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休哈塔假丝酵母休哈塔亚种

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  • 运动发酵单胞菌运动亚种的特点与优势及培养方法!
    运动发酵单胞菌运动亚种的特点与优势及培养方法! 运动发酵单胞菌运动亚种是Zymomonas属的微生物,原产地为美国。G-,细胞具有圆端的短杆状,丛生鞭毛运动,单个或成对排列。主要用途为研究,具体用途为用于细菌发酵酒精的研究。 一、菌种简介平台编号:Bio-66722提供形式:冻干物拉丁属名:Zymomonas Mobilis Subsp. Mobilis中文名称:运动发酵单胞菌运动亚种属名:Zymomonas种名加词:mobilis subsp. mobilis其它中心编号:ATCC 31821来源历史:←北京工商大学化工学院(31821)收藏时间:2008.10.31原始编号:WAY资源归类编码:15131139101模式菌株:非模式菌株主要用途:研究具体用途:用于细菌发酵酒精的研究特征特性:G-,细胞具有圆端的短杆状,丛生鞭毛运动,单个或成对排列。利用葡萄糖、蔗糖或果糖产乙醇和CO2,利用山梨醇,不发酵麦芽糖、阿拉伯糖、鼠李糖、木糖。不还原硝酸盐,不液化明胶,接触酶阳性。 生物危害程度:四类致病对象:无培养基:葡萄糖 100.0g,酵母膏 5.0g,(NH4)2SO4 1.0g,KH2PO4 1.0g,MgSO4?7H2O 0.5g,琼脂 20.0g,蒸馏水 1.0L, pH7.0。培养温度:30℃资源保藏类型:培养物保存方法:真空冷冻干燥法实物状态:有实物共享方式:公益性共享;资源纯交易性共享;合作研究共享;资源交换性共享用途:研究;用于细菌发酵酒精的研究注意事项:仅用于科学研究或者工业应用等非医疗目的不可用于人类或动物的临床诊断或治疗,非药用,非食用(产品信息以出库为准) 二、产品特点1、菌种功能明确、品种稳定、应用 2、产品仅限用于科研本品芽孢含量高,稳定性好、耐高温和挤压 3、繁殖能力快、定植能力强、易存活、耐受低pH值环境 4、复活迅速,可在短期内成为优势种群 5、本品安全高效、无抗药性、不污染环境 6、对多数抗生素不敏感,可与低浓度抗革兰氏阴性菌抗生素同时使用。 三、产品优势1、产品质量稳定,是为科研和提供微生物菌种资源共享服务的专业平台。2、国内首创封闭管包装,冻干后的菌株使用时添加配套的复苏培养基后迅速而完全溶解。针对不同的菌株提供八种不同的培养方法,保证菌种的复苏质量。3、严格的质检程序,确保产品质量的稳定性。4、该类产品广泛使用到食品、药品、化妆品、水产品、化工等行业,疾控中心、质检局、出入境、药检局等等,得到广泛好评。 四、菌种的培养1、菌种是指食用菌菌丝体及其生长基质组成的繁殖材料。菌种分为母种(一级种)、原种(二级种)和栽培种(三级种)三级。工业发酵的有用菌种,其筛选步骤包括菌种分离、初筛和复筛。2、挑选具有某种能力的有用菌种,也称种子制备,是指菌种在一定条件下,经过扩大培养成为具有一定数量和质量的纯 菌种的制备过程。以作接入发酵罐中进一步扩大菌体量及合成产物之用。3、种子制备包括孢子制备和菌丝体制备菌种制备。4、保存在沙土管或冷冻管中的菌种,用无菌手续挑取少许,接入琼脂斜面培养基上,在25℃(或较高温度)下培养5~7天(或较长时间。所得孢子还需进一步用较大表面积的固体培养基以获得更多孢子(对于霉菌类孢子制备,多数采用大米、小米之类的天然培养基)。5、将培养成熟的斜面孢子制成悬浮液,接种到扁瓶固体培养基上,于25~28℃培养14天。将成熟的扁瓶孢子于真空中抽干,使水分降至10%以下,并放入 4℃冰箱中备用。一次制得的孢子瓶可在 上延续使用半年左右。6、如果有些菌种不产孢子,如赤霉素产生菌或产孢子不多的,则可采用摇瓶液体培养制得菌丝体,作种子罐的种子。种子罐的目的是使接入有限的孢子或菌丝体迅速发芽、生长、繁殖成大量菌体。其中的培养基组分应是易于被菌体利用的碳源(如葡萄糖)和氮源(如玉米浆),及无机盐(如磷酸盐)等。作为发酵罐的种子应生命力旺盛、染色深、菌丝粗壮,无杂菌及异常菌体。接种量一般在10%~20%。 五、保藏方法1、传代培养保藏法又有斜面培养、穿刺培养、疱肉培养基培养等(后者作保藏厌氧细菌用),培养后于4-6℃冰箱内保存。2、液体石蜡覆盖保藏法是传代培养的变相方法,能够适当延长保藏时间,它是在斜面培养物和穿刺培养物上面覆盖灭菌的液体石蜡,一方面可防止因培养基水分蒸发而引起菌种死亡,另一方面可阻止氧气进入,以减弱代谢作用。3、载体保藏法是将微生物吸附在适当的载体,如土壤、沙子、硅胶、滤纸上,而后进行干燥的保藏法,例如沙土保藏法和滤纸保藏法应用相当广泛。4、寄主保藏法用于目前尚不能在人工培养基上生长的微生物,如病毒、立克次氏体、螺旋体等,它们必须在生活的动物、昆虫、鸡胚内感染并传代,此法相当于一般微生物的传代培养保藏法。病毒等微生物亦可用其他方法如液氮保藏法与冷冻干燥保藏法进行保藏。5、冷冻保藏法可分低温冰箱(-20-30℃,-50-80℃)、干冰酒精快速冻结(约-70℃)和液氮(-196℃)等保藏法。6、冷冻干燥保藏法先使微生物在极低温度(-70℃左右)下快速冷冻,然后在减压下利用升华现象除去水分(真空干燥)。有些方法如滤纸保藏法、液氮保藏法和冷冻干燥保藏法等均需使用保护剂来制备细胞悬液,以防止因冷冻或水分不断升华对细胞的损害。保护性溶质可通过氢和离子键对水和细胞所产生的亲和力来稳定细胞成分的构型。保护剂有牛乳、血清、糖类、甘油、二甲亚砜等。 欢迎访问微生物菌种查询网,本站隶属于北京百欧博伟生物技术有限公司,单位现提供微生物菌种及其细胞等相关产品查询、咨询、订购、售后服务!与国内外多家研制单位,生物医药,第三方检测机构,科研院所有着良好稳定的长期合作关系!欢迎广大客户来询!
  • 【瑞士步琦】冷冻干燥含酵母菌的微球应用
    瑞士步琦冷冻干燥含酵母菌的微球应用冷冻干燥应用”益生菌是一种有益于人体健康的微生物,常被用于改善肠道菌群。微胶囊包埋技术可以帮助保护菌株,延长其在体内的存活时间,不易受外界环境的影响而失活。因此,在生产益生菌产品时,需要考虑选择合适的微胶囊技术,以确保益生菌的稳定性和活性。下面这篇应用非常好的结合了微胶囊包埋和冷冻干燥技术,证明菌种经过包埋干燥后仍具有生物活性,为发酵工艺和食品转化等领域开辟新的可能性。1介绍冷冻干燥,也称为冻干是一种非常通用的脱水方法,常用于保存微生物、食物或药物,如蛋白质类药物。它将冷冻和干燥结合在一个独特的操作中,可以创造出高质量的干燥终产品。冷冻干燥通常用于保存微生物培养物,因为它具有不可忽视的优点:储存的方便性和增加邮寄微生物的可能性。此外,制得的产品只需要少量维护,培养基在储存过程中不会受到污染,微生物可以长时间保持活力。然而,众所周知,冷冻干燥技术对微生物至关重要,因为它对微生物的生存能力和生理状态都有负面影响。根据方法和生物体的不同,微生物存活率也各有不同;然而,活力水平明显低于液氮储存 2。观察到的活力下降主要是由于一些不良副作用引起的,例如细胞内冰晶的形成1、敏感蛋白的变性或在此过程中膜脂质的物理状态发生一些不可逆的变化 3,5。为了防止这种影响,通常在冷冻或冷冻干燥前使用脱脂牛奶、蔗糖、甘油、 DMSO 或海藻糖等作为冻干保护物质1,3。据报道,海藻糖在干燥、冷冻、渗透胁迫和热休克等极端环境下对酵母和细菌具有保护作用。这些保护效果与膜的稳定和酶活性的保存有关。关于海藻糖的保护作用,已经报道了几种假设。一些报道认为它的作用是通过多个外部氢键取代参与维持蛋白质三级结构的水分子,另一些报道认为它形成玻璃态结构以确保物理稳定性。除了发酵过程或食品转化,酿酒酵母或乳酸菌等微生物在益生菌膳食食品和饲料补充剂领域具有重要的经济意义。然而,这些应用需要在储存过程中保持细胞活力。通过造粒和冷冻干燥技术相结合,可以得到大小和组成均匀的无尘颗粒。由于具有更高的颗粒表面积,这使得产品将具有良好的颗粒流动性,更容易掌握的剂量和更快的产品复原性。尽管存在上述挑战,冷冻干燥仍然是一种酵母、孢子真菌和细菌的方便保存方法,因为它们的长期生存能力通常保持得相当好,而且菌株的储存和分发要求也很简单。因此,本应用旨在生产酿酒酵母颗粒作为模型微生物,使用微胶囊造粒仪 Encapsulator B-390 作为造粒机,将酵母悬浮液挤压进入液氮中形成单分散球体,然后使用冷冻干燥机 Lyovapor&trade L – 200 进行冷冻干燥处理。2仪器,试剂和器材仪器:ESCO NordicSafe, Biosafety Cabinet Class IIBUCHI 微胶囊造粒仪 Encapsulator B-390BUCHI 冷冻干燥机 LyovaporTM L-200 Pro,干燥腔体搭配可加热搁板BUCHI LyovaporTM Software试剂:YPD 培养基, Sigma Aldrich海藻糖, Sigma Aldrich脱脂奶粉琼脂去离子水液氮器材:玻璃培养皿液氮杜瓦瓶3实验本应用中描述的工作是在无菌条件下进行的。将 84g 市售面包酵母悬浮溶解在 50mL 无菌 YPD 培养基(Sigma Aldrich)中。在酵母悬浮液中加入 50mL 无菌冻干保护剂培养基(5g 海藻糖(Sigma Aldrich)和 5g 脱脂牛奶溶于去离子水中),然后用微胶囊造粒仪 B-390 进行制粒(表1)。将挤压后的液滴收集在液氮浴中冷冻,然后转移到不锈钢托盘中,保存在 -25°C 的冰箱中进行冷冻干燥。表1:微胶囊包埋参数_300μm 喷嘴1mm 喷嘴频率[Hz]68060电压[V]7502500压力[mbar]500500冷冻干燥步骤(初级干燥和次级干燥)使用 LyovaporTM 编程软件,如表 2 所示。使用 LyovaporTM L-200 Pro 干燥腔体、可加热的搁板和环境空气。表2:初级干燥和次级干燥冻干参数无酵母菌微球采用与含酵母菌微球相同成分培养基和参数进行制备。冷冻干燥后,将 1mL 无菌水加入 1mL 微球中,用以复原样品。对于含有酵母菌的菌珠,对每个重组溶液进行10倍、100 倍和 1000 倍的连续稀释。将复原后的溶液和稀释液分别涂于 YPD 琼脂平板上,如图 1 所示。琼脂板在 28℃ 培养 24h,评价细胞活力。▲ 图1:琼脂平板上的酵母活力测试4结果与讨论含有酵母的微球可以通过使用微胶囊造粒仪 B-390 进行包埋制备,结果表明:用微胶囊造粒仪 B-390 将酵母滴入液氮中,可使酵母迅速颗粒化;用 300μm 的喷嘴和 1mm 的喷嘴分别制备了 700μm 和 1500μm 左右的微球。仅使用含冻干保护剂介质的溶液也得到了类似的结果。如图 2 所示,冻干后的微球在形状和大小上与湿冻微球保持相似。▲ 图2:用微胶囊造粒仪 B-390 制得的 300μm 酵母微球,在冻干前(左)后(右)的对比通过扫描电镜对其结构进行分析。在图 3 中,可以观察到含有酵母的球珠(下两图)和仅由冻干保护剂培养基制成的球珠(上两图)在形态上的差异。含有酵母菌的微球具有由 5μm 颗粒组成的粗糙结构,可以认为是微生物,而只含有冻干保护剂的微球具有更光滑的结构。▲ 图3:含酵母菌的冻干微球(下)和不含酵母菌冻干微球(上)的结构对比当冷冻干燥时,考虑到膜中脂质物理状态的变化或由于某些蛋白质结构的变化,生物系统可能受到破坏3,9。为了验证酵母菌的活力,将酵母菌重新水合,稀释,并在 28°C 的 YPD 琼脂板上培养 24 小时。图 4 证实了文献报道的内容,即便失去了部分活力,酵母在冻干后仍然可以生长2,4,6,10。▲ 图4:在 28℃ 琼脂板中培养 24 小时后的酵母菌活力5结论含有酵母菌的微粒可以很容易地用微胶囊造粒仪 B-390 进行制备,并使用冻干机 LyovaporTM L-200 进行冷冻干燥处理。B-390 的喷嘴直径分别为300 μm和1000 μm,制得的微粒直径分别为 700μm 和 1500μm。冷冻干燥后,珠粒的大小和形状没有变化。该颗粒流动性好,容易掌握使用剂量,且与水混合后溶解速度快。冻干后的微生物在贮藏过程中仍能保持良好的活力,并能在复水化后成功生长。在本应用中,造粒包埋和冷冻干燥的结合显示出了非常好的实验结果。它可以在发酵工艺和食品转化等领域开辟新的可能性,有利于生产制备剂量易控制和重组的培养发酵剂;另外,在益生菌和食品补充剂领域中获得无尘且可自由流动的粉末,同时保证产品颗粒大小和组成的均匀度。6参考文献N’Guessan, F. K. Coulibaly, H. W. Alloue-Boraud, M. W. A. Cot, M. Djè, K. M. Production of Freeze-Dried Yeast Culture for the Brewing of Traditional Sorghum Beer, Tchapalo. Food Sci. Nutr. 2016, 4 (1), 34–41.Bond, C. Freeze-Drying of Yeast Cultures. In Cryopreservation and Freeze-Drying Protocols Day, J., Stacey, G., Eds. Methods in Molecular BiologyTM Humana Press, 2007 pp 99–107.Leslie, S. B. Israeli, E. Lighthart, B. Crowe, J. H. Crowe, L. M. Trehalose and Sucrose Protect Both Membranes and Proteins in Intact Bacteria during Drying. Appl. Environ.Microbiol. 1995, 61 (10), 3592–3597.Miyamoto-Shinohara, Y. Imaizumi, T. Sukenobe, J. Murakami, Y. Kawamura, S. Komatsu, Y. Survival Rate of Microbes after Freeze-Drying and Long-Term Storage.Cryobiology 2000, 41 (3), 251–255.Wolkers, W. F. Tablin, F. Crowe, J. H. From Anhydrobiosis to Freeze-Drying of Eukaryotic Cells. Comp. Biochem. Physiol. A. Mol. Integr. Physiol. 2002, 131 (3), 535–543.Lodato, P. Huergo, M. S. de Buera, M. P. Viability and Thermal Stability of a Strain of Saccharomyces Cerevisiae Freeze-Dried in Different Sugar and Polymer Matrices. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999, 52 (2), 215–220.Strasser, S. Neureiter, M. Geppl, M. Braun, R. Danner, H. Influence of Lyophilization,Fluidized Bed Drying, Addition of Protectants, and Storage on the Viability of Lactic Acid Bacteria. J. Appl. Microbiol. 2009, 107 (1), 167–177.Miyamoto, T. (Kyushu U. Kawabata, K. Honjoh, K. Hatano, S. Effects of Trehalose on Freeze Tolerance of Baker’s Yeast. J. Fac. Agric. - Kyushu Univ. Jpn. 1996.Giulio, B. D. Orlando, P. Barba, G. Coppola, R. Rosa, M. D. Sada, A. Prisco, P. P. D. Nazzaro, F. Use of Alginate and Cryo-Protective Sugars to Improve the Viability of Lactic Acid Bacteria after Freezing and Freeze-Drying. World J. Microbiol. Biotechnol. 2005, 21 (5), 739–746.Cerrutti, P. Huergo, M. S. de Galvagno, M. Schebor, C. Buera, M. del P. Commercial Baker’s Yeast Stability as Affected by Intracellular Content of Trehalose, Dehydration Procedure and the Physical Properties of External Matrices. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2000, 54 (4), 575–580.
  • 单染色体酵母第一作者选择申请海外博士,科学家再次疾呼:莫让“海归”标签“逼”走优秀博士生
    p  span style="color: rgb(255, 0, 0) "日前刚在英国 《自然》杂志发表领先世界的合成生物学成果,中国科学院分子植物科学卓越创新中心、植物生理生态研究所合成生物学重点实验室覃重军研究员就在媒体面前流露出内心焦虑:论文的第一作者、掌握了自己学术思想和实验关键技术的博士生邵洋洋正在申请海外博士后,其中就包括此次与他们同时发表类似论文的美国同行实验室。/span/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/ef2459e4-3725-47d6-a971-944dcbf97e7b.jpg" title="640-3.jpeg"//pp style="text-align: center "▲覃重军研究员(右)与论文第一作者也是团队成员之一的邵洋洋在实验室进行试验研究。/pp  “为了学生的前途考虑,我希望她出国,但为国家考虑,我真希望能留住她。”覃重军无奈地说,span style="color: rgb(0, 112, 192) "按照国内学术圈现行的 “游戏规则”,年轻人若在国外实验室做出好的工作再回国,获得的待遇会好很多。能否根据真实学术水平和实际科研贡献,给予海内外青年人才同等待遇?这个近来被诸多讨论的话题,再次摆在我们面前。/span/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "国内不乏孕育重大产出的优秀“学术土壤”/span/strong/pp  将酿酒酵母中16条天然染色体,通过基因编辑的方法合成一条,覃重军研究团队在 “合并染色体”的国际竞争中拔得头筹。连他最强劲的竞争对手——美国科学院院士、纽约朗格尼医学中心的杰夫· 博伊克,都忍不住来问他,究竟是怎么会想到要这么做,又是怎样完成染色体 “十六合一”的?因为博伊克的实验室用了相同的技术路线,但只融合到两条染色体。/pp  “这是只有外行才敢想的念头,一开始没多少人觉得我能做出来。”覃重军非常感谢植生所给了他宽松的氛围,支撑他度过了最艰难的时光,“整整五年,我没有发表一篇与酵母相关的论文,换在别的单位,或许早就让卷铺盖走人了。”/pp  span style="color: rgb(0, 112, 192) "覃重军说,这次成功的关键是他在初期作了大量思考,清晰界定了实验的原则,同时实验室也在进行系统的技术积累。/span中国科学院上海植物生理生态研究所所长、中国科学院院士韩斌告诉记者,尽管覃重军没有出论文,但研究所更看重人才的长期发展,在国际评估中,他的研究方向一直得到认可,span style="color: rgb(0, 112, 192) "“需要五到十年才能出的重大成果,我们就该耐心等待。”/span为了让科学家安心做科研,植生所为各研究组长提供稳定的年薪,而非根据各研究组的科研经费多少来核算。/pp  维持研究团队运转的人头费一直是件头疼事。多年来,覃重军研究组的“赤字”超过300万元。 “有些单位的研究组账面少于50万元,就可能被要求关闭,更不可能赤字运行。”为此,他感到十分幸运, “现在无论哪里要我去,我都不会离开植生所这片宽容的学术土壤。”更何况,这里每年都会冒出两三项引发学术界关注的重大成果,已初具国外著名实验室的创新氛围。/ppspan style="color: rgb(255, 0, 0) "strong  优质“小环境”还需“大环境”扶持滋养/strong/span/pp  宽松而有活力的 “学术土壤”在国内尽管还不多,但越来越多的 “星星之火”已经出现。不必远寻,就在生命科学领域,上海就有多个研究所具备了专注学术、宽容失败、奋力创新科研氛围,而且具备了国际一流的研究实力。/pp  照理说,span style="color: rgb(0, 112, 192) "这样的研究所对优秀博士毕业生应该具有相当吸引力。但邵洋洋斟酌再三,还是决定申请海外博士后。/span的确,以此次单染色体人工酵母的工作,她可以申请到全球合成生物学领域任何一个顶尖实验室,去那些实验室接受训练和熏陶,这是每个年轻博士所向往的。然而,更吸引人的,是去一个优秀海外实验室学习上两三年,做出杰出工作再回国,就能比不出国的青年科学家获得更多科研经费支持和房贴,申请人才计划、科研项目都更有优势。/pp  “可我又有什么理由阻止她出国做博士后呢?尽管我的研究组人手十分紧张,她走之后,很多后续工作可能难以开展。”span style="color: rgb(0, 112, 192) "尽管植生所的 “小环境”不错,但从整个科研大环境来看, “海归”标签依然在科研经费获取、人才评价等方面起着重要作用。这让覃重军如鲠在喉。/span/pp  不久之前,中国科学院神经科学研究所博士后刘真受聘为研究组长,他也曾为是否出国做博士后而纠结过。尽管他留在国内并做出了世界首批克隆猴这样的杰出工作,但在科研启动期所获得的资助仍比不上 “海归”们。/pp  span style="color: rgb(0, 112, 192) "“一个优秀博士生的流失,不仅意味着一段黄金创造力的流失,也可能将国内实验室的创新科研思路带给竞争对手。”痛心之余,覃重军疾呼,能否更公平地对待不同路径成长起来的人才,适时转变人才评价方式,让优秀博士生不必为了 “海归”标签而出国。/span/p
  • 酵母实现葡萄糖变鸦片 我们如何应对?
    每年,世界著名的合成生物学竞赛iGEM( International Genetically Engineered Machine)都会吸引数以千计来自全球各地的学生,就&ldquo 组装生命系统&rdquo 的创意与技术一较高下。Jerome Sessini/Magnum为了探讨合成生物学给社会安全和人类健康带来的潜在风险,2014年11月,FBI特工爱德华· 尤(Edward You)假设了这样一个场景:如果经过遗传改造的酵母能将糖&ldquo 加工&rdquo 成鸦片,我们该怎么办?曾经的假想现在已经成真。就在2014年iGEM大赛结束一周后,两位专门研究如何用酵母制造鸦片的科学家找到了我们。那时他们还没有发表论文,希望听听我们作为生物技术政策研究人员的意见。他们想知道,如何能在论文中将研究的益处最大化,并且缓和由此带来的风险的尖锐性。如今,加利福尼亚大学伯克利分校的约翰· (John Dueber)、肯高迪亚大学的文森特· 马丁(Vincent Martin)和同事已经将这篇论文公诸于众。经他们改造的酵母具有将葡萄糖转换成吗啡的完整生化反应通路(见&ldquo &lsquo 酿造&rsquo 鸦片的酵母&rdquo );而卡尔加里大学的研究人员更是给这架&ldquo 鸦片机器&rdquo 添上了最后一块零件。我们现有的吗啡都提取自罂粟(Papaver somniferum)。而通过改造酵母,寻找更简单、更可控的生物合成途径,可以帮助我们获得更便宜、成瘾性更低、更安全,以及更有效的镇痛药物。酵母可以自我复制、容易生长、貌不显眼,还能轻易地播撒四方。因此,这一研究还会为鸦片制品的违禁交易提供便利。鸦片制品可以由此实现分散化、本地化生产,普通人可以轻而易举地得到它们。这些年来,合成生物学家利用改造过的酵母、细菌和真核植物,制造了许多&ldquo 友好&rdquo 的物质,例如抗疟疾药物、香氛、调味料、工业化学品和燃料。制造吗啡的酵母菌株,是我们研究出的第一种可以合成管制镇痛药的生物系统;然而,它肯定不会是最后一种可能&ldquo 惹麻烦&rdquo 的生物合成系统。合成生物学界应该和监管者合作,积极评估这类具有&ldquo 两面性&rdquo 的技术的风险与收益。本文列出了一些最需要优先讨论的问题,它们不仅关乎公共卫生与安全,也与合成生物学的前景密切相关。这些问题包括:只允许持有相关执照的机构、获得授权的研究人员和技术人员使用能够合成鸦片制品的酵母菌株;减小这种酵母菌株对鸦片违禁交易市场的吸引力;贯彻灵活、灵敏的监管措施,以应对我们对这一技术在认识上的转变,以及技术本身的变化。&ldquo 酿&rdquo 鸦片的酵母葡萄糖需要经过若干个生物化学反应才能变成吗啡,研究人员花费了7年时间才赋予了酵母合成吗啡的能力。参与这一研究的3个团队分别将罂粟、甜菜根,以及土壤中一种细菌的遗传物质转移到酵母中,使其获得发生其中一个或几个反应的能力。第4个团队则为这条反应链接上了最后一环,在酵母中实现了(S)-网状番荔枝碱[ (S)-reticuline] 到(R)-网状番荔枝碱的转化:一种能够实现&ldquo 葡萄糖&rarr 吗啡&rdquo 全转化的酵母由此诞生。理论上,只要懂得一些基本的发酵操作,任何人都能使用家用的啤酒发酵工具养殖这种酵母。如果你用发酵罐&ldquo 酿&rdquo 出了10g吗啡,只需喝下1~2ml发酵液,你就能摄入一个标准的处方剂量。现有的工程酵母菌株并没有这么高的产能,然而,其他一些相关的商业化发酵产物,已经达到了此种产出率,有些物质的产出率甚至比这还高10倍以上。尽管研究人员的初衷是制造合法的镇痛药,这一新技术还是带来了不少麻烦。生物合成的吗啡要么比现有吗啡具有更高的费-效比(即在成本相等的情况下效果更好)、更为监管者所接受,要么成瘾性更小、更安全。然而,现有的吗啡在制造、管理,以及运输环节上,成本都不高。2001到2007年间,高产罂粟的成功培育使得罂粟制品(又叫&ldquo 罂粟杆浓缩物&rdquo ,一般以大批量形式销售)的成本降低了20%(约为每公斤300~500美元)。合成生物学家、神经科学学家、药物化学家等不同领域从业人员必须通力合作,并且进行旷日持久、所费不赀的临床试验,才能设计出更具商业价值的鸦片类镇痛药。此外,为了防止更多人对鸦片上瘾,全球鸦片制品的供需都处于严格的管控之下。法律保障为了防止罂粟制品流向非法市场,国际社会、各个国家均制定了多种条约与法律。鸦片制造国往往会采用有安保措施的大型设施生产鸦片制品。为了加强安全性,澳大利亚甚至专门选种了一种含有大量二甲氢吗啡的罂粟品种。二甲氢吗啡很难转变成吗啡,直接口服还会导致中毒。我们很难预测全球最大的麻醉品管制机构&mdash &mdash 国际麻醉品管制局(International Narcotics Control Board,INCB))&mdash &mdash 会对这种新型吗啡合成系统作何反应。INCB不大可能因此削减目前鸦片类镇痛药的生产定额,也不大可能对目前合法的鸦片交易模式进行调整。这就阻碍了酵母菌株进入鸦片制造市场。这种新型酵母菌株很可能对鸦片的违禁交易市场产生巨大影响。如今,鸦片有两个主要的非法交易渠道。首先是药物处方。非法交易者会窃取氧可酮(oxycodone)或氢可酮(hydrocodone)等镇痛药处方、开具不合理处方,或将合法处方非法销售出去。其次是毒品犯罪网络。阿富汗、缅甸、老挝、墨西哥等国家非法种植的罂粟制成的海洛因会通过犯罪网络流入市场,并以几十上百倍于成本的价格出售。新型菌株为毒品犯罪网络(特别是对毒品有高需求的北美和欧洲)提供了一个新&ldquo 选项&rdquo 。使用酵母制毒极易掩人耳目。酵母生长迅速、运输方便,不论犯罪组织还是执法机构都很难对这种酵母的流向进行控制。总之,由此带来的&ldquo 分散化&rdquo 与&ldquo 本地化&rdquo 生产,必然会降低非法鸦片制品的生产成本,增加其易得性,对全球的鸦片问题起到持续的恶化作用。目前,全世界有超过1 600万人正在非法使用鸦片制品。理论上讲,有了这种酵母,你只需家用的啤酒酿造工具,就能制造吗啡。(How Hwee Young/EPA/Corbis)四点建议若要对这一研究进行灵活、合理的监管,我们需要克服两个主要障碍。首先,目前我们对&ldquo 工程微生物&rdquo 的监管,主要集中在病原微生物(例如炭疽杆菌和天花病毒)上;酵母本不在监管的范畴中。其次,要实现有效监管,各国与国际的药物监管部门、执法机构需要通力合作,然而他们的行为规范与准则各不相同。公共卫生专家、科学家、监管者和执法机构必须加强沟通与协调。INCB,以及其他研究生物安全与生物安保监管的专业组织,就可以担负起组织这类国际对话的责任。以下四点,是为四个亟待解决的问题敲响警钟。技术层面 我们在设计酵母菌株时,应该尽可能降低它们对犯罪分子的&ldquo 吸引力&rdquo 。例如,我们可以用它制造对毒贩无甚价值的麻醉药(比如二甲氢吗啡);另外,我们可以弱化工程菌株,使其只能在既定的实验室环境内发挥作用,这样一来,一般人就很难利用它在其他地方生产和收集鸦片制品;最后,我们还可以设计需要特殊的营养成分,才能正常生长的酵母菌株。我们已经将以上&ldquo 生物遏制手段&rdquo (methods of biocontainment)应用在了大肠杆菌(Escherichia coli)上。我们也可以给这种菌株打上DNA水标记(DNA watermark)之类的&ldquo 烙印&rdquo ,方便执法机构对其进行识别。加强审查 鉴于犯罪组织可能利用公开的DNA序列制造自己的菌株(尽管这种可能性不大),那些专门提供DNA片段定制服务的公司,也需要提高警惕。制造此种酵母菌株的基因序列必须被列入DNA片段供应商的审查列表。目前,这一审查列表由两个自发性组织&mdash &mdash 国际合成生物学学会(International Association of Synthetic Biology)与国际基因合成联合会(International Gene Synthesis Consortium)&mdash &mdash 负责监管, 而审查的对象仅限于病原体的基因片段。健全安保 我们应该对此种酵母的使用环境进行严格管控,只有经监管者许可、受到控制的场所,才能利用它生产麻醉剂。上锁、安警报、实验室与实验原料监控系统等物理性质的生物安保措施可以防止酵母被盗。实验室的工作人员需要通过安保审查,方能上岗。同样,研究人员要承担相应的权责,不能向未经合法授权的单位或个体提供酵母菌种。法律监管 监管麻醉剂的现有法律,例如《美国管制药物法案》(US Controlled Substance Act)以及其他国家的类似法律,应该将监管触角延伸至此类酵母,保证其产物在生产与销售上的合法性。生物技术的发展日新月异,如果我们能够对这种具有两面性的技术采取有力、有效的监管,就能给以后的类似情况树立榜样。事实上,参与此项研究的生物学家,已经在最关键问题上做出了表率:他们愿意,也正在为他们的&ldquo 造物&rdquo 担负责任。然而,这篇文章的写作对象并不是他们。其他基因组工程师也在沿着这条道路前进。参与研发基因组编辑工具CRISPR/Cas9的科学家已经对学术界和监管机构发出呼吁,对CRISPR/Cas9进行积极的风险评估;而在此之前,我们不能利用这一工具编辑野生动植物基因,或修改人生殖细胞基因组。合成生物学已经日臻成熟,这要求我们必须拿出负责的态度,做出负责的行动。(撰文:肯尼思· A· 奥耶(Kenneth A. Oye) J· 查普尔· H· 劳森 (J. Chappell H. Lawson) 塔尼亚· 布贝拉(Tania Bubela)。
  • MALDI-TOF MS可快速、准确鉴定假丝酵母菌,对复合体鉴定有优势
    p  对假丝酵母菌种类鉴定可指导临床更好治疗外阴阴道假丝酵母菌病span style="font-size: 14px "(vulvovaginalcandidiasis,VVC),/span但传统的假丝酵母菌的鉴定方法如芽管试验、显色培养和API鉴定等精准性不能令人满意,基因测序分析目前认为是鉴定假丝酵母菌最准确的方法,但耗时久,成本高。本研究使用毅新博创自主研发的的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪Clin-ToF及其配套的真菌处理试剂盒,通过应用自建白假丝酵母菌复合体数据库并进行验证,使该质谱仪对白假丝酵母菌、非洲假丝酵母菌和都柏林假丝酵母菌鉴定准确率分别为98.08%、97.37%和100%,白假丝酵母菌复合体总体鉴定率97.95%,完善了MALDI-TOF MS在白假丝酵母菌复合体分型方面鉴定的应用。/pp  近日,一篇题为“应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定假丝酵母菌”发表在《中华检验医学杂志》上,文章中指出:本次研究使用了毅新质谱自主研发的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪Clin-ToF及其配套的真菌处理试剂盒,通过建立并完善MALDI-TOF MS检测假丝酵母菌的数据库,得出的研究结果表明,MALDI-TOF MS可用于快速和准确鉴定假丝酵母菌,对假丝酵母菌复合体的鉴定有优势。/pp style="text-align: center "img title="2018.8.3 1-1.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/9b459e37-9598-4740-8ad4-1a0b9e80e4fd.jpg"//pp style="text-align: center "  span style="font-size: 14px "北京大学深圳医院研发团队发表论文/span/pp  快速和准确鉴定假丝酵母菌意义重大。据不完全统计,至少有75%的育龄期妇女发生过VVC,约有5%—8%的妇女反复发作,对假丝酵母菌种类准确鉴定可指导临床更好治疗VVC。但传统的假丝酵母菌的鉴定方法如芽管试验、显色培养和API鉴定等精准性均不能令人满意。基因测序分析目前被认为是鉴定假丝酵母菌最准确的方法,但该方法也有耗时久,成本高等问题。并且在VVC患者中,白假丝酵母菌、非洲假丝酵母菌和都柏林假丝酵母菌(白假丝酵母菌复合体)这三者在感染性、致病性和复发性等方面存在显著差异,如何能够区分三种假丝酵母菌,这对于临床诊断和治疗有重要意义。/pp style="text-align: center " img width="498" height="301" title="2018.8.3 1-2.jpg" style="width: 265px height: 158px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/47f7eb05-6da3-457b-9193-4c7e3f4f9182.jpg"/ /pp style="text-align: center "span style="font-size: 14px "白假丝酵母菌 /span /pp style="text-align: center " img width="597" height="454" title="2018.8.3 1-3.jpg" style="width: 270px height: 153px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/2eed775f-415f-440f-9d66-cfa2f4ce0302.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-size: 14px "相关鉴定谱图/span/pp  目前已有的研究成果中,各种MALDI-TOF MS对白假丝酵母菌复合体的鉴定率低,国产MALDI-TOF MS大部分不能有效区分白假丝酵母菌复合体中的三种假丝酵母菌。本次研究通过使用毅新质谱自主研发的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪Clin-ToF及其配套的真菌处理试剂盒,建立了假丝酵母菌数据库,并对该数据库进行验证,结果显示Clin-ToF质谱仪对白假丝酵母菌、非洲假丝酵母菌和都柏林假丝酵母菌鉴定准确率分别为98.08%、97.37%和100%,白假丝酵母菌复合体总体鉴定率97.95%,优化了MALDI-TOF MS对白假丝酵母菌复合体的鉴定效能。/pp style="text-align: center "img width="408" height="506" title="2018.8.3 1-4.jpg" style="width: 271px height: 288px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/f84fa0bb-2b9b-4f47-8e56-16e92b6d91a9.jpg"//pp  毅新Clin-ToF微生物鉴定平台是一套包括仪器、试剂、数据库等在内的完整系统,具有快速鉴定、灵敏准确、简便低耗、性价比高等特点。其中微生物数据库是在国家科技部重大专项的支持下,由解放军军事医学科学院牵头,毅新与多家国内顶级科研单位历时5年,累计投入超过1.5亿元共同建立的。该数据库广泛应用于包括三甲医院、科研单位、第三方医学检验机构在内的40多家单位,临床验证超过20万株,2017年获得北京市科学技术进步奖,并连续多次满分通过卫生部室间质评。/pp /p
  • 焦点 | IKA HABITAT 助力合成生物学研究
    /// HABITAT 生物反应器,是合成生物学进行发酵研究的好帮手!合成生物学是继“DNA双螺旋”和“人类基因组计划”之后的第三次生物技术revolution。未来60% 的产品有望都可通过合成生物学方法进行生产制造,其在变革传统生产方式上的潜力备受关注。目前,合成生物学应用已经覆盖了化工、能源、医药、农业、食品、化妆品、材料合成、泛健康等诸多领域。 与传统发酵相比,合成生物学可以按照特定目标理性设计、改造乃至重设合成生物体系,进而定向操作获取人类需要的物质,解决医药、能源、原材料、食品稀缺等问题。发酵常以微生物作为生物工厂,通过发酵获得高纯度目标产物,比如利用基因工程改造微生物来生产人类胰岛素、生长激素、酶,以及维生素和部分营养补充剂等;利用微生物细胞工厂生产化学品、材料、燃料、植物天然成分和替代蛋白;通过细菌、细胞来治疗疾病和帮助作物增产等。IKA HABITAT 生物反应器! 合成生物学发酵研究的好拍档德国IKA HABITAT 生物反应器,是合成生物学进行发酵研究的好帮手。HABITAT 发酵罐的如何助力: HABITAT ferment 罐盖支架 直观的软件操作 0.5~10L罐体,单壁或夹套HABITAT 生物反应器集成搅拌、温控、pH监测、DO监测、补料、取样、进气、尾气冷凝、液位监测、消泡监测等全部功能,并可对实验数据进行实时图谱展示,具备警报功能、pH/DO自动控制和内置电极校准程序,并可在断电后自动重启,实时保存数据和导出数据。罐体多规格可选,500ml~10L,有单壁和夹套罐体形式,满足不同应用需求罐体及传感器(消泡电极除外)可置于高压灭菌器内进行灭菌,可重复使用可选配罐盖安装支架,用于2L以上罐盖配件的安装和拆卸控制塔前端有状态指示灯,可辅助监控搅拌、pH、DO、温度、消泡和液位等参数的变化情况,有异常会出现红色警示独有的新型chaotic mixing混沌混合方式,可加速底物的混合效率集成的4个Watson Marlow 泵,方向和速度可调,方便泵入和泵出不同的液体(如酸,碱,消泡剂,补料试剂)关于 IKA IKA 集团是实验室前处理、分析技术、 工业混合分散技术的市场领导者。电化学合成仪、磁力搅拌器、顶置式搅拌器、分散均质机、混匀器、恒温摇床、恒温培养箱/烘箱、移液器、研磨机、旋转蒸发仪、加热板、恒温循环器、粘度计、量热仪、生物反应器、化学合成釜、实验室反应釜等相关产品构成了IKA 实验室前处理与分析技术的产品线;而工业技术主要包括用于规模生产的混合设备、分散乳化设备、捏合设备、以及从中试到扩大生产的整套解决方案。IKA 还与全球知名大学和科学家进行着密切的合作, 支持其在科研道路上不断探索。我们致力于为客户提供更好的技术, 帮助客户获得成功。IKA 成立于1910年,集团总部位于德国南部的Staufen,在美国、中国、印度、马来西亚、日本、巴西、韩国、英国、波兰等国家都设有分公司。 艾卡(广州)仪器设备有限公司是IKA 集团于2000年设立的全资子公司,主要负责为中国和蒙古国提供产品、技术和服务支持。
  • 使用QPCR 检测酵母,避免巨大经济损失 -- 将英国Bibby 的荧光定量用于红酒行业
    英国Bibby Scientific 集团,子品牌PCRmax 下的荧光定量PCR仪ECO, 或者子品牌TECHNE下的PRIME PRO 48, 可以有效而可靠地检测名叫“德克.布鲁赛尔”的酵母。 对于全球红酒行业而言,该酵母的存在是破坏红酒的一个主要原因。从这方面说,Bibby 的基于PCR的荧光定量检测方法也有助于红酒行业防止巨额经济损失。酵母中释放的可破坏味道的酚成份, 产生了不可预计的芳香成份,通常会与谷仓的味道或动物的汗味等结合,从而破坏红酒的味道。如果采用传统的微生物学技术去检测酵母,太费时费力,成本高, 结果也不太可靠。相反, 实时定量PCR方法,能高效快速并精确地检测酵母。检测“德克.布鲁赛尔”酵母的存在,可用Bibby 的荧光定量PCR仪 ECO 或Prime Pro 48,及“德克.布鲁赛尔26S核醣体RNA” 检测试剂。该试剂专门用于德克.布鲁赛尔酵母基因组的定量检测, 由引物与探针序列组成,检测范围广。广州语特仪器科技有限公司全权代理Bibby产品在中国大南方区的销售。Bibby PCR Detection Methods Could Prevent Large Economic Losses in the Wine IndustryBibby Scientific has announced that it has launched a PCR-based method for reliable and highly specific detection of the yeast, Dekkera bruxellensis, which is a major cause of wine spoilage worldwide, causing large economic losses within the global wine industry.Flavour-spoiling phenolic compounds released from this yeast lead to undesirable aromas, known as ' Brett' taints, that are normally associated with aromas of barnyard, burnt plastic, wet animal and horse-sweat. Detection of the yeast through traditional microbiological techniques can be time-consuming, costly and unreliable. In contrast, real-time or quantitative PCR-based detection methods allow for exceptionally rapid and highly specific identification of the yeast. Testing for the presence of D. bruxellensis can be determined using the Techne Prime Pro 48 qPCR system in conjunction with the Techne qPCR test ' Dekkera bruxellensis 26S ribosomal RNA' . The Techne qPCR Kit for D. bruxellensis is designed for the in vitro quantification of D. bruxellensis genomes. The kit is designed to enable the broadest detection possible whilst remaining specific to the D. bruxellensis genome. The kit is comprised of primers and probe sequences that have 100% homology with a wide range of D. bruxellensis sequences based on comprehensive bioinformatics analyses关于语特 和 英国Bibby / 德国ART / 德国CAT / 瑞士Gerber Instruments 广州语特仪器科技有限公司专注于搅拌器/分散乳化机等实验室样品制备等通用仪器, 熔点仪/光度计/冰点仪等分析仪器,以及PCR等生命科学仪器。 作为英国比比(Bibby )在中国南方的首代,广东,广西,四川,重庆,云南,海南,贵州和西藏是我司的服务范围。语特公司也是德国ART, 德国CAT,瑞士Gerber Instruments 在中国的首代。 * 英国BIBBY 成立于上个世纪50年代,作为英国最大的实验室科学仪器生产商, 旗下有4个子品牌:Stuart,Techne,Jenway,Electrothermal. 专注于样品前处理等通用实验室仪器(如:熔点仪, 搅拌器, 混匀器,摇床, 培养箱,干浴器/氮吹仪,水浴,菌落计数器, 纯水蒸馏器),分子生物学研究设备(基因扩增仪PCR,荧光定量,杂交箱);分光光度计/超微量紫外等分析仪器,及平行反应工作站相关产品。 * 德国ART 成立于上个世纪,是德国乃至全球最专业的分散乳化专家。顶级分散乳化产品从实验室仪器,中试产品到工业设备, 分散头种类组合高达上百种;应用领域覆盖了化工,化妆品,制药,食品,环保等各大领域。 * 德国CAT 成立于上个世纪50年代,是德国样品制备仪器方面的专家之一, 以”品质稳定”而闻名。其顶置式搅拌器种类多样,从手持式,教学用,到科研通用型,高粘度型,是CAT的代表产品线。 * 瑞士Gerber Instruments 有超过120的历史,是专注于乳食品行业的典型代表。其产品冰点仪, 乳脂离心机, 食品专用PH计, 流出式粘度计等, 风靡欧洲及其它大陆国家。
  • 安捷伦科技公司授予哈姆纳-UNC 药物安全科学研究院 Paul Watkins 博士“安捷伦思想领袖奖”
    安捷伦科技公司授予哈姆纳-UNC 药物安全科学研究院 Paul Watkins 博士“安捷伦思想领袖奖” 2014 年 1 月 21 日,北京 — 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布授予 Paul B. Watkins 博士“安捷伦思想领袖奖”,以表彰其为预测药源性肝脏损伤 (DILI) 开发综合方法所做的贡献。Paul B. Watkins 博士现为国际药物安全专家兼哈姆纳-UNC 药物安全科学研究所主任。 该奖项表明安捷伦将继续支持哈姆纳科学家对药源性肝脏损伤的研究 (Hamner, 2011)。Watkins 博士的研究涉及老鼠基因模型、遭受过或正遭受药源性肝脏损伤 (DILI) 的患者,以及来源于干细胞的患者特异性肝脏培养模型。 Watkins 博士还主持由美国国家卫生研究院资助的美国药源性肝脏损伤互助网,他说:“整个行业都需要新的预测工具,以便在药物开发过程中更轻松地评估药物化合物的安全性,通过利用基因和基因组学数据把各种临床生物学研究应用集成起来,我们希望能更好地推测并防止患者对生物制药治疗可能产生的副反应。” 通过安捷伦的核磁共振技术、SurePrint G3 微阵列平台和其他整合性生物技术,Watkins 及其团队期望进一步揭示药源性肝脏损伤的成因。 Watkins 博士说:“患者对副反应的易感染性似乎与基因组成有关,但也与非基因因素(例如年龄、营养状况和药物的相互作用)相关。我们很高兴对这个问题有了更深的理解,我也很荣幸能够获得安捷伦思想领袖奖,它对我们的工作给予了有力的支持。” 该奖项的执行发起人,安捷伦 LC/MS 研究与开发部门高级总监 John Fjeldsted 博士说:“药源性肝脏损伤是一些有前景的新型候选药物在临床开发过程中失效以及其他药物被清理出市场的主要原因。” “我们十分高兴哈姆纳科学家取得了卓越的研究结果,也非常高兴现在授予 Watkins 博士安捷伦思想领袖称号。”他补充道。我们相信药源性肝脏损伤的多组学研究结果将会显著影响代谢组学、蛋白质组学和基因相关的研究,并为多种市场带来更多的确定性毒性测试。” 关于安捷伦思想领袖奖 安捷伦思想领袖奖支持生命科学和化学分析领域的权威思想领袖,推动了基础科学的长足进步。如需了解有关此前获奖者的信息,请访问 安捷伦思想领袖计划 网站。 关于哈姆纳健康科学研究院 哈姆纳健康科学研究院是一家非赢利性转化生物医学研究所,坐落于北卡罗来纳州研究三角园区的开放型多学科大学内。自创立起 35 年来,该研究院在毒理学研究方面取得了杰出的研究成果,哈姆纳科学家和医学专家专注于与学术、产业和政府各界积极合作研究药物与化学安全。哈姆纳使用的新技术,包括用于改善毒性测试的基因组学和生物信息学方法,用于预测毒理学的计算机模型,利用人体细胞或细胞系来评估细胞反应扰动的体外模型和体内模型,以揭示在易感染药源性毒性中发挥作用的基因。要了解更多信息,请访问:www.thehamner.org。 关于安捷伦科技公司 安捷伦科技公司(纽约证交所:A) 是全球领先的测试测量公司,同时也是化学分析、生命科学、诊断、电子和通信领域的技术领导者。公司拥有 20600 名员工,遍及全球 100 多个国家,为客户提供卓越服务。在 2013 财年,安捷伦的净收入达到 68 亿美元。如欲了解关于安捷伦的详细信息,请访问:www.agilent.com 。 2013 年 9 月 19 日,安捷伦宣布将通过对旗下电子测量公司进行免税剥离,分拆为两家上市公司的计划。分拆后电子测量公司名字为是德科技 (Keysight Technologies, Inc.),此次分拆预计将于 2014 年 11 月初完成。 编者注:更多有关安捷伦科技公司的技术、企业社会责任和行政新闻,请访问安捷伦新闻网站:www.agilent.com.cn/go/news 。
  • 酵母粉、酵母提取物、酵母浸粉和酵母浸膏的区别您知道吗?
    在给许多客户介绍酵母浸粉时,很多人都会将其与酵母粉混为一谈,经常会问:“酵母浸粉不就是酵母粉吗?”“酵母浸膏和酵母浸粉哪个好呢?” 首先我们了解一下什么是酵母粉、酵母浸粉和酵母浸膏吧! 酵母粉含义:一般是指灭活的酵母,产品成分主要是失去活性的酵母菌体,营养成分包括仍然包裹在菌体内部的粗蛋白、胞壁多糖以及丰富的维生素、生长素、微量元素等。 酵母粉分类:分糖蜜酵母粉与啤酒渣酵母粉两大类,前者专门发酵生产并干燥制成,以糖蜜为主要原料,品质好且质量稳定;后者采用啤酒生产的废料-废啤酒酵母泥为原料,一般采取滚筒干燥制成,成本较低,但杂质较多,酵母细胞较老化,微生物不易吸收利用,品质不稳定。酵母粉主要在传统的抗生素等发酵行业应用较广泛。 酵母粉特点:微生物对酵母粉的营养物质利用率与利用速率较低,发酵完毕后不能利用的残留物(粗蛋白与菌体细胞壁)较多,难以处理。 酵母浸粉含义:又称酵母提取物,是采用新鲜酵母经酵母自溶、过滤、 浓缩、喷雾干燥而得到的一种浅黄色至类白色 干燥粉末。有酵母自然 香味,易溶于水,水溶 液呈淡黄色。酵母浸粉吸湿性,请放阴凉干燥处保存。酵母浸粉当中含有氨基酸类、肽类、水溶性维生素、及酵母多糖、酵母核酸组成的一种混合物,酵母浸粉当中含有丰富的B族维生素和各种氨基酸。核苷酸类、有机酸类、矿物质类及维生素类的水溶性物质。在当中它起的主要作用是补充氮源和提供细菌生长的各种维生素及氨基酸。 酵母浸粉分类:同样可以采取糖蜜发酵的糖蜜酵母和啤酒生产的废啤酒酵母泥为原料生产。 糖蜜酵母生产的酵母浸粉一般品质较高,这一方面是糖蜜酵母发酵经过专业的生产控制,原料品质就比较高,另外啤酒酵母粉为原料也有利于酵母积累更丰富的天然营养成分。另外一方面是以糖蜜酵母为原料的酵母浸粉生产规模可以做的很大,生产厂家可以充分采用先进的生产工艺设备与技术,从生产技术的角度保证酵母浸粉产品的高品质。 酵母浸粉特点:酵母浸粉的生物利用度高,微生物的利用速率快,特别有利于对发酵培养基比较挑剔的营养缺陷型、基因重组工程菌的吸收利用,有助于缩短发酵周期,提高微生物发酵效价;同时发酵残留非常少,有利于发酵废液的环保处理。 酵母浸粉主要用于微生物培养基制备的基础原材料以及生物制药发酵。 酵母浸膏以酵母为原料,采用自溶法或加酶水解法工艺,经分离、脱色精制浓缩而成的,含氨基酸、肽、多肽及酵母细胞水溶性成分的膏状产品。 废啤酒酵母泥生产的酵母浸粉品质一般要大大差于糖蜜酵母浸粉,这主要是因为废啤酒酵母泥本身是啤酒生产的副产物,不存在什么质量控制;另外一方面是废啤酒酵母泥不能长途运输,生产厂家一般只能依赖周边啤酒厂的有限供应,生产规模难以扩大,因此限制了厂家的投资规模,一般只能土法上马,难以把生产技术装备以及所能采取的技术手段提升到理想的状态,导致产品色泽较深、不溶性杂质较多,维生素、生长素等微量营养物质的含量也比较欠缺。 酵母粉和酵母浸粉是完全不一样的产品,更不能混为一谈。 酵母浸粉和酵母浸膏的区别在于酵母浸粉经过高温瞬时干燥所损失的营养成分比酵母浸膏长时间浓缩所损失的营养要少得多,所以酵母浸粉在实际使用中用量更经济,且使用方便,也更易于运输和保存。 酵母浸粉和酵母浸膏应用领域食:品饲料领域、动物营养领域、生物发酵领域、营养保健领域、发酵工业领域:可用于抗生素新药、多肽、核苷酸、B族维生素、生长因子、氨基酸、有机酸、酶制剂、生物防腐剂、原料药、VC及肌苷、生物材料、维生素、微量元素、基因工程等生物工程产业。为微生物发酵培养提供全面均衡的营养 、微生物培养基:假单胞杆菌、醋酸杆菌、葡萄糖酸杆菌、大肠杆菌、枯草杆菌、乳酸链球菌、葡萄球菌、酵母及支原体。
  • 安捷伦科技公司将“思想领袖奖”授予 Ram Sasisekharan 博士
    p style="text-align: center "strong因推进用于生物药物表征的分析技术和多层分析运用而闻名的权威 MIT 研究人员/strong/pp  2017年7月27日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所: A)今日宣布授予 Ram Sasisekharan 博士“安捷伦思想领袖奖”,表彰其在生物制剂表征领域做出的杰出贡献。/pp  生物药物的开发时间线从研发到人体临床试验通常可能长达数年,因此,更高效地开发出针对新型癌症靶点和新兴病原体(如大流行性流感、埃博拉病毒、寨卡病毒和多重耐药性细菌)的单克隆抗体 (mAb) 显得至关重要。/pp  安捷伦思想领袖奖将会帮助 Sasisekharan 博士和他在波士顿麻省理工学院 (MIT) 的实验室继续开发不同的方法,致力于缩短从产品设计到临床应用之间的时间。 他们提出的方法代表了一种新的模式,以高度丰富、平行和多层次的方式对产品和工艺进行表征和优化。/pp  安捷伦的 6545XT AdvanceBio LC/Q-TOF 系统、AssayMAP Bravo 平台(样品前处理解决方案)、1260 Infinity II 生物惰性液相色谱技术结合1290 Infinity II 超高效液相色谱系统、以及 MassHunter 软件均可用于实现这一新的模式。 Sasisekharan 的团队将通过重点关注 mAb 表征分析技术的进展探索关键质量属性测量方法在克隆选择和药物开发过程早期的利用,以此作为加快生物制剂市场投放速度的策略。/pp  Sasisekharan 博士说道:“我很荣幸能够获此殊荣,另外安捷伦能够对我们在生物制药表征和开发领域开展的工作提供支持,我感到十分高兴。”Sasisekharan 博士是 MIT 科赫癌症研究所生物工程系生物工程与健康科学技术的一名 Alfred H. Caspary 教授。/pp  “我们很高兴能与 Sasisekharan 博士和他在 MIT 的整个团队针对这些创新方法和方案开展合作。 只有从根本上改善生物药物开发过程和时间进度,才有利于早日获得更有效的治疗方法。”安捷伦细胞分析事业部部总经理兼这一奖项的执行发起人 Todd Christian 谈道。/pp  “安捷伦思想领袖奖”为生命科学、诊断学和应用化学领域的权威思想领袖的研究提供科研经费、产品和专业技术方面的支持,无疑将推动基础科学的长足进步。/pp  strong关于安捷伦科技公司/strong/pp  安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是分析实验室技术领域的全球领导者,拥有 50 多年的敏锐洞察与创新,我们的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。在 2016 财年,安捷伦的净收入为 42 亿美元,全球员工数约为 13000 人。/p
  • 上新 | IKA 正式发布HABITAT 生物反应器
    /// HABITAT 生物反应器能对多种细胞进行重复性和标准化培养。它集生物反应器、光生物反应器和发酵罐于一体,符合人体工程学设计并可高效运行。IKA 推出一款新的生物反应器。HABITAT 生物反应器能对多种细胞进行重复性和标准化培养。它集生物反应器、光生物反应器和发酵罐于一体,符合人体工程学设计并可高效运行。HABITAT 生物反应器整合了 IKA 核心产品研发能力,在混合、温控、自动化、安全和设计上都实现了创新。HABITAT 作为 IKA 第一款自主研发的生物反应器,该机器在设计和操作上都有显著改善。提供罐盖支架的生物反应器HABITAT 是一款提供支架的实验室生物反应器。支架可让罐盖永远不用放下。马达可挂在支架的侧面,传感器亦可安全存放于支架上。所有这些都确保了符合人体工程学的工作、整洁的实验室台面和更快的组装操作。创新混合模式IKA 工程师开发了一种新的混合模式,专门用于 HABITAT 生物反应器。在Chaotic Mode(混沌模式)下,反应器内容物的混合遵循混沌动力学系统的数学原理。这确保了更快、更有效的混合。单独的 PID 处理器单独的 PID 处理器为实验室反应过程提供控制选项。管理员也不必是有经验的专家。如果温度值被改变,软件就会检查这种改变对过程的影响并进行调控。广泛的应用根据培养细胞的类型,实验室可将 HABITAT 用作生物反应器,或与 IKA 恒温器结合用作发酵罐。通过连接 LED 灯板,HABITAT 甚至变成了一个光生物反应器。在同类生物反应器中,HABITAT 是一款马达尺寸与罐体体积匹配的生物反应器。操作简单易上手从第一次操作开始,可与主机分离的平板电脑和直观的操作软件都让工作变得更容易。HABITAT 的智能校准管理使温度、pH和DO传感器的校准变得简单。软件可存储所有测试条件(反应器尺寸、搅拌器等)和所有测量值。四个集成的蠕动泵有助于收获细胞。因此,整个操作都很简单,学习时间短。长时间的实验可在无人值守条件下安全运行。体验 HABITATHABITAT 现已上市。使用适当的设备也可通过VR虚拟实验室体验 HABITAT 的性能与构造。体验HABITAT,请与我们联系:info@ika.cn,了解更多产品信息。关于 IKA IKA 集团是实验室前处理、分析技术、 工业混合分散技术的市场领导者。电化学合成仪、磁力搅拌器、顶置式搅拌器、分散均质机、混匀器、恒温摇床、移液器、研磨机、旋转蒸发仪、加热板、恒温循环器、粘度计、量热仪、实验室反应釜等相关产品构成了IKA 实验室前处理与分析技术的产品线;而工业技术主要包括用于规模生产的混合设备、分散乳化设备、捏合设备、以及从中试到扩大生产的整套解决方案。IKA 还与全球知名大学和科学家进行着密切的合作, 支持其在科研道路上不断探索。我们致力于为客户提供更好的技术, 帮助客户获得成功。IKA 成立于1910年,集团总部位于德国南部的Staufen,在美国、中国、印度、马来西亚、日本、巴西、韩国、英国、波兰等国家都设有分公司。
  • ThawSTAR细胞复苏仪—无水自动化解冻细胞“黑科技”
    前言:深低温下细胞出于“休眠”状态得以长期保存,解冻后需要维持较好的活率才能达到应用效果 ,细胞解冻需要一个”舒适“的温度范围,如何实现过程控温?如何有效安全解冻细胞?如何维持工艺可重复?今天小编向各位介绍一款全系列产品,它就是美国百奥莱BioLife公司开发的ThawSTAR细胞程序复苏仪,一直被业内视为解锁细胞解冻工艺黑科技产品,ThawSTAR可以轻松实现细胞自动化解冻,标准工艺高度重复,解冻安全、操作方便、性能稳定!一、ThawSTARTM CFT系列细胞复苏仪(冻存管专用)2021年6月23日CFDA正式批准由复星凯特引进美国Kite的嵌合抗原受体CAR-T细胞治疗产品奕凯达(阿基仑赛注射液)上市,该药品为中国首个获批上市的细胞治疗产品,行业士气颇受鼓舞,9月3日,国内第 2 款CAR-T! 药明巨诺 “瑞基仑赛注射液”获批上市 。一时间,朋友圈瞬间被刷爆,翘首期盼,艰辛付出,终于硕果累累!近二十年,随着世界生物技术快速发展,国内生物制药行业生机盎然,新的制药工艺不断引进与改进,免疫细胞靶向治疗已然成为实体肿瘤、癌症等决定患者生与死的最后救命稻草。对于采用“活体”细胞静脉注射的方式备受关注!白血病女孩Emily通过CAR-T疗法实现痊愈的故事,让患者再次看到希望。实际上,细胞解冻复苏需要一个“舒适温度”范围才能维持较好的解冻后活率,美国百奥莱BioLife 公司自2015年推出首款ThawSTARTM CFT系列细胞程序复苏仪以来,一直被视为业内黑科技产品,在无水干式的条件下自动化轻松解冻冻存管内细胞,而且维持与水浴一致的解冻活率,该款仪器设计小巧,操作简单,通过STARTM低温传感技术监控细胞样本解冻过程温度变化,可以在BSC生物安全柜内洁净度较高的环境中直接使用,相比传统水浴操作,ThawSTAR 解冻更安全、更稳定、更方便!ThawSTARTM 操作简单,流程如下:1. 连接电源启动仪器,预热至起始温度2. 垂直插入冻存管3. 仪器自动启动解冻程序4. 程序达到解冻终点后,冻存管弹出5. 取出样本后,轻轻晃动,冰晶消失。ThawSTARTM CFT系列细胞复苏仪订购信息,如下:二、ThawSTARTM CB系列细胞复苏仪(冻存袋专用)当前,已上市的几款CAR-T细胞药主要采用冻存袋灌装解冻,复杂且昂贵的生产工艺决定了其在终端市场的售价,此前,复星凯特阿基仑赛注射液被流出的药品销售订单来看,国内首款CAR-T疗法阿基仑赛注射液零售价为120万元/袋(约68ml),复星凯特相关负责人回复记者称,“公司CAR-T细胞治疗产品定价将根据价值、疗效、成本等各项综合考量制定,目前定价方案尚未最终确定,正在进行多方沟通中,希望可以惠及风多中国患者。” 但毫无疑问的是CAR-T细胞疗法确实很贵!(来源:资料图)(来源:资料图)CAR-T细胞疗法的全称是嵌合抗原受体T细胞免疫疗法,其中CAR指的是嵌合抗原受体,它的原理在于先激活免疫细胞,然后再去杀死癌细胞,即利用T细胞来杀死癌细胞。针对冻存袋细胞给患者静脉注射前最关键的一步解冻复苏工艺,美国百奥莱公司开发了ThawSTARTM CB细胞程序复苏仪!为实现冻存袋细胞标准化解冻方式提供了新途径!ThawSTARTM CB细胞程序复苏仪是一款针对细胞冻存袋细胞标准程序解冻的复苏仪,针对25~1000mL 容量6个标准规格冻存袋,提供了12个标准的解冻程序,通过STARTM低温穿透传感技术,直接检测细胞样品温度,实时传感系统自动判断解冻结束终点,给细胞解冻时控温提供了有效途径,人性化的操作界面一目了然,密码登录,解冻过程温度数据记录,方便追溯。对于不同细胞剂量美国百奥莱厂家还可以提供订制化解冻程序服务,仪器整体设计结构紧凑,桌面型触摸屏操作,操作简单、安全、稳定。 同样,ThawSTARTM CB优化了操作设计,流程如下:ThawSTARTM CB细胞复苏仪,程序可选、操作简单、解冻安全!ThawSTARTM CB系列细胞复苏仪订购信息,如下:三、ThawSTARTM AT系列细胞程序复苏仪(冻存瓶专用)传统的细胞药主要采用冻存袋存储细胞并在临床上注射使用,但是,受冻存袋包材本身柔软等材料本身特性限制,无法自动化批量分装,液体残留偏高。最近十年,由比利时Aseptic Technologies公司研发生产的AT-Closed Vials可谓是火遍了全球生物技术靶向治疗行业,解决了小剂量分装,深低温冻存、同时也实现了自动化放大分装工艺。尤其干细胞用户群体普遍采用6mL的AT-Closed Vial,那么针对6mL规格的AT-Closed Vial 如何实现有效干式精准解冻呢?美国百奥莱公司早在2018年便开发了ThawSTAR AT6细胞程序复苏仪,并被国外多家知名免疫细胞公司所采用,通过订制化标定解冻过程温度执行程序,可实现自动且精准的判断解冻结束终点,操作简单,工艺高度重复,避免了人为主观判断解冻终点造成的细胞药“失效”!ThawSTAR AT6 细胞复苏仪对于不同剂量下,液氮与干冰冻存过的样本解冻时间表现对比,如下:ThawSTARTMAT系列细胞复苏仪有多款型号,订购信息如下:如果您需要申请Demo机试用,请抓紧联系我们吧!中国区授权总经销:上海朗喜工业科技有限公司
  • 伊利诺伊大学癌症中心生物工程科学家 Rohit Bhargava 荣获“安捷伦思想领袖奖”
    伊利诺伊大学癌症中心生物工程科学家 Rohit Bhargava 荣获“安捷伦思想领袖奖” 2016 年 12 月 12 日,北京 安捷伦科技公司(纽约证交所: A)今日宣布授予 Rohit Bhargava 博士“安捷伦思想领袖奖”,表彰他对红外光谱成像的发展及其在生命科学研究中的应用的开创性工作。 Bhargava 博士是伊利诺伊大学癌症中心的创办人兼教授,他还在贝克曼高等科技研究所拥有实验室。 他也是伊利诺伊州癌症社区项目的发起人和负责人,该项目将在 2017 年初正式更名为伊利诺伊州癌症中心。他在推进新型化学成像技术方面的工作包括开发红外光谱学模型并证明它们如何应用于癌症检测、诊断和预后。 “安捷伦思想领袖奖”包括安捷伦提供的资金支持和技术支持,有利于 Bhargava 博士开发新型应用和软件对组织学样本进行红外分析,尤其是针对癌症检测和诊断。 Bhargava 博士讲道:“我们很感谢安捷伦的支持。 这使得双方能够携手合作,将红外成像技术进一步推广到数字分子病理学领域。” 安捷伦光谱和真空解决方案部副总裁兼总经理 Philip Binns 谈道:“我们很高兴能够支持 Bhargava 博士将红外光谱成像从实验室扩展到临床研究。 要使用安捷伦近期推出的高速激光直接红外成像 (LDIR) 技术开发新的生物医学应用,Bhargava 博士绝对是不二人选。” “安捷伦思想领袖奖计划”为生命科学、诊断学和应用化学领域的权威思想领袖的研究提供科研经费、产品和专业技术方面的支持,无疑将推动基础科学的长足进步。 如需了解此前获奖者的信息,请访问安捷伦思想领袖计划。关于安捷伦科技公司 安捷伦科技公司(纽约证交所: A),是生命科学、诊断学和应用化学市场的全球领导者,是致力打造美好世界的顶级实验室合作伙伴。 安捷伦与全球 100 多个国家和地区的客户进行合作,提供仪器、软件、服务和消耗品,产品可覆盖到整个实验室工作流程。 在 2016 财年,安捷伦的净收入为 42 亿美元。全球员工数约为 12,500 人。 如需了解安捷伦公司的详细信息,请访问 www.agilent.com。
  • 哈佛华人团队结合冷冻电镜和AlphaFold揭示核孔复合体精细结构 有望成为结构生物学新规范
    “我们通过冷冻电镜技术拿到了核孔复合体高分辨率的密度图。然后借助于 AlphaFold 结构预测,搭建出核孔复合体胞质环的精细模型。通过原子模型,为解释细胞核的运输机制,理解细胞生命活动的基本过程提供了重要的结构基础,同时也能为非常多相关的疾病提供重要的线索。”美国国家科学院院士、哈佛大学医学院生物化学及分子药理学教授团队表示。6 月 10 日,该课题组在 Science 上发表题为《核孔复合体胞质环的结构》的论文 [1]。图 | 相关论文(来源:Science)董颖、皮雄、彼得罗丰塔纳(Pietro Fontana)担任共同第一作者,吴皓担任通讯作者。图|吴皓(来源:吴皓个人主页)利用单颗粒低温冷冻电子显微镜和 AlphaFold 预测,确定了来自非洲爪蟾卵母细胞中一个接近完整的结构对于在该研究中 AlphaFold 所起到的作用,董颖表示,此次解析的核孔复合体(NPC,nuclear pore complex)是真核生物中最大的膜蛋白复合物之一,它位于核膜上,介导核膜内外的物质转运。由于其分子量巨大,组成成分复杂,动态变化多样,这使得电镜解析图谱的分辨率很有限(6-7 埃),并且搭建分子模型困难重重。但是 AlphaFold 的出现很好地弥补或一定程度上解决了图谱分辨率不足的问题,它可以预测很多没有结构的蛋白亚基,从而补充解释蛋白复合物结构里缺失的结构单元的高分辨信息;还可以预测部分亚基相互作用界面,从而说明亚基作用的结构基础以及生物学意义。另一方面,AlphaFold 预测也并非万能,它给出了诸多的可能性之后,课题组也需要理性分析哪一种结果最为合理,最能解释得清楚相关生物学现象。论文共同作者皮雄表示:“AlphaFold 能够预测出相互作用的蛋白亚基,与我们通过冷冻电子显微学计算出来的比较相符,从而大大方便了我们确定相互作用的蛋白亚基,进而加速我们模型搭建的过程。”图 | 皮雄(来源:皮雄)据悉,核孔复合体是细胞质和细胞核之间双向物质运输的管道。该团队利用单颗粒低温冷冻电子显微镜和 AlphaFold 预测,确定了来自非洲爪蟾卵母细胞的核孔复合体胞质环的一个接近完整的结构。使用 AlphaFold 预测核孔蛋白的结构,并以突出的二级结构密度作为指导,将核孔蛋白的结构拟合到中等分辨率的图谱中。利用 AlphaFold 进行复杂的预测,还可以进一步建立或证实某些分子间的相互作用。课题组鉴定了 Nup358 的 5 个拷贝的结合模式,这是最大的核孔复合体亚基,具有 Phe-Gly 重复序列,并预测它包含一个线圈-线圈结构域,在一定条件下可能作为成核中心辅助核孔复合体形成。核孔复合物是真核细胞核膜中的分子管道,可以调节细胞核和胞质溶胶之间生物分子的进出口,脊椎动物核孔复合体的分子量约为 110 至 125 MDa,直径约为 120 nm。核孔复合体被分为四个主环:胞质侧的细胞质环(CR,cytoplasmic ring),核膜平面上的内环(Inner Ring, IR)和管腔环 (Luminal Ring, LR),以及面向细胞核的核环 (Nuclear Ring, NR)。每个环具有相似的八重对称,并由不同的核孔蛋白的多个副本组成。核孔复合体参与了许多生物过程,其功能障碍与越来越多的严重疾病有关。尽管在过去的 20 年里,许多团体进行了开创性的研究,但人们仍然缺乏对核孔复合体的组织、动态和复杂性的充分理解。图 | 董颖(来源:董颖)(来源:Science)预测核孔复合体中最大的蛋白 Nup358 具有 s-形球状结构域此次研究中,该团队使用非洲爪蟾卵母细胞,作为结构表征的模型系统,因为每个卵母细胞都有大量的NPC颗粒,因此这些颗粒可以在没有去垢剂提取的帮助下,在天然核膜上可视化。据悉,课题组使用单颗粒冷冻电子显微镜,来分析不同倾斜角度的数据并进行三维重建,之后用 AlphaFold 进行模型构建和结构预测,重建了 X.laevis NPC 的 6.9 和 6.7埃分辨率的全 CR 原聚体和一个核心区域,并使用 AlphaFold 预测了单个核孔蛋白的结构。对于任何模糊的亚基相互作用,该团队也预测了复杂的结构,这进一步指导了 CR 原聚物的模型拟合。他们将核孔蛋白或复杂结构置于 CR 密度中,以获得一个几乎完整的 CR 原子模型,由内部和外部 Y复合物、两个 Nup205 拷贝、两个 Nup214-Nup88-Nup62 复合物拷贝、一个 Nup155 和 5 个 Nup358 拷贝组成。值得注意的是,课题组预测了核孔复合体中最大的蛋白 Nup358 具有 s 形球状结构域,一个线圈结构域和一个含有苯丙氨酸-甘氨酸(FG)重复序列的 c 端区域,而先前显示形成的一个凝胶样的凝析相,可用于选择性物质通道。其中,四个 Nup358 拷贝夹在内部和外部 y 复合体周围以稳定 CR,第五个 Nup358 位于夹子簇的中心。另据悉,AlphaFold 还预测了一个同源低聚物,可能是 Nup358 的五聚体、卷曲螺旋结构,这可能为 Nup358 募集到核孔复合体提供亲合力,并降低 Nup358 在核孔复合体生物发生中凝聚的阈值。可以说,此次研究提供了一个整合的低温冷冻电子显微镜和结构预测的例子,可作为从中等分辨率密度图中、获得更精确的兆道尔顿蛋白复合物模型的新方法。该论文提出的更准确、以及几乎完整的 CR 模型,扩展了他们对NPC分子相互作用的理解,代表了向完整的NPC分子结构迈出的实质性一步,对NPC的功能、生物发生和调控具有影响。(来源:Science)有望成为结构生物学的规范该团队在论文中表示,几乎完整的 NPC CR 模型揭示了其内部的分子相互作用及其生物学意义。CR 组装的一个意想不到的方面是,他们观察到了 Nups 之间的组成和绑定模式的不对称性:其一,两个 Y 配合物之间的构象差异;其二,两个 Nup205 分子与 Y 配合物的结合模式不同;其三,两个 Nup214-Nup88-Nup62 配合物并排放置;其四,5 个 Nup358 配合物具有不同的结合模式。因此,这种不对称性是代表 CR 的基础状态、还是由放线菌素 D(Actinomycin D,ActD) 的结合引起的,以及它是否会是 NR、IR 或 LR 结构中的共同特征?这将是一个很有趣的问题。而研究人员的 X.laevis NPC 样本来自单倍体卵母细胞,这可能与体细胞中的核孔复合体有更大的不同。该团队认为,Nup358 的多个拷贝、及其低聚卷曲螺旋关联,解释了其在细胞质中卵发生过程中,作为NPC组装的关键驱动因素的作用,这不同于有丝分裂后和较慢的间期NPC组装。这一过程发生在内质网(ER,endoplasmic reticulum)的堆叠膜片上,称为环状膜层(AL,annulate lamellae),其苯丙氨酸-甘氨酸(FG,Phenylalanine-glycine)重复序列中的 Nup358复合物作为紧固件,从开始空间就可指导核孔复合体生物发生。这说明,Nup358 的低聚结构可能会降低 Nup358 复合体形成的阈值,从而有助于解释其在不同 Nups 中的成核作用。此外,课题组还提出了一种综合的方法,利用冷冻电子显微镜和 AlphaFold 结构预测的最新发展,从而带来了更精确的核孔复合体建模。在学界最近发表的论文或预印本论文中,也使用了类似的方法来确定核孔复合体的结构。AlphaFold 预测与传统结构建模不同,这是基于人工智能的建模方式。实现高分辨率的目标,是获得尽可能好的最佳模型。而在建模过程中,包含来自 AlphaFold 的信息,可能类似于该领域之前对立体化学约束所做的事情。随着复杂预测的能力更加普遍,该团队预计这种方法不仅有助于新结构的建模,而且有助于重新绘制以前的中分辨率低温电子显微镜图,成为结构生物学的规范。(来源:Science)董颖表示:“很多时候,我们采取科学的验证方式——用一系列生化实验对 AlphaFold 预测结果进行反向验证。我们利用人工智能,冷冻电镜与传统生物化学综合研究方式,推动了我们对复杂、动态的生物大分子的结构和功能的进一步理解。由此可见,AlphaFold 的出现给我们研究科学问题的方式也带来了革命性影响。我们在未来的科学研究中,只要大胆尝试,多方位思考,总能碰撞出美妙的火花!”担任论文共同作者的傅天民,目前在俄亥俄州立大学药学院,担任生物化学与药理学助理教授。其表示,该课题由他之前在吴皓教授实验室发起。他介绍了该研究的背后故事:2019 年初,吴皓教授与实验室的学生们,在佛罗里达参加美国生物化学与分子生物学年会。会后,吴老师带着学生们去吃火锅,饭桌上大家聊起结构生物学最重大的问题还有哪些,傅天民提出核孔复合物的结构是一个重要且没完全解决的问题,这个提议得到了吴皓教授的支持。回到波士顿后,王隆飞打算用酵母细胞来研究核孔复合物,傅天民则着手用非洲爪蟾的卵母细胞来研究。之所以选定爪蟾卵母细胞主要因为这类细胞易于获取,而且细胞核上有丰富的核孔复合物。后来,傅天民要去俄亥俄州立大学建立自已的实验室,课题转交给两个新来的博后董颖和 Pietro,他们两个紧密合作,克服了一系列技术难题,初步拿到了一些高质量的样品,收集了一些数据。随后,皮雄博士加入课题。皮雄博士和董颖博士通过大量的数据处理,为冷冻样品优化提供了正确的方向。最后通过大家几个月不懈的努力,利用进一步优化的高质量样品,收集了几万张冷冻电镜照片。最终皮雄博士通过冷冻电镜三维重构技术得到了高分辨率的密度图。Alex 利用 AI 结构预测对结构模型搭建起了重要作用。吴皓教授整个过程的支持、指导是课题得以成功的决定力量。董颖表示:“NPC是我进入吴老师实验室的第一个课题。现在回想起来整个研究经历都有些百感交集。当时我们‘白手起家,从零开始’。我从未接触过动物实验,我只能查找文献,自己摸索一切实验流程。中途可谓困难重重,我时常在解剖镜前解剖蛙卵,铺膜制样,一坐就是一整天。制样优化样品周期很长,我们寻找了各式各样的载网(因为不是所有载网在高角度拍摄的条件下都稳定),我做了很多载网稳定性的分析,光是优化样品就花了半年多。优化中途,陆续已有相关研究报道出现,当时我们整个团队几乎都要放弃。就在这时,皮雄博士通过大量的计算,得到了七埃左右分辨率的密度图。同时吴老师提议我们为模型搭建寻找新的切入点——恰逢AlphaFold横空出世,我们一不做二不休,立刻开启寻找冷冻电镜与AlphaFold对接的可能。”经过几个月没日没夜的计算、预测、模型搭建,课题组惊奇地发现新的研究方式带来了意想不到的研究结果。功夫不负有心人,最终他们非常有幸地与来自不同研究组的科学家们同台展示了研究结果。皮雄表示:“核孔复合体作为细胞生命活动的‘南天门’,严密调控着细胞的生命活动。作为一个功能如此复杂,形态巨大的复合体,它的精细结构是如此的严密和复杂。拿到它的精细结构也是非常困难。作为一个如此困难的课题,需要团队每个成员紧密合作,协同前进。每一部分工作都包含了团队每个成员的巨大努力。研究中,我主要负责冷冻电镜的数据处理,拿到高分辨率的核孔复合体的密度图,同时也参与了冷冻样品的优化。”(来源:Science)对于该成果的应用,董颖表示:“已经有相关研究报道说明NPC结构和功能的异常和许多疾病相关,例如神经退行性疾病阿尔兹海默症,介导了一些病毒如HIV的入侵,甚至会诱导一些癌症的发生。由于核孔复合体介导了很多重要物质的转运,其研究一直是近几年来科学界研究的一大热点。目前针对它的研究还处于相对基础的阶段,这主要受到它的复杂性,和动态性的局限。但就它推广到应用的可能性来讲,我认为只要我们能够把它‘看’得足够清楚,运动的原理理解的足够清楚,我们就有可能对它进行靶向药物设计,调节它的底物转运。给治疗人类疾病提供更多可能。最近几年来随着冷冻电镜技术和人工智能的进步,相信二者能共同推动其成为新兴药物靶点,逐步应用到疾病治疗。”对于后续计划,董颖表示:“我们队 NPC 的研究还只是冰山一角,后续有很多有趣的研究方向——现举几个例子:(1)由于核孔复合体底物众多,但出核和入核的底物的识别和转运机制如何?NPC 转运物质的孔道呈现有趣的胶状结构,这一结构高度动态,很可能在底物转运过程中发生相分离,我们可以借助单分子荧光标记来细化这些转录途径。(2)研究 NPC 的某些特定的活动状态,已经有研究报道酵母中可能存在多种 NPC 的状态和组装形式,这些结构组成具体参与了怎样的生物学功能还不清楚。(3)NPC 组装和解聚如何发生,特定组装状态下有哪些多辅助分子参与稳定其状态,这些我们可以联合质谱技术来鉴定新的作用亚基。”澳大利亚莫纳什大学药物科学研究所曹剑骏评价称,在本文中,该团队首先利用核孔复合体在非洲角蟾卵母的极高丰度这一特质,对天然膜环境中地核孔复合体进行直接观察,避免了可能存在人为纯化干扰。同时,课题组使用倾斜样品的方式,解决了膜蛋白样品在膜中的受限的角度分布,从而实现蛋白结构的三维重建。此过程中,该团队以令人敬佩的毅力手工选取了 20 万单颗粒样品,以实现整个核孔复合体的低分辨率(19 埃)结构,并集中于胞质环的局部结构解析得到中等分辨率(~7 埃)的电子云密度图。但这一分辨率依旧只能辨别大致的二级结构特征,而存在建模困难。因此,该团队尝试借助最新的 AlphaFold 基于序列的结构预测功能,由单个亚基、多亚基局部预测出发,实现整个胞质环的结构解析。该团队同时将基于 AlphaFold 的结果与传统的同源结构预测相对比,为蛋白结构工作者提供了一个优秀范例,展示了如何借助 AlphaFold 这一新工具解析未知蛋白结构。研究中,课题组同样也得到了核内环的信号,但是尚未得以解析,想来将来会由相应的工作面世,从而完备整个核孔复合物的结构信息。同时,该论文的蛋白结构分辨率受制于天然核孔结构的非均一性和单颗粒的人工手动筛选通量,而后者有希望得到 AI 辅助单颗粒筛选软件的帮助,从而解放研究人员双手实现以更多的单颗粒数据收集,最终有望解析出各类不同状态的核孔复合体结构,进一步阐述这一精妙的分子复合体的调节机制。-End-支持:Ren参考:1、Pietro Fontana et al., Structure of cytoplasmic ring of nuclear pore complex by integrative cryo-EM and AlphaFold. Science (2022) DOI: 10.1126/science.abm9326
  • FDA食品添加剂法规允许直接添加维生素D2酵母
    美国食品药物管理局(FDA)近日修订了美国食品添加剂法规,允许安全使用维生素D2面包酵母(vitamin D2 bakers yeast),并将其作为维生素D2的来源和膨松剂,但必须满足以下条件:(1)维生素D2面包酵母是由面包酵母(酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae)暴露于紫外线下产生的物质,是面包酵母中内源性麦角脂醇(ergosterol)经过光化学反应转化成维生素D2(也被称为麦角钙化甾醇(ergocalciferol)或(9,10-seco(5Z,7E,22E)-5,7,10(19),22-ergostatetraen-3-ol)) (2)维生素D2面包酵母可单独作为一种活性干酵母浓缩物,或与传统的面包酵母进行组合 (3)这种添加剂可用于酵母发酵的烘焙食品和烘焙混合以及酵母发酵的烘焙小吃食品,但在每100克成品食品中维生素D2的含量不得超过400国际单位(International Units) (4)为了确保添加剂的安全使用,除了《联邦食品药品和化妆品法规》所要求的其他信息外,食品添加剂容器标签必须要有适当的使用说明,以确保所生产的最终产品符合上述第(3)点描述的限制要求 (5)含有该添加剂的加工食品标签必须按照成品食品中含量递减的合适顺序,在成分声明中标注添加剂名称:“维生素D2面包酵母”。  为了合理确立在预期使用条件下某种食品添加剂的无危害性,FDA考虑了该添加剂的人类饮食预期的摄入量、添加剂的毒理学数据和其他提供给该局的相关信息。FDA还将个人来自所有食品源的添加剂的预计每日摄入量(estimated daily intake,EDI)与根据毒性数据建立的可接受摄入量水平进行了对比。EDI由基于拟议用于特定食品中的添加剂数量预测和来自所有食品源的添加剂数量决定。该机构通常将百分之九十消费者使用的食品添加剂的EDI来衡量高慢性饮食的摄入量。
  • 方案 | IKA HABITAT 生物反应器助理疫苗制备工艺
    /// 德国IKA HABITAT 细胞生物反应器,是新型流感疫苗制备工艺的好拍档。全球每年因季节性流感病毒感染,约造成300-500万例重症和29-65万例死亡,对人类社会造成的损失无疑是巨大的,破坏力也是灾难性的。一波接一波的甲流疫情不断考验着人类免疫系统对病毒的抵抗能力,甲流高效药磷酸奥司他韦可以帮助人们在流感病毒入侵期间进行治疗,而让人体尽早认识流感病毒才可达到预防传染的效果。流感疫苗是预防流感有效的方式。早期流感疫苗的制备路线病毒灭活疫苗是最为经典和传统的疫苗。20世纪40年代,科学家在鸡胚中研制出第一个全病毒灭活疫苗,并在20世纪50年代发展成至今仍在使用的鸡胚生产灭活流感疫苗的成熟工艺。全病毒灭活疫苗可激发个体产生良好的免疫反应,但全病毒疫苗会有热原性和不良副作用的问题。为克服这些问题,新型疫苗不断被推出,像亚单位流感疫苗的问世就进一步提高了疫苗的安全性,降低了疫苗的反应原性。流感疫苗的现代工艺方案鸡胚培养流感病毒的方法虽发展较早,但此类疫苗可能会引起接种者过敏反应,且连续的病毒传代有可能产生不可预期的抗原位点突变,进而导致抗原性改变,从而降低疫苗效力。20世纪50年代末,开发了基于细胞培养的疫苗生产技术。常用细胞包括鸡胚细胞,MDCK(犬肾细胞)、Vero细胞(绿猴肾细胞)等。流感疫苗的开发从传统鸡胚培养平台逐步转向细胞培养平台。IKA HABITAT 生物反应器疫苗制备的好拍档德国IKA HABITAT 细胞生物反应器,是新型流感疫苗制备工艺的好拍档。HABITAT 优势特点:HABITAT 生物反应器集成搅拌、温控、pH监测、DO监测、补料、取样、进气、尾气冷凝、液位监测、消泡监测等全部功能,并可对实验数据进行实时图谱展示,具备警报功能、pH/DO自动控制和内置电极校准程序,并可在断电后自动重启,实时保存数据和导出数据。罐体多规格可选,500ml-10L,有单壁和夹套罐体形式,满足不同应用需求罐体材质为高硼硅酸盐玻璃,接触样品的金属部件为316L不锈钢,全部经电抛光处理易清洁罐体及传感器(消泡电极除外)可置于高压灭菌器内进行灭菌,可重复使用可选配罐盖安装支架,用于2L以上罐盖配件的安装和拆卸控制塔前端有状态指示灯,可辅助监控搅拌、pH、DO、温度、消泡和液位等参数的变化情况,有异常会出现红色警示特别的新型chaotic mixing混沌混合方式,可加速底物的混合效率集成的4个Watson Marlow 泵,方向和速度可调,方便泵入和泵出不同的液体(如酸,碱,消泡剂,补料试剂)内置 4 个质量流量控制器用于供气控制:N2、O2、空气和 CO2 等10.4英寸大屏平板电脑,内置软件,操作友好,用户可将平板拿在手中对参数进行设置调整关于 IKAIKA 集团是实验室前处理、分析技术、 工业混合分散技术的市场先驱。电化学合成仪、磁力搅拌器、顶置式搅拌器、分散均质机、混匀器、恒温摇床、恒温混匀器、移液器、研磨机、旋转蒸发仪、恒温循环器/水浴/油浴、加热锅、加热板、粘度计、量热仪、生物反应器、发酵罐、化学合成釜、实验室反应釜等相关产品构成了IKA 实验室前处理与分析技术的产品线;而工业技术主要包括用于规模生产的混合设备、分散乳化设备、捏合设备、以及从中试到扩大生产的整套解决方案。IKA 还与世界著名大学和科学家进行着密切的合作, 支持其在科研道路上不断探索。我们致力于为客户提供更好的技术, 帮助客户获得成功。IKA 成立于1910年,集团总部位于德国南部的Staufen,在美国、中国、印度、马来西亚、日本、巴西、韩国、英国、波兰等国家都设有分公司。 艾卡(广州)仪器设备有限公司,是IKA 集团于2000年在广州设立的全资子公司,为中国区客户提供产品技术和服务支持。
  • 罗氏宣布基因中心总监退休 继任者原来是她
    p  罗氏(Roche)今日在巴塞尔宣布基因泰克研究与早期研发中心(Genentech Research and Early Development (gRED))总监Michael Varney 将于7月末退休,新的总监将由Aviv Regev于2020年8月1日出任。/pp  Aviv Regev(1971),博士,现任麻省理工学院(MIT)和哈佛大学(Harvard)布罗德研究所(Broad Institute of MIT)教授、核心研究所成员、执行领导团队成员,麻省理工学院生物学教授、霍华德· 休斯医学研究所(Howard Hughes Medical Institute)研究员。届时,她将加入罗氏执行委员会。/pp  对于此项任命,罗氏CEO Severin Schwan表示:“我非常高兴Aviv Regev加入我们团队,她宝贵的专业知识将帮助我们在基于数据的药物发现和开发中发掘出更多的可能性。”/pp  对于Michael的退休,Schwan表示:“我非常感谢迈克在过去15年里做出的巨大贡献,包括扩大我们的药物平台影响力,和对我们的渠道的积极影响。我祝愿他退休后继续幸福和健康。”/p
  • 安捷伦将“思想领袖奖”授予Brandon Ruotolo和Kristina Hakansson博士
    p style="text-align: center "span style="color: rgb(31, 73, 125) "strong密歇根大学的科学家凭借其对蛋白质和蛋白质复合物表征先进方法的研究获得认可/strong/span/pp  2018年5月7日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)日前宣布将“安捷伦思想领袖奖”授予来自密歇根大学的两位顶尖科学家 — Brandon Ruotolo和Kristina Hakansson,以支持他们借助质谱了解蛋白质和蛋白质复合物结构及功能的研究。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/135a1b0f-54fa-41a2-93bd-ddd0f7bbdc44.jpg" title="Ruotolo.jpg" width="160" height="200" border="0" hspace="0" vspace="0" style="width: 160px height: 200px "/img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/dce0ab76-7ea2-4a75-9793-5ffe6eded0b5.jpg" style="width: 160px height: 200px " title="Hakansson.jpg" width="160" height="200" border="0" hspace="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "strongBrandon Ruotolo和Kristina Hakansson/strong/pp style="text-align: left "  对开发基于蛋白质治疗药物所产生的日益浓厚的兴趣,促使需要更快速且信息更丰富的分析仪器、方法和信息学。br//pp  Ruotolo博士是分析化学和化学生物学教授,Hakansson博士是化学教授。两人都在密歇根大学的人文科学艺术学院从事研究。/pp  他们的工作主要集中于开发更快速、更具有特异性的完整蛋白质和蛋白质复合物表征技术,包括各种化学修饰方式、新的碎片方法和离子淌度质谱,这是一种可确定少量样品中蛋白质组装体的成分、大小和拓扑结构的技术。/pp  该奖项将提供三年的资金支持和安捷伦仪器支持,包括离子淌度质谱仪、高效液相色谱仪和样品前处理及进样仪器。此外还将提供安捷伦专家的持续协作和支持,以加快研究。/pp  安捷伦副总裁兼质谱事业部总经理Monty Benefiel表示:“与基于质谱的蛋白质表征领域的顶尖研究人员合作,将使安捷伦能更快地评估新的生物分析技术和解决方案并将其推向市场。我们将共同推进对该动态领域的认知、技术和解决方案的发展。”/pp  Ruotolo教授表示:“对安捷伦科技公司颁发的这一奖项我感到非常荣幸。此外,我也很高兴能够加强我们之间以及和Hakansson实验室之间的合作关系。我希望安捷伦的慷慨帮助能够使 UM 和安捷伦在化学测量科学领域建立长期的合作关系,使我们能共同推动并开发出代表这个领域的前沿新技术。”/pp  Hakansson对此表示赞同:“我很高兴能有机会在新仪器平台上进一步推动我们基于电子的结构表征方法,并将正式与Ruotolo实验室展开合作。我们和安捷伦在相关领域拥有互补的专业知识,并且我们的研究小组协作性强,这将继续引领我们沿这个方向发展,令人感到非常兴奋。”/pp  Ruotolo和Hakansson将与多家生物制药行业的科学家合作,帮助确保他们的研究针对当前非常重要的蛋白质表征挑战,并为评估和优化新方法创造机会。/pp  “安捷伦思想领袖奖”为生命科学、诊断学和化学分析领域的权威思想领袖的研究提供科研经费、产品和专业技术方面的支持,这无疑将推动基础科学的长足进步。/pp strong 关于安捷伦科技公司/strong/pp  安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者,拥有 50多年的敏锐洞察与创新,我们的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。在2017财年,安捷伦的营业收入为44.7亿美元,全球员工数为14200人。/p
  • 杜立林实验室在裂殖酵母中发现违反孟德尔定律的自私基因
    p  2017 年 6 月 20 日,北京生命科学研究所杜立林实验室在《eLife》发表题为“A large gene family in fission yeast encodes spore killers that subvert Mendel' s law”的研究论文。该论文通过研究裂殖酵母的种内生殖隔离现象,发现一个之前功能未知的基因家族的成员是违反孟德尔定律的自私基因。/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/0846f491-22f5-4c1a-93d8-ebacf97d9eb4.jpg" title="20170621185717311.png"//pp  孟德尔的分离定律指出二倍体中位于基因组同一位置的一对等位基因会以 1:1 的比例进入单倍体的配子中。有些自私基因违反这一定律,通过杀死不含该基因的配子来扭曲分离比例,从而在杂合二倍体形成的配子中以超过 50% 的频率出现。这样的自私基因被称为配子杀手(gamete killer)。真菌包括酵母的配子通常叫做孢子(spore),因而真菌中的配子杀手也叫做孢子杀手(spore killer)。目前已经发现的配子杀手数目有限,在分子水平上被鉴定的更寥寥无几。/pp  杜立林实验室的研究人员发现裂殖酵母天然菌株 CBS5557 和实验室菌株交配产生的孢子大多不能存活。类似的种内生殖隔离现象在其他不同来源的裂殖酵母菌株杂交时也经常发生。通过高通量测序辅助的分离子分组混合分析法(bulk segregant analysis),作者发现 CBS5557 和实验室菌株杂交时存活的后代中来源于实验室菌株基因组的两个区域的等位基因频率显着低于 50%,暗示在 CBS5557 基因组的这些区域存在孢子杀手。通过进一步的基因组学和遗传学分析,作者证明分别位于这两个区域的属于 wtf 基因家族的 cw9 和 cw27 基因是孢子杀手。实验还发现这两个孢子杀手可以在不同的菌株背景下和不同的基因组位置上起作用,它们之间会发生互相杀伤。通过人为突变可以得到会杀伤自己的突变体和不能杀伤但可以保护自己的突变体,提示一个孢子杀手具备可以拆分的杀伤活力和保护活力。通过第三代测序技术对 CBS5557 基因组进行分析,发现该基因组中存在 32 个 wtf 基因家族的成员,且与实验室菌株基因组中的 wtf 基因数目和序列都有显着的差异,说明这个孢子杀手基因家族的快速变异可能是这个物种的种内生殖隔离现象背后的主要原因。这一工作为理解基因组进化和物种形成提供了新认识。/pp  杜立林实验室博士后胡雯为论文的第一作者。论文的其他作者还包括杜立林实验室的生物信息分析员索芳和研究生郑金鑫,以及何万中实验室的姜招弟博士和何万中博士。杜立林博士为本文的通讯作者。此项研究由科技部和北京市政府资助,在北京生命科学研究所完成。  /p
  • 天木生物ARTP成功助力耐受高浓度甘蔗糖蜜酿酒酵母的选育
    本期为您推荐广西科技大学生物与化学工程学院牛福星副教授课题组发表在Microbial Cell Factories上面的文章:Key role of K+ and Ca2+ in high-yield ethanol production by S. Cerevisiae from concentrated sugarcane molasses。本研究利用常压室温等离子体进行诱变,筛选出对不同胁迫因素(高渗透压、高醇、高温、高盐离子以及高浓度甘蔗糖蜜)分别具有鲁棒性能的酿酒酵母菌株。其中由此所选育的对高浓度甘蔗糖蜜具有鲁棒性能的酿酒酵母乙醇合成产量达到目前物理诱变高水平(111.65 g/L,糖醇转化率达到95.53%)。最后结合酵母的细胞形态、发酵产能以及组学分析,揭示了限制酿酒酵母无法实现高浓度甘蔗糖蜜高浓度乙醇发酵的主要限制性因素是K+和Ca2+同时存在的影响。 生物基乙醇的合成原料有很多,从环保、经济、富民的角度研发是重点。我国是人口大国,每年由于食品添加、工业应用等所消耗的糖量位居世界前列。甘蔗是糖分提炼的主要原材料之一,在提料糖分的同时会产生糖蜜,而且早期研究数据表明产3吨糖的同时可产约1吨糖蜜。糖蜜是一种混合物,成分复杂,直接排放或者用于田间施肥是为浪费且会造成环境污染,而且是为资源利用的不充分。但是利用糖蜜(非粮食)生物资源进行酿酒酵母的乙醇合成,却可以在不断满足人们对乙醇用量需求的同时,助推国家绿色低碳能源发展。酿酒酵母利用糖蜜进行乙醇发酵的工艺已经比较成熟,但是在利用高浓度的糖蜜来生产高浓度的乙醇效率方面却是一个挑战,究其原因便是各种胁迫性因素的影响。但是从科学研究的角度确切的阐述哪种才是限制性的关键影响因素早期还未有研究报道。 研究人员借助ARTP(室温等离子体)诱变、适应性进化以及高通量的基于三苯基-2H-四唑氯化铵(TTC)及前体物丙酮酸(或丙酮酸自由基离子)与Fe3+发生络合反应呈现黄色的双重高通量筛选方法(Py-Fe3+)获取了分别对高浓度甘蔗糖蜜(总糖浓度达到300 g/L)以及蔗糖添加模型下的高温(37℃)、高醇(10%)、高渗透压(400 g/L可发酵总糖)以及高浓度K+(15 g/L)、Ca2+(8 g/L)、K+&Ca2+(15 g/L &8 g/L)发酵环境下的七株鲁棒型酿酒酵母菌株(图1、表1)。通过各自鲁棒型菌株在高浓度甘蔗糖蜜环境下细胞形态比较(图2),乙醇合成的产率以及细胞数量(图3、图4)、鲁棒型菌株比较基因组学、比较转录组学GO、KEGG分析研究,得出K+、Ca2+同时存在才是限制酿酒酵母高浓度甘蔗糖蜜乙醇发酵的主要因素。图1 实验流程 表1 在相同发酵条件下与野生型J108相比产量差距图2 在250 g/L糖蜜发酵不同菌株的细胞形态A:NGCa2+-F1 B:NGK+-F1 C:NGK+&Ca2+-F1 D:NGTM-F1图3 不同菌株的乙醇合成率及细胞数图4.在5L发酵罐体系中利用250 g/L甘蔗糖蜜发酵, 菌株NGTM-F1的乙醇产量达到111.65 g/L 总结:甘蔗糖蜜对细胞的影响不仅仅局限于高浓度发酵,在低浓度情况下同样会对细胞的生长造成一定影响。该项目的研究是为初次从科学研究的角度准确阐述了限制酿酒酵母无法实现高浓度甘蔗糖蜜高浓度乙醇发酵的主要限制因素,其结果对于以甘蔗糖蜜作为底物的生物合成具有重要指导作用。文章链接:https://doi.org/10.1186/s12934-024-02401-5
  • 施一公团队Science再发文 报道酵母剪接体三维结构
    p  2016年12月16日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公教授研究组于《科学》(Science)杂志就剪接体的结构与机理研究再发长文(Research Article),题为《酵母剪接体处于第二步催化激活状态下的结构》(Structure of a Yeast Step II Catalytically Activated Spliceosome),报道了酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)剪接体在即将开始第二步剪接反应前的工作状态下的三维结构,阐明了剪接体在第一步剪接反应完成后通过构象变化起始第二步反应的激活机制,从而进一步揭示了前体信使RNA剪接反应(pre-mRNA splicing,以下简称RNA剪接)的分子机理。/pp  由于真核生物中的基因编码区中存在不翻译成蛋白质的序列(称为内含子),染色体DNA转录出来的前体mRNA(pre-mRNA)并不直接参与蛋白质翻译,而是需要先将其中的内含子片段去除,才能进入核糖体进行蛋白质合成。内含子的去除需要通过两步转酯反应来实现:首先,位于内含子序列中下游被称为分支点(branch point sequence)的序列中有一个高度保守的腺嘌呤核苷酸(A),其2’羟基亲核攻击内含子5’末端的鸟嘌呤(G),于是第一步反应发生,形成套索结构 然后,5’外显子末端暴露出的3’-OH向内含子3’末端的鸟嘌呤发起攻击,第二步反应发生,两个外显子连在一起。通过这两步反应,前体信使RNA中数量、长度不等的内含子被剔除,剩下的外显子按照特异顺序连接起来从而形成成熟的信使RNA(mRNA)(图1)。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/0e590db1-7664-40b3-9508-9269cc1b944d.jpg" title="201612161410211731.jpg"//pp style="text-align: center "图1 基因剪接反应示意图(图片来源:《Cell》)/pp  这两步化学反应在细胞内是由一个庞大、复杂而动态的分子机器——剪接体催化完成的。对于每一个内含子来说,为了调控反应的各个基团在适当时机呈现合适的构象从而发挥其活性,剪接体各组分按照高度精确的顺序结合和解离,组装成一系列具有不同构象的分子机器,统称为剪接体。根据它们在RNA剪接过程中的生化性质,这些剪接体又被区分为B、Bact、B*、C、P、ILS等若干状态。获取剪接体在组装、激活、催化反应过程中各个状态的结构是最基础也是最富挑战性的结构生物学难题之一。/pp  2015年8月,施一公研究组率先突破,在世界上首次报道了裂殖酵母剪接体处于ILS状态的3.6埃高分辨率结构。2016年7月22日,施一公教授研究组在《科学》在线发表背靠背长文,首次报道了酿酒酵母剪接体分别处于激活状态(activated spliceosome,又称为Bact complex)和第一步催化反应后(catalytic step I spliceosome,又称为C complex)的近原子分辨率的剪接体结构,首次完整地展示了第一步转酯反应前后pre-mRNA和其中起催化作用的snRNA的反应状态,以及剪接体内部蛋白组分的组装情况。但是对于剪接体催化第二步转酯反应的细节,至今没有高分辨率的结构加以佐证。/pp  在最新发表的《科学》长文中,施一公教授研究组捕获了性质良好的酿酒酵母剪接体样品,并利用先进的单颗粒冷冻电镜技术和高效的数据分类方法,重构出了总体分辨率分别为4.0埃的冷冻电镜结构,首次报道了酵母第二步催化激活状态下的剪接体结构。该结构的解析,进一步补充了mRNA剪接过程的关键信息,描述了从第一步转酯反应到第二步转酯反应过程中,剪接体催化反应活性中心内部组分的变化,以及关键蛋白的参与情况,为理解第二步反应所需的3’剪接位点是如何进入活性位点提供了重要的结构基础。值得关注的是,该结构的催化核心区域的分辨率达到3.5埃,第一次展示了转酯反应进行中的关键结构信息,填写了第二步转酯反应细节信息的空白。/pp  2015年8月至今,施一公教授研究组共报道了剪接反应中5个关键状态剪接体复合物的高分辨率结构,分别是3.8埃的预组装复合物tri-snRNP、3.5埃的激活状态复合物Bact complex、3.4埃的第一步催化反应后复合物C complex、4.0埃的第二步催化激活状态下的C* complex以及3.6埃的内含子套索剪接体ILS complex。这5个高分辨率结构所代表的剪接体状态,基本覆盖了整个剪接通路中关键的催化步骤,提供了迄今为止最为清晰的剪接体不同工作状态下的结构信息,大大推动了RNA剪接研究领域的发展。/pp  施一公教授为本文的通讯作者 清华大学生命学院博士后结构生物学高精尖创新中心卓越学者闫创业、医学院四年级博士生万蕊雪以及生命学院二年级博士生白蕊为该文的共同第一作者 生命学院二年级博士黄高兴宇参与了这项研究 电镜数据采集于清华大学冷冻电镜平台,计算工作得到清华大学高性能计算平台、国家蛋白质设施实验技术中心(北京)以及荣之联董事长王东辉先生的支持。本工作获得了北京市结构生物学高精尖创新中心及国家自然科学基金委的经费支持。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/265b7d28-fd8c-4b5c-b254-723cb115e514.jpg" title="201612161410211270.jpg"//pp style="text-align: center "图2 C* complex三维结构示意图/ppbr//p
  • 代谢组学:未来新方向(What' s next in ' omics: The metabolome)
    p style="text-align: center "img title="}}}X`IWTUFUUQ127)%~1G7I.png" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/4cde966e-0cd0-489d-a12d-84067a144220.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-size: 12px "PHOTO: DREAM DESIGNS/LYRICSAIMA/SHUTTERSTOCK.COM/span/pp  加拿大阿伯特大学生命科学与计算科学教授David Wishart说,我们自身其实就是一大组生化反应,“因此,基因组和蛋白质组不断进化来支持代谢组,而不是相反的路径。” Wishart说,有别于其他组学方法,代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转录组或者蛋白质组要快得多。这使得代谢组在许多领域都非常吃香,如环境毒理学、进化和发育、疾病诊断与治疗反馈、以及药物、杀虫剂和除草剂的研发等。代谢组流动检测帮助合成生物学家揭示遗传改变如何影响通路和产物。/pp  作为组学家族最年轻的成员,代谢组学发展势头正劲。2014年,国际代谢组学学会主办了他们的第10次年会,与首次会议是同一座城市:日本鹤岗市。“第一年,我们有大约150人参会。”墨尔本大学助理教授、该校的澳大利亚代谢组分站负责人Ute Roessner说,“今年我们有超过500名注册参会人。而且代谢组学已经成为了每位研究者研究工具的一部分。现在,年轻的研究者定期开展代谢组学工作,作为他们博士工作的一部分。”/pp  代谢组学最主要的挑战根植于它的优点。代谢组数据很强大,因为生物体具有许多的代谢物,包括相关的前体、衍生物和具有一定浓度的降解产物,它们都极具多样性且变化迅速。这种复杂性需要精妙的分离和检测方法。代谢组学包括了脂类分析,这是一个极具潜力的发展领域,赛默飞世尔科技公司策略市场部经理黄盈盈(音译)说:“脂质组学与心血管疾病、癌症、糖尿病和肥胖症直接相关。然而脂质在体内的结构和浓度极具多样性,能达到10倍的变异。”许多生理脂类和其他代谢物共享一种化学组成,仅仅在排列上具有差别。因此,加州大学戴维斯分校教授、西海岸代谢组学中心主任Oliver Fiehn将代谢组学称为“异构体科学”。/ppstrong  仪器的决策树/strong/pp  人们对代谢组学的兴趣不断增长,促使分子分离和检测仪器的制造商研发出各种针对代谢组学的硬件、软件和技术支撑。当研究人员需要将这些技术带进实验室时,他们面临着复杂的决策树。第一个分支就是非靶向还是靶向的分析。非靶向方法在所有可能的组分上聚集数据。靶向分析则聚焦于已知的组分,经常是数量上的变化,例如在胁迫和疾病的反应过程中。/pp  核磁共振光谱学(NMR)对于靶向分析来说尤为强大,因为它可定量、可重复,适合于检测复杂样品如血液、尿液或仅需少量或不经过处理的少量组织提取物。芬兰奥卢大学分子流行病学负责人Peter Wü rtz最近作为共同作者发表了一篇文章,该项工作利用布鲁克公司的仪器,将NMR代谢组学应用于数千个爱沙尼亚和芬兰的生物银行样品中。研究团队找到了四种生物标记,当组合在一起时,与各种情况的猝死风险的提高显著相关。Wü rtz指出,这一研究是观测性的,并没有探究其机制,但却展示了NMR在生物标记分析中的能力。然而,使用NMR的代谢组学分析也存在局限,因为它的灵敏性比更加流行的代谢组学方法“质谱分析法(MS)”要低好几个数量级。/pp  质谱需要样品处理。组分通常需要离子化并经过分离,最常用的方法是气相色谱(GC)和液相色谱(LC)法。毛细管电泳(CE)能很好地分离极性代谢物,能够用到与单细胞一般大小的样品中。毛细管电泳—质谱联用是人类代谢组技术公司(HMT)的特色产品,而像安捷伦和爱博才思等企业也提供该产品。但是,毛细管电泳技术需要专业的操作者和强大的软件来分析迁移时间中的漂动,安捷伦代谢组项目经理Theodore Sana说。/pp  毛细管电泳—质谱联用技术的强大之处在于解析那些易于挥发或者能够通过衍生物挥发出来的物质,例如原初中心代谢的小分子。而液质联用技术则特别适用于大的、热不稳定的有机分子,包括许多次生代谢产物、较大的碳水化合物和脂类。一些诸如超高效液相色谱(UPLC,最初由Waters公司研发)、超临界流体色谱和离子迁移分离法的新进展,提高了速度和分离能力,囊括了非极性分子和具有多种异构体或异位体的组分(例如脂类)。分离方法与质谱分析器偶联起来,例如飞行时间(TOF)质量分析器,能够快速、高分辨率地解析大质量范围的分子。加入四级或线性离子捕获器可以选择在离子化过程中产生的特定成分或组分片段。一旦研究者完成了代谢组特性的分类,他们就可以决定是购买仪器还是将样品送往服务机构。/ppstrong  供应和服务商的选择/strong/pp  安捷伦提供有气质联用、液质联用、毛细管质谱联用和NMR等仪器。Sana 说:“作为单个供应商能提供所有这些技术,包括了硬件、软件和技术支持,我们具有不可替代的位置。”(岛津公司也提供被研究人员推荐为廉价的原初装置的多种系统。)用户对安捷伦提供的直观软件给予了好评,Sana证实这确实是公司优先考虑的事情。举例来说,安捷伦的GeneSpring —质模专业版软件用于多重组学数据的整合分析。Sana 说,“GeneSpring可以使你采用来源于RNA、蛋白质和代谢物完全不同的数据,并将它们动态地映射在生物通路上,就像KEGG(一种代谢通路工具)那样。” GeneSpring也支持预处理来自其他厂商平台的数据,例如作为一个电子表格。使用一个通路工具对来源于大量实验的结果进行可视化,这对于搜集生物学洞察力、计划接下来的实验来说十分有用,Sana说。/pp  爱博才思专注于液质联用质谱仪,研究人员高度评价了该仪器快速的数据获取,卓越的动态范围,以及定量化和准确的质量能力(通常定义为百万分之五或更低的精度)。该公司也提供毛细管电泳和离子迁移的选择。对于代谢组学来说,爱博才思推荐三联TOF和QTrap系统。公司高级市场经理Fadi Abdi说,“我们的三联TOF是进行定性定量分析的高分辨率、精确质谱仪,适合于代谢组学的发展。Qtrap是为要求灵敏性、靶向性和定量性的工作流程所设计的。”Abdi这样解释,为了鉴定、确认和定量产物,三联TOF系列的高获取速度可以在一个液相时间段的单次进样中同时完成质谱和串联质谱分析。Qtrap的多重反应检测器提供父本化合物的数据和由质谱随后产生的片段,简化数据处理流程并使研究者对他们的数据具有信心,爱博才思代谢组和脂质组学应用部门研究员Baljit Ubhi说。/pp  那些寻找广泛代谢物覆盖的研究者可以考虑爱博才思的组合包,融入了爱博才思的高分辨率液质联用系统和力可公司的高分辨率气质联用系统。这一合作为客户提供了“两种技术的精华”,力可市场技术部主任 Jeff Patrick说。组合包中包括了来源于Genedata公司的软件,能够将来源于两个平台的数据整合以提供可靠的代谢组学分析。/pp  另一种流行的多功能液质联用质谱选择是赛默飞世尔科技公司基于轨道阱(Orbitrap)技术的仪器。轨道阱质谱分析仪通常用于蛋白质组,但是在整合了一个高级分离系统(如UPLC)时,它的高分辨率能力尤其适用于代谢组学的分析,黄盈盈说。平行检测消除了为了加速样品分析所需的多重运行。赛默飞世尔科技公司产品线上的最新系统是具有三个质谱分析仪的轨道阱融合三杂交系统。液相分离以后,通过四极孔样品过滤,并在随后的轨道阱和线性离子捕获中进行可能的平行分析。黄盈盈说,三杂交系统的设计初衷是为研究人员提供灵活性与精确的质谱性能。/pp  赛默飞世尔科技、爱博才思和布鲁克也提供质谱成像的仪器,这也被称为MALDI成像法。Roessner解释,这种方法克服了代谢组学的一个局限:代谢物分析通常只能在均一化的样品或提取物中进行,但是那些特定的细胞和组织却具有不同的代谢物特征。质谱成像技术为一个纤薄的组织切片(例如,来源于一个器官或植物组织中)提供了代谢物空间分布的图像。这一过程是使用激光解吸将矩阵处理的样品进行组分离子化,然后再使用质谱进行分析。对组分进行二维图像的重建提供了组织间代谢物的定位。/pp  Roessner在该项技术中使用了布鲁克系统,他说:“尽管仍在初级阶段,但这是一种令人兴奋的方法。它可以用于观察肺部样品中药物相关代谢物的分布,或者去追踪环境刺激后,组织中代谢物分布的改变。”赛默飞世尔科技的轨道阱系统在此方法上具有优势,黄盈盈说:“因为离子是来源于组织的,没有经过液相分离,你需要一种超高分辨率的仪器,就像轨道阱。”/pp  对于不打算购买系统或者倾向于服务所带来的便捷性的研究者来说,他们也有很多选择。Biocrates公司和Metabolon公司都面向全球提供质谱代谢组学分析服务。Metabolon公司也涉猎大型、长期的合作,例如Craig Venter的人类寿命项目,Metabolon 公司销售市场高级副总裁Chris Bernard说,在代谢组学如何付诸实践、如何用于一系列项目中的问题上,合作对于Metabolon公司而言很重要。/pp  NMR代谢组学所具备的优势在于不通过标准曲线的真正定量,样品可保留,可实现最少样品的操作,单次反应就能检测到所有带有结构信息的代谢物。但是科学家对于它的兴趣可能会受到装机成本的阻碍。研究人员可以通过服务商来获取这种方法,例如Chenomx公司。Wü rtz和他的同事也通过Brainshake公司提供NMR代谢组学的服务与合作。这是建立在他们使用NMR进行生物标记研究的经验,并将代谢组学数据与全基因组关联研究联系起来,该研究将遗传变异和疾病风险联系在一起。/pp  代谢组学服务机构正在通过国家和学术中心设施快速增长。在澳大利亚,Roessner属于第一批建立政府资助的国家代谢组服务平台。加拿大也资助国家代谢组的项目,其他国家也在这个领域跟进。在美国,国立卫生研究院(NIH)共同基金早在2012年就开始建立代谢组学的区域中心。负责西海岸项目的Fiehn说:“这些中心提高了代谢组学的能力,能够为学术界和产业界服务,而且他们有不同的特色,例如肯塔基中心的代谢流平台和北卡罗来纳的核磁共振平台。”国立卫生研究院的中心平台也为初次接触代谢组学的科学家提供短期课程。/ppstrong  下一步挑战/strong/pp  当被问到代谢组学面临的重大挑战时,研究人员和供应商一致认为有三点:对未知物的鉴定 研发出可供查询的标准数据集,就像GenBank的基因组资源 代谢组学与其他全系统数据的整合。/pp  “质谱太过于敏感,因此我们得到了大量物质,却不知道它们是什么。”Wishart说。为了帮助研究者进行代谢物鉴定,安捷伦研发了气质和液质联用质谱的数据库,专供基于质谱技术的代谢物鉴定。力可公司提供了一个GC-TOF的数据库,据Patrick表示可用于任何气相色谱的数据,尽管该数据库是为力可公司的仪器而进行的优化。力可公司目前正在探索与高分辨率精确质谱库进行合作的机会。/pp  Wishart意识到,最未知的是代谢物中的代谢物:“分解产物和由酶转换而来的或者具有微生物活性的分子。”这种分子的相似性是鉴定它们的关键因素。Fiehn团队研发了一些商业化的质谱文库,也在开发虚拟文库。研究人员可以从物质已知的谱图数据出发,来预测相似的或修饰变异物的谱图。LipidBlast是Fiehn团队开发的串联质谱虚拟谱库,超过20万种脂类可供免费下载。/pp  为了面对数据整合和可搜索性所带来的挑战,代谢组界采取了一些举措,推动数据存储库的建立。例如位于英国的Metabolights是由欧洲代谢组学标准协调委员会(COSMOS)联盟所支持的,该联盟制定了代谢组学的数据标准。还有代谢组学工作平台(Metabolomics Workbench),该平台旨在建立国立卫生研究院资助下的代谢组项目的数据库。赛默飞世尔科技与Fiehn合作推出了mzcloud.org网站提供免费的社区数据库,数据库包括在鉴定时有待注释的未知组分的真实和虚拟谱图。/pp  即便是在代谢组学界有了存储数据的数据库之后,Patrick仍意识到,鉴于大量数据的背景和意义,“系统生物学的首要挑战是生物学干扰”。他认为解决的方案是软件,这“驱动着代谢组学的发展方向。” Bernard也有同感,他表示Metabolon公司客户首要的需求是帮助他们理解结果的生物学意义,“质谱对于产生数据来说很不错,挑战在于从噪音中分离出信号:85%的质谱数据点都是噪音”。Metabolon公司的客户可以使用MetaboLync的门户网站,其中包含了他们样品中的一系列代谢物,对比拥有超过1.4万种组分的本地文库,用于自动认证代谢物的鉴定,Bernard补充道,另外该门户最强大的特性在于,它具有在通路水平可视化并探索数据的能力。/pp  随着该领域的不断发展,仪器供应商和服务提供商都迫切地期待与用户在他们的代谢组学研究上展开合作和讨论,不仅是买卖关系,而且可以掌握当前动态。“我们正与一些科研人员开展密切合作。”Sana 说,“在推进代谢组学领域的发展中,研究人员往往是新点子的来源。”/pp  (译者之一高大海系中国科学院海洋研究所助理研究员)/pp  Chris Tachibana 是美国西雅图和丹麦哥本哈根的科学作家。/pp  原文:What' s next in ' omics: The metabolome/pp /p
  • IKA HABITAT 生物反应器荣获iF设计奖
    /// IKA 荣获今年的iF设计奖。该奖项授予工业/工具类的新型智能实验室生物反应器,因其符合人体工程学的设计和直观的操作优势。2023年6月1日,施陶芬。HABITAT生物反应器成功打动了由133位成员组成的独立的iF设计奖评审团。 事实证明,即使高度复杂的设备,也可以轻松愉快地工作。作为第一个带盖支架的实验室生物反应器,它为用户节省了大量操作,确保了符合人体工程学的工作和整洁的实验室。特别的“混沌混合"模式能够实现更快、更高效的混合。直观的操作界面缩短了熟悉时间。 IKA与所有相关的开发商和设计师分享了获得这一久负盛名奖项的激动心情。HABTAT生物反应器是来自56个国家提交的近11000种产品之一。iF设计奖自1954年起颁发给杰出设计,是世界上重要的设计奖项之一。关于 IKA IKA 集团是实验室前处理、分析技术、 工业混合分散技术的市场先驱者。电化学合成仪、磁力搅拌器、顶置式搅拌器、分散均质机、混匀器、恒温摇床、恒温培养箱/烘箱、移液器、研磨机、旋转蒸发仪、加热板、恒温循环器、粘度计、量热仪、生物反应器、化学合成釜、实验室反应釜等相关产品构成了IKA 实验室前处理与分析技术的产品线;而工业技术主要包括用于规模生产的混合设备、分散乳化设备、捏合设备、以及从中试到扩大生产的整套解决方案。IKA 还与世界著名大学和科学家进行着密切的合作, 支持其在科研道路上不断探索。我们致力于为客户提供更好的技术, 帮助客户获得成功。IKA 成立于1910年,集团总部位于德国南部的Staufen,在美国、中国、印度、马来西亚、日本、巴西、韩国、英国、波兰等国家都设有分公司。 艾卡(广州)仪器设备有限公司是IKA 集团于2000年设立的全资子公司,主要负责中国和蒙古国的产品、技术和服务支持。
  • 哈药纯中纯水检出致癌物 北京四纯净水不“净”
    昨天,国家质检总局在官方网站公布对瓶(桶)装饮用水产品质量监督抽查结果,18种饮用水产品质量不过关上黑榜,哈药“纯中纯”弱碱性饮用水、“景友”鄂尔多斯天然沙漠水被检出潜在致癌物溴酸盐超标。   此次共抽查了北京、天津、河北等211家企业生产的220种瓶(桶)装饮用水产品,包括186种瓶装饮用水和34种桶装饮用水,结果发现有18种产品不符合标准,涉及菌落总数、大肠菌群、霉菌、酵母、溴酸盐、电导率、界限指标(锶含量)、游离氯等多个项目。  在黑名单中,哈药集团制药六厂生产的“纯中纯”弱碱性饮用水(350mL/瓶,2011-03-11)、鄂尔多斯市景友鸿鹄矿泉饮品有限责任公司生产的“景友”鄂尔多斯天然沙漠水(398mL/瓶,2011-04-02)等一共6种饮用水检出溴酸盐超标。  记者查询到,溴酸盐在国际上被认定为潜在致癌物,它是矿泉水或山泉水等天然水源在经过臭氧消毒后生成的副产品。我国新版矿泉水标准中,对溴酸盐含量都有严格限量规定。  同时,来自重庆的“雨露”饮用纯净水(610ml/瓶,2011-03-24)游离氯(余氯)不合格,而如果余氯超过一定的含量,饮用后对人体有害。  北京四纯净水不“纯净”  本报讯 (记者廖爱玲)昨天,在北京市食品安全办公室公布的22种停售下架食品名单中,也发现了4种北京产的饮用水产品不合格。  这4种饮用水包括来自北京科源兴生物科技有限公司红门玉龙水厂生产的桶装“蓝岛冰泉”优质饮用水 北京黄土岗水厂生产的桶装饮用纯净水 北京万事食品有限公司生产的“万昌”饮用水 北京市老井饮用水有限公司的天泰山泉饮用纯净水。
  • “垃圾DNA”不“垃圾” ——酵母可能依赖内含子度过艰难时期
    p style="text-indent: 2em "strong酵母可能依赖内含子帮助它们度过艰难时期。/strong/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/1082ae37-6879-49ea-89f6-bd66609032f0.jpg" title="酵母.jpg" alt="酵母.jpg" width="300" height="200" border="0" vspace="0" style="width: 300px height: 200px "//pp style="text-align: center "span style="color: rgb(127, 127, 127) "图片来源:STEVE GSCHMEISSNER/spanbr//pp  就像从电影中删掉的片段一样,生物基因中的一些序列最终也会被剪掉,细胞不会利用它们制造蛋白质。现在,两项研究发现,这些被称为内含子的片段有助于酵母在艰难时期存活。这项研究揭示了DNA的另一种可能的功能,科学家曾认为这种功能是无用的。/pp  未参与该研究的美国加州旧金山州立大学进化分子生物学家Scott Roy说:“这些结果非常令人信服,也非常令人兴奋。”这项研究开启了了解“内含子作用的全新范式”。/pp  加州大学洛杉矶分校酵母微生物学家Guillaume Chanfreau说,这也回答了一个长期存在的问题:strong为什么酵母保留了以前被认为是“垃圾DNA”的东西/strong。/pp  内含子普遍存在于植物和真菌中,也存在于人类和其他动物体内——在大约2万个基因中,每个基因平均携带8个内含子。在最初将它们视为垃圾之后,研究人员最近开始确定内含子的某些功能。例如,一些基因中的内含子可能有助于控制细胞制造多少相应的蛋白质。/pp  为了确定剥夺内含子的影响,加拿大谢布鲁克大学RNA生物学家Sherif Abou Elela和同事系统地从酵母菌中删除内含子,并产生了数百个菌株。然后,研究人员将这些改良菌株与普通真菌一起培养。/pp  当食物缺乏时,大多数缺乏内含子的菌株很快就死掉了,研究小组近日在《自然》上报道称,它们无法与普通酵母竞争。然而,在营养更丰富的培养基中,经过改造的酵母具有优势。Abou Elela说:“如果你处于好时期,内含子是一种负担。但在逆境中,它是有益的。”/pp  麻省理工学院分子生物学家David Bartel和同事也独立研究出了类似的结果。他们测量了酵母细胞中不同RNA分子的数量,同时注意到,在“拥挤”的培养基中生长的酵母积累了大量内含子。相关论文刊登于《自然》。/p
  • 【文献速递】Nature子刊:胶质母细胞瘤靶向治疗新策略-联合抑制PDGFRA和EPHA2
    近日,重庆陆军军医大学西南医院病理科&西南癌症中心研究所卞修武院士和王岩教授研究团队在胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)的治疗策略方面取得了新的进展,相关研究成果已发表在Nature子刊“Signal Transduction and Targeted Therapy”(IF= 18.005,JCR1)。△ 图1Nature子刊《Signal Transduction and Targeted Therapy》(IF:18.187,JCR 1区)胶质瘤是最常见的脑肿瘤,2016年世界卫生组织(World Health Organization,WHO)将其分为四级(I-IV)。数字越大,恶性程度越高,预后越差,其中,GBM属于IV级。GBM恶性程度高、侵袭性强,患者的平均生存期约为15个月,5年生存率不到5%,因此,探究GBM的发生、发展机制,寻找复发相关的分子标志物,针对相关靶点进行转化研究,具有重要的意义。在临床上,大多数GBM患者(约90%)被诊断为野生型IDH1/2,定义为原发或新发的GBM;大约10%的GBM患者携带IDH1/2突变,定义为继发性GBM。根据癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中脑胶质瘤基因转录组,可以将GBM分为4种亚型:前神经元型、神经元型、经典型、间质型。经典型以EGFR基因扩增/突变为特征,前神经元型主要表现为PDGFRA(Platelet-derived growth factor receptor α)突变或IDH1/2 突变,间质型主要存在神经纤维蛋白1(Neurofibromatosis type 1,NF1 )突变。血小板衍生生长因子受体α(PDGFRA) 和受体β(PDGFRB) 属于受体酪氨酸激酶(Receptor tyrosine kinase,RTK)家族,并作为血小板衍生生长因子(Platelet-derived growth factor,PDGF)的受体发挥作用。哺乳动物中的四种 PDGF 基因(PDGFA、PDGFB、PDGFC 和 PDGFD)分别编码四种肽(PDGFA、PDGFB、PDGFC 和 PDGFD),它们形成五种功能同源或异源二聚体:PDGF-AA、PDGF- AB、PDGF-BB、PDGF-CC 和 PDGF-DD。研究发现PDGFA 和 PDGFRA 在胶质瘤发生和进展中起关键作用。实验也表明,PDGFA 和 PDGFRA 的过表达成功地诱导了小鼠模型中GBM的发育,这些结果表明PDGFRA 在GBM中的关键作用,并将 PDGFA/PDGFRA 轴确定为 GBM 的潜在治疗靶点。虽然已经开发出几种针对 PDGFRA 的抗肿瘤药物,体外和体内的数据也支持靶向PDGFRA对GBM细胞的有效抑制作用,然而,单一PDGFRA抑制剂的临床试验均未显示出抗肿瘤作用。基于上述背景,研究人员对GBM 中 PDGFA 和 PDGFRA 的调控机制进行了详细研究。首先开展的实验数据表明,PDGFRA 的活性或表达缺陷并没有有效地阻断PDGFA活性,所以推测PDGFRA 可能不是 PDGFA 功能所必需的。为了分析参与 PDGFA 功能的蛋白质,研究人员进行了免疫共沉淀 (Co-IP) 和质谱 (MS)实验,并首次描绘了 PDGFA 相关蛋白网络。令人惊讶的是,实验结果表明,即使没有激活 PDGFRA 和 AKT,EPHA2 也可以被 PDGFA 暂时激活。此外,MS、Co-IP、体外结合热力学(In vitro binding thermodynamics)和邻近连接实验(Proximity ligation assay)都一致地证明了EPHA2与PDGFA的相互作用,EPHA2的高表达导致 TCGA-GBM 数据库和临床 GBM 样本中 PDGF 信号靶标的上调。由于 PDGFA 诱导的 EPHA2 活化,通过抑制剂阻断 PDGFRA 不能有效抑制 GBM细胞的增殖,但同时抑制 EPHA2 和 PDGFRA后,在体外和体内的实验结果都显示出对GBM 细胞的协同抑制作用。因此,靶向PDGFRA 和 EHA2的双重抑制剂有望作为未来GBM的治疗新策略。△ 图2 PDGFRA和EPHA2联合抑制对GBM细胞的协同抑制作用。a、MTT实验测量过表达EPHA2(左)或敲低EPHA2(右)的LN18细胞的IC50。b、抗体阵列分析载体、EPHA2抑制剂(ALW)和PDGFRA抑制剂(IMA)处理的LN18细胞,显著变化的蛋白质用框架标记并单独列出。c、MTT实验评价联合药物在四种GBM细胞株的作用。d、载体、IMA、ALW 或 IMA + ALW 处理过的 U251 细胞原位生长的代表性图像(使用博鹭腾AniView100多模式动物活体成像系统拍摄)。e、生物发光信号强度绘制的肿瘤大小统计图。f、载体、IMA、ALW或IMA+ALW治疗的小鼠原位GBM肿瘤组织切片上Ki67的代表性免疫组织化学图像。论文链接https://www.nature.com/articles/s41392-021-00855-2广州博鹭腾博鹭腾作为一家集生命科学仪器设备的研发、生产、服务于一体的国家高新技术企业,目前已开发并上市了多款具有自主知识产权的产品,形成了活体成像、分子影像、蛋白凝胶预制及印迹处理系统、发光检测四个系列,用户包括清华大学、中山大学、西北农林科技大学等上百家高校及科研单位。
  • 安捷伦科技公司将为哈姆纳健康科学研究院博士研究提供支持
    安捷伦科技公司将为哈姆纳健康科学研究院Russell Thomas博士的研究提供支持 2011 年 12 月 6 日,北京&mdash &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)与安捷伦科技基金会今日宣布,哈姆纳健康科学研究院的 Russell S. Thomas 博士荣膺安捷伦思想领袖奖,该奖项将为 Thomas 博士开发药源性肝损伤的预测方法提供支持。 此奖项包括安捷伦科技基金会提供的资金支持以及安捷伦公司提供的仪器系统,其中包括一台 6460 三重串联四极杆液相色谱/质谱系统和一台安捷伦微阵列扫描仪。 Thomas 博士是哈姆纳研究院化学品安全科学研究所的学术带头人,该所的研究者们希望通过系统的生物学方法对药源性肝损伤进行预测,其中包括对转录组学、代谢组学和全基因组关联研究所得的数据进行整合分析。 药源性肝损伤是监管部门禁止使用某些药物或将其清出市场的主要原因。Thomas 博士研究工作的目标之一是最终能够准确识别出对某些药物具有肝损伤遗传易感性的患者。此项工作将有效降低肝损伤的发生率,甚至能够帮助一些之前被禁用的药物重回市场。 Thomas 博士表示:&ldquo 药源性肝损伤是开发安全有效的治疗药物时所面临的最主要问题。目前,针对经历过药源性肝损伤的患者进行的基因序列数据分析还未能找到任何多种药物共有的易感因子。我很荣幸能够获得安捷伦思想领袖奖,它对我们在哈姆纳研究院进行的工作的重要性给予了极大的肯定。在此项奖励的支持下,我们将能够评估将各种药物根据其在肝中活化的信号通路进行分组后,是否存在同一组药物共有的易感因子,从而最终预测出哪些患者可能会受到伤害。&rdquo 安捷伦副总裁兼生物系统部总经理 Gustavo Salem 说:&ldquo 个体化医疗的趋势日渐明朗,因此我们希望通过为 Thomas 博士的工作提供支持,能够推进该领域的实质性进展。长期以来,我们一直大力支持整合生物学方法的研究与开发,希望能够解决更多重要的健康难题,而哈姆纳研究院进行的此项研究与安捷伦的目标不谋而合&rdquo 。 安捷伦思想领袖计划为思想领袖的研究提供科研经费、分析仪器和专业技术方面的支持,这无疑将推动生命科学领域的长足进步。 关于哈姆纳健康科学研究院 哈姆纳健康科学研究院位于美国北卡罗来纳州三角研究园的中心,是一家非营利性研究机构。化学品安全科学研究所和哈姆纳-UNC 药物安全科学研究所是哈姆纳研究院中的佼佼者,创立 37 年以来,它们在毒理学和人类健康研究方面取得了杰出的研究成果,开发并验证了大量顶尖的安全评估工具。哈姆纳通过与全球范围内的学术、产业和政府各界积极合作,始终坚持开放、多学科发展,为人类的健康事业不断作出积极贡献。要了解更多信息,请访问 http://www.thehamner.org。关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的 18,700 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度,安捷伦的业务净收入为 66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。 编者注:更多有关安捷伦科技公司的技术、企业社会责任和行政新闻,请访问安捷伦新闻网站:www.agilent.com.cn/go/news。
  • PerkinElmer旗下ViaCord与米娅.哈姆携手推广脐带血教育
    PerkinElmer旗下的ViaCord与米娅&bull 哈姆携手推广脐带血教育,援助移植家庭(开始参与提高公众意识活动,向米娅哈姆基金会提供资金援助) ViaCord&mdash PerkinElmer(NYSE:PKI)旗下的一家附属公司,今天宣布与全球运动明星米娅&bull 哈姆及其米娅&bull 哈姆基金会携手,共同提高脐带血库价值和利益方面的意识,赞助基金会以帮助需要脐血或骨髓移植的患者和家庭。 通过这个协议,该公司将向米娅&bull 哈姆基金会提供资金,双方将在全球范围内就脐带血库价值和器官移植等关键问题上合作开展普及教育以提高民众意识。 2007年,当她的双胞胎出生时,米娅&bull 哈姆和她的丈夫决定通过ViaCord来保存他们的脐血。脐带血是一种有价值的,无任何争议的干细胞来源。脐带血已经被证实可有效治疗70多种严重疾病,包括许多癌症和免疫缺陷病。到目前为止,全球已经实施了1万多例的脐带血移植。最近,自体脐带血的使用被认为是一个潜在的治疗糖尿病和大脑性麻痹的方法。在不久的将来,脐带血干细胞的医学应用可以扩展到包括心血管疾病和中风的治疗。 ViaCord的主席Jim Corbett说:&ldquo 米娅&bull 哈姆是全球最佳运动员之一,在业界内外都显示了其水平和风度。她与我们共同分享脐带血干细胞价值和潜能的喜悦,我们非常高兴能有机会一起工作。我们的科学知识和脐血库方面的专业技能和米娅&bull 哈姆的激情,在推动更大的脐血干细胞价值意识和脐血干细胞使用可能性方面将是一个很好的结合。&rdquo 米娅&bull 哈姆说:&ldquo 我失去了我的弟弟Garrett,他患的是再生障碍性贫血,是一种脐带血可以治疗的疾病,所以我的家庭直接地知道可以使用匹配脐带血的重要价值。我很高兴与ViaCord一起,帮助教育家庭脐带血库的价值,同时可以提高我的基金会能力,从而赞助更多的需要脐带血或者骨髓移植的家庭。&rdquo PerkinElmer是全球新生儿筛查领域的领导者,正致力于在全球范围内扩大产前筛查和母婴保健领域的市场份额。该公司提供最全面的新生儿筛查解决方案,包括世界第一个唯一经FDA认证的串联质谱试剂盒,以及PerkinElmer Genetics这样的一个提供完全服务性的新生儿疾病筛查实验室。PerkinElmer使得家庭可以在婴儿出生时保存其脐带血,通过ViaCord业务供将来医学在治疗70多种严重疾病,许多癌症和免疫缺陷病方面使用。PerkinElmer同时也提供孕早期产前筛查方案 Ultra-Screen,通过其NTD 实验室来提供产前风险评估。 PerkinElmer向以全球技术领先者著称,致力于推动健康科学和光电子学市场的成长和创新,从而提高生活质量。据报道,PerkinElmer公司2007年的年收入为18亿美元,拥有9100名员工,为超过150多个国家的客户提供服务,同时该公司也是标准普尔500指数的成员。有关其它信息,请访问www.perkinelmer.com 或致电1-877-PKI-NYSE. 关于米娅&bull 哈姆基金会 米娅&bull 哈姆基金会是一个非营利性的国家组织,专门从事筹集资金和提高公众意识以帮助需要骨髓或脐带血移植的患者家庭,另外该组织还致力于让年轻女性获得更多参与体育运动的机会。关于其它信息,请访问http://www.miafoundation.org 关于PerkinElmer的更多信息,请联络: 投资者联络 媒体联络 Michael A. Lawless Stephanie R. Wasco PerkinElmer Inc. PerkinElmer Inc. (781)663-5659 stephanie.wasco@perkinelmer.com (781)663-5701
  • 接管业务超三年,SCIEX重塑CE品牌——访SCIEX CE&Biopharm部门运营及维修部高级经理徐昊博士
    p  1989年,贝克曼库尔特公司(当时的贝克曼仪器)推出了世界上第一套全自动化毛细管电泳系统P/ACE™ 2000。从那时起,贝克曼公司便不断发展新的毛细管电泳技术、推出众多的技术改进和应用发展,贝克曼公司的这些努力推动了毛细管电泳技术的市场广泛应用。/pp  2011年,丹纳赫68亿美元收购贝克曼库尔特。2014年,SCIEX接管贝克曼库尔特毛细管电泳业务,并称,毛细管电泳产品还将继续使用贝克曼库尔特品牌名。进入2018年,SCIEX称将启动毛细管电泳产品的品牌重塑战略。/pp  2018年2月2日,SCIEX CE业务部门在柬埔寨暹粒发布了新产品——生物制品分析系统C100HT。借此机会,仪器信息网编辑专访了SCIEX CE& Biopharm部门运营及维修部高级经理徐昊博士,共同回顾过去、展望未来!/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201804/insimg/1d3aeb04-a291-44ea-ab10-dc05b8da7bf0.jpg" title="SCIEX CE& Biopharm部门运营及维修部高级经理徐昊博士2.jpg"//pp style="text-align: center "SCIEX CE& Biopharm部门运营及维修部高级经理徐昊博士/pp  strongInstrument:近年来,SCIEX的毛细管电泳(CE)业务在中国的发展变化情况是怎样的?在2017这一年里发生了哪些亮眼的事件?/strong/ppstrong  徐昊博士:/strong我们谈到的CE业务是一个统称,其下有不同的产品。而我们的不同产品线都有很高的增长率。/pp  中国的CE业务也一直持续增长,尤其是在2014年加入到SCIEX以后有了更大的发展。我们的CE产品在全球以及中国都牢牢地占据着市场的领先位置,不论是增长率还是市场占有率等各个方面,从全球到中国,我们都是领导者。随着业务的增长,SCIEX CE业务的领先地位相信会进一步稳固。/pp  可以说2017年我们中国区的业绩表现很亮眼,在SCIEX中扮演着越来越重要的角色。2017年我们在中国的亮眼事件可以说非常多。我们与中检院开展多个合作项目,将乳品检测标准写入了AOAC,我们举办了几十场的市场活动,客户的反应也非常好。因为我们的大部分客户是从事研发工作的,他们对仪器的使用和依赖程度很大,迫切需要得到仪器厂家的支持。/pp strong Instrument:贝克曼库尔特的CE在业内有着悠久的历史与品牌影响力,1989年世界上第一台全自动的CE就是贝克曼推出的,至今已经快30年。您如何看待SCIEX接管该业务这件事?CE业务给SCIEX带来的价值是什么?/strong/ppstrong  徐昊博士:/strong对于贝克曼来讲,CE是主打业务 而对于SCIEX来讲,CE也是与质谱(MS)互补的一个主要业务,所以,把CE转入SCIEX,从整体发展战略以及定位来讲都是非常合适的。因为,MS与CE有着共同的客户群,特别是在生物制药这个领域,所以,SCIEX接管CE,其市场定位、未来发展都会更加有利。/pp  我们公司的产品有LC-MS、MS、Nano LC-MS、CESI等,目前还没有其他任何一家公司像SCIEX的产品这样有着广泛的可选性。也就是说自CE加入以后,SCIEX用户拥有了更多选择。/pp  strongInstrument:2014年CE即加入到SCIEX,却为何选择在2018年进行CE产品品牌重塑?/strong/ppstrong  徐昊博士:/strong刚刚收购的时候,客户那里有着操作标准流程,记录里有贝克曼的品牌和编号,试剂盒上也同样有编号,我们不想打破用户的流程标准。不过,现在合并已经超过了3年多,我们可以和用户讲,希望他们的记录进行更新。而且,现在用户可以充分利用SCIEX的强大产品组合。例如,在生物制药领域,MS和CE强强联手,能够给用户带来新的价值。而客户们也很理解这一点,所以,现在我们有了重新定位的价值主张。/pp strong Instrument:如何看待CE在全球以及中国的市场前景?在全球以及中国,SCIEX CE长期关注点是哪些?/strong/ppstrong  徐昊博士:/strongCE的市场前景可以用“大有作为”来形容。/pp  中国市场和全球市场很像,我们最主要的方向也是单克隆抗体药等领域。生物制药是我们最核心的一个领域,我们将继续增长在该领域的份额。在生物制药领域,就像在新品C100HT发布时讲到的,从候选的1000种克隆到最后的只有一种成功上市,整个过程用到了很多分析方法,如LCMS、MS、CEMS、CESI等,而从分离角度来讲,CE是生物药研究最有效、最快的一个方法。我们的CE 技术是单克隆抗体质控最后的把关工序。随着单克隆抗体产业的扩大,我们也会加强市场投入。/pp  第二个关注点是要向其他领域发展,包括蛋白质组学、代谢组学,以及食品安全等也需要CE技术的介入。例如,在蛋白质组学领域,一位权威的学者在做有关完整蛋白研究时面临着巨大的挑战,即需要各种各样的表征分析技术,现在他利用CE技术获得了很好的结果。代谢组学也是如此,如负电荷和正电荷分析,LC很难一次做好,而因为MS的高灵敏度以及CE的离子抑制特性好的特点,如果把CE和MS结合起来,在代谢组学领域会有很好的表现。/pp  我们在中国也已经向许多新领域进行了拓展,其中主要的是食品安全、临床诊断领域,此外还有烟草、酒类等也正处于我们的开拓期。由于我们是市场的第一品牌和第一市场占有率的产品,为了扩大CE在中国的应用,我们也在积极和国家级重点实验室等合作,开发相关的新标准,希望用CE产品给大家更多的帮助,能够为中国用户的生活质量、健康提供更多的保障。/pp  SCIEX的母公司丹纳赫对旗下子公司的营收有一定的要求,希望我们每年销售额的增长更多的来自于新产品的销售,这也不断地刺激、推动我们进行创新。/pp style="text-align: right "  strong采访编辑:刘丰秋/strong/ppbr//p
  • 祝贺冠亚种子水分仪入选中国热带农业科学院
    中国热带农业科学院(简称“中国热科院”)是隶属于农业农村部的科研机构,创建于1954年,前身是设立于广州的华南热带林业科学研究所,1958年迁**海南儋州,1965年升格为华南热带作物科学研究院,1994年更为现名。 中国热科院现有儋州、海口、湛江和三亚(筹)四个院区,科研试验示范基地6.8万亩,在海南、广东“两省六市”设有16个科研和附属机构。拥有**重要热带作物工程技术研究中心、海南儋州**农业科技园区、省部共建**重点实验室培育基地、农业部综合性重点实验室等70多个部省级以上科技平台和3个博士后科研工作站。 种子活力是指在广泛的田间条件下,决定其迅速整齐出苗和长成正常幼苗潜在能力的总称。目前我国商品种子**检验标准中只规定了发芽率、含水量、净度、纯度四大指标,对种子活力指标未做任何形式的说明与要求。目前应用较多的种子活力测定方法仍然是基于发芽试验的发芽速度测定。由于耗时长,越来越不能满足快速准确掌握种子质量信息的需求。 日前中国热科院选定冠亚种子水分仪为哈密瓜示范基地项目实验室种子含水量实验提供科学准确的测试工作。 冠亚种子水分仪,种子含水量测定仪SFY-6D采用进口精密称重系统称量取样,采用卤素辐射源快速干燥样品,在测量样品重量的同时,加热单元和水分蒸发通道快速干燥样品,在干燥过程中,水分仪持续测量并即时显示样品丢失的水分含量%,干燥程序完成后,终测定的水分含量值被锁定显示,直接计算干燥前后样品质量的变化来求取含水率。相对于烘箱来说在冠亚卤素快速水分测定仪工作的过程中,减少了人为、环境等方面所带来的失误。与国际烘箱加热法相比,可以短时间内达到加热功率,在高温下样品快速被干燥,其检测结果与国标烘箱法具有良好的一致性,具有可替代性,且检测效率远远高于烘箱法。因此冠亚卤素快速水分测定仪被越来越多的科研单位,生产企业所青睐和选用。
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