转自丁香园，作者：Cooks先介绍几本质谱解析的专著吧！现在理论比较完善，专著比较多的是EI质谱，最经典的是麦克拉夫蒂的《质谱解析》，现在有中文的第三版，英文已经出第四版了。书中介绍了离子碎裂的基本机理，分子结构的推测，以及一些辅助技术，还介绍了常见化合物（烃、醇、醛、酯、酸、醚等）的EI质谱。由于现在EI普库已经比较完备，对于未知化合物的鉴定，一般通过谱库的匹配就可以实现了。所以现在研究EI裂解规律的人越来越少了。因为裂解规律的研究不是为了研究裂解而研究的，主要目的还是为了实现对未知化合物的解析。这本书作为质谱入门的数据，我还是强烈推荐的，至少你可以学习裂解途径的正确表示方法！其他入门的书籍还有几本英文的（中文的我基本不推荐阅读）：1，A Beginner's Guide to Mass Spectral Interpretation （很老了）2，Interpretation of Mass Spectra 4th Edition (F. W. McLafferty & F. Turecek)（质谱解析英文版）3，mass-spectrometry basics4，Understanding Mass Spectra- A Basic Approach (Second Edition)上面介绍的书其实都比较陈旧了，也不是现在质谱研究的主流，现在主流的质谱技术是大气压化学电离质谱（API），包括APCI, ESI, APPI等，由于这些电离的技术比较新，相关的专著比较少。我看到一些书仅是简单的介绍了这些API的接口，很少有对这些接口下的裂解进行探讨的，而这样的研究现在主要来源于几本质谱学的杂志(RCM,JMS, JAMSS)。以API源作为接口的质谱，现在主要有离子阱，三重四级杆，TOF，LTQ等。离子阱有多级质谱（MSn）功能，是结构研究的强有力工具，LTQ（线形离子阱）也可以实现类似的功能，但现在这种仪器还不普及。我以后说的解析主要是针对离子阱质谱的！关于离子阱质谱最好的书是Raymond E. March 和John F. J. Todd的Quadrupole Ion Trap Mass Spectrometry-Second Edition，这本书是讲离子阱理论最权威的了，只是里面太多的理论，当然学学这些对我们解析质谱还是很有帮助的，但假如没有很好的物理和数学基础，想看懂还是比较费尽的。
质谱的定性分析基于对质谱谱图的解析而实现，但由于有机化合物种类繁多，繁杂的裂解规律不易记忆，又缺乏解析的思路和方法，很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。为适应广大分析技术工作者的需求，信立方培训中心为大家开设《有机质谱谱图解析专题培训班》，欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。 第15期有机质谱谱图解析应用技术培训班 会议安排： 会议时间：2016-11-29至2016-12-2（4天） 会议地点：北京外国专家大厦（华严北里8号院外国专家大厦（北四环））适用对象：使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员。 课程内容： 一、谱图解析基础知识：1、原子中电子的排布2、奇电子离子与偶电子离子3、氮规则4、环加双键值5、同位素峰6、单分子反应二、离子的丰度：1、质荷比与离子丰度包含的结构信息2、影响碎片离子丰度的基本因素三、离子碎裂的基本机理：1、断裂2、环的开裂3、重排反应4、置换反应5、消除反应四、常见有机化合物的质谱图特征：1、碳氢化合物2、醇、酮、醛、酸、酯、醚3、胺类、酰胺类, 氨基酸,硝基化合物,腈基化合物4、卤代物5、多官能团化合物五、由质谱图推测分子结构：1、基本方法及思路2、实例练习六、NIST谱图库检索实用技术：1、NIST谱图库简介2、NIST谱图库主要功能3、NIST谱图库检索实例注：学员可自带原始数据采集文件，讲师可采用学员的文件作为案例进行分析） 专家介绍： 1、王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员，中国最早从事质谱研究的专家之一，参与了国内多项质谱仪器的研发工作，有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作：《有机质谱解析》；2、苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究，参与了国内质谱仪器的研发工作，组织过多种质谱应用技术培训，有丰富的教学经验。代表著作：《色谱-质谱联用技术及应用》；3、李重九 中国农业大学理学院应用化学系教授，农残分析领域著名质谱专家，在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作《有机质谱应用：在环境、农业和法庭科学中的应用》 报名咨询： 联系人：李老师 座机：010-51654077-8119 电话：15910410867 邮箱：liru@instrument.com.cn
请教一下各位大佬，请问质谱负离子有可能出现[M+2甲酸-H]-的峰吗？下图的是我们检测的一组质谱数据，感觉正负离子对应不起来，请诸位大佬帮忙解析一下，谢谢??[img]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2024/03/202403271746135319_5064_5333993_3.png[/img]
前几天写了个液相的简易流程，朋友看到让我写个质谱方面。那就写吧，因为[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url]用的多点，拿[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url]来说吧。我们已经放假了，长假期该如何操作，保证仪器不受损伤。第一，关机。[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url]频繁开关机很不好，我们的仪器只有在维护的时候才关机。关机首先在真空控制中卸真空，降温到合适的温度后关掉工作站，MS，GC依次关，氦气电脑打印机随意。我培训新人经常说的是，开机先开便宜的，后开贵的，关机先关贵的，后关便宜的。关机燃气助燃在仪器前，载气保护气在仪器后，开机反过来。很容易记住。第二，维护，由于日常仪器都是处在运行之中，年前要进行下维护保养，平常不容易碰到的离子源，经常碰到的进样口检测器等，该清洗清洗，好像网上也有很多视频。我的建议是，拆的时候录像或者拆一个拍一张，装的时候就有参照了。另外提前拿一干净盘子在旁边，零件什么的及时放里面，防止掉落。顺便还可以除除尘，如果有仪器套膜可以罩上防尘。曾经有人问我，进实验室为什么要换鞋？你买的又不是防酸碱鞋，咱们又不是洁净室。其中一个原因是，灰尘是很多仪器的天敌，鞋底带入的灰尘相对比较多，所以最好换鞋。色谱和质谱类进样按照说明书都能操作，但是再解析有人就很懵了。怎么那么多方法，那么多文件。我这里有一个简单易懂的程序。质谱和色谱都可用的第一种，先走一个高浓度的标准物质，这时的方法是你设置的方法，没有带任何信息的方法。走完之后定性，不管是质谱离子对定性还是色谱保留时间定性，可另存一个定性方法。这时色谱质谱设置标准物质点数，浓度，质谱设置SIM方法，我们称之为定量方法，然后拿定量方法去走序列，可直接得出曲线和样品浓度。第二种，色谱的，可以先设置方法，不带信息的那种，走序列，走完之后拿其中一个点保留时间定性，浓度点定量，保存为定量方法，在再解析里用定量方法处理一遍序列，可得曲线和浓度。有时需要走完标准曲线确定定性方法，建立标准曲线，然后根据处理标准曲线得到的定量方法，用它去处理样品。根据不同的工作站和仪器进行操作。OK。任务完成，都是基本操作，有不同意见或者有更好的处理方法请留言，多谢。
质谱法是将被测物质离子化，按离子的质荷比分离，测量各种离子谱峰的强度而实现分析目的的一种分析方法。质量是物质的固有特征之一，不同的物质有不同的质量谱——质谱，利用这一性质，可以进行定性分析（包括分子质量和相关结构信息）；谱峰强度也与它代表的化合物含量有关，可以用于定量分析。质谱仪一般由四部分组成：进样系统——按电离方式的需要，将样品送入离子源的适当部位；离子源——用来使样品分子电离生成离子，并使生成的离子会聚成有一定能量和几何形状的离子束；质量分析器——利用电磁场（包括磁场、磁场和电场的组合、高频电场、和高频脉冲电场等）的作用将来自离子源的离子束中不同质荷比的离子按空间位置，时间先后或运动轨道稳定与否等形式进行分离；检测器——用来接受、检测和记录被分离后的离子信号。一般情况下，进样系统将待测物在不破坏系统真空的情况下导入离子源（10-6～10-8mmHg），离子化后由质量分析器分离再检测；计算机系统对仪器进行控制、采集和处理数据，并可将质谱图与数据库中的谱图进行比较。一、 进样系统和接口技术将样品导入质谱仪可分为直接进样和通过接口两种方式实现。1. 直接进样在室温和常压下，气态或液态样品可通过一个可调喷口装置以中性流的形式导入离子源。吸附在固体上或溶解在液体中的挥发性物质可通过顶空分析器进行富集，利用吸附柱捕集，再采用程序升温的方式使之解吸，经毛细管导入质谱仪。对于固体样品，常用进样杆直接导入。将样品置于进样杆顶部的小坩埚中，通过在离子源附近的真空环境中加热的方式导入样品，或者可通过在离子化室中将样品从一可迅速加热的金属丝上解吸或者使用激光辅助解吸的方式进行。这种方法可与电子轰击电离、化学电离以及场电离结合，适用于热稳定性差或者难挥发物的分析。质谱进样系统发展较快的是多种液相色谱/质谱联用的接口技术，用以将色谱流出物导入质谱，经离子化后供质谱分析。主要技术包括各种喷雾技术（电喷雾，热喷雾和离子喷雾）；传送装置（粒子束）和粒子诱导解吸（快原子轰击）等。2. 电喷雾接口带有样品的色谱流动相通过一个带有数千伏高压的针尖喷口喷出，生成带电液滴，经干燥气除去溶剂后，带电离子通过毛细管或者小孔直接进入质量分析器。传统的电喷雾接口只适用于流动相流速为1～5μl/min的体系，因此电喷雾接口主要适用于微柱液相色谱。同时由于离子可以带多电荷，使得高分子物质的质荷比落入大多数四极杆或磁质量分析器的分析范围（质荷比小于4000），从而可分析分子量高达几十万道尔顿（Da）的物质。3. 热喷雾接口存在于挥发性缓冲液流动相（如乙酸铵溶液）中的待测物，由细径管导入离子源，同时加热，溶剂在细径管中除去，待测物进入[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相[/url]。其中性分子可以通过与[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相[/url]中的缓冲液离子（如NH4+）反应，以化学电离的方式离子化，再被导入质量分析器。热喷雾接口适用的液体流量可达2ml/min，并适合于含有大量水的流动相，可用于测定各种极性化合物。由于在溶剂挥发时需要利用较高温度加热，因此待测物有可能受热分解。4. 离子喷雾接口在电喷雾接口基础上，利用气体辅助进行喷雾，可提高流动相流速达到1ml/min。电喷雾和离子喷雾技术中使用的流动相体系含有的缓冲液必须是挥发性的。5. 粒子束接口将色谱流出物转化为气溶胶，于脱溶剂室脱去溶剂，得到的中性待测物分子导入离子源，使用电子轰击或者化学电离的方式将其离子化，获得的质谱为经典的电子轰击电离或者化学电离质谱图，其中前者含有丰富的样品分子结构信息。但粒子束接口对样品的极性，热稳定性和分子质量有一定限制，最适用于分子量在1000Da以下的有机小分子测定。6. 解吸附技术将微柱液相色谱与粒子诱导解吸技术（快原子轰击，液相二次粒子质谱）结合，一般使用的流速在1～10μl/min之间，流动相须加入微量难挥发液体（如甘油）。混合液体通过一根毛细管流到置于离子源中的金属靶上，经溶剂挥发后形成的液膜被高能原子或者离子轰击而离子化。得到的质谱图与快原子轰击或者液相二次离子质谱的质谱图类似，但是本底却大大降低。
他们在质谱分析领域兢兢业业，掌握最前沿的应用技术，具有丰富理论知识和实践经验，我们都应向他们学习讨教。他们的在学术上的深度、钻研的态度值得我们追仿。 王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员，中国最早从事质谱研究的专家之一，参与了国内多项质谱仪器的研发工作，有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作： 《有机质谱解析》 苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究，参与了国内质谱仪器的研发工作，组织过多种质谱应用技术培训，有丰富的教学经验。代表著作：《色谱-质谱联用技术及应用》 李重九 中国农业大学理学院应用化学系教授，农残分析领域著名质谱专家，在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作：《有机质谱应用：在环境、农业和法庭科学中的应用》 本月，大家有机会跟这三位资深的专家学者面对面，探寻质谱在分析领域有何最新进展，快速提升自己现有谱图解析水平，从掌握到精通... 第15期有机质谱谱图解析应用技术培训班即将开始~ 会议安排 会议时间：2016-11-29至2016-12-2（4天）会议地点：北京外国专家大厦（华严北里8号院外国专家大厦（北四环））适用对象： 使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员。 您能学到什么 1、本课程将有机质谱繁杂的裂解规律归纳提炼为简要、易学、易记的六大裂解类型 2、课程将讲解如何使用专属应用软件或手工计算的方式，计算未知物的元素组成 3、本课程将介绍若干免费网站，进一步查找特定元素组成可能的对应结构 4、本课程将以实例讲解偶电子离子的裂解规律，应用于ESI源(CID谱) 5、本课程将讲解合理的中性碎片及氮规则等谱图解析中的核心原理，以识别分子离子峰 除此之外，你不懂的或者工作当中遇到的问题都可以带到课堂上来，授课专家会为您一一解答指导！ 课程内容 一、谱图解析基础知识1、原子中电子的排布2、奇电子离子与偶电子离子3、氮规则4、环加双键值5、同位素峰6、单分子反应 二、离子的丰度1、质荷比与离子丰度包含的结构信息2、影响碎片离子丰度的基本因素 三、离子碎裂的基本机理1、断裂2、环的开裂3、重排反应4、置换反应5、消除反应 四、常见有机化合物的质谱图特征1、碳氢化合物2、醇、酮、醛、酸、酯、醚3、胺类、酰胺类, 氨基酸,硝基化合物,腈基化合物4、卤代物5、多官能团化合物 五、由质谱图推测分子结构1、基本方法及思路2、实例练习 六、NIST谱图库检索实用技术1、NIST谱图库简介2、NIST谱图库主要功能3、NIST谱图库检索实例注：学员可自带原始数据采集文件，讲师可采用学员的文件作为案例进行分析） 报名咨询 联系人：李老师座机：010-51654077-8119电话：15910410867邮箱：liru@instrument.com.cn
质谱解析和方法开发书籍都有哪些？！
质谱介绍及质谱图的解析质谱法是将被测物质离子化，按离子的质荷比分离，测量各种离子谱峰的强度而实现分析目的的一种分析方法。质量是物质的固有特征之一，不同的物质有不同的质量谱——质谱，利用这一性质，可以进行定性分析（包括分子质量和相关结构信息）；谱峰强度也与它代表的化合物含量有关，可以用于定量分析。质谱仪一般由四部分组成：进样系统——按电离方式的需要，将样品送入离子源的适当部位；离子源——用来使样品分子电离生成离子，并使生成的离子会聚成有一定能量和几何形状的离子束；质量分析器——利用电磁场（包括磁场、磁场和电场的组合、高频电场、和高频脉冲电场等）的作用将来自离子源的离子束中不同质荷比的离子按空间位置，时间先后或运动轨道稳定与否等形式进行分离；检测器——用来接受、检测和记录被分离后的离子信号。一般情况下，进样系统将待测物在不破坏系统真空的情况下导入离子源（10-6～10-8mmHg），离子化后由质量分析器分离再检测；计算机系统对仪器进行控制、采集和处理数据，并可将质谱图与数据库中的谱图进行比较。一、 进样系统和接口技术将样品导入质谱仪可分为直接进样和通过接口两种方式实现。1. 直接进样在室温和常压下，气态或液态样品可通过一个可调喷口装置以中性流的形式导入离子源。吸附在固体上或溶解在液体中的挥发性物质可通过顶空分析器进行富集，利用吸附柱捕集，再采用程序升温的方式使之解吸，经毛细管导入质谱仪。对于固体样品，常用进样杆直接导入。将样品置于进样杆顶部的小坩埚中，通过在离子源附近的真空环境中加热的方式导入样品，或者可通过在离子化室中将样品从一可迅速加热的金属丝上解吸或者使用激光辅助解吸的方式进行。这种方法可与电子轰击电离、化学电离以及场电离结合，适用于热稳定性差或者难挥发物的分析。目前质谱进样系统发展较快的是多种液相色谱/质谱联用的接口技术，用以将色谱流出物导入质谱，经离子化后供质谱分析。主要技术包括各种喷雾技术（电喷雾，热喷雾和离子喷雾）；传送装置（粒子束）和粒子诱导解吸（快原子轰击）等。2. 电喷雾接口带有样品的色谱流动相通过一个带有数千伏高压的针尖喷口喷出，生成带电液滴，经干燥气除去溶剂后，带电离子通过毛细管或者小孔直接进入质量分析器。传统的电喷雾接口只适用于流动相流速为1～5μl/min的体系，因此电喷雾接口主要适用于微柱液相色谱。同时由于离子可以带多电荷，使得高分子物质的质荷比落入大多数四极杆或磁质量分析器的分析范围（质荷比小于4000），从而可分析分子量高达几十万道尔顿（Da）的物质。3. 热喷雾接口存在于挥发性缓冲液流动相（如乙酸铵溶液）中的待测物，由细径管导入离子源，同时加热，溶剂在细径管中除去，待测物进入[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相[/url]。其中性分子可以通过与[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相[/url]中的缓冲液离子（如NH4+）反应，以化学电离的方式离子化，再被导入质量分析器。热喷雾接口适用的液体流量可达2ml/min，并适合于含有大量水的流动相，可用于测定各种极性化合物。由于在溶剂挥发时需要利用较高温度加热，因此待测物有可能受热分解。4. 离子喷雾接口在电喷雾接口基础上，利用气体辅助进行喷雾，可提高流动相流速达到1ml/min。电喷雾和离子喷雾技术中使用的流动相体系含有的缓冲液必须是挥发性的。5. 粒子束接口将色谱流出物转化为气溶胶，于脱溶剂室脱去溶剂，得到的中性待测物分子导入离子源，使用电子轰击或者化学电离的方式将其离子化，获得的质谱为经典的电子轰击电离或者化学电离质谱图，其中前者含有丰富的样品分子结构信息。但粒子束接口对样品的极性，热稳定性和分子质量有一定限制，最适用于分子量在1000Da以下的有机小分子测定。6. 解吸附技术将微柱液相色谱与粒子诱导解吸技术（快原子轰击，液相二次粒子质谱）结合，一般使用的流速在1～10μl/min之间，流动相须加入微量难挥发液体（如甘油）。混合液体通过一根毛细管流到置于离子源中的金属靶上，经溶剂挥发后形成的液膜被高能原子或者离子轰击而离子化。得到的质谱图与快原子轰击或者液相二次离子质谱的质谱图类似，但是本底却大大降低。
随着质谱技术的发展，质谱仪的分辨率和灵敏度不断提高，高分辨质谱仪逐渐被推广应用。用高分辨质谱进行样品分析，可获得丰富的结构信息，特别是其出色的质量精度和准确度，使通过准确质量法推导化合物分子式更加准确。而通用的NIST谱库更是提供了一种仅需要比较结果谱图就能得到分子式的方法，极大地简化了数据处理流程，减少了数据分析工作量，降低了分析难度，成为[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]-高分辨质谱的重要优点之一。但是，把高分辨质谱数据交给数据处理软件进行分子式推导和谱库比对并非一蹴而就的事，要获得准确的定性分析结果，对结果进行仔细筛选和确证是必不可少的步骤。本文以高分辨[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]GC-MS[/color][/url]数据处理为例，简要介绍高分辨质谱数据分析中的应注意的问题。1.NIST质谱库收录的是在70 eV EI源下分析纯化合物获得的质谱图，为保证比对结果的准确性，要求样品质谱图尽可能纯净。准备样品时，应选择适当的样品浓度，尽量降低本底，对复杂混合物样品进行纯化，使待测化合物尽可能纯净。分析仪器要求灵敏度、分辨率高，采集到的质谱信息全面、准确、清晰。在TIC图上选取质谱图时也需进行一定的处理，扣除仪器背景，最好选择TIC出峰的上行或下行段，得到平均质谱图，以避免TIC峰顶离子浓度饱和或某一时间点出现偶然误差。2.数据处理软件对库结果会给出“质量误差”这一参数，它是判断结果准确性的重要参数之一，但是，质量误差最小的结果未必是最准确的结果。尽管高分辨质谱能提供很高的质量精度，但这并不意味着它可以得到绝对准确的质量值。当待测化合物元素组成复杂、分子量大时，质量误差的偏差对结果的影响更为明显，此时同位素峰信息往往比质量信息具有更强的鉴别能力。3. 虽然谱库检索简单可靠，但仍有其局限性。以NIST谱库为例，检索只利用碎片离子及其丰度这一信息，没有利用高分辨质谱提供的全部信息。实际应用中，同系物往往有相似的碎片离子组成，在这种情况下，匹配度最高的结果不一定是准确的。不过NIST谱库也收录化合物的保留指数，如果在对库时加入保留指数，则可缩小结果范围，得到更准确的结果。通过降低EI源电压或用CI源确定待测化合物的分子离子峰也有助于验证结果的准确性。4. 虽然数据库收录大量种类繁多的化合物信息，但相对于有机化合物总数而言，仍然只是很小的一部分。如果待测物是未被数据库收录的化合物，则谱库检索无法获得准确结果，此时质谱法只能推导出可能的分子式，需要结合其他分析手段推导化合物结构。综上而言，高分辨质谱及其配备的数据处理软件为未知样品的定性分析提供了简便可靠的手段，但要获得准确的结果，必须对数据进行谨慎的筛选和确证。完全依赖数据库比对结果不可取，在实际应用中，最好综合考虑数据库比对结果、色谱保留指数和同位素峰等信息，有条件的话，用标准品来验证无疑是最可靠的方法。
质谱分析具有灵敏度高，样品用量少，分析速度快，分离和鉴定同时进行等优点，广泛应用于化学，化工，环境，能源，医药，运动医学，刑事科学技术，生命科学，材料科学等各个领域。但质谱图解析始终是一大难题，小编无意中从万能的网络上挖出某质谱解析大师的解谱绝学，如获至宝，据说，只要掌握这一点，就掌握了质谱解析的80%以上，其他20%就靠自己回去偷着演练了，这是不相当于武功里面的“葵花宝典”！质谱同学们来试试管不管用？多级质谱解析为何难？ 首先我们要明白为什么质谱，尤其是多级质谱的解析很难，甚至比核磁还难？！这是因为其提供的信息非常有限，NMR可以提供原子层次的信息，而质谱只能提供到基团（多个原子构成的特定组成）层次。这些有限的信息，少到从理论上就不可能推测出一个唯一的结构！是啊，确实如此，就像我们遇到了无解的方程，难道还有比这更难的吗？举了例子，对绝大多少小分子化合物来说，一套NMR图谱(1H, 13C, HMQC, HMBC)，有经验的人就可以推测出其结构；而拿来一套小分子的多级质谱，即便有10级的数据，如果解析的人不知道其他背景知识的话，比如样品是天然产物，还是合成的，若是天然产物，来自什么植物或药材，有没有紫外吸收等等，绝大多数情况没有人可以确切的推出化合物的结构。看到这里，是不是感觉很失望！既然这么难，为什么非要用质谱分析呢？用NMR不就得啦！不然，质谱的优势在于其灵敏度高，同时在其与LC联用以后，就成为一种强大的混合物分子工具（LC-MS），这是NMR不可比拟的。LC-MS成熟以前，若要研究清楚一味药材中有哪些成份，不花几年功夫，基本没戏，一般一个植化的硕士或博士研究清楚一个药材就可以毕业了!但有了LC-MS，这个过程可能只需要几个月，甚至几周就可以获得以前需要几年才能获得的信息！因此，质谱是其他技术暂时无法替代的！建立裂解规律 虽然普遍意义上的质谱数据没有唯一解，但只要限定研究的范围和条件，那还是有解可循的。就如化合物的浓度与其UV响应的关系我们是没法知道的，可在一个很窄的范围内，就能用直线来近似他们的关系！那么如何限定质谱研究的范围呢？首先我有几项假设，所有的质谱推理都建立在它们之上：•假设1：结构相似的化合物具有相同或相似的裂解规律；•假设2：化合物的裂解行为的外因是质谱构造和碰撞能量，内因是分子结构特性，外因决定几率，内因决定终点；假设1首先肯定了在某些情况下，即结构相似，质谱的裂解数据是有规律可循的！结构相似，可以指有相同的官能团，或者在天然产物分类上属于一类，比如都属于黄酮、甾体、萜等。这个相似性越接近，那么它们具有相同的裂解形式的可能越大，同属于查尔酮的化合物间的行为就比其他黄酮更接近。假设2更进一指明了化合物的结构与质谱的关系，主要用来解决“为什么不同质谱仪器获得的质谱数据有很大差别”（NMR不应该有这种情况）的问题，可以肯定一点，不同仪器获得的数据是有规律可循的，这一点也为我们建立不同质谱仪器数据的智能解析程序鉴定了基础（我们正在开发的一种秘密武器）！“外因决定几率”指碎片离子在质谱图上的丰度高低，“内因决定终点”是指可能存在哪些类型的碎片离子。通过前面两个假设，知道了质谱的规律性在一个很小的范围内是可以成立的，那最关键的就是建立这一小类化合物的裂解规律，而如何建立裂解规律呢？要先从分析已知化合物的多级质谱入手。可是我们还不知道它们的裂解规律啊，怎么分析这些质谱数据呢？我想这就是大多数人遇到的第一个难题了，获得了质谱数据，即便是已知化合物的，也不知道那些棒棒们代表什么！在这里，我假定大家已经知道了最基本的质谱知识，比如full scan, MS/MS, 准分子离子，碎片离子，丰度等。直接进入传说中最神秘的“一三断裂”，可以说“一三断裂”是CID(碰撞诱导解析)质谱中最常见的裂解形式，与以往70eV的EI-MS非常不相同。EI-MS中的能量太高了，一般小分子的大部分结构单元都受不起这么高的能量，碎的面目全非；而ESI-MS中的CID温和很多，并且碰撞的能量还不是一气就全招呼上，慢慢来，一点一点的把化合物结构中不稳定的部位给敲掉。正是因为能量不高，化合物结构中不同基团的特异性差异才得以最大化的体现，也让分子有机会摆好“一三”的pose后，才被打掉！说的专业一点，“一三断裂”是一种能垒较低的裂解反应！大家熟知的麥式重排仅是“一三断裂”的一个特列而已，据我所知，现有的小分子内的重排裂解都可归到“一三断裂”中！http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/rd6Go5Sb8IS3DNyzLfSrPMXtnMQrFjW9uhvAY1sQCZyt5JGX4rY3NwnoibWVReiaYibVthgzzyyjWoPAgFJYcxFxA/640?tp=webp&wxfrom=5“一三断裂”是CID(碰撞诱导解析)质谱中最常见的裂解形式。你们是不是觉得这个太简单了，好似大家都知道吧！唉，这么多年了，我就靠这么点本事混饭吃啊~以后谁再说质谱解析难，看看上面的图然后回家面壁吧！当然会有一些例外，比如自由基断裂，还有黄酮中4-CO的丢失等。如果你实验中，遇到一些不符合这个规律的例子，欢迎来“实验与分析人社区”与小编分享哦。（文章来源：互联网）
现在理论比较完善，专著比较多的是EI质谱，最经典的是麦克拉夫蒂的《质谱解析》，现在有中文的第三版，英文已经出第四版了。书中介绍了离子碎裂的基本机理，分子结构的推测，以及一些辅助技术，还介绍了常见化合物（烃、醇、醛、酯、酸、醚等）的EI质谱。由于现在EI普库已经比较完备，对于未知化合物的鉴定，一般通过谱库的匹配就可以实现了。所以现在研究EI裂解规律的人越来越少了。因为裂解规律的研究不是为了研究裂解而研究的，主要目的还是为了实现对未知化合物的解析。这本书作为质谱入门的数据，我还是强烈推荐的，至少你可以学习裂解途径的正确表示方法！其他入门的书籍还有几本英文的（中文的我基本不推荐阅读）：1 A Beginner''s Guide to Mass Spectral Interpretation （很老了）2 Interpretation of Mass Spectra 4th Edition (F. W. McLafferty & F. Turecek)（质谱解析英文版）3 mass-spectrometry basics4 Understanding Mass Spectra- A Basic Approach (Second Edition)上面介绍的书其实都比较陈旧了，也不是现在质谱研究的主流，现在主流的质谱技术是大气压化学电离质谱（API），包括APCI, ESI, APPI等，由于这些电离的技术比较新，相关的专著比较少。我看到一些书仅是简单的介绍了这些API的接口，很少有对这些接口下的裂解进行探讨的，而这样的研究现在主要来源于几本质谱学的杂志(RCM,JMS, JAMSS)。以API源作为接口的质谱，现在主要有离子阱，三重四极杆，TOF，LTQ等。离子阱有多级质谱（MSn）功能，是结构研究的强有力工具，LTQ（线形离子阱）也可以实现类似的功能，但现在这种仪器还不普及。我以后说的解析主要是针对离子阱质谱的！关于离子阱质谱最好的书是Raymond E. March 和John F. J. Todd的Quadrupole Ion Trap Mass Spectrometry-Second Edition，这本书是讲离子阱理论最权威的了，只是里面太多的理论，当然学学这些对我们解析质谱还是很有帮助的，但假如没有很好的物理和数学基础，想看懂还是比较费尽的。
主管您好！请问什么时候能看到 质谱性能及参数介绍及质谱谱图解析方法概述 培训的上传视频？谢谢
附件是GC-MS中未知峰的质谱图，谱库匹配度很低，可能是谱库外的物质或两种以上物质的共流出图 请大神帮忙解析下该图，推测可能的化合物或结构，谢谢！PS：已上传原始数据(DATA.MS)。推测很大可能是两种物质的共流出离子图。
未知样的质谱图解析流程 (一)解析分子离子区(1) 标出各峰的质荷比数，尤其注意高质荷比区的峰。(2) 识别分子离子峰。首先在高质荷比区假定分子离子峰，判断该假定分子离子峰与相邻碎片离子峰关系是否合理，然后判断其是否符合氮律。若二者均相符，可认为是分子离子峰。 (3) 分析同位素峰簇的相对强度比及峰与峰间的Dm值，判断化合物是否含有C1、Br、S、Si等元素及F、P、I等无同位素的元素。 (4)推导分子式，计算不饱和度。由高分辨质谱仪测得的精确分子量或由同位素峰簇的相对强度计算分子式。若二者均难以实现时，则由分子离子峰丢失的碎片及主要碎片离子推导，或与其它方法配合。 (5)由分子离子峰的相对强度了解分子结构的信息。分子离子峰的相对强度由分子的结构所决定，结构稳定性大，相对强度就大。对于分子量约200的化合物，若分子离子峰为基峰或强蜂，谱图中碎片离子较少、表明该化合物是高稳定性分子，可能为芳烃或稠环化合物。 例如：萘分子离子峰m/z128为基峰，蒽醌分子离子峰m/z 208也是基峰。分子离子峰弱或不出现，化合物可能为多支链烃类、醇类、酸类等。 (二)、解析碎片离子(1) 由特征离子峰及丢失的中性碎片了解可能的结构信息。 若质谱图中出现系列CnH2n+1峰，则化合物可能含长链烷基。若出现或部分出现m/z77，66，65，51，40，39等弱的碎片离子蜂，表明化合物含有苯基。若m/z91或105为基峰或强峰，表明化合物含有苄基或苯甲酰基。若质谱图中基峰或强峰出现在质荷比的中部，而其它碎片离子峰少，则化合物可能由两部分结构较稳定，其间由容易断裂的弱键相连。(2)综合分析以上得到的全部信息，结合分子式及不饱和度，提出化合物的可能结构。 (3)分析所推导的可能结构的裂解机理，看其是否与质谱图相符，确定其结构，并进一步解释质谱，或与标准谱图比较，或与其它谱(1HNMR、13CNMR、IR)配合，确证结构。
质谱解析程序质谱解析程序 解析未知样的质谱图，大致按以下程序进行。（一）解析分子离子区 (1) 标出各峰的质荷比数，尤其注意高质荷比区的峰。 (2) 识别分子离子峰。首先在高质荷比区假定分子离子峰，判断该假定分子离子峰与相邻碎片离子峰关系是否合理，然后判断其是否符合氮律。若二者均相符，可认为是分子离子峰。 (3) 分析同位素峰簇的相对强度比及峰与峰间的Dm值，判断化合物是否含有C1、Br、S、Si等元素及F、P、I等无同位素的元素。 (4) 推导分子式，计算不饱和度。由高分辨质谱仪测得的精确分子量或由同位素峰簇的相对强度计算分子式。若二者均难以实现时，则由分子离子峰丢失的碎片及主要碎片离子推导，或与其它方法配合。 (5) 由分子离子峰的相对强度了解分子结构的信息。分子离子峰的相对强度由分子的结构所决定，结构稳定性大，相对强度就大。对于分子量约200的化合物，若分子离子峰为基峰或强蜂，谱图中碎片离子较少、表明该化合物是高稳定性分子，可能为芳烃或稠环化合物。 例如：萘分子离子峰m／z 128为基峰，蒽醌分子离子峰m／z 208也是基峰。分子离子峰弱或不出现，化合物可能为多支链烃类、醇类、酸类等。（二）、解析碎片离子 (1) 由特征离子峰及丢失的中性碎片了解可能的结构信息。 若质谱图中出现系列CnH2n+1峰，则化合物可能含长链烷基。若出现或部分出现m／z 77，66，65，51，40，39等弱的碎片离子蜂，表明化合物含有苯基。若m／z 91或105为基峰或强峰，表明化合物含有苄基或苯甲酰基。若质谱图中基峰或强峰出现在质荷比的中部，而其它碎片离子峰少，则化合物可能由两部分结构较稳定，其间由容易断裂的弱键相连。 (2) 综合分析以上得
抱歉这两天打扰大家了。问题:我知道质谱的解析，需要把你的化合物导入到仪器的软件里，然后进行比对。药物代谢，进入体内的不仅有药物原型，还有代谢产物。我的问题是，这些代谢产物，是不是要自己事先预测好，计算好，然后一并导入软件？（例如：小檗碱是C20H18NO4，它的葡糖醛酸化结构是C26H26NO10，我不紧要把小檗碱导入，还要把后者分子式一并导入数据库，对吗？）还有一个问题：质谱的解析，主要是数字的加减和核对，这样理解对吗？
我们知道质谱分析最重要的部分就是解析图谱，如何解析二次离子质谱呢？好像很困难，因为目前关于二次离子质谱的数据并不多。本人综合总结了培训过程中所学一点经验给大家分享；1。二次离子质谱分为两种，一种动态二次离子质谱(ＤＳＩＭＳ)，如ＣＡＭＥＣＡ公司生产的ＩＭＳ－ｘｆ系列，一种静态二次离子质谱（Ｓ－ＳＩＭＳ），如ＵＬＶＡＣ－ＰＨＩ公司生产的ｎａｎｏ－ＴＯＦ系列。动态和静态区分的标准时入射离子的计量，当＞10^12ions/cm^2称为动态－ＳＩＭＳ，小于这个数值，称为Ｓ－ＳＩＭＳ．动态－ＳＩＭＳ主要用作半导体器件痕量元素的深度分析，以及矿物用同位素定年。要求样品导电性要好，静态－ｓｉｍｓ主要用于表面成分分析，如有机物，无机物分析，且可以分析分子碎片，并可以使其成像（2D,3D）。2。全部同位素解析，根据同为个数，和自然界的丰度，半段谱峰对应的元素，同时也可以考虑一般谱峰都是带一个电荷的离子，通过查元素周期表就可以确认他们存在与否。（未完待续）
解析未知样的质谱图，大致按以下程序进行。（一）解析分子离子区 (1) 标出各峰的质荷比数，尤其注意高质荷比区的峰。 (2) 识别分子离子峰。首先在高质荷比区假定分子离子峰，判断该假定分子离子峰与相邻碎片离子峰关系是否合理，然后判断其是否符合氮律。若二者均相符，可认为是分子离子峰。 (3) 分析同位素峰簇的相对强度比及峰与峰间的Dm值，判断化合物是否含有C1、Br、S、Si等元素及F、P、I等无同位素的元素。 (4) 推导分子式，计算不饱和度。由高分辨质谱仪测得的精确分子量或由同位素峰簇的相对强度计算分子式。若二者均难以实现时，则由分子离子峰丢失的碎片及主要碎片离子推导，或与其它方法配合。 (5) 由分子离子峰的相对强度了解分子结构的信息。分子离子峰的相对强度由分子的结构所决定，结构稳定性大，相对强度就大。对于分子量约200的化合物，若分子离子峰为基峰或强蜂，谱图中碎片离子较少、表明该化合物是高稳定性分子，可能为芳烃或稠环化合物。 例如：萘分子离子峰m／z 128为基峰，蒽醌分子离子峰m／z 208也是基峰。分子离子峰弱或不出现，化合物可能为多支链烃类、醇类、酸类等。（二）、解析碎片离子 (1) 由特征离子峰及丢失的中性碎片了解可能的结构信息。 若质谱图中出现系列CnH2n+1峰，则化合物可能含长链烷基。若出现或部分出现m／z 77，66，65，51，40，39等弱的碎片离子蜂，表明化合物含有苯基。若m／z 91或105为基峰或强峰，表明化合物含有苄基或苯甲酰基。若质谱图中基峰或强峰出现在质荷比的中部，而其它碎片离子峰少，则化合物可能由两部分结构较稳定，其间由容易断裂的弱键相连。 (2) 综合分析以上得到的全部信息，结合分子式及不饱和度，提出化合物的可能结构。 (3) 分析所推导的可能结构的裂解机理，看其是否与质谱图相符，确定其结构，并进一步解释质谱，或与标准谱图比较，或与其它谱(1H NMR、13C NMR、IR)配合，确证结构。
请教一下各位大佬，检测出来的质谱数据正负离子数据相差1应该是什么原因，该怎么解释呢？还有负离子出现M+62的峰应该是加合了什么离子呢？望指教，谢谢。
现在，质谱解析存在一个误区。由于大家对EI谱的解析已经很熟悉了，而且我们在学校中学习的主要也是EI谱的解析，但是目前我们在应用中更多的是碰到的一些软离子化方式如ESI产生离子的裂解。通常，我们并没有注意到两者的区别，即便是在国内的一些专业文献中大家也不是很注意，都尝试用解析EI谱的方式去解析后者，事实上，这是不科学的或者说是不严谨的。后者的裂解方式不是那么容易就能够说明的，是需要通过多级质谱以及其它一些“Wet Chemistry”的方法解释的，所以对于国内文献中一些根据三重四极杆获得的二级产物离子谱就得出全面的裂解途径大家应该用怀疑的眼光去看，有时经常发现他们甚至都不能自圆其说。
[font=system-ui, -apple-system, BlinkMacSystemFont, &]质谱是分析测试中常用的仪器分析方法，但谈到质谱仪各部分的功能及原理，你又能说上来多少？质谱图的解析，你是否有思路从何入手？今天仪小宝就来带大家深入了解下质谱仪的原理和有机质谱谱图分析的相关知识。[/font][size=14px]高效[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/5p][color=#3333ff]液相色谱[/color][/url]系统主要由贮液瓶、泵、进样器、柱子、柱温箱、检测器、数据处理系统组成。对于整个系统而言，柱子、泵和检测器是核心部件，同时也是易出问题的主要部位。[/size][size=14px]质谱仪由进样系统、离子源、质量分析器、离子检测器、数据系统和真空系统组成，每一个硬件单元在仪器使用中都扮演着必不可少的角色。接下来，小宝会从原理、功能等方面为大[/size][size=14px]家详细介绍下质谱仪的核心硬件单元。[/size][color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px]离子源[/size][/font][/b][/color][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px][color=#443e3e]：[/color][/size][/font][size=14px]待测物从进样系统被引入后，首先来到离子源。质谱仪检测的是[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相[/color][/url]离子，离子源可将待测物离子化，使待测物形成质荷比[/size][size=14px]([/size][size=14px]ｍ／ｚ[/size][size=14px]) [/size][size=14px]不同的[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相[/color][/url]离子。不同离子源的电离方式不同，从而得到的信息和谱图也不同。常用的离子源包括[/size][size=14px]EI、CI 、ESI、APCI等。[/size]不同离子化方式都可以产生正、负离子，而分子离子种类与离子化媒介、基质及过程有关，分子离子具有一定内能，可进一步分解产生碎片离子（准分子离子经诱导解离产生碎片离子），不同碎片离子对应质荷比不同，在质谱图中体现出来，从中可推断分子的结构信息。[font=system-ui, -apple-system, BlinkMacSystemFont, &][color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif]离子检测器：[/font][/b][/color][/font][font=system-ui, -apple-system, BlinkMacSystemFont, &]经[/font]过质量分析器之后，待测物便来到了离子检测器。离子检测器用于离子的检测，包括直接检测和间接检测。直接检测的是离子的电荷或者电量，通过一系列电子线路将其转化成电压、电流等。[color=#33ccff][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px]其他[/size]：[/font][/b][/color][size=14px][color=rgba(0, 0, 0, 0.9)]除了以上提到的离子源[/color][/size][size=14px][color=rgba(0, 0, 0, 0.9)]、[/color][/size][size=14px][color=rgba(0, 0, 0, 0.9)]质量分析器和离子检测器，质谱仪的其他核心部件如[/color][/size][size=14px][color=rgba(0, 0, 0, 0.9)]进样系统、数据系统和真空系统，对于质谱仪同样必不可少。[/color][/size][size=14px][color=rgba(0, 0, 0, 0.9)]进样系统用于样品导入，可直接进样也可间接进样。数据系统包含了计算机的软件和硬件，控制并监视仪器的运行、采集数据以及处理数据。真空系统对仪器相当重要，决定了不同仪器的性能指标，从真空条件上可以看到仪器性能的差别。[/color][/size][font=system-ui, -apple-system, BlinkMacSystemFont, &]相信经过以上的介绍，各位应该对质谱仪的各部分功能及原理有了更深刻的认知，但只会操作和原理也是远远不够的，谱图解析在质谱法的使用中亦是非常重要的一步，如何依据质谱图建立解析思路，构建合理的待测物结构？教您六步分析法！[/font][color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px]核对质谱图[/size][/font][/b][/color][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px][color=#443e3e]：[/color][/size][/font][size=14px]首先要核对质谱图是否合理，比如基峰，一张谱图只能有一个基峰，如果检测器调整的不合适或者样品浓度过大，则会有很多基峰。另外要观察同位素峰是否存在，有的同位素丰度的含量很低，则可以通过数据列表看是否有同位素峰。[/size][size=14px]要注意，丰度值和[/size][size=14px]m/z[/size][size=14px]同样重要，它不仅体现了同位素丰度，同时也反映了碎裂的难易程度，离子结构的稳定程度，通常碎裂之后的那部分比较稳定，则丰度值比较高。[/size][color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px]浏览谱图概貌[/size][/font][/b][/color][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px][color=#443e3e]：[/color][/size][/font][size=14px]从谱图概貌里首先要看高端、低端的特征峰，高端主要找分子离子，而低端主要是特征离子和离子系列。其次要判断分子离子是否存在，有无分子离子质量数奇偶性、丰度分布。根据以上可初步判断是否含氮、可以通过同位素峰值的特征可以初步判断是否还有某些元素。浏览谱图概貌主要是利用最基本的概念，做出初步的判断。[/size][color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px]核对质谱图[/size][/font][/b][/color][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px][color=#443e3e]：[/color][/size][/font][size=14px]质谱解析首先要做到的就是确定分子量，通过谱图信息，找到分子离子即可确定。如果找不到分子离子，则可通过改变电离方式等得到，有了分子量之后推导元素式，推导出元素式之后即可计算Ｒ＋DB值。[/size][color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px]核对质谱图[/size][/font][/b][/color][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px][color=#443e3e]：[/color][/size][/font][size=14px]综合所有的结构信息，即可搭建可能的结构式，从不同的结构式中筛选，从而得到候选化合物。[/size][color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px]排除与谱图不相符的结构[/size][/font][/b][/color][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px][color=#443e3e]：[/color][/size][/font]分析筛选候选化合物重要离子来源，主要采用排除法，通过分析化合物重要离子来源、m/z和丰度与样品的谱图对照，从而排除与谱图不相符的结构。[size=14px][/size][font=微软雅黑, sans-serif][/font][color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px]排除与谱图不相符的结构[/size][/font][/b][/color][font=Helvetica, Arial, sans-serif][size=14px][color=#443e3e]：[/color][/size][/font]用NMR等其他仪器分析、结构表征等方式获得的结果验证、核对、合成化合物质谱核对。关于谱图解析一般有两种情况，一种是已知化合物结构，查找样品里是否含有，可以在库里查找，相对简单；另一种是天然产物或者合成中的中间产物，结构完全未知，在库里不存在，这种就一定要验证，相对困难。[size=14px][size=14px][/size][/size][size=14px][/size]希望经过介绍，可以帮助各位更清楚的了解质谱仪的原理及质谱图的解析！若想要了解更多信息，欢迎了解以下课程：《有机质谱谱图解析技巧》！[color=#3daad6][b][font=Helvetica, Arial, sans-serif][font=微软雅黑, sans-serif]名师[/font][/font][/b][/color]：[size=14px][color=#3daad6][b]王毅[/b][color=black]长期从事色谱及有机质谱分析，具有丰富的色谱质谱实际应用经验。擅长有机质谱碎裂规律总结及质谱碎裂机理的分析，尤其是利用有机质谱裂解机理实现对异构体化合物的区分鉴别、合成化合物的结构确证、未知化合物的结构解析、有机质谱对催化反应机理的证明、色谱质谱分析方法开发、有机质谱图解析培训。[/color][color=black]曾两次组织系统性的有机质谱解析课程培训，参加学员超过百人，课程受到学员们的一致好评。[/color][color=#3daad6]曾协助中国科学院上海有机化学研究所、浙江大学、中国农业科学院、中国农业大学、北京中医药大学等高校或研究所对有机质谱数据进行分析，相关成果在高水平期刊上得以发表.[/color][color=black]多次受邀在其他平台进行有机质谱解析的课程讲解，[/color][color=#3daad6]有机质谱解析培训受到质谱学家王光辉老师的推荐[/color][color=black]，讲解内容的核心也是从如何从一张未知物质谱图推导该未知物的结构，[/color][color=#3daad6]无需很高的水平的人员也能操作[/color][color=black]，目的是促使质谱解析系统高效快捷并得到广泛应用。[/color][color=black]迄今在《Analyst》《Molecules》《Chinese J. Anal.Chem.》《质谱学报》《高等学校化学学报》等期刊上发表质谱学术论文15篇。[/color][/color][/size][color=#3daad6][b][font=微软雅黑, sans-serif][color=#3daad6][b]课程截图[/b][/color][/font][font=Helvetica, Arial, sans-serif][color=#443e3e]：[/color][/font][/b][/color][img=,690,393]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2023/11/202311081821060525_9994_5659437_3.png!w690x393.jpg[/img]了解更多：[url]https://www.instrument.com.cn/ykt/course/detail_7005.html[/url]
对GC/MS的三维数据导出后，用MATLAB软件进行多元分辨解析后，分别得到不同物质（未鉴定）的质谱数据，如何将一种物质的质谱数据进行谱图库检索，怎样才能让谱图库识别这种数据格式？
[img=,690,55]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/03/201803021524542180_6133_1811858_3.png!w690x55.jpg[/img]小弟是新手，请各位大神帮忙解析下，母离子 M+H 是 1066.52 （二级质谱如图）， 其2M+H 的分子量是 533.77和 534.27 （无二级质谱）， 带两个电荷，可能的化合物类型（会不会是多肽？）[img=,690,70]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/03/201803021533353671_5495_1811858_3.png!w690x70.jpg[/img]母离子 M+H 是 938.47（二级质谱如图）， 其2M+H 的分子量是 469.73 和 470.22 （二级质谱如下图）， 带两个电荷[img=,690,75]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/03/201803021536089241_4585_1811858_3.png!w690x75.jpg[/img]类似的化合物还有很多，但分子量均很大，有带6-7个电荷的，分子量达到7000的，就不一一列举，但是他们一般带有特定的离子碎片峰，包括226.11或354.17或372.18，附件是质谱原始数据，以上的出峰时间在4.15min。
谁有学习质谱解析的视频或者好书推荐，谢谢
1、在1#TIC图中保留时间从11.0min-15.5min的质谱图基本一致，但在NIST图库里没有找到标准图，求2#图的解析，谢谢！2、3#，4#，5#三张质谱图是另一个样品中的某种助剂，其分子量应该较大，或者沸点较高，可能是一种光稳定剂，由于分子量较大在高温下分解成三种物质，求图谱解析。3、注，我们有裂解器。
质谱是通过荷质比来鉴定不同的分子的，所以，其基本功能就是测定分子量。通过分子量这一信息能够获知的信息有很多，从裂解单个分子的方向出发，比如基团信息、结构的测定。 现代的很多质谱能够保证分子的完整性，于是可以用来测序，鉴定未知的蛋白质，或者比较样本当中蛋白和肽段的丰度分布，用于临床诊断。 所以，在药学上的应用，不仅仅可以鉴定某种药物，也可以鉴定某药物的代谢过程和形式;可以鉴定跟药物分子作用的大分子，可以鉴定可能的靶点;可以检测给药之后，蛋白水平的变化，从而评价药效药理;在蛋白质组学上，质谱已经是不可或缺的仪器工具了。因此，只有你想不到，没有它做不到。 所谓质谱就是将化合物变成离子状态然后检测离子;质谱主要是作为一种分析工具，主要完成两种任务，定性和定量。定性：化合物的质荷比就是独特的标签，串联质谱可以有二级或多级碎片帮助分析化合物结构;定量一级或多级碎片定量可以获得超高的灵敏度，ppt-ppm,ag级别吧。在药物研究中的应用，简单说就是定性：天然产物、合成的化学药物、药物代谢物;定量：目前正在开展的是生物药的QC将由质谱来操刀;目前质谱在药物研究领域的应用已经非常广泛未来将会更加广泛。 按照分辨率的不同，先来把质谱分个类，可以分为高分辨和低分辨。高分辨质谱(飞行时间, 静电轨道阱，离子回旋共振，磁质谱)能提供精确分子量信息，从而获知可能的元素组成(分子式)，获得第一手的定性信息，在药物研发的各个阶段来说都是一个强有力的工具，当然运行成本高。低分辨质谱(四极杆，四极离子阱)只能提供精确到1Da的分子量信息，适合于已知化合物的鉴别和检测，但是价格便宜，应该说相当普及了。 质谱作为单独的分析仪器应用有限，还要和色谱等其他仪器联用才能发挥最大功效，介绍几个常见的色谱质谱联用仪器:GC/LC-QQQ, 液相/气相色谱串联四极杆，低分辨，分子量小于3k。能提供一定的分子碎片信息，定量能力强，用于一些需要微量定量的场合，例如体液中的药物浓度测定等GC/LC TOF，高分辨，分子量可达50万。特别使用于大分子研究，例如蛋白质类离子阱质谱，高分辨低分辨都有，主要特点是可以提供多级碎片信息，定性能力最强，定量性能较差，用于药物代谢，杂质研究等。 天然药化会用的比较多，有些未知结构的化合物用质谱还有红外和核磁共振可以得到化合物的结构，一般未知化合物的结构都会用到质谱，有一些高分辨率的质谱仪测定一些结构比较简单的化合物，甚至不需要用到红外和核磁共振。老师曾说过，质谱的核心就在解谱,质谱图的解析是关键。从质谱图我们获得的一个个离子相对的数量和它们各自的分子量，通过峰与峰之间的差值我们可以推断的是杂原子的种类或者脱落碎片的分子量，再根据峰与峰高度的比值获得碳骨架的形态(部分物质)，如果存在分子离子峰，可以直接得到物质的分子量。由此可以看出，通过质谱，可以了解到物质的分子量、元素组成、元素比例，甚至可以获得部分结构上的信息。之后再通过红外，碳谱氢谱就能将物质的结构完全获得了。解析未知样品的质谱图,大致按以下程序进行:一:解析分子离子区(1)标出各峰的质荷比数，尤其注意高质荷比区的峰。(2)识别分子离子峰。首先在高质荷比区假定分子离子峰，判断该假定分子离子峰与相邻碎片离子峰关系是否合理，然后判断其是否符合氮律。若二者均相符，可认为是分子离子峰。(3)分析同位素峰簇的相对强度比及峰与峰间的Dm值，判断化合物是否含有C1、Br、S、Si等元素及F、P、I等无同位素的元素。(4)推导分子式，计算不饱和度。由高分辨质谱仪测得的精确分子量或由同位素峰簇的相对强度计算分子式。若二者均难以实现时，则由分子离子峰丢失的碎片及主要碎片离子推导，或与其它方法配合。(5)由分子离子峰的相对强度了解分子结构的信息。分子离子峰的相对强度由分子的结构所决定，结构稳定性大，相对强度就大。对于分子量约200的化合物，若分子离子峰为基峰或强蜂，谱图中碎片离子较少、表明该化合物是高稳定性分子，可能为芳烃或稠环化合物。例如：萘分子离子峰m/z 128为基峰，蒽醌分子离子峰m/z 208也是基峰。分子离子峰弱或不出现，化合物可能为多支链烃类、醇类、酸类等。二:解析碎片离子(1)由特征离子峰及丢失的中性碎片了解可能的结构信息。若质谱图中出现系列CnH2n+1峰，则化合物可能含长链烷基。若出现或部分出现m/z 77，66，65，51，40，39等弱的碎片离子蜂，表明化合物含有苯基。若m/z 91或105为基峰或强峰，表明化合物含有苄基或苯甲酰基。若质谱图中基峰或强峰出现在质荷比的中部，而其它碎片离子峰少，则化合物可能由两部分结构较稳定，其间由容易断裂的弱键相连。(2)综合分析以上得到的全部信息，结合分子式及不饱和度，提出化合物的可能结构。(3)分析所推导的可能结构的裂解机理，看其是否与质谱图相符，确定其结构，并进一步解释质谱，或与标准谱图比较，或与其它谱(1H NMR、13C NMR、IR)配合，确证结构。解析未知样的质谱图，大致按以下程序进行。
各位版友们，仪课通推出有机质谱谱图解析专场答疑活动啦！ 《有机质谱谱图解析》课程已经上线5个月了，热度一直只增不减，大家除了表达对课程的喜爱之外，也提出了一些实际操作中的问题：[align=center][img=,300,130]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/04/202204221015468313_6478_4197640_3.png!w690x301.jpg[/img][/align][align=center]（有机质谱解析交流群截图）[/align] 小编整理了一下，有机质谱谱图解析中的[color=#3daad6]常见问题[/color]集中在以下方面：1.如何根据谱图判断化合物所含的Cl、Br原子数目？2.如何分析谱图中的离子类型？3.如何分析碎片离子生成的途径（即该离子由哪个母离子，通过什麽断裂途径，丢失什么碎片得到）？4.如何判断谱图中的分子离子峰，分析基峰离子的产生途径？5.对于a.b两个位置异构体，通过给出的质谱图，如何进行区分？6.通过计算不饱和度，如何判断离子是奇电子离子还是偶电子离子？…… 这么多的问题出现，仅仅依靠大家相互讨论来解决，实在耗时耗力。于是，有学员已经多次呼吁：要是能邀请专家，来一场[color=#3daad6]专场答疑[/color]该多好！[align=center][/align][b]专家答疑[/b] 为了能解决大家听课时积累的疑问，同时给解决工作中的实际问题带来启发，仪课通组织了一场[color=#3daad6]有机质谱谱图解析专场答疑直播活动[/color]，邀请《有机质谱谱图解析》课程主讲人——[color=#3daad6]王毅[/color]老师亲临直播间，为大家解答疑问。 本次活动是《有机质谱谱图解析》课程学员的购课服务，以帮助学员们更好地理解课程内容，应用于实际工作。[color=#3daad6] 暂未购课学员[/color]想要参加，可以[color=#3daad6]填写以下问卷[/color]，我们将[color=#3daad6]精选15名学员，[/color]在直播间[color=#3daad6]现场为你解答[/color]。[align=center][color=#3daad6]提交问题入口：[/color][/align][align=center][img=,300,300]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/04/202204221016536930_1336_4197640_3.png!w500x500.jpg[/img][/align][align=center][color=#3daad6]活动时间：[/color][b]2022年4月28日20：00正式开始！[/b][/align][b]嘉宾[/b][size=17px][b] [/b][/size]王毅：工程师[font=&]长期从事色谱及有机质谱分析，具有丰富的色谱质谱实际应用经验。擅长有机质谱碎裂规律总结及质谱碎裂机理的分析，尤其是利用有机质谱裂解机理实现对异构体化合物的区分鉴别、合成化合物的结构确证、未知化合物的结构解析、有机质谱对催化反应机理的证明、色谱质谱分析方法开发、有机质谱图解析培训。曾两次组织系统性的有机质谱解析课程培训，参加学员超过百人，课程受到学员们的一致好评。多次受邀在其他平台进行有机质谱解析的课程讲解，有机质谱解析培训受到质谱学家王光辉老师的推荐。曾协助中国科学院上海有机化学研究所、浙江大学、中国农业科学院、中国农业大学、北京中医药大学等高校或研究所对有机质谱数据进行分析，相关成果在高水平期刊上得以发表，迄今在《Analyst》《Molecules》《Chinese J. Anal. Chem.》《质谱学报》《高等学校化学学报》等期刊上发表质谱学术论文15篇。[/font][b]活动福利[/b][color=#3e3e3e] 本次活动将[/color][color=#3daad6]免费[/color][color=#3e3e3e]送出[/color][color=#3daad6]喜马拉雅季卡会员[/color][color=#3e3e3e]作为奖品，填写问卷或者参与当天活动均有机会获得！[/color][color=#3daad6]数量有限，先到先得！[/color][align=center][img=,300,201]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/04/202204221018238366_3363_4197640_3.jpg!w690x464.jpg[/img][/align][align=center][color=#3daad6]市场价：73元[/color][/align][align=center] 获得此奖品的同学，可以享受以下服务：[/align][align=center][img=,300,573]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/04/202204221019191532_818_4197640_3.png!w690x1319.jpg[/img][/align] 本次答疑直播干货满满、奖品超值，赶紧参与提交你想问的问题，4月28日，我们不见不散哦！[img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/aVPA1dDVY3rsvXkVsP6GVJ2M4hNiaibic1wkTCmiaW6h0PmiaIqata6mRAg0E6nP0h2ezVBQUP12M6ctqj9ynIq1Fmw/640?wx_fmt=png[/img]?学员有话说 《有机质谱谱图解析》课程已经上线5个月了，热度一直只增不减，大家除了表达对课程的喜爱之外，也提出了一些实际操作中的问题：[align=center][img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/HicNrGvuJvWLlc0QAoC2qV3cvkgrQdGDKoqekS0QMotz0cD7UOUKzj5jeCVFal6997NiaXkITkzTPLzNYGu2ibQNA/640?wx_fmt=png[/img][/align]（有机质谱解析交流群截图） 小编整理了一下，有机质谱谱图解析中的[color=#3daad6]常见问题[/color]集中在以下方面：1.如何根据谱图判断化合物所含的Cl、Br原子数目？2.如何分析谱图中的离子类型？3.如何分析碎片离子生成的途径（即该离子由哪个母离子，通过什麽断裂途径，丢失什么碎片得到）？4.如何判断谱图中的分子离子峰，分析基峰离子的产生途径？5.对于a.b两个位置异构体，通过给出的质谱图，如何进行区分？6.通过计算不饱和度，如何判断离子是奇电子离子还是偶电子离子？…… 这么多的问题出现，仅仅依靠大家相互讨论来解决，实在耗时耗力。于是，有学员已经多次呼吁：要是能邀请专家，来一场[color=#3daad6]专场答疑[/color]该多好！[align=center][img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_jpg/HicNrGvuJvWLlc0QAoC2qV3cvkgrQdGDK6MNgwyT5aOvkYyFu3tPdRXyTxQicEFrDeF8qpOrpgQPvibLE8IygZfRA/640?wx_fmt=jpeg[/img][/align][align=center](部分学员聊天记录)[/align][img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/aVPA1dDVY3rsvXkVsP6GVJ2M4hNiaibic1wkTCmiaW6h0PmiaIqata6mRAg0E6nP0h2ezVBQUP12M6ctqj9ynIq1Fmw/640?wx_fmt=png[/img]专家答疑 为了能解决大家听课时积累的疑问，同时给解决工作中的实际问题带来启发，仪课通组织了一场[color=#3daad6]有机质谱谱图解析专场答疑直播活动[/color]，邀请《有机质谱谱图解析》课程主讲人——[color=#3daad6]王毅[/color]老师亲临直播间，为大家解答疑问。 本次活动是《有机质谱谱图解析》课程学员的购课服务，以帮助学员们更好地理解课程内容，应用于实际工作。[color=#3daad6] 暂未购课学员[/color]想要参加，可以[color=#3daad6]填写以下问卷[/color]，我们将[color=#3daad6]精选15名学员，[/color]在直播间[color=#3daad6]现场为你解答[/color]。[align=center][color=#3daad6]提交问题入口：[/color][/align][align=center][img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/HicNrGvuJvWLlc0QAoC2qV3cvkgrQdGDKZvZEv0iaARRWQ2UQ8XwOMkrVSSrzS70jZmCp68vJp1Y28eW05eEg02g/640?wx_fmt=png[/img][/align][align=center][color=#3daad6]活动时间：[/color][b]2022年4月28日20：00正式开始！[/b][/align][b]# 嘉宾[/b][size=17px][b] [/b][/size][size=14px][back=#000000][b] 王毅[/b][/back][/size][back=#000000][b][size=14px][back=#010000]工程师 [/back][/size][/b][/back][img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_jpg/HicNrGvuJvWLlc0QAoC2qV3cvkgrQdGDKuAOic9dNIFDNXQvuZW7wxbmsWHh9Y4evzlNeLRjP29I9jVKXaVMT46g/640?wx_fmt=jpeg[/img][font=&]长期从事色谱及有机质谱分析，具有丰富的色谱质谱实际应用经验。擅长有机质谱碎裂规律总结及质谱碎裂机理的分析，尤其是利用有机质谱裂解机理实现对异构体化合物的区分鉴别、合成化合物的结构确证、未知化合物的结构解析、有机质谱对催化反应机理的证明、色谱质谱分析方法开发、有机质谱图解析培训。曾两次组织系统性的有机质谱解析课程培训，参加学员超过百人，课程受到学员们的一致好评。多次受邀在其他平台进行有机质谱解析的课程讲解，有机质谱解析培训受到质谱学家王光辉老师的推荐。曾协助中国科学院上海有机化学研究所、浙江大学、中国农业科学院、中国农业大学、北京中医药大学等高校或研究所对有机质谱数据进行分析，相关成果在高水平期刊上得以发表，迄今在《Analyst》《Molecules》《Chinese J. Anal. Chem.》《质谱学报》《高等学校化学学报》等期刊上发表质谱学术论文15篇。[/font][align=center][/align][img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/aVPA1dDVY3rsvXkVsP6GVJ2M4hNiaibic1wkTCmiaW6h0PmiaIqata6mRAg0E6nP0h2ezVBQUP12M6ctqj9ynIq1Fmw/640?wx_fmt=png[/img]活动福利[color=#3e3e3e] 本次活动将[/color][color=#3daad6]免费[/color][color=#3e3e3e]送出[/color][color=#3daad6]喜马拉雅季卡会员[/color][color=#3e3e3e]作为奖品，填写问卷或者参与当天活动均有机会获得！[/color][color=#3daad6]数量有限，先到先得！[/color][align=center][img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_jpg/HicNrGvuJvWLlc0QAoC2qV3cvkgrQdGDKl7j2jEMu9iajYj6CGLS22IUeKHg0ZPWTCDhdib3JwzYXEiao7hnwutRsQ/640?wx_fmt=jpeg[/img][/align][color=#3daad6]市场价：73元[/color] 获得此奖品的同学，可以享受以下服务：[img]https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/HicNrGvuJvWLlc0QAoC2qV3cvkgrQdGDK1UbbZ3omiaIkPASbTtmBicWFuDHJJ8GXYJOFRNptlVeEkX0swYWGz6cA/640?wx_fmt=png[/img] 本次答疑直播干货满满、奖品超值，赶紧参与提交你想问的问题，4月28日，我们不见不散哦！
[align=center][b][font=宋体][size=14px]质谱定性：结构式和免费解析工具[/size][/font][/b][/align][font=宋体]在实际分析中，有机化合物的主要组成元素为[/font]CNOSP[font=宋体]且化合价≥[/font]2[font=宋体]，原子之间连接形式丰富多样，如何确定原子之间的连接方式，解析化合物结构并得出结构式是鉴定化合物的关键。分析化学通过光谱、波谱和质谱等多种技术手段确定化合物结构。对于质谱技术，在《质谱定性：分子式及免费资源和工具》我们谈到质谱通过测量分子量定性化合物，高分辨高精度质谱数据在一定条件下可以计算出分子式，对于结构式，质谱技术通过把化合物分子“碎片化”并测量这些碎片化的质量来鉴定物质或者推测化合物结构，[b]这部分我们讨论质谱定性解析结构式和免费的解析工具，主要介绍免费的网络资源[/b]。[/font][font=宋体]限于篇幅，本文集中讨论论坛大家的关注热点，主要内容如下：[/font]1[font=宋体]讨论大家比较关注的[b]小分子[/b]，质谱技术主要指的是[/font]ESI/APCI[font=宋体]（常规大气压电离）—[/font]MS/MS[font=宋体]（串联质谱）技术；[/font]2[font=宋体]讨论多级谱图（主[b]要是二级谱图[/b]，但不讨论二级技术如：[/font]CID[font=宋体]、[/font]HCD[font=宋体]、[/font]ECD[font=宋体]）的解析及未知物质的鉴定，对信号的处理及数据统计分析不讨论。[/font][b]1[font=宋体]多级质谱技术鉴定化合物策略[/font][/b][font=宋体]质谱主要测定的是质量，如果只能得到化合物的质量（即质谱图上的分子离子峰），在没有其它数据作支撑的情况下，即使提高测量的精度，符合分子量要求的化合物数量随着分子量增加急剧增加；现代化学认为化合物的分子结构（化学键和功能团）决定了化合物的性质和用途，对同一名义分子量化合物知道元素组成仅仅是完成最粗浅的测量（以上内容有兴趣了解的请参阅论坛帖子：质谱定性：分子式及免费资源和工具[/font][url]https://bbs.instrument.com.cn/topic/7560694[/url][font=宋体]）。因此，用质谱技术来分析化合物结构比测量分子量意义更加重大。[/font][font=宋体]多亏了在质谱分析中，大家发现给化合物能量，会解离化合物结构，产生“碎片”。这些碎片信息和化合物结构直接相关。不同的碎片质量和信号强度组成了质[b][color=red]“谱”[/color][/b]，质谱和光谱一样成了化合物的[color=red]指纹[/color]，具有结构特异性，解析指纹进一步通过指纹鉴定化合物（[/font]CompoundIdentification[font=宋体]）成为质谱学的基本研究方向。[/font][font=宋体]质谱产生“碎片”能力为质谱的多级质谱能力，现代串联质谱不论是时间串联和空间串联常用的技术为[/font]MS/MS(MS2[font=宋体]二级质谱图[/font])[font=宋体]，对于三级以上谱图因为仪器功能或者操作难度使用不普遍。电子攻击源（[/font]EI[font=宋体]源）质谱一次给的能量要有些“富余”，除了分子离子峰，也会产生丰富的碎片信息，有的时候有些种类化合物甚至找不到分子离子峰。对于带碎片的质谱图（二级及以上质谱图），化合物的鉴定有以下策略：（[/font]1[font=宋体]）基于碎片产生的规则解析。在对一系列纯的化合物进行质谱分析后，发现相似的化合物有相似的碎片模式，通过总结发现了一些规律：奇偶电子、[/font]N[font=宋体]律、丢失重排还有不同化学功能团的碎裂等（这部分可以温习大学分析化学质谱课程），对于有经验的人员加上一定的目标化合物背景信息，可以对碎片进行比较好的解析，目前有些商品化软件如[/font][i]Mass Frontier[/i][font=宋体]才取类似基于碎片产生机制的软件专家系统辅助解析质谱。（[/font]2[font=宋体]）基于数据库搜索。基于碎片产生的规则，需要很强的经验，工作量挺大的，而且犯错的可能性挺大，如果我有足够数量的化合物，而且化合物纯度足够，我把这些化合物都预先在固定的仪器种类固定的实验条件下实验获得谱图并整理成数据库，在后续质谱实验拿获得质谱图与前期数据库进行比对来鉴定确认化合物。数据库搜索比对的算法（即打分方法）最经典的是把谱图向量化，计算两个向量化谱图的[/font]cos[font=宋体]值（参见论坛帖子：二极管阵列检测器与峰纯度分析[/font][url]https://bbs.instrument.com.cn/topic/4302951[/url][font=宋体]），分值越高，可能性越高。打分算法是质谱解析软件的重要组成，它关系着计算时间[/font]FDR[font=宋体]，这些年新的打分算法发展很快。因为我不懂这里就不讨论了。目前大家使用最多的数据库有[/font]NIST[font=宋体]和[/font]Wiley[font=宋体]的[/font]EI[font=宋体]电离源数据库用于匹配[/font]GCMS[font=宋体]实验数据搜索，[/font]NIST[font=宋体]最新发布的[/font]2020[font=宋体]数据库包含了[/font]350643[font=宋体]张[/font]EI[font=宋体]谱图，有意思的是[/font]NIST[font=宋体]谱图收费，而搜库软件免费。对[/font]MS/MS[font=宋体]数据库，[/font]NIST[font=宋体]收录了[/font]652000[font=宋体]张谱图（很多事多肽），别的收录[/font]MS/MS[font=宋体]谱图库信息资源有[/font]MassBank[font=宋体],[/font]METLIN[font=宋体],[/font] Madison[font=宋体],[/font]MetabolomicsConsortium Database (MMCD)[font=宋体]等。[/font][b][font=宋体]搜库是质谱鉴定化合物最便捷最有效的方式，但是这种策略在[/font]MS/MS[font=宋体]分析小分子却遇到了极大困难。[/font][/b][font=宋体]首先，高质量的可重复的谱图不容易获得，其主要原因是质谱仪器多样。以[/font]EI[font=宋体]源为代表的[/font]GC-MS[font=宋体]技术电离能量固定，质量分析器绝大部分是四级杆（近些年也有[/font]QQQ[font=宋体]，[/font]QTOF,Orbitrap[font=宋体]的高端[/font]GCMS[font=宋体]），谱图在不同实验室的可重复性较好，与之对应的是[/font]ESI/APCI[font=宋体]——[/font]MS/MS[font=宋体]技术质量分析器种类丰富，串联质谱的不同质量分析器组合更是眼花缭乱，产生[/font]MS/MS[font=宋体]碎片技术也是种类繁多，即使是同一种[/font]CID[font=宋体]碎裂技术，各家仪器公司设计的碰撞池和不同的碰撞能量标定也千差万别，[/font]CID[font=宋体]在不同质量分析器产生的碎片差别也会很大（如在[/font]QQQ[font=宋体]和离子阱同一化合物碎片离子差别较大；其次，相比蛋白质组学主要分析对象——多肽，小分子的结构预测和谱图预测非常困难，因为可以死磕蛋白质的基本结构肽键及氨基酸残基，加上有基因组学对蛋白质序列有很强的指导标定，所以搜库对以[/font]MS/MS[font=宋体]技术为基础的蛋白质组学也是很方便实用的，小分子结构千变万化，也没有什么资料可以预判结构，在没有相关背景信息时候，解析谱图，鉴定小分子基本上是连蒙带猜，可信度自己把握。[/font][b][font=宋体]解决以上问题的方案是把搜库和结构解析结合发展信息学工具[/font][/b][font=宋体]。扩大搜索化合物数据库（[color=red]不是质谱图库[/color]）范围，如[/font]PubChem[font=宋体]，[/font]KEGG[font=宋体]等数据库，检索的主要参数是分子量；对于结构解析，化学信息学发展让直接计算（[/font]in silico[font=宋体]）碎片成为可能，通过计算的碎片与实际质谱数据匹配打分，解析鉴定化合物。在处理计算化合物[/font]MS/MS[font=宋体]碎片过程中，不同研究者和课题组有不同的处理方案，有的采用人工智能和机器学习方案对既有数据进行挖掘总结，形成算法解析匹配碎片离子，有的对既有化合物结构采用图论的方式，结合化学键能理论，把化合物分解成理论上碎片，有的从特征中性丢失片段（[/font]MS/MS[font=宋体]中性丢失信息比[/font]EI[font=宋体]质谱丰富）、大碎片产生模式等把小分子进行分类，预测谱图，交叉验证。[b]在这些信息学工具发展过程中，提出了碎片树（[/b][/font][b]Fragmentation trees[font=宋体]，不同于基于多级质谱的碎片树）力求对所有碎片精心解析，同时也要发展具有特色的打分系统，提高鉴定成功率。[/font][/b][font=宋体]化学信息学在[/font]MS/MS[font=宋体]解析方面发展多年，有多重商业或者免费的软件，基于使用方便，我向大家推荐几款基于[/font]WEB[font=宋体]的信息学工具。[/font]2[b][font=宋体]基于[/font]WEB[font=宋体]的免费[/font]MS/MS[font=宋体]分析工具[/font][/b]2.1[size=14px] MetFrg [/size][font=宋体]发布于[/font]2010[font=宋体]年，是第一个结合搜库和串联质谱碎片预测技术鉴定小分子的软件，有[/font]WEB[font=宋体]版本和程序版本，[/font]WEB[font=宋体]网页地址：[/font][url=https://msbi.ipb-halle.de/MetFragBeta/%20%EF%BC%8C2016]https://msbi.ipb-halle.de/MetFragBeta/[font=宋体]，[/font]2016[/url][font=宋体]更新了新的版本。我们以诺氟沙星和诺美沙星（二者[/font]MS/MS[font=宋体]谱图见图[/font]1[font=宋体]）为例简单介绍使用过程，主要界面见图[/font]2[font=宋体]，第一部分是化合物数据库搜索（[/font][color=#00B050]Database Setting[/color][font=宋体]），一般建议选择比较大的数据库如[/font]Pubchem[font=宋体]，增加搜索范围，也可以搜索自己比较熟悉的数据库，如[/font]LipidMaps[font=宋体]，减少搜索范围，数据库越大，搜索计算时间越长。在[/font][color=#00B050]Parent Ion[/color][font=宋体]输入一级质谱分子量[/font]([font=宋体]诺氟沙星[/font]320.140429)[font=宋体]，选择加和离子形式[/font]([M+H]+)[font=宋体]，点击[/font][color=#00B050]Calculate[/color],[font=宋体]页面会自动就算[/font]Neutral Mass[font=宋体]，输入质量准确度（默认为[/font]5ppm[font=宋体]，建议不要低于[/font]10ppm[font=宋体]），点击[/font][color=#00B050]Retrieve Candidates[/color],[font=宋体]后台搜索选择的数据库，如果只有[/font]1[font=宋体]个选项，化学式[/font]Formula[font=宋体]会出现，在我们例子中共有[/font]9795[font=宋体]个候选化合物。点击[/font]DownloadCandiate[font=宋体]可以下载结果。[/font][img=,690,279]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291101157581_2325_2265735_3.jpg!w690x279.jpg[/img][font=宋体]图[/font]1. [font=宋体]诺氟沙星和诺美沙星[/font]MS/MSZ[font=宋体]质谱图。仪器[/font]LTQ-Orbitrap XL [font=宋体]，[/font]ESI[font=宋体]电离源，[/font]HCD[font=宋体]碎裂模式。[/font][font=宋体]完成第一部分后，进入网页的第二部分碎片匹配注释（[/font]FragmentationSetting & Processing[font=宋体]）。左边的搜索条件同第一部分，其中[/font][color=#00b050]Tree Depth[/color][font=宋体]是碎片树（[/font]Fragmentation trees[font=宋体]）的层级，默认[/font]2[font=宋体]，碎片离子较少可以选择[/font]1[font=宋体]。右边输入[/font][color=#00b050]MS/MS Peak list[/color][font=宋体]，最多可以输入[/font]40[font=宋体]个碎片，一般选择[/font]S/N[font=宋体]大于[/font]3[font=宋体]的峰（诺氟沙星输入[/font]6[font=宋体]个碎片峰，其中一个为分子离子峰），可以[b]把[/b][/font][b]excel[font=宋体]数据直接复制进框[/font][/b][font=宋体]，点击[/font][color=#00b050]Process Candidates[/color][font=宋体]。后台开始计算，第一部分候选结果越多计算时间越久，计算完毕，显示结果，共匹配到[/font]9469[font=&]个候选化合物。下拉[/font]WEB[font=&]页面，显示结果（图[/font]3[font=&]），结构式，命名等信息列表，其中倒数第二列[/font][color=#00b050]FinalScore[/color][font=宋体]显示打分情况，最高分为[/font]1[font=宋体]，分数越高，可信度越高。在最后一列[/font]Details[font=宋体]点击[/font]Fragments[font=宋体]，会弹出窗口显示碎片峰的归属注释，按照分子量从小到大排列，断裂片段显示为绿色（图[/font]4[font=&]）。[/font][font=&][img=,690,431]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291103044054_6384_2265735_3.jpg!w690x431.jpg[/img][/font][font=宋体]图[/font]2 MetFrg WEB[font=宋体]使用界面（已经输入诺氟沙星质谱结果数据）[/font][font=宋体][img=,690,431]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291104030596_917_2265735_3.jpg!w690x431.jpg[/img][/font][font=宋体][font=宋体]图[/font]3 MetFrg WEB[font=宋体]诺氟沙星质谱图计算结果[/font][/font][font=宋体][img=,690,431]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291104312661_8999_2265735_3.jpg!w690x431.jpg[/img][/font][font=宋体][font=宋体]图[/font]4 MetFrg WEB [font=宋体]质谱图碎片峰注释结果[/font][/font][font=宋体][font=宋体]从输出结果显示测定分子是第[/font]29[font=宋体]个候选化合物，打分也很高，说明[/font]MetFrg[font=宋体]工具需要进一步优化。在诺美沙星的分析中，我们设定相同的分析参数，但是[/font]MS/MS[font=&]碎片更丰富，[/font]9[font=&]个碎片峰，候选化合物从[/font]8875[font=&]减少到[/font]8707[font=&]（图[/font]5A[font=&]），但是目标候选化合物在第[/font]16[font=&]位，所以提高碎片的种类对鉴定结果具有重要意义。[/font][/font][font=宋体][img=,690,852]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291106411933_5743_2265735_3.jpg!w690x852.jpg[/img][/font][font=宋体][font=宋体]图[/font]5 [font=宋体]诺美沙星[/font]MetFrg分析结果[/font][font=宋体][/font][font=宋体]2.2[size=14px]CFM-ID[/size][font=宋体]相比[/font]MetFrg,CFM[font=宋体]对[/font]MS/MS[font=宋体]谱图数据要求更高，要[b]求提供低中高碎裂电压的[/b][/font][b]MS/MS[font=宋体]谱图[/font][/b][font=&]。[/font]WEB[font=宋体]地址为[/font][url]http://cfmid.wishartlab.com/[/url][font=宋体]，目前版本为[/font]3.0([font=宋体]新版本强化了对脂类的谱图计算和鉴定[/font])[font=宋体]，主要功能分三大部分（图[/font]6[font=宋体]）[/font]:[color=#00b050] Spectra Prediction[/color]([font=&]谱图预测[/font])[font=宋体]、[/font][color=#00b050]PeakAssignment[/color][font=宋体]（峰注释）和[/font][color=#00b050]CompoundIdentification[/color][font=宋体]（化合物鉴定），点击页面功能区[color=#00b050]☆[/color][/font][color=#00b050]Utilities[/color][font=宋体]，可以到达各个功能应用模块。[/font]CFM-ID[font=宋体]比[/font]MetFrg[font=宋体]在质谱图处理更加专业，区分[/font]EI[font=宋体]和[/font]ESI[font=宋体]源，对[/font]MS/MS[font=宋体]质谱图获得、模拟计算和比对更加侧重实际实验，在物质鉴定模块，它所应用的数据库如[/font]HDMB[font=宋体]、[/font]NIST[font=宋体]、[/font]DrugBank[font=宋体]等都是质谱图数据库，做的有“图”可依，鉴定过程更加接近商业化[/font]GCMS[font=宋体]过程，对于有准确度要求，更专业的用户，我更加推荐[/font]CFM-ID[font=宋体]。[/font][/font][font=宋体][/font][img=,690,358]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291110415660_6534_2265735_3.jpg!w690x358.jpg[/img][font=宋体]图[/font]6 CFM-ID WEB[font=宋体]界面。[/font][font=宋体][size=14px]以双硬脂酸磷脂酰乙醇胺（[/size][/font][font='Calibri',sans-serif][size=14px]DSPE[/size][/font][size=14px]）为例，获取不同碎裂能量谱图后计算，对碎片峰注释，结果如图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7[/size][/font][size=14px]，输入不同碎裂能量的[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]MS/MS[/size][/font][size=14px]碎片峰（图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7A[/size][/font][size=14px]），点击运行后，输出重新绘制的[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]MS/MS[/size][/font][size=14px]图，点击峰，弹窗会碎片峰的结构信息（图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7B[/size][/font][size=14px]）[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px],[/size][/font][size=14px]后续会有碎片峰（质量从小到大）的列表代码信息及打分（图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7C[/size][/font][size=14px]），最后是代码所指的结构式列表（图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7D[/size][/font][size=14px]）。如果把图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7A[/size][/font][size=14px]检索的质量误差缩小，检索的碎片匹配会更少，打分越高（对比图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7C[/size][/font][size=14px]和图[/size][font='Calibri',sans-serif][size=14px]7E[/size][/font][size=14px]）。[/size][img=,690,403]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291111211908_5136_2265735_3.jpg!w690x403.jpg[/img][font=宋体]图[/font]7 CFM-ID MS/MS[font=宋体]谱图注释功能。[/font]2.3 [font=宋体]质量测定的精度提高了搜索与计算碎片的匹配度，[/font][size=14px]CSI: FingerID[/size][font=宋体]对质量精度要求更高，与前两个免费资源相比，在输入分子离子峰时，还要求输入所有同位素峰的质量即相对强度（图[/font]8[font=宋体]红框部分），从而更加精确的计算分子式（[/font]fourmula[font=宋体]），力求做到元素精确。[/font]CSI: FingerID[font=宋体]的[/font]WEB[font=宋体]网址为[/font][url]https://www.csi-fingerid.uni-jena.de/[/url][font=宋体]，界面逻辑性很好数据输入，分子式到结构式，值得一提的是[/font]CSI: FingerID[font=宋体]支持多级质谱（[/font]MS[sup]n[/sup][font=宋体]）输入（图[/font]8[font=宋体]绿框部分），算法是以[/font]QTOF[font=宋体]的数据为基本数据采用机器学习获得，鉴定比较精准，但是有局限性。值得一提的是软件版本是[/font]SIRIUS,[font=宋体]功能非常强大，提供多种模式计算分子式，保证了结构鉴定的准确度。[/font][img=,690,365]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007291112077367_4334_2265735_3.jpg!w690x365.jpg[/img][font=宋体]图[/font]8 CSI: FingerID WEB[font=宋体]界面。[/font]3[font=宋体]总结[/font] [font=宋体]（[/font]1[font=宋体]）分子式是结构式的前提，在使用信息学工具时候，分子离子峰的质量峰是第一要输入的参数，要求质谱数据高准确度高分辨率（详细请参阅论坛帖子：质谱定性：分子式及免费资源和工具[/font][url]https://bbs.instrument.com.cn/topic/7560694[/url][font=宋体]）。[/font][font=宋体]（[/font]2[font=宋体]）[/font][size=14px]MetFrg[/size][font=宋体]使用简便，数据库全，功能多，界面友好（我的最爱），鉴定准确度略低；[/font][size=14px]CFM-ID [/size][font=&]功能强大，[/font]EI[font=宋体]和[/font]ESI-MS/MS[font=宋体]谱图都可以运行，专业性强，在使用中对[/font]QTOF[font=宋体]数据有一定的偏好性，因为没有软件版，在使用中尤其是是有质谱图数据库检测常会抽风；[/font][size=14px]CSI: FingerID[/size][font=&]同样偏向[/font]QTOF[font=宋体]数据，页面设计逻辑性好，只奔着未知物鉴定的终极方向而去，功能稍显单一。[/font][font=宋体]（[/font]3[font=宋体]）不怕麻烦最好安装软件版本，[/font]WEB[font=宋体]因为浏览器和网络的原因，不是很稳定。[/font][font=宋体]（[/font]4[font=宋体]）条件允许最好自己建立数据库，三个都支持自建数据库，搜索效率更高，建立的数据库也是一笔宝贵资源。[/font][b][font=宋体]（[/font]5[font=宋体]）对立体异构的化合物，信息学工具目前没有好的解决方案，因为质谱鉴定立体异构体成功实验不够多（偶尔有成功的都发文章了），解析理论也不够充分。[/font][font=宋体]写在最后[/font]:[/b][font=宋体]疫情期间，有疫情发论文之争，我们测出来的病毒核酸序列是按照指定格式上传到国外生物信息学网站，也有美国对我们技术封锁新闻，华为的芯片设计软件是国外公司的，哈工大竟然被禁止使用[/font]MATLAB[font=宋体]……；个人，因为不能去公司上班，通过通信工具和同事交流并辅助“鉴定物质”，在使用国外数据库时，尤其是[/font]Pubmed[font=宋体]突然想到如果老美禁止我们登录他们的网站怎么办（奥巴马时期，因为美国政府停摆，有些公共服务网站服务器停摆了一周）。遂写了质谱定性系列帖子，期望可以引起对实验技术人员对数据整理及相关信息学研究的重视。[/font][font=宋体]帖子的内容大部分来自和同事的问答，限于篇幅，也为了增加可读性，删减了大量内容，在四月中旬上班补充了谱图，质谱定性[/font]-[font=宋体]分子式及免费资源在[/font]5[font=宋体]月底完成，剩下的准备[/font]10[font=宋体]月底之前完成，[/font]6[font=宋体]月底看到回帖有网友想看到谱图解析及鉴定的后续，在努力赶工完成疫情加班落下的工作间隙，匆忙在[/font]7[font=宋体]月份尾巴把第二部分写完。[/font][font=宋体][size=14px]大数据时代，数据就是知识，数据就是财富，我们有丰富的物质基础，期望我们有自己的数据库，有自己的信息学工具。[/size][/font]
想请教一下大家在做有机质谱解析的时候需要注意一些问题，以及有机质谱解析用三重四级杆怎样做比较合理，有什么样的问题需要注意？最近一直在看这方面的书籍但是没有过实际经验，因此想请教一下各位前辈，也好学习一下
有机质谱谱图解析专题培训班开课啦！详情请见：http://www.instrument.com.cn/training/training_info.asp?TRI_No=100854http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/09/201209110935_390110_2501482_3.gif 您是有机质谱的使用者吗？您是否因为有机化合物种类繁多，繁杂的裂解规律不容易记忆，又缺乏解析的思路和方法，而面对谱图常常无从下手呢？那么，我们欢迎您报名参加我们的有机质谱谱图解析培训班！http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/09/201209110940_390111_2501482_3.gif 在这里，您可以享受专业的质谱分析研究高职人员精辟的知识讲解； 在这里，您可以再次全面系统的学习谱图解析的基础知识和基本规律； 在这里，您可以和专家探讨常见的问题； 在这里，您可以专享网上社区，免费下载资料，参加讲师的答疑活动； 在这里，。。。 您还在等什么？快带着问题来参加我们的学习班吧！ 费用：3000元 开班地点：北京 开班时间：2012年12月10日 培训天数：5天http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/09/201209110942_390112_2501482_3.gif专家团队王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员，中国最早从事质谱研究的专家之一，参与了国内多项质谱仪器的研发工作，有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。著有《有机质谱解析》等专著。苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究，参与了国内质谱仪器的研发工作，组织过多种质谱应用技术培训，有丰富的教学经验。有《色谱-质谱联用技术及应用》等专著。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/09/201209110949_390118_2501482_3.gif课程大纲http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/09/201209111100_390143_1632253_3.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/09/201209110958_390125_2501482_3.gif
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