三代测序

请问第三代溶出分析仪已出来，第一代能否修理继续使用？

中国目前共有13个核反应堆在运行，总装机容量达到1080万千瓦；在建机组达28台，装机容量达3097万千瓦。美国现有104个核反应堆，占总能源比近20%，而中国核电占比不到2%。如果要达到10%，中国将会拥有100个、200个甚至更多的核反应堆，成为世界第一核电大国。 日本福岛核电站1号机组为上世纪60年代末建成的首批商用核电站，我国正在运行和建设的核电站多为80年代和90年代后改进型或革新型核电站，安全性能优于福岛。我国核电站‘门槛’比世界平均水平要高，核电站的选址更加保守、安全，均远离地质断裂带，建在稳定的基岩上。抗震标准、防洪标准等都做到了‘高一级’设防。” 日本福岛核电站事故的原因主要是因为二代核电应急系统中的泵需要电源驱动，没有电，反应堆停堆后无法冷却，导致了一系列后果。“中国在建的第三代AP1000中，整个安全设备系统没有一台泵。无需依靠外在电源，利用高位水箱，靠温差、靠重力、靠气体膨胀来推动流体流动，安全系数得以大幅提升。” 福岛核电事故的经验和教训，为使我国的核电发展更为健康，要防止“因噎废食”。“核电站安全问题，从本质上来讲，不是技术问题，而是利益代价的问题。设防标准要足够保守，必要时要考虑能防范像日本福岛遭遇的9.0级大地震和10米高海啸甚至更高的外来威胁等。”因此中国要大力发展第三代核电，从国家利益出发，集中全力让三代核电快一点发展，三代越多越好，二代越少越好。” 3月16日，国务院总理温家宝主持召开国务院常务会议，要求暂停审批新核电项目。据知情人士透露，在中国核电发展路径上，目前还存有争议，继续发展二代核电的声音犹存。而此次国务院“暂停审批”受冲击最大的是中核集团和中广核集团。这两大巨头是中国目前核电发展的主力军，暂停审批的核电项目中，大部分都是这两家企业的项目，主力机组是二代改进型核电机组。 此次日本核事故将会成为调整中国核电结构的契机，中国核电发展路径是“二代和三代并举”还是大力发展第三代呢？

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无需进行文库制备，所用DNA样本比标准方法更少2012年12月13日 来源： 中国科技网 作者： 陈丹 中国科技网讯 据物理学家组织网12月12日（北京时间）报道，英国研究人员简化了基因组测序的标准流程，首次无需进行文库制备便完成了DNA（脱氧核糖核酸）单分子测序，而且新方法只要很少量的DNA就能获得序列数据，用量可低至不到1纳克（10亿分之一克），仅为常规测序方法的500分之一到600分之一。 文库制备是指从测序前基因组样本中提取不同长度的DNA片段，这一过程不仅费力、费时，还会浪费DNA，而新技术能极大地减少DNA的损耗，并缩短测序时间。 该研究论文的第一作者、英国威康信托基金会桑格研究所的保罗·库普兰说：“我们用这种方法对病毒和细菌的基因组测序后发现，即使在相对较低的水平，我们也能够确定所检测的是何种有机物，不论样本中是否存在特定的基因或质粒（这对于确定抗生素耐药性很重要），或者其他信息，如对特定DNA碱基的修改等。”他表示，一旦技术得到优化，将在快速、高效地识别医院和其他医疗场所中的细菌和病毒方面具有很大的应用潜力。 研究小组利用第三代单分子测序系统PacBio RS演示了这种简化的直接测序方法。他们仅仅用800皮克（千分之一纳克）DNA来分析一个生物体的基因组，尽管测序仪只读取了基因组的70个序列片段，相对于常规测序方法获得的数据来说不过是很小的一部分，但这些信息足以让研究人员确定他们所检测的生物体的品种。 这项技术也使得科学家能够对此前无法识别的宏基因组（也称微生物环境基因组）样本中的生物体进行确认。“为微生物测序，首先需要能够在实验室中培养它们。”论文的主要作者、英国巴布拉汉研究所的塔米尔·钱德拉说，“这不仅耗费时间，而且有时候微生物不生长，为它们的基因组测序极其困难。”他表示，新方法可以直接对微生物测序，短时间内便可确定其“身份”。 论文的另一主要作者、威康信托基金会桑格研究所的哈罗德·斯维尔德洛说：“我们的技术可以在对所测序列没有任何先验知识、没有特定微生物试剂的条件下，在很短的时间内操作，这是一种很有前途的替代手段，可应用于控制感染等临床需要。”（记者陈丹） 总编辑圈点 长久以来，基因测序等围绕基因科学所展开的研究，都被人们贴上了从本源上解开人体生命奥秘、彻底解除遗传疾病威胁等殷切的标签。多国为提高社会健康水平，都开展了解码国民DNA的活动，有些甚至覆盖全基因组。然而，面对由30亿个碱基对构成的人类基因组，精确测序注定将是一场浩大而又漫长的工程。如何能快速、准确地将海量DNA数据转化为有帮助的实用信息，已经成为该领域科学家们面临的重大挑战之一。因而我们说，英国科学家此番取得的突破，不管是从整个学科研究的方法论层面，还是从临床应用的角度，都提高了基因研究服务于人类的速度。 《科技日报》（2012-12-13 一版）

第三张“基因变异图谱”与第二代基因组测序技术——评“千人基因组计划”首期研究成果的医学意义世界上任意两个人的基因99%都是相同的，而恰是那1%不同，负责着个体间的表型差异。《自然》杂志近期披露，当人体内携带有250到300基因变异位点的时候，相关基因就就会“沉默”。甚至，一个人只携带了 50到100基因变异位点，就可能患上某种疾病。10年前，“人类基因组计划”这一耗资30亿美元、历时10余年的伟大科学工程完成之际，人们以为得到了揭开自身生命奥秘的天书，生命科学也划时代地进入了“后基因组时代”。如今看来，当时得到的仅仅是人类基因组的“参考图谱”，对于人群里个体间的基因差异，或是更具医学意义的“基因变异图谱”来说，人们知之甚少。第三张“基因变异图谱”为了探寻个体间的基因差异，科学界在2002年启动了HapMap（人类基因组单体型图谱）计划。Hapmap在2005年完成的“第一张基因变异图谱”含有一百万个“单核苷酸多态性”（SNPs）位点；HapMap在2008年完成的“第二张基因变异图谱”含有三百一十万个SNPs位点。而此次“千人基因组”所公布的一期结果——“第三张基因变异图谱”，已经包含了一千五百万个SNPs位点。今年10月28日，《自然》杂志为此刊出的文章题目为“基于群体规模的基因变异图谱”，鲜明的指出，“千人基因组计划”首期研究成果，其最大优势在于：“第三张基因变异图谱”所采用的样本，针对了“大规模人群”。 远超过此前两张“基因变异图谱”所测定的样本数。绘制“第三张基因变异图谱”的所有数据，是基于两个核心家庭，6个个体的精确基因组测序，179个个体的低覆盖率基因组测序，以及七百多人的蛋白编码区的基因测序。检测人群数目庞大，人种涉及中国人、日本人、西欧人等。因此，第三张“人类基因变异图谱”的问世，可以从更深的层次上了解，种族之间、个体之间的基因差异。更具医学意义的是，对于人群中发生频率在１％以上的基因变异，本次研究的覆盖率达到９５％以上。这就意味着：此前Hapmap计划所绘制的两张“基因变异图谱”中，没能涉及的“罕见病”致病基因，可能在“第三张基因变异图谱”中已经被标出。“基因变异图谱”的医学应用随着，“人类基因变异图谱”绘制的日臻完善，和商业化全基因组SNP 分型芯片成本的不断降低，以及新的统计方法和软件的出现, “全基因组关联分析”( Genome-Wide Associat ion Study , GWAS) 越来越多的应用于复杂疾病“易感基因”的确定。今年6月6日，安徽医科大学的张学军教授领衔的团队，通过对中国汉族和维吾尔族人群近2万份样本进行分析，在人类基因组的3个区域内发现与白癜风发病密切相关的4个易感基因。今年8月2日，中***事医学院贺福初院士领衔的蛋白质组学国家重点实验室，通过对大陆5个肝癌高发区的4500多名肝癌病例和对照的研究，发现了肝癌易感基因新区域（1p36.22）今年8月23日，新乡医学院的王立东教授联合国内18家医院，建立了数十万份的食管癌标本资料库，并首次在人类第10号和20号染色体上，发现两个食管癌易感基因(PLCE1和C20orf54)。基因变异有着很强的人种差异，相比国外此领域的研究成果，以上研究成果的临床意义，在于其是针对我国的特有人群。也就是说，以上研究成果在我国的临床上更具医学价值。更为可喜的是，以上研究成果均发表在此领域最为权威的《自然 遗传学》杂志上。我国在利用GWAS需找复杂疾病易感基因领域的研究，已经得到了世界的公认。

科技日报讯 （记者王怡）中国科学院北京基因组研究所和吉林中科紫鑫科技有限公司4月18日在长春联合召开国产新一代基因测序仪样机观摩研讨会，向与会的国内基因测序领域专家和应用单位代表展示这一合作成果，同时向社会公开征集部分应用单位进行免费测试使用，测试工作将于今年下半年开展。 据了解，新一代基因测序仪样机是目前唯一技术性可以匹敌国际市场主流产品的国产基因测序系统，与国外第二代高通量测序系统相比，已经成功解决“读长较短”这一关键技术难题。该基因测序仪已经达到和部分超越国际主流设备技术指标，其成本低于进口设备1/3以上，应用成本低于进口设备1/5以上，使新一代测序技术真正达到进入广泛应用市场的经济条件，并将彻底解决我国基因测序仪完全依赖进口的局面。截至目前，该系统已获得7个发明专利和1个实用新型专利授权，还有多项专利正在申报。 中科院北京基因组研究所研究员于军介绍，新一代基因测序仪对传染性疾病的预防控制和诊疗，生物恐怖因子、食源性致病因子和转基因成分鉴定，口岸卫生和有害生物防御性检疫，以及针对人类遗传多样性而产生的疾病早期预警和个体化用药相关基因的检测分析等实践应用，提供强有力的技术支持。 据悉，测序仪今年下半年将在医疗、检验检疫、疾病防控、高校、研究院所等20家应用单位进行免费测试使用。已经确认参加测试应用的单位包括中国检验检疫科学研究院、北京出入境检验检疫局、青岛海洋大学等10余家单位。测试工作主要包括对系统性能的优化和改进，以及根据应用领域的不同进行应用产品的共同开发，即在基础试剂产品的平台上衍生出一系列专用型试剂产品，并开发相应的数据分析算法和数据库，实现测序技术实践应用的全面解决方案。来源：中国科技网-科技日报 2014年04月20日

你说世界变化快不快，PCR已经迈入第三代！近日，一种称为微滴式数字PCR（ddPCR™）的新技术出现在《Analytical Chemistry》杂志上，它能够确定样品中待测靶分子的绝对数目。第一代PCR就是我们目前最常用的终点PCR技术，通过凝胶电泳获得定性的结果。风靡全球的实时定量PCR技术为第二代，它利用荧光试剂监控扩增，来实现相对定量。在开展基因表达分析时，需要标准曲线或参考基因来协助定量。微滴式数字PCR则为第三代PCR，它不再依赖Cq值或内参基因，即可确定低至单拷贝的待检靶分子的绝对数目。微滴技术让数字PCR更低成本，且更实用。

2010年2月，罗森伯格的Ion Torrent公司推出了世界上第一台半导体测序仪——PGM，这也是首台“桌面型”（benchtop）测序仪。PGM的测序原理不同于此前的测序技术。随着2011年三款新的测序平台的发布，此领域的变革步伐不断加快。这三款新平台分别为：Ion Torrent的PGM、Pacific Biosciences的RS和Illumina的MiSeq。研究人员发现，Ion Torrent、MiSeq和PacBio RS技术所产生的数据对富含GC、中性和富含AT的基因组都表现出近乎完美的覆盖，只是在利用PGM对富含AT的恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）基因组进行测序时，有大约30%的基因组无覆盖。这三台快速周转的测序仪都能够产生有用的序列。然而，就数据质量和应用而言，还存在很大差异。产量有限且每个碱基的费用高阻碍了大规模测序项目在PacBio仪器上的开展。从实用性和流程方便性来看，PGM和MiSeq相当接近。决定购买哪一台将取决于可利用的资源、现有设施和人员的经验，当然，资金和应用也要考虑.虽然目前个人化基因测序仪更多地还是用于科研，但对它在临床上的应用，是Life公司和IIIumina公司当下都在积极推进的最重要的方向。 Life在2011年7月就PGM的临床应用，向FDA提交了申请。IIIumina公司也紧随其后：“我们正在申请FDA对MiSeq的审批。MiSeq在设计过程中就考虑到了特定的临床应用环境，我们相信这个系统的许多特征会有助于它获得FDA的批准。

本文导读：21个月大的小女孩嘟嘟有个“脆弱”的家：这个家现有的三代人里，每代总有一个人“碰不得”，打个喷嚏就能骨折。50年来，不间断遗传的脆骨症让这个“玻璃家族”伤痕累累。面对嘟嘟无辜的眼神，母亲梁敏只有一个心愿：希望女儿不需借用双拐行走，为命运翻牌。图为：记者叶茂林摄 　　楚天都市报讯 21个月大的小女孩嘟嘟有个“脆弱”的家：这个家现有的三代人里，每代总有一个人“碰不得”，打个喷嚏就能骨折。50年来，不间断遗传的脆骨症让这个“玻璃家族”伤痕累累。面对嘟嘟无辜的眼神，母亲梁敏只有一个心愿：希望女儿不需借用双拐行走，为命运翻牌。　　昨日下午，记者走进“玻璃家族”位于解放公园路的家。虽然轻手轻脚，但还是惊醒了熟睡的嘟嘟。记者看到，嘟嘟的右腿上了夹板，用绷带固定在床边的椅背上。母亲梁敏说，女儿出生40天后，就先后三次骨折。“伢疼得厉害了，就使劲咬着胳膊，也不哭。”梁敏拍着哭闹的“瓷娃娃”，满眼心疼。　　事实上，嘟嘟的外婆、母亲都是一碰就碎的“瓷娃娃”。外婆中学时连续骨折数次，腿骨布满愈合不良的骨痂，现已卧病在床;母亲梁敏出生50天开始发病，已经数不清骨折过多少次，为减少磕碰，17岁前，她没走过一步路。连续三代，骨折的魔咒始终笼罩这个家庭，夹板和绷带的使用率仅次于锅碗瓢盆。　　梁敏的丈夫是血友病患者，腿部残疾，只能打些零工，目前，全家仅靠梁敏父亲微薄的退休金和低保维持生活，一家五口至今仍蜗居在一间20多平方米的房间里。　　面对魔咒，梁敏从没低过头。今年5月，她利用慈善机构捐赠的电脑开了北京奥特美自动化技术有限公司一家网店，希望自力更生，攒钱为嘟嘟治病。　　武汉市中医院骨科医生张汉庆介绍，脆骨症具有先天遗传性，目前尚无有效治愈方法。由于嘟嘟年龄太小，治疗尚停留在预防和矫正畸形阶段，两周岁后方可考虑移植髓内钉，但不菲的手术费对“玻璃家族”来说，依然是道坎。

9月29日消息，据中国台湾区媒体报道，从明年1月起，英特尔将陆续淘汰第三代迅驰平台Napa和Napa Refresh。 来自笔记本厂商的消息称，英特尔计划于明年1月停产Napa Refresh系列处理器，具体型号包括T7600、T7400、T7200、T5600和T5500。上述产品的生命周期将在明年3月正式结束。 本月，英特尔已经下发了Napa平台的停产通知，产品型号包括T2700、T2600、T2500、T2400、T2300 和T2300E。上述产品的生命周期将延续到今年11月。 另外，入门级产品赛扬M 530和520也将于明年1月宣布停产，而M 450, 440和430已在本月下发了停产通知，生命周期将截止今年11月。 对此，业内人士指出，停产上述65纳米处理器有助于英特尔降低生产成本，并有助于实现在2年内过渡到45纳米工艺的目标。 本文来源：赛迪网

[b][font=inherit]一、项目基本情况[/font][/b]项目编号：[230001]HLJLB[CS]20230005项目名称：免疫规划实验室基因测序试剂耗材采购采购方式：竞争性磋商预算金额：511,812.00元采购需求：合同包1(试剂耗材):合同包预算金额：315,429.00元[table=100%][tr][td]品目号[/td][td]品目名称[/td][td]采购标的[/td][td]数量（单位）[/td][td]技术规格、参数及要求[/td][td]品目预算(元)[/td][td]最高限价(元)[/td][/tr][tr][td]1-1[/td][td]生物试剂盒[/td][td]质谱仪试剂包[/td][td]1(套)[/td][td]详见采购文件[/td][td]8,550.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-2[/td][td]生物试剂盒[/td][td]质谱样品处理基质[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]10,175.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-3[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用末端修复/添加polyA尾试剂盒[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]16,000.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-4[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用快速连接试剂盒[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,550.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-5[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用FFPE DNA 修复试剂[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]11,265.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-6[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用NEB Blunt/TA Ligase Master Mix 连接酶[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]6,750.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-7[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用直接RNA测序试剂[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]17,546.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-8[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用RNA A尾修饰酶[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,700.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-9[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用10 mM dNTP 溶液[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,624.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-10[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用快速连接反应试剂盒[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,300.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-11[/td][td]生物试剂盒[/td][td]三代测序用T4 DNA 连接酶[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,510.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-12[/td][td]其他医疗设备[/td][td]三代测序用无RNA XP 磁珠[/td][td]3(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]33,651.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-13[/td][td]其他医疗设备[/td][td]三代测序用DNA核酸纯化磁珠[/td][td]3(瓶)[/td][td]详见采购文件[/td][td]14,403.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-14[/td][td]生物试剂盒[/td][td]QIAxcel设备病毒RNA提取试剂盒[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]15,750.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-15[/td][td]生物试剂盒[/td][td]一步RT-q[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]混合物qScriptTMXLT 1-Step RT-q[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url] ToughMix[/td][td]10(袋)[/td][td]详见采购文件[/td][td]20,000.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-16[/td][td]生物试剂盒[/td][td]Qubit仪器RNA 定量试剂盒[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,427.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-17[/td][td]诊断用血清[/td][td]胎牛血清[/td][td]20(瓶)[/td][td]详见采购文件[/td][td]49,660.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-18[/td][td]生物试剂盒[/td][td]一步法RT-[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]试剂盒[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]32,450.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-19[/td][td]生物试剂盒[/td][td]Universal [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url] 预混液[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]14,104.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-20[/td][td]临床检验设备[/td][td]QIAxcel DNA 筛查卡夹[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]11,570.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-21[/td][td]生物试剂盒[/td][td]分子大小阈值参照QX Alignment Marker 15bp/3kb[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,187.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-22[/td][td]生物试剂盒[/td][td]分子大小参照QX Size Marker 100bp/2.5kb[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,030.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-23[/td][td]生物试剂盒[/td][td]DNA提取试剂盒[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]11,500.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-24[/td][td]微生物培养基[/td][td]细胞液体培养基Eagle`s Minmum Essential Medium,Composition Were Chosen From Nissui 05900[/td][td]20(瓶)[/td][td]详见采购文件[/td][td]3,000.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-25[/td][td]塑料制品[/td][td]封口膜[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]360.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-26[/td][td]塑料制品[/td][td]0.22um滤膜[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]2,300.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-27[/td][td]塑料制品[/td][td]透明封板膜[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]6,350.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-28[/td][td]塑料制品[/td][td][url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url] 板（96 孔，透明，透明孔）[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]5,830.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-29[/td][td]塑料制品[/td][td]ABI 12连管[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,865.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-30[/td][td]塑料制品[/td][td]ABI 12连管专用盖子[/td][td]5(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]2,450.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-31[/td][td]塑料制品[/td][td]1.5毫升低吸附离心管（无DNA/RNA）[/td][td]4(包)[/td][td]详见采购文件[/td][td]960.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]1-32[/td][td]其他诊断用生物制品[/td][td]超纯水（去核酸酶水）[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,612.00[/td][td]-[/td][/tr][/table]本合同包不接受联合体投标合同履行期限：自合同签订之日起12个月。合同包2(试剂耗材):合同包预算金额：196,383.00元[table=100%][tr][td]品目号[/td][td]品目名称[/td][td]采购标的[/td][td]数量（单位）[/td][td]技术规格、参数及要求[/td][td]品目预算(元)[/td][td]最高限价(元)[/td][/tr][tr][td]2-1[/td][td]临床检验设备[/td][td]预处理柱[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]11,137.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-2[/td][td]临床检验设备[/td][td]精纯化柱[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]6,756.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-3[/td][td]其他医疗设备[/td][td]紫外灯[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]7,214.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-4[/td][td]其他医疗设备[/td][td]检测紫外灯[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]9,298.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-5[/td][td]临床检验设备[/td][td]终端精制器[/td][td]2(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]5,224.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-6[/td][td]其他医疗设备[/td][td]水箱紫外灯[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,533.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-7[/td][td]其他医疗设备[/td][td]水箱空气过滤器[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]5,022.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-8[/td][td]其他医疗设备[/td][td]杀菌紫外灯[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,104.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-9[/td][td]临床检验设备[/td][td]超滤膜[/td][td]1(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,350.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-10[/td][td]其他非病人用诊断检验、实验用试剂[/td][td]谷氨酰胺[/td][td]10(瓶)[/td][td]详见采购文件[/td][td]360.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-11[/td][td]微生物培养基[/td][td]Hepes（1M）[/td][td]5(瓶)[/td][td]详见采购文件[/td][td]2,500.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-12[/td][td]酒精[/td][td]75%医用酒精[/td][td]50(瓶)[/td][td]详见采购文件[/td][td]400.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-13[/td][td]消毒灭菌设备及器具[/td][td]121℃压力蒸汽灭菌化学指示卡[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]60.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-14[/td][td]塑料制品[/td][td]采便盒[/td][td]500(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,000.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-15[/td][td]有衬背的诊断或实验用试剂[/td][td]PH试纸（PH3—5）[/td][td]10(个)[/td][td]详见采购文件[/td][td]30.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-16[/td][td]生物试剂盒[/td][td]乙肝核心抗体IgM检测试剂盒[/td][td]20(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]2,400.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-17[/td][td]其他非病人用诊断检验、实验用试剂[/td][td]二甲基亚砜[/td][td]2(瓶)[/td][td]详见采购文件[/td][td]2,800.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-18[/td][td]临床检验设备[/td][td]医用剪刀[/td][td]20(把)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,000.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-19[/td][td]临床检验设备[/td][td]镊子[/td][td]10(把)[/td][td]详见采购文件[/td][td]350.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-20[/td][td]生物试剂盒[/td][td]QIAxcel DNA High Resolution Cartridge[/td][td]1(套)[/td][td]详见采购文件[/td][td]11,570.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-21[/td][td]生物试剂盒[/td][td]PrimeScript One Step RT-[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url] Kit Ver.2[/td][td]5(套)[/td][td]详见采购文件[/td][td]12,200.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-22[/td][td]临床检验设备[/td][td]棉签[/td][td]3(包)[/td][td]详见采购文件[/td][td]300.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-23[/td][td]临床检验设备[/td][td]酒精棉球[/td][td]35(包)[/td][td]详见采购文件[/td][td]350.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-24[/td][td]其他血液制品[/td][td]麻疹病毒（MV）抗体IgG室间质控品[/td][td]25(支)[/td][td]详见采购文件[/td][td]37,500.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-25[/td][td]其他血液制品[/td][td]风疹病毒（RuV）抗体IgG室间质控品[/td][td]25(支)[/td][td]详见采购文件[/td][td]37,500.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-26[/td][td]生物试剂盒[/td][td]白喉杆菌核酸检测试剂盒（荧光[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]法）[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]1,440.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-27[/td][td]生物试剂盒[/td][td]百日咳，副百日咳、霍氏鲍特菌三重核酸检测试剂盒（荧光[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]法）[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,320.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-28[/td][td]生物试剂盒[/td][td]脑膜炎奈瑟菌（A/B/C/型）三重核酸检测预分装试剂盒[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,320.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-29[/td][td]生物试剂盒[/td][td]脑膜炎奈瑟菌（X/Y/W135/型）三重核酸检测预分装试剂盒[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]4,320.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-30[/td][td]生物试剂盒[/td][td]流感嗜血杆菌、肺炎链球菌双重核酸检测试剂盒（荧光[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]法）[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]2,880.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-31[/td][td]生物试剂盒[/td][td]脑膜炎奈瑟菌双重核酸检测预分装试剂盒[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]2,880.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-32[/td][td]微生物培养基[/td][td]血平板[/td][td]2(包)[/td][td]详见采购文件[/td][td]120.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-33[/td][td]微生物培养基[/td][td]哥伦比亚血平板[/td][td]2(包)[/td][td]详见采购文件[/td][td]330.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-34[/td][td]无衬背的诊断或实验用试剂[/td][td]革兰氏染液[/td][td]1(包)[/td][td]详见采购文件[/td][td]55.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-35[/td][td]微生物培养基[/td][td]普通巧克力平板[/td][td]4(包)[/td][td]详见采购文件[/td][td]580.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-36[/td][td]诊断用血清[/td][td]无菌脱纤维羊血/马血[/td][td]1(包)[/td][td]详见采购文件[/td][td]100.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-37[/td][td]生物试剂盒[/td][td]腮腺炎病毒核酸检测试剂盒[/td][td]1(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]3,200.00[/td][td]-[/td][/tr][tr][td]2-38[/td][td]生物试剂盒[/td][td]乙型脑炎病毒IgM抗体酶联免疫检测试剂盒[/td][td]2(盒)[/td][td]详见采购文件[/td][td]880.00[/td][td]-[/td][/tr][/table]本合同包不接受联合体投标合同履行期限：自合同签订之日起12个月。[b][font=inherit]二、申请人的资格要求：[/font][/b]1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定 2.落实政府采购政策需满足的资格要求： 无。[b][font=inherit]三、获取采购文件[/font][/b]时间： 2023年09月04日 至 2023年09月08日 ，每天上午 00:00:00 至 12:00:00 ，下午 12:00:00 至 23:59:59 （北京时间,法定节假日除外）地点：公告期内凭用户名和密码，登录黑龙江省政府采购管理平台(http://hljcg.hlj.gov.cn/)，选择“交易执行-应标-项目投标”，在“未参与项目”列表中选择需要参与的项目，确认参与后即可方式：在线获取售价： 免费获取[b][font=inherit]四、响应文件提交[/font][/b]截止时间： 2023年09月14日 09时00分00秒 （北京时间）地点：线上提交[b][font=inherit]五、开启[/font][/b]时间： 2023年09月14日 09时00分00秒 （北京时间）地点：线上开启[b][font=inherit]六、公告期限[/font][/b]自本公告发布之日起3个工作日。[b][font=inherit]七、其他补充事宜[/font][/b][color=#5b5852]1、供应商应在黑龙江省政府采购网（http://hljcg.hlj.gov.cn）提前注册并办理电子签章CA，CA用于制作标书时盖章、加密和开标时解密（CA办理流程及驱动下载参考黑龙江省政府采购网（http://hljcg.hlj.gov.cn）办事指南-CA办理流程），具体操作步骤供应商在黑龙江省政府采购网（http://hljcg.hlj.gov.cn）下载政府采购供应商操作手册。[/color][back=#f9f8f7][color=#5b5852][/color][/back][color=#5b5852]2、供应商制作电子投标文件及其他相关操作说明，详见黑龙江省政府采购网（http://hljcg.hlj.gov.cn）下载专区--系统操作手册--黑龙江省政府采购管理平台-供应商操作手册。[/color][back=#f9f8f7][color=#5b5852][/color][/back][color=#5b5852]3、本项目远程解密，供应商无需到场，开标截止时间前半个小时内供应商自行登录系统签到并在开标截止时间后30分钟内完成系统解密。[/color][back=#f9f8f7][color=#5b5852][/color][/back][color=#5b5852]4、竞争性磋商需二次报价的，供应商自行准备二次报价所需要的电脑及网络。在规定的时间内上传二次报价，任何原因导致的二次报价上传失败，后果由投标人自行承担。[/color][font=inherit][/font][b][font=inherit]八、凡对本次采购提出询问，请按以下方式联系。[/font]1.采购人信息[/b]名 称：黑龙江省疾病预防控制中心地 址：油坊街40号联系方式：55153613[b]2.采购代理机构信息[/b]名 称：黑龙江龙博项目管理集团有限公司地 址：哈尔滨市香坊区汽轮头道街10号三楼联系方式：0451-82763333[b]3.项目联系方式[/b]项目联系人：高先生电 话：0451-82763333

紫外检测器毛细管电泳做二代测序建库质控可行吗？

美国加州的山景城是“硅谷”的重要组成部分。现在，一个与硅芯片相关的潜力大产业正在这里兴起，那就是基因组测序技术产业。这个产业的发展是随着多家大公司的激烈竞争开始的。不过，一家名为“整合基因”（Complete Genomics，CG）的公司不像别的公司一样研发和销售测序仪器，而是为科学家提供外包的测序服务，更绝的是，在这家公司里做测序的，并不是研究人员，而是一排排的机器人。近日，《新科学家》杂志探秘了这家充满科幻意味的公司。前台都是“机器人”走进CG公司，连前台都由计算机终端出任。它会主动向来客问好，询问姓名、身份和来访意图。旁边连接的一台打印机则自动打出访客挂牌。与此同时，一份电子邮件已经发送到内部接应人员的电脑上。这家公司的生产线更像科幻电影里的实验室，昏暗蓝色的房间里到处都是高级仪器，室内温度保持在28℃和相对较高的湿度，几名穿着实验服，带着发罩的工作人员在监视着电脑屏幕，查看着机器人的运作状态。这儿已经成为了世界上最大的人类基因组测序工厂。只是在这里工作的不是人类，而是机器人。在一个大约只有半个网球场大的房间里，“坐着”16台机器人，不间断地进行着人类基因组测序的工作。去年，它们完成800个人的DNA测序工作其中三分之一是后半年做出来的。到了今年，它们已经可以每个月生产出400个人的基因了。CG公司只是目前迅速形成产业的诸多基因组测序公司中的一家，但是它十分独特。公司市场总监图柯特（Jennifer Turcotte）对《新科学家》杂志解释说，通常而言，DNA测序是在一个密封的机器里进行的，但在这家公司的实验室里，机器人却是在一个开放暴露的环境下做基因组测序，这是为了便于维修。实验室特定的温度和湿度是为了符合测序中出现的生化反应，微弱的蓝光是为了避免荧光探测剂在探测基因代码符号时受到其他频率光波的破坏。这儿所进行的基因组测序，已是目前最新的第三代基因组测序技术，称为“DNA纳米球测序技术”。这种新方法是将DNA链放置在一小块硅芯片上进行调节，自我组装成所谓的“纳米球”。这样的测序所需要的试剂更少，得到的数据则更多。技术人员都穿着无尘室服装，因为任何一点灰尘都会干扰测序，除非哪儿出问题了，一般而言这些技术人员不会干预机器人的工作。机器人则会自动添加试剂，操作样本，每个DNA纳米球上携带着70个核苷酸，其排列顺序会通过光信号被拍摄记录下来。费用正在逐步降低这些机器人正在做的工作，是一个浩大庞杂的工程蓝图中的第一步，所有的人类基因组中有着30亿对碱基对，而CG计划将其全部组装出来。这需要非常大的计算量，公司为此也建了一个自动数据中心。不过，这个数据中心设在距离公司大约有20分钟车程的地方那儿的电费更便宜。目前CG公司只针对研究者和制药公司开放，个人还没法购买他们的服务。在这里，每对基因组测序要价9500美元，如果购买1000对以上，则每对价格降为5000美元。这个价格是随着基因组测序技术突飞猛进而急剧下降的，要知道，十年前，第一对人类基因组序列完成时，其价格是以十几亿美元计量的。而科学家现在已经预计几年后，基因组测序的价格可能会降到一般人都可能支付得起的程度。基因组测序的流水线完全是由机器人来做的，而职员做什么呢？公司共有185名职员，部分是科研人员，忙于改善公司的测序技术，另一部分则是做市场和联络，与各类客户打交道。基因组测序工程是一项既有非常光明的前途但又异常庞大的科学工程，而自动化则可能成为处理这项工作的最佳工具。基因学家们认为，通过一些基因扫描，是可以找到导致人类易感疾病的一些基因变异，人类基因谱上，有一些常见明显变异，但是就整个遗传问题来看，还有大量的混乱的遗传变异隐藏在DNA双螺旋体中，这些也导致了世界上千奇百怪的遗传疾病。如何去捕猎这些神秘莫测的错误基因代码呢？只剩下一个方法，那就是将整个人类基因谱测序，来捕捉一些可能和疾病有关的基因变异。这个方法虽然听上去如同“大海捞针”一样不靠谱，但目前一些迹象表明，今后或许基因组序列会成为医疗记录的一部分，或者科学家可以通过家庭的基因组测序来纠正基因错误。比如，去年西雅图系统生物学研究所的胡德（Leroy Hood）及其小组与CG公司进行了合作，在《科学》杂志上刊登了一篇论文。他们对一家四口的基因组进行了测序。这是个特殊的家庭，两个孩子都患有两种隐性遗传病米勒综合征和纤毛运动障碍，而父母则完全正常，在分别测出这家人的基因序列后，研究者将父母和子女基因组序列进行比较，验证了米勒综合征这种非常罕见遗传病的致病突变。提供测序外包的服务目前，站在基因组测序产业化起跑线上的企业包括了同样位于加州的生物科学公司Pacific Bio。这个公司创立了首次可以对单个DNA进行测序的仪器。和CG公司一样，目前，这家公司也只向研究者提供服务。有一些大型的、从事基因组测序产业的公司已经将基因组测序做到医院和个人普及的地步了，如研发制造大型测序分析仪器的Illumina公司。这个公司在2008年美国成长最快的科技公司评选中，风头甚至盖过了Google。它们提供的产品甚至可以直接给病人使用。而另一位基因创业企业家罗斯伯格（Jonathan Rothberg）甚至发明了可以放在桌子上的基因解码器，可以在2小时之内以很高的精度解读出1000万个基因代码符号。大部分的基因组测序企业都站在一个竞争线上，尽力提高DNA测序的速度，降低费用。而CG公司其实并非和它们是严格意义上的竞争对手他们计划组装出所有的人类基因序列，研发也是为此目的而进行。此外，他们并不如其他公司一样开发更高级更小巧的基因组测序仪，而是为科学家提供基因组测序的外包服务，也就是说，研究人员无需购买、安装、培训、运行和维修仪器，而只要将样品交给这家公司，等待结果到来就可以。虽然很多人不理解他们的做法，但这家公司始终坚持自己的观点，认为这样的服务最能让科学家将时间从捣腾仪器设备的工作中解放出来，专心放在生物学和假说验证上。从这几年CG公司取得的成绩来看，这种做法确实是有效的。2009年，CG公司宣布其测出了第一个人类基因序列，并移交给美国生物科技信息中心数据库。同一年，他们在《科学》上刊文，发布了三个完整人类基因组序列分析的结果，当时文章还宣布，测序的成本已经可以降到1726美元。这在生物界引起了轰动。到了那一年结束，他们已经做出了50个人的基因序列。此外，他们的名字也随着来自各地的科学家一起多次登上了权威学术杂志。除了去年帮助科学家解开了米勒综合征突变难题给科学界留下难忘的印象之外，美国的罗氏公司还曾经借助CG的基因组测序技术，完成了人类科学史上第一例肺癌患者的全基因组比较。相关研究结果刊登在《自然》杂志上。而美国癌症学会也开始和CG公司联手，希望通过其服务比较正常人和癌细胞基因组序列的差异。或许在不久的将来，解开癌症之谜的第一个贡献就属于这些蓝光照耀下的机器人。

“在未来五年，全球基因组学生命科学研究工具市场预计每年增长6%，而新一代测序仪市场预计每年增长16%，”一家生命科学市场研究公司DeciBio在2012年4月12日发表的一份报告中说。　　在这份报告中，位于洛杉矶基的DeciBio估计生命科学研究工具的市场规模将从2011年的374亿美元增长至到458亿美元，年复合增长率为4%。DeciBio说，在新一代测序仪持续被采用的推动下，2016年基因组学市场规模预计增长到89亿美元，而2011年是68亿美元。　　DeciBio的合作伙伴Stéphane Budel,在一封给GenomeWeb的电子邮件中说，基因组学“有望成为生命科学研究工具市场增长最快的部分，”并且补充说，新一代测序技术“正在真正改变这次比赛。”更多内容：http://www.instrument.com.cn/news/20120413/076792.shtml

进入21世纪，自第一个植物基因组拟南芥被完整破解以来，有近300种植物的基因组被陆续破解，并在此基础上建立了相应的植物基因组数据库，中药材植物是其中重要的组成部分。中药材品种数量众多，一项市场调查发现，123种常用的中药材都有不同程度的掺假或混用的情况。传统的DNA条形码技术虽然具有很好的物种区分能力，但是一般是针对单一的物种进行鉴定，碍于桑格测序的技术局限性，其对多药味的中成药的鉴别存在困难。NGS测序则可以解决多药味处方的鉴别的问题，目前已有许多关于NGS技术应用于中药材产品的报道。Peng Zhang等尝试用Pacific Biosciences（PacBio）公司的单分子实时（Single-molecule Realtime，SMRT）测序技术对生脉散中各个药味进行检测，不同于传统的NGS测序，其开发了一种Full-lebgth Muiti-barcoding的策略，直接对ITS2和PsbA-trnH的片段进行了测序，并选择三味蒺藜散用于验证方法的可行性。最终通过不同通用DNA引物的组合可以实现对生脉散与三味蒺藜散中所有药味的鉴定，同时可以鉴定出外源性的物种，充分证明了此种方法用于中成药质量控制的可行性。由于龙胆泻肝丸中川木通的混用会引起马兜铃肾病，因此其质量检测要求比较严格，通过鸟枪法宏基因组测序技术使用Illumina HiSeq 2500平台对龙胆泻肝丸中的木通进行验证，从实验室制作的2个参考样本（RF01和RF02）中获得了ITS2、PsbA-trnH和MatK三个序列的共计129个有用的Contigs，实现了对木通及龙胆泻肝丸中其余药味样本的检测。将该方法应用于市场收集样本的检测，发现市场样品多存在产品投料缺失、伪品混用、川木通代替木通投料等情况，证明了该方法用于中药材尤其中成药质量控制方面具有可行性。Cheng等基于高通量测序方法开发了一种新的用于识别中药中生物成分的M-TCM方法，对六味地黄丸的生物成分进行分析。分析过程中选择了3批不同制造商的六味地黄丸的药材及自己实验室制备的参考样本，最终实现了对六味地黄丸中不同药味与外源性生物的检测，并通过该方法进一步验证了有些厂家以加工过的原材料进行投料生产的猜测。目前对于天南星的化学检测方法较少，且天南星根茎具有毒性，Li等通过高通量测序与实时[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]技术检测在传统如意金黄散处方中是否存在掺伪的情况，并通过是否能鉴别如意金黄散中有毒的天南星及其混伪品虎掌来确定此方法的可行性。结果显示，市场收集的如意金黄散样品中未检测到天南星与厚朴，却检测到了虎掌和当归，实时[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]方法与NGS测序的检测结果一致，进一步验证了结果的准确性。Xin等[44]利用PACBIO RSII SMRT平台对3份市场来源和2份实验室自制的九味羌活丸样品进行测序，通过对ITS2和PsbA-trnH两种DNA条形码的测序结果分析，发现实验室自制的样品中所有的药味均被检出，而市场购买的样品中黄芩、苍术、白芷、川芎等药味未被检测到，同时朝鲜苍术、白术等非处方药味和外源性的物种例如杜鹃属、牵牛属等却有检出。Williams A等[48]利用PacBio平台结合[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]DGGE（Denaturing Gradient Gel Electrophoresis）的方法检测当归补血方中处方药味的投料是否准确，并通过高效[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/5p][color=#3333ff]液相色谱[/color][/url]的方法检测当归和黄芪中的1338质量标志物，确定其剂量关系。

近日，美国 FDA 审批通过 Illumina 公司的 MiSeqDx 台式新一代测序仪及配套试剂盒，成为全球首个而且是目前唯一一个获得 FDA 临床认证的新一代测序（NGS）平台。通过认证的试剂盒除了针对囊性纤维化的检测之外，还包括通用试剂盒，让临床实验室能够开发他们自己的诊断检测。美国 FDA 医疗器械与辐射健康中心的官员 Alberto Gutierrez 博士认为：“NGS 正在改变我们了解基因组学的方式。在这之前，测序与特定疾病相关的基因是个漫长而昂贵的过程。今天，我们能够在单个检测中非常快速地读取和解释大的 DNA 片段，而这一信息丰富的技术日渐普及，能够被医生用于患者护理。”此次通过 FDA 认证的两项分析分别是 MiSeqDx Cystic Fibrosis 139-Variant Assay 和 MiSeqDx Cystic Fibrosis Clinical Sequencing Assay，它们可用于囊性纤维化的筛查和诊断。囊性纤维化是一种常见且致命的遗传疾病，在欧美人群中较为常见。在美国约有 1000 万名携带者，而患病人数超过 3 万名。此疾病由囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）基因的突变引起，有着广泛的临床表现，这取决于哪些CFTR基因突变存在。大部分CFTR突变是罕见的，其分布和频率随群体而异。MiSeqDx Cystic Fibrosis 139-Variant Assay 旨在同时检测CFTR基因中的 139 个临床相关的致病突变及变异，包括 ACMG 和 ACOG 建议筛查的那些。MiSeqDx Cystic Fibrosis Clinical Sequencing Assay 则凭借 Illumina 的靶向重测序技术，为 CFTR 基因的蛋白编码区域和内含子/外显子边界提供高度准确的数据。美国国立卫生研究院（NIH）的院长 Francis Collins 也是一名囊性纤维化的研究人员。他在一份声明中指出，这一具有里程碑意义的举措，将有助于实现个性化医疗的承诺。他认为，高通量 DNA 测序仪的出现让医生能够全面查看患者的基因组，以便搜索各种变异或突变，它们可能增加疾病风险，推动疾病进程，和/或影响药物反应。这些信息有可能在很多方面让患者受益。不过激动归激动，他认为目前还有很多工作要做。Francis Collins 博士和 FDA 局长 Margaret Hamburg 在《新英格兰医学杂志》上联名发文，称测序平台在临床应用中的批准将为医生在患者护理中更广泛地采用遗传信息铺平道路。不过，他们也指出，尽管目前已取得一些进展，但仍存在政策、法律和监管问题，而新发现也必须得到验证。此外，医生、医疗保健工作人员和患者仍需要支持和帮助，才能了解基因组数据。他们谈道：“新一代测序到达这一监管里程碑仅仅是个开始。我们需要共同努力，以确保研究进展和基因组信息的临床应用是基于严谨的证据。”原文检索：Francis S. Collins, and Margaret A. Hamburg. First FDA Authorization for Next-Generation Sequencer. NEJM, November 19, 2013; DOI: 10.1056/NEJMp1314561

以固态检测器为代表的第三代电感耦合等离子体发射光谱仪的进展评述

美国商标专利局已接受申请，有望带领人类度过2012劫难美国东部时间3月31日下午， 美国商标专利局 在其官方网站发布声明取消了对“ 永动机”专利的申请禁止，同时正式宣布接受中国泛科技主题网站 果壳网此前提交的第三代永动机专利申请。随后，果壳网在其官方网站证实了这一消息，并正式发布了这款名为“果壳永动一号”（GPower1）的永动机。项目研发负责人、 果壳DIY站编辑 天蓝提琴 日前在接受央视 《致富经》节目采访时说：“是的，我们确实做到了。回过头来看，其实也没那么难。从以质子高维展开为理论基础的第三类永动机数学模型建立，到研发原型机，以及之后的精密机械制造，均由果壳DIY主题站科研技术人员完成。”为了让公众直观了解果壳永动机的神奇， DIY主题站 技术人员建造了现实版的名画 《瀑布》。《瀑布》是荷兰著名画家 埃舍尔 生前创作的以“不可能存在”为主题系列画作中的一幅。

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高通量测序如果用于临床，或者是为临床行业所服务，那么需要哪些资质呢？

来源：中国科技网-科技日报 作者：王怡 2013年10月31日 原标题：我自主研发基因测序技术将实现产业化 科技日报讯（记者王怡）2013年国际基因组学大会10月29日在青岛举行。在开幕现场，中国科学院北京基因组研究所与吉林紫鑫药业股份有限公司就合作开发第二代高通量测序系统项目签订投资意向协议，这标志着由中科院自主研发的第二代测序仪项目即将进入市场转化和产业转化阶段。 基因测序技术，自人类基因组计划实施以来长期占据着国际生命科学技术研究的制高点，随着第二代基因测序技术的发展日趋成熟和成本急剧降低，该项技术被越来越多的科研和实践领域所应用，形成庞大市场。目前我国市场上所有高通量测序设备和试剂均来源于进口，据估计仅2013年我国在仪器和试剂上的投入就超过20亿元。 “我们的基因组学研究一直处于世界前列，源于我们最早参与人类基因组测序的工程，但是我们使用的设备一直都依靠国外的进口设备，中国科学院作为国立科研机构，我们有义务自主研制开发基因测序仪打破国外垄断。”中科院北京基因组研究所党委书记杨卫平说。 在中科院资助下，历时两年半时间完成第二代测序仪研发项目，于2011年实现原理样机和性能验收，部分性能指标超越同类进口产品。其后中科院北京基因组研究所自主投入完成该项目的工程化和产品化开发，并形成其自主知识产权群，目前已有9个专利获得授权。 “第二代高通量测序仪的产业化发展是我们的第一步，后面我们希望能有更多的进展，比如在试剂、数据库和后台都能实现国产化。”杨卫平说。

基因测序的基本原理是边合成边测序。在Sanger等测序方法的基础上，通过技术创新，用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP，当DNA聚合酶合成互补链时，每添加一种dNTP就会释放出不同的荧光，根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件处理，从而获得待测DNA的序列信息。

以下问题是我摘抄的，当时记在我的记录本上，所以没有记下名字，很是抱歉。但是我想拿出来这是对大家的一种共享，所以祈求大家原谅。Q:我将PCR产物纯化后送测，结果说是双模板，测序峰重叠，请问是模板不纯吗？A:应该指的是模板不纯。可能是割胶纯化时，范围偏大，非目的基因片断亦混入其中。该非目的片断的大小与目的片断也类似。如果片断长度大的话，可以先连一下克隆载体，这样测序应该没有问题。 测序峰重叠不知道你讲的时双峰类型的还是指比较杂乱的而且无序的重叠： 如果是双峰（TP）,有可能是标本来源是杂合子的缘故，如果是后者，原因很多，一般看打印出的测许结果大致可以判断。原因：1。有时候PCR产物可能就是失败的产物或者浓度很低。2．提纯不好，非目的片段保留。3．测序时Matrix等条件的错误。Q:测序结果不好，测序峰比较乱，基线不平，测许公司说含有复杂结构，现急需要该序列，请问高手这种情况该怎么办？有什么测许方法？A；我自己曾经亲自做过测序，对于这种情况，一般是有解决的方法的。不过公司不愿意为了你自己的一个样品去专门摸索条件。1． 最大可能是提取的质粒不纯，可以将质粒再次转化后挑单克隆重做（很奏效）。2． 直接在测序前的模板热变性使用86度，5分钟而不是大多数的96度3分钟3． 实在不行切后分别放到T载体上，一般都可以保证顺利读出序列。最后值得一提的是如果能自己根据理论序列给设计几个比较合理的测序引物可能一切就OK了。Q:上星期将我的PCR纯化产物拿到TAKARA测序，结果今天公司打电话来说测了100多个bp就读不下去了，建议我克隆后再测，我的PCR产物纯化只有很亮的一条带，不知道为什么测不出来。答：测不下去的原因主要是序列里面有困难序列，二级结构或短序列重复，比如发卡结构和AT长重复等，甲基化的影响不大清楚，本人认为不会影响测序。所以，PCR产物测不下去的话，克隆后也很难保证测过去。其实就测序来说，PCR产物还是质粒都无所谓，只要样品纯可以了。正向测不通反向再测也可能会测通，因为DNA中正链和反链二级结构不是完全一样的，正链中遇到困难序列在反链中可能相对简单，测序酶可能可以急需合成DNA。另外，还可以改一下测序PCR的反映条件等等，也可以测通。

天津金思德生物公司提供技术支持与相关服务 天津金思德生物技术有限公司，是一家具有权威核心技术的高科技公司。拥有雄厚的科研技术力量、精良的仪器设备、完善的项目管理、严格的质量管理体系以及专业的技术支持。在精湛的技术平台基础上，为广大客户提供最优质的服务和具有竞争力的价格。 金思德可以提供DNA鉴定人员培训、鉴定技术支持、DNA测序设备升级、设备维修包括：（ABI-310，3100，3130xl，3730xl，3500xl，及其它DAN检测设备）等服务。同时我们还可以帮您解决生物实验室淘汰和闲置的大型DAN测序设备。并可以帮您管理，维护，维修及旧设备回收等服务。解除您的后顾之忧，帮您节省时间，空间和资金等实际问题。是立足于生命科学技术领域的佼佼者，我们公司已成为全国诸多知名公司，生物院校，科研机构，鉴定中心的长期合作伙伴和供应商！使更多的广大客户得到最优质的产品、维修和技术支持服务。金思德一直在不断提升自身服务的竞争力，努力打造国际一流品牌和服务。我们因你们而存在！ 公司名称：天津金思德生物技术有限公司联系人：李俊玲 QQ：2499291612电话：022-84901689 18920118658公司地址：天津市东丽区华明镇南坨工业园广源路13号

测序都是从5'端进行的，正向和反向测序是指对DNA的两条互补链分别测序，通常两个方向测序结果经校读后完全一致才能认为得到可靠结果。生工测序结果一般都提供两个文档，一个是TEXT的序列文档，一个是用Chromas软件打开的ABI文档。1.寻找引物http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比对，去除引物序列，找到目的片段。在DNAMan上进行比对，看引物能不能比对上（一个不变，一个反向互补），如果比不上，那可能就不是你要的序列，如果能比上，上游以引物第一个为分界线，去除前面的；下有一最后一个为分界线，去除后面的，剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。批注：PCR产物进行测序的结果可能不包含引物序列2.将找到的对应目的片段转成*.txt格式3.下载BioEdit软件第一：打开Bioedit软件，导入拼接好的样品序列与标准亚型参考序列File—New Alignment—Sequence—New Sequence—导入拼接好的样品序列和标准参考序列（从TEXT文档利用复制粘贴工具）—Apply and close —保存结果—关闭窗口第二：点击菜单栏上按钮“Accessory Application”，选择“Clustalw Multiple Alignment”File—Open—Accessory Application—Clustalw Multiple Alignment第三：比对结束后，删除比对序列两端的多余序列，使所有序列等长选择需要编辑的序列—Sequence—Edit Sequence—进行序列的编辑—保存修改后结果第四：选择“Sequence”菜单下的“Gaps”，点击“Lock Gaps”第五：将比对后的序列保存为Fasta 格式文档4.下载MAGE4.0软件1) 打开MEGA软件，选择“File”菜单栏中的“Convert To MEGA Format”，把序列文件的格式转换为meg文档保存；2) 双击序列的meg文档，选择“Nucleotide Sequences”，点击“OK”；3) 程序运行中询问是否为蛋白编码序列，选择“NO”；4) 在MEGA操作界面选择“Phylogeny”菜单栏下“Bootstrap Test of Phylogeny”中的“Neibour-Joining”；5) 选择“Test of Phylogeny”栏中的“Bootsrap”，“Replications”设定为1 000；在“Options Summary”栏中的“Model”项中，设定参数为“Kimura 2-Paramete”r，最后选择“Compute”；6) 将分析结果采用Los Alamos HIV序列库提供的HIV-BLAST和Subtyping工具进行验证。

DNA序列测定分手工测序和自动测序，手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪，其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。本实验介绍的是ABI PRISM 310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。【原理】ABI PRISM 310型基因分析仪（即DNA测序仪），采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司专利的四色荧光染料标记的ddNTP（标记终止物法），因此通过单引物PCR测序反应，生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'''端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物，使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一根毛细管内电泳，从而避免了泳道间迁移率差异的影响，大大提高了测序的精确度。由于分子大小不同，在毛细管电泳中的迁移率也不同，当其通过毛细管读数窗口段时，激光检测器窗口中的CCD（charge-coupled device）摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测，激发的荧光经光栅分光，以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光，并在CCD摄影机上同步成像，分析软件可自动将不同荧光转变为DNA序列，从而达到DNA测序的目的。分析结果能以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。它是一台能自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定DNA片段的碱基顺序或大小和定量的高档精密仪器。PE公司还提供凝胶高分子聚合物，包括DNA测序胶（POP 6）和GeneScan胶（POP 4）。这些凝胶颗粒孔径均一，避免了配胶条件不一致对测序精度的影响。它主要由毛细管电泳装置、Macintosh电脑、彩色打印机和电泳等附件组成。电脑中则包括资料收集，分析和仪器运行等软件。它使用最新的CCD摄影机检测器，使DNA测序缩短至2.5h，PCR片段大小分析和定量分析为10～40min。由于该仪器具有DNA测序，PCR片段大小分析和定量分析等功能，因此可进行DNA测序、杂合子分析、单链构象多态性分析（SSCP）、微卫星序列分析、长片段PCR、RT-PCR(定量PCR)等分析，临床上可除进行常规DNA测序外，还可进行单核苷酸多态性（SNP）分析、基因突变检测、HLA配型、法医学上的亲子和个体鉴定、微生物与病毒的分型与鉴定等。【试剂与器材】1．BigDye测序反应试剂盒 主要试剂是BigDye Mix，内含PE专利四色荧光标记的ddNTP和普通dNTP，AmpliTaq DNA polymerase FS，反应缓冲液等。　　2．pGEM-3Zf（+）双链DNA对照模板0.2g/L，试剂盒配套试剂。　　3．M13（-21）引物TGTAAAACGACGGCCAGT，3.2μmol/L，即3.2pmol/μl，试剂盒配套试剂。　　4．DNA测序模板 可以是PCR产物、单链DNA和质粒DNA等。模板浓度应调整在PCR反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒DNA，浓度为0.2g/L，即200ng/μl。　　5．引物 需根据所要测定的DNA片段设计正向或反向引物，配制成3.2μmol/L，即3.2pmol/μl。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物，如M13（-21）引物，T7引物等。　　6．灭菌去离子水或三蒸水。　　7．0.2ml或和0.5ml的PCR管，盖体分离，PE公司产品。　　8．3mol/L 醋酸钠（pH5.2）称取40.8g NaAc·3H2O溶于70ml蒸馏水中，冰醋酸调pH至5.2，定容至100ml，高压灭菌后分装。　　9．70%乙醇和无水乙醇。　　10．NaAc/乙醇混合液 取37.5ml无水乙醇和2.5ml 3mol/L NaAc混匀，室温可保存1年。　　11．POP 6测序胶 ABI产品。　　12．模板抑制试剂（TSR）ABI产品。　　13．10×电泳缓冲液 ABI产品。　　14．ABI PRISM 310型全自动DNA测序仪。　　15．2400型或9600型PCR仪。　　16．台式冷冻高速离心机。　　17．台式高速离心机或袖珍离心机。