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质谱数据解析方法

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质谱数据解析方法相关的资讯

  • Open-pFind助力蛋白质组学分析 显著提高质谱数据解析率
    p style=" line-height: 1.5em " & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 中国科学院计算技术研究所研究员贺思敏及其研究团队设计和实现了新一代开放式搜索算法Open-pFind,可提高质谱数据解析的数量与质量,有望成为蛋白质组学日常数据分析的主力工具。相关成果10月9日在线发表于《自然—生物技术》。 br/ /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201810/uepic/419b4d61-469e-48e0-baf9-3ef492f7ff8b.jpg" title=" 2018-10-12_165404.png" alt=" 2018-10-12_165404.png" / /p p style=" line-height: 1.5em "   质谱数据的低解析率直接影响着肽段和蛋白质鉴定数目和鉴定精度的提高。质谱数据解析率一直较低,是由于质谱数据中通常有大量存在意外修饰或发生意外酶切的肽段,传统的限定式搜索因搜索空间有限,通常无法对上述肽段进行有效检索。 /p p style=" line-height: 1.5em "   新一代开放式搜索引擎Open-pFind采用基于序列标签索引的开放式搜索流程,快速扫描蛋白质数据库并对部分高质量谱图进行鉴定。在此过程中,意外修饰、突变、半特异及非特异性酶切肽段均在引擎的搜索空间内。Open-pFind通过基于支持向量机的肽谱匹配重打分算法,挖掘数据中的特征信息,并据此进行第二次精细搜索。同时,Open-pFind集成了前端数据处理的pParse模块,对肽段母离子进行校准,并有效提取混合谱图,进一步提升了谱图解析率。 /p p style=" line-height: 1.5em "   在四组典型质谱数据集上,Open-pFind解析率均达到了70%~85%,比同类软件鉴定结果多出50.5%~117.0%。对于高质量的串联质谱图,Open-pFind甚至基本实现了完全解析。在搜索空间是常规引擎5个量级的基础上,Open-pFind的速度仍然是常规引擎的2~3倍,是同类开放式引擎的数十倍甚至上百倍。在超大规模人类蛋白质组数据集上,Open-pFind报告了超过12000种蛋白,且准确度远远超过以往常规分析结果。 /p p    /p p br/ /p
  • 双特异性抗体解析新方法:离子迁移质谱结合碰撞诱导去折叠
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章,Ion Mobility-Mass Spectrometry and Collision-Induced Unfolding of Designed Bispecific Antibody Therapeutics1,文章的通讯作者是密歇根大学的Brandon副教授。  双特异性抗体(bispecific antibodies, bsAbs)是一类重要的新兴疗法,能够同时靶向两种不同的抗原,已被开发作为对某些单克隆抗体疗效有限疾病的治疗手段。尽管bsAbs具有独特的优势,但它的结构较为复杂,需要特殊的制备工艺,“knobs-into-holes”(KiH)是其中一种可以用于制备bsAbs的技术,这种技术通过将knob链CH3结构域表面的特定氨基酸突变为较大氨基酸,将hole链上的突变为较小氨基酸,从而实现“knobs-into-holes”的配对形式,提高不同轻重链在配对时的正确配对率,产生正确的bsAbs。然而,由于抗体治疗药物分子量较大,通常比传统的小分子药物表现出更大的结构复杂性和异质性,对KiH bsAb 高级结构的完整表征对定义bsAb的结构功能关系,以及确保最终治疗的稳定性、有效性和安全性都至关重要。目前已开发的分析方法有很多,但是普遍存在样品消耗量大、数据采集和解析时间较长等缺点。近年来,非变性离子迁移质谱(ion mobility-mass spectrometry, IM-MS)和碰撞诱导去折叠(collision-induced unfolding,CIU)逐渐被证实是用于分析单克隆抗体高级结构的有效方法,能够从存在结构异质性和杂质的几微克样品中表征单抗治疗药物的高级结构。IM可以根据气相蛋白离子的电荷和旋转平均碰撞截面(collision cross sections,CCSs)在毫秒时间尺度上对蛋白进行分离。当与质谱耦合时,可以很容易地将质荷比相同但CCS不同的离子区分开来,而CIU可以使IM-MS同步提供蛋白质结构和构象稳定性信息。CIU根据二硫键、糖基化水平、结构域交换特性等信息来区分差异。  在这篇文章中,作者描述了定量CIU在bsAbs中的首次应用,扩展了非变性IM-MS和CIU的能力,用于稳定表征KiH bsAb及其亲本knob和hole同型二聚体单抗的高级结构。  图1 Native、未修饰的knob(蓝色)和hole(橙色)同型二聚体,以及KiH bsAb异型二聚体(绿色)的CIU实验。(A)24+电荷态(左)及其相应重复RMSD基线(右)的平均CIU指纹图谱(n=3)。所有的指纹图谱都显示了白色虚线框所示的三个主要特征。在(B) 5 V、(C) 65 V、(D) 110 V时的标准化TWCCSN2分布。在较低的激活电位下,所有抗体均具有相似的CCS,在较高的加速电位下则存在显著差异。(E)两两的RMSD分析显示,与重复的RMSD基线(虚线)相比,抗体之间的整体高级结构差异。(F)CIU50分析说明了KiH bsAb模型的稳定性如何保持在knob和hole的同型二聚体之间。  如图1所示,bsAb的稳定性似乎与本文研究的KiH模型的两个亲本同型二聚体单克隆抗体相关。在电压为65V时,KiH bsAb的TWCCSN2分布与亲本knob同型二聚体单抗的分布相似 而在110V时,则与亲本hole同型二聚体单抗的分布相似。并且KiH bsAb的稳定性介于两种亲本同型二聚体单抗的稳定性之间。与指纹图谱中记录的第一次CIU转换相对应的是CIU50-1值,第二次的则是CIU50-2值,从3组样本的数据分析推测,CIU50-1和CIU50-2很可能代表了KiH bsAb和mAb结构中不同结构域的局部稳定性。  图2 knob和hole的半体CIU数据。(A)16+电荷态的平均CIU指纹图谱(n=3).(B)两两RMSD分析显示,半体之间的高级结构存在显著差异。(C)CIU50分析显示,蛋白质稳定性存在显著差异。  为了更好地展示KiH bsAb不同结构域的CIU特征,作者记录了同型二聚体单抗IM-MS光谱中16+电荷态的knob和hole半体的CIU数据。从图2A的指纹图谱可以看出,每种结构都包含4种主要的CIU特征,但是图2B的RMSD分析显示两种半体的高级结构之间存在显著差异。CIU50分析进一步表明,在观察到的两次展开过渡中,knob半体明显比hole半体更稳定。作者推测造成这种CIU主要差距的原因可能是Fab结构域的差异。  图3 Fab和Fc片段的CIU数据。(A)13+电荷态的平均CIU指纹图谱(n=3).(B)两两RMSD分析显示,knob和hole的Fab片段之间存在显著差异。(C)CIU50分析显示,不同片段之间稳定性存在显著差异。  为了进一步将CIU特征联系到KiH bsAb的结构域当中,作者对木瓜蛋白酶消化后产生的Fab和Fc片段进行了CIU分析。从图3A可以看出,knob和hole的Fab片段都具有3种CIU特征,但是嵌合的Fc片段则具有4种CIU特征。尽管knob和hole的Fab片段具有相似的CIU指纹图谱,但是RMSD分析显示它们之间的高级结构仍然存在较大差异,并且knob的Fab片段稳定性明显高于hole的。至于Fc片段的稳定性则远高于两种Fab片段,可能的原因是重链CH3结构域的强非共价作用以及knobs-into-holes配对的影响。  图4 去糖基化后的knob、hole同型二聚体和KiH bsAb异型二聚体24+离子(n=3)。(A)比较对照组和去糖基化抗体的RMSD分析显示,高级结构有显著差异。CIU50-1(B)和CIU50-2(C)分析显示抗体去糖基化后表现出显著的不稳定性。(D)对照组和去糖基化抗体之间的CIU50值差异图。  先前的研究已经证明,CIU对不同水平的单抗糖基化很敏感,其中去糖基化会导致单抗高级结构的不稳定。作者利用高分辨率非变性轨道阱质谱分辨添加PNGaseF前后同型二聚体mAb和KiH bsAb糖型的变化。实验结果显示,KiH bsAb表现出高度糖异质性,包含至少12种不同的糖型。这很可能归因于组装的KiH bsAb中每个独立的knob和hole重链上存在独特的糖基化,进一步增加了其复杂性。  总而言之,这篇文章展示了IM-MS结合CIU用于建立KiH bsAb及其亲本同型二聚体之间高级结构联系的能力。单独的CCS不足以解决此研究中抗体之间细微的高级结构差异。相比之下,CIU指纹图谱则可以分辨和区分每一个等截面的抗体。这一解释bsAb CIU细节的能力,加上对KiH bsAb稳定性的更深入理解,有可能提供支持KiH bsAb发现和发展的关键信息。  撰稿:梁梓欣  编辑:李惠琳  文章引用:Ion Mobility-Mass Spectrometry and Collision-Induced Unfolding of Designed Bispecific Antibody Therapeutics  李惠琳课题组网址www.x-mol.com/groups/li_huilin  参考文献  Villafuerte-Vega, R. C., Li, H. W., Slaney, T. R., Chennamsetty, N., Chen, G., Tao, L., & Ruotolo, B. T. (2023). Ion Mobility-Mass Spectrometry and Collision-Induced Unfolding of Designed Bispecific Antibody Therapeutics. Analytical Chemistry.
  • 叶明亮团队开发N-糖肽质谱谱图解析新软件 解析率提升31%
    近日,大连化物所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)叶明亮研究员团队开发了一款具有高灵敏度的N-糖肽质谱谱图解析新软件——Glyco-Decipher。该软件可实现在解析谱图的过程中不依赖糖库,利用不同糖肽的同一肽段骨架具有相似碎裂规律的特点,发展出基于“模式识别”的肽段序列鉴定新方法,实现谱图拓展,从而提高完整糖肽的鉴定灵敏度,并且可发现未知的糖链及糖链修饰。Glyco-Decipher为深度解析位点特异性糖型,揭示糖基化修饰的微观不均一性,以及研究糖生物学功能等提供了新工具。  蛋白质糖基化与疾病的发生发展密切相关,临床上使用的大多数肿瘤标志物是糖基化蛋白质。在组学层次上进行位点特异性糖型的分析对发现新型疾病标志物,提高基于蛋白质糖基化的精准医学研究水平等具有重要作用。 N-糖肽质谱谱图高度复杂,谱图解析率低,且常规N-糖肽解析软件依赖糖库,无法实现未知糖链及修饰糖的鉴定。为解决上述问题,本工作开发了非糖库依赖的肽段序列鉴定方法,实现了未知糖链肽段及其上可能带有的修饰基团的鉴定。为解决N-糖肽质谱谱图解析率低的问题,团队系统研究了糖肽的碎裂规律,发现糖链的种类、组成、母离子价态等对肽段骨架的碎裂模式没有显著的影响,建立了肽段序列相同的完整糖肽谱图之间的联系,发展了基于“模式识别”的肽段序列鉴定策略,实现了完整糖肽的谱图拓展,在原有基础上将完整糖肽的解析率提升了31%。  本工作还以蛋白Prosaposin为例,展示了蛋白Prosaposin在老鼠的五个不同的组织中糖基化差异,进一步揭示了该蛋白上各个位点特异性糖型的丰度分布,展示了Glyco-Decipher在蛋白糖基化分析领域的应用潜力。通过对同一个N-糖肽质谱数据进行对比分析,发现Glyco-Decipher的谱图解析效率比其它软件提升了34-179%。该软件具有友好的用户界面和较好的定量比较功能,学术界可以免费使用(软件可从github下载)。  叶明亮团队长期致力于位点特异性糖型分析方法的发展,包括糖肽的富集方法和谱图的解析方法:在O-GlcNAc糖肽的富集方面发展了酶促标记结合化学氧化法(Anal. Chem., 2021)、可逆酶促化学标记法(Angew. Chem. Int.Edit., 2022)等方法;在O-GalNac糖肽的富集方面发展了酶解辅助的亲水作用色谱法(Anal. Chem., 2017)、酶化学方法(Anal. Chem., 2018)、Ti-IMAC富集方法(Anal. Chem. 2021)等;在N糖肽的富集方面发展了适合大样本分析的自动化富集方法(Anal. Chem., 2021);在O-GalNac糖肽的谱图解析方面,发展了O-search检索策略(Anal. Chem., 2019),有效地减小了检索空间,提高了鉴定灵敏度。最近,上述检索策略被集成于一款具有自主知识产权的谱图检索软件——MS-Decipher(Bioinformatics, 2022)中。  相关研究成果以“Glyco-Decipher Enables Glycan Database-independent Peptide Matching and in-depth Characterization of Site-specific N-glycosylation”为题,于近日发表在《自然-通讯》(Nature Communications)上。该工作的共同第一作者是大连化物所1809组博士研究生方正和秦洪强研究员。上述工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、大连化物所创新基金等项目的支持。
  • 禾信质谱:将PM2.5源解析过程提高到小时级别
    图为搭载了SPAMS车载式检测仪器的大气环境移动监测车   当前,我国大气污染形势严峻,以可吸入颗粒物(PM10)、细颗粒物(PM2.5)为特征污染物的区域性大气环境问题日益突出,损害公众身体健康。   针对我国严峻的大气污染形势,国家陆续出台了一系列政策法规,如我国首部综合性大气污染防治规划《重点区域大气污染防治&ldquo 十二五&rdquo 规划》以及《大气污染防治行动计划》等,突显国家对污染防治工作的高度重视。   大气颗粒物来源解析工作是科学、有效开展颗粒物污染防治的基础和前提,是制定环境空气质量达标规划和重污染天气应急预案的重要依据。   参照《大气颗粒物来源解析技术指南(试行)》(环发〔2013〕92号),环境保护部今年发布了《关于开展第一阶段大气颗粒物来源解析研究工作的通知》(环办[2014] 7号),要求2014年底全国各直辖市、省会城市(拉萨除外)、计划单列市提交源解析阶段性研究结果。基于目前全国的大气污染防治形势,相信2015年将会有更多的城市需要开展PM2.5的来源解析工作。   目前大气颗粒物来源解析工作时间紧、任务重,全国大部分地市环境监测单位源解析配套队伍建设刚刚起步,同时能独立完成大气颗粒物源解析的团队有限。   鉴于上述我国源解析工作开展现状,《大气颗粒物来源解析技术指南(试行)》(环发[2013]92号)要求,针对重污染过程,应基于在线高时间分辨率的监测和模拟技术,发展快速源识别和解析方法。   国家自2008年起,在科技部和环境保护部设立专项,大力发展能够快速得到PM2.5源解析结果的技术。经过多年的努力,2012年禾信的PM2.5连续自动源解析技术诞生(基于在线质谱仪器的直接测量法)。   PM2.5连续自动源解析技术可快速获取源解析结果,可将源解析过程提高到小时级别,且可实时在线监控每种污染源的变化趋势。除此之外,单颗粒源解析方法对数据的结构或特征无任何限制条件,未引入任何人为假设条件;此技术方法用于大气颗粒物源解析不仅具有较好客观性,而且充分利用排放源的成分谱,具有精度较高、抗干扰性较强等特点。相对于传统源解析来说,这是革命性的进步,现已在北京、上海、广州等全国30多个城市得以推广应用。   PM2.5连续自动源解析系统包括了3部分:仪器(SPAMS)、谱库和&ldquo 指纹&rdquo 比对模型。在线源解析的基础是大数据谱库,比如柴油车、汽油车、矿尘、燃煤、工业源、海盐等的谱图,这些谱图相当于每一个污染源的&ldquo 指纹&rdquo ,当仪器进行监测时,与仪器配套的模型比对系统会自动将实时测到的每个颗粒物特征与谱库中的谱图进行比对,即&ldquo 指纹&rdquo 比对,及时判断出颗粒物的来源。大数据源谱库是源解析的基础,禾信已陆续与国内多家高校、研究所、监测站等合作建立了中国本地化谱库。   仪器(SPAMS,在线单颗粒气溶胶质谱仪)是禾信公司具有完整自主知识产权、基于质谱技术的在线源解析产品,是目前国际首台PM2.5在线源解析监测设备,其运用空气动力学透镜作为颗粒物接口 基于双光束测径原理进行单颗粒气溶胶计数,激光电离 利用双极有网飞行时间质谱测定气溶胶颗粒的分子量,实现了单颗粒气溶胶化学成分和粒径的同步检测。   PM2.5连续自动源解析系统可快速反映污染来源情况,为有的放矢、靶向治理提供数据支撑 可快速评价治理措施的成效,便于及时调整治理措施 结合气象信息,可判断本地源及外地源对重污染天气的贡献比例 为动态调控、精细化治理提供技术支撑。同时,实时发布来源信息,增强公众对大气污染成因的认知,缓解重污染天气时的舆论压力。   PM2.5连续自动源解析系统将源解析过程提高到小时级别,为源解析工作的开展提供了新的思路。为政府部门制定大气污染防治规划提供了可靠依据,对污染治理重点的确定以及环境的有效监管具有十分重要的指导意义。
  • 庆制药主题月,仪课通免费送质谱解析课程!
    我们都知道,有机质谱分析具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、可同时进行多组分分析等优点,广泛应用于食品、环境、石油化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,已经成为一种非常重要的定性定量分析方法。 质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,复杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析思路和方法,因此,从实践角度了解谱图分析就显得尤为重要。拿到质谱谱图后,如何判断化合物结构?为了帮助大家解决这些问题,仪课通新上线《有机质谱谱图解析 实例讲解》课程,现时免费发放!您可以从实际案例中理解谱图解析的基本概念,以实例讲解,拿到有机质谱谱图后如何拆解分析,从而推导出化合物结构!讲师介绍王毅:工程师。长期从事色谱及有机质谱分析,具有丰富的色谱质谱实际应用经验。擅长有机质谱碎裂规律总结及质谱碎裂机理的分析,尤其是利用有机质谱裂解机理实现对异构体化合物的区分鉴别、合成化合物的结构确证、未知化合物的结构解析、有机质谱对催化反应机理的证明、色谱质谱分析方法开发、有机质谱图解析培训。曾两次组织系统性的有机质谱解析课程培训,参加学员超过百人,课程受到学员们的一致好评。曾协助中国科学院上海有机化学研究所、浙江大学、中国农业科学院、中国农业大学、北京中医药大学等高校或研究所对有机质谱数据进行分析,相关成果在高水平期刊上得以发表。多次受邀在其他平台进行有机质谱解析的课程讲解,有机质谱解析培训受到质谱学家王光辉老师的推荐,讲解内容的核心也是从如何从一张未知物质谱图推导该未知物的结构,无需很高的水平的人员也能操作,目的是促使质谱解析系统高效快捷并得到广泛应用。课程亮点1、授课讲师从事质谱分析研究十几年,具有丰富的理论和实践经验,并且进行过多次专业培训;2、课程运用大量实例,将基础知识、基本规律以及解析思路深度剖析,无保留分享,深入浅出,通俗易懂;课程领取扫描二维码添加客服好友免费领取课程!
  • 禾信推出PM2.5在线源解析质谱监测系统
    目前,中国大气污染严重,治理迫在眉睫。污染状况如何、污染是什么、如何快速判断污染来源、以及治理效果如何评估等问题,均是大气污染治理的难点。为了应对大气成分染污来源解析的需求,增强大气颗粒物污染防治工作的科学性、针对性和有效性,禾信公司全新推出基于国际领先的单颗粒气溶胶飞行时间质谱技术的PM2.5在线源解析质谱监测系统(SPA-MS 05系列),实现气颗粒物的在线源解析功能,不仅对快速变化大气污染过程进行监测,而且可在短时间内对污染来源进行判定。 PM2.5 在线源解析质谱监测系统SPA-MS 05系列 (实现PM2.5在线源解析的一种高效、可靠手段)   PM2.5 在线源解析质谱监测系统SPA-MS 05系列,是禾信公司具有完整自主知识产权、基于质谱技术的国际先进的在线源解析设备,是实现PM2.5在线源解析的高效、可靠手段。   开展快速精准的在线源解析工作   为政府及时了解污染现状及来源提供技术支撑   为重点城市、重点行业、重点企业的污染状况监测提供技术支撑   在AQI接近临界点时,为政府及时采取有效控制措施提供科学依据   为产业结构调整等治理措施提供科学依据   为环境管理部门检验治理成效提供技术支撑   为环保精细化管理提供科学依据   在环境应急、污染投诉排查时快速找到污染源   在线源解析(质谱直接测量法)的优势   基于国际领先的单颗粒气溶胶飞行时间质谱技术   直接进样、不需要前处理   高时间分辨率,1小时可得到源解析结果   不同的来源,颗粒物的质谱特征不同   实时在线监测每一个颗粒物的粒径和质谱特征   智能高效的在线源解析功能,实现快速精准分析   具备全天候监测能力,在恶劣气象条件下发现污染排放现象   具备捕捉间歇式瞬间污染排放现象的能力 在线源解析(质谱直接测量法) 在线源解析技术与传统离线源解析综合对比   在线源解析的基础:丰富的谱图库资源   结合全球顶尖科学家20年的应用成果,与国内权威机构多年合作完成建立拥有100余类典型源谱谱库;   具备在线源谱库自建功能;   与用户紧密合作不断完善和修订谱库资源,提高源解析精确度。   领先的飞行时间质谱技术   实时在线:无需繁琐的前处理过程   快速、高时间分辨:可捕捉到瞬时变化   单颗粒质谱技术:粒径,有机、无机成分正负离子同时检测   数据分析:每天几十万个颗粒物质谱信息记录与处理   机动性强:实验室、车载、船载   智能高效的在线源解析软件   禾信自主研发的应用于SPA-MS系列仪器的在线源解析软件,可实时显示颗粒的粒径、正负谱成分信息,融合了在线源解析、颗粒类型统计的功能,具备在线源谱库自建功能,实时采集大气颗粒物,对其进行在线源解析。   同时,基于Matlab平台,软件以简捷的数据结构,直观的界面操作,并融入各种成熟的数据模型,满足客户离线获取数据的需要 并且能够根据科研需求,兼容其它多种数据分类方法。
  • 2015年第12期有机质谱谱图解析应用技术培训班邀请函
    信立方培训中心(北京信立方科技发展股份有限公司运营的科学仪器专业门户网站—仪器信息网(www.instrument.com.cn)旗下专业培训机构)致力于分析科学仪器的应用技术培训工作。为提高相关从业人员的技术水平,使分析科学仪器更好地服务于科研、生产及研发工作,适应当前从事质谱应用技术人员的迫切需求,培训中心自2009年起,至今已开设近三十期不同类型和层次的质谱培训班,涵盖气质、液质、谱图解析等领域,受到广大学员欢迎和好评。  有机质谱分析基于不同质荷比(m/z)的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、同时进行多组份分析等优点。近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为日常工作中非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析基于对质谱谱图的解析而实现,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。为适应广大分析技术工作者的需求,信立方培训中心将于2015年8月18日-21日在北京举办第十二期有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。  培训时间:2015年8月18-21日  培训地点:外国专家大厦(华严北里8号院外国专家大厦(北四环))  适用对象:  各企事业单位、科研院所从事食品卫生、检验检测、石油化工有环境监测及等行业负责分析测试的技术人员,以及各大专院校相关专业在校研究生及分析中心等技术人员。  学习目标:  系统掌握有机质谱谱图解析的基本方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,结合实例讲解谱图解析的基本思路和方法,为有机质谱的定性分析打下坚实基础。  课程特色:  讲师均为长期从事质谱分析研究的高职人员,具有丰富的理论知识和实践经验   有机质谱谱图解析的基础知识、基本规律和精选实例相结合,深入浅出,通俗易懂   独有的有机质谱谱图解析水平测试题,可清楚的对比学习前后的技术水平   学员可带问题参加学习班,在学习班和专家即时讨论交流,解决实际问题   授课专家:  1、王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》   2、苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》   3、授课专家不宜公开   授课大纲:  一、谱图解析基础知识  1、原子中电子的排布  2、奇电子离子与偶电子离子  3、氮规则  4、环加双键值  5、同位素峰  6、单分子反应  二、离子的丰度  1、质荷比与离子丰度包含的结构信息  2、影响碎片离子丰度的基本因素  三、离子碎裂的基本机理  1、断裂  2、环的开裂  3、重排反应  4、置换反应  5、消除反应  四、常见有机化合物的裂解及质谱图特征  1、碳氢化合物  2、醇、酮、醛、酸、酯、醚  3、胺类、酰胺类  4、卤代物、硝基化合物  5、腈  五、由质谱图推测分子结构  1、基本方法及思路  2、实例练习  六、NIST谱图库检索实用技术  1、NIST谱图库简介  2、NIST谱图库主要功能  3、NIST谱图库检索实例  授课方式:  (一)课程讲座  (二)案例讲解  注:学员可自带原始数据采集文件,讲师可采用学员的文件作为案例进行分析  培训费用:  每人3800元,2人以上组团报名可每人优惠100元(含报名费、培训费、资料费、培训期间每日午餐费用)。  颁发证书:  参加相关培训并通过考试的学员,可以获得:  由信立方培训中心颁发并有授课老师签字的结业证书。该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。  报名咨询:  联系人:李老师  电话:010-51654077-8119/15910410867  邮箱:liru@instrument.com.cn
  • 谱图大牛,教你重新认识有机质谱谱图解析!
    有机质谱分析基于不同质荷比(m/z)的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、同时进行多组份分析等优点。近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为日常工作中非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析基于对质谱谱图的解析而实现,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。 为适应广大分析技术工作者的需求,信立方培训中心将于2015年8月18日-21日在北京举办第十二期有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。 培训时间:2015年8月18-21日 培训地点:外国专家大厦(华严北里8号院外国专家大厦(北四环) 适用对象: 各企事业单位、科研院所从事食品卫生、检验检测、石油化工有环境监测及等行业负责分析测试的技术人员,以及各大专院校相关专业在校研究生及分析中心等技术人员。 学习目标: 系统掌握有机质谱谱图解析的基本方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,结合实例讲解谱图解析的基本思路和方法,为有机质谱的定性分析打下坚实基础。 课程特色: p 讲师均为长期从事质谱分析研究的高职人员,具有丰富的理论知识和实践经验; p 有机质谱谱图解析的基础知识、基本规律和精选实例相结合,深入浅出,通俗易懂; p 独有的有机质谱谱图解析水平测试题,可清楚的对比学习前后的技术水平; p 学员可带问题参加学习班,在学习班和专家即时讨论交流,解决实际问题; 授课专家:   1、王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》;   2、苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》; 3、授课专家不宜公开; 授课大纲:  一、谱图解析基础知识   1、原子中电子的排布   2、奇电子离子与偶电子离子   3、氮规则   4、环加双键值   5、同位素峰   6、单分子反应 二、离子的丰度   1、质荷比与离子丰度包含的结构信息 2、影响碎片离子丰度的基本因素 三、离子碎裂的基本机理  1、断裂  2、环的开裂  3、重排反应  4、置换反应   5、消除反应 四、常见有机化合物的裂解及质谱图特征   1、碳氢化合物   2、醇、酮、醛、酸、酯、醚   3、胺类、酰胺类   4、卤代物、硝基化合物 5、腈 五、由质谱图推测分子结构   1、基本方法及思路 2、实例练习 六、NIST谱图库检索实用技术   1、NIST谱图库简介   2、NIST谱图库主要功能 3、NIST谱图库检索实例 培训费用 每人3800元,2人以上组团报名可每人优惠100元(含报名费、培训费、资料费、培训期间每日午餐费用)。 颁发证书 参加相关培训并通过考试的学员,可以获得: 由信立方培训中心颁发并有授课老师签字的结业证书。该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。 报名咨询 联系人:李茹 电话:010-51654077-8119/15910410867 邮箱:liru@instrument.com.cn
  • 质谱为什么需要调谐以及参数解析
    为了得到好的质谱数据,在进行样品分析前应对质谱仪的参数进行优化,这个过程就是质谱仪的调谐。调谐是质谱使用中非常重要的一环,今天小编就与大家聊一聊调谐操作。一、质谱调谐调谐这个词来源于模拟电路。电路中,调节L或C使其谐振的过程,叫做调谐。在质谱中,射频电源(RF)含有线圈,相当于电感L 质量分析器相当于电容C。在质谱出产前,实际上要调节射频电源(RF)的线圈,使得线圈和质量分析器组成LC电路达到谐振。这个过程就是最初的调谐。后来将调谐的概念拓展为调谐质谱的多个参数,使其达到最佳工作状态。调谐中将设定离子源部件的电压 设定amu gain和amu off值以得到正确的峰宽 设定电子倍增器(EM)电压保证适当的峰强度 设定质量轴保证正确的质量分配。调谐包括自动调谐和手动调谐两类方式,自动调谐中包括:自动调谐、标准谱图调谐、快速调谐等方式。如果分析结果将进行谱库检索,一般先进行自动调谐,然后进行标准谱图调谐,以保证谱库检索的可靠性。二、质谱调谐液通常一般的调谐用PFTBA(全氟三丁胺)。还有高质量低质量调谐的特殊(目标)调谐。全氟三丁胺 (PFTBA) 放在紧靠着真空室下面的标样小瓶内。当一开始调谐时,PFTBA 自动进入离子源内。通常 PFTBA 使用一年或更长的时间才需要更换。这种化合物的稳定性为再现调谐提供了必要的条件。同样,这种化合物具有足够的挥发性使其进入离子源,而不需要加热。PFTBA 碎片离子质量数覆盖了很宽的质量范围,并且由于只有 C-13 和 N-15 同位素,使碎片离子质量容易解析。三、质谱调谐故障分析故障现象:调谐参数改变时, 调谐峰强度的变化滞后产生故障的可能原因及排除方法:a. 离子源被污染,排除方法是对离子源依次用甲醇、丙酮超声清洗各15min b. 预四级杆被污染,排除方法是对预四级杆依次用甲醇、丙酮超声清洗各15min c. 离子源部件未安装到位,电路未接通,排除方法是将离子源拆下,重新安装。故障现象:调谐质谱仪时,需要过高的离子能量和推斥电压产生故障的可能原因及排除方法:a. 高离子能量过高是由于离子源被污染,推斥电压过高是预四级杆、四级杆被污染,排除方法是对离子源、预四级杆、四级杆依次用甲醇、丙酮超声清洗各15min及保养维护 b. 质谱仪调谐未达到最佳状态,排除方法是重新调谐质谱仪。故障现象:调谐参数改变时,仪器响应不明显产生故障的可能原因及排除方法:离子源短路或电路未接通,排除方法是取出离子源, 用万用表测量各部件间的电路连接是否正常。故障现象:调谐峰的形状不好,有肩峰产生故障的可能原因及排除方法:a. 质谱仪调谐未达到最佳状态,排除方法是重新调谐质谱仪 b. 离子源被污染,排除方法是对离子源依次用甲醇、丙酮超声清洗各15min c. 分析器有缺陷或损坏,排除方法是检查分析器外观是否有缺陷或损坏。故障现象:调谐时,无参考峰出现产生故障的可能原因及排除方法:a. 参考标样全氟只丁氨瓶中无参考标样,排除方法是添加参考标样全氟砚丁氨于质谱仪内置的参考样瓶中 b. 参考标样的管路被堵塞,排除方法是拆下管路,用丙酮超声清洗 c. 空气泄漏,排除方法是检查空气峰m/z 28的高度,若大于10%氦气峰m/z 4的高度,表明有空气泄漏,用注射器将丙酮滴在各接口处,通过观察丙酮的分子离子峰m/z58的强度变化, 进一步查明泄漏的确切位置。故障现象:出现不规则、粗糙的调谐峰产生故障的可能原因及排除方法:a. 离子源被污染,排除方法是对离子源依次用甲醇、丙酮超声清洗各15min b. 灯丝老化,排除方法是更换灯丝 c. 质谱仪调谐未达到最佳状态,排除方法是重新调谐质谱仪。故障现象:m/z 18、28、32峰大于10%氦气峰m/z 4产生故障的可能原因及排除方法:a. 空气泄漏,排除方法是检漏,检查柱子的连接情况 b. 氦气即将用尽, 气瓶内杂质富集,排除方法是更换载气瓶并安装脱气装置 c. 新近清洗的离子源未烘干,排除方法是设置250℃的离子源温度烘烤离子源 d. 柱子被污染,排除方法是老化柱子。故障现象:灯丝状态良好时,无离子产生产生故障的可能原因及排除方法:a. 离子源需要重新校准,排除方法是利用校准工具重新校准离子源 b. 空气泄漏严重,排除方法是检漏并紧固各连接处。故障现象:调谐质谱仪时, 高质量峰m/z 502、614不显示产生故障的可能原因及排除方法:预四级杆短路,排除方法是将预四级杆拆下, 用氦气或氮气吹干。
  • 质谱大牛带你重新认识“有机质谱谱图解析”
    培训关键字:有机质谱谱图解析、面授、王光辉、苏焕华 授课专家 王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。著有《有机质谱解析》等专著。 苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。著有《色谱-质谱联用技术及应用》等专著。 范国樑 天津大学材料科学与工程学院、副教授;天津市色谱研究会秘书长;天津市分析测试协会副理事长;中国色谱学会理事。专著"有机结构波谱分析"-质谱部分20万字,天津大学出版社出版。在chromatography A、分析化学(中国)、色谱(中国)等期刊发表论文40多篇。做为项目负责人完成973项目、天津市自然基金、科技部攻关项目十余项。获天津市技术发明奖二、三等奖两项。发明专利10项。 课程内容 一、谱图解析基础知识 二、离子的丰度 三、离子碎裂的基本机理 四、常见有机化合物的质谱图特征 五、由质谱图推测分子结构 六、NIST谱图库检索实用技术 注:学员可自带原始数据采集文件,讲师可采用学员的文件作为案例进行分析 更多课程内容请直接电话咨询010-51654077-8123。 其他信息: 培训机构: 信立方培训中心 适用对象: 使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员。 费用:3800元/人 开班地点:北京市 开班时间:2015-05-26 培训天数: 共4天 地址:外国专家公寓(华严北里8号院外国专家大厦) 报名方式: 联系人: 安先生 Email: job@instrument.com.cn 联系电话: 010-51654077-8123 传真:010-82051730
  • 聚焦大气污染来源解析 禾信质谱亮相BCEIA2013
    2013年10月23日,第十五届北京分析测试学术报告会及展览会(BCEIA 2013)于北京展览馆隆重召开,禾信质谱携自主研发、生产的“PM2.5 在线源解析质谱监测系统SPA-MS 05系列”和“在线挥发性有机物质谱仪SPIMS 1000”盛大亮相展会现场。科技部条财司吴学梯副司长参观禾信展位 中国仪器仪表学会分析仪器分会理事长关亚风研究员参观禾信展位 客户代表参观禾信展位 PM2.5 在线源解析质谱监测系统SPA-MS 05系列   禾信公司此次展出的PM2.5 在线源解析质谱监测系统SPA-MS 05系列,是具有完整自主知识产权、基于质谱技术的国际先进的在线源解析设备,是实现PM2.5在线源解析的高效、可靠手段。该仪器可以在1小时内得到当地的PM2.5源解析分类饼图 区分本地源与外地源 实现深度源解析、源分类、源判识 具有应急、预警功能 且具备样品前处理简单、使用费用低等优点。 在线挥发性有机物质谱仪SPIMS 1000   另一款展出的在线挥发性有机物质谱仪SPIMS 1000是由禾信公司独立开发具有完全自主知识产权的质谱在线分析设备。仪器融合了膜富集、光电离、飞行时间质谱分析、高速数据采集以及高频高压电源等多个关键性技术。具有实时、快速、在线的特点,可实现VOCs定时定量检测,节省了离线方法中对样品采样、存贮、运输等过程所需要的时间。禾信在线挥发性有机物质谱仪SPIMS 1000荣获BCEIA 2013金奖BCEIA 2013金奖技术宣讲现场 禾信大气颗粒物(PM2.5)实时在线源解析技术荣获CAIA二等奖   值得关注的是,禾信公司在本届BCEIA 2013展会上荣获两项大奖:分别是BCEIA 2013金奖和CAIA二等奖。禾信“在线挥发性有机物质谱仪SPIMS 1000” 荣获BCEIA 2013金奖。本届“BCEIA金奖”评选竞争激烈,共有27家单位、35个项目通过初选,最终14个项目获得2013年“BCEIA金奖”。中国分析测试协会特设立的BCEIA 金奖每两年评选一次,以促进我国分析测试领域分析仪器技术的发展和分析仪器水平的提高,鼓励企业的技术开发和面向市场的技术成果,鼓励分析仪器的研究、开发、技术的自主创新,推动新研制仪器产业化和推广应用。   禾信公司的“大气细颗粒物(PM2.5)实时在线源解析技术”荣获CAIA二等奖。本届参评项目共计43项,涉及生物分析、食品安全、环境保护、纳米材料等多个学科领域。中国分析测试协会科学技术奖(CAIA奖)是我国分析测试领域唯一得到国家正式承认的科学技术奖 该奖设立于1993年,每年评审一次,用于奖励高水平的分析测试领域的研究成果。禾信质谱接受行业媒体采访   此外,禾信产品还受到众多媒体朋友的关注,仪器信息网、仪众传媒、化工仪器网、实验与分析等媒体来到禾信展位进行了采访报道。禾信的在线源解析技术可在1小时内对采集的颗粒物实现燃煤、机动车、扬尘、生物质燃烧、海盐等多种类源的划分,克服了传统源解析方法耗时久、花费高、多种仪器联用存在仪器误差等缺陷,在国内首次实现大气细颗粒物(PM2.5)实时在线源解析,该技术受到观众、媒体的高度关注。  关于广州禾信分析仪器有限公司   禾信公司成立于2004年,是集质谱仪器研发、制造、销售及技术服务为一体的国家级火炬计划重点高新技术企业。注册资金4000万元,场地6000平方米。   通过多年努力,掌握高分辨垂直引入式飞行时间质谱分析器、电喷雾离子源、电子轰击离子源、真空紫外光电离源、大气压基质辅助激光解析离子源、大气压差分真空接口、膜进样以及质谱专用高速数据采集卡等,具有自主知识产权的质谱核心技术和飞行时间质谱仪器全套装配工艺 通过ISO9001:2008质量管理体系认证。在国内率先实现质谱仪器产品自主正向开发。产品研发得到国家“863”计划、国家重大科学仪器设备开发专项、国家火炬计划以及多项省市级科技攻关重点项目的支持。   禾信公司向环境监测、气象、工业生产、医药等领域提供商品化质谱仪器以及技术服务。近年来,质谱仪器销售额连创新高实现数量级增长,入选2012年中国优秀创业投资项目。2012年实现首台质谱仪器出口美国。
  • 第15期全国有机质谱谱图解析培训班11月29日即将召开
    p br/ & nbsp   他们在质谱分析领域兢兢业业,掌握最前沿的应用技术,具有丰富理论知识和实践经验,我们都应向他们学习讨教。他们的在学术上的深度、钻研的态度值得我们追仿。 br/ br/ br/ 王光辉 br/   中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作: 《有机质谱解析》 br/ br/ br/ br/ 苏焕华 br/   北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》 br/ br/ br/ br/ 李重九 br/   中国农业大学理学院应用化学系教授,农残分析领域著名质谱专家,在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作:《有机质谱应用:在环境、农业和法庭科学中的应用》 br/ br/ br/   本月,大家有机会跟这三位资深的专家学者面对面,探寻质谱在分析领域有何最新进展,快速提升自己现有谱图解析水平,从掌握到精通... br/ br/ br/ br/ 第15期有机质谱谱图解析应用技术培训班即将开始~ br/ br/ & nbsp br/ 会议安排 br/ br/   会议时间:2016-11-29至2016-12-2(4天)会议地点:北京外国专家大厦(华严北里8号院外国专家大厦(北四环))适用对象: & nbsp 使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员。 br/ br/ & nbsp br/ 您能学到什么 br/ br/   1、本课程将有机质谱繁杂的裂解规律归纳提炼为简要、易学、易记的六大裂解类型 br/ br/   2、课程将讲解如何使用专属应用软件或手工计算的方式,计算未知物的元素组成 br/ br/   3、本课程将介绍若干免费网站,进一步查找特定元素组成可能的对应结构 br/ br/   4、本课程将以实例讲解偶电子离子的裂解规律,应用于ESI源(CID谱) br/ br/   5、本课程将讲解合理的中性碎片及氮规则等谱图解析中的核心原理,以识别分子离子峰 br/ br/   除此之外,你不懂的或者工作当中遇到的问题都可以带到课堂上来,授课专家会为您一一解答指导! br/ br/ br/ 课程内容 br/ br/   一、谱图解析基础知识1、原子中电子的排布2、奇电子离子与偶电子离子3、氮规则4、环加双键值5、同位素峰6、单分子反应 br/ br/   二、离子的丰度1、质荷比与离子丰度包含的结构信息2、影响碎片离子丰度的基本因素 br/ br/   三、离子碎裂的基本机理1、断裂2、环的开裂3、重排反应4、置换反应5、消除反应 br/ br/   四、常见有机化合物的质谱图特征1、碳氢化合物2、醇、酮、醛、酸、酯、醚3、胺类、酰胺类, 氨基酸,硝基化合物,腈基化合物4、卤代物5、多官能团化合物 br/ br/   五、由质谱图推测分子结构1、基本方法及思路2、实例练习 br/ br/   六、NIST谱图库检索实用技术1、NIST谱图库简介2、NIST谱图库主要功能3、NIST谱图库检索实例注:学员可自带原始数据采集文件,讲师可采用学员的文件作为案例进行分析) br/ br/ br/ 报名咨询 br/ br/   联系人:李老师& nbsp & nbsp & nbsp 座机:010-51654077-8119& nbsp 电话:15910410867邮箱: a href=" mailto:liru@instrument.com.cn" liru@instrument.com.cn /a /p
  • 有机质谱谱图解析专题培训班第一轮通知
    有机质谱分析基于不同质量数的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为的原理进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、可同时进行多组分分析等优点,近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为一种非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。 为适应广大分析技术工作者的需求,我们将与仪器信息网合作于2014年7月22日-25日在北京举办有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。 培训日期:2014年7月22日-25日 培训地点:北京 外国专家大厦 培训日程: 主要课程及讲师 授课时间及主要内容 有机质谱解析基础&mdash &mdash 王光辉 7月22日-23日全天 ①基础知识(原子中电子的排布;奇电子离子与偶电子离子;氮规则;环加双键值;分子离子的识别;同位素峰;单分子反应) ②离子丰度(质荷比与离子丰度;影响碎片离子丰度的基本因素) ③离子碎裂的基本机理(电荷及游离基定域的概念;离子碎裂的类型) ④由质谱图推测分子结构 常见有机物质谱解析 7月24日全天 常见有机物质谱解析(碳氢化合物、醇、醚、醛、酸、酯、胺、卤代物、硝基化合物) 质谱解析小结&mdash &mdash 苏焕华 7月25日全天 ①质谱解析方法小结(各类化合物的质谱特征,质谱推导结构的基本方法) ②质谱解析练习题 & 答疑 专家介绍: 王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,曾参与国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作: 《有机质谱解析》; 苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,曾参与国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。著作:《色谱-质谱联用技术及应用》; 其他课程: 2014年7月29-31日 液质联用(LC-MS)应用技术培训班(医药) 2014年10月21-23日 液质联用(LC-MS)应用技术培训班(食品/环境) 报名方式: 电话:010-51654077-8123 15801554077 安老师 Email:job@instrument.com.cn 报名地址:http://www.instrument.com.cn/training/train_sign.asp?TRI_No=101113
  • 我国开发定量蛋白质组学数据解析软件
    中科院计算所究团队与董梦秋实验室合作,成功开发了定量蛋白质组学数据解析软件,用计算方法排除干扰信号的影响、提高肽段和蛋白质的定量准确度并对每个定量值进行准确性评价。   基于质谱的定量蛋白质组学是现代生物学技术的生长点之一,用于测量复杂生物体系中蛋白质及其翻译后修饰在不同条件下的丰度变化,是研究蛋白质功 能和药物作用机制的重要工具。已有的定量软件往往不能有效排除干扰信号,定量值的计算方法有待完善,而且缺乏准确性评价,致使输出结果&ldquo 鱼龙混杂&rdquo ,引起 的假阳和假阴两方面的困扰都比较严重。  为了更好地解决问题,开发者研究了几百个可疑定量值的原始质谱图和色谱图数据,找原因、攒经验,充分挖掘肽段的质谱、色谱信号特点以及从肽段定量到蛋白 质定量的方法,灵活应用各种组合和统计算法,建立了一整套非常细致的数据分析流程。为了验证软件的性能,董梦秋实验室的同学通过轻重SILAC或 14N/15N标记哺乳动物细胞或细菌,从10:1到1:10按不同比例混合得到14套标准样品,产生了14套测试数据集。 测试结果表明,定量结果的准确性明显超过定量蛋白质组学领域的两个主流软件Census和MaxQuant,主要表现在输出的非数比值数目(即 不能定量的部分)占总比值数目的0.01&ndash 0.5%,远低于Census的MaxQuant的对应比例2.5&ndash 10.7%和 1.8&ndash 2.7%;Census和MaxQuant输出了许多不准确结果,其定量值的标准差是软件的1.3&ndash 2倍;给出了肽段和蛋白质定量比值的置信区 间,而Census和MaxQuant没有准确性评价。目前,该研究工作得到了科技部、基金委、中科院和北京市政府的资助。
  • 信立方有机质谱谱图解析专题培训班通知
    信立方质谱培训中心致力于有机质谱应用技术培训工作。为提高相关从业人员的技术水平,让有机质谱更好的为科研、生产及研发工作服务,适应当前从事质谱应用技术科技人员的迫切需求,培训中心考察了全国各类有机质谱应用技术培训现状,借鉴并发扬培训成效显著的全国有机质谱应用技术培训班的成功经验,与仪器行业最大的门户网站仪器信息网合作,于2009年开设了气质联用(3期)、液质联用(1 期)、谱图解析(2 期)等不同类型和层次的质谱培训班,受到广大学员欢迎和好评。2010年培训中心将继续举办此系列质谱培训班,并适当增加培训内容,计划从2010年3月开始,每月举办一期,详情请查看信立方质谱培训中心在仪器信息网的专栏:http://training.instrument.com.cn。   有机质谱分析基于不同质量数的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为的原理进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、可同时进行多组分分析等优点,近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为一种非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。为适应广大分析技术工作者的需求,我们将与仪器信息网合作于2010年5月17日在北京举办第三期有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。   适用对象   使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员。   学习目标   系统掌握有机质谱谱图解析的基本方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,结合实例讲解谱图解析的基本思路和方法,为有机质谱的定性分析打下良好基础。   课程特色   讲师均为长期从事质谱分析研究的高职人员,具有丰富的理论知识和实践经验   有机质谱谱图解析的基础知识、基本规律和精选实例相结合,深入浅出,通俗易懂   独有的有机质谱谱图解析水平测试题,可清楚的对比学习前后的技术水平   学员可带问题参加学习班,在学习班和专家即时讨论交流,解决实际问题   学员专享网上社区,学员可互动交流,免费下载资料,参加讲师的网上答疑活动。   专家团队   王光辉   中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。著有《有机质谱解析》等专著。   苏焕华   北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。著有《色谱-质谱联用技术及应用》等专著。   课程大纲      咨询联系方式:010-51299927-101,13269178446,training@instrument.com.cn
  • 岛津质谱谱图解析高级培训班在京举办
    质谱分析是当今最重要的分析方法之一,已日益倍受分析工作者的推崇。具备高超的质谱解谱能力,是分析工作者能够充分发挥质谱技术特长高水平地完成分析检测工作的关键。 为帮助岛津的有机质谱(含GCMS和LCMS)用户提高质谱解谱能力,岛津分析中心秉承&ldquo 专业分析者教育服务&rdquo 的核心服务理念,于2013年6月19日至6月21日在岛津北京分析中心成功举办了首届质谱谱图解析高级培训班。 培训班特邀请有机质谱界享有盛名的专家王光辉老师和盛龙生老师讲授有机质谱解析基础知识、离子丰度和离子碎裂机理、如何从质谱图推导化合物结构和大气压离子化质谱的解析等内容。13位来自全国各地的质谱用户抱着真诚的学习态度参加了本次培训班。 培训班课堂场景 6月19、20日两天,王光辉老师深入浅出地讲解了有机质谱图与分子结构的关联、由质谱图推测分子结构、偶电子离子裂解规律等内容。6月21日,盛龙生老师详尽讲解了大气压离子化质谱的解析等内容。 王光辉老师讲课 盛龙生老师讲课 两位专家渊博的学识和丰富的实践经验折服了本次培训班的学员。学员们从中学到了大量的质谱知识,理清了概念,受益非浅。学员们还就自身开展的项目向两位专家请教。王光辉老师特地介绍了岛津GCMSsolution软件和NIST软件在解谱上的实用功能;盛龙生老师为此次培训班特地编写了&ldquo 大气压离子化质谱的解析&rdquo 培训教材,这是业内所见到的第一个系统地讲解大气压下离子化质谱解析的教材。可见两位专家对此次培训班的用心。 鉴于此次培训班的成功举办,今后,该培训班有望在各地分析中心轮流举办,以满足不同地区用户的需要,作为岛津公司&ldquo 全面应对用户需求,提升服务品质&rdquo 实践中的重要一环。 附件 本次培训班特邀授课专家简介: 专家姓名 专家简介 王光辉 中国科学院化学所质谱中心研究员。国内最早从事质谱研究的专家之一,国内质谱解析领域的知名专家,有数十年从事质谱技术研究与教学工作经验。编著《有机质谱解析》一书,该书为国内质谱技术丛书的经典著作,是从事质谱解析工作的必备书籍。 盛龙生 中国药科大学教授,长期从事药物分析方法学研究。主要研究方向:质谱法及其联用技术的方法学和应用研究,包括色谱 /质谱联用技术在中药、生物药物、合成药物及药物代谢和代谢组学中的应用研究。著有《色谱质谱联用技术》,《药物分析》等多本专著。 关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所为扩大中国事业的规模,于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司。 目前,岛津企业管理(中国)有限公司在中国全境拥有13个分公司,事业规模正在不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心;覆盖全国30个省的销售代理商网络;60多个技术服务站,构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。 岛津作为全球化的生产基地,已构筑起了不仅面向中国客户,同时也面向全世界的产品生产、供应体系,并力图构建起一个符合中国市场要求的产品生产体制。 以&ldquo 为了人类和地球的健康&rdquo 为目标,岛津人将始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务。 更多信息请关注岛津公司网站www.shimadzu.com.cn/an/ 。
  • 有机质谱谱图解析培训班即将开班,从速报名
    信立方质谱培训中心致力于质谱应用技术培训工作。为满足当前从事质谱应用技术人员的迫切需求,培训中心与仪器行业最大的门户网站仪器信息网合作,在考察全国各类质谱应用技术培训现状的基础上,借鉴、发扬培训成效显著的质谱应用技术培训班的成功经验,旨在提高相关从业人员应用技术水平,使质谱技术更好地服务于科研、生产及质控,监测等领域。自2009年,迄今已开设二十余期不同类型和层次的质谱培训班,受到广大学员的欢迎和好评。2013年培训中心将继续举办此系列质谱培训班,并不断增加和更新培训内容,详情请查看信立方质谱培训中心。报名地址:http://www.instrument.com.cn/training/training_info.asp?TRI_No=101009 有机质谱分析基于不同质量数的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为的原理进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、可同时进行多组分分析等优点,近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为一种非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。为适应广大分析技术工作者的需求,我们将与仪器信息网合作于2013年12月3日-6日在北京举办有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。 专家团队   &diams 王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》   &diams 苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》 课程大纲 一、谱图解析基础知识 二、离子的丰度 1、原子中电子的排布 2、奇电子离子与偶电子离子 3、氮规则 4、环加双键值 5、同位素峰 6、单分子反应 1、质荷比与离子丰度包含的结构信息 2、影响碎片离子丰度的基本因素 三、离子碎裂的基本机理 四、常见有机化合物的质谱图特征 1、断裂 2、环的开裂 3、重排反应 4、置换反应 5、消除反应 1、碳氢化合物 2、醇、酮、醛、酸、酯、醚 3、胺类 4、酰胺类 5、腈 五、由质谱图推测分子结构 六、NIST谱图库检索实用技术 1、基本方法及思路 2、实例练习 1、NIST谱图库简介 2、NIST谱图库主要功能 3、NIST谱图库检索实例 咨询及报名联系方法   电话:010-51654077-8113 13810253507 传真:010-82051730   Email:training@instrument.com.cn
  • 使用非数据依赖采集法实现氢/氘交换质谱数据自动化分析
    HDX-MS是一种基于蛋白质主链酰胺氢原子与氘水中氘原子交换而获取有关蛋白质高阶结构和动态信息的方法。该技术可以帮助研究蛋白质折叠机制、发现配体结合位点、突出变构效应,在生物医药行业中发挥重要作用。尽管HDX-MS在蛋白质分析中频繁使用,但它通常无法进行高通量分析,且受限于大于150 kDa蛋白的分析。此外,HDX-MS生成复杂的同位素峰型常伴有谱图重叠现象,导致氘代值被错误计算。随着样品复杂性的增加,这一问题会更加加剧。目前,数据处理的方法涉及到手动检查原始数据以筛选谱图,并丢弃有任何信号问题的肽段图谱。然而这种方法随着样品分子量和复杂程度的增加变得难以执行,且容易受到人为错误的干扰(图1)。因此迫切需要一种可以消除手动筛选数据的负担,同时能够兼容更复杂的谱图(来自复杂混合物或整个细胞裂解液样品的谱图)。本文作者使用了一种自动化HDX数据分析的方法,利用data independent acquisition(DIA)采集方法同时从MS1和MS2领域获取氘代数据,并开发了AutoHX软件来挖掘和分析HDX数据。图1.传统HDX-MS数据采集与分析流程和本文使用的数据采集和分析流程比较。针对使用HDX-MS时,碰撞诱导解离(CID)碎裂模式产生的肽段碎片会伴随着气相中的氘重组现象(即scrambling现象),会影响残基水平氘代值的准确测量这一问题,作者定量研究了HDX-MS2数据的特性。作者发现,scrambling与离子传输和碎裂能量有关,且在高传输效率的条件下scrambling较严重,因此首先使用较为温和的离子传输参数和碎裂能量能够降低scrambling程度。随后作者建立了可描述碎片氘代值与该肽段可碎裂位点数量之间的线性关系(图2)。随着碎片离子长度的增加,相应的碎片离子氘代值会线性增加,因此通过回归计算可以计算出整个肽段的氘代率。这种方法不仅利用了CID产生的碎片信息,同时更为准确的计算出肽段的氘代值,排除了肽段谱图重叠对计算氘代值的干扰。图2.在一条给定肽段中,HD scrambling中,氘代值与碎片长度的关系。接着作者提出使用DIA方法来获取HX-MS2实验中MS1和MS2域的氘化数据,以实现在不同质谱平台采集数据、采集复杂样品的信息、分析自动化数据,且使得通过CID产生的MS2中提取肽段氘代值成为可能。首先作者设置了尽可能小的DIA窗口,并使用了较大的窗口重叠区域,以最小化MS2谱图的复杂性并确保每条氘代肽段至少有一个窗口(图3)。同时,作者开发了一个名为AutoHX的软件(作为Mass Spec Studio中的插件),该软件自动选择理想的DIA窗口,并从MS1数据计算前体肽段的氘代值,以及从MS2数据计算所有碎片的氘代值。同时改进了HX-PIPE(为HDX-MS量身定制的搜索引擎),使其搜库结果直接应用于AutoHX的分析。随后AutoHX使用了一系列过滤器来从数据集中解析低质量信号,然后使用基于RANSAC的谱图分析器,为所有肽段及其碎片匹配最佳同位素集合,并绘制动力学曲线图。该方法显著提高了肽段序列覆盖的冗余度(图4),从而提高了测量质量。图3. DIA窗口设计示意。图4. 基于DIA采集模式得到的序列覆盖(糖原磷酸化酶B,phosphorylase B)与基于传统HDX-MS中MS1采集模式的结果比对。接着,软件会通过MS1和MS2数据收集到的肽段前体离子和肽段碎片离子的信息,计算出相应的氘代值,同时将所有重复组计算出的氘化值集合成一个分布(通常为正态分布),并从该正态分布中,选择最接近平均值的组合,即为精确的氘代值,利用每个时间点的氘代值生成HDX动力学曲线(图5)。作者将手动筛选检查的数据与自动分析法获得的氘代数据进行了比对,结果具有一致性,验证了自动化方法的准确性和可靠性(图6)。同时在做同一样本不同状态HDX比较实验时,AutoHX可以生成氘代差异的显著性差异分析图(Woods plot)(图7),用于比较不同状态下的蛋白结构和构象差异。图5. 氘代曲线的组合方式。图6.手动MS1数据分析和AutoHX自动计算的氘代率对比。图7.氘代差异分析流程示意图。最后作者用两个蛋白体系验证了该方法的实用性和可靠性。第一个体系为DNA聚合酶ϴ (Pol ϴ )与其抗生素药物novobiocin结合的结构变化。通过比较手动处理与自动化处理的数据,作者发现生成的氘代差异图结果相似,提示该方法具有较好的准确性,并能够定位结合带来的氘代上升和下降区域(图8)。第二个体系是DNA依赖性蛋白激酶(DNA-PKcs)与选择性抑制剂AZD7648的结合。使用AutoHX软件处理了六个HDX-MS实验的数据,快速生成了Woods图,发现大部分可检测到的稳定性增加集中在FAT和激酶结构域(图9b),还包括药物结合位点的铰链环区域(图9c),揭示了药物结合位点及其引起的动态性变化。这部分研究结果展示了自动化数据分析在药物结合研究中的有效性,特别是在分析大型蛋白质复合物和难以纯化的蛋白质时,为药物开发和疾病治疗提供了有价值的信息。图8.手动处理与自动处理的Pol ϴ 与novobiocin-bound Pol ϴ 的HDX数据作差对比。图9. DNA-PKcs+AZD7648的自动化HDX分析流程结果。总的来说,该研究开发了AutoHX软件,通过自动化数据分析和基于DIA的HX-MS2工作流程,显著提高了氢/氘交换质谱技术在蛋白质结构和药物结合分析中的效率与应用范围,使得这一领域技术更加易于使用并可供更广泛的科研社区应用。该工作的亮点,从实验设计上:考虑到了目前HDX-MS流程——数据采集、数据分析——中存在的瓶颈与局限。从方法学考察层面:方法验证科学严谨、周到。从技术上:大大降低了人工处理HDX-MS数据的成本,提高了检测能力,有提高检测通量的潜力。从科学思维上:利用了scrambling的规律,将普遍的问题转化成了机遇。HX-DIA提供了一个概念上的转变,降低了该技术的使用门槛,使该技术“平民化”。本文发表在Nat. Commun.上,题目为“Automating data analysis for hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry using data-independent acquisition methodology”,作者是加拿大卡尔加里大学的David C. Schriemer。
  • 陈素明课题组实现了电化学中间过程的时间分辨质谱解析
    近日,国际权威学术期刊Angew. Chem. Int. Ed(《德国应用化学》)在线发表了高等研究院陈素明教授课题组在结构导向的质谱分析方面最新研究成果。论文题为“Elucidation of Underlying Reactivities of Alternating Current Electrosynthesis by Time-resolved Mapping ofShort-lived Reactive Intermediates”。武汉大学为论文唯一署名单位,高等研究院万琼琼副研究员为论文的第一作者,陈素明教授、易红研究员为论文共同通讯作者。该工作通过构建具有时间分辨能力的Operando电化学-质谱分析装置,实现了电化学过程中活性中间体以及自由基异构体的结构和动力学解析,揭示了电化学反应的内在机制(图1)。图1.时间分辨的Operando电化学-质谱分析装置与电化学芳胺功能化反应质谱是对分子进行定性和定量的有力工具,但在实际的复杂研究体系中,常规的质谱分析方法很难实现深层次的结构解析和定量分析。其中,化学反应瞬态中间过程的分析就是一个巨大的挑战。电化学合成是合成化学的新兴领域,但是电化学反应过程的机理研究一直受限于短寿命活性中间体的捕获和结构分析鉴定。为了解决电化学中间过程分析的难题,本研究开发了一种具有超快时间响应的原位电化学-质谱分析装置,可以在电合成工况条件下时间分辨地解析电化学反应过程中的短寿命活性中间体。由于该装置可以最大程度地模拟直流电合成和交流电合成反应,因此通过全面解析电化学芳胺功能化反应过程中活性中间体的结构和动力学,揭示了交流电合成相对于直流电合成具有独特反应性的内在机制。包括:减少中间体的过度氧化/还原,促进氧化-还原电生活性中间体的有效反应,尤其是控制多步电合成反应过程中氮中心自由基的动力学来减少竞争反应。这些发现对于深入理解交流电合成反应的机理提供了关键的信息。此外,本研究还发展了一种解析反应过程中氮中心自由基异构体的新型分析策略。由于中性的氮中心自由基和胺自由基阳离子在质谱分析时都会呈现出相同质量的质子化离子峰,因此难以在质谱中进行区分。研究巧妙利用中性自由基能形成碱金属加合峰的特性,并通过时间分辨的电化学-质谱分析装置测定中性自由基和自由基阳离子的寿命差异,从而准确地分辨出了反应过程中的氮中心自由基异构体。该方法不仅揭示了电化学芳胺功能化过程中隐藏的自由基反应历程,而且提供一种氮自由基异构体解析的通用方法,从而可以深入理解氮中心自由基的反应动力学。据悉,该研究得到了国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目经费的支持,雷爱文教授课题组为该工作提供了电化学实验装置支持。
  • 信立方有机质谱谱图解析培训班圆满结束
    有机质谱分析近年来在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,已成为一种非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。 为适应广大分析技术工作者的培训需求,信立方质谱培训中心与仪器信息网合作开展的第一期有机质谱谱图解析技术专题培训班,于2009年7月20日在北京如期举办. 培训班为期5天,邀请中国科学院化学研究所质谱中心王光辉研究员、北京石油化工科学研究院苏焕华高工和北京防化研究院杨小兵博士共同主讲。培训内容涉及谱图解析的基础知识、离子的丰度、离子碎裂的基本原理、常见有机化合物的质谱图特征和NIST谱图库检索实用技术等,培训过程中主讲专家还带领学员进行了由质谱图推测出分子结构的基本方法和思路的实例练习。通过此次学习,加深了学员对有机质谱解析的理解和认识,并且更系统和条理的掌握了质谱解析的思路和方法. 谱图解析培训班授课现场 按照此次培训班日程安排。7月24日上午培训中心安排全体学员进行了有机质谱谱图解析培训班结业考试,考试结束后,便由王光辉和苏焕华老师针对培训班学员提出的问题进行集中答疑,杨小兵老师对学员的结业试卷进行批阅。答疑过程中,两位专家不仅仅只是解答单一的疑问,而是将所有的疑问归纳汇总,综合答疑。对全体学员解惑的过程也是将此次培训班所讲授的知识与实际操作融汇贯通的过程. 专家答疑现场 老师认真批阅结业试卷 此次培训班结业考试中,宁波市海洋与渔业研究院、上海计量测试技术研究所和石家庄疾病预防控制中心的三名学员分获前三名。培训中心向他们颁发了优秀学员证书并进行了500元至200元不等的优秀学员奖金奖励. 优秀学员与授课专家合影留念 有机质谱谱图解析技术不仅需要分析工作者深厚的经验积累,而且需要其对繁杂的裂解规律具有清晰的解析思路和系统条理的解析方法,为使广大分析工作者更系统掌握有机质谱谱图解析的基本方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,为有机质谱的定性分析打下良好基础。同时,也为未能参加此次培训班的学员再提供一次良好的学习机会,信立方质谱培训中心拟于2009年10月下旬在北京举办第二期有机质谱谱图解析技术专题培训班,结合实例讲解谱图解析的基本思路和方法,望感兴趣的广大分析工作者切莫错失良机。详细课程设置请密切关注本网培训中心专栏。 注:第三期气质联用(GC-MS)应用技术培训班9月21日-25日在杭州举办。目前已开始报名,详情请查阅: http://www.instrument.com.cn/training/training_info.asp?TRI_No=100244。
  • 第16期(2017年)有机质谱谱图解析应用技术培训班邀请函
    p & nbsp & nbsp   信立方培训中心(仪器信息网旗下培训中心)致力于质谱应用技术培训工作。为提高相关从业人员的技术水平,使质谱更好地为科研、生产工作服务,适应当前从事质谱应用技术科技人员的迫切需求,自2009 年起,先后开设了近四十期不同类型和层次的质谱技术培训班,受到广大学员欢迎和好评。 br/   近年来,质谱技术在我国快速发展,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各领域,成为日常工作中非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析基于对质谱谱图的解析。但因有机化合物种类繁多,裂解规律繁杂不易掌握,在缺乏谱图解析思路和方法的情况下,许多分析人员在拿到谱图后常感到无从下手。应广大分析工作者需求,信立方培训中心将于2017年5月16日-19日在北京举办第十六期有机质谱谱图解析应用技术培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员报名。 br/ br/ strong   招生对象: /strong br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 各企事业单位、科研院所从事食品卫生、检验检测、石油化工、环境监测、制药等行业负责分析测试的技术人员,以及各大专院校相关专业在校研究生、分析中心专业技术人员。 br/ br/ strong   学习目标: /strong br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 系统掌握有机质谱谱图解析方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,结合实例讲解谱图解析的思路和方法,为有机质谱定性分析打下坚实基础。 br/ strong br/   课程内容: br/ /strong strong   一、谱图解析基础知识 br/ /strong   1、原子中电子的排布 br/   2、奇电子离子与偶电子离子 br/   3、氮规则 br/   4、环加双键值 br/   5、同位素峰 br/   6、单分子反应 br/ strong   二、离子的丰度 /strong br/   1、质荷比与离子丰度包含的结构信息 br/   2、影响碎片离子丰度的基本因素 br/   strong  三、离子碎裂的基本机理 /strong br/   1、断裂 br/   2、环的开裂 br/   3、重排反应 br/   4、置换反应 br/   5、消除反应 br/   strong  四、常见有机化合物的裂解及质谱图特征 /strong br/   1、碳氢化合物 br/   2、醇、酮、醛、酸、酯、醚 br/   3、胺类、酰胺类、氨基酸、硝基化合物、腈基化合物 br/   4、卤代物 br/   5、多官能团化合物 br/ strong   五、由质谱图推测分子结构 /strong br/   1、基本方法及思路 br/   2、实例练习 br/   六、NIST谱图库检索实用技术 br/   1、NIST谱图库简介 br/   2、NIST谱图库主要功能 br/   3、NIST谱图库检索实例 br/ strong br/   授课专家: /strong br/ strong   1、王光辉 /strong 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》; br/ strong   2、苏焕华 /strong 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》; br/ strong   3、李重九 /strong 中国农业大学理学院应用化学系教授,农残分析领域著名质谱专家,在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作《有机质谱应用:在环境、农业和法庭科学中的应用》 br/ br/    strong 举办时间/地点: /strong br/   2017年05月16日-19日 北京-外国专家大厦 br/ strong br/   培训费用: /strong br/   每人3800元,2人以上组团报名可每人优惠100元(含报名费、培训费、资料费、培训期间每日午餐费用) br/ br/ strong   报名咨询: /strong br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 联系人:李老师 br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 电话:010-51654077-8119& nbsp & nbsp & nbsp br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 手机:15910410867& nbsp br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 邮箱:liru@instrument.com.cn /p
  • 关于举办“有机质谱谱图解析专题培训”进阶培训班通知
    各企事业单位:  近年来,有机质谱分析因基于不同质量数的带电离子在电场或磁场中的不同运动行为的原理进行定性或定量分析,具有灵敏度高、样品用量少、分析速度快、可同时进行多组分分析等优点,在我国发展很快,其被广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为一种非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析是基于对质谱谱图的解析实现的,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不容易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。为适应广大分析技术工作者的需求,信立方质谱培训中心于2016年5月24~27日在北京外国专家大厦(华严北里8号院)举办“第14期有机质谱谱图解析专题培训班”,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员来参加。一、培训对象:  各企事业单位、科研院所从事食品卫生、生物医药、检验检测、石油化工、环境监测及生物科技等使用有机质谱联用仪进行常规检测、科研或研发的技术人员,以及各大专院校相关专业在校研究生及分析中心等技术人员。二、授课专家:  □王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》;  □苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。著有《色谱-质谱联用技术及应用》等专著。  □李重九 中国农业大学理学院应用化学系教授,农残分析领域著名质谱专家,在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作《有机质谱应用:在环境、农业和法庭科学中的应用》三、授课大纲:四、授课方式  (一)课程讲座; (二)专题小组研讨与案例讲解分析结合。五、培训费用:  每人3800元(含报名费、培训费、资料费、午餐费),食宿可统一安排,费用自理。  六、报名联系:  联系人:李老师 15910410867  电 话:010-51654077-8119  传 真:010-82051730  E_mail:liru@instrument.com.cn 在线报名:http://form.mikecrm.com/iVCBG2
  • 第十六期(2017年)有机质谱谱图解析应用技术培训班下周二(5月16日-19日)如期召开
    p   信立方培训中心(仪器信息网旗下培训中心)致力于质谱应用技术培训工作。为提高相关从业人员的技术水平,使质谱更好地为科研、生产工作服务,适应当前从事质谱应用技术科技人员的迫切需求,自2009 年起,先后开设了近四十期不同类型和层次的质谱技术培训班,受到广大学员欢迎和好评。 br/   为适应广大分析技术工作人员的需求,信立方培训中心将于2017年6月21日-23日在北京举办2017年GC-MS气质联用应用技术培训班,诚邀有志提高气质联用应用技术水平的分析人员前来报名 br/    strong 授业解惑: /strong br/   1、讲授气质联用仪(GC-MS)结构、性能评价及离子源,真空系统,质量分析器等核心部件功能,系统、深入掌握气质联用技术; br/   2、讲授气质联用定性& amp 定量分析方法,谱库检索及结果判断,为石化,农残等日常应用分析方法开发,定性定量分析奠定坚实基础; br/   3、讲授仪器离子源等关键部件日常维护要求,提高仪器的实际操作水平 br/   课程内容: br/   一、GC-MS仪器结构、功能和主要性能指标 br/   1、仪器各个组成部分的结构和功能:GC系统(进样器、柱箱、色谱柱气路系统)、MS系统(离子源、质量分析器、检测器)、真空系统(真空机组、真空测量、连接件)、数据系统(硬件、软件)。 br/   2、仪器主要性能指标:质量范围、分辨率、灵敏度、扫描速度。 br/ strong   二、GC-MS离子化方法及质量分析器 /strong br/   1、离子化方法: EI离子化方法、CI离子化方法。 br/   2、质量分析器:四极质量分析器、离子阱质量分析器。 br/   strong  三、GC-MS联用技术的定性、定量方法及应用 /strong br/   1、GC-MS联用定性分析:GC和MS定性分析存在问题及解决办法、GC-MS联用技术定性重要依据及优势 br/   2、GC-MS联用定量分析:GC-MS联用技术定量方法的建立、GC-MS扫描技术及其应用 br/   3、定量分析中质量保证和质量控制 br/ strong   四、GC-MS联用操作技术和常规维护 /strong br/   1、真空的重要性和常见问题 br/   2、联用中GC需要注意的问题 br/   3、仪器调谐参数及调谐结果判断 br/   4、GC-MS数据采集和数据处理需要注意的问题 br/   5、谱库检索的前提和检索结果的判断 br/   6、维持仪器正常运行需要的常规维护培训 br/   strong  授课专家: /strong br/   strong  1、王光辉 /strong 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》; br/   strong  2、苏焕华 /strong 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》; br/    strong 3、李重九 /strong 中国农业大学理学院应用化学系教授,农残分析领域著名质谱专家,在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作《有机质谱应用:在环境、农业和法庭科学中的应用》 br/   strong  4、张颖& nbsp /strong 所在中石化北京化工研究院,长期从事分析化学研究工作。主要研究领域包括质谱、色谱分析;研究方向:聚烯烃催化剂等固体催化剂的表征及催化机理研究;聚合物及加工助剂、VOC的分析方法研究;化工产品中痕量杂质的分析方法研究等。曾获省部级科技进步奖三次,申请授权专利发明20余件,发表文章40余篇。 br/   strong  举办时间/地点: /strong br/   2017年6月21日-6月23日 北京-外国专家大厦 br/    strong 颁发证书: /strong br/   参加相关培训并通过考试的学员,可以获得: br/   由信立方培训中心颁发并有授课老师签字的结业证书。该证书可作为有关单位专业 br/   技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。 br/    strong 培训费用: /strong br/   每人3500元,2人以上组团报名可每人优惠100元(含报名费、培训费、教材资料费、培训期间每日午餐费)。晚餐、住宿可统一安排,费用自理。 br/ strong   报名咨询 br/ /strong   联系人:李老师 15910410867 br/   电 话:010-51654077-8119 br/   传 真:010-82051730 br/   E_mail:liru@instrument.com.cn /p
  • 信立方培训中心“第11期有机质谱谱图解析”培训班在京成功举办
    2015年05月26-29日由信立方培训中心在北京举办&ldquo 第十一期有机质谱谱图解析&rdquo 培训班,历时四天,于2015年05月29日圆满落幕。 近有24家企业,共计30多位参加。  本次培训由中国科学院化学研究所质谱中心研究员王光辉、北京石油化工科学研究院苏焕华、天津大学材料科学与工程学院范国樑三位老师进行授课讲解。四天的课程从有机质谱与分子结构关联的角度,深入讲述与质谱谱图解析紧密相关的奇电子偶电子规则,氮规则,分子离子识别,离子丰度,离子碎裂规律等核心概念。介绍各类典型有机化合物---碳氢化合物、(脂肪烃,炔,芳烃等),醇,醚,酮,醛,羧酸,酯,胺,卤代物,硝基化合物等的裂解及质谱规律,并以丰富的实例讲述从质谱图推测分子结构的基本方法。 此次培训学员反映很有收获,通过参加此次培训班也与业内的其他同行进行了交流。 中国科学院化学研究所质谱中心研究员 王光辉 天津大学材料科学与工程学院 范国樑 北京石油化工科学研究院高级工程师苏焕华 学员认真听讲 王光辉老师给学员认真讲解实际遇到的问题 苏焕华老师现场讲解学员的疑问 学员与王光辉、范国梁老师的合影 学员与苏焕华老师的合影 联系人:李老师 电 话: 010-51654077-8119 手 机:15910410867 邮 件:liru@instrument.com.cn 更多培训班相关动态,请关注信立方培训中心微信公众号:training17
  • SYNAPT系列高分辨质谱又一力作 | 南开李功玉团队:助力微小差异蛋白构象高效解析
    研究背景蛋白质分子在真实生命条件下的结构和功能特性往往受多种环境因子调控,包括配体分子、缓冲条件以及各种类型翻译后修饰等。作为一种常见的翻译后修饰,蛋白不稳定聚糖修饰,例如糖基化中的唾液酸化修饰,在各种生物过程中发挥着至关重要的作用。然而,由于天然可变性和环境敏感性,在完整蛋白水平研究唾液酸化修饰的构效关系一直缺乏合适的结构分析手段。论文简介近日,南开大学李功玉课题组(研究方向:大分子结构质谱分析)与福州大学李金宇课题组(研究方向:计算化学生物学与药物化学)合作,发展《糖型分辨去折叠离子淌度质谱》方法,利用课题组自主开发的《结构质谱指引下的分子动力学模拟》技术,成功揭示了唾液酸化修饰与糖蛋白构象稳定性之间的复杂关系(Chem. Sci. 2024, DOI: 10.1039/D4SC03672G)。该研究通过对唾液酸化模式、化学计量学信息及其对构象稳定性影响的综合分析,系统阐明唾液酸化调节蛋白质动态三维结构的分子机制,为蛋白低丰度翻译后修饰结构的快速高效解析提供一种新思路。该工作是李功玉课题组在《构象分辨质谱分析》领域的应用方法学拓展与深化,通过发展全离子去折叠、非变性离子淌度质谱和全原子分子动力学模拟技术,使构象分辨质谱分析从小肽(Angew. Chem. Int. Ed. 2023, e202314578 Chem. Sci. 2023, 5936-5944 Anal. Chem. 2023, 2221-2228)跨越至大蛋白(Chem. Sci. 2024, DOI: 10.1039/D4SC03672G Anal. Chem. 2023, 10895-10902 Anal. Chem. 2022, 2142-2153),成功实现微小差异的蛋白动态构象的快速高效分辨分析,有效提高了结构质谱解析气相蛋白动态构象的结构分辨率(Nat. Commun. 2019, 10, 5038),属于化学测量学领域质谱分析方向的前沿研究课题。研究亮点开发了一种糖型分辨蛋白构象去折叠策略,通过课题组前期报道的全离子去折叠 (AIU) 与非变性离子淌度质谱 ( Native IM-MS ) 联用技术,实现了对不同糖型蛋白质构象的稳定性快速分析和动态去折叠过程的可视化追踪(Chem. Sci. 2024, DOI: 10.1039/D4SC03672G)。通过自主构建的定量分析构象参数,定量揭示唾液酸化对蛋白构象稳定性的调控作用,首次发现唾液酸化可以稳定蛋白质构象,并限制其动态构象转变(Chem. Sci. 2024, DOI: 10.1039/D4SC03672G)。将课题组前期(Chem. Sci. 2023, 5936-5944)提出的《结构质谱指引下的分子动力学模拟》新思路,首次拓展至大蛋白( 80 kDa)结构解析。利用这种独创结构质谱解析平台,课题组近期成功解析蛋白气相去折叠的新型分子机制(Chin. Chem. Lett. 2024, in press),发现富含片层的结构域优先去折叠,并观察到 β-片层到 α-螺旋的动态转变,同时证明 α-螺旋比 β-片层具有更高的稳定性。该方法具有较强的广泛适用性,未来可应用于几乎所有蛋白体系。研究内容首先,为了表征不同胎球蛋白的唾液酸化模式,作者进行了基于 EThcD 的自下而上的糖蛋白质组学实验,图 1b 总结了牛胎球蛋白(bFT)和人胎球蛋白(hFT)的位点特异性糖基化模式。值得注意的是,具有两个唾液酸的糖型在 bFT 中占主导地位,而具有一个唾液酸的糖型在 hFT 中最为丰富(图 1c)。图1. bFT 和 hFT 的糖基化模式为了探究完整蛋白质结构与特定糖型之间的联系,作者开发了一种糖型分辨去折叠策略,该方法结合了非变性离子淌度质谱(Native IM-MS)与全离子去折叠(AIU)技术。通过优化转移池电压, hFT 的氧鎓离子和主要蛋白形式(电荷状态 12+ 、 13+ 和 14+)都得到了很好的分离,通过糖型分辨去折叠实验确定的糖型也与糖蛋白组分析一致(图 2b)。为了更加直观地比较蛋白质构象,作者为每种糖蛋白生成了 AIU 指纹图谱。实验结果表明,随着唾液酸数量的增加,第二个构象与第三个构象之间的 CCS 值差异逐渐缩小。此外,三唾液酸化的 hFT 具有四个构象,而其他唾液酸形式则具有五个构象,由此说明唾液酸的数量可能与胎球蛋白的构象灵活性有关(图 2c)。图2. 糖型分辨全离子去折叠可视化图谱为了进一步阐明唾液酸化诱导的蛋白质结构变化,作者量化了一系列的构象参数,包括 CCS 、 AIU50 等。第一个构象转变(T1)的 AIU50 值随着唾液酸个数增加而升高(图 3b 和 3f),这意味着唾液酸化会稳定糖蛋白结构,作者推测这可能是通过促进唾液酸和蛋白质结构域之间的额外静电相互作用和氢键作用实现的。值得注意的是,在 hFT 的第二个转变(T2)中观察到了相反的趋势,作者推测可能是唾液酸化在一定程度上促进了蛋白质的构象灵活性(图 3f)。之后,作者利用展开曲线来量化去折叠比例,并绘制了关于唾液酸化构象稳定性和动态转换的图谱。通过监测 CCS 变化百分比与碰撞电压的关系,绘制了展开曲线(图 3c 和 3g)。展开曲线显示,随着唾液酸数量的增加,去折叠起始能量逐渐增加,这表明存在明显的依赖唾液酸数量的展开趋势。同时,糖型分辨去折叠策略放大了构象差异, bFT 和 hFT 的 RMSD 分别为 5.9%~20.8% 和 7.7%~20.9% (图 3d 和 3h)。这些发现凸显了基于 AIU 方法在表征由不稳定的聚糖修饰诱导的细微构象变化方面的优势。图3. 糖型分辨去折叠定量分析胎球蛋白构象稳定性最后,为了研究唾液酸化与蛋白质结构之间的相互作用,作者使用唾液酸水解酶对 bFT 进行消化,同时通过分子动力学模拟进一步阐明了气相中 Asn99 和 Asn156 唾液酸化对蛋白动态构象变化的影响。唾液酸化与去唾液酸化牛胎球蛋白的 MD 结果都表现出四个构象,且具有可接受的 CCS 误差(图 4d)。唾液酸化亚型(646.8 K)的熔解温度(Tm)高于去唾液酸化亚型(642.1 K),表明唾液酸化有助于维持蛋白质构象(图 4e)。对去折叠中间体中 α-helix 和 β-sheet 结构占比的分析表明,唾液酸化有利于维持 bFT 中二级结构的适当折叠(图 4f)。加热过程中的代表性展开特征(图 4g )表明唾液酸化聚糖可以包裹并紧实蛋白质结构。综上,作者认为末端唾液酸化稳定了胎球蛋白构象并限制了其动态结构波动。图4. 唾液酸化对胎球蛋白构象的稳定作用该研究为深入理解蛋白质不稳定聚糖修饰的结构和功能提供了新的见解,为疾病诊断和治疗提供了新的理论基础。同时,该研究也为开发新的蛋白质结构解析方法提供了新的思路。相关研究成果以“Sialylation-induced stabilization of dynamic glycoprotein conformations unveiled by time-aligned parallel unfolding and glycan releasing mass spectrometry”(《构象分辨质谱助力微小差异蛋白构象高效解析》)为题在线发表于化学领域重要期刊、英国皇家化学会旗舰期刊 Chemical Science 上。 南开大学化学学院 2022 级硕士研究生王雅梅、科研助理贾翼菲以及南通大学刘以畅博士为该文共同一作。李功玉研究员和李金宇教授为本文共同通讯作者。美国威斯康星大学麦迪逊分校李灵军教授和刘源博士对本项目提供了重要的技术支持。本文主要质谱数据均采集于天津《物质绿色创造与制造海河实验室》结构质谱分析平台。本研究工作获国家重点研发计划、国家高层次人才计划、国家自然科学基金和中央高校基本科研业务费等项目资助。另附:南开大学李功玉课题组(详细信息请参考课题组主页:李功玉课题组 ( x-mol.com ))常年招聘科研助理和师资博士后,欢迎对大分子结构质谱感兴趣的同仁联系(ligongyu@nankai.edu.cn),重点引进具有有机合成化学、计算化学、细胞生物学和蛋白质组学等背景的相关研究方向人才。论文信息Sialylation-induced stabilization of dynamic glycoprotein conformations unveiled by time-aligned parallel unfolding and glycan releasing mass spectrometryYifei Jia, Yichang Liu, Yamei Wang, Jinyu Li* and Gongyu Li*Chem. Sci., 2024https://doi.org/10.1039/D4SC03672G作者简介 王雅梅 硕士研究生南开大学本文第一作者,2022 年本科毕业于南京师范大学,同年保送至南开大学化学学院攻读硕士学位(导师:李功玉研究员),研究课题主要聚焦疾病相关蛋白的结构质谱解析新方法开发。 刘以畅 讲师 南通大学 本文共同第一作者,2022 年于福州大学获物理化学博士学位(导师:李金宇教授),现任南通大学药学院讲师,研究方向为计算化学生物学与药物化学。 李功玉 研究员南开大学本文通讯作者,南开大学化学学院,特聘研究员、博士生导师。国家高层次青年人才计划入选者、国家重点研发计划青年项目首席科学家。2017 年博士毕业于中国科学技术大学化学系,随后在密西根大学和威斯康星大学麦迪逊分校完成博士后研究,于 2021 年 2 月加入南开大学化学学院,研究方向为大分子结构质谱分析。 李金宇 教授福州大学本文共同通讯作者,教授、博士生导师,福州大学化学学院院长助理。2011 年于荷兰阿姆斯特丹大学和法国里昂高等师范学院获化学与材料学双硕士,2015 年于德国亚琛工业大学医学院获生物学博士学位,同年于德国于利希研究中心先进模拟研究院从事博士后研究,2016 年加入福州大学化学学院、生物药光动力治疗技术国家地方联合工程研究中心。研究方向为蛋白质计算化学生物学理论方法开发与应用。本文说明了离子淌度技术在蛋白构象研究中的重要作用。沃特世一直致力于不断开发创新质谱相关技术,如特色离子淌度技术、特色成像技术等,同时以“助力客户成功”为使命,期待更多的用户合作及科学成果!
  • 科技日报:广东质谱技术攻克PM2.5污染来源解析难题
    原文链接:http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2014-01/10/content_242044.htm?div=-1 科技日报讯 (刘笑楠 刘丹)近日,从广州禾信分析仪器有限公司传来喜讯,该公司经过10年努力,打破国外技术封锁,已开发出具有完全自主知识产权的基于单颗粒气溶胶质谱直接测量法的“在线源解析技术”,成功攻克了实时、快速弄清PM2.5污染物来源的这个世界性技术难题。 据介绍,应用禾信公司的这项技术成果,可在1小时内直接得到污染来源信息。它无需样品前处理,可以快速对一个一个的细颗粒进行分析,同时测量其直径和化学成分。和传统方法比较,检测速度可提高1000倍,检测成本降低100倍,有望成为大规模解决多城市PM2.5污染来源连续解析这一问题的关键工具。 该技术,不仅能够快速实现“说得清”空气污染有多严重,还能快速“说得清”污染是什么、从哪里来,进而开展准确、及时的实时动态源解析工作,迅速判断主要污染源及其影响程度,确定优先治理对象,满足极端条件下第一时间进行空气污染预警及应急的高要求,为PM2.5污染评估、治理等提供快速、准确的决策支撑。 该技术主要负责人周振博士谈到,“在多位院士的指导和国家863项目的支持下,早在7年前就开始提早布局,集合国家及社会资本,我们瞄准大气灰霾和PM2.5污染问题专心开发核心技术。在这过程中顶住各种压力,4000多万元投入,终于成功研制出这台能够用于PM2.5与灰霾研究的大型高端质谱仪器。” 前不久,由广州市环境监测中心站和广州禾信分析仪器有限公司联合制定的我国首个PM2.5在线源解析工作方案——《广州市环境空气PM2.5在线源解析(质谱直接测量法)工作方案》通过专家论证。来自国内权威单位的资深环保专家组一致认为,PM2.5在线源解析技术,采用国际先进的全新质谱技术手段,具有显著创新性。 目前,禾信公司是全球PM2.5在线源解析技术方案的唯一供应商;已经在包括广州、北京、上海、石家庄、南京等全国20多个城市开展监测,将在我国的大气环境监测、环境研究等领域中发挥重要的不可替代作用。“当然,再下一步,科学家们还将利用这个技术,研究污染物组成、污染来源与健康的关系等一系列重要问题。”周振补充说。 图为中国环境保护部总工程师万本太在广州禾信专题调研在线源解析技术。万本太评价该技术是对传统源解析技术的一种发展创新和重要补充,将在我国大气污染来源监测与分析工作中发挥重要作用。
  • 质谱直接测量法解析PM2.5来源技术通过论证
    PM2.5的防治问题一直备受关注,要先弄清PM2.5颗粒的来源才能有效进行防治。记者获悉,广州即将启动PM2.5在线源解析工作,该新技术可在线快速获得PM2.5单颗粒的化学物质构成,并及时判断主要污染物来源及其影响程度。据悉,日前,《广州市环境空气PM2.5在线源解析(质谱直接测量法)》项目研究工作方案已通过专家论证。   市环境监测中心站负责人向记者介绍,大气颗粒物的污染物来源解析技术(质谱直接测量法)则是通过化学、物理学、数学等方法定性或定量识别环境受体中大气颗粒物污染的来源。对颗粒物的化学组成进行定性和定量检测,剖析其主要来源及形成机理,掌握主要污染源的排放及其影响程度,为形成区域环境空气污染综合整治提供科学依据。   2012年6月,广州市市长陈建华曾公开透露,广州PM2.5最主要的来源是三类, 一是工业企业的燃煤,去年广州燃煤2894万吨 二是汽车尾气,这两部分在PM2.5的占比为36%~40%,是造成PM2.5浓度超标的主要原因 第三就是餐饮业的油烟,占比高达10%~12%,其他来源包括建筑工地扬尘、马路扬尘以及秸秆焚烧等。   但是,市环保局有关负责人表示,传统污染物的源解析是以手工采样和实验室检测为基础,过程所需时间跨度较长,时效性较差,实时污染源控制目标指导能力较弱,已难以满足预防需求。
  • 上海交通大学丁显廷/林关宁团队提出单细胞质谱流式技术数据分群方法的基准分析框架
    2019年,上海交通大学丁显廷教授和林关宁教授团队联合在Genome Biology上发表了题为“A Comparison Framework and Guideline of Clustering Methods for Mass Cytometry Data”的文章。 该文章从准确性(precision)、一致性(coherence)和稳定性(stability)三个层面由浅入深地阐明了不同单细胞质谱流式技术(CyTOF)细胞族群分析方法的优劣及其适用场景。这是国际一线杂志第一次报道中国大陆学者在单细胞质谱流式技术数据标准化和分析方法学方面的工作。相比传统荧光标记的流式细胞术,CyTOF技术采用金属同位素标记抗体,避免了荧光重叠和自荧光消除的问题,可在单细胞水平同时测量数百万细胞中近百种蛋白质的表达量。这种同时获取高维度蛋白质的超强能力使得CyTOF技术在药物优化、疫苗开发和疾病标记发现方面具有重要的应用价值。然而,迄今为止CyTOF技术的数据标准化、样本和数据的质量控制、分析方法学,主要还是基于欧美学者提出的Accense,PhenoGraph和Xshift等分析方法。虽然这些分析方法已被广泛应用于不同的领域和临床研究,但是很多研究者对于采用哪个方法能更好地分析个体化的数据仍然存在疑惑。在这篇文章中,研究人员在三类异源(骨髓细胞、肌肉组织、结肠组织)6个单细胞组学的数据集上对目前经典的无监督和半监督细胞分群方法进行了基准分析和深度比较。在准确性(precision)分析上,根据四种内部评价指标(Accuracy,F-measure, NMI和ARI)讨论了不同方法对细胞进行分群的准确性;在一致性(coherence)分析上,利用三种外部评价指标(DB,CH和XB)探讨了细胞分群方法揭示细胞数据内部本质结构的能力;在稳定性(stability)分析方面,研究了随细胞采样数量变化,不同方法的准确性和识别出的细胞亚群数量的鲁棒性。此外,这篇文章还讨论了分群方法的分群分辨率,发现PhenoGraph和Xshifit能够识别出更细粒度的亚群(亚群数量偏多),而DEPECHE倾向于识别粗粒度的亚群(亚群数量偏少)。图1 CyTOF数据细胞分群方法的选择决策树综合上述框架的分析结果,这篇文章为单细胞质谱流式分析领域的研究者,特别是初学者以及没有生物信息学基础的研究者,提供了细胞分群方法的选择决策树。图2 聚类方法的稳定性分析上海交通大学生物医学工程学院个性化医学研究院是中国最早建立起单细胞质谱流式技术的单位之一,并已初步实现技术向临床应用的转化,先后利用单细胞痕量蛋白分析技术完成了寄生虫耐药、银屑病、结肠癌、肺结核方面的相关临床应用研究。刘晓博士、宋炜宸博士生是论文的第一作者。丁显廷教授和林关宁教授是论文的通讯作者。相关研究得到国际人类表型组计划、国家传染病重大专项、上海市高峰高原学科建设计划、国家自然科学基金等项目的支持。
  • 关于举办“第十五期有机质谱谱图解析最新应用技术”专题培训班邀请函
    p strong 各企事业单位: /strong br/   信立方培训中心致力于有机质谱应用技术培训工作。为提高相关从业人员的技术水平,让有机质谱更好的为科研、生产及研发工作服务,适应当前从事质谱应用技术科技人员的迫切需求,培训中心考察了全国各类有机质谱应用技术培训现状,借鉴并发扬培训成效显著的全国有机质谱应用技术培训班的成功经验,与仪器行业最大的门户网站仪器信息网合作,从2009 年开始,开设了三十期不同类型和层次的质谱培训班,受到广大学员欢迎和好评。 br/ br/   近年来有机质谱在我国发展很快,广泛应用于食品安全、环境保护、化学化工、制药、生命科学、材料科学等各个领域,成为日常工作中非常重要的定性定量分析方法。质谱的定性分析基于对质谱谱图的解析而实现,但由于有机化合物种类繁多,繁杂的裂解规律不易记忆,又缺乏解析的思路和方法,很多质谱分析人员在拿到谱图后常感觉到无从下手。 br/ br/   为适应广大分析技术工作者的需求,信立方培训中心将于 strong 2016年11月29日-12月2日 /strong 在北京举办第十五期有机质谱谱图解析专题培训班,欢迎有志提高有机质谱谱图解析水平的分析人员前来参加。   br/ br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 培训目标:系统掌握有机质谱谱图解析的基本方法,了解有机化合物的裂解反应类型和基本裂解规律,结合实例讲解谱图解析的基本思路和方法,为有机质谱的定性分析打下坚实基础。   br/ br/ & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 培训时间:2016年11月29日-12月2日 br/   培训地点:北京外国专家大厦   br/ br/ strong 授课专家: /strong br/   1、王光辉 中国科学院化学研究所质谱中心研究员,中国最早从事质谱研究的专家之一,参与了国内多项质谱仪器的研发工作,有丰富的理论知识、实践经验和培训教学经验。代表著作:《有机质谱解析》; br/   2、苏焕华 北京石油化工科学研究院高级工程师,70年代初开始有机质谱应用研究,参与了国内质谱仪器的研发工作,组织过多种质谱应用技术培训,有丰富的教学经验。代表著作:《色谱-质谱联用技术及应用》; br/   3、李重九 中国农业大学理学院应用化学系教授,农残分析领域著名质谱专家,在大学主讲色谱、质谱等仪器分析课程。代表著作《有机质谱应用:在环境、农业和法庭科学中的应用》 /p p & nbsp /p p strong 授课大纲: /strong /p p img title=" 01.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201610/insimg/82a14715-0d24-4ede-9659-383e16db9321.jpg" / br/ strong br/ 培训费用: /strong br/   每人3800元(含报名费、培训费、资料费、培训期间每日午餐费用)。 br/ br/ strong 颁发证书: /strong br/   参加相关培训并通过考试的学员,可以获得: br/   由信立方培训中心颁发并有授课老师签字的结业证书。该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。   br/ br/ strong 报名咨询: /strong br/   电话:010-51654077-8119 br/   手机:15910410867 br/   传真:010-82051730 br/   邮箱:liru@instrument.com.cn /p
  • ESI Q-TOF质谱分析PEG化蛋白药物方法简介
    贾伟 沃特世科技(上海)有限公司实验中心 PEG修饰蛋白及多肽类药物后,可在不产生毒性、不损害药效的情况下,通过增加蛋白类药物的溶解性、减少免疫原性、增加稳定性、延长体内药物半衰期等功效增强大分子药物的疗效。PEG的这种功效在1970年代后期被发现,到了1990年PEG化修饰的Adagen被美国FDA批准,至今已有若干个PEG修饰的大分子药物上市销售,这些药物在癌症、肝炎、痛风、糖尿病等疾病治疗中为患者带来了福音。 明确PEG修饰位点、确定修饰位点的数量、以及表征PEG的聚合度分布性是PEG化大分子药物运用于临床前以及药品质量监控必须且非常重要的工作。由于PEG的高分子聚合物性质,由PEG修饰后的蛋白及多肽的结构变得极为复杂。在早期对其进行质谱分析,特别是对PEG的聚合度分布性分析方面,多使用MALDI离子源类型的质谱。这是因为MALDI源离子化的样品,所带电荷数较少(单电荷离子居多),因此其质谱图相对简单;而通过ESI源离子化的样品将携带多个电荷,这使离子信号复杂,致使其质谱图谱较难解析。随着LC-ESI技术的发展, 美国Indiana大学的Lihua Huang等学者通过在色谱分析柱后加胺的技术,使样品的ESI离子化时的荷电数适当减少,从而使PEG化样品的ESI图谱得到高效的解析[1]。而MALDI TOF类质谱由于质谱分辨率的限制(目前MALDI TOF分辨率在8万内),面对分子量动辄十几万甚至更高的PEG化蛋白,其可获得的数据质量较差,因而MALDI方法可得到的PEG化蛋白的有效结构信息非常有限。 Lihua Huang等学者进一步开发了ESI Q-TOF分析PEG化蛋白的修饰位点的质谱方法[2]。这种方法包括源内裂解(ISF,In Source Fragmentation)与二级质谱(MS/MS)两个步骤。在第一步ISF过程中,PEG化多肽的PEG部分被裂解而变短;在第二步MS/MS过程中,多肽被打碎产生b、y离子碎片。通过分析携带缩短的PEG链的b、y离子信息,最终得出确切的PEG化修饰位点。ISF与MS/MS为什么可以分别 &ldquo 选择&rdquo 碎裂PEG化多肽的PEG与多肽两个部分呢?推测与PEG化多肽的电荷分布有关。在PEG化多肽的离子化过程中,PEG的醚键附着了大量的H+,并在ISF下完全断裂,而使冗长的P EG链缩短到一两个单位大小。之后的MS/MS过程中,由于缩短的PEG链已无H+附着不再断裂。而多肽在MS/MS中获得了碎裂的机会,并产生携带&ldquo PEG短标签&rdquo 的b、y离子碎片。论文中,研究人员运用此方法成功地分析了IgG4与胰高血糖素的PEG修饰位点。 参考文献 (1) Huang L, Gough PC, Defelippis MR. Characterization of Poly(ethylene glycol) and PEGylated Products by LC/MS with Postcolumn Addition of Amines. Anal Chem. 2009, 81, 567-577. (2) Lu X, Gough PC, DeFelippis MR, Huang L. Elucidation of PEGylation site with a combined approach of in-source fragmentation and CID MS/MS. J Am Soc Mass Spectrom. 2010, 21, 810-818
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