质谱分子式计算器

1.问题描述在化合物检测中,质谱检测由于其高精密和宽检测范围,是化合物定性和定量分析的必要手段 其检测的离子峰基于精确分子量(ExcatMass),12C为12,1H为1.007825,16O为15.994915,而一般数据库或计算所得均为相对分子量,在实际检测过程中不能满足及时、快速的计算要求。利用[b]小程序-分子量计算器[/b]可以快速、准确解决这一问题。2.搜索小程序-分子量计算器[img=搜索小程序,627,377]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/07/201907231138351812_3608_3963607_3.png!w627x377.jpg[/img][align=left]3.分子量计算器主界面[/align][align=left]点击进入小程序后,主界面如下所示:[/align][img=,375,648]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/08/201908141636090567_9413_3963607_3.png!w375x648.jpg[/img][align=left]4.小程序计算相对分子量通过键盘输入分子式,如乙酸乙酯分子式为C4H8O2,依次点击’C’-’4’-’H’-’8’-’O’-’2’,然后点击‘≈’(即约等号),即可得到该化合物的相对分子量，结果为88.106。[/align][img=,372,649]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/08/201908141636370065_6838_3963607_3.png!w372x649.jpg[/img][align=left]5.小程序计算精确分子量[/align][align=left]同上操作，按‘=‘(即等号),即可得到该化合物的精确分子量，结果为88.05243。[/align][img=,374,644]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/08/201908141636560395_842_3963607_3.png!w374x644.jpg[/img]6.结束语简单快捷的操作,准确的计算结果,希望能够成为质谱检测工作者的手边利器。[img=,258,258]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/07/201907271601233013_7936_3963607_3.jpg!w258x258.jpg[/img]----------------------------------------[align=left]版本更新，界面稍有变化，功能有所加强。如乙酸乙酯C4H8O2，亦可输入CH3COOC2H5，小程序会自动简化分子式，并计算相对分子量/精确分子量，最大支持原子个数99。如无法使用,请更新至微信最新版本。[/align]

[align=center][font=黑体][size=16.0pt]质谱定性：分子式及免费资源和工具[/size][/font][/align]质谱作为一种分析工具最吸引人的是其定性能力。定性能力对应分析方法的专属性，[b]专属性是开发分析方法首先应该考虑的要素。[/b]质谱通过测量分子离子质量及碎片离子质量来识别鉴定化合物，测量分子量是质谱的基本能力和首要评价指标。通过阅读此文希望能回答以下问题：[b]1[font=宋体]审稿人要求测得高分辨质谱数据有什么要求？[/font]2[font=宋体]什么样的样品可以测精确分子量？什么样的质谱数据才能是高分辨质谱数据？[/font]3[font=宋体]高精度分子量测量有什么要注意的？[/font][/b][font=黑体][size=&]1 [/size][/font][font=黑体][size=14.0pt]分子量[/size][/font]我们常说的测定分子量是相对分子量，在教科书上相对分子量指的是物质的分子或特定单元的平均质量与核素¹ ² C[font=宋体]原子质量的[/font]1/12[font=宋体]之比。在粗略计算时，我们一般通过简单计算所有元素中子数和质子数（即元素周期表上原子序数之和）直接加和即名义分子量（[/font]nominal mass[font=宋体]），一般为“[/font]1[font=宋体]”的整数。不同的分子量物质也不一样，如乙醇（分子量[/font]46[font=宋体]）和甲醇（[/font]32[font=宋体]），这是质谱定性的基础；尴尬的是，不同的物质，分子量可能一样，如甲醇（[/font]32[font=宋体]）和氧气（[/font]32[font=宋体]）。[/font]那么可以用质谱测定名义分子量定性吗？名义分子量一样的物质在现实世界多吗？实际情况是，自然界常见元素的排列组合组成的化合物可能性太多，所以不同元素组成但是名义分子量相同的化合物存在的可能性非常高。此时质谱还能定性吗？答案是肯定的。世上的事最怕仔细和认真。在近代物理学和质谱发展的百年过程中，人们发现每种原子核的精确分子量（exact mass[font=宋体]）与名义分子量（[/font]nominal mass[font=宋体]）是有微小差别的（表[/font]1[font=宋体]），这些微小差别是因为[b][u]质量亏损[/u][/b]（质子中子结合形成的原子核结合能量变化，具体物理定义可查阅物理教材）造成的。每一种原子核的精确质量与名义分子量之间的差值是固定和特殊的，[b]同样推广至由各种原子核组成的化合物它们的精确分子量有一个属于它的精确分子量。如果能精确测量分子量那么就可以给出测量物质的[color=red]结构式[/color]——质谱定性[/b]。[/font][align=center][b][font=宋体]表[/font]1[font=宋体]常见元素精确分子量[/font][/b][/align] [table][tr][td] [align=center][b][font=宋体]元素[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][b][font=宋体]同位素[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][b][font=宋体]精确相对分子量[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][b][font=宋体]质量亏损[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][b][font=宋体]自然界丰度[/font][color=#31849b]%[/color][/b][/align] [/td][/tr][tr][td] [align=center][b][font=宋体]氢[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][sup][color=#31849b]1[/color][/sup][color=#31849b]H[/color][/align] [align=center][sup][color=#31849b]2[/color][/sup][color=#31849b]H[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]1.00783[/color][/align] [align=center][color=#31849b]2.01410[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=red]+0.00783[/color][/align] [align=center][color=red]+0.01410[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]99.9885[/color][/align] [align=center][color=#31849b]0.0115[/color][/align] [/td][/tr][tr][td] [align=center][b][font=宋体]碳[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][sup][color=#31849b]12[/color][/sup][color=#31849b]C[/color][/align] [align=center][sup][color=#31849b]13[/color][/sup][color=#31849b]C[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]12.00000[/color][/align] [align=center][color=#31849b]13.00335[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=red]+0[/color][/align] [align=center][color=red]+0.00335[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]98.93[/color][/align] [align=center][color=#31849b]1.07[/color][/align] [/td][/tr][tr][td] [align=center][b][font=宋体]氮[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][sup][color=#31849b]14[/color][/sup][color=#31849b]N[/color][/align] [align=center][sup][color=#31849b]15[/color][/sup][color=#31849b]N[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]14.00307[/color][/align] [align=center][color=#31849b]15.00011[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=red]+0.00307[/color][/align] [align=center][color=red]+0.00011[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]99.632[/color][/align] [align=center][color=#31849b]0.368[/color][/align] [/td][/tr][tr][td] [align=center][b][font=宋体]氧[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][sup][color=#31849b]16[/color][/sup][color=#31849b]O[/color][/align] [align=center][sup][color=#31849b]17[/color][/sup][color=#31849b]O[/color][/align] [align=center][sup][color=#31849b]18[/color][/sup][color=#31849b]O[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]15.99491[/color][/align] [align=center][color=#31849b]16.99913[/color][/align] [align=center][color=#31849b]17.99916[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#00b050]-0.00509[/color][/align] [align=center][color=#00b050]-0.00087[/color][/align] [align=center][color=#00b050]-0.00084[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]99.757[/color][/align] [align=center][color=#31849b]0.038[/color][/align] [align=center][color=#31849b]0.205[/color][/align] [/td][/tr][tr][td] [align=center][b][font=宋体]磷[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][sup][color=#31849b]31[/color][/sup][color=#31849b]P[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]30.97377[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#00b050]-0.02623[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]100[/color][/align] [/td][/tr][tr][td] [align=center][b][font=宋体]硫[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][sup][color=#31849b]32[/color][/sup][color=#31849b]S[/color][/align] [align=center][sup][color=#31849b]33[/color][/sup][color=#31849b]S[/color][/align] [align=center][sup][color=#31849b]34[/color][/sup][color=#31849b]S[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]31.97207[/color][/align] [align=center][color=#31849b]32.97146[/color][/align] [align=center][color=#31849b]33.96787[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#00b050]-0.02793[/color][/align] [align=center][color=#00b050]-0.02854[/color][/align] [align=center][color=#00b050]-0.03213[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]94.93[/color][/align] [align=center][color=#31849b]0.76[/color][/align] [align=center][color=#31849b]4.29[/color][/align] [/td][/tr][tr][td] [align=center][b][font=宋体]氯[/font][/b][/align] [/td][td] [align=center][sup][color=#31849b]35[/color][/sup][color=#31849b]Cl[/color][/align] [align=center][sup][color=#31849b]37[/color][/sup][color=#31849b]Cl[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]34.96885[/color][/align] [align=center][color=#31849b]36.96590[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#00b050]-0.03115[/color][/align] [align=center][color=#00b050]-0.03410[/color][/align] [/td][td] [align=center][color=#31849b]75.78[/color][/align] [align=center][color=#31849b]24.22[/color][/align] [/td][/tr][/table][font=黑体][size=&]2 [/size][/font][font=黑体][size=14.0pt]准确度[/size][/font]要想测量表1[font=宋体]中的精确分子量，质谱必须要要很高的准确度。所有的仪器在测量过程中都有误差，质谱测量偏差[/font]D[font=宋体]常用测量分子量[/font]M[sub]m[/sub][font=宋体]减去理论分子量[/font]M[font=宋体]的差值与分子量[/font]M[font=宋体]之间比值来指示[/font] ([font=宋体]式[/font]1)[font=宋体]，常用[/font]ppm[font=宋体]来表示。[/font][align=center]D=[font=宋体]（[/font]M[sub]m[/sub]-M[font=宋体]）[/font]/M-------------(1)[/align][b][font=宋体]现在我们要问的是质谱多大的测量偏差才能满足定性分析的专属性？分子量可以准确推出分子式吗？[/font][/b] 1994[font=宋体]年[/font]Journal of [font='Times New Roman',serif]AmericanSociety for Mass Spectrometry[/font][font=宋体]编辑[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Michael [/font][font='Helvetica',sans-serif]L. [/font][font='Times-Roman',sans-serif]Gross[/font][font=宋体]指出[/font][i][font='Times-Roman',sans-serif]Journal of Organic Chemistry[/font][/i][font=宋体]杂志要求的[/font][font='Times-Roman',sans-serif]5ppm[/font][font=宋体]质量测量精度是不够的[/font][font='Times-Roman',sans-serif],[/font][font=宋体]考虑[/font][font='Times-Roman',sans-serif]CHON[/font][font=宋体]四种元素组成的化合物，限定测量分子量±[/font][font='Times-Roman',sans-serif]5ppm[/font][font=宋体]的偏差，名义分子量为[/font][font='Times-Roman',sans-serif]500[/font][font=宋体]有[/font]5[font=宋体][color=red]个分子式组合[/color][/font][font=宋体]，名义分子量为[/font][font='Times-Roman',sans-serif]750.4[/font][font=宋体]有[/font]626[font=宋体][color=red]个候选分子式[/color][/font][font=宋体]（参考文献：[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Accurate Masses for Structure Confirmation[/font][font=宋体]，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Michael L. Gross,1994[/font][font=宋体]）。如果要缩小分子式选择范围，测量精度随着分子量不断快速提高。有人采用枚举法，既用计算机不断列举[/font][font='Times-Roman',sans-serif]CNONS[/font][font=宋体]组成的分子式及其精确分子量，认为在测量误差[/font][font='Times-Roman',sans-serif]0.1m[/font][font=宋体]道尔顿[/font][font='Times-Roman',sans-serif](0.0001Da)[/font][font=宋体]时，小于[/font]500Da[font=宋体]的化合物可以通过测量精确分子量直接给出化学式（参考文献：[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Truly “exact” mass:Elemental composition can be determined uniquely from molecular massmeasurement at [/font][font='Cambria Math',serif]∼ [/font][font='Times-Roman',sans-serif]0.1 mDa accuracy for molecules up to [/font][font='Cambria Math',serif]∼ [/font][font='Times-Roman',sans-serif]500 Da[/font][font=宋体]，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Sunghwan Kim[/font][font=宋体]等，[/font]2006[font=宋体]））。目前很多质谱公司的软件及免费资源（图[/font][font='Times-Roman',sans-serif]4[/font][font=宋体]）具有基于限定元素及氮律和化合价原则，可以给出各种化学式组合并按照质量准确度得出最接近的化学式（图[/font][font='Times-Roman',sans-serif]1[/font][font=宋体]）。[/font][img=,690,657]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/06/202006011057279221_100_2265735_3.jpg!w690x657.jpg[/img][align=center][font=宋体]图1高分辨质谱图及Xcalibur软件计算的化学式，化学式下面是分子量偏差。[/font][/align]很多做有机的同学在送样质谱检测的时候会要求测量数据精确到小数点后四位，[b]其实这是非常粗糙的要求，而且不合理[/b]。为什么？因为有些同学的分子量可以到[font='Times-Roman',sans-serif]2000Da[/font][font=宋体]，小数点后四位及[/font][font='Times-Roman',sans-serif]0.0001/2000=5[/font][font='Viner Hand ITC']×[/font][font='Times-Roman',sans-serif]10[sup]-8[/sup](0.05ppm),[/font][font=宋体]对质谱测量精度要求很高，一般实验室不会装备这么高精度的质谱。[color=red]碰到测量分子量比较大的物质，我建议还是控制测量误差在[/color][/font][font='Times-Roman',sans-serif][color=red]5ppm[/color][/font][font=宋体]（当然有钱有仪器的实验室可以要求更高），同时要补充波谱数据（核磁，红外）。[/font][b][font=宋体]准确的质谱测量数据可以定性化合物，分子量越大，定性能力会减弱[/font][font=&]，原子组合形式会急剧增加。即使质谱测量的是单一物质，因为同位素的存在，分子量也不会是一个，[/font][/b][font=宋体]同位素会提高质谱定性能力吗？事实上同位素测量确实可以辅助质谱定性，但是测量同位素质量需要质谱达到一定的质量分辨率。[/font][b]3[font=黑体]分辨率[/font][/b]Michael L. Gross[font=宋体]也指出准确测量分子量需要质谱高分辨率。事实上，高分辨率是精确测定分子量的前提。高分辨才能保证分子量测量值的“唯一性”。质谱分辨率指的是质谱区分两个相邻[/font][font='Times-Roman',sans-serif]m/z[/font][font=宋体]谱峰的能力，常用半峰宽来表示（[/font][font='Times-Roman',sans-serif]FWHM[/font][font=宋体]）（式[/font]2[font=宋体]）。只有足够的分辨率才能区分物质的同位素峰。同位素随着化合物分子量的增加显著影响分子量的计算，[b]考虑所有同位素贡献的分子量为物质的平均分子量，低分子量物质的精确分子量一般指的是单同位素分子量（[/b][/font][b][font='Times-Roman',sans-serif]monoisotopic mass[/font][font=宋体]）[/font][/b][font=宋体]。图[/font][font='Times-Roman',sans-serif]2[/font][font=宋体]用的是采用低分辨率（单位分辨率）和高分辨率（分辨率[/font][font='Times-Roman',sans-serif]60000[/font][font=宋体]）质谱测定同一物质的质谱图。重复测量几次，低分辨质谱测得分子量会在小数点后第一位变化，高分辨质谱测得单同位素分子量变化非常小。[b]当采用棒状图（[/b][/font][b]centroid[font=宋体]）采集一段时间低分辨质谱图时候，可以看到质谱峰是一簇的，平滑之后可以看到分子量（峰，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]peak[/font][font=&]）及半缝宽（分辨率）。[/font][/b][img=,690,222]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/06/202006011057509007_2110_2265735_3.jpg!w690x222.jpg[/img][align=center][font=宋体]图2 A高分辨质谱图(profile模式),[/font][/align][align=center][font=&]B[/font][font=宋体]（centroid）和C（profile模式）低分辨质谱图。[/font][/align][align=center][font=宋体]采集的是0.5min的平均谱图，高分辨模式1scan/100ms，低分辨质谱1scan/10ms[/font][/align]随着分子量的增加，强度最高的质量峰不在是单同位素分子量，分子量中心向高处漂移，整个质量峰呈现正态分布。图[font='Times-Roman',sans-serif]3[/font][font=宋体]是一系列多肽的质谱图，可以看到随着分子量增加，同位素质谱图会变得复杂。[/font][img=,690,533]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/06/202006011058096181_8370_2265735_3.jpg!w690x533.jpg[/img][font=宋体]图3 MALDIT-OF测量的一系列多肽。随着分子量增加，同位素峰增加。[/font]从上面谱图我们可以猜测，[color=red]随着分子量的增加，同位素对分子量计算及质谱峰（如果可以测量）分布影响会越来越大[/color]。质谱仪器性能也限制了高分子量物质的测量，主要表现在：[b]（1[font=宋体]）分子量测量限制[/font][/b][font=宋体]。大部分质谱测量范围为[/font][font='Times-Roman',sans-serif]50-2000Da,[/font][font=宋体]也有[/font][font='Times-Roman',sans-serif]100-4000Da[/font][font=宋体]的，对于[/font]MALDI-TOF[font=宋体]有些厂家最高分子量可以测量[/font][font='Times-Roman',sans-serif]18[/font][font=宋体]万[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Da[/font][font=宋体]，这些测量限制主要是来源离子源（如何让“猪”带电起飞）和电子透镜及质量检测器（引导“猪”沿着设计线路飞到检测器）；[b]（[/b][/font][b]2[font=宋体]）测量精度限制及分辨率限制。[/font][/b][font=宋体]大部分质谱分辨率随着分子量增加而下降，采用[/font][font='Times-Roman',sans-serif]MALDI-TOF[/font][font=宋体]测定的完整蛋白质质谱图有时候看起来像紫外光谱图，谱图已经无法区分同位素。采用[/font][font='Times-Roman',sans-serif]ESI[/font][font=宋体]测定，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]ESI[/font][font=宋体]可以让分析物带多个电荷，以常做质量分析检测的单克隆抗体（分子量约[/font][font='Times-Roman',sans-serif]15[/font][font=宋体]万[/font]Da[font=宋体]为），如果想要分子量可以被准确标出，就需要[/font][font='Times-Roman',sans-serif]150000/1000=150[/font][font=宋体]个电荷[/font][font='Times-Roman',sans-serif],[/font][font=宋体]考虑同位素分子量间隔为[/font][font='Times-Roman',sans-serif]1Da,[/font][font=宋体]即区分同位素在[/font][font='Times-Roman',sans-serif]150[/font][font=宋体]个电荷间隔为[/font]1/150=0.0067,[font=宋体]最低限度的分开要求在[/font][font='Times-Roman',sans-serif]1000Da[/font][font=宋体]的分辨率最低为[/font][font='Times-Roman',sans-serif]1000/0.0067[/font][font='Viner Hand ITC']×[/font][font='Times-Roman',sans-serif]2=300000,[/font][font=宋体]即在最低[/font][font='Times-Roman',sans-serif]30[/font][font=宋体]万分辨率才可以直接判断带电离子带的电荷数并且直接计算分子量。[/font]R= M/ W[sub]h[/sub] --------------[font=宋体]（[/font]2[font=宋体]）[/font]啰嗦了这么多，只想告诉精确测量分子量需要考虑目标化合物的分子量大小及匹配的分辨率，下面说点实际的，[b][u]精确测量分子量的大致步骤及免费辅助工具。[/u][/b][font='Times-Roman',sans-serif]4[/font][font=宋体]精确分子量测量[/font]如果只需要简单测个分子量比对一下手动计算的分子量，大部分质谱仪都可以完成。一般原则是根据化合物分子量大小及性质选择，非极性选择[font='Times-Roman',sans-serif]EI-MS[/font][font=宋体]，极性选择[/font][font='Times-Roman',sans-serif]ESI-MS[/font][font=宋体]，分子量稍大且制样简单可选择[/font][font='Times-Roman',sans-serif]MALDI-MS[/font][font=宋体]，大部分检测器都可以满足分辨率要求。[/font][b][font=宋体]如果用高分辨质谱精确测量化合物精确分子量，建议按照以下步骤执行：[i]步骤[/i][/font][i][font='Times-Roman',sans-serif]1[/font][/i][/b][font=宋体]首先得到物质的分子式（考虑加和离子情况），采用软件（常用免费软件，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]ChemDraw[/font][font=宋体]，[/font]Mass Spectrum Interpreter[font=宋体]，[/font]Isotope Pattern Calculator[font=宋体]，[/font]IsoSPEC[font=宋体]，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]ECIPEX…..[/font][u][font=宋体]参考文献[/font][font='Times-Roman',sans-serif]enviPat: Isotope Pattern, Profile andCentroid Calculation for Mass Spectrometry, Martin Loos[/font][font=宋体]，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Christian Gerber,2016[/font][/u][font=宋体]）或者网络免费资源（推荐网站[/font][font='Times-Roman',sans-serif]1. SIS [url]https://www.sisweb.com/mstools/isotope.htm[/url][/font][font=宋体]和网站[/font][font='Times-Roman',sans-serif]2 ChemCalc [url]https://www.chemcalc.org/?ionizations=&mf[/url]=[/font][font=&]）计算分子量并得到模拟的高分辨质谱图（带同位素峰）；[b][i]步骤[/i][/b][/font][b][i][font='Times-Roman',sans-serif]2[/font][/i][/b][font=宋体]采用高分辨质谱（你可以找到的最好质谱）测量得到高分辨质谱图；[b][i]步骤[/i][/b][/font][b][i][font='Times-Roman',sans-serif]3[/font][/i][/b][font=宋体]计算精确分子量与实际测量值偏差，并对比同位素质谱。[b][color=red]对于分子量[/color][/b][/font][b]2000Da[font=&][color=red]以下化合物，同时提交实际测量质谱图与计算模拟质谱图，一般会完美的解答编辑及审稿人的疑问。[/color][/font][font=宋体]第一步计算分子量很重要，再次强烈推荐[/font]ChemCalc[font=宋体]的免费网站（图[/font][font='Times-Roman',sans-serif]4[/font][font=宋体]）。[/font][/b][font=宋体]该网站功能强大，界面清爽友好，主要功能区在网页的最左边，可以通过分子式计算分子量（图[/font][font='Times-Roman',sans-serif]4A[/font][font=宋体]），也可以通过质谱测量的分子量给出分子式选项（图[/font][font='Times-Roman',sans-serif]4B[/font][font=宋体]，回看第二部分）。拓展功能可以计算肽段二级碎片离子，计算聚合物片段及分子量，提供质谱分析有用参数及常见基团质量。[b]使用非常简单，打开网页即可。[/b][/font][img=,690,776]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/06/202006011058356222_2565_2265735_3.jpg!w690x776.jpg[/img][font=宋体]图4 ChemCalc网站质谱计算工具。[/font]顺便说一下第[font='Times-Roman',sans-serif]3[/font][font=宋体]部分提到的问题，如果需要测定的分子量太大怎么办？这个时候你可以用你手头软件去卷积功能（很多质谱公司软件内嵌有这个功能，有些公司需要单独购买）。去卷积功能很强大，对低分辨和高分辨数据都可以处理，高分辨质谱数据有利于剔除干扰峰，计算的分子量会更加准确一些。[/font][b][font=&][size=14.0pt]5[/size][/font][size=14.0pt]精确分子量测量及同位素测量应用[/size][font='Times-Roman',sans-serif]5.1[/font][font=宋体]定量。[/font][/b][font=宋体]质谱定量的黄金标准是三重四极杆的[/font][font='Times-Roman',sans-serif]MRM[/font][font=宋体]模式，最近很多人用高分辨质谱直接全扫描，然后用很窄的目标分子量范围（±[/font][font='Times-Roman',sans-serif]5ppm[/font][font=宋体]）提取的离子流色谱图（[/font][font='Times-Roman',sans-serif]XIC[/font][font=宋体]）定量。个人经验及相关文献都认为：与传统[/font][font='Times-Roman',sans-serif]MRM[/font][font=宋体]定量模式相比，高分辨质谱全扫描定量方式各项测试指标相近，灵敏度略低。[b]基于精确分子量测定的全扫描模式定量方法优势是方法开发迅速，只需要计算精确分子量，不需要标准物质，优化参数少，这对定量分析化合物及代谢物很有吸引力，尤其是代谢物标准物质不易得到情况，[/b]比如在处理药物强制破坏实验可以采用全扫描定量模式检查破坏产物。[/font][font='Times-Roman',sans-serif]ThermoFisher[/font][font=宋体]在四级杆[/font][font='Times-Roman',sans-serif]-[/font][font=宋体]静电轨道离子阱（[/font][font='Times-Roman',sans-serif]QE[/font][font=宋体]）质谱上发展了[/font][font='Times-Roman',sans-serif]PRM[/font][font=宋体]定量方式，该方式结合精确分子量测量和[/font][font='Times-Roman',sans-serif]MRM[/font][font=宋体]各自优点，在高分子量物质定量尤其是多肽定量很有优势（因为工作还没发表，不便举例）。[/font][b][font='Times-Roman',sans-serif]5.2[/font][font=宋体]物质筛查与追踪。[/font][/b][font=宋体]我们重新回到第[/font][font='Times-Roman',sans-serif]1[/font][font=宋体]部分的质量亏损。[b]质谱学上的质量亏损[/b][/font][b]M[sub]d[/sub][font=&]指的是原子核的精确分子量[/font][font='Times-Roman',sans-serif]M[sub]ex[/sub][/font][font=&]与原子核质子与中子之和[/font][font='Times-Roman',sans-serif]N[/font][font=&]差值[/font][/b][font=宋体]（式[/font][font='Times-Roman',sans-serif]3[/font][font=宋体]）[b]。[/b][/font][align=center][font='Times-Roman',sans-serif]M[sub]d[/sub]=M[sub]ex[/sub]-N-------------[/font][font=宋体]（[/font][font='Times-Roman',sans-serif]3[/font][font=宋体]）[/font][/align]限定元素和限定分子量，精确分子量可以直接给出分子式。代谢组学及环境分析利用高分辨质谱进行靶向和非靶向分析，一次进样，从质谱图直接拉出一个分子式列表。石油化工利用质量亏损筛查原油中氧硫化合物成分（[b][u]注意：CHN[font=宋体]质量亏损为正，[/font]OS[font=宋体]为负[/font][/u][/b][font=宋体]）；有些公司开发了利用质量亏损筛查药物代谢物的软件（[/font][font='Times-Roman',sans-serif]MetabolitePilot[/font][font=宋体]、[/font][font='Times-Roman',sans-serif]MetWorks…[/font][font=宋体]）。物质追踪主要利用高分辨质谱对同位素质量峰的测量，分析化合物标记的[b]易于识别的特异的[/b]同位素模式（[/font][font='Times-Roman',sans-serif]iso pattern[/font][font=宋体]），设置过滤参数，准确快速定位化合物，常见引入的元素有[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Br[/font][font=宋体]，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Cl[/font][font=宋体]和一些同位素比较多的元素。如参考文献：[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Isotopic signature transfer and mass patternprediction (IsoStamp): An enabling technique for chemically-directed proteomics[/font][font=宋体]，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Krishnan K. Palaniappana[/font][font=宋体]和[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Selenium-isotopic signature toward massspectrometric identification and enzyme activity assay[/font][font=宋体]，[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Hu Junjie[/font][font=宋体]等，[/font]2019.[font=黑体][size=&]6[/size][/font][size=14.0pt]实际实验中应该注意的问题[/size][font='Times-Roman',sans-serif] [b] 6.1 [/b][/font][b][font=&]质谱需要校正和维护。[/font][/b][font=宋体]高分辨质谱需要严格的校正，越是精密的数据越要仔细校正分子量偏差和分辨率。在采用外标校正，应该注意校正时间间隔，避免超过时间段，有些质谱采用双离子源，其中一个离子源实时注入外标校正液，不间断校正。也可以采用内标锁定方式校正质谱，内标一般用流动相中背景信号，常见的背景见参考文献：[/font][b][font='Times-Roman',sans-serif]Interferences and contaminantsencountered in modern mass spectrometry[/font][font=&][color=red]，[/color][/font][i][font='Times-Roman',sans-serif][color=red]AnalyticaChimica Acta[/color][/font][/i][font=宋体]，[/font][color=red]BerndO.Keller[/color][/b]等高分辨质谱维护主要维护使用环境，[font='Times-Roman',sans-serif]TOF[/font][font=宋体]的漂移管和[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Orbitrap[/font][font=宋体]的轨道阱受温度影响会很大。[/font][b][font='Times-Roman',sans-serif]6.2 [/font][font=&]控制进样浓度。[/font][/b][font=宋体]现在的高分辨质谱一般用的是[/font][font='Times-Roman',sans-serif]Orbitrap[/font][font=宋体]或者[/font]FTICR[font=宋体]质谱，傅里叶变换质谱的进样浓度不易太高太低，注意[/font][font='Times-Roman',sans-serif]AGC[/font][font=宋体]数据阈值，避免空间电荷效应（简单的说就是注入质谱太多离子，这些运动的离子形成了局部的电场磁场，干扰了质谱分析器的电场磁场[/font][font='Times-Roman',sans-serif],[/font][font=宋体]空间电荷效应会降低分辨率，数据准确度下降）。举个离子，一个硒标记的多肽，同位素峰非常有特色，通过高分辨质谱测量不同浓度下同位素峰峰高比例与理论值比较，发现高浓度和低浓度样品都会偏离理论值（图[/font][font='Times-Roman',sans-serif]5[/font][font=宋体]）。[/font][img=,690,437]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/06/202006011059101922_8276_2265735_3.jpg!w690x437.jpg[/img][font=宋体]图5测量同位素峰811/809比值与理论值在不同信噪比的偏离度。[/font][b][font='Times-Roman',sans-serif]6.3 [/font][font=&]数据[/font][/b][font=宋体]。质谱采集有[/font][font='Times-Roman',sans-serif]profile[/font][font=宋体]和[/font]centroid[font=宋体]两种模式，简单说就是一个是[b]峰[/b]一个是[b]棒[/b]。在表征可以采用[/font][font='Times-Roman',sans-serif]profile[/font][font=宋体]数据采集，在做定量分析提取[/font][font='Times-Roman',sans-serif]XIC[/font][font=宋体]时建议采用[/font]centroid[font=宋体]，这样采集的数据文件不会太大，而且采用[/font][font='Times-Roman',sans-serif]profile[/font][font=宋体]的数据在提取[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/3p][color=#3333ff]离子色谱[/color][/url]图，因为峰宽可能落在提取窗口之外，很可能造成数据“溢出”，定量不准（图[/font][font='Times-Roman',sans-serif]6[/font][font=宋体]）。数据处理之前，对自己分析的样品背景了解越多，越有利于非靶向分析（真正的盲测是很难的），处理数据应该限定元素组成和限定分子量。[/font][img=,690,394]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/06/202006011059392307_9613_2265735_3.jpg!w690x394.jpg[/img][font=宋体]图6profile和centroid模式质谱图，虚线为XIC提取质量范围，可以看到profile模式下，质量（峰尖）落在提取范围内，但是有一部分峰落在提取范围之外。[/font][font=黑体][size=&]7 [/size][/font][size=14.0pt]预告：同分异构体[/size][font=宋体]最后一个问题：如果碰到同分异构体怎么办？质谱可以解析吗？可以，质谱可以通过碎片离子峰和二级质谱解析确认化合物的[b]结构式而不是分子式[/b]。事实上，在质谱分析相关课程及质谱使用过程中，大家认为质谱的定性能力主要来源于碎片离子的解析，这方面很多有经验的老师都是质谱解析高手。如果后续有时间码字，[b]我想和大家讨论的是[u]没有质谱解析经验的同学们[/u]在获得分子式后如何通过质谱推测结构式？在知道结构式后如何解析碎片[/b][/font][b][font='Times-Roman',sans-serif]([/font][font=&]二级[/font][font='Times-Roman',sans-serif])[/font][font=&]质谱图？[/font][/b][font=宋体]最重要的是介绍一些[b][u][color=red]免费免费免费[/color][/u]（重要的事情说三遍）[/b][u]软件及网络资源解析碎片（二级或者多级）质谱图，或者通过碎片（二级）质谱图推测化合物结构，[/u]后续聊聊：[b]质谱定性：结构式及免费资源和解析工具。[/b][/font]

计算出来的“人体分子式”，字母为化学元素，后面的数字为原子数。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/04/201504112255_541695_1636655_3.jpg

[color=#444444]因为要做高分辨质谱，所以要知道化合物的分子式。看了很多文献，写花色苷的结构式时，那个氧原子上都有个加号，这个是正离子吧，如下图。它的中文名称是矢车菊-3-二葡萄糖苷-5-葡萄糖苷，按这个正离子数出来，应该是C（33）H（41）O（21），那么它的分子量计算时是不是要减去一个氢原子，为C（33）H（40）O（21）啊？做质谱时筛选母离子是用C（33）H（41）O（21） 还是C（33）H（40）O（21）来设置加氢加钠啊？应该按照请大家帮帮忙！谢谢！算分子量是不是要按照中性分子来计算啊？[/color][color=#444444][img=,421,280]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/09/201909060957079190_8147_1843534_3.jpg!w421x280.jpg[/img][/color]

(1)-3-7 分子式索引 (Formula Index, FI)分子式索引于 1920 年第 16 卷起推出. 报导的内容简洁, 只提供化合物的名字、登记号与文摘号三种信息 (下图), 是辅助索引. 需要进一步了解化合物的详细信息则需要查找化学物质索引. 使用分子式索引的时机包括不清楚化合物的命名, 以及快速了解某化合物是否有人研究过.CA 对 分子式的编排采用简单易记的 Hill 系统, 而不用 20 世纪初盛行的 Richter 系统 (Richter 系统字母次序为 C, H, O, N, Cl, Br, I, F, S, P 等, 例如 C10H5ON4BrS). Hill 系统以 C, H 为主体, 然后其它原子按照英文字母顺序排列, 例如 C10H5BrN4OS. 如果化合物没有 C, 则全部按照字母次序, 例如氢溴酸为 BrH. 想进一步了解 Hill 系统可以查阅 J. Am. Chem. Soc., 1900, 22 (8), 478-494.有些结构不明确的化合物在分子式索引中暂不命名, 但提供沸点、熔点、质谱等理化数据. 对于高聚物或有机盐 (如醇、酚、胺的金属盐) 的查阅从化合物的母体着手, 例如高聚物从单体; 季铵盐 (C6H5CH2)(CH3)2(CH3CH2)N+ I- 从C11H18N; 乙醇钠 C2H5ONa 从 C2H6O 母体着手.分子式索引的编排、阅读与查找范例如下:http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/10/201110190538_324733_1631320_3.jpg练题 1: 查 1997 年 126 卷报导下列化合物 (分子式 C19H20ClN3S) 的文摘Piperidine 1--4--1H-pyrazol-3-yl 答案 1: 126: P31349v练题 2: 查 1992-1996 期间报导 dichlorodiiodomethane (CCl2I2) 的文摘号答案 2: 117: 14730j; 120: 63571d; 120: 106321s[/fo

非常好用的计算器下载[img]http://www.instrument.com.cn/bbs/images/affix.gif[/img][url=http://www.instrument.com.cn/bbs/download.asp?ID=34209]计算器[/url][img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2006/12/200612022310_34210_1603125_3.jpg[/img]

一般曲线总是会有截距，按要求应对截距与0作t检验，当取95%置信水平，应无显著差异。若无显著差异即可舍去截距。实验值与真值之间必然存在截距绝对值大小的误差，因此有必要舍去截距。其实就是再审核某曲线的时候觉得截距大了，然后就做t检验，然后就一跺脚花了一个小时做了个计算器，以后用起来方便。1.本计算器只能用于10个点以内的曲线，不过我想也没有做个十几二十个点的吧。2.本计算器只能用于双测得，单侧也用不到吧。3.由于没有什么技术含量就是一些简单公式的应用，价值10分。4.不能用的请自行安装兼容包，在第一篇里有附件供下载。http://www.instrument.com.cn/download/shtml/222260.shtml下面上图：http://ng1.17img.cn/bbsfiles/files/2012/11/201211151825_404501_1603606_3.JPG简单吧在固定地方输入数据，绿色的出曲线，r上面有，黄色的出t检验结果。原本不想多介绍的，因为真的太简单了，没什么技术含量，就是用index和match编的。不过titi老大说字数不够。。。那就介绍一下吧，上面说了截距很重要对于截距的有效性检验可以减少实验中系统误差的产生。整个计算器都锁定了，只需在m和A出输入对应的浓度以及吸光度即可在下方绿色的单元格内显示拟合出来的曲线，上方可以显示相关系数r和r2,（应该是γ，不过大家用贯r了所以不改了），在α出输入你要的置信度，一般考虑为双侧，所以单侧的没做，即可在黄色的单元格内显示出t值以及检验结果是否为合格，无需自己查t表。还有有些标准是给出斜率的，如有需要对斜率做t检验也是可以的，如有需要请单独联系我。