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单细胞液滴制备分析

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单细胞液滴制备分析相关的资讯

  • 华大智造单细胞赛道再发力!发布单细胞液滴生成仪及组学新品
    7月29日,在第十二届细胞产业大会的单细胞多组学与临床应用分论坛上,华大智造重磅发布其在单细胞领域的两款最新产品,单细胞液滴生成仪 DNBelab C-TaiM 4(泰山),以及单细胞表观组学产品scATAC建库试剂盒。单细胞液滴生成仪 DNBelab C-TaiM 4(左)及单细胞表观组学产品scATAC建库试剂盒(右)这是华大智造继DNBelab C系列高通量单细胞转录组建库试剂盒产品后,单细胞组学全流程产品家族补充的重要产品,更为完善的产品组合也将更好地赋能全球生命科学实验室开启规模化、标准化的单细胞多组学研究。两款新品加持单细胞测序全流程本次上新的单细胞液滴生成仪DNBelab C-TaiM 4 (以下简称TaiM4)的命名灵感来源自“泰山”,传递了华大智造不断攀登技术极限的理念。TaiM 4能为细胞或细胞核的分离和标签提供稳定的动力。该仪器配备4个独立控制的微流控通路,同时兼容单细胞ATAC文库和3’ RNA文库制备需求,支持1-4个样本的灵活上样。它延续了华大智造单细胞产品小巧轻便、即开即用的优点,适用于2500米以下的海拔实验环境。此外,该设备在单细胞ATAC文库制备过程中的细胞核分离、标记过程仅需6分钟;在单细胞3’RNA文库制备过程中的细胞核分离、标记过程仅需9分钟。华大智造单细胞液滴生成仪DNBelab C-TaiM 4另外一款上新产品是DNBelab C系列高通量单细胞ATAC文库制备试剂盒套装及配套的微流控载片。和DNBelab C-TaiM4 单细胞液滴生成仪配套使用,可以完成数万细胞核的ATAC文库制备。试剂盒套装包含液滴生成使用的百万级标签磁珠、自主开发的液滴生成油、以及适配华大智造测序仪的文库制备试剂等。该产品基于精密压力驱动微流控技术,污染率低,可完成高质量单细胞ATAC文库的制备和数据产出。可用于免疫组学、肿瘤、神经科学、发育生物学等领域的单细胞研究。两篇Nature 科研应用表现不俗值得一提的是,scATAC建库试剂盒已经在科研应用中牛刀小试,早期试用的结果已用于2篇Nature文章中,产品数据表现不俗。一站式平台 助力单细胞多组学标准化、规模化华大智造作为生命科技核心工具缔造者,能够为单细胞测序全流程提供独一无二的一站式平台。其中,针对细胞/细胞核制备环节,华大智造提供小鼠多组织解离试剂盒和50+物种组织解离方案指南;此外,已经发布的DNBelab C系列3’ RNA建库产品,已经产出了 30000+例样本数据,覆盖了40多种物种类型和300多种组织类型,重磅预告了不同物种组织的3’ RNA数据表现白名单,并展示了部分数据;在数据分析环节,提供配套的单细胞高通量、高精度多模态分析平台,不仅能够对单细胞测序数据进行简单的质控,还支持更多功能的分析和多组学数据的整合。华大智造产品市场中心总监汪婧婧博士在发布会现场表示:“华大智造在单细胞领域,除了为科研人员提供单细胞建库产品和基因测序产品MGISEQ-2000、DNBSEQ-T7、DNBSEQ-T20外,还能够提供自动化文库制备系统MGISP-100,将复杂的单细胞文库制备过程转移到自动化平台一键运行,为单细胞行业引入了全新的自动化概念,这将开启单细胞湿实验标准化时代的到来,我们也坚信单细胞多组学标准化、规模化时代终将来临。”汪婧婧博士华大智造产品市场中心总监单细胞产品家族图自动化建库流程图在单细胞产品领域,华大智造通过其率先发布的DNBelab C系列产品,已收获了众多企业及科研用户的好评。在过去的一年时间里,国内已有9个企业认证成为华大智造单细胞产品服务商,终端使用客户数量100多家。在科研产出上,基于华大智造单细胞测序平台,已累计产出高质量文章50多篇,其中包括2篇Nature,1篇Cell,其中有21篇文章IF>10,充分证明了该单细胞平台性能的优越性。小结:单细胞技术是当前测序领域最火的技术之一,相关公司超过50家,其中不乏众多国产企业。作为国内基因测序上游龙头企业,华大智造并非在单细胞领域走的最快的,但其追赶之势十分迅猛,加上本身先天平台优势,大有后来者居上的势头。如其所言:“未来,华大智造将进一步深耕单细胞组学领域,发挥自身在基因测序设备领域、实验室自动化领域的优势,为规模化的科学研究、为单细胞组学全面进入临床及精准健康研究,提供更为优质、标准的系列产品组合,赋能单细胞多组学标准化、规模化时代”。
  • 青岛能源所发明拉曼激活单细胞液滴分选技术
    p   单个细胞是地球上细胞生命体功能和进化的基本单元。单细胞精度的高通量功能分选是解析生命体系异质性机制、探索自然界微生物暗物质的重要工具。单细胞拉曼光谱(SCRS)能够在无标记、无损的前提下揭示细胞固有的化学组成,因此拉曼激活细胞分选技术(RACS)日益受到广泛关注。但是分选通量是当前限制其广泛应用的最重要的瓶颈之一。据此,青岛能源所单细胞中心马波研究员与徐健研究员带领的多学科交叉团队通过耦合SCRS和液滴微流控技术,发明了拉曼激活单细胞液滴分选技术(Raman-activated single-cell Droplet Sorting RADS),这是目前已公开报道的工作中分选通量最高的RACS系统。该工作于11月3号在线发表于Analytical Chemistry。 /p p   单细胞中心前期发明了基于微流控芯片的流式RACS技术(Zhang, et al, Analytical Chemistry, 2015),通过集成基于介电的单细胞捕获释放和电磁阀吸吮技术,实现了高速流动状态下单细胞的捕获、拉曼采集、释放和分选,通量达~60 个细胞/分钟。为了进一步提高通量,研究人员提出,单细胞经液滴包裹后,通过耦合介电可实现超高通量分选。液滴包裹不仅可以保护细胞免受分选过程中的损伤,还能够与分选后细胞的培养、DNA、RNA、蛋白等的提取与分析等无缝衔接。因此,RADS技术有着广阔应用前景。 /p p   然而,在RADS技术中存在诸多技术难题。首先,液滴表面凸/凹的形状会产生透镜效应,从而影响拉曼激光聚焦,降低空间分辨率,最终导致无法获取液滴中细胞的拉曼信号。其次,单细胞液滴包裹需要油相的引入,而油相具有强拉曼背景,会严重影响细胞拉曼信号的精确获取。第三,如何实现拉曼采集、分析、单细胞液滴包裹及分选的自动化集成未见先例。单细胞中心研究人员巧妙利用先获取单细胞拉曼信号,后进行单细胞液滴包裹的策略,有效解决了液滴对拉曼信号采集的影响 同时,在线集成液滴发生和分选同步进行,大大简化了系统操作步骤 最后,通过自主开发的软件,实现了拉曼采集、分析、单细胞液滴包裹及分选的高度自动化。该系统实现了高产虾青素之雨生红球藻的精确化(分选准确率高达98.3%)、高通量(260 细胞/分钟)筛选。研究人员还证明,分选后有92.7%的雨生红球藻细胞保持活性并可增殖,和未经分选的对照组相比没有显著性差异,说明RADS技术充分保护了细胞的活性。 /p p   单细胞中心前期已证明,基于单细胞拉曼成像的拉曼组(Ramanome)技术能够非标记、非破坏性地识别与分析几近无限的细胞功能。与拉曼组技术相耦合的RADS将能够高通量分选广泛的细胞功能,从而允许下游特定功能单细胞的培养或组学分析。这一工作为研制高度通量化与集成化的单细胞拉曼分选与测序系统奠定了基础。 /p p   论文共同一作是青岛能源所单细胞中心的王喜先与任立辉。本工作得到了中科院武汉水生所胡强研究员、北京大学王玮教授等的帮助,并得到了中科院仪器专项、国家自然科学基金、中国博士后科学基金和山东省自然科学基金等的支持。 /p p style=" TEXT-ALIGN: center" img title=" W020171108322918001267.jpg" style=" HEIGHT: 279px WIDTH: 500px" border=" 0" hspace=" 0" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201711/noimg/dee566b0-1166-47be-9cbd-0a240348aece.jpg" width=" 500" height=" 279" / /p p /p p & nbsp /p p style=" TEXT-ALIGN: center" 图1 拉曼激活单细胞液滴分选(RADS)系统示意图 /p
  • 青岛能源所发明拉曼激活单细胞液滴分选技术
    style type=" text/css" .TRS_Editor P{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor DIV{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor TD{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor TH{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor SPAN{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor FONT{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor UL{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor LI{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt }.TRS_Editor A{margin-top:0px margin-bottom:12px line-height:1.8 font-family:宋体 font-size:10.5pt } /style p   单个细胞是地球上细胞生命体功能和进化的基本单元。单细胞精度的高通量功能分选是解析生命体系异质性机制、探索自然界微生物暗物质的重要工具。单细胞拉曼光谱(SCRS)能够在无标记、无损的前提下揭示细胞固有的化学组成,因此拉曼激活细胞分选技术(RACS)日益受到关注。但分选通量是当前限制其广泛应用的瓶颈。中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心研究员马波与徐健带领的多学科交叉团队,通过耦合SCRS和液滴微流控技术,发明了拉曼激活单细胞液滴分选技术(Raman-activated single-cell Droplet Sorting RADS),这是目前已公开报道的工作中分选通量最高的RACS系统。相关研究工作在线发表在 em Analytical Chemistry /em 上。 /p p   科研人员前期发明了基于微流控芯片的流式RACS技术,通过集成基于介电的单细胞捕获释放和电磁阀吸吮技术,实现了高速流动状态下单细胞的捕获、拉曼采集、释放和分选,通量达~60个细胞/分钟。为了进一步提高通量,研究人员提出,单细胞经液滴包裹后,通过耦合介电可实现超高通量分选。液滴包裹不仅可以保护细胞免受分选过程中的损伤,还可与分选后细胞的培养、DNA、RNA、蛋白等的提取与分析等无缝衔接。因此,RADS技术有着广阔应用前景。 /p p   然而,在RADS技术中存在诸多技术难题。首先,液滴表面凸/凹的形状会产生透镜效应,影响拉曼激光聚焦,降低空间分辨率,导致无法获取液滴中细胞的拉曼信号。其次,单细胞液滴包裹需要油相的引入,而油相具有强拉曼背景,会严重影响细胞拉曼信号的精确获取。第三,如何实现拉曼采集、分析、单细胞液滴包裹及分选的自动化集成未见先例。研究人员巧妙利用先获取单细胞拉曼信号,后进行单细胞液滴包裹的策略,有效解决了液滴对拉曼信号采集的影响;在线集成液滴发生和分选同步进行,简化了系统操作步骤;最后,通过自主开发的软件,实现了拉曼采集、分析、单细胞液滴包裹及分选的高度自动化。该系统实现了高产虾青素之雨生红球藻的精确化(分选准确率高达98.3%)、高通量(260细胞/分钟)筛选。研究表明,分选后有92.7%的雨生红球藻细胞保持活性并可增殖,和未经分选的对照组相比没有显著性差异,这说明RADS技术充分保护了细胞的活性。 /p p   前期研究已证明,基于单细胞拉曼成像的拉曼组(Ramanome)技术能够非标记、非破坏性地识别与分析几近无限的细胞功能。与拉曼组技术相耦合的RADS将能够高通量分选广泛的细胞功能,从而允许下游特定功能单细胞的培养或组学分析。这一工作为研制高度通量化与集成化的单细胞拉曼分选与测序系统奠定了基础。 /p p   研究工作得到了得到了中科院仪器专项、国家自然科学基金、中国博士后科学基金和山东省自然科学基金等的支持。  /p p br/ /p p style=" text-align:center " img alt=" " oldsrc=" W020171108379243922765.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201711/uepic/6707be3b-54a6-42a1-861d-30e8d5f0f10d.jpg" uploadpic=" W020171108379243922765.jpg" / /p p style=" text-align: center " 拉曼激活单细胞液滴分选(RADS)系统示意图 /p
  • 新品速递|华大智造发布DNBelab C4单细胞测序文库制备试剂盒
    单细胞测序技术的发展日新月异,单细胞的研究已进入超高通量、超大数据研究阶段。华大智造自主研发的DNBelab C系列高通量单细胞RNA文库制备试剂盒(简称DNBelab C4)发布,助力突破单细胞研究门槛高、费用高的瓶颈,加速细胞分辨率下生命科学和医学新一轮的变革与发展,拥抱千万单细胞时代的到来。目前,应用华大智造DNBelab C4和DNBSEQ测序平台已开展百万单细胞项目十余项,发表SCI文章十余篇。2022年3月22日,国际顶级学术期刊《自然》(Nature)发表了基于华大智造单细胞利器DNBelab C4和DNBSEQ测序平台的科研应用。该研究助力科学家精确得到诱导全能干细胞(8CLC),并且通过细胞图谱分析证明了发育得到组织的多样性,证明了8CLC的全能性,最终获得了人类体外诱导的全能干细胞。这一研究的突破,正是得益于单细胞测序技术的进步与应用。在过去,研究人员可能要对成千上万个细胞进行处理和培养,才能获得全能干细胞,成功的概率只有不到百分之十五。基于华大智造自主开发的DNBelab C4,结合DNBSEQ测序平台,科学家可以以高灵敏度和高准确性的方法进行多维的单细胞分析,快速得到具有重要发育潜能的细胞,并研究这些细胞的发育去向。 利用8CLC发育的畸胎瘤组织充分证明8CLC的全能性 口袋里的单细胞实验室 每套试剂盒均带有一个小巧便携的DNBelab C4装置,无需电源,不需安装和维护,只需轻轻一拉便可实现单细胞液滴生成,堪称“可装进口袋的单细胞实验室”,简化了仪器的操作难度,并降低了单细胞研究的门槛。高效的磁珠捕获系统华大智造DNBelab C4采用自主设计的捕获磁珠,平均单个磁珠表面修饰有107条捕获序列,能够高效捕获目的分子;同时引入了自主研发的多磁珠识别技术,可有效提高细胞捕获效率以及获取细胞的完整信息。目前,DNBelab C4已经应用于人、鼠、猴、猪等十几个物种,超200种不同类型样本的单细胞转录组研究;单次实验有效捕获细胞数量1,000~12,000个,多胞率(Multiplet Rate)4,000(细胞系),每个细胞UMI中位数15,000个(细胞系)。投入细胞捕获效率捕获细胞数多胞率UMI中位数/细胞(细胞系)平均基因个数/细胞(细胞系)5,000~30,00030~60%1,000~12,0004,000单细胞研究一站式平台华大智造为单细胞测序提供一站式平台,包括自动化文库制备系统MGISP-100、MGISP-960和基因测序仪MGISEQ-2000、DNBSEQ-T7等,全面支持单细胞组学研究的快速展开。其中,自动化建库平台的搭建,有助力于节省人力、提高通量、减少操作失误。现已有部分研究机构和测序服务机构采用了该一站式平台进行了单细胞测序应用,测序结果表现优异。作为生命科技核心工具的提供者,在单细胞领域,华大智造致力于为所有生命科学实验室提供便携、经济、用户友好的单细胞组学全流程产品,助力行业开启规模化单细胞研究新时代。华大智造正在开展服务商认证,首批已认证三家服务商。
  • 液滴微流控流式细胞仪技术|CTC单细胞miRNA原位多重检测
    在液体活检的研究中,基于表面上皮标志物(EpCAM和CK)的循环肿瘤细胞(CTC)检测策略应用较为广泛,但存在局限性。研究表明,CTC中的肿瘤相关miRNA与癌症的发生和发展具有高度相关性,具有成为肿瘤表征和鉴定标志物的潜力。目前,高通量地针对单个CTC在活细胞水平开展原位分析,并进一步实现多个miRNA的同步分析,是颇具挑战性的工作。然而,新型的二维纳米材料——金属有机框架(MOF)因结构可控、功能多样的特性,为研究人员提供了活细胞探针载体的新思路。   近日,中国科学院深圳先进技术研究院陈艳团队联合清华大学深圳国际研究生院谭英团队、香港理工大学杨莫团队,提出了新型的2D MOF纳米传感器集成的液滴微流控流式细胞仪(Nano-DMFC),可应用于CTC单细胞miRNA的原位多重检测。相关研究成果以2D MOF Nanosensor-Integrated Digital Droplet Microfluidic Flow Cytometry for In Situ Detection of Multiple miRNAs in Single CTC Cells为题,发表在Small上。   本研究开发了一种新型的2D MOF纳米传感器集成的液滴微流控流式细胞仪(Nano-DMFC),突破了活细胞中核酸原位分析的技术瓶颈,高通量地实现了样本中单个CTC活细胞miRNA的原位、多重、定量分析。该纳米传感方案以金属有机框架MOF为猝灭剂,双色荧光染料标记DNA探针为供体,首次合成了用于双重miRNAs检测的生物功能化MOF荧光共振能量转移(FRET)纳米探针。该2D MOF纳米传感器修饰了两种乳腺癌靶向多肽序列,以增加肿瘤细胞靶向和内体逃逸能力。集成2D MOF纳米传感器的数字液滴微流控流式细胞仪,可实现单个乳腺癌细胞中双重miRNA标志物(miRNA-21和miRNA-10a)的原位检测。   纳米传感器集成的液滴微流控流式细胞仪由三部分组成——单细胞液滴发生器、纳米探针微注射单元和液滴荧光检测单元。Nano-DMFC系统首先产生单细胞液滴,然后2D MOF纳米传感器被精确地微注射到每个单细胞液滴中,在活细胞水平实现单个肿瘤细胞中的双重miRNA表征。在单个肿瘤细胞内存在目标miRNA时,MOF纳米片上的染料标记的ssDNA与其靶标形成杂交双链DNA(dsDNA),dsDNA和MOF之间的相互作用减弱,使dsDNA从MOF表面分离,最终触发荧光的恢复。不同类型的miRNA在单个细胞中产生不同的荧光信号。最后,研究使用光纤集成的液滴流式检测装置,在纳米探针孵育后对液滴中的信号进行检测和分析,从而实现对单细胞中双重miRNA的检测。实验结果表明,Nano-DMFC平台能够以双重miRNA为靶标在仿生样本(含有10,000个阴性上皮细胞)中检测出10个阳性CTC细胞,同时在加标血液样本的回收实验中表现出良好的重复性。该平台验证了以miRNA为标志物的CTC检测新策略。Nano-DMFC系统作为小型化、高度集成、操作简易的活细胞miRNA分析平台,为探究肿瘤细胞异质性和鉴定细胞亚型提供了新思路,并在临床研究中具有癌症早期诊断和术后监测的潜力。   研究工作得到国家自然科学基金、广东省粤港联合创新领域项目、深圳市科技创新委员会和香港研究资助局等的支持。   论文链接   A、同时检测miR-21和miR-10a的MOF-PEG-peps纳米复合材料传感器的制备方案;B、Nano-DMFC系统中的样品处理单元和miRNA检测单元,可实现单细胞液滴包裹、纳米传感器微注射、单个CTC细胞多重miRNA荧光检测。 在液体活检的研究中,基于表面上皮标志物(EpCAM和CK)的循环肿瘤细胞(CTC)检测策略应用较为广泛,但存在局限性。研究表明,CTC中的肿瘤相关miRNA与癌症的发生和发展具有高度相关性,具有成为肿瘤表征和鉴定标志物的潜力。目前,高通量地针对单个CTC在活细胞水平开展原位分析,并进一步实现多个miRNA的同步分析,是颇具挑战性的工作。然而,新型的二维纳米材料——金属有机框架(MOF)因结构可控、功能多样的特性,为研究人员提供了活细胞探针载体的新思路。
  • 如何制备*单细胞悬液,几个小TIPS包教包会
    时下细胞研究很火的科研技术当属单细胞测序,但此技术对细胞悬浮液的总量以及活性都有一定的要求,因此制备高质量的单细胞悬浮液成为实验成功的关键点。单细胞测序涉及的细胞类型多种多样,如肠、肺、PBMC、胚胎、神经、乳腺、干细胞等,而其中样本的处理消化亦是重中之重,样本前处理与后续的分析结果有着莫大的关联。如何在上机前得到最*的悬液呢?这里和大家分享一些制备*单细胞悬液的小tips。1、在样本采集过程中,建议采用无菌样品处理方式,包括使用不含核酸酶的试剂和耗材;2、实体组织需要先处理,传统组织处理方法有机械法,包括网搓法、研磨法。机械法一般适用样本类型为脾脏、淋巴结、胸腺;另外较温和的方法有酶解法(使用胰蛋白酶类、胶原酶、溶菌酶、弹性蛋白酶以及一些商业化包装的组合酶),适用样本类型有肝脏、肾脏、心脏、肺脏、脊髓、脑、肠道、皮肤、肿瘤等。3、如果您使用的是10x Genomics相关仪器和平台,可以从官网查看10x Genomics不同样本单细胞悬液制备官方建议或者利用关键词查询与自己样本类型相同的已发表的单细胞测序文献。对于如何获得高质量的样品,10X公司建议在单细胞悬液制备过程中,细胞重悬的缓冲液选用无Ca2+、Mg2+和EDTA的1× PBS,并用0.04% non-acetylated BSA清洗两次(300rcf,5min),选择其他缓冲液或培养基可能会对结果产生不同程度的影响。4、细胞在处理过程受到外界环境影响,其基因表达谱可能会出现一些变化;有些细胞对环境极为敏感,可能会死亡裂解,造成RNA降解从而造成检测中的背景细胞升高,进而影响所获得的数据质量。实验过程中需要尽量避免细胞死亡,不断优化细胞处理条件,加快实验流程的进度,减小对细胞的影响。5、单细胞悬液制备过程中出现的细胞团、细胞碎片或纤维等杂质会增加微流体芯片的堵塞风险。如果存在细胞碎片和大团块,请将样品通过40 µm Flowmi 细胞过滤器,细胞悬液体积损失小。 图源:10x Genomics 的Protocol《 Fresh Frozen Human Peripheral Blood Mononuclear Cells for Single Cell RNA Sequencing》图源:《10x Genomics® Single Cell Protocols——Cell Preparation Guide》相关产品Bel-Art Flowmi 40微米 细胞过滤器,适用于1000微升移液管(50个/包)
  • Dolomite Bio成功举办高通量单细胞转录组测序和单细胞液滴包裹技术交流会
    随着科学的发展,科学家们发觉许多群体细胞,完整个体水平的研究只是研究多种类细胞,多个细胞共同作用的“平均值”,淹没了细胞个体之间的差异。因此,针对单个细胞的研究技术,单细胞基因组学研究(Single Cell Genomics Study)成为生物学研究迫切的方向,并成为再生医学,发育生物学,肿瘤研究,免疫学研究必不可少的关键研究手段。 Dolomite Bio公司基于其已有的单细胞RNA测序模块系统和μEncapsulator单细胞包裹模块系统取得良好的销售业绩及客户反馈。2017年11月,Dolomite Bio公司隆重推出Nadia高通量单细胞建库仪,可平行运行1/2/4/8个样品, 每个样品18min内可生成6000个单细胞库;专为DropSeq方案设计;使用一次性试剂盒,防止污染;自动检测试剂盒状态,触摸屏控制,全自动运行。同时,添加Innovate新方法开发平台,可以使用自己的试剂,开发新的方法,可调节液滴大小、频率、温度、搅拌和时间等参数,一旦条件摸索成功,可通过Nadia高通量单细胞建库仪在相同条件下平行运行2/4/8个样品。 2018年4月24日-27日, Dolomite Bio公司在北京、上海、深圳和澳门成功举办了Nadia高通量单细胞转录组测序技术交流会,会议现场Dolomite Bio公司CEO Mark Gilligan先生详细介绍了液滴微流控技术应用在单细胞研究的优势,高通量单细胞RNA测序实验中遇到的问题以及B细胞和T细胞、FACS分选等应用,并现场利用Nadia单细胞建库仪和Innovate新方法开发平台演示了单细胞库制备的整个实验过程。现场部分客户被邀请亲自体验了实验过程,客户对实验结果非常满意,并对Nadia通量高、操作简单、Innovate灵活开放的特点给予了极大的肯定。清华大学会场中科院学术会议中心会场华大基因会场澳门大学会场Mark给客户演示Nadia样机
  • 实验室达人的秘密武器|高压均质机与单细胞悬液制备仪实用指南
    实验室中的科研人就如同探索未知的勇士,他们借助着各种精密仪器,探寻着各种神奇奥秘。当我们在追求科研的精准与效率时,两款设备不容忽视—那就是高压均质机和单细胞悬液制备仪。它们如同实验室中的得力助手,以其独特的功能为实验工作提供了极大的便利性,同时也解决了部分操作时的难题。想要获取更多的研究思路和手段吗?那就让我们一起走近这两款设备,感受它们为科研带来的无限可能。一、高压均质机:高压均质机这一看似普通的设备,实则蕴含着巨大的能量。利用高压和剪切力,将物料进行均质化处理,使得原本不均匀的混合物变得细腻均匀。在食品、化工、医药等领域,高压均质机都发挥着不可替代的作用。在实验室中,科研人员可以利用高压均质机对样品进行预处理,提高实验的准确性和可靠性。 高压均质机 JXNANO-5高压均质机应用领域:制药行业中制备脂肪粒、载药型乳液均质、脂质体、纳米混悬剂和微胶囊等 生物工程产品的细胞破碎、胞内外物质的提取和均质 精细化工、碳纳米管、石墨烯、导电浆料、电阻浆料的生产和制备 个人护理品-脂质纳米的均质分散 食品和工业产品的均质和乳化,提高产品稳定性 高压均质机产品优势:①结构特点:单支陶瓷柱塞驱动,出料流量精准控制。可选配柱塞润滑装置,密封使用寿命更长。②均质压力:最大设计压力2000bar/200MPa/29000psi,选用卫生级数字隔膜压力表。③均质流量:最小样品量15ml,特别适合昂贵的药剂生产。自动吸料,无需进料设备。④部件技术:均质阀座组件可采用氧化锆、钨钢、金刚石、司太立等材质,单/双面加工,双面使用,使用寿命加倍。二级阀分散乳化,使物料分布更加均匀一致。⑤节能技术:设备变频控制,接入220V市电即可使用,进口品牌部件设备更稳定,更低的能耗,更高的能效比。二、单细胞悬液制备仪:单细胞悬液制备仪是实验室中另一款不可或缺的设备。应用于流式细胞术/单细胞测序/原代细胞培养等实验。另外单细胞悬液制备仪在肿瘤研究 心血管研究 干细胞研究 免疫研究 神经科学研究等研究领域的应用也很广泛,主要目的时为科研人员提供了更多实验便利。单细胞悬液制备仪 JX-CKSM-4WK样品范围:人类及小鼠肿瘤组织/正常组织,哺乳动物软组织,植物愈伤及根尖组织。产品应用:单细胞测序(Single-Cell RNASeq)多色流式分析(Multicolor Flow Cytometry)质谱流式细胞计数(Mass Cytometry)原代细胞分离培养(Primary Cell Isolation And Culture)细胞治疗CAR-T组织高利用率、单细胞化过程高效、单细胞高产出1、操作简易,制备流程全自动,仅需30min即可获取大量单细胞悬液2、自动控温,保护样品活力,细胞活性可达85%以上3、多种消化方案,针对不同样品选择不同程序,针对不同组织均有配套试剂盒4、针对临床穿刺样本,使组织的利用率达到100%,细胞产量可达10万个以上5、针对原代细胞培养样本,在15min内完成组织到单细胞过程,降低细胞逆境时间,提高细胞存活率6、针对组织单细胞测序,快速完成单细胞化处理,获得高产且活率在85%以上的单细胞,以小鼠组织为例:在实验室的日常工作中,高压均质机和单细胞悬液制备仪的使用频率很高。科研人员通过操作这些设备,不仅能够提高实验效率,还能够减少人为误差,保证实验结果的准确性。同时,这些设备还具有操作简便、性能稳定、便于清洁等优点,使得科研人员能够更加专注于实验本身,而不是被繁琐的清洗和操作所困扰。净信小贴士:目前任何设备都不是万能的。在使用高压均质机和单细胞悬液制备仪时,科研人员也需要注意一些细节问题。例如,要定期对设备进行维护和保养,确保设备的正常运行;在操作过程中,要严格按照操作规程进行,避免因为操作不当而导致设备损坏或实验结果失真。
  • 363万!中国海洋大学多功能酶标仪、单细胞悬液制备仪等设备采购项目
    项目编号:SDSHZB2023-058项目名称:中国海洋大学多功能酶标仪、单细胞悬液制备仪等设备采购项目预算金额:363.0000000 万元(人民币)采购需求:本项目预算总金额为363万元,共分为5个包,其中:A1包:多功能酶标仪等设备(接受进口产品),预算金额:109万元;A2包:移动式小动物麻醉机等设备(接受进口产品),预算金额:51.5万元;A3包:全自动无创血压测量系统等设备(接受进口产品),预算金额:72万元;A4包:液晶数码生物显微镜等设备(接受进口产品),预算金额:44万元;A5包:冷冻切片机等设备采购(接受进口产品),预算金额:86.5万元。合同履行期限:详见附件本项目( 不接受 )联合体投标。获取招标文件时间:2023年03月18日 至 2023年03月24日,每天上午8:00至11:30,下午13:00至16:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:青岛市市北区敦化路138号甲西王大厦24楼23A01室或者邮件报名方式:以下方式二选一:(1)现场报名:须携带加盖单位公章的营业执照副本复印件及现金,按照上述时间、地点获取招标文件。(2)邮件报名:有意参加本次采购活动的投标人填写项目名称、项目编号、包号、公司名称、联系人、联系电话、邮箱、营业执照扫描件及标书费汇款底单发送至shzbqdb@163.com,邮件名称命名为:中国海洋大学多功能酶标仪、单细胞悬液制备仪等设备采购项目-“投标单位名称”。未按规定报名的投标人其报名无效。开户银行:兴业银行青岛市北支行,开户名:山东盛和招标代理有限公司,银行账号:522130100100053768,提交标书费须从投标人基本账户或一般账户转出,电汇时须备注2023-058-包号、资金用途注明标书费。未按规定报名的投标人其报名无效,本项目实行资格后审,获取招标文件成功不代表资格后审通过,招标文件售后不退。售价:¥300.0 元,本公告包含的招标文件售价总和对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名称:中国海洋大学地址:青岛市崂山区松岭路238号联系方式:崔老师 0532-667819792.采购代理机构信息名称:山东盛和招标代理有限公司地址:青岛市市北区敦化路138号甲西王大厦24楼23A01室联系方式:孙萌、张蕾、肖颖梦 0532-67737979 3.项目联系方式项目联系人:孙萌、张蕾、肖颖梦电话:0532-67737979
  • HORIBA | 厉害了!青岛能源所实现毫秒级单细胞拉曼分选,"后液滴"设计功不可没|前沿用户报道
    作者 | 王喜先单个细胞是地球上生命体功能和进化的基本单元,蕴藏着生长发育、衰老死亡、新陈代谢、信号传导等众多奥秘。单细胞精度的功能分选是解析每个细胞千差万别的原因、探索自然界海量陌生细胞(不可培养微生物)的重要工具,分选通量的提高将帮助研究人员累积更多的研究样本,拓展更广的筛选范围(自然环境、突变体库等)。因此,实现单细胞精度的高通量功能分选至关重要。近,中国科学院青岛生物能源与过程研究所传来喜讯,该所单细胞中心马波研究员与徐健研究员带领的多学科交叉团队,将单细胞拉曼光谱(SCRS)与液滴微流控技术耦合,发明了高通量拉曼激活单细胞液滴分选技术(RADS,Raman-activated single-cell Droplet Sorting)。该工作于2017年11月3日在线发表于美国化学会《Analytical Chemisrtry》。注:单细胞拉曼光谱(SCRS)能够在无标记、无损的前提下揭示细胞固有的化学组成。巧妙的“后液滴包裹”设计本研究开发的高通量拉曼激活单细胞液滴分选技术(RADS技术),是一种巧妙的“后液滴包裹”设计,它在微流控芯片的拉曼光谱检测点后方引入液滴包裹单元,这样就克服了制约通量提高的电磁阀作为分选驱动力的瓶颈问题,实现了基于介电力驱动的高通量分选。这使得从自然界中筛选新型的种子选手,或是从突变体库中找到更优秀的候选者,都变成现实。这项研究成功地将传统的“先养再选”思路扭转成了“先选再养”,避免了传统分选的涂平板和挑克隆的过程,省去了扩大培养、提取以及定量等繁琐过程。与传统技术相比,RADS技术的优势为:从筛选到采集,高效一体化拉曼分析过程接下来我们就来看看整个从筛选到采集的工作是如何进行的。具体来说,如下图,在微流控芯片中,细胞排着队(从左向右)一个个经过拉曼检测点(Raman),之后被逐个包裹在液滴(Oil)里面,与此同时计算机对采集到的单细胞拉曼信号进行判别,满足分选条件的,启动介电力(Dielectrophoresis),目标细胞将进入分选通道(Collect),而不满足分选条件的细胞将流入废液通道(Waste)。拉曼激活单细胞液滴分选技术在上述“流程”中的拉曼分析环节,研究团队利用HORIBA HR 800型拉曼光谱仪来采集单细胞拉曼光谱信号,配置EMCCD使得信号强度大幅提升,这对分选通量提高起到了重要作用。如果说微流控芯片、拉曼光谱仪及RADS是分析过程的三大核心结构,那么本项工作更加重要的“总指挥”则是团队自主开发的分析软件,该软件将拉曼采集、分析、单细胞液滴包裹及分选过程集成在一起,充分实现了从分选到采集的高度自动一体化。实践中的应用在上述分选技术的基础上,研究团队成功完成了大量实践研究,如高产虾青素之雨生血球藻的精确化(分选准确率98.3%)、高通量(260细胞/分钟)筛选等,并通过实验发现并证明,分选后92.7%的雨生血球藻细胞仍可保持活性并可增殖。相信后续还会有更多令人兴奋的实践研究成果不断诞生。本工作在中国科学院青岛生物能源与过程所完成,同时得到了中科院武汉水生所胡强研究员、北京大学王玮教授等的帮助,并得到了中科院仪器专项、国家自然科学基金、中国博士后科学基金和山东省自然科学基金等的支持。相关研究成果以“Raman-activated Droplet Sorting (RADS) for Label-free High-throughput Screeningof Microalgal Single-cells.”为题发表在《Analytical Chemisrtry》上。后 记报道成文过程中,小编有幸采访到以上研究的作者之一籍月彤老师,她告诉小编,“这是一个多学科交叉共同完成的工作,分析化学、生物化学、电子信息、自动化等背景的同事一起努力,终实现多信息获取下的高通量分选方案。”团队介绍中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心(http://www.Single-Cell.cn/)拥有约60人的研发队伍,其核心使命是研制和应用示范包括单细胞拉曼成像、拉曼激活细胞分选、单细胞测序、单细胞培养等在内的新一代单细胞分析系列仪器,以及元基因组、拉曼组等生物大数据软件,进而以微藻合成生物学、共生菌群与健康、海洋生物资源等为模式研究体系,探讨单个活体细胞精度的微生物组功能与进化机制。近,徐健研究员团队还发明了基于“拉曼组”的单细胞快检技术,能够在单个细胞精度同时测定淀粉、甘油三酯、蛋白质含量以及油脂不饱和度,为细胞工厂的性能测试平台增添了一个崭新手段。该工作于11月19日在线发表于Biotechnology for Biofuels。HORIBA科学仪器事业部结合旗下具有近 200 多年发展历史的 Jobin Yvon 光学光谱技术,HORIBA Scientific 致力于为科研及工业用户提供先进的检测和分析工具及解决方案。如:光学光谱、分子光谱、元素分析、材料表征及表面分析等先进检测技术。今天HORIBA 的高品质科学仪器已经成为全球科研、各行业研发及质量控制的首选。
  • 华微发布海风系列I型_单细胞捕获孵育_定向进化_滴内PCR新品
    创新点:海风HW-SeaBreeze 芯片实验室。可实现单细胞柔性捕获、液流/液滴精准控制、滴内PCR、无标记筛选、器官芯片、仿生环境建立等操作。 关键技术: (1)研究对象——直径0.1-2000um生物颗粒:细胞/细菌/病毒/线虫; (2)单核液滴——高通量,绝对单细胞液滴制备, 可删除空液滴及多核液滴; (3)精准控温——恒温孵育:微流培养池/器官芯片 液滴数字PCR); (4)柔性操控——保持活性;液滴/液流,电场/气压/激光多场景控制 (5)多类筛选——支持 拉曼/影像/阻抗等无标记筛选,荧光标记筛选 (6)器官芯片——液滴/液流 ,液/气/氧/温/光/电/时:多维精准控制 (7)耗材定制——芯片内生物存活7日,按需定制, 价格远低进口 ■ 应用领域:细胞培养、药物开发、器官芯片、肿瘤细胞医疗、仿生微环境、文库、单细胞(菌)液滴包裹/操控/筛选、单亲克隆、滴内PCR、定向进化等。 海风系列I型_单细胞捕获孵育_定向进化_滴内PCR
  • 单细胞分离的特点应用以及小技巧
    单细胞分离采用类似喷墨打印机以及一次性分配分离槽,温和高效地接种单细胞,使用明场高分辨率成像或可选荧光分选细胞,每个单细胞分离捕获 5张图像,单克隆性,提高工作效率,保持并增强细胞活率,且防止交叉污染。  采集单细胞分离的证据,在接种细胞时记录5张连续图像,以96或384孔板的形式提供直接的单克隆性图像证据,提高克隆形成率,与传统方法相比,在克隆形成率上可实现高达8倍的提升。  保持细胞健康和无菌,正如克隆生长实验所见,通过温和的分离维持细胞活性,并使用无菌的一次性单向分离槽防止交叉污染,简便、快速、可选择以及无损分离单细胞,简化遗传和克隆培养、分析中分离过程。快速高效接种单个活细胞至微孔板分离系统的主要功能为高效柔和地分离或分选活的单细胞。该系统通过微流控技术柔和地形成细胞液滴,同时利用白光和荧光成像实时分析细胞数量和荧光强度,将符合要求的单细胞液滴准确接种至96孔板。  主要特点  1.分离效率85%,单细胞活率75%;  2.记录分离前后的连续5张图像,用于支持细胞株的单克隆性;  3.采用一次性分离槽,省却系统的清洗验证,减小交叉污染的风险;  4.采用白光成像和荧光成像,可根据细胞直径、圆度以及荧光强度筛选出感兴趣的细胞;  5.内置除静电装置,消除微孔板静电,确保细胞液滴接种至微孔正中间,尤其是PCR板。  单细胞分离系统可代替传统的有限稀释法,高效地将单个活细胞接种至微孔板中。得益于分离系统的高效率和高活率,可以将每块微孔板中可获得的单克隆细胞团提高至多8块,从而在相同的工作量下可筛选更多的细胞克隆,从中发现更多更优质的细胞株。分离过程中记录的连续5张图像,可以与后续的孔板成像的图像证据互相补充,从而提高单克隆性的可信度。  应用范围:连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。  单细胞分离的小技巧  1. 缩短制备单细胞悬液的时间,以保留细胞活力  2. 考虑使用细胞筛来过滤出细胞团块或双细胞  3. 注意缓冲液的选择,包括分选和收集溶液  4. 如果您打算在分选后培养细胞,请使用对数生长期的细胞,并确定最佳培养条件  5. 在分选转染后的细胞时,通常在转染后72小时进行,以提高细胞群的生存能力  6. 如果采用荧光抗体来分离稀有细胞,请在染色前离心抗体,以便去除任何可能被误认为是靶细胞的荧光颗粒  7. 对于单细胞基因组学应用,在分选后别忘了离心平板,以确保细胞在孔的底部  8. 选择一种可靠的分析技术来评估分选细胞的数量和质量
  • 性价比谁与争锋?大连华微新推单细胞分选仪仅售36.8万
    性价比谁与争锋?大连华微新推单细胞分选仪仅售36.8万——“HW-cyclone旋风系列2023”单细胞液滴制备与分选系统,破茧而出!大连华微生命科技,推出“HW-cyclone旋风系列”单细胞液滴制备与分选系统(2023款),单激光(基础版)售价36.8万!此消息一出,业内哗然!单细胞分选设备平均百万的售价,被大连华微靠自研专利技术,砍掉三分之二!这——还没完!单细胞液滴制备与分选相应耗材:华微生命的微流控芯片,更是达到惊人的低价:RMB200-600元/片,仅为进口单价的1/10—1/5;一次性管线耗材,低至人民币10元+/次……单细胞领域,注定又是一场腥风血雨!西方人说:技术,不能让中国人掌握!似曾相识,像中国高铁一样,只要研发起步不落后于西方,中国民族企业就能靠自己的智慧,以“铁杵磨针”的韧性不辍耕作,就能捅破高科技那层“窗户纸”,而核心技术一旦被中国企业掌握,就能创造物美价廉的高性价比产品,让全球客户都买得起、用得上!而性价比——是中国制造在高科技领域:靓丽的标签!图1 大连华微生命科技推出的“HW-cyclone旋风系列”单细胞液滴制备与分选系统这么低的售价,能和国外百万以上的产品pk么?性能如何?功能是否拉跨?和流式技术对比,细胞活性怎么样?带着这些疑问,让我们走近这个被预言为“2023年性价比新高度”的“HW-cyclone旋风系列”单细胞液滴制备与分选系统。一、结构 (1)基于用户显微镜的开放式研发体系,包括:“HW-cyclone旋风系列”单细胞液滴制备与分选系统、显微镜、进样驱动装置(注射泵或压力泵)、微流控芯片等部分组成,不仅大幅降低采购成本,更方便改造、升级甚至用户自行设计(变更)各流程环节,个性化科研,才能让灵感迅速转化为科技成果。此外,系统的1+N积木式结构,以及客户常用的注射泵、压力泵等传统进样方式,与客户科研习惯具有良好的兼容性。从源头(细胞进样悬液),至最终分选成果收集,全流程低成本管线通路(含微流控芯片),可一次性或多轮使用,“一次抛”方式杜绝了污染与交叉影响;“多次抛”常见于相同试剂重复实验或高效教学环节,并可大幅降低成本。图2 大连华微生命科技推出的“蓝晶系列”单细胞液滴包裹与分选类微流控芯片二、功能针对单个细胞、细菌、病毒、线虫、细胞团等1-100um粒径范围的生物颗粒,进行液滴包裹、检测、按阈值分选等操作。 (1)单细胞微滴包裹(微滴批量制备)(2)细胞检测: 荧光标记 无标记技术(高级版)(3)细胞分选(以下方式任选其一): 电场力分选 磁场力分选 流体驱动柔性分选(4)特色技术(均高端机型/版) 单细胞液滴包裹时空滴删除功能 液滴切分功能 液滴再注液功能 连环分选(分选后再分选) 一分三路分选 分选后捕获(培养、扩增) 多种类单核1+1分选(5)升级扩展 升级至多激光/多通道, 扩展至影像传感、拉曼检测等检测方式; 增配单细胞自动植板系统(96/384孔板,单孔入单滴); 升级至疾风、暴风、飓风、龙卷风等大连华微高端系列; 根据客户想法,升级为其它个性化微流控方式三、价格(直销)(1)单激光分选系统(单通道基础版):36.8万元RMB;(2)微流控芯片(通用款或批量型):200-800元RMB;(3)管线通路耗材:10-30元/实验;(4)生物显微镜、泵、试剂、PC电脑等均可客户自备。 (提醒用户:长期实验使用,请重点考量耗材成本)四、系统原理(1)单细胞液滴包裹原理 针对细胞、细菌等1-100um粒径的生物颗粒,基于两相不相溶液体,在“十”、“T”、“Y”等形式液路中的通道交叉口,利用剪切力,生成均一的液滴,实现微观下细胞个体之间的分离。 (2)分选原理有别于流式分选技术对细胞极大伤害性的高压鞘液,本产品采用低液压驱动,肿瘤细胞等敏感生物颗粒几乎不会收到液压方面的伤害。基于电磁场、介电力、流体驱动等方式,针对单个细胞在分叉通道处,根据实时检测参数,施力向不同的分支驱动液滴,实现分选,其中电场力、介电力驱动效率高达:1000个细胞/分钟;五、功能及参数 (1)单细胞液滴包裹:1,000—50,000 drop/min (2)电场力/磁场力/介电力分选:1,000 drop/min (3)无标记分选:100 drop/min上述分选通量,无法与流式细胞仪(每秒数万个)相提并论,原因之一:降低的速度,极弱的液压推动,就是为了——细胞活性!如果流式分选针对某种细胞分选的活率为30%,华微采用的弱压驱动分选原理,使细胞分选活率达到流式的2至3倍(60%-90%),其分选成果符合单细胞基因测序的活率要求。尤其针对肿瘤细胞等脆弱样本,细胞保活的优势明显。原因之二:匹配单细胞植板流程。从另一个角度,如果下一环节是单细胞孔板滴注,那么,针对秒级的板孔间喷嘴移动,超过5Hz的分选速度,对整个系统的单细胞植板效率影响不大。六、活性因采用柔性低压力驱动方案(1-30PSI可调,压强可低至流式1/70),以及从头至尾的液滴全流程包裹策略,且细胞无需沾染电荷,故活性远优于流式分选技术,分选后细胞活率60-99%表1 常见流式分选设备喷嘴与压力配置表七、耗材微 流控芯片(液滴制备、液滴分选、特定功能定制芯片);管 线耗材(管路、夹具、连接件等),价格低廉,成本可忽略。大连华微生命科技,产品源于元器件级别的自主研发,客户众多,质量经过中科院、中国农科院、三甲医院、中国海洋大学、华东理工大学、江南大学等985/211高校,及其它众多客户应用及检验,性能稳定,价格低廉,拥有更亲民的性价比。公司创始研发团队包括:五位北京大学校友、两位原中科院资深工程师、多位国内985/211高校毕业生,并与中科院大连化物所、大连理工大学、大连交通大学、大连医科大学等合作单位的多位教授、博士或其它科研人员,进行长期合作。大连华微生命科技,是中国单细胞液滴分选领域的“清晨耕耘者”,(国内未发现比华微更早的商业化产品研发&制造商),用“十年磨一剑”描述毫不为过——在2013年,创始人就申请了多项发明专利,攻克多项西方对我国的“卡脖子”技术,并历经无数次改进优化,并实现了国产化。2021年,大连华微生命科技携手大连医大附属医院(三甲)、大连交通大学,以源于企业创始人专利技术的“单细胞柔性分选技术”,入选“2021年大连市重点科技计划项目”,并喜报频传,两年来不断获取新成果(预计2024年实现商业化,敬请期待)。大连华微的每一次技术革新,或能提高性能,或大幅降低成本,都承载着华微人潜心研发、敢于挑战未来科技的创业精神,我们将一如既往,不辍耕作,在单细胞细分领域不断探索,致力于全球业内的前沿科技研发,为中国民族工业添砖加瓦。企业简介:大连华微生命科技有限公司(Dalian Life Huawei Technology Co., Ltd.)(以下简称大连华微),科技型企业,是一家拥有自主知识产权,集研发、生产、销售及服务为一体的微流控系统一站式解决方案供应商,依靠自有专利技术,立足独立研发民族品牌,致力于微流体控制科技产品的研发与生产,历经十年的探索磨砺,为中国乃至世界的业内客户带来全新的选择。未来公司将一如既往地重视创新科研,与广大华微客户一起携手进步,共同推动着中国生命科学的发展,做世界细分领域有话语权的中国高科技民族企业。
  • 案例:超声波破碎仪破碎细胞液的实操流程
    超声波破碎仪破碎细胞液的操作流程破碎细胞液是超声波破碎仪在生物学、生物化学等领域中常见的应用之一。以下是使用超声波破碎仪进行细胞液破碎的基本操作流程:注意:在进行实验前,请根据实验的具体要求和样品的特性,合理选择超声波破碎仪的参数,并严格按照仪器和试剂的使用说明进行操作。 操作流程准备工作: 准备需要破碎的细胞液样品,将其放入合适的管或容器中。确保使用的容器和超声波破碎仪的处理装置(破碎杵、破碎管等)是洁净的。确保超声波破碎仪的电源连接正常,仪器处于正常工作状态。设置超声波破碎仪参数: 打开超声波破碎仪的控制面板,设置合适的参数,包括超声波功率、工作时间、工作模式等。这些参数的设置需根据细胞液的性质和实验要求进行调整。选择合适的处理装置: 根据样品性质选择合适的处理装置,例如破碎杵、破碎管或破碎尖。不同的处理装置适用于不同类型和量的样品。装载样品: 将装有细胞液的管或容器放置到超声波破碎仪的处理装置中。注意确保样品的容器符合仪器要求,以避免因容器形状或材质不适配而影响破碎效果。进行超声波破碎: 启动超声波破碎仪,开始超声波破碎。根据实验要求,可以选择连续工作或脉冲工作模式。监控样品的温度,确保在破碎过程中不会产生过多的热量。监控破碎过程: 在破碎过程中,可以通过适当的时间间隔停止超声波破碎,检查样品的破碎程度。可以根据需要调整破碎时间,以确保达到理想的细胞破碎效果。结束破碎: 破碎完成后,停止超声波破碎仪的运行。取出样品,根据实验需要进行后续处理,如离心、分析等。清洗工作: 清洗超声波破碎仪的处理装置和样品容器,以防止交叉污染。按照仪器和容器的清洗要求进行操作。以上是一般超声波破碎仪破碎细胞液的基本操作流程。具体的操作步骤和参数设置应根据实验的具体要求和仪器的型号而定。
  • 5家进口+N家国产,单细胞测序平台大盘点!
    2009年,单细胞测序技术问世。2013年被Nature Methods评为年度技术。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现。2018年以来,以新格元为代表的国内单细胞平台如雨后春笋般涌现。Fig 0 单细胞平台一览图详细了解厂商和各家产品之前,预告一下“第六届基因测序网络大会”,会议上德运康瑞、墨卓等企业的专家代表将有精彩的分享。马上免费报名吧!报名页面:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/一、低通量单细胞平台低通量的单细胞平台主要是基于smart-seq2技术原理开发而来,典型代表有Fluidigm C1™ 单细胞全自动制备系统和WaferGen ICELL8® Single-Cell System两大平台。1、Fluidigm C1™ 单细胞全自动制备系统Fig1.1 富鲁达C1单细胞系统  2012年6月13日,Fluidigm 在日本横滨举行的国际干细胞研究学会 (ISSCR ) 上发布了C1™ 单细胞全自动制备系统,是真正第一个实现商业化的平台。  C1单细胞自动制备系统微流体技术,可以同时捕获多个单细胞(IFC:~96 cells;HT-IFC:~800 cells),在同一张芯片上完成细胞捕获、裂解、逆转录及预扩增的全过程,完成smart-seq全步骤的自动化。2、WaferGen ICELL8® Single-Cell SystemFig1.2 宝生物iCell8单细胞平台  2015年2月份,Wafergen公司开发出ICELL8 Single-Cell System单细胞分选平台,后被TaKaRa公司收购。  利用WaferGen Smart Chip TE平台筛选细胞,5184个反应孔,可进行单细胞RNA测序样本的制备、扩增、表达谱建库测序、生物信息分析,可快速得到样本间的基因表达差异。  每次运行可分离500~1800个细胞; 细胞的捕获效率大约37%; 细胞适用范围为5-100um; 样本通量为8(一枚ICELL8芯片上一次最多可以分析8种细胞样品); 没有整合试剂,使用Takara试剂,需进行试剂优化; 自动成像技术系统:可实现单细胞反应孔可视化; 单细胞挑选软件:只挑选活的单细胞进入后续的处理,从而可以节约反应试剂,缩短数据分析时间。[点评]:虽然低通量测序现在不是市场上的主流,但是由于其实验的精密度是非常高的,已依旧没有被社会淘汰。二、高通量单细胞平台(进口)  2017-2018年,两大商业化的单细胞测序平台(10X Genomics, BD Rhapsody)出现,最终让单细胞测序技术进一步达到更大商业化。1、 Mission bio:专注于高通量单细胞DNA测序的平台Fig2.1 Mission bio Tapestri Single-cell Multi-omics Solution  Tapestri平台基于微液滴的微流控装置,利用油包水体系对细胞进行捕获与封装。封装时,细胞和蛋白酶等会被一起装入微液滴中,每一个微液滴相当于一个微容器。之后,细胞在微液滴中进行裂解、加条形码(barcoding)等步骤,再结合靶向 PCR 扩增技术,对特定的DNA目标序列与蛋白产物进行单细胞水平的建库。建库完成后,即可进行高通量测序和后续的生物信息学分析。• 专注单细胞DNA测序。• 高灵敏度,可检测含量低至0.1%的罕见亚克隆,以及突变的合子型和突-变共发生情况。• 多种检测类型,可检测SNV、InDel及CNV等多种变异类型。• 高通量,每个样本可测量5,000~10,000细胞。• 灵活性强,可定制化设计疾病基因检测靶点及CRISPR靶点 。2、Illumina® Bio-Rad®:基于数字PCR的高通量单细胞平台  2017年1月17日,Illumina公司和Bio-Rad实验室公司在JP摩根健康大会上发布了Illumina® Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution。Fig2.2 Illumina Bio-Rad Single-Cell Sequencing Solution该系统包含Illumina® Nextseq 500和Bio-Rad® ddSEQ™ Single-Cell Isolator;Bio-Rad最好的液滴分离技术,Droplet Digital™技术,可以对单细胞进行隔离和编制条形码,然后在Illumina的许多主要NGS仪器上进行下游测序。• 可一次性检测8个样本,每个样本可以得到500~10000个细胞。• 捕获效率低,仅为3%,但测序成本相对较低。3、10x Genomics Chromium 高通量单细胞平台(controller/connect/X series)10X面对市场不同的需求推出了三款仪器。最早的这一款就是chromium controller,这款仪器配备了是标准通量和低通用的两款试剂盒。2021年的时候,10X上又推出了chromium X series这款仪器,目前这款仪器也是市场主推的一款。它适配的试剂盒的规格也更丰富。Fig2.3 10x Genomics Chromium 高通量单细胞平台另外10X推出的chromium connect仪器最大特点就是它能够实现从单细胞分离以及到最后NGS文库构建的一个全流程的过程,因此更加适合于一些大通量的实验室。• 每次运行提供8个通道,每个通道可以收集100-10000个细胞。(注:Chip M是16个通道)• 每次细胞分装运行时间为18min左右;• 细胞捕获效率最高可达65%;• doublet比例为0.9%/1000个细胞;• 针对单细胞ATAC分析,线粒体污染率低于2%;4、BD Rhapsody™:基于微孔板法的高通量单细胞分析系统  BD Rhapsody™单细胞分析系统包括BD Rhapsody™扫描仪和BD Rhapsody™ Express单细胞分析系统。BD Rhapsody™ Express 系统配备的专有单细胞捕获技术,以微孔为基础,稳定,能够捕获数百到数千个单细胞并为其打上条形码,分析基因组和蛋白质组信息。BD Rhapsody™扫描仪旨在可视化单个细胞捕获工作流程中的所有步骤,为每个步骤提供详细的分析度量,以便用户在整个工作流程中做出关键决策。Fig 2.4 BD Rhapsody™单细胞分析系统• 单细胞捕获效率:最高可达~80%• 单细胞检测通量:100-40000• 双细胞比例: ~2-3% for 10k cells load; ~8-10% for 40k cells load[点评]:1)10x Genomics仍是主力军,在国内拥有众多代理商和服务商,占据着80%左右的国内科研市场份额。同时该平台近两年注重空间组学平台开发,2022年推出了一系列新产品;10x Chromium X系列产品有多种应用类型,支持低中高3通通量模式,在推广上又与之前的Controller进行联动(增加保修年限),是10x的主力机型。2)BD Rhapsody™平台坚持微流控微孔板的原理,配备有扫描仪,可以实时监测单细胞状态,保证细胞的分离捕获效率;同时其配套有抗体和流式平台,在单细胞实验的组合解决方案上有明显优势(混样、与流式仪器上下互动组合)。3)Mission Bio单细胞平台专注单细胞基因组测序,在血液肿瘤方向深耕多年,接触临床应用时间较早;近些年在逐步增加国内服务商的覆盖,已有多家知名服务商与之合作。4)Bio-Rad与illumina合作推出的单细胞建库平台捕获效率较低,市场占有率及市场声音较低。点击图片即可报名参会,8位嘉宾将带来单细胞测序内容!三、高通量单细胞平台(国产)截止到2022.12.31,国内的单细胞平台共有10个,分为微流控微孔平台(以新格元Matrix系统为代表)和液滴微流控平台(以华大C4系统为代表)。1、新格元Singleron Matrix® 自动化单细胞测序文库构建系统可完成将单细胞悬液分散到微流控芯片的高密度微孔阵列中,并自动完成细胞分离、细胞裂解、细胞标记至mRNA捕获步骤,无需实验人员干预。Fig3.1 Singleron Matrix自动化单细胞测序文库构建系统• 单个样本单张芯片可捕获细胞数量500-30000个 • 每份样本捕获效率最高可达75% • 检测1000个细胞中含有双细胞的比例低于0.2%;[点评]新格元生物是国内首家一站式全方位的单细胞整体解决方案提供商,在产品方面既有单细胞转录组、核转录组、免疫受体等常规产品,同时也有单细胞转录动态监测、单细胞糖基化、单细胞靶向基因检测试剂盒等特色产品,能够给科研者提供更加多样的组学研究选择。是国产单细胞的主要玩家之一。2、华大智造:DNBelab C4高通量单细胞平台DNBelab C4是华大智造推出的基于负压的微流控单细胞技术。小巧轻便(长230mm、宽42mm、高57mm),无需电源,重量不到220g,操作简单,可随时开始单细胞建库。Fig3.2 DNBelab C4 Pocket Single-Cell Lab• 有效捕获细胞数:1000~12000 cells/run;• 细胞直径范围:5µm-25µm ;• 多胞率(Multiplet Rate):8% ;• 捕获效率:30~60% ;3、寻因生物:SeekOne双平台体系(微孔板平台+液滴油包水平台)寻因生物有单细胞标记两大主流技术:油包水法SeekOne® DD和微孔芯片法SeekOne®MM(Microwell & Magnetic Beads)。1)微孔芯片法MM  SeekOne MM(Microwell & Magnetic Beads)高通量单细胞转录组试剂盒基于微孔技术原理,通过微孔芯片SeekOne Chip实现单细胞捕获,并利用核酸修饰的Beads 对不同细胞来源的RNA 进行分子标记,最终构建兼容Illumina及华大智造测序仪的高通量单细胞转录组文库。Fig3.3.1 SeekOne MM平台(手动法)• 单次可放置1-4张芯片,单人操作可同时处理1-4个样本;• 单张芯片微孔数:17w;• 单张芯片捕获细胞数:500-10000 cells;• 捕获率:最高可达60%;• 双胞率: 0.7% / 1000 cells;• 无需其他昂贵硬件配套2)油包水法DD  液滴油包水平台(DD)是寻因生物的主力平台,并基于该平台开发了相应试剂盒,其主要有单细胞3‘转录组试剂盒和单细胞5’免疫受体试剂盒。• 芯片通量:1~8个样本,可以拆卸不会有芯片浪费;• 运行时间:3 min生成15万个油包水液滴;• 单通道细胞捕获:500-12000 Cells;• 双胞率:0.3% / 1000 cells;[点评]寻因生物尽管对外宣称具有MM和DD双平台,但整体推广上仍侧重DD平台,并依托其可拆卸的芯片实现更加灵活的实验安排。目前该公司产品相对较单一,公司在推广上发力比较多,推出了相当多的视频专题进行客户教育,算是不错的行业先行者。4、墨卓生物在过去的2022年中,墨卓生物对外发布了单细胞液滴微流控平台及其试剂盒、微生物高通量单细胞基因组测序产品。其中单细胞液滴平台MobiNova-100引入了光激发分离(Light-CUT专利技术)原理,可以在单细胞核酸捕获阶段将分子标签与微珠进行分离,因此在实验中需要专门的配套设备。Fig4.1 墨卓生物单细胞仪器• 芯片通量:1~4个样本;• 试剂盒种类:目前仅有单细胞3‘转录组试剂盒;• 运行时间:10 min;• 单通道细胞捕获:500-20000;• 双胞率:5% / 10000 cells;此外墨卓生物还推出了MobiMicrobe 微生物高通量单细胞基因组测序解决方案及其仪器产品M1,主要是在菌株水平分析宿主-噬菌体关联信息及转录转移事件。• 样本通量:每次可处理1个样本;• 捕获通量:每个样本可捕获微生物细菌数量≥6000个;• 仪器配套高速相机,能够观测微芯片中微滴发生和融合;• 仪器配有低温存储模块能,可同时放置4个0.2 mL PCR反应管和4个1.5 mL离心管;• 仪器配有扩增模块(96x0.2ml,12x8连管或96孔 PCR板)• 仪器带有自检功能:仪器在开机和运行过程中会自动检测,遇到异常会发出报警提示。5、其他除了以上4个国产单细胞平台之外,在过去的两年中还出现过一些平台公司,他们均采用液滴法来作为技术源头,并处于早期产品阶段,以单细胞转录组、免疫受体等作为主推产品,为客户提供产品或者服务。这些厂家有万乘生物(10K genomics)、百迈克生物、跃真生物(m20 genomics)、德运康瑞、纯迅生物等。总结  截至2022年12月,目前国内市场共有2个低通量进口品牌、4个高通量进口品牌和10个国产品牌,均有各自的公司定位和产品体系以及对应领域解决方案。  纵览2022年国内市场单细胞信息,主要特点有:• 单细胞新平台频出。如墨卓,M20,百迈客均是2022年推出单细胞平台。• 单细胞平台特点突出,各有产品和市场定位,有从单品到一站式解决方法成长的趋势。• 单细胞市场更为成熟。各家单细胞平台对内完善了团队建设,对外加强服务商或产业端的合作。• 空间技术应用。10X主推空间原位,德运康瑞收购先能原位,华大和百迈客主推基于测序的空间技术。• 单细胞多组学,有单细胞平台的厂家基本在或计划开发单细胞多组学(免疫,表观,蛋白,突变,全长)产品矩阵。• 单细胞技术应用方向扩展到动物,植物,微生物。如联川,诺禾推出农口单细胞激励计划,BD联合华南农大推出经济作物单核文库构建方案。(信息来源于生物医学小站)第六届基因测序网络大会进入报名页面:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/点击图片报名
  • 大连华微推出新产品:无极通量“阵列式单细胞超高通量柔性筛选系统”
    —“HW—TORNADO龙卷风”系列大连华微生命科技有限公司(Dalian Life Huawei Technology Co., Ltd.)(以下简称大连华微),是一家拥有自主知识产权,集研发、生产、销售及服务为一体的微流控系统一站式解决方案供应商。大连华微推出“HW—TORNADO龙卷风”系列单细胞液滴制备、混匀、检测、柔性操控与分选综合控制系统,引起业内客户高度关注。“HW—TORNADO龙卷风”系列产品,全球业内具有特色的“N×”阵列式并行模块单元结构,可积木式定制扩展,针对细胞、细菌、酶、病毒、蛋白、线虫等尺寸在0.1微米至2000微米范围的活性生物颗粒,实现高通量筛选:5亿×N个液滴/日(N=1,2,4,8,16…选用阵列数,理论上速度可任意增加);对尺寸在100纳米至2毫米米范围的生物颗粒进行液滴包裹、检测、分析及筛选,可删除空液滴,实现单个液滴只包含一个细胞、菌、酶(或其它生物颗粒);多频激光(405/488/532/561/638等)可根据用户需求配置,共聚焦实时协同作业,并可实现灵活的更换和快速升级;触摸屏软件,智能识别,实现自动化的操作处理;系统可根据客户需求定制生物芯片,实现液滴检测、混匀,以及无损操控与筛选。 大连华微成立伊始,就定位于世界前沿科技的研发与生产,其自主研发的“细胞、菌、酶液滴高通量制备、检测及柔性筛选系统”秉持民族品牌,已经发展5个系列数十种型号,成为业内知名、拥有完全自主知识产权的单细胞液滴自动化控制产品。公司本次重磅推出的:阵列式100%单细胞-巨高通量柔性筛选系统“HW—TORNADO龙卷风”系列,支持全面广泛的应用及科研需求,涵盖单细胞基因测序、基因编辑、细菌分选、药物筛选、疾病诊断、酶活筛选、基因文库构建等多个重要领域。 近一两年,国内出现很多仿制的实验室DIY型“分选系统”——依靠国外成型的功能组件、电源、信号控制部件搭接而成,智能程度低、可靠性差、误差不可控,分选过程对生物颗粒活性影响不可逆,且操作繁琐。最重要的:如果采购这种DIY型“产品”,一旦其进口电源、主控功率部件出现故障或损坏,DIY供应者无法修复,只有更换,且更换成本极高(至少需要RMB十万元以上,维修周期超过两个月,如西方限制进口则无法继续使用)。华微产品源于元器件级别的自主研发,客户众多,质量经过中科院、三甲医院、985高校等高端客户应用及检验,产品可靠性、柔性控制的性能远优于上述DIY型“产品”。华微产品除保修一年外,部件还终身享受成本价格换修(最贵的单个元件更换,不高于前述DIY供应者换修价格的三分之一),维修周期一般不超过一周,自主研发产品不存在受西方限制的核心组件,可大幅节省客户后续使用成本,这是拥有自主核心技术的底气。大连华微生命科技有限公司,依靠自有专利技术,立足独立研发民族品牌,致力于国际前沿领域的微流体控制科技产品的研发与生产,历经十年的探索磨砺,为中国乃至世界的业内客户带来全新的选择。未来公司将一如既往地重视创新科研,与广大华微客户一起携手进步,共同推动着中国生命科学的发展,做世界细分领域有话语权的中国高科技民族企业。关于华微生命科技:大连华微生命科技有限公司,坐落于素有中国“浪漫之都”之称的海滨城市大连高新区火炬路,是大连市第六批“海创工程”企业;成立伊始,就定位于世界最前沿科技的研发与生产,提供生物技术、生命科学、医疗健康、环境保护等领域的专业设备、耗材、服务,以及相关完整解决方案。
  • 国产单细胞柔性高通量分选技术历经“十年一剑”磨练后的发光发热——大连华微生命科技有限公司创始人李木
    单细胞柔性高通量分选——超越进口仪器的独门绝技!——大连华微生命科技微流控优势技术综述 在生命科学、生物制药、环保以及医疗等领域,针对细胞(肿瘤细胞)、细菌(工程菌)、病毒、细胞团、酶、线虫等活性生物颗粒,在保证活性前提下,根据参数进行单细胞级、高通量、柔性分选分离,即高效筛选出特异性个体,对于科研应用意义重大,也是当前最前沿的技术之一。历经近半个实际的科技迭代发展,单细胞操控技术日新月异,从最初的人工方式,到风靡半个世界的流式分选技术,以及近些年出现的拉曼检测分选、视觉捕捉、气动高压分选、光镊控制、液流瞬动等手段,都具有一定的进步性,不断推动整个产业的进步发展。2015年之前,生命科学中的单细胞分选应用,甚至包括细胞分析、捕获、操控等领域,均是进口仪器的天下,“单细胞”成为制约中国生命科学、生物技术等领域“卡脖子”技术之一,仪器与耗材严重依赖进口,国产仪器只能做一些边边角角的低附加值外围部件。图1 常见进口流式细胞仪直到2016年之后,在中科院大连化物所、大连理工大学以及大连医科大学附属医院等合作伙伴单位的支持下,历时6年研发,国产单细胞分选设备终于诞生——大连华微生命科技科研团队,成功绕开国外知识产权壁垒,开发出拥有中国人自己知识产权的单细胞分选分离系统,并在科研、教育、医疗、制药、环保等领域陆续实现应用。2018年之后,借助独有的柔性高通量操控、多通道级联等专利技术,大连华微生命科技(以下简称大连华微),在业内率先提出单细胞“柔性”高通量分选的概念,实现与西方进口设备的中西方分选技术的正面PK,除多次竞标中以性价比、独有特色技术脱颖而出外,更是多次以“单一来源”方式中标。那么,从2010年开始,历经“十年一剑”的磨练,大连华微,有哪些超越进口仪器的独门绝技呢?单细胞之删除空滴技术众所周知,皮升至微升级液滴型微反应器(以下简称液滴),是下一代生化分析工具,小小液滴,可以实现微米级尺寸的隔离空间,除了对单细胞、单细菌等生物颗粒起到保护作用外,还可以防止特定个体及其衍生物、排泄物、裂解物等单体相关物质,与其它个体实验的混淆,实现了细胞(或菌等)单体实验成果的可溯源性。实现比重99%的单细胞液滴,删除空滴与多核液滴,才是最严谨的“单细胞”技术。即,一个液滴里只包含一个细胞(或其它生物颗粒),删除空液滴、多细胞液滴(多核液滴),这样巨量规模、相互隔离的活性单细胞液滴群,对基因工程、筛菌、筛酶、定向进化、文库制备、制药、医疗等领域研究意义重大,是科学家最期望的活性样本处理形式之一。大连华微众多的独有特色技术中,包含单细胞液滴柔性高通量制备,可在液滴包裹时,根据实时监测删除空滴及多核液滴,实现液滴制备结果中,只包含“单核液滴”,为生物颗粒个体的隔离型大规模并行研究,以及海量样本中特异性个体的筛选、分离,提供了可行且高效的技术基础。大连华微推出的暴风系列产品,因为该特色技术,获得“2019年度中国科学仪器优秀新产品”荣誉称号,并进入多家国家重点实验室、三甲医院,以及985高校实验室。而很多进口设备,不具备上述空液滴、多核液滴的删除机制——其“单细胞液滴制备”,指的是“能够制备单细胞液滴”,而非“制备成果都是单细胞液滴”,即:单细胞包裹符合泊松分布的规律,更详细的数据:除5%—20%的单细胞液滴外,会伴生超过70%的空液滴、5-10%的多核液滴,在多环节的生命科学、生化实验中,大幅降低实验效率,造成耗材、人工的严重浪费,也被客户戏称“假单细胞”。图2 大连华微推出的国产单细胞柔性高通量分选分离设备单细胞之柔性分选技术在全球单细胞分选细分领域,大连华微生命科技率先提出“柔性”控制策略。半个世纪以来,单细胞分选技术日新月异,但基于流式技术的分选设备,占据较大比重。而流式技术最被客户诟病的——就是较差的活性!概述而言,下列技术手段对活性生物颗粒,尤其细胞既有不同程度的损害,影响到后续活性实验环节,包括:高压直流电、高压强鞘液或油相、采用高压气流的“气吹”技术、强负压的“抽吸”技术、高压交流电的介电分选技术、采用有毒有害液体试剂、采用施力接触式目标操控、采用过强激光产生“光毒效应”等上述技术,分别从电、液流、化学、光学等方面,对生物颗粒的活性有不同程度的伤害(尤其流式细胞仪,具有高压直流电、高压强鞘液等“双高”特质,尤为明显),除一些比较“坚强”的工程菌、细胞外,多数分选的单体成果,在后续的生殖、扩增、单亲克隆、PCR等活性实验环节中表现较差,甚至无法应用。大连华微在针对单细胞液滴控制中,基于“柔性”控制策略,的制备、检测、柔性分选分离、混匀、切分、定位、滴内再注液等过程环节,不采用高电压直流电场、高压强鞘液,并注重生物颗粒操控过程中的营养物质的供给,实现整个分选即操控过程,生物颗粒的活性影响很小,不影响后续的生殖、扩增等实验环节。单细胞之高通量操控技术一位微流控业内大牛曾言:在针对海洋样本分选分离环节,一切低于秒级的检测技术,都是耍流氓!这句话的严谨性值得商榷,但代表了单细胞分选技术的客户需求——高通量!众所周知,很多时候,我们国产设备与进口设备的最显著差距,就在通量速度这方面。一个反面实例——拉曼单细胞分选,因无需标记在应用中具有很多技术优势,但当前不能广泛应用的原因,就是通量太低,单个细胞的检测,就需要数十秒,甚至数分钟的过程,对于生物样本的海量个体,效率明显力不从心。大连华微为满足不同客户需求,推出系列化高中低档单细胞分选分离设备,单细胞分选具有高通量特质,每秒细胞分选数量范围:数十至数万个,典型应用为:50 drop/s,150drop/s,300drop/s,500drop/s,1000drop/s,2000-20000drop/s等多种规格。单细胞之无标记分选众所周知,针对活性生物颗粒进行荧光标记,是当前生命科学、生物技术等微观个体科研领域的主要手段,但荧光标记本身,对细胞活性、再生性、伦理等方面,产生很多负面影响。业内付诸期望的拉曼检测技术,还需要技术进一步迭代升级,目前因过低的通量,还不能广泛应用。因此,其它高通量的无标记单细胞分选技术,是业内急需。大连华微的专利技术之一:采用独有的无标记高通量单细胞分选技术,针对96/384孔板的单细胞保活性分选,速度可以达到96孔板/5分钟的水平,活性保持95%,单孔单细胞率95%,当前该技术已经获得全球排名前五的世界科仪巨头的认可与合作邀约。该技术已经得到大连市科技局评估、考察、论证,并获得“大连市2021年度重点科研计划项目”立项支持,项目合作伙伴包括多年哈佛医学院科研工作经验的海归教授、三甲医院肿瘤学主治专家等,该技术是大连华微近年来最重视的科研利器之一,前景广阔,未来可期。单细胞之样本多样性兼容大连华微的商业化系列产品,目前可针对尺寸0.1-2000um范围的活性生物颗粒,包括:细胞、细菌、酶、病毒、线虫、细胞团等,进行液滴包裹、捕获、分选、孵育等控制。而切换不同尺寸、种类的样本目标,只需更换一块生物芯片,即可快捷完成。单细胞之实验平台开放性对于科研、教育类客户,基于显微镜平台的全开放式结构设计,方便客户进行各环节的实验观测、功能增加与特定技术环节的DIY实现,如自行增加/更换:激光器、滤光片、光路、高速相机等,或可实现全场景视频、图像记录,可以非常少的成本、经济的实现,并更方便科技文献撰写需求。单细胞之精确数字化分选大连华微的分选技术之一,即逐粒串行检测,也就是针对生物颗粒,单个评估并操控,可以完成千万、数亿甚至更大样本容量中1个特异型(野生型)的鉴别并分选出来。精确数字化,是与“相对”、“概率”等对立的名词术语,因为中国广告法的规定,不能用另一个常用名词。单细胞之液滴混匀单细胞液滴(或多细胞液滴)中,多组分混匀。单细胞液滴之比例切分单细胞液滴(或多细胞液滴),按比例进行分割。单细胞液滴之再注液针对已经生成的单细胞液滴(或多细胞液滴),可按其参数进行特定目标液滴的滴内再次加样、加液,比如细菌分选后裂解液滴注、营养物质补充、后期反应药液加注等场合。单细胞液滴之大规模并行阵列针对海量样本的超高通量单细胞检测、分选需求,大连华微推出的Nx阵列式并行控制方案,检测、分选速度可以高达5亿×N drop/24h,其中N=1,2,4,8,16。。。自然数,为采用测控单元阵列数,理论上无上限。单细胞分选设备之高性价比外国科技界有句广为流传的话:技术,不能让中国人掌握!以进口设备1/2-1/5,进口耗材(芯片)1/5-1/10的价格,可与进口设备媲美的技术,助力中国科学家,挑战世界单细胞领域最前沿科技。综上,大连华微自主研发的单细胞设备,基于多激光技术,采用皮升至微升级液滴(微反应器,下一代生化分析工具),可针对尺寸0.1-2000um范围的活性生物颗粒(细胞、细菌、酶、病毒、线虫、细胞团等),进行单核液滴包裹、高通量绝对检测、柔性分选分离、单体捕获、滴内PCR、器官功能细胞培育等操作,实现单亲克隆、药物筛选、单细胞基因测序、基因编辑、文库制备、酶活筛选、马牛羊雌/雄选育等应用。图3 大连华微推出的:单细胞操控商业化产品及其主要参数基于元器件级别的研发技术,大连华微生命科技,还推出微流控芯片实验室,一站式解决方案(设备、软件、可定制生物/微流控芯片):对目标样本数无要求,保持活性前提,实现单细胞液滴高速制备、检测、柔性分选分离、混匀、切分、定位、滴内再注液等,液滴相互隔离,并可控制融合;生物芯片的片上温控系统,支持单细胞滴内PCR扩增、培养孵育。当然,最近几年,政治开始影响全球高端科技的融合与发展,前沿技术成为某些发达国家制约我国经济发展的手段,中国产业,如何从“卡脖子”的技术壁垒中突围?答案只有一个:自力更生!但生命科学等领域的新技术开发周期长、成本居高不下,企业希望国家能出台更多财政、税收、推广等层面支持,加速高新技术开发。大连华微生命科技有限公司(Dalian Life Huawei Technology Co., Ltd.),作为科技部评定的高新技术企业,已拥有国际先进水平的活性细胞控制技术,全球业内率先提出“单细胞柔性高通量分选(筛选)”概念,并成功研发、应用,获得市场广泛好评。但生命科学还有单细胞无标记柔性分选、高通量拉曼检测、微滴内生化反应等,更多的前沿未解课题,等待我们继续努力,攻坚克难,增强中国民族科技的市场话语权。而影响中国民族工业的核心技术,必须掌握在中国人自己手中!
  • 大连华微推出阵列式单细胞超高通量柔性筛选新品—“HW—TORNADO龙卷风”系列
    p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 大连华微生命科技有限公司(Dalian Life Huawei Technology Co., Ltd.)(以下简称大连华微)在业内率先推出“HW—TORNADO龙卷风”系列单细胞液滴制备、混匀、检测、柔性操控与分选综合控制系统,引起业内客户高度关注。 /p p style=" text-align: center" a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C378571.htm" target=" _blank" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 386px height: 210px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/db3d37f0-9eca-4460-bc35-a293604ec7cf.jpg" title=" 龙卷风 华微.jpg" alt=" 龙卷风 华微.jpg" width=" 386" height=" 210" / /a /p p style=" text-align: center " span style=" text-decoration: underline " strong a href=" https://www.instrument.com.cn/netshow/C378571.htm" target=" _blank" 单细胞分析_分选_滴内注液_龙卷风系列“HW-TORNADO /a (点击查看详情) /strong /span /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " “HW—TORNADO龙卷风”系列产品,全球业内独创的N× 阵列式并行模块单元结构,可积木式定制扩展,针对细胞、细菌、酶、病毒、蛋白、线虫等尺寸在0.1微米至2000微米范围的活性生物颗粒, strong 实现极高的筛选通量 /strong :5亿× N个液滴/日(N=1,2,4,8,16& #8230 选用阵列数,理论上速度无上限);对尺寸在100纳米至2毫米米范围的生物颗粒进行液滴包裹、检测、分析及筛选,可删除空液滴,实现单个液滴仅包含一个细胞、菌、酶(或其它生物颗粒);多频激光(405/488/532/561/638等)可根据用户需求配置,共聚焦实时协同作业,并可实现灵活的更换和快速升级;触摸屏软件,智能识别,实现自动化的操作处理;系统可根据客户需求定制生物芯片, strong 实现液滴检测、混匀,以及无损操控与筛选 /strong 。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 大连华微成立伊始,就定位于世界最前沿科技的研发与生产,其自主研发的“细胞、菌、酶液滴高通量制备、检测及柔性筛选系统”秉持民族品牌,已经发展5个系列数十种型号,成为国内唯一,国际领先的,拥有完全自主知识产权的单细胞液滴自动化控制产品。公司本次重磅推出全球领先的阵列式100%单细胞超高通量柔性筛选系统“HW—TORNADO龙卷风”系列,支持全面广泛的应用及科研需求,涵盖单细胞基因测序、基因编辑、细菌分选、药物筛选、疾病诊断、酶活筛选、基因文库构建等多个重要领域。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/855405f3-eec8-4fee-8d2e-85548ca7b48f.jpg" title=" 龙卷风 大连华微.jpg" alt=" 龙卷风 大连华微.jpg" / /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 近一两年,国内出现很多仿制的实验室DIY型“分选系统”——依靠国外成型的功能组件、电源、信号控制部件搭接而成,智能程度低、可靠性差、误差不可控,分选过程对生物颗粒活性影响不可逆,且操作繁琐。最重要的:如果采购这种DIY型“产品”,一旦其进口电源、主控功率部件出现故障或损坏,DIY供应者无法修复,只有更换,且更换成本极高(至少需要RMB十万元以上,维修周期超过两个月,如西方限制进口则无法继续使用)。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 华微产品源于元器件级别的自主研发,客户众多,质量经过中科院、三甲医院、985高校等高端客户应用及检验,产品可靠性、柔性控制的性能远优于上述DIY型“产品”。华微产品除保修一年外,部件还终身享受成本价格换修(最贵的单个元件更换,不高于前述DIY供应者换修价格的三分之一),维修周期一般不超过一周,自主研发产品不存在受西方限制的核心组件,可大幅节省客户后续使用成本,这是拥有自主核心技术的底气。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " strong 关于大连华微生命科技有限公司 /strong /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 大连华微生命科技有限公司(Dalian Life Huawei Technology Co., Ltd.),国家级高新技术企业,是一家拥有自主知识产权,集研发、生产、销售及服务为一体的微流控系统一站式解决方案供应商。 /p p style=" text-align: justify text-indent: 2em " 大连华微生命科技有限公司,依靠自有专利技术,立足独立研发民族品牌,致力于国际领先的微流体控制科技产品的研发与生产,历经十年的探索磨砺,为中国乃至世界的业内客户带来全新的选择。未来公司将一如既往地重视创新科研,与广大华微客户一起携手进步,共同推动着中国生命科学的发展,做世界细分领域有话语权的中国高科技民族企业。 /p
  • 单细胞分析技术研究呈“井喷”式增长
    学理工的人大概都有这样的感觉,很多规律和现象都可以用理论、公式或算法来描述及推导。只要知道了所有的条件,便能预测结果。反过来,也可以通过现象反推关键的成因。久而久之,我们也习惯并爱上了这样逻辑清晰、条理分明的世界。以至于我们时常因为意外的结果徒然而叹,也为寻找到那孜孜以求的&ldquo 理&rdquo 而欢欣鼓舞。抛开现实里的林林总总,理工男女的生活可以很简单&mdash &mdash 以&ldquo 理&rdquo 立身,有&ldquo 理&rdquo 走遍天下,无&ldquo 理&rdquo 无地容身。这样的准则对某些人来说甚至可以上升到人生哲学的高度&mdash &mdash 直到他们遇上了生物学。   相比数理化,生命科学相当&ldquo 后进&rdquo 。在数理化已经发展到有相当完整的理论体系的今天,生物学,尤其是分子生物学可谓是才刚刚起步。&ldquo 不幸的&rdquo 生物工作者还处于认知的原始积累阶段。我们研究的几乎每一个对象,每一种方法,大概还没有可以宣称已经研究透彻的例子&mdash &mdash 即使对象是简单如病毒这样连生命都算不上的活性大分子。实验不能重复,现象无法解释这样的事在生物实验室里是家常便饭。许多人都遇到过PCR扩增失败,或电泳多出一条带这样的事。多数选择再做一次看看,而不是寻根究底。因为整个系统太复杂、变量太多太多了。      系统的复杂程度太高是一方面,另外一个原因是研究手段的局限(当然还有更多客观原因,非本文主旨所以省略)。微观世界的研究手段的升级依赖于其他科学门类的进步,对手段的依赖必然导致方法论的单调。在分子和细胞生物学领域,许多人习惯用宏观思维去理解微观世界,比如重视群体现象而忽视个体差异,用一群相关的细胞代替一个系统。而对一个复杂的系统用笼统的手段进行研究,得出的结论自然是粗浅的。   虽然没人做过统计,但据估计至少95%以上的现代生物学研究成果是建立在对细胞群体的研究基础上。忽略细胞异质性(Cellular Heterogeneity)的方法固然降低了系统的复杂度,简化了流程。其带来的生物信息不可逆的丢失也是显而易见的。这种平均化的方法必然导致信息的稀释或丢失,在某些情况下甚至会让人得出矛盾的结论。另外,该方法让发现并分离细胞群体中的&ldquo 异类&rdquo 的尝试变得难上加难。如此,只有强信号才有可能被检测到。而这不仅让以往科学家们的努力有了不过是摘取了低处枝条上果实的意味,也让部分成果的准确性打上了问号。   单细胞分析技术正是解决上述问题的方法,其中最引人注目的是单细胞测序技术(Single-Cell Sequencing)。然而,细胞异质的不确定性导致需要同时分析很多单细胞以消除小量样品可能带来的偏差,而这直接和实验可行性挂钩。幸运的是,由于技术的进步和费用的降低,单细胞测序技术近年来已得到迅速推广。通过对单个细胞的逐个测序,信息的精度、深度,以及信息量可获得几何级数的增长,随之带来的是我们对具体对象更加翔实和准确的了解。而且,通过数学方法,高度相关的细胞可以被整合起来当作亚群体处理以部分消除单个细胞的随机异质性,或者按相关性重排以构建全新的不依赖于传统时间轴的图谱。这些新手段已经给我们带来了一些前所未有的认知。那些前沿科学家们所取得的成就,同时也刺激着更多的人加入他们的行列,形成了正反馈。   近年来,单细胞测序逐渐大众化,相关的论文发表数量在2010年后呈指数增长之势,在高品质期刊上发表的单细胞研究成果屡见不鲜。其产生的影响深远,以致Nature Methods将单细胞测序选为2013年度重大技术,并在2014年首刊专述。在后面的文章中我将会挑选几篇有代表性的文章谈谈它们的意义。有意思的是,二代测序技术已经在2007年当选Nature的年度重大技术。单细胞研究的流行无疑让它的使用拓展到了更广阔的领域。   单细胞研究不仅在DNA和RNA测序方面取得了极大的进展,单细胞质谱分析(Mass Cytometry)也正在逐渐得到更多的关注。该技术用带有重金属原子标记的单克隆抗体对细胞表面和细胞内的关键蛋白进行标记,然后依次等离子化细胞,通过质谱分离重金属原子并分析其丰度来获取相应蛋白在各细胞内的表达情况。该技术也叫质谱流式细胞技术,相比荧光流式细胞技术,其主要特点是背景低、通道互扰小,所以可以同时分析更多的蛋白质。如今可用的重金属标记已达35种,这是基于荧光的检测手段无法企及的(最新的荧光流式技术可一次检测16-18种蛋白)。该技术可以一次分析百万量级的单细胞,而且没有理论上限,超出单细胞测序几个数量级。因此可以用来构建非常详细的细胞关联图,尤其适合分析高复杂度的系统,比如血液中的细胞。另一方面,单细胞质谱无法像测序那样对全基因组进行分析,但是由于它是直接对细胞的功能的执行者&mdash &mdash 蛋白质进行解析,跳过了对细胞内各种基因表达调控机制的考量,其意义是非常明显的。   此外,单细胞测序技术让微流控芯片技术(Microfluidics)得到了发展。除了在制备单细胞测序文库方面具有优势以外,该技术在其他领域内的应用也得到了拓展,如在微流控环境中进行细胞培养。该方法可将少数细胞分离到纳升级(nL)的独立单元中分别培养并进行定向引导,然后可以立即利用微流控系统制备测序文库。在干细胞研究以及生物制药领域,该技术应该有着广阔的应用前景。   在单个细胞层面的研究近年来经历了井喷式的增长。然而,其应用主要体现在基础研究中。目前临床上唯一被使用的单细胞检测法是胚胎植入前遗传学诊断(PGD, Preimplantation Genetic Diagnosis)。循环肿瘤细胞(CTCs, Circulating Tumor Cells)虽然在定义上是存在于循环系统中的极少量单个细胞,临床上仍然是先富集然后进行整体分析。对单个CTC进行分析的必要性已有探讨,但开发出相应的技术并在临床上被接受还有一段路要走。
  • 环球公司成功举办单细胞RNA测序和液滴微流控技术交流会
    2011 年,《自然方法》杂志( Nature Methods )将单细胞测序列为年度值得期待的技术之一,2013 年,《科学》杂志(Science)将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,表明单细胞测序已成为科研热点。应广大客户的强烈需求,2017年6月6日-8日,环球分析测试仪器有限公司携手英国Dolomite Bio公司在北京、上海和广州成功举办单细胞RNA测序和液滴微流控技术交流会,会议的主要内容包括:1、液滴微流控技术应用在单细胞研究的优势2、高通量单细胞RNA测序实验中遇到的问题3、B细胞和T细胞、FACS分选等应用介绍4、现场演示Dolomite Bio公司的产品会议现场,Dolomite Bio公司的技术专家Muriel博士演示了单细胞制备的整个实验过程,现场所有客户均被邀请亲自体验了实验过程,客户对实验结果非常满意,并对Dolomite Bio系统通量高、应用灵活、开放的特点给予了极大的肯定。 北京会议现场 客户体验实验 上海会议现场 广州会议现场
  • 多组分时空分析:走进单细胞的“社会”
    p style=" text-indent: 2em " 1952年,美国细胞生物学家威尔逊曾提出,“一切生命的关键问题都要到细胞中去寻找答案。”纵观近50年来荣获诺贝尔奖生理学或医学奖和化学奖的重大突破,70多个都与细胞生物学密切相关。 /p p style=" text-align: center text-indent: 2em " img title=" 20197282317511500.jpg" style=" max-height: 100% max-width: 100% " alt=" 20197282317511500.jpg" src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201907/uepic/8e8f4b00-dde2-40b2-8c13-4213c687f8ec.jpg" / /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " span id=" _baidu_bookmark_start_182" style=" line-height: 0px display: none " ? /span 研究团队进行相关实验 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " 图片来源于网络 /p p style=" text-indent: 2em " 作为研究细胞生命活动规律的科学,细胞生物学在科学家的显微镜下经历了近180年的历史,但细胞对人类来说依然是“黑箱”一般的存在。如今,研究人员正在尽力通过对单个细胞进行研究来阐明细胞的“天性”。 /p p style=" text-indent: 2em " 自2014年起,在国家自然科学基金重大项目“单细胞多组分时空分析”支持下,中国科学家在有关单细胞生物学的重大科学问题上取得了一系列进展。 /p p style=" text-indent: 2em " span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 没有两个细胞是完全相同的 /strong /span /p p style=" text-indent: 2em " 如果把细胞环境比作一个社会,每个细胞就是一个独立的人。 /p p style=" text-indent: 2em " 在对人类社会的研究中,不仅个体的特征和行为值得关注,研究所处环境中个体之间相互协调或对抗作用等关系以及群体所产生的集体行为,也相当重要。细胞研究亦是如此。 /p p style=" text-indent: 2em " 多年来,通过对细胞的研究,科学家已经对生命体的生长发育、遗传变异、认知与行为、进化与适应性等若干生命科学问题有了较为清晰的认识。不过,在清华大学副教授陆跃翔看来,这些还远远不够。 /p p style=" text-indent: 2em " “在之前的研究中,科学家探索出细胞新陈代谢、生命运动过程中的各种表征方法,如蛋白表达分析、基因转录检测(反转录PCR)等,这些方法更多的是在大样本的细胞中进行观察与测量后,得到一个平均结果。”陆跃翔解释到。 /p p style=" text-indent: 2em " 然而,没有两个细胞是完全相同的。这些平均结果掩盖了细胞之间微小的差异,这些差异可能在某些关键生命过程如细胞分化、肿瘤的发展过程中起着决定性作用。 /p p style=" text-indent: 2em " 为了获取细胞生理状态和过程中更准确、更全面的信息,科研人员将目光瞄准单个细胞。 /p p style=" text-indent: 2em " “单细胞内部的生命活动,可以被认为是生物活性分子之间复杂的化学反应的结果,正是这些分子的时空分布、结构、功能及其相互作用方式,决定了细胞增殖、分化、凋亡以及重大疾病发生、发展、迁移等过程。”陆跃翔分析道。 /p p style=" text-indent: 2em " 但是想要研究这些生物活性分子形成的精密复杂的相互作用和调控网络并非易事。它不仅要求科学家了解其化学成分,更要理解它们之间相互作用的复杂过程,以及在细胞内部细胞器中特定位置的作用区域和时空变化。 /p p style=" text-indent: 2em " strong 2014年,国家自然科学基金委员会发布重大项目“单细胞多组分时空分析”申请指南, /strong 清华大学化学系教授张新荣组织的研究团队的申请获批。他们凝练出 strong 荧光探针制备与合成、新型时空分辨成像方法以及在细胞内生物分子相互作用 /strong 研究等关键科学问题。 /p p style=" text-indent: 2em " “我们希望发展建立适于单细胞中多种生物活性分子时空分辨的荧光分析新方法,驱动生命科学和基础与临床医学研究进步。”谈及科学目标,张新荣如是说。 /p p style=" text-indent: 2em " span style=" color: rgb(255, 0, 0) " strong 新技术带你深入了解“社会” /strong /span /p p style=" text-indent: 2em " 如何实现这一目标?在张新荣看来,这需要从单细胞中多组分分子的时空信息获取方法出发。为此,项目组将其分为“荧光探针制备与合成”“新型时空分辨成像方法”以及“细胞内生物分子相互作用”三大方向进行攻关。 /p p style=" text-indent: 2em " strong 要了解细胞这个独特的“社会”,首先需要的是一台可以钻进细胞内部获取关键分子信息的“放大镜”。因此,荧光探针制备与合成至关重要。 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 针对单细胞中极低含量分子检测问题,山东师范大学教授唐波课题组综合运用共轭聚合物信号放大、无光源激发、光谱红移、核酸杂交链式放大等技术,构建了若干超灵敏的分子与纳米荧光探针,实现了细胞及活体中某些活性分子浓度皮摩尔水平的原位、动态检测。 /p p style=" text-indent: 2em " 同时,细胞中生理过程的发生和发展往往不是一类分子的孤立事件,涉及到多种分子的参与。因此课题组还开发了一系列的两组分、三组分和四组分同时检测的荧光探针,并设计了多模态探针来获取更丰富的成像信息。 /p p style=" text-indent: 2em " “本项目的一个重要特色工作是时任中国科学院上海应用物理研究所研究员樊春海课题组基于框架核酸构建的多组分分析探针和成像方法。”张新荣介绍,框架核酸是一类人工设计的结构核酸,具有尺寸精确、结构精确、修饰精确的特点,通过精确的化学修饰,可以将多种小分子及大分子探针负载到框架核酸上,实现多组分探针的可控构建。 /p p style=" text-indent: 2em " 不过,实现探针在亚细胞区域内对胞内生物活性分子的精确定位和实时检测可并不那么容易。 /p p style=" text-indent: 2em " “细胞核内分子密度大且背景荧光特别高,导致人们对单分子的观察非常困难。传统光学显微成像分辨率,不足以解析染色体DNA的构造。”陆跃翔告诉记者,尤其在超高空间分辨率的前提下,要实现持续的动态观察,对荧光探针和成像方法都提出了更大的挑战。 /p p style=" text-indent: 2em " 在活细胞超分辨成像方面,北京大学生物动态光学成像中心研究员孙育杰课题组研发了高性能探针Gmars-Q,使其在光照时进入暗态,从而延长成像时长,比已有最好探针的活细胞超分辨成像时间长一个数量级,这种超高分辨成像技术实现了纳米尺度的活细胞核内动态观测。 /p p style=" text-indent: 2em " “Gmars-Q的独特机制打开了基于蛋白结构和动力学优化荧光蛋白的设计策略。”德国卡尔斯鲁厄理工学院教授Gerd Ulrich Nienhaus曾对此给予高度评价。 /p p style=" text-indent: 2em " strong 在现代分析化学的发展中,大科学装置的应用也越来越受到科学家的重视。 /strong /p p style=" text-indent: 2em " 依托中国科学院高能物理研究所和中国科学院上海应用物理研究所的两台 strong 同步辐射光源, /strong 樊春海课题组和中国科学院高能物理研究所研究员高学云课题组开展了 strong 同步辐射X射线细胞成像方法 /strong 的研究。 /p p style=" text-indent: 2em " 实验团队通过搭建X射线全场三维成像平台,合成了一系列X射线成像探针,发展了细胞成像算法,实现了单细胞的X射线三维成像。为了应对单一技术无法在高分辨率下同时实现细胞的结构与功能定位的挑战,课题组又发展了X射线与超分辨荧光联用技术,实现了在纳米分辨下的细胞结构与功能融合成像的突破。 /p p style=" text-indent: 2em " 已有研究发现DNA不仅有序列信息,还有三维结构信息。基于此,北京大学教授、中国科学院外籍院士谢晓亮课题组通过对sgRNA改造,开发了一种全新的活细胞染色质DNA的多色、稳定标记系统,实现对活细胞内基因位点的长时间连续观察追踪。 /p p style=" text-indent: 2em " 2018年,该重大项目迎来一项重磅突破。谢晓亮课题组在《科学》上发表文章,介绍他们在单细胞水平研究双倍体哺乳动物细胞的基因组结构研究方面取得的成果。利用新发展的Dip-C技术,项目组构建了人源双倍体细胞的具有高空间分辨率的单细胞基因组三维结构。 /p p style=" text-indent: 2em " “这种结构分型对研究细胞功能有着至关重要的作用,也为唐氏综合症等染色体非整倍体疾病提供了研究和干预手段。”谢晓亮说。 /p p style=" text-indent: 2em " strong span style=" color: rgb(255, 0, 0) " 让基础研究走出实验室 /span /strong /p p style=" text-indent: 2em " 对于细胞“社会”的深层解析,不仅为了阐明各种生命现象与本质,科学家更是希望据此对这些现象和规律加以控制和利用,以达到造福人类的目的。在该重大项目支持下,诸多研究展现出了良好的社会应用前景。 /p p style=" text-indent: 2em " “许多疾病的研究和治疗最终都必须回归细胞水平。”在张新荣看来,一系列单细胞多组分时空分析技术能够有效加深人们对生命现象的本质理解,也有助于了解疾病机理,进而促进生物医药科学和相关产业的发展。 /p p style=" text-indent: 2em " strong “项目研发的诊疗一体化功能纳米探针,为相关重大疾病成因、诊断提供表征手段和依据,对疾病的早期预警以及提高疾病治愈率有着重要意义。 /strong ”张新荣讲道,部分创制的探针已经进行了市场转化,基于探针建立的荧光成像技术也成为国家重大新药创制课题中药效评价的关键技术之一。 /p p style=" text-indent: 2em " 例如,唐波课题组研究的“超高灵敏度—可逆探针”能够在活体水平上示踪炎症发生发展过程中超氧阴离子的浓度水平及动态变化过程,缩短了药物临床试验周期,提高了药物筛选效能。为即将进入临床Ⅱ、Ⅲ期的鼻敏胶囊、咳敏胶囊、结肠炎栓3个中药新品种的作用靶点、药效评价研究提供了技术支撑。 /p p style=" text-indent: 2em " 而基于同步辐射装置的X射线细胞显微成像技术,分辨率很容易达到数十纳米,可以在大视场下实现完整细胞的纳米分辨无损成像,与荧光显微装置相比具有巨大优势,在细胞显微成像方面也展现出了巨大的应用前景。 /p p style=" text-indent: 2em " 然而,对于人类来说,走进细胞“社会”是一个任重而道远的过程。还有无数未知的奥秘等着科学家去探索。 /p p style=" text-indent: 2em " 张新荣表示,该重大项目成果为下一步融合多种分析方法、发展全器官跨尺度高灵敏三维成像提供了基础。 /p p style=" text-indent: 2em " “通过研发同步辐射X射线相衬—电镜融合成像,有可能在全脑三维微米精度地图引导下选取局部特征区域进行纳米精度的结构解析,大幅降低高精度神经网络解析的盲目性。在特定位点,也可利用荧光分子成像和质谱分子解析,进一步作功能研究。”项目组成员表示,在有关“社会”的探索与发现之旅上,中国科学家一直砥砺前行。 /p
  • 聚焦单细胞分析自动化|贝克曼库尔特生命科学携手10x Genomics开启合作
    近日,贝克曼库尔特生命科学与10x Genomics公司宣布建立新的合作伙伴关系,以扩展单细胞监测工作流程的自动化解决方案。作为协议的一部分,10x Genomics将开发专用的Chromium Single Cell试剂盒,在贝克曼库尔特生命科学的Biomek i7自动化移液处理工作站上使用。该定制应用程序将实现高质量、大规模的10x Genomics单细胞文库自动化制备,产生可立即用于测序的文库。肿瘤学、免疫学和神经科学等领域正越来越依赖单细胞方法,这些方法可帮助研究人员揭示生物学的复杂性,并推动新的科学发现。随着更大规模的研究需要更广泛的解决方案,文库制备等手动过程的自动化可提高通量。此次合作关系的建立计划在Chromium单细胞系统运行结束后实现工作流程的自动化。合作前期的重点是高通量的文库制备,通过同时处理数十个单细胞样本为实验室提供更简化且更高效的解决方案。贝克曼库尔特生命科学生物技术流程解决方案副总裁兼总经理Elsa Burgess表示:“在贝克曼库尔特生命科学,我们每天都在努力打破手动工作流程的瓶颈,让实验室能够更快实现研究目标,并避开容易出错的步骤。我们很荣幸10x Genomics信任我们,让我们为其客户提供单细胞分析的自动化解决方案,特别是当越来越多的研究人员使用这种方法时。这只是开始,这项令人兴奋的合作最终将惠及多个科学领域的研究人员。”10x Genomics公司的联合创始人、总裁兼首席科学官Ben Hindson表示:“随着研究人员不断使用更多样本进行单细胞分析,他们在寻找新的自动化解决方案,以便高度自信地构建高质量的文库,且手动操作时间更少。我们有些客户已经成功试用了这种方法,我们很高兴能够与贝克曼库尔特生命科学正式合作,开发大规模的自动化产品,开创更大规模的单细胞研究。”作为此次合作的一部分,10x Genomics计划开发一套与自动化兼容的耗材,以便实现高通量的样本处理,并获得经过验证的结果。关于贝克曼库尔特生命科学生命科学、研究、精密制造。如果您一生的使命是在这些或相关领域中的任何一个,您需要了解贝克曼库尔特生命科学公司。它是丹纳赫公司(纽约证券交易所代码:DHR)全球科技家族的一部分。我们的使命是帮助那些寻求生命中重要科学和医疗健康问题答案的人。自 1935 年以来,贝克曼的名字一直是将复杂生物医学检测技术简化和自动化的代名词。几十年后,我们的全球组织也开始体现库尔特科学遗产。今天,贝克曼库尔特生命科学公司是一个值得信赖的全球资源,提供帮助优化研究和制造效率的工具。离心机、颗粒计数器/分析仪、自动化液体处理器、流式细胞仪、基因组试剂。所有这些产品——以及更多产品——通过提高敬业的科学家、质量控制专家和其他人的生产力,进而持续改善人们的生活质量。无论人们在哪里需要答案,从著名的大学和大型制药公司,到初创的小型生物技术公司、食品/饮料和电子制造公司,您都可以找到贝克曼库尔特生命科学。关于 10x Genomics10x Genomics公司致力于提供业界领先的技术,以帮助科学家揭示生物学和疾病的复杂性,提升了解和治疗疾病的方式。通过将创新的微流体技术,试剂和生物信息学相结合,使全球的研究人员能够以前所未有的分辨率和通量加速探索研究,改善人类健康。仅供研究使用 (RUO),不用于诊断过程。
  • 快讯:伯乐收购单细胞分析公司Celsee
    p    strong 仪器信息网讯 /strong Bio-Rad(伯乐)周四表示,已经收购了位于密歇根州安娜堡的Celsee,一家提供用于分离、检测和分析单细胞仪器与消耗品的供应商。 /p p   收购的财务条款没有披露。 /p p   Celsee公司的Genesis系统为科学家提供了一种强大、灵活且可扩展的方式,让他们能够分析和解释细胞行为,并收集以往无法检测的细胞关键信息。此系统可应用在蛋白质组学、免疫监测(替代流式细胞仪)以及新一代测序文库制备。 /p p   Genesis系统采用的是一种专利技术。利用重力和Celsingle& #8482 微量分析玻片,它能够温和地捕获和分离单细胞,同时保持细胞活力和结构完整性,而不用担心微流体或分液装置引起的细胞应激。据介绍,Genesis流程可达到& gt 70%的捕获效率,且灵敏度高于其他的单细胞分析技术,玻片可容纳多达100万个细胞分离微孔。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/5e15c56c-a675-4a0a-8ba6-aac1a4fd4028.jpg" title=" 微信图片_20200410005113_副本.jpg" alt=" 微信图片_20200410005113_副本.jpg" / /p p   Celsee公司目前正卷入10x Genomics的专利诉讼中,后者在美国特拉华州地方法院对Celsee提出专利侵权、不正当竞争、虚假广告及相关索赔。 3月下旬,Celsee提出了答复,并对10x Genomics的第二次修订投诉提出反诉。 /p p   同时,总部位于加利福尼亚州赫拉克勒斯的伯乐也参与涉及10x Genomics的多项专利诉讼。 /p
  • 微生物所开发出新型微滴反应筛选技术及单细胞分析应用
    p style=" text-indent: 2em " 微生物所 strong 微生物资源前期开发国家重点实验室 /strong 杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的 strong 微流控界面纳升注射技术 /strong (Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。 /p p    strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) " 界面纳升注射(INJ)具有诸多显著优势 /span /strong /p p   针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明专利和美国专利,并研制了基于INJ技术的小型桌面系统。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201910/uepic/fe470173-c411-4a4f-857f-952adad6e8d5.jpg" title=" 界面纳升注射(INJ)系统.jpg" alt=" 界面纳升注射(INJ)系统.jpg" / /p p style=" text-align: center " 界面纳升注射(INJ)系统 /p p   该系统和国外同类产品如美国Labcyte公司的Echo超声纳升移液系统、以及美国TTP Labtech公司的mosquito HTS微量筛选系统相比, strong 在仪器成本、耗材成本、最小液滴体积、流式细胞仪兼容性、操作的灵活性、以及污染控制等方面,均具有显著优势, /strong 适用于各类单细胞微体积反应分析,也可应用于其他微体积反应分析,在微生物培养筛选、合成生物学、药物筛选、蛋白结晶条件筛选等方面均具有应用潜力。 /p p   在性能方面,INJ系统通过高精密度的微体积控制实现不同试剂组分的纳升体积分步添加,兼容96和384孔板,可以在预先填装矿物油的孔板上,按照程序设定加入纳升样品或试剂液滴,用于实现高通量筛选。利用低成本探针可以精确加注的最小体积达到1 nL,当加样体积为5 nL时,体积标准偏差小于11 %。加注的液滴通过离心可以沉降到孔板底部并融合,液滴的融合效率最高,达到99%以上。利用多次加注样品、试剂的方法,可以实现多步反应和浓度梯度配置。系统加注的体积精确性、线性和重现性良好。 /p p   strong span style=" color: rgb(0, 112, 192) "  FACS-INJ单细胞分析流程和应用 /span /strong /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 281px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201910/uepic/7cc806a5-55aa-475f-a110-69b3c5038b70.jpg" title=" 杜文斌-流式细胞分选+界面纳升注射技术图示.jpg" alt=" 杜文斌-流式细胞分选+界面纳升注射技术图示.jpg" width=" 600" height=" 281" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " span style=" text-align: center " FACS-INJ单细胞分选分析流程 /span /p p    strong 单细胞分析是一项变革性技术 /strong ,在单细胞基因组异质性研究及复杂微生物群落中稀有微生物种群多样性研究等领域应用广泛。然而,如何进一步降低单细胞分析的成本,提高可靠性和效率,仍然面临重大挑战。流式细胞荧光激活细胞分选(FACS)是目前最高效的单细胞分选技术,可实现病毒、细菌、真菌和动物细胞的多参数检测和分选 利用荧光标记,可对不同类型的细胞进行有效的区分,分选成功率高。研究团队将INJ与FACS平台相结合,建立了FACS-INJ单细胞分选分析流程,应用覆盖了单细胞表型分析、基因型分析、基因表达分析以及全基因组扩增测序。 /p p   研究团队首先利用FACS-INJ系统实现了 strong 病原菌微生物单细胞耐药基因的PCR筛查和单细胞药敏表型筛查 /strong 。经优化,多孔板可预先装载纳升体积的PCR引物或不同浓度的抗生素液滴。PCR筛查体积缩小到500 nL,试剂消耗和成本和常规体系相比降低至原先的1/40,耐药检测的体积控制在200 nL,试剂消耗和成本和常规体系相比降低至原先的1/1000,时间从& gt 12小时缩短至5小时,这对于大幅降低临床病原检测的成本,实现脑脊液、房水等难获取微量样品的耐药基因和表型筛查具有重要意义。 /p p   其次,FACS-INJ系统还可用于 strong 动物细胞的单细胞基因表达分析 /strong 。以小鼠巨噬细胞RAW264.7在细菌胞外多糖处理前后的炎症反应为例,通过荧光激活流单细胞式分选处理前后的小鼠巨噬细胞,基于一步法反转录实时荧光PCR扩增,在单细胞水平解析了次黄嘌呤鸟嘌呤转磷酸核糖基酶(HPRT)基因(看家基因)和白介素1β(IL-1β)基因(炎症反应)表达水平的变化。 /p p   最后,团队与北京大学黄岩谊课题组合作,建立了 strong 基于FACS-INJ的微生物全基因组扩增测序流程 /strong ,以获得未培养微生物的全基因组信息。流程包括流式分选微生物单细胞、单细胞裂解、酸碱中和、MDA扩增和建库测序。以热泉来源的古菌硫化叶菌(Sulfolobus sp. A20)菌株为模型,将单细胞扩增的体积优化至360nL,硫化叶菌全基因组覆盖度达到80%以上。在纳升级微液滴中实现西南印度洋未培养单细胞微生物全基因组DNA的MDA扩增与测序,拼接后获得15个单细胞基因组,大小在0.1~3.7Mb大小。该方法获得的微生物基因组污染度较传统的MDA扩增方法显著降低(& lt 5%),显著提高了微生物单细胞基因组数据质量。平台也适用于肿瘤、胚胎等动物细胞的全基因组扩增测序,对肿瘤细胞的单细胞测序的覆盖度达到60-80%。 /p p   上述研究工作近期作为特邀论文在线发表在Small上。微生物研究所助理研究员贠娟莉博士、郑小伟博士、徐鹏博士为论文共同第一作者,杜文斌研究员、黄力研究员和北京大学黄岩谊教授为论文共同通讯作者。该研究该研究得到了中国大洋协会大洋十三五重点项目、中科院战略性先导科技专项(B类),中国科学院重点部署项目、中国科学院前沿科学重点研究项目、国家自然科学基金面上项目和优青项目等支持。 /p p   论文出处: /p p   Yun, J.L. sup # /sup Zheng, X.W. sup # /sup Xu. P. sup # /sup Zheng, X. Xu, J.Y. Cao, C. Fu, Y.S. Xu, B.X. Dai, X. Wang, Y. Liu, H.T. Yi, Q.L. Zhu, Y.X. Wang, J. Wang, L. Dong, Z.Y. Huang, L.* Huang, Y.Y.* Du, W.B.* Interfacial Nanoinjection-based Nanoliter Single-cell Analysis, Small, 2019, doi:10.1002/smll.201903739. /p p    a href=" https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/smll.201903739" target=" _self" style=" text-decoration: underline font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) " strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) " 查看原文戳这里 /span /strong /a /p p    strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " 杜文斌 /span /strong span style=" font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai " ,男,中科院微生物研究所研究员。2007年于浙江大学化学系,获博士学位。2007-2011年于美国芝加哥大学化学系从事博士后研究工作。2013年11月加入中科院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室。主要从事微流控芯片技术及新型分析微生物技术与应用研究。已发表论文60余篇,申请中国和美国专利30余项,授权20多项。主持国家优秀青年科学基金项目,国家重点研发计划 “数字诊疗装备研发”项目,中国科学院前沿科学重点研究项目等。 /span /p
  • 河南省儿童医院郑州儿童医院1256.90万元采购流式细胞仪,单细胞分析仪,液氮罐
    html, body { -webkit-user-select: text } * { padding: 0 margin: 0 } .web-box { width: 100% text-align: center } .wenshang { margin: 0 auto width: 80% text-align: center padding: 20px 10px 0 10px } .wenshang h2 { display: block color: #900 text-align: center padding-bottom: 10px border-bottom: 1px dashed #ccc font-size: 16px } .site a { text-decoration: none } .content-box { text-align: left margin: 0 auto width: 80% margin-top: 25px text-indent: 2em font-size: 14px line-height: 25px } .biaoge { margin: 0 auto /* width: 643px */ width: 100% margin-top: 25px } .table_content { border-top: 1px solid #e0e0e0 border-left: 1px solid #e0e0e0 font-family: Arial /* width: 643px */ width: 100% margin-top: 10px margin-left: 15px } .table_content tr td { line-height: 29px } .table_content .bg { background-color: #f6f6f6 } .table_content tr td { border-right: 1px solid #e0e0e0 border-bottom: 1px solid #e0e0e0 } .table-left { text-align: left padding-left: 20px } 详细信息 河南省儿童医院郑州儿童医院2022年第三批科研设备采购项目-公开招标公告 河南省-郑州市-金水区 状态:公告 更新时间: 2022-10-20 中小微企业融资申请 项目概况 河南省儿童医院郑州儿童医院2022年第三批科研设备采购项目招标项目的潜在投标人应在“郑州市公共资源交易中心电子交易平台(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/TPBidder/)”,凭企业CA数字证书直接下载招标文件。尚未办理企业CA数字证书的,请登录郑州市公共资源交易中心网站(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/),查阅网站首页“通知公告”或“CA及签章办理流程”中《关于数字证书(CA)互认功能上线试运行的通知》(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/tzgg/20200612/9db87633-2aec-4d6f-b692-a167ec8c11d6.html),及时办理CA数字证书及电子签章,并完成市场主体库相关信息。获取招标文件,并于2022年11月11日10时00分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 1、项目编号:郑财招标采购-2022-322 2、项目名称:河南省儿童医院郑州儿童医院2022年第三批科研设备采购项目 3、采购方式:公开招标 4、预算金额:12,569,000.00元 最高限价:12569000元序号 包号 包名称 包预算(元) 包最高限价(元) 1 A包 单细胞蛋白质表达定量分析系统 1573000 1573000 2 B包 智能细胞制备系统 1040000 1040000 3 C包 质谱流式技术 6520000 6520000 4 D包 全自动磁性细胞分选仪 1000000 1000000 5 E包 高分辨率细胞能量代谢分析系统(含荧光检测系统) 1320000 1320000 6 F包 气相液氮罐 1116000 1116000 5、采购需求(包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等) 5.1项目简要说明:河南省儿童医院郑州儿童医院2022年第三批科研设备采购项目,详见第五章技术标准及要求。5.2包段划分:本项目共划分六个标段。5.3交货期:合同签订后90日历天内;5.4质保期:3年;5.5质量要求:合格。 6、合同履行期限:同交货期7、本项目是否接受联合体投标:否 8、是否接受进口产品:是 9、是否专门面向中小企业:否 二、申请人资格要求: 1、满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定;2、落实政府采购政策满足的资格要求: 本项目执行节约能源、保护环境、扶持不发达地区和少数民族地区、促进中小微企业发展、支持监狱企业、促进残疾人就业等相关政府采购政策。 3、本项目的特定资格要求 3.1、投标货物符合中华人民共和国国务院令第 650 号《医疗器械监督管理条例》及中华人民共 和国国务院令第 680 号《国务院关于修改《医疗器械监督管理条例》的决定》相关规定,取得医疗器械注册证或医疗器械产品相关备案凭证(如有)。3.2、国内产品的制造商须具有医疗器械生产许可证(如有);代理商(经销商)须具有医疗器械经营许可证或医疗器械经营备案凭证(如有)。3.3、根据《关于在政府采购活动中查询及使用信用记录有关问题的通知》(财库[2016]125号) 和豫财购[2016]15号的规定,对列入失信被执行人、税收违法黑名单(重大税收违法失信主体)、政府采购严重违法失信行为记录名单的企业,拒绝参与本项目政府采购活动(查询渠道:“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)查询:列入失信被执行人、税收违法黑名单(重大税收违法失信主体)、中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn):政府采购严重违法失信行为记录名单)注:采购代理机构在开标当天将对所有参与本项目投标的供应商的信用情况(失信被执行人、税收违法黑名单(重大税收违法失信主体)、政府采购严重违法失信行为记录名单)进行查询、打印留存。若在开标当天查询到供应商有相关负面信息的,则该供应商为无效供应商。3.4、单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下同一标段的政府采购活动【 开标当天,代理机构通过“ 国家企业信用信息公示系统” (www.gsxt.gov.cn/corp-query-homepage.html)查询股东信息】。3.5、本项目不接受联合体投标。 三、获取招标文件 1.时间:2022年10月21日 至 2022年10月27日,每天上午00:00至12:00,下午12:00至23:59(北京时间,法定节假日除外。) 2.地点:“郑州市公共资源交易中心电子交易平台(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/TPBidder/)”,凭企业CA数字证书直接下载招标文件。尚未办理企业CA数字证书的,请登录郑州市公共资源交易中心网站(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/),查阅网站首页“通知公告”或“CA及签章办理流程”中《关于数字证书(CA)互认功能上线试运行的通知》(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/tzgg/20200612/9db87633-2aec-4d6f-b692-a167ec8c11d6.html),及时办理CA数字证书及电子签章,并完成市场主体库相关信息。 3.方式:供应商凭CA密钥登录“郑州市公共资源交易中心网”点击“交易主体登录”下载所含格式(*.ZZZF)的采购文件及资料。 4.售价:0元 四、投标截止时间及地点 1.时间:2022年11月11日10时00分(北京时间) 2.地点:郑州市公共资源交易中心电子交易平台(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/TPBidder/)加密上传;供应商无需到交易中心现场参加开标会议,评标委员会不再对投标文件中涉及的相关资料原件进行验证。所有投标单位不需提供证书原件 五、开标时间及地点 1.时间:2022年11月11日10时00分(北京时间) 2.地点:郑州市公共资源交易中心门户网站远程开标大厅(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/BidOpening)。 六、发布公告的媒介及招标公告期限 本次招标公告在《河南省政府采购网》、《郑州市政府采购网》、《郑州市公共资源交易中心网》、《中国招标投标公共服务平台》、《河南省电子招标投标公共服务平台》上发布, 招标公告期限为五个工作日 。 七、其他补充事宜 备注:1)所有供应商应提前30分钟,登录“郑州市公共资源交易中心门户网站远程开标大厅”进行远程开标准备工作。登录后,须先进行签到,其后应一直保持在线状态,保证能准时参加开标大会、投标文件的解密、现场答疑澄清等活动。2)投标人应认真学习郑州市公共资源交易中心通知公告栏发布的《郑州市公共资源交易中心关于不见面开标大厅系统升级的通知》(网址:http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/tzgg/20220311/cfa4db9c-75b0-493b-9f21-be25cf2c6a8d.html),根据手册及郑州市公共资源交易中心发布的相关补充通知要求做好不见面开标的准备工作,并按要求设置参与不见面开标的电脑环境,否则由此可能引起的、解密失败或无法解密等问题由投标人自行承担。3)、是否接受进口产品:智能细胞制备系统不接受进口产品;其余设备接受进口产品 八、凡对本次招标提出询问,请按照以下方式联系 1. 采购人信息 名称:河南省儿童医院郑州儿童医院 地址:郑州市金水区郑东新区农业东路与龙湖外环东路交叉口 联系人:刘刚 联系方式:0371-85515732 2.采购代理机构信息(如有) 名称:河南省机电设备国际招标有限公司 地址:河南省郑州市东明路187号金成大厦B座10层招标一部 联系人:王富祯 李金泽 联系方式:0371-65528803 3.项目联系方式 项目联系人:王富祯 李金泽 联系方式:0371-65528803 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 $('.clickModel').click(function () { $('.modelDiv').show() }) $('.closeModel').click(function () { $('.modelDiv').hide() }) 基本信息 关键内容:流式细胞仪,单细胞分析仪,液氮罐 开标时间:2022-11-11 10:00 预算金额:1256.90万元 采购单位:河南省儿童医院郑州儿童医院 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:河南省机电设备国际招标有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 河南省儿童医院郑州儿童医院2022年第三批科研设备采购项目-公开招标公告 河南省-郑州市-金水区 状态:公告 更新时间: 2022-10-20 中小微企业融资申请 项目概况 河南省儿童医院郑州儿童医院2022年第三批科研设备采购项目招标项目的潜在投标人应在“郑州市公共资源交易中心电子交易平台(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/TPBidder/)”,凭企业CA数字证书直接下载招标文件。尚未办理企业CA数字证书的,请登录郑州市公共资源交易中心网站(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/),查阅网站首页“通知公告”或“CA及签章办理流程”中《关于数字证书(CA)互认功能上线试运行的通知》(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/tzgg/20200612/9db87633-2aec-4d6f-b692-a167ec8c11d6.html),及时办理CA数字证书及电子签章,并完成市场主体库相关信息。获取招标文件,并于2022年11月11日10时00分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 1、项目编号:郑财招标采购-2022-322 2、项目名称:河南省儿童医院郑州儿童医院2022年第三批科研设备采购项目 3、采购方式:公开招标 4、预算金额:12,569,000.00元 最高限价:12569000元 序号 包号 包名称 包预算(元) 包最高限价(元) 1 A包 单细胞蛋白质表达定量分析系统 1573000 1573000 2 B包 智能细胞制备系统 1040000 1040000 3 C包 质谱流式技术 6520000 6520000 4 D包 全自动磁性细胞分选仪 1000000 1000000 5 E包 高分辨率细胞能量代谢分析系统(含荧光检测系统) 1320000 1320000 6 F包 气相液氮罐 1116000 1116000 5、采购需求(包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等) 5.1项目简要说明:河南省儿童医院郑州儿童医院2022年第三批科研设备采购项目,详见第五章技术标准及要求。5.2包段划分:本项目共划分六个标段。5.3交货期:合同签订后90日历天内;5.4质保期:3年;5.5质量要求:合格。 6、合同履行期限:同交货期 7、本项目是否接受联合体投标:否 8、是否接受进口产品:是 9、是否专门面向中小企业:否 二、申请人资格要求: 1、满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2、落实政府采购政策满足的资格要求: 本项目执行节约能源、保护环境、扶持不发达地区和少数民族地区、促进中小微企业发展、支持监狱企业、促进残疾人就业等相关政府采购政策。 3、本项目的特定资格要求 3.1、投标货物符合中华人民共和国国务院令第 650 号《医疗器械监督管理条例》及中华人民共 和国国务院令第 680 号《国务院关于修改《医疗器械监督管理条例》的决定》相关规定,取得医疗器械注册证或医疗器械产品相关备案凭证(如有)。3.2、国内产品的制造商须具有医疗器械生产许可证(如有);代理商(经销商)须具有医疗器械经营许可证或医疗器械经营备案凭证(如有)。3.3、根据《关于在政府采购活动中查询及使用信用记录有关问题的通知》(财库[2016]125号) 和豫财购[2016]15号的规定,对列入失信被执行人、税收违法黑名单(重大税收违法失信主体)、政府采购严重违法失信行为记录名单的企业,拒绝参与本项目政府采购活动(查询渠道:“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)查询:列入失信被执行人、税收违法黑名单(重大税收违法失信主体)、中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn):政府采购严重违法失信行为记录名单)注:采购代理机构在开标当天将对所有参与本项目投标的供应商的信用情况(失信被执行人、税收违法黑名单(重大税收违法失信主体)、政府采购严重违法失信行为记录名单)进行查询、打印留存。若在开标当天查询到供应商有相关负面信息的,则该供应商为无效供应商。3.4、单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下同一标段的政府采购活动【 开标当天,代理机构通过“ 国家企业信用信息公示系统” (www.gsxt.gov.cn/corp-query-homepage.html)查询股东信息】。3.5、本项目不接受联合体投标。 三、获取招标文件 1.时间:2022年10月21日 至 2022年10月27日,每天上午00:00至12:00,下午12:00至23:59(北京时间,法定节假日除外。) 2.地点:“郑州市公共资源交易中心电子交易平台(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/TPBidder/)”,凭企业CA数字证书直接下载招标文件。尚未办理企业CA数字证书的,请登录郑州市公共资源交易中心网站(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/),查阅网站首页“通知公告”或“CA及签章办理流程”中《关于数字证书(CA)互认功能上线试运行的通知》(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/tzgg/20200612/9db87633-2aec-4d6f-b692-a167ec8c11d6.html),及时办理CA数字证书及电子签章,并完成市场主体库相关信息。 3.方式:供应商凭CA密钥登录“郑州市公共资源交易中心网”点击“交易主体登录”下载所含格式(*.ZZZF)的采购文件及资料。 4.售价:0元 四、投标截止时间及地点 1.时间:2022年11月11日10时00分(北京时间) 2.地点:郑州市公共资源交易中心电子交易平台(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/TPBidder/)加密上传;供应商无需到交易中心现场参加开标会议,评标委员会不再对投标文件中涉及的相关资料原件进行验证。所有投标单位不需提供证书原件 五、开标时间及地点 1.时间:2022年11月11日10时00分(北京时间) 2.地点:郑州市公共资源交易中心门户网站远程开标大厅(http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/BidOpening)。 六、发布公告的媒介及招标公告期限 本次招标公告在《河南省政府采购网》、《郑州市政府采购网》、《郑州市公共资源交易中心网》、《中国招标投标公共服务平台》、《河南省电子招标投标公共服务平台》上发布, 招标公告期限为五个工作日 。 七、其他补充事宜 备注:1)所有供应商应提前30分钟,登录“郑州市公共资源交易中心门户网站远程开标大厅”进行远程开标准备工作。登录后,须先进行签到,其后应一直保持在线状态,保证能准时参加开标大会、投标文件的解密、现场答疑澄清等活动。2)投标人应认真学习郑州市公共资源交易中心通知公告栏发布的《郑州市公共资源交易中心关于不见面开标大厅系统升级的通知》(网址:http://zzggzy.zhengzhou.gov.cn/tzgg/20220311/cfa4db9c-75b0-493b-9f21-be25cf2c6a8d.html),根据手册及郑州市公共资源交易中心发布的相关补充通知要求做好不见面开标的准备工作,并按要求设置参与不见面开标的电脑环境,否则由此可能引起的、解密失败或无法解密等问题由投标人自行承担。3)、是否接受进口产品:智能细胞制备系统不接受进口产品;其余设备接受进口产品 八、凡对本次招标提出询问,请按照以下方式联系 1. 采购人信息 名称:河南省儿童医院郑州儿童医院 地址:郑州市金水区郑东新区农业东路与龙湖外环东路交叉口 联系人:刘刚 联系方式:0371-85515732 2.采购代理机构信息(如有) 名称:河南省机电设备国际招标有限公司 地址:河南省郑州市东明路187号金成大厦B座10层招标一部 联系人:王富祯 李金泽 联系方式:0371-65528803 3.项目联系方式 项目联系人:王富祯 李金泽 联系方式:0371-65528803
  • ACS Editors’ Choice:单细胞质谱分析
    近日,清华大学欧阳证教授课题组在analytical chemistry上发表了single-cell mass spectrometry analysis of metabolites facilitated by cell electro-migration and electroporation,且以acs editors' choice形式亮点报道。 文章介绍了基于细胞电迁移-电穿孔的单细胞质谱分析方法,该方法无需细胞高精度操控平台,仅通过对单细胞施加一定序列的电压,即可实现对单个酵母等具有细胞壁的细胞内代谢物的可控释放与质谱分析。 acs美国化学会报道: acs 编辑良择 | 基于细胞电迁移-电穿孔的单细胞质谱分析方法通讯作者:欧阳证,清华大学作者:zishuai li (李自帅),zhengmao wang (王正茂),junmin pan (潘俊敏),xiaoxiao ma (马潇潇),wenpeng zhang (张文鹏),zheng ouyang (欧阳证) 单细胞分析对研究细胞在转录组学、蛋白组学以及代谢组学等方面的异质性有着重要的意义。目前,科学家们开发了大量的单细胞分析方法和技术,例如荧光分析法、微流控芯片、流式细胞仪、单细胞测序等。质谱分析,因其低样品消耗量、高灵敏度、高定量准确性等优势,已经被广泛应用于单细胞蛋白组学、脂质组学和代谢组学分析中。然而,目前大部分的单细胞质谱分析方法,都需要依托于高精度操作平台,这给单细胞分析技术的应用带来了一定的挑战。 清华大学欧阳证教授课题组报道了一种基于细胞电迁移-电穿孔的单细胞质谱分析方法。该方法无需细胞高精度操控平台,仅通过对单细胞施加一定序列的电压,即可实现对单个酵母等具有细胞壁的细胞内代谢物的可控释放与质谱分析。如图1所示,在硼玻璃纳喷管中加入适当体积(约0.5 μl)的细胞悬浮液(约104细胞/ml),该溶液内平均只含有单个细胞。由于细胞表面通常带负电,通过非接触式电极对溶液施加直流负电压,使细胞迁移到纳喷管尖端,并在针尖处封闭一段超小体积(约1.5 pl)的液体。之后施加高压脉冲电压,在细胞膜表面形成电穿孔,细胞内代谢物即释放到前端的超小体积液体中,从而避免了细胞内代谢物的过度稀释。最后,采用非接触式电极加压,由纳升电喷雾离子化将该部分溶液离子化并进行质谱分析。图1. 基于细胞电迁移-电穿孔的单细胞质谱分析方法 该研究中,首先用酵母细胞进行了方法验证。如图2所示,从离子流热图中可以看出,施加脉冲电压后,在质荷比m/z 50到800的范围内出现了大量的代谢物离子信号。图2b-c中比较了施加脉冲电压前后的单细胞分析质谱图。通过精确质量对比、串级质谱分析等方法,该课题组在单个酵母细胞内检测到了71种代谢物。图3a-f展示了几种典型代谢物的串级质谱谱图。 图2. (a)质谱离子流热图。在5 s时刻施加了高压脉冲电压。(b)负离子模式。(c)正离子模式。 图3. 负离子模式下单酵母菌代谢产物典型的串级质谱谱图 (a) glu, (b) gsh, (c) amp, (d) adp, (e)atp, (f) udp-hex. 除了酵母细胞,该方法还可用于其他种类的具有细胞壁结构的单细胞菌类的高灵敏度质谱分析。图4展示了莱茵衣藻(chlamydomonas reinhardtti)、杜氏盐藻(dunaliella salina)、斜生栅藻(scenedesmus obliquus)、绿眼虫(euglena viridis)的单细胞分析质谱图。图4. 不同种类细胞的单细胞质谱谱图。从内向外依次为:莱茵衣藻,杜氏盐藻,斜生栅藻,绿眼虫。 此外,该课题组还研究了不同培养环境下,单个细胞内代谢物相对含量的变化情况。将两组莱茵衣藻细胞,分别在有/无光照条件下培养24小时,之后采用本方法进行单细胞内代谢物的质谱分析。单细胞质谱分析表明,在黑暗条件下,衣藻细胞内的卡尔文循环内的碳固定被终止,细胞内有氧呼吸强度下降,糖酵解代谢增强。此时,细胞的光合作用停止,细胞通过糖酵解分解糖类以提供基本的代谢需求,同时降低有氧呼吸强度以维持生存。图5. 黑暗条件下的莱茵衣藻单细胞内部分代谢物强度比值变化。 本研究的相关结果已发表在analytical chemistry,并以acs editors' choice形式亮点报道。该论文得到了国家自然科学基金项目的支持。 文章链接:https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.analchem.0c02147
  • 3D细胞培养分析技术微孔板制备的新视角
    阿斯利康中国创新研究中心(ICC)的科学家们开发了一项新技术,利用Tecan 全自动液体处理工作站Freedom EVO® 进行细胞培养微孔板自动化温控制备,进而完成药物候选化合物筛选。该研究团队在BD Matrigel&trade 加样前使用琼脂预涂微孔板,从而顺利地在96孔微孔板上实现3D细胞培养分析。 中国创新研究中心(ICC)是阿斯利康在中国上海张江高科技园区投建的研发基地。该中心于2007年正式投入使用,专注于调查研究影响亚洲人口健康的各类疾病,其中包括:胃癌、肝癌以及肺癌。该中心采用国际一流的先进技术解析这些癌症的遗传机理,并在临床上识别及确证相关的生物标记物和药物靶标。 由Yi Gu博士带领的细胞科学研究部门正在对这些疾病开展一项药物研究项目,希望通过筛选多种化合物来确定候选药物。3D细胞检测分析是该项目组基于采用BD Matrigel (BD Biosciences)作为细胞培养底物进行的二次药筛技术其中的一种。Matrigel是从EHS (Engelbreth-Holm-Swarm)小鼠肉瘤的可溶性基底膜抽提得到的细胞外蛋白凝胶复合物,能够诱导克隆细胞在标准细胞培养基表面通过不同方式生长(图1)。这些非均相构成诱发了克隆体的形成,非常适用于研究肿瘤细胞之间的粘附、生长、迁移及转移。由于克隆细胞很好地模仿了人体组织的生长与成型过程,因此研究人员能够在药筛最初期识别正确的化合物。 手工制板存在着明显的两个缺陷:容易出错且耗费时间,而通过使用全自动液体处理工作站Freedom EVO来提高检测通量并改善结果的一致性,无疑是最好的解决方案。这一自动化平台早已成熟应用于化合物梯度稀释和其他大量细胞检测实验中,可以在保持原有应用的基础上快速且低成本地修改应用程序。 ICC资深自动化科学家William Shi解释说:&ldquo 历来此类3D细胞检测都是在6孔板上进行的,由于样本需求量大且Matrigel底物处理比较复杂,因此手工制板十分困难。并且,这种6孔板型无法与大量试剂需求和大批量化合物筛选工作相匹配,因此我们开始着手不断寻找高性价比的方法。另一点很重要的是,Matrigel的异质组分具有较大表面张力且在微孔内分布不均,其低剂量加样非常困难,因此分析6孔板上的实验结果已经极其困难,更别提在96孔板内检测分析了。为了解决这一问题,我们先在微孔板上预涂一层薄薄的琼脂,然后再进行Matrigel加样。这种方法虽然解决了Matrigel的表面张力问题,却带来了如何平衡在50℃以下琼脂凝固与4℃以上Matrigel过度粘稠这两种物质的复杂加样问题。&rdquo 后来我们选用了全自动化液体处理工作站Freedom EVO,其中选配了多个温控载架,使得盛装琼脂和Matrigel的液槽一直保持适宜的温度,非常便于加样。整个加样过程都是由自动化系统的液体处理机械臂(LiHa)上的单通道完成,通过多次洗液注液循环实现预热或预冷,避免加样针堵塞。加样初期通过机械臂的多次注液将预热琼脂(55℃左右)加入提前预热的96孔板内,这样可以将琼脂冷却的可能性降到最低点,从而减少琼脂的用量,降低实验成本。随后,微孔板在载板架上经室温冷却15-20分钟,使得琼脂在加入Matrigel前得以凝固。 采用这种解决方案后,能在短短90分钟内完成6块微孔板的加样制备,而传统手工处理一天仅能完成3-4块微孔板的加样,两者形成鲜明对比。制备好的微孔板质量在使用自动化加样技术后也有了很大提升,避免了人工制板常出现的批对批、板对板、甚至孔对孔的误差问题。William总结道:&ldquo 这种高度一致性对药物筛选来说至关重要,高质量的实验结果数据有助于我们加快药物研发进程,Freedom EVO自动化平台独具的灵活性使得这一切能够轻松实现!&rdquo 更多关于Tecan Freedom EVO液体处理工作站的信息请访问以下网站或询问当地Tecan员工/经销商:www.tecan.com/freedomevo 更多关于阿斯利康中国创新研究中心的信息,请访问以下网站:en.astrazeneca.com.cn BD和Matrigel是美国BD公司(Becton, Dickinson and Company)的注册商标。 Corining是美国康宁公司(Corining)的注册商标。 关于帝肯: 瑞士帝肯www.tecan.com是全球领先的生命科学与生物制药、法医和临床诊断领域自动化及解决方案供应商。公司成立于1980年,总部设在瑞士Mä nnedorf,分别在瑞士、北美和奥地利设有自己的研发和生产基地,目前公司主要经营的产品有三大类:全自动化液体处理平台( Liquid Handling&Robotics )、多功能酶标仪(Multimode Reader)和OEM组件;销售服务网络遍布世界52个国家,客户覆盖制药企业、生物技术公司、科研院所、法医、医院、血站系统和疾病控制中心(CDC)等。其液体处理技术已拥有行业经验30年,在全球处于领先地位,备受世界领先生命科学实验室的青睐。 帝肯(上海)贸易有限公司是瑞士帝肯集团公司亚太区总部,2008年4月成立于上海浦东。帝肯(上海)目前拥有一支专业的售前和售后服务团队,在科研、医院、血站和CDC领域构建了良好的经销网络,并以&ldquo 力求比客户期望做得更好&rdquo 的服务理念,给广大终端用户提供专业的服务。 欲知更多详情,请联系帝肯上海 市场部:Libby Zhu Tel: 021 2206 3206 / 010 8511 7823 Fax: 021 2206 5260 / 010 8511 8461 helpdesk-cn@tecan.com www.tecan.com
  • 单细胞分析的丝滑IMAX体验: icpTOF 以多元素指纹量化海藻细胞与纳米颗粒间相互作用为例
    Hendriks L., Skjolding L. M., Robert T., 确定细胞中金属元素的生物利用率的传统方法一般需对细胞进行酸消解,然后利用溶液进样电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)进行后续分析。这种方法的缺点是需要大量的细胞,并且只能为给定的细胞群体提供平均值1。众所周知,千人千面,不同群体以及同群体细胞的特异性在文献中也多有报道2。基于这个大前提,使用特定的分析方法对不同群或同群细胞进行逐序单个分析,获取与单个细胞特异性有关的大数据就尤其重要(见图1)。本文中介绍的单细胞-电感耦合等离子体质谱法(sc-ICP-MS)与之前介绍过的单颗粒ICP-MS(sp-ICP-MS)基本类似(微信公共号:粒粒皆信息:什么是单颗粒物ICP-MS质谱分析法?)。事实上,上述两种技术都依赖于相同的基本原理和icpTOF瞬时事件全谱多元素测量能力,从而可以获得由单一个体产生的微秒时间区间内的瞬时信号,例如单个纳米颗粒(NPs)或单个细胞。(译者注:这等同在拍一段有很多快速武术对打的电影场景,需要使用高速摄像机来捕捉每一个武打动作细节和变化,同时也不漏过颜色,声音等关键信息,这样才能最终呈现出高清120Hz的作品。) 单颗粒ICP-MS方法的基础概念和硬件构架3源于2003年Degueldre等发表的第一篇论文。在过去的二十年间,通过进样系统,数据采集硬件和数据处理专用软件的进一步发展和商业化,不断增加的科研文献见证了该技术领域的迅速成熟。在单颗粒ICP-MS上投入的研究和应用开发同样的也使单细胞ICP-MS分析受益。 在单细胞ICP-MS中,细胞悬浮液经超声波雾化后形成的液滴被带入ICP-MS等离子体中。细胞在等离子体中依次被汽化、原子化和最终离子化。每个细胞产生一个含有多种元素的离子云,在仪器上被检测为高于背景的时长几百微秒的单个信号峰。与单颗粒ICP-MS类似,记录到的尖峰频率与细胞数量浓度成正比,这些尖峰的强度则与细胞中该元素质量有关。这种技术已经成功的应用在测定海藻中的镁元素含量4,并进一步用于纳米颗粒物毒理学研究中评估细胞对纳米颗粒物的摄取情况5,6,7。 虽然单细胞ICP-MS的测量方法看起来很简单,但要获得真实可靠的数据,实施起来需要注重的细节很多。除了需要额外注意来自培养基的可能高背景信号和细胞在样品导入系统中的潜在破损,在单细胞研究中反复报道的一个主要瓶颈是细胞进样装置的低运输效率,这是因为与纳米颗粒物相比,细胞的尺寸更大,在传输过程中也更容易损失。事实上,传统的系统通常包括一个旋风式雾化室,是专为引入较小的溶液液滴而设计的,导致细胞传输效率低于10%。而用于单细胞导入的定制系统,包括改进的雾化器或全消耗喷雾室8,9,以及其他创新设计10,11,经过多年反复测试,已被验证可以高效传输单细胞进入ICP-MS。 另一个瓶颈在于质谱仪器质量分析器的性能:传统的ICP-MS仪器具有单四极杆或扇形场质量分析器,在进行单细胞分析时最多只能同时检测一到两种元素信息(只能拍黑白影片)。而在常见的单颗粒分析场景中,比如在纳米毒理学研究中,在试图量化纳米颗粒物(特征金属元素)和细胞(蛋白固有元素)的关联时,需要同时获得单细胞事件内多种元素浓度信息。为了获得微秒级事件信息全貌,快速且广谱分析的质量分析器,如飞行时间质量分析器等高精尖‘摄影器材’是必不可少的(译者注:例如,等同于可提供高清彩色120Hz影片给观众更加真实的IMAX观影体验)。图1:a)在对细胞进行酸消解后,通过传统的雾化法将溶液样品引入ICP-MS,并记录仪器获得的稳态信号。这种整体分析法对初始样品中所包含的数千个细胞获得一个平均值。然而这种实验是基于细胞是均匀的假设,而忽略了细胞具有多样性的事实。因此,少数细胞群(用绿色和紫色表示),在元素组成上虽与主类细胞有差异,却没有被体现在结果中,这完美的诠释了辛普森悖论。b)在单细胞ICP-MS方法中,将细胞悬浮液稀释后,在单位时间内仅有一个细胞个体被引入ICP-MS等离子体。每个细胞产生一个独立的离子云,作为信号峰被ICP-MS仪器记录。这种方法允许检测每一个单独的细胞,从而保证了细胞特异性信息的无损获取和保存。简单来说,在单细胞ICP-MS中,细胞是以个为单位进行分析的,可以根据它们不同的分析物含量识别出不同的群体,而不是仅仅产生一个平均值。icpTOF飞行时间质谱法 在飞行时间质谱法(TOF-MS)中,其基本原理是根据离子到达检测器前通过固定长度的飞行管的飞行时间来精确分辨离子。离子束在脉冲加速电压后具有相同的动能,但轻的离子会比重的离子获得更高的速率,进而更早到达检测器。测量所有离子的陆续到达时间可以得到一个连续时间谱,经过简单的校准和换算后可以得到一张全质谱谱图(一般6-280 Th)。TOF质量分析仪的主要优点是:对分析的元素及同位素的数量没有限制,而且全谱数据采集速度快(通常几十微秒就可以获得一张全元素谱图)。这样的快速全谱数据采集能力在处理单一实体(如单细胞)检测时尤其重要,因为单细胞产生的瞬时事件长度很短,一般在200-500微秒区间。 飞行时间技术在单细胞分析领域并不是一个新概念,最初是由Bandura在2009年提出的,其原型机12用于单个细胞的时间分辨分析13,从而为众所周知的 "质谱流式 "领域打开了大门。这项应用使用稳定的稀土金属同位素来标记细胞,从而允许通过其金属标记物来检测相应细胞14。除了展现了生物研究和药物筛选应用中的巨大潜力,质谱流式也被用于检测细菌细胞中的银纳米颗粒15。然而,由于质量检测范围有限(80 Da)和涉及染色的样品制备程序,质谱流式细胞技术无法检测许多固有元素。 与质谱流式不同的,如图2a) 所示的ICP-TOF (TOFWERK AG, 瑞士) 可以测量从质荷比6到280的全谱图16,从而可以覆盖轻质元素,如Na, Mg, P, S, K, Ca, Mn, Fe, Cu, Zn等。这些元素是活细胞的固有元素,它们的分布(也被称为细胞离子组17)可以作为细胞发育状态的指标18。例如,磷存在于核酸(DNA和RNA)中,也是ATP、CTP、GTP和UTP等能量化合物的重要成分。钠和钾在电信号的传输中起作用,而锌被不同的生物过程中的多种酶用作催化剂。由于ICP-TOF-MS的同时多元素检测能力,可以在多种元素的相关分析基础上进行指纹识别19。如图2b) 所示,镁、磷、锰、铁、铜和锌被鉴定为被分析藻类的本征指纹元素。不需要标记或染色,即可依据细胞的 "天然 "元素指纹来进行单细胞分析20,21。通过测量特定细胞类型的金属微量元素,则可以获得更细致的指纹信息。例如,海藻细胞富含镁等金属微量元素,镁是叶绿素的核心组成部分,对光合作用至关重要。因此,金属微量元素的组成可以作为一种独特的指纹来明确识别不同的细胞种类。通过测量单细胞的金属元素组分,可更好地了解由金属蛋白和金属酶调节的基本生物过程,从而解密细胞生命周期不同状态22。尽管细胞的生物化学并不完全反映在其离子组上,但通过监测其金属含量的变化,可以确定地获得对细胞状况和生物过程的更深入了解。 通过使用TOF质量分析仪作为检测器,可以动态系统地获得完整的质谱数据,从而可以对发现特定实体本身及其所处环境进行连续或高通量表征。因此在纳米毒理学背景下,人们可以很容易地确定纳米颗粒物是否与细胞相关联。图2:a) icpTOF仪器(TOFWERK AG, Thun,Switzerland)的示意图:在iCAP Q(Thermo Scientific, Bremen, Germany)的框架上搭配一套高分辨率飞行时间质量分析器。因此,ICP-TOF受益于与iCAP Q相同的ICP离子源、离子光学、碰撞/反应池技术和样品引入设备。b) 用48 µ s时间分辩率采集的淡水藻类细胞raphidocelis subcapitata的瞬时信号速率。c) 藻类细胞通常用于毒理学风险评估研究,这里在暴露于金纳米颗粒一段时间后进行分析,以调查其摄取情况。在ICP-TOF的全质量数范围内,可以根据检测细胞的本征元素指纹对细胞进行追踪,并能直接定量测量纳米颗粒物-细胞的关联。icpTOF单细胞分析应用实例 单一实体分析,与批量样品测量相比,能产生信号的质量相对有限,这对仪器灵敏度要求更高。下面的应用案例研究展示了icpTOF S2仪器(TOFWERK AG,瑞士)的性能指标:具有与单四极杆ICP-MS类似的高灵敏度,又可同时快速检测全谱信号,特别适合分析单一实体,如单细胞或纳米颗粒(NPs)等。随着工业和日常生活中纳米颗粒物的广泛使用,纳米安全和纳米毒理学在过去20年一直是深入研究的课题。纳米颗粒物的安全评估研究中的一个重要参数是其在细胞摄取的分析和量化。 透射电子显微镜(TEM)和扫描电子显微镜(SEM)具有高空间分辨率,它们经常被用于细胞内纳米颗粒物的分析23,24。尽管有令人印象深刻的成像能力,基于电子显微镜方法的一个主要缺点是对样品制备的繁琐要求。此外,由于没有额外的元素定量或自动图像分析,获得的图像是定性的且结果较难被解读25,26。如前所述,单细胞ICP-MS也可用于量化细胞对纳米颗粒物的摄取,根据观察到的信号峰的强度大小,提供与细胞相‘关联’的纳米颗粒数量的信息5,6。这类实验通常有以下三个明显的观察结果: 只检测到纳米颗粒物中的特征元素,表明溶液中存在纳米颗粒物 只检测到细胞固有元素而没有任何纳米颗粒物中的元素,表明细胞并没有与纳米颗粒物相关联 同时检测到细胞固有元素和纳米颗粒物中的元素,意味着两者有关联 根据观察到的相关联的纳米颗粒/细胞峰的频率和幅度,可以确定摄取了纳米颗粒物的细胞的百分比以及与每个藻类细胞相关的纳米颗粒数量的估计值。在理想的情况下,可以根据浓度和暴露时间动态地对海藻细胞和纳米颗粒数量的相关性的进行评估。 在本案例研究中,将海藻细胞暴露在BaSO4(NM-220)溶液中72小时,接着按照Merrifield等人提出的程序进行清洗5,去除未与细胞结合的纳米颗粒。在暴露后并在ISO8692藻类培养基中进行冲洗后27,样品中预计只包含与藻类细胞相关联的纳米颗粒物。随后,样品被储存在15毫升的试剂管中,用锡纸包裹,等待分析。 在使用四极杆ICP-MS进行单细胞的初始研究中,我们发现清洗后的细胞悬浮液中仍存在BaSO4纳米颗粒,如图3a所示。有学者认为未关联的纳米颗粒已经去除,而这些检测到的纳米颗粒是与海藻细胞相关联的。然而由于只测量了一种元素138Ba,并不能完全证实这一猜想。 我们使用单细胞ICP-TOF-MS(见图2a)重复了一个类似的实验。从图2b中我们可以知道被分析的藻类细胞的本征元素指纹,即只有同时检测到Mg、P、Mn和Fe等元素时才被认为检测到了藻类细胞。令人惊讶的是,即使暴露72小时后,BaSO4 纳米颗粒与水藻细胞的指纹信号没有显著关联(图3b)。可以看到,Ba仅与Mg和Fe的信号同时被检测到,而没有水藻的其他指纹信号同时出现。虽然缺失的元素信号强度有可能是低于仪器检测极限,但至少这说明检测到的元素与藻类细胞的本征元素指纹不一致。然而在检测到藻类细胞的指纹信号中,没有观测到Ba元素信号。综上所述,如果没有icpTOF瞬时多元素检测能力,在清洗后细胞悬浮液中检测到的纳米颗粒的Ba信号很容易被误解为是与藻类细胞相关联的颗粒物。图3:a)实验流程图。在样品暴露于纳米颗粒物72小时后,细胞被清洗以去除上清液中游离态的纳米颗粒物。b) 通过使用飞行时间质谱仪重复单细胞测量,可以跟踪细胞的元素指纹,以验证纳米颗粒物信号和细胞信号的是否同时出现。结果显示虽然纳米颗粒物和细胞没有直接关联,但Ba信号与Mg和Fe信号是一起出现的。 这些结果导致了对可能引发该现象的机制的讨论。一个合理的解释是海藻细胞通过释放胞外聚合物物质(EPS)来清除粘附在细胞表面的纳米颗粒物。EPS被认为是影响藻类细胞对纳米颗粒的生物利用率的关键因素28,29。EPS产量的增加可使藻类细胞主动脱落纳米颗粒,从而减轻摄取或吸附到细胞外部,而纳米颗粒仍然以被包含在EPS中的形式存在于溶液中。虽然缺乏关于这种行为的定量数据,但足以解释BaSO4纳米颗粒信号与Mg和Fe信号的契合。当然Fe与Ba信号的同时出现还可以被解释为溶解的Ba与ISO 8692培养基中的EDTA络合在了一起,而EDTA被添加在溶液中以保持Fe的生物可利用率。要回答这个问题,我们使用TEM观察到EPS聚集体中包裹有纳米颗粒(图4)。由于TEM局限于定性分析,再加上EPS结构微妙,这种包裹的确切机制和发生频率很难被量化。然而单细胞ICP-TOF-MS则可以直接对这一现象进行定量分析,而不需要对样品进行复杂的制备,同时还可以在较短的时间内分析更多的藻类细胞及EPS聚集体,提供更可靠的统计数据。此外,单细胞ICP-TOF-MS可以动态地从藻类悬浮液中不间断取样,评估这种清除行为的发生频率与样品浓度和时间的关系,进一步了解藻类细胞和纳米颗粒之间的相互作用。这种利用ICP-TOF研究动态摄取和清除行为的研究思路不仅限于藻类细胞,还可以扩展到纳米医学或纳米生物技术的其他类型细胞,如哺乳动物细胞或细菌。图4:一个藻类细胞(Raphidocelis subcapitata)的透射电子显微镜图像,该细胞之前暴露在银纳米颗粒物中,脱落的细胞外聚合物物质(EPS)含有银纳米颗粒。(由Louise H. S. Jensen和Sara N. Sø rensen提供)。 正如本研究强调的那样,尽管传统的四极杆质谱(sc-ICP-Q-MS)可以测量单细胞,但它最多只能同时测量一种或两种元素或同位素,所以即使检测到纳米颗粒信号也不能100%确定其与细胞直接关联。另外还需要TEM来确定颗粒物是否被藻类吸收在内部或简单附着在细胞外部。然而使用ICP-TOF-MS可以将被暴露在纳米颗粒物中藻类的离子组与对照藻类的离子组进行比较,从而评估它们的状况。这些信息对于从机理上理解海藻细胞与纳米颗粒物的相互作用非常有价值,并可以进一步促进开发以生理学为基础的纳米颗粒物风险评估工具。icpTOF结论与展望 单细胞ICP-TOF-MS是一个新兴的、令人兴奋且快速发展的研究领域。虽然尚需数年时间才能达到质谱流式技术在单细胞多参数分析方面的水平,但ICP-TOF-MS得益于灵敏度的提高和同时全谱检测能力,能够基于元素指纹检测未被标记的细胞,从而为新的实验设计创意提供可能性。例如,除了测量纳米颗粒物和细胞的相关性外,ICP-TOF-MS记录的多元素数据可用于评估细胞在纳米颗粒介导毒性影响下的不同状态。 除了液体样品引入方法之外,也可以使用激光剥蚀(LA)-ICP-TOF-MS进行单细胞分析30,31。通过将制备有细胞的载玻片放在样品台上并使用激光扫描,可以产生单个完整细胞层面上的元素分布二维图像,其中每个像素包含一个完整的全元素谱图。LA-ICP-TOF-MS成像的高空间分辨率对纳米毒理学研究特别有意义,因为它可以观察和定位纳米颗粒物在亚细胞结构中的聚集,以进一步了解和解释各种现象(如摄取、积累和释放纳米颗粒)。 此外,所生成的大量数据可以通过降维技术进行处理,如主成分分析(PCA)或机器学习工具,并提取与细胞状态和类型有关的信息,从而使细胞的分类变得更容易。这在质谱流式工作流程中是常见的处理方法。这项技术不仅限于纳米毒理学研究,还可以扩展到金属组学和细胞生物学中。无论如何,我们将继续努力改进飞行时间质谱ICP-TOF-MS技术,使其在更广阔的应用领域发挥作用。icpTOF致谢作者感谢Olga Meili和Aiga Mackevica校对本文并提供反馈。Lars M. Skjolding得到了PATROLS – Advanced Tools for NanoSafety Testing项目资助(760813)。感谢Louise Helene Sø gaard Jensen和Sara Nø rgaard Sø rensen允许使用图4中的TEM图像。最后特别感谢Robert Thomas邀请在Spectroscopy杂志中的 "原子视角专栏 "刊登此文。原文链接:Hendriks L., Skjolding L. M., Robert T., Single-Cell Analysis by Inductively Coupled Plasma–Time-of-Flight Mass Spectrometry to Quantify Algal Cell Interaction with Nanoparticles by Their Elemental Fingerprint, Spectroscopy, 2020, Volume 35, Issue 10, Pages 9–16https://www.spectroscopyonline.com/view/single-cell-analysis-by-inductively-coupled-plasma-time-of-flight-mass-spectrometry-to-quantify-algal-cell-interaction-with-nanoparticles-by-their-elemental-fingerprint (请点击左下角“阅读原文”跳转)本文由TOFWERK中国-南京拓服工坊科技编译,结论以英文原文为准。参考文献1 S. J. Altschuler and L. F. Wu, Cell, 2010, 141, 559–563.2 W. M. Elsasser, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1984, 81, 5126–5129.3 C. Degueldre and P. Y. Favarger, Colloids Surfaces A Physicochem. Eng. Asp., 2003, 217, 137–142.4 K. S. Ho and W. T. Chan, J. Anal. At. Spectrom., 2010, 25, 1114–1122.5 R. C. Merrifield, C. Stephan and J. R. Lead, Environ. Sci. Technol., 2018, 52, 2271–2277.6 F. Abdolahpur Monikh, B. Fryer, D. Arenas-Lago, M. G. Vijver, G. Krishna Darbha, E. Valsami-Jones and W. J. G. M. Peijnenburg, Environ. Sci. Technol. Lett., 2019, 6, 732–738.7 I. L. Hsiao, F. S. Bierkandt, P. Reichardt, A. Luch, Y. J. H
  • 清华大学与岛津在沪联合举办第二期CM-MS细胞分析讲习会
    p strong 仪器信息网讯 /strong 2017年12月25日,清华大学和岛津中国在岛津上海分析中心联合举办了第二期微流控芯片质谱联用细胞分析讲习会。讲习会展示了由清华大学林金明课题组研究开发的多通道微流控芯片-质谱联用的接口技术以及芯片上细胞培养与观察研究的最新成果,同时也展示了岛津高性能质谱检测仪器与多通道微流控芯片联用的广阔发展前景。与首期一样,本期讲习会也受到了与会者热烈欢迎,一些老师和同学慕名参加,大大超出讲习会原定员人数 span style=" color: rgb(79, 129, 189) " (相关链接: a title=" " style=" color: rgb(79, 129, 189) text-decoration: underline " href=" http://www.instrument.com.cn/news/20170928/230318.shtml" target=" _self" span style=" color: rgb(79, 129, 189) " 清华大学-岛津中国联合举办首期微流控芯片质谱联用细胞分析讲习会 /span /a ) /span 。 /p p style=" text-align: left text-indent: 2em " 岛津中国事业战略室产品企划部部长端裕树博士致欢迎词。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img width=" 600" height=" 451" title=" 11.jpg" style=" width: 600px height: 451px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/996bdf36-b1c6-47e1-b8ac-b863190587b9.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " strong 端裕树致欢迎词 /strong /p p   清华大学林金明教授介绍了微流控芯片质谱联用仪器的研发过程和《微流控芯片细胞分析》课程的开设内容,并现场演示微流控液滴制备方法。 /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 400" title=" 12.jpg" style=" width: 600px height: 400px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/b20cb4c4-ec0c-4325-9292-3db053aa78e7.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p style=" text-align: center "   strong  林金明现场讲演 /strong /p p   厦门大学/上海交通大学杨朝勇教授介绍单细胞液滴微流控技术。 /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 451" title=" 14.jpg" style=" width: 600px height: 451px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/7d0f132c-7698-41c0-a913-2e1629cf8d91.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p style=" text-align: center "   strong  杨朝勇介绍单细胞液滴微流控技术 /strong /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 400" title=" 16.jpg" style=" width: 600px height: 400px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/1ad78cbb-935c-4e84-b8e3-686085b77f41.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " strong 清华大学化学系博士生在讲解CM-MS细胞缺氧实验 /strong /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 451" title=" 17.jpg" style=" width: 600px height: 451px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/76455169-05c2-41ba-92e4-dfd7b5d9dc39.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p style=" text-align: center " strong 现场演示 /strong /p p   对于本期讲习会,全体与会者给予了一致好评。最终,第二期微流控芯片质谱联用细胞分析讲习会圆满结束。 /p p style=" text-align: center " img width=" 600" height=" 451" title=" 19.jpg" style=" width: 600px height: 451px " src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201712/insimg/60595e9e-4938-419d-8734-573be9bbe440.jpg" border=" 0" vspace=" 0" hspace=" 0" / /p p style=" text-align: center "    strong 全体与会人员合影 /strong /p
  • 青岛能源所发明高通量光镊辅助静态池成像单细胞分选技术
    单细胞多组学技术已成为生命科学的有力工具,但一个精准、低损伤、广谱适用、简捷的目标表型单细胞获取手段,是靶向性单细胞基因组、转录组、蛋白质组或代谢物组分析的先决条件。近日,青岛能源所单细胞中心发明了光镊辅助静态池成像分选技术(OPSI),能“所见即所得”、保持细胞原位活性、高通量地分选明场、荧光、拉曼成像下的目标单细胞,支撑高质量的单细胞基因组/转录组测序。该技术对于细菌、古菌、真菌、动植物、人体等各种大小的细胞均广谱适用。相关工作发表于微流控领域国际权威期刊《芯片实验室》Lab on a Chip。OPSI技术服务单细胞多组学研究明场图像、荧光图像、拉曼光谱均可反映细胞丰富的表型信息,汇集上述信息并具备单细胞精度索引、所见即所得特点的单细胞分选技术,在单细胞分析工作中具有广泛的适用性。单细胞中心前期基于单细胞拉曼光谱技术,开发出液相环境中测量与分选菌群中目标微生物单细胞的拉曼分选-测序技术RAGE-Seq(Raman-activated Gravity-driven Encapsulation and Sequencing;Xu et al., Small, 2020)。该技术可在无需标记条件下,通过拉曼光谱获得整个单细胞的化学物质指纹图谱,从而迅速识别活体单细胞的生理特性和代谢产物变化等,更重要的是借助其小体积分离反应的特点,可从单个细胞中得到几乎完整的全基因组信息,对微生物的功能鉴定和资源开发具有重要意义。然而该技术操作过程稍显繁琐,分选通量较低,对于大批量的单细胞分选与分析存在一定的难度。为解决上述问题,单细胞中心徐腾博士、李远东博士带领的研究小组,基于青岛星赛生物的单细胞微液滴分选系统EasySort Compact,在RAGE-Seq技术的基础上开发了基于OPSI的新一代的单细胞分选耦合培养/测序策略。不同于流式分选技术中细胞逐个流过窄通道后成像筛选的原理,OPSI提出了一种静态池成像分选的思路,即在微流控芯片中构建流速为0的稳定静态流场,对样本细胞进行限域,并在该流场内进行平面明场、荧光成像或拉曼扫描,选取目标细胞。之后通过低细胞损伤的1064 nm光镊将目标单细胞移出静态流场,并进行单细胞液滴包裹导出完成分选。该系统使细胞能够以精确索引的方式进行分类,“所见即所得”,并广泛适用于从细菌、古菌到人体细胞等不同尺寸大小的单细胞(直径1 ~ 40 μm)。验证试验表明,OPSI的单细胞分选准确率 99.7%,保证10~20细胞/min的分选通量,并高度保持了细胞活性。此外,OPSI继承了RAGE小尺寸分离反应的特点,显著降低了传统单细胞基因扩增中存在的歧化现象。例如,使用该系统分选人体MCF-7单细胞进行RNA-seq,可获得高质量和高可重复性的单细胞转录组谱。OPSI的通用性、方便性、灵活性和低成本等优势,为其在单细胞多组学研究中提供了广阔的应用前景。基于OPSI的上述特色,单细胞中心和青岛星赛生物合作推出了自动化、智能化的单细胞微液滴分选系统(EasySort Lego/Compact)系列产品,并与国际显微镜和显微光谱仪领军产商(如赛默飞Thermo Fisher Scientific、堀场HORIBA等)合作,在全球科学仪器市场进行推广。该工作由单细胞中心马波研究员和徐健研究员主持,与青岛星赛生物合作完成,得到了国家重点研发计划、山东省自然科学基金委和国家自然科学基金委的资助。(文/图 徐腾 刘阳)原文链接:https://doi.org/10.1039/D2LC00888BTeng Xu#, Yuandong Li#, Xiao Han, Lingyan Kan, Jing Ren, Luyang Sun, Zhidian Diao, Yuetong Ji, Pengfei Zhu, Jian Xu*, Bo Ma*. Versatile, facile and low-cost single-cell isolation, culture and sequencing by optical tweezer-assisted pool-screening. Lab on a Chip 2022.
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