免疫组化原位杂交系统

项目编号：SDJDHF20220450-Z219/HYHA2022-2547项目名称：山东大学全自动免疫组化及原位杂交染色科研平台采购采购方式：竞争性磋商预算金额：145.0000000 万元（人民币）最高限价（如有）：145.0000000 万元（人民币）采购需求：采购全自动免疫组化及原位杂交染色科研平台，具体参数详细见“第四章 采购内容及项目要求”合同履行期限：自合同生效之日起至本项目质保期满为止。本项目( 不接受 )联合体投标。凡对本次采购提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名称：山东大学地址：山东大学中心校区明德楼联系方式：王老师0531-883697972.采购代理机构信息名称：海逸恒安项目管理有限公司地址：山东省济南市历下区华润置地广场A5-6号楼27楼招标三部联系方式：徐玉镯、吕宁、李雨莹0531-82661997、187658755653.项目联系方式项目联系人：徐玉镯、吕宁、李雨莹电话：0531-82661997、18765875565全自动免疫组化及原位杂交染色平台-附件.pdf

3月17日，中国科学院深圳先进技术研究院合成微生物组学研究中心、深圳合成生物学创新研究院戴磊课题组，在《自然-通讯》(Nature Communications)上，发表了基于成像的空间微生物组最新研究成果(Spatial profiling of microbial communities by sequential FISH with error-robust encoding)。 　　该团队发展了一种可容错编码的序贯荧光原位杂交(SEER-FISH)技术，用于解析复杂微生物群落的空间结构。该方法可识别复杂群落中的不同微生物物种，在单细胞尺度上原位解析微生物物种之间以及微生物-宿主之间的相互作用，是探究微生物群落的生态和功能的重要工具。 　　自然界中的微生物群落具有丰富的物种多样性。各种微生物独特的生存方式和相互作用关系构成了群落特定的空间结构。尽管现有的高通量测序技术能够描绘微生物群落的物种组成及丰度，但缺乏解析群落空间结构的有力工具。由于传统荧光显微成像技术可分辨的物种数量受限于荧光基团的颜色种类，绘制高物种分辨率的复杂微生物群落的空间结构颇具挑战性。 　　基于此，研究发展了新的SEER-FISH成像技术并将其用于复杂微生物群落，在微米尺度上绘制了拟南芥根系定植的微生物群落的空间分布，观测到不同物种在根表上的空间异质性定植以及在受到宿主代谢物扰动后的空间分布变化和物种空间关联改变。SEER-FISH技术可以精准解析复杂微生物群落的空间结构，为探讨植物根际、人体肠道等宿主共生微生物组的生态规律和生理功能提供了有力工具。 　　SEER-FISH通过序贯荧光原位杂交的方式实现微生物群落空间结构的解析。它的工作原理是为每种微生物分配特定的多色编码，每轮使用带有相应颜色荧光基团的寡核苷酸探针来标记对应的微生物，再通过多轮荧光原位杂交成像获取每个细胞的多色编码，从而确定其对应的物种(图1a-c)。该团队进一步对编码进行优化，使用不同汉明距离(HD，hamming distance)的纠错编码可以提高物种准确识别率，且具有高度的可扩展性(图1d)。 　　研究在不同微生物群落的体外成像实验中对SEER-FISH技术进行系统评估。实验验证了该方法对群落组成识别的准确性和可重复性，能够准确量化群落物种组成的变化(图2a-c)，使用不同的编码方案所得到的群落组成高度一致(图2d-f)。 　　植物根际定植着高度多样的微生物群落。它们既受到植物宿主的调控又影响植物的生理健康。然而，科学家对于根际微生物群落的空间结构却鲜有研究。研究将SEER-FISH应用于根表微生物的空间成像，勾勒了不同生理分区分布定植的微生物群落组成 (图3a-c)。 　　研究发现，定植在根表的微生物群落并非随机分布，而是倾向于形成聚集体。这些微生物聚集体的尺度在几十到几百微米，并存在多个物种(图3d-f)。微生物聚集体的形成的具体原因有多种假说，包括偏好性定植、提高在根际环境下的适应性等。此外，研究通过对群落中的微生物进行邻近关系分析，发现了显著的菌-菌空间关联(图3g)。 　　通过外源添加拟南芥根际分泌的代谢产物植保素(camalexin)和香豆素(fraxetin)，研究发现根际微生物的组成和空间分布均发生了显著变化(图4a-c)。例如，中华根瘤菌主要定植于靠近根尖的位置，而这种偏好性的定植在加入植保素和香豆素后发生改变(图4d)。农杆菌本身在根上的定植没有偏好性，但在受到香豆素扰动后表现出更多的定植于根成熟区(图4e)。根际微生物空间分布的高度异质性和物种之间的差异，与环境异质性、微生物本身的特性均有关。 　　研究进一步对定植微生物的空间关联进行分析，发现植保素和香豆素均不同程度地影响改变了物种之间的空间关联(图4f)。微米尺度下的空间关联暗示了微生物群落中不同物种之间广泛存在的短程相互作用(如营养竞争与互养、接触抑制、群体感应等)，对于进一步的机制研究有重要的指导意义。 　　研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、广东省自然科学基金及深圳合成生物创新研究院的支持。

p style=" text-align: center " span style=" color: rgb(31, 73, 125) " strong 用于淋巴瘤的全自动 CISH 和 IQFISH 基因组合集多项创新于一体 /strong /span /p p 　　2018年5月4日，北京——安捷伦科技公司(NYSE: A)日前宣布推出用于 Dako Omnis 的 EBER RNA CISH、κ 和 λ mRNA CISH 探针，以此扩展其原位杂交探针产品组合。此外还推出了用于淋巴瘤的手动 IQFISH 基因组合，该组合在欧洲拥有代表体外诊断的 CE 标志。 /p p 　　EBER RNA CISH、κ 和 λ mRNA CISH 产品的推出进一步提高了 Dako Omnis 仪器的诊断能力，这款仪器现可同时进行显色原位杂交 (CISH)、荧光原位杂交 (FISH) 和免疫组织化学 (IHC) 的检测。通过最优化的和经过验证的实验方案，Dako Omnis可以加快病例分析周期，并帮助实验室拥有始终如一的质量并获得最佳结果。 /p p style=" text-align: center" img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/191f31ea-fe48-4929-9f60-2fd6561e909f.jpg" title=" dako-omnis-advanced-staining.jpg" / /p p 　　丹麦奈斯特韦兹西兰大学医院病理学部医学实验室技术人员 Dorthe Strue-Nielsen 表示：“对我们的实验室来说，同时在 Dako Omnis 上进行 CISH 和 IHC 是一项完美的解决方案，可以节约很多手动操作时间。” /p p 　　用于淋巴瘤的 IQFISH 基因组合是一系列基于寡核苷酸的 FISH 探针，可用于检测涉及 MYC、BCL2、BCL6、MALT1、CCND1 和 IGH 基因的重排。这些探针既用于福尔马林固定石蜡包埋的组织切片，也可用于分裂和双融合方法。 /p p 　　这些探针使用合成的寡核苷酸制成，而非更常见的细菌人工染色体。这项创新技术消除了探针中的重复序列，可以降低背景信号。 /p p 　　安捷伦基因组学事业部营销主管 Jeff Heimburger 谈道：“CISH 探针生产采用的是安捷伦独特的工艺。将它们作为FISH 和 IHC工作流程的一部分，同时在 Dako Omnis 上运行，可提高实验室分析效率，为患者提供更快速地诊断。” /p p 　　安捷伦是第一家将快速杂交技术带入病理学实验室的商业供应商。安捷伦的 IQFISH 缓冲液可以改进杂交效率，使通常需要花费两天的检测在 5 小时内完成。对大多数实验室来说，这项创新的推出使病理学家在有需求时即可进行 FISH 检测，让患者更快获得检测结果。 /p p 　　关于安捷伦科技公司 /p p 　　安捷伦科技公司(纽约证交所：A)是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者，拥有 50多年的敏锐洞察与创新，我们的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。在2017财年，安捷伦的营业收入为44.7亿美元，全球员工数为14200人。 /p