比克白芷素

SARS-CoV-2的奥密克戎变异株最早报道于2021年11月，目前已成为世界范围内的主要感染株。奥密克戎在S蛋白的30多个突变导致其致病性和复制能力的下降，而传播力却明显增强。目前，宿主对奥密克戎的反应尚不明确。近期，西湖大学生命科学学院郭天南团队、浙江大学医学院附属杭州市西溪医院黄劲松团队协同国家传染病医学中心、上海市传染病与生物安全应急响应重点实验室、复旦大学附属华山医院感染科张文宏团队共同合作评估了奥密克戎变异株感染、SARS-CoV-2非奥密克戎株感染，非SARS-CoV-2呼吸道病毒（流感病毒及腺病毒）感染患者的血液蛋白质组学特征，并和健康受试者接种全程2针新冠疫苗前后的蛋白质组学特征进行了同步比较，相关成果于5月18日发表于Cell Discovery杂志。研究分析表明，在血液蛋白质组学的角度，接种疫苗后的奥密克戎株与非奥密克戎株宿主反应类似；同一般流感相比，具有显著的差异特征。在非重症肺炎患者中，接种疫苗后感染奥密克戎诱导的免疫反应与非奥密克戎株感染相似，炎症反应远超过健康对照病例，但没有流感和流感样病人严重。这可能是由于新冠疫苗为大部分患者提供了潜在的保护作用。但需要注意的是，本研究并没有分析重症肺炎患者，因此，奥密克戎株或流感病毒等在重症患者中引起的宿主炎症反应我们无法通过本研究评估。研究结果提示，奥密克戎株与流感的宿主免疫反应存在显著差异，接种疫苗可能是非重症奥密克戎株患者宿主炎症反应降低的原因之一。参考文献[1] BAO JF, SUN R, Ai JW, 等. Proteomic characterization of Omicron SARS-CoV-2 host response [J]. Cell Discovery. 2022[2] SHEN B, YI X, SUN Y, 等. Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera[J]. Cell, 2020, 182(1): 59-72.e15.

2020年初，一场突如其来的疫情打乱了大家的生活节奏。面对来势汹涌的疫情，全国上下正在积聚力量，全力战胜新型高致病性冠状病毒（2019-nCoV）。医护人员、解放军战士、志愿者们纷纷奔赴武汉，与疫魔竞速，守卫着国民的生命安全，致敬最美逆行者！同时疫情研究者一样没有停下自己的脚步，特别是在分子水平，我们调研了基于Orbitrap超高分辨的蛋白质组学和结构组学技术在病毒学研究中的应用，谨以此文致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。Orbitrap技术促进病毒机理研究病毒与宿主共同进化，获得捕获和操纵宿主细胞过程进行复制的机制传播。同样，宿主细胞会通过部署防御机制或通过适应感染环境。在整个感染过程中，细胞严重依赖于时空调控的病毒-宿主蛋白-蛋白相互作用的形成。 蛋白质组学方法与病毒学的结合促进了对病毒复制、抗病毒宿主反应和病毒对宿主防御的颠覆机制的深入研究。而Orbitrap技术依靠其高灵敏度、高精度，高通量等特性在该方面表现出色。案例一：Orbitrap技术深度挖掘病毒-宿主蛋白质相互作用2019年Viruses杂志上发表了基于组学技术研究宿主变化的综述，质谱技术中基于亲和纯化分离蛋白质复合物随后进行MS分析（AP-MS）的方法可以用于分离病毒-病毒和病毒-宿主多蛋白复合物，可识别间接和直接的蛋白质相互作用，提供相互作用事件的瞬时信息，或跟踪单个病毒基因产物的过表达，以深入了解单个蛋白质的功能；表达蛋白质组学技术（定量蛋白质组学和翻译后修饰组学）可以研究病毒蛋白的组成，宿主在病毒入侵过程中蛋白质和翻译后修饰的动态变化。（Viruses 2019, 11, 878 doi:10.3390/v11090878）迄今为止，基于蛋白质组学方法的进展已经为识别数量惊人的病毒-宿主蛋白关联铺平了道路，科学家基于这些数据构建了包含了5000多种病毒成分和宿主细胞之间的非冗余蛋白相互作用数据库。这些有价值的信息库包括相互作用蛋白数据库、VirHostNet(http://virhostnet.prabi.fr/)、VirusMentha(Nucleic Acids Res. 2015 43(D1):D588–D592)、IntAct-MINT(Nucleic Acids Res. 2015 43(D1):D583–D587)和Uniprot。 案例二：Orbitrap技术揭示新型塞卡病毒宿主因子Pietro,Scaturro, Alexey, et al. Nature, 2018 寨卡病毒(ZIKV)最近成为全球健康问题，由于它的广泛传播和与严重的联系新生儿神经症状和小头症。然而,与致病性相关的分子机制关于ZIKV的大部分仍然未知。 技术路线：利用赛默飞 LTQ-Orbitrap和Orbitrap Q Exactive HF质谱进行全蛋白质组学和修饰蛋白质组学（实验路线见下图a），研究对象为神经细胞系SK-N-BE2和NPC细胞，表征细胞对病毒的反应，在蛋白质组和磷酸化蛋白质组水平上的变化，利用亲和蛋白组学方法鉴定ZIKV蛋白的细胞靶点。使用这种方法，找到了386个与zikv相互作用的蛋白质，导致宿主在神经发育受损，视网膜缺陷和不孕。此外，确定了寨卡病毒感染后1216个磷酸化位点存在上调或下调，来自AKT, MAPK-ERK和ATM-ATR信号通路中，为防范ZIKV感染扩散提供机制基础。在功能上，系统地理解了ZIKV诱导后的宿主的蛋白质和细胞通路水平的扰动，并对感染后细胞施加Rock抑制剂药物干预,利用非标定量蛋白质组学方法分析差异蛋白进行验证（下图热图），补充这一空白。技术路线图案例三：Orbitrap技术深入探寻寨卡病毒病毒与宿主的相互作用Etienne Coyaud, et al. Molecular & Cellular Proteomics，2018,技术路线技术路线：本文利用生物素识别以及IPMS亲和纯化结合MS 方法，研究寨卡病毒侵染后病毒与宿主细胞蛋白质的相互作用（技术路线见上图），实验结果揭示了1224个蛋白3033多肽形成的相互作用网络（见下图a）。相互作用包括多肽加工和质量控制、囊泡方面的作用运输，RNA处理和脂质代谢。40%的 作用都是以新报道的相互作用。通过数据挖掘分析，揭示过氧化物酶体在ZIKV感染中的关键作用。病毒宿主蛋白相互作用网络图 温馨提示：积极防护 保护自己 戴口罩 勤洗手

蛋白质分析仪一种用于定量测定蛋白质含量的仪器，广泛应用于生物医学研究、药物开发和临床诊断等领域。检测精度是衡量蛋白质分析仪性能的重要指标，影响检测精度的因素有很多，本文将详细探讨这些因素及其对检测精度的影响。　　一、检测精度的基本概念　　检测精度是指仪器在测量过程中，测量值与真实值的一致程度。精度越高，说明测量结果越接近真实值。检测精度通常用相对误差、误差和标准偏差等指标来衡量。　　二、影响检测精度的主要因素　　1.仪器性能　　-蛋白质分析仪的性能直接影响其检测精度。仪器的分辨率、灵敏度、线性范围和稳定性等参数对其精度有重要影响。高质量的仪器通常具有更高的检测精度。　　2.操作规范　　-操作规范与否对检测精度有很大影响。操作人员需严格按照仪器的操作规程进行操作，确保每一个步骤都符合要求，避免因操作不当引起的误差。　　3.样品准备　　-样品的准备工作，如样品的采集、处理和储存等，对检测精度也有重要影响。样品的代表性、纯净度和稳定性等因素都会影响较终的检测结果。　　4.环境条件　　-环境条件，如温度、湿度、气压和振动等，对检测精度有显著影响。仪器在不同的环境条件下可能表现出不同的性能，因此需要在适宜的环境下使用仪器，以确保检测精度。　　5.校准与标定　　-定期校准与标定是确保仪器检测精度的重要措施。通过校准，可以消除仪器在使用过程中由于漂移、老化等因素引起的误差，确保测量结果的准确性。　　6.仪器维护　　-仪器的日常维护与保养对检测精度也有重要影响。定期清洁、检查和更换仪器的易损部件，可以延长仪器的使用寿命，保持其良好的工作状态，从而提高检测精度。 　　三、提高检测精度的方法　　1.选择高性能的仪器　　-根据具体的检测需求，选择性能优良、精度高的仪器，以确保检测结果的准确性。　　2.严格遵循操作规程　　-操作人员需经过专业培训，掌握仪器的操作要领，严格按照操作规程进行操作，避免因操作不当引起的误差。　　3.规范样品准备　　-样品的采集、处理和储存需按照相关标准和规范进行，确保样品的代表性和稳定性，避免因样品问题引起的误差。　　4.控制环境条件　　-在使用仪器时，尽量选择适宜的环境条件，避免在异常环境下使用仪器，以确保检测精度。　　5.定期校准与标定　　-定期对仪器进行校准与标定，消除仪器漂移、老化等因素引起的误差，确保仪器的测量精度。　　6.加强仪器维护　　-定期对仪器进行清洁、检查和维护，确保仪器处于良好的工作状态，延长其使用寿命，提高检测精度。　　总之，蛋白质分析仪的检测精度受多种因素的影响，通过科学合理的管理和操作，可以显著提高其检测精度和应用效果。在实际应用中，应根据具体情况，采取有效的措施，确保仪器的较佳性能和应用效果。

大家好，本周为大家分享一篇最近发表在Journal of The American Chemical Society上的文章，A Chemical Proteomic Map of Heme−Protein Interactions1。该文章的通讯作者是美国斯克利普斯研究所的Christopher G. Parker研究员。高铁血红素（heme）是人体中许多蛋白质的辅助因子，也是血液中氧气的主要转运体。最近的研究也证实了高铁血红素可以作为一种信号分子，通过与伴侣蛋白质结合而不是通过其金属中心反应来发挥其作用。然而，目前关于血红素结合蛋白的注释还不够完整。因此，本文采用化学蛋白质组学的方法去揭示人体中与高铁血红素发生互作的蛋白质谱。化学蛋白质组学是揭示蛋白质功能和发现药物靶标的重要工具。其中，最常用的是基于活性的蛋白质分析（Activity-based protein profiling，ABPP），通过结合活性分子探针标记及串联质谱分析，实现对靶标蛋白的鉴定。如图1b，本文设计了一个“全功能”活性分子探针（HPAP），共包含3个部分：1. Hemin母核，用于与靶蛋白非共价结合；2.光活化基团-双吖丙啶，可在UV光照下生成卡宾，促使分子探针与蛋白发生共价交联；3. 炔基，可在铜催化下与含有叠氮的试剂（荧光标签，生物素）发生点击化学反应，后两者组成FF-control。具体实验流程如下图1a所示，用HPAP处理不同细胞（In Situ）或不同细胞来源的蛋白质组（In vitro），HPAP中的hemin母核可与靶蛋白发生非共价结合，经UV光照，HPAP-蛋白间形成共价交联，再利用点击化学可将HPAP-蛋白与荧光素（TAMRA）或者生物素标签相连，用于后续的荧光成像（In-gel fluorescence）或者链霉亲和素纯化、LC-MS鉴别定量（MS-based I.D. and quantitation）。 图1. (a)使用基于高铁血红素的光亲和探针(HPAP)识别血红素结合蛋白的流程示意图。(b) HPAP、hemin和FF-control的结构；(c) HEK293T裂解物中与HPAP结合的蛋白的荧光成像；(d) hemin加入对HPAP与蛋白结合的影响。作者首先使用了SDS-PAGE去评估了HPAP标记蛋白的能力。如图1c所示，随着HPAP浓度的提高，胶图上条带颜色也逐渐加深，说明HEK293T细胞裂解液中与HPAP结合的蛋白在逐渐增加。如图1d所示，在10 μM HPAP的条件下，逐渐加入hemin，可以看到胶图上条带颜色逐渐变浅，说明hemin与HPAP之间发生了竞争，HPAP模拟了hemin与蛋白的结合过程。随后，作者又使用已知的hemin结合蛋白来确认HPAP捕获目标蛋白的能力。如图2所示，这些已知蛋白被HPAP成功的标记上，但由于hemin的加入，条带的颜色在逐渐变浅（TAMRA）。Western blot的结果显示，蛋白的总量并无太大变化，但hemin的竞争结合，导致与HPAP结合的蛋白量在下降。以上实验均说明，HPAP具有较好的选择性标记能力，能够模拟hemin与靶蛋白的结合，并以共价交联的方式标记在蛋白上。 图2. 用已知的高铁血红素结合蛋白确认HPAP捕获目标蛋白的能力。验证了方法的可行性后，作者将HPAP与定量蛋白质组学结合用于绘制高铁血红素-蛋白质互作谱。考察了多种细胞系，包括：人胚胎肾细胞（HEK293T）、人慢性髓系白血病细胞（K562）以及人原代外周血单个核细胞（PBMCs）。每种细胞系设置了两种实验形式：1）特异性结合实验（Enrichment）：通过将HPAP识别出蛋白与FF-Control识别出的蛋白进行对比，排除非特异结合的干扰（图1b），如果同一蛋白通过HPAP富集到的量是FF-control富集到的量4倍以上，则认为该蛋白是HPAP特异性结合蛋白。2）竞争性结合实验(Competition)：观察HPAP富集的蛋白在hemin和HPAP同时存在时富集到的量的变化，变化大于3倍且具有显著性差异（p＜0.05)的蛋白被认为是HPAP与hemin竞争性结合的蛋白。最终确定的高铁血红素结合蛋白应满足以上两种实验的筛选标准(图3a)。如图3b-d所示，总共鉴定出378个的高铁血红素结合蛋白，其中214个来自HEK293T, 182个来自K562, 107个来自PBMC。尽管三种细胞类型之间的结合蛋白有一些重叠，但大多数靶点蛋白只存在于一种或两种细胞类型中(图3b)，这暗示血红素在不同细胞中可能发挥不同的功能。其中，19个靶点蛋白是在UniProt上已经注释为高铁血红素的结合蛋白，剩余都是未揭示的结合蛋白。这些结合蛋白按照功能可划分为：转运蛋白，转录因子，支架蛋白和酶（图3c），根据代谢通路又可进一步划分（图3d）。作者最后对几个新发现的结合蛋白进行了验证，并选择IRKA1进行进一步的作用机制研究。IRKA1在调节炎症信号通路中起着关键作用，IRAK1被IRAK4磷酸化，然后自磷酸化，产生NFkB介导的炎症反应。经实验确认（图4），hemin是IRKA1的一种变构活化配体，可增强其酶活性，促进IRAK1的自磷酸化。 图3. 基于蛋白质组学的HPAP-蛋白互作分析。 图4. Hemin对IRKA1的调节作用。总之，本文设计开发了一种基于高铁血红素的光亲和探针，它可以与化学蛋白质组工作流程结合，以识别不同蛋白质组中的高铁血红素结合蛋白。利用该方法也可拓展至其他分子配体靶标蛋白的识别。 撰稿：刘蕊洁编辑：李惠琳原文：A Chemical Proteomic Map of Heme-Protein Interactions参考文献1. Homan, R. A., Jadhav, A. M., Conway, L. P., & Parker, C. G. (2022). A Chemical Proteomic Map of Heme-Protein Interactions. Journal of the American Chemical Society, 144(33), 15013–15019.

奥维尔多大学成功使用Thermo Scientific ICP-MS可靠且高效地测定蛋白质中的硫元素 英国剑桥 (2011年1月13日) — 全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技今日宣布，奥维尔多大学光谱分析研究组成功使用Thermo Scientific XSERIES 2 ICP-MS实现蛋白质中硫元素的测定，结果可靠且避免了干扰。一直以来，气态多原子对硫同位素的准确测定带来的干扰是令研究组特别困扰的问题。而XSERIES 2 ICP-MS成功攻克了这些难题，在提供高精度分析结果的同时优化了分析效率。位于西班牙阿斯图里亚斯的奥维尔多大学光谱分析研究组致力于解决科学技术研究中遇到的分析难题。在这个框架下个所成立的一个二级小组专注于研究采用电感耦合等离子体质谱法(ICP-MS)用于生物高分子（如DNA和蛋白质）定量分析的方法进展。该小组面临的主要问题之一就是在使用低分辨仪器测定硫元素时气态多原子（比如氧气）带来的干扰。为了消除这些问题，该小组选择使用碰撞/反应池(CRC)技术的Thermo Scientific XSERIES 2 ICP-MS。蛋白质的定量分析是目前分析化学领域要求最严格的应用之一。传统的质谱技术如电喷雾质谱 (ESI-MS)和基质辅助激光解吸质谱(MALDI-MS)，一直在蛋白质分析中发挥着关键作用。而ICP-MS用于蛋白质测定的潜力最近才被发掘。尽管ICP-MS的检测结果不提供任何关于结构方面的信息，但它对大多数元素都具有优越的定量能力，为蛋白质的准确测定带来极大价值。为了与最新科技发展保持一致，奥维尔多大学的研究小组将XSERIES 2 ICP-MS与一台反相毛细管液相色谱仪(μLC)进行联用，准确测定了标准蛋白质中的硫同位素。奥维尔多大学光谱分析研究组的Jö rg Bettmer博士说：“选择Thermo Scientific XSERIES 2 ICP-MS，是因为除它以外没有四级杆质谱仪能够在准确性、可靠性和整体性能等方面满足要求。这次的成功应用使我们实现了硫同位素的测定，结果可靠且无干扰。拥有该系统，我们得以准确高效地检测含硫的标准蛋白质，这在以前是不可能实现的。”基于四级杆技术的XSERIES 2 ICP-MS为常规分析和高性能分析应用提供了卓越的效率。操作人员能够更快地实现分析目标，获取置信度更高的实验结果，而所需操作时间更少。仪器创新的离子透镜设计能将简单磁场升级为碰撞池技术(CCT)的性能，不影响正常的（非CCT模式）灵敏度或背景。碰撞池可以匹配多种反应气，例如匹配纯氧气以抑制复杂基体的干扰。 欲了解更多关于Thermo Scientific XSERIES 2 ICP-MS信息，请拨打电话：800-810-5118，400-650-5118，邮件：sales.china@thermofisher.com, 或访问网站：www.thermo.com.cn 关于赛默飞世尔科技赛默飞世尔科技（纽约证交所代码： TMO）是科学服务领域的世界领导者。我们致力于帮助我们的客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年销售额超过 100 亿美元，拥有员工约35,000人。主要客户类型包括：医药和生物技术公司、医院和临床诊断实验室、大学、科研院所和政府机构，以及环境与工业过程控制行业。借助于Thermo Scientific 和 Fisher Scientific 两个首要品牌，我们将持续技术创新与最便捷的采购方案相结合，为我们的客户、股东和员工创造价值。我们的产品和服务有助于加速科学探索的步伐，帮助客户解决在分析领域所遇到的从复杂的研究项目到常规检测和工业现场应用的各种挑战。 欲了解更多信息，请浏览公司网站：www.thermofisher.com 或中文网站：www.thermo.com.cn，www.fishersci.com.cn。

纳米天线工作示意图　图片来源：物理学家组织网　　据物理学家组织网2022年1月10日报道，加拿大蒙特利尔大学科学家在最新一期《自然方法》杂志上撰文称，他们利用DNA，制造出了一种5纳米长的天线，这种天线可用于监测蛋白质结构随时间如何变化（当蛋白质发挥生物功能时会产生独特的信号），有望在生物医药等多领域“大显身手”。　　该研究资深作者、加拿大生物工程和生物纳米技术研究主席亚历克西斯瓦雷-贝利斯勒说：“近年来，化学家们意识到，DNA可以用于构建各种纳米结构和纳米机器。DNA可以像乐高一样组装，受此启发，我们制造出了这种基于DNA的荧光纳米天线，它可以帮助我们描述蛋白质的功能。”　　他解释道：“就像双向无线电既能接收也能发射无线电波一样，我们制造出的荧光纳米天线可以接收一种颜色（波长）的光，并根据它感应到的蛋白质运动，以另一种颜色将光发射回来，通过检测反射光，我们可以了解蛋白质的运动情况。”　　研究第一作者、蒙特利尔大学化学博士生斯科特哈伦解释道，使用DNA设计纳米天线的主要优势之一是，DNA相对简单且可编程，可用其制造出不同长度的天线，而且，研究人员很容易让荧光分子与DNA相连，然后将这种荧光纳米天线与生物纳米机器（如酶）相连。　　研究人员表示，这种天线有望在生物化学和纳米技术等诸多领域“大显身手”。哈伦说：“我们能在它的帮助下，首次实时检测到碱性磷酸酶的功能，这种酶与癌症和肠道炎症等许多疾病有关。此外，还可以帮助化学家识别有前途的新药，并指导纳米工程师开发更好的纳米机器。”　　瓦雷-贝利斯勒强调：“这种纳米天线很容易使用，世界各地的许多实验室可以很方便地利用它们来研究蛋白质，识别新药或开发新的纳米技术。我们计划成立一家初创公司，将这种纳米天线商业化，并将其提供给研究人员和制药行业。”

元胡止痛片，为理气剂，由延胡索和白芷组成，为临床常用经方，具有理气，活血，止痛之功效。主气滞血瘀所致的胃痛，胁痛，头痛及痛经。 方中延胡索辛散温通，既善于活血祛瘀，又能行气止痛，为本方之君药。白芷辛散温通，长于祛风散寒，燥湿止痛，为本方之臣药，助延胡索活血行气止痛。全方合用，共奏理气，活血，止痛之功。中国药典2020版一部中，对元胡止痛片中延胡索和白芷的含量测定分别进行了规定，文中按中国药典的方法，用月旭Ultimate® LP-C18进行测定，符合药典要求，能满足检测需求。 01 色谱条件醋延胡索中延胡索乙素的测定流动相配置0.6%冰醋酸溶液：取水1000ml，加入冰醋酸6ml，用三乙胺调节pH至6.0，抽滤，用冰醋酸/三乙胺将pH调至6.0，摇匀，超声脱气，即得。谱图和数据延胡索乙素对照品溶液图02 色谱条件白芷中欧前胡素的测定 色谱柱：月旭Ultimate® LP-C18（4.6×250mm，5μm）；流动相：乙腈/水＝47/53（在线混合）；检测波长：300nm；柱温：30℃；流速：1.0ml/min；进样量：20μL。谱图和数据欧前胡素照品溶液图结论使用月旭Ultimate® LP-C18（4.6×250mm，5μm），在该色谱条件下进行测定，可以达到检测需求，可用于元胡止痛片中醋延胡索和白芷的含量检测。

蛋白质组创新团队主要成员钱小红和应万涛正在实验室交流。 　　新华网消息：今年初，在国家科技奖励大会闭幕之际，记者慕名来到世界知名的科技&ldquo 硅谷&rdquo &mdash &mdash 北京中关村生命科学园，探访军事医学科学院蛋白质组学创新团队。园区内正在兴建的&ldquo 凤凰工程&rdquo &mdash &mdash 我国生命科学领域投资最大的基础设施。顺着环形道路向北步行200米左右，能见到一座坐西朝东、棕红色、斜切式、平卧地面的U形建筑，那正是记者要去的北京蛋白质组研究中心。U形建筑的西侧，耸立着一个高大的红色立体造型&ldquo P&rdquo ，这是蛋白质组学的首个英文字母。正面墙上，嵌着银色&ldquo proteome&rdquo (蛋白质组），这是人类历史上第一次将诞生仅十年的&ldquo proteome&rdquo 词汇镶入建筑物的墙中，形成国际上众多蛋白质组大师留影的背景。 　　U形建筑的中央，是一个长方形的荷花池，别有情趣。在夏天，沿着U形开口的方向，能够看到柳叶飞扬，芦苇飘香，流水潺潺，波光粼粼，候鸟栖息，鱼儿戏水的美景。那是科学家们心中的&ldquo 凤鸣湖&rdquo 。 　　步入中心大厅，记者看到，墙壁上挂满了相关领域世界著名科学家的照片和成就介绍。楼上楼下的实验室十分洁净，整齐划一，许多世界一流的实验设备在这里紧张运行。 蛋白质组创新团队带头人之一杨晓明课题组。 　　梦想，瞄准最浩瀚的&ldquo 生命海洋&rdquo 　　生命是地球孕育的奇迹。 　　蝴蝶从卵变虫、成蛹、化蝶，变幻诡异。让科学家们意想不到的是，其幕后操盘者竟是蛋白质组，而非基因组。 　　&ldquo 今天的人类文明已经高度发达，但实际上，生命现象就像一个浩瀚的太平洋，而我们迄今仍在渤海湾里探索。&rdquo 作为团队带头人之一的杨晓明研究员说。 　　2003年，记录人类生命&ldquo 天书&rdquo 的基因组计划宣告完成，但&ldquo 蝴蝶迷案&rdquo 更加扑朔。全球科学家愈来愈意识到一项更艰巨、更宏大的任务&mdash &mdash 解读&ldquo 天书&rdquo ，即基因组功能的阐明已经摆在面前。人类经过百年跋涉，重返近代生命科学的发源地之一：蛋白质。这不仅关注个体，而是全面揭示数以万计的整体。 　　1838年，荷兰科学家发现了蛋白质。这是生物体内一种极为重要的高分子有机物，占人体干重的54%。&ldquo 蛋白质组&rdquo 一词，1995年最早由澳大利亚科学家正式提出，其含义是指一个基因组、一种生物或一种细胞组织所表达的全套蛋白质。 　　&ldquo 1998年初，我在科学海洋里寻觅更有效的研究工具与策略。机缘巧合之下，敏锐地关注到刚刚出现的蛋白质组学，并逐渐把精力投入到这个新兴领域。&rdquo 国际人类蛋白质组计划的奠基人和开拓者之一、中国科学院院士贺福初介绍说。 　　蛋白质是基因的编码产物，科学家将它们的关系，比作建筑材料与设计图纸。就人体而言，基因组固定，蛋白质组就能变幻出形态、功能各异的不同器官。由此可见，蛋白质组对进一步阐释&ldquo 生命天书&rdquo 的重要性不言而喻。 蛋白质组创新团队主要成员之一张成岗课题组。 　　拼搏，为中国科学开辟&ldquo 新天地&rdquo 　　井冈山，被誉为&ldquo 红色摇篮&rdquo 。毛泽东领导的工农红军在这里开辟了&ldquo 农村包围城市&rdquo 的新道路。 　　明朝的闭关锁国政策，让领跑数千年的中国迅速落后于世界。当新兴的全球科技浪潮再次袭来，中国将如何应对？ 　　2002年4月，人类蛋白质组计划开始孕育。贺福初院士在华盛顿筹备会议上提出了&ldquo 两谱两图三库&rdquo 的研究策略，阐述了人类肝脏蛋白质组计划暨&ldquo HLPP蓝图&rdquo ，打动了各国与会学者。他们接受邀请，来到北京香山继续研讨。2002年11月，第一届国际人类蛋白质组学大会在五四运动爆发的源头&mdash &mdash 法国凡尔赛召开，40岁的贺福初院士在这里当选为&ldquo HLPP&rdquo 首任执行主席，成为该领域全球科研大军统帅。时任国家科技部部长徐冠华说，这是首次由我国科学家牵头负责的重大国际合作计划。 　　&ldquo 酝酿之初争议非常大。&rdquo 贺福初院士回忆到。&ldquo 2002年，在华盛顿，论证中我们提出：蛋白质组计划必须按生物系统（如器官、组织、细胞）进行一种战略分工和任务分割。否则，就是一盘散沙。这个策略从华盛顿争到凡尔赛，争到蒙特利尔，然后再争到北京，后来是德国慕尼黑，一直在争。可现在，国际上不少科学家已逐步按照这个方式进行了。&rdquo 　　历史必将铭记，在华盛顿会议上，中国学者的发言激起了千层浪，来自世界各国的科学家议论纷纷，有赞赏、有疑惑、更有激辩，唯独没有无动于衷！军事强调服从，但科学包容争议。事实证明，中国科学家在蛋白质组学领域最终赢得国际尊重和广泛支持。 　　借助国际计划的东风，经过10多年发展，目前该团队已经拥有2位中国科学院院士，1位发展中国家科学院院士，5位入选国家&ldquo 千人计划&rdquo 、&ldquo 万人计划&rdquo 科学家，3位何梁何利奖获得者，7位国家973项目首席科学家，7位&ldquo 国家杰出青年基金&rdquo 获得者，6位中国青年科技奖获得者，20人次被军地评为科技金星、银星、新星，成为蛋白质组学领域中具有显著国际竞争力的精锐之师。3位科学家分别当选党的十六大、十七大、十八大全国代表；2人获全国百篇优博。 　　团队成员先后在《自然》《细胞》系列子刊及《科学》等国际顶级刊物上发表文章280余篇，影响因子合计1600余。2006年，他们荣获&ldquo 首届全军优秀科技群体&rdquo ，并于2004年－2009年获得国家自然基金委创新群体基金的连续资助，刚刚又获得了2013年度国家科技进步奖创新团队奖。团队带头人贺福初院士成为中国蛋白质组学的奠基人与开拓者，担任国际人类蛋白质组计划执委（全球8位），并当选为亚太人类蛋白质组组织主席。 　　2009年，该团队在国际蛋白质组学领域最权威杂志一期刊登3篇文章，创同一单位同期刊发数全球最高纪录。2011年，他们又在《自然》子刊连发两篇重大成果，引起广泛关注。2012年2月1日，《新闻联播》用1分11秒的时间播发张令强课题组联合香港、深圳专家在骨质疏松症治疗领域取得重大突破并在线发表于《自然医学》的好消息。2012年5月，《人类肝脏蛋白质组计划10周年专著》正式发表，这是世界上首次以大百科全书的方式出版人类组织器官的蛋白质组专著。 　　据统计，2010年底，贺福初院士课题组在蛋白质组学领域发文影响因子及引用累计排名跃居全球第4位；2012年4月《自然》出版集团宣布，张学敏院士课题组在《自然》系列刊物年度发文数位居亚洲所有高校、科研机构前50名。此外，该团队还获得国家自然科学二等奖4项、国家科技进步二等奖3项，省部级一等奖7项。包括诺贝尔奖获得者、美国总统首席科学顾问等在内的数百名国际知名专家纷纷到中心访问交流，寻求合作；在《科学》和《自然》等世界顶级刊物进行系列专题报道。 　　在军事医学科学院党委的大力支持下，该团队在人才队伍建设上不断探索，创立了&ldquo 固定+流动&rdquo 的用人机制、&ldquo 哑铃+候鸟&rdquo 的引智机制、&ldquo 聚变+裂变&rdquo 的育才机制。他们借助中组部&ldquo 千人计划&rdquo 、北京市&ldquo 海聚工程&rdquo 等政策，诚邀7名海外专家和国内200多位同行加盟，逐步建立了&ldquo 开放、流动、联合、竞争&rdquo 的高效运行机制，实践形成了&ldquo 求实、创新、卓越、和谐&rdquo 的团队精神，为军队实施国际化的科研战略担当起&ldquo 试验田&rdquo 。 蛋白质组创新团队主要成员之一张令强课题组。 　　深度，探底&ldquo 将军之官&rdquo 　　&ldquo 肝者，将军之官。&rdquo 　　此段文字出自中国最早一部生命百科全书《黄帝内经》。 　　肝脏是人体的&ldquo 发电厂&rdquo 、&ldquo 化工厂&rdquo ，是免疫系统的&ldquo 摇篮&rdquo 、血液的&ldquo 源泉&rdquo 。肝脏相当于人体的&ldquo 国防总部&rdquo ，但因&ldquo 将军&rdquo 负担过重，其疾病同样触目惊心，仅中国就有9300万不同程度的肝病患者，综合治疗费用高达9000亿元。 　　&ldquo 如果以人类主要的150种疾病进行计算，大约有3000&mdash 15000种蛋白质具有成为药物靶标的可能，迄今用到的只有总量的1/30到1/6。&rdquo 团队主要成员周钢桥介绍说。究其原因，如同钓鱼那样，一般浅水鱼很容易钓到，而深水鱼很难甚至根本钓不到。 　　&ldquo 蛋白质组学技术的强大能力使其能竭泽而渔，就像把三峡水库彻底放干，常常漏网的小鱼、小虾、螃蟹、泥鳅、黄鳝等，尤其是深水中暗藏的大鱼，都将全部抓住一样，自然给制药界带来巨大前景。&rdquo 团队主要成员杨晓介绍说。 　　工笔是国画的一种技法，以细腻深入、生动全面著称。该团队采用工笔手法，描绘了整个肝脏数以万计的蛋白质分子群落的&ldquo 社会生活&rdquo 状况，这幅历史巨卷，同样为无数国际同行所折服，并在其它组织器官的蛋白质组研究中所借鉴和效仿。 　　2002年以来，围绕&ldquo 肝脏计划&rdquo 的全面执行，中国科学家领衔全球10余个国家和地区的100多个实验室共同展开了一幅壮丽画卷。目前，已经初步揭示了人类肝脏蛋白质组的整个&ldquo 太阳系&rdquo ，系统解析出一组、两谱、三图、三库&mdash &mdash 九大&ldquo 行星&rdquo ；鉴定蛋白质13000余种；构建了高可信肝脏蛋白质相互作用网络图；建立了人体首个器官蛋白质组数据库；发现了脂肪肝、肝细胞病毒感染、癌变以及转移相关的蛋白质标志物群、潜在药靶和候选药物；寻找到了一批与肝炎、肝癌等复杂疾病相关的易感基因。 　　鉴于中国的重要贡献，数位诺贝尔奖获得者、国际蛋白质组组织的历任主席等纷纷给予高度评价；该领域顶级权威期刊《分子细胞蛋白质组学》向世界专栏介绍中国的成就；国际蛋白质组学核心刊物《蛋白质组学》和《蛋白质组研究》分别出版中国蛋白质组学专刊和人类肝脏蛋白质组计划专刊，全面介绍中国在此领域的成就。 蛋白质组学的未来&mdash &mdash 朱云平研究员正在给研究生讲解建设中的&ldquo 凤凰工程&rdquo 。 　　广度，向着&ldquo 登月之旅&rdquo 前进 　　2013年12月2日，全球瞩目的&ldquo 嫦娥三号&rdquo 踏上了登月之旅，&ldquo 玉兔&rdquo 的一小步，极大地增强了军事医学科学院蛋白质组学创新团队追求宏伟梦想的信心和勇气。早在创建之初，贺福初院士就将&ldquo 人类蛋白质组计划&rdquo 比喻为生命科学的&ldquo 登月之旅&rdquo ，激励更多的年轻人为之奋斗。 　　如果在十几年前提到蛋白质组学，恐怕知之者甚少，从事其研究者更是寥若星辰。但是，随着经济的迅速增长和开始建设创新性国家，政府逐步倾力推动基础科学发展。 　　1998年，我国第一个蛋白质组重大项目获得批准，从此拉开了该领域蓬勃发展的序幕。以贺福初、钱小红研究员为代表的一批科学家率先探索，成为我国蛋白质组学事业的先行者。 　　21世纪初，国家陆续启动了蛋白质组学首个973项目以及&ldquo 中国人类肝脏蛋白质组计划&rdquo ，这个新兴领域的星火已燎原于九州，逐渐从一支独秀发展成群雄并起、全国争锋的喜人形势。同时，数十位中国科学家开始担任国际组织领导、理事以及权威期刊编委，我国在该领域的世界话语权日益巩固。 　　山水之作，云雾染意，青松铸魂。 　　10多年来，在该团队的努力推动下，中国蛋白质组学研究朝气蓬勃，墨润之地，日新月异。从最初以建立技术平台，开展技术方法的研究、整合为主，到以高通量蛋白质组学研究技术平台为基础，深入研究关系我国人民健康的重大疾病问题和重要生命科学问题，在多个领域方向取得国际瞩目的突破性进展。&ldquo 在新兴的生命科学学科里，蛋白质组学是发展最快、成效最显著的领域之一。&rdquo 国家自然科学基金委生物学部原主任强伯勤曾这样评价。 　　在这幅山水巨卷中，中国科学家用线条一笔一笔勾勒描绘的青松已经漫山遍野，风声呼啸。近4年来，中国在该领域发文量直线上升，紧追美国，成就位居全国其他学科前列。 　　目前，随着研究工作的日积月累，深埋的&ldquo 石油&rdquo 开始井喷。发展和完善了一批具有自主知识产权的蛋白质组新技术新方法，技术能力成百上千倍地大幅提升，在国际蛋白质组学技术测评中名列前茅；筛选到一批与重大疾病防诊治相关的候选蛋白质标志物群、潜在药靶和候选药物，有望显著提高我国人群健康水平，大力推动生物医药的快速发展；制定一系列数据标准、开发新算法新软件，并逐渐为国际同行所采纳。 　　&ldquo 在人类蛋白质组计划中，我们抓住了机遇，一些领域和成果走在了世界前列，但整体水平仍有待提高。&rdquo 团队主要成员钱小红如是评价。据文献统计显示，与丹麦44.24、美国26.65的蛋白质组研究论文平均引用次数相比，我国在该领域发表成果的数量虽多，但9.48的篇均引用水平与欧美最高水平尚有差距。 　　&ldquo 成绩属于过去，未来任重道远。&rdquo 军事医学科学院高福锁政委说，&ldquo 在未来实现中国梦、强军梦的过程中，我们将以党的十八大提出的创新驱动发展战略为牵引，以刚刚获得的2013年度国家创新团队奖为新的起点，从零开始，埋头苦干，以更大的信心和勇气攀登世界科技高峰，为国家生物安全提供更好的技术支撑，为人类生命科学的蓬勃发展做出更大的创新贡献！&rdquo

蛋白质保存影响冷冻干燥配方的关键因素冻干应用”用于生物制药的蛋白质和多肽的冷冻干燥是一个复杂的过程，存在许多挑战。在这篇文章中，我们会讨论了影响配方冷冻干燥的关键因素，来确保蛋白质的保存。冷冻干燥配方通常经过精心设计，以保持燥材料的完整性、稳定性和生物活性。这对于药品、生物制药或某些食品等敏感材料尤为重要。生物制药冷冻干燥的原因有很多，它们可能在液态下不稳定或有严格的储存要求。冷冻干燥非常适合不需要进一步加工的产品，因为它们可以在小瓶中干燥并在加工后立即密封以避免污染。生物制药制剂由提供所需效果的活性成分（例如蛋白质或多肽），为了保持其生物活性，需要添加称为赋形剂（成分）的其他物质，从而形成一种非常适合冷冻干燥的组合物。用于生物制药制剂的辅料清单填充剂：甘露醇、蔗糖或乳糖等材料可增加体积并有助于形成稳定的基质。冷冻保护剂：甘油或二甲基亚砜 （DMSO） 等物质，可保护活性成分免受冷冻应激。石松保护剂：它们在干燥阶段保护活性成分，包括蔗糖或海藻糖等糖。稳定剂：有助于保持配方的pH值和离子强度的缓冲液等成分。表面活性剂：这些用于稳定蛋白质和其他敏感分子的聚集。防腐剂：如果产品容易受到微生物生长的影响，则保护产品。溶剂：溶剂的选择至关重要，通常使用水。在特殊情况下，也可以使用有机溶剂。辅料的选择取决于多种因素。就像某些植物需要特定类型的堆肥或土壤一样，生物制药的活性成分需要正确的配方才能茁壮成长。尽可能多地了解要冷冻干燥的材料的性质是很重要的，包括它在不同条件下的稳定性和冷冻干燥产品的预期用途。就像在我的花园里一样，在准备土壤之前，我需要了解我正在种植的植物或种子的类型。辅料的选择取决于多种因素。对于蛋白质而言，它们的长期稳定性与制剂的含水量及其构象结构有关。蛋白质需要水来避免变性，在选择蛋白质溶剂时应小心。此外，应使用海藻糖等保护剂来稳定分子，以帮助其保持其功能活性。问成功冻干的关键化合物特性是什么？答热特性有多种分析方法可用于确定化合物特性，例如差示扫描量热法 （DSC）、傅里叶变换红外光谱法（FTIR）等。为了成功冻干，需要了解目标蛋白质或多肽的热特性。DSC是评估蛋白质和多肽热稳定性的强大技术。它测量与材料相变相关的热流作为温度的函数。量热法可以为实验者提供配方的重要特性，如：玻璃化转变温度，Tg：非晶态材料转变为玻璃（脆性）状态的温度。在冷冻干燥中，在初级干燥过程中将产品保持在Tg以下以保持结构和稳定性至关重要。熔点，Tm：固体物质变成液体的温度。在冷冻干燥中，必须了解Tm，以避免在过程中熔化，以保持产品的完整性。结晶温度，Tc：溶质在冷冻过程中结晶的温度。如果不希望结晶，则必须避免此温度。反应热，ΔH：与化学反应相关的热变化。了解 ΔH 有助于预测和控制相变期间所需或释放的热量，确保冷冻、初级干燥和二级干燥阶段之间的平稳过渡。比热容，Cp：将单位质量物质的温度改变一摄氏度所需的热量。Cp 至关重要，因为它有助于确定需要供应或去除的热量，以实现所需的温度变化，确保高效和有效的干燥。另一种分析技术是冻干显微镜，它有助于确定塌陷温度（用Tc表示）。这是产品结构在干燥阶段开始塌陷的温度。了解 Tc 对于设置适当的货架温度以避免 Tg 和 Tm 至关重要。了解会影响热特性的几个因素缓冲液：这会影响热稳定性。将pH值保持在接近蛋白质等电点的缓冲液可增强稳定性。蛋白质或多肽的浓度：也会影响热稳定性。因此，在代表最终产品的浓度下进行热表征非常重要。扩大工艺规模：由于浓度不同，这可能需要重新评估热特性。辅料：还必须考虑辅料对所列热特性的影响。问如何优化冷冻阶段？答使用乙醇混合物进行快速冷冻是首选冻结速率和最终冻结温度会影响冰晶的形成和大小，进而影响升华速率。产品必须在足够低的温度下冷冻，以确保其完全冷冻。这个冷冻阶段创造了蛋白质将被嵌入的结构。如果这不正确，蛋白质将失去其活性并被锁定在错误的构象中或失去其完整性。对于蛋白质和多肽，最好储存在 -80℃ 下，因此不建议在 -20℃ 下缓慢冷冻。使用乙醇混合物进行快速冷冻是首选，因为它会导致形成更小的冰晶，这有利于维持蛋白质的稳定性。问影响干燥阶段的关键因素是什么？答终点测定在处理蛋白质和多肽时，干燥阶段至关重要。太快或太慢，要么会破坏蛋白质结构，要么最终得到不充分干燥的产品。初级干燥是最长的阶段，我们必须设置适当的腔室压力和货架温度。设置系统压力的最佳方法是使用热电偶或其他温度探头确定产品温度，然后找到该温度下相应的冰蒸气压。终点测定对于确保所有冰都已从产品中升华非常重要，因为残留的水分会影响稳定性和保质期。另外，不要不必要地延长干燥阶段，因为它既不节省成本，也不节能，甚至有可能导致产品损坏。终点测定的方法多种多样，包括温差测试（样品和货架之间）、压差测试和压升测试。BUCHI 冻干机BUCHI 冻干机搭载 Infinite TechnologyTM，具备丰富实验室蒸发经验，精巧灵活高性能，模块化的配置，且可以通过实施自动终点测定来自动确定终点。这种跟踪干燥过程的过程分析技术允许实时调整，从而加快优化过程。自动终点确定为监控过程可重复性提供了必要的工具，确保了批次之间的一致性。终点测定的使用可防止过早过渡到后续干燥阶段，从而确保最佳干燥结果。初级干燥后，由于水分子紧密结合，通常有 5-10% 的残余水分含量；因此需要二次干燥。目标是使结合的水汽化，这通常是在较低的压力和较高的温度下完成的。然而，如果温度过高，可能会导致蛋白质或多肽的降解。二次干燥对于确保稳定性和保质期很重要。虽然蛋白质在干燥过程中会变得不稳定（变性），但只要折叠机制是可逆的，蛋白质就可以完全复叠（复性），并且在复溶后仍显示出药物稳定性。

随着高通量、高灵敏度、高分辨率生物质谱技术的出现，蛋白质组学技术取得飞速发展，蛋白质组学（Proteomics）是蛋白质（protein）与 基因组学（genomics）两个词的组合体，表示“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学研究，就是要把一个基因组表达的绝大多数蛋白质或一个复杂的混合体系中绝大多数蛋白质进行精确的定量和鉴定。蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。蛋白质组学研究主要包括蛋白质分离、鉴定与生物信息学分析，其中样品中蛋白质的分离至关重要，会直接影响后续的分析结果。对比传统的柱层析分离方式，磁珠法提取蛋白质能轻松实现高通量和多样品平行处理。磁珠法提取蛋白质与提取核酸原理类似，都需经过“结合-洗涤-洗脱”等过程，蛋白纯化后，还需经过裂解、二硫键还原、酶解等多步预处理才能将蛋白样品裂解为可检测的肽段，这些过程同样涉及多次移液、加热、震荡等步骤。Vitae 100全自动液体处理工作站● 睿科Vitae 100全自动液体处理工作站整合移液、磁吸、震荡、加热功能于一体，可全自动完成磁珠法蛋白纯化，可替代蛋白酶解实验过程中大部分手工操作，实现高通量、高效率、高一致性的蛋白纯化。Vitae 100配置了可选4或8通道的空气注射泵移液器，机械定位准确至0.05mm，高通量提取时准确性、均一性均优于手工操作。另外Vitae 100创新性的整合了“磁吸-加热-震荡”三合一模块，节省盘面空间，减少移液步骤，利用自动化操作来减少人为实验操作带来的误差，提升实验结果的稳定性，减少污染的可能性，同时利用自动化精准的时间控制和操作，来优化实验流程，提高实验室运行效率。▲蛋白质组学自动化前处理解决方案睿科生化科技公司睿科生化科技公司是睿科集团旗下专注研发生产生命科学领域样品前处理设备的高科技企业。公司提供自动化的生物样品前处理设备，服务于生物/药物分析、分子诊断、临床检测、蛋白组学、代谢组学等领域。公司核心团队拥有10多年丰富的行业经验，掌握自主核心技术，系统化架构和集成式开发，可提供灵活的定制化服务，为客户提供个性化的产品和服务。

【山东云唐*新品推荐YT-Z12T】云唐仪器|食品蛋白质检测仪可快速准确检测奶粉中蛋白质含量→点击此处进入客服在线咨询优惠专区。山东云唐专业厂家自主研发生产农药残留检测、食品安全检测、植物生理等仪器仪表，品质保障，价格实惠，售后无忧，欢迎新老客户来电咨询!山东云唐智能让诚信为高质量发展护航，我们将努力提供更卓越的产品质量和更人性化的售后服务给广大客户，为社会创造更大的价值。云唐仪器|食品蛋白质检测仪可快速准确检测奶粉中蛋白质含量　　随着科技的不断发展，食品蛋白质检测仪在食品安全检测领域发挥着越来越重要的作用。其中，对于奶粉中蛋白质含量的快速准确检测，食品蛋白质检测仪更是扮演着至关重要的角色。本文将详细介绍食品蛋白质检测仪的工作原理、优势及其在奶粉蛋白质含量检测中的应用。　　食品蛋白质检测仪在奶粉蛋白质含量检测中具有显著的优势。首先，它大大提高了检测效率。相较于传统的检测方法，如Kjeldahl法、Lowry法等，食品蛋白质检测仪能够在短时间内完成大量样品的检测，从而满足现代化生产线上对奶粉质量监控的需求。其次，仪器具有高度的准确性。通过精确的光电测量和荧光检测技术，食品蛋白质检测仪能够确保测量结果的准确性，避免因人为因素或操作不当导致的误差。此外，食品蛋白质检测仪还具有操作简便、自动化程度高等特点，使得检测过程更加便捷高效。　　在奶粉蛋白质含量检测中，食品蛋白质检测仪的应用具有重要意义。奶粉作为婴儿成长发育的重要营养来源，其蛋白质含量直接影响到婴儿的健康状况。因此，对奶粉中蛋白质含量的准确检测显得尤为重要。食品蛋白质检测仪能够快速、准确地检测出奶粉中的蛋白质含量，为奶粉生产厂家提供及时、可靠的质量监控手段。同时，对于消费者而言，了解奶粉中蛋白质的含量有助于他们选择合适的奶粉产品，为婴儿的健康成长提供保障。　　此外，食品蛋白质检测仪还可以用于奶粉生产过程中的质量控制。在奶粉生产过程中，通过定期对原料、半成品和成品的蛋白质含量进行检测，可以及时发现生产过程中的问题，采取有效措施进行调整和改进，确保奶粉产品质量的稳定性和可靠性。同时，食品蛋白质检测仪还可以用于奶粉产品的批次管理和追溯，确保产品的质量和安全可追溯。　　总之，食品蛋白质检测仪在奶粉蛋白质含量检测中发挥着重要作用。它不仅能够提高检测效率和准确性，为奶粉生产厂家提供及时、可靠的质量监控手段，还能为消费者选择合适的奶粉产品提供有力支持。随着科技的不断进步和食品安全意识的提高，食品蛋白质检测仪将在食品安全检测领域发挥更加重要的作用，为保障人们的饮食安全贡献力量。

瓜氨酸化是影响蛋白质结构和功能的关键的翻译后修饰。尽管它与各种生物过程和疾病发病紧密相关，但由于缺乏有效的方法来富集、检测和定位该翻译后修饰，其潜在机制仍然知之甚少。近期，威斯康星大学麦迪逊分校李灵军教授课题组报道了生物素硫醇标签的设计和开发，该标签能够通过质谱法对瓜氨酸化进行衍生化、富集来实现可靠的鉴定。作者对小鼠组织的瓜氨酸化蛋白质组进行了全局分析并且从432种瓜氨酸化蛋白质中识别出691个修饰位点，这是迄今为止最大的瓜氨酸化数据集。作者发现并阐述了这个翻译后修饰的新的分布和功能并且表示该方法有希望为进一步破译瓜氨酸化的生理和病理作用奠定基础。这项工作以“Enabling Global Analysis Of Protein Citrullination Via Biotin Thiol Tag-Assisted Mass Spectrometry”为题发表在国际化学权威杂志Analytical Chemistry上 (https://doi.org/10.1021/acs.analchem.2c03844)，文章作者为Yatao Shi#, Zihui Li#, Bin Wang#，Xudong Shi , Hui Ye, Daniel G. Delafield, Langlang Lv, Zhengqing Ye, Zhengwei Chen, Fengfei Ma，Lingjun Li*。此外，李灵军教授课题组进一步拓展了此方法的实用性。作者通过应用二甲基化亮氨酸(DiLeu)等重标记策略第一次实现了瓜氨酸化的高通量定量研究，并利用这一方法揭示了瓜氨酸化在人体细胞DNA损伤及修复过程中的重要作用。相关成果以“12-Plex DiLeu Isobaric Labeling Enabled High-Throughput Investigation of Citrullination Alterations in the DNA Damage Response”为题同样发表在Analytical Chemistry上(https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c04073)，文章作者为Zihui Li, Bin Wang, Qinying Yu, Yatao Shi, Lingjun Li*。　　研究的主要内容　　作者设计了一种生物素硫醇标签，它可以很容易的以低成本合成并且可以与瓜氨酸残基和2,3-丁二酮发生特异性反应(图 1a)。这种衍生化不仅增加了质量转移以允许更可靠的鉴定，而且还引入了生物素部分，使修饰分子的后续富集成为可能。该生物素硫醇标签设计具有紧凑的结构，在高能碰撞解离 (HCD) 期间仅产生两个碎片/诊断离子(图 1b)。 因此，肽主链可以保持良好的裂解效率，并在 HCD 或电子转移解离 (ETD) 期间分别产生丰富的b/y或c/z离子系列。在 HCD(图 1c)、ETD或电子转移/高能碰撞解离(EThcD)碎裂下，衍生化肽标准品的序列收集质谱图几乎完全覆盖相应的肽序列。实验结果表明生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸化肽可以产生用于解析及标注的高质量的串联质谱图，并且与各种裂解技术相结合时可以提高瓜氨酸化位点的识别可信度。　　图1|用于瓜氨酸化分析的生物素硫醇标签设计。a，使用生物素硫醇标签和 2,3-丁二酮对瓜氨酸肽进行衍生化。 b，HCD、ETD 或 EThcD 片段化后生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸化肽的片段化位点。c，HCD裂解后生物素硫醇标签衍生的瓜氨酸肽标准品 SAVRACitSSVPGVR 的串联质谱图。　　在接下来的实验中作者使用该生物素硫醇标签和基于质谱的自下而上的蛋白质组学方法对瓜氨酸化进行分析(图2a)。作者在体外利用 PAD(一种可以催化瓜氨酸化的酶)催化的人组蛋白 H3 蛋白来验证这个过程。作为未被PAD催化的阴性对照，未发现组蛋白的肽段被鉴定为瓜氨酸化，证明了生物素标签反应的高特异性(图 2b)。在体外 PAD 处理后，作者 发现许多精氨酸残基被催化为瓜氨酸，并且大量的位点被高可信度的鉴定为瓜氨酸化位点(图 2c)，进一步表明该方法的高效性。在 HCD 碎裂后，其产生了一系列丰富的 b/y 离子，可以帮助准确的表征在同一肽段上单个(图 2d)以及多个(图 2e)瓜氨酸化位点。　　图2|使用生物素硫醇标签进行体外瓜氨酸化分析。a，使用生物素硫醇标签进行蛋白质瓜氨酸化分析的实验工作流程。b、c，在体外 PAD 处理之前 (b) 和之后 (c) 组蛋白 H3 蛋白的瓜氨酸化分析。 已识别的瓜氨酸化位点在序列中以蓝色字母突出显示。 序列下方的红色矩形表示鉴定的瓜氨酸化肽，而瓜氨酸化位点以蓝色显示。 d，PAD处理的组蛋白 H3 (R64Cit) 的已鉴定瓜氨酸化肽的串联质谱图示例。 e，PAD 处理的组蛋白 H3 的同一肽上鉴定的两个瓜氨酸化位点(R70Cit 和 R73Cit)的串联质谱图示例。　　接下来，作者们尝试利用所开发的方法对复杂的生物样本中的瓜氨酸化进行全局分析，并希望能够以此提供阐明生物体中瓜氨酸化调节机制的依据。首先，作者对小鼠的六个身体器官和五个大脑区域进行了深入的瓜氨酸组分析，生成了第一个小鼠瓜氨酸组组织特异性数据库。作者从432种瓜氨酸化蛋白质中以高置信度的方式鉴定了691个瓜氨酸化位点(图 3a)。更重要的是，这些蛋白质中约有 60% 未曾在UniProt 数据库检索并被报道，这一结果极大地扩展了对瓜氨酸化以及这些底物蛋白质如何受到瓜氨酸化影响的理解。作者发现结果中与 UniProt 数据库的已知的瓜氨酸位点重叠部分较少(图 3b)，这可能是因为 UniProt 中描述的近 40% 的瓜氨酸化位点是基于相似性外推理论而没有实际的实验证据。此外，许多报道的位点位于组蛋白上，尤其是蛋白质末端，可能会逃过自下而上质谱策略的检测(图 3b)。图 3c 展示了单位点瓜氨酸化和多位点瓜氨酸化蛋白质分布情况，其中 70% 的已鉴定蛋白质仅有一个瓜氨酸化位点被检测到。　　这个新发现的瓜氨酸化蛋白质组为推测瓜氨酸化的调控机制提供了宝贵的资源。例如，作者在髓鞘碱性蛋白(MBP)上鉴定到了九个瓜氨酸化位点，而在 UniProt 数据库中只有四个(图3d)。作者的结果提供了高质量的串联质谱图，不仅证实了已知修饰位点的存在(图3e)，而且还高可信度的识别了未知的位点(图 3f)。然后作者进行了瓜氨酸化肽段的序列分析，发现在鉴定的瓜氨酸化位点两侧并没有高度保守的氨基酸序列模式(图3g)，但是谷氨酸残基更频繁地出现在瓜氨酸的N末端侧附近。这与Fert-Bober 等人报道的小鼠瓜氨酸组分析结论一致。另一方面，Tanikawa 等人发现在人体组织和血浆中大约五分之一的 PAD4 底物含有 RG/RGG 基序。同样，Lee 等人及相关研究人员观察到天冬氨酸和甘氨酸残基在瓜氨酸化位点出现频率偏高。值得注意的是，这些研究使用了不同的人源细胞系或组织，因此作者的结果可能表明在不同物种之间瓜氨酸化位点周围的序列模式是不同的。为了更好地辨别瓜氨酸化蛋白质所涉及的功能，作者展示了基因本体论(GO)富集分析的热图，其显示了二十个最显著富集的细胞成分(图3h)以及KEGG途径(图3i)。作者发现小鼠大脑组织和身体器官之间存在明显差异，而瓜氨酸蛋白更多地参与大脑功能。具体来说瓜氨酸化蛋白质集中在轴突、髓鞘、核周体和突触中，因此在中枢神经系统中可能发挥着重要的作用。　　图3|不同小鼠组织的大规模瓜氨酸组分析。a，不同小鼠组织中已鉴定的瓜氨酸化蛋白和瓜氨酸化位点的数量。 b，本研究中鉴定的瓜氨酸化位点与 UniProt 数据库中报告的位点比较。 c，每个鉴定的瓜氨酸化蛋白质的瓜氨酸化位点数量分布。d，本研究中确定的瓜氨酸化位点与 UniProt 数据库中关于髓鞘碱性蛋白的瓜氨酸化位点的比较。e、f，在髓磷脂碱性蛋白 R157Cit (e) 和 R228Cit (f) 上鉴定的两个瓜氨酸化位点的示例串联质谱图。g，鉴定的瓜氨酸化肽的序列。瓜氨酸化位点位于中间的“0”位置。字母的高度表示每个氨基酸在特定位置的相对频率。 h,i，使用 Metascape 生成的热图显示不同小鼠组织中显着丰富的(p 值 0.01)细胞成分 (h) (KEGG) 通路 (i)。　　为了进一步拓展该方法的实用性，作者应用了二甲基化亮氨酸(DiLeu)等重标记策略，第一次实现了对瓜氨酸化进行高通量的定量研究。作者首先使用瓜氨酸化标准肽段进行测试，证明在优化反应条件下DiLeu标记和生物素硫醇标记反应可以分步进行而不互相干扰(图 4B，4C)。同时，将标准肽段按照已知比例进行4-plex DiLeu标记并混合，再进行生物素硫醇标记和瓜氨酸化分析，结果显示了非常好的定量准确性(图5)。作者进一步优化了运用该方法在复杂生物样品中进行定量分析的实验方法，并且证明此方法依然可以实现极佳的定量准确度和精确度(图6)。　　图4|瓜氨酸化标准肽段测试DiLeu标记和生物素硫醇标记分步反应的特异性和效率　　图5|瓜氨酸化标准肽段测试DiLeu标记和生物素硫醇标记定量分析的准确性　　图6|复杂生物样品测试DiLeu标记和生物素硫醇标记定量分析的准确度和精确度　　作者接下来应用该方法对DNA损伤中瓜氨酸化的作用进行了研究。作者在MCF7细胞中用三种方法造成了DNA损伤，并定量分析了蛋白质瓜氨酸化的变化。作者一共鉴定到63种瓜氨酸化蛋白以及其包含的78个瓜氨酸化位点，并发现三个实验组中的瓜氨酸化表达相比于对照组呈现出非常不同的趋势(图7A)，这一结果表明瓜氨酸化在不同类型的DNA损伤模型中具有差异性的作用。通过对实验组中显著变化的瓜氨酸化蛋白进行生物过程网络分析，作者发现瓜氨酸化主要对DNA代谢，蛋白结构变化，翻译以及DNA修复等过程进行调控(图 7B，7C)。该实验结果表明蛋白瓜氨酸化对DNA损伤以及相关发病机理具有非常重要的作用。　　图7|高通量定量分析研究瓜氨酸化在DNA损伤中的变化及作用(来源：Anal. Chem.)　　小结　　本文章介绍了一种生物素硫醇标签的设计和开发，该标签可与瓜氨酸化肽段发生特异性反应并极大地提高了瓜氨酸化的富集和检测效率。在使用标准肽和重组蛋白证明该方法的有效性后，作者进一步优化了从复杂生物样品中检测瓜氨酸化的实验过程。通过此方法对小鼠五个大脑区域和六个身体器官的蛋白质瓜氨酸化进行分析，作者鉴定出432个瓜氨酸化蛋白以及691个瓜氨酸化位点，这是迄今为止最大的数据集。该研究揭示了这种翻译后修饰可能在神经系统中发挥的关键作用，并表明它们在包括呼吸和糖酵解在内的许多代谢过程中也可能发挥着重要作用。总的来说，实验结果表明蛋白质瓜氨酸化在不同组织中具有广泛分布并参与各种生物过程，这扩展了目前对蛋白质瓜氨酸化生理作用的认知和理解。此外，作者进一步拓展了此方法的实用性，通过应用DiLeu等重标记策略第一次实现了瓜氨酸化的高通量定量研究，并利用这一方法揭示了瓜氨酸化在人体细胞DNA损伤及修复过程中的重要作用。更重要的是，该方法可以提供一种普适、简单而强大的检测方法来明确鉴定蛋白质瓜氨酸化，这也将启发和有益于未来对这种翻译后修饰在生理和病理条件下的功能作用的研究。　　相关研究成果近期发表在Analytical Chemistry上的两篇文章中, 通过生物素硫醇标签辅助质谱法对蛋白质瓜氨酸化进行全局分析文章的共同第一作者是威斯康星大学麦迪逊分校博士生石亚涛，李子辉，王斌，并与中国药科大学叶慧教授课题组合作 应用二甲基化亮氨酸等重标记策略进行蛋白质瓜氨酸化高通量定量研究文章的第一作者是威斯康星大学麦迪逊分校博士生李子辉，两篇文章通讯作者为李灵军教授。更多关于李灵军教授研究团队的最新研究进展欢迎登陆课题组网站：https://www.lilabs.org/

在我们的日常包装食品中，都会看到这样的营养标识，可以有助于我们更清晰的营养摄入，更健康的生活。其中蛋白质是构成人体细胞和组织的重要成分，人体正常值一般是60～80 g/L。蛋白质含量的测定对于食品质量的掌握具有十分重要的现实意义，因为蛋白质不仅是食品中重要的营养物质，同时也是组成人体一切细胞和组织的重要成分，其含量的多少直接决定着食物的营养价值。特别对奶制品来说，蛋白质含量的高低对定价有直接影响。目前测定蛋白质的方法主要有凯式定氮法、杜马斯法。随着社会的发展，人类对环保、高效意识的增强，越来越多的企业对杜马斯法测定蛋白质含量越来越关注。德国元素Elementar在杜马斯快速定氮分析仪的研发脚步从未停歇。自1964年公司推出世界第一台杜马斯定氮仪后，公司响应食品、农产品、肥料等样品的分析需要更大样品量的需求，于1989年，进一步推出了全球首款克级样品量的杜马斯定氮仪，逐步推动了杜马斯定氮法在法规中的应用。

德国柏林——2019年8月26日——布鲁克公司（纳斯达克代码:BRKR）在Euroismar 2019（https://conference.euroismar2019.org）上公布了1.2GHz高分辨率蛋白质核磁共振（NMR）数据。布鲁克2台1.2GHz超导磁体已在布鲁克瑞士磁体工厂达到目标场强，创造了稳定、均匀的NMR磁体的世界纪录，可用于高分辨率和固态蛋白质NMR在结构生物学中的应用，以及用于研究固有无序蛋白质（IDPs）。在EUROISMAR 2019上，布鲁克及其科学合作者展示了1.2 GHz高分辨率NMR数据，这些数据是使用新的1.2 GHz 3 mm三通道反向TCI低温探头获得的。布鲁克独特的1.2GHz超高场核NMR磁体采用了一种新的混合设计，高温超导体（HTS）在里层，低温超导体（LTS）在外层，这两者一起为高分辨率蛋白质NMR提供了极其苛刻的稳定性和均匀性。一旦进一步的系统开发和工厂测试完成，意大利佛罗伦萨大学的Lucia Banci教授和Claudio Luchinat教授有望成为第一批获得1.2 GHz NMR谱仪的客户，这一过程预计还需要几个月的时间。在1.2 GHz系统上对CERM测试样本进行初始数据采集后，他们表示：“在布鲁克瑞士超高场设备上，已经获得了突触核蛋白的高分辨率谱图数据，突触核蛋白是一种与阿尔茨海默氏症和帕金森氏症等疾病相关的固有无序蛋白质。此外，我们还能对与多种癌症相关的蛋白质的第一个1.2 GHz NMR谱图数据进行了审查。毫无疑问，1.2 GHz仪器分辨率的提高——由于在高磁场中色散的增加而成为可能——将有助于推动结构生物学等重要研究领域的研究。一旦最终开发和工厂评估完成，我们期待在实验室收到1.2 GHz NMR谱仪。"布鲁克 BioSpin集团总裁Falko Busse博士表示：“新的1.2 GHz系统是一场技术革命，将使新的分子和细胞生物学发现成为可能。我们非常重视我们的超高场NMR客户对我们的信任，并且我们为在1.2 GHz频率下生成世界上第一个高分辨率蛋白质核磁共振(NMR)数据而感到自豪。虽然我们尚未完全完成新1.2 GHz系统的所有开发，但我们最近的快速进展证明了我们致力于创新，并致力于与客户合作开发有利的科学能力。”与先前宣布的Ascend 1.1 GHz磁体类似，Ascend 1.2 GHz混合HTS/LTS磁体是一个标准孔（54 mm）的双层磁体系统，其漂移和均匀性规格与布鲁克现有的900 MHz和1 GHz超高场NMR磁体相似，确保与一系列NMR探头类型和谱仪附件兼容。布鲁克公司的Ascend™ 1.2 GHz NMR磁体利用了先进的导体和磁体技术，用于绕组、连接、力管理、淬火保护、低漂移和高均匀性，这些技术是为ENC 2019宣布作为产品的Ascend 1.1 GHz磁体成功开发的。1.2GHz 1H-15N 2D BEST-TROSY（左）和1.2GHz 3D 15N编辑的NOESY-HSQC 2D平面，500μM泛素样品，13C/15N标记，溶解在90%H2O和10%D2O溶液中。两个实验均使用3mm TCI低温探头进行记录。

p 　 strong 　摘要 /strong br/ /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　prm-PASEF& reg 方法大幅提高4D-靶向蛋白质组学定量能力 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　Matthias Mann实验室利用dia-PASEF& reg 、超低流量Evosep色谱和TIMS/PASEF装置的进一步的改进实现单个细胞鉴定超过1000种蛋白质 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　布鲁克获得Albert Heck实验室的PhoX交联剂许可，caps-PASEF将进一步助力结构蛋白质组学研究 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify text-indent: 2em " 布鲁克凭借TIMS技术商业化的成功，斩获HUPO 2020科学技术奖 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify text-indent: 2em " br/ /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　2020年10月19日，第19届人类蛋白质组组织世界网络大会(hupo2020.org)上， 布鲁克公司的Melvin A.Park和Oliver Raether因捕集离子淌度技术(TIMS)和平行积累连续碎裂(PASEF& reg )方法的成功商业化而获得HUPO科学技术奖。该奖项以表彰新的方法改变了科学家研究蛋白质组学的方式，验证了timsTOF Pro使用短梯度的大队列深度4D-蛋白质组学在转化医学中的应用。布鲁克还借此机会对PASEF共同发明人Matthias Mann教授的贡献表示感谢。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong A：用PaSER& #8482 实现实时数据库搜索‘Run and Done’ 4D-蛋白质组学 /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　布鲁克进一步宣布发布PaSER，这是一款基于完全基于GPU计算的软件，在最近宣布收购的IP2软件的基础上进行开发的，实现了蛋白质组学数据库的“实时”搜索。“PaSER”一词是由Scripps研究所的John Yates III教授和Robin Park博士创造的，由实时并行数据库搜索引擎(Parallel Database Search Engine in Real-time)英文单词的首字母缩写组成。独特的PaSER架构使用在GPU上运行的并行多线程搜索引擎，以比数据采集更快的速度实时搜索蛋白质组学结果。这就是‘Run and Done’的高通量4D-蛋白质组学，即在数据采集完成后，科学家们就已经可以鉴定肽和蛋白质组。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202010/uepic/0caae4db-f789-453e-aebe-a3f243058378.jpg" title=" 1.jpg" alt=" 1.jpg" / /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong 图1： PaSER可以实时监测4D-蛋白质组学数据采集 /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　John Yates III教授将在 a href=" https://www.bruker.com/events-records/2020/hupo-connect-2020.html" target=" _blank" style=" color: rgb(31, 73, 125) text-decoration: underline " span style=" color: rgb(31, 73, 125) " strong HUPO Connect 2020的布鲁克网络研讨会 /strong /span /a 上将发表以“质谱和信息学的协同效应”为主题的演讲，Robin Park博士将在布鲁克蛋白质组学用户网络会议上探讨IP2和PaSER。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　布鲁克蛋白质组学副总裁Gary Kruppa博士评论道：“timsTOF Pro使4D-蛋白质组学可以大规模测量每一个被检测到的多肽的离子迁移率以获得碰撞截面(CCS)。结合timsTOF Pro的速度，这意味着蛋白质组学的瓶颈已经从检测技术转移到大量数据的处理上来。IP2的速度和基于PaSER GPU的搜索是timsTOF Pro的完美搭配。同时，我们很高兴Robin Park博士加入布鲁克，他将继续为TIMS/PASEF方法开发IP2和PaSER。” /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong B：超高灵敏度和真正的单细胞4D-蛋白质组学 /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　Matthias Mann教授在德国马普所和哥本哈根大学医学院的研究团队与Evosep和布鲁克进行合作，在高灵敏度和真正的单细胞蛋白质组学研究上取得了重大进展。 改造的timsTOF Pro可以从少量样品甚至对单个细胞进行蛋白质组学分析。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　Matthias Mann教授将在HUPO Connect 2020环节中介绍 “系统生物学的深度视觉蛋白质组学”方面的工作，而他的学生Andreas Brunner博士将在 a href=" https://www.bruker.com/events-records/2020/hupo-connect-2020.html" target=" _blank" style=" color: rgb(31, 73, 125) text-decoration: underline " span style=" color: rgb(31, 73, 125) " strong HUPO Connect 2020的布鲁克网络会议 /strong /span /a span style=" color: rgb(31, 73, 125) " strong 上 /strong /span 介绍“timsTOF上的超高灵敏度MS使单细胞的蛋白质组学分析成为可能”。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　Matthias Mann教授说：“从样本处理和分析的角度来看，在真正的单细胞水平上对蛋白质表达进行有意义的测量是非常具有挑战性的。我们很高兴能与Evosep和布鲁克成为合作伙伴，以帮助我们实施、证明并最终将我们的想法付诸实践，以便在不久的将来为所有研究人员提供真正的单细胞蛋白质组学。” /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong C.靶向定量4D-蛋白质组学与prm-PASEF /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　布鲁克的prm-PASEF定量蛋白质组学工作流程是目前通道数目最多的靶向蛋白质组学方法，TIMS提供的额外分离维度还可以减少MS2定量分析中的干扰。 凭借PASEF方法的速度和额外的TIMS分离优势，prm-PASEF现在可以在每100毫秒的TIMS分离中靶向十二种以上的母离子。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong /strong /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202010/uepic/32db7ac2-da14-4399-93b7-e57823a38c9a.jpg" title=" 2.jpg" alt=" 2.jpg" / /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong 图2：用TIMS prm-PASEF通过离子淌度过滤掉干扰离子 /strong br/ /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　卢森堡健康研究所和卢森堡大学的Gunnar Dittmar教授将在 a href=" https://www.bruker.com/events-records/2020/hupo-connect-2020.html" target=" _blank" style=" color: rgb(31, 73, 125) text-decoration: underline " span style=" color: rgb(31, 73, 125) " strong HUPO Connect 2020的布鲁克网络研讨会 /strong /span /a 上介绍“基于prm-PASEF的超高通道数的靶向蛋白组学新方法用于临床研究”。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong D. caps-PASEF方法与PhoX交联剂联合用于结构4D-蛋白质组学研究 /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　布鲁克很高兴地宣布与Utrecht大学的Albert Heck和Richard Scheltema合作，并获得了PhoX交联技术使用授权。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　timsTOF Pro利用PhoX和新型caps-PASEF方法在交联质谱法中的优势在《Molecular and Cellular Proteomics》中发表的论文《Benefits of Collisional Cross Section Assisted Precursor Selection for Cross-linking Mass Spectrometry》中有详细描述。 布鲁克的PhoX交联试剂将于2021年初上市。 /p p style=" text-align: center" img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 246px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202010/uepic/5435ce79-4850-4347-8dc5-d42723e30cef.jpg" title=" 3.jpg" alt=" 3.jpg" width=" 400" height=" 246" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong 图3：Utrecht大学的Albert Heck和Richard Scheltema开发的PhoX交联剂的结构。 /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-align: center " strong E.4D-蛋白质组学数据分析软件开发 /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　因为布鲁克采用独特的开放式数据文件格式，围绕timsTOF Pro的第三方软件生态系统正在不断发展，包括Bioinformatics Solutions 公司的PEAKS Studio和PEAKS Online软件包对dia-PASEF的支持。特别是，PEAKS Online还提供了一个增强的、基于云的解决方案，用于处理来自大样本队列的大型数据集，LFQ定量和SILAC等新工作流也得到进一步提升。MaxQuant也很快将支持dia-PASEF数据处理。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　Biognosys宣布使用SpectroMine快速处理timsTOF Pro的4D PASEF数据，SpectroMine基于强大的Pulsar搜索引擎构建，可用于DDA蛋白质组学策略的多线程和非标记定量分析。 /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　Biogosys的首席技术官Lukas Reiter博士评论道：“我们一直将优化我们软件对timsTOF Pro的支持作为首要任务，从而实现对4D PASEF数据的快速处理和蛋白质组的深度覆盖。SpectroMine 2现在可用于同位素标记，以及使用timsTOF Pro数据进行非标记定量(LFQ)工作流。” /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　HUPO Connect 2020的布鲁克网络会议的会议详情，请点击 a href=" https://www.bruker.com/events-records/2020/hupo-connect-2020.html" target=" _blank" https://www.bruker.com/events-records/2020/hupo-connect-2020.html /a strong /strong /p p style=" line-height: 1.5em text-align: justify " 　　 /p

布鲁克在第64届美国质谱年会(ASMS 2016)宣布推出布鲁克HDX Solution —氢氘交换解决方案。BHDX解决方案将LEAP H/D-X PAL自动样品处理系统与布鲁克maXis II ETD UHR-QTOF质谱系统以及HDExaminer软件相结合，提供了一套自动可靠的HDX-MS工作流。Bruker HDX解决方案通过H/D比值获得单一同位素精确定量分析结果，为深入了解生物分子结构提供可靠依据。　　这些年来，生物制药表征分析需要对生物蛋白的空间构象有更加深入的了解，还要了解多种因素如pH值、温度和压力等对蛋白的影响。对于这一挑战，HDX-MS已经成为了一种有价值的分析技术。生物制药分析方法需要运用强大的分析统计工具，自动化的提供高质量数据。HDX-MS已成为生物制药领域的常规而可靠的分析方法。　　关键结构的鉴定、药物/蛋白的解析以及蛋白之间相互作用、蛋白质构象变化等是目前生物治疗发展过程中面临的关键问题。Bruker HDX解决方案使得液相分离和MS/MS检测自动化，简化数据分析和解析工作，并能获得可靠的蛋白结构解析结果。　　布鲁克道尔顿生物制药副总裁Bob Galvin博士评论说：“最新Bruker HDX解决方案的推出，进一步加强了布鲁克生物表征产品系列，使得生物制药领域的研究者能够更快、更准确的深入了解到蛋白质构象和相互作用。”关于HDX解决方案　　Bruker HDX解决方案提供了完整的工作流程，将LEAP H / DX PAL自动进样器应用于预定标记实验，并结合了UHPLC系统与高分辨质谱系统。maXis II ETD UHR-QTOF质谱系统的质量准确度达到ppm级以下，高灵敏度与同位素保真度提高了系统获取准确H/D比值的能力。再加上HDX-MS解析软件Sierra Analytics HDExaminer的应用，创造了更大的应用空间与简便的应用环境。LEAP H / DX PAL自动进样器与maXis II ETD UHR-QTOF质谱系统　　在市场处于领先的超高质量分辨率QTOF质谱与ETD(电子转移解离)能力结合，开创了布鲁克maXis II系统HDX-MS实验的新纪元。比起在肽段水平的研究，在更微量水平的探索能更容易的提供特异性识别位点。LEAP H/D-X PAL自动进样设备将稳健可靠的样品处理整合到布鲁克HDX 解决方案。革新的时间安排软件能够自动安排样品处理步骤，包括贴标签、培养、消化和灭活等，提高LC的效率与整个实验室效率。　　用HDExaminer软件获得的信息可用于研究在干扰状态下蛋白质的构象变化。通过数据输出，有关这些变化的数据信息可被容易的可视化，也可通过导入如PyMol的晶体结构可视化程序更深入的了解这些变化。　　海德堡大学分子生物学中心的Matthias P. Mayer教授表示：“通过布鲁克HDX解决方案，我们能够以高精度、高重复性和最小的动手时间测量氢交换反应动力学。系统的自动安排软件帮助我们充分利用仪器使用时间，从而提高我们的实验室效率”编译：郭浩楠

如今，玉米已成为世界上最高产的农作物之一，玉米有“饲料之王”的美称，但是由于普通玉米籽粒蛋白含量较低，因此饲料中需要补充大豆蛋白。提高玉米蛋白含量不仅是保障国家粮食安全的重大战略需求，也是保障我国畜禽养殖业和饲料加工业健康发展的重要途径之一。中国科学院分子植物科学卓越创新中心巫永睿研究团队与上海师范大学王文琴研究团队合作在Nature上发表了题为 “THP9 enhances seed protein content and nitrogen-use efficiency in maize”的研究论文。图为巫永睿团队接受中央电视台采访“德国元素Elementar的杜马斯定氮仪准确的测定了我们研究材料的蛋白表型，对于我们克隆野生玉米高蛋白基因至关重要。”——中国科学院分子植物科学卓越创新中心巫永睿课题组为加强我国玉米科技工作者的交流与合作，展示玉米生物学研究的最新科研成果，推动玉米研究领域的新理论、新技术和新成果的应用， 中国作物学会、中国作物学会玉米专业委员会拟定于2024年4月在江苏省南京市召开第七届全国玉米生物学学术研讨会。德国元素Elementar也将携最新的杜马斯氮/蛋白质分析仪出席此次会议，欢迎各位老师莅临参观。时间：2024年4月25日-4月28日地点：南京国际会议大酒店（南京市玄武区中山陵四方城2号）德国元素Elementar在杜马斯快速定氮分析仪的研发脚步从未停歇。自1964年公司推出第一台杜马斯定氮仪后，公司响应食品、农产品、饲料等样品的分析需要更大样品量的需求，于1989年，进一步推出了首款克级样品量的杜马斯定氮仪。逐步推动了杜马斯定氮法在法规中的应用。如今，杜马斯定氮法在食品、饮料、宠物食品、饲料和肥料等领域的应用已经获得大家的认可余肯定。德国元素Elementar杜马斯定氮仪

p style=" text-align: center " img title=" IMG_1279.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/053b4ae8-ce11-4330-abec-7a4ed6c2a53a.jpg" / /p p 　　2017年9月18日，在第十六届人类蛋白质组学年度世界大会(HUPO)上，Bruker推出了用于PASEF质谱的timsTOF Pro系统。该质谱采用了专有捕获离子迁移谱(TIMS)技术，能实现更高速度、更高灵敏、更强大的鸟枪法蛋白质组学分析，具有出色的单次肽和蛋白质鉴定性能。 /p p 　　基于TIMS创新技术的四极杆飞行时间质谱仪(QTOF-MS)由MaxQuant / Perseus和PEAKS Studio蛋白质组学分析软件支持，这种timsTOF Pro方法对于定量蛋白质组学工作流程尤其有利。 /p p & nbsp & nbsp & nbsp 从较小样品量的识别性能方面，这种独特的前端TIMS分析仪对更高速度的鸟枪法蛋白质组学进行了优化。其独特的双TIMS几何形状允许离子在第一个TIMS部分中并行累积，并且在实时执行额外的TIMS分离步骤之后，离子从第二个TIMS部分释放出来，用于MS / MS碎裂。这可以产生近100%的占空比，使得这种平行堆积和连续碎裂(PASEF)技术在酶促消化产生的蛋白质混合物中，应用可重复纳流LC-MS分析可以具有前所未有的性能。 /p p style=" text-align: center " img title=" timsTOF_Pro nanoELUTE_3D - 副本.jpg" src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/b2589663-240a-424c-8bb3-77fa0c6b1803.jpg" / 　　 /p p & nbsp & nbsp & nbsp PASEF能力代表了性能的改进，因为它提供更高灵敏度和更高速度的鸟枪法蛋白质组学分析，而不损失质量分辨率。而之前，更高的扫描速度通常导致用于鸟枪法蛋白质组学的基于FT的质谱技术具有较低质量分辨率。这些临界限制可以由PASEF消除，允许以高灵敏度以及接近100%的占空比，同时还可以保持前体和产物离子的超高质量分辨率。双TIMS技术这一重要PASEF功能，有助于科学家们深入研究细胞复杂生物学以及发现重要低水平生物学蛋白。同时，这一功能也有助于蛋白质翻译和临床蛋白质组学研究中的验证和纵向研究。 /p p 　　定量蛋白质组学是蛋白质组学研究的关键领域，双重TIMS供电的PASEF提供了超越传统门控时间串联FT的质谱分析局限性的优势。新的timsTOF Pro提供超过四个数量级的动态范围，低肽负载(100-200ng)，这使得它非常适合于研究细胞生物学和临床中经常遇到的小细胞群体和低样品量的蛋白质组学。 /p p 　　德国马丁斯堡的马克斯· 普朗克生物化学研究所蛋白质组学和信号转导系主任马蒂亚斯· 曼(Matthias Mann)表示：“我的实验室与布鲁克合作开发PASEF技术，我们很高兴看到timsTOF Pro实现我们最初设想的鸟枪法蛋白质组学的潜力。这种新技术有可能革新蛋白质组学的几个领域：临床研究，其中速度和定量能力是运行大样本队列的关键 需要增加灵敏度的应用 富含磷酸肽或其中有限数量的细胞可用于分析的样品；并且对于使用等压标记的定量实验，其中使用捕获的离子迁移率的额外分离可以至少部分地消除引起所谓的比例压缩效应导致不可接受的误差的共分裂物质的干扰。我们对技术进一步发展的潜力感到非常兴奋。“ /p p 　　Bruker Daltonics的Omics解决方案副总裁Gary Kruppa表示：“蛋白质组学研究人员总是希望提高速度，灵敏度和定量能力，同时保持高分辨率，准确的质量和高保真度同位素图案，以便更深入地了解蛋白质组。使用PASEF，科学家们现在不需要将扫描速度和敏感度的解决方案进行权衡，它们通过TIMS前体离子选择获得高灵敏度，高扫描速度和无与伦比的特异性这三重效果。这提供了发现低水平生物相关蛋白质的可能性，目前它们是超出了非TIMS质谱仪的性能范围的。“ /p p 　　马丁· 马克斯普朗克生物化学研究所计算系统生物化学小组组长Juergen Cox评论说：“Bruker决定采用开放文件格式，以便我们可以直接使用原始数据，将有利于蛋白质组学研究人员的使用MaxQuant和Perseus软件平台。我们对数据质量特别重视，并期待与Bruker合作，通过最先进的客户支持软件和分析统计查询，我们可以使用PASEF在timsTOF Pro上获取数据。“ /p p 　　关于带有PASEF的timsTOF PRO /p p 　　专有的timsTOF Pro系统使用通过捕获离子迁移光谱(TIMS)实现的PASEF，为鸟枪法蛋白质组学提供了行业领先的数据采集速度。 timsTOF Pro的独特双TIMS几何结合了TIMS设备中离子包的时间聚焦，意味着PASEF提供的速度优势同时提高了灵敏度和定量。所有这些在速度，灵敏度和定量方面的增益保持了Bruker的高性能QTOF质谱仪的优势，包括高质量分辨率(即使在最高数据采集速率下，分辨率为50,000 FWHM)，ppm精确质量和高同位素保真度(True同位素模式或TIPTM)。具有PASEF的强大的timsTOF Pro为科学家提供了深入细胞机器复杂生物学研究、发现低水平生物学重要蛋白质、在蛋白质翻译以及临床蛋白质组学研究中进行验证提供了有力工具。 /p p 　　关于MaxQuant和Perseus软件平台 /p p 　　MaxQuant是猎枪蛋白质组学数据分析的行业标准。 Juergen Cox在过去十年发展起来，已经成为肽，蛋白质和翻译后修饰的鉴定和定量最常用的包装。近期，MaxQuant已经适应于timsTOF数据的分析，管理由保留时间、离子迁移率、质量和信号强度所占据的空间中的4D特征。用于多元数据分析的Perseus软件支持生物和生物医学研究人员解释分子定量，相互作用和蛋白质翻译后修饰数据。 Perseus包含用于高维数据分析的统计工具的综合组合，涵盖归一化，模式识别，时间序列分析，跨学科比较和多重假设检验。 /p p 　　关于PEAKS Studio /p p 　　生物信息解决方案公司的旗舰软件PEAKS Studio为蛋白质组学研究界提供了创新的质谱数据分析工作流程。自从在二十世纪初期首次亮相以来，PEAKS Studio已被高度认可，其基准测试从头测序算法被集成到所有其他鸟枪法蛋白质组学软件模块中。从头测序与传统数据库检索的结合确保了对原始光谱数据的完整解释，以满足质谱的复杂性和灵敏度，并为蛋白质组学和治疗性蛋白质发现提供了先进的解决方案，如通过肽/蛋白质鉴定和定量，肽图，翻译后修饰和序列变体。 /p p 　　PEAKS Studio提供的独特工作流程以及由timsTOF Pro的第四维离子迁移率引起的令人信服的数据质量促成了生物信息解决方案公司和Bruker的合作。 /p p 　　关于布鲁克公司(纳斯达克股票代码：BRKR) /p p 　　55多年来，布鲁克已经使科学家们能够突破发现，开发新的应用，提高人类生活质量。 Bruker的高性能科学仪器和高价值分析和诊断解决方案使科学家能够在分子，细胞和微观层面探索生命和材料。 /p p 　　通过与客户的密切合作，Bruker在生命科学分子研究，应用和制药应用以及显微镜，纳米分析和工业应用方面实现了创新，生产力和客户成功。近年来，Bruker也成为细胞生物学，临床前成像，临床表现学和蛋白质组学研究，临床微生物学和分子病理学研究的高性能系统的提供者。 /p p & nbsp /p

p 　　蛋白质是自然界中最神秘的物质之一，几乎所有的生命活动都有它的身影。正如人有生死，生物体内的蛋白质也有出生与死亡。蛋白质的出生是一个精准的从脱氧核糖核酸(DNA)转录得到的信使核糖核酸(mRNA)进而翻译合成蛋白质的过程。当蛋白质的功能使命完成后，需要被及时降解掉(死亡)，否则，蛋白质过早或者过晚降解均会导致其功能失常，进而导致“阿尔兹海默综合征”、“克雅士病”等多种疾病的产生。 /p p 　　泛素-蛋白酶体途径是真核生物最重要的蛋白质降解途径。在这个途径中，蛋白质被特异进行泛素标记(即泛素化修饰)，进而被送到蛋白酶体进行降解。该途径是一种能量(ATP)依赖的特异、高效的蛋白质降解途径, 发现该途径的三位科学家阿龙· 切哈诺沃、阿弗拉姆· 赫尔什科与欧文· 罗斯共享了2004年诺贝尔化学奖。在此途径中，泛素连接酶发挥了“扳机”似的重要作用，特异地进行底物蛋白质的识别，并启动后续的降解过程，是打开蛋白质死亡之门的钥匙。然而由于泛素连接酶与底物蛋白质间的低亲和力，至今尚无有效的高通量的实验鉴定方法。 /p p 　　近年来，生物大数据的积累使得我们有望利用知识挖掘思想对这一问题进行理论探索。军事科学院国家蛋白质科学中心贺福初院士、李栋研究员团队对泛素连接酶与底物的相互作用涉及的蛋白质网络、蛋白质结构和序列等多个层面的生物大数据开展了系统分析，给出了3856对潜在的介导泛素连接酶与底物相互作用的结构域组合，鉴定了底物蛋白序列上10480个潜在的泛素连接酶识别特征，发现了泛素连接酶与底物在生物学网络中倾向于形成特定的拓扑性质。进而基于这些特征发展了首个人类泛素连接酶-底物相互作用的预测和展示系统(UbiBrowser，http://ubibrowser.ncpsb.org)。该项研究有助于人们从多个角度认识泛素连接酶对底物的调控作用，发现两者之间的选择关系，并进而掌握开启蛋白质死亡之门的“钥匙”。 /p p 　　本项研究也是贺福初院士、李栋研究员团队利用生物大数据挖掘生物学知识的再次成功尝试。2008年，该团队整合基因组上下文等生物学特征，成功进行了蛋白质相互作用可靠性评估(Molecular & amp Cellular Proteomics, 2008, 7: 1043-1052)。2009年，该团队利用结构域预测了蛋白质组尺度内相互作用蛋白间的信号流走向(Molecular & amp Cellular Proteomics, 2009, 8: 2063-70)。2013年，该团队利用logistic回归方法，整合蛋白质功能等多层次生物学证据，对蛋白质组尺度的自相互作用蛋白进行了系统挖掘 (Mol Cell Proteomics, 2013,12:1689-700)。近年来，在国家科技部”中国人类蛋白质组计划”重点专项项目的支持下，该团队致力于通过整合深度学习等数据分析算法，以生物医学知识图谱为核心，构建面向生物医学大数据知识智能发现的“高速公路”。 /p p 　　本项研究8月24日发表在国际著名的《自然》子刊《自然?通讯》(Nature Communications)上，共同第一作者是军事科学院国家蛋白质科学中心李杨博士、卢亮博士和首都医科大学谢萍副教授。贺福初院士和李栋研究员为共同通讯作者。该工作得到国家国际科技合作专项、精准医学重点专项和国家自然科学基金的支持。 /p p br/ /p

仪器信息网讯 2021年3月8日-11日，第17届美国人类蛋白质组学会议(US HUPO 2021)于线上盛大召开。自2005年以来，美国HUPO每年举行一次年度会议，除US HUPO外，该组织还联合多方举办过3届HUPO国际会议。本年度的US HUPO会议期间公布了该组织的多个奖项结果，其中洛克菲勒大学Brian Chait教授获2021年的蛋白质组学终身成就奖，加利福尼亚大学的PeiPei Ping教授获2021年的蛋白质组学杰出贡献奖。　　US HUPO颁发的蛋白质组学终身成就奖全称为“Catherine E. Costello蛋白质组学终身成就奖”，该奖项由US HUPO赞助，是为了纪念其第一位获奖者Catherine E. Costello而设立的。　　第三届获奖者(2021年) 洛克菲勒大学 Brian T. Chait　　Brian T. Chait教授在过去的42年中，曾与卡米尔(Camille)和亨利德雷福斯(Henry Dreyfus)教授任职质谱和气态离子化学实验室的负责人。最近，他一直领导着美国国立卫生研究院(NIH)资助的国家资源生物大分子的质谱分析实验室。Chait教授因开发用于表征蛋白质的仪器和方法方面的研究而获得了多个奖项，包括2002 ACS质谱杰出成就奖，2007 HUPO蛋白质组学杰出发现奖和2015 ASMS质谱学会的杰出贡献。　　往届获奖者一览：　　第一届获奖者(2019年) 波士顿大学医学院 Catherine E. Costello　　第二届获奖者(2020年) 苏黎世联邦理工学院 Ruedi Aebersold

p style=" text-indent:28px" span style=" font-family:宋体" 近日，美国威斯康辛大学麦迪逊分校葛瑛团队借助布鲁克 /span span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 电喷雾行时间串联质谱在自顶而下的蛋白质组学研究中取得了重大突破。相关研究成果发表在著名期刊“ /span span nature methods /span span style=" font-family:宋体" ”（ /span span IF=26.919 /span span style=" font-family:宋体" ）上，文章题目“ /span span A photocleavable surfactant for top-down proteomics /span span style=" font-family:宋体" ”。 /span /p p style=" text-indent:28px" span style=" font-family:宋体" 翻译后修饰的蛋白质在许多关键细胞中发挥着重要作用，因此对蛋白质组进行全面的分析，对于解释分子作为一个系统如何相互作用，以及了解细胞系统在健康和疾病中的功能至关重要。而基于 /span span top-down /span span style=" font-family:宋体" 质谱技术的蛋白质组分析是表征完整蛋白质组的新兴手段，它可以提供一个系统的、全局的、无偏差的、定量的蛋白质评估，包括相互作用，修饰，位置和功能方面的信息。 /span /p p style=" text-indent:28px" span top-down /span span style=" font-family:宋体" 质谱技术是将反相液相色谱（ /span span RPLC) /span span style=" font-family:宋体" 直接与 /span span MS /span span style=" font-family:宋体" 偶联来进行操作的，可以对来自于全细胞或组织裂解液的复杂混合物中的完整蛋白进行快速、灵敏的分析。然而，由于蛋白质组的高度复杂性和动态性，蛋白质组学依然面临着巨大的挑战。其中之一便是蛋白质溶解的问题，为了有效的从细胞或组织中提取蛋白质，提取缓冲液中通常含有表面活性剂。但是传统的表面活性剂与质谱不相容，它们的存在极大的抑制蛋白质的质谱信号，因此在质谱分析前要先除去表面活性剂。 /span /p p style=" text-indent:28px" span style=" font-family:宋体" 葛瑛团队针对这一难题，创造性的合成了可光降解的表面活性剂 /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 。并对其进行了一系列的质谱分析，来验证其作为表面活性剂在蛋白质组学中的优异性能。 /span /p p style=" text-align:center" & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp & nbsp span style=" font-family:宋体" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201904/uepic/b918dc99-5c9a-4371-b153-1b8548915f5d.jpg" title=" 1_meitu_1.jpg" alt=" 1_meitu_1.jpg" width=" 579" height=" 102" style=" width: 579px height: 102px " / /span /p p style=" margin-top:8px margin-right:0 margin-bottom:8px margin-left:0 text-align:center" strong span style=" font-family:宋体" 图 /span span 1 Azo /span /strong strong span style=" font-family:宋体" 作用机理 /span /strong /p p style=" text-indent:28px" span style=" font-family:宋体" 首先在保证对蛋白质增溶的前提下，借助布鲁克 /span span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 电喷雾质谱分析小分子蛋白质 /span span ubi /span span style=" font-family:宋体" 与 /span span 0.1% /span span style=" font-family:宋体" 表面活性剂的相容性质。结果表明，在所有被评估的表面活性剂中， /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 是唯一一种既能有效溶解蛋白质，又能与完整蛋白质的 /span span top-down /span span style=" font-family:宋体" 质谱分析相容的表面活性剂。 /span /p p style=" margin-top:8px margin-right:0 margin-bottom:8px margin-left:0 text-align:center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201904/uepic/7c38388f-f60e-4eea-ba33-92d4e4c80f54.jpg" title=" 8.jpg" alt=" 8.jpg" width=" 385" height=" 346" style=" width: 385px height: 346px " / /p p style=" text-align: center " strong span style=" font-family:宋体" 图 /span span 2 Azo /span span style=" font-family:宋体" 与常用表面活性剂的质谱相容性评价 /span /strong /p p style=" margin: 8px 0px text-align: center " img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201904/uepic/7da2baff-7569-4bd5-b574-f4bca40cfad0.jpg" title=" 9.jpg" alt=" 9.jpg" width=" 385" height=" 281" style=" width: 385px height: 281px " border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin: 8px 0px text-align: center " strong span style=" font-family:宋体" 图 /span span 3 /span span style=" font-family:宋体" 表面活性剂对心肌组织裂解液 /span span LC-MS /span span style=" font-family:宋体" 分析的影响比较 /span /strong /p p style=" text-indent:28px" span style=" font-family:宋体" 对 /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 在在线反相液相色谱和质谱联用（ /span span span RPLC-MS /span /span span span span style=" font-family:宋体" ）中自顶向下蛋白质组学中的应用 /span /span /span span style=" font-family:宋体" 进行评估，对比没有表面活性剂蛋白浓度和质谱信，使用 /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 时号均明显升高（ /span span b /span span style=" font-family:宋体" ）。在单一的 /span span RPLC-MS /span span style=" font-family:宋体" 运行中，在 /span span Azo /span span span style=" font-family:宋体" 存在的蛋白质缓冲液中 /span /span span style=" font-family:宋体" 观察到 /span span 663 /span span style=" font-family:宋体" 个独特的蛋白形式，而在无 /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 存在的蛋白质缓冲液中只观察到了 /span span 6 /span span style=" font-family:宋体" 个（ /span span c /span span style=" font-family:宋体" ， /span span d /span span style=" font-family:宋体" ）。此外，从三种液相色谱 /span span - /span span style=" font-family:宋体" 质谱联用的准确质量测量上，共检测到 /span span 2836 /span span style=" font-family:宋体" 种蛋白质形式（ /span span e /span span style=" font-family:宋体" ， /span span f /span span style=" font-family:宋体" ）。 /span /p p style=" text-align:center" span style=" font-family:宋体" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201904/uepic/3892f310-54a7-42e0-a5fc-3281847cecf7.jpg" title=" 10.jpg" alt=" 10.jpg" width=" 385" height=" 335" style=" width: 385px height: 335px " border=" 0" vspace=" 0" / /span /p p style=" margin: 8px 0px text-align: center " span & nbsp /span strong span style=" font-family: 宋体 " 图 /span 4 RPLC-MS span style=" font-family: 宋体 " ） /span Azo span style=" font-family: 宋体 " 在自顶向下蛋白质组学中应用 /span /strong /p p style=" margin-top:8px margin-right:0 margin-bottom:8px margin-left:0" span style=" font-family:宋体" 此外， /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 还能大大提高检测的深度，并显示出许多在对照样品中检测不到的蛋白质。 /span /p p style=" text-align:center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201904/uepic/d4e74520-0d11-49b0-aec3-4c991dc3f8f5.jpg" title=" 11.jpg" alt=" 11.jpg" width=" 385" height=" 320" border=" 0" vspace=" 0" style=" width: 385px height: 320px " / /p p style=" margin: 8px 0px text-align: center " strong span style=" font-family:宋体" 图 /span span 5 Azo /span span style=" font-family:宋体" 队翻译后修饰蛋白质的质谱分析 /span /strong /p p style=" text-indent:28px" span style=" font-family:宋体" 葛瑛团队还进一步证明 /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 能有效提取心肌组织及胚胎肾细胞的膜蛋白，并能够进行自上而下的蛋白质组学质谱分析。通过借助布鲁克用 /span span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 电喷雾质谱对表面活性剂 /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 的质谱分析，验证了 /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 与 /span span MS /span span style=" font-family:宋体" 具有良好的相容性，能有效的增加蛋白质的溶解度，可用于高通量自顶向下的蛋白质组学。同时， /span span Azo /span span style=" font-family:宋体" 还是唯一一种能够有效溶解蛋白质，包括膜蛋白，而不阻碍下游自上而下的质谱分析的强表面活性剂。 /span /p p style=" margin-top:8px margin-right:0 margin-bottom:8px margin-left:0 text-indent:28px" strong span style=" font-family:宋体" 产品介绍 /span span -- /span span style=" font-family:宋体" /span /strong span style=" font-family:宋体" 布鲁克 /span span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 电喷雾飞行时间串联质谱 /span /p p style=" text-align:center" img src=" https://img1.17img.cn/17img/images/201904/uepic/a9e5b405-9ff8-414d-8d4e-de35249fa535.jpg" title=" 0.jpg" alt=" 0.jpg" / /p p style=" text-align: center " strong span style=" text-indent: 28px " span style=" font-family: 宋体 text-indent: 28px " 布鲁克 /span maXis II /span span style=" text-indent: 28px font-family: 宋体 " 电喷雾飞行时间串联质谱 /span /strong /p p style=" text-indent:28px" span style=" font-family:宋体" 布鲁克 /span span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 电喷雾飞行时间串联质谱在广泛的应用领域展现出良好的性能和解决最具挑战性分析难题的能力， /span span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 能同时提供全方位的性能指标。另外， /span span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 提供电子转移解析 /span span (ETD) /span span style=" font-family:宋体" 功能，能够分析包括单克隆抗体亚基在内的整体大蛋白序列分析。可选功能“ /span span HighMass /span span style=" font-family:宋体" ”有利于表征大分子和天然状态的蛋白质复合物如抗体药物偶联物。 /span /p p style=" text-indent:28px" span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 配备上最新的 /span span TOF /span span style=" font-family:宋体" 创新技术，使其在整合解决方案、灵敏度、光谱精确度和动态的范围方面处于领跑位置。来自于 /span span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 的高质量数据，有准确的质量和真实的同位素模型 /span span (TIP) /span span style=" font-family:宋体" ，结合 /span span Bruker /span span style=" font-family:宋体" 公司的计算公式发现工具， /span span SmartFormula /span span style=" font-family:宋体" & #8482 和 /span span SmartFormula & nbsp 3D /span span style=" font-family:宋体" & #8482 ，确保提供最大程度的准确分子式。 /span /p p style=" margin-top:8px margin-right:0 margin-bottom:8px margin-left:0 text-indent:28px" span maXis II /span span style=" font-family:宋体" 最佳适用范围包括抗体表征 /span span ( /span span style=" font-family:宋体" 完整蛋白与亚基 /span span ) /span span style=" font-family:宋体" 、分析整蛋白和蛋白质组、蛋白复合物、小分子鉴定与定量，采用 /span span High Mass /span span style=" font-family:宋体" 可选功能，可以获取天然态质谱图，同时有电子转移解析 /span span (ETD) /span span style=" font-family:宋体" 功能 /span span ( /span span style=" font-family:宋体" 可选 /span span ) /span span style=" font-family:宋体" 。 /span /p p br/ /p

* 布鲁克 PaSER™ 软件现在将具有变革性的支持 CCS 的 DIA-NN 深度神经网络学习与突破性的 dia-PASEF 功能相结合，以实现：* 40 分钟梯度从细胞裂解物中定量 8000种蛋白质* 在 Evosep One 上 4.8 分钟方法，定量 5000 种蛋白质* 只需 10 ng 细胞裂解物消化液，95 分钟梯度即可定量 5000 种蛋白质* timsTOF Pro上开发 CCS 加持的 “prm Live” 功能，实现低成本靶向蛋白质组学研究，可同时定量 1800 个以上的肽段，并保证最高的灵敏度和良好的 CVs* 基于 CCS 的 TIMScore™ 算法也获得重大进展，大大提升了磷酸化肽和蛋白质鉴定覆盖率，并且提高了肽段鉴定的可靠性* 用于高置信度序列确证的全新 OligoQuest™ 软件和工作流程，能支持RNA和修饰寡核苷酸的药物开发* SCiLS™ autopilot 软件，用于使用布鲁克 IntelliSlides™ 在 timsTOF fleX 和 rapifleX® MALDI 平台上进行自动质谱成像 (MSI) 采集* 展示2021年6月推出的两个新产品：* timsTOF SCP 用于无偏单细胞蛋白质组学 (SCP)，例如，用于空间癌症生物学，研究基于不同细胞类型的特异性蛋白质组，并将它们与 sc-RNA-seq 转录组相关联。* 第二代的 timsTOF Pro 2， 带来前所未有的蛋白质组学分析深度和通量。———————————————————————————————————————————2021 年 11 月 2 日美国费城 —— 布鲁克在第 69 届 ASMS 会议上宣布了新产品 CCS-enabled 4D-蛋白质组学，用于增强 timsTOF Pro 2、timsTOF fleX 和 timsTOF SCP 质谱仪的主要功能。布鲁克生命科学质谱副总裁 Rohan Thakur 博士表示：“斯克利普斯研究所 Yates 实验室开发的 TIMScore 是通过针对正向和诱饵/反向肽评估预测的实验 CCS 来增加肽选择的精确度。在我们与柏林 Charité 医学院 Ralser 实验室的合作中，CCS 值的效用增强了 DIA-NN，并且在我们与乌得勒支大学 Scheltema 实验室的合作中，它还增强了对 PhoX™ 交联肽的检测。最后，Dana-Farber 癌症研究所Marto实验室刚刚发布了支持 CCS 的 prm Live，其中具有实时保留时间校正功能，可对 1800 多种肽进行平行靶向的高灵敏度、低 CV 定量。”A. CCS-enabled DIA-NN 支持的 PaSER ，可用于 dia-PASEF 工作流程转化蛋白质组学需要高通量、短梯度和蛋白质组深度覆盖，它可以由dia- PASEF实现。这一成果发表在《Nature Methods》[Mann，Nat Meth 2020]，得到了各种蛋白质组学软件包的支持，包括dia-NN、Spectronaut、MaxQuant和PEAKS Online。DIA-NN 软件 [Demichev, Nat Methods. 2020] 1.8 版包含用于深度神经网络学习的全新 CCS 支持模块，以在 dia-PASEF 中对肽谱匹配进行评分 [Demichev, bioRxiv 2021]。目前布鲁克正在与柏林Charité 医学院的Vadim Demichev博士和Markus Ralser博士合作，将CCS-enabled DIA-NN集成到timsTOF平台的PaSER GPU蛋白质组学软件中，能够增强鉴定和定量。Ralser 教授及其同事的工作加速了大样本队列中的转化蛋白质组学，并且通过使用 dia-PASEF 实现了在 5 分钟的采集时间内鉴定超过5000 种的量化蛋白质这一革命性的提升。柏林Charité 医学院爱因斯坦生物化学教授Markus Ralser博士评论道：“timsTOF Pro出色的性能令人印象深刻。我们也很高兴看到布鲁克将Vadim Demichev的DIA-NN开源版本纳入其PaSER实时蛋白质组学工作流程，并期待与布鲁克的合作能进一步改进4D-蛋白质组学工作流程。”图：dia-PASEF 扫描功能的图形表示B. prm-PASEF Live 增加了靶向肽的数量并进行高灵敏度定量分析与传统prm方法相比，prm-PASEF工作流程在靶向更多化合物的同时保持了非常高的灵敏度。现在新的prm-PASEF 编辑器可以独立使用，也可以在与 Skyline™ 一起使用来建立 prm 方法。Jarrod Marto 教授等人在《Analytic Chemistry》最近发表的一篇论文 《PRM-LIVE with Trapped Ion Mobility Spectrometry and Its Application in Selectivity Profiling of Kinase Inhibitors》对prm-PASEF Live进行了介绍，文中采用动态调整保留时间窗口的方式，以使用 iRT 肽作为保留时间标准，在 60 分钟的采集中定量来自细胞裂解液的 1857 种肽段，以实现可重现的多目标监测。这种创新的prm-PASEF Live概念克服了色谱保留时间漂移的问题，提高了在多目标监测中的定量精度和重现性。C. TIMScore 加入 CCS-enabled 数据库搜索引擎在4D-蛋白质组学应用中，CCS值可用于非标记定量的“Match Between Runs”[Cox，MCP 2020]。TIMScore利用机器学习产生CCS值,并将CCS值应用于搜索引擎的算法中，使搜索引擎能够大幅提高肽段和蛋白质鉴定数目，同时保持更严格的假阳性率（FDR）。数十万个实验数据点被用来训练ML算法，该算法能够准确预测胰蛋白酶和磷酸化肽的CCS值。磷酸化在细胞信号转导和生物学中起着关键作用，但磷酸化肽准确鉴定难度大。在Dana-Farber癌症研究所，TIMScore使Eric Fischer教授提供的未富集白血病细胞系样本中磷酸化肽的鉴定数量提升了10% 以上。南佛罗里达州大学的Stanley Stevens教授补充说：“TIMScore 使从小鼠小胶质细胞系中富集的磷酸化肽的鉴定增加了 11%。CCS值和4D-蛋白质组学已经成为我们基于质谱的蛋白质组学的应用中不可或缺的技术。TIMScore有望改变DDA搜索的执行方式，鉴定更多有意义的肽段和蛋白质，使我们能够使用CCS值进行更深入的蛋白质组研究。”图：TIMScore，机器学习支持CCS预测，可减少肽模糊度并提高置信度D. 全新发布 OligoQuest™ 布鲁克发布了最新软件OligoQuest，作为面向生物制药客户的合规软件套装BioPharma Compass 中的一部分，该软件强化了RNA 和寡核苷酸表征功能。OligoQuest 结合 maXis II 和 timsTOF Pro 等质谱仪上同位素高准确度测定功能，能够对核酸大分子进行准确表征，例如sgRNA及其杂质。并且，布鲁克特有的PASEF扫描模式，可快速深度覆盖复杂样品信息，例如酶解mRNA等。OligoQuest软件是与RiboDynamics，LLC共同开发，其所提供的算法和工作流程，可以用来注释大于100个碱基的核酸二级谱图。RiboDynamics 首席执行官Dan Fabris和康涅狄格大学高级教授 Harold S. Schwenk 解释说：“同位素高准确度与超高分辨率质谱相结合，对于高度修饰的 RNA 分析前景广阔，这是之前的商业软件无法提供的。 使用 OligoQuest 简化相应的分析工作，将大大加速 RNA 领域的研究和开发。” 图：OligoQuest 界面显示 3' - 和 5' -末端和内部片段匹配以进行序列确认E. 用于自动 MALDI 质谱成像（MSI）的 SCiLS autopilot布鲁克今年推出了SCiLS autopilot软件结合IntelliSlides玻片用于MALDI 成像的自动设置。SCiLS autopilot 自动完成从玻片载入到数据采集的六项关键性能优化。样本的扫描图像由IntelliSlide 上的条形码上登记注册和自动检测组织边缘，然后进行多步骤自动优化，以减少 MALDI 成像所需的时间和经验，并确保重复性和图像质量。通过 SCiLS autopilot 进行自动化，非专业用户可以方便的使用 MALDI 成像，将生理组织背景添加到 4D-Omics 研究中。布鲁克 MALDI 成像业务总监 Michael Easterling 博士表示：“随着 MALDI 成像在生物制药中的广泛应用，智能自动化对于确保MALDI成像的无缝整合和结果准确度至关重要。数据采集和处理软件与成像质谱平台（如 timsTOF fleX）的深度系统集成，为多组学研究提供了空间生理信息。”图：实现快速、精确的 MALDI 成像测量自动设置参考文献： [Mann, Nat Methods 2020]: https://doi.org/10.1038/s41592-020-00998-0 [Demichev, Nat Methods. 2020]: https://dx.doi.org/10.1038%2Fs41592-019-0638-x [Demichev, bioRxiv 2021]: https://doi.org/10.1101/2021.03.08.434385 [Cox, MCP 2020]: https://doi.org/10.1074/mcp.tir119.001720 [Marto, Anal. Chem. 2021]: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c02349

第70届美国质谱年会（70th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics）于明尼苏达州（Minnesota）当地时间2022年6月5-9日（北京时间 2022年6月6-10日）举办，会议期间布鲁克公司推出新的 timsTOF HT 系统，进一步拓展了革命性的 4D-多组学 timsTOF 平台。timsTOF HT 采用新型第 4 代 TIMS（trapped ion mobility separation，捕集离子淌度分离）XR cell 和14 位 Digitizer，可实现更宽动态范围、更深的肽段覆盖率和更准确的定量分析。该系统在 4D 血浆、组织蛋白质组和表观蛋白质组学中表现出色。这些系统性能的提升不以牺牲超高灵敏度和高通量蛋白质组学分析（例如每天分析 50 个样本（SPD）或是高达 200 SPD 时的超高稳定性为代价，也不影响结果的可靠性（肽段和蛋白水平控制 1% FDR（错误发现率）），并且避免了靶向免疫识别方法中固有的抗原交叉反应性。利用 dia-PASEF 技术，timsTOF HT 质谱仪可以微克级样本中，在 60 分钟梯度内鉴定超过 100k 独特的肽段其定量分析 CV 值更是低于 5%。此外，timsTOF HT 还针对高通量、高深度和无偏血浆蛋白质组学和液体活检生物标记研究进行了优化。耶拿大学的 Florian Meier 教授说：“我们与布鲁克的合作实现了流程化组织蛋白质组学分析，这是临床蛋白质组学的一个关键领域。由于组织切片和活检常包含非常异质的细胞群，因此对他们的分析极具挑战性。timsTOF HT 系统的 dia-PASEF 采集模式可以在宽动态范围内对蛋白质进行定量分析，即使是在心脏组织等非常困难的样本中，也不会损失分析通量和灵敏度。”PrognomiQ 公司蛋白质组学部门副总裁 Bruce Wilcox 博士在胰腺癌研究中使用 Seer Proteograph 和 timsTOF Pro 2，在深度、无偏血浆蛋白质组学中对生物标志物进行探索研究。Wilcox 博士表示：“我们收集了 193 个胰腺癌患者和健康人群的样本，并采用 5 种 Seer 纳米颗粒处理样本，在这些样本中共检测到 3822 种蛋白质。通过使用多个 timsTOF 系统，约 2933 种蛋白质在至少 25% 的患者样本中被鉴定到。”在本届 ASMS 上布鲁克还宣布与 Scienion 达成协议，其具有极高灵敏度的 timsTOF SCP 系统与 CellenONE F1.4 单细胞 pico-分配器和新的 ProteoChip™ 进行共同销售，实现了由单一供应商提供的无偏、非标记单细胞蛋白质组学 (SCP) 解决方案。Scienion GmbH 首席执行官兼创始人 Holger Eickhoff 博士评论说：“我们很高兴与布鲁克一起提供完整的 SCP 解决方案。借助扩大合作关系，并通过结合我们 SCP 团队的专业知识来加速单细胞蛋白质组学解决方案的研究与开发，从而更好地满足单细胞蛋白质组学界的需求。”

p style=" text-align: left background: rgb(255, 255, 255) margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 蛋白质组学是对复杂生物样品中蛋白质结构和功能的大规模系统性研究，生物样本的高复杂性和不均一性为蛋白质组学研究带来了极大挑战。近年来，离子淌度与高分辨质谱的联合使用，使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D-蛋白质组学是指在3D分离即保留时间（retention time）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度的基础之上，增加了第四个维度--离子淌度（mobility），根据离子的形态、大小进行分离（图1）。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 305px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/7b2a33cb-0815-40c6-b214-afc66996233a.jpg" title=" 图片1.png" alt=" 图片1.png" width=" 600" height=" 305" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-align: center text-indent: 0em " 图1. 新一代4D-蛋白质组学示意图 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 布鲁克推出的基于timsTOF Pro的4D-蛋白组学平台，采用了创新的TIMS（Trapped Ion Mobility Spectrometry，捕集离子淌度）技术和PASEF（Parallel Accumulation Serial Fragmentation，平行累积连续碎裂）采集模式（图2）。捕集型离子淌度TIMS是指离子在气流的推动下向前运动，将离子按大小和形状分开，在离子运动的反方向施加电场，阻滞离子的运动，将离子trap在特定的位置，然后逐渐降低电场，将离子由大到小逐个释放。timsTOF Pro使用了双TIMS结构，具有独特的PASEF扫描模式，离子在第一个TIMS部分中进行累积并聚焦，然后传输到第二个TIMS中，进行淌度分离和释放；同时第一段TIMS会重新进行新一批离子的累积；并且，四级杆对母离子的选择、碰撞池对离子的碎裂与TIMS中离子的释放同步进行，实现快速、高效的二级采集。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 279px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/60853c3f-0b18-48df-8afc-114acc2bc4ab.jpg" title=" 图片2.png" alt=" 图片2.png" width=" 600" height=" 279" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图2. timsTOF Pro的结构示意图 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 基于timsTOF Pro的4D-蛋白组学平台，具有鉴定深度、定量准确性、检测速度、仪器稳定性等性能的全面提升： /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 具有色谱保留时间、离子淌度、质荷比、谱峰强度4维信息，显著提高对复杂样本的分离能力和谱图质量，促进了共流出组分的同分异构体区分； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 创新双TIMS设计，使离子的累积和淌度分离同步进行，带来近100%的Duty Cycle； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 离子碰撞截面积（CCS）值的准确、高重现性测量； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 灵敏度的革命性提升，适合微量样本的组学分析； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 超过100 Hz二级扫描速度； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 超级稳定的整体设计，能够保证长时间连续样本测试的稳定性，耐用性，易维护。 span style=" text-indent: 2em " & nbsp /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 基于timsTOF Pro的4D-蛋白组学平台不仅适合于蛋白质组的深度鉴定、定量分析，还适合于翻译后修饰的精准研究，临床大队列样本的快速检测，微量样本甚至单细胞蛋白质组研究、蛋白质复合体交联分析等。该平台发布两年多以来，已经得到越来越多的蛋白组学研究团队认可并开始使用此革命性技术，一方面，是因为过去两年多已经有大量的数据证明，timsTOF Pro的采集速度和灵敏度的同时提升大大突破了蛋白组学研究现有瓶颈，这提高了基础蛋白组学研究的水平；另一方面，timsTOF Pro灵敏度和扫描速度上的独特优势，意味着所以可以用更低的进样量和更短的色谱梯度鉴定到更多的蛋白，同时离子淌度的引入，更是大幅提高了数据的完整性和谱图的归属性，这些特点对基础蛋白组学研究向临床蛋白组学应用的转化至关重要。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 4D-蛋白质组学技术提高蛋白和多肽覆盖深度 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " strong 基于质谱技术的蛋白质组学研究方法在生命科学研究的各个领域都取得了傲人的成果，但由于蛋白质组学样本的自身复杂性（蛋白丰度的动态范围& gt 106）和目前质谱仪采集速度和灵敏度的局限性，低丰度蛋白鉴定异常困难，这让深度覆盖蛋白组学面临着巨大的挑战，提高蛋白质组学覆盖深度一直是科研工作者努力的方向之一。 /strong /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 4D组学质谱平台timsTOF Pro的出现，让蛋白组学技术产生了革命性的变化，timsTOF Pro采用双TIMS结构，并采用独特的PASEF扫描模式，可以提供超过100 Hz的MSMS扫描速度，能使二级采集速度和灵敏度同时提高，这个特性可以完美应对传统质谱在采集速度和灵敏度方面的挑战。timsTOF Pro出色的灵敏度，只需要传统分析十分之一的进样量，就可以得到更好的鉴定深度（图3），这让timsTOF Pro更加适合生物标志物研究、药物发现、临床蛋白组学研究和单细胞蛋白组学等这些样本量通常会比较少的应用。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 258px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/c49572a1-0f8c-4b8e-ad7e-510ac1369573.jpg" title=" 图片3.png" alt=" 图片3.png" width=" 600" height=" 258" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图3. timsTOF Pro的蛋白水平和多肽水平深度覆盖 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 4D-蛋白质组学技术带来更精确的翻译后修饰组学研究 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 蛋白质翻译后修饰（如磷酸化、糖基化、甲基化、乙酰化和泛素化等）通过动态调控蛋白的结构和功能，参与信号传导、基因表达、物质代谢等多种生命活动，成为了科研工作的关注焦点。近年来，随着样品制备手段和质谱技术的快速发展，翻译后修饰的研究方法不断涌现。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 传统的质谱分析技术在蛋白质翻译后修饰研究中常面临着巨大的挑战： /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 蛋白质的翻译后修饰在样本中含量低且动态范围广； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 应用于蛋白质翻译后修饰的研究策略主要还是基于鸟枪法的蛋白组学，酶切极大提高了样本复杂度； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 由修饰位点不同带来的同分异构多肽会在色谱上存在严重的共洗脱问题，而这些同分异构肽段在传统蛋白组学质谱平台上不能得到有效分离。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 由于翻译后修饰分布广泛且含量较低，往往需要进行修饰肽段的富集，所得到的样本量较少，需要灵敏度更高的仪器进行检测；此外，翻译后修饰位点、修饰类型的确认，对于蛋白功能的解析至关重要。布鲁克推出的4D-蛋白组学平台timsTOF Pro，提高了峰容量和修饰位点异构鉴定的可信度，具有大于100Hz的扫描速度和优越的灵敏度，显著提高了翻译后修饰的鉴定深度和位点鉴定的准确性（图4）。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 265px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/5bfed120-716a-48f7-b0e9-9801dd628a74.jpg" title=" 图片4.png" alt=" 图片4.png" width=" 600" height=" 265" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em " 图4. 磷酸化组学分析。A.& nbsp 50-100 ug起始蛋白量进行IMAC富集，采用不同色谱梯度，单针分析磷酸化多肽鉴定数目。B. 离子淌度可以准确区分修饰位点异构，提高修饰鉴定和定量的可靠性。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " span style=" color: rgb(79, 129, 189) " strong 4D-蛋白质组学加快组学研究向临床应用转化 /strong /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 蛋白质组学不仅是研究生命活动、疾病机理的最有效方法之一，而且在对癌症、老年痴呆等人类重大疾病的分子诊断和临床治疗方面也有十分广阔的前景。随着样本制备、色谱分离和质谱技术的进步，临床蛋白组学渐渐开始走向大队列研究，矩形研究策略则是趋势。高通量蛋白组学则成为了生物医学基础研究和应用开发的重要前沿和突破口，而如何实现对大队列样本稳定可靠地分析也逐渐成为了科研热点和难点。总的来说，实现高通量临床蛋白组学面临如下挑战： /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 蛋白质组学样本自身的复杂性和不均一性（蛋白丰度的动态范围& gt 106），使得低丰度蛋白鉴定和定量异常困难； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 目前质谱仪采集速度和灵敏度的局限性，使得短梯度下难以实现蛋白深度覆盖； /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp 大队列样本分析对高通量方法和仪器稳定性提出了很高的要求。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 基于timsTOF Pro的4D-蛋白组学平台具有更快的扫描速度、更高的灵敏度和更好的离子选择性，显现出了向临床转化的广阔前景。布鲁克应用专家以及timsTOF Pro的用户做了大量工作，开发了多个成熟的高通量样本检测的应用方案，以探索蛋白组学技术用于临床研究的可能。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 布鲁克nanoElute LC为timsTOF Pro质谱标配的纳升流液相，采用短梯度色谱方法（图5A）28.8min一个循环，单针进样200ng的HeLa平均可以鉴定4180种蛋白质（图5B），26000条多肽（图5C），30针重复的相关系数R& gt 0.97（图5D）。这些结果表明，此方法与timsTOF Pro的高扫描速度和灵敏度结合，能同时兼顾分析通量和蛋白覆盖深度。我们将此方法用于多组份样本分析，小于12小时即可完成24个组份分析（图5E），HeLa样本24个组份可以鉴定大于9000种蛋白质，小鼠小脑样本24个组份可以鉴定大于10000种蛋白质。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 359px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/999652fb-442b-4b16-bebd-29d5867ff800.jpg" title=" 图片5.png" alt=" 图片5.png" width=" 600" height=" 359" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图5. 基于nanoElute短梯度高通量方案 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " span style=" text-indent: 2em " 布鲁克与Evosep公司合作，联合推出用于临床蛋白质组学研究的整体解决方案，timsTOF Pro出色的扫描速度和灵敏度与Evosep One LC强大的分离能力和稳定性完美适配。英国牛津大学纳菲尔德医学系Roman Fischer教授，采用这套系统进行临床大队列的的血液蛋白组研究，用于快速发现疾病标志物。将收集的192例血浆样本去除12个高丰度蛋白，在timsTOF Pro与Evosep液相平台上使用11.5分钟梯度（100例样品/天）分析，样本测试中插入20针QC样本进行质控，总计212个样本仅需51小时测试时间（图6A），这项工作采用传统的质谱方案可能需要接近10天。实验结果显示，采用4D Match Between Runs，192个样本中，可以对500个蛋白进行定量分析，并且CV值小于10%，而QC样本的CV值小于5%（图6B、6C）。 /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " & nbsp /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/7c042971-4e8a-4eca-ae3c-d7e819e5b0f9.jpg" title=" 图片6.png" alt=" 图片6.png" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图6. & nbsp Roman Fischer教授采用的临床血液蛋白组研究案例 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " & nbsp /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 创新的4D-DIA非标记定量技术：dia-PASEF@ /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 布鲁克与苏黎世联邦理工学院、德国马普研究所和多伦多大学合作，将PASEF与DIA（Data-Independent Acquisition，数据非依赖采集）的优势相结合，产生了一种新的采集模式称为dia-PASEF@（图7）。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " & nbsp /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/5d5aae78-f80d-488e-a9e9-da3eab36fa54.jpg" title=" 图片7.png" alt=" 图片7.png" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图7. 全新dia-PASEF@采集策略 span style=" text-indent: 2em " & nbsp /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 在dia-PASEF@扫描模式中，母离子在进入四级杆之前已经通过淌度进行了累积和分离，根据碰撞截面积（CCS）大小依次洗脱（与m/z有一定相关性），这样四级杆就可以根据洗脱离子的m/z进行离子选择，并且每批PASEF都会有多个窗口进行扫描，从而提高离子的利用率，避免了传统DIA方法中离子利用率低的问题。此外，使用离子淌度和质量数双重隔离窗口来触发MS/MS，提高了母离子选择和匹配的准确性，并降低了二级混合谱图的复杂性。并且在一级热图中，可以选择多电荷区域作为dia-PASEF@的母离子窗口，有效屏蔽单电荷杂质的干扰。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 306px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/df424259-85f1-478c-8cd3-dc81f106d619.jpg" title=" 图片8.png" alt=" 图片8.png" width=" 600" height=" 306" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图8. dia-PASEF@进行高通量、微量样本的蛋白质组定量分析 span style=" text-indent: 0em " & nbsp /span /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " dia-PASEF@具有更深的蛋白质组覆更高的分析通量和更优异的灵敏度，适合于高通量、微量样本的蛋白质组定量分析。采用95min梯度，单针进样200ng的HeLa，利用dia-PASEF@可以鉴定超过7,600种蛋白质、66,000种肽段。采用不同长度的梯度，30min可以鉴定6395个Hela细胞蛋白、4032个Yeast蛋白，达到快速、深度覆盖。即使在微量样本时，如单针进样10ng的Hela，仍能鉴定3000种蛋白质。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 布鲁克在ASMS 2020发布了高通量dia-PASEF@方案（图9A），即将Evosep One LC与timsTOF Pro再次联合，最大程度发挥Evosep One LC快速分离和timsTOF Pro扫描速度和稳定性的优势。该方案目前有4种方法（图9B），分别采用4.8min、7.2min、14.4min和24min色谱方法，对应的每天可以分析300、200、100和60蛋白质组学样本，把蛋白组学分析通量提升到一个全新的高度。分析结果（图9C，9D）显示出此方案在保证分析通量的同时，蛋白覆盖深度也有很好的保证，4.8min的分析单针可以鉴定2158蛋白，24min可以得到与传统蛋白组学长梯度分析相当的结果。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 284px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/fb3f5696-51bb-453a-8e70-cf3ba53b5151.jpg" title=" 图片9.png" alt=" 图片9.png" width=" 600" height=" 284" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图9. 高通量dia-PASEF@方案 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 英国牛津大学Roman Fischer教授采用高通量dia-PASEF@方案，进行血液蛋白质组学大队列研究，43天完成4300针连续进样，总共采集2.5亿张二级谱图，整个采集过程只需一次离子传输管清洗（图10）。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 324px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/4ca80514-f97a-4b36-b172-fa4ce1cf4a03.jpg" title=" 图片10.png" alt=" 图片10.png" width=" 600" height=" 324" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图10. Roman Fischer教授采用dia-PASEF@技术进行大队列研究 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 创新的4D-PRM靶向定量技术：prm-PASEF@ /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 在布鲁克的革命性timsTOF Pro平台上，通过将PASEF与平行反应监测（PRM）相结合，使其非标记靶向蛋白质组学性能得到了进一步增强。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " prm-PASEF@技术在保持高灵敏度的同时，使靶向离子数目最大化，100ms的PASEF扫描时间可以靶向10个以上的肽段，有效离子利用率提高10倍以上，实现了谱峰上采集点数目最大化，显著提高数据的完整性（图11A）。prm-PASEF@技术根据色谱流出时间、淌度、质荷比以及碎片离子的分辨能力进行离子筛选，具有更好的选择性，定量更加准确（图11B）。此外，来自卢森堡健康研究所Antoin Lesur教授采用prm-PASEF@技术在细胞样本里30min梯度检测213种靶向肽段，在5amol到50fmol范围都可以准确定量，具有优秀的灵敏度（图11C）。 /p p style=" text-align: center text-indent: 0em " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 428px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202007/uepic/4aa99cb0-4e1d-46da-87c1-f588c4faa99a.jpg" title=" 图片11.png" alt=" 图片11.png" width=" 600" height=" 428" border=" 0" vspace=" 0" / /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center " 图11. prm-PASEF@进行靶向蛋白质组定量分析 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 综上，捕集型离子淌度技术引领蛋白质组学进入4D新时代，基于timsTOF Pro的4D-蛋白质组学平台在蛋白质组分析方面展现出极佳的灵敏度、采集速度和覆盖深度，有利于实现更精确的翻译后修饰分析、高通量的临床大队列样本分析。新开发的dia-PASEF@和prm-PASEF@离子利用率高，具有更高的鉴定深度和定量准确性。随着布鲁克和合作团队对蛋白组学方案的不断开发，4D-蛋白质组学必将越来越完善，展现出更加广泛的应用前景。 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " & nbsp & nbsp /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " 参考文献 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Antoine Lesur, et al.,& nbsp New prm-PASEF for highly multiplexed targeted acquisition in clinical samples. ASMS 2020, Poster TP470. /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Christopher M. Adams, et al.,& nbsp Identification and Quantitation of Phosphopeptide PositionalIsomers using Trapped Ion Mobility Spectrometry and PASEF. ASMS 2019, WP 662 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Florian Meier,& nbsp et al.,& nbsp Online Parallel Accumulation–Serial Fragmentation (PASEF) with a Novel Trapped Ion Mobility Mass Spectrometer. Molecular & amp Cellular Proteomics, 2018,17(12),2534-2545. /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Florian Meier,& nbsp et al.,& nbsp Parallel Accumulation–Serial Fragmentation (PASEF): Multiplying Sequencing Speed and Sensitivity by Synchronized Scans in a Trapped Ion Mobility Device. J. Proteome Res. 2015, 14,12, 5378-5387 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Matthew Willetts，et al.,& nbsp High Sensitivity PTM Characterization in Complex Cell Lysates Using Trapped Ion Mobility. ASMS 2019, Poster TP630 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Shourjo Ghose，et al.,& nbsp Analysis of Histones from HEK293T Cells using a QTOF with Trapped Ion Mobility and PASEF Workflows. ASMS 2019, Poster TP642 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Stephanie Kaspar-Schoenefeld,& nbsp et al.,& nbsp High throughput 4D-Proteomics – Application of dia-PASEF & reg and the Evosep One for short gradients. App Note 1867805 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Thomas Kosinski,& nbsp et al.,& nbsp Maximized throughput and analytical depth for shotgun proteomics using PASEF on a TIMS equipped QTOF. ASMS 2018, TP 685 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Thomas Kosinski,& nbsp et al.,& nbsp Plasma proteomics goes high throughput-timsTOF Pro with PASEF and 4D feature alignment to quantify 500 plasma proteins in 11.5min. App Note 1867805 /p p style=" margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em " · & nbsp Thomas Kosinski,& nbsp et al.,& nbsp Short nanoLC gradients optimize throughput on a tims equipped QTOF with PASEF, ASMS 2019, TP 514.& nbsp /p

p style=" text-align: center line-height: 1.75em " 　　 strong 布鲁克全新MALDI-2离子源大幅提高小分子检测灵敏度 & amp CCS值加持让4D-蛋白质组学技术更加强大 /strong /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " strong /strong /p p style=" text-align: center " img style=" max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 316px " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/5c7e847f-df4c-4033-9ac8-9f54cedb0ccb.jpg" title=" MALDI-2-750-395.png" alt=" MALDI-2-750-395.png" width=" 600" height=" 316" border=" 0" vspace=" 0" / /p p 　　1、MALDI-2离子源将小分子分析灵敏度提升 1-2个数量级 /p p 　　2、新的 prm-PASEF方法增强 4D-蛋白质组学分析 /p p 　　3、大规模高精度 CCS值测量用于机器深度学习 /p p 　　4、短梯度 dia-PASEF方法进一步提高 4D-蛋白质组学通量 /p p 　　5、4D数据采集与分析 MOMA提高多肽同分异构鉴定和定量可靠性 /p p 　　6、基于 IP2/GPU实时搜索引擎的 “Run & amp Done”让 4D-蛋白质组学通量更进一步 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　 strong 仪器信息网讯 /strong & nbsp 在 ASMS 2020网络会议上，布鲁克公司宣布推出了首个商用 MALDI strong 后电离( PI ）离子源MALDI-2。 /strong MALDI-2 离子源作为选配项可用于 timsTOF fleX sup TM /sup ESI / MALDI质谱仪上。 span style=" color: rgb(0, 0, 0) " strong 全新的MALDI-2离子源可将小分子和脂质分析的灵敏度提高一到两个数量级 ，从而进一步扩大 MALDI质谱与基于MALDI技术的质谱 成像应用范围。 /strong /span /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " span style=" color: rgb(0, 0, 0) " strong /strong /span /p p style=" text-align: center" img style=" max-width:100% max-height:100% " src=" https://img1.17img.cn/17img/images/202006/uepic/626ed7c0-9105-462a-b2e9-5873dc33b928.jpg" title=" 图片1.png" alt=" 图片1.png" / /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　此外，布鲁克还推出 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 了基于 TIMS / PASEF的 4D-蛋白质组学新方法 /strong /span ，包括全新的 PRM方法 prm-PASEF、短梯度 DIA方法 dia-PASEF、 4D数据采集与分析MOMA Mobility Offset Mass Aligned)以及基于 GPU实时数据搜索引擎的 Run & amp Done 数据分析方法& nbsp 。4D-蛋白质组学每次样本分析能产生成千上万条多肽的精确 CCS (碰撞横截面积)值，这些新的方法都是基于对这些精确的 CCS值的大规模并实时利用， 从而大大提高蛋白、多肽和 PTMs鉴定的深度和可靠性 ，除此之外， CCS值创新性的使用，也为 LFQ分析带来了超稳定和超高灵敏度的性能，并在timsTOF Pro这一极其稳定的这一极其稳定的质谱质谱平台上实现了真正高通量平台上实现了真正高通量4D-蛋白质组学、4D-脂质组学和4D-代谢组学。 /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " span style=" color: rgb(0, 32, 96) " strong 　　一. 在timsTOF fleX上进行上进行SpatialOMx sup & reg /sup 和转化质谱成像和转化质谱成像 /strong /span /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　布鲁克创新的MALDI-2 PI离子源极大地提高了MALDI的灵敏度和应用范围。MALDI-2的的第二个激光器(266nm)在正交方向照射由布鲁克独有的在正交方向照射由布鲁克独有的SmartBeam& #8482 3D(355nm)激光器产生的MALDI离子流中。同时，布鲁克还推出了优化的flexMatrix & #8482 基质配方用于MALDI-2离子源。现在，可以在timsTOF fleX ESI / MALDI仪器上选仪器上选配新的MALDI-2离子源。 /p p style=" text-align: justify line-height: 1.75em " 　　MALDI-2离子源研究先驱、德国明斯特大学(University of Muenster)生物医学质谱学术带头人Klaus Dreisewerd教授表示：“在过去的35年中，MALDI已成为适用于多种应用、独特而快速的分析工具。现在我们开发的MALDI-2离子源，可以显著扩展MALDI的应用领域，例如为小分子分析提供更高的灵敏度，以及的让那些无法在传统MALDI离子源离子化的物质产生信号。因此，配备了MALDI-2离子源的离子源的timsTOF fleX将把MALDI分析带到新的科学研究和分析领域中。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　布鲁克全球质谱成像总监Michael Easterling博士补充说博士补充说到：“随着MALDI成成和和SpatialOMx在药物开发中针对用于组织模型分析价值的不断增长，驱使人们追求更高的灵敏度与多功能性。凭借其极大提高的灵敏度和可涉及化合物类型的宽范围，MALDI-2离子源现在可以进一步增强基于质谱的非目标组织物分析。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　布鲁克现在还为其MetaboScape sup & reg /sup 代谢组学软件提供MALDI-2化合物谱图库。 MetaboScape软件在软件在SCiLS& #8482 Lab MALDI成像软件内可提供自动分析物注释功能，包括直接在组织图像中对许多代谢物、聚糖和脂质进行可靠注释的CCS算法。 /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 二、CCS加持推动4D-蛋白质组学& #8482 的创新 /strong /span /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　prm-PASEF用于定量4D蛋白质组学 /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　在布鲁克的革命性布鲁克的革命性timsTOF& #8482 Pro平台上，通过将PASEF sup & reg /sup 与平行反应监测与(PRM)相结合，使其非标记定量蛋白质组学性能得到了进一步增强。这种独特的的prm-PASEF利用了TIMS的第4维分离和 PASEF的高速扫描的优势，提高了多肽离子的选择性和灵敏度，增加了靶标离子的数目。布鲁克与Skyline团队紧密合作进行prm-PASEF方法开发，现在Skyline软件已经可以分析prm-PASEF数据并生成定量分析报告。 /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　来自卢森堡健康研究所Gunnar Dittmar教授和Antoin Lesur教授共同参与了prm-PASEF的开发，他们评论说：“我们对timsTOF Pro上使用上使用prm-PASEF分析的早期结果印象非常深刻与在其它平台上已经开发多年的PRM方法相比，prm-PASEF的灵敏度和速度已经非常有竞争力。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　哈佛医学院达纳· 法伯癌症研究所、布里格姆女子医院副教授贾Jarrod Marto博士补充道：“自从开始与布鲁克团队合作开发prm-PASEF以来，我们取得了巨大的进展。timsTOF Pro超快的采集速度和离子淌度信息的独特结合，使我们能够的独特结合，使我们能够在临床大队列研究中能够可靠地定量分析潜在的候选生物标记物。此外，利用研prm-PASEF LIVE实时调整采集参数功能可进一步提高实离子利用率和分析通量。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 　大规模、高精度CCS测定用于深度学习 /strong /span /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　采用独特的TIMS技术，多肽的CCS值可以被大规模精确测定，这一新的维值的引入可增加4D-蛋白组学的鉴定结果的可靠性。最近Matthias Mann教授团队在bioRxiv上在线发表了题为《Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from a million training samples》doi: https://doi.org/10.1101/2020.05.19.102285的论文，研究中他们在timsTOF Pro分析了来源于5种生物，并经过预分级的蛋白酶解物，一共采集360针样本得到5700,000 CCS值用于深度学习模型建立，从而进行大规模多肽CCS值的预测。 /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　德国马普生化研究所主任Matthias Mann教授评论道：“气相中多肽离子的肽离子的大小和形状对于基于质谱的蛋白质组学来说是一个未充分开发的维度，现在人们可以预测来源于不同生物体的任何肽段的CCS值，从而充分利用离子淌度这一附加信息，为高级蛋白质组学工作流程奠定基础。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 　短梯度dia-PASEF和MOMA增强4D-蛋白组学性能 /strong /span /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　得益于timsTOF Pro的超快采集速度和超高灵敏的优势，我们开发了新的基于短梯度方法的于短梯度方法的dia-PASEF工作流程，并在越来越多的timsTOF Pro实验室被采用。dia-PASEF可以让数据完整性得到巨大提升，目前PEAKS软件(Bioinformatics Solution Inc.)和Spectronaut软件(Biognosys)已经支持这一工作流程。 /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　Biognosys首席技术官Lukas Reiter博士评论道：“随着随着Spectronaut 14的发布，我们实现了对timsTOF Pro数据的全面支持。新版本软件可以从PASEF数据快速生存谱图库和并有离子淌度的校正功能，从而得到更精确的靶向提取。此外，我们还为timsTOF Pro添加了directDIA功能的支持。我们也很高兴有一台timsTOF Pro在我们的实验室，这可以进一步加快软件的开发，加强对这个全新平台的支持。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　布鲁克蛋白质组学副总裁Gary Kruppa博士补充道：“随着prm-PASEF的推出、dia-PASEF的日益成功，以及由PASEF的稳定性、灵敏度和离子利用率加持的短梯度方法，使timsTOF Pro具有将4D-蛋白质组学实现临床转化能力。此外，TIMS的独特的MOMA(Mobility Offset Mass Aligned)特性能够区分共洗脱的同分异构母离子，得到更加专属的MS/MS谱图。 MOMA功能有助于提高使用短使用短梯度时蛋白覆盖深度，这对我们做转化蛋白组学研究的用户来说至关重要，因为使他们每天在timsTOF Pro上分析50个样本成为可能。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　 span style=" color: rgb(0, 112, 192) " strong 　Yates Lab开发开发‘‘Run & amp Done’’实时搜索引擎用于高通量4D-蛋白质组学 /strong /span /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　布鲁克正式宣布可以使用Proteomic Pipeline(IP2）引擎，该引擎是一款基于GPU计算，并计算，并集成了加州斯克里普斯研究所John Yates教授研发的ProLuCID数据库搜索工具。这个GPU计算的独特的IP2软件由Robin Park博士开发，它允许使用者在数据采集期间实时搜索timsTOF Pro的的 4D数据，数据采集完成即可得到搜库结果。 /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　John Yates III教授和Robin Park博士表示：“计算技术的进步与质谱灵敏度和扫描速度的共同发展，使人们能够获得获得更准确、更大规模的数据分析方法，回答许多生物学问题。基于GPU设计的搜索引擎能同时执行大量多线程并行计算，从而大大缩短搜索时间，并通过将搜库结果反馈到数据采集软件，指导质谱数据采集。与布鲁克的合作让我们感到兴奋，这个引擎能更好的利用timsTOF Pro进行科学研究。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　布鲁克生命科学质谱执行副总裁Rohan Thakur博士补充说：“IP2/GPU解决方案提供了一个软件基础架构，让第三方软件可以通过“插件应用”形式使用，并能利用高性能服务器或云计算来处理数据。我们的战略是致力于开放数据文件格式，以促进应用生态驱动的软件开发，包括我们第三方合作伙伴可以通过API访问的形式从timsTOF Pro用户生态中获利。” /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　欢迎各位专家进入布鲁克虚拟会议室，了解布鲁克在ASMS 2020中的活动进展。John Yates教授、Ron Heeren教授、、Bram Heijs博士、Klaus Dreisewerd教授等专家学者参加了本次发布会并带来精彩的学术报告。 /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　点击参与布鲁克会议： a href=" http://www.bruker.com/events/2020/asms-2020-reboot" target=" _blank" www.bruker.com/events/2020/asms-2020-reboot /a /p p style=" line-height: 1.75em text-align: justify " 　　 /p

p style=" text-align: center " img src=" http://img1.17img.cn/17img/images/201704/noimg/934abd35-8b09-4a0f-ad3e-63227c614184.jpg" title=" 未标题-1.jpg" / /p p 　　近日，由中国农业科学院饲料研究所研究员王建华领衔的创新团队成功创制新型抗生素替代品——新型抗菌抗内毒素双效肽，其安全性高、抗菌性更强，并可解内毒素，具有很好的新药临床化开发优势。相关研究成果于近日在《科学报道(Scientific Reports)》上在线发表。 br/ /p p 　　抗生素耐药性、药物残留及近年出现的“超级细菌”为抗生素类药物的使用敲响警钟，治疗过程中又存在副作用——革兰氏阴性病原菌内毒素脂多糖(LPS)释放，直接威胁机体健康，因此开发新型抗生素替代品迫在眉睫。目前，在食品医药及饲料兽药行业具有广泛应用潜力的抗生素替代品牛乳铁蛋白衍生肽，虽具有广谱杀菌性，但存在溶血性较高、生物安全性低的问题。 /p p 　　王建华团队利用多氨基酸组合定点突变技术，从核心抗菌序列入手，对牛乳铁蛋白衍生肽3个关键位点进行替换，筛选出的2条突变体比母体肽具更强的抗金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)、沙门氏菌活性，且溶血性更低。研究还发现突变体抑制病原菌脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)和蛋白质合成的能力更强。动物实验显示，染菌小鼠注射10~15 mg/kg可在10小时内显著降低体内病原菌量。此外，突变体可结合细菌内毒素，通过降低小鼠血清促炎因子水平抑制炎症产生，减少内毒素对小鼠肺部的诱导损伤，显著提高因内毒素引发毒血症的小鼠存活率。 /p p br/ /p

以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康，甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质，在致病过程中发挥着关键作用，但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期，我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络，研究成果发表在《Cell Research》，标题为“Comparison of viral RNA–host protein interactomes across pathogenic RNA viruses informs rapid antiviral drug discovery for SARS-CoV-2”。　　研究人员采用RNA结合蛋白综合鉴定（Comprehensive identification of RNA-binding proteins by mass spectrometry）技术，全面解析了新冠病毒（SARS-CoV-2）、寨卡病毒（ZIKV）和埃博拉病毒（EBOV）这3种RNA病毒在侵染状态下病毒基因组RNA与宿主蛋白的互作网络。基于病毒基因组RNA-宿主蛋白互作网络，研究人员鉴定出一系列参与不同病毒感染的宿主蛋白质复合物，并深入解析多种宿主因子在病毒感染过程中的功能。在此基础上，研究人员建立了靶向宿主蛋白质的抗病毒药物筛选方法，并筛选出多个具有广谱抗病毒活性的药物。　　该研究不仅绘制了不同病毒RNA-宿主蛋白质的互作网络，为病毒学和抗病毒研究提供了重要的研究资源，还为抗病毒药物的研发提供了新的视角。 　　论文链接：　　https://www.nature.com/articles/s41422-021-00581-y　　注：此研究成果摘自《Cell Research》期刊原文章，文章内容不代表本网站观点和立场，仅供参考。

毒性蛋白质病(Proteinopathy)通常由细胞内或细胞外沉积大量折叠变异的蛋白质(Misfolded protein)所致。在蛋白合成和成熟过程中的任何一个环节出现问题，如蛋白突变、折叠以及翻译后修饰出现异常都有可能会导致蛋白质病的发生。虽然蛋白质病这个术语对很多人来说还比较陌生，但现已证明其和多种严重的神经性疾病，如阿尔兹海默症、帕金森病和肌萎缩性侧索硬化症(ALS)的发生密切相关。靶向蛋白质病的研究也为屡屡受挫的神经退行性疾病治疗提供了新的曙光[1,2]。高内涵整体解决方案的优异体现在七月的Cell主刊中，研究将目光转至由MUC1基因移码突变导致的肾病(MUC1 kidney disease ,MKD)[3]。与神经性退行性疾病类似，MKD目前尚无有效治疗手段。结合细胞系、小鼠模型、病人组织和日益火热的类器官来源样本，研究证实MUC1突变蛋白(MUC1-fs)会大量聚集在细胞内，并最终激活未折叠蛋白应答(Unfolded protein response UPR)，诱发细胞损伤和毒性。因此，MKD也属于蛋白质病的一种。针对该发病机制，研究实施基于高内涵平台的高通量筛选，并成功获得能特异清除突变MUC1蛋白的小分子药物BRD4780。该研究不仅深入我们对蛋白转运异常发生机制的了解，也为多种毒性蛋白质病提供了新的治疗策略和切入点。在七月的研究热点版块中，Nature Review Drug Discovery专门针对发现进行了解析[4]。该研究也体现了珀金埃尔默高内涵整体解决方案的高效应用。成像平台Opera Phenix配合CellCarrier Ultra系列微孔板主导高内涵筛选的同时，并通过水镜优势参与了基于上述四种样本的所有荧光拍摄和动态追踪分析细胞凋亡进程。针对类器官样本的拍摄，PreciScan功能被用于提速拍摄进程和排除不需要的图像采集和分析。所有的荧光分析由Harmony软件完成，尤其是‘spot’分析功能的应用。a疾病解析通过MKD病人和体外模型等样本，研究使用抗体染色方式分析野生型MUC1和对应突变产物的组织和细胞分布。在不同来源的样本中，值得一提的是基于病人诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cells , iPS cells)建立的类器官(Organoid)样本。基于干细胞技术的类器官模型建立和分析也是近年来高内涵的优势应用方向之一[5]。与病人的切片结果一致，野生型MUC1主要分布在类器官的顶膜部位，而突变蛋白则分布在细胞内。进一步研究证明聚集在细胞内的突变MUC1会诱发细胞应激，活化ATF6-UPR通路并最终导致细胞损伤，表明MKD是蛋白质病。基于MKD病人的肾类器官模型染色，图片由Opera Phenix拍摄。红色指示野生型MUC1蛋白；绿色指示突变体MUC1蛋白；蓝色为E-cadherin；黄色为Na/K ATPase标记基底外侧膜。b高内涵筛选为了发现能有效清除突变蛋白的药物，研究针对病人样本建立永生化细胞系，并利用Opera Phenix开展大规模、多指标高内涵筛选。在初筛中，研究关注能清除突变蛋白并无显著细胞毒性的药物，并在此基础上细化筛选药物浓度开展二轮筛选。通过两轮筛选后，研究通过特异性、mRNA水平调控和是否能抑制ER应激药物thapsigargin的细胞毒性三个指标来进一步分析候选药物。高内涵筛选流程图最终，从3713种化合物中，研究成功发现BRD4780满足上述的指标，能有效特异清除突变蛋白的同时不影响MUC1转录水平，并能保护病人模型细胞系不受thapsigargin的应激压力。进一步的实验证明BRD4780能工作于类器官模型和小鼠模型，是非常有潜力的MKD治疗药物。左图：基于细胞系的染色结果，黄色指示野生型MUC1蛋白；绿色指示突变体MUC1蛋白；灰色指示细胞核。右图：对应的统计分析和细胞数变化分析。c机制研究为了解析MUC1突变体亚细胞聚集原理和BRD4780工作机制，研究利用成像技术进行大量共定位研究，并发现病人来源细胞系中MUC1突变体滞留在内质网和高尔基体之间的早期分泌通路中，并与运货受体TMED9有显著的共定位趋势，且这个现象能进一步在多种模型和病人组织中重现。通过动态成像追踪，研究证明BRD4780能将滞留的突变蛋白从早期分泌途径中释放出来，并促进其进入溶酶体降解途径。基于细胞系的亚细胞共定位研究，分析基于Harmony软件的‘spot’分析功能。基于细胞系、小鼠模型、病人组织和类器官来源样本的荧光染色分析，红色指示TMED9；绿色指示突变体MUC1蛋白；灰色指示细胞核。* 荧光图片均由Opera phenix 拍摄。非常有意思的是，在病人样本中研究同时也发现TMED9蛋白水平的上升，而BRD4780处理同样能降低TMED9蛋白水平。此外，通过CRISPR技术敲除TMED9能表型模拟BRD4780的处理效果，清除突变蛋白。因此，TMED9参与了MUC1突变体在早期分泌途径的滞留和积累，并可能是BRD4780的直接作用靶点。针对此，研究采取细胞热移位测定法(Cellular thermal shift assay，CETSA)证实细胞内BRD4708和TMED9存在直接相互作用。凭借其能在生理条件下进行细胞水平分析的优势，CETSA成为了内源蛋白-药物相互作用分析技术的生力军，是表性筛选下游药物解析的利器。基于CETSA方法在细胞水平确认BRD4708能直接结合TMED9综合上述的发现，研究向我们阐释了MKD的发病以及BRD4780的作用机制。通过直接结合TMED9，BRD4780将突变的MUC1蛋白从内质网和高尔基体之间的早期分泌通路中释放出来，加速溶酶体对其的清除。令人兴奋的是，在具有很好的药理性质的同时，BRD4780不仅能作用于MKD，还能作用于其他多种膜相关蛋白导致的毒性蛋白质病，如UMOD突变相关的慢性肾病和色素性视网膜炎等，是非常有潜力的候选药物。MKD的发病机制和BRD4780的作用机制图同时，该研究也是高内涵两大应用领域的精华案例。首先是亚细胞水平成像应用，研究中涉及到的大量定位、共定位研究和动态追踪蛋白转运过程都是高内涵的优势应用场景。其次，更为关键的是，该研究也是成像筛选主导的药物发现案例。从疾病模型表型的建立到靶向逆转疾病相关表型的筛选，和最后下游的药物机制研究，都离不开珀金埃尔默高内涵解决方案。高内涵解决方案，伴随着机器学习的逐渐成熟，将成为创新药物研发行业的新鲜血液[6]。参考文献1. Ganguly G, et al.Proteinopathy, oxidative stress and mitochondrial dysfunction: cross talk in Alzheimer' s disease and Parkinson' s disease. Drug Des Devel Ther. 2017 Mar 16 11:797-810.2. Scotter EL, et al.TDP-43 Proteinopathy and ALS: Insights into Disease Mechanisms and Therapeutic Targets. Neurotherapeutics. 2015 Apr 12(2):352-63. doi: 10.1007/s13311-015-0338-x.3. Dvela-Levitt M, et al.Small Molecule Targets TMED9 and Promotes Lysosomal Degradation to Reverse Proteinopathy. Cell. 2019 Jul 25 178(3):521-535.e23.4. A novel approach to reverse proteinopathies https://www.nature.com/articles/d41573-019-00133-55. Czerniecki SM, et al.High-Throughput ScreeningEnhancesKidneyOrganoid Differentiation from HumanPluripotent Stem Cells and Enables Automated Multidimensional Phenotyping. Cell Stem Cell. 2018 Jun 1 22(6):929-940.e4.6. Machine learning brings cell imaging promises into focus https://www.nature.com/articles/d41573-019-00144-2关于珀金埃尔默：珀金埃尔默致力于为创建更健康的世界而持续创新。我们为诊断、生命科学、食品及应用市场推出独特的解决方案，助力科学家、研究人员和临床医生解决最棘手的科学和医疗难题。凭借深厚的市场了解和技术专长，我们助力客户更早地获得更准确的洞见。在全球，我们拥有12500名专业技术人员，服务于150多个国家，时刻专注于帮助客户打造更健康的家庭，改善人类生活质量。2018年，珀金埃尔默年营收达到约28亿美元，为标准普尔500指数中的一员，纽交所上市代号1-877-PKI-NYSE。了解更多有关珀金埃尔默的信息，请访问www.perkinelmer.com.cn。

中国，上海——2014 年5月29日——国家蛋白质科学中心将于2014年年底正式投入使用。国家蛋白质科学中心配备了先进的规模化蛋白质制备系统，该系统是由我国科学家自主设计的五套大型自动化装置组成，将软件控制、硬件设备和生物应用结合在一起，实现了整个大规模蛋白表达过程的自动化。由贝克曼库尔特科学事业部提供的系统核心-Biomek系列自动化工作站，分别在高通量克隆构建，高通量原核细胞、昆虫细胞以及哺乳动物细胞的培养及蛋白表达，高通量蛋白质纯化等研究领域，为该中心的科研人员提供了强有力平台和技术支持。观看央视专题视频采访，敬请点击：http://news.cntv.cn/2014/05/25/VIDE1400996168085191.shtml 关于贝克曼库尔特生命科学事业部贝克曼库尔特生命科学事业部一直致力于改善全世界人类的健康。处于全球领先地位的贝克曼库尔特公司，为广大科研、商业实验室的生命科学研究工作者们提供先进的仪器系统、试剂和世界级的技术服务与支持，不断促进生物学科研的新技术发展。作为离心机和流式细胞仪的行业领导者，贝克曼库尔特公司长期以来一直是毛细管电泳、颗粒表征和实验室自动化的创新者，其产品主要用于最前沿的重要研究领域，包括基因组学、蛋白质组学等。欲了解更多信息，敬请访问贝克曼库尔特全球网站www.BeckmanCoulter.com和中文官方网站www.beckmancoulter.com.cn。更多详情，欢迎您联系：贝克曼库尔特商贸（中国）有限公司Tel: 021 3865 1000 / 010 6521 3000Fax: 021 5830 6850 / 010 6515 6025www.beckmancoulter.com.cn

成果名称 固液界面（SLIM）蛋白质结晶方法及新型结晶板研制 单位名称 北京大学 联系人 马靖 联系邮箱 mj@labpku.com 合作方式 □技术转让 □技术入股 &radic 合作开发 □其他 成果成熟度 □研发阶段 &radic 原理样机 □通过小试 □通过中试 □可以量产 成果简介： 在结构生物学领域，晶体学是获得蛋白质原子结构的最普遍方法。近年来，尽管人们对蛋白质结晶原理的认识逐步深入，并且在方法研究方面不断有新的突破，但是国际上尚没有一个通用的可以获得蛋白质晶体的方法，蛋白纯化及晶体生长是一个劳动密集、成功率比较低的工作。在这种情况下，蛋白质晶体制备技术的自动化、并行化、小型化创新将大大简化蛋白晶体生长步骤，从而提高工作效率，十分必要。 在此背景下，苏晓东课题组提出一个新的蛋白质结晶概念，即固体液体界面方法（SLIM），该方法可降低蛋白结晶筛选时对蛋白质浓度及量的要求。SLIM主要基于提前滴加池液使其干燥便于储存运输，而后在&ldquo 干滴板&rdquo 上生长晶体时滴加蛋白溶液到&ldquo 干池液&rdquo 中，这为蛋白晶体生长提供了不同的动力学途径。这个方法的一个突出优点是可以利用自动化的多通道的移液设备大批量的准备许多&ldquo 干滴板&rdquo ，从而大大简化蛋白结晶过程并增加通量。为了使这个方法能够实用化，课题组需要尝试及采用各种高通量、自动化移液系统来制造大量低成本&ldquo 干滴板&rdquo ，同时还要设计并制备合适的结晶塑料板材。 作为&ldquo 仪器创制与关键技术研发&rdquo 基金首批支持的项目，在项目资金的支持下，通过结晶&ldquo 干滴板&rdquo 制备仪器的购置，以及结晶板材生产模具的试制，苏晓东教授这一新型蛋白质结晶板的研制工作得以顺利推进。目前，苏晓东课题组已经成功制备了蛋白质结晶&ldquo 干滴板&rdquo 样品，并已获得良好的效果，相关专利申请已进入国家阶段。接下来，课题组将继续与相关公司及厂家合作，进一步研制&ldquo 干滴板&rdquo 的大批量、高通量生产技术，实现该技术成果的转化。 应用前景： 蛋白质晶体制备技术的自动化、并行化、小型化创新将大大简化蛋白晶体生长步骤，从而提高工作效率，应用前景广阔。