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链球菌属

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链球菌属相关的资讯

  • 研究揭示新型抗化脓链球菌感染免疫应答机制
    2月3日,中国科学院上海巴斯德研究所刘星课题组在Nature上,发表题为Streptococcal pyrogenic exotoxin B cleaves GSDMA and triggers pyroptosis的研究论文。该研究首次发现并报道化脓链球菌GAS毒力因子SpeB通过切割激活GSDMA触发皮肤上皮细胞焦亡并抑制其系统性感染。  A族链球菌(Group A streptococcus,GAS),又称化脓链球菌(Streptococcus pyogenes),是自然界广泛存在的一种强毒力致病菌,可通过宿主皮肤及呼吸道黏膜感染并引发多种疾病,包括猩红热、丹毒、致命坏死性筋膜炎、中毒性休克及脓毒症等。全球每年约有7亿人受其感染(50多万死于中重度感染)。GAS的皮肤定植及侵袭能力与其分泌的毒力因子密切相关,其中关键毒力因子之一是链球菌热原外毒素B(streptococcal pyrogenic exotoxin B,SpeB)。GAS感染后临床严重程度与其SpeB表达量呈显著负相关,而具体分子机理尚不清晰。  为探究SpeB在GAS侵袭性感染中功能,研究利用GAS小鼠皮肤感染模型,比较野生型及不同毒力因子缺失GAS菌株致病能力。结果显示,相比于野生型及其他毒力因子缺失菌株感染后出现的严重化脓和坏死性病变,SpeB缺失GAS菌株感染后感染部位未观察明显皮肤溃烂且中性粒细胞明显减少;同时,小鼠表现出更严重的系统性感染和死亡。通过原代皮肤角质细胞GAS感染实验发现,相比于其他菌株,GAS SpeB的缺失使其丧失诱导细胞焦亡样细胞死亡的功能,并促进其系统性感染。在此基础上,研究运用CRISPR/Cas9全基因组敲除筛选平台,筛选鉴定出SpeB诱发皮肤上皮细胞焦亡的关键蛋白:GSDMA——炎性细胞死亡(焦亡)关键执行者Gasdermins家族成员之一。进一步,研究从分子层面详细解析了SpeB激活GSDMA机制:SpeB特异性剪切GSDMA(而非Gasdermins家族其他成员),产生约27kDa的N-末端片段并诱导细胞焦亡;Edman测序和质谱分析发现SpeB切割GSDMA第246位氨基酸;胞内导入体外纯化的GSDMA 1-246aa片段可直接诱导细胞焦亡;脂膜试纸条和脂质体结合实验揭示GSDMA 1-246aa能够与细胞膜磷脂以及含有相应磷脂的脂质体结合;脂质体泄漏实验证明GSDMA 1-246aa能够在特定脂质体上成孔;序列比对结果显示该剪切位点在小鼠Gsdma1中保守;SpeB诱导的Gsdma1切割可诱发小鼠上皮细胞焦亡;小鼠GAS感染部位可检测到Gsdma1剪切;相比于野生型小鼠,Gsdma1的敲除使其对GAS感染更加敏感。  该研究首次发现并报道皮肤上皮细胞(KCs,“宝船”)表达的GSDMA分子(“火炮”)既作为外源病原感受器识别化脓链球菌(GAS,“海盗船”)毒力因子SpeB(“钩锁”),同时作为免疫效应器在细胞膜上打孔(“炮筒”),释放炎性因子(“炮火”)引起细胞焦亡及皮肤化脓坏死性病变,以控制病原菌进一步系统性感染。该研究揭示了机体免疫防御应答中的新型机制——单一蛋白(GSDMA)同时作为病原菌感受器和宿主效应因子,并为由如化脓链球菌等致病菌感染引起的相关疾病的临床治疗提供了新靶点和新思路。  论文链接
  • 变异链球菌的菌落特征与使用范围及培养方法!
    变异链球菌的菌落特征与使用范围及培养方法! 变异链球菌属于甲型溶血性链球菌类,菌体较小,呈圆形或卵圆形,常成双或以短链状排列,革兰染色呈阳性。它在胰蛋白胨培养基中和含有95%氮气及5%二氧化碳混合气体的环境下生长良好。 一、菌种简介平台编号:Bio-53150规格:冻干物拉丁属名:Streptococcus Mutans菌株名称:变异链球菌其他编号:ATCC700610培养基编号:116或114,5% CO2 or 厌氧培养温度:37培养时间:48 小时用途:对红霉素、利福平、利福霉素AMP、壮观霉素、链霉素敏感。血清型C。注意事项:仅用于科学研究或者工业应用等非医疗目的不可用于人类或动物的临床诊断或治疗,非药用,非食用(产品信息以出库为准)保藏条件:斜面菌种和安瓿瓶冻干菌种应在 2-8°C 保存。西林瓶菌种请置于-20°C 保存。甘油请置于-80°C。 二、培养基TSA+5%脱纤维蛋白羊血(血琼脂平板) 三、菌落特征变异链球菌在血平板培养基上呈旺溶血,菌落较小,呈灰白色、圆形,表面突起,菌落质地较硬,有嵌入培养基内生长的趋势。 四、菌种的培养1、菌种是指食用菌菌丝体及其生长基质组成的繁殖材料。菌种分为母种(一级种)、原种(二级种)和栽培种(三级种)三级。工业发酵的有用菌种,其筛选步骤包括菌种分离、初筛和复筛。2、挑选具有某种能力的有用菌种,也称种子制备,是指菌种在一定条件下,经过扩大培养成为具有一定数量和质量的纯生产菌种的制备过程。以作接入发酵罐中进一步扩大菌体量及合成产物之用。3、种子制备包括孢子制备和菌丝体制备 菌种制备。4、保存在沙土管或冷冻管中的生产菌种,用无菌手续挑取少许,接入琼脂斜面培养基上,在25℃(或较高温度)下培养5~7天(或较长时间。所得孢子还需进一步用较大表面积的固体培养基以获得更多孢子(对于霉菌类孢子制备,多数采用大米、小米之类的天然培养基)。5、将培养成熟的斜面孢子制成悬浮液,接种到扁瓶固体培养基上,于25~28℃培养14天。将成熟的扁瓶孢子于真空中抽干,使水分降至10%以下,并放入 4℃冰箱中备用。一次制得的孢子瓶可在生产上延续使用半年左右。6、如果有些生产菌种不产孢子,如赤霉素产生菌或产孢子不多的,则可采用摇瓶液体培养制得菌丝体,作种子罐的种子。种子罐的目的是使接入有限的孢子或菌丝体迅速发芽、生长、繁殖成大量菌体。其中的培养基组分应是易于被菌体利用的碳源(如葡萄糖)和氮源(如玉米浆),及无机盐(如磷酸盐)等。作为发酵罐的种子应生命力旺盛、染色深、菌丝粗壮,无杂菌及异常菌体。接种量一般在10%~20%。 五、使用范围(1)合成培养基。合成培养基的各种成分完全是已知的各种化学物质。这种培养基的化学成分清楚,组成成分精确,重复性强,而且微生物在这类培养基中生长较慢。如高氏一号合成培养基、察氏(Czapek)培养基等。 (2)天然培养基。由天然物质制成,如蒸熟的马铃薯和普通牛肉汤,前者用于培养霉菌,后者用于培养细菌。这类培养基的化学成分很不恒定,也难以确定,但配制方便,营养丰富,培养效果好,所以常被采用。 (3)半合成培养基。在天然有机物的基础上适当加入已知成分的无机盐类,或在合成培养基的基础上添加某些天然成分,如培养霉菌用的马铃薯葡萄糖琼脂培养基。这类培养基能更有效地满足微生物对营养物质的需要。 六、注意事项1)冻干首次活化,干粉要全部用完,不能预留,用无菌吸管吸取 0.3ml 的培养液(即以上建议的培养基配方,不加琼脂)或者无菌水,滴入冻干管中,轻轻振荡至其溶解。吸取全部菌悬液,接种在培养基上(建议不超过 2 支平板);2)经过冷冻干燥保藏,菌种处于休眠状态,复苏培养时可能会延迟生长,这时需较长的培养时间; 若您收到的是已复苏的培养物(非冻干菌),则可以直接用于您的实验,或根需要转接培养;如有不明白之处,请务必先咨询我单位技术人员,避免不必要的损失;二次接种量要多,固体斜面培养基水分要少才能让菌体长得比较明显,液体培养要静止培养;3)微生物菌种应保藏于低温、清洁干燥的地方,室温放置时间过长会导致菌种衰退;4)菌种操作应在无菌条件下进行;转种完毕,应经灭菌再做丢弃处理;5)应根据菌种状况及时转接,冻干菌种保藏时间通常为2-25 年;6)菌种使用过程中如出现杂菌污染或菌种生产性能下降,应及时和微生物菌种查询网联系;7)如若有菌种复苏不活或者污染等情况,请在收到菌钟后 2 个月内联系,逾期不予受理;8)打管操作需由专业微生物技术人员在相应的防护设备中进行,生物危害程度为三类的菌种应在生物安全柜中操作,打管时冻干管应远离面部,保护眼睛;9)安瓿瓶开封:用浸过 75%酒精的脱脂棉擦净安瓿管,用火焰加热其顶端,滴少量(2-3滴)无菌水至加热顶端使之破裂,用锉刀或者镊子敲下已破裂的安瓿管顶端并将冻干管开口处在火焰上过一遍,并保持在火焰旁操作;10)甘油管使用:使用本甘油菌时可以不用完全融解,在甘油菌表面蘸取少量涂板或进行液体培养即可。也可以完全融解后使用,但随着冻融次数的增加,细菌的活力会逐渐下降。 欢迎访问微生物菌种查询网,本站隶属于北京百欧博伟生物技术有限公司,单位现提供微生物菌种及其细胞等相关产品查询、咨询、订购、售后服务!与国内外多家研制单位,生物医药,第三方检测机构,科研院所有着良好稳定的长期合作关系!欢迎广大客户来询!
  • Luminex ARIES A族链球菌检测试剂获FDA许可证
    p   Luminex今天表示,美国食品和药物管理局已经为其ARIES sup & reg /sup A族链球菌检测试剂授予了510(k)许可证,这是中等复杂度的样品测试,用于从喉咙直接检测化脓链球菌擦拭标本。 /p p   该公司指出,这是FDA在过去24个月内已经在其ARIES系统上许可的第六种检测方法。 /p p   Luminex总裁兼首席执行官Homi Shamir在一份声明中表示,该公司的广泛呼吸系统提供了既有目标的检测方法,例如ARIES& reg A族链球菌检测试和可定制的疾病状态面板。通过我们广泛的呼吸测试方案,临床医生可以进入测试快速适应患者不同临床需要的灵活性。“ /p p   ARIES& reg A族链球菌实时PCR测试是Luminex呼吸测试菜单的一部分,还包括ARIES Bordetella测定,白血病流感A / B和RSV测定,NxTAG呼吸道病原体面板和Verigene呼吸道病原体Flex测试。 /p p   对A组链球菌感染的快速准确诊断对于确保及时开始适当的抗生素治疗至关重要,Luminex说,此外,侵袭性感染病例每年在美国造成多达1600例死亡。 /p p & nbsp /p
  • 宁夏化学分析测试协会批准发布《一次性使用卫生用品中金黄色葡萄球菌检验 实时荧光PCR法》等4项团体标准
    各有关单位:根据国家《团体标准管理规定》和《宁夏化学分析测试协会团体标准管理办法》,我协会对《一次性使用卫生用品中金黄色葡萄球菌检验 实时荧光PCR法》等4项团体标准进行了评审,已经通过了专家审查,现予以发布,自2024年5月30日起正式实施,特此公告。 序号标准号标准名称发布日期实施日期1T/NAIA0288-2024一次性使用卫生用品中金黄色葡萄球菌检验 实时荧光PCR法2024-05-172024-05-302T/NAIA0289-2024一次性使用卫生用品中绿脓杆菌检验 实时荧光PCR法2024-05-172024-05-303T/NAIA0290-2024一次性使用卫生用品中溶血性链球菌检验 实时荧光PCR法2024-05-172024-05-304T/NAIA0291-2024一次性使用卫生用品中环氧乙烷残留量的测定 气相色谱-质谱法2024-05-172024-05-30 2024协会团体标准公告-5.17.pdf
  • 汽车内检测到10级致病菌
    近日,英国《每日邮报》援引相关机构的研究结果报道:公厕座便器上每平方英寸(合6.45平方厘米)“潜伏”大约80个细菌,而轿车方向盘、变速杆和后座等部位的同样面积上所检测到的细菌数量接近800个,几乎是公厕座便器的10倍。   汽车真有这么脏吗?根据有关机构的研究表明,车内空气环境质量之恶劣,堪比垃圾填埋场,并且科研人员还在汽车内检测到了10级致病菌中的三甲选手。   中国科学院所属中科理化环境分析研究中心通过气象色谱法、称重法、撞击法、擦拭法等四种实验方法,对车辆的TVOC(总挥发性有机化合物)、可吸入颗粒物、菌落总数和菌种等情况涉及汽车空气状况的物质进行了全面的检测与研究,并最终发布了一份“汽车空气质量检测报告”。   据悉,本次汽车空气质量检测,共检测了50个样品,而这些样品汇集了包括:大众、通用、丰田、本田、马自达等在内的数十个主流汽车品牌旗下的主力车型,至于车辆的使用年限则从1年到15年不等,相对应的行驶里程则在1-27万公里之间。可以说,本次检测的样品基本覆盖了我国当下汽车使用的现状,而由此所获得的结果。应该说,也极具真实性与权威性。   根据检测报告显示,除可吸入颗粒物基本符合国家标准(0.15mg/)外,TVOC、菌落总数情况堪忧。特别是菌落总数方面的情况让人触目惊心。根据《国家室内空气质量标准》,TVOC应0.60mg/,但本次检测的结果,汽车内TVOC超标30%(平均数) 在菌落总数方面,国家标准为1000cfu/,而实际结果为2174.75cfu/(平均值),超标近174.75%。如果与更严格的新加坡标准相比,此次测得的车内空气质量更是超标了近449.5%。此外,研究人员还在某部车内测得了22603cfu/的惊人数据,要知道垃圾填埋场的标准也仅为2500cfu/(新加坡标准)。   在中科理化环境分析研究中心进行的汽车空气质量全面检测中,研究人员不仅检测了可吸入颗粒物、TVOC和菌落总数的数据,并且对车内菌种的情况,进行分析。根据报告显示,研究人员从样本车内检测出,包括:金黄葡萄球菌、大肠杆菌、霉菌、绿脓杆菌和肺炎链球菌在内的多种病菌。此外,研究人员综合各类因素后,认为车内应该还会存在溶血性链球菌、白色念珠菌、沙门氏菌、蜡质芽孢杆菌、节杆菌和感冒病毒等在内的数十种病菌。   在诸多菌类中金黄葡萄球菌、肺炎链球菌和溶血性链球菌这三种病菌应该引起我们的重视。根据细菌的致病性,通常可以将致病细菌封为10个等级,而我们刚刚说到的那三种病菌,在其中恰恰位列三甲。   金黄色葡萄球菌是人类的一种重要病原菌,隶属于葡萄球菌属,可引起局部化脓感染,也可引起肺炎、伪膜性肠炎、心包炎等,甚至败血症、脓毒症等全身感染。并且有“嗜肉菌"的别称。根据统计,在美国由金黄色葡萄球菌肠毒素引起的中毒,占整个细菌性食物中毒的33%,加拿大则更多,占到45%,我国每年发生的此类中毒事件也非常多。   肺炎链球菌简称肺炎球菌,它是引发人类大叶性肺炎的元凶。根据《病原微生物生物实验室生物安全管理条例》中的有关规定,人间传播的微生物名录(待颁布)肺炎链球菌属于三类,也就是最危险的一类。   溶血性链球菌又称沙培林对热,可引起皮肤、皮下组织的化脓性炎症、呼吸道感染、流行性咽炎的爆发性流行以及新生儿败血症、细菌性心内膜炎、猩红热和风湿热、肾小球肾炎等病态反应。   相比TVOC和菌落总数的超标,在专家看来,金黄葡萄球菌、肺炎链球菌和溶血性链球菌的大量存在,是对健康的更大危险,作为位居致病细菌三甲的细菌,它们不仅致病性更强,同时被灭杀的难度也更大。可以说,它们的存在就如同一个个隐形的杀手,对人民的健康造成了直接,但又是相当隐蔽的危险。
  • 解读抗药性极强的超级病菌
    超级病菌是一种耐药性细菌。这种超级病菌能在人身上造成浓疮和毒疱,甚至逐渐让人的肌肉坏死。更可怕的是,抗生素药物对它不起作用,病人会因为感染而引起可怕的炎症,高烧、痉挛、昏迷直到最后死亡。这种病菌的可怕之处并不在于它对人的杀伤力,而是它对普通杀菌药物——抗生素的抵抗能力,对这种病菌,人们几乎无药可用。2010年,英国媒体爆出:南亚发现新型超级病菌NDM-1,抗药性极强,可全球蔓延。   超级病菌的历史   1920年,医院感染的主要病原菌是链球菌。   1960年,产生了耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌(MRSA),MRSA取代链球菌成为医院感染的主要菌种。耐青霉素的肺炎链球菌同时出现。   1990年,耐万古霉素的肠球菌、耐链霉素的“食肉链球菌”被发现。   2000年,出现绿脓杆菌,对氨苄西林、阿莫西林、西力欣等8种抗生素的耐药性达100% 肺炎克雷伯氏菌,对西力欣、复达欣等16种高档抗生素的耐药性高达52%-100%。   2010年,研究者发现携有一个特殊基因的数种细菌具有超级抗药性,可使细菌获得超级抗药性的基因名为NDM-1。同年10月巴西大规模爆发KPC超级病菌导致多名感染者丧生。   抗生素的发展历史   1877年,Pasteur和Joubert首先认识到微生物产品有可能成为治疗药物,他们发表了实验观察,即普通的微生物能抑制尿中炭疽杆菌的生长。   1928弗莱明爵士发现了能杀死致命的细菌的青霉菌。青霉素治愈了梅毒和淋病,而且在当时没有任何明显的副作用。   1936年,磺胺的临床应用开创了现代抗微生物化疗的新纪元。   1944年在新泽西大学分离出来第二种抗生素链霉素,它有效治愈了另一种可怕的传染病:结核。   1947年出现氯霉素,它主要针对痢疾、炭疽病菌,治疗轻度感染。   1948年四环素出现,这是最早的“广谱”抗生素。在当时看来,它能够在还未确诊的情况下有效地使用。今天四环素基本上只被用于家畜饲养。   1956年礼来公司发明了万古霉素,被称为抗生素的最后武器。因为它对G+细菌细胞壁、细胞膜和RNA有三重杀菌机制,不易诱导细菌对其产生耐药。   1980年代喹诺酮类药物出现。和其他抗菌药不同,它们破坏细菌染色体,不受基因交换耐药性的影响。   1992年,这类药物中的一个变体因为造成肝肾功能紊乱被美国取缔,但在发展中国家仍有使用。   超级病菌产生的原因   基因突变是产生此类细菌的根本原因。但在自然状况下,变异菌在不同微生物的生存斗争中未必处于优势地位,较易被淘汰。   抗生素的滥用则是这类细菌今日如此盛行的导火线!由于人类滥用抗生素,使得原平衡中的优势种被淘汰,而这种“抗抗生素”的细菌则树立成长的成为了优势种,取得了生存斗争的优势地位,从而得以大量繁衍、传播。   综上,基因突变是产生此类细菌的根本原因,抗生素的滥用对微生物进行了定向选择,导致了超级细菌的盛行。所以,一方面,我们在寻找解决途径的同时,必须注意对抗生素等物质的使用。否则,超级细菌的生存状况将迅速从“优势”走向“盛世”。另一方面,我们应该积极探索,继续寻找解决方案,而不能过分悲观,因为优势与盛世的距离从不小于劣势与失败。   超级病菌怎样传播?   (1)经血传播:如输入全血、血浆、血清或其它血制品,通过血源性注射传播   (2)胎源性传播:如孕妇带毒者通过产道对新生儿垂直传播   (3)医源性传播:如医疗器械被乙肝病毒污染后消毒不彻底或处理不当,可引起传播 用1个注射器对几个人预防注射时亦是医源性传播的途径之一 血液透析患者常是乙型肝炎传播的对象   (4)性接触传播:近年国外报道对性滥交、同性恋和异性恋的观察肯定证实   (5)昆虫叮咬传播:在热带、亚热带的蚊虫以及各种吸血昆虫,可能对病毒传播起一定作用   (6)生活密切接触传播:与病毒携带者长期密切接触,唾液、尿液、血液、胆汁及乳汁,均可污染器具、物品,经破损皮肤、粘膜而传播。
  • 益生菌活菌计数方法比较研究
    益生菌活菌计数方法现状 随着益生菌功能研究的深入,益生菌越来越多地应用于食品和保健食品中,“ 活菌数”是保证其相关产品质量的一个关键指标。提高益生菌活菌计数方法的准确性和稳定性,可以为企业生产过程中对益生菌相关产品质量的控制、提升食品质量安全水平提供技术支撑,同时可以更好地应用于监管部门的专项抽查、风险监控、执法检验等活动中。 目前较普遍使用的益生菌活菌计数方法是参照国家标准GB 4789.35-2010《食品安全国家标准食品微生物学检验乳酸菌检验》。 食品用乳酸菌主要分为两大类:一类是食品加工用乳酸菌 第二类是具有健康功能的活的乳酸菌,又称益生菌。与食品加工用乳酸菌特征指标不同的是,益生菌产品的活菌数通常都很高,可达到100亿至1000亿以上,而冷冻干燥菌粉原料中活菌数甚至可达到1000亿至10000亿,且生产日活菌添加量与保质期内活菌稳定性通常是益生菌产品最关键的质量标准和功效指标,也是衡量益生菌原料与终端产品市场价值最核心与关键的因素。现行国标在实际应用中发现,进行高活菌密度、某些特殊剂型及配方或含有某些新菌种的益生菌产品的活菌计数时,常常出现结果不稳定或检验结果明显低于生产时活菌添加量的情况。 影响计数结果最主要的影响因素包括稀释液和计数培养基。样品稀释时,三个因素对活菌的准确计数影响最大:稀释比例、稀释液组成和pH值。综述前人的研究经验(2):样品制备的稀释比例为1:5-1:10 稀释后样品悬液的pH值最好与最佳生长pH值-致 因益生菌具有氧敏感性,稀释液中应该含有抗氧化剂。日本研究者Masamichi MUTO和Fumiaki ABE等(2010年)在研究了多种稀释液配方后认为,Mitsuoka' s缓冲液适用于含有严格厌氧的双歧杆菌活菌产品的稀释,该缓冲液含有磷酸盐、半胱氨酸和吐温80,前2个成分分别具有缓冲能力、抗氧化能力,而吐温80则可改善产品在稀释液中的分散能力。(3)目前国标方法选用的培养基如下:以MRS琼脂(厌氧)为总乳酸菌计数培养基 在含有多菌种的产品中,以添加有莫匹罗星抗生素的MRS琼脂(厌氧)作为双岐杆菌选择性计数培养基,以MC琼脂(需氧)为嗜热链球菌选择性计数培养基,以总乳酸菌数减去双歧杆菌和嗜热链球菌数为乳杆菌数。但是,近年来,综述多个研究结果(2, 3),RCM培养基可提高冷冻干燥双歧杆菌的活菌计数准确性。 此外,本实验室多年来采用GB 4789 .34-2003《食品卫生微生物学检验双岐杆菌检验》中推荐的TPY琼脂培养基用于乳酸菌的计数,发现其用于益生菌产品的活菌计数结果较稳定。 为此,本研究比较了两种稀释液及几种计数培养基对两类代表性益生菌产品(冷冻干燥活菌粉原料和益生菌颗粒产品)活菌计数结果的影响,以确定更符合益生菌产品特点的活菌计数方法。
  • 拉曼组技术为抗菌药效评价提供新方法
    抗生素的不当使用一方面贻误病情、导致复发感染,甚至造成人体菌群紊乱,诱导其它疾病的发生,另一方面则加速耐药菌乃至“超级细菌”的出现。因此,如何实现“快、准、狠”的抗生素精准用药既是精准医学的重要前沿,也是遏制耐药性蔓延的核心挑战之一。而准确全面的抗菌效果评价技术是抗生素精准用药的前提与基础。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心与中山大学光华口腔医学院合作发表了基于重水标记单细胞拉曼成像的药物抗菌效果评价技术,在单个细菌细胞精度快速测量药物对细胞代谢活性的抑制性。以此为基础提出的“基于代谢活性的最低抑菌浓度”(“MIC-MA”指数),与目前临床用药普遍依据的“最低抑菌浓度”(“MIC”指数)相比具有重要的特色与优势,因此有望成为指导临床精准用药的新标准之一。该工作近期发表于《分析化学》(Analytical Chemistry)。  据专家估算,目前在必须使用抗生素治疗的临床案例中,高达30~50%存在着治疗方案制定、抗生素选择或抗生素疗程等方面的错误 在重症监护中,约30~60%的抗生素处方均存在非必要抗生素的滥用、非对症抗生素或者非最佳抗生素组合方案等问题。与此同时,目前每年约有70万人死于耐药菌感染 到2050年,这一数目将激增至每年1000万人,大约为每年死于各种癌症的病人总数。因此,2016年9月22日联合国大会193个成员国共同签署了历史性宣言,承诺通力合作扫除“超级耐药病菌”。2016年8月26日中国国家卫计委等14部门联合印发的《遏制细菌耐药国家行动计划(2016-2020)》中明确提出,要“加强抗菌药物应用和耐药控制体系建设”和“完善抗菌药物应用和细菌耐药监测体系”。准确全面的抗菌效果评价技术是抗生素精准用药的前提与基础,但是,临床需求与技术现状的矛盾如此紧迫和突出,以至于2016年9月8日美国NIH悬赏二千万美元,专门激励细菌耐药性临床快检技术的研发。  迄今为止,MIC指数,即体外培养细菌24小时后能抑制培养基内病原菌生长的最低药物浓度,一直是微生物药敏试验、抗菌药效评价和临床抗菌方案制定的主流标准与主要依据之一。然而其测量不仅耗时耗力,且对难以实验室培养或生长缓慢的病菌无能为力。尤其关键的是,MIC只能从抑制细胞数目扩增这一角度反映与测量药效,却无法检测处于“NGMA”(Non-Growing but Metabolically Active)状态的病菌,即在药物作用下已经不再增殖但仍然具备代谢活性的存活细胞。这种状态的病菌在临床上十分常见,如果在抗菌治疗中成为漏网之鱼,将贻误病情,引起复发性感染,进而诱导耐药菌乃至“超级细菌”的频繁出现。因此根据MIC制定抗菌治疗方案有可能出现“不够快、不够准、不够狠”的情况。  针对上述瓶颈问题,研究人员开发了基于拉曼组(Ramanome)的细菌药物应激效应成像技术(如图),有效地克服了上述缺陷。该研究以导致龋病的变形链球菌(Streptococcus mutans)与多种临床常见抗菌药物为模式,证明单细胞拉曼成像能够精确测量细胞利用胞外重水(D2O)分子的速率,而后者与该细胞的代谢活跃程度呈高度的正相关。因此与重水标记耦合的单细胞拉曼成像能够从对微生物代谢活性抑制的角度定量测量药效,让处于“NGMA”状态的细胞无所遁形,从而使抗菌治疗方案“够准”。同时,由于该方法具备单个细菌细胞的精度,因此对于绝大部分细菌、古菌和真菌,该方法能够测量同一样品内不同细胞之间在抗菌效应上的差异程度,评价病菌细胞群体或群落在药物作用下是否已被“赶尽杀绝”,从而使抗菌治疗方案“够狠”。实验还证明,该方法能够在半小时内快速区分氟耐受型和氟易感型的变形链球菌,这一高度灵敏性对于评价抗菌效果是否“够快”具有重要意义。  基于上述重水标记单细胞拉曼成像技术,研究人员提出了名为“基于代谢活性的最低抑菌浓度”(“MIC-MA”指数)的抗菌药效指标,即药物作用8个小时后所有细胞其代谢活性彻底、且全都被抑制的最低药物剂量。对于特定病菌和特定抗菌药物,MIC-MA指数与MIC指数显著不同。在该研究测试的三种抗菌药物的MIC剂量下,尽管变形链球菌细胞群体已经不再生长与扩增,但大部分的细胞都仍然保持着一定的代谢活性。事实上,在高达60倍MIC的氨苄西林剂量时,仍然存在高比例的“NGMA”状态的变形链球菌细胞,这导致在抗生素压力消失时病菌“星火燎原”,发生复发性感染。这说明MIC-MA在评价抗菌药效是否“快、准、狠”等方面,与目前临床上普遍参照的MIC相比,具有重要的特色与优势。  此外,传统MIC检测将受试微生物作为同质化的群体来看待,忽视了针对细胞之间药效异质性的考察与评价。而MIC-MA在单个细胞精度的药敏性与药效检测,对于研究考察耐药性形成与微进化机制等方面具有重要意义。  单细胞中心前期已经证明拉曼组能够快速区分细胞药物应激机制(Teng L, et al, Sci Rep, 2016)。因此,拉曼组技术预期将成为指导“个体化”临床精准用药与耐药性快检的新手段与新标准之一,同时,也为新型抗菌药物筛选与研发提供了崭新的共性技术平台。  青岛能源所单细胞中心研究员徐健和中山大学光华口腔医学院教授凌均棨为论文的共同通讯作者,联合培养博士生陶一帆是论文的第一作者。该工作获得了国家自然科学基金委、中科院生物高通量检测分析技术服务网络(STS)等的支持。  论文信息:  Yifan Tao, Yun Wang, Shi Huang, Pengfei Zhu, Wei E. Huang, Junqi Ling*, Jian Xu*. Metabolic-activity based assessment of antimicrobial effects by D2O-labeled Single-Cell Raman Microspectroscopy. Anal. Chem., 2017, DOI:10.1021/acs.analchem.6b05051.  Lin Teng, Yun Wang, Xiaojun Wang, Honglei Gou, Ren Lihui, Tingting Wang, Yun Wang, Yuetong Ji, Wei E. Huang, Jian Xu, Label-free, rapid and quantitative phenotyping of stress response in E. coli via ramanome. Sci Rep, 2016. 6:34359. DOI:10.1038/srep34359.基于重水标记单细胞拉曼成像的药物抗菌效果评价技术示意图
  • 超级细菌几乎可抵御所有抗生素 10年内无药可治
    能抵御几乎所有抗生素 已致死一人 多为旅行感染 一些细菌被发现含NDM-1基因 澳大利亚专家观察“超级细菌”   比利时医疗人员13日证实,一名比利时人死于据信源自南亚的超级细菌。这种细菌抗药性极强,几乎能抵御所有抗生素,已经感染英国、美国、瑞典、荷兰、澳大利亚个别居民。欧洲专家预计,至少10年内没有抗生素可以有效对付这种细菌,因此呼吁全球密切监控阻止超级细菌传播。   一个多国专家小组提醒,超级细菌感染者多为曾在南亚国家旅行或接受手术的人。对于研究人员将超级细菌源头指向印度,印度政府表示强烈不满。   比利时 一感染者死亡   比利时布鲁塞尔一家医院的医生13日告诉当地媒体,一名曾在巴基斯坦出车祸并在那里接受短暂治疗的比利时男子于今年6月死亡。这名医生没有交代死者身份,只说他在巴基斯坦入院治疗时感染含超级抗药基因NDM—1的细菌。“他遭遇车祸,腿部受伤,因接受大手术入院治疗,随后回到比利时,但回国时已感染这种超级细菌。”医生说。   医生曾用强力抗生素黏菌素治疗这名患者,但仍无法挽救他的生命。按法新社说法,这名比利时男子是“NDM—1超级细菌”致死第一人。另有一名比利时男子因在黑山遭遇车祸感染这种超级细菌,随后在比利时接受治疗,上月康复。   英国 去年已发现病例   英国医学杂志《柳叶刀》最新一期刊登研究报告称,2009年英国就已经出现了NDM—1感染病例的增加。参与这项研究的英国健康保护署专家大卫利弗莫尔表示,大部分的NDM—1感染都与曾前往印度等南亚国家旅行或接受当地治疗的人有关。   而研究者在英国研究的37个病人中,至少有17人曾在过去1年中前往过印度或巴基斯坦,他们中至少有14人曾在这两个国家接受过治疗,包括肾脏移植手术、骨髓移植手术、整容手术等。不过,英国也有10例感染出现在完全没有接受过任何海外治疗的病人身上。   澳大利亚 三人确诊   研究人员警告,随着越来越多美国人和欧洲人赴印度、巴基斯坦接受整形手术,超级细菌可能在全球蔓延。法新社援引堪培拉医院传染病部门主任科利尼翁的话报道,曾赴印度接受手术的3名澳大利亚人确诊感染超级细菌,“我们在他们的尿液中发现这种具多重抗药性、难以对付的细菌。如果细菌传染给其他人,确实是个问题。”   法国 “超级细菌”威力减弱   法国国家医学与健康研究所13日报告说,该国一家医院日前在一名受伤者的皮肤样本中发现具有超强抗药基因的细菌菌株,但这些菌株的抗药性不太强,这名受伤者也未受到感染。   研究所专家诺曼德当天对媒体说,医生在治疗一名受伤者时提取了他的皮肤样本,后来发现样本中有一些细菌菌株含有超级抗药的NDM-1基因,患者随后被隔离治疗。根据目前掌握的情况,这名受伤者并未感染“超级细菌”,其健康状况很稳定。   NDM-1基因之所以引起医学界的担忧,是因为携有该基因的一些细菌对抗生素具有抗药性。但法国发现的携有这一基因的细菌对几种药物不具备有效“抵抗力”,法国医学专家因此呼吁民众不要惊慌。   危害多大 10年内无药可治   NDM—1,意思是“新德里金属蛋白酶—1”,是一种超级抗药性基因。这种脱氧核糖核酸结构可以在同种甚至异种细菌之间“轻松”复制。研究人员现阶段多在大肠杆菌和肺炎克雷伯氏菌等细菌内发现NDM—1基因。   含这种基因的细菌对几乎所有抗生素具有免疫力。就连“杀伤性较强的”碳青霉烯类抗生素也拿这类细菌束手无策。欧洲临床微生物和感染疾病学会说,预计至少10年内没有抗生素可以“消灭”含NDM—1基因的细菌。澳大利亚堪培拉医院传染病部门主任彼得科利尼翁说:“这类细菌难以对付,(更准确地说,)我们没有任何药物可以对付它。”   如何应对 全球严密监控   美联社分析,这种超级细菌虽恐怖,但控制它的传播并非没有办法,毕竟迄今感染患者人数较少。英国伯明翰大学分子遗传学教授克里斯托弗托马斯说:“我们可能正处于新一轮抗生素抗药性的初始阶段,我们仍有能力阻止它。”他认为,良好的监控和疾病控制程序可以阻止超级细菌传播。   加拿大卡尔加里大学微生物学专家约翰皮特奥特这般评论《柳叶刀传染病》那篇关于超级细菌的报告:“应该用极端严密的监控阻止多重抗药性细菌传播。”他建议国际社会加强对超级细菌的监控,尤其是那些推广“医疗旅行”的国家。   谁是祸首?滥用抗生素所致   研究人员认为,滥用抗生素是出现超级细菌的原因。抗生素诞生之初曾是杀菌的神奇武器,但细菌也逐渐进化出抗药性,近年来屡屡出现能抵抗多种抗生素的超级细菌。由于新型抗生素的研发速度相对较慢,对付超级细菌已经成为现代医学面临的一个难题。   风波:印度抗议 凭啥叫“新德里”   印度卫生部发表声明,对英国杂志刊登报告将超级细菌源头指向印度表示不满,并强烈抗议英国卫生部的相关警告及把使细菌获得超级抗药性的基因命为“新德里金属蛋白酶—1”(简称NDM-1)的做法。   印度卫生部声明称,把超级细菌和“印度医院外科手术的安全联系在一起,还用彼此不相关的例子证明这一点……从而说明印度不是一个安全的地方,是错误的。”印度政府还抗议用“新德里金属蛋白酶—1”命名超级抗药基因。印度著名心脏病专家特里罕认为,将“超级细菌”命名为“新德里”,是将这样一个可怕的致病源头直接指向印度,将对印度“医疗旅游”产生严重负面影响。印度外科手术费用远比欧美便宜。据新华社   链接:超级病菌怎样炼成?   1920年 医院感染的主要病原菌是链球菌。   1960年 产生了耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌(MRSA),MRSA取代链球菌成为医院感染的主要菌种。耐青霉素的肺炎链球菌同时出现。   1990年 耐万古霉素的肠球菌、耐链霉素的“食肉链球菌”被发现。   2000年 出现绿脓杆菌,对氨苄西林、阿莫西林、西力欣等8种抗生素的耐药性达100% 肺炎克雷伯氏菌,对西力欣、复达欣等16种高档抗生素的耐药性高达52%-100%。   2010年 研究者发现携有一个特殊基因的数种细菌具有超级抗药性,可使细菌获得超级抗药性的基因名为NDM-1。
  • 一谱识菌: MALDI-TOF MS 在病原微生物临床应用的专家共识
    摘要 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术在微生物学检验中具有检测速度快、鉴定准确率高、检测成本低、检测通量高、可鉴定菌种类型广泛等特点。随着微生物质谱技术的快速发展和广泛应用,MALDI-TOF MS的规范化使用及管理、技术要点等内容亟须广泛普及,以更好推动该技术在临床微生物学实验室的高效使用。专家组通过对国内外相关指南共识及文献的阅读和讨论,结合我国MALDI-TOF MS的临床应用现状,就临床实际工作中存在的常见问题,对影响或决定MALDI-TOF MS技术规范化使用、结果准确解读、科研探索等方面存在的问题进行了反复和深入的讨论,最终形成本共识。随着实践经验的不断总结和临床研究的不断深入,编写组将不定期对共识内容进行更新和完善。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)是一种新型软电离有机质谱技术,用于分析生物分子(如DNA、蛋白质、多肽、糖类等)和大分子量的有机分子 [ 1 ] ,使得微生物蛋白质指纹图谱进行菌种鉴定成为可能。随着MALDI-TOF MS仪器临床使用日渐广泛,越来越多的临床问题需要规范。本专家共识旨在对日常使用MALDI-TOF MS进行病原微生物鉴定的常见问题给出详细建议,仅供临床微生物学实验室参考。 一、概述 问题1: MALDI-TOF MS进行病原微生物鉴定的优势和局限性有哪些?推荐意见1 :推荐MALDI-TOF MS作为细菌、酵母及酵母样真菌鉴定的首选方法之一。MALDI-TOF MS用于病原微生物鉴定,与临床常用微生物鉴定方法包括菌落和镜下形态学、生化、免疫学以及基因测序相比,具有明显的优势 [ 2 , 3 ] 。1.快速、简便、通量高:前处理及上机操作步骤操作简单,短时间内即可完成多标本检测。2.准确度高:MALDI-TOF MS的鉴定准确率为90.0%~95.0%,显著高于微生物生化鉴定系统 [ 4 ] 。MALDI-TOF MS检测的是保守且具有种特异性的核糖体蛋白,对近缘菌种的区分能力较传统方法更强,尤其对有重要临床意义的菌种鉴定有明显优势。例如对凝固酶阴性葡萄球菌和引起心内膜炎的HACEK群菌种 [ 5 ] 。3.鉴定范围广:相比生化鉴定方法,MALDI-TOF MS能鉴定更多的临床菌种,除了常见细菌,还适用于分枝杆菌、酵母及酵母样真菌、丝状真菌、专性厌氧菌等 [ 6 ] 。根据行业标准《医用质谱仪第2部分:基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪》(YY/T 1740.2-2021),商业参考谱图数据库应包含≥700种微生物 [ 7 ] 。4.检测成本低:试剂耗材(靶板、试剂、校准品)少、成本低。尽管MALDI-TOF MS有许多优势,但也需要注意该技术在微生物鉴定方面的局限性,主要包括以下几个方面:(1)部分近缘菌种鉴定易混淆。近缘菌种由于核糖体蛋白的内在相似性,使得谱图难以区分,包括但不限于大肠埃希菌/志贺菌属、蜡样芽孢杆菌复合群、肺炎链球菌和缓症链球菌群、洋葱伯克霍尔德菌复合群、鼻疽/类鼻疽伯克霍尔德菌、无色杆菌属、弗劳地柠檬酸杆菌复合群、阴沟肠杆菌复合群、沙门菌属、结核分枝杆菌复合群 [ 6 ] 。随着数据库的扩展和算法的改进,区分以上近缘菌种的能力会逐步改善。各制造商的易混淆菌种清单可参考相应的产品说明书。(2)混合菌鉴定困难。尽管有不少研究尝试对混合培养物进行鉴定 [ 8 , 9 , 10 ] ,但尚无可靠的混合菌鉴定系统投入临床使用,目前的MALDI-TOF MS准确鉴定仍需以获得纯菌落为前提。(3)仅适用于可体外培养并形成纯菌落的病原微生物。MALDI-TOF MS目前无法用于耶氏肺孢子菌、衣原体、立克次体等微生物的鉴定。(4)数据库存在局限性。MALDI-TOF MS的微生物鉴定性能依赖于制造商数据库中菌种的覆盖程度,建库菌株的数量和来源,入库谱图的质量等 [ 3 ] 。因此,当制造商数据库(包括临床库与科研库)无法满足用户当地的菌种鉴定需求时,实验室可以通过自建库进行补充,若自建库与本品牌的科研库鉴定发生冲突,应采用基因测序进行确认,参见问题11。 二、标本制备 问题2:在MALDI-TOF MS鉴定过程中,如何保证生物安全?推荐意见2: 确定或疑似高致病性的微生物,在鉴定前需依据其生物学特征进行充分灭活,确保生物安全。操作要点:(1)MALDI-TOF MS鉴定过程中,应根据《微生物和生物医学实验室生物安全通用准则》保证生物安全,包括对鉴定病原微生物的灭活、化学试剂的防护以及医疗废物处理等。(2)MALDI-TOF MS操作应在生物安全二级及以上实验室进行,涉及活菌操作应在二级生物安全柜内完成。(3)操作中使用的甲酸、乙腈及三氟乙酸(trifluoroacetic acid,TFA)等化学试剂,应做好通风,避免体表接触。(4)布鲁菌、炭疽芽孢杆菌、结核分枝杆菌以及疑似高致病性病原菌的质谱鉴定,需采用具有灭活效能的试剂进行相应处理,如乙醇、TFA [ 11 , 12 , 13 ] 。灭活后在二级及以上生物安全柜内使用甲酸乙腈提取法涂布靶板 [ 13 ] 。为保证生物安全,亦可增加预灭活步骤,如在平板中加入75%的乙醇溶液,完全覆盖培养物,静置30 min后挑取菌落鉴定。此外,建议对分枝杆菌额外增加高温灭活的步骤(80 ℃/90 min或95 ℃/30 min) [ 11 , 14 ] 。问题3 不同类型病原微生物的前处理流程?推荐意见3: 推荐MALDI-TOF MS 鉴定不同类型的病原微生物时,采用适宜前处理方法进行操作,其中甲酸乙腈提取法应用范围较广。MALDI-TOF MS 鉴定前处理的主要目的是灭活病原微生物、破坏其细胞壁及提取胞内蛋白质。不同类型微生物细胞壁的结构和成分不同,破壁难易程度有别,从而直接影响蛋白质释放。因此需要选择适当的前处理流程,主要包括:直接涂抹法、原位甲酸提取法、甲酸乙腈提取法、双甲酸法等多种方法 [ 6 ] , 图1 中总结了不同类型微生物的 MALDI-TOF MS 样品制备流程。图1 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定不同病原微生物适用的前处理方法高致病性微生物的鉴定,应在灭活后采用甲酸乙腈提取法。双甲酸法能有效提升丝状真菌的检出率 [ 15 ] ,且较甲酸乙腈提取法更简单。但无法保证对真菌的充分灭活,尤其是挑菌涂抹靶板过程中孢子可能溢散,需要考虑生物安全及交叉污染风险。部分分枝杆菌与丝状真菌等病原微生物细胞壁厚,即使采用推荐的前处理方法,谱图质量仍不理想,应摸索更适当的前处理方法,如添加超声(18 ℃下进行,40 W 峰值功率和50% 占空比超声 1 min [ 16 ] )、冻融(‒ 75 ℃ 30 min或‒ 20 ℃ 60 min,室温融化 [ 17 ] )等步骤。问题4: 培养基对MALDI-TOF MS鉴定病原微生物有什么影响?推荐意见4: 使用不同培养基通常对MALDI-TOF MS鉴定结果影响不大,推荐优选非选择性的固体培养基进行鉴定。用固体和液体培养基获得的图谱可能存在差异,研究表明液体培养基会降低某些微生物的鉴定准确率 [ 18 , 19 , 20 ] ,但绝大部分情况下对鉴定结果影响不大 [ 3 , 6 ] 。尽管在液体培养基中微生物生长状态更为均一,但固体培养基更符合临床应用场景 [ 21 , 22 ] ,建议选择制造商推荐的培养基。不同固体培养基对于常见病原微生物的核糖体蛋白影响甚微,对鉴定准确性影响不大,但以下原因会对图谱质量产生影响 [ 22 , 23 , 24 , 25 , 26 ] 。培养基影响微生物蛋白质表达谱:MALDI-TOF MS蛋白质指纹图谱主要由核糖体蛋白和其他高丰度管家蛋白的信号组成。培养基对于前者影响小,但是可能会通过改变其他蛋白质的表达情况而影响谱图 [ 23 , 27 ] ,具体机制不明。培养基成分造成的电离抑制效应:培养基含有多种选择性成分,包括抗菌药物、盐和酸碱指示剂等。盐是质谱的电离抑制剂,例如使用直涂法鉴定麦康凯培养基(MacConkey agar,MAC)培养的假单胞菌时,可能由于培养基中含有胆盐成分造成电离抑制而影响鉴定,但某些肠道分离株的鉴定似乎不受MAC成分的影响 [ 26 ] 。培养基中的色素可影响鉴定结果:虽然暂无培养基中色素影响质谱鉴定的报道,但Buskirk等 [ 28 ] 研究发现真菌色素会抑制解吸/电离过程,电离抑制存在浓度依赖性,在高黑色素浓度(5 000 ng/spot)下接近 100%,提示含色素的培养基如MAC可能具有类似的效果 [ 26 ] 。血琼脂培养基中的血红蛋白可对谱图造成干扰:生长在哥伦比亚血培养基上的金黄色葡萄球菌较甘露醇盐琼脂培养基上菌落具有更多的峰 [ 27 ] ,但不会改变菌种的鉴定结果 [ 21 ] 。问题5: 哪些临床标本可直接进行鉴定?推荐意见5: 推荐MALDI-TOF MS直接鉴定血培养阳性标本,按照标准操作流程,可有效缩短标本周转时间(turnaround time,TAT),但应注意其局限性。原则上MALDI-TOF MS鉴定需采用纯菌落,但有部分临床标本无须分纯培养即可直接进行质谱鉴定,包括血培养阳性标本、尿液标本、无菌体液标本,其中用血培养阳性标本直接鉴定较为成熟,能缩短TAT,满足临床快速诊疗的需求。血培养阳性标本:菌体的富集是影响阳性血培养直接鉴定效率的重要因素 [ 29 , 30 ] 。通过富集技术处理阳性血培养标本后,直接用MALDI-TOF MS进行鉴定 [ 31 ] ,主要方法有短时培养法、分离胶促凝管富集法和试剂盒富集法( 图2 )。此外,需关注血培养阳性样本的涂片革兰染色结果是否为单一病原微生物,如有两种及以上形态的病原微生物,可影响鉴定结果。图2 血培养阳性病原微生物的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定方法尿液标本:研究表明尿路感染患者的尿液中有足够的菌量(≥10 5 CFU/ml),可直接进行病原微生物质谱鉴定,建议先用尿分析仪对菌量进行评估 [ 32 ] 。同样需要关注涂片革兰染色是否为单一病原微生物。参考步骤:(1)低速(2 000~4 000× g)离心去除白细胞、细胞碎片及黏液;(2)高速(10 000~14 000× g)离心沉淀菌体;(3)无菌水清洗沉淀后用甲酸乙腈提取法进行MALDI-TOF MS上机前处理 [ 32 , 33 , 34 ] 。无菌体液标本:脑膜炎患者的脑脊液标本的直接质谱鉴定方法报道相对较少 [ 35 , 36 ] ,主要因为标本中菌量较低,检测灵敏度无法保证。研究显示无菌体液如脑脊液 [ 37 ] 、腹腔积液 [ 38 ] 、关节滑液 [ 39 , 40 ] 标本可先接种于血培养瓶中进行培养增菌,在血培养仪报阳后进行质谱鉴定,同样能显著缩短TAT。此外,略过分纯培养步骤,直接用原始标本进行质谱鉴定病原微生物仍存在局限性:(1)无法鉴定混合微生物;(2)标本中人体细胞干扰或菌量不足可能导致鉴定结果不可靠 [ 32 , 41 ] ,因此在进行无菌体液标本直接鉴定的同时,需要对此标本进行平行的传代培养,并在获得纯菌落后进行最终鉴定结果的确认。 三、结果分析与解读 问题6: 采集到质量较差的谱图时,如何分析原因?推荐意见6: 推荐采用新鲜菌落进行MALDI-TOF MS鉴定,针对不同病原微生物的特征,选择恰当的前处理方法提高谱图质量。合格的谱图应包含丰富的谱峰信息,体现在峰数量较多且分散、强度错落有致、分辨率较高、信噪比较高。在日常工作中,如果质控正常,采集到的谱图质量仍不理想,可能的原因如下 [ 3 , 6 ] 。标本因素:(1)建议使用新鲜的菌落进行鉴定,此时微生物处于指数生长期,有利于采集到优质谱图;随生长时间延长,菌龄增加,影响谱图质量 [ 42 ] 。(2)肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、隐球菌等黏液型菌落,由于细胞壁外有荚膜,导致破壁困难,鉴定性能下降 [ 18 ] ,建议使用棉签拂去菌落表面黏液,再挑取下层菌落进行点靶。前处理操作:若前处理方法选择不当,导致细胞壁破碎效果差,蛋白质释放不足,容易出现杂峰干扰、峰数量少、信号低等问题。点靶操作:因操作者手法问题造成点靶质量差,常见于以下几种情况( 图3A~3D )。(1)菌量过少( 图3B )可能造成谱图信号弱。(2)菌量过多( 图3C ),涂靶过厚,容易造成谱图分辨率差、质量轴漂移等现象。(3)涂靶不均匀( 图3D ),自动采集过程中容易采空,或者厚薄不均造成结晶分布不均,影响激光激发效果,重复性差。(4)培养基成分干扰,挑取菌落时混入培养基,涂靶后鉴定容易受到培养基峰的干扰。图3 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱点靶效果示意图(3A示菌量适宜,3B示菌量过少,3C示菌量过多,3D示涂靶不均匀)问题7: 当谱图质量合格但鉴定结果不理想时,如何分析原因?如何确定处理方法?推荐意见7: 当谱图质量合格但鉴定结果不理想时,推荐通过校准/质控排查仪器原因,观察菌落排查标本混合菌、污染等原因,最后考虑数据库的局限性,可用自建库进行改善。仪器原因:质量轴发生偏移,可能的原因包括未进行校准或校准不当、靶板平整度不合格、结晶不理想及其他仪器系统原因等。可通过在靶板不同区域进行质控/校准菌株的鉴定操作快速排查。当校准/质控未通过或不同区域质量轴差异较大时,需保证靶板的平整度,并及时对仪器进行校准。标本原因:(1)混合菌或者培养物被污染。如果标本在质谱鉴定前未获得纯菌落,谱图中可能含有多菌种谱峰信息,导致鉴定失败。建议重新挑取纯菌落,或者重新通过分纯培养获得纯菌落。(2)标本间交叉污染。操作不当导致的交叉污染,如靶板清洗不充分、不同靶点之间枪头混用、标本溢出靶点等,可能导致谱图信息混杂,影响鉴定结果。建议规范操作并按照说明书正确清洗靶板。(3)培养条件不同。当待测株与建库株的培养方法不一致时,可能鉴定失败。如部分丝状真菌在不同的培养基类型、培养天数、温度等条件下,可能会对谱图产生较大的影响 [ 21 , 43 ] 。数据库原因:(1)数据库菌种覆盖度不足。如果数据库中未包含待测菌株的菌种参考谱图,则无法正确鉴定。(2)待测菌株与数据库中同种菌株差异较大。虽然数据库中包含待测菌种,但由于亚种、地域、标本来源、是否产黏液等因素导致的同种菌株之间差异性,鉴定结果可能不理想。问题8: 单个标本重复鉴定出现不同的鉴定结果,如何解读结果及处理?推荐意见8: 单个标本重复鉴定出现不同结果,多是由于鉴定未到种水平所致。可能匹配质谱易混淆的近缘菌种,也可能是由于分辨率不足/数据库菌种缺失导致的匹配到多个低置信度的同属不同种,如有必要需重新制样或进一步补充其他方法进行区分。多次采集/多点采集鉴定出现不同结果,考虑以下原因和相应处理流程。近缘菌种易混淆:MALDI-TOF MS对于部分亲缘关系相近的菌种没有足够的区分度。常见的易混淆结果是复合群内的不同种,如阴沟肠杆菌复合群,包括阴沟肠杆菌、阿氏肠杆菌、霍氏肠杆菌、神户肠杆菌等,也有可能是属内多个近缘菌种,如李斯特菌属里的单核细胞增生李斯特菌、无害李斯特菌、斯氏李斯特菌、威氏李斯特菌等,甚至可能是不同属的菌株混淆,如大肠埃希菌与志贺菌属。建议关注制造商的易混提示/低分辨提示,再根据临床是否需要鉴定到种水平采取相应措施。种特征不明显:谱图缺失种特异峰,分辨水平低,谱图与数据库中多个菌种匹配。通常体现为谱图质量不高,峰相对少,打分较低。建议采用提取法或者更充分的破壁方法进行前处理。数据库缺少待测菌种:此时谱图可能会与数据库中存在的近缘菌种匹配,得出多个结果。通常发生在少见罕见菌种鉴定,谱图质量好,但分数不高。若多个结果属于同一个属,建议质谱报告为属水平结果,并通过基因测序等其他方法进行种水平鉴定。混合菌和交叉污染:通常体现为不同菌种结果亲缘关系并不相近,且分数不高、峰较多。建议通过规范取样、制样来避免交叉污染;若是怀疑混合菌,进行重新分纯。问题9: 病原微生物采用不同方法鉴定,结果不一致时应如何处理?推荐意见9: 不同微生物鉴定方法学的适用性、病原谱、准确率有区别,当MALDI-TOF MS鉴定结果与其他方法不一致,推荐使用基因测序作为鉴定“金标准”。病原微生物鉴定常见方法包括形态学、生化、MALDI-TOF MS和基因测序鉴定,对于一些肠道病原菌还需补充血清凝集试验。目前实验室采用全自动微生物生化鉴定仪和MALDI-TOF MS较为广泛,而基因测序可作为难鉴定菌的备选方案 [ 44 , 45 ] 。基因测序方法中,Sanger测序能够实现大部分常见微生物的种水平鉴定,但某些菌种(如诺卡菌、非结核分枝杆菌等),其特征核酸序列片段(如16S rRNA)分辨力有限,无法准确鉴定,常需要联合多个特殊性片段测序,甚至需要全基因组测序 [ 46 ] 。在日常的微生物鉴定时,应明确所采用方法的局限性及所要达到的鉴定水平(属/复合群/种),选用适宜的鉴定技术,必要时采用多种方法确认。当不同方法鉴定结果不一致时,需要考虑如下因素:特定病原微生物采用不同方法学鉴定时的可信度:(1)肺炎链球菌和缓症链球菌群,质谱鉴定可能出现错误,而生化鉴定技术可作为补充 [ 6 ] ;(2)鲍曼不动杆菌复合群内菌种,生化鉴定方法尚无法有效鉴别,MALDI-TOF MS可明确区分复合群,基因测序可准确鉴定;(3)肠道致病菌,需补充血清凝集试验实现不同血清型的鉴别。所选择方法的病原菌谱:不同鉴定方法所能覆盖的病原菌谱存在差异,基因测序MALDI-TOF MS生化鉴定。若鉴定结果不一致,应考虑待测菌是否在所选方法的病原菌谱内。如按蚊伊丽莎白金菌可被质谱正确鉴定,但生化鉴定卡的病原菌谱并不包括此菌种,可能被误鉴定为脑膜炎脓毒伊丽莎白金菌。所选择方法的鉴定准确率:目前MALDI-TOF MS鉴定准确率已经接近分子方法,高于生化鉴定。不同方法结果不一致时,基因测序仍被认为是菌种鉴定的“金标准” [ 47 ] 。问题10: 不常见病原微生物的鉴定结果如何验证?推荐意见10: Sanger测序可用于验证不常见病原微生物的质谱鉴定结果,推荐16S 核糖体RNA(16S ribosomal RNA,rRNA)(细菌)/内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)(真菌)作为靶基因,当无法鉴定到种水平,需要加测其他保守基因。对不常见病原微生物的鉴定结果,建议查询其基本信息,并采用其他方法学的复核和验证,优先选择基因测序。病原学分子鉴定技术可采取保守区核酸扩增和Sanger测序结合的方式,细菌靶基因首选16S rRNA基因,通过与数据库中已知序列比对,相似度超过98.7%为同一种 [ 48 ] ,无已知序列超过阈值则可能是新种;真菌首选ITS基因,通常使用相似度97.0%作为同种阈值 [ 49 ] 。当首选靶基因分辨率不足(不止一个种超过阈值)时,需加测其他保守基因,具体可参照临床和实验室标准协会(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)MM18 [ 50 ] 。基于测序技术的快速发展和成本的有效控制,亦可采用基因组测序技术实现不常见病原微生物的准确鉴定,基于基因组序列的平均核苷酸一致性分析,与模式菌株或参考菌株比对分值超过94.0%可认定为待鉴定菌种与模式菌株菌种一致 [ 51 ] 。问题11; 哪些病原微生物鉴定到种水平有重要临床意义?推荐意见11: 临床鉴定病原微生物需要尽可能鉴定到种水平。当质谱分辨率不足时,对于影响公共健康或影响临床决策的病原微生物,推荐采用其他鉴定方法报告到种水平。原则上临床鉴定病原微生物应尽可能鉴定到种水平。MALDI-TOF MS无法鉴定到种时,需根据临床意义判断是否可报告至复合群或属水平。如有必要到种水平,可采用改进前处理提高质谱鉴定分数、或辅以其他方法进一步鉴定。以下几种情况需报告到种水平甚至是亚种水平。影响公共健康、与严重疾病相关的病原微生物:细菌,如炭疽芽孢杆菌、鼠疫耶尔森菌、霍乱弧菌、白喉棒杆菌、单核细胞增生李斯特菌;真菌,如新型隐球菌与格特隐球菌、耳念珠菌等需要报告到种 [ 52 ] 。菌种间致病性存在差异的病原微生物:例如(1)肺炎链球菌是临床常见的致病菌,而口腔/缓症链球菌常被认为是定植菌 [ 53 ] 。(2)血培养常见污染菌如凝固酶阴性葡萄球菌、棒杆菌属、丙酸杆菌等,若≥2套被检出,应鉴定到种以判断其临床意义。(3)血液或无菌体液中的牛链球菌群常与肠道肿瘤密切相关,应鉴定至亚种水平 [ 54 ] 。(4)尿标本分离到的解脲棒杆菌常与肾结石相关 [ 55 ] ,而在乳腺组织、脓液分离出的克罗彭施泰特棒杆菌则与肉芽肿性乳腺炎相关 [ 56 ] ,需鉴定到种水平。(5)嗜水气单胞菌复合群常无需鉴定到种,但如该类细菌引起食源性腹泻需进行病原学溯源或引起肠外血流感染、尿路感染及组织脓肿时,应准确鉴定到种水平 [ 57 ] 。与经验使用抗菌药物相关的病原微生物:例如鲍曼不动杆菌尽管与皮特不动杆菌或医院不动杆菌同属于一个复合群,但鲍曼不动杆菌感染患者往往表现出更高的耐药率和病死率 [ 58 , 59 , 60 ] ,需要进行区分。真菌中容易产生耐药尤其是多药耐药的菌种,例如耳念珠菌
  • 左氧氟沙星滴眼液中抑菌剂的含量测定
    左氧氟沙星滴眼液为微黄色至淡黄色或淡黄绿色的澄明液体。适用于葡萄球菌属、链球菌属、肺炎球菌、细球菌属、肠球菌属等所引起的眼睑炎、睑腺炎、泪囊炎、结膜炎、睑板腺炎、角膜炎等眼部疾病。为防止滴眼液在使用和保存过程中被微生物污染,往往会添加适量的抑菌剂,因此,抑菌剂的合理使用和质量控制已成为保障滴眼液安全性、有效性的关键问题之一。月旭科技为大家带来左氧氟沙星滴眼液中抑菌剂的含量测定方案。色谱条件色谱柱:月旭Xtimate® C18(4.6×250mm,5μm)。流动相:水相(每1000mL水中加入三乙胺4mL和磷酸7mL):乙腈=35:65;检测波长:214nm;柱温:30℃;流速:1.0mL/min;进样量:20μL。谱图和数据1. 空白溶剂2. 苯扎溴铵对照品溶液3. 供试品溶液满量程图局部放大图结论使用月旭Xtimate® C18(4.6×250mm,5μm)色谱柱,在此色谱条件下,可以满足检测要求。产品信息
  • 宁夏化学分析测试协会发布《一次性卫生用品中绿脓杆菌检验 实时荧光PCR法》等2项团体标准征求意见稿
    各相关单位:按照宁夏化学分析测试协会团体标准工作程序,标准起草组已完成《一次性卫生用品中绿脓杆菌检验 实时荧光PCR法》和《一次性卫生用品中溶血性链球菌检验 实时荧光PCR法》2项团体标准征求意见稿的编制工作。现按照我协会《团体标准制修订程序》要求,公开征求意见。请有关单位及专家提出宝贵意见,并将征求意见表(附件)于2024年4月14日前反馈给秘书处。联系人:张小飞 电 话:13995098931邮箱:1904691657@qq.com 关于团标征求意见函 -3.14.pdf团标表格7-专家意见表.doc团体标准 一次使用卫生用品中绿脓杆菌 实时荧光PCR法 魏嘉雯(1).pdf团体标准 一次使用卫生用品中溶血性链球菌检验 实时荧光PCR法 姚博伟0125.pdf
  • FDA批准质谱仪系统VITEK MS用于鉴定193种不同致病细菌和真菌
    2013.8.21,FDA批准美国第一个质谱仪检测系统用于自动识别已知能导致人体严重疾病的细菌和酵母的上市。该质谱仪系统VITEK MS能鉴定出193不同微生物,可在一系列自动化测试过程中进行192种不同的测试,而且每个测试只需要大约一分钟。   谱仪系统VITEK MS可以鉴别诸如念珠菌、隐球菌和马拉色氏霉菌属组的酵母茵和葡萄球菌科、链球菌科、肠杆菌科、假单胞菌科和类杆属组的细菌,这些酵母茵和细菌跟皮肤感染、肺炎、脑膜炎和血液感染有关。HIV或AIDS、癌症治疗或器官移植后的抗排斥治疗损害或削弱免疫系统的患者特别容易受到这些细菌感染。   VITEK MS采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术,该技术利用激光打破酵母和细菌标本成小颗粒,形成一个独特的微生物模型。VITEK MS在检测系统数据库自动将这些微生物模型与193种已知的酵母和细菌进行比对,从而鉴别微生物。   此与其他要求大量微生物繁殖来检测的鉴别方法相比,质谱分析方法只需要少量的酵母或细菌繁殖,所以只要微生物生长到可视程度后就可以马上开始检测,通常在在18到24小时内。传统的方法需要五天才能得出相同的鉴别结果。   FDA通过新型分类程序审查了VITEK MS,这是对一些新型低中度风险且不完全等同于已知合法市售的医疗设备的调控途径。   VITEK MS再临床上用于鉴别由人体标本培养得到的微生物,它与联合其它临床和实验室发现相互结合,从而辅助诊断细菌和真菌感染。   VITEK MS的制造商为北卡罗来纳州达勒姆的生物梅里埃公司。
  • 卫生部将对食品中致病菌含量设底线
    卫生部近日发布通知,就《食品安全国家标准食品中致病菌限量》征求意见。新标准对食品中可能出现的沙门氏菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌等8种致命菌的含量作了明确规定。   新标准规定了肉及肉制品、水产品、蛋制品、粮食制品、豆类制品、焙烤及油炸类食品、糖果、巧克力类及可可制品、调味品、即食食品等17类食品的致病菌含量。其中,对所有采用罐头工艺加工生产的食品,统一规定“罐头工艺生产的食品符合商业无菌”。据卫生部有关人士介绍,该标准在制定过程中,充分考虑到我国的实际情况,结合我国食物中毒的高危食品和致病菌的风险,分析了致病菌对我国各类食品可能产生的风险,同时还参考了国际组织和发达国家的相关标准。
  • 宁夏质量技术协会立项《食品接触用PET瓶盖中大肠菌群检验-滤膜法》等8项团体标准
    各相关单位:根据《宁夏质量技术协会团体标准管理办法》的相关规定,宁夏质量技术协会经专家研究审核,决定对《食品接触用PET瓶盖中大肠菌群检验-滤膜法》《食品接触用PET瓶盖中菌落总数和霉菌检验-滤膜法》《食品接触用PET瓶盖中金黄色葡萄球菌检验》《一次性卫生用品中大肠埃希氏菌O157:H7快速检测方法-实时荧光PCR法》《一次性卫生用品中金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、溶血性链球菌检验-多重实时荧光PCR法》《产可得然胶土壤杆菌菌株诱变筛选技术规程》《可得然胶含量快速检测方法-微孔板法》《产可得然胶土壤杆菌菌株冻干保存技术规程》团体标准批准立项,现予以公示。请参与起草单位严格按照《宁夏质量技术协会团体标准管理办法》团体标准制定工作要求,严把质量关,加强组织协调,增强本标准的适用性和有效性,确保标准高质量,按期完成标准编制工作。标准制定过程中如有问题,请联系宁夏质量技术协会秘书处。联系人:杨老师电 话:0951-8762976地 址:宁夏银川市兴庆区玉皇阁南街292号
  • 矿泉水新标取消菌落总数 强调致病菌
    矿泉水新标取消菌落总数强调致病菌 或致部分水企转型纯净水(图) 矿泉水新标准的出台或将迫使部分企业转做纯净水   记者近日从国家标准化委员会获悉,备受关注的《饮用天然矿泉水》和《饮用天然矿泉水检验方法》的两个国家标准发布,其中溴酸盐有了与世界卫生组织一致的限定值,最高不得超过0.01mg/L。同时增加了粪链球菌、铜绿假单胞菌和产气荚膜梭菌3项微生物指标。   记者从多家水企获悉,如要达标,必须先进行设备的改造,根据企业规模,少则数十万,多则上百万。因此,不排除有水企为降低成本而转型生产纯净水。   取消菌落总数强调致病菌   “此前媒体所报道的溴酸盐致癌也间接导致新标准的修改,总体来说是一个进步。”广州一水企负责人告诉记者,溴酸盐这个问题一直都存在,只是没有引起足够的重视,加上旧的《饮用天然矿泉水》国家标准已经十多年没有修改,确实已经到了要修改的地步。   据其介绍,正常情况下,水中不含溴酸盐,但普遍含有溴化物。当用臭氧对水消毒时,溴化物与臭氧反应,氧化后会生成溴酸盐。国际癌症研究中心(IARC)认为,溴酸钾对实验动物有致癌作用,但溴酸盐对人的致癌作用还不能肯定,为此将溴酸盐列为对人可能致癌的物质。   记者了解到,新标准取消了菌落总数,更强调致病菌。广州八奇饮用水有限公司总经理罗灏认为,这更具科学性。他表示,菌落总数是一个很笼统的概念,产品一开封就会受到污染,菌落总数不合格也是很正常的,但强调致病菌则是另一个概念,更能保障人体健康。   不堪成本压力或转型纯净水   据了解,如要达标,企业必须先进行工艺和设备的改进。罗灏表示,对于矿泉水来说,新标准的实施对产品要求更严格了,但实际上,在保留矿泉水原有口感的情况下,又对溴酸盐有限定值,对企业来说也是不小的难题。溴酸盐致癌在国内的说法也是这几年才出现,目前技术上还不是很成熟,但仍有各种方法可以尝试,大家正在研究一个更高效、节约成本的方法。   记者了解到,企业首先要进行设备的改造,根据企业规模,少则数十万,多则上百万。“不排除有水企转做纯净水,纯净水不存在溴酸盐的问题。”某矿泉水负责人告诉记者,新标准的出台也是规范市场的一个手段,不能达标的将被清出市场。
  • 中科院青岛能源所突破益生菌质检关键技术
    据悉,中国科学院青岛生物能源与过程研究所(以下简称“中科院青岛能源所”)联合中国食品发酵工业研究院等,开发了基于拉曼组原理的益生菌单细胞质检技术SCIVVS,为快速、准确、全面、低成本的益生菌产品质检提供了全新的解决方案。相关成果近日发表于iMeta杂志。长期以来,益生菌质检大多依赖于分离培养或元基因组测序,存在耗时长、成本高、复合益生菌产品深度质检困难等瓶颈。针对这一瓶颈,中科院青岛能源所单细胞中心联合中国食品发酵工业研究院、青岛东海药业和青岛星赛生物等团队,基于拉曼组原理,开发了一种名为SCIVVS的单细胞精度益生菌质检技术。针对益生菌产品,SCIVVS提取所有细胞进行重水饲喂和单细胞拉曼光谱的高通量采集。在每一张拉曼光谱上,利用其指纹区,基于与益生菌单细胞拉曼光谱参照数据库的比对,快速完成每个细胞的种类鉴定环节。通过构建21种法定可食用益生菌的标准菌株拉曼光谱数据库,SCIVVS可实现平均高达93%的分辨准确度。同时,利用其重水利用峰(C-D峰),则可针对每个物种,量化每个细胞的活性、代谢活力等。进而可通过拉曼激活单细胞分选技术,快速获得目标种类或目标代谢活力的单细胞,从而对接下游单细胞全基因组测序或培养。为了支撑SCIVVS,中科院青岛能源所和青岛星赛生物合作,成功研制单细胞拉曼光镊分选仪、高通量流式拉曼分选仪。运用单细胞拉曼光镊分选仪,研究人员直接从纯种或复合益生菌产品出发,在5个小时之内,完成了精确到每个物种的活细胞计数、活力定量和活力异质性测量。同时,针对乳酸杆菌、双歧杆菌或链球菌等各种益生菌,均能产出高质量的单细胞基因组(覆盖度可高达99.4%),从而完成精准溯源。对比目前的益生菌产品质检方法,SCIVVS具有快速、准确、全面、低成本、易于自动化等优势,较传统方法快20倍以上,而成本仅为传统方法的1/10,且能免培养、高精度、自动化、一站式地完成产品中每个物种的活细胞计数、活力定量、活力异质性测量和溯源,有望形成新的技术标准。
  • 亮点回顾:"质”同道“禾” 上下求索 多学科抗感染论坛-真菌专场
    8月23日,由中山大学附属第一医院医学检验科、广东省真菌病监测网、广州禾信仪器股份有限公司联合举办,以“‘质’同道‘禾’”,上下求索”为主题的多学科抗感染论坛-真菌专场交流会圆满落幕。点击图片跳转观看精彩回放温馨提示此次论坛干货满满,特意准备了汇集6位教授学术精华的真菌专场知识地图,8月26日17:00后,在本公众号后台回复 CMI-1600 便可获取。本次论坛大咖云集,北京协和医院徐英春教授、张丽教授,浙江大学医学院附属邵逸夫医院俞云松教授,中山大学附属第一医院谢灿茂教授、廖康教授、郭鹏豪教授齐聚一堂,以线上主题演讲的形式聚焦真菌感染的诊疗与检测,为大家呈现了一场饕餮学术盛宴。左右滑动查看更多《念珠菌感染诊治现状》浙江大学医学院附属邵逸夫医院 俞云松教授俞云松教授分享了从侵袭性真菌病趋势、易感高危人群类型、IFD诊断困惑、抗真菌治疗策略、念珠菌定植与感染、念珠菌病原学检测方法和治疗方案、抗真菌药物的选择等方面,进行了多维度、全面系统地论述。俞云松教授指出:侵袭性真菌病的临床管理面临诸多挑战,突破重点仍在于诊断技术的不断改进与升级。《真菌感染实验室诊断操作规范》中国医学科学院北京协和医院 张丽教授张丽教授从真菌概况、国内真菌检测能力、真菌实验室诊断相关指南、真菌实验室仪器设备基本配置、各种标本的采集和处理、真菌培养基接种选择和方式、真菌培养条件和时间等方面展开细致讲解。在培养后菌株鉴定方法板块中,张丽教授提到,在酵母菌的鉴定中,MALDI TOF-MS的准确性能达到90%以上,其在丝状真菌的鉴定上也有相关应用。《"重"中之"重"一例血流感染案例分享》中山大学附属第一医院 郭鹏豪教授郭鹏豪教授以一例血流感染的案例抛砖引玉,在对患者惊险起跌的病情进行了详细介绍后,不断抛出问题,并由俞云松教授和张丽教授针对性地给予详细专业点评及解答。最后郭鹏豪教授对该案例进行总结:真菌性心内膜炎是一种死亡率极高的感染病,不明原因发热的患者,需关注心内膜炎的可能性,实验室可借助MALDI TOF-MS技术缩短病原体鉴定的时间。最后名家论道环节,教授们就“真菌病诊疗的困难与挑战”发表见解,多学科精彩思维齐碰撞,直将热度推向最高峰,评论区内大家直呼“内容丰富,精彩纷呈,值得回看”。本次论坛展示了多学科合作模式在真菌病诊疗中的价值,各专家共同为真菌病诊疗事业贡献了一份力量。温馨提示此次论坛干货满满,特意准备了汇集6位教授学术精华的真菌专场知识地图,8月26日17:00后,在本公众号后台回复 CMI-1600 便可获取。MALDI-TOF MS检测是近年发展起来的一种快速准确、经济可靠的病原微生物鉴定方法。通过绘制具有保守特征的微生物核糖体蛋白指纹图谱并与标准数据库进行比对,实现对病原菌的快速鉴定。全自动微生物质谱检测系统CMI-1600禾信仪器在此方面,已自主研发出全自动微生物质谱检测系统CMI-1600,目前已获得发明专利15项,实用新型专利14项,是国内唯一在核心期刊上以封面论文形式介绍该仪器研制的国产仪器。01关联案例:马尔尼菲篮状菌采用全自动微生物质谱检测系统CMI-1600,利用甲酸-乙腈蛋白提取法分别对酵母相和丝状真菌相的数十株临床分离的马尔尼菲篮状菌进行检测,并批量采集高质量图谱,使用禾信仪器自主研发的MicroCreate软件进行特征峰提取建立专项子谱库。部分马尔尼菲篮状菌质谱图马尔尼菲篮状菌特征谱初步验证表明,6株从病患样本分离的马尔尼菲篮状菌种级鉴定准确率达到100%。因此,马尔尼菲篮状菌自建库可实现相关样本的快速准确鉴定,CMI-1600对临床少见疑难菌株有良好的鉴定潜力。02关联案例:109种1710菌株采用全自动微生物质谱检测系统CMI-1600对临床即时分离的109种1710菌株进行鉴定,包括肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌、鲍曼不动杆菌、大肠埃希菌、无乳链球菌、头状葡萄球菌、流感嗜血杆菌、产吲哚金黄杆菌、新型隐球菌、阿莎丝孢酵母、成团泛菌、小孢根霉菌、白色假丝酵母、热带假丝酵母、光滑假丝酵母等临床病原菌。鉴定结果与医院LIS系统最终诊断结果(某进口质谱及生物鉴定结果为主)进行比对显示:CMI-1600种水平鉴定一致率为99.18%(1669/1710),属水平鉴定一致率为99.88%(1708/1710),表明对临床微生物鉴定结果与医院检验科鉴定结果具有高度的一致性。
  • 大肠菌群平板计数法的常见问题有哪些?
    大肠菌群平板计数法的常见问题有哪些?1、VRBA培养相关问题(1)所用器皿是否需要灭菌?答:不需要。配制培养基所用到的锥形瓶、玻璃棒、勺子等均不需要灭菌,但要求一定要清洗干净,表面无污渍、无残留。煮沸完成后,取下锥形瓶,用一般常用的卫生纸(软纸)覆盖瓶口,用橡皮筋缠绕,待冷却至适宜温度即可倾注培养基。在倾注培养基时,须点燃酒精灯,稍微灼烧锥形瓶口。(2)如何保持“煮沸2min”?答:可以用电磁炉或电热板进行加热煮沸,在该培养基即将煮沸时调低温度。实际操作时,不需要严格按照此要求进行,加热煮沸数秒即可。原因:本培养基很难保持煮沸2min,一旦煮沸,则培养基很快上涌、翻腾,若不调低温度或立刻采取其他措施,则培养基可在数秒内喷涌出来,严重者可喷涌2米以上、电磁炉周围1—2米范围内都是培养基飞溅的范围(实验室危险因子之一)。(3)若培养基未用完,是否可以冷藏起来下次用?答:不可以。4789.28中已规定,固体培养基最多允许熔融1次(指的是经过高压灭菌冷却后的培养基还可以熔融一次后使用)。且VRBA培养基冷却后,再次熔融时非常容易喷涌,若温度控制不当,底部培养基熔融后很快就会发生喷涌(即培养基未完全熔融就会发生喷涌现象)。(4)倾注完成后是否需要“覆盖一层”?如何覆盖?答:一般情况下不需要覆盖。在实际操作过程中,若检验员初次接触该食品(或食品品类),则有必要在倾注培养基后再覆盖一层(原因是不清楚该样品是否会发生蔓延)。而如此往复测试几次后,若该样品或食品品类均不存在蔓延现象,则以后的实验中都不需要进行覆盖。若重复多次测试后都有蔓延现象,则以后的检验中zuihao都进行覆盖,zuihao是在原培养基已凝固或半凝固(不会发生晃动)时再倾注一层培养基(“一层”是指缓慢倾注培养基至培养基刚好能够覆盖整个平皿)。 2、如何确定培养基上长的是不是大肠菌群?答:建议新手们认真按照标准进行证实试验,此证实试验简单易操作,每一次VRBA上有菌落生长都进行证实试验,如此往复3-4次,对于哪种形态才是大肠菌群已经能够了然于心。3、两个梯度都长了菌,如何选取?答:选取15-150CFU之间的平板(指的是VRBA平板上所有菌落数在此范围),挑取可疑菌落进行证实试验。详细举例说明:若有两个连续梯度的4个平板上菌落数均在15-150之间,则4个平板上的菌落都要挑取进行证实试验,实际操作时,可灵活操作,如:1:10的两个平板上的菌落数分别为120、123,1:100的两个平板的菌落数分别为16、18,严格来讲必须至少在每个平板上分别挑取5个可疑菌落、5个典型菌落进行证实试验,如此需要40根GBLB肉汤管。建议使用镍合金接种环(即传统的接种环,而不是一次性塑料接种环),因为VRBA上生长的菌落(无论典型或可疑)大部分长在底层、且菌落一般较大,被培养基覆盖,传统的接种环较细,用以刮去上层培养基较方便,挑取菌落也较方便。 4、如何进行证实试验?菌落选取数量?答:同上所述,建议新手们VRBA上的所有不同形态的菌落都进行证实试验。每种不同形态都挑取5-10个进行证实试验(若BGLB管足够,建议多挑取几个进行试验)。注意:A.每种可疑菌落挑取5个,每个菌落放入1管GBLB管中;B.“产气者,记为大肠菌群阳性管”,就要求在实验前须认真筛选BGLB管,凡产气的GBLB管应弃去不用。 5、结果如何计算?答:首先,在VRBA培养24h后进行计数,分别计数可疑大肠菌群和典型大肠菌群(何为可疑、何为典型?同“2”,检验员多进行几次实验后自然很清楚典型的大肠菌群是何种形态)的数量。假如在1:10的平板上可疑大肠菌群有10个,典型大肠菌群有6个;其次,进行证实试验,挑取上述可疑和典型大肠菌群各5个(或者全部挑取),假如10个可疑大肠菌群中有3个证实为阳性,6个典型大肠菌群中有5个证实为阳性,则计算方法如下:最终大肠菌群数=经证实的大肠菌群数=可疑大肠菌群经证实的数量+典型大肠菌群经证实的数量=10×(6/10)×10+6×(5/6)×10=110。 6、若平板上很多菌落,最终证实全部为阴性,结果如何计算?答:根据第3条,选取适宜菌落数的平板挑取菌落进行证实试验,若证实全部为阴性,则需要再挑取更低稀释度的平板上的菌落(建议可疑和典型菌落分别挑取10个)进行证实试验,若第二次证实试验均呈阴性,以<1乘以zuidi稀释度进行计算,如:1:10的平板菌落数分别为120、123,1:100的平板上菌落数分别为16、18,首先挑取1:100的两个平板上的菌落进行证实试验,若全部为阴性,再挑取1:10的两个平板上的菌落进行证实试验,若1:10的平板上的菌落数证实为阴性,则最终计算过程为<1x10,最终结果为<10;若1:10的的平板上的菌落有阳性管,则按照第5条进行计算。中国微生物菌种查询网专业为各企事业单位,科研院所,各级学校提供微生物菌种产品查询、购买服务!网站主要提供的产品:质控菌种,标准菌种,中国微生物菌种4万多株,细胞系/株1万多株其中金黄色葡萄球菌,大肠埃希氏菌(大肠杆菌),沙门氏菌,黑曲霉,铜绿假单胞菌,枯草芽孢杆菌,链球菌,白色念珠菌,志贺氏菌等为常用菌株。
  • 北京市将建监测网严防“超级细菌”
    日前,一种“超级细菌”现身印度等国,引起广泛关注,耐药患者之所以频现,与抗生素滥用有关。昨天,北京市医疗机构药事管理专家委员会成立,本市将在年内建立细菌耐药监测网,及时发现耐药致病菌。初期包括所有三级医院和部分二级医院,未来将覆盖包括社区医院在内的所有医疗机构。   据悉,药事专家委员会的抗菌药物与细菌耐药监测组将承担抗菌药物的临床应用监测,收集数据并进行汇总、分析、上报和提出改进意见。   “超级细菌”对几乎所有抗菌药物均耐药,加强抗菌药物合理应用是降低细菌耐药的有效措施之一。北京大学临床药理研究所常务副所长吕媛表示,目前,我国超级耐药细菌监控网络还未监测到俗称“超级细菌”的多重耐药菌,但随着国际交往的日益紧密,极有可能在我国“现身”。   吕媛称,耐药性的出现主要是因为抗生素的不合理使用所致,本市即将建立的耐药监测网是要对各医疗机构的细菌耐药情况进行监测。届时,将从临床病人处分离致病菌,研究其对哪些抗菌类药物耐药,并根据全市汇总情况对医院用药进行指导。例如,目前发现肺炎链球菌对红霉素的耐药率比较高,就不建议医院使用。同时,也将对临床医生开展抗生素使用的培训。目前计划监测网内的医疗机构每3个月报一次监测结果,将来希望实现实时上报。   专家表示,被媒体广泛关注的多重耐药菌(即“超级细菌”)并非首个耐药菌,只是其耐药特点与其他耐药菌不同而已,如铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌等都是目前临床较为关注的耐药菌。   应对措施:二三级医院处方每月点评   昨天,药事专家委员会表示,将在每个月从二、三级医院抽取100张处方,对抗生素是否过量等进行评估,提高药品使用的合理性和安全性。   药事专家委员会共分为药事管理组、抗菌药物与细菌耐药监测组、合理用药与药品不良反应监测组、处方点评组、学科建设与药学研究组、临床药学组、药品质量管理组和中药组等8个小组。其中,处方点评组将对本市医疗机构的用药情况和趋势进行监测,这也是本市首次建立合理用药的预警监测机制。   北京大学人民医院药剂科主任李玉珍表示,处方点评组将在每个月随机收集全市二、三级医院的100张处方,对门诊处方中的注射剂、抗菌素、每张处方金额及开药例数等多项内容进行评估。   李玉珍表示,届时,将对目前本市医疗机构用药的前十种进行排名,那些“安全无效”的辅助性药品、中药、注射剂等都不能在前十名之内。   马上就访:合理用药将缓解医疗费增长过快   北京市卫生局副局长郭晋和表示,目前用药不合理的现象仍然存在。他透露,如果在今后的处方点评中,不合格处方达到一定数量,将根据卫生部相关处方点评管理办法对医院进行处罚。   郭晋和表示,处方点评措施就是用合理用药来遏制医疗费的增长过快,规范医院用药,不要为了经济效益过度用药
  • 特一药业:磺胺嘧啶片国内首家通过一致性评价
    近日,特一药业集团对外公告,抗菌药物磺胺嘧啶片获得国家药品监督管理局核准签发的《药品补充申请批准通知书》。药品通过仿制药质量和疗效一致性评价,为该品种药物首家过评的企业。该药品为白色或微黄色药片,主要成分为磺胺嘧啶,分子式为C10H10N4O2S。在乙醇或丙酮中微溶,在水中几乎不溶;在氢氧化钠试液或氨试液中易溶,在稀盐酸中溶解。属广谱抗菌药,但由于目前许多临床常见病原菌对该类药物耐药故仅用于敏感细菌及其他敏感病原微生物所致的感染。该药可以用于敏感细菌及其他敏感病原微生物引起的下列感染:1、敏感脑膜炎球菌所致的流行性脑脊髓膜炎的治疗和预防。2、与甲氧苄啶合用可治疗对其敏感的流感嗜血杆菌、肺炎链球菌和其他链球菌所致的中耳炎及皮肤软组织等感染。3、星形奴卡菌病。4、对氯喹耐药的恶性疟疾治疗的辅助用药。5、治疗由沙眼衣原体所致的宫颈炎和尿道炎的次选药物。6、治疗由沙眼衣原体所致的新生儿包涵体结膜炎的次选药物。
  • 菲特立发布Fitlylab-Water水质微生物快速检测系统新品
    Fitlylab-Water 水质微生物快速检测系统,通过ISO/TR 13843: 2000水质量标准—微生物认证法认证,通过权威认证 ISO 16140:2003“食品和动物饲料的微生物学” 代替法的认证, 符合ISO/IEC 17025:2005标准的内部认证Fitlylab-Water水质微生物快速检测系统由MBS-MR主机,笔记电脑, Fitlylab中文操作软件,VL微生物检测瓶,水质过滤系统组成可以快速定量检测水质中菌落总数,总大肠菌群(大肠菌群),大肠杆菌(大肠埃希氏菌),耐热大肠菌群(粪大肠菌群),铜绿假单胞菌(绿脓杆菌)沙门氏菌,金黄色葡萄球菌,肠球菌(粪链球菌)等,一台机器可以同时检测多个项目多个样品。。傻瓜型,样品无需前处理,直接加样检测,完全,快捷,准确,不需要实验室,不需要专业人员就可以安全操作,仪器自动出报告,报告为PDF格式。针对样品要求小的直接加水样到检测瓶里,水样量大的利用滤膜过滤法,把过滤后的滤膜丢进配套的检测瓶里。Fitlylab-Water水质微生物快速检测系统由罗马第二大学物理研究所,意大利核物理研究院(INFN)和罗马第三大学生物系研究所共同研发。是取代传统微生物检测方法的高科技技术结晶.通过权威认证 ISO 16140:2003“食品和动物饲料的微生物学” 代替法的认证, 符合ISO/IEC 17025:2005标准的内部认证,通过ISO/TR13843: 2000水质量标准—微生物认证法认证可检测项目:菌落总数,总大肠菌群(大肠菌群),大肠杆菌(大肠埃希氏菌),耐热大肠菌群(粪大肠菌群),铜绿假单胞菌(绿脓杆菌)沙门氏菌,金黄色葡萄球菌,肠球菌(粪链球菌)创新点:通过ISO/TR 13843: 2000水质量标准—微生物认证法认证,通过权威认证 ISO 16140:2003“食品和动物饲料的微生物学” 代替法的认证, 符合ISO/IEC 17025:2005标准的内部认证 可以快速定量检测水质中菌落总数,总大肠菌群(大肠菌群),大肠杆菌(大肠埃希氏菌),耐热大肠菌群(粪大肠菌群),铜绿假单胞菌(绿脓杆菌)沙门氏菌,金黄色葡萄球菌,肠球菌(粪链球菌)等,一台机器可以同时检测多个项目多个样品。。傻瓜型,样品无需前处理,直接加样检测,完全,快捷,准确,不需要实验室,不需要专业人员就可以安全操作,仪器自动出报告,报告为PDF格式。 Fitlylab-Water水质微生物快速检测系统
  • 心系食安,如海光电再次推出食品安全检测新方案
    继食品农残系列快速筛查解决方案推出后,如海光电又推出了食品渔兽药残留快速筛查解决方案,致力保护您舌尖上的安全。恩诺沙星、环丙沙星这些名称或许你并不熟悉,但它们正在通过美食到达你的舌尖、食道、肠胃,危害你的健康......恩诺沙星被国家指定为动物专用药,为微黄色粉末,味苦,不溶于水,易溶于有机溶剂。抗菌谱广,对支原体有特效。环丙沙星为微黄色结晶性粉末,味苦,在水中几乎不溶,溶于乙酸,微溶于乙醇和三氯甲烷。恩诺沙星、环丙沙星均属于喹诺酮类抗生素,二者结构式如下:恩诺沙星对于链球菌、葡萄球菌、大肠杆菌以及枯草芽孢杆菌有明显抑制作用,通常用于治疗畜类的乳房炎等感染性疾病,也作为疾病的预防用药添加与饲料和饮用水中。环丙沙星对葡萄球菌、肺炎球菌、链球菌属有抑制作用,通常作为治疗药物注射到动物体内,或者作为预防疾病药物添加到动物的饮用水中。我国对恩诺沙星及环丙沙星在动物源性食品中的最高残留限量(MRL)规定如下(环丙沙星是恩诺沙星在动物体内的主要代谢物,因此在动物食品中的测定将二者共同作为标示物,含量为二者含量之和):由于动物食品中该类药物的残留过量会对消费者健康造成危害,如恩诺沙星及环丙沙星在人体内过量累积可导致高度过敏反应、胃肠道不适以及中枢神经系统异常等症状,且会导致耐药菌的形成,影响该类药物的临床疗效。目前常见的检测方法主要有微生物法、液相色谱法、高效液相色谱法、高效毛细管电泳法、液相色谱-质谱联用法、免疫测定法与免疫亲和色谱法等,这些检测方式普遍存在成本高、检测周期长,无法满足现场快速检测的需求。因此建立一种针对该类药物的快检方法是十分必要的。针对此现象,如海光电基于光谱分析技术,结合表面增强试剂,推出渔兽药快速筛查解决方案,整个检测过程在15分钟之内即可完成。方法操作简单快捷,并可对多种兽药进行检测。箱体式拉曼光谱仪RFS1000-T和手持式拉曼光谱仪RFS1000,基于激光拉曼指纹光谱分析技术和网络数据核查技术,结合喹诺酮类抗生素快速检测试剂和前处理设备,可以快速实现食品安全的快速检测。专门为执法、 快筛检测而设计,易于上手,操作简单。 猪肉中恩诺沙星检测谱图牛奶中某沙星谱图除食品渔兽药残留检测,如海光电还研发了农药残留等多达上百种常用科目快速检测方案,致力于分析与研究、服务与分享,为保健食品安全行业保驾护航!
  • 探访山西“超级细菌”检测实验室
    工作人员正在检查实验结果   10月26日上午,中国疾病预防控制中心通报,国内已发现3例超级细菌(NDM-1耐药基因细菌)病例。29日,记者从山西省疾病预防控制中心了解到,我省还未发现超级细菌病例,但省疾控中心的实验室以及我省一些条件较好的市疾控中心实验室,都具备了监测“超级细菌”的条件。11月1日,本报记者走进山西省疾病预防控制中心实验室,独家探访“超级细菌”检测实地。   出了省疾控中心主楼6层的电梯向左一拐,便可以通过透明玻璃看到一个长廊,玻璃上写着“生物安全实验室,授权后方可进入”几个字,检测“超级细菌”的实验室就在里面。判定超级细菌并非难事   “嘟!”随着疾病检验科科长张凡非将门禁卡一刷,中心实验室的门应声而开。穿上隔离衣,戴上鞋套,记者跟随张凡非进入。走廊两侧有各种实验室,还有工作人员专用的更衣室、准备室、洗涤室等。几个实验室门口还贴着“生物危害”的标志。“我是全单位唯一持实验室门禁卡及密码的人,因为实验室安全性要求极高。我是第一责任人。”张凡非说。   穿过长廊,来到最里面的一间实验室。“这里就可以检测超级细菌了。”张凡非说。实验室里,两名工作人员正在一台“生物安全柜”前工作,戴着口罩、手套,全副武装。他们正在做肠道病菌试验。如果是做超级细菌的实验,专业上称“药敏试验”,第一步,也需要在生物安全柜里将病菌分纯。   “大家可以放心的是,判定超级细菌并非难事。”张凡非介绍。耐药性强的细菌并不是首次发现,而是一直存在,并且数量很多,比如耐青霉素的肺炎链球菌,过去对青霉素、红霉素、磺胺等药品都很敏感。而这次超级细菌引起的问题,主要是发现肠杆菌对抗生素不敏感了,产生了很强的泛耐药性,而之前这种细菌并没发现耐药性。所以说,省疾控中心实验室及我省一些条件较好的市疾控中心实验室,一直就具备检测及监测这种超级细菌的条件。2—3天就可确认试验结果   药敏试验通俗的解释,就是做某一种细菌对指定的药物敏感试验。如果不敏感了,也就说明耐药了。张凡非介绍。   检测是否是超级细菌需要经过4道程序。首先要从临床上取患者感染部位的标本,比如取呼吸道感染患者的痰标本,然后放在培养基上进行细菌培养,培养时间一般需要48小时。   培养出细菌后,就要进行耐药反应。耐药反应所选抗生素,是严格按照国家的监测要求进行的。目前,省疾控中心实验室所用抗生素有十几种,都是临床常用抗生素,针对不同的病菌,将不同的抗生素涂抹在药敏试纸上。之后,观察其结果。   结果有3种:敏感、中度敏感及耐药。涂抹过抗生素的药敏试纸上,都会出现直径、大小不同的药敏环儿。如果药敏环儿周围,细菌被抑制不滋生了,说明细菌对抗生素是敏感的 如果药敏环儿周围的细菌抑制情况不太明显,说明结果属于中度敏感 若药敏环儿周围的细菌依旧滋生,没有一点抑制效果,说明细菌产生了耐药性。   发现疑似耐药性反应,实验室就会将其送到中国CDC“临床基因扩增检验实验室”做基因分析,如果确认其含有耐药基因,那就可以确认这个细菌是超级细菌了。最快两三天就可以确认是否是超级细菌。一旦发现疑似耐药性反应,那么细菌的“主人”,就应第一时间被“隔离”。   整个监测过程并不复杂,但条件要求很严格。“比如菌株的存放就要求放置于-80℃的超低温环境内,”张凡非指着房间内的一个大冰柜,“那就是存放菌株的地方。”超级细菌不是传染病   “超级细菌是感染病,而非传染病。这是两种截然不同的概念。感染病是一种条件致病,并不是接触性传染病。”张凡非说。“感染性疾病需要具备一定的条件。打个比方,有人吃了西瓜会拉肚子,但有人就不会。细菌感染也一样,同样的细菌,由于不同的个体免疫力不同会有不同的反应,由于细菌感染而致病的还是少数。因此,大众没必要恐慌。”   张凡非还表示,真正的问题根源是超级细菌背后反映的抗生素滥用问题。“这个问题解决不了,超级细菌才会真正无敌。”
  • 微生物检测说到烂的无菌操作--细节说的明明白白的
    无菌室的工作要尽可能减少交流。不允许在无菌室内谈笑。要尽可能减少在无菌室内走动。沉降菌技术必须按照规定的时间进行使用。工作人员进入无菌室工作之前必须做好前期准备工作。要按照规定穿戴经过特殊处理的服装、并对身体做好清洁、避免对检测品造成污染。在检测样品的提取过程中,工作人员要尽可能远离检测物品。避免检测物品受到细菌污染。检测样品提取之后要进行科学的保存,避免受到污染。提取过程要尽可能加快速度,不能将检测样品在空气中闲置太长的时间避免空气中的细菌对检测样品造成污染。检测样品的提取过程必须严格遵守无菌操作的程序。打开储存样品的时候,要使用浓度为75%的酒精对存在检测样品的器皿瓶口进行消毒,要使用酒精棉球作为消毒的重要工具。器皿的瓶口要进行两次以上的酒精消毒,提取工作完成之后要科学的安放检测样品,并且随时检查储存检测样品的空间,避免检测样品受到污染。食品微生物检验的主要内容与特点1、检验内容目前我国对食品微生物检验的根本要求是安全无毒害。在对食品微生物进行检验时,主要内容包括3点:(1)对食品污染程度的检验,以检验食品样本中菌落总数、大肠菌群总数和霉菌总数为主,这种检验方式,只能对样本的污染程度做出判断,不能说明食品是否存在安全问题。(2)对食品中致病菌的定性检验,即检验食品样本中是否存在某种或多种致病性微生物,常规检验的致病菌主要有金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、志贺氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌、致泻大肠埃希氏菌、溶血性链球菌、蜡样芽孢杆菌、阪崎肠杆菌及副溶血性弧菌等。(3)对食品中致病菌的定量检验,即检验食品样本中某种或多种致病性微生物存在的量,通过检验结果结合科学数据,对食品样本的危害程度进行分析。2、食品微生物检验的特点(1)食品微生物检验涉及的微生物范围广,种属多。采集食品微生物检验样品比较复杂,要求高。食品微生物检验的研究对象包括:a.经食物传播的病原微生物,他们是人类疾病病原微生物、畜禽疫病的病原微生物和人畜共患传染病病原微生物,这几类微生物可达数百种;b.引起人类食物中毒的微生物及其毒素;c.引起食品腐败变质的微生物;d.食品工业微生物。可以说食品微生物检验接触的微生物类群、种属比其他专业微生物检验为多。(2)食品中待分离细菌数量少、杂菌量多,对检验工作干扰严重。食品微生物检验,其目的菌,如致病性微生物和食品中毒微生物及毒素,主要来源于生产加工、储存运输、销售等过程中污染的,在污染的微生物中,致病性微生物一般数量相对较少,却有大量的非致病性微生物污染,两者之间比较悬殊。(3)食品中微生物检验具有数量观念在GB 4789食品卫生微生物学检验方法中,对某些微生物的数量已经明确规定,除要检测食品污染程度指示菌,如菌落总数、大肠菌群的测定外,还有致病菌如金黄色葡萄球菌、产气荚膜梭菌、蜡样芽胞杆菌都需要菌数计算。诊断食物中毒仅做定性试验是不够的,还需要对致病菌定量检验。随着科技发展,各种致病菌的定量检验必将全面开展。食品微生物检验工作者必须不断摸索、积累,致病菌的定量检验,使其他致病菌的定量检验早日开展。(4)食品微生物检验需要准确性与快速性。食品生产后,为了保持新鲜程度,一般都是尽快的进入市场,转到消费者手中的,这就要求就检验工作尽快获得结果,保证食品的食用安全。另一方面,工厂化大规模生产的食品,每一批次数量较大,采样数量、采样方法和检验方法都直接影响到检验正确性和批量产品的处理,如果检验的结果不准确,将会造成严重的政治影响和经济损失。这一点是食品微生物检验工作必须注意的问题。(5)微生物检验具有一定法律性质。对食品的微生物检验,世界各国均制定有检验法规。作为食品微生物检验人员,在进行食品微生物检验时,均应按规定要求实施,不得任意更换其他方法。无菌操作的重要性所谓无菌,指的是不存在保证生命活动的营养细胞的状态。而无菌操作则是采用无菌的器械进行操作,防止微生物进入无菌范围的技术。在食品微生物检验中,无菌操作是重要的理念,只有采用无菌操作技术,保持食品样本在检验过程中不受到二次污染,才能保证检验结准确的反映出食品样本的卫生状况。在食品检验的各个环节,都有可能有微生物的进入,因此无菌操作技术应贯穿整个检验过程,如果有一个环节没有采用无菌操作,那么其他环节的无菌操作也将没有任何意义。无菌操作的具体应用1、取样食品微生物检验首先是从样本中无菌称取要求检验的质量,取样过程中使用的天平要经过消毒,检验用品如剪刀、药匙要经过170℃/2h 干热灭菌。取样过程严格按照无菌操作进行,才能保证食品样品的原始状态。前处理根据国标要求,取样后要对样品进行前处理。一般而言,称取 25g/ml 样品于盛有225ml无菌稀释液的无菌均质袋中均质,制备成1:10样品匀液进行检验。对于计数样品要,制备10倍系列稀释样品匀液,操作方法参见GB4789.2-2016。整个过程必须严格按照无菌操作进行。3、纯种分离在食品微生物检查过程中,为了更加准确的确定微生物群体,需要将疑似的目标菌从混杂的样品中分离出来,进而得到纯培养物。通常情况下,需要结合不同微生物的具体特性,针对性的选择培养基与培养条件,促进目标微生物的繁殖。或者通过使用某种抑制素,抑制除目标菌以外的杂菌生长,进而将其他杂菌淘汰。接着将培养物接种在固体培养基上形成目标菌的单菌落。这种单菌落还需要进行一定的纯化与鉴定,才能保障分离的菌株为纯菌株。在整个分离纯化过程中,通常需要用接种环把微生物的纯培养物从一个器皿转接到另一个器皿中培养。在这一过程中,如果不能严格按照无菌操作进行,很难保证检验结果的准确性。同时,实验人员应加强自身实验水平与操作能力,确保无菌操作技术熟练、准确。4、革兰氏染色革兰氏染色技术是食品微生物确认鉴定中重要的方法,将疑似的目标菌经过纯化分离后染色,在光学显微镜下观察微生物形态,能初步鉴定微生物是否是所检验的目标菌。革兰氏染色的操作步骤:涂片—初染—媒染—脱色—复染,整个过程中最重要的是涂片,涂片过程中必须严格无菌操作,避免杂菌混入,影响镜检结果。5、空白对照根据《GB4789.2-2016 食品安全国家标准食品微生物学检验菌落总数测定》,将营养琼脂培养基倾入加有1mL空白稀释液灭菌培养皿内作空白对照。空白对照的结果可以说明三个问题:
  • 北京市科委项目:飞行时间质谱的示范推广研究顺利答辩验收
    仪器信息网讯 2021年6月25日,由北京协和医院与毅新质谱共同承担,北京市肿瘤防治研究所、单位中国康复研究中心、北京大学口腔医学院、首都医科大学附属北京妇产医院共同参与的首都健康保障培育研究专项——飞行时间质谱的示范推广研究顺利答辩验收。  该项目由北京市科学技术委员会设立,旨在成熟飞行时间质谱的检测技术产品化,研究与探索基于微生物组学等临床应用,口腔微生态与口腔疾病相关性,非小细胞肺癌疗效预测血液生物标志物等领域研的应用。历时三年,课题单位共同圆满完成了各项指标任务。  现场汇报  本次项目首次将MALDI-TOF MS在临床微生物领域应用规范化,并进行了疑难病例收集、鉴定及数据库的进一步建设。完成了多项疾病检测技术包括非小细胞肺癌疗效预测多组学血液生物标志物、微生物鉴定的血培养报阳后样本快速鉴定、口腔微生态、B族链球菌检测应用示范的推广,成熟了飞行时间质谱多项应用领域检测技术的产品化。  课题介绍:  子课题1、基于飞行时间质谱平台非小细胞肺癌疗效预测多组学血液生物标志物的研究及临床推广——北京市肿瘤防治研究所  子课题2、基于飞行时间质谱微生物鉴定的血培养报阳后样本快速鉴定的应用示范推广——中国康复研究中心  子课题3、基于飞行时间质谱微生物鉴定的口腔微生态应用示范推广——北京大学口腔医院  子课题4、基于飞行时间质谱微生物鉴定的B族链球菌检测试剂的应用示范推广——首都医科大学附属北京妇产医院  子课题5、参与各项专家共识和标准的制定及完成应用推广示范——北京毅新博创生物科技有限公司  通过答辩讨论,与会专家们一致认为:该课题的参与项目组已经完成全部的考核指标,很好地统筹了科研院所与创新性公司的实力,重点任务超额完成,并认为质谱技术具备多方面优势,已经成为了很好的检测与分析手段。  答辩环节  本次项目的圆满完成,标志着国产飞行时间质谱技术已经取得长足的发展。在全球质谱市场面临激烈的今天,国产质谱必将占据重要位置。
  • 专家谈矿泉水新国标 可能致癌物将被限量
    人民网科技北京9月25日电 据国家质检总局消息,从10月1日起,新的饮用矿泉水强制性国家标准《饮用天然矿泉水》(GB 8537-2008)将正式实施。与1995年制定的原标准相比,新国标在多个方面做出了修改,其中一个重要变化是增加了可能致癌的溴酸盐的限量指标———0.01mg/L,即每升饮用天然矿泉水中的溴酸盐含量不得超过0.01毫克。其他修改包括:增加了对天然矿泉水中锑、锰、镍等三种金属物质的指标限量,不得用容器将原水运至异地进行灌装 对预包装饮用天然矿泉水须标示水源点名称 当氟含量大于1.0mg/L时,应标注“含氟”字样以及除非经国家有关部门审批认可,否则标签上不得声称有医疗作用等。   正常情况下,水中不含溴酸盐,但普遍含有溴化物。当用臭氧对水消毒时,溴化物与臭氧反应,氧化后会生成溴酸盐。国际癌症研究中心认为溴酸钾对实验动物有致癌作用,但溴酸盐对人的致癌作用还不能肯定,为此,将溴酸盐列为有可能致癌的物质。   由于早期我国很少使用臭氧对水进行消毒,因此我国《饮用天然矿泉水》国家标准未制定溴酸盐限量要求。但近年来,矿泉水企业普遍采用臭氧杀菌工艺,致使溴酸盐现象凸显出来。2006年,国家标准委下达了《饮用天然矿泉水》国家标准修订计划,并对矿泉水中溴酸盐问题进行了多次研究,参照有关国际组织和国家对溴酸盐限值的规定,将国家标准中溴酸盐限值初定为0.01mg/L。   专家解读:限量可能致癌物质出于安全考虑   “对于溴酸盐是否会致癌,国际上有相关的说法但没有确定,目前引起致癌的结论主要是从动物实验身上得到的结果,人类对其认识也是逐渐的过程,以前没有认识到它的重要性。我们在标准里引入限量值,是出于安全性的考虑。” 新国标主要起草人、全国食品发酵标准化中心室主任郭新光表示,此次对溴酸盐做出限量规定,是参考国际标准后做出的调整。   新国标的另一个重要变化是取消了菌落总数指标的要求,同时,增加了粪链球菌等3项微生物的指标限量,规定取样250mL饮用天然矿泉水中,粪链球菌等3项致病菌含量均为“0”。增加这三项致病菌指标要求,将为提升天然矿泉水的食用安全性提供保障。   郭新光表示,删除菌落总数的指标要求,是因为菌落总数检测时,有害菌和有益菌都在里面,菌落总数高,并不代表有害菌数量多,而增加粪链球菌等3项微生物的指标限量,则对有害菌的目标指向更加清楚。   新国标强制执行 部分企业将相应增加成本   作为强制性国标,所有生产饮用矿泉水的企业都必须遵照执行新标准,这势必会对该产业产生影响,如新国标对溴酸盐的限量规定就会对部分企业产生冲击。“并不是所有的矿泉水都含有溴酸盐,这跟企业采用的原水有很大关系。如果原水的溴含量高,势必会影响到溴酸盐的含量,对这样的企业,他们必须在生产工艺或技术上做出调整,也会相应地增加成本,但对于一些本身溴酸盐含量就很低的企业来说,影响相对较小。”郭新光说。
  • 青岛能源所等发明基于拉曼组原理的益生菌单细胞质检技术
    目前市场上有大量的益生菌品牌和产品,但质量参差不齐,给消费者带来极大困扰,也阻碍了产业的健康发展。此问题的根源在于目前业界缺乏快速、准确、全面、低成本的益生菌产品质检手段。青岛能源所单细胞中心联合中国食品发酵工业研究院、青岛东海药业和青岛星赛生物科技有限公司等,开发了基于拉曼组原理的益生菌单细胞质检技术SCIVVS,为突破这一紧迫的技术瓶颈提供了全新的解决方案。该工作近日发表于iMeta杂志。 基于拉曼组原理发明益生菌单细胞质检技术SCIVVS   益生菌产品的市场规模已近千亿,但是存在大量的“鱼目混珠”现象。其重要原因是益生菌质检的方法学局限性。由于这些方法大多依赖于分离培养或元基因组测序,因此存在耗时长、成本高、难以快速测定细胞活性和代谢活力及其细胞间异质性、复合益生菌产品深度质检困难、流程繁琐、难以自动化等瓶颈性问题。这些局限性导致益生菌产品难以快速、低成本、全面、深度地进行质检,很大程度上阻碍了益生菌产业的健康发展。   针对这一产业瓶颈,青岛能源所单细胞中心张佳副研究员、任立辉高级工程师、张磊博士、公衍海助理研究员等带领的研究小组,联合中国食品发酵工业研究院、青岛东海药业和青岛星赛生物等团队,基于拉曼组原理,开发了一种名为SCIVVS(Single-Cell Identification, Viability and Vitality tests and Source-tracking)的单细胞精度益生菌质检技术体系。针对益生菌产品,SCIVVS首先不是提取总核酸或者进行平板培养,而是提取所有的细胞进行重水饲喂和单细胞拉曼光谱的高通量采集。在每一张拉曼光谱上,利用其指纹区,基于与益生菌单细胞拉曼光谱参照数据库的比对,快速完成每个细胞的种类鉴定环节。通过构建21种法定可食用益生菌的标准菌株拉曼光谱数据库,SCIVVS可实现平均高达93%的分辨准确度。同时,利用其重水利用峰(C-D峰),则可针对每个物种,量化每个细胞的活性、代谢活力等。进而可通过拉曼激活单细胞分选技术,快速获得目标种类或目标代谢活力的单细胞,从而对接下游单细胞全基因组测序或培养。   为了支撑SCIVVS,在国家重大科学仪器研制、国家重点研发计划等项目的支持下,青岛能源所和青岛星赛生物合作研制成功了单细胞拉曼光镊分选仪(RACS-Seq)、高通量流式拉曼分选仪(FlowRACS)等原创仪器产品。运用RACS-Seq,研究人员直接从纯种或复合益生菌产品出发,在5个小时之内,完成了精确到每个物种的活细胞计数、活力定量和活力异质性测量。同时,针对乳酸杆菌、双歧杆菌或链球菌等各种益生菌,均能产出高质量的单细胞基因组(覆盖度可高达99.4%),从而完成精准溯源。   对比目前的益生菌产品质检方法,SCIVVS具有快速、准确、全面、低成本、易于自动化等优势,较传统方法快20倍以上,而成本仅为传统方法的1/10,且能免培养、高精度、自动化、一站式地完成产品中每个物种的活细胞计数、活力定量、活力异质性测量和溯源,有望形成新的技术标准。在此基础上,该合作团队将基于“益生菌单细胞技术联盟(A-STEP)”,联合益生菌产业领军企业,建立一个“标准化”、“一站式”、“公益性”的技术服务体系,为实现从生产端到消费端的益生菌产品质量规范化,提供一个原创的、切实可行的解决方案。   该工作由单细胞中心徐健、中国食品发酵工业研究院姚粟、青岛东海药业崔云龙等主持完成,得到了国家自然科学基金、山东省自然科学基金和国家重点研发计划青年科学家项目等项目的支持。
  • 饮用矿泉水新国标溴酸盐和菌落问题引发热议
    尽管还处于网络公示、征求意见阶段,《饮用天然矿泉水》新国标的修订已提前预热。值得注意的是,此前备受争议的溴酸盐问题终于浮出水面,新标准草案中,首次将溴酸盐列入限量指标,初定溴酸盐浓度低于0.01毫克/升,与生活饮用水标准一致。对于首次将溴酸盐问题明确作为一个限量指标写入《饮用天然矿泉水》国标,不管是在业界还是消费者中间,都引发了热议。   一些对此持肯定态度的专家认为,早在1993年,世界卫生组织就在《饮用水水质准则》中,对溴酸盐进行了限定,当时的限值定为0.025毫克/升,2004年修改为0.01毫克/升。我国现行的《生活饮用水卫生标准》规定溴酸盐限值为0.01毫克/升,与世界卫生组织的标准一致。在国际上,部分国家已对溴酸盐限量作了规定,如欧盟规定为0.003毫克/升,美国规定为0.01毫克/升。此次《饮用天然矿泉水》新标准的修订,意在与国际接轨。此前,国际癌症研究机构已将溴酸盐定为2b级的潜在致癌物。绝大多数消费者认为,这一修订体现了对消费者知情权的尊重和保护。   据了解,以前国内的矿泉水企业都用氯来给矿泉水消毒,并不用臭氧,所以基本不存在溴酸盐这个问题。当然,氯本身也有很多问题,带来很多副作用,于是近些年来,业界开始转而使用臭氧来杀菌,目前这种工艺在国内使用得已经非常普遍,于是溴酸盐超标就开始凸现出来。   业内专家分析认为,矿泉水中含有溴酸盐有两个原因:一是水源水本身富含溴化物,一般纯净水不含溴化物,也就不存在溴酸盐的问题,而矿泉水中溴化物的含量是有高低不同的,需要区别看待 二是企业使用较高浓度的臭氧杀菌,两个因素结合起来,才会产生较高浓度的溴酸盐。   在没有新工艺取代之前,臭氧仍是矿泉水行业最有效的消毒剂。要达到标准中新修订的限量指标,企业必须通过改进工艺来降低臭氧浓度。众多被溴酸盐问题牵动神经的企业也看法不一,某大型矿泉水企业负责人认为,新国标带来了新的考验,但企业只要在工艺上适度处理,相信达标不成问题。只是如此一来,增加了企业的检验成本,进而提高了生产成本。但也有企业认为,既然溴酸盐的潜在危险尚没有定论,没必要在限定值上过于苛刻。   让企业感到欣喜的是,新标准草案中,删除了“菌落总数”指标。据了解,矿泉水国标过去一直对菌落总数限定严格,每毫升不得超过50个,这样近乎苛刻的严格限值,导致众矿泉水企业为控制菌落总数而加大臭氧投放量,也增大了致癌物溴酸盐产生的几率。   事实上,并非所有“菌落”中的细菌都是有害的,只有大肠杆菌等致病菌才会危害人体。在WHO(世界卫生组织)等的最新标准中,菌落总数已是非检验指标,但对致病菌的控制却越来越严。此次矿泉水国标的修订虽然取消了菌落总数的要求,但新增了对粪链球菌、绿脓杆菌和产气荚膜杆菌3项致病菌的检测要求。这样一来,卫生、安全的门槛丝毫没有降低,反而体现了检测手段科学进步。同时,也利于我国的矿泉水产品和国际标准接轨,方便其出口国外。对于这项规定,国外的企业普遍持强烈欢迎态度,这将使一些国际品牌更加符合中国市场的要求。以前发生的法国依云矿泉水因为菌落超标被判不合格而引发的争议有望避免。   业内人士比较一致的观点认为,最直接的一点是,菌落总数删除后,臭氧问题的解决降低了难度系数,溴酸盐超标的几率也小了很多。   基层质检系统对于溴酸钾的问题也保持着密切关注。广州市质监局相关人士表示,饮用水的质量卫生问题一直是质监部门关注的对象,对矿泉水企业的检查是日常工作中不可或缺的。目前该局正在开展“清泉行动”,对一批不合格的饮用水企业进行了查处。   这位人士表示,如果新标准实施后,将会按照国家质检总局的要求进行检查,要求所有生产企业加强工艺控制,保证矿泉水溴酸盐含量符合饮用水标准。
  • 易财经送检瓶装水:8品牌15项指标均合格
    网易财经6月8日讯 最近一段时间,由农夫山泉“标准门”争议而引发的瓶装饮用水质量安全问题受到公众普遍关注,网易财经日前选取国内主要8个饮用水品牌的样品送检权威检测机构进行了检测,结果显示,这些品牌被检测的各项指标值都达到国标规定。   5月初,农夫山泉“标准门”争议受到广泛关注后,鉴于消费者对国内瓶装饮用水的安全问题产生担忧,网易财经决定以第三方机构身份随机选取国内市场销售的主要品牌瓶装饮用水进行检测。   公证人员全程监督   首先,网易财经为保证此次抽样和送检行为的公正和公开,特意邀请了北京市国立公证处进行全程监督和证据保全。   在送检项目上,主要选取了公众关注度较高的、可能致癌或致病的9项理化指标和6项微生物指标,分别是PH值、铅、砷、汞、镉、硒、氟化物、亚硝酸盐、溴酸盐、菌落总数、大肠菌群、霉菌、粪链球菌、铜绿假单胞菌和产气荚膜梭菌(后3种菌类含量属于天然矿泉水检验项目,非天然矿泉水不检测,同时天然矿泉水无霉菌和菌落总数指标)。   经过前期准备,5月15日上午,网易财经在北京市国立公证处3名公证人员的监督下,分别以普通消费者身份在北京家乐福大钟寺中坤广场店和沃尔玛知春路店随机购买了8个品牌的10种样品瓶装饮用水。   这些品牌分别是康师傅(2012.4.1)、雀巢优活(2013.3.11)、农夫山泉(3个批次,生产日期分别为2013.2.28 2013.3.21 2013.3.21)、可口可乐冰露(2013.4.21)、昆仑山(2013.3.7)、5100(2012.12.5)、娃哈哈(2013.2.8)和怡宝(2013.4.23)。   5月15日下午,这10种样品被送到国家食品质量安全监督检验中心(北京市海淀区产品质量监督检验所)进行检测,5月28日,网易财经拿到检验报告单。   15项指标基本都合格   为了更全面和权威,本次抽检瓶装饮用水最后对比的国家标准选择了3项,分别是生活饮用水卫生标准(GB5749-2006)、饮用天然矿泉水卫生标准(GB8537-2008)和瓶装(桶)饮用水卫生标准(GB19298-2003,其中采纳后来的两次修改数值)。   对比后网易财经发现,送检的8个品牌的10份样品的15项检测指标含量都在国标限值内,尤其是镉、汞、铅等理化指标方面,10种样品的含量均是大大低于国标限制。   例如对于外界广泛关注的镉含量,生活饮用水卫生标准和瓶装(桶)饮用水卫生标准都要求其含量不得超过0.005mg/L,而本次送检的10个品牌瓶装水镉含量全部0.0001 mg/L 例如砷含量,生活饮用水卫生标准和瓶装(桶)饮用水卫生标准都要求其含量不得超过0.01 mg/L,而本次送检的10个品牌瓶装水中8个样品的砷含量检测值都是0.0001 mg/L,只有雀巢优活和5100的含量分别为0.0021和0.0047,但也远低于国标要求。   而在PH值方面,娃哈哈和怡宝均为7,康师傅为6.4,而另外7个样品的PH值均大于7,其中5100天然矿泉水和昆仑山天然雪山矿泉水的PH检测值最高,分别达到了8.2和7.9。   业内专家对网易财经表示,从各项指标的含量数值看,这些品牌的水质基本可以说是安全的,没有问题。   值得注意的是,专家同时指出,检测结果只能证明这些品牌送检的这些项目指标是合格的。如果要完全确定一个产品的质量安全,必须在科学抽样后,还需要按照国标要求进行全部指标和多次反复检测才能下定论。   相关报道   矿泉水协会秘书长:瓶装水老板不喝自家生产的水   中国矿联天然矿泉水专业委员会秘书长廖雷透露,在瓶装水市场,几种类型的水都有各自的问题,或污染、或长期饮用不利健康、或偷换概念。由于瓶装水市场问题重重,一些瓶装水企业负责人自己都不喝自家生产的水,廖雷坦言,他自己就遇到好几个水企负责人不喝自家水的情况。
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