安图生物微生物质谱

[b]1、微生物质谱到底是个啥？2、质谱为什么能够鉴定微生物？3、为什么要用质谱做微生物鉴定？[/b]

大家好我是生物质谱板块的版主，建了一个生物质谱交流的微信群。希望各位有做蛋白组学、代谢组学等方向的前辈和同学可以加进来一起相互讨论学习交流。[img=,498,468]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2017/07/201707231435_01_3152958_3.png[/img]

两会已然闭幕。生物质谱版块似乎也很配合，早早就为两会做准备，从春节之后就安静得很。人大代表提各种议案，广大版友则可以提提您对生物质谱从研究所走向民生大众的路子有哪些。 这几年的色谱质谱市场，除了常规的科研单位采购量一往直前外，政府采购，事业单位采购势头也不差。结合民生的，诸如新生儿筛查，抑或快速微生物检测等。 托之前职务之便的福，对微生物检测/快速鉴定的应用方案略知一二。不过底子薄，还是想和各位行家作揖请教，这劳什子在快速微生物鉴定方面有着所谓的“强大实力”，那在这个领域应用的意义和实际价值到底有多大。对于普通百姓，它的可靠性又有多高。如果靠谱，怎样才能使生物质谱更好地服务大众，以期惠民。希望各位积极参与。

生物质谱和普通质谱的区别是什么？生物质谱就是专门用来做生物样本的，本质上没有区别，生物质谱的测试分子量一般较小，在50-2000，有的可以到几千，常用的一般在50-1000，也有做蛋白的分子量范围会更大一些

[font=&][size=26px][color=#333333]什么是生物质谱？[/color][/size][/font][font=&][size=26px][color=#333333]用于生物质谱的软电离技术有哪[/color][/size][/font][b][/b][font=&][size=26px][color=#333333]些？[/color][/size][/font]

如题，也许你对生物质谱早有耳闻，但是你对生物质谱了解多少呢？

生物质谱技术在细胞生物学中的应用桑志红 王红霞 综述　概 论 蛋白分离与显色 蛋白质鉴定 数据库查寻 灵敏度 具体示例 展望未来（相关文献）摘 要 基因组计划的飞速发展使我们提早进入"后基因组时代"，而质谱技术的重要进展使得通过酶解、质量分析、序列分析及其数据库检索对蛋白质进行高通量快速鉴定的技术方法应运而生，并成为"后基因组时代"的关键核心技术。这种技术的应用范围已经从细胞,组织以及整个有机体中蛋白质的表达到蛋白质翻译后修饰等等方面。本文简要综述生物质谱技术在细胞生物学等学科中的应用。　 过去的十年经历并见证了生命科学革命性的变化. 大规模基因组测序技术的问世使人类基因组计划最终目标的实现比预期一再提前。与此同时，近几年间已有10余种模式生物的基因组序列测定告罄，3年内还将有40种左右生物的基因组全序列问世。因此大多数人同意我们现在已经提早进入"后基因组时代"（post-genome era）, 目前我们所面临的挑战是如何破解基因组计划已获得的大量序列信息并加以应用。这个问题的关键是基因的生物学功能不能只通过对核酸一级结构(序列)的检测来确定。研判一个未知基因的功能、与其他基因产物及其亚细胞结构之间的功能联系, 最终都必须通过在蛋白水平对基因产物的研究才能确定。蛋白质组这个名词是近几年才提出来的，它用来描述一个细胞的全部蛋白质,而在蛋白水平上进行大规模的研究引出了新的术语蛋白质组学。蛋白质表达图谱是依靠蛋白质显示技术和精确定量技术对细胞或组织中蛋白质表达总况进行比较（2）, 这个领域最近已有综述（11）。细胞图谱蛋白质组学是指应用生物质谱技术鉴定蛋白质及其相互作用并确定在亚细胞中的定位。本文的目的是 简要综述生物质谱技术在细胞生物学领域中越来越多的应用，并为该领域正考虑应用这种技术的研究者提供一些的有用的信息。 作为一个新的研究领域，蛋白质组学发展的关键是近年来质谱技术的革新。这种革新极大地促进了质谱技术在生命科学研究中的应用。质谱现在可以作为将各种蛋白质与序列数据库联系起来的桥梁。生物质谱根据质量数和所载电荷数不同的多肽片断在磁场中产生不同轨道而以质荷比（m/z）方式来分离它们。80年代末，随着两种崭新的尤其适合蛋白质研究的软电离方式ESI（电喷雾电离）和MALDI（基质辅助激光解吸附电离）的出现，质谱成为现代蛋白质科学中最重要和不可缺少的组成部分。 生物质谱最强大的应用功能之一是能够鉴定蛋白质复合物的组成成分（19）。细胞中一些最重要的生命过程都是通过多蛋白质复合体来执行和调节的，但由于蛋白质鉴定的困难，大多数上述蛋白复合体都是未知的。生物质谱灵敏度的不断提高显著地促进了对具有生物学功能和治疗潜力的蛋白复合体的鉴定，例如，NF-k B信号通路，CD95（FAS/APO-1）介导的细胞死亡途径，和核受体介导的转录信号传导过程中形成的蛋白复合体。在某些情况下，复合物可通过常规蛋白纯化的方法进行纯化，如剪接体复合（25），酵母纺锤体复合物（29）及VHL肿瘤抑制复合物（18）。然而，更常见的是，复合物中的组成成分通过一步免疫沉淀或免疫亲和步骤后就可纯化，这种方法甚至可以用于鉴定那些用常规蛋白纯化和鉴定技术所不及的一些过渡态或不稳定的复合物。因为生物质谱技术的介入，现在已经不再需要通过抗体进行免疫印迹实验，而是通过生物质谱技术对免疫沉淀获得的蛋白复合体组分直接进行蛋白序列分析。以酵母P24复合物鉴定为例，应用上游表位标签策略有可能不需制备抗目标蛋白的抗体就能对蛋白质复合物进行鉴定（13）。这种方法（36）对于基因组序列已完全清楚和遗传稳定的生物（如芽殖酵母,啤酒酵母）尤为简便, 例如对RENT复合物和促有丝分裂后期复合物（49）。因为这种方法的成功应用，使人们对上游表位标签策略－蛋白纯化－生物质谱分析的方法兴趣倍增。值得一提的是，将能被特殊蛋白酶切除的连接子（接头）掺入表位标签是尤为有利的（如下所述）。 上述方法是通过识别蛋白复合物中相互作用和配对的各组分而达到对蛋白鉴定的目的，另一种策略则是通过对分离纯化的细胞器蛋白组成进行鉴定而在亚细胞水平对蛋白质定位.　用这种方法确定蛋白质位置,　对评价蛋白质潜在的功能将是大有帮助的.　应用这种方法，我们称为细胞器蛋白质组学,　已经发现正常工作状态下的细胞器含有比我们以前所知道的数量多得多的蛋白种类。然而实际上，由于质谱极高的分辨率和灵敏度，纯化后的细胞器组分即使只有微量的混杂，也能被质谱分辨并误认为是细胞器的组成部分。因此，如何充分的纯化以保证至少绝大多数被鉴定的蛋白质都来自同一种细胞器，成为制约上述工作的瓶颈。 蛋白质翻译后修饰也是蛋白鉴定工作中的一个重要方面。根据DNA序列信息并不能可靠预测或推导出蛋白质翻译后的修饰。而质谱技术已经被证明对研究蛋白质翻译后的修饰（例如磷酸化和糖基化）是极为有用的，特别是对序列已知的蛋白的鉴定。例如:Betts等人（1a）用这种方法成功地鉴定了从小鼠大脑中分离的神经纤维蛋白体内磷酸化位点。同样方法, Wong等人（45）确定了钙联蛋白质（calnexin)C未端的磷酸化位点。在糖基化的例子中, Carr等人（5）采用液相色谱与质谱联用技术选择性地鉴定了糖蛋白中N- 和O-联接的寡糖. 稍后, 本文将会通过对E-选择素中糖基化位点的鉴定来进一步说明这种方法.

[color=#333333]求大神推荐一款国内的微生物质谱，性价比要高，性能好一点，最好还可以做其他应用，比如做核酸、成像等。[/color]

现在各个公司单位招聘正在大张旗鼓的进行，在仪器信息网举行的2012网上招聘会上我发现了很少招聘生物质谱的岗位，其中有些单位硬性条件很高，比如AB要求博士（Phd）http://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/em09509.gif。为什么招聘生物质谱的岗位那么少？学生物质谱的版友们一般找什么工作呢？你们现在在哪工作呢（研究单位也算）?应用生物质谱的版友们你们的专业叫什么呢？对找工作有困惑吗？反正我不敢说自己是生物化学出身，最后都不敢说自己是做生物的了。http://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/em09509.gif

[img]http://www.instrument.com.cn/bbs/images/affix.gif[/img][url=http://www.instrument.com.cn/bbs/download.asp?ID=109983]经典生物质谱课件[/url]本人收藏的经典生物质谱课件，拿出来和大家分享！[img]http://www.instrument.com.cn/bbs/images/affix.gif[/img][url=http://www.instrument.com.cn/bbs/download.asp?ID=109984]经典生物质谱课件[/url]

生物质谱技术应用及进展 　 生物质谱因其高灵敏度、高准确度、快速、易于自动化等特点，在生命科学领域的应用和研究日益广泛。本文就其近年来在蛋白质、核酸、糖类、药物代谢以及微生物检验等方面的应用及进展作一综述。 生物质谱；电喷雾；基质辅助激光解吸附；串联质谱 O657.6 A Applications and progress on bio-mass spectrometry YING WAN TAO，QIAN XIAO HONG National Center of Biomedical Analysis, Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100850 For its high sensitivity, accuracy, high speed and easy to automate, bio-mass spectrometry develops very fast . This article reviews its applications and latest progress in the field of proteins/peptides, nucleotides, carbohydrates, pharmaceutical metabolism and microbiology in the past years. bio-mass spectrometry; electrospray ionization; matrix-assisted laser desorption ionization; tandem mass spectrometry　 1 概述 生命科学的发展总是与分析技术的进步相关联，X射线晶体衍射对DNA双螺旋结构的阐述奠定了现代分子生物学的基础，使人类对微观领域的认识迈出了决定性的一步。原位PCR技术的出现使得生命科学在微观领域的研究不再是可望而不可及。大规模、自动化基因测序技术的问世，使本世纪生命科学领域最宏大的研究项目人类基因组计划的实施比预期一再提前。而后基因组时代，即功能基因组和蛋白质组计划的实施所必需的高通量大规模筛选对分析方法又一次提出了挑战。已发展了一百多年的质谱技术，由于其所具有的高灵敏度，高准确度，易于自动化等特点，毫无疑问地成为解决上述问题的关键手段之一。 自1886年Goldstein发明早期质谱仪器常用的离子源，到1942年第一台单聚焦质谱仪商品化，质谱基本上处于理论发展阶段。随后质谱在电离技术和分析技术上的发展和完善，使之很快应用于地质、空间研究、环境化学、有机化学、制药等多个领域。然而，即使在等离子体解吸（plasma desorption, PD)和快原子轰击（fast atom bombardment, FAB)两项软电离质谱技术出现以后，质谱分析的相对分子质量也只是在几千左右。真正意义上的变革以80年代中期出现的两种新的电离技术：电喷雾电离（electrospray ionization, ESI）和基质辅助激光解吸电离（matrix-assisted laser desorption ionization, MALDI）为代表，这两种技术所具有的高灵敏度和高质量检测范围，使得在fmol （10-15）乃至attomole（10-18）水平检测分子量高达几十万的生物大分子成为可能，从而开拓了质谱学一个崭新的领域棗生物质谱，促使质谱技术在生命科学领域获得广泛应用和发展。 2 生物质谱仪 目前商业化的生物质谱仪，其离子化方式主要是电喷雾电离与基质辅助激光解吸电离，前者常采用四极杆质量分析器，所构成的仪器称为电喷雾（四极杆）质谱仪（ESI-MS），后者常用飞行时间作为质量分析器，所构成的仪器称为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪（MALDI-TOF-MS）。ESI-MS的特点之一是可以和液相色谱、毛细管电泳等现代化的分离手段联用，从而大大扩展了其在生命科学领域的应用范围，包括药物代谢、临床和法医学的应用等；MALDI-TOF-MS的特点是对盐和添加物的耐受能力高，且测样速度快，操作简单。此外可用于生物大分子测定的质谱仪还有离子肼（ion trap, IT）质谱和傅里叶变换离子回旋共振（fourier transform ion cyclotron resonance, FTICR）质谱等。而最近面市最新型的生物质谱仪是液相色谱-电喷雾-四极杆飞行时间串联质谱仪（LC-ESI-MS-MS）与带有串联质谱功能的MALDI-TOF质谱仪，前者是在传统的电喷雾质谱仪的基础上采用飞行时间质量分析器代替四极杆质量分析器，大大提高了仪器的分辨率、灵敏度和质量范围，其商品名有Q-TOF和Q-STAR等；后者是在质谱中加入了源后降解（post-source decay, PSD）模式或碰撞诱导解离（collisionally induced dissociation, CID）模式，从而使生物大分子的测序成为可能。 3 生物质谱的应用 3.1 蛋白质和多肽的分析 3.1.1 分子量测定 分子量是蛋白质、多肽最基本的物理参数之一，是蛋白质、多肽识别与鉴定中首先需要测定的参数，也是基因工程产品报批的重要数据之一。分子量正确与否往往代表着所测定的蛋白质结构正确与否或者意味着一个新蛋白质的发现。生物质谱可测定生物大分子分子量高达400KDa，准确度高达0.1%～0.001%，远远高于目前常规应用的SDS电泳与高效凝胶色谱技术。 3.1.2 肽谱测定 肽谱是基因工程重组蛋白结构确认的重要指标，也是蛋白质组研究中大规模蛋白质识别和新蛋白质发现的重要手段。通过与特异性蛋白酶解相结合，生物质谱可测定肽质量指纹谱(peptide mass fingerprint, PMF)，并给出全部肽段的准确分子量，结合蛋白质数据库检索，可实现对蛋白质的快速鉴别和高通量筛选。PMF常和胶上原位酶解相结合，成为蛋白质组研究中必不可少的一种手段。此外根据肽段质量数变化，可对基因产品的插入、缺失、突变进行对比分析。 3.1.3 肽序列测定技术 构成蛋白质的常见氨基酸有20种，一段3个氨基酸的肽段碎片将有8,000种可能的排列方式，4个氨基酸将有160,000种排列方式，即一个特定的4个氨基酸序列的出现概率为1/160,000。因此，即使对于一个相当大的蛋白质组来说，五、六个氨基酸残基的序列片段已具有很高的特异性。串联质谱技术可直接测定肽段的氨基酸序列，从一级质谱产生的肽段中选择母离子，进入二级质谱，经惰性气体碰撞后肽段沿肽链断裂，由所得到的各肽段质量数差值推定肽段序列，用于数据库查寻，称之为肽序列标签技术（peptide sequence tag, PST），目前广泛应用于蛋白质组研究中的大规模筛选。较之传统的Edman降解末端测序技术，生物质谱具有不受末端封闭的限制、灵敏度高、速度快的特点。另外，一种间接的肽序列测定技术即肽阶梯序列技术（peptide ladder sequence），通过末端酶解或化学降解，产生一组相互之间差一个氨基酸残基的多肽系列，经MALDI-TOF-MS鉴定后，由所得到的肽阶梯图中各肽段的分子量差值确定末端的氨基酸序列，从而用于数据库查寻。

请问专家，我们学院准备购买生物质谱，用与生物制药分析，和化学分析，仪器厂商给我们的配置是这样的：离子交换液相色谱，反向液相色谱，离子阱质谱，（可换maldi 源)，TOF，和一台毛细管电泳。这样配置合理吗？双向电泳可不用了吗。请专家指教。

各位大大们！非常感谢仪器信息网，我们公司想买台生物质谱，用于分析蛋白和其修饰（糖结构+PEG等），不知道在众多的质谱中应该如何去选择。我们主要的目的有：1.蛋白的分子量；2.蛋白的修饰位点的分析；3.蛋白的糖结构的分析；希望大大提供一些宝贵的建议。

如题，生物质谱是专用于生化分析的质谱吗？在使用方法上同化学分析用质谱有哪些不同？多谢了！

现在的生物质谱仪有那些生厂家，那个品牌的生物质谱仪更先进一些？一般的标准配置售价几何？听说英国生物质谱有一个品牌有专利诉讼不知结果如何？

[emo04] 我想了解生物质谱方面的知识，有这方面的专家愿意和我结识吗？

各位达人可以以以下格式进行发言讨论：型号：品牌：用途：优点：不足：希望大家只针对产品本身发言，人为因素的暂不纳入讨论范围。因为诸如哪家售后工程师态度啊，专业水平等方面主观色彩太重，大家可以专门的topic另行讨论。生物质谱相关讨论：【讨论】生物质谱离子源 ESI vs MALDI 大比拼【讨论】生物质谱之 TOF-TOF大讨论

看到咱们版面有关于生物质谱应用于各个行业的帖子非常多，整理出来一个集锦帖，这样有助于版友查阅。 希望小伙伴儿们有新的应用方面的内容及时来跟帖补充哦！参与讨论和补充内容都会有积分奖励哦！1.生物质谱技术在蛋白质组学中的应用http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20120429/4005901/ 发帖人：省部重点实验室2.生物质谱技术及其在RNA 检测中的应用http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20120429/4005897/ 发帖人：省部重点实验室3.生物质谱技术应用及进展http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20120429/4005899/ 发帖人：省部重点实验室4.生物质谱技术在细胞生物学中的应用http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20120429/4005891/ 发帖人：省部重点实验室5.生物质谱在国内应用状况如何，有什么前景？http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20110518/3313081/ 发帖人：金水楼台先得月3楼的回答中包含：生物质谱技术及其在核酸领域的应用 跟帖人：lucia_J 生物质谱在检验医学中的应用 生物质谱——蛋白质组研究的关键技术6.生物质谱在糖蛋白结构分析中的应用http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20110321/3197676/ 发帖人：lucia_J7.生物质谱技术原理及其应用与展望http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20060520/430192/ 发帖人：我在故我思8.生物质谱技术帮助发现精神分裂症特征蛋白http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20120429/4005923/ 发帖人：省部重点实验室9.MALDI-TOF生物质谱成像技术的进展http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20110608/3351682/ 发帖人：lucia_J10.霍普金斯大学课件-色谱质谱技术在生物医学研究中的作用http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20110608/3351682/ 发帖人：pharmacy_detect 这么看来，咱们生物质谱的应用很广泛呀！小伙伴儿们，有什么新的应用要来讨论分享哦！

生物质谱具有灵敏度高、准确性好、易于大规模和高通量操作等优点。目前，生物质谱广泛应用于蛋白质组学的研究当中。 随着蛋白质组学和基因组学研究的不断深入，是不是意味着生物质谱会帮助我们了解生命的奥秘呢？

请问什么是生物质谱仪？

生物质谱（生物制药）交流群：建群的目的是方便大家互相交流学习，共同进步。QQ群号码：802032502

微生物质谱技术无疑是质谱行业热点之一，他的前景如何?技术瓶颈在哪里呢?

如果没有看到KAIKAI对进入论坛的总结，也许我不会了解那些潜在的一些竞争，如果没有看到生物版块版主在2011年初发的关于新年版块的建议，也许不会去思考：当你进入论坛，点击不同版块的时候，你是出于什么原因？如果没有看到刚才版主发的帖子上有人留言说对2011年生物质谱版块的规划，也不会想到要问：2011年，在生物质谱论坛，你想了解什么？（注：很多人对生物质谱都表示不了解，可是说到是否了解质谱，包括气质、液质，估计进论坛的大部分人都很清楚，说到生物，我想大家就更不陌生了，为何两个一结合就不清楚了呢？）

各位达人可以以以下格式进行发言讨论：型号：品牌：用途：优点：不足：希望大家只针对产品本身发言，人为因素的暂不纳入讨论范围。因为诸如哪家售后工程师态度啊，专业水平等方面主观色彩太重，大家可以以专门的topic另行讨论。生物质谱相关讨论：【讨论】生物质谱之 Q-TOF大讨论【讨论】生物质谱之 TOF-TOF大讨论

微生物质谱技术无疑是质谱行业热点之一，他的前景如何?技术瓶颈在哪里呢?

http://simg.instrument.com.cn/bbs/images/brow/em09511.gif请教一下，都说生物质谱很贵，到底有多贵呢？

为什么会出现生物质谱这个概念？这是怎样一种分类系统？这个分类系统里除了生物质谱以外还有什么质谱？我知道质谱有三部分：离子源，质量分析器和检测器常见的分类似乎是按照质量分析器分的？包括四级杆/多重四级杆/三电极的离子阱/线性离子阱 quadrupole/quadrupole trap飞行时间质谱仪/多重飞行时间， TOF磁质谱仪 magnetic sector离子回旋共振质谱仪 ICR轨道阱 Orbitrap而以上似乎都可以和生物联系起来，如果是这样的话，那在质谱前面加生物二字又有何意义？还是生物质谱专制上面的某几种？哪几种？纯属个人好奇，欢迎大家各抒己见。。。

生物质谱技术正成为蛋白质鉴定分析的主要支撑技术，它通过测定样品离子的质荷比(m/z) 来进行成分和结构分析。双向凝胶电泳分离的蛋白质点数目多、量少，其鉴定方法是利用蛋白质的各种属性参数如相对分子质量、等电点、序列、氨基酸组成、肽质量指纹谱等在蛋白质数据库中检索，寻找与这些参数相符的蛋白质。若在数据库中找不到，有可能是发现了新蛋白质，要进行序列分析，进一步合成DNA 探针来表达、分离和鉴定它

我们单位想采购一台生物质谱仪，所测定的蛋白质分子量大约在5000-100000之间，不知道各位行家里手有什么好建议？谢谢！

本人想做一有关生物质谱的seminar，因为自己也是刚接触，求助同仁有关方面的资料，最好有PPT了。因为是学生内部交流，简单一些没关系。谢谢！