蛋白质瓜氨酸化生理作用的认知和理解。此外,作者进一步拓展了此方法的实用性,通过应用DiLeu等重标记策略第一次实现了瓜氨酸化的高通量定量研究,并利用这一方法揭示了瓜氨酸化在人体细胞DNA损伤及修复过程中的重要作用。更重要的是,该方法可以提供一种普适、简单而强大的检测方法来明确鉴定蛋白质瓜氨酸化,这也将启发和有益于未来对这种翻译后修饰在生理和病理条件下的功能作用的研究。  相关研究成果近期发表在Analytical Chemistry上的两篇文章中, 通过生物素硫醇标签辅助质谱法对蛋白质瓜氨酸化进行全局分析文章的共同第一作者是威斯康星大学麦迪逊分校博士生石亚涛,李子辉,王斌,并与中国药科大学叶慧教授课题组合作 应用二甲基化亮氨酸等重标记策略进行蛋白质瓜氨酸化高通量定量研究文章的第一作者是威斯康星大学麦迪逊分校博士生李子辉,两篇文章通讯作者为李灵军教授。更多关于李灵军教授研究团队的最新研究进展欢迎登陆课题组网站:https://www.lilabs.org/
  • 岛津质谱成像技术助力超富硒植物单粒种子原位研究
    近日,中科院高能所李玉锋研究员团队,以硒超富集植物-堇叶碎米荠(Cardamine violifolia)单粒种子为研究对象,借助北京同步辐射装置X射线荧光微分析实验站硬件和软件功能升级契机,发展了基于同步辐射X射线荧光二维/三维成像技术(SRXRF)、X射线吸收谱技术、二维质谱成像技术(MALDI-MSI)及微区计算机断层扫描(micro-CT)等技术的空间金属组学(spatial metallomics)研究框架,实现了堇叶碎米荠单粒种子中有机硒和无机硒的原位二维/三维研究,首次发现堇叶碎米荠种皮中存在甲基硒代化合物,加深了对堇叶碎米荠富硒机制的理解,并以Spatial metallomics reveals preferable accumulation of methylated selenium in a single seed of the hyperaccumulator Cardamine violifolia为题发表于 Journal of Agricultural and Food Chemistry(影响因子/JCR分区:5.895/Q1)。该研究工作得到岛津中国创新中心的实验支持。图1 Journal of Agricultural and Food Chemistry原文背景介绍硒(Se)是动物和人类必需的元素。它是硒蛋白和硒酶的重要组成部分,硒缺乏会增加各种神经、内分泌和癌症风险,更严重的是,会导致器官衰竭和死亡。世界卫生组织(WHO)和美国农业部建议成人每日膳食硒摄入量为55 ~ 200 μg。然而,在一些地区,人们的日摄入量明显低于推荐剂量(仅26 μg/天),因此,探索富硒膳食补充剂来改善人们日常硒的摄入是很有必要的。图2 堇叶碎米荠硒在植物生长周期内无法被消耗,一些百合科、十字花科和豆科植物可累积高达几千毫克/公斤的硒元素。原产于中国湖北省恩施市的堇叶碎米荠(Cardamine violifolia)已被证明是硒的超富集植物,已用作膳食补硒剂原料。&bull 单粒种子中硒的原位空间分布和形态分布堇叶碎米荠对于硒元素的耐受性和超积累的机制主要包括:(1)钙蛋白和富半胱氨酸激酶的表达下调和硒结合蛋白的表达上调 (2)体内解毒硒的泛素基因或蛋白的表达 (3) 堇叶碎米荠硒的特定代谢途径。研究发现堇叶碎米荠可以通过硫酸盐转运体和各种S/Se代谢酶来积累硒元素。而堇叶碎米荠中硒元素的主要存在形态为硒代半胱氨酸(SeCys),硒代蛋氨酸(SeMet),硒代羊毛硫氨酸,甲基硒代半胱氨酸(MeSeCys),甲基硒代蛋氨酸(MeSeMet),二甲基硒醚(DMSe)和二甲基二硒醚(DMDSe)等。图3 通过SRXRF和MALDI-MSI研究硒在单粒种子中的原位空间分布和形态研究结果表明,一方面SRXRF结果显示硒元素在整个种子中都有分布,子叶中硒含量相对高于外胚层/种皮;另一方面MALDI-MSI结果显示DMSe (m/z 107.970)、MeSeCys (m/z 184.019)和MeSeMet (m/z 212.983)主要存在于种子外胚层。硒植物毒性的一个突出原因被认为是硒氨基酸(如SeCys)错掺入蛋白质。已有研究表明,甲基化SeCys形成MeSeCys是Se超富集物的一个关键耐受机制之一, 这大大减少了非特异性取代蛋白质中的Cys的SeCys的数量。本研究中MeSeCys的发现证实了这也是堇叶碎米荠的Se耐受的重要机制之一。质谱成像MALDI-MSI方法本研究中的质谱成像部分使用岛津iMScope QT (Shimadzu, Kyoto, Japan)进行。MALDI-MSI在光学显微镜的帮助下确定所需的采集区域,用激光二极管激发的掺钕钇铝石榴石(Nd/YAG)激光(355 nm)照射种子组织切片。激光直径为40 μm,扫描步长为80 μm。对每个像素进行100次激光照射(1000 Hz重复频率)。所有数据均在正负模式下分别采集,采集范围分别为m/z 100 ~ 500和m/z 500 ~ 1000。利用IMAGEREVEAL MS分析软件对所采集的数据进行图像分析,最终得到显示多种形态硒的具体分布。图4 岛津新一代成像质谱显微镜——iMScope QT本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。
  • 天津富集参展JASIS 2012展示色谱耗材
    来自中国的天津市富集科技有限公司,是一家专注于试验室仪器耗材,特别是色谱耗材的企业。富集参加了正于日本幕张举行的JASIS 2012分析展/科学仪器展,展出了旗下“希波氏”针式过滤器、SPE固体萃取柱、微孔滤膜等耗材。
  • 1943万!自然资源部第三海洋研究所加速器质谱仪、全自动石墨化系统、气体接口系统、样品分离、纯化和富集系统-液相部分等采购项目
    一、项目基本情况项目编号:2024-HCGK-SH343项目名称:加速器质谱仪、全自动石墨化系统、气体接口系统、样品分离、纯化和富集系统-液相部分预算金额:1943.000000 万元(人民币)最高限价(如有):1943.000000 万元(人民币)采购需求:合同包1(预算金额¥1890万元):加速器质谱仪(数量:1套)、全自动石墨化系统(数量:1套)、气体接口系统(数量:1套);合同包2(预算金额¥53万元):样品分离、纯化和富集系统-液相(数量:1套),具体内容详见招标文件。合同履行期限:合同签订之日起18个月内完成到货、安装,并通过验收交付使用。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2024年06月05日 至 2024年06月13日,每天上午8:30至11:30,下午14:30至17:30。(北京时间,法定节假日除外)地点:厦门市思明区莲岳路221-1号公交大厦11楼;厦门市海沧区沧虹路95号工商银行8楼。方式:现场购买或邮寄购买。购买标书电话:颜小姐 0592-5333808/5333807(传真),谢小姐 0592-6581288。招标文件邮寄购买标书费账户:开户名:厦门市华沧采购招标有限公司 开户行:厦门银行银隆支行 账 号:8751020109007675售价:¥50.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:自然资源部第三海洋研究所     地址:福建省厦门市思明区大学路178号        联系方式:倪先生 0592-2195352      2.采购代理机构信息名 称:厦门市华沧采购招标有限公司            地 址:厦门市思明区莲岳路221-1号公交大厦11楼、厦门市海沧区沧虹路95号工商银行大厦8楼            联系方式:李先生 0592-5333087            3.项目联系方式项目联系人:李先生电 话:   0592-5333087
  • 安捷伦科技将 IMAXIO 指定为新一代测序技术靶向序列富集服务的认证服务供应商
    安捷伦科技将 IMAXIO 指定为新一代测序技术靶向序列富集服务的认证服务供应商 2012年7月3日,北京 &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)日前宣布,IMAXIO 正式成为安捷伦SureSelect新一代测序技术靶向序列富集系统的认证服务供应商。在过去的数年中,IMAXIO 一直是安捷伦芯片的认证服务供应商,2012 年初,该公司成功通过安捷伦的 SureSelect 服务供应商认证,扩展了服务范围。 IMAXIO 是一家专注于基因组学和疫苗研究的综合型生物技术公司,可以提供广泛的综合性基因组学服务,包括基于芯片的研究(比较基因组杂交研究和比较转录组学研究)和使用新一代测序方法进行DNA 和 RNA测序。最近,IMAXIO 采购了安捷伦 NGS 文库和芯片样品制备的自动工作站,有效提高了处理通量。 &ldquo 此次最新的靶向序列富集认证是一步重要举措,不仅增强了我们与安捷伦的合作关系,同时也可满足整合性基因组学研究中日益增长的需求&rdquo 。IMAXIO 基因组学事业部主任 Vé ronique Vidal 博士表示。 &ldquo SureSelect 是新一代测序技术(NGS)靶向序列富集领域中的顶尖技术,相关论文达 250 多篇,&rdquo 安捷伦基因组学市场高级总监 Kathleen Shelton 说道,&ldquo 我们希望与 IMAXIO 结成高效且富有成果的合作关系。&rdquo 为了获得认证服务供应商的身份,IMAXIO 参加了全面的现场培训,并通过了对专业知识和技能的一系列严格评估。 SureSelect 可与主要的 NGS 平台(例如 Illumina、SOLiD 与 454)相兼容。安捷伦 eArray 设计工具的用户可轻松设计定制型产品,靶向锁定任何目标基因组区域,有效提高研究效率。SureSelect 还可通过添加客户定制的基因来对通用试剂盒进行定制设计。 关于 IMAXIO IMAXIO 是一家专注于基因组学和疫苗领域的生物制药公司。基因组学事业部的工作涉及人类健康领域中伴随诊断测试开发的相关项目。IMAXIO 致力于独立开发或与合作伙伴共同开发应用于人类和动物健康领域的重组疫苗。在法国,IMAXIO 已经推出了应对细螺旋体病的人体疫苗 Spirolept。要了解更多信息,请访问 www.genomics-imaxio.com。 关于安捷伦的基因组学 安捷伦科技公司是新一代测序技术靶向序列富集和基因组学芯片领域中的全球领导者。安捷伦 SureSelect 和 HaloPlex 靶向序列富集系统可帮助研究者轻松选择要进行测序的基因组片段,避免了进行全基因组测序而造成的时间和成本浪费。HaloPlex 及其一天之内完成&ldquo 样品制备到测序仪&rdquo 的工作流程极好的配合了新一代台式测序仪的理念,而 SureSelect 在单次反应中精确捕获所有外显子组和甲基化组的功能则可与新一代测序系统完美匹配。这只是安捷伦利用从芯片生产中积累的定制合成长链寡苷酸的复杂混合物的专业技术开发出来的两个产品。其它都建立在此核心技术之上的产品系列还包括用于全基因组基因表达测定和用于比较基因组杂交的芯片,以及具有高度特异性和灵敏度的寡核苷酸荧光原位杂交产品系列 &mdash SureFISH。除了以寡核苷酸为基础的产品外,安捷伦还提供有用于样品质量检测的微流控芯片生物分析仪、加速新一代测序技术的靶向序列富集工具以及用于基因组实验的完整系列试剂、硬件、方法和生物信息学软件。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是化学分析、生命科学、诊断、电子和通信领域的技术领导者。公司的 20,000 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度,安捷伦的业务净收入为 66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问 www.agilent.com。
  • 安捷伦科技指定贝克曼库尔特基因组学公司为首家认证的靶向富集和芯片服务提供商
    安捷伦科技指定贝克曼库尔特基因组学公司为首家认证的 靶向富集和芯片服务提供商 2010 年 11 月 3 日,北京&mdash &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)和贝克曼库尔特基因组学公司今日宣布,贝克曼库尔特基因组学公司正式成为安捷伦认证的SureSelect 靶向序列捕获系统(包括结合了测序文库制备和 gDNA 制备试剂的新型 SureSelect XT 系统)服务提供商(CSP)。通过收购 Cogenics 公司,贝克曼库尔特公司已经成为了安捷伦认证的 SurePrint 芯片服务提供商,至此,该公司成为了首家同时通过安捷伦这两个平台认证的服务提供商。 贝克曼现已通过认证,能够提供AB SOLiD和 Illumina 这2种基因组分析测序平台上游的 SureSelect 靶向富集操作。研究人员使用 SureSelect 系统可以仅针对目标基因组区域而非整个基因组进行测序,从而显著提高新一代测序工作流程的速度和成本效率。 SureSelect 靶向序列捕获系统基于极为高效的杂交选择技术,可实现自动化操作并易于扩展以满足大规模测序项目的需要。该系统的基因组 DNA上样量不超过 3 微克,因此研究人员对珍稀样品也能够进行高度针对性的新一代测序。 贝克曼库尔特公司位于北卡罗来纳州莫里斯威尔市的工厂,早在 2004 年,就成为安捷伦认证的首家 SurePrint 芯片服务提供商。该公司已获得认证,能够利用安捷伦的 SurePrint 芯片平台提供基因表达、microRNA 测序以及比较基因组杂交(CGH)服务。安捷伦高灵敏度的 60 mer 寡核苷酸探针具有极高的分辨率,得到的结果高度可信;此外,安捷伦设计的完整芯片工作流程旨在为用户提供一种便捷、高效和可重现的测序方法。 &ldquo 贝克曼库尔特基因组学公司将其在新一代测序和基因组分析方面的丰富经验融入安捷伦 SureSelect 和 SurePrint 平台,这让我们倍受鼓舞,&rdquo 安捷伦基因组学中心市场总监 Chris Grimley 博士说道,&ldquo 这是一次强强联手,世界各地从事生命科学研究和药物研究的科技人员都将获益匪浅。&rdquo &ldquo 要在竞争激烈的全球测序产品市场占得先机,为客户提供优质高效的解决方案至关重要,&rdquo 贝克曼库尔特基因组学公司全球测序产品经理 Marc Rubenfield 说道,&ldquo 我们非常高兴能够与安捷伦科技公司深入合作,成为其认证的首家使用安捷伦 SureSelect 靶向序列捕获系统结合Illumina 和 AB 新一代测序平台的基因组服务提供商。通过将 SureSelect 的序列捕获能力与新一代测序技术相结合,我们便能为客户提供特定基因组区域的高质量序列信息。&rdquo 在经过相关培训并通过一系列严格的评估测试后,贝克曼最终成为安捷伦认证的服务提供商;评估测试内容包括对SureSelect 靶向序列捕获系统和全套安捷伦一体化芯片工作流程的精通程度,具体内容如下: * 使用安捷伦 2100 生物分析仪进行样品质量控制; * 使用安捷伦芯片试剂、试剂盒和优化方案进行样品标记; * 使用 SureHyb 芯片夹进行芯片杂交; * 使用安捷伦 DNA 芯片扫描仪进行芯片扫描以及用Feature Extraction软件进行数据提取; * 使用 GeneSpring 软件和安捷伦基因组工作站软件分析数据。 关于贝克曼库尔特基因组学公司 贝克曼库尔特基因组学公司总部位于马萨诸塞州丹弗斯市,是基因组学服务与核酸纯化产品的领先供应商,服务于世界各地的生命科学研究者和制药行业。贝克曼库尔特基因组学公司是贝克曼库尔特公司的全资子公司,由原贝克曼库尔特旗下的 Agencourt 生物科学公司和刚收购的 Cogenics 公司构成。该公司凭借一流的专业技术和个性化服务,为客户提供最高品质的分析结果和创新的思维。要了解更多信息,请访问:www.beckmangenomics.com 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18500 名员工在 100 多个国家为客户服务。2009 财政年度,安捷伦的业务净收入为45亿美元。要了解安捷伦科技的更多信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • 2017中国(广州)分析测试论坛召开 色谱质谱技术“炙手可热”
    仪器信息网讯 2017年2月21日,CHINA LAB 2017广州国际分析测试及实验室设备展览会暨技术研讨会在广州保利世贸博览馆如约举行。由中国广州分析测试中心、广东省科技合作研究促进中心(原广东省对外科技交流中心)、国药励展展览有限责任公司联合主办的“2017中国(广州)分析测试论坛”同期召开。下午的“色谱质谱”分会场中,5位来自科研院校、仪器厂商的专家带来最新技术及应用分享。会议现场座无虚席,色谱质谱分析技术依然“炙手可热”。“色谱质谱分析技术分会场”现场《细颗粒污染物的表征与溯源》中国科学院生态环境研究中心,环境化学与生态毒理学国家重点实验室刘倩研究员  围绕“细颗粒污染物的表征与溯源”主题,刘倩研究员带来“色谱质谱”分会场首个报告。在明确纳米颗粒物在PM2.5毒性健康效应中具有的关键作用后,刘倩研究员就如何对复杂样品中的纳米颗粒物进行快速鉴定和表征、如何甄别复杂环境介质中纳米颗粒物的来源、如何利用天然稳定同位素对PM2.5溯源等问题,介绍了团队建立的CE-ICP-MS鉴定表征复杂样品中的纳米颗粒等新型分析方法,探讨了北京地区PM2.5的来源和生成机制。《固相微萃取/气相色谱-质谱联用鉴别沉香真伪方法研究》中国广州分析测试中心,广东省测试分析研究所吴惠勤研究员  针对传统和现有沉香鉴别方法中所存在的缺乏科学数据和量化数据、取样时易损坏收藏品等问题,吴惠勤研究员介绍了团队建立的一种新型鉴别沉香真伪方法。通过采用固相微萃取(SPME)富集沉香香气成分,GC-MS测定沉香的化学组成;通过研究不同产地沉香及假沉香的香气成分,确定天然沉香的6种特征成分;通过天然沉香的GC-MS指纹图谱以及特征成分对比,即可判断沉香样品的真伪。该方法具有样品用量小、操作简便快速、检测灵敏度高、特征性强、结果准确可靠等特点,已成功用于沉香药材及其收藏品的真伪鉴别。《如何根据应用正确用水》赛多利斯中国张燕芬  赛多利斯中国产品经理张燕芬带来题为《如何根据应用正确用水》的报告,与到场观众一同探讨了GB国标对实验室用水的要求、纯水等级划分制备方法、如何在分配环节保证纯水水质等问题。通过比较现有纯水设备的技术及指标性能,介绍赛多利斯在实验室纯水领域提供的 系列代表性产品。《微生物降解多环芳烃的代谢机制》中山大学生命科学学院栾天罡教授  多环芳烃(PAHs)具有“三致效应”,来源于自然和人类生活,在环境中具有普遍性,微生物降解则是环境中PAHs的重要去除方式。基于上述考虑,栾天罡教授团队以珠江口红树林湿地生态系统为研究对象,通过采取SPME-GC-MS等分析方法,深入探讨PAHs的细菌降解途径与机理,揭示菌-菌、菌-藻可协作参与PAHs的降解并提高对PAHs的去除效率;复合微生物降解体系可用于PAHs的去除和污染修复;PAHs污染能导致抗生素耐药基因污染等关联机制。《固相微萃取探针研制与活体检测》中山大学化学与化学工程学院环境化学研究所欧阳钢锋教授  固相微萃取(SPME)作为一项快速简便的国际前沿绿色采样及样品前处理技术,自上世纪70年代诞生以来,已被列入1990-2000年分析化学领域六个“GREAT IDEAS”之一,广泛应用于环境、食品、香料、生物、药物分析等领域。欧阳钢锋教授团队将重点放在固相微萃取探针的研制和活体检测上,在基于有机金属框架材料、碳材料和高分子材料等系列SPME探针的研制和表征方面取得的进展,并利用SPME技术对动植物活体中的有机污染物进行采样分析和跟踪检测。
  • 通过质谱分析发现两百万年前牙齿内含最古老人族基因
    人族指人类及其古老的亲属,大约700万年前出现在非洲。据《自然》网站10日报道,在一项最新研究中,来自丹麦和南非的科学家从生活在200万年前的非洲原始人罗百氏傍人的牙齿化石中提取到了其基因信息,这是迄今发现的最古老的人族基因,将基因记录追溯到了以前无法企及的时间。描述相关蛋白质序列的论文已经提交生物预印本网站。  哥本哈根大学和开普敦大学研究人员领导的团队,对在约翰内斯堡西北部发现的4个罗百氏傍人的化石进行了采样。长期以来,研究人员一直在争论这些原始人与其他古代人类物种的关系。  研究团队使用质谱分析技术,分析了每个样本牙釉质(牙齿的矿物外层)中的数百种氨基酸。他们在一些牙齿中发现了釉原蛋白-Y,其由Y染色体上的一个基因产生,他们因此确定这些牙齿属于男性。另外两颗牙齿缺乏釉原蛋白-Y的迹象,且含有该蛋白的X染色体版本,他们推断这些样本可能来自女性。  研究人员指出,这是一个惊人的发现,这么漫长的岁月,这些遗骸“几乎变成了石头”。  研究团队对所有4个样本中约400个相同的氨基酸进行了测序,在此基础上绘制出了一个简单的进化树。  研究团队指出,根据这些古老遗骸的基因数据构建的进化树,“有望成为古人类学领域一个变革性突破”。研究古老的蛋白质可提高人们对非洲南方古猿等在人类家谱中的位置的理解,有“人类祖母”之称的“露西”就属于南方古猿。不过,也有其他科学家表示,古老的蛋白质是否有助人们对人类进化的图景达成共识,目前还没有定论。
  • NimbleGen SeqCap RNA序列富集系统, 让您的RNA测序事半功倍!
    在利用 RNA 测序技术进行基因表达分析的时候,您是否因为需要的测序量太大而苦恼呢?是否因为对于目标区域的测序深度不够而一筹莫展呢?现在开始,携手罗氏,您的 RNA 测序将进入新的时代!罗氏 NimbleGen 序列捕获家族的新成员 SeqCap RNA 系列产品,通过对目标 RNA 区域的靶向富集能够显著降低 RNA-seq 对于测序量的要求并极大增加低表达转录本的覆盖度, 大大降低您进行基因表达相关研究的成本。除此之外,SeqCap RNA 序列富集系统还具有以下优势:简化实验流程—— 样本制备过程无需Poly A富集或rRNA去除步骤,SeqCap RNA 直接针对您关注的编码或非编码区进行富集。 大大降低样本起始量—— 您可以用低至 10ng 的总 RNA 开始实验。 更大的实验灵活度—— 该方法适用于多种实验设计方案,从小 panel 分析到全转录组分析,或其他如 lncRNA 测序的设计。 降低对测序量的要求——举例来说,一个包含 250 个基因的测序项目,使用 SeqCap RNA 进行靶向富集后,您可以少用 50X 的测序深度来达到和传统RNA-seq 相当的检测精确度和灵敏度。通过把测序 reads 集中在您的目标区域和非管家基因上,增加对于低丰度转录本和异构体的定量能力及检测效率,让您的 reads 物尽其用。您在实验过程中是否对以上列出的各种优势有所需求呢?如果感兴趣的话,您可以从罗氏技术专家处获得用 SeqCap RNA 技术发表的文献资料,我们也将随时回答您的各种技术问题。*本文所有数据均来自罗氏NimbleGen总部*NIMBLEGEN SEQCAP为罗氏注册商标*仅用于生命科学研究,不用于诊断更多信息请点击相关链接(http://www.nimblegen.com/products/seqcap/rna-system/index.html)
  • 基于电荷检测质谱(CDMS)对AAV提取的DNA的分析揭示基因组的截断
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章,Analysis of AAV-Extracted DNA by Charge Detection Mass Spectrometry Reveals Genome Truncations1,文章的通讯作者是来自印第安纳大学化学系的Jarrold, Martin F.教授。  腺相关病毒(AAV)是一种小的(26纳米)、无包膜二十面体病毒。由于其低免疫原性和高组织亲和性,AAV已成为一种很有前途的基因治疗载体。AAV衣壳包含三种病毒蛋白质,VP1、VP2和VP3。对于来自HEK细胞的重组AAV (rAAV),VP1-3的比例约为1:1:10。AAV包裹单链(ss)DNA基因组。野生型基因组的长度约为4.7 kB。基因组两侧有两个倒置末端重复序列(ITRs),它们在复制和基因组包装中起着重要作用。目前,主要用于rAAV研究的生产平台是人HEK293细胞的瞬时转染,然而其HEK293细胞的制造限制其大规模地用于AAV载体的生产。杆状病毒感染的Sf9细胞系已被发现是一种可行的生产方法,但是研究发现在生产过程中出现的ITR丢失和基因组截断现象,似乎成为了Sf9细胞系必须关注的一个问题。因为包裹着不完整的基因组的载体,会使得治疗的有效性降低。  在本研究中,作者提出了一种利用电荷检测质谱(CDMS)直接检测从AAV中提取的DNA的方法。CDMS可以使用静电线性离子阱(ELIT)同时检测单个粒子的电荷数和质荷比,从而直接获得粒子的质量。测量是在一个自制的仪器上进行的,简单地说,纳喷雾(Advion Triversa Nanomate)产生的离子通过金属毛细管进入仪器,然后通过几个不同真空区域。第一个区域包含FUNPET(an ion-funnel ion-carpet hybrid),随后是射频六极杆和分段射频四极杆。FUNPET会破坏气体通过毛细管时形成的气体射流,样品离子随即在六极杆中被热化,最终的离子能量由六极杆上的直流电位决定。离子束在分段四极杆中的径向分布被压缩,经过四极杆的离子通过非对称艾泽尔透镜聚焦到双半球形偏转能量分析器中,并设置传输具有较窄动能分布的离子(以100 eV/z为中心)。传输的离子被聚焦到ELIT中,其中一些离子被捕获并通过位于ELIT端帽之间的检测圆筒来回振荡。振荡离子产生的信号被电荷敏感放大器接收。信号被放大和数字化,然后用快速傅里叶变换(FFTs)进行分析。短时间窗口FFT通过每个捕获事件的信号进行转换,以确定离子是否在整个事件中被捕获。没有在整个事件中存活的离子信号将被丢弃。振荡频率与m/z有关,振幅与电荷成正比。用这种方法测量了数千个离子,并将其分成直方图以给出质量分布。    图1. 来自Sf9细胞的AAV8-CMV-GFP的CDMS测量。(a,b)未孵育样品的质量分布和电荷与质量散点图。电荷与质量散点图中的橙色线是球形离子瑞利电荷极限的预测。(c,d)在45°c孵育15分钟后测量的质量分布和散点图。(d)中的插图显示了基因组从衣壳挤出的示意图。(e,f) 80°C孵育15 min后的结果。绿色虚线表示释放的ssDNA GOI的序列质量,紫色虚线表示互补DNA链碱基对进入溶液后的序列质量。图1第一排的图片显示了用CDMS测量的Sf9细胞制备的AAV8-CMV-GFP的质量分布。在4.5MDa处的主峰是由于rAAV对GOI进行了包装,在5.2MDa处的峰值是由于异质DNA的包装达到了包装容量,在3.7处MDa的肩峰是由于空颗粒。对应的电荷-质量散点图如图1第二排所示。其中空颗粒和包装了DNA的颗粒在电荷上的数值比较接近是因为DNA被包裹到了衣壳的内部。图1c显示了AAV8-CMV-GFP在45°C孵育15min后测量的质量分布。rAAV已经开始分解,存在大量质量低于3 MDa的离子。在3.7 MDa处的空颗粒的数量也大幅增加,这表明基因组正在被释放。而在80℃孵育15min后可见AAV已经完全分解,对应峰也消失了,而剩下的峰与推测的互补DNA链的分子量相当。图2显示了培养后为提取GOI而测量的rAAV载体的CDMS质量分布和电荷-质量散射图。值得注意的是,AAV8-CMV-CRE和AAV8-CAG-GFP(来自Sf9细胞)的平均电荷约为400 e, AAV8-CMV-GFP(来自HEK细胞)的平均电荷约为900 e。平均电荷的差异可能反映了dsDNA的整体几何结构,电荷越高的GOIs具有更广泛的结构。    图2. 在80°C孵育15分钟后记录的代表性质量分布和电荷与质量散点图。结果显示AAV8-CMV-CRE、AAV8-CAG-GFP和AAV8-EF1a-GFP来源于Sf9细胞,AAV8-CMV-GFP来源于HEK细胞。紫色虚线显示dsDNA GOI的序列质量。插图显示了dsDNA GOI的峰值的扩展视图。图3a显示了测量到的dsDNA GOI与AAV样本序列质量的偏差的柱状图,对于大多数AAV样本,测量的dsDNA GOI大于序列质量。这种偏差可以用反离子来解释。DNA在中性溶液中带负电荷,因为它的一些主链磷酸被电离,dsDNA GOI有2219−3443个碱基对,因此它们可能有多达4438−6886个反离子。最可能的反离子是NH4+因为样品是用醋酸铵溶液电喷涂的。如果所有的dsDNA GOI主链磷酸都被电离并且有NH4+反离子,则附加质量(超出完全电离序列质量)为80 ~ 124 kDa。而有些dsDNA的分子量低于预测的序列质量,这是因为序列发生了截断导致的,图3d显示了为该样品测量的DNA峰值的扩展视图。峰宽可以提供截断分布的信息。如果所有的DNA链都损失了425 nt,峰值就会很窄。另一方面,如果截短长度分布较宽,则会产生较宽的峰值。图3d中的峰值相对较窄,说明分布较窄。有一个高质量拖尾,这可能表明一些基因组被截断了小于425 nt。    图3. 来自Sf9和HEK细胞的一系列GOIs的AAV8、AAV9和AAVDJ血清型的dsDNA质量测量总结。(a)测量质量与序列质量偏差的柱状图。(b)考虑反离子的测量质量与预期质量的偏差的柱状图。(c) AAV基因组结构示意图。(d)来自HEK细胞的AAV8-CMV-CRE的dsDNA GOI峰的扩展视图。最后,将CDMS测量的基因组截断与来自第三代测序方法的信息进行比较将具有指导意义。尽管CDMS测量可以判断基因组是否被截断以及缺失的数量,但它不能确定截断发生在哪里。关于截断发生位置的信息可以从第三代测序中获得,这些信息反过来可以深入了解其机制。因此,CDMS测量全基因组MW和第三代测序是互补的。CDMS测量可用于筛选截断的基因组,以便通过第三代测序进行后续深入分析。  撰稿:李孟效  编辑:李惠琳  文章引用:Analysis of AAV-Extracted DNA by Charge Detection Mass Spectrometry Reveals Genome Truncations  李惠琳课题组网址www.x-mol.com/groups/li_huilin  参考文献  1. Barnes, L. F. Draper, B. E. Kurian, J. Chen, Y. T. Shapkina, T. Powers, T. W. Jarrold, M. F., Analysis of AAV-Extracted DNA by Charge Detection Mass Spectrometry Reveals Genome Truncations. Analytical Chemistry, 4310-4316.
  • 安捷伦收购Avida Biomed|高性能 NGS 靶向富集工作流程开发
    创新的化学方法可以在同一样本上同时进行基因组和表观基因组分析,从而为精准医学提供更深入的洞见2023 年 1 月 4 日,北京——安捷伦科技有限公司(纽约证交所:A)今天宣布收购 Avida Biomed。这是一家初创的生命科学公司,为临床研究人员开发具有独特性能的高性能靶向富集工作流程,利用下一代测序(NGS)方法研究癌症。此次收购补充了安捷伦市场领先的 SureSelect 产品组合,并进一步增强了安捷伦扩展到高成长性的临床研究和诊断市场的战略。 Avida Biomed 的化学试剂和检测方法与包括 Magnis 和 Bravo 在内的安捷伦自动化平台相兼容,这将有助于有效地扩展研究性实验和常规样本测试。Avida Biomed 的创新基因组学工具可以从单个样本中同时进行基因组和 DNA 甲基化分析,而且不会影响灵敏度或特异性。该公司简化的检测方案(包括文库制备)可以在一个流程内完成,从而实现检测结果的快速周转。这种可自动化的工作流程已经过验证,可用于多种样本类型,包括对性能参数要求苛刻的液体活检。安捷伦诊断和基因组学集团总裁 Sam Raha 表示:“Avida Biomed 的才华横溢的科学家和基因组学行业资深人士组成的团队创造了一流的工具集,与安捷伦现有的 NGS 产品高度互补。我们很高兴地欢迎 Avida Biomed 团队加入安捷伦。我们也非常兴奋能够将这些强大的工具带给我们在世界各地的肿瘤学客户,他们正在努力提高对癌症的理解以及癌症患者的诊断和治疗。”Avida Biomed 的技术将使从事精准医学工作的科学家能够开发各种基于新方法的应用,包括生物标志物发现、临床试验患者入组、诊断和预后、治疗选择和疾病复发。Avida Biomed首席执行官Shengrong Lin表示:“我们很荣幸也很高兴能与安捷伦合作,将我们的技术推向市场。靶向富集是对科学家感兴趣的目标基因进行深入分析的关键。我们期待着进一步结合我们的资源和专业知识,使我们的工具和技术能够为全球临床研究人员广泛使用。”
  • 中国化学会首届全国质谱分析研讨会召开
    仪器信息网讯 2014年4月26-27日,由中国化学会、国家自然科学基金委员会主办,中国化学会质谱分析专业委员会(以下简称为:质谱分析专业委员会)、清华大学化学系/分析中心承办的&ldquo 中国化学会首届全国质谱分析学术研讨会&rdquo 在北京西郊宾馆召开,来自全国各地79个单位的代表约420人参加了此次会议,汇集了院士、杰青、千人、百人等一批优秀人才。 会议现场 清华大学林金明教授主持开幕式   研讨会由质谱分析专业委员会秘书长、清华大学林金明教授主持。质谱分析专业委员会主任、南京大学陈洪渊院士,国家自然科学基金委化学部分析化学学科主任庄乾坤教授分别致开幕辞。 质谱分析专业委员会主任、南京大学陈洪渊院士 国家自然科学基金委化学部 分析化学学科主任庄乾坤教授   据陈洪渊院士介绍,随着质谱的快速发展和普及,中国化学会2013年批准成立质谱分析专业委员会,而此次研讨会是专业委员会成立后举办的首个全国性学术活动。为了迎接本次会议的召开,质谱分析专业委员会与《中国科学· 化学》共同推出了质谱分析专刊,专刊共收录22篇评述报告,集中展示中国学者在质谱分析领域的研究进展。   本次研讨会设大会报告、分会报告、墙报展,并由岛津公司赞助了优秀论文奖,内容涵盖质谱仪器研制与新技术、新方法,以及质谱在环境、食品、生命科学、医药等领域的应用。   从15个大会报告内容来看,生命科学研究仍然是中国学者研究的重点,15个大会报告中8个与生命科学有关,蛋白质组学更是热点,有4个报告涉及此。 中科院大连化物所张玉奎院士 复旦大学杨芃原教授   据中科院大连化物所张玉奎院士介绍,其所在的中科院分离分析化学重点实验室拥有各类质谱仪器76台套。复旦大学杨芃原教授也在报告中表示,中国用于蛋白质研究的质谱数量很大,如:蛋白质科学基础设施(北京)质谱规模在50台,蛋白质科学基础设施(上海)30台,华大基因(深圳)100台,复旦大学生物医学研究院30台。可见,对于蛋白质组学研究,质谱已经成为不可或缺的工具。 军事医学科学院钱小红研究员 中科院大连化物所叶明亮研究员   凭借先进高端的质谱设备,蛋白质组学的研究已经有了飞速的发展,目前中国科学家鉴定到的蛋白质数量已达到12000个左右,但专家们也提出,蛋白质组学研究仍然面临巨大挑战。人类蛋白质丰度范围很广,目前可鉴定到的蛋白大多数为高丰度蛋白,对于低丰度蛋白的鉴定还缺乏有效的方法。此外,对于蛋白质大规模、非标记的绝对定量也是难题。在本次研讨会上,张玉奎院士、杨芃原教授、中科院大连化物所叶明亮研究员、军事医学科学院钱小红研究员分别介绍了应对上述挑战的一些新方法和新技术,如改变样品前处理的方式,使用新的富集及分离材料 使用新的质谱数据处理方法,以及搭建集成化的蛋白质质谱分析平台等。 中科院高能物理研究所柴之芳院士 清华大学张新荣教授 安捷伦公司杜伟博士   此外,中科院高能物理研究所柴之芳院士介绍了利用质谱研究金属组学和金属蛋白质组学,并将此方法用于阿尔茨海默病的病因研究。清华大学张新荣教授介绍了&ldquo 单细胞质谱分析&rdquo ,据其介绍,2014年,美国《科学》杂志将单细胞生物学列为值得特别关注的领域,单细胞质谱分析可以给科学家提供许多新的生物学信息,不仅可以验证过去的经典方法的结论,而且可以发现许多未曾意料或被掩盖的规律,质谱工作者应该关注,可以将其作为一个新的研究方向。安捷伦公司杜伟博士介绍了安捷伦在系统生物学中的最新技术及应用。 北京大学刘虎威教授 中国医学科学院药物研究所再帕尔· 阿不力孜研究员 岛津公司端裕树博士 中科院化学所陈义研究员   质谱离子化新方法研究则是大会报告中居于第二热度的内容,15个报告中有5个报告与此相关。敞开式离子源(AIM)是2004年才出现的一种新型的离子源,其具有快速、可直接分析等优势,由此也得到了科学家们的亲睐。北京大学刘虎威教授介绍实时直接分析离子源DART离子化的新技术&mdash &mdash 等离子体辅助激光解吸附离子化及敞开式表面辅助解吸附离子化,以提高DART的灵敏度。中国医学科学院药物研究所再帕尔· 阿不力孜研究员介绍了其课题组研制的敞开式质谱分子成像装置及应用,据其介绍,相比于现有的质谱成像技术,空气动力辅助离子化质谱成像技术(AFAI-MSI)可适用于大体积样品,可远距离检测,并可兼容多种质谱仪,可获得更丰富更全面的信息,AFAI-IMS在药物及其代谢物研究方面有很大优势。岛津公司端裕树博士介绍了岛津公司最新研制的敞开式离子源解析电晕束离子源(DCBI)及应用。中科院化学所陈义研究员介绍了其课题组进行的质谱离子化新方法探索,研制了位置可调的双枪离子化方法,并用运载离子化、镀金光子晶体离子化等方法提高测定的灵敏度。 中科院生态环境研究中心江桂斌院士   此外,在大会报告环节,中科院生态环境研究中心江桂斌院士介绍了&ldquo 色谱质谱在新污染物发现中的应用&rdquo ,据其介绍目前环境污染物中,PFOS含量在ppt级,并呈下降趋势 PBDEs在ppb级,也呈下降趋势 SCCPs在ppm级,呈现上升趋势。除了现有已知的污染物外,江桂斌课题组还利用MC-ICP-MS、 FT-ICR-MS等技术用于新污染物发现研究。 浙江大学潘远江教授   清华大学林金明则介绍了液滴形成与质谱联用,其主要研究了两种不同的液滴混合的方式,并通过质谱分析两种不同种类液滴混合后发生的反应。浙江大学潘远江教授则介绍了电喷雾质谱中苄基迁移反应的机理。 现场展示   本次研讨会还设立了仪器展示,岛津、安捷伦、赛默飞、天瑞仪器、威思曼、迪马、瑞达、磐合、兰博、正红塑料等进行了现场展示。   据悉,2015年秋天,中国化学会第二届全国质谱分析学术研讨会将在美丽的杭州召开,由浙江大学承办。(撰稿:杨娟)
  • 铀系放射性核素激光质谱分析技术取得突破
    铀系放射性核素(230Th-231Pa-232Th-238U)是海洋碎屑沉积物定年、评估沉积颗粒侧向迁移程度、以及重建粉尘通量、表层海洋输出生产力、深海洋流流速、深海氧化还原状态所依赖的重要指标。对于晚第四纪深海沉积物中超痕量的230Th和231Pa而言,其浓度范围一般在几到几百pg/g,是自然界中丰度最低的一类核素。传统分析230Th和231Pa含量的溶液方法化学处理流程复杂、耗时久,溶样和化学分离时Pa的回收率难以保证稳定。开展沉积物230Th和231Pa含量的可靠分析,还需精确标定人工放射性核素(229Th、233Pa)的混合稀释剂溶液,但233Pa的半衰期大约只有一个月,每批次的实验分析均需重新配制和标定稀释剂溶液。因此,常规开展沉积物230Th和231Pa的分析受到了极大限制,目前国内外仅有少数单位可以进行此类分析。为了深入开展海洋沉积物铀系核素的地球化学研究,充分发挥铀系核素的古海洋应用潜力,显然需要更高效、便捷的分析方法。本研究另辟蹊径,利用激光剥蚀-多接收质谱技术来突破上述分析难题。海洋沉积物基质复杂,结构松散,无法直接进行激光剥蚀。为此我们首先开发了海洋沉积物高温熔融玻璃化的方法。在中国科大黄方教授课题组建立的火山岩粉末小样品玻璃化方法的基础上,本研究针对海洋沉积物富高温挥发组分(如碳酸钙、硫酸盐等)的特点进行了改进。在得到均一硅酸盐玻璃样品后,我们进一步建设了激光剥蚀质谱分析方法。由于质谱中232Th拖尾对丰度极低的230Th、特别是231Pa的信号存在显著干扰,为了可靠获取U-Th-Pa在质谱仪中的分馏,需制备富集230Th和231Pa但不受232Th拖尾影响的玻璃标样。我们利用处于铀系衰变平衡的钙铀云母矿物,制备了不含232Th(低于检测限)、且富集231Pa的玻璃标样。利用太平洋深海表层沉积物,制备了富230Th而232Th拖尾可以忽略的玻璃标样。同时,基质效应、拖尾干扰稳定性、多原子干扰、离子计数器在超低计数时的性能等,均可能对230Th和231Pa的信号存在不确定的影响。事实上,以往的激光剥蚀质谱分析典型的浓度测量范围在ng/g及以上,对于自然界中极低含量的231Pa,此前从未报道过激光剥蚀质谱分析。本研究对这些不确定性进行了系统验证,将激光剥蚀硅酸盐典型分析的元素/同位素含量测试范围向下拓展了2-3个数量级。研究者对一系列已知230Th和231Pa含量的海洋沉积物样品(利用溶液稀释剂法进行测试)进行了分析对比,进一步验证了极低丰度下海洋沉积物230Th和231Pa激光质谱分析测试的可靠性。本研究建立的方法(图1)可以实现多种类型的海洋沉积物中230Th、231Pa、232Th、238U的快速准确测量,极大提高了样品处理与测试效率。对存在230Th过剩的海洋沉积物样品的230Th/232Th分析的准确度在±2%以内,而对230Th衰变平衡的样品(230Th含量低至数十pg/g),230Th/232Th的准确度在±5%以内。231Pa/232Th比值的分析的准确度在±12%以内(231Pa含量低至几pg/g, 溶液稀释剂分析准确度一般在百分之几的水平)。因此,海洋沉积物万亿分之一浓度水平的铀系核素激光质谱分析技术完全满足实际需求,具有广泛的应用前景。图1.本研究分析方法的主要流程上述研究成果近期以“Determination of picogram-per-gram concentrations of 231Pa and 230Th in sediments by melt-quenching and laser ablation mass spectrometry”为题,发表于分析化学领域Nature Index期刊《Analytical Chemistry》。南京大学博士研究生郑健帆为论文的第一作者,陈天宇教授为论文的通讯作者。南京大学内生金属矿床成矿机制研究国家重点实验室及关键地球物质循环前沿科学中心为论文的第一和通讯单位,合作单位包括青岛海洋科学与技术试点国家实验室、布里斯托尔大学、明尼苏达大学、自然资源部海洋一所。该论文得到了西太平洋地球系统多圈层相互作用重大研究计划等基金项目的联合资助。
  • 铀系放射性核素激光质谱分析技术取得突破
    铀系放射性核素(230Th-231Pa-232Th-238U)是海洋碎屑沉积物定年、评估沉积颗粒侧向迁移程度、以及重建粉尘通量、表层海洋输出生产力、深海洋流流速、深海氧化还原状态所依赖的重要指标。对于晚第四纪深海沉积物中超痕量的230Th和231Pa而言,其浓度范围一般在几到几百pg/g,是自然界中丰度最低的一类核素。传统分析230Th和231Pa含量的溶液方法化学处理流程复杂、耗时久,溶样和化学分离时Pa的回收率难以保证稳定。开展沉积物230Th和231Pa含量的可靠分析,还需精确标定人工放射性核素(229Th、233Pa)的混合稀释剂溶液,但233Pa的半衰期大约只有一个月,每批次的实验分析均需重新配制和标定稀释剂溶液。因此,常规开展沉积物230Th和231Pa的分析受到了极大限制,目前国内外仅有少数单位可以进行此类分析。为了深入开展海洋沉积物铀系核素的地球化学研究,充分发挥铀系核素的古海洋应用潜力,显然需要更高效、便捷的分析方法。本研究另辟蹊径,利用激光剥蚀-多接收质谱技术来突破上述分析难题。海洋沉积物基质复杂,结构松散,无法直接进行激光剥蚀。为此我们首先开发了海洋沉积物高温熔融玻璃化的方法。在中国科大黄方教授课题组建立的火山岩粉末小样品玻璃化方法的基础上,本研究针对海洋沉积物富高温挥发组分(如碳酸钙、硫酸盐等)的特点进行了改进。在得到均一硅酸盐玻璃样品后,我们进一步建设了激光剥蚀质谱分析方法。由于质谱中232Th拖尾对丰度极低的230Th、特别是231Pa的信号存在显著干扰,为了可靠获取U-Th-Pa在质谱仪中的分馏,需制备富集230Th和231Pa但不受232Th拖尾影响的玻璃标样。我们利用处于铀系衰变平衡的钙铀云母矿物,制备了不含232Th(低于检测限)、且富集231Pa的玻璃标样。利用太平洋深海表层沉积物,制备了富230Th而232Th拖尾可以忽略的玻璃标样。同时,基质效应、拖尾干扰稳定性、多原子干扰、离子计数器在超低计数时的性能等,均可能对230Th和231Pa的信号存在不确定的影响。事实上,以往的激光剥蚀质谱分析典型的浓度测量范围在ng/g及以上,对于自然界中极低含量的231Pa,此前从未报道过激光剥蚀质谱分析。本研究对这些不确定性进行了系统验证,将激光剥蚀硅酸盐典型分析的元素/同位素含量测试范围向下拓展了2-3个数量级。我们对一系列已知230Th和231Pa含量的海洋沉积物样品(利用溶液稀释剂法进行测试)进行了分析对比,进一步验证了极低丰度下海洋沉积物230Th和231Pa激光质谱分析测试的可靠性。本研究建立的方法(图1)可以实现多种类型的海洋沉积物中230Th、231Pa、232Th、238U的快速准确测量,极大提高了样品处理与测试效率。对存在230Th过剩的海洋沉积物样品的230Th/232Th分析的准确度在±2%以内,而对230Th衰变平衡的样品(230Th含量低至数十pg/g),230Th/232Th的准确度在±5%以内。231Pa/232Th比值的分析的准确度在±12%以内(231Pa含量低至几pg/g, 溶液稀释剂分析准确度一般在百分之几的水平)。因此,海洋沉积物万亿分之一浓度水平的铀系核素激光质谱分析技术完全满足实际需求,具有广泛的应用前景。图1.本研究分析方法的主要流程上述研究成果近期以“Determination of picogram-per-gram concentrations of 231Pa and 230Th in sediments by melt-quenching and laser ablation mass spectrometry”为题,发表于分析化学领域Nature Index期刊《Analytical Chemistry》。南京大学博士研究生郑健帆为论文的第一作者,陈天宇教授为论文的通讯作者。南京大学内生金属矿床成矿机制研究国家重点实验室及关键地球物质循环前沿科学中心为论文的第一和通讯单位,合作单位包括青岛海洋科学与技术试点国家实验室、布里斯托尔大学、明尼苏达大学、自然资源部海洋一所。该论文得到了西太平洋地球系统多圈层相互作用重大研究计划等基金项目的联合资助。
  • 氨基糖苷类抗生素检测新方案 样本富集净化新选择——AGs免疫亲和柱!
    氨基糖苷类化合物(AGs)是由两个或两个以上氨基糖通过糖苷键与氨基环醇骨架连接而成的碱性低聚糖抗生素。这类抗生素包括:链霉素、新霉素、卡那霉素、庆大霉素、壮观霉素等。他们共同特点是水溶性好、性质稳定、抗菌谱较广,又因其价格低廉,在兽药领域应用广泛。AGs存在一定程度的耳毒性、肾毒性和神经肌肉阻滞作用。目前世界多个国家和组织建立了AGs在动物源食品中的相关限量标准,我国GB 31650-2019规定AGs在动物源食品中的限量如下所示:AGs检测方法及制约因素AGs分子中因富含氨基和羟基而呈强极性,其分子中缺少发色团和荧光团,反相色谱保留较差,因此动物源食品中 AGs的检测比其他抗生素更为复杂。目前 AGs的检测方法主要有免疫分析法、高效液相色谱-质谱/质谱法(HPLC-MS/MS)、液相色谱-串联质谱法(LC-MS-MS),其中免疫分析法方便快速更适合定性筛查检测,HPLC-MS/MS、LC-MS-MS定量准确、灵敏度高更适合确证检测。在乳及乳制品中,GB/T 22969-2008《奶粉和牛奶中链霉素、双氢链霉素和卡那霉素残留量》,虽然只规定了链霉素、双氢链霉素和卡那霉素3种氨基糖苷类药物残留量的高效液相色谱-串联质谱测定的确证方法,但GB 31650-2019《食品中兽药最大残留限量》中还规定了其他氨基糖苷类药物包含大观霉素、安普霉素、庆大霉素、新霉素等,这些项目也是实验室对乳及乳制品安全检测过程的必检项目。目前HPLC-MS/MS、LC-MS-MS方法可对多种AGs进行同时检测,但是一次性不能对多种氨基糖苷类药物富集净化是提高检测效率的主要制约因素之一!在动物组织中,GB/T 21323-2007《动物组织中氨基糖苷类药物残留量的测定 高效液相色谱-质谱/质谱法》规定了动物组织中大观霉素、潮霉素B、双氢链霉素、链霉素、丁胺卡那霉素、卡那霉素、安普霉素、妥布霉素、庆大霉素和新霉素10种氨基糖苷类药物残留量的高效液相色谱-串联质谱测定的确证方法。但此检测AGs的方法前处理过程使用C18富集净化,检测限仅为20-100μg/kg。美正氨基糖苷类免疫亲和柱美正通过多年的积累,开发出一种使用氨基糖苷类免疫亲和柱前处理的方法,解决了动物源性食品中氨基糖苷类抗生素检测过程中前处理富集净化的难点。使用氨基糖苷类免疫亲和柱的前处理方法,可以将动物源食品中11种氨基糖苷类抗生素进行一次性特异性富集净化,能够更好地消除基质干扰,既提高了前处理富集净化效率又提高了分析的准确度和灵敏度。药物种类壮观霉素潮霉素B双氢链霉素链霉素丁胺卡那霉素卡那霉素安普霉素妥布霉素庆大霉素新霉素巴龙霉素产品特点特异性强:免疫学原理,对样本中AGs选择性高、特异性结合能力强;操作简单:可穿透式柱塞,使用便捷;性能优异:AGs加标回收率80-120%,准确度高样本类型动物源性食品,包括乳制品、动物组织及水产品等。药物残留类免疫亲和柱免费试用!美正在药物残留检测领域有更多的前处理富集净化方法,值美正十五周年之际,意向用户可对我司药物残留类免疫亲和柱进行免费试用。
  • 宁波大学余绍宁团队成功研发全自动、多通道的微生物富集系统
    微生物(细菌/真菌/病毒)种类繁多而又无处不在,与我们的生活和健康紧密相关。对微生物的研究和应用,经常要进行捕获和分离。如何快速捕获、分离复杂体系中的未知微生物,一直是微生物领域的痛点。日前,宁波大学材化学院/质谱研究院余绍宁团队在微生物富集技术中取得突破--研发了系列普适性微生物(细菌/真菌)富集试剂盒(可用于临床血培养瓶、土壤、环境水体和空气等复杂条件下的富集),并就此开发出了全自动、多通道的微生物富集系统(CM-Enricher100)。普适性微生物(细菌/真菌)富集试剂盒依赖于磁珠表面多种化学亲和试剂的修饰,可对所研究的超过100种细菌/真菌进行高效率、非特异性地捕获富集。CM-Enricher100微生物富集系统,则借助于目前商业化的磁珠核酸自动化捕获原理,利用磁力装置对捕获微生物后的磁珠进行回收。其不同点是结合了专用的普适性微生物捕获试剂盒,以完成对细菌/真菌的快速捕获。该系统及其试剂盒可使整个微生物富集、清洗、回收过程在半小时内完成。该系统的可能应用场景包括但不限于:临床血培养瓶未知微生物的富集(双磁珠法);临床尿液、泪液、体液、脑脊液等未知微生物的富集(三磁珠法);水产养殖水体微生物的富集;土壤中未知微生物的富集;畜牧场空气中微生物的富集;环境监测水体中微生物的富集。该技术成果已通过传鸣(宁波)化学科技有限公司(http://www.cm-chem.com;0574-86551027)进行了产业化,欢迎进行不同领域、不同应用场景的合作研究。 CM-Enricher100全自动微生物富集仪普适性微生物富集试剂盒系列产品(适用于临床血培养瓶、体液、土壤、环境水体和空气等的微生物捕获富集)
  • 萃取富集-石墨炉原子吸收法测试工业废水中铊含量
    铊及铊化物都具有剧毒,铊对动植物的毒性远大于铅、镉、汞等其他重金属。《GB 31573-2015 无机化学工业污染物排放标准》中规定涉铊的无机化合物工业企业,其车间或生产设施废水排放口的铊总量限值为0.005 mg/L。现行水质中铊含量测定标准《HJ 748-2015 水质铊的测定石墨炉原子吸收分光光度法》中列出了两种测试方法:沉淀富集法和直接法。直接法对于基体复杂的废水样品而言,基体影响大,且灵敏度不足,准确性存疑;沉淀富集法则需要用到溴水(剧毒试剂)、离心机(额外的实验设备)等,对实验室管理体系要求较高,增加了企业的管理成本。珀金埃尔默开发了一种利用铁盐和溴化钾试剂对废水样品中的铊进行萃取富集处理的方法,有效去除碳酸锂生产企业排放废水中的复杂基质,并降低对石墨炉原子吸收光谱仪的灵敏度要求,大大简化了处理过程,节省企业的管理成本,结果准确可靠,是一种高性价比的企业内控检测方法。仪器和试剂本次实验使用的是PerkinElmer™ 900T型火焰-石墨炉一体式原子吸收光谱仪,配置铊元素无极放电灯(Tl-EDL)。样品处理用到的试剂有:硫酸、磷酸、盐酸、铁(III)盐(即硫酸铁或氯化铁)、溴化钾、甲基异丁基酮(MIBK),纯度要求在分析纯以上。前处理精确量取废水样品25mL于烧杯中,加入铁盐试剂,盐酸,混匀后置于150 ℃ 电热板上加热,待无气泡冒出后,提高加热温度使溶液近干。取下稍冷后,加入硫酸(1+4),加热数分钟,用水转移至50mL比色管中,加水定容至35mL,加入溴化钾试剂,摇匀。静置,加入磷酸,加水定容至50mL刻度,摇匀。向比色管中准确加入5 mL甲基异丁酮(MIBK),充分振摇数分钟,待静置分层后,取上层有机相测试。样品分析仪器测试参数石墨炉升温程序标准溶液与样品测试谱图如下图所示,峰型左右对称呈正态分布形状,出峰时间在1秒左右,表明石墨炉温度程序对样品合适。标准溶液和样品溶液Tl测试谱图标准曲线和样品测试结果见下图,萃取富集-石墨炉原子吸收法测试TI的结果与ICP-MS法一致,加标回收符合方法验证要求。通过萃取富集的处理方式,样品中低浓度Tl元素可以浓缩至有机相中,相应的限量指标也从原来0.005 mg /L转变为0.025 mg/L,同时原本干扰大的基体组分也去除干净,大大降低对仪器的灵敏度要求。萃取富集石墨炉法Tl标准曲线AAS和ICPMS测试结果想要了解更多测试细节,欢迎扫码下载应用报告。扫描上方二维码即可下载资料
  • 685万!四川大学华西第四医院核酸质谱分析仪+高通量二代基因测序仪采购项目
    项目编号:QXZB-2022-1159B项目名称:四川大学华西第四医院核酸质谱分析仪+高通量二代基因测序仪采购项目预算金额:685.0000000 万元(人民币)采购需求:1.采购项目名称:四川大学华西第四医院核酸质谱分析仪+高通量二代基因测序仪采购项目;2.数量、简要技术需求或服务要求:具体详见招标文件第六章。合同履行期限:政府采购合同签订生效后90个日历天内,完成交货、安装调试、培训。本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 病毒气溶胶采集富集仪
    仪器名称病毒气溶胶采集富集仪单位名称检验检疫科学研究院联系人胡孔新联系邮箱kongxinhu@sina.com成果成熟度□正在研发 □已有样机 □通过小试 □通过中试 &radic 可以量产合作方式&radic 技术转让 &radic 技术入股 &radic 合作开发 &radic 其他成果简介:&mdash &mdash &ldquo 国家重点新产品&rdquo ,拥有自主知识产权的环境微生物气溶胶监测系统&mdash &mdash 专业针对空气病毒性微生物监测设计,现场实现目标浓缩富集,提升敏感性,超越现有空气微生物采样器&mdash &mdash 温湿度环境小气候数据同时采集&mdash &mdash 系统的收集、富集、样品处理、检测技术方案&mdash &mdash 轻巧、便于携带、友好软件智能控制符合国际ISO14698-1及GB/T:25916.1-2010: 洁净室及相关受控环境生物污染控制通用标准,是大型集会、公共场所、禽畜养殖场、生物反恐、生物安全、食品、制药、化妆品、医药等领域里对空气有机污染监测的理想设备。通过①计算机3D辅助制作符合流体动力学的气液混合装置、②表面活性剂样本处理技术、③磁珠富集、核酸提取技术一体化以及④病毒检测配套方法四个关键方面创新设计,解决了生物气溶胶采集效率问题,整合了收集、富集、核酸提取和目标检测等技术环节,提高了气溶胶回收率和监测敏感性,适用于各种类型的实验分析。收集、富集生物气溶胶同时监测环境温、湿度数据,彻底抛开传统Anderson法,且收集效果远远优于Anderson法,与后续检测技术对接程度及敏感性优于现有国内外采样器。智能控制、设计精美、外观紧凑,携带方便,高效、可靠收集、富集空气中的生物颗粒(病毒、细菌、真菌、花粉等&hellip )。主要特点:1. 大体积液体样品收集气溶胶,防止大体量空气采集导致气溶胶再流失;现场浓缩成小体积样品,提高监测敏感性,避免现场大体积收集管过多,减轻工作量。2. 配套广谱和特异监测目标富集试剂,样品后续处理高度灵活,可满足多种分析检测技术,如免疫测定、PCR、颗粒微生物计数、分离培养及显微镜观察等,提升检测敏感性和现场操作简便性。3. 便携供电长达2h以上,体积小、外观紧凑,设计精美,标准支架、手提箱方便携带,设备坚固耐用可适用于各种恶劣环境。4. 自动进行温度、湿度监测,可连续提供小体积液体样品。5. 机器主要部件可拆分并进行灭菌或清洗、消毒。主要技术参数:型号BIO-Capturer-5病毒气溶胶采集富集仪应用传染病监测、动物疫病监测、卫生监督、生物反恐原理液体包裹收集,磁珠修饰富集温度监控有湿度监控有智能化控制触屏人机界面颗粒尺寸1um空气流速30-40L/min实时监控采集时间设定1-999min可调采样体积设定1-9999L可调采集液体积20ml+/-5回收样品体积100&mu L(配套广谱和特异微生物目标富集试剂)电池持续时间2h电压要求12VDC主机重量3kg噪声&le 70dB功耗<40W工作环境温度+5℃ to +50℃+0℃ to +50(可选冬季温度防护箱)储藏环境温度-20℃ to 70℃国际同领域生物气溶胶监测仪器类比分析:产品设备国别知识产权大体积采集外接电源自备电源智能控制气体定量精确定量温湿度监测目标富集小样品回收配套试剂敏感性提升10-100倍SKC BIO-SAMPLER美国&radic &radic &radic × × × × × × × × × Coriolis空气采样器法国&radic &radic &radic &radic &radic &radic × × × × × × BIO-Capturer病毒气溶胶采集富集仪中国&radic &radic &radic &radic &radic &radic &radic &radic &radic &radic &radic &radic 数据展示:气溶胶采集、富集效果评价实验以10倍系列稀释流感病毒H3N2气溶胶模拟采集、富集实验,分别以统一条件real-time PCR方法对直接收集液样品、广谱富集磁珠处理后样品、特异富集磁珠处理后样品进行检测分析,评价采集、富集效果。结果显示:特异富集处理后,灵敏度高出至少2个数量级;广谱富集处理灵敏度高出至少1个数量级。(如下图所示)。应用前景: 该仪器可应用于: 各级出入境口岸,包括口岸场所及国际航行交通工具等卫生监督、生物反恐、传染病监测; 禽畜养殖场、市场等动物疫病环境监测; 各级疾病预防控制中心、医疗机构传染病监测、内部感染监控; 邮政处理场所、人口密集的公共场所、重大集会场所等反生物恐怖监测; 科研院所生物安全实验室等感染性生物气溶胶泄漏的监控; 其他存在有机污染的生物气溶胶环境监测领域等。知识产权及项目获奖情况:科技部、环保部、商务部、质检总局四部委认定&ldquo 国家重点新产品&rdquo 证书相关知识产权列表:知识产权类别知识产权名称状态实用新型专利生物气溶胶采集富集装置;授权专利号:ZL201220127837.9国家发明专利病毒性气溶胶采集富集仪,授权专利号:ZL201210089458.X国家发明专利用于固相膜免疫分析方法流动相的样本处理制剂,授权专利号:ZL200410091168.4国家发明专利一种特异性检测流感病毒合成多肽授权专利号:ZL201010233015.4专利技术:液面包裹喷气口,高效气溶胶粒子采集、易清洗采样头设计专利技术:高效/简便富集操作、回收浓缩小样品、对接分子生物学、免疫学检测成熟方法专利技术:系统、完整的病毒生物气溶胶现场监测解决技术方案与配套试剂
  • 安捷伦科技推出用于新一代测序的最新人全外显子靶向序列富集工具
    安捷伦科技公司与维康信托基金会桑格研究院和 Gencode 研究团队合作开发了 用于新一代测序的最新人全外显子靶向序列富集工具 2010 年 8 月 4 日,加利福尼亚州圣克拉拉市和英国剑桥市 &mdash 安捷伦科技公司(NYSE:A)今日推出用于新一代 DNA 测序的 SureSelect 人全外显子 50 Mb 靶向序列富集试剂盒。研究人员使用该试剂盒能够有效地去除非目标区域,只对基因组表达序列进行测序,从而大大简化实验步骤。 该新型试剂盒是安捷伦科技与维康信托基金会桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)和 Gencode 研究团队合作开发而成,科学家们为原有的 Agilent SureSelect 人全外显子试剂盒增加了 12 兆碱基(Mb)的新内容,使覆盖碱基总数达到约 50 Mb。原试剂盒是安捷伦与哈佛大学-麻省理工学院博德研究所 (Broad Institute)的研究者合作开发的,新增内容则由维康信托基金会桑格研究院的研究者确定,作为他们参与 Gencode 项目研究的部分工作。维康信托基金会桑格研究院的研究者和国际癌症基因组研究团队(ICGC)的成员作为早期用户,一年前已经开始使用该新型 SureSelect 人全外显子试剂盒。现在,该试剂盒的商业化产品正式推出。 &ldquo 这一新型试剂盒是安捷伦与维康信托基金会桑格研究院长期合作而开发的最新工具,&rdquo Agilent SureSelect 平台业务经理 Fred P. Ernani 博士说道,&ldquo 我们希望这种富有成效的合作关系能一直持续,在未来为基因组学研究领域带来更好的工具。&rdquo 此外,维康信托基金会桑格研究院已决定采用 Agilent SureSelect 靶向序列富集系统进行其未来的新一代测序工作。但是因为该研究院是一个慈善机构,它不会为商业化产品代言。 &ldquo 序列捕获流程是我们科研团队深入了解基因功能的最重要的环节,&rdquo 维康信托基金会桑格研究院基因组分析生产主任 Cordelia Langford 博士说道,&ldquo 所以,我们必须确保该流程能够为这一重要研究工作提供可重现的高质量和高效处理的样品。&rdquo Agilent SureSelect 靶向序列捕获系统提供目前市场上最全面的靶向序列富集产品以及最优化的方案,适用于多种不同的测序方法和平台。SureSelect 产品线目前包括 14 种产品,更多产品正在开发当中。SureSelect 产品可用于在单个试管中捕获从小于 200 Kb 到大于 50 Mb 大小范围内的靶向序列。该产品现在除了可以支持Illumina系统的 单末端和双末端测序以及indexing方案外,还支持SOLiD 系统的片段文库测序、双末端测序和barcoding方案。 用户使用 Agilent eArray xD 桌面设计工具,可以轻松设计出在单个试管中捕获任意目标基因组的定制产品,从而有效提高研究效率。或者,用户可利用安捷伦的 eArray 在线设计工具,定制基于原人全外显子试剂盒的SureSelect 靶向序列富集产品。在线定制 SureSelect 人全外显子 50 Mb 靶向序列富集试剂盒的产品,也将于不久后推出。 更多资讯,请访问:https://www.genomics.agilent.com/CollectionSubpage.aspx?PageType=Product&SubPageType=ProductDetail&PageID=2317.在 earray.chem.agilent.com 上查找 eArray,并单击&ldquo eArray 产品页面&rdquo 。 关于安捷伦科技公司 安捷伦科技(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通讯领域的技术领导者,公司的 19,000 名员工在 110 多个国家为客户服务。在 2009 财政年度,安捷伦的业务净收入为 45 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • 谱育科技展现首台(套)风采:双通道走航质谱分析仪
    “首台(套)”是指国内实现重大技术突破、拥有知识产权、尚未取得市场业绩的装备产品,包括前三台(套)或批(次)成套设备、整机设备及核心部件、控制系统、基础材料、软件系统等。自2018年4月发改委等8部门联合印发《关于促进首台(套)重大技术装备示范应用的意见》以来,首台(套)重大技术装备受到了社会各界的广泛关注。各省份接连出台落地举措和认定名单,不仅给予政策上的支持,还有多达数百万的资金奖励 同时,获得首台(套)认定,也彰显着一家企业的领先科技和硬实力。  近年来,科学仪器行业也涌现了多批首台(套)仪器装备,为此,仪器信息网特别策划“聚焦科学仪器首台(套)”专题,向广大同行及用户展示这些仪器“尖子生”的创新风采。  谱育科技EXPEC 3500高性能双通道走航质谱分析仪于2018年上市,2020年12月获浙江省制造业首台(套)认定。  1、请介绍公司获首台(套)认定的产品推出及获认定时间,攻克了哪些技术难关,解决了国家哪些重要问题?  EXPEC 3500高性能双通道走航质谱分析仪上市的时间是2018年,首台(套)认定时间为2020年12月。  高性能双通道走航质谱分析仪产品针对挥发性有机物(VOCs)的实时走航监测所面临的问题创新研制,集单质谱分析、气相色谱质谱联用(GC-MS)分析于一体,在快速走航监测分析技术、多模式动态吸附热解析技术、径向聚焦脉冲内离子源技术、双极性射频电压动态平衡技术及质谱增益自动调谐技术上具有重大突破。同时,产品集成了自主开发的智能化走航软件及定制化改装载体,具有快速响应、高时空分辨、准确定性与定量、全污染因子覆盖等特点,实现了VOCs区域污染画像、异味精准溯源、连续在线监测等功能,相关技术指标达到了国际先进水平,填补了国内该领域装备的空白,对推动我国VOCs精准管控与执法具有重要的意义。  2、该产品研制推出的背后,有哪些意义深刻的里程碑事件,或者有哪些令人难忘的研发、生产等故事可以分享?  高性能双通道走航质谱分析仪从2015年研发立项到2018年产品研制成功共历时3年:开始方案设计和开发探索,生产加工、系统测试验证和升级乃至完成产业化发展。为满足国内走航监测市场的需求,实现高性能双通道走航质谱分析仪的产业化,项目从核心器件、关键部件、仪器整机到仪器应用为轴线的"全链条式"创新设计新模式,攻克了双通道走航质谱分析仪的核心器件和关键技术研究,开展了双通道走航质谱分析仪的研制与应用方法研究,实现了双通道走航质谱分析仪的研制和产业化,填补国内该领域空白。  3、该产品能够实现在哪些领域的关键应用,可以帮助用户解决哪些重要问题?相比以往,在应用上有哪些变化和创新?  为快速捕获区域污染源头,获取空气中挥发性有机物的时空分布。高性能双通道走航质谱分析仪研制过程中,采用直接进样(无需富集)和富集+分离进样的多(两个或更多)通道走航监测系统,可实现VOCs等的快速检测,同时能解决传统质谱走航监测仪器无法区分分子量相同物质的问题。直接进样通道实时分析空气中的污染物,当污染物等待测物超过阈值时,和富集+分离通道实现联动,确保目标VOCs等待测物及时采集、无遗漏 配合移动工具(如监测车)“边走边测”的特点,实现VOCs等待测物快速检测和精确定性、定量分析。该方法可以满足国家相关标准要求,能监测包括芳香烃类、卤代烃类、酯类、醛类、酮类、有机硫等污染因子在内的近千种以上环境大气挥发性有机物。  VOCs 监测技术是开展 VOCs 污染防治工作的重要基础。传统常用的VOCs监测分析方法 “手工采样、仪器分析、数据解析”在实际应用中存在一定的局限性,例如分析过程繁琐,周期长,样品采集,时效性低,耗费大量人力物力,且指向性较差,影响监测结果的准确性。  近年来,VOCs走航监测技术具有现场实时快速检测、移动进行区域快速排查等优势,在VOCs污染防治领域获得了快速发展。搭载广谱型VOCs监测设备,进行移动监测的技术手段。双通道走航监测车搭载质谱分析技术因其检测速度快、可实时在线监测、灵敏度高等优点,在VOCs监测方面具有强大优势。走航监测结合监测数据、GPS信息和电子地图,可实现对大气污染物的“边走边测”,摸清整体的挥发性有机物污染物分布情况,实现对监测区域、工业园区、重点企业实行地毯式快速监察,有效提升了环境监测部门的效率。  4、企业往往都希望采购成熟产品,首台(套)问世后,大规模应用和市场推广是主要难题。那么,您认为该产品的应用和市场推广层面,面临哪些挑战,公司采取了哪些手段积极应对?  高性能双通道走航质谱分析仪定位于高端VOCs监测设备市场,主要解决VOCs的全时空、快速走航监测需求,弥补传统在线、移动监测手段的不足,为VOCs的精准防控提供有力监测手段。国内外同类产品仅适用单通道质谱分析方法,由于该方法不涉及色谱分离,分析速度极快,单次分析时间可实现秒级响应,适合环境空气、厂界等多种场合的VOCs快速筛查。但是由于缺少色谱分离过程,直接进样质谱法的缺点也很明显,例如无法有效区分同分异构体以及分子量相同的化合物,从而无法实现这两类化合物的准确定性定量,存在明显的技术缺陷。  本设备将直接进样质谱法和GC-MS法相结合,优势互补,建立双通道分析模式,用于VOCs快速准确定性定量,是较为理想的监测技术方案。选用双通道VOCs质谱分析仪,分析仪能够同时支持GC-MS法和直接进样质谱法,可同时发挥GC-MS法定性定量准确、灵敏度高、监测因子覆盖范围广,以及直接进样质谱法分析速度快等优势。关键监测技术的升级,有效保证设备分析结果准确可靠,在同类型走航市场上具有明显优势。  在推广上公司积极发挥产品价值,发挥GC-MS法定性定量准确、灵敏度高、监测因子覆盖范围广等优势,也能发挥直接进样质谱法分析速度快的优势。本产品具备环境空气监测、污染源(有组织、无组织)监测及污染物实时走航监测等功能模式。利用双通道走航质谱的工作性能,不断带动走航设备行业的发展走向双通道质谱设计。  5、获首台(套)重大技术装备认定对公司而言意味着怎样的激励?带来了哪些实质性的助力?下一步公司在企业发展和产品研制层面还将有哪些计划?  首台套重大技术装备认定是对谱育科技双通道走航质谱的重要认可,一定程度上可定了双通道走航质谱在污染溯源筛查、环境监测、应急监测等领域的作用,同时助力监测设备市场更加认可双通道走航质谱的性能和价值,助力更好的推广产品。  围绕十四五及长期环境监测规划,谱育科技不断进行了技术平台提升,围绕环境管理的综合性和复杂性问题,探索走航技术与激光雷达技术、傅里叶红外遥感技术、半导体激光遥测技术等技术联用,研发多参数走航联用技术平台,实现高时空分辨、多类型污染物、天地空的多维度综合分析和评价,为达标管控和环境管理提供更详实的数据。
  • 安捷伦高分辨气相色谱-质谱分析方案 | 针对持久性全氟化合物(PFAS)的分析
    什么是 PFAS?它具有哪些功能?又存在哪些危害?1PFAS 即全氟/多氟烷基类物质,是一系列人工合成的有机化合物,主要由碳原子和氟原子构成。2凭借其优异的高热稳定性和化学稳定性,PFAS 在纺织、表面活性剂、食品包装、不粘涂层、防水涂层和灭火泡沫等领域广泛使用。3“成也萧何,败也萧何”,PFAS 进入环境之后,由于极其稳定,几乎不被生物降解,它可在环境中持久存在。而作为一种典型的内分泌干扰物,极微量的 PFAS 暴露就可能带来健康风险;同时考虑到不同人的体质,其安全水平难以预测。已经成为重点关注的环境新污染物之一。PFAS 监测的难点是什么?1目标化合物的数量庞大,已经报告的超过 6000 多个;且标准品不易获得;2涵盖不同的挥发性、极性和官能团。无法使用一种设备或者一个方法分析所有化合物;3浓度低(通常为低 ppt 和亚 ppt 级),要求设备有较高检测灵敏度;虽然高倍富集可以提高检测灵敏度,但同样会带来严重干扰;4实际环境中存在的 PFAS 化合物的种类和含量尚不清楚。安捷伦 7250 气相色谱-高分辨质谱联用仪具有灵敏度高、扫描速率快,高分辨抗干扰,精确质量数采集定性准确的特点,非常适合环境样品当中挥发性和部分半挥发性 PFAS 化合物的检测。因此安捷伦公司与美国加州大学戴维斯分校用户合作建立了包含上百种不同类型的 PFAS 化合物的气质高分辨谱库,包含全氟烷基碘化物(PFAIs)、氟聚物碘化物(FTIs)、氟聚物醇(FTOHs)、含氟聚物烯烃(FTO)、含氟聚物丙烯酸酯(FTAC)、含氟聚物甲基丙烯酸酯(FTMAC)和全氟烷基羧酸(PFCAs)等(图 1)。除了化合物高分辨质谱图、每个碎片的精确质量数及对应化学组成,谱库当中还包括了每个化合物的分子式、结构式、特定分析条件下的保留时间等信息(图 2)。图 1. 不同类型 PFAS 化合物的高分辨质谱图 图 2. 谱库当中 PFAS 化合物的高分辨质谱图、分子式、结构式、保留时间等信息基于 PFAS 气质高分辨质谱库、7250 SureMass 算法和安捷伦未知物分析软件,对饮用水和土壤样品当中的 PFAS 化合物进行了检测。图 3 显示的是样品高分辨质谱图经解卷积后通过与高分辨质谱库比对和保留时间辅助确认,对样品当中包含的 PFAS 化合物进行准确定性的结果(分别以一个化合物示例)。图 3. A:土壤当中检测到乙基全氟丁基醚;B:饮用水当中检测到甲基全氟辛酸数据结果表明:7250 高分辨气质和 PFAS 化合物高分辨质谱库的配合使用相得益彰,能够显著降低对 PFAS 这类复杂化合物的分析难度,提高定性准确性,加快分析速度。结 语 在上述实验过程中,7250 工作的扫描范围是 50-1200m/z,在这样宽广的范围内采集的质谱数据的分辨率和准确性不会受到影响,方便对环境当中各种类型的污染物进行大范围的筛查检测。利用 7250 这一优势,除了 PFAS 化合物,上述水样当中还检测到了包括消毒副产品、个人护理产品中的化学品、药物、杀虫剂等环境污染物,真正体现了 7250 高分辨质谱“一网打尽”的强大能力。
  • 金玉满堂 第三届全国质谱分析学术报告会(大会篇)
    p style=" text-indent: 0em " strong 仪器信息网讯& nbsp /strong 2017年12月9日,由中国化学会质谱分析专业委员会主办,厦门大学承办,中国质谱学会和中国分析测试协会协办的“第三届全国质谱分析学术报告会”在厦门翔鹭国际大酒店隆重开幕(相关报道: a href=" http://www.instrument.com.cn/news/20171209/235407.shtml" target=" _blank" title=" " 高速发展中的中国质谱分析——第三届全国质谱分析学术报告会厦门开幕 /a )。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/b347d060-cfa6-44b0-9a9b-053bef7ebded.jpg" title=" 14.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 大会现场 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 本次大会参会人数为1500余人,创历史之最。13位顶级专家奉献精彩大会报告,全景展示了我国质谱技术、应用前沿研究进展。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/4764ed1d-142b-4271-9d85-cc7ef1fe7def.jpg" title=" 1.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 0em " 国家自然科学基金委员会研究员 陈拥军 /span /strong /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 报告题目:《变革中的中国化学》 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 陈拥军指出当前我国化学发展机遇和挑战并存。挑战在于如何将我国化学研究逐渐发展成为化学学科研究的开拓者和引领者,真正实现“从量的扩张到质的提升”的转变与跃升。这就要求中国化学突破创新引领乏力的瓶颈,抓住国际化学格局变化中的战略发展机遇。新时期,国家自然科学基金委员会化学部将通过进一步精准定位项目资助格局的方式,从小到大,从弱到强,激励原始创新,孕育颠覆性技术,实现前瞻性基础研究、引领性原创成果重大突破;破除传统思想束缚,营造创新文化环境;深化工作改革,构建适应创新发展的学科布局;加强学习,建设高素质、专业化管理队伍。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/81188f97-5a1f-46d5-a6f1-774db70baf07.jpg" title=" 2.jpg" / /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 中国科学院院士/南京大学教授 陈洪渊 /strong /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 报告题目:《追溯质谱百年,展望未来宏图》 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 从1906年诞生至今,质谱学已经是一个发展成熟、具有活力和重大影响力的研究领域,共11位科学家因与质谱相关的杰出工作而获得诺贝尔奖。陈洪渊指出,随着分离方法和检测方法的进步,可被质谱检测的对象越来越多,分析效果越来越好。未来还要进一步提升质谱的分析能力:通过设计新型离子化器,提高样本的离子化效率,特别要注重微纳尺寸的离子化过程研究;需要进一步加强质谱成像基本原理和方法的研究以及人工智能的运用,以实现更高精度的空间组织切片解析和对疾病机制的解析。在生命质谱分析中超大数据的挖掘与处理,需要大数据处理方法的完善和数据库的提升。在单细胞质谱分析中,需要更有效的电离、更高的样品通量和灵敏度的方法。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/1808ef0f-21d0-46f4-a201-e02fcecb4b19.jpg" title=" 3.jpg" / /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 中国科学院院士/大连化学与物理研究所研究员 张玉奎 /strong /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 报告题目:《深度覆盖的蛋白质组分析新方法》 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。张玉奎指出,近十多年来,蛋白质组学得到了长足的发展,但迄今仍有1728个在基因组有表达而蛋白质组从未被鉴定到的蛋白质,其中膜蛋白约占50%。膜蛋白是生物膜功能的主要承担者,起到重要的生理作用,如物质运输、信息识别、保护、润滑等作用。由于膜蛋白疏水性强,采用现有样品预处理方法会被除掉。张玉奎课题组为提高蛋白质组样品处理效率,建立了基于离子液体的样品预处理方法。该方法能够有效溶解膜蛋白质,解决了表面活性剂与后续质谱鉴定不兼容问题,显著提高了蛋白质组定量分析的覆盖度和精准度。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/974482bf-209e-488e-ad19-5dd00e32ac62.jpg" title=" 4.jpg" / /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 中国科学院院士/苏州大学教授 柴之芳 /strong /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 报告题目:《放射性同位素质谱和元素周期表》 /strong /p p style=" text-indent: 2em " span style=" text-indent: 2em " 放射性同位素质谱旨在研究放射性元素及其同位素组成,广泛应用于天然核反应推研究、放射性核素追踪、含量极低同位素检测等。重要的放射性同位素质谱方法有热电离质谱、辉光放电质谱、二次离子质谱、共振电离质谱、电感耦合等离子体质谱、加速器质谱等。柴之芳院士着重介绍了加速器质谱(AMS)的技术特点和发展情况。AMS在最近几年取得了很大的进步,全球新建了80余个AMS中心,是目前应用最多的放射性同位素质谱分析方法。AMS是把加速器技术(一种把带电粒子加速到高能量的装置)结合质谱技术(一种分析和测量不同质量的原子或分子的仪器)构成的一种超高灵敏度质谱分析设备,相对分析灵敏度可达10-12-10-14,AMS可进行微量分析,所需样品量可少于1mg。所以AMS成为精确探测器微量长寿命放射性同位素的重要方法。与其他质谱相比,AMS具有抗干扰能力极佳,基体干扰小,计数本底极低的优点;缺点是仪器较为复杂。 /span /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/1228512d-08af-42bd-a308-3413c40e9db5.jpg" title=" 5.jpg" / strong style=" text-indent: 0em " span style=" text-indent: 2em " 加拿大阿尔伯塔大学教授 乐晓春 /span /strong /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " /span /strong /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 报告题目:《质谱研究砷的形态及结合蛋白》 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 乐晓春向与会者着重介绍了他们课题组基于质谱的砷的化学形态及其与蛋白结合的最新研究进展,包括砷的形态、代谢过程、分子机制和砷的暴露等几个方面的研究,该研究对环境安全有重要意义。砷在自然界中有100多种化学形态,不同形态的砷毒性差别很大。采用高效液相色谱法(HPLC)和电感耦合等离子体质谱法(ICP-MS)进行分离和检测,采用电喷雾串联质谱(ESI-MS/MS)对不同环境样本中存在的特定的砷的形态进行定量。利用高分辨质谱进一步对未知形态的砷进行鉴定。乐晓春课题组的实验结果表明,砷的甲基化代谢过程中的三价砷中间体比五价砷的毒性大很多。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/f02aac3d-4656-421f-b7d3-7d52f8dda527.jpg" title=" 6.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 清华大学教授 张新荣 /span /strong /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 报告题目:《单细胞质谱分析》 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 细胞是组成生命体的基本单元,了解复杂多变环境中单个细胞各个阶段的变化以及行为,需要单细胞分析的方法。单细胞质谱分析可获得细胞中各种成分的分子信息,并能够对细胞中各种未知成分进行快速鉴定,获得细胞中蛋白质乃至小分子代谢物的“组学”信息。张新荣介绍,Nano-ESI 是目前使用最广泛的质谱离子化方法,一般认为它在小体积样品的离子化上优势明显, 并且具有极高的灵敏度。但是,针对单细胞样品,Nano-ESI 仍然显得处理样品时体积偏大,因为它只能处理纳升级样品,而单细胞样品通常在皮升级,因此,需要研究和设计适于皮升级样品的 ESI 离子源(pico-ESI)。张新荣着重介绍了其课题组开发的一种在单细胞水平上进行皮升样品的离子化方法。结合微液滴萃取技术,该方法能快速移除极小体积样品中的干扰离子和盐类,提高了离子化效率和检测的信噪比。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/f2353e0b-b50b-43a4-ace2-9579b5b2920e.jpg" title=" 7.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 北京大学教授 刘虎威 /span /strong /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 报告题目:《用于敞开式离子化质谱分析的样品制备与富集技术》 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 敞开式离子化质谱(AMS)非常适合于快速筛查分析,已经在环境、食品、药品和材料分析等领域展现了诱人的应用前景。然而,由于敞开式环境的离子化会受到环境条件和样品基质的影响,导致离子化效率和检测灵敏度降低,故限制了 AMS 在痕量分析中的实际应用。刘虎威结合他们实验室的工作,总结了用于 AMS 分析的样品制备和富集技术,所涉及的 AMS 包括解吸附电喷雾离子化(DESI)、纸喷雾离子化(PS)、牙签喷雾离子化(WTS)、探针电喷雾离子化(PESI)、涂层叶片喷雾离子化(CBS)、实时直接分析(DART)、介质阻挡放电离子化(DBDI)、大气压固体分子探针(ASAP)和解吸附电晕束离子化(DCBI)。样品制备技术包括固相萃取(SPE),单液滴微萃取(SDME),固相微萃取(SPME)等。他指出,样品制备与富集可有效提高AMS灵敏度;AMS在有机反应监测及能源研究领域有应用潜力。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/fe208a70-46ce-470d-9bcd-04945123ac63.jpg" title=" 8.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 复旦大学教授 杨芃原 /span /strong /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 报告题目:《中高端Q-TOF质谱的关键技术和仪器国产化》 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 杨芃原同与会者分享了他对中高端Q-TOF质谱的关键技术和仪器国产化的认识。他指出,中高端质谱的关键技术和仪器国产化一直是国家和科学家关注的重点之一。制造Q-TOF质谱仪器需要搭建精密的四级杆、线性离子阱、飞行时间质谱。四级杆体系的机械加工,主 RF 和 DC 控制等技术的实践,特别是 RF 的 LC 串联和并联振荡、阻抗匹配、功率反馈控制和自动增益,国内研究机构已经形成了核心技术。线性离子阱的电学控制,特别是辅助共振 RF 的控制,以及反傅里叶变换 RF 的控制技术都很关键。飞行时间质谱的机械、高压、高压脉冲的控制以及高速信号检测技术,国内好几家单位已经完全掌握了相关的核心技术和调试技术,商品仪器已经见于国内市场。他指出,我国研究单位的赶超,重点应放在新型的离子阱原理和实施技术方面,这将有助于我国的质谱技术能逐渐赶上世界先进水平。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/34343a05-4fb1-4662-be4a-b8fc3e15e0a5.jpg" title=" 9.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 美国威斯康星大学教授 李灵军 /span /strong /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 报告题目:《发展用于定量多组学研究的新型化学标签》 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 质谱技术的最新进展使得基于质谱的组学研究方法成为生物医学研究的核心技术。复杂生物体系中蛋白质、多肽和代谢产物的定量分析是弄清许多生理和病理过程动态变化的关键。多相同量异位素标记在液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分析中为许多样品的平行比较分析提供了一种有效的策略。李灵军在报告中介绍了他们课题组对几种新型的化学标签的设计和开发工作的最新进展,包括二甲基亮氨酸(dileu)同位素标记试剂等。这些化学标签可广泛应用于各种组学的研究。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/124d52de-0909-4335-a145-4f4c75c7e480.jpg" title=" 10.jpg" / /p p br/ /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 中央民族大学教授 再帕尔· 阿不力孜 /strong /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 报告题目:《高覆盖与定量质谱成像方法及其 应用进展》 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 再帕尔· 阿不力孜向与会者介绍了代谢组学与质谱新技术、新方法及其应用进展。包括基于LC-MS技术的高通量代谢组学分析方法;AFAI-MSI质谱成像技术平台;整体动物体内药物分析的质谱成像新技术与方法;成像代谢组学分析新方法;药物体内整体、原位分析及药效或毒性机制研究;临床(肿瘤)病理分子诊断手段的研发。他指出,质谱技术具有很强的生命力和发展空间;而质谱成像技术是将质谱检测与影像技术相结合的新型分子影像手段,通过高覆盖、高灵敏、特异性的免疫标记原位可视化分析,显示出巨大的发展前景;质谱成像技术与代谢组学相结合,可获得全面、原位的分子时空动态变化信息,实现不同分子的同时直观可视化分析,为药物或候选新药的药效及毒理作用机制的研究提供新颖的研究手段;免标记、便捷、高覆盖、高灵敏度的AFAI-MSI技术有利于原位生物标志物的发现及疾病筛查,并结合分子病理学研究,可实现癌症等疾病的分子分型及分子分期,有望发展成为一个新型的分子病理诊断工具,并推动精准医学的发展及其个体化诊疗进程。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/8ca2eeed-603f-480b-ab23-e00449c932d9.jpg" title=" 11.png" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 中国科学院大连化学与物理研究所研究员 许国旺& nbsp /span /strong /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 报告题目:《二维液相色谱-质谱三维信息用于代谢组深度覆盖的研究》 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 二维液相色谱利用了在每一维上不同的分离机理,不仅可实现一次进样对亲水性和疏水性化合物的互补分离,而且可增加峰容量,通过切换通路的设计可实现多种形式的二维色谱。不仅如此,高分辨质谱可提供非常丰富的有结构规律的碎片信息,可实现第三维的分离分析。许国旺基于他们实验室近年来的研究工作,着重阐明了如何根据代谢组分析的不同需求,构建中心切割、全二维、平行柱、停止流等多种形式的多维液相色谱系统,在此基础上,辅以结构导向的信息依赖的高分辨质谱数据采集方法,通过―计算代谢组学‖实现利用三维信息对代谢组和脂质组的深度覆盖和高质量分析。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/2bae99fa-2a86-47e0-ad18-e799a041af21.jpg" title=" 12.png" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 香港浸会大学教授 蔡宗苇 /span /strong /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " 报告题目:《MALDI质谱成像技术在环境毒理领域的应用研究》 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 传统的环境毒理学采用生物和化学分析技术来研究环境污染物在细胞、模型动物和人体样本中的毒性作用机制和代谢转化,缺乏针对生物组织样本的异质性,以及生物标志物的空间分布特点的研究。质谱成像技术,可进行生物组织切片以及细胞样本的代谢物、蛋白、多肽等生物分子的原位分析,对样本中目标分子的组成、丰度和特异性分布进行全面、高通量快速分析。现阶段,将组学研究和质谱成像技术相结合来研究环境污染物的毒性、迁移和转化,受到了广泛的关注。蔡宗苇介绍了他们课题组针对环境中的双酚类污染物的研究。采用质谱成像技术发现,多种筛选的标志物在肾脏中具有组织特异性分布。另外,他们采用 3D 成像技术对肾脏进行重构研究,发现了三个异质性相关的标志物亚结构。这些重要的信息对于环境污染物诱导的各种疾病的检测分析具有十分重要的意义,并能够对代谢组学、脂质组学和蛋白质组学发现的生物标志物在不同空间分布上进行验证。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/fb5ab20c-aa64-4cc5-8bd0-9b535f8ede6e.jpg" title=" 13.jpg" / /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong span style=" text-indent: 2em " PerkinElmer博士 Kaveh Kahen /span /strong /p p style=" text-indent: 0em text-align: center " strong 报告题目:《Recent Advancements in Elemental and Molecular Mass Spectrometry from PerkinElmer》 /strong /p p style=" text-indent: 2em " span style=" text-indent: 2em " Kaveh Kahen向与会者介绍了在过去的35年中PerkinElmer的诸多创新技术。例如,1999发明了动态反应池,实现了对砷和硒等微量元素在反应模式下进行检测。2017,公司推出了NexION 2000 系列 ICP-MS,可用于纳米颗粒、单细胞分析。除此之外,珀金埃尔默也已在有机质谱领域开始发力。随着2009 年收购Branford的Analytica,PerkinElmer开始建立了LC/MS产品线。在2016年10月,PerkinElmer推出了新的QSight系列三重四级杆LC-MS/MS系统。 /span /p p style=" text-indent: 2em " span style=" text-indent: 2em " 更多精彩报道,请关注仪器信息网。 /span /p
  • 328万!大庆市生态环境局采购在线式气相色谱质谱联用分析仪、SO2分析仪等
    项目概况大庆市生态环境局VOCs自动监测站仪器设备采购项目C的潜在投标人应在大庆市电子政府采购交易管理平台获取招标文件,并于2021年11月15日9点30分前递交投标文件。一、项目基本情况黑龙江省大庆市政府采购中心受采购人委托组织大庆市生态环境局VOCs自动监测站仪器设备采购C项目。本项目面向各类型企业进行采购。欢迎有能力的国内供应商参加。本项目远程开标。项目编号:DZC20201539项目名称:大庆市生态环境局VOCs自动监测站仪器设备采购项目C预算金额:3,280,000.00元,参与投标供应商投标报价超出预算的投标无效。采购需求:详见附件合同履行期限:签订合同后一个月内。本项目不接受联合体投标。二、申请人的资格要求:1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定;2. 本项目执行政府采购扶持中小企业的相关政策。详见《政府采购促进中小企业发展管理办法》。投标供应商所投全部产品为小型企业或微型企业或监狱企业或残疾人福利单位制造,提供声明函(须按招标文件内规定格式填写声明函),则总报价享受10%的扣除,用扣除后的价格参与评审。注:①以上“用扣除后的价格参与评审”是指开标现场,依据供应商投标总报价进行10%的扣除后参与评审。②涉及多个产品的声明函中应包含全部产品,不提供声明函或提供不全的不享受相关扶持政策。3.本项目的特定资格要求:(1)提供参与本项目投标供应商有效的营业执照或事业单位法人证书。(2)在开标现场,本项目要求所投在线式气相色谱质谱联用分析仪、在线式气相色谱分析仪(甲烷/非甲烷总烃)产品必须满足3个及以上品牌,否则,本项目废标。(3)单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下的政府采购活动。三、获取招标文件时间:公告之日起至2021年11月1日注:请参与本项目投标的供应商在2021年11月1日17时00分前自助下载文件,逾期则无法下载文件,由此造成的后果由供应商自行承担。地点:大庆市电子政府采购交易管理平台方式:网上自助下载文件(详见:http://ggzyjyzx.daqing.gov.cn/bsznTbr/20199.htm?pa=7355---《入库、办理数字证书及自助下载文件说明》)售价:免费四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点2021年11月15日9点30分地点:大庆市行政服务中心四楼开标室五、公告期限自本公告发布之日起5个工作日。六、其他补充事宜1、退出投标时限:如供应商退出投标,必须在投标截止时间前72小时,否则不予退出。2、全面贯彻庆财采【2019】3号文大庆市财政局关于开展政府采购领域扫黑除恶专项斗争的通知的规定,在本项目中重点打击8类政府采购领域涉黑、涉恶、涉乱形为。详见:http://www.hljcg.gov.cn/xwzs!queryOneXwxxqx.action?xwbh=8B2FAECAA29800DEE053AC10FDFA79C0七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息名 称:大庆市生态环境局地 址:黑龙江省大庆市高新区建设大厦联系方式:马梦淑131040951392.采购代理机构信息名 称:大庆市政府采购中心地  址:大庆市萨尔图区东风新村纬二路2号(大庆市行政服务中心三楼)联系方式:0459-61581503.项目联系方式采购人项目联系人:马梦淑电 话:13104095139采购代理机构项目联系人:王琪电话:0459-6158150附件: 项目需求温馨提示:本项目为明标打分。一、规格型号及参数序号名称规格参数/项目特征/服务要求单位数量1在线式气相色谱质谱联用分析仪仪器应用要求1)#适用于挥发性有机物的在线分析,满足环境空气挥发性有机物的定性定量分析;满足环保部《2018年重点地区环境空气挥发性有机物监测方案》(环办监测函〔2017〕2024 号)规定的VOCs在线监测设备的应用要求,仪器采用GC-MS/FID法。2)连续24小时在线监测环境空气中可挥发性有机物,并1小时出一组数据。监测项目应满足通用的臭氧前驱体标准(PAMs)监测项目,同时可监测环境空气中卤代烃、含氧化合物等挥发性有机物,监测项目≥116种。3)产品须满足《环境空气挥发性有机物气相色谱连续监测系统技术要求及检测方法》(HJ 1010-2018)中的要求。2.仪器工作环境1)工作环境温度: 20-30℃。2)工作环境湿度:≤ 85%R.H. (无冷凝)3)电源:单相200-240V@50 Hz,电流大于10A。3.仪器主要技术指标采样模块1)进样捕集模块:采用低温除样品中水分,低温富集目标VOCs;不使用液氮富集冷阱装置,降温至少至摄氏-30℃,可浓缩富集 C2-C12 碳氢化合物,保证目标化合物有效捕集及脱附,满足高挥发性化合物的捕集需要。2)软件可全自动进行系统状态和性能检查,自动完成多点校准曲线绘制和方法切换;3)热解析模块:可在15秒内快速加热至除水、解吸样品等过程所需要的温度,保证干扰物去除,目标化合物被迅速解析、进样,达到良好的分离效果;4)系统控制软件可完成采样、捕集、热解吸、分析,加热反吹等全过程自动控制;5)采用高精度电子质量流量模块精确控制采样流量和采样体积;6)采用分流进样,分流比可设置为5:1到90:1,可有效应对高浓度污染因子监测。 色谱分离模块1)气相色谱能实现目标化合物的有效分离;2)在FID检测器中:环戊烷和异戊烷的分离度、2,3-二甲基戊烷和2-甲基己烷的分离度及邻-二甲苯和苯乙烯的分离度达到 1.0 以上;3)色谱柱系统:毛细管色谱柱柱。4) 色谱柱温度控制:室温+10℃到300℃;从300℃降温到50℃不超过1分钟;FID检测器模块1)全自动电子压力控制;2)全自动点火,熄火自动保护;3)在线仪器专用FID检测器; 质谱检测器1)离子化方式:EI;2)质量分析器:四极杆质谱检测器;3)为确保测试间隔无残留,除离子源及传输模块可高温加热外,质量分析器可独立高温加热;最高温度可加热至240度;4)质量稳定度≤0.1amu/12 h;5)质谱最大扫描速度不低于:10000amu/s;6)质量准确度≤0.1amu;7)质量范围:10-500amu;8)质量分辨率:优于单位质量分辨率;9) 真空系统:真空度满足系统要求,真空系统无油设计。10)意外断电后可以自行恢复测试,达到技术指标要求所需的时间在 6 h 以内,确保数据获取率达到国家要求 4.仪器性能1)可分析组分:大气中挥发性有机物,包括PAMS(57种),TO15组分(65种),OVOC(12种)等有机物;满足《2019年地级及以上城市环境空气挥发性有机物监测方案》(环办监测函〔2019〕11 号)规定的在线监测物种要求;2)不少于90%目标化合物的方法检出限≤0.1ppb,目标化合物中应至少保留乙烷和乙烯。3)量程范围:不低于50 nmol/mol;4)长时间保留时间漂移:≤0.5min;5)方法线性:按照HJ1010-2018标准要求全部目化合物的线性相关系数≥0.98;6)重复性和稳定性:连续7次以上测定同一浓度目标化合物的标准气体,不少于90%的目标化合物RSD小于10%;7)所有物种系统残留均小于0.1nmol/mol;8)数据有效率≥85%;9)分离度≥1.0(以分离环戊烷及异戊烷为准);10)供电及功率:220VAC±10%,50Hz,≤1000瓦(含峰值)。11)设备应集成在定制机柜中,与空气常规因子监测仪器安装形式保持一致,便于产品后期的安装与运维。5. 数据分析1)数据分析系统具有报警管理功能,当设备出现故障、数据超过限定值,会通过短信或者邮件方式告知用户。2)基于自动寻峰算法,通过指数算法自动识别,可以快速筛查同分异构体,进行VOCs组分的准确定性定量分析。3)能够分析VOCs随时间变化规律,计算OFP臭氧生产潜势等参数,反映光化学污染状况及演变规律。4)能够集成气象五参数分析仪,O3/NOx等常规分析仪,GPS及GIS等监测数据进行关联分析。5)能够实时显示各目标化合物监测数据和工作状态参数等, 可设置条件查询和显示历史数据。6)能够记录存储半年以上的数据, 具有历史数据查询、 导出功能。停电后,能自动保存数据。套12在线式气相色谱分析仪(甲烷/非甲烷总烃)1)#采用气相色谱-氢火焰离子化检测法连续在线监测环境空气中非甲烷总烃浓度和甲烷浓度;2)#监测原理:采用国家标准规定的气相色谱法(GC-FID直接法),通过非甲烷总烃低温富集直接进样的技术路线直接得到非甲烷总烃的浓度,满足《环境空气非甲烷总烃连续自动监测技术规定(试行)》(总站气字【2021】61号)要求。3)分析周期:≤15min;4)进样捕集模块:样品流量采用电子流量压力控制,可定体积采样;采用低温富集技术,富集最低温度≤-10℃,保证目标化合物有效捕集;5)热解吸模块:富集管采用快速升温技术,升温速度>15℃/s,最高温度可达≥200℃;6)方法检出限:甲烷检出限≤100ppb,非甲烷总烃检出限≤20 ppbC。7)空白:通入含 60%相对湿度的高纯零空气,空白样品甲烷浓度≤100ppb、非甲烷总烃浓度小于非甲烷总烃方法检出限;8)校准曲线:非甲烷总烃校准曲线的相关系数 R2≥0.999;9)24h 零点漂移:≤±20 ppbC;10)24h 量程漂移:≤±5%;11)重复性:≤5%;12)准确性:≤±10%;13)高浓度残留:≤2%标准气体浓度;14)平行性:≤ 2%15) 压力/流量控制:满足全自动在线监测的需求,仪器采用全电子压力/流量控制(载气,氢气,空气),具有保留时间锁定和自动校准功能;16)停电后,能自动保存数据;停电恢复后,监测仪能自动恢复到原来的工作状态;具备自动校准功能;能够记录储存半年以上的数据,具有历史数据查询、导出功能;17)分析软件采用全中文操作,能进行所有维护诊断功能操作,能监控并记录仪器的阀箱温度、柱箱温度、载气压力、柱前压力等各项运行参数,可设置自动控制仪器的运行参数,自动进行数据处理,实现对外通讯。套13SO2分析仪设备用途1)用于空气中二氧化硫浓度的监测配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:紫外荧光法2)量程范围:0-500ppb到0-20ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.5ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S.6)检测下限:1.0ppb7)零点漂移:≤1ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:产品性能要求1)具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级;6)具备光源光强衰减自检功能7)产品软件获得计算机软件著作权登记证书8)产品通过CCEP认证。套14氮氧化物分析仪设备用途1)用于空气中NO、NO2、NOx浓度的监测;配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)分析方法:化学发光法2)量程范围:0-500ppb到0-20ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.2ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S.6)检测下限:≤0.4ppb7)零点漂移:≤0.5ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:11)响应时间:小于等于5分钟12)样气流量:(500±50)sccm产品性能要求1)具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级。6)产品软件获得计算机软件著作权登记证书。7)产品需通过CCEP认证。套15一氧化碳分析仪设备用途1)用于空气中一氧化碳浓度的监测配置要求1)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:气体滤波相关红外吸收法,对环境空气中的一氧化碳进行实时监测。2)量程范围:0-50ppm到0-1000ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb、ppm、μg/m3、mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.1ppm(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S6)检测下限:≤0.5ppm,7)零点漂移:±1ppm/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:16臭氧分析仪设备用途1)用于空气中臭氧浓度的监测配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:紫外吸收法2)量程:0~500ppb到0~10ppm,可选双量程和自动量程3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.3ppb(RMS)5)量程噪声:≤5ppb6)检测下限:≤0.6ppb7)零点漂移:≤2ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:套17PM10分析仪设备用途1) 用于空气中PM10颗粒物质量浓度的监测配置要求1) 含PM10切割头、采样纸带等技术参数要求1) #测量原理:β射线吸收法2) 分辨率:0.1μg/m33) 最低检测限:0.002mg/m34) 仪器平行性:≤7%5) 测量量程:(0~1)mg/m3、(0~2)mg/m3、(0~5)mg/m3、(0~10)mg/m3(可选)6) 采样流量:16.7L/min7) 流量误差:±1%F.S8) 采样流量稳定性:≤±2%工作点流量/24h9) 校准膜重现性:≤±2%标准值10) 测量周期:10分钟-300分钟11) 源:C14放射源,活动10μCi,属于豁免源12) 滤纸带:玻璃纤维13) 探测器:PMT(闪烁体光电倍增管)产品性能要求1) 具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2) 具备开机自检和运行自诊断功能;3) 可自动存储校准数据及报警信息;套115动态校准仪能依据外接标准气体种类提供精确浓度的标准气体输出,完成大气自动监测分析仪器的零点、跨度、精密度及多点校准工作。基本单元(稀释配气部分)1)稀释气流量范围:标配:0~10SLM;可选:0~5SLM、0~20SLM2)标气
  • 全国首个核酸质谱耳聋基因检测试剂盒获批!
    2023年1月5日,广州市达瑞生物技术股份有限公司“二十项遗传性耳聋基因突变检测试剂盒(飞行时间质谱法)”正式获批国家药品监督管理局(NMPA)第三类医疗器械认证,是国内首个基于飞行时间质谱技术进行耳聋基因检测的获证试剂盒。临床意义在我国,耳聋在新生儿中的发病率为1‰~3.47‰,遗传因素致聋比例达50%~60%,虽然耳聋相关基因众多,但是中国人群中有明确的常见耳聋基因及其热点致病变异,在中国人群中,耳聋基因致病变异携带率至少达15%[1],其中携带的耳聋基因变异中约70%来自于GJB2、SLC26A4、线粒体DNA 12SrRNA及GJB3这4个热点基因[2]。进行遗传性耳聋基因检测的目的:(1)确诊先天性遗传性耳聋患者,结合听力检测结果,实现早期干预;(2)早期发现迟发性遗传性耳聋的患者,给予有效防治措施,可以延缓听力下降;(3)明确药物性聋易感基因变异携带者,通过指导用药,避免耳聋的发生;(4)早期发现听力正常的耳聋基因变异携带者,为其本人及家庭成员的婚育提供准确的遗传咨询;(5)通过早期预防和干预,减少社会和家庭经济投入[1]。产品优势覆盖全面单个反应孔检测4个基因20个位点,覆盖中国人群的大部分热点位点。操作简单成套检测试剂盒搭配DR MassARRAY自动化的操作系统和强大的数据分析软件,极大缩短了手动操作时间。准确率高DR MassARRAY平台分型结果与金标准sanger测序法结果一致率达99.99%。通量灵活DR MassARRAY系统配备的96孔芯片可以分批使用,单次可以上机检测1或2张芯片,检测样本通量灵活。性价比高使用常规PCR试剂,无需荧光探针,将多重靶标检测集中到尽可能少的反应中,高效节约了时间、试剂、人工成本。DR MassARRAY 飞行时间质谱检测系统DR MassARRAY是国内研发、生产,专为医院和临床检测中心设计的一款中等通量的基因测序系统,完美地整合了PCR技术的高灵敏度、芯片技术的高通量、质谱技术的高精确度和智能分析的强大功能,是全国首家获批的可直接用于核酸检测的质谱检测系统。参考文献1. 遗传性耳聋基因筛查规范[J].中华医学杂志,2021.2. 遗传性耳聋基因变异筛查技术专家共识[J].中华医学遗传学杂志,2019.广州市达瑞生物技术股份有限公司广州市达瑞生物技术股份有限公司(股票代码:832705)是集体外诊断产品、医学检测、创新孵化为一体的生物医药高新技术企业。公司始终专注于优生优育和精准医学产品的研发及应用,坚持引进吸收与自主创新相结合,打造世界一流的诊断技术平台,为人类健康服务。
  • 2022原位质谱网络研讨会明日开幕附日程
    2022年,原位质谱和原位检测迈入4.0黄金时代!快捷、灵敏地检出并有效监控有毒有害物质的污染迁徙,或准确、高效定位核心营养及病变成分的分布变化,仍然是全球分析检测人的崇高责任和远大目标。缘由新冠爆发,核酸检测已人尽皆知;更多物种的分析检测,仍属局内人员的专业领地,尚非公众常识。即便是与国计民生的方方面面紧密关联的食品安检或临床检验,因所采用的检验设备异常昂贵或技术储备高企,还普遍停留在高能低效和聚集在大学研究院等象牙塔级别的中心实验室来完成。原位电离质谱(Ambient Ionization Mass Spectrometry,简称 AIMS)技术作为质谱学和分析科学领域的重大变革,近十年来始终引领行业大潮,盘踞头条,在临床检验、生命科学和分析测试各个行业快速下沉,突破传统技术瓶颈,逐步形成行业新趋势和新标准,契合时空多组学发展大势和地标特优大数据开发,推动着质谱快检技术的进步和创新,助力实现应检尽检、早查预警和诊疗前移,大大降低社会运营成本和化学危害风险。“探寻风味密码”、“揭示病理变化”… … AIMS 原位质谱既保持了质谱系统后端质量分析器的灵准特点,又增加了原位电离特有的快与广谱的优势,实现样品的应检快检全检,大数据捕获因而更加精准高效。经十多年积淀,原位质谱分析检测方案已演化为一支最有活力和潜力的分析科学生力军。因其特有的原位、无损、实时、快速、低耗和易上手等优点,原本高门槛的质谱技术为各行业快速熟悉、接纳、和喜爱;应用场景也由初期的刑侦司法理化物证分析,演绎至食药分析、材料表征、商贸检疫、农渔环监、物种识别、风味剖析、烟酒茶检、医药临检、卫检疾控、组学研究、生产质控、成像研究、疾病筛查和手术监控等领域。基于此,华质泰科(华质生物)与仪器信息网将于2022年8月24日联合举办“2022原位质谱网络主题研讨会”,聚焦精准食药检测、风味聚类溯源、生命组学成像和现场环境毒检等国际应用热点场景和原位质谱技术前沿。特邀演讲嘉宾多为一线知名科学家,长期浸润于质谱学前沿和分析应用高地,学术造诣与行业实践高度结合,其成果分享将为国内各行各业深挖检测分析新技术和促进环球产业合作提供重要的窗口和契机。诚挚邀请您莅临这一网络盛会,与同僚共享共鸣,推动实时科学与先进分析检测技术的高水平发展!扫码报名 / 会议网址David D.Y. Chen 陈大勇 教授南京师范大学,加拿大英属哥伦比亚大学主持人简介:David D.Y. Chen 陈大勇,教授,博士生导师,南京师范大学,加拿大英属哥伦比亚大学。本科毕业于厦门大学、博士毕业于艾伯特大学。1993年在艾伯塔大学医学微生物学与传染病学系从事博士后研究。1999年任职加拿大 UBC 至今,2013年起聘任南京师范大学教授。专注于研究分离、纯化、质谱新方法和新技术,开发新装备及其在生物医学中的应用。David D. Y. Chen 是国际上分析化学领域的知名学者,在国际分析化学的权威性杂志上发表研究论文100多篇,被引用3900余次,H-index 为36 (Google Scholar Citations)。先后获得了英国皇家化学会的分析方法奖;加拿大化学会的分析科学 W.A.E. McBryde 奖章;不列颠哥伦比亚大学的最高自然科学和工程学奖-CharlesMcDowell 金奖和加拿大化学会分析化学杰出贡献奖(Maxxam Award)。演讲嘉宾蔡宗苇 教授,香港浸会大学Prof. Zongwei CaiHong Kong Baptist UniversityAmbient Ionization Mass Spectrometry Imaging in Research of Environmental Toxicology大气压电离质谱成像在环境毒理研究中应用简介:蔡宗苇教授1982年毕业于厦门大学化学系,获得理学学士学位,1990年获得德国马尔堡大学博士学位。1991-1993年在美国 Nebraska 大学担任博士后,1994-1996年任研究助理教授。1996-2000年,蔡教授在 GSK 工作,领导一个质谱组,从事药物代谢和药代动力学研究。现任香港浸会大学化学系讲座教授,二噁英分析实验室主任,环境与生物分析国家重点实验室主任。蔡宗苇教授从事质谱化学分析的基础理论及其在环境、生物、药物和痕量有机污染物的应用,目前主要研究与环境污染物相关的人体健康和疾病,已在国际学术刊物上发表论文600多篇。他的研究小组配备了一系列先进的质谱仪,用于药物代谢、蛋白质组学和代谢组学等研究。Brian Musselman 博士美国 IonSense 技术顾问主持人Pulsing Ambient Ionization Mass Detection for High Throughput DART-based Analysis脉冲式原位电离质谱用于高通量 DART 分析简介:Brian D.Musselman 博士,美国 IonSense 技术顾问。质谱发明家、质谱工业资深顾问。曾任 JOEL (美国) 质谱产品、应用、市场部高级经理,AB SCIEX 生物质谱市场高级总监,IonSense 总裁兼首席执行官。曾获 Pittcon’ 97 ESI-TOF 质谱发明银奖,IR100’ 94 台式高分辨 GCMate 质谱发明奖。曾任美国质谱学会 ASMS 副总裁,ALA 委员,ABRF 委员和财经主席。Terry Bates美国康奈尔大学 Gavin Sacks 组SPMESH DART-MS: super-rapid, robust, repeatable, and quantitative analysis of volatile odorants挥发性气味剂的超快、皮实耐用、可重复定量的增强型筛网顶空吸附富集结合 DART 原位质谱分析方法摘要:食品和饮料行业经常对气味挥发物进行针对性的分析。例如,在某些葡萄品种中,3-异丁基-2-甲氧基吡嗪(IBMP,青椒味)可作为葡萄品质的标志;而愈创木酚和甲酚等挥发性酚类可作为葡萄生长在野火附近的“烟味”标志。由于这些气味剂在复杂基质中以痕量水平存在(mg/kg 至 ng/kg),常规分析方法提取复杂,步骤耗时缓慢,且通量较低(单个样品需 15 分钟或更长),不适合在收获期间短时内分析大量样品。为解决这个问题,开发了一种新优化的 SPMESH-DART-MS 方法,用于快速分析多个加州商业葡萄园的酿酒葡萄(赤霞珠,300份样品)中的 IBMP。SPMESH 方法能够达到亚 ng/L (亚 ppb)的检测限,每个样品所需的时间 1 分钟,并且与 SPME-GCMS 显示出良好的相关性 (R2=0.84)。目前正在进行的工作是扩大目标挥发物的检测范围(包括酚类和醛类)。简介:Terry Bates,康奈尔大学 Gavin Sacks 博士实验室博士生,并担任系课程开发委员会、教师高管招聘委员会、康奈尔大学本科研究委员会的博士代表、以及众多本科生和硕士级实验室成员的导师。主要研究分析风味化学,致力于开发新的提取方式和高通量分析方法,对痕量挥发性气味进行法分析,包括对葡萄种群的挥发性化合物分析,鉴定新番茄品系中的异味等。在攻读博士学位之前,Terry 在丹佛大学获得了分子生物学学士学位,并在康奈尔大学获得了化学硕士学位。Gavin Sacks 实验室关注研究收获前后的环境因素对农产品感官特性的影响(风味、颜色),特别是葡萄酒和果汁。该实验室在开发利用快速灵敏的原位质谱新技术和应用于风味化合物的表征分析方面处于领先地位。Benjamin Draper 博士/创始科学家美国 Megadalton Analysis of Gene Therapy Vectors by Charge Detection Mass Spectrometry基因治疗载体的电荷检测质谱分析 CDMS by LESA-MS摘要:质谱已成为表征生物大分子的最有力的分析技术。非变性电喷雾电离(Native ESI)是电离生物药的首选方法,但其对分子量特大的分析物的分析存在瓶颈和局限。因质量异质性,大多数常规质谱仪无法分辨超过100万分子量(Da)的生物大分子的电荷状态。我们提出了一种全新的基于 LESA 的电荷检测质谱(CDMS)技术。CDMS 的质量测定能力远超100万分子量(Da)。因可直接测量单个离子的质荷比及电荷数,生物大分子质量的直接测定便成为了可能。很多超出传统质谱能力的检测需求,可以通过 CDMS 来实现。本文专注于基因治疗载体和从十万到超过几百万分子量的大型寡核苷酸的分析应用。简介:Benjamin Draper 于2018年在印第安纳大学 Martin Jarrold 的领导下完成了他的博士研究工作——电荷检测质谱(CDMS)的开发。作为博士研究工作的一部分,他简化了 CDMS 数据采集和分析,以实现100倍的加速,从而可以进行实时数据分析。这彻底改变了 CDMS,为分析包括下一代疫苗在内的各种高分子量样品打开了窗口。Benjamin 还对灵敏度的提高做出了贡献,使得 CDMS 对百万道尔顿分子量的样品能达到飞摩尔级的灵敏度,并因此大大缩短了测量所需的时间。目前 Benjamin 负责 Megadalton Solution 的分析开发,重点关注 AAV 等基因治疗载体。Ronald Emmons 博士美国托莱多大学Solid Phase Microextraction Hyphenated to Direct Analysis in Real Time: Robust Quantitation in Minutes固相微萃取与实时直接分析 DART 相结合:分秒实现皮实稳定的定量摘要:原位质谱(AIMS)尤其是 DART 技术的出现使得各个领域对更快、更皮实耐用的分析需求日增。此前,人们多着眼于它优秀的快筛定性能力,忽视了其同样卓越的定量表现。定量的主要障碍是如何提高样品均一性、减少离子化基质效应和稳定电离环境。前置固相微萃取(SPME)是规避这些问题的理想选择之一;SPME 可预浓缩分析物,可直接与 DART 源串联。利用改进型、大体积的 SPME-Arrow 和热解吸装置(TDU)对农药和药物定量,富集充分,解吸附彻底,不受现场环境干扰。样品自制备到完成 DART-MS 分析共需3.5分钟,大多数化合物的线性动态范围(LDR)为2.5 - 500 μg/L,日间重复性好(<10%)。用于分析饮用水和鱼类组织难以降解具有生物链聚集毒性的全氟和多氟烷基(PFAS)化合物的灵敏度达到了优异的 ppt 级别。简介:Emanuela Gionfriddo 博士,美国托莱多大学助理教授。2013年获得意大利卡拉布里大学分析化学博士学位。2014年,在加拿大滑铁卢大学 Pawliszyn 教授团队担任博士后研究员和负责工业重点分析实验室(InFAReL)气相色谱。Gionfrido 博士发表论文50多篇,1项基于 PTFE 的 SPME 涂层专利,托莱多大学 Nina McClelland 博士水化学和环境分析实验室的创始成员之一,被任命为俄亥俄州总检察长 Yost 环境顾问委员会成员。Ronald V. Emmons,美国托莱多大学化学系 Emanuela Gionfriddo 实验室在读博士,主导多个关于 DART-MS 与 SPME 结合的研究项目,有效地预富集和定量环境污染物。研究领域:环境化学、微萃取技术、生物相容性萃取;探索开发不断出现的新型快速分析技术与质谱仪直接耦合方法及应用,使用绿色提取方法分析复杂的生物和环境样品。Laure Menin 博士/平台负责人瑞士联邦理工学院SICRIT® Exploris™ Orbitrap setup: a Smart tool for a Mass Spectrometry facility to expand its range of covered applications新一代轨道阱质谱鼻 SICRIT-Exploris: 助力质谱中心提能增效移星换斗的智能装备摘要:瑞士联邦理工(洛桑)(EPFL)化学科学与工程研究所(ISIC MSEAP)的质谱分析平台为瑞士的100多个实验室提供分析测试服务,涵盖了从有机小分子到生物大分子及金属的广泛应用。除最常用的电离技术(ESI、APCI、APPI、MALDI、EI/CI 和 ICP)外,冷喷雾电离(CSI)还允许分析敏感的超分子结构。电子轰击 EI 电离常搭配低分辨率 GC-MS,高分辨率质谱通常搭配电喷雾等(ESI-APCI/APPI-FTMS);业界不太投资高分辨质谱搭配电子轰击源(EI-HRMS)。我们平台的 Orbitrap 搭配 SICRIT 在线软电离质谱鼻(Plasmion),可直接引入气味儿样品或 GC 馏分,便捷灵敏,分子离子信号完整,指征简单。使用该 SICRIT-Orbitrap 技术已完成300多个用户的样本分析测试服务,部分成果将予以示例和讨论。简介:Laure Menin 1997年获得生物化学、微生物学和细胞生物学博士学位。曾在法国和瑞士的不同公司担任项目经理,如 Entomed SA、Geneprot 从事大规模蛋白质组学领域,Atheris 实验室从事药物发现和有毒动物毒液的肽组学分析。自2008年以来,Laure Menin 一直在管理瑞士联邦理工学院化学科学与工程研究所(ISIC MSEAP)的质谱设备。该平台配备了10套质谱,拥有自上而下蛋白质组学以及蛋白质复合物分析方面的强大专业知识,为 EPFL 研究小组、外部学者以及行业外部客户提供科学支持。Gilles Frache 博士/首席工程师卢森堡科学技术研究所(LIST)Atmospheric Pressure MALDI coupled to Orbitrap(s), principle and applications大气压基质辅助激光解吸电离源耦合轨道阱的原理及应用摘要:近年人们对质谱成像(MSI)的兴趣日增,其生物医学应用也在逐步开发。然而,基于真空 MALDI 的 MSI(基质辅助激光解吸电离质谱成像)在对生物分子辨别的准确性和空间分布的分辨率方面有待提升。本报告主要分享大气压基质辅助激光解吸电离源(AP-MALDI)耦合高分辨轨道阱(Orbitrap)质谱的质谱成像技术(MSI),及其在生物分子辨别的准确度和空间分布定位的分辨率方面的显著优势。首先,AP-MALDI 源偶联最新一代轨道阱高分辨质谱仪(Orbitrap Exploris 480)与其前代相比,在灵敏度上有提升。其次,应用场景涵盖聚合物、多肽、和生物组织切片的脂质成像分布。采用了全自动基质喷涂仪(SunChrom)进行基质喷涂。使用多重软件工具实现了数据可视化与图像解析。两代轨道阱质谱仪的灵敏度确有代差;靶点空间分辨率都达到了10μm甚至更低。该技术在非靶向标志物的质谱成像应用方面,具有高灵敏度、高图像采集速度、及高空间分辨率的发展潜力。AP-MALDI(MassTech)偶联轨道阱高分辨质谱成像技术可成为传统的 MALDI-MS 的替代方案;该项技术具备独特的几分钟内将搭载液相 LC 的轨道阱谱仪(即LC/MS 模式)快速变为为搭载原位成像源的高清高敏质谱成像(即 MSI 模式)的能力。最新一代轨道阱质谱仪性能的提升也为 MSI 技术的发展和应用打开了更加广阔的前景。简介:Gilles Frache 博士,卢森堡科学技术研究所材料研究与技术表征平台首席工程师。化学及分子物理化学硕士、法国梅兹大学博士,博士后。自2008年起,肩负起卢森堡科学技术学院材料研究与技术表征平台的分子分析和质谱成像团队负责人。专注于利用色谱,质谱分析以及利用质谱成像技术在有机材料及生命科学领域的研究。在欧洲建立了 AP/MALDI 质谱成像演示实验室并且利用多种质谱成像技术包括 AP/MALDI-MS 和 TOF SIMS 方法应用于皮肤质谱成像。Peter Verhaert 教授/创始人比利时 ProteoFormiXAP-MALDI MS Histochemistry for disease biomarker discovery in patient samples archived at tissue banks大气压基质辅助激光解析电离 AP/MALDI 组化方法用于自组织银行存档的患者样本中发现疾病生物标志物摘要:直接运用分子成像技术(MSI)在病人或供体材料上发现高度符合医疗需求的疾病候选生物标志物。以福尔马林固定-石蜡包埋(FFPE)组织切片作为样本,在识别生物标志物的同时,标记其在组织切片上的分布位点。类比免疫组化法,可将该成像方法称之为质谱组化法(MSHC)。借助 MSHC,我们研究了世界各地生物样本库中保存的大量的人体健康和疾病组织,其中包括现代医院病理留存样本以及世界著名研究机构的科研样本。通过绘制所有 FFPE 待检生物分子(肽、神经递质、代谢物)的指纹和分布,我们编制了《人体福尔马林固定 - 石蜡包埋生物分子图谱》。该方法优点除了 FFPE 的样品量足够大,其稳定性足够好以外,MSHC 的另一优点是它完全为非靶向和无需标记的技术,可直接将所有的现存组织病理学知识与新颖生物分子信息相关联。所用设备为高分辨质谱(LTQ Orbitrap Velos)偶联高分辨 AP-MALDI (ng) UHR。组织切片 5μm 厚,平铺在常用显微镜载玻片上,以自动喷涂装置喷涂 MALDI 基质如二羟基苯甲酸。利用生物样本库中的人类 "模型 "组织切片来衡量 MSHC 的性能,结果显示 MSHC 可轻松实现 10~20μm 的横向分辨率,分辨率可低至 ~5μm,对生物分子包括神经肽、生物胺和代谢产物的成像,准确度较高。借用 HistoSnap 软件及高性能质谱成像软件平台 Mozaic(瑞士 SpectroSwiss)对各种尚无生物标志物报道的疾患者的活检和尸检样本进行了高达几个 GB 的数据采集和整合,建立了人类下丘脑核神经分泌肽的单细胞分辨率的 MSHC 空间“组学”技术。热忱欢迎意向合作者加入这一“智人生物分子 FFPE 组织图谱”项目。简介:Peter D.E.M. Verhaert,教授兼 ProteoFormiX BV 创始 CEO & CSO(强生创新中心)。1987年,比利时鲁汶大学生物学博士(比较神经生物学);1988年,加拿大滑铁卢大学生物化学与毒理学博士后;1989-1999年,比利时鲁汶大学比较生理学系研究教授;1998年,比利时 Sabattical Innogenetics NV;2000-2004年,荷兰 Oss Organon NV 高级研究员;2005-2016年,荷兰代尔夫特理工大学生物分析技术与创新肽生物学教授;2017年至今,比利时 Proteformix BV 创始人兼首席执行官。主要从事自上而下蛋白质组学、肽组学和质谱成像(MS 组织化学)及在神经退行性疾病和癌症中的应用,是肽组学和自上而下蛋白质组学的先驱(自2000年起);欧洲药物蛋白质组学实验室联合创始人和前主席(2000-2005年);EUPA Open Proteomics 主编(2013-2016)。Jan-Christoph Wolf 博士/CEO德国 Plasmion Recent advances in SICRIT applications from liquid chromatography to Hydrogen-GC在线软电离质谱鼻 SICRIT 最新进展:从偶联液相 LC 到承接氢气 GC 馏分简介:Jan-Christoph Wolf 博士,曾在瑞士苏黎世联邦理工学院 ETH Zurich(2013-2015年,师从 Renato Zenobi 教授)和德国慕尼黑工业大学分析化学系(2010-2013年)从事博士后研究工作,项目有化学战剂现场检测,柴油机微粒过滤器中硝基多环芳烃的形成,柴油机排气中颗粒数的测定,气溶胶化学,仪器方法发展等。目前是德国 Plasmion 联合创始人兼首席执行官,是质谱电离新方法(即原位质谱)领域的领先专家。Rian L Griffiths 博士/研究员诺丁汉大学药学院Probing Interspecies Microbial Metabolites via LESA-MS通过 LESA-MS 探秘微生物代谢助力感染医学诊疗摘要:在医疗、保健、工业和环境设施中普遍存在的多种微生物的生物膜基本已具有抗菌素耐药性。微生物通过产生群体感应信号分子(QSSM)来协调生物行为。通过液质 LC-MS 分析囊性纤维化患者的血浆,已经确定了肺感染的 QSSMs生物标志物。铜绿假单胞菌(PA)有三个群体感应(QS)系统,其中一个就是基于假单胞菌的喹诺酮信号系统(pqs),而先前已有研究证实它会受到金黄色葡萄球菌(SA)和白色念珠菌(CA)的影响。液滴萃取表面分析质谱(LESA-MS)允许快速直接的表面分析,已在 PA、SA 和分枝杆菌的蛋白质和脂类研究中得到应用,而 QSSMs 以及绿脓菌素等代谢产物以前就在唾液中被检到过。所以,本工作旨在探索 PA、SA 和 CA 生物膜中 QSSMs 扩散和分泌的差异以及它们在不同组合中的差异。采用 LESA-MS 可直接对不同微生物的培养基采样,研究代谢产物扩散和分泌,推断出与感染相关的代谢差异,检出了从 PA 扩散而来的烷基喹诺酮(AQ)QSSMs 与主动分泌的毒力因子(绿脓菌素)。通过子离子扫描 MSMS 鉴定了 AQ 的同分异构体,研究了 SA 或 CA 或两者组合培养的 PA 的混合生物膜的外源代谢物。本文展示了 LESA-MS 新方法;设想若代谢产物可无创自唾液获取,那么,通过代谢物的直接原位分析就能快速鉴定感染性病原体,从而快速确定相应的诊疗方案。此探索在临床医学及感染研究方面将有长远的重要意义。简介:Rian Griffiths 2010年毕业于伯明翰大学化学系,获理学硕士学位;在 Josephine Bunch 教授的指导下继续攻读博士学位,研究通过 MALDI-MS 控制复杂生物样品中脂质复合物形成的途径,2015年获伯明翰大学分析化学博士。2014-2018年,在 Helen Cooper 教授的实验室(伯明翰大学生物科学学院),开发了液体萃取表面分析(LESA)质谱法,用于直接分析变性和折叠的完整蛋白,以及来自生物样品如干血斑和薄组织切片的非共价蛋白复合物。2019年,Rian Griffiths 在诺丁汉大学 Morgan Alexander 教授的实验室担任研究员。2019年10月,成为独立的 Anne McLaren 研究员。Griffiths 博士拥有广泛的表面采样质谱和成像经验,包括基质辅助激光解吸/电离(MALDI)、液体萃取表面分析(LESA)、Flowprobe 和二次离子质谱(SIMS)。她的研究包括小分子代谢物、脂质、完整蛋白质和非共价蛋白质复合物的分析。8月24日/周三 9:00-17:30报名及会议网址:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/aims2022/
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