质谱技术细菌聚类分析

使用电子舌、电子鼻和色度仪，并结合主成分和聚类分析对Lactobacillus fermentum(发酵乳杆菌)、L.delbrueckii(德氏乳杆菌)和L.casei(干酪乳杆菌)制备酸浆水的品质进行了评价。

微生物的鉴别与分析是生命科学领域中的一个重要方面。许多微生物例如金黄色葡萄球菌、酵母菌等与我们的生命健康密切相关。细菌中蛋白质、核酸等活性物质具有特定的指纹拉曼光谱，可以实现对细菌本身的活性物质如蛋白质、核酸等分析。拉曼光谱具有非接触、无惧水等特点，因此也可以对细菌体内的合成物进行鉴别与分析，及快速研究细菌在不同环境下的损伤等。Thermo Fisher DXR2xi超快速显微拉曼成像光谱仪具有先进的自动化光学控制系统、高灵敏度智能化检测方式、优异的光谱分辨率和空间分辨率，结合采用并行算法的OMNICxi多功能软件及最大数据库等强大的分析功能，轻松进行微/纳米级样品的检测与分析，实现单个活性细菌的快速检测与分析。

为研究草莓相关拮抗细菌的多样性, 以期筛选对草莓土传病害有良好防效的生防细菌。本研究从大量草莓根围细菌中分离得具高拮抗活性细菌群体, 并借助现代分子分类方法鉴定其群体结构, 旨在寻找优良的用于防治草莓土传病害的生防菌株。

在饲料国家标准目录中针对饲料微生物的检测有细菌总数、志贺氏菌、沙门氏菌、霉菌总数、大肠菌群、嗜酸乳杆菌。其中针对饲料细菌总数和霉菌总数的检测需计数菌落总数，现在大多数的企业基本是肉眼人工手动计数，既耗时又耗力。迅数全自动菌落计数仪实现全自动菌落计数、菌落形态分析、粘连菌落分割、自动颜色识别、自动杂质剔除，以及形态分析、自动换算、测量等大量先进功能，能够很好的完成国标中菌落计数、总数选择等工作。帮助实验人员完成菌落总数的计数工作，提升企业微生物实验室规格。

ICP-MS 法可以分析成批培养的细菌细胞中的总金属含量，然后根据测得的细胞总数平均算出单个细菌细胞的铁含量。由于平板计数法无法计算死亡细胞或未被培养的完整细胞，导致计数出现误差。然而，由于仪器的限制，目前还未见有方法可直接分析单个细菌细胞中的铁含量。基于单细胞ICP-MS (SC-ICP-MS) 分析技术取得的重大进展，使得直接测定单个细胞内金属含量成为现实。PerkinElmer 公司专利的Asperon™ 单细胞雾室将单个完整细胞引入ICP-MS的等离子体中，结合NexION® 系列ICP-MS 质谱仪瞬时采集速度快的优势，可确定单个细菌细胞内的铁含量。在本次实验中，我们利用SC-ICP-MS 法分别测定了三种菌株的单个细胞的铁含量。这三个菌株分别是大肠杆菌B 株(Eco)、枯草芽孢杆菌168 株(BAC) 和红球菌RHA1 株(RHA)。SC-ICP-MS 技术可直接测定单个细胞的铁含量，并确定每种菌株的铁含量分布情况。铁含量与细菌的细胞大小相关，即最大菌株(RHA)单个细胞的平均铁含量最高，而最小菌株(Eco) 单个细胞的平均铁含量最低。

开发出一种固相微萃取 (SPME) 和气相色谱/三重四极杆质谱 (GC/QQQ) 方法，用于分析嫁接红茶样品。使用 Agilent MassHunter Profinder 和 Agilent Mass Profiler Professional (MPP) 软件进行数据提取和统计分析。对鉴定或初步鉴定的特征挥发性化合物进行主成分分析和层次聚类分析，以揭示不同茶叶样品之间的差异。

xCELLigence RTCA 可用于生物被膜研究中的一些基础和复杂应用。与传统的分析方法相比，该方法所涉及的工作量明显较少：仅需将细菌接种至E-Plate 中，然后连续自动地进行数据采集即可。xCELLigence 数据的实时性可实现不同菌株和处理之间定量比较，并可评估细菌及其 EPS。利用传统的终点分析法获得详细的生物被膜动力学信息需要耗费大量的工作时间，且无法实现相同水平的重复性。

在被检标本中，常混杂有多种细菌，平板划线分离法可使这多种细菌在培养基表面分散生长，各自形成菌落，以便根据菌落的形态及特征，挑选单个菌落进行纯培养。

为了解中华开菲尔微生物菌群的结构特征,本论文运用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术对开菲尔菌株发酵过程中微生物菌群的结构变化进行了实验分析,结果表明：细菌菌群DGGE图谱上出现有三种不同迁移位置的斑带,而酵母菌群DGGE图谱上只有一条斑带 经过DNA序列的对比分析可知：细菌菌群分别为肠膜明串珠菌（Leuconostoc mesenteroides）、马乳样乳杆菌（Lactobacillus kefiranofaciens）和开菲尔乳杆菌（Lactobacillus kefir）,它们的序列同源性都达到100% 酵母菌群为德尔布有孢圆酵母（Torulaspora delbrueckii）,其序列同源性为99%。本论文首次报道了德尔布有孢圆酵母在开菲尔菌落中的存在。

本文报导了一种以最轻微破坏方式取样，鉴定藏书和档案纸中有机成分的快速、直接方法，该方法能够满足收藏、法庭科学和其它应用的需求。采用实时直接分析质谱（DART-MS）分析了已知厂商16种参照纸的纸浆组分和树脂污染物。不经提取、衍生、色谱分离和其它耗费时间和化学试剂的样品处理，即获得了牛皮纸、化学预热机械纸和石墨浆纸的实时质谱图。漂白硬木牛皮纸中含植物甾醇，而漂白软木牛皮纸中没有，这是二者的区别。是否为化学预热机械纸浆牛皮纸，可用木质素热裂解产物进行区分：丁香酚基产物来自硬木、愈创木酚基和香豆素类产物来自软木、化学预热机械纸浆纸。磨木浆纸与其它所有纸张都不同，含大量挥发性提取物。本方法还能立刻区分含松香和烷基烯酮二聚体（AKD）施胶剂的纸。DART-MS方法快速、简便，质谱图可重复。只要用镊子从纸的表面夹取10μg左右的微量样品即可进行分析。得到的标准图谱可用于进一步DART-MS纸张研究，也可以用于Library of Congress开发的打印和书写纸DART-MS可检索谱库。打印和书写纸张的化学成分因厂商和年代不同而不同。最稳定的欧洲纸是约1650年前用高质量亚麻布手工制作的。这种纸含纤维素长纤维，常常因为碳酸钙和碳酸镁而呈碱性pH，用明胶等外施胶剂进行浸渍处理，以减少或防止用墨水书写时洇纸。17世纪后半叶，机械化和新兴的化学学科开始在造纸业中发挥重要作用。开始用造纸明矾（硫酸铝，Al2(SO4)3• 18H2O）改善纸张质量，但那时还不知道Al3+在有水时会发生水解形成酸性（pKa = 5.0）。1世纪和19世纪的工业革命带来了新的造纸设备，并用硫酸和氯作为漂白剂，用麦秆、蔬菜代替布料纤维，用松香胶明矾内施胶剂代替明胶。机械纸浆纤维较短而且纯度低，含有大量木质素和其它植物化学物质，或带酸性或能分解成酸，并造成纸张泛黄。松香施胶剂含有松香酸，需要明矾和酸性pH才能有效施胶。直到20世纪发明了漂白化学木浆，并用碳酸钙作为滤料。20世纪后期，开始出现碱性造纸，采用合成施胶剂烷基烯酮二聚体（AKD）和烯烃基琥珀酸酐（ASA），以及无氯漂白工艺。但世界各地仍在生产含松香明矾施胶剂的酸性纸。目前，国际上倡导绿色技术，21世纪的纸张将使用高产率的化学预热机械和废料再循环纸浆。由此可见，藏书和档案纸张在不断变化，并以不同速度发生着化学降解。测定不同纸张的各种化学成分，及其对物理和光学长期稳定性的影响，以及保存方式对这些成分的影响，是一项具有挑战性的工作。虽然普遍认为纸张的酸性是稳定性的主要影响因素，但其它化学成分，包括金属离子、木质素、添加剂和降解产物，以及温度、湿度、氧气、光纤和化学污染物等，也将对降解构成影响。研究年代久远的纸张对了解其降解过程非常有益，但纸张原来的性质及其保存条件是多变的，可能以不为人知的方式影响了纸张的理化性质。 为了减少这些变数，现在的研究广泛采用已知厂商的当代参照纸，进行加速老化实验，模拟旧版纸的老化行为。这些参照纸包括二十世纪九十年代初期为欧洲保存委员会生产的一批纸张，以及1995年为ASTM国际标其它分析方法也用于纸张的研究。用带或不带光谱解卷积和化学计量学分析功能的傅里叶变换（FT）红外、近红外和FT-拉曼光谱，研究纸张降解。这些非破坏性的光谱分析可以发现主要化合物的官能团，但却不能进行特异性的化合物鉴定。用衍生或不衍生的裂解GC（Py-GC）和Py-GC–MS分析纸张和添加物，这些轻微破坏性方法可以对挥发性和/或裂解生成化合物进行鉴定，但GC法受化合物挥发性和热稳定性的限制，而且分析用时较长。 纸张研究需要一种最轻微破坏性取样，能够进行快速高通量分析，及有机化合物鉴定的分析技术。实时直接分析质谱（DART-MS）是一种较新的质谱方法，不经提取、衍生和色谱分离，就能够检测各种基质中全部挥发性、半挥发性、非挥发性极性有机化合物。所分析的固体样品包括书写墨水、细菌全细胞、蝇类昆虫、植物和玩具等。对离子形成机制和灵敏度、重现性影响因素的研究已有报导。本文首次报导了用正离子DART-MS表征打印和书写纸张的方法。对Whatmann #1 100%棉纤维素纸和15种ASTM-ISR参照纸进行了分析。提出了用特殊技术对微型样品进行全面分析的可重现的灵敏方法。本文比较了用DART-MS和Py-MS得到的正离子，对固体物质DART-MS的离子形成进行了探讨。

细菌纤维素（Bacterial Cellulose,BC）是由木醋杆菌等微生物经过液态发酵制得的凝胶状膜。与植物纤维素和动物纤维素相比，细菌纤维素具有纳米级、高纯度、高持水性、高杨氏模量和抗张强度、良好的生物相容性等优良的特性。由于其具有这些优良的特性，使其广泛应用在食品、造纸、医药和生物化工等领域。

本文应用发现代谢组学的精确质量Q-TOF LC/MS 工作流程，研究了处于早稳定期和晚稳定期的细菌。所采用的软件可批量处理数据，使得数据分析更高效且实现了自动化。应用Agilent MassHunter Profinder（批量特征提取软件）总共从正离子数据中获得了488 个特征，从负离子数据中获得了623 个特征。采用Mass Profiler Professional (MPP) 进行的统计学分析揭示了细菌在早稳定期和晚稳定期丰度具有显著差异的特征。在正离子数据中，有57 个特征在早稳定期中的丰度要高于晚稳定期。而在负离子数据中，有52 个特征在早稳定期中的丰度要明显高于晚稳定期。为了理解这些代谢组学数据的生物学和生物化学背景，我们通过数据库搜索、精确质量MS/MS 谱库匹配，以及MS/MS 分子结构关联对超过100 个差异特征进行了标注和鉴定。

市场对高灵敏度、高重现性且可靠的活性分析物分析法的需求日益增长，因此，对气相色谱的柱技术要求也越来越高。活性分析物之所以难以分析，是因为可能被气相色谱流路中的活性位点所吸附。安捷伦科技最近推出了一款 Agilent J&W DB-WAX 超高惰性气相色谱柱。这种惰性极高的毛细管柱涂覆了一层创新型聚乙二醇 (PEG) 固定相。本应用简报展示了该固定相在分析含极性官能团的化合物时出色的惰性。结果表明该色谱柱适用于多种棘手的工业应用。现已发现，燃料和润滑剂的抗氧化添加剂中均存在多种酚类化合物，包括苯酚和叔丁基苯酚。图 6 是对含八种常见酚类化合物（浓度均为 100 ppm w/w，溶剂为环己烷）的酚类混标进行分离得到重复三次的叠加色谱图。这些化合物得到了不错的分离度和峰不对称性。三次重复进样得到的叠加色谱图表明所有组分的保留时间均具有出色的重现性。上述酚类化合物在许多工业生产（例如纸浆与纸张、染料以及纺织品的生产）过程中也十分常见。

试验方法原理:本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术，结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD、RFLD 等分子生物学实验。

MALDI-TOF-MS是应用于细菌快速检测的一种新技术，与传统检测技术以及目前常用的全自动细菌鉴定方法相比，具有鉴定速度快、通量高、结果准确，成本低等优势。东西分析研发生产的Ebio ReaderTM 3700M飞行时间质谱系统可准确且快速有效的鉴别药品中是否存在洋葱伯克霍尔德氏菌群，为药品的安全生产提供质量把关。

纤维素是当今世界上最丰富的可再生高聚物。纤维素大部分来源于植物，还有部分来自微生物。细菌纤维素（Bacterial cellulose，缩写作BC）是细菌初级代谢的特定产物，主要起着保护层的作用。直到20世纪下半叶细菌纤维素（BC）具有许多独特性质才引起人们广泛关注。细菌纤维素具有高纯度、高结晶度、髙结合水能力、高机械强度和生物相容性好等特点，故可应用于食品、造纸、医药等领域。

现场检测中，通过对水体进行发光细菌急性毒性检测，快速判定水体的综合毒性和污染量级，起到早期预警作用。文章介绍了DeltaTox 毒性仪及其工作原理和方法、毒性参照物实验和比对实验等内容。仪器通过高敏感度分析仪（光度计）测试发光细菌与水样混合后的光强度，并与空白实验的光强度比较，根据实验前后样本发光强度的变化得到光损失或光增益的百分比，该检测耗时短，操作简便，敏感度高，适用于现场检测或突发性污染事故的应急监测。

摘　要：利用气相色谱－离子迁移谱技术分析不同香菇干样挥发性组分的指纹图谱。根据离子迁移数据利用热图聚类和主成分分析不同样品间的差异。热图聚类分析可将２７份香菇材料分为２大类；ＰＣＡ分析表明，前２个主坐标的方差贡献率分别为３０．２％和２６．９％。结果表明气相色谱偶联离子迁移谱技术对构建香菇挥发性物质指纹图谱及挥发性组分数据库具有潜在的应用价值。

采用激光烧蚀-电感耦合等离子体质谱(LA-ICP-MS)、仪器中子活化分析(INAA)和x射线荧光分析(XRF)等方法，对不同生产设施采集的砖石进行取证元素组成研究。这些检查的目的是评估这些方法在砖石法医比较分析中的潜力。使用NIST标准参考材料(679、98b和97b)评价分析方法的准确性。为了进行比较，采用多元数据分析。以主成分分析(PCA)和聚类分析为例，对基于V、Na、K、Sm、U、Sc、Fe、Co、Rb和Cs浓度的INAA结果进行了评价。不同分析方法得到的结果是一致的。结果表明，所述元素分析方法是对砖石进行法医鉴定的一种有价值的工具。

摘要：通过对以黄铜矿为主的低品位硫化铜矿中温硫杆菌生物浸矿体系的细菌优势菌群的研究，探讨了黄铜矿的细菌作用机理. 采用9K 培养基从细菌浸出矿浆中分离出了14 株中温硫杆菌，其浸矿能力都弱于分离前的自然混菌菌种，在浸矿过程中自然形成的混菌群落中各菌株之间存在着协同效应. 从上述菌株中随机挑选出氧化浸出能力有较大差异的YK8, YK12 和YK14 进行了16S rDNA 克隆测序分析，显示它们与Acidithiobacillus ferrooxidans 的同源性均达到99%，为嗜酸氧化亚铁硫杆菌. 由此说明该浸矿体系的优势菌群为嗜酸氧化亚铁硫杆菌，细菌氧化作用机理以直接作用为主. 各纯菌株对Fe2+的氧化率存在较大差异，对菌浸矿浆用不同能源诱导培养后的混菌浸矿能力有显著变化.

真菌毒素是真菌在食品或饲料里生长所产生的代谢产物，对人和动物都具有极大的健康隐患。据联合国粮农组织（FAO）统计，全球每年约有 25% 的农产品受到真菌毒素污染。为了保证食品和饲料的安全，全世界多个国家通过法规或标准严格规定粮食中主要真菌毒素的限量。但传统的检测方法存在耗时长，通量低，定性能力差等问题。本文采用高分辨台式质谱仪 Q Exactive Focus建立了粮食提取物中多种真菌毒素的检测方法。方法具有媲美高端三重四极杆的灵敏度，同时可以对复杂基质中的痕量物质准确地定性分析，充分保障结果的准确性。

革兰氏染色（Gram stain）用途：由丹麦病理学家Christain Gram于1884年创立，直到现今，革兰氏染色法仍是细菌学中广泛使用的一种鉴别染色法。通过革兰氏染色，可将细菌鉴别为革兰阳性菌(G+)和革兰阴性菌(G-)两大类。

细菌检测仪检测水中细菌的操作步骤

真菌毒素是真菌在食品或饲料里生长所产生的代谢产物，对人和动物都具有极大的健康隐患。据联合国粮农组织（FAO）统计，全球每年约有 25% 的农产品受到真菌毒素污染。为了保证食品和饲料的安全，全世界多个国家通过法规或标准严格规定粮食中主要真菌毒素的限量。但传统的检测方法存在耗时长，通量低，定性能力差等问题。本文采用高分辨台式质谱仪 Q Exactive Focus建立了粮食提取物中多种真菌毒素的检测方法。方法具有媲美高端三重四极杆的灵敏度，同时可以对复杂基质中的痕量物质准确地定性分析，充分保障结果的准确性。

本应用报告采用Agilent 1260 Infinity SFC 超临界色谱和Agilent 6540 QTOF 超高分辨质谱系统建立对医药产品中聚合物土温80 (Tween80) 的分析技术。本研究基于Agilent QTOF 精确质量及超临界色谱分离技术快速实现了医药产品中土温80 分析，其中精确高分辨质荷比全扫描技术可以有效发掘土温80 中不同聚合度(n=17?32) 的存在形式和分布方式，超临界色谱则可解决反相色谱C18 分离困难的问题，利用正相分离机理有效的实现了不同聚合度土温80 的分离测试，同时SFC 作为一种环保绿色分离技术也将成为经典色谱分析的有益补充。

随着人类对环境污染的认知逐渐加深，对检测标准的不断完善，对土壤的关注也越来越多。酰胺类除草剂具有广谱性，效果好、价格低使用方便等优点，是目前应用较为广泛的一种除草剂，施用后容易造成土壤和沉积物吸附，其中乙草胺和丁草胺具有弱的基因毒性，乙草胺已被美国环保局定为B-2类致癌物。2019年我国出台新的环境标准，严格控制土壤中酰胺类农药的含量。本文参考HJ1053-2019 《土壤和沉积物 8 种酰胺类农药的测定 气相色谱-质谱法》标准，选择Trace1300系列气相,配合ISQ7000质谱，对土壤中的8种酰胺类农药进行了分析，配合TG-35MS高惰性低流失色谱柱，对8种酰胺类农药有良好的检出。为做土壤分析的实验室，提供可参考的有效的解决方案。

细菌接种倾倒法主要用于菌落总数的计数

黄芪为豆科黄芪属植物。具有健脾补中，益卫固表，利尿，托毒生肌的功效。主治脾气虚证，气虚自汗证，气血亏虚，溃久难敛等。 黄芪的主要产地分布于山西、内蒙古、东北和甘肃等地。黄芪的品质好坏与品种、产地和微量元素的含量多少以及其内部元素组分的构成有一定的关系。山西的黄芪比较绵软，东北的黄芪比较粗壮，内蒙古的黄芪品质较好。

纤维素是当今世界上最丰富的可再生高聚物。纤维素大部分来源于植物，还有部分来自微生物。细菌纤维素（Bacterial cellulose，缩写作BC）是细菌初级代谢的特定产物，主要起着保护层的作用。直到20世纪下半叶细菌纤维素（BC）具有许多独特性质才引起人们广泛关注。细菌纤维素具有高纯度、高结晶度、髙结合水能力、高机械强度和生物相容性好等特点，故可应用于食品、造纸、医药等领域。细菌纤维素又被称为椰果，其含有丰富的优质纤维素，能促进肠胃蠕动，防止便秘、改善人体消化功能、预防心血管疾病、美容减肥和防癌的功效。细菌纤维素在食品方面得到广泛应用。在日本，台湾及东南亚国家中主要应用于果冻、布丁、罐头、饮料等方面，并且深受欢迎。

本实验采用赛默飞世尔科技Trace1300GC 配ISQ 质谱检测器分析药品中的8 种基因毒性物质——磺酸酯，样品通过乙酸乙酯超声提取可以完成药品中磺酸酯的萃取。同时对于EP 方法中提出的顶空衍生化方法，其本身存在一定的局性限，本方法通过直接进样分析目标物，可以去除假阳性的影响，满足检测要求，本方法准确，灵敏度高。