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质谱联用数据分析

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质谱联用数据分析相关的资讯

  • 天津工生所建立无标定量MSE质谱数据分析流程
    超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)已经成为蛋白质组学、代谢组学以及药代动力学研究中的一项核心支撑技术,通过对不同生物样品的定量研究可以全面、精细地表征该生物体系的生理特性及预测功能。在用于蛋白质组学的质谱分析中,无标定量以其稳定性和安全性逐渐占据了主要地位。MSE方法是由Waters公司开发的应用在Q-TOF类型质谱仪器上的一种组学数据采集方法,作为一种数据独立获取(DIA)方式,它可以提高无标蛋白质定量的准确性和动态范围。但由于它特殊的输出格式形式,一些致力于分析数据依赖型(DDA)数据的常用开源软件不能对MSE 数据进行进一步的分析。   近日,中国科学院天津工业生物技术研究所水雯箐研究组成功建立了对基于MSE方法的无标定量蛋白质组学数据的新分析流程。在该研究中,结合开源软件Skyline和统计软件Diffprot建立起的工作流程,实现了对无标定量MSE质谱数据的定量分析。通过对磷酸化肽段和全细胞质蛋白质组定量数据的分析应用,验证了新开发流程的可靠性、稳定性、准确性和透明便捷的处理流程。另外,该研究创新性地发现改进后的新流程也可以应用于对小分子化合物的大规模定量分析,在蛋白质配体相互作用实验中,研究人员利用该新流程发现了针对药物靶点蛋白NDM1的新型小分子配体。   该研究获得国家自然科学基金和天津自然科学基金项目的支持,相关研究成果已经发表于Proteomics (2014,14:169&ndash 180),天津工生所和南开大学联合培养的研究生刘姗姗为第一作者。    无标定量MSE数据分析流程图
  • 岛津成像质谱显微镜应用专题丨质谱成像数据分析利器
    镜质合璧 还原真实质谱成像数据分析软件IMAGEREVEAL MS 简化常规分析您还在担心浪费宝贵的时间或丢失有价值的数据?利用IMAGEREVEAL MS可自动从大量数据中发现重要信息。 IMAGEREVEAL MS工作流程 主要特点 只需3步即可完成数据处理✦ 利用“整合分析”模式在“整合分析”模式下通过预设参数可自动获取具有显著特征的质谱图像。这一功能非常便于用户以同样方式处理大量数据。用户只需执行一步操作即可创建基于差异分析和/或图像分析的数据列表、进行数据统计分析以及获取质谱图像。 使用“整合分析”的示例在“整合分析”模式下,软件会自动选取NASH组织中与正常组织相具有特殊性的质谱图像。 多种分析模式3个分析模式示例对NASH(非酒精性脂肪性肝炎)小鼠肝脏的分析NASH(非酒精性脂肪性肝炎)是指一种与饮酒无关的脂肪肝疾病。 1找出NASH组织特有的分子差异分析 2查找与染色图像分布相似的分子图像分析 3创建显示目标分子浓度分布的质谱图像定量分析 处理多种格式数据利用自带的数据转换工具“IMDX Converter”可以将多种格式的数据转换为IMAGEREVEAL MS可读取的imdx格式。 * 无法保证转换其他仪器中的所有数据。有关数据转换的实际结果,请参阅产品介绍网站。 其他功能1靶向分析/非靶向分析靶向分析:基于列表中目标m/z值进行分析,如脂质或代谢物等。此外,还可以创建自定义列表。 非靶向分析:在指定的质量范围内对所有m/z进行分析。可用于检查该范围内包含的有意义的m/z值。 化合物列表 2同时处理多个质谱图像数据文件本软件可以同时处理多个数据文件,并且一次性导入所有数据后即可进行图像对比,操作简单。分析大数据无需拆分,可直接分析达几百GB的数据文件。30天试用版IMAGEREVEAL MS包含所有功能,如有需要可登录以下网站或点击文末“阅读原文”前往下载。https://www.shimadzu.com/an/lifescience/imaging/reveal.html 本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。
  • 岛津发布全新IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件
    p & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 近日,岛津公司宣布发布IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件。该软件可以不需要任何额外的时间或麻烦,即可从多种角度分析数据,从而简化了数据分析过程。它特别适合用于分析大数据集或者同时分析多组数据。岛津将在9月5日至7日举办的JASIS展会上展示这款软件。 /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/9aa35697-5099-45a4-9d58-757dd3bbe885.jpg" title=" imagereveal_ms.jpg" / /p p style=" line-height: 1.5em " & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 质谱成像技术主要用于分析二维图像,这些图像显示了用质谱仪测定的物质的分布情况。近年来,在空间分辨率和质量精度方面的技术进步使得质谱产生了大量的数据,这对数据分析产生了极大的挑战。 /p p style=" line-height: 1.5em " & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件可以通过轻松搜索大量质谱成像数据的功能,从而获得所需信息来解决上述问题,这可显著提高研究效率。该软件包括六种类型的数据分析功能,具有不同的可用功能,具体取决于客户选择的许可证。数据转换器可用于分析非岛津质谱仪测量的数据。 /p p style=" line-height: 1.5em " & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp IMAGEREVEAL MS软件起源于同九州大学医疗氧化还原导航创新中心的联合研究。自2006年以来,岛津通过提供一系列质谱系统和专门知识,作为合作伙伴参与了该项目。从2012年到2016年,岛津公司与三菱田边制药公司合作开发了质谱数据软件,该软件能够无缝分析从基质辅助激光解吸/电离质谱仪(MALDI-MS)上得到数据。所得到的原型均是IMAGEREVEAL MS软件研发的基础。 /p p br/ /p
  • 热分析/红外光谱联用的数据分析方法 第6部分 在Origin软件中GS曲线、FGP曲线以及实时红外光谱图(EGS图)的作图法
    p   本文转载自微信公众号热分析与吸附,作者为中国科学技术大学丁延伟老师,并已获转载授权。 /p p strong    /strong 在《热分析/红外光谱联用的数据分析方法第4部分 仪器分析软件中热重部分的数据处理与作图》和《热分析/红外光谱联用的数据分析方法第5部分 仪器分析软件中红外光谱部分的数据处理与作图》中以实验室在用的美国PerkinElmer公司的热重/红外光谱/气相色谱质谱联用仪为例简要介绍了在仪器的数据分析软件中与热重部分和红外光谱部分相关的数据处理与作图相关的内容,在本部分内容中将简要介绍在Origin软件中GS曲线、FGP曲线以及实时红外光谱图的数据处理与作图相关的内容。由于在Origin软件中不同时刻/温度下的三维红外光谱作图十分繁琐,将在本系列内容第7部分中进行介绍。 /p p   为了保持本系列内容的完整性,以下介绍的大部分内容主要来自本公众号2019年10月6日发布的《在Origin软件中热分析/红外光谱联用的数据作图方法》一文,其中做了相应的修改并增加了实时红外光谱图(EGS图)的内容。 /p p   1. GS曲线的作图法 /p p   一般来说,在由红外光谱分析软件Timebase得到的Excel格式的文件中主要有EGP曲线(即通常所说的GS曲线)文件和不同时刻温度下的逸出气体红外光谱图(即EGS)文件,一共两个文件。 /p p   GS曲线可以直接由导出的Excel格式的GS曲线文件得到,通常说的官能团剖面图(即FGP曲线)可以由EGS文件中导出。 /p p   在Origin软件中对GS曲线的作图十分简单,在Origin软件中导入曲线所对应的Excel文件(图1至图3)。 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/1db6881e-d64f-41b6-8671-0ae37784c440.jpg" title=" 图1.jpg" alt=" 图1.jpg" / /p p style=" text-align: center " 图1 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 500px height: 308px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/62609940-652e-42c0-967b-5e4165a0c4eb.jpg" title=" 图2.jpg" alt=" 图2.jpg" width=" 500" height=" 308" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " 图2 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 543px height: 750px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/54de575b-3929-471b-ad4f-c5b07c3b38ce.jpg" title=" 图3.jpg" alt=" 图3.jpg" width=" 543" height=" 750" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " 图3 /p p   选中A、B列,点击图4中plot选项,即可得到图5,即为EGP曲线。可以在图5中根据需要改变曲线的粗细、形状和颜色,在此不作详述。 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/947a9618-194f-4302-aff3-fd6c2fa954a0.jpg" title=" 图4.jpg" alt=" 图4.jpg" / /p p style=" text-align: center " 图4 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 557px height: 464px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/e4ce67e8-3c64-471d-8782-d1ece89f1798.jpg" title=" 图5.png" alt=" 图5.png" width=" 557" height=" 464" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " 图5 /p p   2. 官能团剖面图(即FGP曲线)的作图法 /p p   下面介绍由逸出气体红外光谱图(即EGS)文件得到FGP曲线的方法。通常在Timebase软件中,可以按照图6的方法,选中Save Time Resolved Data选项导出在实验过程中得到实验范围内不同时刻/温度的Excel格式的所有的红外光谱图。按照图1至图3的方法打开文件,得到如图7所示的界面。图7中,第1行“Long Name”中所对应的数值为温度值(即该行为温度行),1.98e+001即为19.8℃,其他以此类推。A列对应的为波数值(单位为cm-1),其他B、C、D...列所对应的为不同温度下的吸光值。也就是说,在图7中,由除A列以外的其他列作为纵坐标轴对A列按照图4的方法作图,可以得到在不同温度下的红外光谱图。另外,在图7中,如果选中温度行和特定的官能团(即特定的波数值)所对应的行进行作图,则可以得到FGP曲线。下面介绍FGP曲线的作图方法。 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/f42afe19-16bd-432f-980f-506780617eab.jpg" title=" 图6.jpg" alt=" 图6.jpg" / /p p style=" text-align: center " 图6 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/16d2682f-cb11-4132-8b1b-3be6cd40f10c.jpg" title=" 图7.jpg" alt=" 图7.jpg" / /p p style=" text-align: center " 图7 /p p   按照图8的方法分别选中2358cm-1所对应的行和温度行,复制整行。 br/ /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/dcdf9257-47da-4d8b-ad2d-df3abf22d3cc.jpg" title=" 图8.jpg" alt=" 图8.jpg" / /p p style=" text-align: center " 图8 /p p   新建一个空白的Book文件,将温度行和对应波数(2358cm-1)的数值粘贴这两行,选中,点击Worksheet菜单下的Transpose选项(图9),将这两行转换为两列,转换后的表格如图10所示。删除图10中的第一行数据,按照图4的方法作图,即可得到CO2分子的特征官能团在2358cm-1处的FGP曲线(图11)。可以根据需要改变图中曲线的粗细、形状和颜色,在此不作详述。 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/98c364bc-5af7-4f17-b010-d6c6e9ef31df.jpg" title=" 图9.jpg" alt=" 图9.jpg" / /p p style=" text-align: center " 图9 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/3fe819c4-81c9-4309-8fa2-eebc7492a9da.jpg" title=" 图10.jpg" alt=" 图10.jpg" / /p p style=" text-align: center " 图10 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/8c655662-483b-4efa-9b6e-86d7e8f314c3.jpg" title=" 图11.png" alt=" 图11.png" / /p p style=" text-align: center " 图11 /p p   3. 实时红外光谱图(EGS图)的作图法 /p p   在本部分第2节中提到“在图7中,由除A列以外的其他列作为纵坐标轴对A列按照图4的方法作图,可以得到在不同温度下的红外光谱图。”也就是说,在导出的Excel格式的在实验温度/时间范围内的所有红外光谱文件中,选中A列和所对应的一列和/或多列时间/温度列即可得到不同温度/时刻下的实时红外光谱图。 /p p   以下举例说明。图12是不同温度下的一水合草酸钙在加热过程中产生的气体产物的红外光谱图。图中第五行为不同的温度值,第A列为红外光谱的波数值。例如,需要比较第100℃、200℃、500℃和700℃下的红外光谱图的变化,则同时选中这些温度和波数(A列)所对应的列,复制并粘贴到新建的表格文件中,并定义相应列的名称(图13)。同时选中图13中A-E列,点击图4中plot选项,即可得到图14,即为不同温度下的红外光谱图。可以在图14中根据需要改变曲线的粗细、形状和颜色,在此不作详述。由图14可以看出,(1)样品在100℃时样品没有发生分解 (2)在200℃时产生了水,对应于结晶水的失去过程 (3)在400℃时产生了一氧化碳,少量一氧化碳被氧化为CO2 (4)700℃时的气体产物以CO2为主。 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 220px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/a6b0f4c1-4385-4184-8530-572cc84c0cce.jpg" title=" 图12.jpg" alt=" 图12.jpg" width=" 600" height=" 220" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " 图12 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 557px height: 285px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/b989ef36-1508-4bde-b282-9029ef1766ff.jpg" title=" 图13.jpg" alt=" 图13.jpg" width=" 557" height=" 285" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " 图13 /p p style=" text-align: center " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/128d4fc6-623a-479c-9cdb-4f3865f22608.jpg" title=" 图14.png" alt=" 图14.png" / /p p style=" text-align: center " 图14 /p p br/ /p
  • 沃特世在2014年国际质谱大会(IMSC)上推出用于小分子数据分析的Progenesis QI 2.0版
    新一代软件加强了控制能力,独具Pathway Mapping、Process Automation功能及改进的化合物数据库通道日内瓦—(美国商业资讯)—沃特世公司(纽约证券交易所代码:WAT)近日在瑞士日内瓦举行的第20届国际质谱大会上,推出了2.0版Progenesis? QI。该软件是一款用于液相色谱-质谱(LC-MS)小分子组学数据分析的新一代软件。 继六月份推出适用于蛋白质组大分子组学数据分析的2.0版Progenesis QI,沃特世今天发布的软件进一步完善数据平台。Progenesis QI和Progenesis QI蛋白组学软件将液相色谱-质谱(LC-MS)的数据分析速度和精度都提升至新水平,使用户能快速定量和鉴定样品中发生显著变化的小分子、脂质化合物和蛋白质。 Progenesis QI 2.0版的新功能包括:Pathway Mapping能促进将现有发现纳入生物学情境中的过程,从组学数据中获得尽可能多的信息;Workflow Automation能在没有人为干预的情况下,使软件在多个处理阶段自行运转,不仅节省了宝贵的时间,还能在夜间和周末持续运转;改进的化合物数据库通道,提高了成功鉴别化合物的机会;与EZInfo 3.0的扩展统计功能完美结合,具有双向的数据流,只需通过单一的菜单导向命令,就可实现灵活的数据挖掘。 沃特世全球营销和信息部门副总裁Rohit Khanna博士表示:“未进行深入了解的新发现是无用的。最新版本的Progenesis QI拥有改进的界面,使得软件的使用比以前更直观快速,让用户对他们的研究更有信心,并能更深入地理解获得的结果。” Progenesis QI 2.0版拥有基于研究人员的工作方式的灵活、直观易学的工作流程。它有着高度可视化的用户界面。扩展后的功能拓宽了在制药、健康科学、食品、环境和化学研究等诸多研究领域的应用。 如需了解更多有关Progenesis QI 2.0版软件的信息,请访问http://www.nonlinear.com/progenesis/qi/。更多Progenesis QI生物信息学软件的信息,请访问:http://www.waters.com/waters/zh_CN/Progenesis-QI-Software/nav.htm?cid=134790655&locale=zh_CN关于Progenesis QI软件2014年4月,在德国慕尼黑的Analytica Conference(分析研讨会)上,沃特世继收购组学数据分析软件领域的全球领导者Nonlinear Dynamics Ltd.之后,推出了Progenesis QI和Progenesis QI蛋白质组学软件。2014年6月,沃特世发布了用于蛋白质组学的2.0版Progenesis QI,扩充了信息学套装。Progenesis QI软件使研究人员能采用独特的方法分析并可视化LC-MS数据,准确定量和鉴定化合物和蛋白质。Progenesis QI软件支持所有常用的LC-MS数据格式,具有直观的导向性工作流程,能使用户能在宝贵的样品中快速、客观、可靠地找到目标化合物。Progenesis QI 2.0版拥有pathway mapping、process automation和改进的化合物数据通道等新功能,能提供增强的控制能力和功能。
  • 增长明显!2020年质谱联用仪海关进出口数据盘点
    仪器信息网 随着技术的发展和社会对复杂样品定性定量需求的增长,联用技术应运而生。质谱联用技术,不仅拥有质谱卓越的定性能力,还结合了色谱等技术所具有的优秀分离性能,可同时对复杂样品进行定性和定量分析,在环境、食品、制药、农林牧渔、生命科学、医学等众多领域得到了广泛的应用。目前主流的质谱联用技术有气相色谱-质谱联用、液相色谱-质谱联用及毛细管电泳质谱联用技术三大类。  当前,中国质谱联用仪市场仍以进口为主,进口产品市场占有率超过90%,其中赛默飞、安捷伦、岛津、沃特世、珀金埃尔默、SCIEX、布鲁克等占据着绝大多数的市场。而国产厂商包括天美、天瑞、聚光/谱育、磐诺、东西分析、仪电分析、舜宇恒平等也在质谱联用技术上不断突破,并陆续推出商品化仪器。近年来随着生命科学、医药研发、临床检验、材料测试等领域对质谱联用仪的需求不断增长,质谱联用仪市场蓬勃发展,新品不断推出,年销量也在不断增长。通过分析海关质谱联用仪的进口情况,可以从一个侧面反映出中国质谱联用仪市场的一些情况。2020年是特殊的一年,新冠肺炎疫情在全球爆发,各行各业都受到了一定的影响,包括科学仪器行业。为了解过去近两年中质谱联用仪的进出口情况,仪器信息网特别对2019、2020年1-11月,海关质谱联用仪(Hs编码90278012)进出口数据进行了分析汇总,为大家了解中国目前质谱联用仪市场做一个参考。2019、2020年1~11月海关质谱联用仪进出口数据统计统计年月进口量(台)进口金额(人民币:元)出口量(台)出口金额(人民币:元)2019年1~11月35283,881,693,6532620,592,1222020年1~11月46414,302,321,5792022,123,667  从上表可以看到,2020年1-11月,我国共进口质谱联用仪4641台,进口额约为43.02亿元,进口单价约为92.70万元。而2019年同期,质谱联用仪进口3528台,进口额约为34.06亿元,进口单价约为96.54万元。与去年同期相比,2020年1-11月我国质谱联用仪进口台数增加约31.54%,进口额增加约26.31%,进口单价降低约4.14%。从整体来看,2020年进口质谱联用仪市场增长非常明显,但进口单价略有下降。  而从出口情况来看,2020年1-11月,我国共出口质谱联用仪20台,出口额约为2212.37万元,出口单价约为110.62万元。而2019年同期,质谱联用仪出口26台,出口额约为2059.21万元,出口单价约为79.20万元。总体而言,我国质谱联用仪出口量仍然很少,且2020年比上年同期出口量有所减少,但出口单价明显增高。2019、2020年1-11月质谱联用仪进口量逐月数据图(单位:台) 对2020年1-11月质谱联用仪进口量逐月数据分析发现,并对比2019年同期数据可以明显看出,2020年质谱联用仪进口数量明显有所增加,且逐月变化较为明显,其中2020年1~3月受国内新冠肺炎疫情影响,质谱联用仪进口数量较去年明显下降,而则4月份迎来“报复性”增长,质谱联用仪进口台数是去年同期的两倍多,5~7月每月进口数量与去年相比变化不大,8~11月每月进口数量较去年同期呈现明显增长。2019、2020年1-11月质谱联用仪进口金额逐月数据图(单位:人民币/元) 对2020年1-11月质谱联用仪进口金额逐月数据分析发现,并对比2019年同期数据可以明显看出,2020年1~7月,质谱联用仪每月进口金额较去年同期变化不大,除6月较去年有所增长之外,其他月份均有少许下降,而2020年8~11月,质谱联用仪每月进口金额较去年同期则表现出明显的增长。2019、2020年1-11月质谱联用仪主要海关进口国数量(单位:台)2019、2020年1-11月质谱联用仪主要海关进口国金额(单位:人民币/元)2020年1-11月质谱联用仪海关进口国金额分布图 根据海关数据,近两年我国主要从新加坡、日本、美国、德国、爱尔兰、英国、加拿大以及荷兰等国家进口质谱联用仪。其中进口金额最高的前5个国家分别是新加坡、日本、美国、德国和爱尔兰。同时,值得注意的是,以往我国从中国台湾进口质谱联用仪非常少,而2020年进口数量激增,但进口金额非常少,笔者估计可能涉及相关配套配件。2020年1-11月质谱联用仪进口企业注册地分析图 通过海关进口质谱联用仪的企业注册地数据,可以大致了解到进口质谱联用仪在国内的“落脚地”。可以看出 ,2020年1-11月,广东、上海、北京、江苏、浙江、四川 、山东 等省市进口质谱联用仪数量较多,而这些地区也是我国经济较发达,检验检测相关行业比较发达的省份和地区。 就海关进出口数据来看,质谱联用仪在国内的市场潜力非常巨大,2020年尽管新冠疫情爆发给各行各业造成一定影响,但我国质谱联用仪市场增长依然明显,虽然2020年1~3月受国内新冠肺炎疫情影响,进口数量较去年明显下降,而4月份却迎来“报复性”增长,进口量增长达到去年同期的两倍多。 另一方面,由于国内掌握质谱联用仪所涉及的原理、模拟、计算、设计、工程化、工艺化、生产、应用开发及维护等各环节专业技术的人才及专业类公司仍然相对较少,质谱联用仪的发展还是远远落后于西方发达国家。无论是产品数量还是价格上,国产仪器与进口质谱联用仪都存在较大差距,产品数量方面差距尤为悬殊。不过,近年来国产出现的几款市场化的气质联用仪在一定程度上也能满足部分企业的要求,尤其是在环境监测领域。未来,国内仪器厂商也应更加重视自主知识产权与仪器自主研发。质谱联用仪国产化之路任重而道远。
  • 达硕信息推出多款数据分析软件产品
    大连达硕信息技术有限公司(以下简称“达硕信息”)专注企业级数据的分析整合、深度挖掘与商业智能,掌握数据核心技术,提供专业化的数据处理软件产品,个性化的数据整体解决方案,以及平台级的数据整合服务。公司目前推出多款数据分析软件产品,欢迎试用。魔力TM复杂多变量数据智慧化处理软件系统 (ChemDataSolution)科学仪器数据因其高维、高通量与高复杂度的特征,价值密度大,但分析处理的困难度亦很高。食品快检与安全监测、工业过程分析与生物组学研究等众多领域所面临的在线与动态、快速与实时,以及模型共享与大数据分析等诸多问题,对智慧型数据挖掘与深度价值利用提出了现实的需求。与传统的多变量数据分析产品或仪器自带的软件相比,ChemDataSolution系统在复杂情形下的文件夹数据批载入、智能算法流、一键数据处理与多模型分析、同时模型构建、验证与预测、多线程与并行计算以及用户体验等各个方面具有开创性,是分析处理色谱和质谱,尤其是近红外等光谱数据的强大工具。主界面截图 (ChemDataSolution)该系统具有如下的特色与优势: 1、数据分析算法流算法流是指构造包含不同数据处理方法的数据整合与优化流程,设置算法参数,在实际的数据分析处理中,仅需往算法流中添加待分析数据即可获得最终结果,完整保留中间计算结果以备查验,实现更快速便捷,准确智能的分析模式。 2、一键处理与多模型处理因算法流思想可实现数据处理方法的逐级串联与优化整合,将训练集、验证集或预测集同时添加到算法流中,达到一键处理即获得所有分析结果的目的。 3、同步建模、验证与预测在算法流的使用中,用户可分别添加建模、验证与预测数据,系统先构造模型,然后再将验证与预测数据进行相同的预处理或特征选择操作,基于已构建的模型获得计算结果,同样可极大减少用户的操作步骤。 4、智能数据批载入与数据库数据载入是数据分析的基础,实现复杂情形下的数据批载入是实现智慧型数据分析的前提。通过研究不同类型数据结构,尤其是数据自动载入时可能遇到的各种情形,提出数据智能载入的整体解决方案,如数据类型与长度、数据与字符、数据分隔符、化学坐标处理、数据头文件、数据排列方式、数据载入后是否放入已经存在的数据文件中,以及多个数据文件的上述处理方式是否存在差别等。 5、用户体验ChemDataSolution实现了非常人性化的用户体验与功能,比如基于XML技术的参数预设值、保存与调用,用户偏好设置,自定义报表,特别是基于导航栏文件式的数据、图形、算法流与模型结果管理等。 代谢组学小分子化合物快速鉴定软件系统该系统由达硕信息与中国科学院大连化学物理研究所共同开发完成,是未知代谢物定性分析的不二选择。系统融合多级质谱的精确质量数与保留时间信息,实现未知代谢物的多层次鉴定分析。系统主要具有如下功能与特色: 1、完备的代谢标准化合物数据库系统以SOP的方法,在正、负二个电离模式,以及三个不同检测电压下,采用先进的AB SCIEX 5600+仪器,构建2,000个不同代谢物的LC-MSn数据库,同时包含高分辨精确一级和二级质谱,以及保留时间的信息。这也是系统的核心优势之一。 2、定性经验的传递基于LC-MSn分析的化合物鉴定,经验性极强,初学者或者研究生需要花费很大的时间与精力才能基本掌握;而且学生一旦毕业,其定性结果与经验又无法为实验室继续利用,导致学生循环往复,研究组的积累却很是有限。系统通过不同成员构建灵活的扩展库数据库、未知物数据库,本地与局域网互联互通,以及强大的数据库功能,达到这样的目标:“研究生毕业不要紧、定性知识留下来”,“新进实验室不要紧,站在师兄师姐的肩膀上”。 3、多层次定性分析除上述自建标准化合物数据外,系统集成HMDB、Metlin、LIPID MAPS以及MMCD网络数据库,用户可在系统直接批量搜索这些数据库,实现与自建数据库分析结果的比较、融合与定性结果相互补充、扩展。在此基础上,用户可实现自建标准化合物数据库、网络数据库、扩展数据库,以及未知物数据库的综合定性分析,并可在不同数据库所得到的结果间相互比较分析,以获得最可靠的鉴定结果。此外,系统通过先进的样本间数据校正、定性匹配算法、原始数据批载入,批量定性分析,快速丰富查询(如中性丢失等),以及优越的用户体验等功能,实现代谢小分子化合物的快速鉴定。主界面截图 (代谢小分子化合物快速鉴定软件系统)
  • 新型分析软件不断出现 让组学的数据分析不再抓狂
    与其他的组学学科相似,代谢组学的数据收集是个问题,但肯定不是研究人员面对的最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚代谢组学数据集到底意味着什么。幸运的是,不断出现的分析工具正在帮助打破这个瓶颈。   研究人员逐渐懂得,如果你真的想要了解细胞行为,你需要研究代谢物。基因编码蛋白质,而蛋白质作用于小分子。这些分子的存在和丰度,被统称为代谢组(metabolome),反映和影响了健康、营养、免疫系统等。   与其他的组学学科相似,代谢组学的数据收集是个问题,但肯定不是研究人员面对的最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚代谢组学数据集到底意味着什么。&ldquo 数据分析仍是个巨大的瓶颈,&rdquo 赛默飞世尔代谢组学的市场部经理Yingying Huang说。   幸运的是,不断出现的分析工具正在帮助打破这个瓶颈。   光谱图库   代谢组学的数据分析主要分为两个部分:峰值检出(peak picking)和峰值鉴定(peak identification)。峰值检出是利用代表不同条件(如健康和患病)的多个数据库进行筛选的过程,并鉴定出它们之间不同的光谱特征。在这些峰被发现之后,它们所代表的化合物必须被鉴定。   多个软件包可处理第一个问题,包括商业化工具(如安捷伦的MassHunter Profinder,布鲁克的ProfileAnalysis,赛默飞世尔的SIEVE&trade 和Waters的Progenesis QI)以及免费工具(MZmine和XCMS Online)。而一些图库正在开发或已被开发出,以解决第二个问题。   斯克里普斯研究所(Scripps Research Institute)代谢组学和质谱中心的主任Gary Siuzdak谈到,他的METLIN数据库目前列出了240,000种化合物,其中11,600种有MS/MS光谱数据。而人类代谢组数据库(HMDB)有近42,000种化合物,其中1,164种有MS和MS/MS数据。此外还有其他选择,包括ChemSpider和MassBank。   当然,我们不可能收集每个代谢产物的实验数据,加州大学戴维斯分校的Oliver Fiehn认为。目前有太多的代谢产物,而并非全部都有纯化形式作为标准品。&ldquo 在某些时候,你必须预测MS/MS图谱会怎么样,&rdquo 他说。   Fiehn解决这个问题的工具是LipidBlast,它包含200,000个预测的脂类光谱。&ldquo 这很难[做到],&rdquo Fiehn承认,因为与肽段不同,代谢物有各种形状、形式和大小。有了LipidBlast,用户能够将它们未知的图谱与图库进行比较,看看是否有hit,就像DNA研究人员利用BLAST将基因序列与GenBank比较。赛默飞世尔也有个类似的工具,叫LipidSearch&trade 。   阿尔伯塔大学(University of Alberta)的化学教授Liang Li最近推出了一个类似的项目,MyCompoundID.org,以扩展HMDB的用途。MyCompoundID的建立是从HMDB中抽取8,000种代谢物,并计算它们的质量以及经历76种可能的生物转化(如磷酸化、甲基化或D-核糖基化)后的预测光谱特征。这些结果将帮助研究人员缩小未知光谱特征的可能身份。   SWATH采集   代谢组学研究可能是靶向,也可能是非靶向的。对于前者,研究人员设定他们的仪器(通常是三重四级杆质谱仪)来扫描特定的代谢物。而对于后者,仪器扫描特定质量范围内的一切,但只收集高丰度离子的MS/MS碎片数据。   这种所谓的数据依赖的流程是为方便起见而设计的。不过Fiehn认为,它不尽如人意,有时研究人员发现样品之间的特定离子变化明显,但没有被碎裂,因为它是低丰度的。   最近,苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold介绍了这个问题的解决方案1,它已被AB SCIEX商业化。这种被称为SWATH&trade MS的策略避开了数据依赖处理,而支持数据非依赖的处理,即所有进入质谱仪的离子都被碎裂和分析。它逐步分析用户定义的分离窗口,重复,并通过计算整理出产生的碎片,从而覆盖很宽的质量范围。   2013年,华盛顿大学的化学家Gary Patti利用安捷伦的6520 Q-TOF质谱仪和定制的R package,在代谢物上应用了一种类似的方法2。据AB SCIEX的高级营销经理Fadi Abdi介绍,AB SCIEX如今正将SWATH技术应用在蛋白质组学上。   用户在TripleTOF® 质谱仪上收集高速的光谱数据,并利用MS/MS光谱图库来解释它,这与蛋白质组学的方法相似。&ldquo 在数据依赖的分析中,如果您没有触发您的分子,则无法识别它,&rdquo Abdi谈道。&ldquo SWATH允许您收集样品中所有可检测种类的数据,带来更为全面的定量覆盖。&rdquo   通路分析   在研究人员鉴定出有趣的代谢物后,他们需要找出它们在生物系统中的作用。这时就需要通路分析的工具。通路分析让研究人员能够将代谢物定位到已知的生化通路上,为可能的遗传角色及其他代谢物提供线索。   Fiehn的实验室写了一个通路分析的工具,名为MetaMapp,而大部分商业化的代谢组学数据分析包也包含通路分析。赛默飞世尔的SIEVE数据分析包中就有这样的模块,它关联到KEGG通路数据库,而Bruker Daltonics也即将推出它的Compass PathwayScreener工具。   不过,Metabolon(北卡罗来纳州的一家代谢组学服务供应商)的首席科学家Mike Milburn认为,仅仅将代谢物定位到已知的通路商,还不足以看清整幅图像。Metabolon已经完成了约3000项代谢组学研究,每年开展600-700项,半数是科研客户。这些经验使得他们能够看到其他研究人员难以获得的代谢鸟瞰图。   对许多研究人员而言,开始代谢组学流程所需的技能、专长和费用使得外包给Metabolon这样的公司更为常见。但是那些愿意自己承担重任的研究人员也会发现,他们并不缺少计算上的工具。   无论采用哪种方式,Bruker Daltonics代谢组学的市场部经理Aiko Barsch说,&ldquo 我会鼓励新客户进入代谢组学,因为那儿包含了那么多的信息。有那么多新东西有待发现。&rdquo
  • 【我与近红外的故事】曾仲大:近红外数据分析之路
    p    span style=" font-family: 楷体,楷体_GB2312,SimKai " strong 随感: /strong “我与近红外的故事”征文近一年了,看过许多老师情真意切的表达,真是把乐趣融入到了近红外的研究与应用之中,也更加深切地感受到同行们对国内近红外发展的使命感和责任感。而自己与近红外的故事,几次动笔却都没能写下几个字。时间肯定不是借口,惰性真是害人啊。好在拖到春节,总算能静下心来了。就像与近红外的相遇相知,既是机缘巧合,更是某种必然吧。 /span /p p   初识近红外,都是博士毕业一年以后的事了。那时已经在香港理工大学周福添教授课题组从事博士后研究一年多了,主要方向还是老本行-化学计量学基础算法研究,解决中药和代谢组学等复杂体系分析中的数据处理问题,从GC-MS,LC-MS到中药指纹与药物活性关系。一次Daniel MOK博士找到我,询问是否有意愿到陈新滋院士课题组从事中药质量分析与鉴别方面的工作,陈院士那时是理大副校长(后任香港浸会大学校长,现受聘中山大学教授、学委会主任),研究组的条件与学术水准自不必说,就这样幸运地开始了近二年的近红外数据分析之旅。 /p p   对香港熟悉的朋友一定对其大街小巷的名贵中药材印象深刻,尤其是弥墩道,应该是内地赴港旅游人士的必经之地吧,一是去旺角购买电子产品的旅游大巴必定经过这里,另一方面则是这条大道两旁大大小小的中药材店。记得第一次见到时,很是疑惑哪来的那么多冬虫夏草、燕窝和野生人参?说回到陈院士负责的这个研究课题,由香港赛马会中药研究院提供500万研究经费,对包括上述中药,以及石斛、灵芝、阿胶等在内的30味名贵中药材进行质量鉴别分析和研究,目的是帮助那些大街小巷的药材经销店铺,中间批发商,甚至普通消费者,以快速、经济、简便的方法识别药材真假,甚至质量等级。这些药材大多价格不菲,若能够有效识别真假,其商用价值可想而知!顺便一提,香港赛马会中药研究院很多年前已经解散,个中原因无法深究,但在目前国家大力践行中医药研究开发与应用的今天,这也算是一件憾事吧,包括设想中的香港国际中医药中心。 /p p   说到这里,近红外分析可以派上用场了!无论是十年前,还是十年后的今天,应没有什么分析技术比近红外更适合完成这项使命,综合考虑时间效率、分析成本,亦或是平衡多重因素影响下定性定量分析结果的准确性!记得当时我们使用的是FOSS公司的XDS快速含量分析仪(Type XM 1100 Series),以及Polychromix手持式近红外分析仪(Model: 1600-2400)。由于项目定位于实际应用,需要适应不同场合下的快速分析,对数据分析本身的要求同样也是比较高的,比如涉及模型传递,尽可能简化数据分析的过程及对使用者的要求,亦确保结果的准确可靠性。基于此编写了功能完备的近红外数据分析软件系统,一站式地完成近红外数据分析的完整流程,从各种各样的预处理方法到特征选择,再到定性定量模型的构建、评价与验证预测,以及模型传递等。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/137c0a6d-7548-46ef-beea-f984cce33ba7.jpg" title=" 2_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " 中药质量分析与鉴别项目中用到的近红外分析仪 (图1和图2)。 /p p   说实在的,那时对化学计量学的多元校正方法并不是特别熟悉,我的整个硕士和博士研究,都是多元分辨方向,也就是如何从中药和烟草等复杂体系分析的联用仪器数据中,发展“数学分离”的方法,获取化学纯组分的定性定量信息,即纯组分的光谱和色谱信息。幸运的是,得益于在梁逸曾教授研究组六年时间里耳濡目染的学习,比如许青松教授对统计分析的讲解,杜一平教授的QSAR研究等等,使得我无论对复杂数据的理解,还是化学计量学方法的应用与发展,都有足够基础支持我去解决近红外数据分析中遇到的各种问题。在香港的几年时间里,梁教授每年也都会利用假期去香港一段时间,与香港同行合作交流化学计量学及其应用方面的成果,更是继续指导我解决研究中遇到的实际难题。每每想到这些,总会浮现与恩师相处过程中的点点滴滴。至于上面提到的中药质量分析研究项目,我们对包括阿胶、珍珠、川贝母、藏红花、黄连在内的多味中药进行了深入分析研究,获得了非常不错的结果,陈院士对此也给予了很高的评价。很清楚地记得因此第一次上了电视新闻,是香港亚洲卫视针对我们使用近红外分析技术,如何快速识别真假中药,及其质量等级的采访报道。当然,这些研究很多也是和理工大学的同事,以及杨大坚教授(现任重庆市中药研究院院长)、董玮玮博士等一起完成的,我主要负责数据分析,以及数据软件产品开发与实现方面的工作。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/ac0a45a1-23c7-43bf-8467-f0cb1a6ccb8d.jpg" title=" 3_副本.jpg" / /p p style=" text-align: center " 中药质量分析与鉴别项目交流会 (图3),及与日本Yukihiro Ozaki教授交流(图4)。 /p p   离开香港后,很长一段时间内都没有与近红外分析有直接的关联。先是在Philip Marriott 教授课题组做research fellow,从事全二维色谱数据分析方面的工作,主要方向是全二维分离的模拟、预测,以及化学计量学新方法的发展。2012年回国后则作为引进人才,在中科院大连化物所许国旺教授研究组,从事代谢组学数据分析与高分辨LC-MSn数据处理新算法的研究等。看似这些工作与近红外分析不怎么挨着边,但老实说,同其他研究一样,数据分析也是一通百通的事!数据来源与数据结构可能不一样,数据背景与数据分析结果,以及数据处理方法亦可能存在差别,但数据分析的本质却是高度一致的,无论是色谱分离的模拟,亦或是代谢小分子标志物的发现!从这个意义上来说,也算是一直在这个圈子吧。 /p p   近红外技术的发展,面临非常多的机会,无论从国内快检还是工业智能化的需要来看,还是从国外近红外发展的轨迹来看。然而近红外分析更广阔的应用,仍有一系列需要解决的难题,这其中当然包括仪器硬件的小型化、便携式,以及智能化与场景化。但从数据及数据分析的角度来说,快速、准确的模型构建,模型的通用性、更新及转换等仍是需要加以研究的内容。基于此,离开化物所后创办的大连达硕信息技术有限公司,第一个数据产品“魔力”,便专注近红外数据的分析,这也算是真正走在了近红外技术与数据分析的商业应用之路上。希望能够以智慧化、便捷化的方式,分析挖掘科学研究与工业应用中的海量数据。无论对于近红外分析的初入者,还是有了相当经验的人员,一旦采集到数据,便能快速得到好用的模型及结果,这也是目前非常欠缺的,主要原因就在于近红外数据分析的过程长,可变因素多,涉及的算法也很多,传统上要快速得到一个好用的模型并不容易。尽管大多数研究者并没有把数据分析提升到特别核心的位置,但其价值显而易见,甚至在某些方面可与硬件本身相得益彰,弥补硬件的物理劣势! /p p   另一方面,近红外分析以其简单方便的前处理,加上非常快速的数据采集方式,使得数据的获取,甚至大数据的积累顺理成章。然而即使对同一组数据,不同的研究者亦极有可能得到完全不同,甚至相反的分析结果或结论,即使在固定分析方法的情况下!这是一个容易被忽视,却又至关重要的问题,否则不管如何将近红外分析的硬件评价,以及实验测试全过程标准化,也无法得到可相互比较的结果。数据“横看成岭侧成峰”的魅力,不应是由于数据分析方法或人员的不同导致,而是数据背景的属性差异或者数据分析目的的不同产生。基于此,我们也正采用近红外数据分析的通用准则,使用粒子群等最优化的方法,开发全新的近红外数据分析软件产品,自动优选数据分析算法,以及方法的使用顺序,并全局优化方法的参数。这样我们获得数据后,只需按照标准化的流程一步一步走,便可获得最优的数据分析模型与模型结果。从而使得近红外数据的分析,如同实验分析一样,结果的重现性与可比性也就不再是个问题。避免像现在这样,往往是漫无目的的数据探索,耗费漫长时间也不一定能得到合适好用的模型!这无论在研究中,还是在工业生产中,都是需要花大力气迎接的挑战。在这一过程中,得到了袁洪福教授、吴海龙教授、邵学广教授、杜一平教授、褚小立教授、闵顺耕教授等诸多老师的大力支持与帮助。从老师们关切的眼神中,能读懂那份殷殷之情,也唯有努力做点事情,为国内近红外的发展做些有益的工作,方不负此情。 /p p   近红外分析能做的事情很多,近红外数据分析如是,尤其站在移动互联时代,站在大数据分析挖掘的视角与高度。近红外有其自身特有的巨大优势-本身就是物联网中的一个绝佳传感器!从这个意义上来说,近红外分析代表着某种未来,只是通往未来的路上,还需要我辈站在前辈的肩膀上,不断付出智慧和汗水。 /p p   “师者也,教之以事而喻诸德也。”,数据分析之路上,深深地烙上了梁逸曾教授的影响。亦师亦友者,感恩、深切缅怀您。 /p p style=" text-align: right " span style=" font-family: 楷体,楷体_GB2312,SimKai "   2017年1月30日于浙江西湖 /span /p p    strong 个人简介 /strong /p p /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/e1424397-960a-4e21-a206-9245429e6328.jpg" title=" 1_副本.jpg" / /p p   曾仲大,男,博士,现任大连达硕信息技术有限公司总经理。 /p p   曾博士师承梁逸曾教授,2006年获得工学博士学位,主要从事化学计量学基础算法研究,以及色、质、光谱等分析技术在制药、烟草和代谢组学等复杂体系分析中的应用及其数据分析挖掘等。近年来在大数据的分析与应用方面亦有涉猎。 /p p   曾博士先后工作于香港理工大学、澳洲RMIT大学、Monash大学,以及中国科学院大连化学物理研究所。迄今已发表SCI论文40余篇,在2013-2016近三年时间里,以第一作者或合作者在美国分析化学杂志发表7篇研究论文,同时获邀为TrAC等权威期刊撰写化学计量学及化学数据分析处理方面的综述。 /p p   曾博士曾获得中国科学院大连化学物理研究所“所百人”引进人才计划,大连“海创工程”计划、高层次人才创新创业支持计划、新兴技术创新成长计划,以及国家人社部高层次海归人才创业计划的支持。公司主要提供复杂化学与生物数据分析服务,数据挖掘软件产品开发,以及个性化数据应用的整体解决方案。 /p p    strong 人生格言: /strong 有志者,事竟成。 /p
  • 沃特世和PREMIER Biosoft合作推广多聚糖数据分析软件
    强强联手应对生物制药分析的苛刻要求 盐湖城, 犹他州 - 2010年5月24日 沃特世公司(WAT:NYSE)今天宣布已经与PREMIER Biosoft国际公司(帕洛阿尔托,加州)达成协议:双方携手推广该公司的SimGlycan® 软件以及沃特世质谱分析方案,用于多聚糖和糖肽分析。根据协议,沃特世将继续销售和支持其多聚糖质谱分析方案,而PREMIER Biosoft公司则将其软件卖给将使用沃特世SYNAPTTM和XEVOTM质谱平台进行多聚糖和糖肽分析的客户。 通过利用PREMIER Biosoft的SimGlycan数据分析软件来扩展沃特世分离科学产品、质谱仪和超高效液相(UPLC® )色谱柱方案,可以帮助生物制药企业获取生物药物关键信息,这些信息对于了解该药物的稳定性和安全性至关重要。 糖基化的重要性引起了FDA法规的关注和监管 多聚糖是随蛋白质翻译后连接在生物药物如蛋白质、多肽或单克隆抗体上的支链多聚糖分子。细胞中多聚糖加成和成熟反应的最终结果是不均匀的生物药物修饰,而不同的糖基化形式可对生物药物的有效性和安全性产生不同的影响。因此确定生物药物的糖基化位点和多聚糖的糖型及数量对于评价药物的有效性和安全性是必须的,由于存在各种不同的复杂多糖结构,对分析技术提出了很高的要求。另一方面,糖基化的一致性与否通常被作为一个灵敏度很高的标志,以此来判断制药公司是否对生物药物生产过程进行了有效的控制。为此,美国食品药品监督管理局FDA和其它法规机构也提出了相应的指导原则,要求对蛋白质药物糖基化进行更为严格的控制,这将使生物制药行业针对分析技术进行更大的投入,以便更好地分析和了解复杂的生物治疗药物。 关于沃特世的UPLC多聚糖分析方案 沃特世UPLC多聚糖分析方案由ACQUITY UPLC BEH多聚糖分析专用色谱柱配合带荧光检测器的ACQUITY UPLC® 系统组成,用于分析2-氨基苯甲酰胺(2-AB)或其它荧光试剂标记的生物药物经酶处理后得到的多聚糖混合物。UPLC多聚糖分析方案提供比HPLC方案更好的分析结果,具有重现性好、分离度高、灵敏度高且分析速度快的特点,能够帮助实验室分析检测多聚糖的同分异构体(质量数相同、但保留时间不同),进行不同种类多聚糖如高甘露糖、中性以及唾液酸化的多聚糖分析,并同时对相对丰度很低的多聚糖进行分析(相对于其它多聚糖来讲)。 沃特世UPLC多聚糖分析方案配合沃特世质谱仪器使用可以对多聚糖结构进行确证。作为MS/MS数据分析的工具,SimGlycan软件可预测蛋白质分子上的多聚糖结构、对其进行评分并生成一个与得到的质谱图信息最接近的可能的多聚糖列表。SimGlycan数据库是一个巨大的包含8,553种多聚糖信息的关系型数据库,并持续不断地更新其它新发表的多聚糖信息,可支持糖肽和多聚糖分析。 关于PREMIER Biosoft国际公司(www.premierbiosoft.com ) 成立于1994年,由计算机科学家和生物学家领导,专注于制造用于生命科学研究的最尖端的直观软件。该公司的目标是研究生命科学中最新的创新型技术并将其转化为软件产品以辅助研究。 关于沃特世公司(www.waters.com ) 50年来,沃特世公司(NYSE:WAT)通过提供实用且可持续的创新,实现了全球医疗保健、环境管控、食品安全、水质监测等领域的显著进步,为基于实验室的许多机构创造了商业价值。 沃特世的技术突破和实验室解决方案开创了分离科学、实验室信息管理、质谱技术和热分析的相互组合,为客户提供了一个持久成功的平台。 沃特世公司2009年的收入达15亿美元,员工人数达5,200人;公司正在帮助全球客户推进科研进程,并为其提供绝佳的操作体验。
  • 使用非数据依赖采集法实现氢/氘交换质谱数据自动化分析
    HDX-MS是一种基于蛋白质主链酰胺氢原子与氘水中氘原子交换而获取有关蛋白质高阶结构和动态信息的方法。该技术可以帮助研究蛋白质折叠机制、发现配体结合位点、突出变构效应,在生物医药行业中发挥重要作用。尽管HDX-MS在蛋白质分析中频繁使用,但它通常无法进行高通量分析,且受限于大于150 kDa蛋白的分析。此外,HDX-MS生成复杂的同位素峰型常伴有谱图重叠现象,导致氘代值被错误计算。随着样品复杂性的增加,这一问题会更加加剧。目前,数据处理的方法涉及到手动检查原始数据以筛选谱图,并丢弃有任何信号问题的肽段图谱。然而这种方法随着样品分子量和复杂程度的增加变得难以执行,且容易受到人为错误的干扰(图1)。因此迫切需要一种可以消除手动筛选数据的负担,同时能够兼容更复杂的谱图(来自复杂混合物或整个细胞裂解液样品的谱图)。本文作者使用了一种自动化HDX数据分析的方法,利用data independent acquisition(DIA)采集方法同时从MS1和MS2领域获取氘代数据,并开发了AutoHX软件来挖掘和分析HDX数据。图1.传统HDX-MS数据采集与分析流程和本文使用的数据采集和分析流程比较。针对使用HDX-MS时,碰撞诱导解离(CID)碎裂模式产生的肽段碎片会伴随着气相中的氘重组现象(即scrambling现象),会影响残基水平氘代值的准确测量这一问题,作者定量研究了HDX-MS2数据的特性。作者发现,scrambling与离子传输和碎裂能量有关,且在高传输效率的条件下scrambling较严重,因此首先使用较为温和的离子传输参数和碎裂能量能够降低scrambling程度。随后作者建立了可描述碎片氘代值与该肽段可碎裂位点数量之间的线性关系(图2)。随着碎片离子长度的增加,相应的碎片离子氘代值会线性增加,因此通过回归计算可以计算出整个肽段的氘代率。这种方法不仅利用了CID产生的碎片信息,同时更为准确的计算出肽段的氘代值,排除了肽段谱图重叠对计算氘代值的干扰。图2.在一条给定肽段中,HD scrambling中,氘代值与碎片长度的关系。接着作者提出使用DIA方法来获取HX-MS2实验中MS1和MS2域的氘化数据,以实现在不同质谱平台采集数据、采集复杂样品的信息、分析自动化数据,且使得通过CID产生的MS2中提取肽段氘代值成为可能。首先作者设置了尽可能小的DIA窗口,并使用了较大的窗口重叠区域,以最小化MS2谱图的复杂性并确保每条氘代肽段至少有一个窗口(图3)。同时,作者开发了一个名为AutoHX的软件(作为Mass Spec Studio中的插件),该软件自动选择理想的DIA窗口,并从MS1数据计算前体肽段的氘代值,以及从MS2数据计算所有碎片的氘代值。同时改进了HX-PIPE(为HDX-MS量身定制的搜索引擎),使其搜库结果直接应用于AutoHX的分析。随后AutoHX使用了一系列过滤器来从数据集中解析低质量信号,然后使用基于RANSAC的谱图分析器,为所有肽段及其碎片匹配最佳同位素集合,并绘制动力学曲线图。该方法显著提高了肽段序列覆盖的冗余度(图4),从而提高了测量质量。图3. DIA窗口设计示意。图4. 基于DIA采集模式得到的序列覆盖(糖原磷酸化酶B,phosphorylase B)与基于传统HDX-MS中MS1采集模式的结果比对。接着,软件会通过MS1和MS2数据收集到的肽段前体离子和肽段碎片离子的信息,计算出相应的氘代值,同时将所有重复组计算出的氘化值集合成一个分布(通常为正态分布),并从该正态分布中,选择最接近平均值的组合,即为精确的氘代值,利用每个时间点的氘代值生成HDX动力学曲线(图5)。作者将手动筛选检查的数据与自动分析法获得的氘代数据进行了比对,结果具有一致性,验证了自动化方法的准确性和可靠性(图6)。同时在做同一样本不同状态HDX比较实验时,AutoHX可以生成氘代差异的显著性差异分析图(Woods plot)(图7),用于比较不同状态下的蛋白结构和构象差异。图5. 氘代曲线的组合方式。图6.手动MS1数据分析和AutoHX自动计算的氘代率对比。图7.氘代差异分析流程示意图。最后作者用两个蛋白体系验证了该方法的实用性和可靠性。第一个体系为DNA聚合酶ϴ (Pol ϴ )与其抗生素药物novobiocin结合的结构变化。通过比较手动处理与自动化处理的数据,作者发现生成的氘代差异图结果相似,提示该方法具有较好的准确性,并能够定位结合带来的氘代上升和下降区域(图8)。第二个体系是DNA依赖性蛋白激酶(DNA-PKcs)与选择性抑制剂AZD7648的结合。使用AutoHX软件处理了六个HDX-MS实验的数据,快速生成了Woods图,发现大部分可检测到的稳定性增加集中在FAT和激酶结构域(图9b),还包括药物结合位点的铰链环区域(图9c),揭示了药物结合位点及其引起的动态性变化。这部分研究结果展示了自动化数据分析在药物结合研究中的有效性,特别是在分析大型蛋白质复合物和难以纯化的蛋白质时,为药物开发和疾病治疗提供了有价值的信息。图8.手动处理与自动处理的Pol ϴ 与novobiocin-bound Pol ϴ 的HDX数据作差对比。图9. DNA-PKcs+AZD7648的自动化HDX分析流程结果。总的来说,该研究开发了AutoHX软件,通过自动化数据分析和基于DIA的HX-MS2工作流程,显著提高了氢/氘交换质谱技术在蛋白质结构和药物结合分析中的效率与应用范围,使得这一领域技术更加易于使用并可供更广泛的科研社区应用。该工作的亮点,从实验设计上:考虑到了目前HDX-MS流程——数据采集、数据分析——中存在的瓶颈与局限。从方法学考察层面:方法验证科学严谨、周到。从技术上:大大降低了人工处理HDX-MS数据的成本,提高了检测能力,有提高检测通量的潜力。从科学思维上:利用了scrambling的规律,将普遍的问题转化成了机遇。HX-DIA提供了一个概念上的转变,降低了该技术的使用门槛,使该技术“平民化”。本文发表在Nat. Commun.上,题目为“Automating data analysis for hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry using data-independent acquisition methodology”,作者是加拿大卡尔加里大学的David C. Schriemer。
  • 328万!大庆市生态环境局采购在线式气相色谱质谱联用分析仪、SO2分析仪等
    项目概况大庆市生态环境局VOCs自动监测站仪器设备采购项目C的潜在投标人应在大庆市电子政府采购交易管理平台获取招标文件,并于2021年11月15日9点30分前递交投标文件。一、项目基本情况黑龙江省大庆市政府采购中心受采购人委托组织大庆市生态环境局VOCs自动监测站仪器设备采购C项目。本项目面向各类型企业进行采购。欢迎有能力的国内供应商参加。本项目远程开标。项目编号:DZC20201539项目名称:大庆市生态环境局VOCs自动监测站仪器设备采购项目C预算金额:3,280,000.00元,参与投标供应商投标报价超出预算的投标无效。采购需求:详见附件合同履行期限:签订合同后一个月内。本项目不接受联合体投标。二、申请人的资格要求:1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定;2. 本项目执行政府采购扶持中小企业的相关政策。详见《政府采购促进中小企业发展管理办法》。投标供应商所投全部产品为小型企业或微型企业或监狱企业或残疾人福利单位制造,提供声明函(须按招标文件内规定格式填写声明函),则总报价享受10%的扣除,用扣除后的价格参与评审。注:①以上“用扣除后的价格参与评审”是指开标现场,依据供应商投标总报价进行10%的扣除后参与评审。②涉及多个产品的声明函中应包含全部产品,不提供声明函或提供不全的不享受相关扶持政策。3.本项目的特定资格要求:(1)提供参与本项目投标供应商有效的营业执照或事业单位法人证书。(2)在开标现场,本项目要求所投在线式气相色谱质谱联用分析仪、在线式气相色谱分析仪(甲烷/非甲烷总烃)产品必须满足3个及以上品牌,否则,本项目废标。(3)单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下的政府采购活动。三、获取招标文件时间:公告之日起至2021年11月1日注:请参与本项目投标的供应商在2021年11月1日17时00分前自助下载文件,逾期则无法下载文件,由此造成的后果由供应商自行承担。地点:大庆市电子政府采购交易管理平台方式:网上自助下载文件(详见:http://ggzyjyzx.daqing.gov.cn/bsznTbr/20199.htm?pa=7355---《入库、办理数字证书及自助下载文件说明》)售价:免费四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点2021年11月15日9点30分地点:大庆市行政服务中心四楼开标室五、公告期限自本公告发布之日起5个工作日。六、其他补充事宜1、退出投标时限:如供应商退出投标,必须在投标截止时间前72小时,否则不予退出。2、全面贯彻庆财采【2019】3号文大庆市财政局关于开展政府采购领域扫黑除恶专项斗争的通知的规定,在本项目中重点打击8类政府采购领域涉黑、涉恶、涉乱形为。详见:http://www.hljcg.gov.cn/xwzs!queryOneXwxxqx.action?xwbh=8B2FAECAA29800DEE053AC10FDFA79C0七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息名 称:大庆市生态环境局地 址:黑龙江省大庆市高新区建设大厦联系方式:马梦淑131040951392.采购代理机构信息名 称:大庆市政府采购中心地  址:大庆市萨尔图区东风新村纬二路2号(大庆市行政服务中心三楼)联系方式:0459-61581503.项目联系方式采购人项目联系人:马梦淑电 话:13104095139采购代理机构项目联系人:王琪电话:0459-6158150附件: 项目需求温馨提示:本项目为明标打分。一、规格型号及参数序号名称规格参数/项目特征/服务要求单位数量1在线式气相色谱质谱联用分析仪仪器应用要求1)#适用于挥发性有机物的在线分析,满足环境空气挥发性有机物的定性定量分析;满足环保部《2018年重点地区环境空气挥发性有机物监测方案》(环办监测函〔2017〕2024 号)规定的VOCs在线监测设备的应用要求,仪器采用GC-MS/FID法。2)连续24小时在线监测环境空气中可挥发性有机物,并1小时出一组数据。监测项目应满足通用的臭氧前驱体标准(PAMs)监测项目,同时可监测环境空气中卤代烃、含氧化合物等挥发性有机物,监测项目≥116种。3)产品须满足《环境空气挥发性有机物气相色谱连续监测系统技术要求及检测方法》(HJ 1010-2018)中的要求。2.仪器工作环境1)工作环境温度: 20-30℃。2)工作环境湿度:≤ 85%R.H. (无冷凝)3)电源:单相200-240V@50 Hz,电流大于10A。3.仪器主要技术指标采样模块1)进样捕集模块:采用低温除样品中水分,低温富集目标VOCs;不使用液氮富集冷阱装置,降温至少至摄氏-30℃,可浓缩富集 C2-C12 碳氢化合物,保证目标化合物有效捕集及脱附,满足高挥发性化合物的捕集需要。2)软件可全自动进行系统状态和性能检查,自动完成多点校准曲线绘制和方法切换;3)热解析模块:可在15秒内快速加热至除水、解吸样品等过程所需要的温度,保证干扰物去除,目标化合物被迅速解析、进样,达到良好的分离效果;4)系统控制软件可完成采样、捕集、热解吸、分析,加热反吹等全过程自动控制;5)采用高精度电子质量流量模块精确控制采样流量和采样体积;6)采用分流进样,分流比可设置为5:1到90:1,可有效应对高浓度污染因子监测。 色谱分离模块1)气相色谱能实现目标化合物的有效分离;2)在FID检测器中:环戊烷和异戊烷的分离度、2,3-二甲基戊烷和2-甲基己烷的分离度及邻-二甲苯和苯乙烯的分离度达到 1.0 以上;3)色谱柱系统:毛细管色谱柱柱。4) 色谱柱温度控制:室温+10℃到300℃;从300℃降温到50℃不超过1分钟;FID检测器模块1)全自动电子压力控制;2)全自动点火,熄火自动保护;3)在线仪器专用FID检测器; 质谱检测器1)离子化方式:EI;2)质量分析器:四极杆质谱检测器;3)为确保测试间隔无残留,除离子源及传输模块可高温加热外,质量分析器可独立高温加热;最高温度可加热至240度;4)质量稳定度≤0.1amu/12 h;5)质谱最大扫描速度不低于:10000amu/s;6)质量准确度≤0.1amu;7)质量范围:10-500amu;8)质量分辨率:优于单位质量分辨率;9) 真空系统:真空度满足系统要求,真空系统无油设计。10)意外断电后可以自行恢复测试,达到技术指标要求所需的时间在 6 h 以内,确保数据获取率达到国家要求 4.仪器性能1)可分析组分:大气中挥发性有机物,包括PAMS(57种),TO15组分(65种),OVOC(12种)等有机物;满足《2019年地级及以上城市环境空气挥发性有机物监测方案》(环办监测函〔2019〕11 号)规定的在线监测物种要求;2)不少于90%目标化合物的方法检出限≤0.1ppb,目标化合物中应至少保留乙烷和乙烯。3)量程范围:不低于50 nmol/mol;4)长时间保留时间漂移:≤0.5min;5)方法线性:按照HJ1010-2018标准要求全部目化合物的线性相关系数≥0.98;6)重复性和稳定性:连续7次以上测定同一浓度目标化合物的标准气体,不少于90%的目标化合物RSD小于10%;7)所有物种系统残留均小于0.1nmol/mol;8)数据有效率≥85%;9)分离度≥1.0(以分离环戊烷及异戊烷为准);10)供电及功率:220VAC±10%,50Hz,≤1000瓦(含峰值)。11)设备应集成在定制机柜中,与空气常规因子监测仪器安装形式保持一致,便于产品后期的安装与运维。5. 数据分析1)数据分析系统具有报警管理功能,当设备出现故障、数据超过限定值,会通过短信或者邮件方式告知用户。2)基于自动寻峰算法,通过指数算法自动识别,可以快速筛查同分异构体,进行VOCs组分的准确定性定量分析。3)能够分析VOCs随时间变化规律,计算OFP臭氧生产潜势等参数,反映光化学污染状况及演变规律。4)能够集成气象五参数分析仪,O3/NOx等常规分析仪,GPS及GIS等监测数据进行关联分析。5)能够实时显示各目标化合物监测数据和工作状态参数等, 可设置条件查询和显示历史数据。6)能够记录存储半年以上的数据, 具有历史数据查询、 导出功能。停电后,能自动保存数据。套12在线式气相色谱分析仪(甲烷/非甲烷总烃)1)#采用气相色谱-氢火焰离子化检测法连续在线监测环境空气中非甲烷总烃浓度和甲烷浓度;2)#监测原理:采用国家标准规定的气相色谱法(GC-FID直接法),通过非甲烷总烃低温富集直接进样的技术路线直接得到非甲烷总烃的浓度,满足《环境空气非甲烷总烃连续自动监测技术规定(试行)》(总站气字【2021】61号)要求。3)分析周期:≤15min;4)进样捕集模块:样品流量采用电子流量压力控制,可定体积采样;采用低温富集技术,富集最低温度≤-10℃,保证目标化合物有效捕集;5)热解吸模块:富集管采用快速升温技术,升温速度>15℃/s,最高温度可达≥200℃;6)方法检出限:甲烷检出限≤100ppb,非甲烷总烃检出限≤20 ppbC。7)空白:通入含 60%相对湿度的高纯零空气,空白样品甲烷浓度≤100ppb、非甲烷总烃浓度小于非甲烷总烃方法检出限;8)校准曲线:非甲烷总烃校准曲线的相关系数 R2≥0.999;9)24h 零点漂移:≤±20 ppbC;10)24h 量程漂移:≤±5%;11)重复性:≤5%;12)准确性:≤±10%;13)高浓度残留:≤2%标准气体浓度;14)平行性:≤ 2%15) 压力/流量控制:满足全自动在线监测的需求,仪器采用全电子压力/流量控制(载气,氢气,空气),具有保留时间锁定和自动校准功能;16)停电后,能自动保存数据;停电恢复后,监测仪能自动恢复到原来的工作状态;具备自动校准功能;能够记录储存半年以上的数据,具有历史数据查询、导出功能;17)分析软件采用全中文操作,能进行所有维护诊断功能操作,能监控并记录仪器的阀箱温度、柱箱温度、载气压力、柱前压力等各项运行参数,可设置自动控制仪器的运行参数,自动进行数据处理,实现对外通讯。套13SO2分析仪设备用途1)用于空气中二氧化硫浓度的监测配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:紫外荧光法2)量程范围:0-500ppb到0-20ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.5ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S.6)检测下限:1.0ppb7)零点漂移:≤1ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:产品性能要求1)具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级;6)具备光源光强衰减自检功能7)产品软件获得计算机软件著作权登记证书8)产品通过CCEP认证。套14氮氧化物分析仪设备用途1)用于空气中NO、NO2、NOx浓度的监测;配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)分析方法:化学发光法2)量程范围:0-500ppb到0-20ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.2ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S.6)检测下限:≤0.4ppb7)零点漂移:≤0.5ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:11)响应时间:小于等于5分钟12)样气流量:(500±50)sccm产品性能要求1)具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级。6)产品软件获得计算机软件著作权登记证书。7)产品需通过CCEP认证。套15一氧化碳分析仪设备用途1)用于空气中一氧化碳浓度的监测配置要求1)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:气体滤波相关红外吸收法,对环境空气中的一氧化碳进行实时监测。2)量程范围:0-50ppm到0-1000ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb、ppm、μg/m3、mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.1ppm(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S6)检测下限:≤0.5ppm,7)零点漂移:±1ppm/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:16臭氧分析仪设备用途1)用于空气中臭氧浓度的监测配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:紫外吸收法2)量程:0~500ppb到0~10ppm,可选双量程和自动量程3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.3ppb(RMS)5)量程噪声:≤5ppb6)检测下限:≤0.6ppb7)零点漂移:≤2ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:套17PM10分析仪设备用途1) 用于空气中PM10颗粒物质量浓度的监测配置要求1) 含PM10切割头、采样纸带等技术参数要求1) #测量原理:β射线吸收法2) 分辨率:0.1μg/m33) 最低检测限:0.002mg/m34) 仪器平行性:≤7%5) 测量量程:(0~1)mg/m3、(0~2)mg/m3、(0~5)mg/m3、(0~10)mg/m3(可选)6) 采样流量:16.7L/min7) 流量误差:±1%F.S8) 采样流量稳定性:≤±2%工作点流量/24h9) 校准膜重现性:≤±2%标准值10) 测量周期:10分钟-300分钟11) 源:C14放射源,活动10μCi,属于豁免源12) 滤纸带:玻璃纤维13) 探测器:PMT(闪烁体光电倍增管)产品性能要求1) 具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2) 具备开机自检和运行自诊断功能;3) 可自动存储校准数据及报警信息;套115动态校准仪能依据外接标准气体种类提供精确浓度的标准气体输出,完成大气自动监测分析仪器的零点、跨度、精密度及多点校准工作。基本单元(稀释配气部分)1)稀释气流量范围:标配:0~10SLM;可选:0~5SLM、0~20SLM2)标气
  • 《中国气相色谱仪市场数据分析报告(2019年~2020年H1)》正式发布
    气相色谱法至今已有50多年的发展历史,现在已成为一种成熟且应用广泛的分离复杂混合物的分析技术。其中,气相色谱仪由于适用性、分离能力及样品回收率等方面的优势,更是受到广大分析测试领域人员的欢迎。近年来,我国对气相色谱仪的需求有增无减,整个气相色谱市场迎来发展的最佳时机。尽管2020年新冠疫情肆虐,但气相色谱仪市场并未受到影响。为了更系统的了解近年来我国气相色谱仪的市场情况,仪器信息网特别对相关网站气相色谱仪中标信息以及海关总署“气相色谱仪”的进出口数据进行了统计分析,并整理成了《中国气相色谱仪市场数据分析报告(2019年~2020年H1)》。《中国气相色谱仪市场数据分析报告(2019年~2020年H1)》介绍了气相色谱仪技术发展情况,同时详细分析了近两年我国气相色谱各领域、各地区中标情况以及各品牌中标情况,并详细分析了气相色谱仪进出口情况。报告链接 报告节选:仪器信息网将政府部门进行了分类,从这些单位采购情况来看,其中****部门采购率最高,占比为****;其次为****和****,占比分别为****和****;****紧随其后,占比****;****和****占比比较接近,分别为****和****。根据2020年上半年中标统计数据显示,2020上半年公开发布的国内气相色谱仪中标总金额为****亿元人民币,相较于2019年上半年的****亿元同比增长****;上半年中标数量为****台,相较于2019上半年的****台同比增长****。由数据可以看出。。。。。。2020年上半年,我国共进口气相色谱仪****台,与同期相比,数量增长****;进口额共****亿元,与同期相比增长约****。整体来看。。。。。。 。。。。。。报告目录:第一章 气相色谱仪概况….11.1气相色谱仪……11.2气相色谱技术进展及未来发展趋势……11.3 近三年气相色谱仪新品……21.4气相色谱技术应用进展……91.5 气相色谱市场基本情况……10第二章 气相色谱仪招中标分析……122.1 2019年气相色谱仪中标情况分析……122.1.1 2019年气相色谱仪各季度中标情况分析……122.1.2 2019年气相色谱仪采购单位地域情况分析……132.1.3 2019年气相色谱仪采购单位性质情况分析……142.1.4 2019年气相色谱仪各品牌中标情况分析……152.2 2020上半年气相色谱仪中标情况分析……182.2.1 2020上半年气相色谱仪各月份中标情况分析……192.2.2 2020上半年气相色谱仪采购单位地域情况分析……192.2.3 2020上半年气相色谱仪采购单位性质情况分析……202.2.4 2020上半年各品牌气相色谱仪中标情况分析……20第三章 气相色谱仪进出口分析……223.1中国气相色谱仪进口规模及情况分析……223.1.1 2019年及2020上半年气相色谱仪各月份进口情况分析……223.1.2 2019年及2020上半年气相色谱仪进口企业注册地情况分析……233.1.3 2019年及2020上半年进口气相色谱仪货源地情况分析……243.2 中国气相色谱仪出口规模及情况分析……253.2.1 2019年及2020上半年气相色谱仪各月份出口情况分析……253.2.2 2019年及2020上半年气相色谱仪出口发货地情况分析……263.2.3 2019年及2020上半年气相色谱仪出口国情况分析……27第四章 总结……29如对本报告感兴趣,可通过以下邮箱zhangyy@instrument.com.cn 联系我司相关人员,咨询报告相关细节!!
  • 大庆市生态环境局预算328万元购买在线式气相色谱质谱联用分析仪等多台仪器
    3月27日,大庆市生态环境局VOCs自动监测站公开招标,购买在线式气相色谱质谱联用分析仪、在线式气相色谱分析仪、氮氧化物分析仪等多台设备,预算328万元。  项目编号:DZC20201539  项目名称:大庆市生态环境局VOCs自动监测站仪器设备采购项目  采购需求:序号名称规格参数/项目特征/服务要求单位数量1在线式气相色谱质谱联用分析仪1.仪器应用要求1)#适用于挥发性有机物的在线分析,满足环境空气挥发性有机物的定性定量分析;满足环保部《2018年重点地区环境空气挥发性有机物监测方案》(环办监测函〔2017〕2024 号)规定的VOCs在线监测设备的应用要求,仪器采用GC-MS/FID法。2)连续24小时在线监测环境空气中可挥发性有机物。监测项目应满足通用的臭氧前驱体标准(PAMs)监测项目,同时可监测环境空气中卤代烃、含氧化合物等挥发性有机物,监测项目≥116种。3)产品须满足《环境空气挥发性有机物气相色谱连续监测系统技术要求及检测方法》(HJ 1010-2018)中的要求。2.仪器工作环境1)工作环境温度: 20-30℃。2)工作环境湿度:≤ 85%R.H. (无冷凝)3)电源:单相200-240V@50 Hz,电流大于10A。3.仪器主要技术指标采样模块1)进样捕集模块:采用低温除样品中水分,低温填料富集目标VOCs;不使用液氮富集冷阱装置,采用单级小型制冷机实现低温,降温至少至摄氏-40℃,可浓缩富集 C2-C12 碳氢化合物,保证目标化合物有效捕集及脱附,满足高挥发性化合物的捕集需要;2)软件可全自动进行系统状态和性能检查,自动完成多点校准曲线绘制和方法切换;3)热解析模块:可在15秒内快速加热至除水、解吸样品等过程所需要的温度,保证干扰物去除,目标化合物被迅速解析、进样,达到良好的分离效果;4)系统控制软件可完成采样、捕集、热解吸、分析,加热反吹等全过程自动控制;5)采用高精度电子质量流量模块精确控制采样流量和采样体积;6)采用分流进样,分流比可设置为5:1到90:1,可有效应对高浓度污染因子监测。色谱分离模块1)色谱柱模块正常分析时,功耗小于80W;2) 色谱柱温度控制:室温+10℃到300℃;从300℃降温到50℃不超过1分钟;3)色谱柱系统:低热容毛细管柱,柱上直接加热,低功耗,高集成度,无需柱箱;FID检测器模块1)全自动电子压力控制;2)全自动点火,熄火自动保护;3)在线仪器专用FID检测器。质谱检测器1)离子化方式:EI;2)质量分析器:四极质谱检测器;3)为确保测试间隔无残留,除离子源及传输模块可高温加热外,质量分析器可独立高温加热;最高温度可加热至240度;4)质量稳定度≤0.1amu/12 h;5)质谱最大扫描速度不低于:10000amu/s;6)质量准确度≤0.1amu;7)质量范围:10-500amu;8)质量分辨率:优于单位质量分辨率;9) 真空系统:无油涡卷泵(或隔膜泵)+分子泵组合,真空系统无油设计;10)启动及恢复时间:开机抽真空到分析,时间不超过20分钟。意外断电后可以自行恢复测试,确保数据获取率达到国家要求;4.仪器性能1)可分析组分:大气中挥发性有机物,包括PAMS(57种),TO15组分(65种),OVOC(12种)等有机物;满足《2019年地级及以上城市环境空气挥发性有机物监测方案》(环办监测函〔2019〕11 号)规定的在线监测物种要求;2) 方法检出限:C2-C5,采用FID检测器;MSD测量C6-C12范围的碳氢化合物、C2-C5碳氢化合物:≤0.08ppb(丙烷); 碳氢化合物:≤0.06ppb(丙烯);C6-C12碳氢化合物:≤0.09ppb(甲苯)、≤0.03ppb(苯)、≤0.06ppb(正壬烷);卤代烃类挥发性有机物:≤0.08ppb(1,2-二氯丙烷)、≤0.08ppb(四氯化碳);含氧(氮)类挥发性有机物:≤0.13ppb(甲基叔丁基醚)、≤0.09ppb(丙酮);硫化物类VOCs:≤0.06ppb(二硫化碳);3)量程范围:不低于50 nmol/mol;4)长时间保留时间漂移:≤0.5min;5)方法线性:全部目化合物的线性相关系数≥0.98;6)重复性和稳定性:连续7次以上测定同一浓度目标化合物的标准气体,不少于90%的目标化合物RSD小于10%;7)所有物种系统残留均小于0.1nmol/mol;8)数据有效率≥85%;9)分离度≥1.0(以分离环戊烷及异戊烷为准);10)供电及功率:220VAC±10%,50Hz ,≤1000瓦(含峰值)11)色谱-质谱联用仪主机及前处理设备宽度不超过480mm,系统可集成在19英寸机柜内,与空气常规因子监测仪器安装形式保持一致,便于产品后期的安装与运维。 5. 数据分析1)数据分析系统具有报警管理功能,当设备出现故障、数据超过限定值,会通过短信或者邮件方式告知用户;2)基于自动寻峰算法,通过指数算法自动识别,可以快速筛查同分异构体,进行VOCs组分的准确定性定量分析;3)能够分析VOCs随时间变化规律,计算OFP臭氧生产潜势等参数,反映光化学污染状况及演变规律;4)能够集成气象五参数分析仪,O3/NOx等常规分析仪,GPS及GIS等监测数据进行关联分析。套12在线式气相色谱分析仪(甲烷/非甲烷总烃)1)监测项目:环境空气甲烷、总烃、非甲烷总烃;2)#分析方法:气相色谱法;采用总烃扣除甲烷差值法,符合《环境空气 总烃、甲烷和非甲烷总烃的测定 直接进样-气相色谱法》(HJ604-2017)方法要求;3)温控系统:阀箱和柱箱独立控制,柱箱最高温度≥175℃;阀箱最高可控温度≥175℃;4)色谱柱:非甲烷总烃采用填充柱带反吹功能;总烃采用空柱;仪器带反吹功能可对甲烷柱进行反吹;5)压力/流量控制:满足全自动在线监测的需求,仪器采用全电子压力/流量控制(载气,氢气,空气),具有保留时间锁定和自动校准功能;6)FID检测限:优于0.01ng/s;7)数据捕获率:≥99%;8)检出限:≤0.015mg/m3;9)检测限:≤6.4×10-13g/s;10)基线漂移:≤6.0×10-14A/30min;11)噪声:≤8.0×10-15A;12)重复性:≤0.5%;13)量程漂移(非甲烷总烃):≤0.5% FS;14)实际测试3台设备平行性:≤2%;15)停电后,能自动保存数据;停电恢复后,监测仪能自动恢复到原来的工作状态;具备自动校准功能;能够记录储存半年以上的数据,具有历史数据查询、导出功能;16)进样流量、供电电压影响:≤2% FS;17)氧气的影响:≤2% FS;18)绝缘电阻和绝缘强度符合要求;19)人机交互要求:分析仪表具有内置工业PC机和触摸操作显示屏;20)分析软件采用全中文操作,能进行所有维护诊断功能操作,能监控并记录仪器的阀箱温度、柱箱温度、载气压力、柱前压力等各项运行参数,可设置自动控制仪器的运行参数,自动进行数据处理,实现对外通讯。套13SO2分析仪设备用途1)用于空气中二氧化硫浓度的监测配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:紫外荧光法2)量程范围:0-500ppb到0-20ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.5ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S.6)检测下限:1.0ppb7)零点漂移:≤1ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:12)样气流量:(650±65)sccm产品性能要求1)具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级;6)具备光源光强衰减自检功能7)产品中软件系统获得计算机软件著作权登记证书8)产品通过CCEP认证。套14氮氧化物分析仪设备用途1)用于空气中NO、NO2、NOx浓度的监测;配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)分析方法:化学发光法2)量程范围:0-500ppb到0-20ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.2ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S.6)检测下限:≤0.4ppb7)零点漂移:≤0.5ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级。6)产品中软件系统获得计算机软件著作权登记证书。7)产品通过CCEP认证。套15一氧化碳分析仪设备用途1)用于空气中一氧化碳浓度的监测配置要求1)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:气体滤波相关红外吸收法,对环境空气中的一氧化碳进行实时监测。2)量程范围:0-50ppm到0-1000ppm(可选双量程和自动量程)3)浓度单位:ppb、ppm、μg/m3、mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.1ppm(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S6)检测下限:≤0.1ppm7)零点漂移:≤0.1ppm/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:产品性能要求1)具有中文触摸式彩屏,方便查询、操作维护;2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级;6)具备光源光强衰减自检功能;7)产品具有GFC轮定位及同步采样功能;8)产品中软件系统获得计算机软件著作权登记证书;9)产品通过CCEP认证。套16臭氧分析仪设备用途1)用于空气中臭氧浓度的监测配置要求2)含过滤滤膜等技术参数1)#分析方法:紫外吸收法2)量程:0~500ppb到0~10ppm,可选双量程和自动量程3)浓度单位:ppb,ppm,ug/m3,mg/m3(可选)4)零点噪声:≤0.3ppb(RMS)5)量程噪声:≤0.5%F.S6)检测下限:≤0.6ppb7)零点漂移:≤2ppb/24h8)量程漂移:≤1%F.S./24h9)线性度:2)具备开机自检和运行自诊断功能;3)可自动存储校准数据及报警信息;4)支持一键查询历史数据;5)支持远程软件系统升级;6)具备光源光强衰减自检功能。7)产品中软件系统获得计算机软件著作权登记证书;8)产品通过CCEP认证。5) 水箱容积:2.5L6) 压缩机:旋转式7) 体积:330*300*520mm8) 重量:10kg套1
  • Thermo与MSAID合作,创新方法重新定义蛋白质组学研究的数据分析
    日前,服务科学领域的全球领导者 Thermo Fisher Scientific 和蛋白质组学人工智能领域的领导者 MSAID 合作,为蛋白质组学研究人员提供先进的质谱软件,从而产生市场——通过使用人工智能 (AI) 和深度学习显着提高肽识别和定量能力,从获取的数据中获得领先的生物学洞察力。带有 CHIMERYS by MSAID 的 Thermo Scientific Proteome Discoverer 3.0 软件利用人工智能(AI)显着提高蛋白质组学数据中独特肽识别的识别率和数量。与通常假设串联质谱中的所有峰均来自单个肽的现有方法相比,CHIMERYS 确定了可以解释获得的串联质谱的最小肽集。与现有工具相比,这种创新方法使典型蛋白质组学数据集的独特肽识别数量增加了 1.8 倍,蛋白质识别数量增加了 1.5 倍。除了提高蛋白质覆盖率和定量能力外,Proteome Discoverer 3.0 软件与 CHIMERYS 搭配使用还有助于加快数据采集速度,从而提高样品通量。Thermo Fisher Scientific 和 MSAID 在宾夕法尼亚州费城宾夕法尼亚会议中心举行的第 69 届美国质谱学会(ASMS)质谱和相关主题会议上展示他们的新软件解决方案。「以前的技术无法完全解释使用质谱法生成的数据,因为质谱可能包含来自多个共同分离肽的片段,而这些片段无法使用当前算法进行识别。」 Thermo Fisher Scientific 的色谱和质谱研发副总裁 August Specht 说,「通过使用 Proteome Discoverer 3.0 软件和 CHIMERYS,科学家们现在可以利用人工智能对蛋白质组数据进行更深入的挖掘。这不仅提高了蛋白质组学的覆盖范围,而且还扩展了蛋白质组学科学家获取和应用数据的方式。」MSAID 首席执行官 Martin Frejno 说:「嵌合光谱是基于质谱的蛋白质组学中的一个长期存在的问题。通过 CHIMERYS,我们使用 AI 从头开始重新构想串联质谱的分析来解决它。」Proteome Discoverer 3.0 软件版本还包括更新的 INFERYS 预测模型,扩展了对串联质量标记(TMT)、碰撞诱导解离(CID)的支持,并为免疫肽组学提供了改进的结果。通过 Proteome Discoverer 3.0 软件和 CHIMERYS 的智能数据分析与 Thermo Scientific Vanquish Neo 超高效液相色谱(UHPLC)系统和 Thermo Scientific Orbitrap 质谱平台中的领先硬件技术配对,研究人员将有能力继续突破界限 蛋白质组学研究。有关 Thermo Scientific Proteome Discoverer 3.0 软件和 MSAID 的 CHIMERYS 的更多信息:www.thermofisher.com/proteomediscoverer关于 Thermo Fisher ScientificThermo Fisher Scientific 官网:www.thermofisher.comThermo Fisher Scientific 是科学服务领域的全球领导者,年收入约为 350 亿美元。「我们的使命是让我们的客户让世界更健康、更清洁、更安全。」 无论他们的客户是在加速生命科学研究、解决复杂的分析挑战、改进患者诊断和治疗还是提高实验室的生产力,Thermo 都会在这里为他们提供支持。他们由 90,000 多名员工组成的全球团队通过行业领先的品牌(包括 Thermo Scientific、Applied Biosystems、Invitrogen、Fisher Scientific、Unity Lab Services 和 Patheon)提供无与伦比的创新技术、购买便利和制药服务组合。关于 MSAIDMSAID 官网:https://msaid.de/MSAID GmbH [ m s e d] 改变了科学家分析蛋白质组学数据的方式。MSAID 是德国慕尼黑工业大学蛋白质组学和生物分析系主任的私人控股信息学分拆公司。该公司由一个跨学科的科学家团队创立,其愿景是为蛋白质组学领域提供更好的计算解决方案。该团队成员在蛋白质组学数据的获取、分析和解释方面拥有极其出色的业绩记录和长期的专业知识。作为蛋白质组学人工智能的领导者,他们用强大的、基于人工智能的解决方案取代当前的算法,并为更深入、更可靠的蛋白质组学数据查询方式铺平道路。相关报道:https://www.biospace.com/article/releases/innovative-approach-redefines-data-analysis-in-proteomics-research/?keywords=AI
  • 日本岛津推出基于AI开发算法的数据分析辅助软件
    日前,岛津制作所推出了三重四极杆液相色谱质谱联用仪(LC-MS/MS)用可选软件“Peakintelligence”,该软件搭载了利用AI(人工智能:Artificial Intelligence)开发的算法。 本产品可在利用LC-MS/MS与“一次代谢产物方法包”或“细胞培养分析方法包”※1进行分析时,自动检测出画面上频繁出现的峰※2。以前凭借操作员目视确认的工序交由软件完成,实现了研究现场的工作方式改革。本产品是与富士通株式会社、株式会社富士通研究所联合研究开发※3的。 被广泛应用于疾病早期发现和食品农残检测等各种用途的质谱分析仪,随着仪器的不断进步,所采集的数据量越来越庞大。因此,在对仪器采集的数据进行分析时的“峰积分”※4作业成为检测过程中的瓶颈。由于大量的峰检测需要目视确认,故难以做到全部自动化,往往需要花费很长时间的峰积分也成为了沉重的负担。此外,因人为失误或者习惯不同,导致每位操作员的操作精度也参差不齐,加之不能排除被人为篡改的可能性。在医疗和新药开发等生命科学类研究现场,“排除人为因素的高精度峰积分自动化”成为急需解决的课题。 自2016年起,岛津制作所与富士通、富士通研究所联合开展有效利用AI进行峰自动检测技术的研究。本公司承担“弥补teaching data※5不足部分的数据生成技术”研究,富士通与富士通研究所承担“学习熟练操作员分析技巧特征提取技术”研究,生成的7万个teaching data通过Deep Learning(深度学习)功能进行学习。联合研究结果显示,与熟练操作员的目视?手动处理相比,AI实现了误检测率7%,未检侧率9%的高精度检测,因此,此次“Peakintelligence”得以发售。 可选软件“Peakintelligence”虽然是为LC-MS/MS中的生命科学领域(一次代谢产物、细胞培养)而研发的,但将逐步扩大应对机型与应用领域。今后,我们仍将继续开展AI技术研发,利用AI技术,努力提高使用本公司产品的所有分析仪器用户的工作效率。※1 方法包:以产品的形式提供将分析条件与预处理程序等进行优化的“ready-to-use”特定用途分析相关信息。与在用户关注度高的领域有实际业绩的研究人员联合研发。※2 峰:表示从质谱分析仪采集的数据(图表)的波形(峰)。其高度和面积表示化合物的含量。※3 联合研究:开发时,从大阪大学研究生院工学研究科福崎英一郎教授、该研究生院信息科学研究科松田史生教授获得了研究人员需要的输入量和技术性建议。岛津制作所与大阪大学设置了“大阪大学岛津分析创新联合研究讲座”,推进以代谢组学为中心的分析技术的开发与应用。※4 峰积分:确定峰的起点和终点,定义峰的工序。一般的软件都是设置参数以期实现自动检测,但部分峰需要操作人员目视确认、校正。※5 teaching data:进行深度学习网络时的数据。录入网络的数据和与此相对应的预期输出为一组。在本技术中,为分析仪的输出数据和与此相对应的熟练操作员的峰积分结果的组合。新产品的特点1.与熟练操作员相媲美的AI算法分析精度AI开发的算法(搭载在本产品上)与现有软件的分析结果相比较,与熟练操作员分析的一致率前者为93.8%,后者为87%(1个样品中含100种分析对象化合物,分析14个样品的情况)。“Peakintelligence”可完成与熟练操作员相媲美的高精度峰积分。2. 分析时间缩短至三分之一同样的,AI开发的算法和现有软件,对在“峰自动检测与目视校正”上所花费的时间进行比较,在上述条件下,前者为6.3小时,后者为18.1小时。峰积分所需的时间缩短至三分之一。由于该作业需要耐心和注意力集中,所以,对操作员来说是一种巨大的负担。而如果使用“Peakintelligence”,不仅可以实现研究现场的工作方式改革,并且,用户也能更加专注于创造性工作。3. 第一次采用订阅版方式作为本公司的软件产品,第一次采用了订阅版方式。以一年为单位(定价250万日元)出售使用许可,用户可根据研究计划灵活利用。此外本公司还准备了90天的演示版使用许可。
  • 还不会使用远程数据分析系统?进来看
    随着云计算和远程工作的普及,远程数据分析系统成为了许多企业和组织进行数据分析的工具。这种系统可以让用户在任何地点通过互联网连接到远程服务器,使用强大的计算能力和数据处理功能进行数据分析。下面是一个关于远程数据分析系统使用方法的简要介绍。   1、获取访问权限。通常,用户需要向系统管理员或相关部门申请账号和访问权限。一旦获得了访问权限,用户就可以通过远程登录方式连接到远程服务器。   2、了解系统的基本操作和功能。远程数据分析系统通常提供了一系列工具和功能,用于数据导入、清洗、转换、分析和可视化。用户可以通过学习系统的文档、教程或参加培训来熟悉系统的操作方法。   3、在开始进行数据分析之前,用户需要准备好要分析的数据。这可能涉及到从本地计算机或其他数据源导入数据到远程服务器中。该系统通常支持多种数据格式,如CSV、Excel、数据库等。用户可以使用系统提供的导入工具或编写脚本来导入数据。   4、一旦数据导入完成,用户就可以开始进行数据分析了。它通常提供了丰富的分析工具和函数库,包括统计分析、机器学习、数据挖掘等。用户可以根据自己的需求选择合适的工具和方法进行数据分析。同时,系统也通常提供了交互式的编程环境,如Python、R等,使用户可以编写自定义的分析代码。   5、在进行数据分析过程中,用户还可以使用系统提供的可视化工具来展示和呈现分析结果。这些可视化工具可以帮助用户更好地理解数据和分析结果,并与他人分享分析成果。   6、用户需要保存和分享分析结果。本系统通常支持将分析结果导出为各种格式,如图像、报告、数据文件等。用户可以选择合适的导出方式,并将结果保存到本地计算机或其他存储设备中。此外,用户还可以通过系统内部的分享功能或其他协作工具与团队成员共享分析结果。   总结起来,远程数据分析系统是一种强大的工具,可以帮助用户在任何地点进行高效的数据分析。通过获取访问权限、了解系统操作、准备数据、选择合适的分析工具、展示和分享结果,用户可以充分利用它进行数据分析工作,并取得良好的分析成果。
  • 近红外数据分析中的关键问题网络讲座顺利召开
    近红外数据分析中的关键问题网络讲座顺利召开 2016年8月30日上午,由华东理工大学、南开大学、大连达硕信息技术有限公司共同主办的网络讲座,在仪器信息网,以在线的方式顺利召开。讲座分别由杜一平教授、邵学广教授、曾仲大总经理担任主讲人,围绕近红外数据分析中关键性、经常性问题进行全面、深入阐述。 杜老师从近红外光谱数据预处理、变量选择、模型构建与结果验证等诸多方面,非常细致地介绍了整个建模过程中涉及的算法及算法原理、注意事项,以及普遍遇到的问题及解决方法。杜老师也提到,近红外数据分析绝非看似的那样简单,涉及对数据的理解、对算法的理解。同时不能只关注数学方法,更要记住我们是化学家!邵老师从大数据分析角度出发,阐述近红外数据分析,并延伸到近红外光谱的模型转移。大数据是国家关注的重点方向,企业信息化的推进,数据体量不断增大,需要基于大数据与云计算的手段方法提升效率,挖掘数据价值。近红外的模型转移则是现在生产型企业发展中遇到的,非常棘手的问题。不同厂家、不用仪器的数据和模型不能共享,很难实现数据融合。邵老师经过多年的研究与实践从方法到应用给大家进行了详细介绍。同时邵老师介绍了近红外模型转移中需要考虑和注意的问题,以及目前比较成熟的算法,为大家解决实际问题提供广阔思路。 曾老师则从近红外数据分析应用与软件系统实现的角度,阐述如何能更智慧地构建近红外分析模型,并结合大连达硕信息技术有限公司最新发布的,全面介绍系统如何实现智慧型近红外数据分析,包括批量文件夹数据载入,智能数据建模算法流,“随时”、“随时”数据建模,全面的建模方法比较,以及优异的用户体验等等。同时鼓励近红外同行们使用产品,支持国产软件发展。讲座后,三位老师延长预定时间,回答大家感兴趣的诸多问题。此次讲座得到了近红外分析和化学计量学同行的普遍关注,人气指数超过5,500,300余人报名参加。讲座结束后,大家通过各种途径表达对讲座的支持厚爱,效果很好,评价非常高。与此同时,大连达硕信息技术有限公司在讲座后,建立化学数据联盟微信群,一方面使与会者可更深入讨论近红外相关问题,推进行业发展,另一方面也广纳同行对联盟发展的意见与建议,促进联盟发展。 大连达硕信息是国家高新技术企业,专注化学与生物行业数据的整合分析与深度挖掘,辅助决策支持,公司全方位提供数据分析服务、数据处理产品,以及个性化数据应用整体解决方案,是我国化学与生物数据应用领域的排头兵。公司技术力量非常雄厚,在化学与生物数据分析领域积累非常丰富的经验,深受客户好评。
  • 超级站,如何运维和数据分析?
    面对日益严重的大气复合型污染问题,我国从2010 年开始着手开展灰霾监测超级站建设,截止到2015年已投入建设二十多个,并预计 “十三五”期间,超级站的数量可超100个。目前,“三区十群”超级站正逐渐从省级监测中心和省会城市向有条件的地级市延伸;科学研究正逐渐向区域立体监测业务网络拓展。随着各地区超级站建设能力的增强和超级站数量的急剧增加,一系列问题迎面而来。面对如此庞大数量的监测仪器,该如何运维,保证数据的准确性?对输出的数据结果,该如何进行有效数据分析,及时、准确、全面地反映环境质量及发展趋势?  中科光电作为大气超级站的整体供应商及运维服务商,能为客户定制一系列完备的运维和数据分析方案,将高质量地保证超级站正常业务运行,确保监测数据有效输出,实现数据价值最大化。超级站运营维护服务  超级站运维现状  我国环境监测体系人员队伍建设不足,无力进行相关的研究及设备监管工作,使得投入无产出,资源大量无端浪费。同时多样化的环境指标所带来的环境监测设备品牌多、商家多、服务水平参差不一、管理人员联系困难、费用管理困难等问题日益突出。  超级站运维需求  理想的超级站运营维护服务应通过专业化、标准化的服务理念及流程,对超级站进行唯一的服务接口、统一的质量要求、统一的维护资料、长期稳定可靠的服务管理,为各有需求单位提供定制化的服务,保证环境监测数据的真实可靠。  超级站运维管理流程  超级站运维内容  总的来说,超级站运维包括常规维护和重点专项维护,每一项维护内容包括:  系统宏观检查  日常巡检  站房系统维护  采样专项维护  设备专项维护  预防性检修  针对性检修超级站数据分析服务  超级站数据分析服务现状  我国全指标、多样化的环境空气监测工作起步较晚,监测数据开发利用不足。一般情况下,监测部门只是将监测结果上报管理部门,而忽视了监测数据的加工整理和开发利用,从而缺少针对性强的监测数据分析,造成环境管理部门真正需要的信息少,对区域环境质量的变化解释不清,找不出存在的主要环境问题。  超级站数据分析服务需求  高质量的环境监测数据分析工作应具备以下方面:  一)说清现状。通过综合分析数据如实反映环境质量现状和污染来源的真实情况。  二)深度分析。最大限度的发挥各种监测数据的应用价值,集结有效数据,说清污染特征、污染来源及污染变化趋势,为环境污染的预警预测提供有效的数据支撑。  三)突出特色。对汇总数据进行特色加工形成监测报告,让管理机关等不同层面的人得到其想要的结果。  四)提出建议。站在全局的角度去思考,找出存在的问题,分析问题的形成原因,从开展环境管理和发展区域经济的影响因素方面分析原因,针对存在的问题提出相应的合理可行的建议。只有做到以上几点才能实现环境监测的根本目的。  超级站数据分析服务流程   自成立以来,中科光电以专业化、标准化的环境咨询服务队伍,为各有关部门提供定制化的第三方运营维护服务及综合数据分析服务,保障超级站数据准确输出,基于准确数据,说清区域污染过程、污染特征、污染来源及污染趋势,立志成为中国最权威的超级站运营维护团队和环境质量数据咨询服务团队。
  • 药物热分析讲座 第四部分:全自动软件流程 – 热分析数据分析的有力助手
    药物热分析讲座第四部分:全自动软件流程 – 热分析数据分析的有力助手率耐驰热分析学苑 No.16课程描述分析仪器的应用过程中,软件的作用越来越重要。对于分析软件,基本的要求是直观、操作简便、分析结果可靠。在热分析行业,耐驰公司提供的AutoEvaluation 和Identify毫无疑问是里程碑式的软件工具。它们提供的自动分析、自动识别和检索功能是业界绝无仅有的。对于DSC和TGA用户来说,这些工具不但节省时间,而且极大地减少了人为因素的干扰,使分析结果更为可靠。AutoEvaluation是业界第一个自动分析软件。它可以自动检测并分析热效应,无需人工干涉。例如可以使用此功能分析包含多个吸热、放热峰的DSC曲线。Identify是一个图谱检索和数据库系统。使用者通过几次鼠标点击就可以完成数据库检索。目前系统标配的数据库中包含了1200多条参考曲线,其中也包括了药物和有机物的数据。而且,Identify也可用于质量控制。本次课程将介绍如何使用这些软件工具,或者说NETZSCH的软件系统如何能帮助使用者提高日常测量的效率及可靠性。课程安排时间 2018年12月13日,星期四,10:00-11:00 上午,北京时间授课语言 中文设备软件 台式机、笔记本:在初次点击链接进入会议室时,链接会自动引导安装Go to Webinar软 件,并加入会议; 手机、平板电脑:需事先下载安装Go to Webinar客户端软件,后输入会议ID加入。
  • Open-pFind助力蛋白质组学分析 显著提高质谱数据解析率
    p style=" line-height: 1.5em " & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp 中国科学院计算技术研究所研究员贺思敏及其研究团队设计和实现了新一代开放式搜索算法Open-pFind,可提高质谱数据解析的数量与质量,有望成为蛋白质组学日常数据分析的主力工具。相关成果10月9日在线发表于《自然—生物技术》。 br/ /p p style=" text-align: center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201810/uepic/419b4d61-469e-48e0-baf9-3ef492f7ff8b.jpg" title=" 2018-10-12_165404.png" alt=" 2018-10-12_165404.png" / /p p style=" line-height: 1.5em "   质谱数据的低解析率直接影响着肽段和蛋白质鉴定数目和鉴定精度的提高。质谱数据解析率一直较低,是由于质谱数据中通常有大量存在意外修饰或发生意外酶切的肽段,传统的限定式搜索因搜索空间有限,通常无法对上述肽段进行有效检索。 /p p style=" line-height: 1.5em "   新一代开放式搜索引擎Open-pFind采用基于序列标签索引的开放式搜索流程,快速扫描蛋白质数据库并对部分高质量谱图进行鉴定。在此过程中,意外修饰、突变、半特异及非特异性酶切肽段均在引擎的搜索空间内。Open-pFind通过基于支持向量机的肽谱匹配重打分算法,挖掘数据中的特征信息,并据此进行第二次精细搜索。同时,Open-pFind集成了前端数据处理的pParse模块,对肽段母离子进行校准,并有效提取混合谱图,进一步提升了谱图解析率。 /p p style=" line-height: 1.5em "   在四组典型质谱数据集上,Open-pFind解析率均达到了70%~85%,比同类软件鉴定结果多出50.5%~117.0%。对于高质量的串联质谱图,Open-pFind甚至基本实现了完全解析。在搜索空间是常规引擎5个量级的基础上,Open-pFind的速度仍然是常规引擎的2~3倍,是同类开放式引擎的数十倍甚至上百倍。在超大规模人类蛋白质组数据集上,Open-pFind报告了超过12000种蛋白,且准确度远远超过以往常规分析结果。 /p p    /p p br/ /p
  • 赛默飞世尔和Sage-N Research联合提供完整蛋白质组学数据分析解决方案
    2008年8月20日,服务科技,世界领先的赛默飞世尔科技和高通量蛋白质组数据分析解决方案领先者 Sage-N Research Inc.经过五年合作,推出了在蛋白质组学分析领域内的最新产品---为企业Linux市场特殊设计的第一个蛋白质组学软件平台。   SORCERER™ 企业版软件产品来自Sage-N Research Inc.是一种可升级的软件套件,可在高性能的Linux系统上实现完全自动化、高容量的蛋白质组分析,该Linux系统包括刀片服务器和传统的Linux集群。SORCERER™ 是专门为生物医药企业和集中化的实验室里的数据中心设计的,这些实验室必须快速处理各个研究领域(如癌症,干细胞和神经退行性疾病)日益增长的来自质谱的蛋白质组学数据。   SORCERER企业版平台可作为主要的独立的数据分析系统,通过Web界面可支持数以百计的蛋白质组学研究人员使用。它也可以与Thermo Fisher Scientific最近发布的基于Windows的Proteome Discoverer软件进行无缝链接。高通量蛋白质组学研究实验室可将这两个互补性的产品作为一个整合系统,既可对SORCERER平台个性化定制后端的分析工具和底部的接口,也可以对Proteome Discoverer平台个性化定制前端的交互环境。SORCERER企业版是我们最新推出的下一代Proteomics 2.0分析软软件,侧重于蛋白质修饰(如最新的裂解方式电子转移解离裂解)和定量。”Sage-N Research Inc.蛋白质解决方案副总监James Candlin 说,“我们很高兴能与Thermo Fisher Scientific继续进行技术合作,向世界上高效能的蛋白质组学实验室提供具有创新性、世界一流的分析解决方案。   “我们一直致力于为高通量的顾客提供高质量的解决方案和最先进一流的产品,这些产品来自企业内部或与技术领先的伙伴合作开发。”Thermo Fisher Scientific 的蛋白质组学营销总监Andreas Hühmer说,“我们很高兴能够与Sage-N Research Inc.一直进行成功的合作,向市场提供业界领先的产品。”   SORCERER企业版软件为Thermo Scientific的SEQUEST® Clusters的用户提供了一个方向标,这些用户需要增加一些高级的数据分析功能,如蛋白质定量或数据库搜索的翻译后修饰分析。该软件目前正在促销中。  有关SORCERER企业版的软件可以直接咨询Sage-N Research Inc.,也可以向2008年人类蛋白质组大会的34展台的Thermo Fisher Scientific咨询。请致电:900-810-5118或400-650-5118,电邮sales.china@thermofisher.com 或者访问www.thermo.com, http://www.SageNResearch.com/. SEQUEST是华盛顿大学的注册商标 Sorcerer是Sage-N研究所的商标 Windows是微软公司的注册商标   Thermo Scientific是Thermo Fisher Scientific,的一部分,是全球科学服务领域的领导者. -------------------------------------------------------------------------------- 关于赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific)   Thermo Fisher Scientific(赛默飞世尔科技)(纽约证交所代码:TMO)是全球科学服务领域的领导者,致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年销售额超过100亿美元,拥有员工约33,000人,在全球范围内服务超过350,000家客户。主要客户类型包括:医药和生物公司,医院和临床诊断实验室,大学、科研院所和政府机构,以及环境与工业过程控制装备制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific这两个主要的品牌,帮助客户解决在分析化学领域从常规的测试到复杂的研发项目中所遇到的各种挑战。Thermo Scientific能够为客户提供一整套包括高端分析仪器、实验室装备、软件、服务、耗材和试剂在内的实验室综合解决方案。Fisher Scientific为卫生保健,科学研究,以及安全和教育领域的客户提供一系列的实验室装备、化学药品以及其他用品和服务。赛默飞世尔科技将努力为客户提供最为便捷的采购方案,为科研的飞速发展不断地改进工艺技术,提升客户价值,帮助股东提高收益,为员工创造良好的发展空间。欲了解更多信息,请登陆:www.thermofisher.com,或www.thermo.com.cn(中文)。
  • 博奥生物生物芯片数据分析专题培训讲座开班
    博奥生物信息培训班 第一期生物芯片数据分析专题培训讲座开班啦! 本次博奥生物举办的生物芯片数据分析培训讲座,以最优惠的价格为学员提供最实用的数据分析解决方案! 博奥生物芯片数据分析案例剖析及方案分享,让您思路更清晰! 为您提供免费软件应用等公共资源及操作指导,实用才是硬道理! 培训讲座内容安排: 2013.09.05 课程描述 上午:9:00-10:00 生物芯片技术及应用简介 1、生物芯片技术介绍及发展现状 2、博奥生物芯片平台及相应的典型案例介绍 上午:10:45-12:00 生物芯片数据分析解决方案 1、生物芯片常用数据分析手段介绍 2、数据分析典型案例剖析及整体解决方案培训 3、常用软件及公共资源分享 下午:1:30-4:00 常用生物信息软件实际操作培训 1、生物芯片平台给出数据介绍 2、实践培训:Mev、cytoscape、coexpress等经典的数据分析软件及绘图软件的培训 下午:4:00-5:00 参观博奥生物,探讨交流 1、博奥生物芯片平台展厅介绍 2、邀您探讨数据分析疑问,拓宽新的科研思路 培训对象 需要使用高通量技术特别是芯片技术进行科研的老师 需要加强生物信息分析思路,并能使用常用软件进行数据分析的老师 讲师介绍: 赵建晴博士:博奥生物微阵列服务部研究科学家 张杨工程师:博奥生物科技事业部生物信息应用工程师 培训费用: 800元/人(含午餐) 优惠措施: 1:在2013年08月25日前报名,可享受8折优惠。 2:博奥生物的仪器用户可享受1名免费培训名额。 3:相同单位报名超过1人的,从第2人起享受5折优惠。 缴纳注册费账户信息: 用户名:博奥生物有限公司 开户行:中国银行北京上地支行 帐号:3376 5602 2586 培训资料: 包括培训教材、培训证书(生物芯片北京国家研究中心印)、培训学员通讯录、精美礼品一份。 注意事项: 学员自备笔记本电脑,为保证教学质量,每期仅招收20位学员。 报名方式: 请您填写客户培训回执表,发送到qiandu@capitalbio.com邮箱中,我们收到回执表后3天内给予回复。 报到时间及住宿安排: 请于2013年9月5日9点前报到,如需住宿请在回执表中注明,公司可代为安排宾馆,费用自理。 具体路线: 1、北京站-博奥生物:地铁2号线到东直门换乘城铁13号线到西二旗站下车,坐521路/205路/112路到生命科学园站下车。 2、北京西站-博奥生物:步行至地铁军事博物馆馆站,地铁1号线复兴门站换乘地铁2号线,地铁2号线到西直门换乘城铁13号线到城铁西二旗站下车,坐521路/205路/112路到生命科学园站下车。 3、机场大巴至回龙观下车,乘出租车到生命科学园。 联系方式: 联系人:杜倩 电话:010-80726868转8246 15910764175 邮箱:qiandu@capitalbio.com 客户培训回执表: 姓名: E-mail: 单位: 电话: 地址: 邮编: 是否需要住宿: 是 否 备注:如果需要住宿,请注明入住时间 您感兴趣的领域:
  • 扩展数据分析软件工具增强了对2-D DIGE数据组的生物学解读能力
    2005年8月12日英国Chalfont St Giles消息 ——通用电气医疗集团推出了DeCyderTM 扩展数据分析(Extended Data Analysis,EDA)1.0版,―个针对蛋白质组研究市场的先进的软件解决方案。它能对不同数据组进行联合分析,并通过检索公共和本地数据库对结果进行生物学解读。由于增强了新版DeCyder v6.5 DIGE 图像分析软件的分析能力,EDA对2-D DIGE实验分析非常有用。 “EDA v1.0是一个功能强大的,尖端的2-D DIGE 软件解决方案,它以一种便于使用的形式提供先进的统计学分析,”GE Healthcare全球市场经理Kumar Bala 说道,“这种有用的分析工具将促进对调控途径的更深入了解,并帮助蛋白质组学研究人员更快更精确地识别区别于正常组织样品和疾病组织样品、以及不同疾病状态和肿瘤类型间的差异蛋白质。” DeCyder EDA采用多变量分析和高级的聚类分析方法,揭示由2-D DIGE实验所得到的实验数据的蛋白表达模式。该软件采用一个“数据组”(data set)作为2-D凝胶分析的基础,将匹配的蛋白点定义为蛋白图谱的一个点群(group),根据实验目的,每个数据组都能以不同方式被展示出来。 DeCyder EDA是进行生物学差异分析(Biological Variance Analysis,BVA)的一种理想工具,它能回答的问题有: - 在一个特定的数据组中存在有多少个蛋白点群和样品类别? - 是否有蛋白点表现出类似的表达模式,暗示着共调控作用? - 是否有蛋白质或蛋白表达模式可能是某种生物学或疾病状态的特征? - 是否有特定的蛋白质对开发非侵害性诊断或预后性症状检测有用? - 通用电气医疗集团特别设计的DeCyder软件包是Ettan 2-D DIGE 技术平台的关键组件,可精确检测和匹配Ettan DIGE凝胶的多重荧光图像。
  • 进出口双增长!2023年1-6月质谱联用仪进出口数据解读
    各位读者,大家早上好中午好下午好晚上好。近期,科学仪器领域的知名企业在披露的财报中不断释放出“经济下行压力加大”“客户支出谨慎且放缓”“下调全年业绩预期”等信号。面对这一局面,作为分析仪器“掌上明珠”的质谱仪市场表现又如何呢?当前,中国质谱联用仪市场仍高度依赖进口,进口产品市场占有率约90%。为探究质谱仪市场2023上半年的实际情况,仪器信息网结合海关进出口数据,试图找到答案。视频详情:我们先看下质谱大厂的业绩表现:赛默飞的分析仪器板块Q2收入同比增长9%,是四大业务板块之首,其中色谱和质谱业务有所推动;丹纳赫旗下的SCIEX公司Q2业绩实现高个位数的增长;Waters Q2营收增长4%至7.41亿美元,质谱增长接近20%.;布鲁克质谱业务增长近20%,timsTOF在蛋白质组学应用中需求强劲....虽然上半年整个科学仪器行业呈现低迷,质谱市场仍然交出了一份不错的“成绩单”。基于此,仪器信息网对比了2023年1-6月质谱联用仪的进出口数据,发现上半年质谱联用仪的进出口值相较2022同期均得到增长。进口额达到5.2亿美元(+11%),2622台(+24%),进口每台质谱联用仪均价为19.9万美元;出口额也从2022年的188万美元增长到618万美元,出口量从20台增长至56台,出口每台质谱联用仪均价为9.4万美元,平均每台质谱联用仪进口单价为出口单价的2.1倍。整体来看,2023上半年进口质谱联用仪市场增长非常明显,同时进口单价有所增长,从17.8万增长至19.9万美元。而我国质谱联用仪的出口量仍然很少,但相对于2022年上半年同期出口额和出口量均有所增长,同时出口单价明显增高。此外,2022-2023年1-6月,我国质谱联用仪的主要出口国家/地区从中国香港变为了俄罗斯。值得关注的是,质谱联用仪的年出口量在过去5年中均少于60台,2023仅上半年就突破了50台,为国产质谱的成绩点个赞。(本文仅统计了质谱联用仪这一个编码下的数据,未统计可能存在的,一部分进口质谱联用仪中可能将色谱部分和质谱部分分开报关的部分数据。)2023年1-6月质谱联用仪主要进口国比较表2023年1-6月,我国30个省市从新加坡、美国、日本、德国等14个国家和地区,累计进口2622台质谱联用仪,比上年同期增加264台、增幅11.2%,进口额达到5.2亿美元,同比增长1亿美元,增幅24%。进口金额TOP5的国家为新加坡、美国、德国、日本和爱尔兰。其中:新加坡是进口数量最多、进口金额最高的国家(进口715台,1.7亿美元,均价24万美元),美国的进口数量、进口金额均列第二(进口706台、1亿美元,均价15万美元。在进口质谱联用仪总金额的5.2亿美元中,每台质谱联用仪均价19万美元,其中德国的均价50万美元最高,其次是英国41万美元。新加坡进口的质谱联用仪均价为23.8万美元, 日本则为9.7万美元。相信大家也能看出来,这个价格差距和几家质谱大厂的产地相关,据了解,德国工厂生产赛默飞、布鲁克两家‘昂贵’的质谱仪,价格自然高。同时,新加坡工厂坐拥SCIEX、安捷伦以及赛默飞的部分产线,所以进口金额和数量都位居榜首。2022-2023年1-6月质谱联用仪主要进口国家金额月度变化具体来看上半年每个月的进口金额同比变化:2月-5月,连续4个月新加坡进口的质谱联用仪金额均同比增长,其中4月的增幅最大为72%。美国进口的质谱联用仪金额同样,除1月、6月同比下降外,2-5月的进口金额均同比增长,其中2月的增幅最大为267%。德国进口的质谱联用仪金额的月度变化则与新加坡和美国不同,后两者质谱联用仪在2月的进口金额均同比增长,而德国的进口额却在2月同比下降29%;在后两者进口额均同比下降的6月,德国同比增长109%。值得注意的是,德国相较于2022上半年同期进口额的增幅是几个国家中最大的,接近45%,进口额从6522万增长至9437万美元。接下来详细看下我国30个进口省市采购进口质谱联用仪的情况:2023年1-6月质谱联用仪主要进口省市比较表进口金额TOP3分别是广东省、北京市、上海市。进口数量TOP3分别是上海市、广东省、北京市。广东省的进口金额最高(进口580台,1.1亿美元),其次是北京市(进口375台,1.08亿美元)。而上海市的进口数量最多(进口697台,1亿美元)。这其中,北京市进口的质谱联用仪均价最高,为29万美元,广东省为19万美元,上海市则为15万美元。再来看出口,质谱联用仪出口金额相较于2022上半年的188万美元增长至618万美元,增长了228%,出口数量也从20台增至56台。2022-2023.1-6月,质谱联用仪的主要出口国家/地区从中国香港变为了俄罗斯。2023年1-6月质谱联用仪主要出口国比较表2022上半年出口俄罗斯的质谱联用仪共1台,9万美元,而2023年则增长为41台,共420万美元,出口额翻了近47倍,平均每台出口的质谱联用仪价格为10万美元;2022上半年出口到中国香港的质谱联用仪13台,共162万美元,平均每台出口的价格为12.5万美元,2023年则下降为5台,金额146万美元,平均每台出口的价格为29万美元,为2023年出口均价最高的地区。总体而言,我国质谱联用仪的出口量仍然很少,但相对于2022年上半年同期出口额和出口量均有所增长,同时出口单价明显增高,从9万增长至11万美元。
  • 薄层色谱-质谱联用,30 秒即可获取质谱信息?——没错,这个真的可以有!
    色谱法起源于20世纪初,1906年俄国植物学家米哈伊尔茨维特用碳酸钙填充玻璃管,以石油醚洗脱植物色素的提取液,经过一段时间洗脱之后,植物色素在碳酸钙柱中实现分离,由一条色带分散为数条平行的色带。科学家们在色谱法基础上,发明了薄层色谱法,薄层色谱(TLC)具有快速分离复杂混合物的优势,是一种非常有用的反应跟踪手段,同时也可以用于柱色谱分离中溶剂的选择。该法现已广泛用于化学实验室中,如有机合成,天然产物分析等领域。传统 TLC 方法 VS TLC-CMS 方法传统 TLC 方法 传统的 TLC 板样品点分析需要刮下目标斑点,溶于合适溶剂,离心分离出上层离心液,风干后溶于用于气质联用或液质联用的溶剂,再进行质谱分析,整个过程耗时短则几个小时,长则几天,费时费力,效率无法保证!﹀﹀﹀TLC-CMS 方法 2015年,AIS 自主研发推出 Plate Express 薄层色谱质谱接口,可快速从 TLC 板上提取样品并在线传输到质谱进行检测,相比传统的TLC方法,TLC-CMS 更简便可靠,30秒得到样品质谱信息,极大提高了科研效率,真正实现原位快速检测! TLC-CMS 薄层色谱-质谱联用 洗脱溶剂 → TLC 提取 → 质谱鉴定 → 数据分析,30S 内获取质谱信息!TLC-CMS 实验方法三步走!Step 1:设置方法Step 2:放置薄层色谱板,点击“运行”Step 3:直接读取样品质谱信息TLC 薄层色谱质谱接口的优势 1、软件自动化控制,操作步骤简单; 2、样品通过薄层分离后无需进一步处理,直接取样进行质谱分析,保证单点洗脱; 3、灵活设置样品提取力度和时间,根据不同薄层板进行最优化提取,兼容大部分商品化薄层板; 4、可替换的不同厚度的密封洗脱头; 5、避免交叉污染,每次分析后洗脱头会自动清理。
  • 默克与美国大数据公司Palantir合作建立半导体数据分析平台Athinia
    默克与Palantir合作建立半导体制造数据分析平台Athinia  德国材料巨头默克公司(Merck)正与美国大数据公司Palantir Technologies组建一家合资企业,以汇集半导体制造业芯片制造商及其供应商的数据并分析,解决当前面临的半导体短缺问题。  这家名为Athinia的公司将总部设在美国,由默克公司首席科技官Laura Matz担任首席执行官。它将利用人工智能和大数据的结合来帮助解决客户面临的半导体挑战。Athinia是一个安全的数据分析平台,新平台将处理IC制造从气体和沉积材料到光刻和光刻胶化学品供应的数据。该协作工具将把晶圆厂运营商和化学品与材料供应商联系起来,使他们能够安全地共享和分析晶圆厂数据,目标是在美国芯片制造商寻求提高集成电路产量的同时,帮助供应链合理化以提高效率,从而解决当前供应链中断的问题。协作分析平台还将提高供应链的透明度,帮助保证材料供应,防止材料供应影响芯片制造。    默克正通过其电子材料子公司——北美业务部门EMD electronics采取行动,EMD Electronics将监督针对半导体和显示器行业的计划。默克公司表示,到2025年,将在亚利桑那州、加利福尼亚州、宾夕法尼亚州和得克萨斯州的工厂为其美国业务投资10亿美元。Matz拒绝透露为创建Athinia投入了多少资金,也拒绝透露该公司是否有任何芯片制造商、材料供应商或研究机构与该平台签约。她说:“我们现在才刚刚起步,2022年将有第一批采用者。”“芯片短缺需要全行业的合作来解决消费者目前面临的供应链问题,”这家德国公司电子部门首席执行官Kai Beckmann在一份声明中表示。“我们正在美国投资,以扩大我们的生产能力。”  Athinia的计划是将多家材料供应商(包括默克的竞争对手)与半导体制造商一起引入,让他们共享、汇总和分析数据,以提高效率。这些数据将使用Palantir的大数据专业技术保密。  Palantir由Peter Thiel和其他人于2003年创建,并以Gotham、Metropolis和Foundry平台而闻名。Palantir Gotham被美国情报机构和美国国防部的反恐分析人员使用。Palantir Metropolis 供银行和金融界使用,而Palantir Foundry则供公司客户使用,典型客户包括Merck, Airbus and Fiat-Chrysler,后者现在是Stellantis的一部分。  “材料供应商和半导体制造商已经看到产量受到的影响越来越大,”Matz说,他还说,前沿工艺十分灵敏,以至于标称规格的材料可以产生可变化的产量。“传统参数不一定能预测晶圆厂工艺的相互作用,”她补充道。“这项服务的一个关键方面是隐私,Athinia将通过对数据进行编码和匿名来提供隐私。与Athinia合作的结果是,公司将更快地获得更好的数据。”  Athinia平台由Palantir Foundry提供支持,使用户能够构建和分析来自不同来源的数据,生成强有力的建议并支持运营决策,同时帮助确保敏感数据按照适用的数据隐私规则、法规和规范进行处理。
  • 代谢物定性鉴定创新方法与应用专题会暨MExplorer Ultimate代谢组学数据分析新品发布会成功召开! (含部分报告回放链接)
    2023年4月1日,SCIEX中国与大连达硕联合举办的《代谢物定性鉴定创新方法与应用专题会暨MExplorer Ultimate代谢组学数据分析新品发布会》在仪器信息网成功召开。本次专题会以代谢物定性鉴定创新方法与应用为主题,邀请中国科学院大连化物所许国旺研究员等国内知名的专家学者报告最新研究成果,尤其是具有高覆盖度与高准确性的代谢物定性鉴定,从面向质谱分析的前沿方法创新,到临床、医药、油脂等广泛领域应用,让参会人员广受启发,收获良多。在本次活动中,SCIEX中国与大连达硕联合发布了MExplorer Ultimate高分辨质谱/代谢组学数据一站式分析平台!一款面向基于质谱技术的代谢组学数据分析的一站式、智慧化、易入门低门槛产品,亮点突出,特色鲜明。该平台从质谱仪器所产生的原始数据开始,共有十大核心功能。以代谢物定性鉴定为例,针对不同的样本类型,平台可以一次性准确定性分析1,200~2,500种代谢物!本次活动报名人数超千人,直播期间吸引千余位代谢组学及其相关领域的研究人员参与,直播观看次数高达2,300+,同时最高观看人数800+。活动直播间互动十分踊跃,大家对各位专家的报告普遍反映很好,对MExplorer Ultimate产品评价极高,活动取得了圆满成功!许国旺 研究员中国科学院大连化学物理研究所报告题目:《基于高分辨质谱的代谢物定性》许国旺研究员老师的报告从代谢组学的研究对象、流程和方法入手,深入阐释了代谢物定性鉴定具有巨大挑战性的原因,目前代谢物定性分析中普遍存在的问题,如何才能获得“准确可靠”定性分析结果等一系列具有普适性、引领性和前瞻性的问题,以及发表的文献中存在的各种定性错误,有违色谱分离特点与规律的问题,进行了非常翔实、充分的讲解和介绍,特别是结合许老师研究组二十余年的研究经验娓娓道来,非常难得。然后,许老师结合研究组在代谢物定性鉴定方向的最新研究技术、方法和成果,详细介绍了大量研究工作,特别是从大数据+人工智能+机器学习的角度,介绍标准品数据库构建,修饰代谢组学、脂质/肉碱结构与保留时间规律性,2D/LC-MS技术等,实现大规模、高准确性的代谢物定性分析,并为大家提供了可靠代谢物定性分析的推荐策略。卢红梅 教授中南大学报告题目:《Data and AI-driven identification of small molecules》卢红梅教授则从ChatGPT、人工智能和大数据分析出发,介绍了分析化学中的量测大数据,以及这些海量数据,对分析化学家的挑战。在此基础上,介绍了研究组在AI驱动的分析化学数据分析策略和方法,包括面向GC-MS和LC-MS的数据分析一系列创新策略和方法,比如自动化的GC-MS峰解析,以及软件实现,LC-MS数据的峰识别与提取,峰匹配与代谢物定性鉴定分析,等等。特别是针对代谢物的定性分析,发展了多个具有创新性和前瞻性的深度学习方法和模型,获得了良好的定性鉴定结果。来自SCIEX(中国) 生命科学研究市场发展资深经理江峥女士宣布“MExplorer Ultimate高分辨质谱/代谢组学数据一站式分析平台”正式发布!并以视频的形式整体性介绍了MExplorer Ultimate平台。同时,江经理介绍了该平台的开发初衷和背景,与大连达硕合作团队在这一领域深厚积累,希望通过学术界和产业界的通力合作,共同探索解决代谢组学研究与应用痛点和难点问题。期待此次SCIEX与大连达硕联合开发的分析平台,可以为广大的科研工作者开启代谢组学的寻宝之旅,带来更多的便利和收获!也希望线上线下的老师有机会使用到此软件,并提出宝贵的改善意见,以助力平台的进一步提升优化。曾仲大 CEO大连达硕报告题目:《MExplorer Ultimate产品介绍》来自大连达硕的曾仲大博士,详细介绍了MExplorer Ultimate数据分析平台的十大功能,包括样本管理、样本处理、数据采集、信号处理、定性鉴定、统计发现、网络通路、整合分析、分析报告,以及资源管理等。特别是针对每个模块的功能,提供特色鲜明、亮点显著的解决方案,比如以“一次标注,贯穿整个数据分析过程的方式”,最大化便利用户;以拟靶向分析融合非靶向与靶向分析的优势,实现高覆盖度与高准确性的代谢物特征分离与检测;以真正实时、在线的数据质量监控模式,实现数据的全流程跟踪分析;以“一步到位”同时实现质谱原始数据峰提取、峰匹配、QC样本校正,以及保留时间校正的方式,极大提升数据质量;以标准品数据,以及网络与文献整合大数据等方式,并开发基于人工智能的定性鉴定创新方法,实现高覆盖与高准确性的代谢物定性分析,达到目前的最高水平之一;以“一键式”、“算法超市”的形式,实现简单、智能化的差异物发现;以直接原始数据直达代谢物通路与网络分析的形式,极大降低复杂质谱与代谢组学数据分析的门槛。与此同时,平台可以实现正、负电离模式,或者其他多来源数据的整合分析,并实现了面向浏览器端的高质量分析报告,以及全面资源与数据库管理,等等。特别是,平台以多核并行计算、云弹性计算、多索引搜索、多索引搜索和人工智能算法等,帮助用户实现“深入浅出,无声无息”的智能体验。此外,MExplorer Ultimate兼容SCIEX全系列高分辨质谱:7600、6600、5600,以及X500系列。龙志敏SCIEX(中国) 小分子组学及药物市场应用经理报告题目:《针对代谢组学及脂质组学研究的质谱技术及方法进展》来自SCIEX(中国) 龙志敏博士则从质谱技术与硬件发展的视角,深入讲解了代谢物定性分析的方法进展,其中重点介绍了SCIEX ZenoTOF™ 7600高分辨质谱系统的多项核心技术,比如Zeno trap 技术, 可解决飞行时间质谱占空比问题,使得超过90%离子被有效检测到,实现超高灵敏度分析检测,使得实现灵敏度提升增加高达5-20倍;能量可调可控的电子活化解离(EAD)技术,实现脂质精细结构解析及代谢物同分异构体区分低含量物识别与定量,具备小分子和大分子所有分子类型的可调特征碎裂能力;MS/MS量测,可克服飞行时间质谱MS/MS占空比不足,使得超过90%离子被注入飞行时间质谱;同时具有高达133Hz的MS/MS扫描频率,包括改进的数据依赖型扫描模式(DDA)和高分辨率MRM(MRMHR),等等。所有这些创新技术,使得ZenoTOF 7600具有超乎预期的代谢组学和脂质组学代谢物检测与分析能力。吕海涛 研究员上海交通大学报告题目:《功能代谢组学驱动决定性功能代谢物的精准表征》来自上海交大的吕海涛研究员,从功能代谢组学的角度,介绍了功能代谢物的精准表征。首先介绍了细胞生物化学中的分子相互作用,复杂与多样化功能,以及功能调节等。在此基础上,吕老师重点介绍了功能代谢组学,并以胰腺癌为重点研究对象,介绍了STORM策略作为新靶点发现的创新方法与结果,以及下一代功能代谢组学STROM+的研究策略。魏芳 研究员中国农业科学院油料作物研究所报告题目:《基于质谱技术的脂质分子结构分析方法及应用》来自农科院油料所的魏芳研究员,首先介绍了脂质的结构与功能,特别是脂质分子的多样性与结构鉴定的复杂性与挑战。然后,魏老师从不饱和脂质双键位置的分析方法创新的角度,介绍了不饱和脂肪酸位置的鉴定及其准确定量,基于双衍生化的FA精准分析,基于LC-MS的FAs高效分析,复杂不饱和脂质纸质精准结构鉴定,以及双键位置自动注释软件等。在脂质结构鉴定中的创新方法等领域方法,取得了重要进展。本次专题会与发布会的相关视频,根据报告人的意见,提供部分报告回放,点击链接:https://www.instrument.com.cn/webinar/video/collection/11360关于MExplorer Ultimate:SCIEX ZenoTOF™ 7600作为新一代的高分辨质谱系统,具有更高的灵敏度和准确性,同时搭载电子活化解离EAD碎裂技术可实现多重质谱碎裂并实现精准结构表征,在代谢组学研究中具有显著优势。SCIEX ZenoTOF™7600所产生的海量数据,为代谢组学/脂质组学研究,包括代谢物精准定性,提供了前所未有的能力。基于此,SCIEX中国与大连达硕联合开发的面向非靶向代谢组学数据分析的创新平台,即MExplorer Ultimate,实现从质谱原始数据到在线、实时质控,从谱峰识别、提取与匹配到数据质量评价与校正,从高覆盖度与高准确性代谢物精准定性,到一键式差异物智能发现,从拟靶向分析到多源数据整合,从快速通路探索到生物解释的一站式、智慧化、低门槛分析,必将极大地提升用户的数据分析与创新能力。如对代谢组学研究相关质谱技术及数据分析平台感兴趣,欢迎垂询:SCIEX联系方式:SCIEX全国咨询电话: 400-821-3897SCIEX全国咨询邮箱:service.china@sciex.com大连达硕联系方式:大连达硕咨询电话:0411-84753876大连达硕咨询邮箱:contact@chemdatasolution.com
  • BIOTREE 第一届2016组学数据分析美图秀
    p    /p p style=" text-align: center " img title=" 大.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/6cc189f5-ba74-4d01-b40a-5e5b7b07d18d.jpg" / /p p   无论是基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学或是脂质组学,组学的数据收集是科研人员面临的一个问题,但肯定不是最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚组学数据集到底意味着什么。一年辛苦耕耘,在此2016年末之际,尽管组学数据分析仍存在巨大的瓶颈,但正所谓“高手在民间”,BIOTREE特此举办“ span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 第一届2016组学数据分析美图秀 /strong /span ”的活动,望各位生物达人热烈参与,相互切磋,共同进步! /p p   What& #39 s Your New图?不要默默发光,快快加入秀出来! /p p    strong 活动对象: /strong 组学科研人员(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学等)。限80名,注:为保证活动公平性,所有组学服务商业机构不得参加! /p p    strong 作品要求: /strong 不管您是用什么软件做出的组学数据分析图形,只要您觉得美,都可以提供给我们进行参赛,每人仅限提供1张参赛作品。作品范围不限,例如PCA / OPLS-DA / O2PLS得分图、载荷图、Permutation检验图,火山图,层次聚类热力图,GO分析图,代谢通路图,网络图等等。 /p p    strong 活动报名方法: /strong /p p   1、邮箱报名: a href=" mailto:marketing@biotree.cn;zhangyanfang@biotree.cn" marketing@biotree.cn span style=" color: rgb(0, 0, 0) " ; /span zhangyanfang@biotree.cn /a /p p   2、BIOTREE微信公众号报名(请参考上图) /p p   3、电话报名:021-61531195 /p p    strong 报名提交内容: /strong /p p   A、报名者信息(姓名+单位+研究方向+联系电话+联系邮箱+邮寄地址) /p p   B、参赛作品简短介绍(研究意义,意境等,50字以内) /p p   C、1张参赛作品(矢量图或分辨率大于600dpi的图),主办方将压缩图片并加上水印(图作者和作品号)上传至投票平台 /p p   D、请诚信参与本次活动,使用原创作品,禁止盗用他人图片 /p p   E、后期将给参赛者提供作品集 /p p    strong 活动时间: /strong /p p   作品征集:2016年12月5日-12月31日 /p p   作品评比(投票):2017年1月1日至1月16日(每人每天可投一票) /p p   投票截止日期:2017年1月16日24:00 /p p   名单公布& amp 礼品发送:2017年1月17日-1月20日 /p p    strong 四大奖项: /strong /p p   BIOTREE将根据实际投票结果,评选出2016年度最佳New图,并赠予以下奖项 /p p    span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 一等奖: /strong /span iPhone 7(1名) /p p    span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 二等奖: /strong /span iPad Mini 4(1名) /p p    strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 三等奖 /span /strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " span style=" color: rgb(0, 0, 0) " ( /span /span Top 10):BIOTREE 2000元以内的培训班(2017年培训班)任选一个,可转赠(10名) /p p    strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 参与奖 /span /strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " span style=" color: rgb(0, 0, 0) " ( /span /span Top 20):BIOTREE定制U型枕 (前20名报名参赛者) /p p   获奖名单将于2017年1月17日于BIOTREE微信公众号公布;请获该奖项人员主动联系告知地址,方可安排快递奖品,有效期30天; strong 联系热线 /strong :021-61531195 /p p   媒体赞助: /p p style=" text-align: center " img title=" p1.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/329ebf59-4caf-45f3-a8be-da33d090ecce.jpg" / /p p style=" text-align: center " img title=" p2.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/89ba19e6-bc8f-431b-ba11-0dc2925d114a.jpg" / /p p br/ /p
  • 前六月进口近70亿元:光刻设备海关进口数据分析
    自美国提出终断该国企业与华为多年的芯片供应以来,研制中国自己的国产芯片提上了我国的发展日程,也是当前中国市场最为紧迫的一项技术,关于芯片技术发展的讨论不仅在专业领域盛行,也成为了普通民众议论的焦点所在。而芯片的制造离不开半导体设备,其中光刻设备是其中的重中之重。但长期以来,我国的光刻机依赖进口严重。2022年,美国出台《芯片法案》限制向中国大陆出口半导体设备。据《华尔街日报》报道,日本和荷兰已加入美国,努力限制向中国出口先进芯片制造设备(详情:日本、荷兰和美国联合起来限制向中国出口芯片制造设备 )。2月15日,就美日荷限制向中国出口相关芯片制造设备,中国半导体行业协会发表声明(详情:就美日 荷 限制向中国出口相关芯片制造设备,中国半导体行业协会发表声明 )。6月30日,荷兰政府发布公告,9月1日,先进半导体制造设备的额外出口管制措施将生效。从那时起,某些先进半导体制造设备的出口将受到国家授权要求的约束,限制中除了EUV光刻机,还包括了较为先进的DUV光刻机(详情:升级光刻机管制!荷兰发布先进半导体制造设备出口禁令)。此外,日本也限制了6类23种半导体制造设备出口,中国半导体行业协会发布严正声明表示,此次日本政府的出口管制措施将对全球半导体产业生态带来更大的不确定性(详情:中国半导体行业协会再发严正声明 )。日本和荷兰是光刻机的主要生产国家,上半年的种种措施出台为中国半导体产业增添了种种不确定性,为了解上半年光刻机的进口情况,仪器信息网特别对2023年1-6月,光刻机(商品编码84862031、84863031)进口数据进行了分析汇总,为大家了解中国目前光刻机市场做一个参考。需要注意的是,海关数据根据应用领域和原理将光刻机主要分为两类,包括制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机(84862031)和制造平板显示器用的分布重复光刻机(84863031)。2022-2023年1-6月光刻机进口额变化(单位:元)商品名称2022年2023年增幅制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机5245402082684285701030%制造平板显示器用的分布重复光刻机95803117664797902-93%2023年1-6月光刻机进口占比2023年1-6月进口额变化2022年1-6月进口额变化从近两年上半年的进口数据来看,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机增长幅度较大,达到了30%的增幅,而用于制造平板显示器的分布重复光刻机出现了明显的暴跌,增幅为-93%,远低于去年同期。而从两类光刻机的占比来看,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机明显占据主要市场份额。实际上,此前两类光刻机进口额接近(详情:前十月 进口额已达103亿元:光刻设备海关进口数据分析)。用于平板显示器的分布重复光刻机的进口额正经历着逐步暴跌的过程,这或许和国产替代有关。值得注意的是,今年上半年光刻设备进口额在六月份出现暴涨,单月进口额超34亿元,远高于去年同期和其他月。和去年上半年变化趋势相比,这一暴涨的变化趋势也颇为突兀明显。这可能和美日荷制裁升级有关,或因相关消息引发市场恐慌性抢购设备导致。制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机进口贸易伙伴分布制造平板显示器用的分布重复光刻机进口贸易伙伴分布制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机主要进口自荷兰和日本,其中荷兰进口额占比高达76.7%,日本占比21.9%。制造平板显示器用的分布重复光刻机不同于集成电路和半导体器件用光刻机,从其进口额分布可以看出,此类光刻机进口市场被日本企业牢牢把控。目前我国已成为世界平板显示器生产大国,拥有了一批巨头企业,市场广阔。制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机进口注册地分布制造平板显示器用的分布重复光刻机进口注册地分布那么这些光刻机主要销往何处?通过对进口数据的注册地进行分析发现,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机主要“落脚地”是上海市、江苏省和北京市,这些地区也是我国经济较发达地区,近年来积极布局半导体产业,已经逐步形成了一批集成电路产业集群。而制造平板显示器用的分布重复光刻机主要“落脚地”是重庆市。据了解,在“十四五”期间,重庆将重点建设包括集成电路、新型显示、新型智能终端等在内的十类战略性新兴支柱产业。其中新型显示产业在重庆的十类战略性新兴支柱产业中排名第二,地位仅次于集成电路产业。近年来,重庆市新型显示产业政策持续出台,2017年达到峰值,为9条。2022年,重庆市共有2条相关政策公布。在当地政府支持下,近年来多个新型显示优质项目签约落地重庆,重庆正在通过显示面板领域重点项目投产和优质项目签约,进一步加快新型显示产线建设,让重庆新型显示产业的发展活力充沛。根据企查猫查询数据显示,近年来新型显示历年新注册企业数量稳定增长。截至2023年1月17日,重庆新型显示产业相关的注册企业超200家,其中2020年新注册企业数量创历史高峰,达43家,从新增企业数量来看,重庆市新型显示产业企业数量将继续保持上升态势。
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